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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                        cgcttgcttcaaccgctatttctcacttaaaATCATTCATTTGAA-CACGCATGCCAGTT-AAT-A--------A-A-TAA-TA--TTT----CTAAT-TGGTA--TC-ACTTCC-AGTTCCAA-TCC-AT-TGTCCCA------TACAG---TT----ATTGGCTTCA-----TC------GA-TTT--CTAACGAAAACTTCCCAAATGG-AC--------------CAC-T-AAGTGGCTTATG---T---------CA-----------CTCGC---GC------------tctgggtttttcaaagagatgaagaagttttaaaaaaaa
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                       ATCTTTAATTTG-AACATTGATGGCGGTT-AGT-ATC-ACTAAA-A-TAAATA--TTTTTCTCT--T-TAGCAT-T--ACTTC
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                      AT-ATC-TGT-AA-A-TAAATATTTTTTT-TTTAAT-TGGCAC-C--ACTGCC-AGTGCCAA-TCC-TT-TGTCGCT------TACATGAATTG---GTTTA----A-----TC------AA-TTT--CTAACG-------------TAA-AC--------------tttaagtgagcaaataagggttaatgcgagcgagtataaaaatg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tcacgtcTTTT-TCTAATGTGTTT--T--ACTTCC-AGTTACAA-TCC-TT-TGTTGCTAGTGCTTACAT---TTATGGGTT------AAAAAGTT------G---TT--C-AACG-------------TAT-AC--------------AAC-T-AAGTG-TT--TC---TGT-------CG-----------CTCGC---GC------------TCTCTTCGGGTTTTTCATAGGATGAAGAGTTCTAAAAAAAAATCCTCCTGTCTTGGTCTGTGAAAAAAACCCCGAAAGAAC-CGAGTGATATTATACTT-CGCTTTC-TGTAGA-TCCATTCT-TAGTTGTCCATTGGGGAAGTTTACGTTAGA-AATTGATTAGGTCAATAAATGTA------AGCGACCAACAG-ACGCGT-ACT-GAAAGT-GAT-ATCTAGT--AGGAAAG--CATCTA-T-TT-ACGAGAT-ATTAA-TTGGCGTGA--GTTC-AATTAAAGAT-TTAAGTGAG--AAT-GAGGTATGAAGCGAGCGGGTATGCC--AATGGAGTTTATCC-----ACTTGTTTATTTTTACT---TG-G-G-TGGTTTTAT-TTT----TTTTCTt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ---------------CTTC-ATC-----CTATGAAAAA--CCCGAAGAGAGCGCGAGCGA---------------------CAGAAA-CACT---TAGTTGT--A-----------TACGTTGAACAACTTTTTAA-CCCATAAATGTAAGCACTAGCAA-CAAAGG-AT-TGTAACT-GGAAGT-AAA-A-CACAT--TAGAAAAAaca
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ---------------CTTC-ATC-----CTTTGAAAAA--CCCCGAGAGAGCGCGAGCGACA---------------------GAAGCCACTTT---GTTGTCCATTTGTGAAATTT-----------TTTA--AAGCCATTAAATGTA------TGCGA-CAAAGG-AT-TGTAACT-GGAAGT-AAT-T-CCAAT--TAGAAAAATTATCTA-T-TT-ACC-GAA-ATTAA-ATGGCGTGAGTGTTCAAATTAAAGATTTTAAGTGAGAAAATAGCGGT-TGAAGCAAGC--GCTT-CCAAAATGagttctaaaaaaaaatcctcctgtcttggtctgtgaaaaaaaccccgaaagaaccgagtgatattatacttcgctttctgtagatccattcttagttgtccattggggaagtttacgttagaaattgattaggtcaataaatgtaagcgaccaacagacgcgtactgaaagtgatatctagtaggaaagcatctatttacgagatattaattggcgtgagttcaattaaagatttaagtgagaatgaggtatgaagcgagcgggtatgccaatggagtttatccacttgtttatttttacttgggtggttttattttttttctaca
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tagaaaaaatcaaaaataca---------------CTTC-ATCT----CTTTGAAAAA--CCCAGAGAGAGCGCGAGCGAC--------------------CAGAAAGCACTTT-T-GTTGTCCATTTGTGAAATTT-----------TTTA--AAGCCATTAAATGTA------TGCGA-CAGAAGGAT-TGTAACTTGGAAGT-AATTC-CCAAT--TAGAAAAATTATCTA-TATT-ACC-GAA-ATTAAATTGGCGTGAGTGTTCAAATTAAAGATTTTAAGTGAG-AAATAGCGGT-TGAAGCAAGCGagagtttaaaaaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CATAAGCCACTT---AGTGGTCCATTTGGGAAGTTTTCGTTAGA-AATCGATGAAGCCAATAACTGTA------TGGGA-CAATGG-AT-TGGAACT-GGAAGT-GAT-A-CCAAT--TAGAAATATTATT--------------T-ATTAA-CTGGCATGCGTGTTCAAATGAATGATaagttttaaaaaaaa
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gcgcgagtgaAGTTTACGTTAGA-AATTGATTAAACCAATTCATGTA------AGCGA-CAAAGG-AT-TGGCACT-GGCAGT-GGT-G-CCAATTAAAAAAAAAATATTTA-T-TT-ACA-GAT-A------TGACGTGA
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GAAGT-AAT-G-CTAAA--GAGAAAAAT-ATTTA-T-TTTAGT-GAT-ACTAA-CCGCCATCAATGTTCAAATTAAAGATTTTAAGTGAGCAAATAAGGGT-TAATGCGAGCGAGTAT--AAAAATG
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGTTCAAATTATAGAT-TTAAGT---------------TGAAGCAAGTGGGTAT-GCAAAATGGTCTCT-TCCC------TTGTGTATATTTTCCAAGGG-G-G-TGTCTTGATATTTTTTATTTTTTTCTACAC-A
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AAGAGTTTAGGTGAGAAAATAGCGGT-TGGAGCGAGCGGGTAT-GCAAAATAGAGTCT-TCCC------TTGTGTACTTTTCCTA--GG-GTG-TGTCGTGAT-GTT----TTTCTCTtggttttccaatgattgag
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TGTGTATTTTTACTA--GG-G-GGTGTTTTAAT-TTT----TTTCT----ACAC-AAGCC-CCTGTGG
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cacaggcgctagtgcagaaaaaaaatcaaaacaccccTGTTTATTTTTACTA--GG-G-G-TGTTTTGAT-TTT----TC------TACACAAAGCCACCTGTG
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GTATTTTTACTAG-GG-G-G-TGTTTTGA--TTT----TTTTACTGTACAC-AAGCT-CCTGTGaataaatatatgtattacaaagtatagaaatattttcttacaaaagaaaacgtgcatcgaacttttacttcaacagaaataaatttattaagcttaggggaagacttccattaaaatcaacggaatcgctttcctcataacataaatgtacccatatgcaccatgaaaccaaattaactgccctttacttttctaacaagtacctttccagtatatatcattccacctttcaaaacatagtattttcacgcgcttttaaaaatcacaagcacttggctctattaactacatgggaaatttaaaatattaattctttattttgattggctgatttggatattga
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTTACTA--GGAG-G-TGTTTTGAA-TTT----TTTTTTTCTACAC-AAGCC-CCTGTGATa
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A--GG-G-G-TGTTTTGAT-TTT----TTTTC---TGCAC-TAGCG-CCTGTGcaga
21 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|1 ): CCAATATTAACAAAATACTTTGTTTGCGTTTTAGCCTCCCCATCTATCCTAGTACCTAAAATTCAAAATTTTGCCTAATACAGTACCGACTGATTTGTCTCTTCTACTGACCAGAATGTAATATAAAAACCTTCATATCAAAAAATACTTATGTCGTACACTAATTATAGCACATGTATAAATACTTACGAGTGTCCTAGCTATCATATCCGTTAATACCTAGATTTTATATCTAAGATCCTGTGTCATCACGTAATAAAATTCTTGCACTGATCCAAAAATACAGAGTATATCTTACCCAACGCATAAAGTTCATTTATTTTACAATCAAGACAATAAGAATTTTCTTAAGGAAAGTAATTCCATAATAATGACTAACCGAGAAGTCGCCTCGTTTCTCTCAATGACTAATCTTACCCATATGGCCTCTGAGAACCAAGAACAACTCCCCTTTTCCAGTCTTTTTCTACAACTCTGCAGCTTGTCCGTCATATCATTTCCCCACACAAACTATAGTATTTTCACGGTGGCGCATAAAATCCACAAGGCTTGGTGCCTATTCTCAAGCTTTGCAAGTCATTAGCTCACAAGCTTCCTTATTTGCCATTGCTGATTTTGGACTATGATCTTATCTGTGGATTCGATATCTGAAT
Unaligned ( gi|2 ): TCTGTCTTATCTTTCAAAATTACATTTACCTAATTCAAGGAAAAACTTCAATATAAAATTAAAATTTGTTACACATTTATTTAGTCATTATAATACTACCATGTCCTATGCTTCAATGTTTACCCTAGATTGAATATAAAAATGGTATATTATAAATTCTTGCTTGGCAAATTTTACAGAAATAATCTTACAGAAAGATAAATGTTCGTTTTGATCTTATATAATCAAAAAATTTTCTTAAGGGGAATGATTCCATAAAATACAAACGAATCGACTTCTCAAAAACTTAAGTGCACCATTATACAACTCGCTTGATAAACAAGAGTTGACTGCTTCACTTTTCCACTTTTTCTACAATTTACACTAATCCCTGAGCTTAATGAATATATCAATTTTTCCCCCTTACATATATACAAGAGTTCATATAGGCTTATTTTCACCCCGCTATAGACATTCACAAGCGCTTCTGTGGTGCGTGCTGTCAAACCACAAAAGGAAATTTAAGTATTGAATTCTTGCATTTTTTGATTGGCCTGATATTTTGTTGAAGTATTGAATCTTCAAACCTTGGACAGTTTCGGAATATTGAATTTGGAATCTTTTGACGATTTTG
Unaligned ( gi|3 ): GCCTAAATTGACATAAAAATTGGTGTTATTGCAGTTTTACCTCCGGTCTTCCAAGTAACTAGATTGTAATTTTGCAATGACAATAGACATCGTGATTATGTATCTAAGCTGGACCGAATAAATAAAACTTCATATAAAAATAAAAAAGTTGTTACTTATTTTGTCATTAAAATAGCTACGGTGTCTATGCTTCAATGTTTACCAGATTTTATAAATGTGTAATATATATAAATTCTTGCATGAACAAAATACGAATATGCACCCAAGAAAAATGGTATTTATTTACAAGAAATCAGACATTTCTTAAGGAGTAATTCCATAAAATAAACGGAATCGCTTTCCTCACAATCTAATTAACCCATGATGCACGTGGAACAAGAAAACTGCCTTTTTCCAACTTTTTTCTACATAAGACACTTTCCAGATATAAATTTCCCCCTACAAATCTGTTATTTCACCCGCAAATTACAAGCGTTGGGTAATACTACAAAGGAACTTAAGTATGTATCTGATTGTTGGATTGGGGATTGATAGTGCAATCTTGAAATCTTGGTATTTCGAAATTGAATTTTCGAA
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Reference ( family-127 )      : ATCTTTAATTTGAA-CACTCACGCCAGTTAAT-ATCCGTAAA-TAAATANTTTTTCTAATTGGTATC-ACTTCCAGTTACAATCCTTTGTCGCT------TACATTTA---ATTA-----TCGA-TTTCTAACGTANACAACTAAGTGGCTTCT--CGCTCGC---GCT------------TTCATAGGATGAAGAG---------------CTTC-GTC-----CTNTGAAAAA--CCCCGAGAGAGCGCGAGCGACA----------------CAGAAG--CCACTTT-TAGTTGTCCATTNGGGAAGTTTACGTTAGAAATTNATTAAGCCAATAAATGTAAGCGA-CA-AAGGAT-TGTAAC-TGGAAGTGA-TACCAAT--NAGAAAAATTATTTAT-TT-ACG-GATATT-AACTGGCGTGAGTGTTCAAATTAAAGATTTTAAGTGAGAAAATAGCGGT-TGAAGCGAGCGGGTAT-CCAAAATGGNGTCTTCCC-----A-TTGTGTATTTTTACTA--GG-G-G-TGTTTTGA-T-TT-----TTTTTTTT-TACAC-AAGCC-CCTGTGGTGTCA
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                      ---------------CTTC-ATCT----CTTTGAAAAA--CCCAGAGAGAGCGCGAGCGAC-----------------CAGAAA--GCACTTT-T-GTTGTCCATTTGTGAAATTT----------TTTA--AAGCCATTAAATGTATGCGA-CAGAAGGAT-TGTAACTTGGAAGTAATTCCCAAT--TAGAAAAATTATCTATATT-ACC-GAAATTAAATTGGCGTGAGTGTTCAAATTAAAGATTTTAAGTGAG-AAATAGCGGT-TGAAGCAAGCGagagtttaaaaaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                        GCGCGAGTGACA----------------TA--AG--CCACTT---AGTGGTCCATTTGGGAAGTTTTCGTTAGAAATCGATGAAGCCAATAACTGTATGGGA-CA-ATGGAT-TGGAAC-TGGAAGTGA-TACCAAT--TAGAAATATTATT-------------TATT-AACTGGCATGCGTGTTCAAATGAATGATaagttttaaaaaaaa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGTTCAAATTATAGATTT----------AA-----GT-TGAAGCAAGTGGGTAT-GCAAAATGGTCTCTTCCC-------TTGTGTATATTTTCCAAGGG-G-G-TGTCTTGA-TATTTTTTATTTTTTTC-TACAC-A
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAAGTAA-TGCTAAA--GAGAAAAAT-ATTTAT-TTTAGT-GATACT-AACCGCCATCAATGTTCAAATTAAAGATTTTAAGTGAGCAAATAAGGGT-TAATGCGAGCGAGTAT--AAAAATGtggttttccaatgattgag
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGTTTACGTTAGAAATTGATTAAACCAATTCATGTAAGCGA-CA-AAGGAT-TGGCAC-TGGCAGTGG-TGCCAATTAAAAAAAAAATATTTAT-TT-ACA-GATA------TGACGTGA
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AAGAGTTTAGGTGAGAAAATAGCGGT-TGGAGCGAGCGGGTAT-GCAAAATAGAGTCTTCCC-------TTGTGTACTTTTCCTA--GG-GTG-TGTCGTGA-T-GT-----TTTTCTCT-
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             A--GG-G-G-TGTTTTGA----T-----TTTTTTTC-TGCAC-TAGCG-CCTGTG
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TGTGTATTTTTACTA--GG-G-GGTGTTTTAA-T-TT-----TTTTCT----ACAC-AAGCC-CCTGTGGgtgtatttttactagggggtgttttaatttttttctacacaagcccctgtgg
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cacaggcgctagtgcagaaaaaaaatcaaaacaccccTTTACTA--GGAG-G-TGTTTTGAAT-TT-----TTTTTTTC-TACAC-AAGCC-CCTGTGAT
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GTATTTTTACTA--GG-G-GGTGTTTTGA-T-TT-----TTTTACTG-TACAC-AAGCT-CCTGTGcaga
gi|5                          : ATCTTTAATT-GAA-CACCCACGCCAGTAAATTATCCGTAAAATAAATATTTTTTCTAATTGGTATCTACTTCCAGTTACACTCCTTTGTCGCT------TACATTTA---ATTA-----TTGAATTTCTAATGTACACAACTAAGTGGCTT-T--CGCTCGCACGGCT------------TTCATAGGATGAAGAG---------------CTTC-GTC-----CTATGGAAAA--ACCCGAGAGAGCACGAGTAGCATACTTTCGCTTGCTTGCAGAAG--CCACTTTATGTTTGTCCATTGGGGAAGTTTACGTTAGAAATTGATTAAG-CAAGAAATGCAAGCGA-CA-AAAGAT-TGTAAC-TGGAAGTGA-TACCAAT--GAGAAAAATTATTTAT-TT-ACG-GATATT-AACTGGCGTGAGTGTTCAAATTAAAGATCTTAAGTGAGAAAATAGCGGT-TGAAGCGAACGGGTAT-CCAAAATGGCGTCTTCCCTTCAAG-TTGTGTATTTTTACTA--GG-G-G-TGTTTTGA-T-TT-----TTTTTTTG-TACAC-AAGCC-CCTGT-GTGTCAa
gi|6                          : ATCTTTAATTTGAAACACCCACGCCAGTAAAT-ATCCGTAAA-TAAATATTTTTTCTAATTGGTAT--ACTTCCAGTTACACTCCTTTGTCGCT------TATATTTA---ATTA-----TTGA-TTTCTAATGTACACAACTAAGTGGCTTCT--CGCTCGC---GCT------------TTCATAGGATGAAGAG---------------CTTC-GTC-----CTATGAAAAA--CCCCGAGAGAGCACGAGTGACATACTTTCGCTTGCTG-CAGAAG--CCACTTTATAGTTGTCCATTGGGGAAGTTTACGTTAGAAATTGATTAAGCCAAGAAATGCAAGCGA-CA-AAAGAT-TGTAAC-TGGAAGTGA-TACCAAT--GAGAAAAATTATTTAT-TT-ACG-GATATT-AACTGGCGTGAGTGTTCAAATTAAAGATCTTAAGTGAGAAAATAGCGGT-TGAAGCGAACGGGTAT-CCAAAATGGCGTCTTCCCTTCAAG-TTGTGTATTTTTACTA--GG-G-G-TGTTTTGA-T-TT-----TTTTTTTTGTACAC-AAGCC-CCTGTGGTGTCAatgagtaaggagagaggtactatgtaatacactgaagtcgtatactaatagttttt
gi|9                          :                                                   TTTTTCTAATGTGTTTT-ACTTCCAGTTACAATCCTTTGTTGCTAGTGCTTACATTTATGGGTTAAAAAGTTG---TTC-AACGTATACAACTAAGTG-TTTCTGTCGCTCGC---GCTCTCTTCGGGTTTTTCATAGGATGAAGAGTTCTAAAAAAAAATCCTCCTGTCTTGGTCTGTGAAAAAAACCCCGAAAGAAC-CGAGTGATATTATACTTCGCTTT--CTGTAGATCCATTCT-TAGTTGTCCATTGGGGAAGTTTACGTTAGAAATTGATTAGGTCAATAAATGTAAGCGACCA-ACAGACGCGT-AC-TGAAAGTGA-TATCTAG--TAGGAAAG-CATCTAT-TT-ACGAGATATT-AATTGGCGTGA--GTTC-AATTAAAGA-TTTAAGTGAG--AAT-GAGGTATGAAGCGAGCGGGTATGCC--AATGGAGTTTATCC-----ACTTGTTTATTTTTACTT--GG-G-T-GGTTTTA-----T-----TTTTTTTC-TACA
21 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|1 ): CCAATATTAACAAAATACTTTGTTTGCGTTTTAGCCTCCCCATCTATCCTAGTACCTAAAATTCAAAATTTTGCCTAATACAGTACCGACTGATTTGTCTCTTCTACTGACCAGAATGTAATATAAAAACCTTCATATCAAAAAATACTTATGTCGTACACTAATTATAGCACATGTATAAATACTTACGAGTGTCCTAGCTATCATATCCGTTAATACCTAGATTTTATATCTAAGATCCTGTGTCATCACGTAATAAAATTCTTGCACTGATCCAAAAATACAGAGTATATCTTACCCAACGCATAAAGTTCATTTATTTTACAATCAAGACAATAAGAATTTTCTTAAGGAAAGTAATTCCATAATAATGACTAACCGAGAAGTCGCCTCGTTTCTCTCAATGACTAATCTTACCCATATGGCCTCTGAGAACCAAGAACAACTCCCCTTTTCCAGTCTTTTTCTACAACTCTGCAGCTTGTCCGTCATATCATTTCCCCACACAAACTATAGTATTTTCACGGTGGCGCATAAAATCCACAAGGCTTGGTGCCTATTCTCAAGCTTTGCAAGTCATTAGCTCACAAGCTTCCTTATTTGCCATTGCTGATTTTGGACTATGATCTTATCTGTGGATTCGATATCTGAAT
Unaligned ( gi|2 ): TCTGTCTTATCTTTCAAAATTACATTTACCTAATTCAAGGAAAAACTTCAATATAAAATTAAAATTTGTTACACATTTATTTAGTCATTATAATACTACCATGTCCTATGCTTCAATGTTTACCCTAGATTGAATATAAAAATGGTATATTATAAATTCTTGCTTGGCAAATTTTACAGAAATAATCTTACAGAAAGATAAATGTTCGTTTTGATCTTATATAATCAAAAAATTTTCTTAAGGGGAATGATTCCATAAAATACAAACGAATCGACTTCTCAAAAACTTAAGTGCACCATTATACAACTCGCTTGATAAACAAGAGTTGACTGCTTCACTTTTCCACTTTTTCTACAATTTACACTAATCCCTGAGCTTAATGAATATATCAATTTTTCCCCCTTACATATATACAAGAGTTCATATAGGCTTATTTTCACCCCGCTATAGACATTCACAAGCGCTTCTGTGGTGCGTGCTGTCAAACCACAAAAGGAAATTTAAGTATTGAATTCTTGCATTTTTTGATTGGCCTGATATTTTGTTGAAGTATTGAATCTTCAAACCTTGGACAGTTTCGGAATATTGAATTTGGAATCTTTTGACGATTTTG
Unaligned ( gi|3 ): GCCTAAATTGACATAAAAATTGGTGTTATTGCAGTTTTACCTCCGGTCTTCCAAGTAACTAGATTGTAATTTTGCAATGACAATAGACATCGTGATTATGTATCTAAGCTGGACCGAATAAATAAAACTTCATATAAAAATAAAAAAGTTGTTACTTATTTTGTCATTAAAATAGCTACGGTGTCTATGCTTCAATGTTTACCAGATTTTATAAATGTGTAATATATATAAATTCTTGCATGAACAAAATACGAATATGCACCCAAGAAAAATGGTATTTATTTACAAGAAATCAGACATTTCTTAAGGAGTAATTCCATAAAATAAACGGAATCGCTTTCCTCACAATCTAATTAACCCATGATGCACGTGGAACAAGAAAACTGCCTTTTTCCAACTTTTTTCTACATAAGACACTTTCCAGATATAAATTTCCCCCTACAAATCTGTTATTTCACCCGCAAATTACAAGCGTTGGGTAATACTACAAAGGAACTTAAGTATGTATCTGATTGTTGGATTGGGGATTGATAGTGCAATCTTGAAATCTTGGTATTTCGAAATTGAATTTTCGAA
Unaligned ( gi|4 ): GTTTACTTCCAAAAATGTTACCTCTCTCTCTCTTTTCATTATAAAAAATTAATAAAAGTGTTCAGCATTATAGTCATTAATAAATGCTACCTTATGTCTATGTTCTTTCATGTTTACCTAGATTGTAATAAAATATGCTATTGTAATATTCCTTGCTCGGCAAATTTACAAGAAATATATTTACAGAAGTAAATGTACTTATTTATATAATCAGAAATTTCTTAACGGGTAGTATTCCATTAAAATACAACGGATCGGCTTCCTGACATGAATACTTTACTTAAGTGTGCCCAATATACCCGGTGAACCACCAGAAAACATGCCCTGGCCTTCTATCATTCATCTTTTTGTTCTACAAGACTACACTTTTCCAGTTATTATATCAATTTCCCTCTACAAACTATGTCTTTTTCCCGAAGTTCCACAAGCGCTTCGGGCTCTTAGTATAAACTTATGATGAGCTTATGATTCTTGATTTTGATCTATGGCTGGATTAGTTTGTGATATTAGTAATTTCTGCAAGCTTGAGATTCGAGATATTATATATCGAATTTGGACTTTCTG
Unaligned ( gi|7 ): ATACTATTTATTTCCAAAATTTACCTCTTCTCTTCATAAAAAATTAAAAAAGTTTTTACACATTTTAGTCATTATAAATGCTACCATTCCTATTCTTCAATGTCTACCTAGATTAATTATATGTATTTATAAAATTCTTGCCTTGGCAAATTTTACGAATTAATCTTAGCAAAGCATATGTAATTTATTTTACTAACTCAAAACTTTCTTAAGGAAGTAATTCCATAAATTACAACGGATCGACCTTCTATAACACTAACTGTGCATATACATCGGAACAGAACCGCATTTTCATTTTCTACACTTACACTTTCCATATATATCATTCCCCTACAAACATATAATTTTCCACCGCAATTCACAAGCGCTTGGGGTCTATTAATAACACAACGGAAATTTTGAAGTGATTGATTCTTAGATTTTGATTCGGCTGATTTGATCATTGTAATCCCTTTGAATCTTGGATTTTCGAAT
Unaligned ( gi|8 ): AGCATTGTTACACATTTTAGGTAATATAAATATAAATACTACCATTTCCTATGCTTTCAGAGTTTAACCTAGATTTAGCATAATTGTGTATCATATTCATGTAAATTCTTGCATTGCAAAACTAAGAACATATTTTCACAAGAAAAAATGTATTTGTTTTACATAATCAACAATTGATTTCAGTGGAAGTAATTCCATAATATAGTACGGAATCGCTTTCTTCATATTATTAATGTACCAACATGTTCGTAGAACCAAAAAGCCACCCTTCCACTTTTTTCTACAACGTACATTTTCCAATATAATTATTATATCCCATTTTCCAATATAATTATTATATCCTTTTGCTAGAGATGCAAGCTTTAGTGTTTTCAAGTGCAAAGACACAAGCGCTTGAGTGTATTAACTACAGAACAAATTCGAAGTATGAGACCTTTATTTGGATTGGATGATTTGGATTTAG
Unaligned ( gi|10 ): AAAACGTTGTTACTTATTTTATAGTCATTATAAATACTACGTATCATATCTGTCCAATATACCTTAAATTTTATATAAATGTTGTATATATAAATTCGCATGACAAAAATACAGAAATATCTTACCAAAGAAATATGTATTTATTTACAGAATCAAAAATTTCATAAGGAAGTAATCCATTAAATACAAACGGAATCGCTTTTCTCACAATACTTAATTGTACCCATTTGGCACCGTGGAACCAAGAAACTGCCTTTTCCACTGTTTTCTACAACTGACACTTTCCAGTATATATCATTTCCCCCTACAAACTATATTATTTTTCACGCGCAAAATCACAAGCGCCTTGGGTCTATAATTTGAAGTATGAATTCTTGATTTTGATTGGCTGATTTGGATATTGAATCTTGAATCTTGCGAATGTGTGGATTTCGAATATGAATCTCGAATGAAACCTT
Unaligned ( gi|11 ): AATAAAATGTTAAACTGTATAGTCAATATAAAAGTGCCGGTCCTATGCGTCAAATTTACGAATATACTGGTCATAAATGTGCACCATATAAATCTAATAGCAAAGACTGAAATATCTTTTATAAAGATGAAAAATTAATCAACGAGAGAGGATTAAGGGGAATGTCAATAAAAATAACGCAATGGCTTTCCTCGTAACATTAATGTATGTACCTGACATGCACGAAGAGCAAAGAAACTGGCCCTTCTTCACTTTTCTACAACGTACACTTCCATATAATATAATCCCATGATAACTGAGTACGTTCGGCGTCCAAATCACGAAAAGCTGGTCTATTTAAATACAGACGGAAAATAAAGTATTAAACATATGTATTGATGATCTGAAAACTCGAATCTTTGATTTCGAATATTGAATTCAAATGTC
Unaligned ( gi|13 ): CTTGCATTGCAAAACTACAGAAATATTTGGGCAGAAAAAAATGTAATGCAATGGATTTTACATAATCAGAAAATGATTTAATGGGAAGTAACCAAAAAAAAAAAACAACAACAAAAACCCACAACTGAATCGCTTTCCTTGTAACATTAACGTGTGTACTCACAACATAAAACAATAACATTACTGTTTTAACTTTTTTCTACAACGTACAGATTCCAGAATATATCATTTCCCCCTTTAAACTCTAGTTTTTTAAGCACAGAATCATAAACGCATGGATCTATTAACTACTGAGTAAATTCAAAGAATTAATACTTTATTTGGATTAGATGAGCTGGATGTTGAATCTCAAACCTTGGGTTT
Unaligned ( gi|14 ): ATATAATTGTATATAATATAAATTCTTGCTTGGTAAAAGTACAGAAATATCCTTACAGGAAGAAAAAAATATTAATTTATTACTTAAGGGAAGTAATTCCATACAATACACCGAAATCGCTTTCCTCATAACACTGTGTACCCATATGCACGTGGAACCAAGAAACTGTTCTTTCCACTTTTTTTCAACAACGTACAATTTCCAGTATATACCATTTCCCGCTGCAAACTAGAGTATTTCCACGCGCAAAAATTAAAAGCTAAGTCTATTACCACATAAAAGAATTTATTAAAANCATTCTTTACGCATCGATACGTTTTTGGATATTGAATCTAGAACTTTGGATTTGGAATT
Unaligned ( gi|15 ): TTTCAACTTTTACGCCAGATTTGAACTAAATGTGTACCATATAAATTCTTACATGGCAAAGGTACAAAACATTCTTACGGAAATGAAAATGTATTTGTTTTACATAATCAGAAAATAATATAAGTGGACGTTATTCAATAAGATAAAACGGAATAGCTTTCTTCGTAACATTAATGTATGCAGTACCAAAATGCATGTAGAACCAAGGAACTTCGCTTTCCACTTTTGTCTGTTTCTATTTCACACGCAAAGTCACAAGTGCTTGGGTATATTAAATACAGAGGAAATTCGAAGTATAAAACCTTTATTTGGATGATTTGGATATTG
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Reference ( family-127 )      : ATCTTTAATTTGAAACACCCACGCCAGTAAATTATCCGTAAAATAAATATTTTTTCTAATTGGTATC-ACTTCCAGTTACACTCCTTTGTCGCT------TACATTTA---ATTA-----TTGA-TTTCTAACGTACACAACTAAGTGGCTTCT--CGCTCGC---GCT------------TTCATAGGATGAAGAG---------------CTTC-GTCT----CTNTGAAAAA--CCCCGAGAGAGCGCGAGCGACAT---T-----TC-----CT--CT-CAGAAG--CCACTTT-TAGTTGTCCATTNGGGAAGTTTACGTTAGAAATTGATTAAGCCAATAAATGTANGCGA-CA-AAGGAT-TGTAACT-GGAAGTGAT-ACCAAT--NAGAAAAATTATTTAT-TT-ACG-GATATTAA-CTGGCGTGAGTGTTCAAATTAAAGATTTTAAGTGAGAAAATAGCGGT-TGAAGCGAGCGGGTAT-CCAAAATGGCGTCT-TCCC-----GTTGTGTATTTTTACTA--GG-G-G-TGTTTTGA-T-TT-----TTTTTTTC-TACAC-AAGCC-CCTGTGGTGTCA
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gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AGTTTACGTTAGAAATTGATTAAACCAATTCATGTAAGCGA-CA-AAGGAT-TGGCACT-GGCAGTGGT-GCCAATTAAAAAAAAAATATTTAT-TT-ACA-GATA------TGACGTGA
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AAGAGTTTAGGTGAGAAAATAGCGGT-TGGAGCGAGCGGGTAT-GCAAAATAGAGTCT-TCCC------TTGTGTACTTTTCCTA--GG-GTG-TGTCGTGA-T-GT-----TTTTCT
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     A--GG-G-G-TGTTTTGA----T-----TTTTTTTC-TGCAC-TAGCG-CCTGTGct
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGTGTATTTTTACTA--GG-G-GGTGTTTTAA-T-TT-----T---TTTC-TACAC-AAGCC-CCTGTGGgtgtatttttactagggggtgttttaatttttttctacacaagcccctgtgg
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cacaggcgctagtgcagaaaaaaaatcaaaacaccccTTTACTA--GGAG-G-TGTTTTGAAT-TT-----TTTTTTTC-TACAC-AAGCC-CCTGTGAT
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTATTTTTACTA--GG-G-GGTGTTTTGA-T-TT-----TTTTACTG-TACAC-AAGCT-CCTGTGcaga
gi|5                          : ATCTTTAATT--GAACACCCACGCCAGTAAATTATCCGTAAAATAAATATTTTTTCTAATTGGTATCTACTTCCAGTTACACTCCTTTGTCGCT------TACATTTA---ATTA-----TTGAATTTCTAATGTACACAACTAAGTGGCTT-T--CGCTCGCACGGCT------------TTCATAGGATGAAGAG---------------CTTC-GTC-----CTATGGAAAA--ACCCGAGAGAGCACGAGTAGCATACTT-----TCGCTTGCT--TG-CAGAAG--CCACTTTATGTTTGTCCATTGGGGAAGTTTACGTTAGAAATTGATTAAG-CAAGAAATGCAAGCGA-CA-AAAGAT-TGTAACT-GGAAGTGAT-ACCAAT--GAGAAAAATTATTTAT-TT-ACG-GATATTAA-CTGGCGTGAGTGTTCAAATTAAAGATCTTAAGTGAGAAAATAGCGGT-TGAAGCGAACGGGTAT-CCAAAATGGCGTCT-TCCCTTCAAGTTGTGTATTTTTACTA--GG-G-G-TGTTTTGA-T-TT-----TTTTTTTG-TACAC-AAGCC-CCTGT-GTGTCAa
gi|6                          : ATCTTTAATTTGAAACACCCACGCCAGTAAAT-ATCCGTAAA-TAAATATTTTTTCTAATTGGTAT--ACTTCCAGTTACACTCCTTTGTCGCT------TATATTTA---ATTA-----TTGA-TTTCTAATGTACACAACTAAGTGGCTTCT--CGCTCGC---GCT------------TTCATAGGATGAAGAG---------------CTTC-GTC-----CTATGAAAAA--CCCCGAGAGAGCACGAGTGACATACTT-----TCG----CTTGCTGCAGAAG--CCACTTTATAGTTGTCCATTGGGGAAGTTTACGTTAGAAATTGATTAAGCCAAGAAATGCAAGCGA-CA-AAAGAT-TGTAACT-GGAAGTGAT-ACCAAT--GAGAAAAATTATTTAT-TT-ACG-GATATTAA-CTGGCGTGAGTGTTCAAATTAAAGATCTTAAGTGAGAAAATAGCGGT-TGAAGCGAACGGGTAT-CCAAAATGGCGTCT-TCCCTTCAAGTTGTGTATTTTTACTA--GG-G-G-TGTTTTGA-T-TT-----TTTTTTTTGTACAC-AAGCC-CCTGTGGTGTCAatgagtaaggagagaggtactatgtaatacactgaagtcgtatactaatagttttt
gi|9                          :                                                   TTTTTCTAATGTGTTTT-ACTTCCAGTTACAATCCTTTGTTGCTAGTGCTTACATTTATGGGTTAAAAAGTTG---TTC-AACGTATACAACTAAGTG-TTTCTGTCGCTCGC---GCTCTCTTCGGGTTTTTCATAGGATGAAGAGTTCTAAAAAAAAATCCTCCTGTCTTGGTCTGTGAAAAAAACCCCGAAAGAAC-CGAGTGATAT---TATACTTCG----CT--TT-CTGTAGATCCATTCT-TAGTTGTCCATTGGGGAAGTTTACGTTAGAAATTGATTAGGTCAATAAATGTAAGCGACCA-ACAGACGCGT-ACT-GAAAGTGAT-ATCTAG--TAGGAAAG-CATCTAT-TT-ACGAGATATTAA-TTGGCGTGA--GTTC-AATTAAAGA-TTTAAGTGAG--AAT-GAGGTATGAAGCGAGCGGGTATGCC--AATGGAGTTTATCCA-----CTTGTTTATTTTTACTT--GG-G-T-GGTTTTA-----T-----TTTTTTTC-TACA
21 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|1 ): CCAATATTAACAAAATACTTTGTTTGCGTTTTAGCCTCCCCATCTATCCTAGTACCTAAAATTCAAAATTTTGCCTAATACAGTACCGACTGATTTGTCTCTTCTACTGACCAGAATGTAATATAAAAACCTTCATATCAAAAAATACTTATGTCGTACACTAATTATAGCACATGTATAAATACTTACGAGTGTCCTAGCTATCATATCCGTTAATACCTAGATTTTATATCTAAGATCCTGTGTCATCACGTAATAAAATTCTTGCACTGATCCAAAAATACAGAGTATATCTTACCCAACGCATAAAGTTCATTTATTTTACAATCAAGACAATAAGAATTTTCTTAAGGAAAGTAATTCCATAATAATGACTAACCGAGAAGTCGCCTCGTTTCTCTCAATGACTAATCTTACCCATATGGCCTCTGAGAACCAAGAACAACTCCCCTTTTCCAGTCTTTTTCTACAACTCTGCAGCTTGTCCGTCATATCATTTCCCCACACAAACTATAGTATTTTCACGGTGGCGCATAAAATCCACAAGGCTTGGTGCCTATTCTCAAGCTTTGCAAGTCATTAGCTCACAAGCTTCCTTATTTGCCATTGCTGATTTTGGACTATGATCTTATCTGTGGATTCGATATCTGAAT
Unaligned ( gi|2 ): TCTGTCTTATCTTTCAAAATTACATTTACCTAATTCAAGGAAAAACTTCAATATAAAATTAAAATTTGTTACACATTTATTTAGTCATTATAATACTACCATGTCCTATGCTTCAATGTTTACCCTAGATTGAATATAAAAATGGTATATTATAAATTCTTGCTTGGCAAATTTTACAGAAATAATCTTACAGAAAGATAAATGTTCGTTTTGATCTTATATAATCAAAAAATTTTCTTAAGGGGAATGATTCCATAAAATACAAACGAATCGACTTCTCAAAAACTTAAGTGCACCATTATACAACTCGCTTGATAAACAAGAGTTGACTGCTTCACTTTTCCACTTTTTCTACAATTTACACTAATCCCTGAGCTTAATGAATATATCAATTTTTCCCCCTTACATATATACAAGAGTTCATATAGGCTTATTTTCACCCCGCTATAGACATTCACAAGCGCTTCTGTGGTGCGTGCTGTCAAACCACAAAAGGAAATTTAAGTATTGAATTCTTGCATTTTTTGATTGGCCTGATATTTTGTTGAAGTATTGAATCTTCAAACCTTGGACAGTTTCGGAATATTGAATTTGGAATCTTTTGACGATTTTG
Unaligned ( gi|3 ): GCCTAAATTGACATAAAAATTGGTGTTATTGCAGTTTTACCTCCGGTCTTCCAAGTAACTAGATTGTAATTTTGCAATGACAATAGACATCGTGATTATGTATCTAAGCTGGACCGAATAAATAAAACTTCATATAAAAATAAAAAAGTTGTTACTTATTTTGTCATTAAAATAGCTACGGTGTCTATGCTTCAATGTTTACCAGATTTTATAAATGTGTAATATATATAAATTCTTGCATGAACAAAATACGAATATGCACCCAAGAAAAATGGTATTTATTTACAAGAAATCAGACATTTCTTAAGGAGTAATTCCATAAAATAAACGGAATCGCTTTCCTCACAATCTAATTAACCCATGATGCACGTGGAACAAGAAAACTGCCTTTTTCCAACTTTTTTCTACATAAGACACTTTCCAGATATAAATTTCCCCCTACAAATCTGTTATTTCACCCGCAAATTACAAGCGTTGGGTAATACTACAAAGGAACTTAAGTATGTATCTGATTGTTGGATTGGGGATTGATAGTGCAATCTTGAAATCTTGGTATTTCGAAATTGAATTTTCGAA
Unaligned ( gi|4 ): GTTTACTTCCAAAAATGTTACCTCTCTCTCTCTTTTCATTATAAAAAATTAATAAAAGTGTTCAGCATTATAGTCATTAATAAATGCTACCTTATGTCTATGTTCTTTCATGTTTACCTAGATTGTAATAAAATATGCTATTGTAATATTCCTTGCTCGGCAAATTTACAAGAAATATATTTACAGAAGTAAATGTACTTATTTATATAATCAGAAATTTCTTAACGGGTAGTATTCCATTAAAATACAACGGATCGGCTTCCTGACATGAATACTTTACTTAAGTGTGCCCAATATACCCGGTGAACCACCAGAAAACATGCCCTGGCCTTCTATCATTCATCTTTTTGTTCTACAAGACTACACTTTTCCAGTTATTATATCAATTTCCCTCTACAAACTATGTCTTTTTCCCGAAGTTCCACAAGCGCTTCGGGCTCTTAGTATAAACTTATGATGAGCTTATGATTCTTGATTTTGATCTATGGCTGGATTAGTTTGTGATATTAGTAATTTCTGCAAGCTTGAGATTCGAGATATTATATATCGAATTTGGACTTTCTG
Unaligned ( gi|7 ): ATACTATTTATTTCCAAAATTTACCTCTTCTCTTCATAAAAAATTAAAAAAGTTTTTACACATTTTAGTCATTATAAATGCTACCATTCCTATTCTTCAATGTCTACCTAGATTAATTATATGTATTTATAAAATTCTTGCCTTGGCAAATTTTACGAATTAATCTTAGCAAAGCATATGTAATTTATTTTACTAACTCAAAACTTTCTTAAGGAAGTAATTCCATAAATTACAACGGATCGACCTTCTATAACACTAACTGTGCATATACATCGGAACAGAACCGCATTTTCATTTTCTACACTTACACTTTCCATATATATCATTCCCCTACAAACATATAATTTTCCACCGCAATTCACAAGCGCTTGGGGTCTATTAATAACACAACGGAAATTTTGAAGTGATTGATTCTTAGATTTTGATTCGGCTGATTTGATCATTGTAATCCCTTTGAATCTTGGATTTTCGAAT
Unaligned ( gi|8 ): AGCATTGTTACACATTTTAGGTAATATAAATATAAATACTACCATTTCCTATGCTTTCAGAGTTTAACCTAGATTTAGCATAATTGTGTATCATATTCATGTAAATTCTTGCATTGCAAAACTAAGAACATATTTTCACAAGAAAAAATGTATTTGTTTTACATAATCAACAATTGATTTCAGTGGAAGTAATTCCATAATATAGTACGGAATCGCTTTCTTCATATTATTAATGTACCAACATGTTCGTAGAACCAAAAAGCCACCCTTCCACTTTTTTCTACAACGTACATTTTCCAATATAATTATTATATCCCATTTTCCAATATAATTATTATATCCTTTTGCTAGAGATGCAAGCTTTAGTGTTTTCAAGTGCAAAGACACAAGCGCTTGAGTGTATTAACTACAGAACAAATTCGAAGTATGAGACCTTTATTTGGATTGGATGATTTGGATTTAG
Unaligned ( gi|10 ): AAAACGTTGTTACTTATTTTATAGTCATTATAAATACTACGTATCATATCTGTCCAATATACCTTAAATTTTATATAAATGTTGTATATATAAATTCGCATGACAAAAATACAGAAATATCTTACCAAAGAAATATGTATTTATTTACAGAATCAAAAATTTCATAAGGAAGTAATCCATTAAATACAAACGGAATCGCTTTTCTCACAATACTTAATTGTACCCATTTGGCACCGTGGAACCAAGAAACTGCCTTTTCCACTGTTTTCTACAACTGACACTTTCCAGTATATATCATTTCCCCCTACAAACTATATTATTTTTCACGCGCAAAATCACAAGCGCCTTGGGTCTATAATTTGAAGTATGAATTCTTGATTTTGATTGGCTGATTTGGATATTGAATCTTGAATCTTGCGAATGTGTGGATTTCGAATATGAATCTCGAATGAAACCTT
Unaligned ( gi|11 ): AATAAAATGTTAAACTGTATAGTCAATATAAAAGTGCCGGTCCTATGCGTCAAATTTACGAATATACTGGTCATAAATGTGCACCATATAAATCTAATAGCAAAGACTGAAATATCTTTTATAAAGATGAAAAATTAATCAACGAGAGAGGATTAAGGGGAATGTCAATAAAAATAACGCAATGGCTTTCCTCGTAACATTAATGTATGTACCTGACATGCACGAAGAGCAAAGAAACTGGCCCTTCTTCACTTTTCTACAACGTACACTTCCATATAATATAATCCCATGATAACTGAGTACGTTCGGCGTCCAAATCACGAAAAGCTGGTCTATTTAAATACAGACGGAAAATAAAGTATTAAACATATGTATTGATGATCTGAAAACTCGAATCTTTGATTTCGAATATTGAATTCAAATGTC
Unaligned ( gi|13 ): CTTGCATTGCAAAACTACAGAAATATTTGGGCAGAAAAAAATGTAATGCAATGGATTTTACATAATCAGAAAATGATTTAATGGGAAGTAACCAAAAAAAAAAAACAACAACAAAAACCCACAACTGAATCGCTTTCCTTGTAACATTAACGTGTGTACTCACAACATAAAACAATAACATTACTGTTTTAACTTTTTTCTACAACGTACAGATTCCAGAATATATCATTTCCCCCTTTAAACTCTAGTTTTTTAAGCACAGAATCATAAACGCATGGATCTATTAACTACTGAGTAAATTCAAAGAATTAATACTTTATTTGGATTAGATGAGCTGGATGTTGAATCTCAAACCTTGGGTTT
Unaligned ( gi|14 ): ATATAATTGTATATAATATAAATTCTTGCTTGGTAAAAGTACAGAAATATCCTTACAGGAAGAAAAAAATATTAATTTATTACTTAAGGGAAGTAATTCCATACAATACACCGAAATCGCTTTCCTCATAACACTGTGTACCCATATGCACGTGGAACCAAGAAACTGTTCTTTCCACTTTTTTTCAACAACGTACAATTTCCAGTATATACCATTTCCCGCTGCAAACTAGAGTATTTCCACGCGCAAAAATTAAAAGCTAAGTCTATTACCACATAAAAGAATTTATTAAAANCATTCTTTACGCATCGATACGTTTTTGGATATTGAATCTAGAACTTTGGATTTGGAATT
Unaligned ( gi|15 ): TTTCAACTTTTACGCCAGATTTGAACTAAATGTGTACCATATAAATTCTTACATGGCAAAGGTACAAAACATTCTTACGGAAATGAAAATGTATTTGTTTTACATAATCAGAAAATAATATAAGTGGACGTTATTCAATAAGATAAAACGGAATAGCTTTCTTCGTAACATTAATGTATGCAGTACCAAAATGCATGTAGAACCAAGGAACTTCGCTTTCCACTTTTGTCTGTTTCTATTTCACACGCAAAGTCACAAGTGCTTGGGTATATTAAATACAGAGGAAATTCGAAGTATAAAACCTTTATTTGGATGATTTGGATATTG
Unaligned ( gi|16 ): AAGGGAAGCAATTCATAAATTACAAGGAATCGCAACATTCCTCGGAACATTAATTGCCTAATGCACGTAGAAAAGAAAACTTCGCTGCTTTCTACATTTTTTACACATACGTACCACCATTTCCAGAAATATATAATATCACTTCGCAAACTATAGTATTTCAGCCAAAATTGGATCTATAATTACTGGGGAAATTTCGAAGAATGATCCTTTACCTTAACTGGAAGATTTGGATATTGAATATTCGAATCTCAGATTTCGAA
Unaligned ( gi|19 ): ATTTCCACCCTGAAACTATAATTTTCCACGAGCAAAAGTTGGCGAGCGACTTGGATCTATAATTACTGAGAAGAAATTCGAAGTAGACTCCTTTATTTTTATTGGATCATGTGACTGAGGATATTTGATCTGGAATCTTAAATTTCGAATCTATGCGAAATTTGAAATCTCGTAGTATTGGAATTTCGAATGTCGAATGAACCTTCTGGGTTCGTA
Unaligned ( gi|20 ): ATGGATTCGTTTTCCTCTTCTCGTTAATTAATGTACATACCAATAAGCAACCTAACCAAGAAACTGCCCTTTCCCCTTTTCTATACAAGACTTTTAATATTTCTTATTTCCCCCTTCATTGTAGTTTTTCACGCAACAAATCTCAAGACCTCGGGTCTATTAACTACAGAGGAAATTCGAAGTGATTTGGATATTGA
Unaligned ( gi|22 ): CATATATCATTTCCCCCTACAAAGTATAGTATTTTCTTGCCCAAAACCACAAGCGCTTGTGTCTATTTAAAACTTTGAAATATGAATTCTTCATTTTGATTGGCTGATTTGGATATTGAATAACGAATCTTGAATC
Unaligned ( gi|26 ): TATATGTTACACATTTATGTCTATACAAATACTACCATTTCCTATATGCTGTTAAAGTTTATCTAGATTTGATATAAATGTGTACCAGATACTATCTTGCAT
Unaligned ( gi|28 ): TCCAATATTGACAAAATATTTTGTTTTGCGTTTTACCTCCGCCTCATCCTAGTACCTAAAATTAAAATTTTGCAATGACAGTAGCCGACGTGATTGT
Unaligned ( gi|30 ): CAAGGTCCAGATATCATTTCCCCCTGCAATAAAATATTGTACTTTTGCAAAATAAACACTTTTCTTTATTTA
Unaligned ( gi|31 ): ATATTAAATCATACGAAGTATGAATCCTTTATTTTGATTGGCTGATTTCGATATTGAATCTCGGATTTTG
Unaligned ( gi|32 ): CGATGAATCCTTTTATTTTGATTGACTGATTTGGATAGTGAATCTCGAATATTG
Unaligned ( gi|35 ): TCGGAAGTTGGAATCTCGTAAGAAACCTCTGG






Alignments
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lowQualScore                  :           11                    1         1                       22                          333333        222    33333   22                             11       222   666666666666                555555555555555        33333          11                      00000000000000000000000             222                                                                                                                                                                                              11                   333333                                 1111111111                                 
lowQualScore                  :           88                    5         5                       55                          888888        333    33333   00    7  0               6   6 88       333   888888888888                000000000000000    8   77777  1       11            3    0    66666666666666666666666    99       222          1         8             66               1    5  5      5   1   5         66     777       0       5  5  99        55                                   9    0     5                00        3    6   5 222222                55  4 4 8        5555555555        4     5     5            
lowQualScore                  :           ..                    .         .                       ..                          ......        ...    .....   ..    .  .               .   . ..       ...   ............                ...............    .   .....  .       ..            .    .    .......................    ..       ...          .         .             ..               .    .  .      .   .   .         ..     ...       .       .  .  ..        ..                                   .    .     .                ..        .    .   . ......                ..  . . .        ..........        .     .     .            
lowQualScore                  :           00                    5         5                       33                          333333        333    33333   77    3  7               7   7 33       333   333333333333                000000000000000    0   44444  0       00            7    7    00000000000000000000000    22       222          0         7             33               0    7  7      7   4   7         00     999       4       0  0  55        22                                   2    1     0                00        7    7   7 999999                00  0 0 0        2222222222        4     0     7            
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Reference ( family-127 )      : ATCTTTAATTTGGAACACCCACGCCAGTAAATTATCCGTAAAATAAATATTTTTTCTAATTGGTATC-ACTTCCAGTTACACTCCTTTGTCGCT------TACATTTA---ATTA-----TTGA-TTTCTAACGTACACAACTAAGTGGCTTCT--CGCTCGC---GCT------------TTCATAGGATGAAGAG---------------CTTC-GTCT----CTNTGAAAAA--CCCCGAGAGAGCGCGAGCGACAT---T-----TCGCTT-----CAGAAG--CCACTTT-TAGTTGTCCATTNGGGAAGTTTACGTTAGAAATTGATTAAGCCAATAAATGTANGCGA-CA-AAGGAT-TGTAACT-GGAAGTGAT-ACCAAT--NAGAAAAATTATTTAT-TT-ACG-GATATTAA-CTGGCGTGAGTGTTCAAATTAAAGATTTTAAGTGAGAAAATAGCGGT-TGAAGCGAGCGGGTAT-CCAAAATGGCGTCT-TCC-C------TTGTGTATTTTTACTA--GG-G-G-TGTTTTGA-T-TT-----TTTTTTTC-TACAC-AAGCC-CCTGTGGTGTCA
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                      ---------------CTTC-ATCT----CTTTGAAAAA--CCCAGAGAGAGCGCGAGCGAC----------------------CAGAAA--GCACTTT-T-GTTGTCCATTTGTGAAATTT----------TTTA--AAGCCATTAAATGTATGCGA-CAGAAGGAT-TGTAACTTGGAAGTAATTCCCAAT--TAGAAAAATTATCTATATT-ACC-GAAATTAAATTGGCGTGAGTGTTCAAATTAAAGATTTTAAGTGAG-AAATAGCGGT-TGAAGCAAGCGagagtttaaaaaa
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gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAGAGTTTAGGTGAGAAAATAGCGGT-TGGAGCGAGCGGGTAT-GCAAAATAGAGTCT-TCC-C------TTGTGTACTTTTCCTA--GG-GTG-TGTCGTGA-T-GT-----TTTTCT
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A--GG-G-G-TGTTTTGA----T-----TTTTTTTC-TGCAC-TAGCG-CCTGTGct
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CC-C------CTGTGTATTTTTACTA--GG-G-GGTGTTTTAA-T-TT-----T---TTTC-TACAC-AAGCC-CCTGTGGgtgtatttttactagggggtgttttaatttttttctacacaagcccctgtgg
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cacaggcgctagtgcagaaaaaaaatcaaaacaTTTACTA--GGAG-G-TGTTTTGAAT-TT-----TTTTTTTC-TACAC-AAGCC-CCTGTGAT
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GTATTTTTACTA--GG-G-GGTGTTTTGA-T-TT-----TTTTACTG-TACAC-AAGCT-CCTGTGcaga
gi|5                          : ATCTTTAATT--GAACACCCACGCCAGTAAATTATCCGTAAAATAAATATTTTTTCTAATTGGTATCTACTTCCAGTTACACTCCTTTGTCGCT------TACATTTA---ATTA-----TTGAATTTCTAATGTACACAACTAAGTGGCTT-T--CGCTCGCACGGCT------------TTCATAGGATGAAGAG---------------CTTC-GTC-----CTATGGAAAA--ACCCGAGAGAGCACGAGTAGCATACTT-----TCGCTTGCTTGCAGAAG--CCACTTTATGTTTGTCCATTGGGGAAGTTTACGTTAGAAATTGATTAAG-CAAGAAATGCAAGCGA-CA-AAAGAT-TGTAACT-GGAAGTGAT-ACCAAT--GAGAAAAATTATTTAT-TT-ACG-GATATTAA-CTGGCGTGAGTGTTCAAATTAAAGATCTTAAGTGAGAAAATAGCGGT-TGAAGCGAACGGGTAT-CCAAAATGGCGTCT-TCC-CTTCAAGTTGTGTATTTTTACTA--GG-G-G-TGTTTTGA-T-TT-----TTTTTTTG-TACAC-AAGCC-CCTGT-GTGTCAa
gi|6                          : ATCTTTAATTTGAAACACCCACGCCAGTAAAT-ATCCGTAAA-TAAATATTTTTTCTAATTGGTAT--ACTTCCAGTTACACTCCTTTGTCGCT------TATATTTA---ATTA-----TTGA-TTTCTAATGTACACAACTAAGTGGCTTCT--CGCTCGC---GCT------------TTCATAGGATGAAGAG---------------CTTC-GTC-----CTATGAAAAA--CCCCGAGAGAGCACGAGTGACATACTT-----TCGCTTGCTG-CAGAAG--CCACTTTATAGTTGTCCATTGGGGAAGTTTACGTTAGAAATTGATTAAGCCAAGAAATGCAAGCGA-CA-AAAGAT-TGTAACT-GGAAGTGAT-ACCAAT--GAGAAAAATTATTTAT-TT-ACG-GATATTAA-CTGGCGTGAGTGTTCAAATTAAAGATCTTAAGTGAGAAAATAGCGGT-TGAAGCGAACGGGTAT-CCAAAATGGCGTCT-TCC-CTTCAAGTTGTGTATTTTTACTA--GG-G-G-TGTTTTGA-T-TT-----TTTTTTTTGTACAC-AAGCC-CCTGTGGTGTCAatgagtaaggagagaggtactatgtaatacactgaagtcgtatactaatagttttt
gi|9                          :                                                   TTTTTCTAATGTGTTTT-ACTTCCAGTTACAATCCTTTGTTGCTAGTGCTTACATTTATGGGTTAAAAAGTTG---TTC-AACGTATACAACTAAGTG-TTTCTGTCGCTCGC---GCTCTCTTCGGGTTTTTCATAGGATGAAGAGTTCTAAAAAAAAATCCTCCTGTCTTGGTCTGTGAAAAAAACCCCGAAAGAAC-CGAGTGATAT---TATACTTCGCTTT----CTGTAGATCCATTCT-TAGTTGTCCATTGGGGAAGTTTACGTTAGAAATTGATTAGGTCAATAAATGTAAGCGACCA-ACAGACGCGT-ACT-GAAAGTGAT-ATCTAG--TAGGAAAG-CATCTAT-TT-ACGAGATATTAA-TTGGCGTGA--GTTC-AATTAAAGA-TTTAAGTGAG--AAT-GAGGTATGAAGCGAGCGGGTATGCC--AATGGAGTTTATCCAC------TTGTTTATTTTTACTT--GG-G-T-GGTTTTA-----T-----TTTTTTTC-TACA
21 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|1 ): CCAATATTAACAAAATACTTTGTTTGCGTTTTAGCCTCCCCATCTATCCTAGTACCTAAAATTCAAAATTTTGCCTAATACAGTACCGACTGATTTGTCTCTTCTACTGACCAGAATGTAATATAAAAACCTTCATATCAAAAAATACTTATGTCGTACACTAATTATAGCACATGTATAAATACTTACGAGTGTCCTAGCTATCATATCCGTTAATACCTAGATTTTATATCTAAGATCCTGTGTCATCACGTAATAAAATTCTTGCACTGATCCAAAAATACAGAGTATATCTTACCCAACGCATAAAGTTCATTTATTTTACAATCAAGACAATAAGAATTTTCTTAAGGAAAGTAATTCCATAATAATGACTAACCGAGAAGTCGCCTCGTTTCTCTCAATGACTAATCTTACCCATATGGCCTCTGAGAACCAAGAACAACTCCCCTTTTCCAGTCTTTTTCTACAACTCTGCAGCTTGTCCGTCATATCATTTCCCCACACAAACTATAGTATTTTCACGGTGGCGCATAAAATCCACAAGGCTTGGTGCCTATTCTCAAGCTTTGCAAGTCATTAGCTCACAAGCTTCCTTATTTGCCATTGCTGATTTTGGACTATGATCTTATCTGTGGATTCGATATCTGAAT
Unaligned ( gi|2 ): TCTGTCTTATCTTTCAAAATTACATTTACCTAATTCAAGGAAAAACTTCAATATAAAATTAAAATTTGTTACACATTTATTTAGTCATTATAATACTACCATGTCCTATGCTTCAATGTTTACCCTAGATTGAATATAAAAATGGTATATTATAAATTCTTGCTTGGCAAATTTTACAGAAATAATCTTACAGAAAGATAAATGTTCGTTTTGATCTTATATAATCAAAAAATTTTCTTAAGGGGAATGATTCCATAAAATACAAACGAATCGACTTCTCAAAAACTTAAGTGCACCATTATACAACTCGCTTGATAAACAAGAGTTGACTGCTTCACTTTTCCACTTTTTCTACAATTTACACTAATCCCTGAGCTTAATGAATATATCAATTTTTCCCCCTTACATATATACAAGAGTTCATATAGGCTTATTTTCACCCCGCTATAGACATTCACAAGCGCTTCTGTGGTGCGTGCTGTCAAACCACAAAAGGAAATTTAAGTATTGAATTCTTGCATTTTTTGATTGGCCTGATATTTTGTTGAAGTATTGAATCTTCAAACCTTGGACAGTTTCGGAATATTGAATTTGGAATCTTTTGACGATTTTG
Unaligned ( gi|3 ): GCCTAAATTGACATAAAAATTGGTGTTATTGCAGTTTTACCTCCGGTCTTCCAAGTAACTAGATTGTAATTTTGCAATGACAATAGACATCGTGATTATGTATCTAAGCTGGACCGAATAAATAAAACTTCATATAAAAATAAAAAAGTTGTTACTTATTTTGTCATTAAAATAGCTACGGTGTCTATGCTTCAATGTTTACCAGATTTTATAAATGTGTAATATATATAAATTCTTGCATGAACAAAATACGAATATGCACCCAAGAAAAATGGTATTTATTTACAAGAAATCAGACATTTCTTAAGGAGTAATTCCATAAAATAAACGGAATCGCTTTCCTCACAATCTAATTAACCCATGATGCACGTGGAACAAGAAAACTGCCTTTTTCCAACTTTTTTCTACATAAGACACTTTCCAGATATAAATTTCCCCCTACAAATCTGTTATTTCACCCGCAAATTACAAGCGTTGGGTAATACTACAAAGGAACTTAAGTATGTATCTGATTGTTGGATTGGGGATTGATAGTGCAATCTTGAAATCTTGGTATTTCGAAATTGAATTTTCGAA
Unaligned ( gi|4 ): GTTTACTTCCAAAAATGTTACCTCTCTCTCTCTTTTCATTATAAAAAATTAATAAAAGTGTTCAGCATTATAGTCATTAATAAATGCTACCTTATGTCTATGTTCTTTCATGTTTACCTAGATTGTAATAAAATATGCTATTGTAATATTCCTTGCTCGGCAAATTTACAAGAAATATATTTACAGAAGTAAATGTACTTATTTATATAATCAGAAATTTCTTAACGGGTAGTATTCCATTAAAATACAACGGATCGGCTTCCTGACATGAATACTTTACTTAAGTGTGCCCAATATACCCGGTGAACCACCAGAAAACATGCCCTGGCCTTCTATCATTCATCTTTTTGTTCTACAAGACTACACTTTTCCAGTTATTATATCAATTTCCCTCTACAAACTATGTCTTTTTCCCGAAGTTCCACAAGCGCTTCGGGCTCTTAGTATAAACTTATGATGAGCTTATGATTCTTGATTTTGATCTATGGCTGGATTAGTTTGTGATATTAGTAATTTCTGCAAGCTTGAGATTCGAGATATTATATATCGAATTTGGACTTTCTG
Unaligned ( gi|7 ): ATACTATTTATTTCCAAAATTTACCTCTTCTCTTCATAAAAAATTAAAAAAGTTTTTACACATTTTAGTCATTATAAATGCTACCATTCCTATTCTTCAATGTCTACCTAGATTAATTATATGTATTTATAAAATTCTTGCCTTGGCAAATTTTACGAATTAATCTTAGCAAAGCATATGTAATTTATTTTACTAACTCAAAACTTTCTTAAGGAAGTAATTCCATAAATTACAACGGATCGACCTTCTATAACACTAACTGTGCATATACATCGGAACAGAACCGCATTTTCATTTTCTACACTTACACTTTCCATATATATCATTCCCCTACAAACATATAATTTTCCACCGCAATTCACAAGCGCTTGGGGTCTATTAATAACACAACGGAAATTTTGAAGTGATTGATTCTTAGATTTTGATTCGGCTGATTTGATCATTGTAATCCCTTTGAATCTTGGATTTTCGAAT
Unaligned ( gi|8 ): AGCATTGTTACACATTTTAGGTAATATAAATATAAATACTACCATTTCCTATGCTTTCAGAGTTTAACCTAGATTTAGCATAATTGTGTATCATATTCATGTAAATTCTTGCATTGCAAAACTAAGAACATATTTTCACAAGAAAAAATGTATTTGTTTTACATAATCAACAATTGATTTCAGTGGAAGTAATTCCATAATATAGTACGGAATCGCTTTCTTCATATTATTAATGTACCAACATGTTCGTAGAACCAAAAAGCCACCCTTCCACTTTTTTCTACAACGTACATTTTCCAATATAATTATTATATCCCATTTTCCAATATAATTATTATATCCTTTTGCTAGAGATGCAAGCTTTAGTGTTTTCAAGTGCAAAGACACAAGCGCTTGAGTGTATTAACTACAGAACAAATTCGAAGTATGAGACCTTTATTTGGATTGGATGATTTGGATTTAG
Unaligned ( gi|10 ): AAAACGTTGTTACTTATTTTATAGTCATTATAAATACTACGTATCATATCTGTCCAATATACCTTAAATTTTATATAAATGTTGTATATATAAATTCGCATGACAAAAATACAGAAATATCTTACCAAAGAAATATGTATTTATTTACAGAATCAAAAATTTCATAAGGAAGTAATCCATTAAATACAAACGGAATCGCTTTTCTCACAATACTTAATTGTACCCATTTGGCACCGTGGAACCAAGAAACTGCCTTTTCCACTGTTTTCTACAACTGACACTTTCCAGTATATATCATTTCCCCCTACAAACTATATTATTTTTCACGCGCAAAATCACAAGCGCCTTGGGTCTATAATTTGAAGTATGAATTCTTGATTTTGATTGGCTGATTTGGATATTGAATCTTGAATCTTGCGAATGTGTGGATTTCGAATATGAATCTCGAATGAAACCTT
Unaligned ( gi|11 ): AATAAAATGTTAAACTGTATAGTCAATATAAAAGTGCCGGTCCTATGCGTCAAATTTACGAATATACTGGTCATAAATGTGCACCATATAAATCTAATAGCAAAGACTGAAATATCTTTTATAAAGATGAAAAATTAATCAACGAGAGAGGATTAAGGGGAATGTCAATAAAAATAACGCAATGGCTTTCCTCGTAACATTAATGTATGTACCTGACATGCACGAAGAGCAAAGAAACTGGCCCTTCTTCACTTTTCTACAACGTACACTTCCATATAATATAATCCCATGATAACTGAGTACGTTCGGCGTCCAAATCACGAAAAGCTGGTCTATTTAAATACAGACGGAAAATAAAGTATTAAACATATGTATTGATGATCTGAAAACTCGAATCTTTGATTTCGAATATTGAATTCAAATGTC
Unaligned ( gi|13 ): CTTGCATTGCAAAACTACAGAAATATTTGGGCAGAAAAAAATGTAATGCAATGGATTTTACATAATCAGAAAATGATTTAATGGGAAGTAACCAAAAAAAAAAAACAACAACAAAAACCCACAACTGAATCGCTTTCCTTGTAACATTAACGTGTGTACTCACAACATAAAACAATAACATTACTGTTTTAACTTTTTTCTACAACGTACAGATTCCAGAATATATCATTTCCCCCTTTAAACTCTAGTTTTTTAAGCACAGAATCATAAACGCATGGATCTATTAACTACTGAGTAAATTCAAAGAATTAATACTTTATTTGGATTAGATGAGCTGGATGTTGAATCTCAAACCTTGGGTTT
Unaligned ( gi|14 ): ATATAATTGTATATAATATAAATTCTTGCTTGGTAAAAGTACAGAAATATCCTTACAGGAAGAAAAAAATATTAATTTATTACTTAAGGGAAGTAATTCCATACAATACACCGAAATCGCTTTCCTCATAACACTGTGTACCCATATGCACGTGGAACCAAGAAACTGTTCTTTCCACTTTTTTTCAACAACGTACAATTTCCAGTATATACCATTTCCCGCTGCAAACTAGAGTATTTCCACGCGCAAAAATTAAAAGCTAAGTCTATTACCACATAAAAGAATTTATTAAAANCATTCTTTACGCATCGATACGTTTTTGGATATTGAATCTAGAACTTTGGATTTGGAATT
Unaligned ( gi|15 ): TTTCAACTTTTACGCCAGATTTGAACTAAATGTGTACCATATAAATTCTTACATGGCAAAGGTACAAAACATTCTTACGGAAATGAAAATGTATTTGTTTTACATAATCAGAAAATAATATAAGTGGACGTTATTCAATAAGATAAAACGGAATAGCTTTCTTCGTAACATTAATGTATGCAGTACCAAAATGCATGTAGAACCAAGGAACTTCGCTTTCCACTTTTGTCTGTTTCTATTTCACACGCAAAGTCACAAGTGCTTGGGTATATTAAATACAGAGGAAATTCGAAGTATAAAACCTTTATTTGGATGATTTGGATATTG
Unaligned ( gi|16 ): AAGGGAAGCAATTCATAAATTACAAGGAATCGCAACATTCCTCGGAACATTAATTGCCTAATGCACGTAGAAAAGAAAACTTCGCTGCTTTCTACATTTTTTACACATACGTACCACCATTTCCAGAAATATATAATATCACTTCGCAAACTATAGTATTTCAGCCAAAATTGGATCTATAATTACTGGGGAAATTTCGAAGAATGATCCTTTACCTTAACTGGAAGATTTGGATATTGAATATTCGAATCTCAGATTTCGAA
Unaligned ( gi|19 ): ATTTCCACCCTGAAACTATAATTTTCCACGAGCAAAAGTTGGCGAGCGACTTGGATCTATAATTACTGAGAAGAAATTCGAAGTAGACTCCTTTATTTTTATTGGATCATGTGACTGAGGATATTTGATCTGGAATCTTAAATTTCGAATCTATGCGAAATTTGAAATCTCGTAGTATTGGAATTTCGAATGTCGAATGAACCTTCTGGGTTCGTA
Unaligned ( gi|20 ): ATGGATTCGTTTTCCTCTTCTCGTTAATTAATGTACATACCAATAAGCAACCTAACCAAGAAACTGCCCTTTCCCCTTTTCTATACAAGACTTTTAATATTTCTTATTTCCCCCTTCATTGTAGTTTTTCACGCAACAAATCTCAAGACCTCGGGTCTATTAACTACAGAGGAAATTCGAAGTGATTTGGATATTGA
Unaligned ( gi|22 ): CATATATCATTTCCCCCTACAAAGTATAGTATTTTCTTGCCCAAAACCACAAGCGCTTGTGTCTATTTAAAACTTTGAAATATGAATTCTTCATTTTGATTGGCTGATTTGGATATTGAATAACGAATCTTGAATC
Unaligned ( gi|26 ): TATATGTTACACATTTATGTCTATACAAATACTACCATTTCCTATATGCTGTTAAAGTTTATCTAGATTTGATATAAATGTGTACCAGATACTATCTTGCAT
Unaligned ( gi|28 ): TCCAATATTGACAAAATATTTTGTTTTGCGTTTTACCTCCGCCTCATCCTAGTACCTAAAATTAAAATTTTGCAATGACAGTAGCCGACGTGATTGT
Unaligned ( gi|30 ): CAAGGTCCAGATATCATTTCCCCCTGCAATAAAATATTGTACTTTTGCAAAATAAACACTTTTCTTTATTTA
Unaligned ( gi|31 ): ATATTAAATCATACGAAGTATGAATCCTTTATTTTGATTGGCTGATTTCGATATTGAATCTCGGATTTTG
Unaligned ( gi|32 ): CGATGAATCCTTTTATTTTGATTGACTGATTTGGATAGTGAATCTCGAATATTG
Unaligned ( gi|35 ): TCGGAAGTTGGAATCTCGTAAGAAACCTCTGG






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Reference ( family-127 )      : ATCTTTAATTTGGAACACCCACGCCAGTAAATTATCCGTAAAATAAATATTTTTTCTAATTGGTATC-ACTTCCAGTTACACTCCTTTGTCGCT------TACATTTA---ATTA-----TTGA-TTTCTAACGTACACAACTAAGTGGCTTCT--CGCTCGC---GCT------------TTCATAGGATGAAGAG---------------CTTC-GTCT----CTNTGAAAAA--CCCCGAGAGAGCGCGAGCGACAT---T-----TCGCTT-----CAGAAG--CCACTTT-TAGTTGTCCATTNGGGAAGTTTACGTTAGAAATTGATTAAGCCAATAAATGTANGCGA-CA-AAGGAT-TGTAACT-GGAAGTGAT-ACCAAT--NAGAAAAATTATTTAT-TT-ACG-GATATTAA-CTGGCGTGAGTGTTCAAATTAAAGATTTTAAGTGAGAAAATAGCGGT-TGAAGCGAGCGGGTAT-CCAAAATGGCGTCT-TCC-C------TTGTGTATTTTTACTA--GG-G-G-TGTTTTGA-T-TT-----TTTTTTTC-TACAC-AAGCC-CCTGTGGTGTCA
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gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAGAGTTTAGGTGAGAAAATAGCGGT-TGGAGCGAGCGGGTAT-GCAAAATAGAGTCT-TCC-C------TTGTGTACTTTTCCTA--GG-GTG-TGTCGTGA-T-GT-----TTTTCT
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A--GG-G-G-TGTTTTGA----T-----TTTTTTTC-TGCAC-TAGCG-CCTGTGct
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CC-C------CTGTGTATTTTTACTA--GG-G-GGTGTTTTAA-T-TT-----T---TTTC-TACAC-AAGCC-CCTGTGGgtgtatttttactagggggtgttttaatttttttctacacaagcccctgtgg
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cacaggcgctagtgcagaaaaaaaatcaaaacaTTTACTA--GGAG-G-TGTTTTGAAT-TT-----TTTTTTTC-TACAC-AAGCC-CCTGTGAT
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GTATTTTTACTA--GG-G-GGTGTTTTGA-T-TT-----TTTTACTG-TACAC-AAGCT-CCTGTGcaga
gi|5                          : ATCTTTAATT--GAACACCCACGCCAGTAAATTATCCGTAAAATAAATATTTTTTCTAATTGGTATCTACTTCCAGTTACACTCCTTTGTCGCT------TACATTTA---ATTA-----TTGAATTTCTAATGTACACAACTAAGTGGCTT-T--CGCTCGCACGGCT------------TTCATAGGATGAAGAG---------------CTTC-GTC-----CTATGGAAAA--ACCCGAGAGAGCACGAGTAGCATACTT-----TCGCTTGCTTGCAGAAG--CCACTTTATGTTTGTCCATTGGGGAAGTTTACGTTAGAAATTGATTAAG-CAAGAAATGCAAGCGA-CA-AAAGAT-TGTAACT-GGAAGTGAT-ACCAAT--GAGAAAAATTATTTAT-TT-ACG-GATATTAA-CTGGCGTGAGTGTTCAAATTAAAGATCTTAAGTGAGAAAATAGCGGT-TGAAGCGAACGGGTAT-CCAAAATGGCGTCT-TCC-CTTCAAGTTGTGTATTTTTACTA--GG-G-G-TGTTTTGA-T-TT-----TTTTTTTG-TACAC-AAGCC-CCTGT-GTGTCAa
gi|6                          : ATCTTTAATTTGAAACACCCACGCCAGTAAAT-ATCCGTAAA-TAAATATTTTTTCTAATTGGTAT--ACTTCCAGTTACACTCCTTTGTCGCT------TATATTTA---ATTA-----TTGA-TTTCTAATGTACACAACTAAGTGGCTTCT--CGCTCGC---GCT------------TTCATAGGATGAAGAG---------------CTTC-GTC-----CTATGAAAAA--CCCCGAGAGAGCACGAGTGACATACTT-----TCGCTTGCTG-CAGAAG--CCACTTTATAGTTGTCCATTGGGGAAGTTTACGTTAGAAATTGATTAAGCCAAGAAATGCAAGCGA-CA-AAAGAT-TGTAACT-GGAAGTGAT-ACCAAT--GAGAAAAATTATTTAT-TT-ACG-GATATTAA-CTGGCGTGAGTGTTCAAATTAAAGATCTTAAGTGAGAAAATAGCGGT-TGAAGCGAACGGGTAT-CCAAAATGGCGTCT-TCC-CTTCAAGTTGTGTATTTTTACTA--GG-G-G-TGTTTTGA-T-TT-----TTTTTTTTGTACAC-AAGCC-CCTGTGGTGTCAatgagtaaggagagaggtactatgtaatacactgaagtcgtatactaatagttttt
gi|9                          :                                                   TTTTTCTAATGTGTTTT-ACTTCCAGTTACAATCCTTTGTTGCTAGTGCTTACATTTATGGGTTAAAAAGTTG---TTC-AACGTATACAACTAAGTG-TTTCTGTCGCTCGC---GCTCTCTTCGGGTTTTTCATAGGATGAAGAGTTCTAAAAAAAAATCCTCCTGTCTTGGTCTGTGAAAAAAACCCCGAAAGAAC-CGAGTGATAT---TATACTTCGCTTT----CTGTAGATCCATTCT-TAGTTGTCCATTGGGGAAGTTTACGTTAGAAATTGATTAGGTCAATAAATGTAAGCGACCA-ACAGACGCGT-ACT-GAAAGTGAT-ATCTAG--TAGGAAAG-CATCTAT-TT-ACGAGATATTAA-TTGGCGTGA--GTTC-AATTAAAGA-TTTAAGTGAG--AAT-GAGGTATGAAGCGAGCGGGTATGCC--AATGGAGTTTATCCAC------TTGTTTATTTTTACTT--GG-G-T-GGTTTTA-----T-----TTTTTTTC-TACA


blockSeqs                     :           TG                    .         .                       T                           AGTGCT        TGG    AAAAG   A     T                  G   C GT       .     CTCTTCGGGTTT                TTCTAAAAAAAAATC    T   TTGGT  T       AA            G         TACTTTCGCTTGCTTGCA         AT       ATG          T         T             TG               T    C  G      G   A   T         TC     TAA               A  T  GA        AT                                   C          A                GC        T    A   A TTCAAG                AG  A T G        TATTTTTTA         G     .     .
blockSeqs                     :                                                                   .                           .             .      .       .     .                  .   C .        .     .                           .                  .   T      A       .             G         TACTTTCGCTTGCTGCA          .        ATA          T         A             TT               T    .  .      .   A   .         A      T                 .  .  C         C                                    A          .                G         A    .   . TTCAAG                .   . . G        ATTT              .     .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                      .                  .   .      A       .             A         TTATACTTCGCTTTCT           .        TA           G         A             TT               A    .  .      .   C   .         G      T                 .  .  T         C                                    A          .                G         C    .   . .                     .   . . .        TGT               .     .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                      .                  .   .      G       .             A         CA                         .        T            G         A             TT               A    .  .      .   A   .         G      G                 .  .  A         C                                    A          .                C         C    .   . .                     .   . . .        TTT               .     .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                          .         T                          .        A            G         A             TT               A    .  .      .   A   .         A      G                 .  .  G         C                                    .          .                C         A    .   . .                     .   . . .        TTT               .     .     .
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Unaligned ( gi|2 ): TCTGTCTTATCTTTCAAAATTACATTTACCTAATTCAAGGAAAAACTTCAATATAAAATTAAAATTTGTTACACATTTATTTAGTCATTATAATACTACCATGTCCTATGCTTCAATGTTTACCCTAGATTGAATATAAAAATGGTATATTATAAATTCTTGCTTGGCAAATTTTACAGAAATAATCTTACAGAAAGATAAATGTTCGTTTTGATCTTATATAATCAAAAAATTTTCTTAAGGGGAATGATTCCATAAAATACAAACGAATCGACTTCTCAAAAACTTAAGTGCACCATTATACAACTCGCTTGATAAACAAGAGTTGACTGCTTCACTTTTCCACTTTTTCTACAATTTACACTAATCCCTGAGCTTAATGAATATATCAATTTTTCCCCCTTACATATATACAAGAGTTCATATAGGCTTATTTTCACCCCGCTATAGACATTCACAAGCGCTTCTGTGGTGCGTGCTGTCAAACCACAAAAGGAAATTTAAGTATTGAATTCTTGCATTTTTTGATTGGCCTGATATTTTGTTGAAGTATTGAATCTTCAAACCTTGGACAGTTTCGGAATATTGAATTTGGAATCTTTTGACGATTTTG
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Unaligned ( gi|4 ): GTTTACTTCCAAAAATGTTACCTCTCTCTCTCTTTTCATTATAAAAAATTAATAAAAGTGTTCAGCATTATAGTCATTAATAAATGCTACCTTATGTCTATGTTCTTTCATGTTTACCTAGATTGTAATAAAATATGCTATTGTAATATTCCTTGCTCGGCAAATTTACAAGAAATATATTTACAGAAGTAAATGTACTTATTTATATAATCAGAAATTTCTTAACGGGTAGTATTCCATTAAAATACAACGGATCGGCTTCCTGACATGAATACTTTACTTAAGTGTGCCCAATATACCCGGTGAACCACCAGAAAACATGCCCTGGCCTTCTATCATTCATCTTTTTGTTCTACAAGACTACACTTTTCCAGTTATTATATCAATTTCCCTCTACAAACTATGTCTTTTTCCCGAAGTTCCACAAGCGCTTCGGGCTCTTAGTATAAACTTATGATGAGCTTATGATTCTTGATTTTGATCTATGGCTGGATTAGTTTGTGATATTAGTAATTTCTGCAAGCTTGAGATTCGAGATATTATATATCGAATTTGGACTTTCTG
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Unaligned ( gi|8 ): AGCATTGTTACACATTTTAGGTAATATAAATATAAATACTACCATTTCCTATGCTTTCAGAGTTTAACCTAGATTTAGCATAATTGTGTATCATATTCATGTAAATTCTTGCATTGCAAAACTAAGAACATATTTTCACAAGAAAAAATGTATTTGTTTTACATAATCAACAATTGATTTCAGTGGAAGTAATTCCATAATATAGTACGGAATCGCTTTCTTCATATTATTAATGTACCAACATGTTCGTAGAACCAAAAAGCCACCCTTCCACTTTTTTCTACAACGTACATTTTCCAATATAATTATTATATCCCATTTTCCAATATAATTATTATATCCTTTTGCTAGAGATGCAAGCTTTAGTGTTTTCAAGTGCAAAGACACAAGCGCTTGAGTGTATTAACTACAGAACAAATTCGAAGTATGAGACCTTTATTTGGATTGGATGATTTGGATTTAG
Unaligned ( gi|10 ): AAAACGTTGTTACTTATTTTATAGTCATTATAAATACTACGTATCATATCTGTCCAATATACCTTAAATTTTATATAAATGTTGTATATATAAATTCGCATGACAAAAATACAGAAATATCTTACCAAAGAAATATGTATTTATTTACAGAATCAAAAATTTCATAAGGAAGTAATCCATTAAATACAAACGGAATCGCTTTTCTCACAATACTTAATTGTACCCATTTGGCACCGTGGAACCAAGAAACTGCCTTTTCCACTGTTTTCTACAACTGACACTTTCCAGTATATATCATTTCCCCCTACAAACTATATTATTTTTCACGCGCAAAATCACAAGCGCCTTGGGTCTATAATTTGAAGTATGAATTCTTGATTTTGATTGGCTGATTTGGATATTGAATCTTGAATCTTGCGAATGTGTGGATTTCGAATATGAATCTCGAATGAAACCTT
Unaligned ( gi|11 ): AATAAAATGTTAAACTGTATAGTCAATATAAAAGTGCCGGTCCTATGCGTCAAATTTACGAATATACTGGTCATAAATGTGCACCATATAAATCTAATAGCAAAGACTGAAATATCTTTTATAAAGATGAAAAATTAATCAACGAGAGAGGATTAAGGGGAATGTCAATAAAAATAACGCAATGGCTTTCCTCGTAACATTAATGTATGTACCTGACATGCACGAAGAGCAAAGAAACTGGCCCTTCTTCACTTTTCTACAACGTACACTTCCATATAATATAATCCCATGATAACTGAGTACGTTCGGCGTCCAAATCACGAAAAGCTGGTCTATTTAAATACAGACGGAAAATAAAGTATTAAACATATGTATTGATGATCTGAAAACTCGAATCTTTGATTTCGAATATTGAATTCAAATGTC
Unaligned ( gi|13 ): CTTGCATTGCAAAACTACAGAAATATTTGGGCAGAAAAAAATGTAATGCAATGGATTTTACATAATCAGAAAATGATTTAATGGGAAGTAACCAAAAAAAAAAAACAACAACAAAAACCCACAACTGAATCGCTTTCCTTGTAACATTAACGTGTGTACTCACAACATAAAACAATAACATTACTGTTTTAACTTTTTTCTACAACGTACAGATTCCAGAATATATCATTTCCCCCTTTAAACTCTAGTTTTTTAAGCACAGAATCATAAACGCATGGATCTATTAACTACTGAGTAAATTCAAAGAATTAATACTTTATTTGGATTAGATGAGCTGGATGTTGAATCTCAAACCTTGGGTTT
Unaligned ( gi|14 ): ATATAATTGTATATAATATAAATTCTTGCTTGGTAAAAGTACAGAAATATCCTTACAGGAAGAAAAAAATATTAATTTATTACTTAAGGGAAGTAATTCCATACAATACACCGAAATCGCTTTCCTCATAACACTGTGTACCCATATGCACGTGGAACCAAGAAACTGTTCTTTCCACTTTTTTTCAACAACGTACAATTTCCAGTATATACCATTTCCCGCTGCAAACTAGAGTATTTCCACGCGCAAAAATTAAAAGCTAAGTCTATTACCACATAAAAGAATTTATTAAAANCATTCTTTACGCATCGATACGTTTTTGGATATTGAATCTAGAACTTTGGATTTGGAATT
Unaligned ( gi|15 ): TTTCAACTTTTACGCCAGATTTGAACTAAATGTGTACCATATAAATTCTTACATGGCAAAGGTACAAAACATTCTTACGGAAATGAAAATGTATTTGTTTTACATAATCAGAAAATAATATAAGTGGACGTTATTCAATAAGATAAAACGGAATAGCTTTCTTCGTAACATTAATGTATGCAGTACCAAAATGCATGTAGAACCAAGGAACTTCGCTTTCCACTTTTGTCTGTTTCTATTTCACACGCAAAGTCACAAGTGCTTGGGTATATTAAATACAGAGGAAATTCGAAGTATAAAACCTTTATTTGGATGATTTGGATATTG
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Unaligned ( gi|19 ): ATTTCCACCCTGAAACTATAATTTTCCACGAGCAAAAGTTGGCGAGCGACTTGGATCTATAATTACTGAGAAGAAATTCGAAGTAGACTCCTTTATTTTTATTGGATCATGTGACTGAGGATATTTGATCTGGAATCTTAAATTTCGAATCTATGCGAAATTTGAAATCTCGTAGTATTGGAATTTCGAATGTCGAATGAACCTTCTGGGTTCGTA
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Unaligned ( gi|22 ): CATATATCATTTCCCCCTACAAAGTATAGTATTTTCTTGCCCAAAACCACAAGCGCTTGTGTCTATTTAAAACTTTGAAATATGAATTCTTCATTTTGATTGGCTGATTTGGATATTGAATAACGAATCTTGAATC
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Unaligned ( gi|28 ): TCCAATATTGACAAAATATTTTGTTTTGCGTTTTACCTCCGCCTCATCCTAGTACCTAAAATTAAAATTTTGCAATGACAGTAGCCGACGTGATTGT
Unaligned ( gi|30 ): CAAGGTCCAGATATCATTTCCCCCTGCAATAAAATATTGTACTTTTGCAAAATAAACACTTTTCTTTATTTA
Unaligned ( gi|31 ): ATATTAAATCATACGAAGTATGAATCCTTTATTTTGATTGGCTGATTTCGATATTGAATCTCGGATTTTG
Unaligned ( gi|32 ): CGATGAATCCTTTTATTTTGATTGACTGATTTGGATAGTGAATCTCGAATATTG
Unaligned ( gi|35 ): TCGGAAGTTGGAATCTCGTAAGAAACCTCTGG






Alignments
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lowQualScore                  :           88                    5         5                       55                          888888        333    33333   00    7  0               6   6 88       333   888888888888                000000000000000    8   77777  1       11            3    0    888888888888888888888    99       222          1         8             66               1    5  5      5   1   5         66     777       0       5  5  99        55                                   9    0     5                00        3    6   5 222222                55  4 4 8        5555555555        4     5     5            
lowQualScore                  :           ..                    .         .                       ..                          ......        ...    .....   ..    .  .               .   . ..       ...   ............                ...............    .   .....  .       ..            .    .    .....................    ..       ...          .         .             ..               .    .  .      .   .   .         ..     ...       .       .  .  ..        ..                                   .    .     .                ..        .    .   . ......                ..  . . .        ..........        .     .     .            
lowQualScore                  :           00                    5         5                       33                          333333        333    33333   77    3  7               7   7 33       333   333333333333                000000000000000    0   44444  0       00            7    7    000000000000000000000    22       222          0         7             33               0    7  7      7   4   7         00     999       4       0  0  55        22                                   2    1     0                00        7    7   7 999999                00  0 0 0        2222222222        4     0     7            
consensus                     : ATCTTTAATTTGGAACACCCACGCCAGTAAATTATCCGTAAAATAAATATTTTTTCTAATTGGTATC-ACTTCCAGTTACACTCCTTTGTCGCT------TACATTTA---ATTA-----TTGA-TTTCTAACGTACACAACTAAGTGGCTTCT--CGCTCGC---GCT------------TTCATAGGATGAAGAG---------------CTTC-GTCT----CTNTGAAAAA--CCCCGAGAGAGCGCGAGCGACAT---ACTT-CGCTT--T--CAGAAG--CCACTTT-TAGTTGTCCATTNGGGAAGTTTACGTTAGAAATTGATTAAGCCAATAAATGTANGCGA-CA-AAGGAT-TGTAACT-GGAAGTGAT-ACCAAT--NAGAAAAATTATTTAT-TT-ACG-GATATTAA-CTGGCGTGAGTGTTCAAATTAAAGATTTTAAGTGAGAAAATAGCGGT-TGAAGCGAGCGGGTAT-CCAAAATGGCGTCT-TCC-C------TTGTGTATTTTTACTA--GG-G-G-TGTTTTGA-T-TT-----TTTTTTTC-TACAC-AAGCC-CCTGTGGTGTCA
Reference ( family-127 )      : ATCTTTAATTTGGAACACCCACGCCAGTAAATTATCCGTAAAATAAATATTTTTTCTAATTGGTATC-ACTTCCAGTTACACTCCTTTGTCGCT------TACATTTA---ATTA-----TTGA-TTTCTAACGTACACAACTAAGTGGCTTCT--CGCTCGC---GCT------------TTCATAGGATGAAGAG---------------CTTC-GTCT----CTNTGAAAAA--CCCCGAGAGAGCGCGAGCGACAT---ACTT-CGCTT-CT--CAGAAG--CCACTTT-TAGTTGTCCATTNGGGAAGTTTACGTTAGAAATTGATTAAGCCAATAAATGTANGCGA-CA-AAGGAT-TGTAACT-GGAAGTGAT-ACCAAT--NAGAAAAATTATTTAT-TT-ACG-GATATTAA-CTGGCGTGAGTGTTCAAATTAAAGATTTTAAGTGAGAAAATAGCGGT-TGAAGCGAGCGGGTAT-CCAAAATGGCGTCT-TCC-C------TTGTGTATTTTTACTA--GG-G-G-TGTTTTGA-T-TT-----TTTTTTTC-TACAC-AAGCC-CCTGTGGTGTCA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TGTTTATTTTTACTA--GG-G-G-TGTTTTGA------------TTTTTC-TACACAAAGCCACCTGTG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                      ---------------CTTC-ATC-----CTTTGAAAAA--CCCCGAGAGAGCGCGAGCGACA---------------------GAAG--CCACTTT---GTTGTCCATTTGTGAAATTT----------TTTA--AAGCCATTAAATGTATGCGA-CA-AAGGAT-TGTAACT-GGAAGTAAT-TCCAAT--TAGAAAAATTATCTAT-TT-ACC-GAAATTAA-ATGGCGTGAGTGTTCAAATTAAAGATTTTAAGTGAGAAAATAGCGGT-TGAAGCAAGC--GCTT-CCAAAAT-GTGTAT-T---T------TTG---ATTTTTTCTA--aataaatatatgtattacaaagtatagaaatattttcttacaaaagaaaacgtgcatcgaacttttacttcaacagaaataaatttattaagcttaggggaagacttccattaaaatcaacggaatcgctttcctcataacataaatgtacccatatgcaccatgaaaccaaattaactgccctttacttttctaacaagtacctttccagtatatatcattccacctttcaaaacatagtattttcacgcgcttttaaaaatcacaagcacttggctctattaactacatgggaaatttaaaatattaattctttattttgattggctgatttggatattga
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                      ---------------CTTC-ATCT----CTTTGAAAAA--CCCAGAGAGAGCGCGAGCGAC--------------------CAGAAA--GCACTTT-T-GTTGTCCATTTGTGAAATTT----------TTTA--AAGCCATTAAATGTATGCGA-CAGAAGGAT-TGTAACTTGGAAGTAATTCCCAAT--TAGAAAAATTATCTATATT-ACC-GAAATTAAATTGGCGTGAGTGTTCAAATTAAAGATTTTAAGTGAG-AAATAGCGGT-TGAAGCAAGCGagagtttaaaaaa
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gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TGTTCAAATTATAGATTT----------AA-----GT-TGAAGCAAGTGGGTAT-GCAAAATGGTCTCT-TCC-C------TTGTGTATATTTTCCAAGGG-G-G-TGTCTTGA-TATTTTTTATTTTTTTC-TACAC-A
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GAAGTAAT-GCTAAA--GAGAAAAAT-ATTTAT-TTTAGT-GATACTAA-CCGCCATCAATGTTCAAATTAAAGATTTTAAGTGAGCAAATAAGGGT-TAATGCGAGCGAGTAT--AAAAATGtggttttccaatgattgag
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AGTTTACGTTAGAAATTGATTAAACCAATTCATGTAAGCGA-CA-AAGGAT-TGGCACT-GGCAGTGGT-GCCAATTAAAAAAAAAATATTTAT-TT-ACA-GATA------TGACGTGA
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gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 A--GG-G-G-TGTTTTGA----T-----TTTTTTTC-TGCAC-TAGCG-CCTGTGct
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CC-C------CTGTGTATTTTTACTA--GG-G-GGTGTTTTAA-T-TT-----T---TTTC-TACAC-AAGCC-CCTGTGGgtgtatttttactagggggtgttttaatttttttctacacaagcccctgtgg
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cacaggcgctagtgcagaaaaaaaatcaaaacaTTTACTA--GGAG-G-TGTTTTGAAT-TT-----TTTTTTTC-TACAC-AAGCC-CCTGTGAT
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTATTTTTACTA--GG-G-GGTGTTTTGA-T-TT-----TTTTACTG-TACAC-AAGCT-CCTGTGcaga
gi|5                          : ATCTTTAATT--GAACACCCACGCCAGTAAATTATCCGTAAAATAAATATTTTTTCTAATTGGTATCTACTTCCAGTTACACTCCTTTGTCGCT------TACATTTA---ATTA-----TTGAATTTCTAATGTACACAACTAAGTGGCTT-T--CGCTCGCACGGCT------------TTCATAGGATGAAGAG---------------CTTC-GTC-----CTATGGAAAA--ACCCGAGAGAGCACGAGTAGCAT---ACTTTCGCTTGCTTGCAGAAG--CCACTTTATGTTTGTCCATTGGGGAAGTTTACGTTAGAAATTGATTAAG-CAAGAAATGCAAGCGA-CA-AAAGAT-TGTAACT-GGAAGTGAT-ACCAAT--GAGAAAAATTATTTAT-TT-ACG-GATATTAA-CTGGCGTGAGTGTTCAAATTAAAGATCTTAAGTGAGAAAATAGCGGT-TGAAGCGAACGGGTAT-CCAAAATGGCGTCT-TCC-CTTCAAGTTGTGTATTTTTACTA--GG-G-G-TGTTTTGA-T-TT-----TTTTTTTG-TACAC-AAGCC-CCTGT-GTGTCAa
gi|6                          : ATCTTTAATTTGAAACACCCACGCCAGTAAAT-ATCCGTAAA-TAAATATTTTTTCTAATTGGTAT--ACTTCCAGTTACACTCCTTTGTCGCT------TATATTTA---ATTA-----TTGA-TTTCTAATGTACACAACTAAGTGGCTTCT--CGCTCGC---GCT------------TTCATAGGATGAAGAG---------------CTTC-GTC-----CTATGAAAAA--CCCCGAGAGAGCACGAGTGACAT---ACTTTCGCTTGCTG-CAGAAG--CCACTTTATAGTTGTCCATTGGGGAAGTTTACGTTAGAAATTGATTAAGCCAAGAAATGCAAGCGA-CA-AAAGAT-TGTAACT-GGAAGTGAT-ACCAAT--GAGAAAAATTATTTAT-TT-ACG-GATATTAA-CTGGCGTGAGTGTTCAAATTAAAGATCTTAAGTGAGAAAATAGCGGT-TGAAGCGAACGGGTAT-CCAAAATGGCGTCT-TCC-CTTCAAGTTGTGTATTTTTACTA--GG-G-G-TGTTTTGA-T-TT-----TTTTTTTTGTACAC-AAGCC-CCTGTGGTGTCAatgagtaaggagagaggtactatgtaatacactgaagtcgtatactaatagttttt
gi|9                          :                                                   TTTTTCTAATGTGTTTT-ACTTCCAGTTACAATCCTTTGTTGCTAGTGCTTACATTTATGGGTTAAAAAGTTG---TTC-AACGTATACAACTAAGTG-TTTCTGTCGCTCGC---GCTCTCTTCGGGTTTTTCATAGGATGAAGAGTTCTAAAAAAAAATCCTCCTGTCTTGGTCTGTGAAAAAAACCCCGAAAGAAC-CGAGTGATATTATACTT-CGCTT--T--CTGTAGATCCATTCT-TAGTTGTCCATTGGGGAAGTTTACGTTAGAAATTGATTAGGTCAATAAATGTAAGCGACCA-ACAGACGCGT-ACT-GAAAGTGAT-ATCTAG--TAGGAAAG-CATCTAT-TT-ACGAGATATTAA-TTGGCGTGA--GTTC-AATTAAAGA-TTTAAGTGAG--AAT-GAGGTATGAAGCGAGCGGGTATGCC--AATGGAGTTTATCCAC------TTGTTTATTTTTACTT--GG-G-T-GGTTTTA-----T-----TTTTTTTC-TACA
21 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|1 ): CCAATATTAACAAAATACTTTGTTTGCGTTTTAGCCTCCCCATCTATCCTAGTACCTAAAATTCAAAATTTTGCCTAATACAGTACCGACTGATTTGTCTCTTCTACTGACCAGAATGTAATATAAAAACCTTCATATCAAAAAATACTTATGTCGTACACTAATTATAGCACATGTATAAATACTTACGAGTGTCCTAGCTATCATATCCGTTAATACCTAGATTTTATATCTAAGATCCTGTGTCATCACGTAATAAAATTCTTGCACTGATCCAAAAATACAGAGTATATCTTACCCAACGCATAAAGTTCATTTATTTTACAATCAAGACAATAAGAATTTTCTTAAGGAAAGTAATTCCATAATAATGACTAACCGAGAAGTCGCCTCGTTTCTCTCAATGACTAATCTTACCCATATGGCCTCTGAGAACCAAGAACAACTCCCCTTTTCCAGTCTTTTTCTACAACTCTGCAGCTTGTCCGTCATATCATTTCCCCACACAAACTATAGTATTTTCACGGTGGCGCATAAAATCCACAAGGCTTGGTGCCTATTCTCAAGCTTTGCAAGTCATTAGCTCACAAGCTTCCTTATTTGCCATTGCTGATTTTGGACTATGATCTTATCTGTGGATTCGATATCTGAAT
Unaligned ( gi|2 ): TCTGTCTTATCTTTCAAAATTACATTTACCTAATTCAAGGAAAAACTTCAATATAAAATTAAAATTTGTTACACATTTATTTAGTCATTATAATACTACCATGTCCTATGCTTCAATGTTTACCCTAGATTGAATATAAAAATGGTATATTATAAATTCTTGCTTGGCAAATTTTACAGAAATAATCTTACAGAAAGATAAATGTTCGTTTTGATCTTATATAATCAAAAAATTTTCTTAAGGGGAATGATTCCATAAAATACAAACGAATCGACTTCTCAAAAACTTAAGTGCACCATTATACAACTCGCTTGATAAACAAGAGTTGACTGCTTCACTTTTCCACTTTTTCTACAATTTACACTAATCCCTGAGCTTAATGAATATATCAATTTTTCCCCCTTACATATATACAAGAGTTCATATAGGCTTATTTTCACCCCGCTATAGACATTCACAAGCGCTTCTGTGGTGCGTGCTGTCAAACCACAAAAGGAAATTTAAGTATTGAATTCTTGCATTTTTTGATTGGCCTGATATTTTGTTGAAGTATTGAATCTTCAAACCTTGGACAGTTTCGGAATATTGAATTTGGAATCTTTTGACGATTTTG
Unaligned ( gi|3 ): GCCTAAATTGACATAAAAATTGGTGTTATTGCAGTTTTACCTCCGGTCTTCCAAGTAACTAGATTGTAATTTTGCAATGACAATAGACATCGTGATTATGTATCTAAGCTGGACCGAATAAATAAAACTTCATATAAAAATAAAAAAGTTGTTACTTATTTTGTCATTAAAATAGCTACGGTGTCTATGCTTCAATGTTTACCAGATTTTATAAATGTGTAATATATATAAATTCTTGCATGAACAAAATACGAATATGCACCCAAGAAAAATGGTATTTATTTACAAGAAATCAGACATTTCTTAAGGAGTAATTCCATAAAATAAACGGAATCGCTTTCCTCACAATCTAATTAACCCATGATGCACGTGGAACAAGAAAACTGCCTTTTTCCAACTTTTTTCTACATAAGACACTTTCCAGATATAAATTTCCCCCTACAAATCTGTTATTTCACCCGCAAATTACAAGCGTTGGGTAATACTACAAAGGAACTTAAGTATGTATCTGATTGTTGGATTGGGGATTGATAGTGCAATCTTGAAATCTTGGTATTTCGAAATTGAATTTTCGAA
Unaligned ( gi|4 ): GTTTACTTCCAAAAATGTTACCTCTCTCTCTCTTTTCATTATAAAAAATTAATAAAAGTGTTCAGCATTATAGTCATTAATAAATGCTACCTTATGTCTATGTTCTTTCATGTTTACCTAGATTGTAATAAAATATGCTATTGTAATATTCCTTGCTCGGCAAATTTACAAGAAATATATTTACAGAAGTAAATGTACTTATTTATATAATCAGAAATTTCTTAACGGGTAGTATTCCATTAAAATACAACGGATCGGCTTCCTGACATGAATACTTTACTTAAGTGTGCCCAATATACCCGGTGAACCACCAGAAAACATGCCCTGGCCTTCTATCATTCATCTTTTTGTTCTACAAGACTACACTTTTCCAGTTATTATATCAATTTCCCTCTACAAACTATGTCTTTTTCCCGAAGTTCCACAAGCGCTTCGGGCTCTTAGTATAAACTTATGATGAGCTTATGATTCTTGATTTTGATCTATGGCTGGATTAGTTTGTGATATTAGTAATTTCTGCAAGCTTGAGATTCGAGATATTATATATCGAATTTGGACTTTCTG
Unaligned ( gi|7 ): ATACTATTTATTTCCAAAATTTACCTCTTCTCTTCATAAAAAATTAAAAAAGTTTTTACACATTTTAGTCATTATAAATGCTACCATTCCTATTCTTCAATGTCTACCTAGATTAATTATATGTATTTATAAAATTCTTGCCTTGGCAAATTTTACGAATTAATCTTAGCAAAGCATATGTAATTTATTTTACTAACTCAAAACTTTCTTAAGGAAGTAATTCCATAAATTACAACGGATCGACCTTCTATAACACTAACTGTGCATATACATCGGAACAGAACCGCATTTTCATTTTCTACACTTACACTTTCCATATATATCATTCCCCTACAAACATATAATTTTCCACCGCAATTCACAAGCGCTTGGGGTCTATTAATAACACAACGGAAATTTTGAAGTGATTGATTCTTAGATTTTGATTCGGCTGATTTGATCATTGTAATCCCTTTGAATCTTGGATTTTCGAAT
Unaligned ( gi|8 ): AGCATTGTTACACATTTTAGGTAATATAAATATAAATACTACCATTTCCTATGCTTTCAGAGTTTAACCTAGATTTAGCATAATTGTGTATCATATTCATGTAAATTCTTGCATTGCAAAACTAAGAACATATTTTCACAAGAAAAAATGTATTTGTTTTACATAATCAACAATTGATTTCAGTGGAAGTAATTCCATAATATAGTACGGAATCGCTTTCTTCATATTATTAATGTACCAACATGTTCGTAGAACCAAAAAGCCACCCTTCCACTTTTTTCTACAACGTACATTTTCCAATATAATTATTATATCCCATTTTCCAATATAATTATTATATCCTTTTGCTAGAGATGCAAGCTTTAGTGTTTTCAAGTGCAAAGACACAAGCGCTTGAGTGTATTAACTACAGAACAAATTCGAAGTATGAGACCTTTATTTGGATTGGATGATTTGGATTTAG
Unaligned ( gi|10 ): AAAACGTTGTTACTTATTTTATAGTCATTATAAATACTACGTATCATATCTGTCCAATATACCTTAAATTTTATATAAATGTTGTATATATAAATTCGCATGACAAAAATACAGAAATATCTTACCAAAGAAATATGTATTTATTTACAGAATCAAAAATTTCATAAGGAAGTAATCCATTAAATACAAACGGAATCGCTTTTCTCACAATACTTAATTGTACCCATTTGGCACCGTGGAACCAAGAAACTGCCTTTTCCACTGTTTTCTACAACTGACACTTTCCAGTATATATCATTTCCCCCTACAAACTATATTATTTTTCACGCGCAAAATCACAAGCGCCTTGGGTCTATAATTTGAAGTATGAATTCTTGATTTTGATTGGCTGATTTGGATATTGAATCTTGAATCTTGCGAATGTGTGGATTTCGAATATGAATCTCGAATGAAACCTT
Unaligned ( gi|11 ): AATAAAATGTTAAACTGTATAGTCAATATAAAAGTGCCGGTCCTATGCGTCAAATTTACGAATATACTGGTCATAAATGTGCACCATATAAATCTAATAGCAAAGACTGAAATATCTTTTATAAAGATGAAAAATTAATCAACGAGAGAGGATTAAGGGGAATGTCAATAAAAATAACGCAATGGCTTTCCTCGTAACATTAATGTATGTACCTGACATGCACGAAGAGCAAAGAAACTGGCCCTTCTTCACTTTTCTACAACGTACACTTCCATATAATATAATCCCATGATAACTGAGTACGTTCGGCGTCCAAATCACGAAAAGCTGGTCTATTTAAATACAGACGGAAAATAAAGTATTAAACATATGTATTGATGATCTGAAAACTCGAATCTTTGATTTCGAATATTGAATTCAAATGTC
Unaligned ( gi|13 ): CTTGCATTGCAAAACTACAGAAATATTTGGGCAGAAAAAAATGTAATGCAATGGATTTTACATAATCAGAAAATGATTTAATGGGAAGTAACCAAAAAAAAAAAACAACAACAAAAACCCACAACTGAATCGCTTTCCTTGTAACATTAACGTGTGTACTCACAACATAAAACAATAACATTACTGTTTTAACTTTTTTCTACAACGTACAGATTCCAGAATATATCATTTCCCCCTTTAAACTCTAGTTTTTTAAGCACAGAATCATAAACGCATGGATCTATTAACTACTGAGTAAATTCAAAGAATTAATACTTTATTTGGATTAGATGAGCTGGATGTTGAATCTCAAACCTTGGGTTT
Unaligned ( gi|14 ): ATATAATTGTATATAATATAAATTCTTGCTTGGTAAAAGTACAGAAATATCCTTACAGGAAGAAAAAAATATTAATTTATTACTTAAGGGAAGTAATTCCATACAATACACCGAAATCGCTTTCCTCATAACACTGTGTACCCATATGCACGTGGAACCAAGAAACTGTTCTTTCCACTTTTTTTCAACAACGTACAATTTCCAGTATATACCATTTCCCGCTGCAAACTAGAGTATTTCCACGCGCAAAAATTAAAAGCTAAGTCTATTACCACATAAAAGAATTTATTAAAANCATTCTTTACGCATCGATACGTTTTTGGATATTGAATCTAGAACTTTGGATTTGGAATT
Unaligned ( gi|15 ): TTTCAACTTTTACGCCAGATTTGAACTAAATGTGTACCATATAAATTCTTACATGGCAAAGGTACAAAACATTCTTACGGAAATGAAAATGTATTTGTTTTACATAATCAGAAAATAATATAAGTGGACGTTATTCAATAAGATAAAACGGAATAGCTTTCTTCGTAACATTAATGTATGCAGTACCAAAATGCATGTAGAACCAAGGAACTTCGCTTTCCACTTTTGTCTGTTTCTATTTCACACGCAAAGTCACAAGTGCTTGGGTATATTAAATACAGAGGAAATTCGAAGTATAAAACCTTTATTTGGATGATTTGGATATTG
Unaligned ( gi|16 ): AAGGGAAGCAATTCATAAATTACAAGGAATCGCAACATTCCTCGGAACATTAATTGCCTAATGCACGTAGAAAAGAAAACTTCGCTGCTTTCTACATTTTTTACACATACGTACCACCATTTCCAGAAATATATAATATCACTTCGCAAACTATAGTATTTCAGCCAAAATTGGATCTATAATTACTGGGGAAATTTCGAAGAATGATCCTTTACCTTAACTGGAAGATTTGGATATTGAATATTCGAATCTCAGATTTCGAA
Unaligned ( gi|19 ): ATTTCCACCCTGAAACTATAATTTTCCACGAGCAAAAGTTGGCGAGCGACTTGGATCTATAATTACTGAGAAGAAATTCGAAGTAGACTCCTTTATTTTTATTGGATCATGTGACTGAGGATATTTGATCTGGAATCTTAAATTTCGAATCTATGCGAAATTTGAAATCTCGTAGTATTGGAATTTCGAATGTCGAATGAACCTTCTGGGTTCGTA
Unaligned ( gi|20 ): ATGGATTCGTTTTCCTCTTCTCGTTAATTAATGTACATACCAATAAGCAACCTAACCAAGAAACTGCCCTTTCCCCTTTTCTATACAAGACTTTTAATATTTCTTATTTCCCCCTTCATTGTAGTTTTTCACGCAACAAATCTCAAGACCTCGGGTCTATTAACTACAGAGGAAATTCGAAGTGATTTGGATATTGA
Unaligned ( gi|22 ): CATATATCATTTCCCCCTACAAAGTATAGTATTTTCTTGCCCAAAACCACAAGCGCTTGTGTCTATTTAAAACTTTGAAATATGAATTCTTCATTTTGATTGGCTGATTTGGATATTGAATAACGAATCTTGAATC
Unaligned ( gi|26 ): TATATGTTACACATTTATGTCTATACAAATACTACCATTTCCTATATGCTGTTAAAGTTTATCTAGATTTGATATAAATGTGTACCAGATACTATCTTGCAT
Unaligned ( gi|28 ): TCCAATATTGACAAAATATTTTGTTTTGCGTTTTACCTCCGCCTCATCCTAGTACCTAAAATTAAAATTTTGCAATGACAGTAGCCGACGTGATTGT
Unaligned ( gi|30 ): CAAGGTCCAGATATCATTTCCCCCTGCAATAAAATATTGTACTTTTGCAAAATAAACACTTTTCTTTATTTA
Unaligned ( gi|31 ): ATATTAAATCATACGAAGTATGAATCCTTTATTTTGATTGGCTGATTTCGATATTGAATCTCGGATTTTG
Unaligned ( gi|32 ): CGATGAATCCTTTTATTTTGATTGACTGATTTGGATAGTGAATCTCGAATATTG
Unaligned ( gi|35 ): TCGGAAGTTGGAATCTCGTAAGAAACCTCTGG