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Reference ( gi|2 ) : TGCGACAAA---TTAAGAATAAA-TCAAGAAAAA--AAAA----ATT-------ATTAAAA-TTA--ACG---C-TT-GACTATTAAAAT--A-----TGAAA--C----T--TTGTAGATAT---ATTACACCACCAATA-AGG-T----CATT---ATT-------A---AAA---TG-TT-C--AA----A---GTAT--ATAA--------------CA-------GG-------------C----GGCC-ATC-T-------------------G---AAGCC-GA----TTTTTTA-TTAAAACTCGCTT--TTC-GAGTAAC--CGT---A----GCGAT-ATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAACTATTTACAACCCCCCCCCCTCCATTTTCTTCT---G--AAAGG-AT--G----G--A-T---C-A-TAG-CC---AAACT--G--T----C----T-GA-ACGGG-GAAACA--G-A-GT-ACCA-GTGGC-ACTACTCCGGG-GCAAAATCAA-GGT-AG--GC-AGGA---CCGA---AG-CC--A--C---CAC----GA-AAA-GCTAC-AGG--GCACAATGTGACCGCCT--AGA--AT--GGT--G------GCGCACATGCTGAAATCGTGATC----A-------GA---GG-C-----TC----CA-G---G---CG-AA-CGGCAA--------TC-TCCAC-CAT-TCCGCCGCCA-CGTACC-T-----T-CAA-AAG---G-A---AT---AG---A-GG---A--T-C-T--GGTTTAT-CTG--CGTCATACACTCAA-A-----CAT-CT--TAGAC-CAC-TC-CACC-----CCA----T----------ATG-----------A--------CT----------CA-G-----TATT-----C--CT--C-GGG-CTGCTTCCTC-------AGCCTACCAGAGT--TCTGGA-TTTTCCC-----A-AGTC-------AA--C--GTTCCTGCCG-GTC--TT--AAG---ACCCA-T-CGGG---ATCTTTC----TGGGTTCC-ACCTGTTA-GG--GA-ACAA-C-AA-TT-CC-C-TCTT---CATGGAC-A-AT-TGG-C---GCTC-----A--A--G--C-TCAACGGC--T--AGCACCCCTATT--AC--A--A---T-C---TTTCT---T--GCAACT-T-CG----CAACTCCGCA-TC-CTA-GG-GACCCACTTC---ACCC-AGCG-CAG-CAT---CGGGC-AGGAAT--T---T---C-A-CTA----------GC---A--T--GAC--A----GTG--------CGA----G--GG-----A----A-----G-CA--GAA-TCT-CAAGA-AGC--TT-----A---AATCTGGA-T-GCT--GGTT-C-----ATC--A-TA-AAT----C-TG-C---CAAC--TT---CCT--------A-----------GT---G----------GGGG---GGGC----A-T-A-A---G---GCT--ACGGACAT--TGG-TGT-G-GA-CA---CA---T-A-T----C-T-----C--T-GA-GGC----CAACCTCCACCCCCAGC---C-TCACG-TCCT-GGAG--AG-T--C-CGCT--CTATCCACAAA---AAGT-AGTTCCTA---T---CCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAG---CCACAT-A--C-AGGTTTC----AAGCTACCTGTA-CA--T----CATT--------CCCCAC-T-G--GATGGGAAAT---GGG-G-CC----CGCA-ATA---AAAT---C----AC----CCAGTCC-CCCAA-T--A---TT--C-T-------A-AT-TT-C---------TG------TC-C----TA-G-TA---TCCA---CCACGGG---CGTTTGCAC---ACG-AG---GTCC--TG-A-ACCTG-T-AAT--T--GC-A-CTGT-A------------TAT--AT-CATT---------G--------A-G-TGTCGTCACCTG---GCCAGT--G------G--TG---A--TG--C----AGC--G-A-TCG--C-TTT--CTTCCTG-G-AA-TCT---CT--ATCT-CTAGGGGGCAT-TC-------A---T-C---CCGAGCC-CACTACATTCCCGGTC
gi|3 : TGGGACAAAA--TTAAGAATAAT-TCAG----------------ATTTTTGTACATTAAAAATCA--ACG---T-TTTGACTA---AAATTGA-----TGACA--C----T--TTGTAGATAT---ATTACA-TA-CGATA-AGGTT----TACC---ATTG------A---AAA---TA-TT-C--AA----AAG-GTAT--ATAA--------------CA-------TG-------------C----GGTC-ATC-TTGAATGGAGGCCATCTTG-G---AAGCC-GA----TTTTTTA-TT---TCTCTCTT--TTC-G-GT-AC--CTTGGAA----GCAAT-A
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gi|21 : TGCGACAAAA--TTAAGAATAAA-TCAGAAAAAA--AAAT----ATT-------A--AAAA-TTA--ACG---CTTT-GACT----AAATTGA-----TGAAA--CTTTGT--TTGTAGATA----ATTACA-TACC-ATA-AGGTT----TATT---ATTA------A---AAA---TG-TT-CATAA----A---GTAT--ATAA---------------A-------GG-------------C----GGCC-AAC-TTG-----------------G---AAGCT-GA----TTTTTTA-TT-----TCTCTT--TTT-G-GT-AC--CTTAAAA----GCGAT-Acttaatttgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaactgttacactccccccgttttctccgaaaggacaatgtccatagcctaaactgctttgagtgccagtggcattcctccagagcaaaatcaaggtagacaggaccgaagcccaacaaataaaagcaacaggacacaagtgtctgcctagataggatcggggcagtctgtatcgtgtccagaagaggaagtcccgggcgaagcggaaatatcccccattccacccaaacgtacgtccaaaagcatcagaggaaccctggttgtctgggtccttaacacccctagtccattccaccatatg
gi|18 : aaTGCGA--AA---T--ATGACAAA-CTCAGAAAAA--AAAA----TAT-------ATTAAAA-TCA--ACGACTT-TT-TACTA--AAAAT--ATCAATTGAAA--C----TACTTGTAGATAT---ATTACATTACAAAT--AGA-T-----ATTTCCATT-------GAACAAA---TG-TTAC--AA----AG--GTAT--ATAA--------------CATTGC---GGCCTCTATAGAAATC----GGGC-ATC-T-------------------G---AAGCC-GATTTTTTTTTTA-TTCA---TCTCTT--TTC-GAa
gi|1 : acACAAAAGTTTGAGAATAAAATCA-GAAAAA--AAAA----AT--------ATAAAAA-TTATAACG---C-TTTGACTA---AAATTGA-----TAAAA--C----T--TTGTAGATATTCTATTACAATACCA-TATAGG-T----TATT---ATT-------ATT-AAACAGTGATT-C--AAAAGAA---GTATTAACAAAGGCTCAAGAGGTCCATCTGTGTGG-------------CATAGGGCC-ATC-TTG-----------------G---AGGCCCGA----TTTTTTATTT----TCCTCTT--CTC-CGGTATC--CTT---ATAAAGCG-C-GTATAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCTCCA-CTATT-ACATTCCCCCC------ATTTTCT-CT---G--AAAGG-AT--GAGAAG--A-T---CCA-TAG-CT---AAACT--G--TAACCT----T-GA-ACGGGAGAAACAAGG-A-GTTACCA-GTGGCCACTACTCGGGG-GTAAAACCAA-GGT-AG--GC-ATGA---CCGA---AG-CCC-A--C---CACA---GA-AAA-GCAAC-AGG--GCACA-TGTGACCGCCT--AGAT-AG--GGTT-G------GCGCA-GT-CTGAA-TCGTGTCC----A-------GA---GG-T-----CC----CA-G---G---CG-AA-CGGCAA--------TT-TCCAC-CAT-TCCGCCGCCA-CGTACG-T-----T-CAA-AGG---G-T---TG---AG---A-GG---AACC-C-T--GG-TTAT-CTG--CG-----CACTC-A-A-----CATCCC--TAAAC-CAC-TC-CA-------CCA----T----------ATGTCCGTGAGGATA--------CT-----------A-G-----TATC-----C--TC--C-GGG-TTG-TTCCTCCTGTTCTAGCT--CCGGAGT--CTTGGA-TTTT-CC-----A-AGGC-------AA--C--GTTCTGG--G-GTCCTTC--AAG---ATCC--T-CGGA---CTCTCTCTCCTTGG--TCC-ACCTGTTATGC--GA-ACAA-C----TTGCG-C-TCTT---CATGTGT-ATTT-TGGTC---GCTC-----A--ACGG--C-TC--CGCT--T--AG---CCCT-TT--ACA-A--A---TGC---CTTCT---G--G---CC-T-CG----C-ACT---CA-TC---A-AG-G-CTCA----------C-AG-G-CAG-CTT---CGCCG-AGGAAT--T---TTTCC-A-CT-----------------------AC--A----ATG--------CAA----GCTGG-----A----GTATCTG-CA--GAA-TATATAAGAGAGA--TTTATTAA---AATCTGAAGT-GCT--AGTTCC-----ACC--A-TATATT----C-TG-C---CGAC--T-----CT--------A-----------GT---G----------GGGA---GGAC----A-TAA-A---G---GCT--ATGGATATGGTGG--GT-G-GATCA---CA---T-A-T----C-TTTG--C--T-GA-GG-----CAA---TCA--CACAGC---T----CG-TCCTGGGAG--TG-T--C-CGCT--CCTGCCAC---------T-AGT--CTACCCC---CCCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAG---GCACAT-AATC-AGGTTC------AGCTA-TTGTA-CA--TGCTACTTTTGTAACGCCCCCCT-T-G--GATGGGGGAT----GG-G-CC----CGCA-A-A---TAATC--C----AC----TCAGT---CCCAGTT--A---TG--CTT-------A-AT-TT-T---------TC------TTGC----TACG-TA---TCCA---C--CGGG---C-TTTG------ACGTAG---GTCT--CG-ACGCCTGTT-TAT--T--GC-AGCTGTAA------------TAT--CT-CATT---------G--------A-G-TTTC--CACCTG---GCTAGT--G------G--TG---A--TG--T----AGC--G-ATTTG--C-TTC--C--CCTG-G-AACTCT---CT--ATCT-CTAGGG----C-TC-------A---T-C---CCGAGCCGCACT-CATTCCCtctcattaaagaaccgatatt
gi|8 : cAAA---TTAA---TAAA-T--AGATAAATCAGAATTTTGTT-------GTTAAAAATCA--AGG---C-TTTGA---TTAAAATTGA-----TAAAA--C----T--TTGTAGGTAT---ATTACA-TA-CAGTT-AGGCT----TATA---ATTACCATTAA---AAA---TG-TC-CAAAA----A---GTAT--ATAA--------------CA-------GG-------------T----GGCC-ATC-TTG-----------------G---AAGTA-GA----TTTTCTT-TTAcagttctcgggttcctttgggtgattacgccttcttctaactttctaagctgctaccaggcctaccacccaatcgatttcgtcatcttctctagctgtctcggaaaaaggtgggtgccttaaaacgcacatgccttacttctcggcgcggtttccgtg
gi|20 : caggTT-------ATTAAAAATCA--ACC---T-TT-AGCTA--AAACTTGA-----TGAAAACT----T--TTGTAGACAT---ATTACAT-AC-AATA-AGG-T----TTCC---ATT-------G---AAA------------------G---GTAT--ATAA--------------CA-------TG-------------C----GGCC-ATCTT-------------------G---AAtttaacggtactttaaaagtgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaactaatacacctctccccgccccgttttctcctttcaagaggatagggttcacatcctaaaacggggaaataagagtaccagtggcactcatacgggagtaaaaacaaggtaggaaggaccgaagcccacaaatgaaaagtagcaggacacaggtgttcgcctaaatcatggtcagggtagtcagaatcatgtccaaatgggggaagtcccggttgaaacggcaatcttccccattccgccgccatgtaagtccaaaagcaccagagggatcctggttgttggggtactcaacatctctagcccatttcaccatatcaccgggcggatatccttcgggctgtccaaagagtctggatttcccaatcaaccagcctacgttgtaaggcccataggggttttcctgagcccacctgcaaggaacaacttccctcttcaggaacatggcgctcaaggttcaatagtatcacccctttacctccaatccaagggactaacctggcagatttgaaaggaattcccactactggccacttgcatgggaagtgagaggcatcagcagagtc
gi|6 : atgaacaaaattaaaactaaaatcgaaattttttttA-AAA-T----TAGT---AAT-------A---AAA---TG-TT-C--AA----AAAAGTAT--ATAA--------------CA-------GG-------------C----GGCCAATC-TTGAAGTGGCGGCCATCTGGG---AAGCC-GA----TTTTTTA-TT---TCTCTCTTAATTCAGAAT-AC--CTTAAAA----GCGAT-Atggcgaacatcttggtagccgattttttttttaatttttctcattttgatacttaaaaagcgat
gi|23 : gacaaaactgcagaaataaaataagaaaaaatttttatta--AA----A---GTAA--ATAA--------------CA-------GG-------------A----GGCC-ATC-TTG-----------------G---AAGTC-AA----TTTCTTT-TTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggatcccaatgaattacatccccgccttttctcataaaggattgggtatcatagcttaaactgtacttgaactggtaaaacaagagaccaagtgcactactccggggtaaaaccaaggttagcggcgaggaacttcgaagcccaccactcagaaaatgcaacggggcacatgtgaccgcctagatagggttggcgcagtctgaatcgtgccgaggtcccatgagtcgaacgcaatcccacgcatgtccaccgccatcgttcgtcaaaaggagatatgagagagaatctctgggttattctgtacgtatatgctaaacatccactagactcacccaccatatgaacggggcgctgaaactagtatcctccagctgttcctcaaccgcagagtctggactttttccaagtcaaaacgttcttgcggtctcgaacgtatccaatcgggatttcttggtcccacctgttaggcgaacaaaacttccactcttcatgggaaattggctaggctctcaacgctagcacccctttacaatcctttgcaacttcgcatcatcgaataccacgagaggactacccaggcagatccgggaaggaattatccactgcatgacaagtgcgagtaactcgagcagaattctcaagaggctaaggtgtccacgcatcattaaattgacttgcgcataacctttcccagtatagcgtgaggacataagagagctatggatacatggtgggacacatagtcttctgaggcaactcaccccagccatcgtcctgggagtcgctctgccaaaagtagtcc
gi|8 : CAACTAAT-ACACCTCTCCCCGCCCCGTTTTCTCCTTTCA--AGAGG-ATAGG----G--T-T---C-A-CAT-CC---TAA--------------------A-ACGGG-GAAATAA-G-A-GT-ACCA-GTGGC-ACTCATACGGGAGTAAAAACAA-GGT-AG--GA-AGGA---CCGA---AG-CC---------CACAAATGA-AAA-GTAGC-AGG--ACACAG-GTGTTCGCCT--AAATCAT--GGTCAG------G-GTA---GTCAGAATCATGTCC----AAATGGGGGA---AG-T-----CC----CG-G---T---TG-AAACGGCAA--------TC-TTCCC-CAT-TCCGCCGCCA-TGTAAG-T-----C-CAA-AAG---C-A---CC---AG---AGGG---A--TCC-T--GG-TTGT-TGG--GGT-----ACTC-A-A-----CAT-CTC-TAGCC-CAT-TT-CA-------CCA----T----------ATC-----------A--------CCGGG-------CG-GA----TATC-----C--TT--C-GGG-CTG--TC--C-------AA------AGAG---TCTGGA--TTTCCC-----A-A-TC-------AA--C--CAGCCTAC---GTT--GT--AAG---GCCCA-T-AGGG---GTTTTCC----TGAG-CCC-ACCTG-CA-AG--GA-ACAA-C----TT-CC-C-TCTT---CAGGAAC-A----TGG-C---GCTC-----A--AG-G--T-TCAATAG---T--ATCACCCCT-TT--AC--------------------------------------------CTCCA-A-TC-CAA-GG-GAC-----TA---ACCT-G--G-CAG--AT---TTGAA-AGGAAT--TC--C---C-A-CTACTGGCCACTTGC---A--TG-GGA--A----GTG--------AGA----G--GC-----ATC--A-----G-CA--GAG-TCttcaccctatttctgtatcttaatagcgata
gi|12 : caggaaattaataaatagataaatcagaattttgttgttaaaaatcaaggctttgattaaaattgataaaactttgtaggtatattacatacagttaggcttataattaccattaaaaatgtccaaaaagtatataacaggtggccatcttggaagtagattttcttttatttaacggtactttaaaagtgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACTGTT-ACA------CTCCCCCCGTTTTCTCC----G--AAAGG-AC--A-------A-TGTCC-A-TAG-CCT--AAACT--G--C----T----T-T----------------G-A-GT-GCCA-GTGGC-ATTCCTCCAGA-GCAAAATCAA-GGT-AG--AC-AGGA---CCGA---AG-CCCAA--C---AAA----TA-AAA-GCAAC-AGG--ACACAA-GTGTCTGCCT--AGAT-AG--GATC-G------GGGCA-GT-CTG-TATCGTGTCC----AGAAGAG-GA---AG-T-----CC----CG-G---G---CG-AAGCGGAAA--------TA-TCCCC-CAT-TCCACCCAAA-CGTACG-T-----C-CAA-AAG---C-A---TC---AG---A-GG---AACC-C-T--GG-TTGT-CTG--GGTC-----CTTAACA-----C-C-CC--TAGTC-CAT-TC-CA-------CCA----T----------ATG-----------
gi|24 : tgcggcaaagttaataataaatcagattaaaaaatattaaaaatcaacgctttgaccaaaattaatgaatctttgtagatgtattacatacaattaggtttaccattaaaaatgcccaaaatgtatataacaggcagccatcttgaataagccgattttttatttctctttttttcggtaacttcaaagcggtaatatcttaatttgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTACAGCTCCCCCC-----GTTTTCT-CT---G--AAAGG-AT--G----G--GTT---C-ATTAA-CT---ATACT--G--T----
gi|7 : ctcaattatataaaCCCCCACATTTTCT-CT---G--ACATG-AT--G----GG-A-T---CCA-TAA-CCT--AAACT--G--T----C----TTGG-ACGGG-GAAACAA-G-A-AT-ATCA-GTGGC-ACTACTCCGGG-GTAAAACCAA-GGT-AG--GC-AGGA---CCGA---AGTCC--A--C---CACA---GA-AAA-GGAAC-AGG--GCACAA-GTGACCGCCT--AGA--TA--GGT--T------TGGCACAGTCTG-AATCATG
gi|6 : acattCCCCGCC-TTTTCTCAT------AAAGG-ATTGG----GT-A-T---C-A-TAG-CTT--AAACT--G--TAC--T----T-GA-ACTGGTAAAACAA-G-A-G--ACCAAGTG-C-ACTACTCCGGG-GTAAAACCAA-GGTTAGCGGCGAGGAACTTCGA---AG-CCC-A--C---CACTCA-GA-AAATGCAAC-GGG--GCACA-TGTGACCGCCT--AGAT-AG--GGTT-G------GCGCA-GT-CTGAA-TCGTG--C----C-------GA---GG-T-----CC----CA-T---GAGTCG-AA-CG-CAA--------TC--CCACGCATGTCCACCGCCATCGT-TC-G-----T-CAA-AAG---G-AGATATGAGAG---A-GA---A--T-C-TCTGGGTTATTCTGTACGT-ATATGCT-AA-A-----CAT-CCACTAGACTCAC--C-CACC-------A----T----------ATG-----------AACGGGGCGCTGAAAC-----TA-G-----TAT------C--CT--C-CAG-CTG-TTCCTC-------AACCG--CAGAGT---CTGGACTTTTTCC-----A-AGTC-------AAAAC--GTTCTTGC-G-GTC--TC--GAACGTATCCAAT-CGGG---AT--TTC----TTGGTCCC-ACCTGTTA-GGC-GA-ACAA-A-AC-TT-CCAC-TCTT---CATGGGA-A-AT-TGG-CTAGGCT---------------C-TCAAC-GC--T--AGCACCCCT-TT--AC--A--A---T-C---CT--T---T--GCAACT-T-CG----CATCATCGAA-TA-CCACGA-GA-GGACT-----ACCC-AG-G-CAG--ATC--CGGGA-AGGAATTAT---C---C-A-CT-----------GC---A--T--GACA-A----GTG--------CGA----G--TA-----ACTCGA-----G-CA--GAATTCT-CAAGA-GGC---T-----A---A-----GG-T-GTC--CACG-C-----ATC--ATTA-AATTGACT-TG-CGCATAACCTTT---CCC--------A-----------GT---ATAGC------GTGA---GGAC----A-T-A-A---GAGAGCT--ATGGATACA-TGG-TG--G-GA-CA---CA---T-AGT----CTT-----C--T-GA-GG-----CAAC--TCA-CCCCAGC---CAT--CG-TCCT-GG-G--AG-T----CGCT--CTGCC----AA---AAGT-AGTCCtccgccgccacgtacgttcaatggtttgagagaaaccctggtcgtatgcatactcaatatccctagacaactccaccatttgtatctttcgggctgttcctcagcctccagagtttggattttccaaatcaacgttccacggtctcaagacccatagggcttctcctaagttccacctgtttgggaacaaacttccctcttcatggaaatggtgctcaatctcaacactagcaccctttacaaatccttcttgcaacttcacaactcgatccaagagatttaccagacagatccgggaggaattcccactagcatgacaagtgcgatgtatcagcagaatatcagagagcttctgaatgctaggattcaccatataatctgccaacttcatattgaagtggggagtccattaggctacggatatggtgtggacacatatcttctgaggcagcataaccctagccttttcctgggagtccgctctgccaaaagtattctatccccccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagtcacatgcagtttcagctattatacatccacccccacttggatggagaatgggcctgcaataaatcaactcaatccccaatatgctaatttctgccctagtatccaccacgggatctacacgtaggtcctgaacccataattacattgtatatcttgttgagtgtctcaactggccagtgatgatgcaccctagtcgccttccct
gi|3 : gacaaaactgcagaaataaaataagaaaaaatttttattaaaaattagtaataaaatgttcaaaaaagtatataacaggcggccaatcttgaagtggcggccatctgggaagccgattttttatttctctcttaattcagaataccttaaaagcgatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggatcccaatgaattacatCCCCCCATTTTTCTCT---GGGAAAGGCAT--G----GGAA-C---C-A-TAGGCCTAAAAACTACG--G----CATATT-GATACGGA-GAAATA--ACACGT-ACCAAGTGGCCGCTACTCTGGG-GCAAAACCAAAGGT-AGAGGC-AGGA---CCGACACAC-CC--A--CACACAC----AAGAAA-GCAACCAGGCAGCACAAGATGACCGCCC--TGG--ATAGGGT--G------GCG-GC-TTCTGGCATCGTGATCGGCCA-------GAC--GGTC-----TCGGTACG-G---GA--CG-AAACGGCAA--------TCATCCAC-CAT-CCCGC-GCCA-CGTACA-A-----T--AA-AAT---G-A---GT---GG---G-GA---A--T-CCT--AGTT-GT-CTC--CGT-ATA-ACTCAA-AACGATCA--CT--AAGAC-CACCTC-CACCATATACCAAGGATGAGAAG----ATG-----------A--------CT----------CACG-----TATC-----C--TTTCC-GGG-CTG--TCCTC-------AGACT-CCAGAAAAATCAGGA-TCTTCTCCCCTCACAATC-------AA--CTCGTTC-TGCCGAGTC--TCGCAAGGA-ACCCA-T-AGGA---ATTCTCC----GGGGCCCC-ACCTGTTA-TGTAGACACGA-A-AC-TT-CCACATCTCACACGTGGACAA-ATATAA-C---ACCA-----A--A--G--C-TCAACCACGATAGAGCACCCGAATTTAACA-A--A---T-C---CTTATCCAT--GCAACTCT-CA----CAACT-CGAA-TC-CAA-CG-AA------TC---ACCCAAGC--CAG-CACTCACGCGCGAGCATT--T---T---C-A-CTA----------ACGCTA--T--GACCAA----GTGC-------CGA----G--GGC----ATCC-A-----G-CACCGAA-TCT-CAGAG-AGCG-TT-----ACGCAATCTA-------C--GGTT-CCACAGAT---A-TA-CAT----C-TGAC---TAAC--TT---CCTATCTGA--A-----------GT---G----------GGCGAAAGGGC----A-T-A-A---G---GTC--TTTGACAG--TGGATGT-GCGA-CA---TA---T-A-T----C-T-----TCAT-GACGAC----AAACATCC-CCAGCAGC---C-TCAT--TCCTAGGAC--AGTT--C-CGACGGCTATCC-CAAAAGTAAGT-AG-TCTTA---T---CTC
gi|9 : taatgggacaaaattaagaataattcagatttttgtacattaaaaatcaacgttttgactaaaattgatgacactttgtagatatattacatacgataaggtttaccattgaaaatattcaaaaggtatataacatgcggtcatcttgaatggaggccatcttggaagccgattttttatttctctcttttcggtaccttggaagcaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaccccaactatgacacatTTTTCTCC----A--AAAAG-AT--G----GG-A-T---CCA-CAA-CCT--AAACC--G--G----C----TTAA-ACGGG-GAAATAA-G-A-GT-GTCA-GTGGC-ATTAATCCGGG-GTAAATACAA-GCT-AG--GC-AGGG---TCGA---AC-AC--A--C---TAAA---GA-AAA-GCAGG-AGG--ACACAA-ATGCCCGCTT--AGAT-AG--GGT--C------GGGTA-GTCCGGA--TCGTGTCT----A-------GA---AG-TGGAAGTG----CG-G---G---CG-AAACGACAA--------TC-TCCA----T-TCCGCCATAA-CGTACA-TGTACAT-CCA-AAG---GCAC--AT---GA---A-GG---A--T-C-T--TGGTTGT-TTG--TGT-----ACTCAA-------TAT-CT-------------C-TAGC-----C------------------TG--------------------------------------------T-----C--CT--CCGGG-CTG-TCCCTC-------ATCCT-CCAGTGT--G-TAGA-TTT-CCC-----A-A-CC-------AA--C--AT-CCTGC-G-GTG--TC--AGG---ACCCA-T-AGGGTGGGTTCTCC----TGGGTCCC-ACCTGCCT-GG--GA-ACCATC----TT-CT-C-TCTT---CAGAAAC-A----TGG-C---GCTC-----T--A--G--C-TCAGCAAG--T--AGCACCCT--TT--AC--AC-A---T-C---CTTTC---C--GCAACG-C-CG----CAACT---CATTC-CAA-AG-GA-----TTC---ACCT-G--G-CAG--AT---CCGAG-AGGAAT--TC--C---C-A-CTA----------GC---G--T--GGCA-A----GTG--------CAA----G--GC-----ATC--A-----G-CA--CAA-ACT-CAGAG-AGT--------------ATCTGAA-T-GCTA-GGTTCC-----ACC--A-TACAAT----C-TG-C---CAAC--TC---CCTATCGA---A-----------GT---G----------GGGA---GAGC----A-T-A-A---G---GAT--ACGGAAA---TGG-TGG-A-GA-CA---AA---T-ACT----T-T-----C--T-GA-Gaccccctccccccacggagagaaatcgcagccccaggtct
gi|17 : -CT---AAACC--GGGT----T----T-AA-A-GGG-G-------G-G-GT-GCCA-GTGGC-ACTCCTCCGGG--CAAAAACAA-GGT-AG--GC-AGGA---CCGA---AG-CC--AACC---CAA----GA-AAA-ACAAC-AGT--GCACAA-GTACCCGCCT--AGAT-AG--GGT--T------GGGCA---GTTAAGATCGTGTCC----A-------GAAGGGA-CG----TC----TAGG---G---CGAAA-CGGCAAGATACATGTA-TCCAC-TAT-TCCGCCGCCA-CGTACA-T-----C-CAA-AGG---cctcgttctgggattccacgcaaaggtcatctgtttcttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatcggcttacaggtcctacgcttgaacattcccccatttggatggagaatgggcctgcaatgaatacactca
gi|4 : c-CC--A--G---CAC----GA-AAA-GCTA--AAG--GCACAGAGT-ACCGCCTTCAGG--AT--AGT--GAGTTGGGGGCAGATCGTAGAATCGTTGTCCA--A-------GA---GG-T-----CT----CA-GTATG---CA-TA-CGGCAA--------TCATCCGA-TAT-TCTGCTGCCA-CGTAACGT-----TGCAGTAAG---G-A---AT---AGGTGA-GGCAAA--T-CCT--GGTTGTG-CTC--CG--ATGCA-TC-------------CT--TA-AC-CAC-TC-CACC-------A----T----------ATG-----------A--------TC----------CA-GACGGATACTAGTACC--TT--C-CGG-CTG-TTCCTCC------AGCTT-CCAGAGT---CTGGA-TTATTCC-----A-A-TCTT-----AA--C--GTTC-TGT-G-GTC--TC--AAG---ACCCAATATGGG---GTTCTTC----TG---CCCGACCTGTTA-GGA-GA-ACAA-T-AAACT-CC-CATCCC---AATG--C-A--T-TCG-A---GCTC-----ACAA--A--C-TCAACAGA--T--AGCAGCCCT-TT--AC--A--AAAAT-CGCATTTCT---TCTGCAACT-T-CG----CAACT-CG-A-TCACTA-GGAGA-----TTC---A-CC-AGGGCCAT-GAT---CCGA--AGAAAT--TATCT---C-A-CTACGCC------GC---A--T--GAC--A----GAG--------TGA----GACGGTATACA----G-----GCCA--GAATTCT-CAGCA-AGCATTT-----C---AA-----A-T-GCTA-GGTT-CCAAA-AT---A-TA-AAT----C-T-------AAC--TT---CCTCATCGGCAA-----------GT---------------GGG---AGGC----A-T-A-ACGCG---TCT--ACGGATACA-TGG--GT-G-GA-CA---TAATCT-A-TAATCC-T-----C--TAGATGAC----CAACATC--GCCCCAGC---C-TT-CGTTCCT-AG-G--AG-T--CGCGCT--CTGCC----GA---AATT-AGTCTCTA---T---TCCcaccgaaggaaccgtgattgtgtggg
gi|7 : ccaCAG--------TC-TGAAT-CATGTCCGCCGCCA-CGTACG-T-----T-CAA-TGGTTTG-A---G----AG---A-AA---C--C-C-T--GGTC-GT-ATG--CAT-----ACTCAA-------TAT-CCC-TAGAC-AAC-TC-CACC-------A----T----------TTG-----------------------------------------TATC-----T--TT--C-GGG-CTG-TTCCTC-------AGCCT-CCAGAGT--T-TGGA-TTTTCC------A-AATC-------AA--C--GTTCC--ACG-GTC--TC--AAG---ACCCA-T-AGGG---CTTCTCC----TAAGTTCC-ACCTGTTT-GG--GA-ACAA---AC-TT-CC-C-TCTT---CATGGA--A-A--TGG-T---GCTC-----A--A--T--C-TCAAC-AC--T--AGCACCCT--TT--ACA-A--A---T-C---CTTCT---T--GCAACT-T-CA----CAACT-CG-A-TC-CAA-GA-GA-----TTT---A-CC-AG-A-CAG--AT---CCGGG-AGGAAT--TC--C---C-A-CTA----------GC---A--T--GACA-A----GTG--------CGA----T--GT-----ATC--A-----G-CA--GAA-TAT-CAGAG-AGC--T------------TCTGAA-T-GCTAGGATT-C-----ACC--A-TATAAT----C-TG-C---CAAC--TT---CATATTGA---A-----------GT---G----------GGGA---GTCC----A-T-T-A---G---GCT--ACGGATA---TGG-TGT-G-GA-CA---CA---T-A-T----CTT-----C--T-GA-GG-----CAGCAT--AACCCTAGC---C-T--TT-TCCT-GG-G--AG-T--C-CGCT--CTGCC----AA---AAGT-A--TTCTA---TCC-CCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAG---TCACAT-G--C-A-GTTTC-----AGCTA-TTATA-CA--T----CCAC--------CCCCACTT-G--GATGGAGAAT----GG-G-CC----TGCA-AT----AAAT---CA---AC----TCAAT-C-CCCAA-T--A---TG--C-T-------A-AT-TT-C---------TG------CC-C----TA-G-TA---TCCA---CCACGGG----ATCT--AC---ACGTAG---GTCC--TG-A-ACCCA-T-AAT--T--AC-A-TTGT-A------------TAT--CT-TGTT---------G--------A-G-TGTC-TCAACTG---GCCAGT--G------A--TG---A--TG--C----ACCCTA-G-TCG--C-CTT--Cccccgctgagagaatgcttatgccccaggtctcaatttttgctgctatacatatctcgcaaaggaagtgtattaccaagcaacatggagtagcttcaaggaatagcccataataaagagtacattccacccttcacttggatggggatgagcccgcaataaatctccactcattcccaagtattcgctagatttctgcctagttccaccacgggtctctctgcaccgtacggttccgaccccgctaattcagcccgatattgattctcgcttgcgagttgtctcacctgccagtgaggtgaatatgcagcgcactcgccttccccctgagaaccgaaaagcgaatcttaacatcgtgatcaaacgtaaatcataatcttggctatcttctagagtcatctccccgagcccactcatccctggttatctcgggttcccactcccttgtgtgtaacgtctttgagcataacgctctaagctgctaccagcctaccaaccaatccgatccataacccccgataactgtcctcgaacaaaagtga
gi|10 : acattcccccacattttctctgacatgatgggatccataacctaaactgtcttggacggggaaacaagaatatcagtggcactactccggggtaaaaccaaggtaggcaggaccgaagtccaccacagaaaaggaacagggcacaagtgaccgcctagataggtttggcaTAC-CTG--CGTTA----CTCAA-C-----AAT-CCC-TAGAC--AC-TCGCACC-----ACA----T-----------TG-----------A--------CCGGGCGGATACTA-G-----TATC-----CT-CC--C-GGGACTG--TCCTC--------GCCT-CTAGAGT---CTAGG-TTTTTC------A-AATCCTTATT-AA--C--ATTC-TGCGC-GTC--TC--AAG---ATCCA-T-AGGG------TTTC----AGGGTTCCAAACTGTTA-CT--GA-ACAA-CTAA-AC-AC-C-TCTC---CAAGGA--A-AT-GGC-C---GCTCCTTGAA--A--GGCC-TCAAC-AT--T--AGCACCCT--TT--ACATA--A---T-CCA-TTCTT---T--AGAACT-T-CGCCGCCAACTT--AA-TA-CAA-GG-G---CATTTCGA-AACC-AGGC-CAGACCC---CGG---AGGAATTAT---C---C-ACCTA----------GC---A--TTGGAC--ACATGGTGGT------CGACAATG--GGTCC--A----G-----C-CA--GAA-TCT-C-AGA-GGC--T------------TCCGAA-TAGCTA-AATC-C-----ACC--A-TA-AAT----TATG-C---CAAC--TTTAACCT--------ATCGACTACCATGTATCG----------CGAG---GGACA---A-T-A-A---G---GGT--AGAGATTT--TGG-TTT-GTGA-CAC--CA---T-A-T----C-TATAACC--T-TA-G------CAACAT-CA-CCCCAGC---A-TCTTGTTCCT-GGAGTCCG-T--CTCGCT--CTGC---CAAA---CAGTAAGTCATTA---T---Ccct
gi|5 : atatctaTAC-CTG--CGTTA----CTCAA-C-----AAT-CCC-TAGAG-CAC-TC-CACC-----ACA----TGACCGGGCGGAT------------A--------CT-----------A-G-----TATC-----CTTCC--C-GGA-CTG--TCCTC--------GCCT--CTGAGT--CGTAG--TTTTTTC-----A-AATCCTTATTAAA--C--ATTC-TGCGC-GTC--C---AAG---ATCCA-T-AGGG------TTTC----AGGGTCCA-ACTTGTTA-CG---A-ACAAAC-TA-AC-AC-C-TCTC---CAAGGA--A-AT-GGC-C---GCTCCTTGAA--A--G--CCTCAACA-T--T--AGCACCCTT-TT--AC--ATAA---T-C---TTT-T---T--AGAACT-TCCG----CAACTT--AA-TA-CAA-GG-G---CATTTTTCAATCC-ATGG-CAGACCC---CGG----AGAATTAT---C---C-C-CTA----------GC---GATT--GAC--A----ATGGTGGTAGTCGACATTG--GGTC---C----A-----G-CA--GAA-TCT-TCAG--AGC--TT-------------CGAA-T-GCTCAAACA-C-----ATCAAA-TA-A--------TG-C---CAAC--TTAC-CCT--------A-----------TC---GAAAGTTTCGCAGAG---GGAC----A-T-A-A---G---G-T--AGAGAT-T--TGGTTGTCG-GA-CAACCTA---TGA-T----C-T-----A--T-AA-CTCGTAGCAACAT-CA-CCCCAGCATTC-TT-CGTTCCT-GGAG--TC-T--C-CGCT--CTttctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagccacataacaggttacagcaaatcgaccaacaaaattcaccccccgtgtcgatgggaaatagaggacgcggcgcacatacctaaatcccaaactcagtctacacagtaaatgctccacgtaaatattctgacacactccaatagtccaccacggaactctgtcatgtaggttc
gi|13 : atactaG----CAACTC-G-A-TC-CAA-GG-GA-----TTC---ACC--AG-G-CAG--AT---CCGGG-AGGAAT--T---C---CCG-CTA----------GC---G--T--GAC--AA---GTG--------CGA----G--AT-----ATC--A-----G-TA--GAA-TCT-CAGAG-AGC--------------ATTTGAA-T-GCTA-GGTT-CC----ACA--A-TATAAT----C-TG-C---TAAC--TT---CCTATCGA---A-----------GT---G----------GAGA---CGGCATTTA-T-A-A---G---GTT--ACAGACA---TGG-TGT-G-GA-CA---TA---A-A-T----CTT-----C--T-GA-GA-----CAACATC--GCCCCAGC---C-T--CG-TCCT-GG-G--AG-T--C-CGCT--CTGCC----AA---AAGT-AG-TCTTA---TCTACTCTCCCCACCCCCTGGAGAGAATGCTATGCCCCAGGTCTAATTTTGCCTTACATTCTCGCAGGAAGTATGTACCAAGCAACATGGAGCCACAAGGGAG---CCACAT-A--C-AGGTTC------AGCTA-TTGTA-CAT-T----CA-C--------CCCCACTT-G--GATGGGAAAT----GG-G-CC----CGCA-TTA---AATC---C----AC----TCA-TTT-CCCAG-T--A---TG--C-C-------A-TG-TT-C---------TG------CC-C----TA-G-TA---TCCA---CCACGGG---C-CCTGCAC---GTG--G---GTCC--TG-A-CCCCG-T-AAT--T--GC-A-CTGT-A------------Tgccaaatcatgtaagtcaattatcttctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcagccaatagcagttacagcaataacgactacaaaattgcataccccccgtggatgggaaatagagggcgcgcgcacatacctaaatccaaactcatcacacagtaatgctccaacgtcaatatatcgtgaccctaaatatccaaaaccacggaacttctgtcatgtaggttcattgtaacccgaataacacaatagaaagcctgaattactaaccatcgtctgcggcattctcatcttctgtgagccagtgggttgactgaccagtaccggcctttccctgcaatctgctcttaggacatccctcccgagaccactgcattcctggtttgggtatctaaacttcagctatgtacacctctaagctgttaccagagccctatccaaacgcgatccatattctctcttaacgtcctcggaaaggtggatgccttaaaacacggcacgcctgtaacgtcctccggccgccctgcgtttcacg
gi|25 : C---ACCA-AGC---AG--AT---CCGGG-AGGATT--T---T---C-A-CTA----------GC---A--T--GACA-A----GTG--------CGA----G--G
gi|11 : c--A-TT-AAT----C-TG-C---CA-----T---CCT--------A-----------GT---G----------GGAA---GGAC----AAT-ATA---G---GTTTTACGGATAT----G-TGT-A-GA-CA---CA---T-A-T----C-T-----T--C-GA-GGC----AAACCTC-ACCCC--GC---C----CG-TCCT-GG-G--AG-TTCC-CGCT-----TCTGCCAA---AAGT-AGT----A---TA--CCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGCCCACAT-A--CCAGGTT-C----AGTCTA--TGTAACA--TT---CAC---------CTCCAC-TTG--GATGGGGAAT---AGG-GACC----CGCA-ATT---AA-T---CCA--AC----TCAGTCC-CC----T--A---TG--C-T-------A-AT-TTTC---------TG------TC------TA-G-TAATCTCCA---CCACGGA---CTTTTGCCC----CGTAG---GTCT--CG-A-ACCTG-T-AAT--T--GCCA-CTGT-A------------TAT--CTTCAGT---------G--------A-G-T-TC-TCACCTG---GCCAGT--G------G--TG---A--TG--C----ACC--GCA-T-G--C-CTTCCCCCCCTG-GAAA-TCT---CT--ATCT-CTA--GGTCA--TC-------A---A-C---CCGAGCC-CACT-CATT-TCGGTta
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gi|9 : atatctatacctgcgttactcaacaatccctagacactcgcaccacattgaccgggcggatactagtatcctcccgggactgtcctcgcctctagagtctaggtttttcaaatccttattaacattctgcgcgtctcaagatccatagggtttcagggttccaaactgttactgaacaactaaacacctctccaaggaaatggccgctccttgaaaggcctcaacattagcaccctttacataatccattctttagaacttcgccgccaacttaatacaagggcatttcgaaaccaggccagaccccggaggaattatccacctagcattggacacatggtggtcgacaatgggtccagccagaatctcagaggcttccgaatagctaaatccaccataaattatgccaactttaacctatcgactaccatgtatcgcgagggacaataagggtagagattttggtttgtgacaccatatctataaccttagcaacatcaccccagcatcttgttcctggagtccgtctcgctctgccaaacagtaagtcattatcttctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngT-A--C-AGGTCCT----ACGCT---TGAA-CA--T------TC--------CCCCAT-TTG--GATGGAGAAT----GG-G-CC----TGCA-ATG---AATA---C----AC----TCAaactctgtcatgtaggttc
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2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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gi|11 : atatctatacctgcgttactcaacaatccctagacactcgcaccacattgaccgggcggatactagtatcctcccgggactgtcctcgcctctagagtctaggtttttcaaatccttattaacattctgcgcgtctcaagatccatagggtttcagggttccaaactgttactgaacaactaaacacctctccaaggaaatggccgctccttgaaaggcctcaacattagcaccctttacataatccattctttagaacttcgccgccaacttaatacaagggcatttcgaaaccaggccagaccccggaggaattatccacctagcattggacacatggtggtcgacaatgggtccagccagaatctcagaggcttccgaatagctaaatccaccataaattatgccaactttaacctatcgactaccatgtatcgcgagggacaataagggtagagattttggtttgtgacaccatatctataaccttagcaacatcaccccagcatcttgttcctggagtccgtctcgctctgccaaacagtaagtcattatcttctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--A-TT-AAT----C-TG-C---CA-----T---CCT-A-------G------T---G----GG---AAGGA-CAAT----ATA---G---GTTTTACGGATAT---G-T--GT-A-GA-CA---C-A---T-A-T----C-T-----T--C-GA-GGC----AAACCTC-A-CCCC-G----C--C----CG-T-CCT-GG-G--AGTTCC-C-----GCTTCTGCC----AAAAGT-AGT--A-----TACC--NN-NNN--N---NNNNNNN--NNNNNNNNN--NNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN-NNNNNN--NN-NNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNG--AGCCCACAT-A--CCAGGTTC--AGTCTA--T-GT---AACA----TT------------CACCTCC-A-C-TTG--GATGGGGAAT---AG-G-GACC----CGCA-ATT---AA-T---CCA--AC----TCAGTCCCC-----TA--T--G-C-T-------A-AT-TTTC---------TG-----TC-------TA-G-TAATCTCCA---CCACGG-A---C-TTTTG-CCC-CGTA-G---GTCT--CG-A-ACCTG-TAA-T--T--GCCA-C-----------TGT-AT-----A-TCTTCAG-T---GAG-T----TC-TCACCT------GGCCAGT--GG------TG---A--TG--C----ACC--GCA-T-GC-CTTCCCCCCCTG-GAAA-TCT---CTATCT-CTA--GGTCA--TC-------AA-CC---CGAGCC-CACT-CATT-TCGGT
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gi|12 : AACTGT-----T-ACA------CTCCCCCCGTTTTCTCC----G-AAAGG-ACAATG---T-CCATAG-CCTAAA--CT--G--C----T----T-T---------------G-A-GT-GCCA-GTGGC-ATTCCTCCAGA-GCAAAATCAA-GGT-AG--AC-AGGA---CCGA---AGCCC-A--A---CA-A--A---TAAAA-GCAAC-AGG--ACACA-A-G-TGTCTGCC-T---AGAT-AG--G-A-TC-GG-G-GCA-G-T-C-TGT-ATCGT-G-TC---CAGAAGAG-GA-A-----GT-----CCC--GG------GCGAAGCGGAAA--------TA-TCCCC-CAT-TCCACCCAAA-CGTA-CGT-----C-CAA-AAGC-A-T-C-----AG---A-GG---AACC-C-T---G-G-T-TGTCTG--GGT------CCTTAA-C-ACCC-CTA-GTC-CAT-TC-CA-------CCA----T------ATG-tcttaatttgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaactgttacactccccccgttttctccgaaaggacaatgtccatagcctaaactgctttgagtgccagtggcattcctccagagcaaaatcaaggtagacaggaccgaagcccaacaaataaaagcaacaggacacaagtgtctgcctagataggatcggggcagtctgtatcgtgtccagaagaggaagtcccgggcgaagcggaaatatcccccattccacccaaacgtacgtccaaaagcatcagaggaaccctggttgtctgggtccttaacacccctagtccattccaccatatg
gi|13 : tgcggcaaagttaataataaatcagattaaaaaatattaaaaatcaacgctttgaccaaaattaatgaatctttgtagatgtattacatacaattaggtttaccattaaaaatgcccaaaatgtatataacaggcagccatcttgaataagccgattttttatttctctttttttcggtaacttcaaagcggtaatatcttaatttgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaGC----AAC-T-CGA-T-C-CA--AGGGA-----TTC----ACC-A-G-G--C-AG-A-TC---CGG-G-AGGAAT--T---CCCGC-TA----------GCG---T--GAC--AA---GTG--------CGA----G--AT-A---T-C-AG--T-A--GA--A-TC-TCAGAGAGC----------ATTT-GAA-T-GCT-A-GG-TT-CC--AC---A--A-TATAAT----C-TG-C---TAAC--TT---CCT-ATCGA--AG------T---G----GA---GACGG-CA-TTTATA-A---G---GTT--ACAGACAT--GG-T--GT-G-GA-CA---T-A---A-A-T----C-TT----C--T-GA-GAC-----AACATC-G-CCCCAG----C--C-T--CG-T-CCT-GG-G--AGT--C-C-----GCT-CTG-CC---AAAAGT-AGT--CTTATCTA-C--TC-TCC--C---CACCCCC--TGGAGAGAA--TGC-TATGCCCCAGGTCT-AA-TTTTGC--CT-TACAT-TCTCGC--AGGAAGTATG-TACCAAGCAACATGG---AGCCACAAGG-G--AGCC-ACAT-A--C-AGGTTC--AG-CTA--TTGT---A-CAT---T-------------CA-CCCCCA-CTT-G--GATGGGAAAT----G-G-G-CC----CGCA-TTA---AATC---C----AC----TCA-TTTCC-CAG-TA--T--G-C-C-------A-TG-TT-C---------TG-----CC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---C-CCT-G-CACGTG---G---GTCC--TG-A-CCCCG-TAA-T--T--GC-A-C-----------TGT-AT-----
gi|14 : AG-CTAAATTGT---AGCA----TTT-----------CAACATTCA-C-TTG--GATGGGGAAT---TG-G---CC----CGCACATC---AAGG---C----GCGACATTAATTCTC-CAG-TA--G--GGC-T-------T-AT-T--C---------TG-----CC--CACCTCA-A-TA---TACA---CCACGG-G---C-AAT-GACACGT-TA-GTTTGCCA--TG-A-CCCAG-TAAATAAT--GC-A-T-----------TGT-AA-----A-TC-TCAT-T---GAGGTG---TC-TCACCT------GGCCATT--AAGACGCATG---ACGTG--C----AGC--G-A-TCGC-CCT--CCCCCTT-A-AA-TAT---TCAGAT-TCA-TAGGCAT-CCCTACTCTAT-CC-----AGCC-CACT-C--TCCC
gi|15 : ctacacaagcattt-AT-----A-TC-TCGT-T---CGG-TG---TC-TCACCT------GGCCAGT--GG------TG---A--TG--CAGCGAGC--G-A-TCGCGCTT--CCCCCTG-G-AA-TCT---CTATCT-CTA---GGCAA-TC-------CTACG---CGAA---CACG-CATTCCTGGTtgcttactcgttcactcacttgcggtgtgctttaagcatttatccatcaaaacctctcaagctatgctaccagcccgtaccacaatccgagtaccatatcacgctctcgactgtatccacgcgacaagactgggtgccttaaaacagcacacgcacgaacctctatccaggcgccccttgtttcacg
gi|16 : ttacCT------GGCCAGT--TG------AG---A--TA--C-------------TCA----T--TCCCCTG-G-AA-TTT---CTATCT-CTA-G-----T-TC-------AT-CCTCCCGAGCC-CACT-TATTCCCGGTttctcgtacatccttgggatggttaagctttttagctaaacctcttaggctgctaccactctgagcacaatccgcaccataatcctctctactgtcctatgaaaaggtgggtgtcttaaaaaacggcacacgcctgtaagtttccctcgcgtggtcctggattttcaccagt
gi|17 : cacca-CCTAAA--CC--GGGT----T----T-AA-A-GGG-G------G-G-GT-GCCA-GTGGC-ACTCCTCC-GG-GCAAAAACAA-GGT-AG--GC-AGGA---CCGA---AG-CC-AACC---CA----A---GAAAA-ACAAC-AGT--GCACA-A-G-TACCCGCC-T---AGAT-AG--G-G-T--TG-G-GCA-G-T---TAAGATCGT-G-TC---CA-------GA-AGGGACGT-----CTA--GG------GCGAAACGGCAAGATACATGTA-TCCAC-TAT-TCCGCCGCCA-CGTA-CAT-----C-CAA-AGGC-A-C-C-----GA---A-GG---A--A-C-C---GTGAT-TGTGTG--ttgtcgggttctctccttgcatgggtgattaagcttcagctaaatctctaagctgctaccagcctaccacaatccgattcatatcctccctactgtcctaggaaaagtagggtgccttaaaacgcacactcctgtacttcctccggcgtcctggttttcacgtgtc
gi|18 : ACAAACTCAG--AAAAAAAAATAT--------ATTAAAA-TCA--ACGACTTTTTACTA--AAAATATCAATTGAAA--CTACTTGT----AGATAT---ATTACATTACAA-ATA--G-AT-ATTTCCATT-GAAC----AAA---TG-TTACA--AAG---GTATATAACATTGC--------------------GGCCTCTATAGAAATC----G------------------GGCA----------------TCT--GA----------------AGCC-GATTTTT---TTT---TT-----ATTC---ATCTC-T-T--TTCG----ATCTC-ATTAAAGAACCGAT----ATgg
gi|19 : actgcgaaatatg------TG---A--TG--C----ACC--G-A-CCAC-TTT--TCTC-TG-G-AA-TCT---CTATGT-CT--GGGGCATCTC-------TT-TT-----ATCC-CATT-TATTCCTGGTt
gi|2 : TGCGACAAA---TTAAGAATAAA-TCAAGAAAAAAAAAAT-T--------ATTAAAA-TTA--ACG--CTT-GACTATTAAAAT---A--TGAAA--CT--TTGT----AGATAT---ATTACACCACCA-ATAAGG-TC-ATT---ATT-A-------AAA---TG-TT-CA--AA----GTATATAACA------------------------GG-------------C----G------------------GCCA----------------TCT--GA----------------AGCC-GA----T---TTT---TT-----ATTAAAACTCGC-T-T--TTCGAGTAACCGT-A-----G---CGAT----ATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAACTAT-----TTACAACCCCCCCCCCTCCATTTTCTTCT---G-AAAGG-ATGG-A---T-C-ATAG-CC-AAA--CT--G--T----C----T-GA-ACGGG-GAAACA-G-A-GT-ACCA-GTGGC-ACTACTCCGGG-GCAAAATCAA-GGT-AG--GC-AGGA---CCGA---AG-CC-A--C---CA-C------GAAAA-GCTAC-AGG--GCACA-ATG-TGACCGCC-T---AGA--AT--G-G-T--GG-C-GCACA-TGC-TGAAATCGT-G-AT---CA-------GA-G-----GC-----TCC--AG------GCG-AACGGCAA--------TC-TCCAC-CAT-TCCGCCGCCA-CGTA-CCT-----T-CAA-AAGG-A-A-T-----AG---A-GG---A--T-C-T---G-GTT-TATCTG--CGTCATACACTCAAA-C-AT-C-TTA-GAC-CAC-TC-CACC-----CCA----T------ATG-AC------------T----------CA-G-----TAT-----TC--CT--CGGG-CTGCTTCCT-C-------AGCCTACCAGAGT--TCTGGA-TT-TTCCC-----A-AGTC-------AAC--GTTCCTGCC--G-GTC--TT--AAG---ACCC-ATC-GGG---AT---CTTTCTGGGTTCC-AC-CTGTTAGG--GA---AC-AACA-A-TTCC-C---TCTT---CATGGAC-AAT-T-GG-C---GCT--C-----AA--G--C-TCAAC------GGCTAGCACCC---CTATTAC--AA--------T-CT-TTCT---T--GCAACT-T-CGC----AAC-TCCGCAT-C-CT--AGGGACCCACTTC----ACCCA-GCG--C-AGCA-TC---GGG-C-AGGAAT--T---TC-AC-TA----------GCA---T--GAC--A----GTG--------CGA----G--GG-A-------AG--C-A--GA--A-TC-TCAAGAAGC-TTA-----AATCT-GGA-T-GCT---GG-TT-C---AT---C--A-TA-AAT----C-TG-C---CAAC--TT---CCT--------AG------T---G----GG---GGGGG-CA-T----A-A---G---GCT--ACGGACAT-TGG-T--GT-G-GA-CA---C-A---T-A-T----C-T-----C--T-GA-GGC----CAACCTCCACCCCCAG----C--C-TCACG-T-CCT-GGAG--AGT--C-C-----GCT-CTATCCACAAAAAGT-AGT--T---CCTATC--CC-NNN--N---NNNNNNN--NNNNNNNNN--NNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN-NNNNNN--NN-NNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNN-N--AGCC-ACAT-A--C-AGGTTTCAAG-CTAC-CTGT---A-CA----T-------------CATTCCCCA-C-T-G--GATGGGAAAT---GG-G-G-CC----CGCA-ATA---AAAT---C----AC----CCAGTCCCC-CAA-TA--T--T-C-T-------A-AT-TT-C---------TG-----TC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---CGTTT-G-CACACG-A-G---GTCC--TG-A-ACCTG-TAA-T--T--GC-A-C-----------TGT-AT-----A-TA-TCAT-T---GAG-TG---TCGTCACCT------GGCCAGT--GG------TG---A--TG--C----AGC--G-A-TCGC-TTT--CTTCCTG-G-AA-TCT---CTATCT-CTAGGGGGCAT-TC-------AT-CC---CGAGCC-CACTACATTCCCGGTtcctcggtccactcctctgattacctgtgcgattaaactccaacccaacctccgggttgctaccacgaaccatatcctccctactgtccttggaaacggagggcgctctggtttcatgtaggaatgtctattattcctnnnnnnn
gi|20 : ACAAAA--TTAAAACTAAAATCG---------AAAT-TTTTTTTTTATTAAAAATCA--AC---CTTTAGCTA--AAACT-TGA--TGAAAACTT--TTGT----AGACAT---ATTACAT-AC-A-ATAAGG-TT-TCC---ATT-G-------AAA--------------G----GTATATAACA------------------------TG-------------C----G------------------GCCA----------------TCTTGAATGGCGAACATCTTGGTAGCC-GA----T---TTT---TTTTTTAATTT---TTCTCAT-T--TT--GATA--CTTAA--AAAG---CGAT----c
gi|21 : atgaTGCGACAAAA--TTAAGAATAAA-TCAGAAAAAAAAA----T--------ATTAAAAATTA--ACG--CTTTGACTA--AA--T-TGA--TGAAA--CT--TTGTTTGTAGATA----ATTACAT-ACCA--TAAGG-TTTATT---ATT-A-------AAAA--TG-TT-CATAAA----GTATATAA-A------------------------GG-------------C----G------------------GCCA----------------ACTTGGA----------------AGCT-GA----T---TTT---TT-----ATTT---CTCTT-T-T--T---GGT-ACCTT-A--AAAG---CGAT----A
gi|23 : aaA--AA----GTAAATAACA------------------------GG-------------A----G------------------GCCA----------------TCTTGGA----------------AGTC-AA----TTTCTTT---TT-----A-TT---CACCC-TAT--TTC-TGT-ATCTT-A--ATAG---CGAT----Aa
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gi|25 : ctCCA-A-G--C-AG-A-TC---CGG-G-AGGATT--T---TC-AC-TA----------GCA---T--GACA-A----GTG--------CGA----G--G
gi|26 : ccaCCT-CAG-CA--T--G-T-T-------A-TT-TT-C---------TG-----CC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---C-TTT-G-ta
gi|27 : tC-T-CGA-T-C-CA--AGGG----A-CTC----A-CCA-G-G--C-AG-A-TC---C
gi|3 : TGGGACAAAA--TTAAGAATAAT-TCAG----------AT-TTTTGTAC-ATTAAAAATCA--ACG--TTTTGACTA--AAA-T-TGA--TGACA--CT--TTGT----AGATAT---ATTACA-TA-CG-ATAAGGTTT-ACC---ATTGA-------AAA---TA-TT-CA--AAAG--GTATATAACA------------------------TG-------------C----G------------------GTCATCTTGAATGGAGGCCATCTTGGA----------------AGCC-GA----T---TTT---TT-----ATTT---CTCTC-T-T--TTC-GGT-ACCTT-G--GAAG---CAAT----A
gi|3 : taaCCCCAACTAT-----G-ACACATCCCCCCAT----TTTTCTCTG---GGAAAGGCATGGGA---A-CCATAGGCCTAAAAACTACG--G----CATATT-GATACGGA-GAAATAAC-ACGT-ACCAAGTGGCCGCTACTCTGGG-GCAAAACCAAAGGT-AGAGGC-AGGA---CCGACACAC-CC-A--CACACA-C--A---AGAAA-GCAACCAGGCAGCACA-A-GATGACCGCCCT---GGAT-AG--G-G-T--GGCG-GC--T-T-C-TGGCATCGT-GATCGGCCA-------GACG-----GT-----CTC--GGTACGGGACGAAACGGCAA--------TCATCCAC-CAT-CCCGC-GCCA-CGTA-CAA-----T--AA-AATG-A-G-T-----GG---G-GA---A--T-CCT---A-GTT--GTCTC--CGT-ATA-ACTCAAAACGATCA-CTAAGAC-CACCTC-CACCATATACCAAGGATGAGAAGATG-AC------------T----------CACG-----TAT-----CC--TTTCCGGG-CTG-T-CCT-C-------AGACT-CCAGAAAAATCAGGA-TC-TTCTCCCCTCACAATC-------AACTCGTTC-TG-CCGA-GTC--TCGCAAGGA-ACCC-ATA-GGA---AT---TCTCCGGGGCCCC-AC-CTGTTATGTAGAC--AC-GAA--A-CTTC-CACATCTCACACGTGGACAAATAT-AA-C---ACC--A-----AA--G--C-TCAACCACGATAG--AGCACCCGAATT-TAACA-AA--------T-CC-TTATCCAT--GCAACTCT-CAC----AAC-T-CGAAT-C-CA--ACGAA------TC----ACCCA-A-GC-C-AGCACTCACGCGC-G-AGCATT--T---TC-AC-TA----------ACGCTAT--GACCAA----GTGC-------CGA----G--GGCA---TCC-AG--C-ACCGA--A-TC-TCAGAGAGCGTT------A--CG-CAA-T--CT-ACGG-TTCC---ACAGAT--A-TA-CAT----C-TGAC---TAAC--TT---CCT-ATCTGA-AG------T---G----GGCGAAAGGG-CA-T----A-A---G---GTC--TTTGACAG-TGGAT--GT-GCGA-CA---T-A---T-A-T----C-T-----TCAT-GACGAC----AAACATCCC-CAGCAG----C--C-T--CATT-CCTAGGAC--AGT--T-CCGACGGCT-AT-CCC---AAAAGTAAGTAGT---CTTATC--TCACCC--C---CTCCCCCCACGGAGAGAAATCGC--A-GCCCCAGGTCT-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaccccaactatgacacatccccccatttttctctgggaaaggcatgggaaccataggcctaaaaactacggcatattgatacggagaaataacacgtaccaagtggccgctactctggggcaaaaccaaaggtagaggcaggaccgacacacccacacacacaagaaagcaaccaggcagcacaagatgaccgccctggatagggtggcggcttctggcatcgtgatcggccagacggtctcggtacgggacgaaacggcaatcatccaccatcccgcgccacgtacaataaaatgagtggggaatcctagttgtctccgtataactcaaaacgatcactaagaccacctccaccatataccaaggatgagaagatgactcacgtatcctttccgggctgtcctcagactccagaaaaatcaggatcttctcccctcacaatcaactcgttctgccgagtctcgcaaggaacccataggaattctccggggccccacctgttatgtagacacgaaacttccacatctcacacgtggacaaatataacaccaaagctcaaccacgatagagcacccgaatttaacaaatccttatccatgcaactctcacaactcgaatccaacgaatcacccaagccagcactcacgcgcgagcattttcactaacgctatgaccaagtgccgagggcatccagcaccgaatctcagagagcgttacgcaatctacggttccacagatatacatctgactaacttcctatctgaagtgggcgaaagggcataaggtctttgacagtggatgtgcgacatatatcttcatgacgacaaacatccccagcagcctcattcctaggacagttccgacggctatcccaaaagtaagtagtcttatctcaccccctccccccacggagagaaatcgcagccccaggtct
gi|4 : taatgggacaaaattaagaataattcagatttttgtacattaaaaatcaacgttttgactaaaattgatgacactttgtagatatattacatacgataaggtttaccattgaaaatattcaaaaggtatataacatgcggtcatcttgaatggaggccatcttggaagccgattttttatttctctcttttcggtaccttggaagcaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaca-CC-A--C---CAGC--AC--GAAAA-GCTA--AAG--GCACAGA-G-T-ACCGCC-TTCAGGAT-AGTGA-G-TTGGG-G-GCA-GAT-CGTAGAATCGTTG-TC---CAA------GA-G-----GT-----CTC--AGTAT---GC-ATACGGCAA--------TCATCCGA-TAT-TCTGCTGCCA-CGTAACGT-----TGCAGTAAGG-A-A-T-----AGGTGA-GGCAAA--T-CCT---G-GTTGTG-CTC--CG----------ATG-C-ATCC-TTA--AC-CAC-TC-CACC-------A----T------ATG-AT------------C----------CA-GACGGATACTAGTACC--TT--CCGG-CTG-TTCCTCC-------AGCTT-CCAGAG---TCTGGA-TTATTCC--------AATCTT-----AAC--GTT-CTG-T--G-GTC--TC--AAG---ACCCAATATGGG---GT---TCTTCTG---CCCGAC-CTGTTAGGA-GA---AC-AATAAA-CTCC-CA--TCCC---AATG--C--AT-T-CG-A---GCTCAC-----AA--A--C-TCAAC------AGATAGCAGCC---CT-TTACA-AAAATCGCATT-TC-TTC----T--GCAACT-T-CGC----AAC-T-CG-AT-CACT--AGGAG---A-TTC----A-CCA-G-GGCC-ATGA-TC---C-G-A-AGAAAT--TATCTC-AC-TACGCC------GCA---T--GAC--A----GAG--------TGA----GACGGTA---TAC-AGGCC-A--GA--ATTC-TCAGCAAGC----------ATTTCAAA-T-GCT-A-GG-TT-CCAAAA---T--A-TA-AAT----C-T-------AAC--TT---CCTCATCGGCAAG------T---G----GG-----AGG-CA-T----A-ACGCG---TCT--ACGGATACATGG----GT-G-GA-CA---T-AATCT-A-TAATCC-T-----C--TAGATGAC----CAACAT-CG-CCCCAG----C--CTT--CGTT-CCT-AG-G--AGT--CGC-----GCT-CTG-CC---GAAATT-AGT--C---TCTATT--CC-C----------CCCGC--T-GAGAGAA--TGCTTATGCCCCAGGTCTCAATTTTTGCTGCTATACATATCTCGCAAAGGAAGTGTATTACCAAGCAACATGGAGTAGCTTCAAGG-AATAGCC--CATAA--T-A------AAG---A----GT---A-CA----TTC-----------CACCCTTCA-CTT-G--GATGGGG-AT----G-A-G-CC----CGCA-AT----AAATCTCC----AC----TCA-TTCCC-AAG-TA--TTCG-C-T-------AGAT-TT-C---------TG------C--C----TA-G-T----TCCA---CCACGG-GTCTC-TCT-G-CAC-CGTACG---GTTC--CG-A-CCCCGCTAA-T--TCAGC-C-C-----------GAT-ATTG---ATTC-TCGC-TTGCGAGTTG---TC-TCACCT-------GCCAGTGAGG------TGAATA--TG--C----AGC--GCACTCGC-CTT--CCCCCTGAG-AA-CC
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gi|10 : cCTG--CGT-T---ACTCAAC-A-ATCC-CTA-GAC--AC-TCGCACC-----ACA----T-------TGACC-----G-GGCGGATAC---TAG-TATCCTC--CCGGGACTG-T-CCTC--------GCCT-CTAGAGT---CTAGG-TT-TTTC------A-AATCCTTATT-AA--C--ATTC-TG-C--GCGTC--TC--AAG---ATCC-A-TA-GGGT---T---TCA---GGGTTCC-AAACTGTTA-CT---GA-AC-AACTAA-ACAC-C---TCTC---CAAGGA--A-AT-GGC-C---GCT--CCTTGAAA--GGCCTCAAC------A-TTAGCACCC----T-TTACATAA--------T-CCATTCT---TTAG-AACT-T-CGCCGCCAAC-T-T-AAT-A-CA--AGGGC---A-TTTCGA-AACCA-G-G--CCA-G-----ACCCC-GG-AGGAA---T--TAT-CC-ACCTA----------GCA---TTGGAC--ACATGGTGGT------CGACAATG--GG---T-C-C-AG--CCA--GA--A-TC-TCAGAG-GC-TT---------CC-GAA-TAGCT-A-AA-TC-C---AC---C--A-TA-AAT----TATG-C---CAAC--TTTAACCT-ATC-G--ACTACCATGT---ATCGC---GAGGGACAAT----A-A---G---GGT--AGAGATTT-TGG-T--TT-GTGA-CA---CCA---T-A-T----C-TATAACC--T-TA-G------CAACATC-A-CCCCAG----CATC-T--TG-TTCCT-GGAGTCCGT--CTC-----GCT-CTGCCA---AACAGTAAGT--C---ATTATC--TT-CTC--cagttctcgggttcctttgggtgattacgccttcttctaactttctaagctgctaccaggcctaccacccaatcgatttcgtcatcttctctagctgtctcggaaaaaggtgggtgccttaaaacgcacatgccttacttctcggcgcggtttccgtg
gi|10 : atatctatac-G--AGCC-ACATAA-C-AGG-TTA-CAGCAAA-TCGACCAA-CAAAATT-------------CACCCCCCG---T-GTCGATGGGAAATAGAGGA--CGCGGCGCAC--ATACCTAAAT---CCCAAAC----TCAGTCTACACAG-TAAAT--G-C-TCCACGTAA-ATATT-C---------TGACACACT--C----CA-A-TAG--TCCA---CCACGGAA---C-TCT-GT-CATGT-A-G---GTTC--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagccacataacaggttacagcaaatcgaccaacaaaattcaccccccgtgtcgatgggaaatagaggacgcggcgcacatacctaaatcccaaactcagtctacacagtaaatgctccacgtaaatattctgacacactccaatagtccaccacggaactctgtcatgtaggttc
gi|11 : atatctatacctgcgttactcaacaatccctagacactcgcaccacattgaccgggcggatactagtatcctcccgggactgtcctcgcctctagagtctaggtttttcaaatccttattaacattctgcgcgtctcaagatccatagggtttcagggttccaaactgttactgaacaactaaacacctctccaaggaaatggccgctccttgaaaggcctcaacattagcaccctttacataatccattctttagaacttcgccgccaacttaatacaagggcatttcgaaaccaggccagaccccggaggaattatccacctagcattggacacatggtggtcgacaatgggtccagccagaatctcagaggcttccgaatagctaaatccaccataaattatgccaactttaacctatcgactaccatgtatcgcgagggacaataagggtagagattttggtttgtgacaccatatctataaccttagcaacatcaccccagcatcttgttcctggagtccgtctcgctctgccaaacagtaagtcattatcttctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--A-TT-AAT----C-TG-C---CA-----T---CCT-A--------------GT---G--GG---AAGGA-CAAT----ATA---G---GTTTTACGGATAT---G-T--GT-A-GA-CA---C-A---T-A-T----C-T-----T--C-GA-GGC----AAACCTC-A-CCCC-G----C--C----CG-T-CCT-GG-G--AGTTCC-C-----GCTTCTGCC----AAAAGT-AGT--A-----TACC--NN-NNN--N---NNNNNNN--NNNNNNNNN--NNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN-NNNNNN--NN-NNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNG--AGCCCACATA--CCAGG-TTC-AGTCTA--T-GT---AACA----TT------------CACCTCC-A-C-TTG--GATGGGGAAT---AGGGAC-C--CGCA---ATT---AA-T---CCA--AC----TCAGTCCCC-----TA--T--G-C-T-------A-AT-TTTC---------TG-----TC-------TA-G-TAATCTCCA---CCACGG-A---C-TTTTGCCC-CGT-A-G---GTCT--CG-A-ACCTG-TAA-T--T--GCCA-C-----------TGT-AT-----A-TCTTCAG-T---GAG-T----TC-TCACCT------GGCCAGT--GG------TG---A--TG--C----ACC--GCA-T-GC-CTTCCCCCCCTG-GAAA-TCT---CTATCT-CTA--GGTCA--TC-------AA-CC---CGAGCC-CACT-CATT-TCGGT
gi|12 : aaattgctcaaggcatccaccaccgagaTGCGGCAAAG--TTAATAAT-AAA-TCA-GATTAA-AAAA------------T----ATTAAAAATCA--ACG--CTTTGACCA---AAA---TTAAT-GAAT--C----T--TTGTAGATGT---ATTACA-TA-CA-ATTAGGTTTACC---ATTAA-------AAA---TG-CC-CA-AAAT-G---TATATAACA------------------------GG-------------C----A------------------GCCA----------------TCTTGAATA----------------AGCC-GA----T---TTTTT-----ATTT---CTCTTTT-T--TTC-G-GTA-A-CTT-C-A--AAGCGGT----A-ATAtctcgggttcactcttgagtgataagacttaaacgaaacctcctaagctgctaccacctaccacaatccgatcaaatcttctctaacgtctcagaaaaaggtgggtggcttaaaaaacacatgcctgtaccttcctcctcgggcggccctggtttcacccgt
gi|12 : AACTG-T-----T-ACA------CTCCCCCCGTTTTCTCC----G-AAAGG-ACAATG---T-CCATAG-CCTAAA--CT--G--C----T----T-T---------------G-A-GT-GCCA-GTGGC-ATTCCTCCAGA-GCAAAATCAA-GGT-AG--AC-AGGA---CCGA---AGCCC-A--A---CA-A--A---TAAAA-GCAAC-AGG--ACACA-A-G-TGTCTGCC-T---AGAT-AG--G-ATC-GG-G-GCA-G-T-C-TGT-ATCGT-G-TC---CAGAAGAG-GA-A-----GT-----CCC--GG------GCGAAGCGGAAA--------TA-TCCCC-CAT-TCCACCCAAA-CGTA-CGT-----C-CAA-AAGC-AT---C---AG---A-GG---AACC-C-T---G-G-T-TGTCTG--GGT------CCTTAA-C-ACCC-CTA-GTC-CAT-TC-CA-------CCA----T------ATGtcttaatttgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaactgttacactccccccgttttctccgaaaggacaatgtccatagcctaaactgctttgagtgccagtggcattcctccagagcaaaatcaaggtagacaggaccgaagcccaacaaataaaagcaacaggacacaagtgtctgcctagataggatcggggcagtctgtatcgtgtccagaagaggaagtcccgggcgaagcggaaatatcccccattccacccaaacgtacgtccaaaagcatcagaggaaccctggttgtctgggtccttaacacccctagtccattccaccatatg
gi|13 : tgcggcaaagttaataataaatcagattaaaaaatattaaaaatcaacgctttgaccaaaattaatgaatctttgtagatgtattacatacaattaggtttaccattaaaaatgcccaaaatgtatataacaggcagccatcttgaataagccgattttttatttctctttttttcggtaacttcaaagcggtaatatcttaatttgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaGC----AAC-T-CGA-T-C-CA--AGGGA-----TTC----ACC-A-G-G--C-A-G-----ATCCG-GG-AGGAA---T--T---CCCGC-TA----------GCG---T--GAC--AA---GTG--------CGA----G--AT---A-T-C-AG--T-A--GA--A-TC-TCAGAGAGC----------ATTT-GAA-T-GCT-A-GG-TT-CC--AC---A--A-TATAAT----C-TG-C---TAAC--TT---CCT-ATC-G--A-----A-GT---G--GA---GACGG-CA-TTTATA-A---G---GTT--ACAGACAT--GG-T--GT-G-GA-CA---T-A---A-A-T----C-TT----C--T-GA-GAC-----AACATC-G-CCCCAG----C--C-T--CG-T-CCT-GG-G--AGT--C-C-----GCT-CTG-CC---AAAAGT-AGT--CTTATCTA-C--TC-TCC--C---CACCCCC--TGGAGAGAA--TGC-TATGCCCCAGGTCT-AA-TTTTGC--CT-TACAT-TCTCGC--AGGAAGTATG-TACCAAGCAACATGG---AGCCACAAGG-G--AGCC-ACATA--C-AGG-TTC--AGCTA--TTGT---A-CAT---T-------------CA-CCCCCA-CTT-G--GATGGGAAAT---GGG--C-C--CGCA---TTA---AATC---C----AC----TCA-TTTCC-CAG-TA--T--G-C-C-------A-TG-TT-C---------TG-----CC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---C-CCT-G--CACGT-G-G---GTCC--TG-A-CCCCG-TAA-T--T--GC-A-C-----------TGT-AT-----
gi|14 : AGCTAAATTGT---AGCA----TTT-----------CAACATTCA-C-TTG--GATGGGGAAT---TGG--C-C--CGCAC--ATC---AAGG---C----GCGACATTAATTCTC-CAG-TA--G--GGC-T-------T-AT-T--C---------TG-----CC--CACCTCA-A-TA---TACA---CCACGG-G---C-AAT-G-ACACGTTA-GTTTGCCA--TG-A-CCCAG-TAAATAAT--GC-A-T-----------TGT-AA-----A-TC-TCAT-T---GAGGTG---TC-TCACCT------GGCCATT--AAGACGCATG---ACGTG--C----AGC--G-A-TCGC-CCT--CCCCCTT-A-AA-TAT---TCAGAT-TCA-TAGGCAT-CCCTACTCTAT-CC-----AGCC-CACT-C--TCCC
gi|15 : ctacacaagcattt-AT-----A-TC-TCGT-T---CGG-TG---TC-TCACCT------GGCCAGT--GG------TG---A--TG--CAGCGAGC--G-A-TCGCGCTT--CCCCCTG-G-AA-TCT---CTATCT-CTA---GGCAA-TC-------CTACG---CGAA---CACG-CATTCCTGGTtgcttactcgttcactcacttgcggtgtgctttaagcatttatccatcaaaacctctcaagctatgctaccagcccgtaccacaatccgagtaccatatcacgctctcgactgtatccacgcgacaagactgggtgccttaaaacagcacacgcacgaacctctatccaggcgccccttgtttcacg
gi|16 : ttacCT------GGCCAGT--TG------AG---A--TA--C-------------TCA----T--TCCCCTG-G-AA-TTT---CTATCT-CTA-G-----T-TC-------AT-CCTCCCGAGCC-CACT-TATTCCCGGTttctcgtacatccttgggatggttaagctttttagctaaacctcttaggctgctaccactctgagcacaatccgcaccataatcctctctactgtcctatgaaaaggtgggtgtcttaaaaaacggcacacgcctgtaagtttccctcgcgtggtcctggattttcaccagt
gi|17 : cacca-CCTAAA--CC--GGGT----T----T-AA-A-GGG-G------G-G-GT-GCCA-GTGGC-ACTCCTCC-GG-GCAAAAACAA-GGT-AG--GC-AGGA---CCGA---AG-CC-AACC---CA----A---GAAAA-ACAAC-AGT--GCACA-A-G-TACCCGCC-T---AGAT-AG--G-GT--TG-G-GCA-G-T---TAAGATCGT-G-TC---CA-------GA-AGGGACGT-----CTA--GG------GCGAAACGGCAAGATACATGTA-TCCAC-TAT-TCCGCCGCCA-CGTA-CAT-----C-CAA-AGGC-AC---C---GA---A-GG---A--A-C-C---GTGAT-TGTGTG--ttgtcgggttctctccttgcatgggtgattaagcttcagctaaatctctaagctgctaccagcctaccacaatccgattcatatcctccctactgtcctaggaaaagtagggtgccttaaaacgcacactcctgtacttcctccggcgtcctggttttcacgtgtc
gi|18 : AC-AAACTCA-GAAAAA-AAAA--------TA--T----ATTAAAA-TCA--ACGACTTTTTACTA---AAAATATCAATTGAAA--C----TACTTGTAGATAT---ATTACATTACAA-ATA--G-ATATTTCCATT-GAAC----AAA---TG-TTACA-AAG--G---TATATAACATTGC--------------------GGCCTCTATAGAAATC----G------------------GGCA----------------TCT--G--A----------------AGCC-GATTTTT---TTTTT-----ATTC---ATC-TCT-T--TTC-G-ATC-TCATT-A-AAGAACCGAT----ATgg
gi|19 : actgcgaaatatg------TG---A--TG--C----ACC--G-A-CCAC-TTT--TCTC-TG-G-AA-TCT---CTATGT-CT--GGGGCATCTC-------TT-TT-----ATCC-CATT-TATTCCTGGTt
gi|2 : TGCGACAAA---TTAAGAAT-AAA-TCAAGAAAAA-AAAAA-----TT---------ATTAAAA-TTA--ACG--CTT-GACTATTAAAA---T--AT-GAAA--C----T--TTGTAGATAT---ATTACACCACCA-ATAAGG-TCATT---ATT-A-------AAA---TG-TT-CA-AA---G---TATATAACA------------------------GG-------------C----G------------------GCCA----------------TCT--G--A----------------AGCC-GA----T---TTTTT-----ATTAAAACTC-GCT-T--TTC-GAGTA-ACCGT-A------GCGAT----ATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAACTA-T-----TTACAACCCCCCCCCCTCCATTTTCTTCT---G-AAAGG-ATGG-A---T-C-ATAG-CC-AAA--CT--G--T----C----T-GA-ACGGG-GAAACA-G-A-GT-ACCA-GTGGC-ACTACTCCGGG-GCAAAATCAA-GGT-AG--GC-AGGA---CCGA---AG-CC-A--C---CA-C------GAAAA-GCTAC-AGG--GCACA-ATG-TGACCGCC-T---AGA--AT--G-GT--GG-C-GCACA-TGC-TGAAATCGT-G-AT---CA-------GA-G-----GC-----TCC--AG------GCG-AACGGCAA--------TC-TCCAC-CAT-TCCGCCGCCA-CGTA-CCT-----T-CAA-AAGG-AA---T---AG---A-GG---A--T-C-T---G-GTT-TATCTG--CGTCATACACTCAAA-C-AT-C-TTA-GAC-CAC-TC-CACC-----CCA----T------ATGACT-------------------CAG-TATTCCT--C--GGGCTGCTTCCTC-------AGCCTACCAGAGT--TCTGGA-TT-TTCCC-----A-AGTC-------AA--C--GTTCCTGCC--G-GTC--TT--AAG---ACCC-A-TC-GGGA---T---CTTTCTGGGTTCC-AC-CTGTTA-GG---GA-AC-AACA-A-TTCC-C---TCTT---CATGGAC-A-AT-TGG-C---GCT--C-----AA--G--CTCAAC------GGCTAGCACCC---CTATTAC--AA--------T-CT-TTCT---T--GCAACT-T-CGC----AAC-TCCGCAT-C-CT--AGGGACCCACTTC----ACCCA-GCG--C-A-GC----ATCGG-GC-AGGAA---T--T---TC-AC-TA----------GCA---T--GAC--A----GTG--------CGA----G--GG---A-----AG--C-A--GA--A-TC-TCAAGAAGC-TTA-----AATCT-GGA-T-GCT---GG-TT-C---AT---C--A-TA-AAT----C-TG-C---CAAC--TT---CCT--------------A-GT---G--GG---GGGGG-CA-T----A-A---G---GCT--ACGGACAT-TGG-T--GT-G-GA-CA---C-A---T-A-T----C-T-----C--T-GA-GGC----CAACCTCCACCCCCAG----C--C-TCACG-T-CCT-GGAG--AGT--C-C-----GCT-CTATCCACAAAAAGT-AGT--T---CCTATC--CC-NNN--N---NNNNNNN--NNNNNNNNN--NNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN-NNNNNN--NN-NNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNN-N--AGCC-ACATA--C-AGGTTTC-AAGCTAC-CTGT---A-CA----T-------------CATTCCCCA-C-T-G--GATGGGAAATG--GGG--C-C--CGCA---ATA---AAAT---C----AC----CCAGTCCCC-CAA-TA--T--T-C-T-------A-AT-TT-C---------TG-----TC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---CGTTT-GCACACG--A-G---GTCC--TG-A-ACCTG-TAA-T--T--GC-A-C-----------TGT-AT-----A-TA-TCAT-T---GAG-TG---TCGTCACCT------GGCCAGT--GG------TG---A--TG--C----AGC--G-A-TCGC-TTT--CTTCCTG-G-AA-TCT---CTATCT-CTAGGGGGCAT-TC-------AT-CC---CGAGCC-CACTACATTCCCGGTtcctcggtccactcctctgattacctgtgcgattaaactccaacccaacctccgggttgctaccacgaaccatatcctccctactgtccttggaaacggagggcgctctggtttcatgtaggaatgtctattattcctnnnnnnn
gi|20 : ACAAAA--TTAAAACTAAAA-TC----------GAAATTTTTTTTT--T----ATTAAAAATCA--AC---CTTTAGCTA---AAAC--TTGAT-GAAAACT----T--TTGTAGACAT---ATTACA-TA-CA-ATAAGG-TTTCC---ATT-G--------------------A-AAG--G---TATATAACA------------------------TG-------------C----G------------------GCCA----------------TCTTGA--ATGGCGAACATCTTGGTAGCC-GA----T---TTTTTTTTTAATTT---TTC-TCA-T--TTT-G-ATA---CTTAA-A--AAGCGAT----c
gi|21 : atgaTGCGACAAAA--TTAAGAAT-AAA-TCA-GAAAAA-AAAA------------T----ATTAAAAATTA--ACG--CTTTGACT----AAA---TTGAT-GAAA--CTTTGT--TTGTAGATA----ATTACA-TACC--ATAAGGTTTATT---ATTAA-------AAA---TG-TT-CATAAA--G---TATATAA-A------------------------GG-------------C----G------------------GCCA----------------ACTTGG--A----------------AGCT-GA----T---TTTTT-----ATT-----TC-TCT-T--TTT-G-GT--ACCTT-A-A--AAGCGAT----A
gi|23 : aa-AAA--G---TAAATAACA------------------------GG-------------A----G------------------GCCA----------------TCTTGG--A----------------AGTC-AA----TTTCTTTTT-----A-TT---CAC-CCTAT--TTC-T-GT--ATCTT-A-A--TAGCGAT----Aa
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gi|25 : CCA-A-G--C-A-G-----ATCCG-GG-AGGAT---T--T---TC-AC-TA----------GCA---T--GACA-A----GTG--------CGA----G--G
gi|26 : ccaCCT-CAG-CA--T--G-T-T-------A-TT-TT-C---------TG-----CC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---C-TTT-Gta
gi|27 : tC-T-CGA-T-C-CA--AGGGA-----CTC----ACC-A-G-G--C-A-G-----ATCC
gi|3 : TGGGACAAAA--TTAAGAAT-AAT-TCA-GA---------------TTTT--TGTACATTAAAAATCA--ACG--TTTTGACTA---AAA---TTGAT-GACA--C----T--TTGTAGATAT---ATTACA-TA-CG-ATAAGGTTTACC---ATTGA-------AAA---TA-TT-CA-AAAG-G---TATATAACA------------------------TG-------------C----G------------------GTCATCTTGAATGGAGGCCATCTTGG--A----------------AGCC-GA----T---TTTTT-----ATTT---CTC-TCT-T--TTC-G-GT--ACCTT-G-G--AAGCAAT----A
gi|3 : taaCCCCAACTA-T-----G-ACACATCCCCCCAT----TTTTCTCTG---GGAAAGGCATGGGA---A-CCATAGGCCTAAAAACTACG--G----CATATT-GATACGGA-GAAATAAC-ACGT-ACCAAGTGGCCGCTACTCTGGG-GCAAAACCAAAGGT-AGAGGC-AGGA---CCGACACAC-CC-A--CACACA-C--A---AGAAA-GCAACCAGGCAGCACA-A-GATGACCGCCCT---GGAT-AG--G-GT--GGCG-GC--T-T-C-TGGCATCGT-GATCGGCCA-------GACG-----GT-----CTC--GGTACGGGACGAAACGGCAA--------TCATCCAC-CAT-CCCGC-GCCA-CGTA-CAA-----T--AA-AATG-AG---T---GG---G-GA---A--T-CCT---A-GTT--GTCTC--CGT-ATA-ACTCAAAACGATCA-CTAAGAC-CACCTC-CACCATATACCAAGGATGAGAAGATGACT-----C-A-----------C-G-TATCCTTTCC--GGGCTG-T-CCTC-------AGACT-CCAGAAAAATCAGGA-TC-TTCTCCCCTCACAATC-------AA--CTCGTTC-TG-CCGA-GTC--TCGCAAGGA-ACCC-A-TA-GGAA---T---TCTCCGGGGCCCC-AC-CTGTTA-TGTA-GACAC-GAA--A-CTTC-CACATCTCACACGTGGACAA-ATATAA-C---ACC--A-----AA--G--CTCAACCACGATAG--AGCACCCGAATT-TAACA-AA--------T-CC-TTATCCAT--GCAACTCT-CAC----AAC-T-CGAAT-C-CA--ACGAA------TC----ACCCA-A-GC-C-A-GCACTCACGCG-CG-AGCAT---T--T---TC-AC-TA----------ACGCTAT--GACCAA----GTGC-------CGA----G--GGC--A-TCC-AG--C-ACCGA--A-TC-TCAGAGAGCGTT------A--CG-CAA-T--CT-ACGG-TTCC---ACAGAT--A-TA-CAT----C-TGAC---TAAC--TT---CCT-ATCTG--A-----A-GT---G--GGCGAAAGGG-CA-T----A-A---G---GTC--TTTGACAG-TGGAT--GT-GCGA-CA---T-A---T-A-T----C-T-----TCAT-GACGAC----AAACATCCC-CAGCAG----C--C-T--CATT-CCTAGGAC--AGT--T-CCGACGGCT-AT-CCC---AAAAGTAAGTAGT---CTTATC--TCACCC--C---CTCCCCCCACGGAGAGAAATCGC--A-GCCCCAGGTCT-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaccccaactatgacacatccccccatttttctctgggaaaggcatgggaaccataggcctaaaaactacggcatattgatacggagaaataacacgtaccaagtggccgctactctggggcaaaaccaaaggtagaggcaggaccgacacacccacacacacaagaaagcaaccaggcagcacaagatgaccgccctggatagggtggcggcttctggcatcgtgatcggccagacggtctcggtacgggacgaaacggcaatcatccaccatcccgcgccacgtacaataaaatgagtggggaatcctagttgtctccgtataactcaaaacgatcactaagaccacctccaccatataccaaggatgagaagatgactcacgtatcctttccgggctgtcctcagactccagaaaaatcaggatcttctcccctcacaatcaactcgttctgccgagtctcgcaaggaacccataggaattctccggggccccacctgttatgtagacacgaaacttccacatctcacacgtggacaaatataacaccaaagctcaaccacgatagagcacccgaatttaacaaatccttatccatgcaactctcacaactcgaatccaacgaatcacccaagccagcactcacgcgcgagcattttcactaacgctatgaccaagtgccgagggcatccagcaccgaatctcagagagcgttacgcaatctacggttccacagatatacatctgactaacttcctatctgaagtgggcgaaagggcataaggtctttgacagtggatgtgcgacatatatcttcatgacgacaaacatccccagcagcctcattcctaggacagttccgacggctatcccaaaagtaagtagtcttatctcaccccctccccccacggagagaaatcgcagccccaggtct
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Reference ( family-1227 ) : TGCGACAAAA--TTAAGAAT-AAA-TCA-GAAAAA-AAAAA------TTTT-----ATT---AAAAATCA--ACG--CTTTGACTA---AAA---TTGAT-GAAA--C----T--TTGTAGATAT---ATTACA-T-ACCA-ATAAGG-TTATT---ATT-A-------AAA---TG-TT-CA-AAA--G---TATATAACA------------------------GG-------------C----G------------------GCCA----------------TCTTGG--A----------------AGCC-GA----T---TTTTT-----ATTT---CTC-TCT-T--TTC-G-GTA-ACCTT-A-A--AAGCGAT----ATATAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCCCCAACTA-T-----T-ACANCTCCCCCCCCCCCGTTTTCTCCT---G-AAAGG-ATGGGA---T-CCATAG-CCTAAA--CT--G--T----C----T-GA-ACGGG-GAAACAAG-A-GT-ACCA-GTGGC-ACTACTCCGGG-GCAAAACCAA-GGT-AG--GC-AGGA---CCGA---AG-CC-A--C---CA-C--A---GAAAA-GCAAC-AGG--GCACA-A-G-TGACCGCC-T---AGAT-AG--G-G-T--GG-GGCA-G-T-C-TGGAATCGT-G-TC---CA-------GA-G-----GT-----CCC--GG------GCGAAACGGCAA--------TC-TCCAC-CAT-TCCGCCGCCA-CGTA-CGT-----T-CAA-AAGG-A-N-T-----AG---A-GG---A--T-C-T---G-GTT-TGTCTG--CGT-A---ACTCAAA-C-ATCC-CTA-GAC-CAC-TC-CACCCCATATGACC-----G---GG----------TA--------------G-TATCCTT--C--GGGCTG-TTCCT-C-------AGCCT-CCAGAGT--TCTGGA-TT-TTCCC-----A-AATC-------AAC--GTTCCTG-C--G-GTC--TC--AAG---ACCC-ATA-GGGN---T---TCTCCTGGGTCCC-AC-CTGTTA-GG---GA-AC-AAC--A-TTCC-C---TCTT---CATGGAC-A-AT-TGG-C---GCT--C-----AA--G--CTCAAC------AGCTAGCACCC---CT-TTACA-AA--------T-CC-TTCT---T--GCAACT-T-CGC----AAC-T-CGAAT-C-CA--AGGGA---A-TTC----ACCCA-G-G--C-A-G-----ATCCG-GG-AGGAA---T--T---CC-AC-TA----------GCG---T--GAC--A----GTG--------CGA----G--GG---A-T-C-AG--C-A--GA--A-TC-TCAGAGAGC-TT------AATCT-GAA-T-GCT-A-GG-TT-C---AC---C--A-TA-AAT----C-TG-C---CAAC--TT---CCT-ATC-G--A-----A-GT---G--GG---GAGGG-CA-T----A-A---G---GCT--ACGGATAT-TGG-T--GT-G-GA-CA---C-A---T-A-T----C-T-----C--T-GA-GGC----CAACATCCA-CCCCAG----C--C-T--CG-T-CCT-GGAG--AGT--C-C-----GCT-CTGCCC---AAAAGT-AGT--C---CCTATC--CC-CCC--C---CNCCCCC--TGGAGAGAA--CGC-TATGCCCCAGGTCT-AA-TTTTGC--CT-TACAT-TCTCGC--AGGAAGTGTG-TACCAAGCAACATGG---AGCCNCAAGG-G--AGCC-ACATA--C-AGG-TTC-AAGCTA--TTGT---A-CA----T-------------CACCCCCCA-C-T-G--GATGGGGAAT---GGG--C-C--CGCA---ATA---AAAT---C----AC----TCAGTCCCC-CAG-TA--T--G-C-T-------A-AT-TT-C---------TG-----CC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---C-TCT-GCACACGT-A-G---GTCC--CG-A-NCCCG-TAA-T--T--GC-A-C-----------TGT-AT-----A-TC-TCGT-T---GAG-TG---TC-TCACCT------GGCCAGT--GG------TG---A--TG--C----AGC--G-A-TCGC-CTT--CCCCCTG-G-AA-TCT---CTATCT-CTA-GGGGCAT-TC-------AT-CC---CGAGCC-CACT-CATTCCCGGT
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gi|10 : cCTG--CGT-T---ACTCAAC-A-ATCC-CTA-GAC--AC-TCGCACCACAT-TGACC-----G---GGCGGATAC---TA--------------G-TATCCTC--CCGGGACTG-T-CCT-C--------GCCT-CTAGAGT---CTAGG-TT-TTTC------A-AATCCTTATT-AAC--ATTC-TG-C--GCGTC--TC--AAG---ATCC-ATA-GGGT---T---TCA---GGGTTCC-AAACTGTTA-CT---GA-AC-AACTAA-ACAC-C---TCTC---CAAGGA--A-AT-GGC-C---GCT--CCTTGAAA--GGCCTCAAC------A-TTAGCACCC----T-TTACATAA--------T-CCATTCT---TTAG-AACT-T-CGCCGCCAAC-T-T-AAT-A-CA--AGGGC---A-TTTCGA-AACCA-G-G--CCA-G-----ACCCC-GG-AGGAA---T--TAT-CC-ACCTA----------GCA---TTGGAC--ACATGGTGGT------CGACAATG--GG---T-C-C-AG--CCA--GA--A-TC-TCAGAG-GC-TT---------CC-GAA-TAGCT-A-AA-TC-C---AC---C--A-TA-AAT----TATG-C---CAAC--TTTAACCT-ATC-G--ACTACCATGT---ATCGC---GAGGGACAAT----A-A---G---GGT--AGAGATTT-TGG-T--TT-GTGA-CA---CCA---T-A-T----C-TATAACC--T-TA-G------CAACATC-A-CCCCAG----CATC-T--TG-TTCCT-GGAGTCCGT--CTC-----GCT-CTGCCA---AACAGTAAGT--C---ATTATC--TT-CTC--cagttctcgggttcctttgggtgattacgccttcttctaactttctaagctgctaccaggcctaccacccaatcgatttcgtcatcttctctagctgtctcggaaaaaggtgggtgccttaaaacgcacatgccttacttctcggcgcggtttccgtg
gi|10 : atatctatac-G--AGCC-ACATAA-C-AGG-TTA-CAGCAAA-TCGACCAA-CAAAATT-------------CACCCCCCG---T-GTCGATGGGAAATAGAGGA--CGCGGCGCAC--ATACCTAAAT---CCCAAAC----TCAGTCTACACAG-TAAAT--G-C-TCCACGTAA-ATATT-C---------TGACACACT--C----CA-A-TAG--TCCA---CCACGGAA---C-TCT-GT-CATGT-A-G---GTTC--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagccacataacaggttacagcaaatcgaccaacaaaattcaccccccgtgtcgatgggaaatagaggacgcggcgcacatacctaaatcccaaactcagtctacacagtaaatgctccacgtaaatattctgacacactccaatagtccaccacggaactctgtcatgtaggttc
gi|11 : atatctatacctgcgttactcaacaatccctagacactcgcaccacattgaccgggcggatactagtatcctcccgggactgtcctcgcctctagagtctaggtttttcaaatccttattaacattctgcgcgtctcaagatccatagggtttcagggttccaaactgttactgaacaactaaacacctctccaaggaaatggccgctccttgaaaggcctcaacattagcaccctttacataatccattctttagaacttcgccgccaacttaatacaagggcatttcgaaaccaggccagaccccggaggaattatccacctagcattggacacatggtggtcgacaatgggtccagccagaatctcagaggcttccgaatagctaaatccaccataaattatgccaactttaacctatcgactaccatgtatcgcgagggacaataagggtagagattttggtttgtgacaccatatctataaccttagcaacatcaccccagcatcttgttcctggagtccgtctcgctctgccaaacagtaagtcattatcttctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--A-TT-AAT----C-TG-C---CA-----T---CCT-A--------------GT---G--GG---AAGGA-CAAT----ATA---G---GTTTTACGGATAT---G-T--GT-A-GA-CA---C-A---T-A-T----C-T-----T--C-GA-GGC----AAACCTC-A-CCCC-G----C--C----CG-T-CCT-GG-G--AGTTCC-C-----GCTTCTGCC----AAAAGT-AGT--A-----TACC--NN-NNN--N---NNNNNNN--NNNNNNNNN--NNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN-NNNNNN--NN-NNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNG--AGCCCACATA--CCAGG-TTC-AGTCTA--T-GT---AACA----TT------------CACCTCC-A-C-TTG--GATGGGGAAT---AGGGAC-C--CGCA---ATT---AA-T---CCA--AC----TCAGTCCCC-----TA--T--G-C-T-------A-AT-TTTC---------TG-----TC-------TA-G-TAATCTCCA---CCACGG-A---C-TTTTGCCC-CGT-A-G---GTCT--CG-A-ACCTG-TAA-T--T--GCCA-C-----------TGT-AT-----A-TCTTCAG-T---GAG-T----TC-TCACCT------GGCCAGT--GG------TG---A--TG--C----ACC--GCA-T-GC-CTTCCCCCCCTG-GAAA-TCT---CTATCT-CTA--GGTCA--TC-------AA-CC---CGAGCC-CACT-CATT-TCGGT
gi|12 : aaattgctcaaggcatccaccaccgagaTGCGGCAAAG--TTAATAAT-AAA-TCA-GATTAA-AAAA----------T-----ATT---AAAAATCA--ACG--CTTTGACCA---AAA---TTAAT-GAAT--C----T--TTGTAGATGT---ATTACA-T-A-CA-ATTAGGTTTACC---ATTAA-------AAA---TG-CC-CA-AAAT-G---TATATAACA------------------------GG-------------C----A------------------GCCA----------------TCTTGAATA----------------AGCC-GA----T---TTTTT-----ATTT---CTCTTTT-T--TTC-G-GTA-A-CTT-C-A--AAGCGGT----A-ATAtctcgggttcactcttgagtgataagacttaaacgaaacctcctaagctgctaccacctaccacaatccgatcaaatcttctctaacgtctcagaaaaaggtgggtggcttaaaaaacacatgcctgtaccttcctcctcgggcggccctggtttcacccgt
gi|12 : AACTG-T-----T-ACA------CTCCCCCCGTTTTCTCC----G-AAAGG-ACAATG---T-CCATAG-CCTAAA--CT--G--C----T----T-T---------------G-A-GT-GCCA-GTGGC-ATTCCTCCAGA-GCAAAATCAA-GGT-AG--AC-AGGA---CCGA---AGCCC-A--A---CA-A--A---TAAAA-GCAAC-AGG--ACACA-A-G-TGTCTGCC-T---AGAT-AG--G-A-TC-GG-GGCA-G-T-C-TGT-ATCGT-G-TC---CAGAAGAG-GA-A-----GT-----CCC--GG------GCGAAGCGGAAA--------TA-TCCCC-CAT-TCCACCCAAA-CGTA-CGT-----C-CAA-AAGC-A-T-C-----AG---A-GG---AACC-C-T---G-G-T-TGTCTG--GGT------CCTTAA-C-ACCC-CTA-GTC-CAT-TC-CA--CCATATGtcttaatttgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaactgttacactccccccgttttctccgaaaggacaatgtccatagcctaaactgctttgagtgccagtggcattcctccagagcaaaatcaaggtagacaggaccgaagcccaacaaataaaagcaacaggacacaagtgtctgcctagataggatcggggcagtctgtatcgtgtccagaagaggaagtcccgggcgaagcggaaatatcccccattccacccaaacgtacgtccaaaagcatcagaggaaccctggttgtctgggtccttaacacccctagtccattccaccatatg
gi|13 : tgcggcaaagttaataataaatcagattaaaaaatattaaaaatcaacgctttgaccaaaattaatgaatctttgtagatgtattacatacaattaggtttaccattaaaaatgcccaaaatgtatataacaggcagccatcttgaataagccgattttttatttctctttttttcggtaacttcaaagcggtaatatcttaatttgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaGC----AAC-T-CGA-T-C-CA--AGGGA-----TTC----ACC-A-G-G--C-A-G-----ATCCG-GG-AGGAA---T--T---CCCGC-TA----------GCG---T--GAC--AA---GTG--------CGA----G--AT---A-T-C-AG--T-A--GA--A-TC-TCAGAGAGC----------ATTT-GAA-T-GCT-A-GG-TT-CC--AC---A--A-TATAAT----C-TG-C---TAAC--TT---CCT-ATC-G--A-----A-GT---G--GA---GACGG-CA-TTTATA-A---G---GTT--ACAGACAT--GG-T--GT-G-GA-CA---T-A---A-A-T----C-TT----C--T-GA-GAC-----AACATC-G-CCCCAG----C--C-T--CG-T-CCT-GG-G--AGT--C-C-----GCT-CTG-CC---AAAAGT-AGT--CTTATCTA-C--TC-TCC--C---CACCCCC--TGGAGAGAA--TGC-TATGCCCCAGGTCT-AA-TTTTGC--CT-TACAT-TCTCGC--AGGAAGTATG-TACCAAGCAACATGG---AGCCACAAGG-G--AGCC-ACATA--C-AGG-TTC--AGCTA--TTGT---A-CAT---T-------------CA-CCCCCA-CTT-G--GATGGGAAAT---GGG--C-C--CGCA---TTA---AATC---C----AC----TCA-TTTCC-CAG-TA--T--G-C-C-------A-TG-TT-C---------TG-----CC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---C-CCT-G--CACGT-G-G---GTCC--TG-A-CCCCG-TAA-T--T--GC-A-C-----------TGT-AT-----
gi|14 : AGCTAAATTGT---AGCA----TTT-----------CAACATTCA-C-TTG--GATGGGGAAT---TGG--C-C--CGCAC--ATC---AAGG---C----GCGACATTAATTCTC-CAG-TA--G--GGC-T-------T-AT-T--C---------TG-----CC--CACCTCA-A-TA---TACA---CCACGG-G---C-AAT-G-ACACGTTA-GTTTGCCA--TG-A-CCCAG-TAAATAAT--GC-A-T-----------TGT-AA-----A-TC-TCAT-T---GAGGTG---TC-TCACCT------GGCCATT--AAGACGCATG---ACGTG--C----AGC--G-A-TCGC-CCT--CCCCCTT-A-AA-TAT---TCAGAT-TCA-TAGGCAT-CCCTACTCTAT-CC-----AGCC-CACT-C--TCCC
gi|15 : ctacacaagcattt-AT-----A-TC-TCGT-T---CGG-TG---TC-TCACCT------GGCCAGT--GG------TG---A--TG--CAGCGAGC--G-A-TCGCGCTT--CCCCCTG-G-AA-TCT---CTATCT-CTA---GGCAA-TC-------CTACG---CGAA---CACG-CATTCCTGGTtgcttactcgttcactcacttgcggtgtgctttaagcatttatccatcaaaacctctcaagctatgctaccagcccgtaccacaatccgagtaccatatcacgctctcgactgtatccacgcgacaagactgggtgccttaaaacagcacacgcacgaacctctatccaggcgccccttgtttcacg
gi|16 : ttacCT------GGCCAGT--TG------AG---A--TA--C-------------TCA----T--TCCCCTG-G-AA-TTT---CTATCT-CTA-G-----T-TC-------AT-CCTCCCGAGCC-CACT-TATTCCCGGTttctcgtacatccttgggatggttaagctttttagctaaacctcttaggctgctaccactctgagcacaatccgcaccataatcctctctactgtcctatgaaaaggtgggtgtcttaaaaaacggcacacgcctgtaagtttccctcgcgtggtcctggattttcaccagt
gi|17 : cacca-CCTAAA--CC--GGGT----T----T-AA-A-GGG-G------G-G-GT-GCCA-GTGGC-ACTCCTCC-GG-GCAAAAACAA-GGT-AG--GC-AGGA---CCGA---AG-CC-AACC---CA----A---GAAAA-ACAAC-AGT--GCACA-A-G-TACCCGCC-T---AGAT-AG--G-G-T--TG-GGCA-G-T---TAAGATCGT-G-TC---CA-------GA-AGGGACGT-----CTA--GG------GCGAAACGGCAAGATACATGTA-TCCAC-TAT-TCCGCCGCCA-CGTA-CAT-----C-CAA-AGGC-A-C-C-----GA---A-GG---A--A-C-C---GTGAT-TGTGTG--ttgtcgggttctctccttgcatgggtgattaagcttcagctaaatctctaagctgctaccagcctaccacaatccgattcatatcctccctactgtcctaggaaaagtagggtgccttaaaacgcacactcctgtacttcctccggcgtcctggttttcacgtgtc
gi|18 : AC-AAACTCA-GAAAAA-AAAA--------TAT-----ATT---AAAA-TCA--ACGACTTTTTACTA---AAAATATCAATTGAAA--C----TACTTGTAGATAT---ATTACATT-ACAA-ATA--G-ATATTTCCATT-GAAC----AAA---TG-TTACA-AAG--G---TATATAACATTGC--------------------GGCCTCTATAGAAATC----G------------------GGCA----------------TCT--G--A----------------AGCC-GATTTTT---TTTTT-----ATTC---ATC-TCT-T--TTC-G-ATC-TCATT-A-AAGAACCGAT----ATgg
gi|19 : actgcgaaatatg------TG---A--TG--C----ACC--G-A-CCAC-TTT--TCTC-TG-G-AA-TCT---CTATGT-CT--GGGGCATCTC-------TT-TT-----ATCC-CATT-TATTCCTGGTt
gi|2 : TGCGACAAA---TTAAGAAT-AAA-TCAAGAAAAA-AAAAA------TT-------ATT---AAAA-TTA--ACG--CTT-GACTATTAAAA---T--AT-GAAA--C----T--TTGTAGATAT---ATTACA-CCACCA-ATAAGG-TCATT---ATT-A-------AAA---TG-TT-CA-AA---G---TATATAACA------------------------GG-------------C----G------------------GCCA----------------TCT--G--A----------------AGCC-GA----T---TTTTT-----ATTAAAACTC-GCT-T--TTC-GAGTA-ACCGT-A------GCGAT----ATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAACTA-T-----TTACAACCCCCCCCCCTCCATTTTCTTCT---G-AAAGG-ATGG-A---T-C-ATAG-CC-AAA--CT--G--T----C----T-GA-ACGGG-GAAACA-G-A-GT-ACCA-GTGGC-ACTACTCCGGG-GCAAAATCAA-GGT-AG--GC-AGGA---CCGA---AG-CC-A--C---CA-C------GAAAA-GCTAC-AGG--GCACA-ATG-TGACCGCC-T---AGA--AT--G-G-T--GG-CGCACA-TGC-TGAAATCGT-G-AT---CA-------GA-G-----GC-----TCC--AG------GCG-AACGGCAA--------TC-TCCAC-CAT-TCCGCCGCCA-CGTA-CCT-----T-CAA-AAGG-A-A-T-----AG---A-GG---A--T-C-T---G-GTT-TATCTG--CGTCATACACTCAAA-C-AT-C-TTA-GAC-CAC-TC-CACCCCATATGACT---------------------CA--------------G-TATTCCT--C--GGGCTGCTTCCT-C-------AGCCTACCAGAGT--TCTGGA-TT-TTCCC-----A-AGTC-------AAC--GTTCCTGCC--G-GTC--TT--AAG---ACCC-ATC-GGGA---T---CTTTCTGGGTTCC-AC-CTGTTA-GG---GA-AC-AACA-A-TTCC-C---TCTT---CATGGAC-A-AT-TGG-C---GCT--C-----AA--G--CTCAAC------GGCTAGCACCC---CTATTAC--AA--------T-CT-TTCT---T--GCAACT-T-CGC----AAC-TCCGCAT-C-CT--AGGGACCCACTTC----ACCCA-GCG--C-A-GC----ATCGG-GC-AGGAA---T--T---TC-AC-TA----------GCA---T--GAC--A----GTG--------CGA----G--GG---A-----AG--C-A--GA--A-TC-TCAAGAAGC-TTA-----AATCT-GGA-T-GCT---GG-TT-C---AT---C--A-TA-AAT----C-TG-C---CAAC--TT---CCT--------------A-GT---G--GG---GGGGG-CA-T----A-A---G---GCT--ACGGACAT-TGG-T--GT-G-GA-CA---C-A---T-A-T----C-T-----C--T-GA-GGC----CAACCTCCACCCCCAG----C--C-TCACG-T-CCT-GGAG--AGT--C-C-----GCT-CTATCCACAAAAAGT-AGT--T---CCTATC--CC-NNN--N---NNNNNNN--NNNNNNNNN--NNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN-NNNNNN--NN-NNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNN-N--AGCC-ACATA--C-AGGTTTC-AAGCTAC-CTGT---A-CA----T-------------CATTCCCCA-C-T-G--GATGGGAAATG--GGG--C-C--CGCA---ATA---AAAT---C----AC----CCAGTCCCC-CAA-TA--T--T-C-T-------A-AT-TT-C---------TG-----TC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---CGTTT-GCACACG--A-G---GTCC--TG-A-ACCTG-TAA-T--T--GC-A-C-----------TGT-AT-----A-TA-TCAT-T---GAG-TG---TCGTCACCT------GGCCAGT--GG------TG---A--TG--C----AGC--G-A-TCGC-TTT--CTTCCTG-G-AA-TCT---CTATCT-CTAGGGGGCAT-TC-------AT-CC---CGAGCC-CACTACATTCCCGGTtcctcggtccactcctctgattacctgtgcgattaaactccaacccaacctccgggttgctaccacgaaccatatcctccctactgtccttggaaacggagggcgctctggtttcatgtaggaatgtctattattcctnnnnnnn
gi|20 : ACAAAA--TTAAAACTAAAA-TC----------GAAATTTTTTTTTT-----ATT---AAAAATCA--AC---CTTTAGCTA---AAAC--TTGAT-GAAAACT----T--TTGTAGACAT---ATTACA-T-A-CA-ATAAGG-TTTCC---ATT-G--------------------A-AAG--G---TATATAACA------------------------TG-------------C----G------------------GCCA----------------TCTTGA--ATGGCGAACATCTTGGTAGCC-GA----T---TTTTTTTTTAATTT---TTC-TCA-T--TTT-G-ATA---CTTAA-A--AAGCGAT----c
gi|21 : atgaTGCGACAAAA--TTAAGAAT-AAA-TCA-GAAAAA-AAAA----------T-----ATT---AAAAATTA--ACG--CTTTGACT----AAA---TTGAT-GAAA--CTTTGT--TTGTAGATA----ATTACA-T-ACC--ATAAGGTTTATT---ATTAA-------AAA---TG-TT-CATAAA--G---TATATAA-A------------------------GG-------------C----G------------------GCCA----------------ACTTGG--A----------------AGCT-GA----T---TTTTT-----ATT-----TC-TCT-T--TTT-G-GT--ACCTT-A-A--AAGCGAT----A
gi|23 : aa-AAA--G---TAAATAACA------------------------GG-------------A----G------------------GCCA----------------TCTTGG--A----------------AGTC-AA----TTTCTTTTT-----A-TT---CAC-CCTAT--TTC-T-GT--ATCTT-A-A--TAGCGAT----Aa
gi|24 : CTCAATTA-TATAAAT-ACAGCTCCCCCC-----GTTTTCTC-T---G-AAAGG-ATGGG----T-TCATTA-ACTATA--CT--G--T----
gi|25 : CCA-A-G--C-A-G-----ATCCG-GG-AGGAT---T--T---TC-AC-TA----------GCA---T--GACA-A----GTG--------CGA----G--G
gi|26 : ccaCCT-CAG-CA--T--G-T-T-------A-TT-TT-C---------TG-----CC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---C-TTT-Gta
gi|27 : tC-T-CGA-T-C-CA--AGGGA-----CTC----ACC-A-G-G--C-A-G-----ATCC
gi|3 : TGGGACAAAA--TTAAGAAT-AAT-TCA-GA----------------TTTTTGTACATT---AAAAATCA--ACG--TTTTGACTA---AAA---TTGAT-GACA--C----T--TTGTAGATAT---ATTACA-T-A-CG-ATAAGGTTTACC---ATTGA-------AAA---TA-TT-CA-AAAG-G---TATATAACA------------------------TG-------------C----G------------------GTCATCTTGAATGGAGGCCATCTTGG--A----------------AGCC-GA----T---TTTTT-----ATTT---CTC-TCT-T--TTC-G-GT--ACCTT-G-G--AAGCAAT----A
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Reference ( family-1227 ) : TGCGACAAAA--TTAAGAATAAA-TCAGAAAAA-AAAAATTT-------ATTAAAAATCA--ACG--CTTTGACTA---AAA---TTGAT-GAAA--C----T--TTGTAGATAT---ATTACA-T-ACCA-ATAAGG-TTATT---ATT-A-------AAA---TG-TT-CA-AAA--G---TATATAACA------------------------GG-------------C----G------------------GCCA----------------TCTTGG--A----------------AGCC-GA----T---TTTTT-----ATTT---CTC-TCT-T--TTC-G-GTA-ACCTT-A-A--AAGCGAT----ATATAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCCCCAACTA-T-----T-ACANCTCCCCCCCCCCCGTTTTCTCCT---G-AAAGG-ATGGGA---T-CCATAG-CCTAAA--CT--G--T----C----T-GA-ACGGG-GAAACAAG-A-GT-ACCA-GTGGC-ACTACTCCGGG-GCAAAACCAA-GGT-AG--GC-AGGA---CCGA---AG-CC-A--C---CA-C--A---GAAAA-GCAAC-AGG--GCACA-A-G-TGACCGCC-T---AGAT-AG--G-G-T--GG-GGCA-G-T-C-TGGAATCGT-G-TC---CA-------GA-G-----GT-----CCC--GG------GCGAAACGGCAA--------TC-TCCAC-CAT-TCCGCCGCCA-CGTA-CGT-----T-CAA-AAGG-A-N-T-----AG---A-GG---A--T-C-T---G-GTT-TGTCTG--CGT-A---ACTCAAA-C-ATCC-CTA-GAC-CAC-TC-CACCCCATATGACC-----G---GG----------TA--------------G-TATCCTT--C--GGGCTG-TTCCT-C-------AGCCT-CCAGAGT--TCTGGA-TT-TTCCC-----A-AATC-------AAC--GTTCCTG-C--G-GTC--TC--AAG---ACCC-ATA-GGGN---T---TCTCCTGGGTCCC-AC-CTGTTA-GG---GA-AC-AAC--A-TTCC-C---TCTT---CATGGAC-A-AT-TGG-C---GCT--C-----AA--G--CTCAAC------AGCTAGCACCC---CT-TTACA-AA--------T-CC-TTCT---T--GCAACT-T-CGC----AAC-T-CGAAT-C-CA--AGGGA---A-TTC----ACCCA-G-G--C-A-G-----ATCCG-GG-AGGAA---T--T---CC-AC-TA----------GCG---T--GAC--A----GTG--------CGA----G--GG---A-T-C-AG--C-A--GA--A-TC-TCAGAGAGC-TT------AATCT-GAA-T-GCT-A-GG-TT-C---AC---C--A-TA-AAT----C-TG-C---CAAC--TT---CCT-ATC-G--A-----A-GT---G--GG---GAGGG-CA-T----A-A---G---GCT--ACGGATAT-TGG-T--GT-G-GA-CA---C-A---T-A-T----C-T-----C--T-GA-GGC----CAACATCCA-CCCCAG----C--C-T--CG-T-CCT-GGAG--AGT--C-C-----GCT-CTGCCC---AAAAGT-AGT--C---CCTATC--CC-CCC--C---CNCCCCC--TGGAGAGAA--CGC-TATGCCCCAGGTCT-AA-TTTTGC--CT-TACAT-TCTCGC--AGGAAGTGTG-TACCAAGCAACATGG---AGCCNCAAGG-G--AGCC-ACATA--C-AGG-TTC-AAGCTA--TTGT---A-CA----T-------------CACCCCCCA-C-T-G--GATGGGGAAT---GGG--C-C--CGCA---ATA---AAAT---C----AC----TCAGTCCCC-CAG-TA--T--G-C-T-------A-AT-TT-C---------TG-----CC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---C-TCT-GCACACGT-A-G---GTCC--CG-A-NCCCG-TAA-T--T--GC-A-C-----------TGT-AT-----A-TC-TCGT-T---GAG-TG---TC-TCACCT------GGCCAGT--GG------TG---A--TG--C----AGC--G-A-TCGC-CTT--CCCCCTG-G-AA-TCT---CTATCT-CTA-GGGGCAT-TC-------AT-CC---CGAGCC-CACT-CATTCCCGGT
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gi|10 : cCTG--CGT-T---ACTCAAC-A-ATCC-CTA-GAC--AC-TCGCACCACAT-TGACC-----G---GGCGGATAC---TA--------------G-TATCCTC--CCGGGACTG-T-CCT-C--------GCCT-CTAGAGT---CTAGG-TT-TTTC------A-AATCCTTATT-AAC--ATTC-TG-C--GCGTC--TC--AAG---ATCC-ATA-GGGT---T---TCA---GGGTTCC-AAACTGTTA-CT---GA-AC-AACTAA-ACAC-C---TCTC---CAAGGA--A-AT-GGC-C---GCT--CCTTGAAA--GGCCTCAAC------A-TTAGCACCC----T-TTACATAA--------T-CCATTCT---TTAG-AACT-T-CGCCGCCAAC-T-T-AAT-A-CA--AGGGC---A-TTTCGA-AACCA-G-G--CCA-G-----ACCCC-GG-AGGAA---T--TAT-CC-ACCTA----------GCA---TTGGAC--ACATGGTGGT------CGACAATG--GG---T-C-C-AG--CCA--GA--A-TC-TCAGAG-GC-TT---------CC-GAA-TAGCT-A-AA-TC-C---AC---C--A-TA-AAT----TATG-C---CAAC--TTTAACCT-ATC-G--ACTACCATGT---ATCGC---GAGGGACAAT----A-A---G---GGT--AGAGATTT-TGG-T--TT-GTGA-CA---CCA---T-A-T----C-TATAACC--T-TA-G------CAACATC-A-CCCCAG----CATC-T--TG-TTCCT-GGAGTCCGT--CTC-----GCT-CTGCCA---AACAGTAAGT--C---ATTATC--TT-CTC--cagttctcgggttcctttgggtgattacgccttcttctaactttctaagctgctaccaggcctaccacccaatcgatttcgtcatcttctctagctgtctcggaaaaaggtgggtgccttaaaacgcacatgccttacttctcggcgcggtttccgtg
gi|10 : atatctatac-G--AGCC-ACATAA-C-AGG-TTA-CAGCAAA-TCGACCAA-CAAAATT-------------CACCCCCCG---T-GTCGATGGGAAATAGAGGA--CGCGGCGCAC--ATACCTAAAT---CCCAAAC----TCAGTCTACACAG-TAAAT--G-C-TCCACGTAA-ATATT-C---------TGACACACT--C----CA-A-TAG--TCCA---CCACGGAA---C-TCT-GT-CATGT-A-G---GTTC--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagccacataacaggttacagcaaatcgaccaacaaaattcaccccccgtgtcgatgggaaatagaggacgcggcgcacatacctaaatcccaaactcagtctacacagtaaatgctccacgtaaatattctgacacactccaatagtccaccacggaactctgtcatgtaggttc
gi|11 : atatctatacctgcgttactcaacaatccctagacactcgcaccacattgaccgggcggatactagtatcctcccgggactgtcctcgcctctagagtctaggtttttcaaatccttattaacattctgcgcgtctcaagatccatagggtttcagggttccaaactgttactgaacaactaaacacctctccaaggaaatggccgctccttgaaaggcctcaacattagcaccctttacataatccattctttagaacttcgccgccaacttaatacaagggcatttcgaaaccaggccagaccccggaggaattatccacctagcattggacacatggtggtcgacaatgggtccagccagaatctcagaggcttccgaatagctaaatccaccataaattatgccaactttaacctatcgactaccatgtatcgcgagggacaataagggtagagattttggtttgtgacaccatatctataaccttagcaacatcaccccagcatcttgttcctggagtccgtctcgctctgccaaacagtaagtcattatcttctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--A-TT-AAT----C-TG-C---CA-----T---CCT-A--------------GT---G--GG---AAGGA-CAAT----ATA---G---GTTTTACGGATAT---G-T--GT-A-GA-CA---C-A---T-A-T----C-T-----T--C-GA-GGC----AAACCTC-A-CCCC-G----C--C----CG-T-CCT-GG-G--AGTTCC-C-----GCTTCTGCC----AAAAGT-AGT--A-----TACC--NN-NNN--N---NNNNNNN--NNNNNNNNN--NNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN-NNNNNN--NN-NNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNG--AGCCCACATA--CCAGG-TTC-AGTCTA--T-GT---AACA----TT------------CACCTCC-A-C-TTG--GATGGGGAAT---AGGGAC-C--CGCA---ATT---AA-T---CCA--AC----TCAGTCCCC-----TA--T--G-C-T-------A-AT-TTTC---------TG-----TC-------TA-G-TAATCTCCA---CCACGG-A---C-TTTTGCCC-CGT-A-G---GTCT--CG-A-ACCTG-TAA-T--T--GCCA-C-----------TGT-AT-----A-TCTTCAG-T---GAG-T----TC-TCACCT------GGCCAGT--GG------TG---A--TG--C----ACC--GCA-T-GC-CTTCCCCCCCTG-GAAA-TCT---CTATCT-CTA--GGTCA--TC-------AA-CC---CGAGCC-CACT-CATT-TCGGT
gi|12 : aaattgctcaaggcatccaccaccgagaTGCGGCAAAG--TTAATAATAAA-TCAGATTAA-AAAA---T-------ATTAAAAATCA--ACG--CTTTGACCA---AAA---TTAAT-GAAT--C----T--TTGTAGATGT---ATTACA-T-A-CA-ATTAGGTTTACC---ATTAA-------AAA---TG-CC-CA-AAAT-G---TATATAACA------------------------GG-------------C----A------------------GCCA----------------TCTTGAATA----------------AGCC-GA----T---TTTTT-----ATTT---CTCTTTT-T--TTC-G-GTA-A-CTT-C-A--AAGCGGT----A-ATAtctcgggttcactcttgagtgataagacttaaacgaaacctcctaagctgctaccacctaccacaatccgatcaaatcttctctaacgtctcagaaaaaggtgggtggcttaaaaaacacatgcctgtaccttcctcctcgggcggccctggtttcacccgt
gi|12 : AACTG-T-----T-ACA------CTCCCCCCGTTTTCTCC----G-AAAGG-ACAATG---T-CCATAG-CCTAAA--CT--G--C----T----T-T---------------G-A-GT-GCCA-GTGGC-ATTCCTCCAGA-GCAAAATCAA-GGT-AG--AC-AGGA---CCGA---AGCCC-A--A---CA-A--A---TAAAA-GCAAC-AGG--ACACA-A-G-TGTCTGCC-T---AGAT-AG--G-A-TC-GG-GGCA-G-T-C-TGT-ATCGT-G-TC---CAGAAGAG-GA-A-----GT-----CCC--GG------GCGAAGCGGAAA--------TA-TCCCC-CAT-TCCACCCAAA-CGTA-CGT-----C-CAA-AAGC-A-T-C-----AG---A-GG---AACC-C-T---G-G-T-TGTCTG--GGT------CCTTAA-C-ACCC-CTA-GTC-CAT-TC-CA--CCATATGtcttaatttgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaactgttacactccccccgttttctccgaaaggacaatgtccatagcctaaactgctttgagtgccagtggcattcctccagagcaaaatcaaggtagacaggaccgaagcccaacaaataaaagcaacaggacacaagtgtctgcctagataggatcggggcagtctgtatcgtgtccagaagaggaagtcccgggcgaagcggaaatatcccccattccacccaaacgtacgtccaaaagcatcagaggaaccctggttgtctgggtccttaacacccctagtccattccaccatatg
gi|13 : tgcggcaaagttaataataaatcagattaaaaaatattaaaaatcaacgctttgaccaaaattaatgaatctttgtagatgtattacatacaattaggtttaccattaaaaatgcccaaaatgtatataacaggcagccatcttgaataagccgattttttatttctctttttttcggtaacttcaaagcggtaatatcttaatttgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaGC----AAC-T-CGA-T-C-CA--AGGGA-----TTC----ACC-A-G-G--C-A-G-----ATCCG-GG-AGGAA---T--T---CCCGC-TA----------GCG---T--GAC--AA---GTG--------CGA----G--AT---A-T-C-AG--T-A--GA--A-TC-TCAGAGAGC----------ATTT-GAA-T-GCT-A-GG-TT-CC--AC---A--A-TATAAT----C-TG-C---TAAC--TT---CCT-ATC-G--A-----A-GT---G--GA---GACGG-CA-TTTATA-A---G---GTT--ACAGACAT--GG-T--GT-G-GA-CA---T-A---A-A-T----C-TT----C--T-GA-GAC-----AACATC-G-CCCCAG----C--C-T--CG-T-CCT-GG-G--AGT--C-C-----GCT-CTG-CC---AAAAGT-AGT--CTTATCTA-C--TC-TCC--C---CACCCCC--TGGAGAGAA--TGC-TATGCCCCAGGTCT-AA-TTTTGC--CT-TACAT-TCTCGC--AGGAAGTATG-TACCAAGCAACATGG---AGCCACAAGG-G--AGCC-ACATA--C-AGG-TTC--AGCTA--TTGT---A-CAT---T-------------CA-CCCCCA-CTT-G--GATGGGAAAT---GGG--C-C--CGCA---TTA---AATC---C----AC----TCA-TTTCC-CAG-TA--T--G-C-C-------A-TG-TT-C---------TG-----CC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---C-CCT-G--CACGT-G-G---GTCC--TG-A-CCCCG-TAA-T--T--GC-A-C-----------TGT-AT-----
gi|14 : AGCTAAATTGT---AGCA----TTT-----------CAACATTCA-C-TTG--GATGGGGAAT---TGG--C-C--CGCAC--ATC---AAGG---C----GCGACATTAATTCTC-CAG-TA--G--GGC-T-------T-AT-T--C---------TG-----CC--CACCTCA-A-TA---TACA---CCACGG-G---C-AAT-G-ACACGTTA-GTTTGCCA--TG-A-CCCAG-TAAATAAT--GC-A-T-----------TGT-AA-----A-TC-TCAT-T---GAGGTG---TC-TCACCT------GGCCATT--AAGACGCATG---ACGTG--C----AGC--G-A-TCGC-CCT--CCCCCTT-A-AA-TAT---TCAGAT-TCA-TAGGCAT-CCCTACTCTAT-CC-----AGCC-CACT-C--TCCC
gi|15 : ctacacaagcattt-AT-----A-TC-TCGT-T---CGG-TG---TC-TCACCT------GGCCAGT--GG------TG---A--TG--CAGCGAGC--G-A-TCGCGCTT--CCCCCTG-G-AA-TCT---CTATCT-CTA---GGCAA-TC-------CTACG---CGAA---CACG-CATTCCTGGTtgcttactcgttcactcacttgcggtgtgctttaagcatttatccatcaaaacctctcaagctatgctaccagcccgtaccacaatccgagtaccatatcacgctctcgactgtatccacgcgacaagactgggtgccttaaaacagcacacgcacgaacctctatccaggcgccccttgtttcacg
gi|16 : ttacCT------GGCCAGT--TG------AG---A--TA--C-------------TCA----T--TCCCCTG-G-AA-TTT---CTATCT-CTA-G-----T-TC-------AT-CCTCCCGAGCC-CACT-TATTCCCGGTttctcgtacatccttgggatggttaagctttttagctaaacctcttaggctgctaccactctgagcacaatccgcaccataatcctctctactgtcctatgaaaaggtgggtgtcttaaaaaacggcacacgcctgtaagtttccctcgcgtggtcctggattttcaccagt
gi|17 : cacca-CCTAAA--CC--GGGT----T----T-AA-A-GGG-G------G-G-GT-GCCA-GTGGC-ACTCCTCC-GG-GCAAAAACAA-GGT-AG--GC-AGGA---CCGA---AG-CC-AACC---CA----A---GAAAA-ACAAC-AGT--GCACA-A-G-TACCCGCC-T---AGAT-AG--G-G-T--TG-GGCA-G-T---TAAGATCGT-G-TC---CA-------GA-AGGGACGT-----CTA--GG------GCGAAACGGCAAGATACATGTA-TCCAC-TAT-TCCGCCGCCA-CGTA-CAT-----C-CAA-AGGC-A-C-C-----GA---A-GG---A--A-C-C---GTGAT-TGTGTG--ttgtcgggttctctccttgcatgggtgattaagcttcagctaaatctctaagctgctaccagcctaccacaatccgattcatatcctccctactgtcctaggaaaagtagggtgccttaaaacgcacactcctgtacttcctccggcgtcctggttttcacgtgtc
gi|18 : ACAAACTCAGAAAAA-AAAA-TAT-------ATTAAAA-TCA--ACGACTTTTTACTA---AAAATATCAATTGAAA--C----TACTTGTAGATAT---ATTACATT-ACAA-ATA--G-ATATTTCCATT-GAAC----AAA---TG-TTACA-AAG--G---TATATAACATTGC--------------------GGCCTCTATAGAAATC----G------------------GGCA----------------TCT--G--A----------------AGCC-GATTTTT---TTTTT-----ATTC---ATC-TCT-T--TTC-G-ATC-TCATT-A-AAGAACCGAT----ATgg
gi|19 : actgcgaaatatg------TG---A--TG--C----ACC--G-A-CCAC-TTT--TCTC-TG-G-AA-TCT---CTATGT-CT--GGGGCATCTC-------TT-TT-----ATCC-CATT-TATTCCTGGTt
gi|2 : TGCGACAAA---TTAAGAATAAA-TCAAGAAAA-AAAAAATT-------ATTAAAA-TTA--ACG--CTT-GACTATTAAAA---T--AT-GAAA--C----T--TTGTAGATAT---ATTACA-CCACCA-ATAAGG-TCATT---ATT-A-------AAA---TG-TT-CA-AA---G---TATATAACA------------------------GG-------------C----G------------------GCCA----------------TCT--G--A----------------AGCC-GA----T---TTTTT-----ATTAAAACTC-GCT-T--TTC-GAGTA-ACCGT-A------GCGAT----ATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAACTA-T-----TTACAACCCCCCCCCCTCCATTTTCTTCT---G-AAAGG-ATGG-A---T-C-ATAG-CC-AAA--CT--G--T----C----T-GA-ACGGG-GAAACA-G-A-GT-ACCA-GTGGC-ACTACTCCGGG-GCAAAATCAA-GGT-AG--GC-AGGA---CCGA---AG-CC-A--C---CA-C------GAAAA-GCTAC-AGG--GCACA-ATG-TGACCGCC-T---AGA--AT--G-G-T--GG-CGCACA-TGC-TGAAATCGT-G-AT---CA-------GA-G-----GC-----TCC--AG------GCG-AACGGCAA--------TC-TCCAC-CAT-TCCGCCGCCA-CGTA-CCT-----T-CAA-AAGG-A-A-T-----AG---A-GG---A--T-C-T---G-GTT-TATCTG--CGTCATACACTCAAA-C-AT-C-TTA-GAC-CAC-TC-CACCCCATATGACT---------------------CA--------------G-TATTCCT--C--GGGCTGCTTCCT-C-------AGCCTACCAGAGT--TCTGGA-TT-TTCCC-----A-AGTC-------AAC--GTTCCTGCC--G-GTC--TT--AAG---ACCC-ATC-GGGA---T---CTTTCTGGGTTCC-AC-CTGTTA-GG---GA-AC-AACA-A-TTCC-C---TCTT---CATGGAC-A-AT-TGG-C---GCT--C-----AA--G--CTCAAC------GGCTAGCACCC---CTATTAC--AA--------T-CT-TTCT---T--GCAACT-T-CGC----AAC-TCCGCAT-C-CT--AGGGACCCACTTC----ACCCA-GCG--C-A-GC----ATCGG-GC-AGGAA---T--T---TC-AC-TA----------GCA---T--GAC--A----GTG--------CGA----G--GG---A-----AG--C-A--GA--A-TC-TCAAGAAGC-TTA-----AATCT-GGA-T-GCT---GG-TT-C---AT---C--A-TA-AAT----C-TG-C---CAAC--TT---CCT--------------A-GT---G--GG---GGGGG-CA-T----A-A---G---GCT--ACGGACAT-TGG-T--GT-G-GA-CA---C-A---T-A-T----C-T-----C--T-GA-GGC----CAACCTCCACCCCCAG----C--C-TCACG-T-CCT-GGAG--AGT--C-C-----GCT-CTATCCACAAAAAGT-AGT--T---CCTATC--CC-NNN--N---NNNNNNN--NNNNNNNNN--NNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN-NNNNNN--NN-NNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNN-N--AGCC-ACATA--C-AGGTTTC-AAGCTAC-CTGT---A-CA----T-------------CATTCCCCA-C-T-G--GATGGGAAATG--GGG--C-C--CGCA---ATA---AAAT---C----AC----CCAGTCCCC-CAA-TA--T--T-C-T-------A-AT-TT-C---------TG-----TC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---CGTTT-GCACACG--A-G---GTCC--TG-A-ACCTG-TAA-T--T--GC-A-C-----------TGT-AT-----A-TA-TCAT-T---GAG-TG---TCGTCACCT------GGCCAGT--GG------TG---A--TG--C----AGC--G-A-TCGC-TTT--CTTCCTG-G-AA-TCT---CTATCT-CTAGGGGGCAT-TC-------AT-CC---CGAGCC-CACTACATTCCCGGTtcctcggtccactcctctgattacctgtgcgattaaactccaacccaacctccgggttgctaccacgaaccatatcctccctactgtccttggaaacggagggcgctctggtttcatgtaggaatgtctattattcctnnnnnnn
gi|20 : ACAAAA--TTAAAACTAAAATCG---------AAATTTTTTTTTTATTAAAAATCA--AC---CTTTAGCTA---AAAC--TTGAT-GAAAACT----T--TTGTAGACAT---ATTACA-T-AC-A-ATAAGG-TTTCC---ATT-G-------AAA--------------G--G---TATATAACA------------------------TG-------------C----G------------------GCCA----------------TCTTGA--ATGGCGAACATCTTGGTAGCC-GA----T---TTTTTTTTTAATTT---TTC-TCA-T--TTT-G-ATA---CTTAA-A--AAGCGAT----c
gi|21 : atgaTGCGACAAAA--TTAAGAATAAA-TCAGAAAAA-AAAA---T-------ATTAAAAATTA--ACG--CTTTGACT----AAA---TTGAT-GAAA--CTTTGT--TTGTAGATA----ATTACA-T-ACC--ATAAGGTTTATT---ATTAA-------AAA---TG-TT-CATAAA--G---TATATAA-A------------------------GG-------------C----G------------------GCCA----------------ACTTGG--A----------------AGCT-GA----T---TTTTT-----ATT-----TC-TCT-T--TTT-G-GT--ACCTT-A-A--AAGCGAT----A
gi|23 : aa-AAA--G---TAAATAACA------------------------GG-------------A----G------------------GCCA----------------TCTTGG--A----------------AGTC-AA----TTTCTTTTT-----A-TT---CAC-CCTAT--TTC-T-GT--ATCTT-A-A--TAGCGAT----Aa
gi|24 : CTCAATTA-TATAAAT-ACAGCTCCCCCC-----GTTTTCTC-T---G-AAAGG-ATGGG----T-TCATTA-ACTATA--CT--G--T----
gi|25 : CCA-A-G--C-A-G-----ATCCG-GG-AGGAT---T--T---TC-AC-TA----------GCA---T--GACA-A----GTG--------CGA----G--G
gi|26 : ccaCCT-CAG-CA--T--G-T-T-------A-TT-TT-C---------TG-----CC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---C-TTT-Gta
gi|27 : tC-T-CGA-T-C-CA--AGGGA-----CTC----ACC-A-G-G--C-A-G-----ATCC
gi|3 : TGGGACAAAA--TTAAGAATAAT-TCAGA----------TTTTTGTAC-ATTAAAAATCA--ACG--TTTTGACTA---AAA---TTGAT-GACA--C----T--TTGTAGATAT---ATTACA-T-A-CG-ATAAGGTTTACC---ATTGA-------AAA---TA-TT-CA-AAAG-G---TATATAACA------------------------TG-------------C----G------------------GTCATCTTGAATGGAGGCCATCTTGG--A----------------AGCC-GA----T---TTTTT-----ATTT---CTC-TCT-T--TTC-G-GT--ACCTT-G-G--AAGCAAT----A
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Reference ( family-1227 ) : TGCGACAAAA--TTAAGAATAAA-TCA-GAAAAA-AAAAATTTT--T-----ATTAAAAATCA--ACG--CTTTGACTA---AAA---TTGAT-GAAA--C----T--TTGTAGATAT---ATTACA-T-ACCA-ATAAGG-TTATT---ATT-A-------AAA---TG-TT-CA-AAA--G---TATATAACA------------------------GG-------------C----G------------------GCCA----------------TCTTGG--A----------------AGCC-GA----T---TTTTT-----ATTT---CTC-TCT-T--TTC-G-GTA-ACCTT-A-A--AAGCGAT----ATATAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCCCCAACTA-T-----T-ACANCTCCCCCCCCCCCGTTTTCTCCT---G-AAAGG-ATGGGA---T-CCATAG-CCTAAA--CT--G--T----C----T-GA-ACGGG-GAAACAAG-A-GT-ACCA-GTGGC-ACTACTCCGGG-GCAAAACCAA-GGT-AG--GC-AGGA---CCGA---AG-CC-A--C---CA-C--A---GAAAA-GCAAC-AGG--GCACA-A-G-TGACCGCC-T---AGAT-AG--G-G-T--GG-GGCA-G-T-C-TGGAATCGT-G-TC---CA-------GA-G-----GT-----CCC--GG------GCGAAACGGCAA--------TC-TCCAC-CAT-TCCGCCGCCA-CGTA-CGT-----T-CAA-AAGG-A-N-T-----AG---A-GG---A--T-C-T---G-GTT-TGTCTG--CGT-A---ACTCAAA-C-ATCC-CTA-GAC-CAC-TC-CACCCCATATGACC-----G---GG----------TA--------------G-TATCCTT--C--GGGCTG-TTCCTC-------AGCCT-CCAGAGT--TCTGGA-TT-TTCCC-----A-AATC-------AAC--GTTCCTG-C--G-GTC--TC--AAG---ACCC-ATA-GGGN---T---TCTCCTGGGTCCC-AC-CTGTTA-GG---GA-AC-AAC--A-TTCC-C---TCTT---CATGGAC-A-AT-TGG-C---GCT--C-----AA--G--CTCAAC------AGCTAGCACCC---CT-TTACA-AA--------T-CC-TTCT---T--GCAACT-T-CGC----AAC-T-CGAAT-C-CA--AGGGA---A-TTC----ACCCA-G-G--C-A-G-----ATCCG-GG-AGGAA---T--T---CC-AC-TA----------GCG---T--GAC--A----GTG--------CGA----G--GG---A-T-C-AG--C-A--GA--A-TC-TCAGAGAGC-TT------AATCT-GAA-T-GCT-A-GG-TT-C---AC---C--A-TA-AAT----C-TG-C---CAAC--TT---CCT-ATC-G--A-----A-GT---G--GG---GAGGG-CA-T----A-A---G---GCT--ACGGATAT-TGG-T--GT-G-GA-CA---C-A---T-A-T----C-T-----C--T-GA-GGC----CAACATCCA-CCCCAG----C--C-T--CG-T-CCT-GGAG--AGT--C-C-----GCT-CTGCCC---AAAAGT-AGT--C---CCTATC--CC-CCC--C---CNCCCCC--TGGAGAGAA--CGC-TATGCCCCAGGTCT-AA-TTTTGC--CT-TACAT-TCTCGC--AGGAAGTGTG-TACCAAGCAACATGG---AGCCNCAAGG-G--AGCC-ACATA--C-AGG-TTC-AAGCTA--TTGT---A-CA----T-------------CACCCCCCA-C-T-G--GATGGGGAAT---GGG--C-C--CGCA---ATA---AAAT---C----AC----TCAGTCCCC-CAG-TA--T--G-C-T-------A-AT-TT-C---------TG-----CC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---C-TCT-GCACACGT-A-G---GTCC--CG-A-NCCCG-TAA-T--T--GC-A-C-----------TGT-AT-----A-TC-TCGT-T---GAG-TG---TC-TCACCT------GGCCAGT--GG------TG---A--TG--C----AGC--G-A-TCGC-CTT--CCCCCTG-G-AA-TCT---CTATCT-CTA-GGGGCAT-TC-------AT-CC---CGAGCC-CACT-CATTCCCGGT
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gi|10 : cCTG--CGT-T---ACTCAAC-A-ATCC-CTA-GAC--AC-TCGCACCACAT-TGACC-----G---GGCGGATAC---TA--------------G-TATCCTC--CCGGGACTG-T-CCTC--------GCCT-CTAGAGT---CTAGG-TT-TTTC------A-AATCCTTATT-AAC--ATTC-TG-C--GCGTC--TC--AAG---ATCC-ATA-GGGT---T---TCA---GGGTTCC-AAACTGTTA-CT---GA-AC-AACTAA-ACAC-C---TCTC---CAAGGA--A-AT-GGC-C---GCT--CCTTGAAA--GGCCTCAAC------A-TTAGCACCC----T-TTACATAA--------T-CCATTCT---TTAG-AACT-T-CGCCGCCAAC-T-T-AAT-A-CA--AGGGC---A-TTTCGA-AACCA-G-G--CCA-G-----ACCCC-GG-AGGAA---T--TAT-CC-ACCTA----------GCA---TTGGAC--ACATGGTGGT------CGACAATG--GG---T-C-C-AG--CCA--GA--A-TC-TCAGAG-GC-TT---------CC-GAA-TAGCT-A-AA-TC-C---AC---C--A-TA-AAT----TATG-C---CAAC--TTTAACCT-ATC-G--ACTACCATGT---ATCGC---GAGGGACAAT----A-A---G---GGT--AGAGATTT-TGG-T--TT-GTGA-CA---CCA---T-A-T----C-TATAACC--T-TA-G------CAACATC-A-CCCCAG----CATC-T--TG-TTCCT-GGAGTCCGT--CTC-----GCT-CTGCCA---AACAGTAAGT--C---ATTATC--TT-CTC--cagttctcgggttcctttgggtgattacgccttcttctaactttctaagctgctaccaggcctaccacccaatcgatttcgtcatcttctctagctgtctcggaaaaaggtgggtgccttaaaacgcacatgccttacttctcggcgcggtttccgtg
gi|10 : atatctatac-G--AGCC-ACATAA-C-AGG-TTA-CAGCAAA-TCGACCAA-CAAAATT-------------CACCCCCCG---T-GTCGATGGGAAATAGAGGA--CGCGGCGCAC--ATACCTAAAT---CCCAAAC----TCAGTCTACACAG-TAAAT--G-C-TCCACGTAA-ATATT-C---------TGACACACT--C----CA-A-TAG--TCCA---CCACGGAA---C-TCT-GT-CATGT-A-G---GTTC--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagccacataacaggttacagcaaatcgaccaacaaaattcaccccccgtgtcgatgggaaatagaggacgcggcgcacatacctaaatcccaaactcagtctacacagtaaatgctccacgtaaatattctgacacactccaatagtccaccacggaactctgtcatgtaggttc
gi|11 : atatctatacctgcgttactcaacaatccctagacactcgcaccacattgaccgggcggatactagtatcctcccgggactgtcctcgcctctagagtctaggtttttcaaatccttattaacattctgcgcgtctcaagatccatagggtttcagggttccaaactgttactgaacaactaaacacctctccaaggaaatggccgctccttgaaaggcctcaacattagcaccctttacataatccattctttagaacttcgccgccaacttaatacaagggcatttcgaaaccaggccagaccccggaggaattatccacctagcattggacacatggtggtcgacaatgggtccagccagaatctcagaggcttccgaatagctaaatccaccataaattatgccaactttaacctatcgactaccatgtatcgcgagggacaataagggtagagattttggtttgtgacaccatatctataaccttagcaacatcaccccagcatcttgttcctggagtccgtctcgctctgccaaacagtaagtcattatcttctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--A-TT-AAT----C-TG-C---CA-----T---CCT-A--------------GT---G--GG---AAGGA-CAAT----ATA---G---GTTTTACGGATAT---G-T--GT-A-GA-CA---C-A---T-A-T----C-T-----T--C-GA-GGC----AAACCTC-A-CCCC-G----C--C----CG-T-CCT-GG-G--AGTTCC-C-----GCTTCTGCC----AAAAGT-AGT--A-----TACC--NN-NNN--N---NNNNNNN--NNNNNNNNN--NNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN-NNNNNN--NN-NNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNG--AGCCCACATA--CCAGG-TTC-AGTCTA--T-GT---AACA----TT------------CACCTCC-A-C-TTG--GATGGGGAAT---AGGGAC-C--CGCA---ATT---AA-T---CCA--AC----TCAGTCCCC-----TA--T--G-C-T-------A-AT-TTTC---------TG-----TC-------TA-G-TAATCTCCA---CCACGG-A---C-TTTTGCCC-CGT-A-G---GTCT--CG-A-ACCTG-TAA-T--T--GCCA-C-----------TGT-AT-----A-TCTTCAG-T---GAG-T----TC-TCACCT------GGCCAGT--GG------TG---A--TG--C----ACC--GCA-T-GC-CTTCCCCCCCTG-GAAA-TCT---CTATCT-CTA--GGTCA--TC-------AA-CC---CGAGCC-CACT-CATT-TCGGT
gi|12 : aaattgctcaaggcatccaccaccgagaTGCGGCAAAG--TTAATAATAAA-TCA-GATTAA-AAAA-------T-----ATTAAAAATCA--ACG--CTTTGACCA---AAA---TTAAT-GAAT--C----T--TTGTAGATGT---ATTACA-T-A-CA-ATTAGGTTTACC---ATTAA-------AAA---TG-CC-CA-AAAT-G---TATATAACA------------------------GG-------------C----A------------------GCCA----------------TCTTGAATA----------------AGCC-GA----T---TTTTT-----ATTT---CTCTTTT-T--TTC-G-GTA-A-CTT-C-A--AAGCGGT----A-ATAtctcgggttcactcttgagtgataagacttaaacgaaacctcctaagctgctaccacctaccacaatccgatcaaatcttctctaacgtctcagaaaaaggtgggtggcttaaaaaacacatgcctgtaccttcctcctcgggcggccctggtttcacccgt
gi|12 : AACTG-T-----T-ACA------CTCCCCCCGTTTTCTCC----G-AAAGG-ACAATG---T-CCATAG-CCTAAA--CT--G--C----T----T-T---------------G-A-GT-GCCA-GTGGC-ATTCCTCCAGA-GCAAAATCAA-GGT-AG--AC-AGGA---CCGA---AGCCC-A--A---CA-A--A---TAAAA-GCAAC-AGG--ACACA-A-G-TGTCTGCC-T---AGAT-AG--G-A-TC-GG-GGCA-G-T-C-TGT-ATCGT-G-TC---CAGAAGAG-GA-A-----GT-----CCC--GG------GCGAAGCGGAAA--------TA-TCCCC-CAT-TCCACCCAAA-CGTA-CGT-----C-CAA-AAGC-A-T-C-----AG---A-GG---AACC-C-T---G-G-T-TGTCTG--GGT------CCTTAA-C-ACCC-CTA-GTC-CAT-TC-CA--CCATATGtcttaatttgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaactgttacactccccccgttttctccgaaaggacaatgtccatagcctaaactgctttgagtgccagtggcattcctccagagcaaaatcaaggtagacaggaccgaagcccaacaaataaaagcaacaggacacaagtgtctgcctagataggatcggggcagtctgtatcgtgtccagaagaggaagtcccgggcgaagcggaaatatcccccattccacccaaacgtacgtccaaaagcatcagaggaaccctggttgtctgggtccttaacacccctagtccattccaccatatg
gi|13 : tgcggcaaagttaataataaatcagattaaaaaatattaaaaatcaacgctttgaccaaaattaatgaatctttgtagatgtattacatacaattaggtttaccattaaaaatgcccaaaatgtatataacaggcagccatcttgaataagccgattttttatttctctttttttcggtaacttcaaagcggtaatatcttaatttgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaGC----AAC-T-CGA-T-C-CA--AGGGA-----TTC----ACC-A-G-G--C-A-G-----ATCCG-GG-AGGAA---T--T---CCCGC-TA----------GCG---T--GAC--AA---GTG--------CGA----G--AT---A-T-C-AG--T-A--GA--A-TC-TCAGAGAGC----------ATTT-GAA-T-GCT-A-GG-TT-CC--AC---A--A-TATAAT----C-TG-C---TAAC--TT---CCT-ATC-G--A-----A-GT---G--GA---GACGG-CA-TTTATA-A---G---GTT--ACAGACAT--GG-T--GT-G-GA-CA---T-A---A-A-T----C-TT----C--T-GA-GAC-----AACATC-G-CCCCAG----C--C-T--CG-T-CCT-GG-G--AGT--C-C-----GCT-CTG-CC---AAAAGT-AGT--CTTATCTA-C--TC-TCC--C---CACCCCC--TGGAGAGAA--TGC-TATGCCCCAGGTCT-AA-TTTTGC--CT-TACAT-TCTCGC--AGGAAGTATG-TACCAAGCAACATGG---AGCCACAAGG-G--AGCC-ACATA--C-AGG-TTC--AGCTA--TTGT---A-CAT---T-------------CA-CCCCCA-CTT-G--GATGGGAAAT---GGG--C-C--CGCA---TTA---AATC---C----AC----TCA-TTTCC-CAG-TA--T--G-C-C-------A-TG-TT-C---------TG-----CC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---C-CCT-G--CACGT-G-G---GTCC--TG-A-CCCCG-TAA-T--T--GC-A-C-----------TGT-AT-----
gi|14 : AGCTAAATTGT---AGCA----TTT-----------CAACATTCA-C-TTG--GATGGGGAAT---TGG--C-C--CGCAC--ATC---AAGG---C----GCGACATTAATTCTC-CAG-TA--G--GGC-T-------T-AT-T--C---------TG-----CC--CACCTCA-A-TA---TACA---CCACGG-G---C-AAT-G-ACACGTTA-GTTTGCCA--TG-A-CCCAG-TAAATAAT--GC-A-T-----------TGT-AA-----A-TC-TCAT-T---GAGGTG---TC-TCACCT------GGCCATT--AAGACGCATG---ACGTG--C----AGC--G-A-TCGC-CCT--CCCCCTT-A-AA-TAT---TCAGAT-TCA-TAGGCAT-CCCTACTCTAT-CC-----AGCC-CACT-C--TCCC
gi|15 : ctacacaagcattt-AT-----A-TC-TCGT-T---CGG-TG---TC-TCACCT------GGCCAGT--GG------TG---A--TG--CAGCGAGC--G-A-TCGCGCTT--CCCCCTG-G-AA-TCT---CTATCT-CTA---GGCAA-TC-------CTACG---CGAA---CACG-CATTCCTGGTtgcttactcgttcactcacttgcggtgtgctttaagcatttatccatcaaaacctctcaagctatgctaccagcccgtaccacaatccgagtaccatatcacgctctcgactgtatccacgcgacaagactgggtgccttaaaacagcacacgcacgaacctctatccaggcgccccttgtttcacg
gi|16 : ttacCT------GGCCAGT--TG------AG---A--TA--C-------------TCA----T--TCCCCTG-G-AA-TTT---CTATCT-CTA-G-----T-TC-------AT-CCTCCCGAGCC-CACT-TATTCCCGGTttctcgtacatccttgggatggttaagctttttagctaaacctcttaggctgctaccactctgagcacaatccgcaccataatcctctctactgtcctatgaaaaggtgggtgtcttaaaaaacggcacacgcctgtaagtttccctcgcgtggtcctggattttcaccagt
gi|17 : cacca-CCTAAA--CC--GGGT----T----T-AA-A-GGG-G------G-G-GT-GCCA-GTGGC-ACTCCTCC-GG-GCAAAAACAA-GGT-AG--GC-AGGA---CCGA---AG-CC-AACC---CA----A---GAAAA-ACAAC-AGT--GCACA-A-G-TACCCGCC-T---AGAT-AG--G-G-T--TG-GGCA-G-T---TAAGATCGT-G-TC---CA-------GA-AGGGACGT-----CTA--GG------GCGAAACGGCAAGATACATGTA-TCCAC-TAT-TCCGCCGCCA-CGTA-CAT-----C-CAA-AGGC-A-C-C-----GA---A-GG---A--A-C-C---GTGAT-TGTGTG--ttgtcgggttctctccttgcatgggtgattaagcttcagctaaatctctaagctgctaccagcctaccacaatccgattcatatcctccctactgtcctaggaaaagtagggtgccttaaaacgcacactcctgtacttcctccggcgtcctggttttcacgtgtc
gi|18 : ACAAACTCA-GAAAAA-AAAA---TA--T-----ATTAAAA-TCA--ACGACTTTTTACTA---AAAATATCAATTGAAA--C----TACTTGTAGATAT---ATTACATT-ACAA-ATA--G-ATATTTCCATT-GAAC----AAA---TG-TTACA-AAG--G---TATATAACATTGC--------------------GGCCTCTATAGAAATC----G------------------GGCA----------------TCT--G--A----------------AGCC-GATTTTT---TTTTT-----ATTC---ATC-TCT-T--TTC-G-ATC-TCATT-A-AAGAACCGAT----ATgg
gi|19 : actgcgaaatatg------TG---A--TG--C----ACC--G-A-CCAC-TTT--TCTC-TG-G-AA-TCT---CTATGT-CT--GGGGCATCTC-------TT-TT-----ATCC-CATT-TATTCCTGGTt
gi|2 : TGCGACAAA---TTAAGAATAAA-TCAAGAAAAA-AAAAATT----------ATTAAAA-TTA--ACG--CTT-GACTATTAAAA---T--AT-GAAA--C----T--TTGTAGATAT---ATTACA-CCACCA-ATAAGG-TCATT---ATT-A-------AAA---TG-TT-CA-AA---G---TATATAACA------------------------GG-------------C----G------------------GCCA----------------TCT--G--A----------------AGCC-GA----T---TTTTT-----ATTAAAACTC-GCT-T--TTC-GAGTA-ACCGT-A------GCGAT----ATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAACTA-T-----TTACAACCCCCCCCCCTCCATTTTCTTCT---G-AAAGG-ATGG-A---T-C-ATAG-CC-AAA--CT--G--T----C----T-GA-ACGGG-GAAACA-G-A-GT-ACCA-GTGGC-ACTACTCCGGG-GCAAAATCAA-GGT-AG--GC-AGGA---CCGA---AG-CC-A--C---CA-C------GAAAA-GCTAC-AGG--GCACA-ATG-TGACCGCC-T---AGA--AT--G-G-T--GG-CGCACA-TGC-TGAAATCGT-G-AT---CA-------GA-G-----GC-----TCC--AG------GCG-AACGGCAA--------TC-TCCAC-CAT-TCCGCCGCCA-CGTA-CCT-----T-CAA-AAGG-A-A-T-----AG---A-GG---A--T-C-T---G-GTT-TATCTG--CGTCATACACTCAAA-C-AT-C-TTA-GAC-CAC-TC-CACCCCATATGACT---------------------CA--------------G-TATTCCT--C--GGGCTGCTTCCTC-------AGCCTACCAGAGT--TCTGGA-TT-TTCCC-----A-AGTC-------AAC--GTTCCTGCC--G-GTC--TT--AAG---ACCC-ATC-GGGA---T---CTTTCTGGGTTCC-AC-CTGTTA-GG---GA-AC-AACA-A-TTCC-C---TCTT---CATGGAC-A-AT-TGG-C---GCT--C-----AA--G--CTCAAC------GGCTAGCACCC---CTATTAC--AA--------T-CT-TTCT---T--GCAACT-T-CGC----AAC-TCCGCAT-C-CT--AGGGACCCACTTC----ACCCA-GCG--C-A-GC----ATCGG-GC-AGGAA---T--T---TC-AC-TA----------GCA---T--GAC--A----GTG--------CGA----G--GG---A-----AG--C-A--GA--A-TC-TCAAGAAGC-TTA-----AATCT-GGA-T-GCT---GG-TT-C---AT---C--A-TA-AAT----C-TG-C---CAAC--TT---CCT--------------A-GT---G--GG---GGGGG-CA-T----A-A---G---GCT--ACGGACAT-TGG-T--GT-G-GA-CA---C-A---T-A-T----C-T-----C--T-GA-GGC----CAACCTCCACCCCCAG----C--C-TCACG-T-CCT-GGAG--AGT--C-C-----GCT-CTATCCACAAAAAGT-AGT--T---CCTATC--CC-NNN--N---NNNNNNN--NNNNNNNNN--NNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN-NNNNNN--NN-NNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNN-N--AGCC-ACATA--C-AGGTTTC-AAGCTAC-CTGT---A-CA----T-------------CATTCCCCA-C-T-G--GATGGGAAATG--GGG--C-C--CGCA---ATA---AAAT---C----AC----CCAGTCCCC-CAA-TA--T--T-C-T-------A-AT-TT-C---------TG-----TC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---CGTTT-GCACACG--A-G---GTCC--TG-A-ACCTG-TAA-T--T--GC-A-C-----------TGT-AT-----A-TA-TCAT-T---GAG-TG---TCGTCACCT------GGCCAGT--GG------TG---A--TG--C----AGC--G-A-TCGC-TTT--CTTCCTG-G-AA-TCT---CTATCT-CTAGGGGGCAT-TC-------AT-CC---CGAGCC-CACTACATTCCCGGTtcctcggtccactcctctgattacctgtgcgattaaactccaacccaacctccgggttgctaccacgaaccatatcctccctactgtccttggaaacggagggcgctctggtttcatgtaggaatgtctattattcctnnnnnnn
gi|20 : ACAAAA--TTAAAACTAAAATCG----------AAATTTT--TTTTTTATTAAAAATCA--AC---CTTTAGCTA---AAAC--TTGAT-GAAAACT----T--TTGTAGACAT---ATTACA-T-A-CA-ATAAGG-TTTCC---ATT-G--------------------A-AAG--G---TATATAACA------------------------TG-------------C----G------------------GCCA----------------TCTTGA--ATGGCGAACATCTTGGTAGCC-GA----T---TTTTTTTTTAATTT---TTC-TCA-T--TTT-G-ATA---CTTAA-A--AAGCGAT----c
gi|21 : atgaTGCGACAAAA--TTAAGAATAAA-TCA-GAAAAA-AAAA-------T-----ATTAAAAATTA--ACG--CTTTGACT----AAA---TTGAT-GAAA--CTTTGT--TTGTAGATA----ATTACA-T-ACC--ATAAGGTTTATT---ATTAA-------AAA---TG-TT-CATAAA--G---TATATAA-A------------------------GG-------------C----G------------------GCCA----------------ACTTGG--A----------------AGCT-GA----T---TTTTT-----ATT-----TC-TCT-T--TTT-G-GT--ACCTT-A-A--AAGCGAT----A
gi|23 : aa-AAA--G---TAAATAACA------------------------GG-------------A----G------------------GCCA----------------TCTTGG--A----------------AGTC-AA----TTTCTTTTT-----A-TT---CAC-CCTAT--TTC-T-GT--ATCTT-A-A--TAGCGAT----Aa
gi|24 : CTCAATTA-TATAAAT-ACAGCTCCCCCC-----GTTTTCTC-T---G-AAAGG-ATGGG----T-TCATTA-ACTATA--CT--G--T----
gi|25 : CCA-A-G--C-A-G-----ATCCG-GG-AGGAT---T--T---TC-AC-TA----------GCA---T--GACA-A----GTG--------CGA----G--G
gi|26 : ccaCCT-CAG-CA--T--G-T-T-------A-TT-TT-C---------TG-----CC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---C-TTT-Gta
gi|27 : tC-T-CGA-T-C-CA--AGGGA-----CTC----ACC-A-G-G--C-A-G-----ATCC
gi|3 : TGGGACAAAA--TTAAGAATAAT-TCA-GA----------TTTT--TGTAC-ATTAAAAATCA--ACG--TTTTGACTA---AAA---TTGAT-GACA--C----T--TTGTAGATAT---ATTACA-T-A-CG-ATAAGGTTTACC---ATTGA-------AAA---TA-TT-CA-AAAG-G---TATATAACA------------------------TG-------------C----G------------------GTCATCTTGAATGGAGGCCATCTTGG--A----------------AGCC-GA----T---TTTTT-----ATTT---CTC-TCT-T--TTC-G-GT--ACCTT-G-G--AAGCAAT----A
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Reference ( family-1227 ) : TGCGACAAAA--TTAAGAAT-AAA-TCA-GAAAAA-AAAAA------TTTT-----ATT---AAAAATCA--ACG--CTTTGACTA---AAA---TTGAT-GAAA--C----T--TTGTAGATAT---ATTACA-T-ACCA-ATAAGG-TTATT---ATT-A-------AAA---TG-TT-CA-AAA--G---TATATAACA------------------------GG-------------C----G------------------GCCA----------------TCTTGG--A----------------AGCC-GA----T---TTTTT-----ATTT---CTC-TCT-T--TTC-G-GTA-ACCTT-A-A--AAGCGAT----ATATAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCCCCAACTA-T-----T-ACANCTCCCCCCCCCCCGTTTTCTCCT---G-AAAGG-ATGGGA---T-CCATAG-CCTAAA--CT--G--T----C----T-GA-ACGGG-GAAACAAG-A-GT-ACCA-GTGGC-ACTACTCCGGG-GCAAAACCAA-GGT-AG--GC-AGGA---CCGA---AG-CC-A--C---CA-C--A---GAAAA-GCAAC-AGG--GCACA-A-G-TGACCGCC-T---AGAT-AG--G-G-T--GG-GGCA-G-T-C-TGGAATCGT-G-TC---CA-------GA-G-----GT-----CCC--GG------GCGAAACGGCAA--------TC-TCCAC-CAT-TCCGCCGCCA-CGTA-CGT-----T-CAA-AAGG-A-N-T-----AG---A-GG---A--T-C-T---G-GTT-TGTCTG--CGT-A---ACTCAAA-C-ATCC-CTA-GAC-CAC-TC-CACCCCATATGACC-----G---GG----------TA--------------G-TATCCTT--C--GGGCTG-TTCCT-C-------AGCCT-CCAGAGT--TCTGGA-TT-TTCCC-----A-AATC-------AAC--GTTCCTG-C--G-GTC--TC--AAG---ACCC-ATA-GGGN---T---TCTCCTGGGTCCC-AC-CTGTTA-GG---GA-AC-AAC--A-TTCC-C---TCTT---CATGGAC-A-AT-TGG-C---GCT--C-----AA--G--CTCAAC------AGCTAGCACCC---CT-TTACA-AA--------T-CC-TTCT---T--GCAACT-T-CGC----AAC-T-CGAAT-C-CA--AGGGA---A-TTC----ACCCA-G-G--C-A-G-----ATCCG-GG-AGGAA---T--T---CC-AC-TA----------GCG---T--GAC--A----GTG--------CGA----G--GG---A-T-C-AG--C-A--GA--A-TC-TCAGAGAGC-TT------AATCT-GAA-T-GCT-A-GG-TT-C---AC---C--A-TA-AAT----C-TG-C---CAAC--TT---CCT-ATC-G--A-----A-GT---G--GG---GAGGG-CA-T----A-A---G---GCT--ACGGATAT-TGG-T--GT-G-GA-CA---C-A---T-A-T----C-T-----C--T-GA-GGC----CAACATCCA-CCCCAG----C--C-T--CG-T-CCT-GGAG--AGT--C-C-----GCT-CTGCCC---AAAAGT-AGT--C---CCTATC--CC-CCC--C---CNCCCCC--TGGAGAGAA--CGC-TATGCCCCAGGTCT-AA-TTTTGC--CT-TACAT-TCTCGC--AGGAAGTGTG-TACCAAGCAACATGG---AGCCNCAAGG-G--AGCC-ACATA--C-AGG-TTC-AAGCTA--TTGT---A-CA----T-------------CACCCCCCA-C-T-G--GATGGGGAAT---GGG--C-C--CGCA---ATA---AAAT---C----AC----TCAGTCCCC-CAG-TA--T--G-C-T-------A-AT-TT-C---------TG-----CC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---C-TCT-GCACACGT-A-G---GTCC--CG-A-NCCCG-TAA-T--T--GC-A-C-----------TGT-AT-----A-TC-TCGT-T---GAG-TG---TC-TCACCT------GGCCAGT--GG------TG---A--TG--C----AGC--G-A-TCGC-CTT--CCCCCTG-G-AA-TCT---CTATCT-CTA-GGGGCAT-TC-------AT-CC---CGAGCC-CACT-CATTCCCGGT
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gi|10 : cCTG--CGT-T---ACTCAAC-A-ATCC-CTA-GAC--AC-TCGCACCACAT-TGACC-----G---GGCGGATAC---TA--------------G-TATCCTC--CCGGGACTG-T-CCT-C--------GCCT-CTAGAGT---CTAGG-TT-TTTC------A-AATCCTTATT-AAC--ATTC-TG-C--GCGTC--TC--AAG---ATCC-ATA-GGGT---T---TCA---GGGTTCC-AAACTGTTA-CT---GA-AC-AACTAA-ACAC-C---TCTC---CAAGGA--A-AT-GGC-C---GCT--CCTTGAAA--GGCCTCAAC------A-TTAGCACCC----T-TTACATAA--------T-CCATTCT---TTAG-AACT-T-CGCCGCCAAC-T-T-AAT-A-CA--AGGGC---A-TTTCGA-AACCA-G-G--CCA-G-----ACCCC-GG-AGGAA---T--TAT-CC-ACCTA----------GCA---TTGGAC--ACATGGTGGT------CGACAATG--GG---T-C-C-AG--CCA--GA--A-TC-TCAGAG-GC-TT---------CC-GAA-TAGCT-A-AA-TC-C---AC---C--A-TA-AAT----TATG-C---CAAC--TTTAACCT-ATC-G--ACTACCATGT---ATCGC---GAGGGACAAT----A-A---G---GGT--AGAGATTT-TGG-T--TT-GTGA-CA---CCA---T-A-T----C-TATAACC--T-TA-G------CAACATC-A-CCCCAG----CATC-T--TG-TTCCT-GGAGTCCGT--CTC-----GCT-CTGCCA---AACAGTAAGT--C---ATTATC--TT-CTC--cagttctcgggttcctttgggtgattacgccttcttctaactttctaagctgctaccaggcctaccacccaatcgatttcgtcatcttctctagctgtctcggaaaaaggtgggtgccttaaaacgcacatgccttacttctcggcgcggtttccgtg
gi|10 : atatctatac-G--AGCC-ACATAA-C-AGG-TTA-CAGCAAA-TCGACCAA-CAAAATT-------------CACCCCCCG---T-GTCGATGGGAAATAGAGGA--CGCGGCGCAC--ATACCTAAAT---CCCAAAC----TCAGTCTACACAG-TAAAT--G-C-TCCACGTAA-ATATT-C---------TGACACACT--C----CA-A-TAG--TCCA---CCACGGAA---C-TCT-GT-CATGT-A-G---GTTC--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagccacataacaggttacagcaaatcgaccaacaaaattcaccccccgtgtcgatgggaaatagaggacgcggcgcacatacctaaatcccaaactcagtctacacagtaaatgctccacgtaaatattctgacacactccaatagtccaccacggaactctgtcatgtaggttc
gi|11 : atatctatacctgcgttactcaacaatccctagacactcgcaccacattgaccgggcggatactagtatcctcccgggactgtcctcgcctctagagtctaggtttttcaaatccttattaacattctgcgcgtctcaagatccatagggtttcagggttccaaactgttactgaacaactaaacacctctccaaggaaatggccgctccttgaaaggcctcaacattagcaccctttacataatccattctttagaacttcgccgccaacttaatacaagggcatttcgaaaccaggccagaccccggaggaattatccacctagcattggacacatggtggtcgacaatgggtccagccagaatctcagaggcttccgaatagctaaatccaccataaattatgccaactttaacctatcgactaccatgtatcgcgagggacaataagggtagagattttggtttgtgacaccatatctataaccttagcaacatcaccccagcatcttgttcctggagtccgtctcgctctgccaaacagtaagtcattatcttctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--A-TT-AAT----C-TG-C---CA-----T---CCT-A--------------GT---G--GG---AAGGA-CAAT----ATA---G---GTTTTACGGATAT---G-T--GT-A-GA-CA---C-A---T-A-T----C-T-----T--C-GA-GGC----AAACCTC-A-CCCC-G----C--C----CG-T-CCT-GG-G--AGTTCC-C-----GCTTCTGCC----AAAAGT-AGT--A-----TACC--NN-NNN--N---NNNNNNN--NNNNNNNNN--NNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN-NNNNNN--NN-NNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNG--AGCCCACATA--CCAGG-TTC-AGTCTA--T-GT---AACA----TT------------CACCTCC-A-C-TTG--GATGGGGAAT---AGGGAC-C--CGCA---ATT---AA-T---CCA--AC----TCAGTCCCC-----TA--T--G-C-T-------A-AT-TTTC---------TG-----TC-------TA-G-TAATCTCCA---CCACGG-A---C-TTTTGCCC-CGT-A-G---GTCT--CG-A-ACCTG-TAA-T--T--GCCA-C-----------TGT-AT-----A-TCTTCAG-T---GAG-T----TC-TCACCT------GGCCAGT--GG------TG---A--TG--C----ACC--GCA-T-GC-CTTCCCCCCCTG-GAAA-TCT---CTATCT-CTA--GGTCA--TC-------AA-CC---CGAGCC-CACT-CATT-TCGGT
gi|12 : aaattgctcaaggcatccaccaccgagaTGCGGCAAAG--TTAATAAT-AAA-TCA-GATTAA-AAAA----------T-----ATT---AAAAATCA--ACG--CTTTGACCA---AAA---TTAAT-GAAT--C----T--TTGTAGATGT---ATTACA-T-A-CA-ATTAGGTTTACC---ATTAA-------AAA---TG-CC-CA-AAAT-G---TATATAACA------------------------GG-------------C----A------------------GCCA----------------TCTTGAATA----------------AGCC-GA----T---TTTTT-----ATTT---CTCTTTT-T--TTC-G-GTA-A-CTT-C-A--AAGCGGT----A-ATAtctcgggttcactcttgagtgataagacttaaacgaaacctcctaagctgctaccacctaccacaatccgatcaaatcttctctaacgtctcagaaaaaggtgggtggcttaaaaaacacatgcctgtaccttcctcctcgggcggccctggtttcacccgt
gi|12 : AACTG-T-----T-ACA------CTCCCCCCGTTTTCTCC----G-AAAGG-ACAATG---T-CCATAG-CCTAAA--CT--G--C----T----T-T---------------G-A-GT-GCCA-GTGGC-ATTCCTCCAGA-GCAAAATCAA-GGT-AG--AC-AGGA---CCGA---AGCCC-A--A---CA-A--A---TAAAA-GCAAC-AGG--ACACA-A-G-TGTCTGCC-T---AGAT-AG--G-A-TC-GG-GGCA-G-T-C-TGT-ATCGT-G-TC---CAGAAGAG-GA-A-----GT-----CCC--GG------GCGAAGCGGAAA--------TA-TCCCC-CAT-TCCACCCAAA-CGTA-CGT-----C-CAA-AAGC-A-T-C-----AG---A-GG---AACC-C-T---G-G-T-TGTCTG--GGT------CCTTAA-C-ACCC-CTA-GTC-CAT-TC-CA--CCATATGtcttaatttgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaactgttacactccccccgttttctccgaaaggacaatgtccatagcctaaactgctttgagtgccagtggcattcctccagagcaaaatcaaggtagacaggaccgaagcccaacaaataaaagcaacaggacacaagtgtctgcctagataggatcggggcagtctgtatcgtgtccagaagaggaagtcccgggcgaagcggaaatatcccccattccacccaaacgtacgtccaaaagcatcagaggaaccctggttgtctgggtccttaacacccctagtccattccaccatatg
gi|13 : tgcggcaaagttaataataaatcagattaaaaaatattaaaaatcaacgctttgaccaaaattaatgaatctttgtagatgtattacatacaattaggtttaccattaaaaatgcccaaaatgtatataacaggcagccatcttgaataagccgattttttatttctctttttttcggtaacttcaaagcggtaatatcttaatttgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaGC----AAC-T-CGA-T-C-CA--AGGGA-----TTC----ACC-A-G-G--C-A-G-----ATCCG-GG-AGGAA---T--T---CCCGC-TA----------GCG---T--GAC--AA---GTG--------CGA----G--AT---A-T-C-AG--T-A--GA--A-TC-TCAGAGAGC----------ATTT-GAA-T-GCT-A-GG-TT-CC--AC---A--A-TATAAT----C-TG-C---TAAC--TT---CCT-ATC-G--A-----A-GT---G--GA---GACGG-CA-TTTATA-A---G---GTT--ACAGACAT--GG-T--GT-G-GA-CA---T-A---A-A-T----C-TT----C--T-GA-GAC-----AACATC-G-CCCCAG----C--C-T--CG-T-CCT-GG-G--AGT--C-C-----GCT-CTG-CC---AAAAGT-AGT--CTTATCTA-C--TC-TCC--C---CACCCCC--TGGAGAGAA--TGC-TATGCCCCAGGTCT-AA-TTTTGC--CT-TACAT-TCTCGC--AGGAAGTATG-TACCAAGCAACATGG---AGCCACAAGG-G--AGCC-ACATA--C-AGG-TTC--AGCTA--TTGT---A-CAT---T-------------CA-CCCCCA-CTT-G--GATGGGAAAT---GGG--C-C--CGCA---TTA---AATC---C----AC----TCA-TTTCC-CAG-TA--T--G-C-C-------A-TG-TT-C---------TG-----CC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---C-CCT-G--CACGT-G-G---GTCC--TG-A-CCCCG-TAA-T--T--GC-A-C-----------TGT-AT-----
gi|14 : AGCTAAATTGT---AGCA----TTT-----------CAACATTCA-C-TTG--GATGGGGAAT---TGG--C-C--CGCAC--ATC---AAGG---C----GCGACATTAATTCTC-CAG-TA--G--GGC-T-------T-AT-T--C---------TG-----CC--CACCTCA-A-TA---TACA---CCACGG-G---C-AAT-G-ACACGTTA-GTTTGCCA--TG-A-CCCAG-TAAATAAT--GC-A-T-----------TGT-AA-----A-TC-TCAT-T---GAGGTG---TC-TCACCT------GGCCATT--AAGACGCATG---ACGTG--C----AGC--G-A-TCGC-CCT--CCCCCTT-A-AA-TAT---TCAGAT-TCA-TAGGCAT-CCCTACTCTAT-CC-----AGCC-CACT-C--TCCC
gi|15 : ctacacaagcattt-AT-----A-TC-TCGT-T---CGG-TG---TC-TCACCT------GGCCAGT--GG------TG---A--TG--CAGCGAGC--G-A-TCGCGCTT--CCCCCTG-G-AA-TCT---CTATCT-CTA---GGCAA-TC-------CTACG---CGAA---CACG-CATTCCTGGTtgcttactcgttcactcacttgcggtgtgctttaagcatttatccatcaaaacctctcaagctatgctaccagcccgtaccacaatccgagtaccatatcacgctctcgactgtatccacgcgacaagactgggtgccttaaaacagcacacgcacgaacctctatccaggcgccccttgtttcacg
gi|16 : ttacCT------GGCCAGT--TG------AG---A--TA--C-------------TCA----T--TCCCCTG-G-AA-TTT---CTATCT-CTA-G-----T-TC-------AT-CCTCCCGAGCC-CACT-TATTCCCGGTttctcgtacatccttgggatggttaagctttttagctaaacctcttaggctgctaccactctgagcacaatccgcaccataatcctctctactgtcctatgaaaaggtgggtgtcttaaaaaacggcacacgcctgtaagtttccctcgcgtggtcctggattttcaccagt
gi|17 : cacca-CCTAAA--CC--GGGT----T----T-AA-A-GGG-G------G-G-GT-GCCA-GTGGC-ACTCCTCC-GG-GCAAAAACAA-GGT-AG--GC-AGGA---CCGA---AG-CC-AACC---CA----A---GAAAA-ACAAC-AGT--GCACA-A-G-TACCCGCC-T---AGAT-AG--G-G-T--TG-GGCA-G-T---TAAGATCGT-G-TC---CA-------GA-AGGGACGT-----CTA--GG------GCGAAACGGCAAGATACATGTA-TCCAC-TAT-TCCGCCGCCA-CGTA-CAT-----C-CAA-AGGC-A-C-C-----GA---A-GG---A--A-C-C---GTGAT-TGTGTG--ttgtcgggttctctccttgcatgggtgattaagcttcagctaaatctctaagctgctaccagcctaccacaatccgattcatatcctccctactgtcctaggaaaagtagggtgccttaaaacgcacactcctgtacttcctccggcgtcctggttttcacgtgtc
gi|18 : AC-AAACTCA-GAAAAA-AAAA--------TAT-----ATT---AAAA-TCA--ACGACTTTTTACTA---AAAATATCAATTGAAA--C----TACTTGTAGATAT---ATTACATT-ACAA-ATA--G-ATATTTCCATT-GAAC----AAA---TG-TTACA-AAG--G---TATATAACATTGC--------------------GGCCTCTATAGAAATC----G------------------GGCA----------------TCT--G--A----------------AGCC-GATTTTT---TTTTT-----ATTC---ATC-TCT-T--TTC-G-ATC-TCATT-A-AAGAACCGAT----ATgg
gi|19 : actgcgaaatatg------TG---A--TG--C----ACC--G-A-CCAC-TTT--TCTC-TG-G-AA-TCT---CTATGT-CT--GGGGCATCTC-------TT-TT-----ATCC-CATT-TATTCCTGGTt
gi|2 : TGCGACAAA---TTAAGAAT-AAA-TCAAGAAAAA-AAAAA------TT-------ATT---AAAA-TTA--ACG--CTT-GACTATTAAAA---T--AT-GAAA--C----T--TTGTAGATAT---ATTACA-CCACCA-ATAAGG-TCATT---ATT-A-------AAA---TG-TT-CA-AA---G---TATATAACA------------------------GG-------------C----G------------------GCCA----------------TCT--G--A----------------AGCC-GA----T---TTTTT-----ATTAAAACTC-GCT-T--TTC-GAGTA-ACCGT-A------GCGAT----ATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAACTA-T-----TTACAACCCCCCCCCCTCCATTTTCTTCT---G-AAAGG-ATGG-A---T-C-ATAG-CC-AAA--CT--G--T----C----T-GA-ACGGG-GAAACA-G-A-GT-ACCA-GTGGC-ACTACTCCGGG-GCAAAATCAA-GGT-AG--GC-AGGA---CCGA---AG-CC-A--C---CA-C------GAAAA-GCTAC-AGG--GCACA-ATG-TGACCGCC-T---AGA--AT--G-G-T--GG-CGCACA-TGC-TGAAATCGT-G-AT---CA-------GA-G-----GC-----TCC--AG------GCG-AACGGCAA--------TC-TCCAC-CAT-TCCGCCGCCA-CGTA-CCT-----T-CAA-AAGG-A-A-T-----AG---A-GG---A--T-C-T---G-GTT-TATCTG--CGTCATACACTCAAA-C-AT-C-TTA-GAC-CAC-TC-CACCCCATATGACT---------------------CA--------------G-TATTCCT--C--GGGCTGCTTCCT-C-------AGCCTACCAGAGT--TCTGGA-TT-TTCCC-----A-AGTC-------AAC--GTTCCTGCC--G-GTC--TT--AAG---ACCC-ATC-GGGA---T---CTTTCTGGGTTCC-AC-CTGTTA-GG---GA-AC-AACA-A-TTCC-C---TCTT---CATGGAC-A-AT-TGG-C---GCT--C-----AA--G--CTCAAC------GGCTAGCACCC---CTATTAC--AA--------T-CT-TTCT---T--GCAACT-T-CGC----AAC-TCCGCAT-C-CT--AGGGACCCACTTC----ACCCA-GCG--C-A-GC----ATCGG-GC-AGGAA---T--T---TC-AC-TA----------GCA---T--GAC--A----GTG--------CGA----G--GG---A-----AG--C-A--GA--A-TC-TCAAGAAGC-TTA-----AATCT-GGA-T-GCT---GG-TT-C---AT---C--A-TA-AAT----C-TG-C---CAAC--TT---CCT--------------A-GT---G--GG---GGGGG-CA-T----A-A---G---GCT--ACGGACAT-TGG-T--GT-G-GA-CA---C-A---T-A-T----C-T-----C--T-GA-GGC----CAACCTCCACCCCCAG----C--C-TCACG-T-CCT-GGAG--AGT--C-C-----GCT-CTATCCACAAAAAGT-AGT--T---CCTATC--CC-NNN--N---NNNNNNN--NNNNNNNNN--NNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN-NNNNNN--NN-NNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNN-N--AGCC-ACATA--C-AGGTTTC-AAGCTAC-CTGT---A-CA----T-------------CATTCCCCA-C-T-G--GATGGGAAATG--GGG--C-C--CGCA---ATA---AAAT---C----AC----CCAGTCCCC-CAA-TA--T--T-C-T-------A-AT-TT-C---------TG-----TC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---CGTTT-GCACACG--A-G---GTCC--TG-A-ACCTG-TAA-T--T--GC-A-C-----------TGT-AT-----A-TA-TCAT-T---GAG-TG---TCGTCACCT------GGCCAGT--GG------TG---A--TG--C----AGC--G-A-TCGC-TTT--CTTCCTG-G-AA-TCT---CTATCT-CTAGGGGGCAT-TC-------AT-CC---CGAGCC-CACTACATTCCCGGTtcctcggtccactcctctgattacctgtgcgattaaactccaacccaacctccgggttgctaccacgaaccatatcctccctactgtccttggaaacggagggcgctctggtttcatgtaggaatgtctattattcctnnnnnnn
gi|20 : ACAAAA--TTAAAACTAAAA-TC----------GAAATTTTTTTTTT-----ATT---AAAAATCA--AC---CTTTAGCTA---AAAC--TTGAT-GAAAACT----T--TTGTAGACAT---ATTACA-T-A-CA-ATAAGG-TTTCC---ATT-G--------------------A-AAG--G---TATATAACA------------------------TG-------------C----G------------------GCCA----------------TCTTGA--ATGGCGAACATCTTGGTAGCC-GA----T---TTTTTTTTTAATTT---TTC-TCA-T--TTT-G-ATA---CTTAA-A--AAGCGAT----c
gi|21 : atgaTGCGACAAAA--TTAAGAAT-AAA-TCA-GAAAAA-AAAA----------T-----ATT---AAAAATTA--ACG--CTTTGACT----AAA---TTGAT-GAAA--CTTTGT--TTGTAGATA----ATTACA-T-ACC--ATAAGGTTTATT---ATTAA-------AAA---TG-TT-CATAAA--G---TATATAA-A------------------------GG-------------C----G------------------GCCA----------------ACTTGG--A----------------AGCT-GA----T---TTTTT-----ATT-----TC-TCT-T--TTT-G-GT--ACCTT-A-A--AAGCGAT----A
gi|23 : aa-AAA--G---TAAATAACA------------------------GG-------------A----G------------------GCCA----------------TCTTGG--A----------------AGTC-AA----TTTCTTTTT-----A-TT---CAC-CCTAT--TTC-T-GT--ATCTT-A-A--TAGCGAT----Aa
gi|24 : CTCAATTA-TATAAAT-ACAGCTCCCCCC-----GTTTTCTC-T---G-AAAGG-ATGGG----T-TCATTA-ACTATA--CT--G--T----
gi|25 : CCA-A-G--C-A-G-----ATCCG-GG-AGGAT---T--T---TC-AC-TA----------GCA---T--GACA-A----GTG--------CGA----G--G
gi|26 : ccaCCT-CAG-CA--T--G-T-T-------A-TT-TT-C---------TG-----CC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---C-TTT-Gta
gi|27 : tC-T-CGA-T-C-CA--AGGGA-----CTC----ACC-A-G-G--C-A-G-----ATCC
gi|3 : TGGGACAAAA--TTAAGAAT-AAT-TCA-GA----------------TTTTTGTACATT---AAAAATCA--ACG--TTTTGACTA---AAA---TTGAT-GACA--C----T--TTGTAGATAT---ATTACA-T-A-CG-ATAAGGTTTACC---ATTGA-------AAA---TA-TT-CA-AAAG-G---TATATAACA------------------------TG-------------C----G------------------GTCATCTTGAATGGAGGCCATCTTGG--A----------------AGCC-GA----T---TTTTT-----ATTT---CTC-TCT-T--TTC-G-GT--ACCTT-G-G--AAGCAAT----A
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Reference ( family-1227 ) : TGCGACAAAA--TTAAGAATAAA-TCAGAAAAA-AAAAATTT-------ATTAAAAATCA--ACG--CTTTGACTA---AAA---TTGAT-GAAA--C----T--TTGTAGATAT---ATTACA-T-ACCA-ATAAGG-TTATT---ATT-A-------AAA---TG-TT-CA-AAA--G---TATATAACA------------------------GG-------------C----G------------------GCCA----------------TCTTGG--A----------------AGCC-GA----T---TTTTT-----ATTT---CTC-TCT-T--TTC-G-GTA-ACCTT-A-A--AAGCGAT----ATATAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCCCCAACTA-T-----T-ACANCTCCCCCCCCCCCGTTTTCTCCT---G-AAAGG-ATGGGA---T-CCATAG-CCTAAA--CT--G--T----C----T-GA-ACGGG-GAAACAAG-A-GT-ACCA-GTGGC-ACTACTCCGGG-GCAAAACCAA-GGT-AG--GC-AGGA---CCGA---AG-CC-A--C---CA-C--A---GAAAA-GCAAC-AGG--GCACA-A-G-TGACCGCC-T---AGAT-AG--G-G-T--GG-GGCA-G-T-C-TGGAATCGT-G-TC---CA-------GA-G-----GT-----CCC--GG------GCGAAACGGCAA--------TC-TCCAC-CAT-TCCGCCGCCA-CGTA-CGT-----T-CAA-AAGG-A-N-T-----AG---A-GG---A--T-C-T---G-GTT-TGTCTG--CGT-A---ACTCAAA-C-ATCC-CTA-GAC-CAC-TC-CACCCCATATGACC-----G---GG----------TA--------------G-TATCCTT--C--GGGCTG-TTCCT-C-------AGCCT-CCAGAGT--TCTGGA-TT-TTCCC-----A-AATC-------AAC--GTTCCTG-C--G-GTC--TC--AAG---ACCC-ATA-GGGN---T---TCTCCTGGGTCCC-AC-CTGTTA-GG---GA-AC-AAC--A-TTCC-C---TCTT---CATGGAC-A-AT-TGG-C---GCT--C-----AA--G--CTCAAC------AGCTAGCACCC---CT-TTACA-AA--------T-CC-TTCT---T--GCAACT-T-CGC----AAC-T-CGAAT-C-CA--AGGGA---A-TTC----ACCCA-G-G--C-A-G-----ATCCG-GG-AGGAA---T--T---CC-AC-TA----------GCG---T--GAC--A----GTG--------CGA----G--GG---A-T-C-AG--C-A--GA--A-TC-TCAGAGAGC-TT------AATCT-GAA-T-GCT-A-GG-TT-C---AC---C--A-TA-AAT----C-TG-C---CAAC--TT---CCT-ATC-G--A-----A-GT---G--GG---GAGGG-CA-T----A-A---G---GCT--ACGGATAT-TGG-T--GT-G-GA-CA---C-A---T-A-T----C-T-----C--T-GA-GGC----CAACATCCA-CCCCAG----C--C-T--CG-T-CCT-GGAG--AGT--C-C-----GCT-CTGCCC---AAAAGT-AGT--C---CCTATC--CC-CCC--C---CNCCCCC--TGGAGAGAA--CGC-TATGCCCCAGGTCT-AA-TTTTGC--CT-TACAT-TCTCGC--AGGAAGTGTG-TACCAAGCAACATGG---AGCCNCAAGG-G--AGCC-ACATA--C-AGG-TTC-AAGCTA--TTGT---A-CA----T-------------CACCCCCCA-C-T-G--GATGGGGAAT---GGG--C-C--CGCA---ATA---AAAT---C----AC----TCAGTCCCC-CAG-TA--T--G-C-T-------A-AT-TT-C---------TG-----CC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---C-TCT-GCACACGT-A-G---GTCC--CG-A-NCCCG-TAA-T--T--GC-A-C-----------TGT-AT-----A-TC-TCGT-T---GAG-TG---TC-TCACCT------GGCCAGT--GG------TG---A--TG--C----AGC--G-A-TCGC-CTT--CCCCCTG-G-AA-TCT---CTATCT-CTA-GGGGCAT-TC-------AT-CC---CGAGCC-CACT-CATTCCCGGT
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gi|10 : cCTG--CGT-T---ACTCAAC-A-ATCC-CTA-GAC--AC-TCGCACCACAT-TGACC-----G---GGCGGATAC---TA--------------G-TATCCTC--CCGGGACTG-T-CCT-C--------GCCT-CTAGAGT---CTAGG-TT-TTTC------A-AATCCTTATT-AAC--ATTC-TG-C--GCGTC--TC--AAG---ATCC-ATA-GGGT---T---TCA---GGGTTCC-AAACTGTTA-CT---GA-AC-AACTAA-ACAC-C---TCTC---CAAGGA--A-AT-GGC-C---GCT--CCTTGAAA--GGCCTCAAC------A-TTAGCACCC----T-TTACATAA--------T-CCATTCT---TTAG-AACT-T-CGCCGCCAAC-T-T-AAT-A-CA--AGGGC---A-TTTCGA-AACCA-G-G--CCA-G-----ACCCC-GG-AGGAA---T--TAT-CC-ACCTA----------GCA---TTGGAC--ACATGGTGGT------CGACAATG--GG---T-C-C-AG--CCA--GA--A-TC-TCAGAG-GC-TT---------CC-GAA-TAGCT-A-AA-TC-C---AC---C--A-TA-AAT----TATG-C---CAAC--TTTAACCT-ATC-G--ACTACCATGT---ATCGC---GAGGGACAAT----A-A---G---GGT--AGAGATTT-TGG-T--TT-GTGA-CA---CCA---T-A-T----C-TATAACC--T-TA-G------CAACATC-A-CCCCAG----CATC-T--TG-TTCCT-GGAGTCCGT--CTC-----GCT-CTGCCA---AACAGTAAGT--C---ATTATC--TT-CTC--cagttctcgggttcctttgggtgattacgccttcttctaactttctaagctgctaccaggcctaccacccaatcgatttcgtcatcttctctagctgtctcggaaaaaggtgggtgccttaaaacgcacatgccttacttctcggcgcggtttccgtg
gi|10 : atatctatac-G--AGCC-ACATAA-C-AGG-TTA-CAGCAAA-TCGACCAA-CAAAATT-------------CACCCCCCG---T-GTCGATGGGAAATAGAGGA--CGCGGCGCAC--ATACCTAAAT---CCCAAAC----TCAGTCTACACAG-TAAAT--G-C-TCCACGTAA-ATATT-C---------TGACACACT--C----CA-A-TAG--TCCA---CCACGGAA---C-TCT-GT-CATGT-A-G---GTTC--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagccacataacaggttacagcaaatcgaccaacaaaattcaccccccgtgtcgatgggaaatagaggacgcggcgcacatacctaaatcccaaactcagtctacacagtaaatgctccacgtaaatattctgacacactccaatagtccaccacggaactctgtcatgtaggttc
gi|11 : atatctatacctgcgttactcaacaatccctagacactcgcaccacattgaccgggcggatactagtatcctcccgggactgtcctcgcctctagagtctaggtttttcaaatccttattaacattctgcgcgtctcaagatccatagggtttcagggttccaaactgttactgaacaactaaacacctctccaaggaaatggccgctccttgaaaggcctcaacattagcaccctttacataatccattctttagaacttcgccgccaacttaatacaagggcatttcgaaaccaggccagaccccggaggaattatccacctagcattggacacatggtggtcgacaatgggtccagccagaatctcagaggcttccgaatagctaaatccaccataaattatgccaactttaacctatcgactaccatgtatcgcgagggacaataagggtagagattttggtttgtgacaccatatctataaccttagcaacatcaccccagcatcttgttcctggagtccgtctcgctctgccaaacagtaagtcattatcttctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--A-TT-AAT----C-TG-C---CA-----T---CCT-A--------------GT---G--GG---AAGGA-CAAT----ATA---G---GTTTTACGGATAT---G-T--GT-A-GA-CA---C-A---T-A-T----C-T-----T--C-GA-GGC----AAACCTC-A-CCCC-G----C--C----CG-T-CCT-GG-G--AGTTCC-C-----GCTTCTGCC----AAAAGT-AGT--A-----TACC--NN-NNN--N---NNNNNNN--NNNNNNNNN--NNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN-NNNNNN--NN-NNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNG--AGCCCACATA--CCAGG-TTC-AGTCTA--T-GT---AACA----TT------------CACCTCC-A-C-TTG--GATGGGGAAT---AGGGAC-C--CGCA---ATT---AA-T---CCA--AC----TCAGTCCCC-----TA--T--G-C-T-------A-AT-TTTC---------TG-----TC-------TA-G-TAATCTCCA---CCACGG-A---C-TTTTGCCC-CGT-A-G---GTCT--CG-A-ACCTG-TAA-T--T--GCCA-C-----------TGT-AT-----A-TCTTCAG-T---GAG-T----TC-TCACCT------GGCCAGT--GG------TG---A--TG--C----ACC--GCA-T-GC-CTTCCCCCCCTG-GAAA-TCT---CTATCT-CTA--GGTCA--TC-------AA-CC---CGAGCC-CACT-CATT-TCGGT
gi|12 : aaattgctcaaggcatccaccaccgagaTGCGGCAAAG--TTAATAATAAA-TCAGATTAA-AAAA---T-------ATTAAAAATCA--ACG--CTTTGACCA---AAA---TTAAT-GAAT--C----T--TTGTAGATGT---ATTACA-T-A-CA-ATTAGGTTTACC---ATTAA-------AAA---TG-CC-CA-AAAT-G---TATATAACA------------------------GG-------------C----A------------------GCCA----------------TCTTGAATA----------------AGCC-GA----T---TTTTT-----ATTT---CTCTTTT-T--TTC-G-GTA-A-CTT-C-A--AAGCGGT----A-ATAtctcgggttcactcttgagtgataagacttaaacgaaacctcctaagctgctaccacctaccacaatccgatcaaatcttctctaacgtctcagaaaaaggtgggtggcttaaaaaacacatgcctgtaccttcctcctcgggcggccctggtttcacccgt
gi|12 : AACTG-T-----T-ACA------CTCCCCCCGTTTTCTCC----G-AAAGG-ACAATG---T-CCATAG-CCTAAA--CT--G--C----T----T-T---------------G-A-GT-GCCA-GTGGC-ATTCCTCCAGA-GCAAAATCAA-GGT-AG--AC-AGGA---CCGA---AGCCC-A--A---CA-A--A---TAAAA-GCAAC-AGG--ACACA-A-G-TGTCTGCC-T---AGAT-AG--G-A-TC-GG-GGCA-G-T-C-TGT-ATCGT-G-TC---CAGAAGAG-GA-A-----GT-----CCC--GG------GCGAAGCGGAAA--------TA-TCCCC-CAT-TCCACCCAAA-CGTA-CGT-----C-CAA-AAGC-A-T-C-----AG---A-GG---AACC-C-T---G-G-T-TGTCTG--GGT------CCTTAA-C-ACCC-CTA-GTC-CAT-TC-CA--CCATATGtcttaatttgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaactgttacactccccccgttttctccgaaaggacaatgtccatagcctaaactgctttgagtgccagtggcattcctccagagcaaaatcaaggtagacaggaccgaagcccaacaaataaaagcaacaggacacaagtgtctgcctagataggatcggggcagtctgtatcgtgtccagaagaggaagtcccgggcgaagcggaaatatcccccattccacccaaacgtacgtccaaaagcatcagaggaaccctggttgtctgggtccttaacacccctagtccattccaccatatg
gi|13 : tgcggcaaagttaataataaatcagattaaaaaatattaaaaatcaacgctttgaccaaaattaatgaatctttgtagatgtattacatacaattaggtttaccattaaaaatgcccaaaatgtatataacaggcagccatcttgaataagccgattttttatttctctttttttcggtaacttcaaagcggtaatatcttaatttgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaGC----AAC-T-CGA-T-C-CA--AGGGA-----TTC----ACC-A-G-G--C-A-G-----ATCCG-GG-AGGAA---T--T---CCCGC-TA----------GCG---T--GAC--AA---GTG--------CGA----G--AT---A-T-C-AG--T-A--GA--A-TC-TCAGAGAGC----------ATTT-GAA-T-GCT-A-GG-TT-CC--AC---A--A-TATAAT----C-TG-C---TAAC--TT---CCT-ATC-G--A-----A-GT---G--GA---GACGG-CA-TTTATA-A---G---GTT--ACAGACAT--GG-T--GT-G-GA-CA---T-A---A-A-T----C-TT----C--T-GA-GAC-----AACATC-G-CCCCAG----C--C-T--CG-T-CCT-GG-G--AGT--C-C-----GCT-CTG-CC---AAAAGT-AGT--CTTATCTA-C--TC-TCC--C---CACCCCC--TGGAGAGAA--TGC-TATGCCCCAGGTCT-AA-TTTTGC--CT-TACAT-TCTCGC--AGGAAGTATG-TACCAAGCAACATGG---AGCCACAAGG-G--AGCC-ACATA--C-AGG-TTC--AGCTA--TTGT---A-CAT---T-------------CA-CCCCCA-CTT-G--GATGGGAAAT---GGG--C-C--CGCA---TTA---AATC---C----AC----TCA-TTTCC-CAG-TA--T--G-C-C-------A-TG-TT-C---------TG-----CC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---C-CCT-G--CACGT-G-G---GTCC--TG-A-CCCCG-TAA-T--T--GC-A-C-----------TGT-AT-----
gi|14 : AGCTAAATTGT---AGCA----TTT-----------CAACATTCA-C-TTG--GATGGGGAAT---TGG--C-C--CGCAC--ATC---AAGG---C----GCGACATTAATTCTC-CAG-TA--G--GGC-T-------T-AT-T--C---------TG-----CC--CACCTCA-A-TA---TACA---CCACGG-G---C-AAT-G-ACACGTTA-GTTTGCCA--TG-A-CCCAG-TAAATAAT--GC-A-T-----------TGT-AA-----A-TC-TCAT-T---GAGGTG---TC-TCACCT------GGCCATT--AAGACGCATG---ACGTG--C----AGC--G-A-TCGC-CCT--CCCCCTT-A-AA-TAT---TCAGAT-TCA-TAGGCAT-CCCTACTCTAT-CC-----AGCC-CACT-C--TCCC
gi|15 : ctacacaagcattt-AT-----A-TC-TCGT-T---CGG-TG---TC-TCACCT------GGCCAGT--GG------TG---A--TG--CAGCGAGC--G-A-TCGCGCTT--CCCCCTG-G-AA-TCT---CTATCT-CTA---GGCAA-TC-------CTACG---CGAA---CACG-CATTCCTGGTtgcttactcgttcactcacttgcggtgtgctttaagcatttatccatcaaaacctctcaagctatgctaccagcccgtaccacaatccgagtaccatatcacgctctcgactgtatccacgcgacaagactgggtgccttaaaacagcacacgcacgaacctctatccaggcgccccttgtttcacg
gi|16 : ttacCT------GGCCAGT--TG------AG---A--TA--C-------------TCA----T--TCCCCTG-G-AA-TTT---CTATCT-CTA-G-----T-TC-------AT-CCTCCCGAGCC-CACT-TATTCCCGGTttctcgtacatccttgggatggttaagctttttagctaaacctcttaggctgctaccactctgagcacaatccgcaccataatcctctctactgtcctatgaaaaggtgggtgtcttaaaaaacggcacacgcctgtaagtttccctcgcgtggtcctggattttcaccagt
gi|17 : cacca-CCTAAA--CC--GGGT----T----T-AA-A-GGG-G------G-G-GT-GCCA-GTGGC-ACTCCTCC-GG-GCAAAAACAA-GGT-AG--GC-AGGA---CCGA---AG-CC-AACC---CA----A---GAAAA-ACAAC-AGT--GCACA-A-G-TACCCGCC-T---AGAT-AG--G-G-T--TG-GGCA-G-T---TAAGATCGT-G-TC---CA-------GA-AGGGACGT-----CTA--GG------GCGAAACGGCAAGATACATGTA-TCCAC-TAT-TCCGCCGCCA-CGTA-CAT-----C-CAA-AGGC-A-C-C-----GA---A-GG---A--A-C-C---GTGAT-TGTGTG--ttgtcgggttctctccttgcatgggtgattaagcttcagctaaatctctaagctgctaccagcctaccacaatccgattcatatcctccctactgtcctaggaaaagtagggtgccttaaaacgcacactcctgtacttcctccggcgtcctggttttcacgtgtc
gi|18 : ACAAACTCAGAAAAA-AAAA-TAT-------ATTAAAA-TCA--ACGACTTTTTACTA---AAAATATCAATTGAAA--C----TACTTGTAGATAT---ATTACATT-ACAA-ATA--G-ATATTTCCATT-GAAC----AAA---TG-TTACA-AAG--G---TATATAACATTGC--------------------GGCCTCTATAGAAATC----G------------------GGCA----------------TCT--G--A----------------AGCC-GATTTTT---TTTTT-----ATTC---ATC-TCT-T--TTC-G-ATC-TCATT-A-AAGAACCGAT----ATgg
gi|19 : actgcgaaatatg------TG---A--TG--C----ACC--G-A-CCAC-TTT--TCTC-TG-G-AA-TCT---CTATGT-CT--GGGGCATCTC-------TT-TT-----ATCC-CATT-TATTCCTGGTt
gi|2 : TGCGACAAA---TTAAGAATAAA-TCAAGAAAA-AAAAAATT-------ATTAAAA-TTA--ACG--CTT-GACTATTAAAA---T--AT-GAAA--C----T--TTGTAGATAT---ATTACA-CCACCA-ATAAGG-TCATT---ATT-A-------AAA---TG-TT-CA-AA---G---TATATAACA------------------------GG-------------C----G------------------GCCA----------------TCT--G--A----------------AGCC-GA----T---TTTTT-----ATTAAAACTC-GCT-T--TTC-GAGTA-ACCGT-A------GCGAT----ATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAACTA-T-----TTACAACCCCCCCCCCTCCATTTTCTTCT---G-AAAGG-ATGG-A---T-C-ATAG-CC-AAA--CT--G--T----C----T-GA-ACGGG-GAAACA-G-A-GT-ACCA-GTGGC-ACTACTCCGGG-GCAAAATCAA-GGT-AG--GC-AGGA---CCGA---AG-CC-A--C---CA-C------GAAAA-GCTAC-AGG--GCACA-ATG-TGACCGCC-T---AGA--AT--G-G-T--GG-CGCACA-TGC-TGAAATCGT-G-AT---CA-------GA-G-----GC-----TCC--AG------GCG-AACGGCAA--------TC-TCCAC-CAT-TCCGCCGCCA-CGTA-CCT-----T-CAA-AAGG-A-A-T-----AG---A-GG---A--T-C-T---G-GTT-TATCTG--CGTCATACACTCAAA-C-AT-C-TTA-GAC-CAC-TC-CACCCCATATGACT---------------------CA--------------G-TATTCCT--C--GGGCTGCTTCCT-C-------AGCCTACCAGAGT--TCTGGA-TT-TTCCC-----A-AGTC-------AAC--GTTCCTGCC--G-GTC--TT--AAG---ACCC-ATC-GGGA---T---CTTTCTGGGTTCC-AC-CTGTTA-GG---GA-AC-AACA-A-TTCC-C---TCTT---CATGGAC-A-AT-TGG-C---GCT--C-----AA--G--CTCAAC------GGCTAGCACCC---CTATTAC--AA--------T-CT-TTCT---T--GCAACT-T-CGC----AAC-TCCGCAT-C-CT--AGGGACCCACTTC----ACCCA-GCG--C-A-GC----ATCGG-GC-AGGAA---T--T---TC-AC-TA----------GCA---T--GAC--A----GTG--------CGA----G--GG---A-----AG--C-A--GA--A-TC-TCAAGAAGC-TTA-----AATCT-GGA-T-GCT---GG-TT-C---AT---C--A-TA-AAT----C-TG-C---CAAC--TT---CCT--------------A-GT---G--GG---GGGGG-CA-T----A-A---G---GCT--ACGGACAT-TGG-T--GT-G-GA-CA---C-A---T-A-T----C-T-----C--T-GA-GGC----CAACCTCCACCCCCAG----C--C-TCACG-T-CCT-GGAG--AGT--C-C-----GCT-CTATCCACAAAAAGT-AGT--T---CCTATC--CC-NNN--N---NNNNNNN--NNNNNNNNN--NNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN-NNNNNN--NN-NNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNN-N--AGCC-ACATA--C-AGGTTTC-AAGCTAC-CTGT---A-CA----T-------------CATTCCCCA-C-T-G--GATGGGAAATG--GGG--C-C--CGCA---ATA---AAAT---C----AC----CCAGTCCCC-CAA-TA--T--T-C-T-------A-AT-TT-C---------TG-----TC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---CGTTT-GCACACG--A-G---GTCC--TG-A-ACCTG-TAA-T--T--GC-A-C-----------TGT-AT-----A-TA-TCAT-T---GAG-TG---TCGTCACCT------GGCCAGT--GG------TG---A--TG--C----AGC--G-A-TCGC-TTT--CTTCCTG-G-AA-TCT---CTATCT-CTAGGGGGCAT-TC-------AT-CC---CGAGCC-CACTACATTCCCGGTtcctcggtccactcctctgattacctgtgcgattaaactccaacccaacctccgggttgctaccacgaaccatatcctccctactgtccttggaaacggagggcgctctggtttcatgtaggaatgtctattattcctnnnnnnn
gi|20 : ACAAAA--TTAAAACTAAAATCG---------AAATTTTTTTTTTATTAAAAATCA--AC---CTTTAGCTA---AAAC--TTGAT-GAAAACT----T--TTGTAGACAT---ATTACA-T-AC-A-ATAAGG-TTTCC---ATT-G-------AAA--------------G--G---TATATAACA------------------------TG-------------C----G------------------GCCA----------------TCTTGA--ATGGCGAACATCTTGGTAGCC-GA----T---TTTTTTTTTAATTT---TTC-TCA-T--TTT-G-ATA---CTTAA-A--AAGCGAT----c
gi|21 : atgaTGCGACAAAA--TTAAGAATAAA-TCAGAAAAA-AAAA---T-------ATTAAAAATTA--ACG--CTTTGACT----AAA---TTGAT-GAAA--CTTTGT--TTGTAGATA----ATTACA-T-ACC--ATAAGGTTTATT---ATTAA-------AAA---TG-TT-CATAAA--G---TATATAA-A------------------------GG-------------C----G------------------GCCA----------------ACTTGG--A----------------AGCT-GA----T---TTTTT-----ATT-----TC-TCT-T--TTT-G-GT--ACCTT-A-A--AAGCGAT----A
gi|23 : aa-AAA--G---TAAATAACA------------------------GG-------------A----G------------------GCCA----------------TCTTGG--A----------------AGTC-AA----TTTCTTTTT-----A-TT---CAC-CCTAT--TTC-T-GT--ATCTT-A-A--TAGCGAT----Aa
gi|24 : CTCAATTA-TATAAAT-ACAGCTCCCCCC-----GTTTTCTC-T---G-AAAGG-ATGGG----T-TCATTA-ACTATA--CT--G--T----
gi|25 : CCA-A-G--C-A-G-----ATCCG-GG-AGGAT---T--T---TC-AC-TA----------GCA---T--GACA-A----GTG--------CGA----G--G
gi|26 : ccaCCT-CAG-CA--T--G-T-T-------A-TT-TT-C---------TG-----CC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---C-TTT-Gta
gi|27 : tC-T-CGA-T-C-CA--AGGGA-----CTC----ACC-A-G-G--C-A-G-----ATCC
gi|3 : TGGGACAAAA--TTAAGAATAAT-TCAGA----------TTTTTGTAC-ATTAAAAATCA--ACG--TTTTGACTA---AAA---TTGAT-GACA--C----T--TTGTAGATAT---ATTACA-T-A-CG-ATAAGGTTTACC---ATTGA-------AAA---TA-TT-CA-AAAG-G---TATATAACA------------------------TG-------------C----G------------------GTCATCTTGAATGGAGGCCATCTTGG--A----------------AGCC-GA----T---TTTTT-----ATTT---CTC-TCT-T--TTC-G-GT--ACCTT-G-G--AAGCAAT----A
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Reference ( family-1227 ) : TGCGACAAAA--TTAAGAATAAA-TCA-GAAAAA-AAAAATTTT--T-----ATTAAAAATCA--ACG--CTTTGACTA---AAA---TTGAT-GAAA--C----T--TTGTAGATAT---ATTACA-T-ACCA-ATAAGG-TTATT---ATT-A-------AAA---TG-TT-CA-AAA--G---TATATAACA------------------------GG-------------C----G------------------GCCA----------------TCTTGG--A----------------AGCC-GA----T---TTTTT-----ATTT---CTC-TCT-T--TTC-G-GTA-ACCTT-A-A--AAGCGAT----ATATAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCCCCAACTA-T-----T-ACANCTCCCCCCCCCCCGTTTTCTCCT---G-AAAGG-ATGGGA---T-CCATAG-CCTAAA--CT--G--T----C----T-GA-ACGGG-GAAACAAG-A-GT-ACCA-GTGGC-ACTACTCCGGG-GCAAAACCAA-GGT-AG--GC-AGGA---CCGA---AG-CC-A--C---CA-C--A---GAAAA-GCAAC-AGG--GCACA-A-G-TGACCGCC-T---AGAT-AG--G-G-T--GG-GGCA-G-T-C-TGGAATCGT-G-TC---CA-------GA-G-----GT-----CCC--GG------GCGAAACGGCAA--------TC-TCCAC-CAT-TCCGCCGCCA-CGTA-CGT-----T-CAA-AAGG-A-N-T-----AG---A-GG---A--T-C-T---G-GTT-TGTCTG--CGT-A---ACTCAAA-C-ATCC-CTA-GAC-CAC-TC-CACCCCATATGACC-----G---GG----------TA--------------G-TATCCTT--C--GGGCTG-TTCCTC-------AGCCT-CCAGAGT--TCTGGA-TT-TTCCC-----A-AATC-------AAC--GTTCCTG-C--G-GTC--TC--AAG---ACCC-ATA-GGGN---T---TCTCCTGGGTCCC-AC-CTGTTA-GG---GA-AC-AAC--A-TTCC-C---TCTT---CATGGAC-A-AT-TGG-C---GCT--C-----AA--G--CTCAAC------AGCTAGCACCC---CT-TTACA-AA--------T-CC-TTCT---T--GCAACT-T-CGC----AAC-T-CGAAT-C-CA--AGGGA---A-TTC----ACCCA-G-G--C-A-G-----ATCCG-GG-AGGAA---T--T---CC-AC-TA----------GCG---T--GAC--A----GTG--------CGA----G--GG---A-T-C-AG--C-A--GA--A-TC-TCAGAGAGC-TT------AATCT-GAA-T-GCT-A-GG-TT-C---AC---C--A-TA-AAT----C-TG-C---CAAC--TT---CCT-ATC-G--A-----A-GT---G--GG---GAGGG-CA-T----A-A---G---GCT--ACGGATAT-TGG-T--GT-G-GA-CA---C-A---T-A-T----C-T-----C--T-GA-GGC----CAACATCCA-CCCCAG----C--C-T--CG-T-CCT-GGAG--AGT--C-C-----GCT-CTGCCC---AAAAGT-AGT--C---CCTATC--CC-CCC--C---CNCCCCC--TGGAGAGAA--CGC-TATGCCCCAGGTCT-AA-TTTTGC--CT-TACAT-TCTCGC--AGGAAGTGTG-TACCAAGCAACATGG---AGCCNCAAGG-G--AGCC-ACATA--C-AGG-TTC-AAGCTA--TTGT---A-CA----T-------------CACCCCCCA-C-T-G--GATGGGGAAT---GGG--C-C--CGCA---ATA---AAAT---C----AC----TCAGTCCCC-CAG-TA--T--G-C-T-------A-AT-TT-C---------TG-----CC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---C-TCT-GCACACGT-A-G---GTCC--CG-A-NCCCG-TAA-T--T--GC-A-C-----------TGT-AT-----A-TC-TCGT-T---GAG-TG---TC-TCACCT------GGCCAGT--GG------TG---A--TG--C----AGC--G-A-TCGC-CTT--CCCCCTG-G-AA-TCT---CTATCT-CTA-GGGGCAT-TC-------AT-CC---CGAGCC-CACT-CATTCCCGGT
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gi|10 : cCTG--CGT-T---ACTCAAC-A-ATCC-CTA-GAC--AC-TCGCACCACAT-TGACC-----G---GGCGGATAC---TA--------------G-TATCCTC--CCGGGACTG-T-CCTC--------GCCT-CTAGAGT---CTAGG-TT-TTTC------A-AATCCTTATT-AAC--ATTC-TG-C--GCGTC--TC--AAG---ATCC-ATA-GGGT---T---TCA---GGGTTCC-AAACTGTTA-CT---GA-AC-AACTAA-ACAC-C---TCTC---CAAGGA--A-AT-GGC-C---GCT--CCTTGAAA--GGCCTCAAC------A-TTAGCACCC----T-TTACATAA--------T-CCATTCT---TTAG-AACT-T-CGCCGCCAAC-T-T-AAT-A-CA--AGGGC---A-TTTCGA-AACCA-G-G--CCA-G-----ACCCC-GG-AGGAA---T--TAT-CC-ACCTA----------GCA---TTGGAC--ACATGGTGGT------CGACAATG--GG---T-C-C-AG--CCA--GA--A-TC-TCAGAG-GC-TT---------CC-GAA-TAGCT-A-AA-TC-C---AC---C--A-TA-AAT----TATG-C---CAAC--TTTAACCT-ATC-G--ACTACCATGT---ATCGC---GAGGGACAAT----A-A---G---GGT--AGAGATTT-TGG-T--TT-GTGA-CA---CCA---T-A-T----C-TATAACC--T-TA-G------CAACATC-A-CCCCAG----CATC-T--TG-TTCCT-GGAGTCCGT--CTC-----GCT-CTGCCA---AACAGTAAGT--C---ATTATC--TT-CTC--cagttctcgggttcctttgggtgattacgccttcttctaactttctaagctgctaccaggcctaccacccaatcgatttcgtcatcttctctagctgtctcggaaaaaggtgggtgccttaaaacgcacatgccttacttctcggcgcggtttccgtg
gi|10 : atatctatac-G--AGCC-ACATAA-C-AGG-TTA-CAGCAAA-TCGACCAA-CAAAATT-------------CACCCCCCG---T-GTCGATGGGAAATAGAGGA--CGCGGCGCAC--ATACCTAAAT---CCCAAAC----TCAGTCTACACAG-TAAAT--G-C-TCCACGTAA-ATATT-C---------TGACACACT--C----CA-A-TAG--TCCA---CCACGGAA---C-TCT-GT-CATGT-A-G---GTTC--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagccacataacaggttacagcaaatcgaccaacaaaattcaccccccgtgtcgatgggaaatagaggacgcggcgcacatacctaaatcccaaactcagtctacacagtaaatgctccacgtaaatattctgacacactccaatagtccaccacggaactctgtcatgtaggttc
gi|11 : atatctatacctgcgttactcaacaatccctagacactcgcaccacattgaccgggcggatactagtatcctcccgggactgtcctcgcctctagagtctaggtttttcaaatccttattaacattctgcgcgtctcaagatccatagggtttcagggttccaaactgttactgaacaactaaacacctctccaaggaaatggccgctccttgaaaggcctcaacattagcaccctttacataatccattctttagaacttcgccgccaacttaatacaagggcatttcgaaaccaggccagaccccggaggaattatccacctagcattggacacatggtggtcgacaatgggtccagccagaatctcagaggcttccgaatagctaaatccaccataaattatgccaactttaacctatcgactaccatgtatcgcgagggacaataagggtagagattttggtttgtgacaccatatctataaccttagcaacatcaccccagcatcttgttcctggagtccgtctcgctctgccaaacagtaagtcattatcttctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--A-TT-AAT----C-TG-C---CA-----T---CCT-A--------------GT---G--GG---AAGGA-CAAT----ATA---G---GTTTTACGGATAT---G-T--GT-A-GA-CA---C-A---T-A-T----C-T-----T--C-GA-GGC----AAACCTC-A-CCCC-G----C--C----CG-T-CCT-GG-G--AGTTCC-C-----GCTTCTGCC----AAAAGT-AGT--A-----TACC--NN-NNN--N---NNNNNNN--NNNNNNNNN--NNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN-NNNNNN--NN-NNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNG--AGCCCACATA--CCAGG-TTC-AGTCTA--T-GT---AACA----TT------------CACCTCC-A-C-TTG--GATGGGGAAT---AGGGAC-C--CGCA---ATT---AA-T---CCA--AC----TCAGTCCCC-----TA--T--G-C-T-------A-AT-TTTC---------TG-----TC-------TA-G-TAATCTCCA---CCACGG-A---C-TTTTGCCC-CGT-A-G---GTCT--CG-A-ACCTG-TAA-T--T--GCCA-C-----------TGT-AT-----A-TCTTCAG-T---GAG-T----TC-TCACCT------GGCCAGT--GG------TG---A--TG--C----ACC--GCA-T-GC-CTTCCCCCCCTG-GAAA-TCT---CTATCT-CTA--GGTCA--TC-------AA-CC---CGAGCC-CACT-CATT-TCGGT
gi|12 : aaattgctcaaggcatccaccaccgagaTGCGGCAAAG--TTAATAATAAA-TCA-GATTAA-AAAA-------T-----ATTAAAAATCA--ACG--CTTTGACCA---AAA---TTAAT-GAAT--C----T--TTGTAGATGT---ATTACA-T-A-CA-ATTAGGTTTACC---ATTAA-------AAA---TG-CC-CA-AAAT-G---TATATAACA------------------------GG-------------C----A------------------GCCA----------------TCTTGAATA----------------AGCC-GA----T---TTTTT-----ATTT---CTCTTTT-T--TTC-G-GTA-A-CTT-C-A--AAGCGGT----A-ATAtctcgggttcactcttgagtgataagacttaaacgaaacctcctaagctgctaccacctaccacaatccgatcaaatcttctctaacgtctcagaaaaaggtgggtggcttaaaaaacacatgcctgtaccttcctcctcgggcggccctggtttcacccgt
gi|12 : AACTG-T-----T-ACA------CTCCCCCCGTTTTCTCC----G-AAAGG-ACAATG---T-CCATAG-CCTAAA--CT--G--C----T----T-T---------------G-A-GT-GCCA-GTGGC-ATTCCTCCAGA-GCAAAATCAA-GGT-AG--AC-AGGA---CCGA---AGCCC-A--A---CA-A--A---TAAAA-GCAAC-AGG--ACACA-A-G-TGTCTGCC-T---AGAT-AG--G-A-TC-GG-GGCA-G-T-C-TGT-ATCGT-G-TC---CAGAAGAG-GA-A-----GT-----CCC--GG------GCGAAGCGGAAA--------TA-TCCCC-CAT-TCCACCCAAA-CGTA-CGT-----C-CAA-AAGC-A-T-C-----AG---A-GG---AACC-C-T---G-G-T-TGTCTG--GGT------CCTTAA-C-ACCC-CTA-GTC-CAT-TC-CA--CCATATGtcttaatttgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaactgttacactccccccgttttctccgaaaggacaatgtccatagcctaaactgctttgagtgccagtggcattcctccagagcaaaatcaaggtagacaggaccgaagcccaacaaataaaagcaacaggacacaagtgtctgcctagataggatcggggcagtctgtatcgtgtccagaagaggaagtcccgggcgaagcggaaatatcccccattccacccaaacgtacgtccaaaagcatcagaggaaccctggttgtctgggtccttaacacccctagtccattccaccatatg
gi|13 : tgcggcaaagttaataataaatcagattaaaaaatattaaaaatcaacgctttgaccaaaattaatgaatctttgtagatgtattacatacaattaggtttaccattaaaaatgcccaaaatgtatataacaggcagccatcttgaataagccgattttttatttctctttttttcggtaacttcaaagcggtaatatcttaatttgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaGC----AAC-T-CGA-T-C-CA--AGGGA-----TTC----ACC-A-G-G--C-A-G-----ATCCG-GG-AGGAA---T--T---CCCGC-TA----------GCG---T--GAC--AA---GTG--------CGA----G--AT---A-T-C-AG--T-A--GA--A-TC-TCAGAGAGC----------ATTT-GAA-T-GCT-A-GG-TT-CC--AC---A--A-TATAAT----C-TG-C---TAAC--TT---CCT-ATC-G--A-----A-GT---G--GA---GACGG-CA-TTTATA-A---G---GTT--ACAGACAT--GG-T--GT-G-GA-CA---T-A---A-A-T----C-TT----C--T-GA-GAC-----AACATC-G-CCCCAG----C--C-T--CG-T-CCT-GG-G--AGT--C-C-----GCT-CTG-CC---AAAAGT-AGT--CTTATCTA-C--TC-TCC--C---CACCCCC--TGGAGAGAA--TGC-TATGCCCCAGGTCT-AA-TTTTGC--CT-TACAT-TCTCGC--AGGAAGTATG-TACCAAGCAACATGG---AGCCACAAGG-G--AGCC-ACATA--C-AGG-TTC--AGCTA--TTGT---A-CAT---T-------------CA-CCCCCA-CTT-G--GATGGGAAAT---GGG--C-C--CGCA---TTA---AATC---C----AC----TCA-TTTCC-CAG-TA--T--G-C-C-------A-TG-TT-C---------TG-----CC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---C-CCT-G--CACGT-G-G---GTCC--TG-A-CCCCG-TAA-T--T--GC-A-C-----------TGT-AT-----
gi|14 : AGCTAAATTGT---AGCA----TTT-----------CAACATTCA-C-TTG--GATGGGGAAT---TGG--C-C--CGCAC--ATC---AAGG---C----GCGACATTAATTCTC-CAG-TA--G--GGC-T-------T-AT-T--C---------TG-----CC--CACCTCA-A-TA---TACA---CCACGG-G---C-AAT-G-ACACGTTA-GTTTGCCA--TG-A-CCCAG-TAAATAAT--GC-A-T-----------TGT-AA-----A-TC-TCAT-T---GAGGTG---TC-TCACCT------GGCCATT--AAGACGCATG---ACGTG--C----AGC--G-A-TCGC-CCT--CCCCCTT-A-AA-TAT---TCAGAT-TCA-TAGGCAT-CCCTACTCTAT-CC-----AGCC-CACT-C--TCCC
gi|15 : ctacacaagcattt-AT-----A-TC-TCGT-T---CGG-TG---TC-TCACCT------GGCCAGT--GG------TG---A--TG--CAGCGAGC--G-A-TCGCGCTT--CCCCCTG-G-AA-TCT---CTATCT-CTA---GGCAA-TC-------CTACG---CGAA---CACG-CATTCCTGGTtgcttactcgttcactcacttgcggtgtgctttaagcatttatccatcaaaacctctcaagctatgctaccagcccgtaccacaatccgagtaccatatcacgctctcgactgtatccacgcgacaagactgggtgccttaaaacagcacacgcacgaacctctatccaggcgccccttgtttcacg
gi|16 : ttacCT------GGCCAGT--TG------AG---A--TA--C-------------TCA----T--TCCCCTG-G-AA-TTT---CTATCT-CTA-G-----T-TC-------AT-CCTCCCGAGCC-CACT-TATTCCCGGTttctcgtacatccttgggatggttaagctttttagctaaacctcttaggctgctaccactctgagcacaatccgcaccataatcctctctactgtcctatgaaaaggtgggtgtcttaaaaaacggcacacgcctgtaagtttccctcgcgtggtcctggattttcaccagt
gi|17 : cacca-CCTAAA--CC--GGGT----T----T-AA-A-GGG-G------G-G-GT-GCCA-GTGGC-ACTCCTCC-GG-GCAAAAACAA-GGT-AG--GC-AGGA---CCGA---AG-CC-AACC---CA----A---GAAAA-ACAAC-AGT--GCACA-A-G-TACCCGCC-T---AGAT-AG--G-G-T--TG-GGCA-G-T---TAAGATCGT-G-TC---CA-------GA-AGGGACGT-----CTA--GG------GCGAAACGGCAAGATACATGTA-TCCAC-TAT-TCCGCCGCCA-CGTA-CAT-----C-CAA-AGGC-A-C-C-----GA---A-GG---A--A-C-C---GTGAT-TGTGTG--ttgtcgggttctctccttgcatgggtgattaagcttcagctaaatctctaagctgctaccagcctaccacaatccgattcatatcctccctactgtcctaggaaaagtagggtgccttaaaacgcacactcctgtacttcctccggcgtcctggttttcacgtgtc
gi|18 : ACAAACTCA-GAAAAA-AAAA---TA--T-----ATTAAAA-TCA--ACGACTTTTTACTA---AAAATATCAATTGAAA--C----TACTTGTAGATAT---ATTACATT-ACAA-ATA--G-ATATTTCCATT-GAAC----AAA---TG-TTACA-AAG--G---TATATAACATTGC--------------------GGCCTCTATAGAAATC----G------------------GGCA----------------TCT--G--A----------------AGCC-GATTTTT---TTTTT-----ATTC---ATC-TCT-T--TTC-G-ATC-TCATT-A-AAGAACCGAT----ATgg
gi|19 : actgcgaaatatg------TG---A--TG--C----ACC--G-A-CCAC-TTT--TCTC-TG-G-AA-TCT---CTATGT-CT--GGGGCATCTC-------TT-TT-----ATCC-CATT-TATTCCTGGTt
gi|2 : TGCGACAAA---TTAAGAATAAA-TCAAGAAAAA-AAAAATT----------ATTAAAA-TTA--ACG--CTT-GACTATTAAAA---T--AT-GAAA--C----T--TTGTAGATAT---ATTACA-CCACCA-ATAAGG-TCATT---ATT-A-------AAA---TG-TT-CA-AA---G---TATATAACA------------------------GG-------------C----G------------------GCCA----------------TCT--G--A----------------AGCC-GA----T---TTTTT-----ATTAAAACTC-GCT-T--TTC-GAGTA-ACCGT-A------GCGAT----ATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAACTA-T-----TTACAACCCCCCCCCCTCCATTTTCTTCT---G-AAAGG-ATGG-A---T-C-ATAG-CC-AAA--CT--G--T----C----T-GA-ACGGG-GAAACA-G-A-GT-ACCA-GTGGC-ACTACTCCGGG-GCAAAATCAA-GGT-AG--GC-AGGA---CCGA---AG-CC-A--C---CA-C------GAAAA-GCTAC-AGG--GCACA-ATG-TGACCGCC-T---AGA--AT--G-G-T--GG-CGCACA-TGC-TGAAATCGT-G-AT---CA-------GA-G-----GC-----TCC--AG------GCG-AACGGCAA--------TC-TCCAC-CAT-TCCGCCGCCA-CGTA-CCT-----T-CAA-AAGG-A-A-T-----AG---A-GG---A--T-C-T---G-GTT-TATCTG--CGTCATACACTCAAA-C-AT-C-TTA-GAC-CAC-TC-CACCCCATATGACT---------------------CA--------------G-TATTCCT--C--GGGCTGCTTCCTC-------AGCCTACCAGAGT--TCTGGA-TT-TTCCC-----A-AGTC-------AAC--GTTCCTGCC--G-GTC--TT--AAG---ACCC-ATC-GGGA---T---CTTTCTGGGTTCC-AC-CTGTTA-GG---GA-AC-AACA-A-TTCC-C---TCTT---CATGGAC-A-AT-TGG-C---GCT--C-----AA--G--CTCAAC------GGCTAGCACCC---CTATTAC--AA--------T-CT-TTCT---T--GCAACT-T-CGC----AAC-TCCGCAT-C-CT--AGGGACCCACTTC----ACCCA-GCG--C-A-GC----ATCGG-GC-AGGAA---T--T---TC-AC-TA----------GCA---T--GAC--A----GTG--------CGA----G--GG---A-----AG--C-A--GA--A-TC-TCAAGAAGC-TTA-----AATCT-GGA-T-GCT---GG-TT-C---AT---C--A-TA-AAT----C-TG-C---CAAC--TT---CCT--------------A-GT---G--GG---GGGGG-CA-T----A-A---G---GCT--ACGGACAT-TGG-T--GT-G-GA-CA---C-A---T-A-T----C-T-----C--T-GA-GGC----CAACCTCCACCCCCAG----C--C-TCACG-T-CCT-GGAG--AGT--C-C-----GCT-CTATCCACAAAAAGT-AGT--T---CCTATC--CC-NNN--N---NNNNNNN--NNNNNNNNN--NNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN-NNNNNN--NN-NNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNN-N--AGCC-ACATA--C-AGGTTTC-AAGCTAC-CTGT---A-CA----T-------------CATTCCCCA-C-T-G--GATGGGAAATG--GGG--C-C--CGCA---ATA---AAAT---C----AC----CCAGTCCCC-CAA-TA--T--T-C-T-------A-AT-TT-C---------TG-----TC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---CGTTT-GCACACG--A-G---GTCC--TG-A-ACCTG-TAA-T--T--GC-A-C-----------TGT-AT-----A-TA-TCAT-T---GAG-TG---TCGTCACCT------GGCCAGT--GG------TG---A--TG--C----AGC--G-A-TCGC-TTT--CTTCCTG-G-AA-TCT---CTATCT-CTAGGGGGCAT-TC-------AT-CC---CGAGCC-CACTACATTCCCGGTtcctcggtccactcctctgattacctgtgcgattaaactccaacccaacctccgggttgctaccacgaaccatatcctccctactgtccttggaaacggagggcgctctggtttcatgtaggaatgtctattattcctnnnnnnn
gi|20 : ACAAAA--TTAAAACTAAAATCG----------AAATTTT--TTTTTTATTAAAAATCA--AC---CTTTAGCTA---AAAC--TTGAT-GAAAACT----T--TTGTAGACAT---ATTACA-T-A-CA-ATAAGG-TTTCC---ATT-G--------------------A-AAG--G---TATATAACA------------------------TG-------------C----G------------------GCCA----------------TCTTGA--ATGGCGAACATCTTGGTAGCC-GA----T---TTTTTTTTTAATTT---TTC-TCA-T--TTT-G-ATA---CTTAA-A--AAGCGAT----c
gi|21 : atgaTGCGACAAAA--TTAAGAATAAA-TCA-GAAAAA-AAAA-------T-----ATTAAAAATTA--ACG--CTTTGACT----AAA---TTGAT-GAAA--CTTTGT--TTGTAGATA----ATTACA-T-ACC--ATAAGGTTTATT---ATTAA-------AAA---TG-TT-CATAAA--G---TATATAA-A------------------------GG-------------C----G------------------GCCA----------------ACTTGG--A----------------AGCT-GA----T---TTTTT-----ATT-----TC-TCT-T--TTT-G-GT--ACCTT-A-A--AAGCGAT----A
gi|23 : aa-AAA--G---TAAATAACA------------------------GG-------------A----G------------------GCCA----------------TCTTGG--A----------------AGTC-AA----TTTCTTTTT-----A-TT---CAC-CCTAT--TTC-T-GT--ATCTT-A-A--TAGCGAT----Aa
gi|24 : CTCAATTA-TATAAAT-ACAGCTCCCCCC-----GTTTTCTC-T---G-AAAGG-ATGGG----T-TCATTA-ACTATA--CT--G--T----
gi|25 : CCA-A-G--C-A-G-----ATCCG-GG-AGGAT---T--T---TC-AC-TA----------GCA---T--GACA-A----GTG--------CGA----G--G
gi|26 : ccaCCT-CAG-CA--T--G-T-T-------A-TT-TT-C---------TG-----CC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---C-TTT-Gta
gi|27 : tC-T-CGA-T-C-CA--AGGGA-----CTC----ACC-A-G-G--C-A-G-----ATCC
gi|3 : TGGGACAAAA--TTAAGAATAAT-TCA-GA----------TTTT--TGTAC-ATTAAAAATCA--ACG--TTTTGACTA---AAA---TTGAT-GACA--C----T--TTGTAGATAT---ATTACA-T-A-CG-ATAAGGTTTACC---ATTGA-------AAA---TA-TT-CA-AAAG-G---TATATAACA------------------------TG-------------C----G------------------GTCATCTTGAATGGAGGCCATCTTGG--A----------------AGCC-GA----T---TTTTT-----ATTT---CTC-TCT-T--TTC-G-GT--ACCTT-G-G--AAGCAAT----A
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Reference ( family-1227 ) : TGCGACAAAA--TTAAGAAT-AAA-TCA-GAAAAA-AAAAA------TTTT-----ATT---AAAAATCA--ACG--CTTTGACTA---AAA---TTGAT-GAAA--C----T--TTGTAGATAT---ATTACA-T-ACCA-ATAAGG-TTATT---ATT-A-------AAA---TG-TT-CA-AAA--G---TATATAACA------------------------GG-------------C----G------------------GCCA----------------TCTTGG--A----------------AGCC-GA----T---TTTTT-----ATTT---CTC-TCT-T--TTC-G-GTA-ACCTT-A-A--AAGCGAT----ATATAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCCCCAACTA-T-----T-ACANCTCCCCCCCCCCCGTTTTCTCCT---G-AAAGG-ATGGGA---T-CCATAG-CCTAAA--CT--G--T----C----T-GA-ACGGG-GAAACAAG-A-GT-ACCA-GTGGC-ACTACTCCGGG-GCAAAACCAA-GGT-AG--GC-AGGA---CCGA---AG-CC-A--C---CA-C--A---GAAAA-GCAAC-AGG--GCACA-A-G-TGACCGCC-T---AGAT-AG--G-G-T--GG-GGCA-G-T-C-TGGAATCGT-G-TC---CA-------GA-G-----GT-----CCC--GG------GCGAAACGGCAA--------TC-TCCAC-CAT-TCCGCCGCCA-CGTA-CGT-----T-CAA-AAGG-A-N-T-----AG---A-GG---A--T-C-T---G-GTT-TGTCTG--CGT-A---ACTCAAA-C-ATCC-CTA-GAC-CAC-TC-CACCCCATATGACC-----G---GG----------TA--------------G-TATCCTT--C--GGGCTG-TTCCT-C-------AGCCT-CCAGAGT--TCTGGA-TT-TTCCC-----A-AATC-------AAC--GTTCCTG-C--G-GTC--TC--AAG---ACCC-ATA-GGGN---T---TCTCCTGGGTCCC-AC-CTGTTA-GG---GA-AC-AAC--A-TTCC-C---TCTT---CATGGAC-A-AT-TGG-C---GCT--C-----AA--G--CTCAAC------AGCTAGCACCC---CT-TTACA-AA--------T-CC-TTCT---T--GCAACT-T-CGC----AAC-T-CGAAT-C-CA--AGGGA---A-TTC----ACCCA-G-G--C-A-G-----ATCCG-GG-AGGAA---T--T---CC-AC-TA----------GCG---T--GAC--A----GTG--------CGA----G--GG---A-T-C-AG--C-A--GA--A-TC-TCAGAGAGC-TT------AATCT-GAA-T-GCT-A-GG-TT-C---AC---C--A-TA-AAT----C-TG-C---CAAC--TT---CCT-ATC-G--A-----A-GT---G--GG---GAGGG-CA-T----A-A---G---GCT--ACGGATAT-TGG-T--GT-G-GA-CA---C-A---T-A-T----C-T-----C--T-GA-GGC----CAACATCCA-CCCCAG----C--C-T--CG-T-CCT-GGAG--AGT--C-C-----GCT-CTGCCC---AAAAGT-AGT--C---CCTATC--CC-CCC--C---CNCCCCC--TGGAGAGAA--CGC-TATGCCCCAGGTCT-AA-TTTTGC--CT-TACAT-TCTCGC--AGGAAGTGTG-TACCAAGCAACATGG---AGCCNCAAGG-G--AGCC-ACATA--C-AGG-TTC-AAGCTA--TTGT---A-CA----T-------------CACCCCCCA-C-T-G--GATGGGGAAT---GGG--C-C--CGCA---ATA---AAAT---C----AC----TCAGTCCCC-CAG-TA--T--G-C-T-------A-AT-TT-C---------TG-----CC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---C-TCT-GCACACGT-A-G---GTCC--CG-A-NCCCG-TAA-T--T--GC-A-C-----------TGT-AT-----A-TC-TCGT-T---GAG-TG---TC-TCACCT------GGCCAGT--GG------TG---A--TG--C----AGC--G-A-TCGC-CTT--CCCCCTG-G-AA-TCT---CTATCT-CTA-GGGGCAT-TC-------AT-CC---CGAGCC-CACT-CATTCCCGGT
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gi|10 : cCTG--CGT-T---ACTCAAC-A-ATCC-CTA-GAC--AC-TCGCACCACAT-TGACC-----G---GGCGGATAC---TA--------------G-TATCCTC--CCGGGACTG-T-CCT-C--------GCCT-CTAGAGT---CTAGG-TT-TTTC------A-AATCCTTATT-AAC--ATTC-TG-C--GCGTC--TC--AAG---ATCC-ATA-GGGT---T---TCA---GGGTTCC-AAACTGTTA-CT---GA-AC-AACTAA-ACAC-C---TCTC---CAAGGA--A-AT-GGC-C---GCT--CCTTGAAA--GGCCTCAAC------A-TTAGCACCC----T-TTACATAA--------T-CCATTCT---TTAG-AACT-T-CGCCGCCAAC-T-T-AAT-A-CA--AGGGC---A-TTTCGA-AACCA-G-G--CCA-G-----ACCCC-GG-AGGAA---T--TAT-CC-ACCTA----------GCA---TTGGAC--ACATGGTGGT------CGACAATG--GG---T-C-C-AG--CCA--GA--A-TC-TCAGAG-GC-TT---------CC-GAA-TAGCT-A-AA-TC-C---AC---C--A-TA-AAT----TATG-C---CAAC--TTTAACCT-ATC-G--ACTACCATGT---ATCGC---GAGGGACAAT----A-A---G---GGT--AGAGATTT-TGG-T--TT-GTGA-CA---CCA---T-A-T----C-TATAACC--T-TA-G------CAACATC-A-CCCCAG----CATC-T--TG-TTCCT-GGAGTCCGT--CTC-----GCT-CTGCCA---AACAGTAAGT--C---ATTATC--TT-CTC--cagttctcgggttcctttgggtgattacgccttcttctaactttctaagctgctaccaggcctaccacccaatcgatttcgtcatcttctctagctgtctcggaaaaaggtgggtgccttaaaacgcacatgccttacttctcggcgcggtttccgtg
gi|10 : atatctatac-G--AGCC-ACATAA-C-AGG-TTA-CAGCAAA-TCGACCAA-CAAAATT-------------CACCCCCCG---T-GTCGATGGGAAATAGAGGA--CGCGGCGCAC--ATACCTAAAT---CCCAAAC----TCAGTCTACACAG-TAAAT--G-C-TCCACGTAA-ATATT-C---------TGACACACT--C----CA-A-TAG--TCCA---CCACGGAA---C-TCT-GT-CATGT-A-G---GTTC--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagccacataacaggttacagcaaatcgaccaacaaaattcaccccccgtgtcgatgggaaatagaggacgcggcgcacatacctaaatcccaaactcagtctacacagtaaatgctccacgtaaatattctgacacactccaatagtccaccacggaactctgtcatgtaggttc
gi|11 : atatctatacctgcgttactcaacaatccctagacactcgcaccacattgaccgggcggatactagtatcctcccgggactgtcctcgcctctagagtctaggtttttcaaatccttattaacattctgcgcgtctcaagatccatagggtttcagggttccaaactgttactgaacaactaaacacctctccaaggaaatggccgctccttgaaaggcctcaacattagcaccctttacataatccattctttagaacttcgccgccaacttaatacaagggcatttcgaaaccaggccagaccccggaggaattatccacctagcattggacacatggtggtcgacaatgggtccagccagaatctcagaggcttccgaatagctaaatccaccataaattatgccaactttaacctatcgactaccatgtatcgcgagggacaataagggtagagattttggtttgtgacaccatatctataaccttagcaacatcaccccagcatcttgttcctggagtccgtctcgctctgccaaacagtaagtcattatcttctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--A-TT-AAT----C-TG-C---CA-----T---CCT-A--------------GT---G--GG---AAGGA-CAAT----ATA---G---GTTTTACGGATAT---G-T--GT-A-GA-CA---C-A---T-A-T----C-T-----T--C-GA-GGC----AAACCTC-A-CCCC-G----C--C----CG-T-CCT-GG-G--AGTTCC-C-----GCTTCTGCC----AAAAGT-AGT--A-----TACC--NN-NNN--N---NNNNNNN--NNNNNNNNN--NNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN-NNNNNN--NN-NNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNG--AGCCCACATA--CCAGG-TTC-AGTCTA--T-GT---AACA----TT------------CACCTCC-A-C-TTG--GATGGGGAAT---AGGGAC-C--CGCA---ATT---AA-T---CCA--AC----TCAGTCCCC-----TA--T--G-C-T-------A-AT-TTTC---------TG-----TC-------TA-G-TAATCTCCA---CCACGG-A---C-TTTTGCCC-CGT-A-G---GTCT--CG-A-ACCTG-TAA-T--T--GCCA-C-----------TGT-AT-----A-TCTTCAG-T---GAG-T----TC-TCACCT------GGCCAGT--GG------TG---A--TG--C----ACC--GCA-T-GC-CTTCCCCCCCTG-GAAA-TCT---CTATCT-CTA--GGTCA--TC-------AA-CC---CGAGCC-CACT-CATT-TCGGT
gi|12 : aaattgctcaaggcatccaccaccgagaTGCGGCAAAG--TTAATAAT-AAA-TCA-GATTAA-AAAA----------T-----ATT---AAAAATCA--ACG--CTTTGACCA---AAA---TTAAT-GAAT--C----T--TTGTAGATGT---ATTACA-T-A-CA-ATTAGGTTTACC---ATTAA-------AAA---TG-CC-CA-AAAT-G---TATATAACA------------------------GG-------------C----A------------------GCCA----------------TCTTGAATA----------------AGCC-GA----T---TTTTT-----ATTT---CTCTTTT-T--TTC-G-GTA-A-CTT-C-A--AAGCGGT----A-ATAtctcgggttcactcttgagtgataagacttaaacgaaacctcctaagctgctaccacctaccacaatccgatcaaatcttctctaacgtctcagaaaaaggtgggtggcttaaaaaacacatgcctgtaccttcctcctcgggcggccctggtttcacccgt
gi|12 : AACTG-T-----T-ACA------CTCCCCCCGTTTTCTCC----G-AAAGG-ACAATG---T-CCATAG-CCTAAA--CT--G--C----T----T-T---------------G-A-GT-GCCA-GTGGC-ATTCCTCCAGA-GCAAAATCAA-GGT-AG--AC-AGGA---CCGA---AGCCC-A--A---CA-A--A---TAAAA-GCAAC-AGG--ACACA-A-G-TGTCTGCC-T---AGAT-AG--G-A-TC-GG-GGCA-G-T-C-TGT-ATCGT-G-TC---CAGAAGAG-GA-A-----GT-----CCC--GG------GCGAAGCGGAAA--------TA-TCCCC-CAT-TCCACCCAAA-CGTA-CGT-----C-CAA-AAGC-A-T-C-----AG---A-GG---AACC-C-T---G-G-T-TGTCTG--GGT------CCTTAA-C-ACCC-CTA-GTC-CAT-TC-CA--CCATATGtcttaatttgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaactgttacactccccccgttttctccgaaaggacaatgtccatagcctaaactgctttgagtgccagtggcattcctccagagcaaaatcaaggtagacaggaccgaagcccaacaaataaaagcaacaggacacaagtgtctgcctagataggatcggggcagtctgtatcgtgtccagaagaggaagtcccgggcgaagcggaaatatcccccattccacccaaacgtacgtccaaaagcatcagaggaaccctggttgtctgggtccttaacacccctagtccattccaccatatg
gi|13 : tgcggcaaagttaataataaatcagattaaaaaatattaaaaatcaacgctttgaccaaaattaatgaatctttgtagatgtattacatacaattaggtttaccattaaaaatgcccaaaatgtatataacaggcagccatcttgaataagccgattttttatttctctttttttcggtaacttcaaagcggtaatatcttaatttgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaGC----AAC-T-CGA-T-C-CA--AGGGA-----TTC----ACC-A-G-G--C-A-G-----ATCCG-GG-AGGAA---T--T---CCCGC-TA----------GCG---T--GAC--AA---GTG--------CGA----G--AT---A-T-C-AG--T-A--GA--A-TC-TCAGAGAGC----------ATTT-GAA-T-GCT-A-GG-TT-CC--AC---A--A-TATAAT----C-TG-C---TAAC--TT---CCT-ATC-G--A-----A-GT---G--GA---GACGG-CA-TTTATA-A---G---GTT--ACAGACAT--GG-T--GT-G-GA-CA---T-A---A-A-T----C-TT----C--T-GA-GAC-----AACATC-G-CCCCAG----C--C-T--CG-T-CCT-GG-G--AGT--C-C-----GCT-CTG-CC---AAAAGT-AGT--CTTATCTA-C--TC-TCC--C---CACCCCC--TGGAGAGAA--TGC-TATGCCCCAGGTCT-AA-TTTTGC--CT-TACAT-TCTCGC--AGGAAGTATG-TACCAAGCAACATGG---AGCCACAAGG-G--AGCC-ACATA--C-AGG-TTC--AGCTA--TTGT---A-CAT---T-------------CA-CCCCCA-CTT-G--GATGGGAAAT---GGG--C-C--CGCA---TTA---AATC---C----AC----TCA-TTTCC-CAG-TA--T--G-C-C-------A-TG-TT-C---------TG-----CC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---C-CCT-G--CACGT-G-G---GTCC--TG-A-CCCCG-TAA-T--T--GC-A-C-----------TGT-AT-----
gi|14 : AGCTAAATTGT---AGCA----TTT-----------CAACATTCA-C-TTG--GATGGGGAAT---TGG--C-C--CGCAC--ATC---AAGG---C----GCGACATTAATTCTC-CAG-TA--G--GGC-T-------T-AT-T--C---------TG-----CC--CACCTCA-A-TA---TACA---CCACGG-G---C-AAT-G-ACACGTTA-GTTTGCCA--TG-A-CCCAG-TAAATAAT--GC-A-T-----------TGT-AA-----A-TC-TCAT-T---GAGGTG---TC-TCACCT------GGCCATT--AAGACGCATG---ACGTG--C----AGC--G-A-TCGC-CCT--CCCCCTT-A-AA-TAT---TCAGAT-TCA-TAGGCAT-CCCTACTCTAT-CC-----AGCC-CACT-C--TCCC
gi|15 : ctacacaagcattt-AT-----A-TC-TCGT-T---CGG-TG---TC-TCACCT------GGCCAGT--GG------TG---A--TG--CAGCGAGC--G-A-TCGCGCTT--CCCCCTG-G-AA-TCT---CTATCT-CTA---GGCAA-TC-------CTACG---CGAA---CACG-CATTCCTGGTtgcttactcgttcactcacttgcggtgtgctttaagcatttatccatcaaaacctctcaagctatgctaccagcccgtaccacaatccgagtaccatatcacgctctcgactgtatccacgcgacaagactgggtgccttaaaacagcacacgcacgaacctctatccaggcgccccttgtttcacg
gi|16 : ttacCT------GGCCAGT--TG------AG---A--TA--C-------------TCA----T--TCCCCTG-G-AA-TTT---CTATCT-CTA-G-----T-TC-------AT-CCTCCCGAGCC-CACT-TATTCCCGGTttctcgtacatccttgggatggttaagctttttagctaaacctcttaggctgctaccactctgagcacaatccgcaccataatcctctctactgtcctatgaaaaggtgggtgtcttaaaaaacggcacacgcctgtaagtttccctcgcgtggtcctggattttcaccagt
gi|17 : cacca-CCTAAA--CC--GGGT----T----T-AA-A-GGG-G------G-G-GT-GCCA-GTGGC-ACTCCTCC-GG-GCAAAAACAA-GGT-AG--GC-AGGA---CCGA---AG-CC-AACC---CA----A---GAAAA-ACAAC-AGT--GCACA-A-G-TACCCGCC-T---AGAT-AG--G-G-T--TG-GGCA-G-T---TAAGATCGT-G-TC---CA-------GA-AGGGACGT-----CTA--GG------GCGAAACGGCAAGATACATGTA-TCCAC-TAT-TCCGCCGCCA-CGTA-CAT-----C-CAA-AGGC-A-C-C-----GA---A-GG---A--A-C-C---GTGAT-TGTGTG--ttgtcgggttctctccttgcatgggtgattaagcttcagctaaatctctaagctgctaccagcctaccacaatccgattcatatcctccctactgtcctaggaaaagtagggtgccttaaaacgcacactcctgtacttcctccggcgtcctggttttcacgtgtc
gi|18 : AC-AAACTCA-GAAAAA-AAAA--------TAT-----ATT---AAAA-TCA--ACGACTTTTTACTA---AAAATATCAATTGAAA--C----TACTTGTAGATAT---ATTACATT-ACAA-ATA--G-ATATTTCCATT-GAAC----AAA---TG-TTACA-AAG--G---TATATAACATTGC--------------------GGCCTCTATAGAAATC----G------------------GGCA----------------TCT--G--A----------------AGCC-GATTTTT---TTTTT-----ATTC---ATC-TCT-T--TTC-G-ATC-TCATT-A-AAGAACCGAT----ATgg
gi|19 : actgcgaaatatg------TG---A--TG--C----ACC--G-A-CCAC-TTT--TCTC-TG-G-AA-TCT---CTATGT-CT--GGGGCATCTC-------TT-TT-----ATCC-CATT-TATTCCTGGTt
gi|2 : TGCGACAAA---TTAAGAAT-AAA-TCAAGAAAAA-AAAAA------TT-------ATT---AAAA-TTA--ACG--CTT-GACTATTAAAA---T--AT-GAAA--C----T--TTGTAGATAT---ATTACA-CCACCA-ATAAGG-TCATT---ATT-A-------AAA---TG-TT-CA-AA---G---TATATAACA------------------------GG-------------C----G------------------GCCA----------------TCT--G--A----------------AGCC-GA----T---TTTTT-----ATTAAAACTC-GCT-T--TTC-GAGTA-ACCGT-A------GCGAT----ATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAACTA-T-----TTACAACCCCCCCCCCTCCATTTTCTTCT---G-AAAGG-ATGG-A---T-C-ATAG-CC-AAA--CT--G--T----C----T-GA-ACGGG-GAAACA-G-A-GT-ACCA-GTGGC-ACTACTCCGGG-GCAAAATCAA-GGT-AG--GC-AGGA---CCGA---AG-CC-A--C---CA-C------GAAAA-GCTAC-AGG--GCACA-ATG-TGACCGCC-T---AGA--AT--G-G-T--GG-CGCACA-TGC-TGAAATCGT-G-AT---CA-------GA-G-----GC-----TCC--AG------GCG-AACGGCAA--------TC-TCCAC-CAT-TCCGCCGCCA-CGTA-CCT-----T-CAA-AAGG-A-A-T-----AG---A-GG---A--T-C-T---G-GTT-TATCTG--CGTCATACACTCAAA-C-AT-C-TTA-GAC-CAC-TC-CACCCCATATGACT---------------------CA--------------G-TATTCCT--C--GGGCTGCTTCCT-C-------AGCCTACCAGAGT--TCTGGA-TT-TTCCC-----A-AGTC-------AAC--GTTCCTGCC--G-GTC--TT--AAG---ACCC-ATC-GGGA---T---CTTTCTGGGTTCC-AC-CTGTTA-GG---GA-AC-AACA-A-TTCC-C---TCTT---CATGGAC-A-AT-TGG-C---GCT--C-----AA--G--CTCAAC------GGCTAGCACCC---CTATTAC--AA--------T-CT-TTCT---T--GCAACT-T-CGC----AAC-TCCGCAT-C-CT--AGGGACCCACTTC----ACCCA-GCG--C-A-GC----ATCGG-GC-AGGAA---T--T---TC-AC-TA----------GCA---T--GAC--A----GTG--------CGA----G--GG---A-----AG--C-A--GA--A-TC-TCAAGAAGC-TTA-----AATCT-GGA-T-GCT---GG-TT-C---AT---C--A-TA-AAT----C-TG-C---CAAC--TT---CCT--------------A-GT---G--GG---GGGGG-CA-T----A-A---G---GCT--ACGGACAT-TGG-T--GT-G-GA-CA---C-A---T-A-T----C-T-----C--T-GA-GGC----CAACCTCCACCCCCAG----C--C-TCACG-T-CCT-GGAG--AGT--C-C-----GCT-CTATCCACAAAAAGT-AGT--T---CCTATC--CC-NNN--N---NNNNNNN--NNNNNNNNN--NNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN-NNNNNN--NN-NNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNN-N--AGCC-ACATA--C-AGGTTTC-AAGCTAC-CTGT---A-CA----T-------------CATTCCCCA-C-T-G--GATGGGAAATG--GGG--C-C--CGCA---ATA---AAAT---C----AC----CCAGTCCCC-CAA-TA--T--T-C-T-------A-AT-TT-C---------TG-----TC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---CGTTT-GCACACG--A-G---GTCC--TG-A-ACCTG-TAA-T--T--GC-A-C-----------TGT-AT-----A-TA-TCAT-T---GAG-TG---TCGTCACCT------GGCCAGT--GG------TG---A--TG--C----AGC--G-A-TCGC-TTT--CTTCCTG-G-AA-TCT---CTATCT-CTAGGGGGCAT-TC-------AT-CC---CGAGCC-CACTACATTCCCGGTtcctcggtccactcctctgattacctgtgcgattaaactccaacccaacctccgggttgctaccacgaaccatatcctccctactgtccttggaaacggagggcgctctggtttcatgtaggaatgtctattattcctnnnnnnn
gi|20 : ACAAAA--TTAAAACTAAAA-TC----------GAAATTTTTTTTTT-----ATT---AAAAATCA--AC---CTTTAGCTA---AAAC--TTGAT-GAAAACT----T--TTGTAGACAT---ATTACA-T-A-CA-ATAAGG-TTTCC---ATT-G--------------------A-AAG--G---TATATAACA------------------------TG-------------C----G------------------GCCA----------------TCTTGA--ATGGCGAACATCTTGGTAGCC-GA----T---TTTTTTTTTAATTT---TTC-TCA-T--TTT-G-ATA---CTTAA-A--AAGCGAT----c
gi|21 : atgaTGCGACAAAA--TTAAGAAT-AAA-TCA-GAAAAA-AAAA----------T-----ATT---AAAAATTA--ACG--CTTTGACT----AAA---TTGAT-GAAA--CTTTGT--TTGTAGATA----ATTACA-T-ACC--ATAAGGTTTATT---ATTAA-------AAA---TG-TT-CATAAA--G---TATATAA-A------------------------GG-------------C----G------------------GCCA----------------ACTTGG--A----------------AGCT-GA----T---TTTTT-----ATT-----TC-TCT-T--TTT-G-GT--ACCTT-A-A--AAGCGAT----A
gi|23 : aa-AAA--G---TAAATAACA------------------------GG-------------A----G------------------GCCA----------------TCTTGG--A----------------AGTC-AA----TTTCTTTTT-----A-TT---CAC-CCTAT--TTC-T-GT--ATCTT-A-A--TAGCGAT----Aa
gi|24 : CTCAATTA-TATAAAT-ACAGCTCCCCCC-----GTTTTCTC-T---G-AAAGG-ATGGG----T-TCATTA-ACTATA--CT--G--T----
gi|25 : CCA-A-G--C-A-G-----ATCCG-GG-AGGAT---T--T---TC-AC-TA----------GCA---T--GACA-A----GTG--------CGA----G--G
gi|26 : ccaCCT-CAG-CA--T--G-T-T-------A-TT-TT-C---------TG-----CC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---C-TTT-Gta
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gi|8 : acattcccccacattttctctgacatgatgggatccataacctaaactgtcttggacggggaaacaagaatatcagtggcactactccggggtaaaaccaaggtaggcaggaccgaagtccaccacagaaaaggaacagggcacaagtgaccgcctagataggtttggcaAAA--TTAA---T-AAA-T-A-GATAAATCAGAA------TTTT-----GTTGTTAAAAATCA--AGG--CTTTGATTA---AAA---TTGAT-AAAA--C----T--TTGTAGGTAT---ATTACA-T-AC-A-GTTAGGCTTATA---ATT-ACCATTAAAAA---TG-TC-CA-AAAA-G---TATATAACA------------------------GG-------------T----G------------------GCCA----------------TCTTGG--A----------------AGTA-GA----T---TTTCT------TTT---AT----T-T--AAC-G-GTA--CTTT-A-A--AAGTGATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAACTA-A-----T-ACACCTCTCCCCGCCCCGTTTTCTCCTTTCA-AGAGG-ATAGGG---T-TCACAT-CCTAAA------------------------ACGGG-GAAATAAG-A-GT-ACCA-GTGGC-ACTCATACGGGAGTAAAAACAA-GGT-AG--GA-AGGA---CCGA---AG-CC--------CA-C--AAATGAAAA-GTAGC-AGG--ACACA-G-G-TGTTCGCC-T---AAATCAT--G-G-TC-AG-GGTA-G-T-C--AGAATCAT-G-TC---CAAATGGGGGA-A-----GT-----CCC--GG------TTGAAACGGCAA--------TC-TTCCC-CAT-TCCGCCGCCA-TGTA-AGT-----C-CAA-AAGC-A-C-C-----AG---AGGG---A--TCC-T---G-G-T-TGTTGG--GGT-----ACTC-AA-C-ATCT-CTA-GCC-CAT-TT-CA--CCATATCACC-----G---GG----------CG--------------GATATCCTT--C--GGGCTG-T---C-C-------AA------AGAG---TCTGGA-TT-TCCC--------AATC-------AAC--CAGCCTA-C--G-TTG--T---AAG---GCCC-ATA-GGGG---T---TTTCCTGAG-CCC-AC-CTG-CA-AG---GA-AC-AAC----TTCC-C---TCTT---CAGGAAC-A----TGG-C---GCT--C-----AAG-G--TTCAAT------AG-TATCACCC---CT-TTAC---------------------------------------------C-T-CCAAT-C-CA--AGGGA---C-T------AACCT-G-G--C-A-G-----ATTTG-AA-AGGAA---T--TC--CC-AC-TACTGGCCACTTGCA---TG-GGA--A----GTG--------AGA----G--GC---A-T-C-AG--C-A--GA--G-TC-t
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blockSeqs : G T A C A TT T ATTTTTTTTTT GTT A . AC TTA ATA T AC TTTG AC . T C CAA A T TCC ACCATTAA . . A T AA . GGCGGCCAATCTTGAAGTGGCG TCTTGAATGGAGGCCA T AT TGGCGAACATCTTGGT . TTTT TTC TTTTA AAAC T A AA . A ATA A AAG GNNN T NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN TATAAAT ACC CCCCCG CTTTCA C G A G AA AC GCATATTGAT T A . C . A C A T A T AG G ACT CAC C ACACA CAAAT T C CA AT A T C TCA C TG T T TG C C A G GTA T A GGC AATGGGG AGGGAC GGAAG AT TACGGG A GATACATG A G G T A GTACA G T AGATATGAG GTG G CAA ACC C CTG T A GT TA CATACA A AACG A A T C G CCATATACCAAGGATGAGAAGATGACTCAC A TC CG C T C A C A AAATC C A CCCCTCAC CTTATTA TC CC C CG C . GC CGT A T TGGG . C G A . AAC C T CTAAA A ACA ACA A CAAATA . TAG CCTTGAAAGGC CACGATAG GAAT A AAAAATCGCAT . A ATCCAT C C C CGCC A C GCA CA CG ACCCACTTC A T C GC C T CACTC . A . TATC C C CTGGCCACTT GCTAT ACATG GTGGTAGT CAATGGGTC G GC C CC . T T TTAAAT C . A C C TTC CAA AGAT T T TGAC A A GCA CT TAA ATCGACTACC T TTCG CGA A A TTAT T CGC AGA G TT CA AT C T . ACCT ATC G G AATC T TCATGACGACAAACATCCC CATT AT TCA T T A A TC TCC CGACG T TCCACA A CTTAT TT A T NNNNN CACG TGCTTAT CAAT TGCTA A AA AT AGT NN N AT C AC T TA A AA ACCAA AAATTCAC CT T TC AGA GA G GG CACATACCTAAATCCAA GACA G C A . AA TC G . CCACGTA G A T AATATATCGTGACCC . A ATC AAA A TCT G T CC A T C TTT AT T A C A AAT C . AATAGAAAGCC . TACTA T T C TGC GCAT G TCTGTG GA GACGCA AAT CG AC AGCG CTA C G CC A A . TGG T GGGGCATC CTACTCTAT TCCC . A
blockSeqs : A G . . . AA . TTTTTGTAC . A . . . C . . . . . . . CCA A T . GAAC . . . . T . TTGCGGCCTCTATAGAAATCG . T . . . . . . C . . . . . AA . A . T NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN TTT GCT CCTCCA TGGG . A . . . . GGTTTAA . A . . . A . . A . . CG . . . T AACC GCAC . . . GA . C . . . . . . C . . . . TG . . . GAAGAG CG . . TAT A . A . G . . . . . CACAT . . . ACC C . . T T . ATATG T CA . . . . . CCATATGAACGGGGCGCTGAAACTA . CC . . T . A C . TTC . . CA CTTATT . CT . . C . . GA A . T . T . . . TA . . TAAAC . A . T CAAT . . CCTTGAAAGC GGC C . ATAA . . CTTTA C . . . . . GAA AC . CATTTTTCA C . . C . . C . . . TAT C . CGCC ATTG CAA GT GACGGTATA . . . . . T . CTAAG . . . . . ATT C CAA . T . . . . . AC CATCGGCA . ATC . A A . . . . T . CA TT . C . CC . . C . T ATAACTCGTAGCAACATCA . . TT T . . A . CT . . CCA A AGTC . . N NNN NN NNNNNN NN NN . . N . CA . . . CC . C T A TAA TTTCAA CT T . AGA . . . CATACCTAAATCCCAA . G C . . A . . . CC . . . TGACACACTC . . G . . AC . . CA A . . . . . C . . TCA . . . . TG . A . . GTG . . . GT . C . . GC . . . . . . . . GGGGGCAT CTA C . G
blockSeqs : A A . . . AA . ATTTT . A . . . . . . . . . . . CA A T . AA . . . . G . GGCA . T . . . . . . A . . . . . CT . A . N ATT CAT CCCACA CTG . A . . . . TACTTGA . A . . . . . . T . . . . . . . CAC CTCA . . . A . A . . . . . . C . . . . TA . . . A A . . . A . . . . . . . . . TTTG . . . TC . . . T T . ATAA A AC . . . . . CCACATTGACCGGGCGGATACTA . . . . T . A A . TCG . . CA TT . CC . . . . . . . . A . C . . . A . . CAAT . . . T AAAT . . CACAAA AGA C . ATAA . . CTT C . . . . . GAA A . CATTTCGA C . . . . . . . . . TAT . . . GATT AA C CATTGGGTC . . . . . . . GTTA . . . . . TC C C . C . . . . . . ATCTGA . G . . . . . . . T . T T . . . C . . . . . ATAACCTTAGCAACATCA . . AT T . . A . CG . . CCC . CA . . C CCA TG TGCTAT AA CT . . G . NN . . . C . A T C TAG TTCCAC CT . . G . . . ATAAATCTCC . A T . . . . . . . . . . TGCCCACCT . . . . . . . . CA A . . . . . C . . T . . . . . . . . . TTG . . . . . . . . GC . . . . . . . . GAGTCATC AA C . .
blockSeqs : A G . . . AA . TAT . A . . . . . . . . . . . CA A C . AA . . . . A . GGCG . T . . . . . . T . . . . . AA . A . . TT CCT GCCCCG CG . G . . . . TCTTGG . A . . . . . . C . . . . . . . AA AA . . . A . A . . . . . . . . . . . TG . . . . G . . . A . . . . . . . . . ATC . . . A . . . T T . TA A AC . . . . . CCATATGATCCAGACGGATACTA . . . . T . A C . TC . . CA AA . CC . . . . . . . . A . C . . . C . . AACT . . . T AAT . . CAAGG AAG T . AAA . . TTT G . . . . . CAA C . GATTC C . . . . . . . . . TAT . . . ATG AA . GGGCATC . . . . . . . TT . . . . . TT . A . . . . . . . . ATCGAA . G . . . . . . . C . T T . . . T . . . . . CTGAGGCCAACCTCCAC . . T . . . A . C . . CCA . TC . . N NNN NN NNNNNN NN NN . . N . TT . . . C . A T . TA TTCAC TT . . . . . . ATTAATCCA . G T . . . . . . . . . . TGCCC . . . . . . . . T A . . . . . A . . T . . . . . . . . . TG . . . . . . . . G . . . . . . . . TAGGCAT AT C . .
blockSeqs : A G . . . TA . ATT . A . . . . . . . . . . . CC A . . GA . . . . . . TGCG . T . . . . . . C . . . . . A . A . TG T AT TG . A . . . . GCTTAA . A . . . . . . C . . . . . . . AC CA . . . A . A . . . . . . . . . . . TG . . . . G . . . G . . . . . . . . . ACC . . . T . . . T A . TA A GC . . . . . CCACATGACCGGGCGGATACTA . . . . T . A C . TC . . A . . CC . . . . . . . . G . C . . . . . . AAC . . . A CAT . . CAAG AT C . AAA . . CTT C . . . . . AA C . ATTC C . . . . . . . . . TC . . . GT AA . GTAACT . . . . . . . AT . . . . . TT . C . . . . . . . . ATCGA . G . . . . . . . T . T T . . . C . . . . . CTAGATGACCAACATCG . . T . . . . . C . . CC . CT . . C CCT NN ATCGCA NN NN . . N . NN . . . C . A T . TA TTCA C . . . . . . CATCAAGGC . A C . . . . . . . . . . TGTCC . . . . . . . . A A . . . . . C . . T . . . . . . . . . TG . . . . . . . . G . . . . . . . . AGGACAT TT C . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . CG A . . A . . . . . . GGCG . G . . . . . . C . . . . . A . G . AT . G AT . G . . . . TCTGA . . . . . . . . C . . . . . . . AC CA . . . T . A . . . . . . . . . . . CG . . . . G . . . A . . . . . . . . . AAT . . . T . . . T T . A A CA . . . . . CCATATCACCGGGCG . . . . C . A C . TC . . A . . C . . . . . . . . T . T . . . . . . ACT . . . T AAT . . AAAG AT C . ACA . . TCC C . . . . . GA C . ACTC T . . . . . . . . . TC . . . AT AA . GATAT . . . . . . . AT . . . . . TT . T . . . . . . . . AGTAT . G . . . . . . . C . T T . . . T . . . . . TCGAGGCAAACCTCA . . T . . . . . T . . CC . CC . . C NNN NN NNNNNN NN NN . . N . NN . . . C . . T . TA TCAT C . . . . . . TTAAATCC . . T . . . . . . . . . . TGCCC . . . . . . . . T A . . . . . A . . A . . . . . . . . . TG . . . . . . . . G . . . . . . . . GGTCA AT C . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . . . . . . CA A . . G . . . . . . GGAG . T . . . . . . C . . . . . A . A . C TG . A . . . . CTTT . . . . . . . . A . . . . . . . AC AA . . . A . A . . . . . . . . . . . T . . . . A . . . A . . . . . . . . . AGT . . . T . . . G T . A A AC . . . . . CCCCATATGACTCA . . . . . . A C . TT . . . . . C . . . . . . . . A . C . . . . . . TCT . . . T AA . . CAAT GC C . AA . . CT C . . . . . GA C . GACT C . . . . . . . . . T . . . AT AA . TGTAT . . . . . . . TT . . . . . CA . C . . . . . . . . ATTGA . G . . . . . . . C . G T . . . T . . . . . TCTGAGACAACATCG . . T . . . . . C . . CC . CT . . N . T NNNNNN . . . . . . . . TA TCCA C . . . . . . ATAAAATC . . C . . . . . . . . . . TGCCC . . . . . . . . A . . . . . . A . . T . . . . . . . . . T . . . . . . . . G . . . . . . . . GGCAA CT . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . TGCG . . . . . . . . A . . . . . A . A . CA . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . AC A . . . G . T . . . . . . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . AAT . . . T . . . . . . A A AC . . . . . CCATTT . . . . . . . C . TC . . . . . C . . . . . . . . C . . . . . . . . CA . . . G CA . . CTAG AC . . AA . . TT . . . . . . GA A . ATTT A . . . . . . . . . T . . . AT A . GGCAT . . . . . . . TT . . . . . TT . C . . . . . . . . ATCGA . G . . . . . . . C . T T . . . C . . . . . CTGAGGCAGCATAA . . T . . . . . C . . CC . A . . . . . AA TAC . . . . . . . ATAAATCA . . . . . . . . . . . . . TGTC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . . .
blockSeqs : . . . GGTG . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . C . . . A . C . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . ACC . . . T . . . . . . . A T . . . . . CC . . . . . . . . . TG . . . . . C . . . . . . . . G . . . . . . . . CT . . . G CA . . . AG . . . . . . . . . . . . AA C . ATTC C . . . . . . . . . T . . . AT A . GGCAT . . . . . . . AT . . . . . . . C . . . . . . . . A . G . . . . . . . A . A T . . . C . . . . . CTGAGGCAACTCA . . T . . . . . C . . CC . . . . TT . . . . . . . ATGAATAC . . . . . . . . . . . TGCC . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T . . . . . . . . GA C . ATC . . . . . . . . . . T . . . AT A . GGGA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . CTG . . . . . . . . . . . C
blockSeqs : . . . AT C . ACT . . . . . . . . . . T . . . GT A .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqCons : A** TTT************* ** *** CA** GA******* *** *** A** A*** NCT G*** NCTTGA*********** AC****** TG* T*** CCATATGACCGGGCGGATACTA*************************** A******* TC*** CA****** CC ** *** CAAT*** CAAG*********** AC******* GA* C** ATTC********* *** AT***** AA***** GGCAT*********** ** NT********** ATCGA********* **** T* T*** CC***** CCN***** C*** A* TTCAC**************** CT* TGCCC******************** CA A* GGGCAT***
originalCons : TGCGACAAAA--TTAAGAAT-AAA-TCA-GAAAAA-AAAAA------TT-T-----ATT---AAAAATCA--ACG--CTTTGACTA---AAA---TTGAT-GAAA--C----T--TTGTAGATAT---ATTACA-T-ACCA-ATAAGG-TTATT---ATT-A-------AAA---TG-TT-CA-AAA--G---TATATAACA------------------------GG-------------C----G------------------GCCA----------------TCTTGG--A----------------AGCC-GA----T---TTTTT-----ATTT---CTC-TCT-T--TTC-G-GTA-ACCTT-A-A--AAGCGAT----ATATAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCCCCAACTA-T-----T-ACANCTCCCCCCCCCCCGTTTTCTCCT---G-AAAGG-ATGGGA---T-CCATAG-CCTAAA--CT--G--T----C----T-GA-ACGGG-GAAACAAG-A-GT-ACCA-GTGGC-ACTACTCCGGG-GCAAAACCAA-GGT-AG--GC-AGGA---CCGA---AG-CC-A--C---CA-C--A---GAAAA-GCAAC-AGG--GCACA-A-G-TGACCGCC-T---AGAT-AG--G-G-T--GG-GGCA-G-T-C-TGGAATCGT-G-TC---CA-------GA-G-----GT-----CCC--GG------GCGAAACGGCAA--------TC-TCCAC-CAT-TCCGCCGCCA-CGTA-CGT-----T-CAA-AAGG-A-N-T-----AG---A-GG---A--T-C-T---G-GTT-TGTCTG--CGT-A---ACTCAAA-C-ATCC-CTA-GAC-CAC-TC-CACCCCATATGACC-----G---GG----------TA--------------G-TATCCTT--C--GGGCTG-TTCCT-C-------AGCCT-CCAGAGT--TCTGGA-TT-TTCCC-----A-AATC-------AAC--GTTCCTG-C--G-GTC--TC--AAG---ACCC-ATA-GGGN---T---TCTCCTGGGTCCC-AC-CTGTTA-GG---GA-AC-AAC--A-TTCC-C---TCTT---CATGGAC-A-AT-TGG-C---GCT--C-----AA--G--CTCAAC------AGCTAGCACCC---CT-TTACA-AA--------T-CC-TTCT---T--GCAACT-T-CGC----AAC-T-CGAAT-C-CA--AGGGA---A-TTC----ACCCA-G-G--C-A-G-----ATCCG-GG-AGGAA---T--T---CC-AC-TA----------GCG---T--GAC--A----GTG--------CGA----G--GG---A-T-C-AG--C-A--GA--A-TC-TCAGAGAGC-TT------AATCT-GAA-T-GCT-A-GG-TT-C---AC---C--A-TA-AAT----C-TG-C---CAAC--TT---CCT-ATC-G--A-----A-GT---G--GG---GAGGG-CA-T----A-A---G---GCT--ACGGATAT-TGG-T--GT-G-GA-CA---C-A---T-A-T----C-T-----C--T-GA-GGC----CAACATCCA-CCCCAG----C--C-T--CG-T-CCT-GGAG--AGT--C-C-----GCT-CTGCCC---AAAAGT-AGT--C---CCTATC--CC-CCC--C---CNCCCCC--TGGAGAGAA--CGC-TATGCCCCAGGTCT-AA-TTTTGC--CT-TACAT-TCTCGC--AGGAAGTGTG-TACCAAGCAACATGG---AGCCNCAAGG-G--AGCC-ACATA--C-AGG-TTC-AAGCTA--TTGT---A-CA----T-------------CACCCCCCA-C-T-G--GATGGGGAAT---GGG--C-C--CGCA---ATA---AAAT---C----AC----TCAGTCCCC-CAG-TA--T--G-C-T-------A-AT-TT-C---------TG-----CC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---C-TCT-GCACACGT-A-G---GTCC--CG-A-NCCCG-TAA-T--T--GC-A-C-----------TGT-AT-----A-TC-TCGT-T---GAG-TG---TC-TCACCT------GGCCAGT--GG------TG---A--TG--C----AGC--G-A-TCGC-CTT--CCCCCTG-G-AA-TCT---CTATCT-CTA-GGGGCAT-TC-------AT-CC---CGAGCC-CACT-CATTCCCGGT
finalCons : TGCGACAAAA--TTAAGAAT-AAA-TCA-GAAAAA-AAAATTT-------------ATT---AAAAATCA--ACG--CTTTGACTA---AAA---TTGAT-GAAA--C----T--TTGTAGATAT---ATTACA-T-ACA--ATAAGG-TTATT---ATTGA-------AAA---TG-TT-CA-AAA--G---TATATAACA------------------------GG-------------C----G------------------GCCA----------------TCTTGG--A----------------AGCC-GA----T---TTTTT-----ATTT---CTC-TCT-T--TTC-G-GTA--CCTT-AA---AAGCGAT----ATATAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCCCCAACTA-T-----T-ACANCTCCCCCCCCCCCGTTTTCTCCT---G-AAAGG-ATGGGG---T-CCATAG-CCTAAA--CT--GNCTTGA-----------ACGGG-GAAACAAG-A-GT-ACCA-GTGGC-ACTACTCCGGG-GCAAAACCAA-GGT-AG--GC-AGGA---CCGA---AG-CCAC------CA-C--A---GAAAA-GCAAC-AGG--GCACA-A-G-TGACCGCC-T---AGAT-AG--G-G-T--GG-GGCA-G-T-CTG-GAATCGT-G-TC---CA-------GA-G-----GT-----CCC--GG------GCGAAACGGCAA--------TC-TCCAC-CAT-TCCGCCGCCA-CGTA-CGT-----T-CAA-AAGG-A-N-T-----AG---A-GG---AT---C-T---G-GTT-TGTCTG--CGT-A---ACTCAAA-C-ATCC-CTA-GAC-CAC-TC-CACCATATGACCGGGCGGATACTA---------------------------G-TATCCTT--C--GGGCTG-TTCCT-CA-------GCCT-CCAGAGTC---TGGA-TT-TTCCCA------AATC-------AAC--GTTCCTG-C--G-GTC--TC--AAG---ACCC-ATA-GGGN---T---TCTCCTGGGTCCC-AC-CTGTTA-GG---GA-AC-AAC--A-TTCC-C---TCTT---CATGGACAAT---TGG-C---GCTCAAG-----------CTCAACAC-------TAGCACCC---CT-TTACA-AA--------T-CC-TTCT---T--GCAACT-T-CGC----AAC-T-CGA-TC--CA--AGGGATTC---------ACCCA-G-G--C-A-G-----ATCCG-GG-AGGAA---T--T---CC-AC-TA----------GCAT-----GACAA-----GTG--------CGAGGCAT-----------C-AG--C-A--GA--A-TC-TCAGAGAGCNT----------CT-GAA-T-GCT-A-GG-TT-C---AC---C--A-TA-AAT----C-TG-C---CAAC--TT---CCTATCGA---------A-GT---G--GG---GAGGG-CA-T----A-A---G---GCT--ACGGATAT-TGGT---GT-G-GA-CA---C-A---T-A-T----C-T-----C--T-GA-GGC----CAACATCCA-CCCCAG----C--C-T--CG-T-CCT-GGAG--AGT--C-C-----GCT-CTGCCC---AAAAGT-AGTCC-----CTATC--CC-CCCCCN-----CCCCC--TGGAGAGAA--CGC-TATGCCCCAGGTCT-AA-TTTTGC--CT-TACAT-TCTCGC--AGGAAGTGTG-TACCAAGCAACATGG---AGCCNCAAGG-G--AGCC-ACATAC---AGG-TTCA-AGCTA--TTGT---A-CATTCAC----------------CCCCCACT-T-G--GATGGGGAAT---GGG--C-C--CGCA---ATA---AAAT---C----AC----TCAGTCCCC-CAG-TA--T--G-C-T-------A-AT-TT-CTGCCC--------------------TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---C-TCT-GCACACGT-A-G---GTCC--CG-AA-CCCG-TAA-T--T--GC-A-C-----------TGT-AT-----A-TC-TCGT-T---GAG-TG---TC-TCACCT------GGCCAGT--GG------TG---A--TG--C----AGC--G-A-TCGC-CTT--CCCCCTG-G-AA-TCT---CTATCT-CTAGGGCAT---TC-------AT-CC---CGAGCC-CACT-CATTCCCGGT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1227 ) : TGCGACAAAA--TTAAGAAT-AAA-TCA-GAAAAA--AAAA-------TTT------AT-TAAAAATCA--ACG--CTTTGACTA---AA---A-TTGA-TGAAA--C----T--TTGTAGATAT---ATTACA-T-AC-AATA-AGG-------TTATT---ATTG---A--A-AATG-TT-CA-AAA--G---TATATAACA------------------------GG-------------C----G------------------GCCA----------------TCTTGG--A----------------AGCC-GA----T---TTTTT-----ATTT---CTC-TCT-T--TTC-G-G--TA-CC-TTA-A--AAGCGAT----ATATAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCCCCAACTA-T-----T-ACANCTCCCCCCCCCCCGTTTTCTCCT---G-AAAGG-ATGGGG---T-CCATAG-CCTAAA--CT--GN---C---TTGA-ACGGG-GAAACAAG-A-GT-ACCA-GTGGC-ACTACTCCGGG-GCAAAACCAA-GGT-AG--GC-AGGA---CCGA---AG-CC-A--C---CA-C--A---GAAAA-GCAAC-AGG--GCACA-A-G-TGACCGCC-T---AGAT-AG--G-G-T--GG-G-GCA-G-T-C-TGGAATCGT-G-TC---CA-------GA-G-----GT-----CCC--GG------GCGAAACGGCAA--------TC-TCCAC-CAT-TCCGCCGCCA-CGTA-CGT-----T-CAA-AAGG-A-NT-----AG---A-GG---A--T-C-T---G-GTT-TGTCTG--CGT---A---ACTCAAA-C-ATCC-CTA-GAC-CAC-TC-CACC--ATAT-G-A-CC--GGGCG----GAT-ACT-A-GTATCCTT--C--GGGCTG-TTCCTC-------AGCCT-CCAGAG---T-C-TGGA-TT-TTCCC-----A-AATC-------AAC--GTTCCTGC--G-GTC--TC--AAG---ACCC-ATA-G---GGNT---TCTCCTGGGTCCC-ACCTGTTA-GG---GA-AC-AAC--A-TTCC-C---TCTT---CATGGAC-A-AT-TGG-C---GCT--C-----AA--G--CTCAA-C-A-C--T--AGCACCC---CT-TTACA-AA--------T-CC-TTCT---T--GCAACT-T-CG----CAAC-TC-G-AT-C-CA--AG-G-G-A-----TTC----ACCCA-G-G--CA-G-----ATCCG-GG-AGGAA---T--T---CC-A-CTA----------GC---A--T--GA-CA---A--G-TG-----CGA----GGCA-T------C-AG--CA--GA--A-TC-TCAGAGAG---------CNT----CT-GAA-T-GCT-A-G---G-TT-C---AC---C--A----TA-AAT----C-TG-C---CAAC--TT---CCT-ATC-G--A--A--GT---G----GG---GAGGG-C-A-T----A-A---G---GCT--ACGGATAT-TGG-T--GT-G-GA-CA---CA---T-A-T----C-T-----C--T-GA-GGC----CAACATCCA-CCCCAG----C--C-T--CG-TCCT-GGAG--AGT--C-C-----GCT-CTGCCC---AAAAGT-AGT--C---CCTATC--CC-CCC--C---CNCCCCC--TGGAGAGAA--CGC-TATGCCCCAGGTCT-AA-TTTTGC--CT-TACAT-TCTCGC--AGGAAGTGTG-TACCAAGCAACATGG---AGCCNCAAGG-G--AGCC-ACATA--C-AGG-TTC-AAGCTA--TTGTA-C-------ATT-C----------ACCCCCCACTTGGATGGGGAAT---GGG--C-C--CGCA---ATA---AAAT---C----AC----TCAGTCC-CCCAG-T--A-T--GC-T-------A-AT-TT-C---------TG-----CC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---C-TCT-GCACACG-TA-G---GTCC--CG-A-ACCCG-T-AAT--T--GC-A-C-----------TGT-AT-----A-TC-TCGT-T---GA-G-TG---TC-TCACCT------GGCCAGT--G------G--TG---A--TG--C----AGC--G-A-TCGC-CTT--CCCCCTG-G-AA-TCT---CTATCT-CTA--GGG-CAT-TC-------AT-CCCGAGCC-CACT-CATTCCCGGT
gi|1 : ACAAAAGTTTGAGAAT-AAAATCA-GAAAAA--AAAA----------------ATATAAAAATTATAACG--CTTTGACTA---AA---A-TTGA-TAAAA--C----T--TTGTAGATATTCTATTACAAT-AC-CATATAGG-------TTATT---ATTATTAA--ACAGTGATT-CA-AAA--GAAGTAT-TAACAAAGGCTCAAGAGGTCCATCTGTGTGG-------------CATAGG------------------GCCA----------------TCTTGG--A----------------GGCCCGA----T---TTTTT-----ATTT---TCC-TCT-T--CTCCG-G--TATCC-TTATA--AAGCG-C----GTATAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCTCCA-CTA-T-----T-ACATT------CCCCCCATTTTCTC-T---G-AAAGG-ATGAGAAGAT-CCATAG-C-TAAA--CT--GTAACC---TTGA-ACGGGAGAAACAAGGA-GTTACCA-GTGGCCACTACTCGGGG-GTAAAACCAA-GGT-AG--GC-ATGA---CCGA---AG-CCCA--C---CA-C--A---GAAAA-GCAAC-AGG--GCACA-T-G-TGACCGCC-T---AGAT-AG--G-G-T--TG-GCGCA-G-T-C-T-GAATCGT-G-TC---CA-------GA-G-----GT-----CCC--AG------GCG-AACGGCAA--------TT-TCCAC-CAT-TCCGCCGCCA-CGTA-CGT-----T-CAA-AGGG-T-TG-----AG---A-GG---AACC-C-T---G-G-T-TATCTG--CGC-------ACTC-AA-C-ATCC-CTA-AAC-CAC-TC-CACC--ATAT-G-T-CC--GTGAG----GAT-ACT-A-GTATCCTC--C--GGGTTG-TTCCTCCTGTTCTAG-CT-CCGGAG---T-CTTGGA-TT-TT-CC-----A-AGGC-------AAC--GTT-CTGG--G-GTCCTTC--AAG---ATCC--TC-G---GACTCTCTCTCCTTGGT-CC-ACCTGTTATGC---GA-AC-AAC--T-TGCG-C---TCTT---CATGTGT-ATTT-TGGTC---GCT--C-----AACGG--CTC---C-G-CT-T--AG---CC---CT-TTACA-AA--------TGCC-TTCT---G--G---CC-T-CG----C-AC-TC---AT---CA--AG-G---------CTC----A--CA-G-G--CA-G-----CTTCGCCG-AGGAATTTT--T---CC-A-CTA----------CA---A--T--G--CA---A--GCTG------GA-----GTA-T------C-TG--CA--GAATA-TA-TAAGAGAGATTTATTAAAAT----CT-GAAGT-GCT-A-G---T-TC-C---AC---C--A----TATATT----C-TG-C---CGAC--T-----CT-----------A--GT---G----GG---GAGGA-C-A-TA---A-A---G---GCT--ATGGATA--TGG-TGGGT-G-GATCA---CA---T-A-T----C-TTTG--C--T-GA-GGC----AATCA--CA----CAG-------C-T--CG-TCCTGGGAG--TGT--C-C-----GCTCCTGCC-------ACT-AGT-------CTACC--CC-CCC--CANNNNNNNNN--NNNNNNNNN--NNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN-NNNNNN--NN-NNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNN-G--AGGC-ACATAATC-AGG-TTC--AGCTA--TTGTA-C-------ATG-CTACTTTTGTAACGCCCCCCTTGGATGGGGGAT---GGG--C-C--CGCA---A-A---TAATC--C----AC----TCAGT---CCCAGTT--A-T--GCTT-------A-AT-TT-T---------T------CTTGC----TACG-TA---TCCA---C--CGG-G---C-TTT-G---ACG-TA-G---GTCT--CG-ACGCCTGTT-TAT--T--GC-AGC-----------TGTAAT-----A-TC-TCAT-T---GA-G-TT---TC--CACCT------GGCTAGT--G------G--TG---A--TG--T----AGC--G-A-TTTG-CTT---CCCCTG-G-AACTCT---CTATCT-CTA--GGG-C---TC-------AT-CCCGAGCCGCACT-CATTCCC
gi|10 : cCTG--CGT---T---ACTCAAC-A-ATCC-CTA-GAC--AC-TCGCACC--ACATTG-A-CC--GGGCG----GAT-ACT-A-GTATCCTC--CCGGGACTG--TCCTC--------GCCT-CTAGAG---T-C-TAGG-TT-TT-TC-----A-AATCCTTATT-AAC--ATT-CTGC--GCGTC--TC--AAG---ATCC-ATA-G---GGTT---T---CAGGGTTCCAAACTGTTA-CT---GA-AC-AACTAA-ACAC-C---TCTC---CAAGGA--A-AT-GGC-C---GCT--CCTTGAAA--GGCCTCAA-C-A-T--T--AGCA-CC---CT-TTACATAA--------T-CCATTCT---TTAG-AACT-T-CGCCGCCAAC-TT-A-AT-A-CA--AG-G-GCA-----TTTCGA-AACCA-G-GC-CA-G-----ACCCC-GG-AGGAA---TTAT---CC-ACCTA----------GC---A--TTGGA-CACATG--G-TGGT---CGACAATGGGT-C------C-AGC-CA--GA--A-TC-TCAGAG-G---------CTT----CC-GAA-TAGCT-A-A---A-TC-C---AC---C--A----TA-AAT----TATG-C---CAAC--TTTAACCT-ATC-G--ACTACCAT---GTATCGC---GAGGGACAA-T----A-A---G---GGT--AGAGATTT-TGG-T--TT-GTGA-CAC--CA---T-A-T----C-TATAACC--T-TA-G------CAACAT-CA-CCCCAG----CATC-T--TGTTCCT-GGAGTCCGT--CTC-----GCT-CTGCCA---AACAGTAAGT--C---ATTATC--TT-CTC--cagttctcgggttcctttgggtgattacgccttcttctaactttctaagctgctaccaggcctaccacccaatcgatttcgtcatcttctctagctgtctcggaaaaaggtgggtgccttaaaacgcacatgccttacttctcggcgcggtttccgtg
gi|10 : atatctatac-G--AGCC-ACATAA-C-AGG-TTA-CAGCAAA-TCG-A-CCAACAAAATT-C----------ACCCCCCGTGTCGATGGGAAATAGAGGA--CGCGGCGCAC--ATACCTAAAT---CCCAAAC----TCAGTCTACACAG-TAAA-T--GC-TCCACGTAA-ATATT-C---------TGACACACT--C----CA-A-TAG--TCCA---CCACGGAA---C-TCT-GT-CATG-TA-G---GTTC--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagccacataacaggttacagcaaatcgaccaacaaaattcaccccccgtgtcgatgggaaatagaggacgcggcgcacatacctaaatcccaaactcagtctacacagtaaatgctccacgtaaatattctgacacactccaatagtccaccacggaactctgtcatgtaggttc
gi|11 : atatctatacctgcgttactcaacaatccctagacactcgcaccacattgaccgggcggatactagtatcctcccgggactgtcctcgcctctagagtctaggtttttcaaatccttattaacattctgcgcgtctcaagatccatagggtttcagggttccaaactgttactgaacaactaaacacctctccaaggaaatggccgctccttgaaaggcctcaacattagcaccctttacataatccattctttagaacttcgccgccaacttaatacaagggcatttcgaaaccaggccagaccccggaggaattatccacctagcattggacacatggtggtcgacaatgggtccagccagaatctcagaggcttccgaatagctaaatccaccataaattatgccaactttaacctatcgactaccatgtatcgcgagggacaataagggtagagattttggtttgtgacaccatatctataaccttagcaacatcaccccagcatcttgttcctggagtccgtctcgctctgccaaacagtaagtcattatcttctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--A----TT-AAT----C-TG-C---CA-----T---CCT-A------------GT---G----GG---AAGGA-C-AAT----ATA---G---GTTTTACGGATAT---G-T--GT-A-GA-CA---CA---T-A-T----C-T-----T--C-GA-GGC----AAACCTC-A-CCCC-G----C--C----CG-TCCT-GG-G--AGTTCC-C-----GCTTCTGCC----AAAAGT-AGT--A-----TACC--NN-NNN--N---NNNNNNN--NNNNNNNNN--NNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN-NNNNNN--NN-NNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNG--AGCCCACATA--CCAGG-TTC-AGTCTA--T-GTAAC-------ATT-C----------ACCTCC-ACTTGGATGGGGAAT---AGGGAC-C--CGCA---ATT---AA-T---CCA--AC----TCAGTCC-CC----T--A-T--GC-T-------A-AT-TTTC---------TG-----TC-------TA-G-TAATCTCCA---CCACGG-A---C-TTTTGCCC-CG-TA-G---GTCT--CG-A-ACCTG-T-AAT--T--GCCA-C-----------TGT-AT-----A-TCTTCAG-T---GA-G-T----TC-TCACCT------GGCCAGT--G------G--TG---A--TG--C----ACC--GCA-T-GC-CTTCCCCCCCTG-GAAA-TCT---CTATCT-CTA--GGT-CA--TC-------AA-CCCGAGCC-CACT-CATT-TCGGT
gi|12 : aaattgctcaaggcatccaccaccgagaTGCGGCAAAG--TTAATAAT-AAA-TCA-GATTAA--AAAA-------T--------AT-TAAAAATCA--ACG--CTTTGACCA---AA---A-TTAA-TGAAT--C----T--TTGTAGATGT---ATTACA-T-AC-AATT-AGGT------TTACC---ATTA---A--A-AATG-CC-CA-AAAT-G---TATATAACA------------------------GG-------------C----A------------------GCCA----------------TCTTGAATA----------------AGCC-GA----T---TTTTT-----ATTT---CTCTTTT-T--TTC-G-G--TA-AC-TTC-A--AAGCGGT----A-ATAtctcgggttcactcttgagtgataagacttaaacgaaacctcctaagctgctaccacctaccacaatccgatcaaatcttctctaacgtctcagaaaaaggtgggtggcttaaaaaacacatgcctgtaccttcctcctcgggcggccctggtttcacccgt
gi|12 : AACTG-T-----T-ACA------CTCCCCCCGTTTTCTCC----G-AAAGG-ACAATG---T-CCATAG-CCTAAA--CT--GC---T---TTGA------------------GT-GCCA-GTGGC-ATTCCTCCAGA-GCAAAATCAA-GGT-AG--AC-AGGA---CCGA---AGCCC-A--A---CA-A--A---TAAAA-GCAAC-AGG--ACACA-A-G-TGTCTGCC-T---AGAT-AG--G-A-TC-GG-G-GCA-G-T-C-TGT-ATCGT-G-TC---CAGAAGAG-GA-A-----GT-----CCC--GG------GCGAAGCGGAAA--------TA-TCCCC-CAT-TCCACCCAAA-CGTA-CGT-----C-CAA-AAGC-A-TC-----AG---A-GG---AACC-C-T---G-G-T-TGTCTG--GGT--------CCTTAA-C-ACCC-CTA-GTC-CAT-TC-CACC--ATAT-G-tcttaatttgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaactgttacactccccccgttttctccgaaaggacaatgtccatagcctaaactgctttgagtgccagtggcattcctccagagcaaaatcaaggtagacaggaccgaagcccaacaaataaaagcaacaggacacaagtgtctgcctagataggatcggggcagtctgtatcgtgtccagaagaggaagtcccgggcgaagcggaaatatcccccattccacccaaacgtacgtccaaaagcatcagaggaaccctggttgtctgggtccttaacacccctagtccattccaccatatg
gi|13 : tgcggcaaagttaataataaatcagattaaaaaatattaaaaatcaacgctttgaccaaaattaatgaatctttgtagatgtattacatacaattaggtttaccattaaaaatgcccaaaatgtatataacaggcagccatcttgaataagccgattttttatttctctttttttcggtaacttcaaagcggtaatatcttaatttgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaG----CAAC-TC-G-AT-C-CA--AG-G-G-A-----TTC----ACC-A-G-G--CA-G-----ATCCG-GG-AGGAA---T--T---CCCG-CTA----------GC---G--T--GA-CA---A--G-TG-----CGA----GATA-T------C-AG--TA--GA--A-TC-TCAGAGAG---------CAT----TT-GAA-T-GCT-A-G---G-TT-CC--AC---A--A----TATAAT----C-TG-C---TAAC--TT---CCT-ATC-G--A--A--GT---G----GA---GACGG-C-A-TTTATA-A---G---GTT--ACAGACAT--GG-T--GT-G-GA-CA---TA---A-A-T----C-TT----C--T-GA-GAC-----AACATC-G-CCCCAG----C--C-T--CG-TCCT-GG-G--AGT--C-C-----GCT-CTG-CC---AAAAGT-AGT--CTTATCTA-C--TC-TCC--C---CACCCCC--TGGAGAGAA--TGC-TATGCCCCAGGTCT-AA-TTTTGC--CT-TACAT-TCTCGC--AGGAAGTATG-TACCAAGCAACATGG---AGCCACAAGG-G--AGCC-ACATA--C-AGG-TTC--AGCTA--TTGTA-C-------ATT-C----------A-CCCCCACTTGGATGGGAAAT---GGG--C-C--CGCA---TTA---AATC---C----AC----TCA-TTT-CCCAG-T--A-T--GC-C-------A-TG-TT-C---------TG-----CC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---C-CCT-G--CACG-TG-G---GTCC--TG-A-CCCCG-T-AAT--T--GC-A-C-----------TGT-AT-----
gi|14 : AGCTAAATTGTAGC-------ATTTC----------AACATTCACTTGGATGGGGAAT---TGG--C-C--CGCAC--ATC---AAGG---C----GCGACATTAATTC-TCCAG-T--AGG--GC-T-------T-A--TT-C---------TG-----CC--CACCTCA-A-TA---TACA---CCACGG-G---C-AAT-G-ACACGTTA-GTTTGCCA--TG-A-CCCAG-TAAATAAT--GC-A-T-----------TGT-AA-----A-TC-TCAT-T---GAGG-TG---TC-TCACCT------GGCCATT--AAGACGCA--TG---ACGTG--C----AGC--G-A-TCGC-CCT--CCCCCTT-A-AA-TAT---TCAGAT-TCAT-AGG-CAT-CCCTACTCTAT-CC--AGCC-CACT-C--TCCC
gi|15 : ctacacaagcattt-AT-----A-TC-TCGT-T---CG-G-TG---TC-TCACCT------GGCCAGT--G------G--TG---A--TG--CAGCGAGC--G-A-TCGCGCTT--CCCCCTG-G-AA-TCT---CTATCT-CTA---GG-CAA-TC-------CTACGCGAA---CACG-CATTCCTGGTtgcttactcgttcactcacttgcggtgtgctttaagcatttatccatcaaaacctctcaagctatgctaccagcccgtaccacaatccgagtaccatatcacgctctcgactgtatccacgcgacaagactgggtgccttaaaacagcacacgcacgaacctctatccaggcgccccttgtttcacg
gi|16 : ttacCT------GGCCAGT--T------G--AG---A--TA--C-------------TCA----T--TCCCCTG-G-AA-TTT---CTATCT-CTA--GTT-CAT-CC--------T-CCCGAGCC-CACT-TATTCCCGGTttctcgtacatccttgggatggttaagctttttagctaaacctcttaggctgctaccactctgagcacaatccgcaccataatcctctctactgtcctatgaaaaggtgggtgtcttaaaaaacggcacacgcctgtaagtttccctcgcgtggtcctggattttcaccagt
gi|17 : cacca-CCTAAA--CC--GG---G---TTTA-AAGGG-G------G-G-GT-GCCA-GTGGC-ACTCCTCC-GG-GCAAAAACAA-GGT-AG--GC-AGGA---CCGA---AG-CC-AACC---CA----A---GAAAA-ACAAC-AGT--GCACA-A-G-TACCCGCC-T---AGAT-AG--G-G-T--TG-G-GCA-G-T---TAAGATCGT-G-TC---CA-------GA-AGGGACGT-----CTA--GG------GCGAAACGGCAAGATACATGTA-TCCAC-TAT-TCCGCCGCCA-CGTA-CAT-----C-CAA-AGGC-A-CC-----GA---A-GG---A--A-C-C---GTGAT-TGTGTG--ttgtcgggttctctccttgcatgggtgattaagcttcagctaaatctctaagctgctaccagcctaccacaatccgattcatatcctccctactgtcctaggaaaagtagggtgccttaaaacgcacactcctgtacttcctccggcgtcctggttttcacgtgtc
gi|18 : AC-AAACTCA-GAAAAA--AAAA-------TAT------AT-T-AAAATCA--ACGACTTTTTACTA---AAAATA-TCAATTGAAA--C----TACTTGTAGATAT---ATTACATT-ACAAATA---G-------ATATTTCCATTG---AACA-AATG-TTACA-AAG--G---TATATAACATTGC--------------------GGCCTCTATAGAAATC----G------------------GGCA----------------TCT--G--A----------------AGCC-GATTTTT---TTTTT-----ATTC---ATC-TCT-T--TTC-G-A--TC-TCATTA-AAGAACCGAT----ATgg
gi|19 : actgcgaaatatg--TG---A--TG--C----ACC--G-A-CCAC-TTT--TCTC-TG-G-AA-TCT---CTATGT-CTG--GGG-CATCTC-------TT-TT--ATCC-CATT-TATTCCTGGTt
gi|2 : TGCGACAAA---TTAAGAAT-AAA-TCAAGAAAAA--AAAA-------ATT------AT-TAAAA-TTA--ACG--CTT-GACTATTAAA---A-T--A-TGAAA--C----T--TTGTAGATAT---ATTACA-CCACCAATA-AGG-------TCATT---ATT----A--A-AATG-TT-CA-AA---G---TATATAACA------------------------GG-------------C----G------------------GCCA----------------TCT--G--A----------------AGCC-GA----T---TTTTT-----ATTAAAACTC-GCT-T--TTC-GAG--TAACC-GTA------GCGAT----ATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAACTA-T-----TTACAACCCCCCCCCCTCCATTTTCTTCT---G-AAAGG-ATGGA------TCATAG-CC-AAA--CT--GT---C---T-GA-ACGGG-GAAACA-G-A-GT-ACCA-GTGGC-ACTACTCCGGG-GCAAAATCAA-GGT-AG--GC-AGGA---CCGA---AG-CC-A--C---CA-C------GAAAA-GCTAC-AGG--GCACA-ATG-TGACCGCC-T---AGA--AT--G-G-T--GG-C-GCACA-TGC-TGAAATCGT-G-AT---CA-------GA-G-----GC-----TCC--AG------GCGAA-CGGCAA--------TC-TCCAC-CAT-TCCGCCGCCA-CGTA-CCT-----T-CAA-AAGG-A-AT-----AG---A-GG---A--T-C-T---G-GTT-TATCTG--CGTCATAC--ACTCAAA-C-ATCT--TA-GAC-CAC-TC-CACCCCATAT-G-A-CT-----------------C-A-GTATTCCT--C--GGGCTGCTTCCTC-------AGCCTACCAGAG---TTC-TGGA-TT-TTCCC-----A-AGTC-------AAC--GTTCCTGCC-G-GTC--TT--AAG---ACCC-ATC-G---GGAT---CTTTCTGGGTTCC-ACCTGTTA-GG---GA-AC-AAC--AATTCC-C---TCTT---CATGGAC-A-AT-TGG-C---GCT--C-----AA--G--CTCAA-C-GGC--T--AGCACCC---CTATTACA-A---------T-CT-TTCT---T--GCAACT-T-CG----CAAC-TCCGCAT-C-CT--AG-G-G-ACCCACTTC----ACCCA-GCG--CA-GC----ATCGG-GC-AGGAA---T--T---TC-A-CTA----------GC---A--T--GA-CA------G-TG-----CGA----GGGA----------AG--CA--GA--A-TC-TCAAGAAG---------CTTAAATCT-GGA-T-GCT---G---G-TT-C---AT---C--A----TA-AAT----C-TG-C---CAAC--TT---CCT-A------------GT---G----GG---GGGGG-C-A-T----A-A---G---GCT--ACGGACAT-TGG-T--GT-G-GA-CA---CA---T-A-T----C-T-----C--T-GA-GGC----CAACCTCCACCCCCAG----C--C-TCACG-TCCT-GGAG--AGT--C-C-----GCT-CTATCCACAAAAAGT-AGT--T---CCTATC--CC-NNN--N---NNNNNNN--NNNNNNNNN--NNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN-NNNNNN--NN-NNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNN-N--AGCC-ACATA--C-AGGTTTC-AAGCTAC-CTGTA-C-------A-T-C----------ATTCCCCAC-TGGATGGGAAATG--GGG--C-C--CGCA---ATA---AAAT---C----AC----CCAGTCC-CCCAA-T--A-T--TC-T-------A-AT-TT-C---------TG-----TC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---CGTTT-GCACACG--A-G---GTCC--TG-A-ACCTG-T-AAT--T--GC-A-C-----------TGT-AT-----A-TA-TCAT-T---GA-G-TG---TCGTCACCT------GGCCAGT--G------G--TG---A--TG--C----AGC--G-A-TCGC-TTT--CTTCCTG-G-AA-TCT---CTATCT-CTAGGGGG-CAT-TC-------AT-CCCGAGCC-CACTACATTCCCGGTtcctcggtccactcctctgattacctgtgcgattaaactccaacccaacctccgggttgctaccacgaaccatatcctccctactgtccttggaaacggagggcgctctggtttcatgtaggaatgtctattattcctnnnnnnn
gi|20 : ACAAAA--TTAAAACTAAAA-TC----------GAAATTTTTTTTTT------AT-TAAAAATCA--AC---CTTTAGCTA---AA---ACTTGA-TGAAAACT----T--TTGTAGACAT---ATTACA-T-AC-AATA-AGG-------TTTCC---ATTG-----------------A-AAG--G---TATATAACA------------------------TG-------------C----G------------------GCCA----------------TCTTGA--ATGGCGAACATCTTGGTAGCC-GA----T---TTTTTTTTTAATTT---TTC-TCA-T--TTT-G-A--TA-CT-TAA-A--AAGCGAT----c
gi|21 : atgaTGCGACAAAA--TTAAGAAT-AAA-TCA-GAAAAA--AAAA---------T------AT-TAAAAATTA--ACG--CTTTGACT----AA---A-TTGA-TGAAA--CTTTGT--TTGTAGATA----ATTACA-T-AC-CATA-AGGT------TTATT---ATTA---A--A-AATG-TT-CATAAA--G---TATATAA-A------------------------GG-------------C----G------------------GCCA----------------ACTTGG--A----------------AGCT-GA----T---TTTTT-----ATT-----TC-TCT-T--TTT-G-G--TA-CC-TTA-A--AAGCGAT----A
gi|23 : aa-AAA--G---TAAATAACA------------------------GG-------------A----G------------------GCCA----------------TCTTGG--A----------------AGTC-AA----TTTCTTTTT-----A-TT---CAC-CCTAT--TTC-T-G--TA-TC-TTA-A--TAGCGAT----Aa
gi|24 : CTCAATTA-TATAAAT-ACAGCTCCCCCC-----GTTTTCTC-T---G-AAAGG-AT-GGG---T-TCATTA-ACTATA--CT--G
gi|25 : CCA-A-G--CA-G-----ATCCG-GG-AGGAT---T--T---TC-A-CTA----------GC---A--T--GA-CA---A--G-TG-----CGA----GGTA-t
gi|26 : ccaC-CTCAG-C--A-T--GT-T-------A-TT-TT-C---------TG-----CC--C----TA-G-TA---TCCA---CCACGG-G---C-TTT-G
gi|27 : tC-TC-G-AT-C-CA--AG-G-G-A-----CTC----A-CCA-G-G--CA-G-----ATCC
gi|3 : TGGGACAAAA--TTAAGAAT-AAT-TCA-GA-----------------TTTTTGTACAT-TAAAAATCA--ACG--TTTTGACTA---AA---A-TTGA-TGACA--C----T--TTGTAGATAT---ATTACA-T-AC-GATA-AGGT------TTACC---ATTG---A--A-AATA-TT-CA-AAAG-G---TATATAACA------------------------TG-------------C----G------------------GTCATCTTGAATGGAGGCCATCTTGG--A----------------AGCC-GA----T---TTTTT-----ATTT---CTC-TCT-T--TTC-G-G--TA-CC-TTG-G--AAGCAAT----A
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Unaligned ( gi|22 ): GCTAGCTAGGAACCACCAAGGCTCAACCTCCCGGGCTGCTACACGATCCATATCCTCTCTAACTGTCCTCGGAAAAGTGGATGCCCTTAAACACCGCGCCTGTACTTCCTCGCAGCGCCGCTGGTTTTCACGT