lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111111111111111111111 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555 111111111111111111111 1111111 33333333333333333333 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1111111111111111 111 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 6666666666666666666666666666666 33333333333333333 1111111 1111111111111111111 555555555555 1 1 2 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 222222 111 22222 11 111 000000000000 111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 22222222222222222222 22222222222222 111111111111
lowQualScore : 6 0 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 55 1 666 22 666666666 44 99999999999 999999999999999999999999 22 1 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555 6666 777 444444 333 22 2 222 777777777777777777777 44 22 1 222 222 666 1 888888888888888888888 4444444 1 22 1 00000000000000000000 0 1 777 1 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 333 1 777777777 333 22 5555555555555555 33 222 11 44444444 000 1 22 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 0 1 2 22 666666666 1 55 22 888888888 33 1 333 44444 77777 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 0 2 2 3 9999999999999999999999999999999 33 66666 2 8888888 9999 3 00000000000000000 4 1111111 3 3 8888888888888888888 2 3 5 5 888888888888 7 6 0 3 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 8888 333333 333 0 1 00000 8 00 6 1 444 888888888888 6 99 111 8888 3 3 8 77 888888 4 6 3 1 55 22 3 22 8888888888 2 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 333 1 7777777777 22222222222222222222 22222222222222 666 777777777777 8
lowQualScore : . . ................................................................. . .. . ... .. ......... .. ........... ........................ .. . ........................................................ .... ... ...... ... .. . ... ..................... .. .. . ... ... ... . ..................... ....... . .. . .................... . . ... . ........................................................................ ... . ......... ... .. ................ .. ... .. ........ ... . .. ........................................................................................................................... . . . .. ......... . .. .. ......... .. . ... ..... ..... ........................................................................................ . . . . ............................... .. ..... . ....... .... . ................. . ....... . . ................... . . . . ............ . . . . ..................................................................................................................... .... ...... ... . . ..... . .. . . ... ............ . .. ... .... . . . .. ...... . . . . .. .. . .. .......... . .................................................................................................................................................................................. ... . .......... .................... .............. ... ............ .
lowQualScore : 0 2 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 33 5 777 66 444444444 44 00000000000 444444444444444444444444 22 6 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666 6666 666 888888 666 22 0 888 777777777777777777777 11 33 7 777 777 999 0 333333333333333333333 8888888 7 33 7 11111111111111111111 1 9 444 9 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 333 9 888888888 222 44 0000000000000000 99 444 99 88888888 000 5 00 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 3 7 4 00 222222222 5 55 00 000000000 55 6 000 33333 44444 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 1 2 1 3333333333333333333333333333333 44 22222 5 7777777 6666 6 88888888888888888 0 9999999 3 3 0000000000000000000 0 6 6 7 888888888888 0 0 0 3 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5555 000000 444 9 4 00000 0 66 4 8 000 222222222222 0 22 777 2222 2 2 6 99 777777 0 3 8 9 55 66 8 66 5555555555 0 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 222 8 5555555555 00000000000000000000 33333333333333 000 888888888888 9
consensus : GTCGATATCGAATCA--------------TGATCGTGTTT----------------CT-----T-ATGGG---TGTTTGATGGCTACAA-C--TTGCTGTCGA---TA--TC---------G--AC-----------GATAT-------CGT---GT---------CG--ATATC-GA-N-----T---------CAT--GATNGT------TT--T---N------------CT----TA---T------GGT--TGTTT--GACG---AC---TACAA--N----------T--TGC--T-ATCGA---T---ATCG---TCGA-----------T---------ATCGTG---TCGAT-ATCGAAT--C-AT--------------G-----ATCG-TG--TT-TC-------------T---A-T--------G-GT----------------TGTTT--N-A---C---T-NC---A---A-C------T--TG---C--TA----------------T--CGAT---ATC--G--------T---CGA-TA--TC-------------------CGA-AT--CAT-G----ATCGTGTTTT-----------C---------------T-TA-T-G-GTT--GTT---T---GA---C---TTC---A---------AACTTGCTAT-CGATATCGT--C---------GA-TATC-GTG--T---------CGAT--ATCGA-A---T-----CA-----TGATCG-------TN---------------T---T-------------C---T-----T-----A--TG-G----NT--G------------TTTGATGGC-TAC-AACTTGC----------T---A-------C-AT-GC-GT--CG-----AT-ATCG-------A----A-T-CG--T-----T-----TC-TCGT-G-T---T-GTT-TGACGG-----C----------TACAA-CTTGCTATCGATANCGTCGA-TATCGT-TTCGATATA--CGAATCATGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGACGGATAATGAGTTTGCCATCAAACA-CTCATAGGAAAAACGATCAAGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACGATATCGAT----A------GCAA-NNTGTAGCCATCAAACACCCATATTCTAAATTA-----T-TTGATGAACCGACA---TT-GT---------ATTTGT--TC---CCGA-AAGATAACCATTTTATGATAG--ATAATA--CG--TTCG-TAAGAAAT-CGAT-ATCGA-CA-C--GATAT-C--GT---------C-A------T--------G-N----------TA-T----TGT--C--G----AT-AT---CGT---C-----G--AC--ANC----GA-C--ATTG--N---AT--T-TGTTCTC---AAAAGACAAACATC-T------TA--T-GAC--------AG--------T--TCG-CAA-GTCGTCGA---TA-TCG---------ACA--------------------CGATATCG-----------T--C---GATATC-----------GATGTTG-TATTTG
Reference ( gi|1 ) : GTTAATATCGAATCA--------------AGACCATGTTT----------------CT-----T-ATTGG---TGCCTCCTGACTACAA-C--TTGCTGTCGA---TA--TC---------G--AC-----------GATAT-------TGT---TT---------CG--ATATC-GA-T-----T---------CAT--AATAGC------TT--T---G------------CT----TA---T------GGT--TGTTT--GACG---AC---TTTAA--A----------T--TGC--T-ATCGA---T---ATCG---TCAA-----------T---------ATCGTG---TGGAT-ATCGAAT--C-AT--------------A-----ATCG-TG--TT-TC-------------T---A-C--------G-GT----------------TGTTT--T-A---C---T-TC---A---A-C------T--TG---C--TA----------------T--CGAT---ATC--G--------T---CGA-TA--TC-------------------CGA-AT--CATAG----ATCGTGTTTT-----------T---------------T-TA-T-G-GTA--GTT---T---GA---C---TTC---A---------AACTTGCTAT-CGATATTGT--C---------GA-TATC-ATG--T---------CGAT--ATCGA-A---T-----CA-----TGAT-G-------TA---------------T---T-------------C---C-----T-----A--TG-G----CT--C------------TTTGATGAC-TAC-AACCTGC----------T---A------AC-AT-GTAAT--CG-----AT-ATCG-------A----A-T-TG--T-----T-----TC-TCGT-G-T---T-GTT-TGAAAG-----C----------TACAA-CTTGCTATCGATAACATCGA-TATCGT-TT---TAT--CCGAATCATGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGACAGATTATGAGTTTGCCATCAAATA-CTAATAGGAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACGATATCGAT----A------GCAA-TATGTAGTCACCAAACACCCATATTCTAAATTA-----T-TTGATGAACCGATA---TTTGTTC----TTTACTTGT--TC---CCTA-AAGATAACCATTTTATGGTAG--ATAATA--CG--TTCG-CAAGAAAT-CGAT-ATCGA-CA-C--GATAT-C--GT---------C-A------T--------G-C----------TA-T----TGT--C--G----AT-AT---CAT---C-----A--AC--AGG----GA-C--ATTG--A---AT--T-TGTTTTC---AAAAGACAAACATC-T------TA--T-GAC--------AG--------T--TCG-CAA-ATTGTCGA---TA-TCG---------ACA--------------------CGATATCG-----------T--C---GATATT-----------GATGTTG-TATTTG
gi|2 : GTCGATATTGAATCA--------------ATATCTTTTTT----------------CT-----TTACTGGG--TGTTTAATGGCTATAT-C--TTGCTGTCGA---TA--TC---------G--A
gi|4 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgatGTTGACATTGAATCA--------------TGATCGTGTTTTAAATCGCGTTT----CT-----T-ATGAA---TGTTTGATGGCTACAA-C--TTGCTGTCGA---TA--TC---------G--acgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|17 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgatatcgacgatatcgtcaaacacaacacgatatcgtaacgatatcgaaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtGTCGATATCGAATCC--------------TTATCGTGTTT-----------------T-----T-AT-GG---AGGTT--TGACTTCAA-C--TTGCTtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|8 : gatatcgtcgatatcgtGTTGATATCGAATCA--------------TGATCGTGTTTTTTAAATGTGTTTTCTCT-----T-ACTGGAAATGTTTGATGGCTACAAAC--TTGCTGCCGA---TA--TC---------G--a
gi|15 : gagtatgtccaagacacgatgtagatacgtatcgacgaattatcgtcaaacacaaacacggatatcgtaaacgatatcgaaaagtgaccttctggtggctagatatcaaacatgttagtgacgatgtcgtGTTGATATCGAATCATGATAGTGTTTTTTAAATCGTGTTT----------------CT-----T-ATGGA---TGTTCCATGGCTACAA-C--TTACtt
gi|3 : gttagtgacgatatcgtATATCGAATT---------------------TTTTT----------------CT-----C-GTGGT---TGTTTGACAGCTACAA-C--TTGCTATCGA---TA--AC---------A--TC-----------GCTAT-------CGT---TT---------CG--ATATC-GA-A-----T---------CAT--GAT
gi|5 : tcttatgggtgtttgatgactatagcctgctacatgtatcgATATCGAATCA--------------TGATTGTATTT----------------CC-----T-ATGGC---TGTTTGATGACTACAA-C--CTGCT--------------------------AC-----------A-----------TGT---AT---------CG--ATATC-G-----------------------AATTGT------GT--T---T------------CT----CG---T------GGT--TGTTT--GAAA---GC---TACAA--C----------T--TGT--T-ATCGA---T---AACA---TCGA-----------T---------ATCA-A---TGCATAAACGAAT--T-AT--------------G-----ATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataattagtttgccatcaaacagctataggaaaaacgatcaagattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaatatgtagccaccaaacacccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaataatctaaattatttgataccgacattgcatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataataagttcgtaagaaatcgatatcgacacgatatcgttatgttattgtcgataccgtcgacatcgatcattgtatgtgttttcaaaaaaacaaacatcttatgacagatactgagtttgcaagacgtcaatatcgacacgacatggtcacgttattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgtatttg
gi|9 : aacgtttgatgatggtactaattctatcgATAT-GAATCA--------------AGATCGT-TTT----------------CTCGTTAT-ATGGG---TGTTTAATGGCTATAT-C--T-GC-GTTGA---T---TC---------G--AC-----------GATAC--------GT---GT---------CG--ATATC-GA-----------------CAT--GATCGT------TTTCT---G------------TT----TC---T------TAT--TGTTT--AATG---GC---nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataatggatttgccatcaaacacccataggaaaaac
gi|2 : tAATCA--------------TGATTGTATTT----------------TC-----T-ATGGC---TGTTTAATGACTACAA-C--CTGCTGC-------A--T---------------------------ATAT------------------------CG--ATATC-GA-----------------------AT-GT------TT--T---T------------CC----CG---T------GGT--TGTTT--GAAA---GC---TACAA--AAATGTACAACT--TGC--T-ATCGA---TAAGATCG-----AG-----------T---------ATCGT----TTGAT-ACCGAAT--cgatatgcccaaacaccatattctaaattatattgatgaacgtattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacccgctcgacaag
gi|3 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT----------------CT-----T-ATGGG---TGTTTGATGACTATAG-C--CTGCT--------------------------AC-----------A-----------TGT---AT---------CG--ATATC-GAAT-----T---------T----------------TT--T---T------------CT----CG---T------GGT--TGTTT--GACA---GC---TACAA--C----------T--TGC--T-ATCGA---T---AACA---TCGC-----------T---------ATCGTT---TCGAT-ATCGAAT--C-AT--------------G-----ATattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|2 : -----T-ATGGG---TGTTTGGTGGCTACCT-A--TTGCTATCGA---TA--TCGTCAATATCG--AC-----------GATAT-------CGT---GT---------CG--ATATT-GA-A-----T---------C----AATATCTTT---TT--T---C------------TT----TAC--T------GGG--TGTTT--AATG---GC---TATAT--C----------T--TGC--T-GTCGA---T---ATCGAA-TCAT-----------G---------ATCGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataattagtttgccatcaaacagctataggaaaaacgatcaagattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaatatgtagccaccaaacacccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaataatctaaattatttgataccgacattgcatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataataagttcgtaagaaatcgatatcgacacgatatcgttatgttattgtcgataccgtcgacatcgatcattgtatgtgttttcaaaaaaacaaacatcttatgacagatactgagtttgcaagacgtcaatatcgacacgacatggtcacgttattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgtatttg
gi|7 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaa-----T-ATCGG---TGTTTGGTGGCTATAT-C--TTGCTGTCGA---TT--TC---------G--AC-----------GATAT-------CGT---AT---------CG--ATATT-GA-A-----T---------CGT--GATCGT------TT--T---T------------CA----TA---T------GAG--TGTTT--GATG---ttctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|19 : acagatagtgagttttc---TGTCTGATGACTACAA-C--CTGCTATCGA---TA--TC---------G--Attgtaaattatttgatactgacattgtatttgttccaaaaatagccatttatgacagataattagtttgcaagaagtcgatatcgacacgacatggtcaagttattttcggtatcgatgttgtaac
gi|6 : GACCAAAT-C--TTTC-GTCGA---TA--TC---------G--AC-----------GATAT-------CGa
gi|2 : cacacgtaattgaaattaccttctttgttgaattaagacctttcattcctcttttatttgtagttggacctataggaaaacttaacatacatgatacctttgtaaaacgactatatggacacgatatcgttatgccattcattgtACTTTAA-A--TTGCTATCGA---TA--TC---------G--TC-----------AATAT-------CGT---GT---------GT--ATATC-GA-A-----T---------CAT--GATCGT------AT--T---T------------CT----TA---C------GAT--TGTT-----CG---AC---TTCAG--C----------T--TTC--T-ATCTA---T---ATCG---TCGA-----------T---------TTCGcttagagacaatctggtgtatatgatagaaaatgacggtaaaatgacgatttcgatacgatatcgccatgctgttgtcgatattgt
gi|4 : tgcttatgtttgtttgacaACTTTAA-A--TTGCTATCGA---TA--TC---------G--TC-----------AATAT-------CGT---GT---------GT--ATATC-GA-A-----T---------CAT--GATCGT------AT--T---T------------CT----TA---C------GAT--TGTT-----CG---AC---TTCAG--C----------T--TTC--T-ATCTA---T---ATCG---TCGA-----------T---------TTCacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|3 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgatatcgacgatatcgtcaaacacaacacgatatcgtaacgatatcgaaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaTACAA-TGATCGATGTCGACGGTA--TC---------G--ACAATAACATAACGATAT-------CGT---GT---------CG--ATATC-GA-T-----T---------
gi|7 : tcttatgggtgtttgatgactatagcctgctacatgtatcgatatcgaatttttttctcgtggttgtttgacagctacaacttgctatcgataacatcgctatcgtttcgatatcgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataattagtttgccatcaaacagctataggaaaaacgatcaagattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaatatgtagccaccaaacacccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaataatctaaattatttgataccgacattgcatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataataagttcgtaagaTACAA-CA-TCGATACCGAAAATAACTT---------G--AC-----------CATGT-------CGT---GT---------CG--ATATC-GACT-----T---------C-----------------T--T---G------------CA----AAC--T------AAT--TATCT--GTCA----------TAA--A----------T--GGC--T-AT------T---TTTGGAACAAA-----------T---------ACAATG---TCAGT-ATCAAAT--A-ATTTACA---------AT----ATCGGTG--TT-T-----------------------------G-GT----------------GGCTA--T-A---T----------------C------T--TG---C--TG----------------T--CGAT---TTC--G--------A---CGA-TA--TCGTATCGATAT---------TGA-AT--CGT-G----ATCGT-TTTT-----------C---------------A-TA-T-GAGT---GTT---T---GA---T---GGA---A---------AACTCACTAT-Ctgtgttttcaaaaaaacaaacatcttatgacagatactgagtttgcaagacgtcaatatcgacacgacatggtcacgttattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgtatttg
gi|3 : acaTGTCGA---TA--TT---------G--AC-----------G-TCT-------TGCAAACT---------CA--GTATCTG--------T---------CAT--AAGA------------T---G------------TT----TG---T--------T--TTTTT--GAAA---ACACATACAATGA----------T--CGA--T-GTCGACGGT---ATCG---ACAA-----------T---------AACATA---ACGAT-ATCGTGT--CGAT--------------------ATCG--A--TT-TCT------------T---A-C--------G-ac
gi|4 : tcttatgggtgtttgatgactatagcctgctacatgtatcgatatcgaatttttttctcgtggttgtttgacagctacaacttgctatcgataacatcgctatcgtttcgatatcgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataattagtttgccatcaaacagctataggaaaaacgatcaagattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaatatgtagccaccaaacacccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaataatctaaattatttgataccgacattgcatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataataagttTCGA---TA--TC---------GTTAC-----------GATATCGTGTTGTGT---TTGA-------CG--ATATC-Gcgacatggtcacgttattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgtatttg
gi|14 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgatatcgaTCGA---TA--TC---------GTTAC-----------GATATCATGTTGTGT---TTGA-------CG--ATATC-Gaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|4 : agttatgcccaagactcgatgtagataagatatcgaCGA---TA--TC---------G--AC-----------GATAT-------CGT---CAAACACAACACG--ATATC-G--------T---------AAC--GATATCGAAAAGTT--A---C------------CT----TC---T------GGT--GGCT----ATG---ATA--TTCAA--A----------CAATGT--T-AGTGA---------------CGA-----------T---------GTCGTG---TTGAC-ATTGAAT--C-AT--------------G-----ATCG-TG--TT-TTAAATCGCGTTTCTT---A-T--------G-AA----------------TGTTT--G-ATGGC---T-AC---A---A-C------T--TG---C--TG----------------T--CGAT---ATC--G--------T---aaagtaaccttctggaagccatgataatcaaaca
gi|17 : agttatgttcaagacaggatgtagataGA---TA--TC---------G--TC-----------GATAT-------CGT---GT---------CG--ATATC-GA-A-----T---------CCT--TATCGT------GT--T----------------TT----TA---T------GGA--GGTTT-----G---AC---TTCAA--C----------T--TGC--T-Attcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|2 : ---------G--AC-----------GATAT-------CGT---GT---------CG--ATATC-GA-T-----TTGTTGCGAACGT--ATTATC------TA--T----------------CA----TAAAAT------GGT--TATCT--TTCGGGAAC------AA--A----------T---ACAAT-ATCGG---T----TCA---TCAA---------------------AT---------AAT-TTAGAAT----AT--------------G-----G--G-TG--TT-T-----------------------------G-GT----------------GGCT-----A---C---C-T--------A--------T--TG---C--TA----------------T--CGAT---ATC--G--------T---CAA-TA--TCGACGATATCGTGTCGATATTGA-AT--CA-AT----ATCTTTTTTC-----------T---------------T-TACT-G-GGT--GTT---T---AA--------------------------TGGCTAT---ATCTTGC---------------------TG--T---------CGAT--ATCGA-A---T-----CA-----TGATCG-------TT---------------T---T--------------------------------TG-G----GT--G------------TTTAATGGC-
gi|6 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagttt---------G--GC-----------GATAT-------CGT---AT---------CG--AAATC-G--------T---------CAT--TTTACCGTCA--TT--T---T------------CTATCATA---TACACCAGAT--TGTCTCTAAGG---AC---C--AA--A----------T--CTT--TCGTCGA---T---ATCG---ACGA-----------T---------ATC--------GAC-AATGAATGGC-AT--------------AACGATATCG-TG--TC-CA-------------T---A-T--------A-GT----------------CGTTT--T-A---C---atgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|8 : cacacgtaattgaaattaccttctttgttgaattaagacctttcattcctcttttatttgtagttggacctataggaaaacttaacatacatgataccttt---------G--AC-----------GATGT-------CGT---GT---------TG--ATATC-GA-A-----T---------CAT--GATCGTGTTT--TT--T---AAATGTGTTTTCTCT----TAC--T------GGAAATGTTT--GATG---GC---TACAA--AC---------T--TGC--T-GCCGA---T---ATCG---Tatgctgttgtcgatattgt
gi|15 : gagtatgtccaagacacgatgtagatacgtatcgacgaattatcgtcaaacacaaacacggatatcgtaaacgatatcgaaaagtgaccttctggtggctagatatcaaacatgttagt---------G--AC-----------GATAT-------CGT---GT---------TG--ATATC-GA-A-----T---------CAT--GATAGT------GT--T---T------------TT----TA---t
gi|9 : gttagtATATGG-----TGT---TT---------GGGCATATC-GA-TATGAAT---------CAA--GATCGT------TT--TCTCG------------TTA---TA---T------GGG--TGTTT--AATG---GC---TATA--------------TC-TGC----GTTGA---T----TCG---ACGA-----------T---------A-CGTG---TCGAT-ATCGA----C-AT--------------G-----ATCG-T---TT-TC-------------T----------------GT----------------T-TCT--T-A---T---T-aatcgtgtttcttatggatgttccatggctacaacttac
gi|5 : tgccattaaacAT-------TCT---AT---------CG--ATATC-GA-A-----T---------CAT--GATTGT------AT--T---T------------CC----TA---T------GGC--TGTTT--GATG---AC---TACAA--C----------C--TGC--T-A-------------CA---T--G-----------T---------ATCG--------AT-ATCGAAT--T--------------------------G-TG--TT-TC-------------TC--G-T--------G-GT----------------TGTTT--G-AAAGC---T-AC---A---A-C------T--TG---T--TA----------------T--CGAT---AAC--A--------T---CGA-TA--TC---------------------A-ATG-CATAA----Atctaaattatattgatgaacgtattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacccgctcgacaag
gi|8 : aacgtttgatgatggtactaT---TT---------CG--ATATC-G--T-----T---------TAC--GATATC------CG--T---G------------TT----TG---------------TGTTT--GACG---A------TAA--T----------T--CG------TCGA---T---A-CGTA-TCTA-----------C---------ATCGTGTCTTGGAC-ATcgaattatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataatggatttgccatcaaacacccataggaaaaac
gi|2 : gagt---------CA--ATATC-GG-T-----T---------CATCAAATAAT------TT--A---G------------AA----TA---T------GGG--TGTTT--GGTG---GC---TACCT--A----------T--TGC--T-ATCGA---T---ATCG---TCAA-----------TATCGACGATATCGTG---TCGAT-ATTGAAT--C-AA--------------T-----ATCT-TT--TT-TCTT-----------T---A-CT-------G-GG----------------TGTTT--A-ATGGC---T-AT---A---T-C------T--TG---C--TG----------------T--CGAT---AT---------------------------------------------CGA-AT--CAT-G----ATCG----TT-----------T---------------T-TG---G-GT---GTT---T---AA---T---GGC---A---------AACTCATTAT-CCATagtgaccttctggtggctagatatcaaacatgttagtgacgatgtcgtgttgatatcgaatcatgatcgtgttttttaaatgtgttttctcttactggaaatgtttgatggctacaaacttgctgccgatatcgtt
gi|7 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatg---------CA--ATGTC-AG-TA----T---------CA---AATAA-------TT--T---A------------CAA---TA---T------CGG--TGTTT--GGTG---GC---TATAT--C----------T--TGC--T-GTCGA---T---TTCG---ACGA-----------T---------ATCGTA---TCGAT-ATTGAAT--C-GT--------------G-----ATCG-TT--TT-TCA------------T---A-T--------G-AG----------------TGTTT--tatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|11 : acagatagtgagttttccatcGT------TT--T---G------------CT----TA---T------CGC---GTTT--GACG---AC---TTCAA--A----------T--TGC--T-Atatttgttccaaaaatagccatttatgacagataattagtttgcaagaagtcgatatcgacacgacatggtcaagttattttcggtatcgatgttgtaac
gi|4 : cannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattttcT--T---G------------CT----TA---T------GTT--TGTTT--GACA---AC---TTTAA--A----------T--TGC--T-ATCGA---T---ATCG---TCAA-----------T---------ATCGTG---TGTAT-ATCGAAT--C-AT--------------G-----ATCG-TA--TT-TCT------------T---A-C--------G-AT----------------TGTTC--G-A---C---T-TC---A---G-C------T--TT---C--TA----------------T--CTAT---ATC--G--------T---CGA-TT--TC-------------------
gi|2 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgatatcgacgatatcgtcaaacacaacacgatatcgtaacgatatcgaaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--T---G------------CT----TA---T------GTT--TGTTT--GACA---AC---TTTAA--A----------T--TGC--T-ATCGA---T---ATCG---TCAA-----------T---------ATCGTG---TGTAT-ATCGAAT--C-AT--------------G-----ATCG-TA--TT-TCT------------T---A-C--------G-AT----------------TGTTC--G-A---C---T-TC---A---G-C------T--TT---C--TA----------------T--CTAT---ATC--G--------T---CGA-T---TT-------------------CGA-
gi|3 : ------------CT----TA---T------GGG--TGTTT--GATG---AC---TATAG--C----------C--TGC--T-A-------------CA---T--G-----------T---------ATCG--------AT-ATCGAAT--T----------------------------TT--TT-TC-------------TC--G-T--------G-GT----------------TGTTT--G-A---CAGCT-AC---A---A-C------T--TG---C--TA----------------T--CGATAACATC--GCTATCGTTT---CGA-TA--T--------------------CGA-AT--CAT-G----ATcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|19 : t--TGTCT--GATG---AC---TACAA--C----------C--TGC--T-ATCGA---T---ATCG---nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataattagtttgccatcaaacagctataggaaaaacgatcaagattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaatatgtagccaccaaacacccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaataatctaaattatttgataccgacattgcatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataataagttcgtaagaaatcgatatcgacacgatatcgttatgttattgtcgataccgtcgacatcgatcattgtatgtgttttcaaaaaaacaaacatcttatgacagatactgagtttgcaagacgtcaatatcgacacgacatggtcacgttattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgtatttg
gi|6 : --T-GTCGA---T---ATCG---TCGA-----------T---------ATCGaa
gi|4 : cacacgtaattgaaattaccttctttgttgaattaagacctttcattcctcttttatttgtagttggacctataggaaaacttaacatacatgatacctttgtaaaacgactatatggacacgatatcgttatgccattcatCGA---T---ATCG---TCAAACACAACACGAT---------ATCGTA---ACGAT-ATCGAAA--A-GT--------------T-----ACC-------T-TC-------------T---GGT--------G-GC----------------TATGA--T-A-------T-TC---A---A-A------CAATG---T--TAG---------------TGACGAT---GTC--G--------TGT-TGA-CA--TT--------------------GA-AT--CAT-G----ATCGTGTTTTAAATCGCGTTTC---------------T-TA-T-G-AAT--GTT---T---GATGGC---TAC---A---------A-CTTGCTGT-CGATATCGT--acgaaagatttggtccttagagacaatctggtgtatatgatagaaaatgacggtaaaatgacgatttcgatacgatatcgccatgctgttgtcgatattgt
gi|6 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgatatcgaCAA---T---ATCG---ACAA-----------C---------AGCATG---GCGAT-ATCGTAT--C-GA--------------A-----ATCG-TC--AT-TT-------------T---A-C--------C-GT----------------CATTT--T-----C---TATC---ATATA-CACCAGAT--TGTCTC--TAAGGACCAAATCTTTCGT--CGAT---ATC--G--------A---CGA-TA--TCGACAA--------------TGA-ATGGCATAACGATATCGTG--TC-----------C---------------A-TA-T-A-GTC--GTT---T---TA---C---ttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|17 : cacacgtaattgaaattaccttctttgttgaattaagacctttcattcctcttttatttgtagttggacctataggaaaacttaacatacatgatacctttGA---T---ATCG---TCGA-----------T---------ATCGTG---TCGAT-ATCGAAT--C-CT--------------T-----ATCG-TG--TT-TT-------------T---A-T--------G-GA----------------GGTTT--G-A---C---T-TC---A---A-C------T--TG---C--TA----------------t
gi|8 : GA---T---ATCG---TAAA-----------C--------------------GAT-ATCGAA---------------------A-----A--G-TGACCT-TC-------------T--------------G-GT----------------GGCTA--G-A---T---A-TC---A---AAC------A--TG---T--TAG---------------TGACGAT---GTC--G--------TGT-TGA-TA--TC--------------------GA-AT--CAT-G----ATCGTGTTTT-----------TTAAATGTGTTTTCTCT-TACT-G-GAAATGTT---T---GATGGC---TAC---A---------AACTTGCTGC-CGATATCGT--
gi|2 : gagtatgtccaagacacgatgtagatacgtatcgacgaattatcgtcaaacacaaacacgCGA-----------T---------ATCGTG---TCGAT-ATCGATT--T-GTTGCG----------A-----A-CG-TA--TTATC-------------T---A-TCATAAAATG-GT----------------TATCT--T-----------TCGGGA---A-C------AAATA---CAATA----------------T--CGGT----TC--A--------T---CAAATAATTT-------------------AGA-AT---ATGG-------GTGTTT-----------------------------------G-GTG--GCT--------A---C---CT---------------A-TTGCTAT-CGATATCGT--CAATATCGACGA-TATC-GTG--T---------CGAT--ATTGA-A---T-----CA-------AT-A-------TC---------------T---TTTTTC--------T---T-----T-----AC-TG-G----GT--G------------TTTAATGGC-TAT-ATCTTGC----------T-------------------GT--CG-----AT-ATCG-------A----A-T-CA--TGATCGT-----TT-TTG--G-G---T-GTT-TAATGG-----C-----------A-AA-CTCATTATCCATt
gi|8 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgCGA-----------T---------GTCGTG---TTGAT-ATCGAAT--C-AT--------------G-----ATCG-TG--TT-TT-------------TTAAA-T--------GTGTTTTCTCTTACTGGAAATGTTT--G-ATGGC---T-ACA--A---A-C------T--TG---C--TG----------------C--CGAT---ATC--G--------T---tcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|15 : gagtatgtccaagacacgatgtagatacgtatcgacgaattatcgtcaaacacaaacacggatatcgtaaacgatatcgaaaagtgaccttctggtggctagatatcaaacatgttagtgaCGA-----------T---------ATCGTG---TTGAT-ATCGAAT--C-ATGATAGTGTTTTTTAA-----ATCG-TG--TT-TCT------------T---A-T--------G-GA----------------TGTTC--C-ATGGC---T-AC---A---A-C------T--TA---C--t
gi|5 : gttagtgaGAT-ATCGAAT--C-AT--------------G-----ATTG-TA--TT-TCC------------T---A-T--------G-GC----------------TGTTTGATGA---C---T-AC---A---A-C------C--TG---C--TA----------------C----AT---GT---A--------T---CGA-TA--TC--------------------GA-AT--T-----------GTGTTTC-----------T---------------C--G-T-G-GTT--GTT---T---GAAAGC---TAC---A---------A-CTTGTTAT-CGATAACAT--C---------GA-TATCAATG--C-----------ATA-AACGA-A---T-----TA-----TGAT-
gi|2 : aacgtttgatgatggtactaattctatcAAT--C-AT--------------G-----ATTG-TAT-TT-TC-------------T---A-T--------G-GC----------------TGTTTAATGA---C---T-AC---A---A-C------C--TG---C--TG----------------C----AT---AT---A--------T---CGA-TA--T--------------------CGA-AT--------------GT-TTTT-----------C---------------C-CG-T-G-GTT--GTT---T---GAAAGC---TAC---AAAAATGTACAACTTGCTAT-CGATAAGAT--C---------GAGTATC-GT---T---------TGAT--ACCGA-A---T-----AT-----TGAT-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataatggatttgccatcaaacacccataggaaaaac
gi|2 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-------------T---A-T--------G-TT----------------TGTTT--G-A---CAACT-TT---A---A-A------T--TG---C--TA----------------T--CGAT---ATC--G--------T---CAA-TA--TCGTGTGTATAT---------CGA-AT--CAT-G----ATCGTA-TTT-----------C---------------T-TA-C-G-ATT--GTT---C---GA---C---TTC-------------AGCTTTCTAT-CTATATCGT--C---------GA-TTTC-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|3 : tgct-------------T---A-T--------G-GG----------------TGTTTGATGA---C---T-AT---A---G-C------C--TG---C--TA----------------C----AT---GT---A--------T---CGA-TA--TC--------------------GA-AT---------------TTTTTT-----------C---------------T-CG-T-G-GTT--GTT---T---GA---CAG-CTA---C---------AACTTGCTAT-CGATAACAT--C---------GC-TATC-GTT--T---------CGAT--ATCGA-A---T-----CA-----TGAT-gacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|4 : tct-------------T---A-T--------G-TT----------------TGTTT--G-A---CAACT-TT---A---A-A------T--TG---C--TA----------------T--CGAT---ATC--G--------T---CAA-TA--TCGTGTGTATAT---------CGA-AT--CAT-G----ATCGTA-TTT-----------C---------------T-TA-C-G-ATT--GTT---C---GA---C---TTC-------------AGCTTTCTAT-CTATATCGT--C---------GA-TTTC-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataattagtttgccatcaaacagctataggaaaaacgatcaagattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaatatgtagccaccaaacacccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaataatctaaattatttgataccgacattgcatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataataagttcgtaagaaatcgatatcgacacgatatcgttatgttattgtcgataccgtcgacatcgatcattgtatgtgttttcaaaaaaacaaacatcttatgacagatactgagtttgcaagacgtcaatatcgacacgacatggtcacgttattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgtatttg
gi|19 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgatatcgacgatatcgtcaaacacaacacgatatcgtaacgatatcgaaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgct-A---C---T-AC---A---A-C------C--TG---C--TA----------------T--CGAT---ATC--G--------
gi|5 : tgtctgatg---C--TA----------------T--CGAT---AT---------------------------------------------CGA-AT--CAT-G----ATTGTA-TTT-----------C---------------C-TA-T-G-GCT--GTTTGAT---GA---C---TAC-------------AACCTGCTA-----------------------------C-ATGTAT---------CGAT--ATCGA-A---T------------TG-T-G-------T----------------T---T-------------C---T-----C-----G--TG-G----TT--G------------TTTGAAAGC-TAC-AACTTGT----------T---A------TCGAT-AACAT--CG-----AT-ATCA-------A----aa
gi|6 : aacgtttgatgatggtactaatt--TG----------------T--CGAT---ATC--G--------T---CGA-TA--TCGA-----------------CGA-Atgcataaacgaattatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataatggatttgccatcaaacacccataggaaaaac
gi|17 : cacacgtaattgaaattaccttctttgttgaattaagacctttcattcctcttttatttgtagttggacctataggaaaacttaacatacatgatacctttgtaaaacgactatatggacacgatatcgttatgccattcat----------------T--CGAT---ATC--G--------TGT-CGA-TA--TC--------------------GA-AT--CCT-T----ATCGTGTTTT-----------T------------------A-T-G-GAG--GTT---T---GA---C---TTC-------------AACTTGCTAagatttggtccttagagacaatctggtgtatatgatagaaaatgacggtaaaatgacgatttcgatacgatatcgccatgctgttgtcgatattgt
gi|2 : gatatcg--CGAT---ATC--G--------T---CGA-TA--TTGA-----------------CGATAT--C---G----ATAGCA----------------------------------A-TAG-GTA--GCC--------A---C-----C---A---------AAC-----AC-CCATATT----C---------TA-AATT-AT---T---------TGATGAACCGATA---T-----TG-----T-AT-T-------TG---------------T---T-------------C---C-----CGAAAGA--TA-A----CC--A------------TTTTATGATAGAT-AATACGT----------TCGCA------AC-A----AAT--CG-----AT-ATCG-------AC---A-C-GA--T-----A-----TCGTCAT-G-C---T-ATT---AAAA-----A----------TA-----TTG---TCGATATCGTCGA-TATCG
gi|4 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgaca--CGAT---ATC--G--------TAA-CGA-TA--TC--------------------GA-A-------A----A----GTTAC-----------C---------------T-TC-T-G-GTG--GCTA--T---GA---TA--TTC---A---------AAC-----AA-TGTTAGTGA--C---------GA-TGTC-GTG--T---------TGAC--ATTGA-A---T-----CA-----TGATCG-------TG---------------T---TTTAAATCGCGTTTC---T-----T-----A--TG-A----AT--G------------TTTGATGGC-TAC-AACTTGC----------T-------------------GT--CG-----AT-ATCG-------atgttgcattt
gi|4 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgatatcgacgatatcgtcaaacacaaca--CGAT---ATC--G--------T---CGA-TA--T--------------------CGT-AT--C-TAC----ATCCTGTCTT-----------tttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|15 : agttatgttc--CGAT---ATCGTG--------T---TGA-TA--T--------------------CGA-AT--CAT-G----ATAGTGTTTT-----------T---------------T-tcaaacacaacacgatatcgtaacgatatcgaaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|14 : gttagtga--CGAT---ATC--G--------T---CGA-TA--TC-------------------TT--AT--C-TAC----ATCGAGTCTT-----------aaatcgtgtttcttatggatgttccatggctacaacttac
gi|13 : agttatgccc--CGAT---ATT--G--------T---CGA-TA---C-------------------CGT-AT--C-TAC----ATTGTGTCTT-----------tcaaacacaacatgatatcgtaacgatatcgaaaagtaaccttctggaagccatgataatcaaaca
gi|8 : cagttatgtcgGAT---ATC--G--------TAAACGA-TA--TC--------------------GA-AA--AGT-G----ACC----------------------------------T-TC-T-G-GTG--GCT---A---GA---T---ATC---A---------AACATGTTAG-TGA--------C---------GA-TGTC-GTG--T---------TGAT--ATCGA-A---T-----CA-----TGATCG-------TG---------------T---T-------------T---T-----TTAA--A--TGTGTTTTCT--CTTACTGGAAATGTTTGATGGC-TACAAACTTGC----------T-------------------GC--CG-----AT-ATCG-------tcaaacagaacatgatatcgaaacaaaataaaagtaaccttctggtggctttgataatcaaataat
gi|9 : gagtatgtccaagacacgatgtagatacgtatcgacgaattatcgtcaaacacaaacacg--------T---CGA-TA--T---------------------GA-AT--CA-AG----ATCGTTTTCTCG---------T---------------TATA-T-G-GGT--GTT---TAATGG---C---T-----A---------TATCTGC-GT-TGAT-TCGA--C---------GA-TA-C-GTG--T---------CGAT--ATCGA-----------CA-----TGATCG-------TT---------------T---T-------------C---tt
gi|2 : tgccattaaacaataagaaaca---------------T-TA-T-G-TTT--GTT---T---GA---CAACTTT---A---------AA-TTGCTAT-CGATATCGT--C---------AA-TATC-GTG--T---------GTAT--ATCGA-A---T-----CA-----TGATCG-------TAT--------------T---T-------------C---T-----T-----A--CG-A----TT--G------------TT---CGAC-TTC-AGCTTTC----------T---A------TCTAT-ATCGT--CG-----AT-TTCG-------A----tatgcccaaacaccatattctaaattatattgatgaacgtattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacccgctcgacaag
gi|4 : tgc---------------T-TA-T-G-TTT--GTT---T---GA---CAACTTT---A---------AA-TTGCTAT-CGATATCGT--C---------AA-TATC-GTG--T---------GTAT--ATCGA-A---T-----CA-----TGATCG-------TAT--------------T---T-------------C---T-----T-----A--CG-A----TT--G------------TT---CGAC-TTC-AGCTTTC----------T---A------TCTAT-ATCGT--CG-----AT-TTCcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|14 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgatatcgacgatatcgtcaaacacaacacgatatcgtaacgatatcgaaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgc---T---GG---C---TTCCAGA---------AGGTTACTTTTCGATATCGTTAC---------GA-TATC-ATG--TTGTGTTTGACGAT--ATCG
gi|7 : agttatgcccaagactcgatgtagataagatatcgaCTTGCTGT-CGATTTCGA--C---------GA-TATC-GTA--T---------CGAT--ATTGA-A---T-----CG-----TGATCG-------TT---------------T---T-------------T---CA----T-----A--TG-A----GT--G------------TTTGATGtgataatcaaaca
gi|16 : acagatagtgagttttcTAT-CGA-ATTGT------------GA-T--C-ATG--T---------TT-T--ATTAA-A---T-----CA-----TGCT------------------------------T-------------C---A-----T-----A--TG-G----AT--G------------TTTGATGGC-TAC-AACTTGatatagccaccaaacaccgatattgtaaattatttgatactgacattgtatttgttccaaaaatagccatttatgacagataattagtttgcaagaagtcgatatcgacacgacatggtcaagttattttcggtatcgatgttgtaac
gi|4 : acaatgttaatgacga-CGATATCGT--C---------GA-TATC-GTA--T---------CTAC--ATC
gi|14 : agttatgttcaagacag-CGATATCGT--C---------GA-TATC-TTA--T---------CTAC--ATCGA-G---T-----CT-----TGtcaaacacaacacgatatcgtaacgatatcgaaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|13 : agttatgcc-CGATATTGT--C---------GA-TACC-GTA--T---------CTAC--ATTGtcaaacacaacatgatatcgtaacgatatcgaaaagtaaccttctggaagccatgataatcaaaca
gi|17 : cagttatgtcgaagacaGATATCGT--C---------GA-TATC-GTG--T---------CGAT--ATCGA-A---T-----CC-----TTATCG-------TG---------------T---T-------------T---T-----T-----A--TG-G----AG--G------------TT---TGAC-TTC-AACTTGC----------T---A------tcaaacagaacatgatatcgaaacaaaataaaagtaaccttctggtggctttgataatcaaataat
gi|15 : TAGTGA--C---------GA-TATC-GTG--T---------TGAT--ATCGA-A---T-----CA-----TGATAG-------TGTTTTTTAAATCGTGTT---T-------------C---T-----T-----A--TG-G----AT--G------------TTCCATGGC-TAC-AACTTAC----------
gi|6 : gtATTGT--C---------GA-TATC---G--T---------CGAT--ATCGA-
gi|7 : cacacgtaattgaaattaccttctttgttgaattaagacctttcattcctcttttatttgtagttggacctataggaaaacttaacatacatgatacctttgtaaaacgactatatggacacgatatcgttatgccattcTTGA--C---------CA-TGTC-GTG--T---------CGAT--ATCGA-C---TTCTTGCAAAC--TAAT---------TA---------------TCTGT-------------C---A-----T-----AAATG-G----CTATT------------TTTG--GA---AC-AA-----------------------------AT-ACAATGTCA-----GT-ATCA-------A----A-T-AA--T-----T-----TA-CAAT-A-TCGGT-GTT-TGGTGG-----C----------TATAT-CTTGCTGTCGATTTCGACGA-TATCGT-ATCGATAT---TGAATCGTGATcgaaagatttggtccttagagacaatctggtgtatatgatagaaaatgacggtaaaatgacgatttcgatacgatatcgccatgctgttgtcgatattgt
gi|3 : acagatagtgagttttccatcaaacactcatatgaaaaacg--C---------GA-TATC-GTG--T---------CGAT--ATCGA-gttattttcggtatcgatgttgtaac
gi|4 : tcttatgggtgtttgatgactatagcctgctacatgtatcgatatcgaatttttttctcgtggttgtttgacagctacaacttgctatcgataacatcgctatcgtttcgatatcgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataattagtttgccatcaaacagctataggaaaaacgatcaagattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaatatgtagccaccaaacacccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaataatctaaattatttgataccgacattgcatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataataagttcgtaagaaa--C---------GA-TATC-GTA--A---------CGAT--ATCGA-AAAGT-----TACCTTCTGGT-GGCTATGATA---------------T---T-------------CAAAC-----A-----A--TG------------------------TTAGTGAC-GAT-GTCGTGT----------T---G------AC-AT-TGAAT--C------ATGATCGTGTTTTAA----A-T-CGCGT-----T-----TC-TTAT-G-AA--T-GTT-TGATGG-----C----------TACAA-CTTGCTGTCGATAttatgttattgtcgataccgtcgacatcgatcattgtatgtgttttcaaaaaaacaaacatcttatgacagatactgagtttgcaagacgtcaatatcgacacgacatggtcacgttattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgtatttg
gi|3 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgatatcgacgatatcgtcaaacacaacaC-ATG--TAT-------CGAT--ATCGA-A---T---------------T-T-------TT---------------T---T-------------C---T-----C-----G--TG-G----TT--G------------TTTGACAGC-TAC-AACTTGC----------T---ATCGATAAC-ATCGCTAT--CGTTTCGAT-ATCG-------A----A-T-tcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|9 : tcttatgggtgtttgatgactatagcctgctaC-ATA--T---------CGAT--AT-GA-A---T-----CA-----AGATCG-------TT---------------T---T-------------C---TCGTTAT-----A--TG-G----GT--G------------TTTAATGGC-TAT--ATCTGCGTTGATTCGAC---G------AT-AC-GT-GT--CG-----AT-ATCG-------ACATGA-T-CG--T-----TTTCTGTT-TCTT-A-T---T-GTT-TAAcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataattagtttgccatcaaacagctataggaaaaacgatcaagattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaatatgtagccaccaaacacccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaataatctaaattatttgataccgacattgcatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataataagttcgtaagaaatcgatatcgacacgatatcgttatgttattgtcgataccgtcgacatcgatcattgtatgtgttttcaaaaaaacaaacatcttatgacagatactgagtttgcaagacgtcaatatcgacacgacatggtcacgttattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgtatttg
gi|5 : tgccaTA--T---------CGAT--ATCGA-A---T-----CA-----TGATTG-------TA---------------T---TT------------C---C-----T-----A--TG-G----CT--G------------TTTGATGAC-TAC-AACCTGC----------T---A-------C-AT-GTA-T--CG-----AT-ATCG-------A----A-T-TG--TGT---T-----TC-TCGT-GGT---T-GTT-TGAAAG-----C----------TACAA-CTTGTTATCGATAACATCGA-TATCAA-TG---CATAAACGAATTATGATcccaaacaccatattctaaattatattgatgaacgtattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacccgctcgacaag
gi|2 : aacgtttgatgatggtactaattcA-A---T-----CA-----TGATTG-------TA---------------T---T-------------TT--C-----T-----A--TG-G----CT--G------------TTTAATGAC-TAC-AACCTGC----------T----------GC-AT-AT-AT--CG-----AT-ATCG-------A----A-TGTT--T-----T-----TC-CCGTGG-T---T-GTT-TGAAAG-----CTACAAAAATGTACAA-CTTGCTATCGATAAGATCGAGTATCGT-TT---GATA-CCGAATATTGATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataatggatttgccatcaaacacccataggaaaaac
gi|3 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---T-------------C---T-----T-----A--TG-G----GT--G------------TTTGATGAC-TAT-AGCCTGC----------T----------AC-AT-GT-AT--CG-----AT-ATCG-------A----ATT-TT--T-----T-----TC-TCGTGG-T---T-GTT-TGACAG-----C----------TACAA-CTTGCTATCGATAACATCGC-TATCGT-TTCGATAT---CGAATCATGATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|19 : ------------TCTGATGAC-TAC-AACCTGC----------T-------------------AT--CG-----AT-ATCG-------A----A-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataattagtttgccatcaaacagctataggaaaaacgatcaagattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaatatgtagccaccaaacacccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaataatctaaattatttgataccgacattgcatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataataagttcgtaagaaatcgatatcgacacgatatcgttatgttattgtcgataccgtcgacatcgatcattgtatgtgttttcaaaaaaacaaacatcttatgacagatactgagtttgcaagacgtcaatatcgacacgacatggtcacgttattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgtatttg
gi|17 : tgT--CG-----AT-ATCG-------A----A-T-C---C-----T-----TA-TCGT-G-T---T-TTTATGGAGGTTTGAC----------TTCAA-CTTGCTA
gi|4 : gatatcgtcgatatcgtg--T-----T-----GC-TTAT-G-T---TTGTT-TGACAA-----C----------TTTAA-ATTGCTATCGATATCGTCAA-TATCGTGTG---TATA-TCGAATCATGAT
gi|8 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgatatcgacgatatcgtcaaacacaacacgatatcgtaacgatatcgaaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---T-GTT-TGATGG-----C----------TACAAACTTGCTGCCGATAcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|19 : gagtatgtccaagacacgatgtagatacgtatcgacgaattatcgtcaaacacaaacacggatatcgtaaacgatatcgaaaagtgaccttctggtggctagatatcaaacatgttagtgacgatgtcgtgttgatatcgaatcatgatcgtgttttttaaatgtgttttctcttactggaaa---T-GTC-TGATGA-----C----------TACAA-CCTGCTATCGAT---ATCGA-tcgtt
gi|3 : ATATGACAGATAATTAGTTTGCCATCAAACAGCT-ATAGGAAAAACGATCAAGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----A------GCAA-TATGTAGCCACCAAACACCCATa
gi|5 : tcttatgggtgtttgatgactatagcctgctacatgtatcgatatcgaatttttttctcgtggttgtttgacagctacaacttgctatcgataacatcgctatcgtttcgatatcgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATATGACAGATAATGGATTTGCCATCAAACA-CCCATAGGAAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaataatctaaattatttgataccgacattgcatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataataagttcgtaagaaatcgatatcgacacgatatcgttatgttattgtcgataccgtcgacatcgatcattgtatgtgttttcaaaaaaacaaacatcttatgacagatactgagtttgcaagacgtcaatatcgacacgacatggtcacgttattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgtatttg
gi|2 : aacgtttgatgatggtactaattctatcgatatcgaatcatgattgtatttcctatggctgtttgatgactacaacctgctacatgtatcgatatcgaattgtgtttctcgtggttgtttgaaagctacaacttgttatcgataacatcgatatcaatgcataaacgaattatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTATGATGGATAATGAGTTTGCCATTAAACA-Cac
gi|7 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngACAGATAGTGAGTTTTCCATCAAACA-CTCATATGAAAAccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|2 : GACGATATCGAT----A------GCAA-TAGGTAGCCACCAAACACCCATATTCTAAATTA-----T-TTGATGAACCGATA---TT-GT---------ATTTGT--TC---CCGA-AAGATAACCATTTTATGATAG--ATAATA--CG--TTCG-CAACAAAT-CGAT-ATCGA-CA-C--GATAT-C--GT---------C-A------T--------G-CTATTAAAAA-TA-T----TGT--C--G----AT-AT---CGT---C-----G--AT--ATC----GA-T--GTTG--C---AT--T-Tacgatcacgattcaatatcgatacgatatcgtcgaaatcgacagcaagatatagccaccaaacaccgatattgtaaattatttgatactgacattgtatttgttccaaaaatagccatttatgacagataattagtttgcaagaagtcgatatcgacacgacatggtcaagttattttcggtatcgatgttgtaac
gi|2 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattGACGATATCGAT----A------GCAA-TTTAAAGTTGTCAAACAAACATA
gi|4 : tgctACGATATCGAC----A------GCAA-GTTGTAGCCATCAAACATTCATAaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|9 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgatatcgacgatatcgtcaaacacaacacgatatcgtaacgatatcgaaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttctACGATCTTGATTCATA------TCGA-TATGC-----CCAAACACC-ATATTCTAAATTA-----TATTGATGAAC--GTA---TT-GT---------ATTTGT--TC---CCGA-AAGATAACCATTTTATGATAG--ATAATACCCG--CTCGACAAGttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|8 : tgccattaaacaataagaaacagaaaacgatcatgtcgatatcgacacgtatcgtcgaatcaacgcagatatagccattaaacacccatataacgagaaaACGATATCGGC----A------GCAAGTTTGTAGCCATCAAACA
gi|3 : gagtatgtccaagacacgatgtagatacgtatcgacgaattatcgtcaaacacaaacacggatatcgtaaacgatatcgaaaagtgaccttctggtggctagatatcaaacatgttagtgacgatgtcgtgttgatatcgaatcatgatcgtgttttttaaatgtgttttctcttactggaaaCGATATCGAT----ACATGTAGCAG-GCTATAGTCATCAAACACCCATAt
gi|5 : tctCGATATCGAT----ACATGTAGCAG-GTTGTAGTCATCAAACAGCCATAaatttttttctcgtggttgtttgacagctacaacttgctatcgataacatcgctatcgtttcgatatcgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataattagtttgccatcaaacagctataggaaaaacgatcaagattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaatatgtagccaccaaacacccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaataatctaaattatttgataccgacattgcatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataataagttcgtaagaaatcgatatcgacacgatatcgttatgttattgtcgataccgtcgacatcgatcattgtatgtgttttcaaaaaaacaaacatcttatgacagatactgagtttgcaagacgtcaatatcgacacgacatggtcacgttattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgtatttg
gi|7 : aacgtttgatgatggtactaattctatcgatatcgaatcatgattgtatttccCGAAATCGAC----A------GCAA-GATATAGCCACCAAACACCGATATTGTAAATTA-----T-TTGAT--ACTGACA---TT-GT---------ATTTGT--TC---C--A-AAAATAGCCATTT-ATGACAG--ATAATT--AG--TTTG-CAAGAAGT-CGAT-ATCGA-CA-C--GACAT-G--GT---------C-A------A--------G-T----------TA-T----TTT--C--G----GT-AT---Caattgtgtttctcgtggttgtttgaaagctacaacttgttatcgataacatcgatatcaatgcataaacgaattatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataatggatttgccatcaaacacccataggaaaaac
gi|19 : acagatagtgagttttccatcaaacactcatatgaaaaacgatcacgattcaatatcgatacgatatcgtCGATATCGAT----A------GCAG-GTTGTAGTCATCAGACAgatgttgtaac
gi|6 : CACACGTAATTGAAATTACCTTCT-TTGTTGAATTAAGACCTTTCATTCCTCTTTTATTTGTAGTTGGACCTATAGGAAAAC----TTAACATAC--ATGATA--CC--TTTG-TAAAACGA-CTAT-ATGGA-CA-C--GATAT-C--GT---------T-A------T--------G-CCATT------CA-T----TGT--C--G----AT-AT---CGT---C-----G--AT--ATC----GA-C-----G--AAAGAT--T-TGGTCCT---TAGAGACA---ATC-TGGTGTATA--T-GAT--------AGAAAA----TGACGG-TAA-AATGACGA---TT-TCG---------ATA--------------------CGATATCG-----------C--C----ATGCT-----------GTTGTCGATATTaa
gi|3 : ATAATCTAAATTA-----T-TTGAT--ACCGACA---TT-GC---------ATTTGT--TC---CCGA-AAGATAACCATTTTATGATAG--ATAATA--AG--TTCG-TAAGAAAT-CGAT-ATCGA-CA-C--GATAT-C--GT---------T-A------T--------G-T----------TA-T----TGT--C--G----AT-AC---CGT---C-----G--AC--ATC----GATC--ATTG--T---AT--G-TGTTTTCA--AAAAAACAAACATC-T------TA--T-GACAGATACTGAG--------T--TTG-CAA-GACGTCAA---TA-TCG---------ACACGACATGGTCACGTTATTGTCGATATCG-----------T--C---GATATC-----------GATGTTG-TATTTGgt
gi|10 : tcttatgggtgtttgatgactatagcctgctacatgtatcgatatcgaatttttttctcgtggttgtttgacagctacaacttgctatcgataacatcgctatcgtttcgatatcgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataattagtttgccatcaaacagctataggaaaaacgatcaagattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaatatgtagccaccaaacacccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaTTGG--TC---CTTG-AAAACAATCAT---ATG----------TA--CGACTTCG-TAAGATGA-CAAT-ATCTA-CA-C--AATAC-C--CT---------C-A------T--------G-C----------TA-C----TGT--C--A----AT-ATTGACAT---C-----AT-AC--TTG----GT-C--AATGAAA---AT--CGTGTTGT----ATATGGTAACC------------A--T-AAC------------------T--TTG-TTA-GATGAGGA---TATTTG---------TCA--------------------AGCTATTG-----------T--T---GATATT-----------GACATTGTTATTTG
gi|4 : GTAGCCATCAAA--CA--TTCA-TAAGAAACGCGAT-TTAAAACA-C--GAT-----------------C-A------T--------G-------------A-T----T----C--A----AT-GT---CAA---C-----ACGAC--ATC----GT-C--ACTA--A---CA--T-TGTTT------------GAATATC-A------TAGCC-ACC--------AG--------A--AGG-TAA-CTTTTCGA---TA-TCG---------TTA--------------------CGATATCG-------------------------------------TGTTG-TGTTTGgtctt
gi|2 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgatatcgacgatatcgtTCG-TAAGAAATACGATCAT-GA-TT-C--GATATAC--A----------C-A------C--------G-A----------TA-T----TGA--C--G----AT-------AT---C-----G--AT--AGC----AA-T---TTA--A---A------GTTGTC---AA---ACAAACATaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|4 : tgcttTCG-TAAGAAATACGATCAT-GA-TT-C--GATATAC--A----------C-A------C--------G-A----------TA-T----TGA--C--G----AT-------AT---C-----G--AT--AGC----AA-T---TTA--A---A------GTTGTC---AA---ACAAACATttgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|9 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgatatcgacgatatcgtcaaacacaacacgatatcgtaacgatatcgaaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgctt-CGAGAAAA-CGAT-CTTGA-TT-C---ATAT-C--GA---------T-A------T--------G-CCCAAACACCATA-T----TCT--A--A----ATTAT----AT---T-----G--AT----G----AA-CGTATTG--T---AT--T-TGTTCCC---GAAAGATAACCATT-T------TA--T-GAT--------AG--------ttgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|17 : tgccattaaacaataagaaacagaaaacgatcatgtcgatatcgacacgtatcgtcgaatcaacgcagatatagccattaaacacccatataaAAGGATT-CGAT-ATCGA-CA-C--GATAT-C--Gataatacccgctcgacaag
gi|3 : gatatcgtAT-CGAT-ATCGA-C-----GATAT-C--GA---------C-AATAACGT--------GAC----------CA-TGTCGTGT--C--G----AT-ATTGACGT---CTTGCAA--ACTCAGTATCTGT-C--ATAA--G---ATGTT-TGTTTTTTTGAAAACACATACA-----------A--T-GA----------------------TCG-----AT-GTCGACGGTA-TCG---------ACAATAACATAA-----------CGATATCG-----------TGTC---GATATC-----------GATatcgtgtttttatggaggtttgacttcaacttgcta
gi|4 : tcttatgggtgtttgatgactatagcctgctacatgtatcgatatcgaatttttttctcgtggttgtttgacagctacaacttgctatcgataacatcgctatcgtttcgatatcgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataattagtttgccatcaaacagctataggaaaaacgatcaagattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaatatgtagccaccaaacacccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaataatctaaattatttgataccgacattgcatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataataagttcgtaagaaT-CGAT-ATCGT-TA-C--GATAT-C--GT---------G-T------T--------G-T----------GT-T----TGA--C--G----AT-AT---CGT---C-----G--AT--Agttgtatttg
gi|4 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgaT-CAAT-GTCAA-CA-C--GACAT-C--GT---------C-AC-----T--------A-A----------CA-T----TGT--TTGA----AT-AT---CATAG-C-----C--AC--CAG----AA-G--GT----A---AC------TTTTC-----------GATATCGT------TA--C-GAT--------A------------TCG-T---GTTGT--G---T--TTG-----------A--------------------CGATATCG-----------T--C---GATATC-----------Gaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|7 : agttatgttcaagacaggatgtagataT-CGAA-ATCGA-CAGCAAGATAT-A--GC---------C-A------CCAAACACCG-A----------TA-T----TGT--A--A----ATTAT-----T---T-----G--AT--ACT----GA-C--ATTG--T---AT--T-TGTTC-C---AAAA-ATAGCCAT--T------TA--T-GAC--------AGATAATTAGT--TTG-CAA-GAAGTCGA---TA-TCG---------ACA--------------------CGACATGGTCAAGTTATTTT--C---GGTATC-----------GATGTTG-TAatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|8 : acagatagtgagttttccatcaaacactcatatgaaaaacgatcacgattcaatatcgatacgatatcgT-CGAT-ATCAA-CA-C--GACAT-C--GT---------C-AC-----T--------A-A----------CA-T----GTT--T--G----AT-AT---Cac
gi|15 : gagtatgtccaagacacgatgtagatacgtatcgacgaattatcgtcaaacacaaacacggatatcgtaaacgatatcgaaaagtgaccttctggtggctaT-CGAT-ATCAA-CA-C--GATAT-C--GT---------C-A------atcatgatcgtgttttttaaatgtgttttctcttactggaaatgtttgatggctacaaacttgctgccgatatcgtt
gi|14 : gttagT-CGAT-ATCGT-TA-C--GATAT-CATGT---------T-G------T--------G-T-------------T----TGA--C--G----AT-AT---CGT---C-----G--AT--Aatcatgatagtgttttttaaatcgtgtttcttatggatgttccatggctacaacttac
gi|4 : agttatgcccaagactcgatgtagataaga-CGAT-ATCGA-C-----GATAT-C--GT---------C-A------A--------A-CA---------CA-A----CA---C--G----AT-AT---CGT---------A--AC---------GA-T--ATCG--A---Aaaagtaaccttctggaagccatgataatcaaaca
gi|6 : agttatgttcaagacaggatgtagata-CGAT-ATCG--TATC--GAAAT-C--GT---------C-A------T--------T-T----------TA-C----CGT--C--ATTTTCT-AT---CATATAC-----A--CC--AG-----------ATTG---------------TCTC---TAAGGACCAA-ATC-T------T--------------------------------------TCGTCGA---TA-TCG-----------A--------------------CGATATCG-----------A--C---AATaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|14 : cacacgtaattgaaattaccttctttgttgaattaagacctttcattcctcttttatttgtagttggacctataggaaaacttaacatacatgatacctttgtaaaacgactatatggacacgatatcgttatgccattcGAT-ATCGA-C-----GATAT-C--GTCAAACACAAC-A------T--------G-A----------TA-T----CGTAAC--G----AT-AT---Cccatgctgttgtcgatattgt
gi|18 : agttatgcccaagactcgatgtagataaAT-ATCGA-CA-C--GATAT-C--GT---------CTA------T--------G-C----------TATT----TGT--C--G----TT-AT---Cgaaaagtaaccttctggaagccatgataatcaaaca
gi|2 : ----GA-T--ATTG--T---AT--T-TGTTCCC---GAAAGATAACCATT-T------TA--T-GAT--------AGATAATACGT--TCG-CAA-CAAATCGA---TA-TCG---------ACA--------------------CGATATCG-----------T--CAT-GCTATTAAA--------AATATTG-cgatgttgtatttg
gi|2 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccAACATC-GA-----TA--TCGAC--------GA--------TA-TCGACAATATTTTTAA---TA-GCA---------TGA--------------------CGATATCG-----------TGTC---GATATC-----------GAT-TTG-cgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|2 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgca-ATCGTCAA---TA-TCG---------AC----------------------GATATCG-----------TGTC---GATATT-----------GAgcattt
gi|4 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgat-ATCGACGA---TA-TCGTCAAACACAACA--------------------CGATATCG-----------TAAC---GATATC-----------GAatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|14 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgatTTTTCGA---TA-TCG---------TTA--------------------CGATATC-------------------------------------ATGTTG-TGTTTGaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|7 : agttatgcccaagactcgatgtagataagatatcgacgatatcgtTGTCGA---TT-TCG---------AC----------------------GATATCG-----------TATC---GATATT-----------GAgtaaccttctggaagccatgataatcaaaca
gi|9 : acagatagtgagttttccatcaaacactcatatgaaaaacgatcacgatTGTCGA---TA-TCG---------ACA--------------------CG-TATCG-----------T--C---GAgcaagatatagccaccaaacaccgatattgtaaattatttgatactgacattgtatttgttccaaaaatagccatttatgacagataattagtttgcaagaagtcgatatcgacacgacatggtcaagttattttcggtatcgatgttgtaac
gi|9 : tgccattaaacaataagaaacagaaaacgatcaTGTCGA---TA-TCG---------ACA--------------------TGATatcaacgcagatatagccattaaacacccatataacgagaaaacgatcttgattcatatcgatatgcccaaacaccatattctaaattatattgatgaacgtattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacccgctcgacaag
gi|4 : tgccattaaacaataagaaacagaaaacgTCGA---TA-TAC---------ACA--------------------CGATATTG-----------A--C---GATATC-----------GATcgtatcgtcgaatcaacgcagatatagccattaaacacccatataacgagaaaacgatcttgattcatatcgatatgcccaaacaccatattctaaattatattgatgaacgtattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacccgctcgacaag
gi|17 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgatatcgacgatatcgtcaaacacaacacgatatcgtaacgatatcgaaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctTCGA---TA-TCG---------ACA--------------------CGATATCG-----------A--C---GATATatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|8 : gTCGA---TA-TCA---------ACA--------------------CGACATCG-----------T--C---atccttatcgtgtttttatggaggtttgacttcaacttgcta
gi|15 : gagtatgtccaagacacgatgtagatacgtatcgacgaattatcgtcaaacacaaacacggatatcgtaaacgatatcgaaaagtgaccttctggtggctagatatcaaacatgttagtTCGA---TA-TCA---------ACA--------------------CGATATCG-----------T--C---atcatgatcgtgttttttaaatgtgttttctcttactggaaatgtttgatggctacaaacttgctgccgatatcgtt
gi|14 : gttagtTCGA---TG-TAG---------ATA--------------------AGATATCG-----------A--C---GATATC-----------Gatcatgatagtgttttttaaatcgtgtttcttatggatgttccatggctacaacttac
gi|18 : agttatgcccaagacA---TA-TCG---------ACA--------------------CGATATCG-----------T--CTATGCTATTTGTCGTTATCCGATGTTG-TATTTGtcaaacacaacatgatatcgtaacgatatcgaaaagtaaccttctggaagccatgataatcaaaca
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): TATTGACATTTTGGCGTATTTGCTCATTGAAAACTGTTATGTGTATTAAAGGTTACAACTTTGTAAGATGTCGAGATGATGTCTTTACCCTGTTCTCAATATCGGTGATATTGACATAACATTTGGTCTT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 333 8888888888888888888888888888 222222222222222 11 11111 11 111111111 111 33333333333333 111 11111111111111 55555555555555555555 111111111111 333333333333333333 222222222 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666 5555555555555 555555555555555 1111111 22222222222 11111 22222 1 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11 22222 11111 111111 222222222222222222222222 11111111111 2222222 8888888888888888888888888888888888888888 222222222 666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111
lowQualScore : 88 0 7 000 7777777777777777777777777777 000000000000000 1 999 2 1 8 11 1 66666 1 3 00 1 777777777 3 0 000 2 6 33333333333333 1 111 1 0 99 1 99 88888888888888 55555555555555555555 7 888888888888 888 6 888888888888888888 66 000000000 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555 4 8 777 55 4 4 4444444444444 333333333333333 5 9999999 5 66666666666 1 66666 6 99999 5 0 6 44 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 888 0 88 5 8 00 3 00000 44444 5 33 0 0 2 4 777 66 111111 0 55 3 88 3 333333333333333333333333 44444444444 3 4444444 3 3 99999 3 4 2222222 5 1 55 2 0000000000000000000000000000000000000000 88 2 5 222222222 999999999999999999999999999999999999999999999999999999 000 6
lowQualScore : .. . . ... ............................ ............... . ... . . . .. . ..... . . .. . ......... . . ... . . .............. . ... . . .. . .. .............. .................... . ............ ... . .................. .. ......... ....................................................... . . ... .. . . ............. ............... . ....... . ........... . ..... . ..... . . . .. ......................................................................................................... ... . .. . . .. . ..... ..... . .. . . . . ... .. ...... . .. . .. . ........................ ........... . ....... . . ..... . . ....... . . .. . ........................................ .. . . ......... ...................................................... ... .
lowQualScore : 88 7 2 000 9999999999999999999999999999 555555555555555 7 999 2 0 8 00 0 77777 0 0 55 0 888888888 9 3 000 2 7 88888888888888 0 777 0 3 22 0 22 33333333333333 88888888888888888888 3 777777777777 888 7 222222222222222222 99 000000000 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 9 111 55 0 0 6666666666666 333333333333333 7 4444444 3 44444444444 7 88888 7 00000 4 2 0 77 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 222 8 66 0 0 66 2 00000 33333 0 66 8 1 0 4 888 11 111111 8 11 3 55 1 999999999999999999999999 66666666666 1 9999999 5 3 11111 6 9 4444444 2 0 00 5 5555555555555555555555555555555555555555 66 1 7 999999999 333333333333333333333333333333333333333333333333333333 000 7
consensus : GTCGATATCGAATTACGATAT-CGTGTTT------------CT-----T---AT-GGTGTTTGATGGCTACAACTTGCTGTCGATATCG-A-CGATATCGTATCGATATCGANTCAT--GATCGTT-----TTGCTTATGGTTGTTTGACGGCTTTAAATTGCTATCGATATCGTC---------GATATCGTGTCTATATCGAATCAT---GATCGTATT-TCT-TA-C--------GGTTGTTCGA---CTTCAACT--TGC--TATCGATATCGT---CGA-TA--TCCGAATCAT-GATCGTGTTTTCTT-TGGTGGCT-TGAC-NTC---AAACT-TGCTAT-CGATATCGT--C---------GATATCGTG--T---------CGATATCGAATCATG--------------A--TCGT-NT-----------------T-------------CT-TA-TGG--NTGTTTGATG--GCTA-C-AACCTGCT-A----CATGT-GTCGATATCGAAT--CG--T--------TT-CCCGT-G-T---TGTTTGACGGC----------TACAACTCGCTATCGATAACA--TCGA-TATCGTTTC---GATATACGAATCATGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGACAGATAATGAGTTTGCCATCAAACACCNATAGGAAAAACGATCAAGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACGATATCGATAGCAATATGTAGCCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGACATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAAGATAACCATTTTATG-AT---AGATA--ATA--CG--TTCGTAAGAAAT-CGATATCGA-CACGATATC--GTC-AT--------G---------NT--A-TTGT-----------CGAT-AT--CGT--CGATATCG-----A-CGTTGTATTTGNTCTC-AAAAGACAAACATCT------TA--TG---AC--------AG--------T--TTGCAAGNCGNCGATA-TCG---------ACACGA--------------------TATCG-----------T-----------C-----GATA---TCGATGTTG-TATTTG
Reference ( family-1193 ) : GTCGATATCGAATCATGAT---CGTGTTT------------CT-----T---ATGGGTGTTTGATGGCTACAACTTGCTGTCGATATCG-A-CGATATCGTGTCGATATCGANTCAT--GATNGTT-----TTNCTTATGGTTGTTTGACGACTACAANTTGCTATCGATATCGTC---------GATATCGTGTCGATATCGAATCAT---GATCGTGTT-TC--TA-T--------GGTTGTTTNA---CTNCAACT--TGC--TATCGATATCGT---CGA-TA--TCCGAATCAT-GATCGTGTTTTCTTATGGTTGTT-TGAC-TTC---AAACT-TGCTAT-CGATATCGT--C---------GATATCGTG--T---------CGATATCGAATCATG--------------A--TCGT-NT-----------------T-------------CT-TA-TGG--NTGTTTGATG--GCTA-C-AACTTGCT-A----CATGC-GTCGATATCGAAT--CG--T--------TT-CTCGT-G-T---TGTTTGACGGC----------TACAACTTGCTATCGATANCG--TCGA-TATCGTTTC---GATATACGAATCATGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGACGGATAATGAGTTTGCCATCAAACACTCATAGGAAAAACGATCAAGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACGATATCGATAGCAANNTGTAGCCATCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGACATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAAGATAACCATTTTATG-AT---AGATA--ATA--CG--TTCGTAAGAAAT-CGATATCGA-CACGATATC--GTC-AT--------G---------NT--A-TTGT-----------CGAT-AT--CGT--CGACANCG-----A-CATTGNATTTGTTCTC-AAAAGACAAACATCT------TA--TG---AC--------AG--------T--TCGCAAGTCGTCGATA-TCG---------ACACGA--------------------TATCG-----------T-----------C-----GATA---TCGATGTTG-TATTTG
gi|1 : GTTAATATCGAATCAAGAC---CATGTTT------------CT-----T---ATTGGTGCCTCCTGACTACAACTTGCTGTCGATATCG-A-CGATATTGTTTCGATATCGATTCAT--AATAGCT-----TTGCTTATGGTTGTTTGACGACTTTAAATTGCTATCGATATCGTC---------AATATCGTGTGGATATCGAATCAT---AATCGTGTT-TC--TA-C--------GGTTGTTTTA---CTTCAACT--TGC--TATCGATATCGT---CGA-TA--TCCGAATCATAGATCGTGTTTTTTTATGGTAGTT-TGAC-TTC---AAACT-TGCTAT-CGATATTGT--C---------GATATCATG--T---------CGATATCGAATCATG--------------A--T-GT-AT-----------------T-------------CC-TA-TGG--CTCTTTGATG--ACTA-C-AACCTGCTAA----CATGTAATCGATATCGAAT--TG--T--------TT-CTCGT-G-T---TGTTTGAAAGC----------TACAACTTGCTATCGATAACA--TCGA-TATCGTTT------TATCCGAATCATGAT
gi|1 : ATATGACAGATTATGAGTTTGCCATCAAATACTAATAGGAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACGATATCGATAGCAATATGTAGTCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGATATTT----GTTCTTTACTTGTTC-CCTAAAGATAACCATTTTATG-GT---AGATA--ATA--CG--TTCGCAAGAAAT-CGATATCGA-CACGATATC--GTC-AT--------G---------CT--A-TTGT-----------CGAT-AT--CAT--CAACAGGG-----A-CATTGAATTTGTTTTC-AAAAGACAAACATCT------TA--TG---AC--------AG--------T--TCGCAAATTGTCGATA-TCG---------ACACGA--------------------TATCG-----------T-----------C-----GATA---TTGATGTTG-TATTTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagattatgagtttgccatcaaatactaataggaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacgatatcgatagcaatatgtagtcaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatatttgttctttacttgttccctaaagataaccattttatggtagataatacgttcgcaagaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattgtcgatatcatcaacagggacattgaatttgttttcaaaagacaaacatcttatgacagttcgcaaattgtcgatatcgacacgatatcgtcgatattgatgttgtatttg
gi|10 : gttaatatcgaatcaagaccatgtttcttattggtgcctcctgactacaacttgctgtcgatatcgacgatattgtttcgatatcgattcataatagctttgcttatggttgtttgacgactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtggatatcgaatcataatcgtgtttctacggttgttttacttcaacttgctatcgatatcgtcgatatccgaatcatagatcgtgtttttttatggtagtttgacttcaaacttgctatcgatattgtcgatatcatgtcgatatcgaatcatgatgtattcctatggctctttgatgactacaacctgctaacatgtaatcgatatcgaattgtttctcgtgttgtttgaaagctacaacttgctatcgataacatcgatatcgttttatccgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTGGTC-CTTGAAAACAATCAT---ATG--------------TA--CGACTTCGTAAGATGA-CAATATCTA-CACAATACC--CTC-AT--------G---------CT--A-CTGT-----------CAAT-AT-------------TG-----A-CATCATACTTGGTC----AATGAAAATCGTGTTGTA--TA--TGGTAACCATA----AC--------T--TTGTTAGATGAGGATATTTG---------TCAAGC--------------------TATTG-----------T-----------T-----GATA---TTGACATTGTTATTTG
gi|11 : TCGTT-----TTGCTTATCGC-GTTTGACGACTTCAAATTGCTAgtctt
gi|12 : cannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttGACATTTTGGCGT-----ATTTGCTCATTGAA----AACTGTTATGTGTATTAAAGGTT--ACA--AC--TTTGTAA-------GATGTCGA-GATGATGTC--TTT-AC--------C---------CT--G-TTCT-----------CAAT-AT--CGG--TGATATTG-----A-CATAACATTTGGTCT
gi|13 : tattCGATATCATGTT-CT--------G---------T-----TTGA-----------CGAT-AT--TGT--CGATACCGTATCTA-CATTGTGTCTt
gi|13 : cagttatgtcgaCGATATTGTC---------GATACCGTATCTACATTGaaacaaaataaaagtaaccttctggtggctttgataatcaaataat
gi|14 : cagttatgtcgaagacaCGATATCGTC---------GATATCTTATCTACATCGAGTCTT---Gtcaaacagaacatgatatcgaaacaaaataaaagtaaccttctggtggctttgataatcaaataat
gi|14 : agttatgccTCGATATCG--TTACGATAT-CATGTT----------------------------GTGTTTGA-----------------CGATATCG-T-CGATATCTTATCTACATCGAGTCTT--Gtcaaacacaacatgatatcgtaacgatatcgaaaagtaaccttctggaagccatgataatcaaaca
gi|14 : agttatgccT-CGATATCGT-TACGATATCATGTT-GT--------G---------TT-----TGA-----------CGAT-AT--CGT--CGATATCaaagtaaccttctggaagccatgataatcaaaca
gi|14 : agttatgcccaagactcgatgtagataaTGATTATCATGGC-TTCCAGAAGGT-TACTTTTCGATATCGTTAC---------GATATCATG--TTGTGTTTGACGATATCGaaagtaaccttctggaagccatgataatcaaaca
gi|15 : agttatgcccaagactcgatgtagataagatatcga--C---------GATATCGTG--T---------TGATATCGAATCATGATAGTGTTTTTTAAA--TCGTGTT-----------------T-------------CT-TA-TGG--ATGTTCCATG--GCTA-C-AACTTACaaca
gi|16 : gttagtgaCGATATCGAATTGTGAT---CATGTTTTATTAAATCATGCT-----TCATATGGATGTTTGATGGCTACAACTTG
gi|17 : acaatgttaatgaGATATCGTC---------GATATCGTGTCGATATCGAATCCT---TATCGTGTT-TT--TA-T--------GGAGGTTTGA---CTTCAACT--TGC--TA
gi|18 : ATATCGA-CACGATATC--GTCTAT--------G---------CT--ATTTGT-----------CGTT-AT--C----------CG-----A-TGTTGTATTTG
gi|19 : TGTCTGATGACTACAACCTGCTATCGATATCG-A-
gi|2 : TGCTTATGTTTGTTTGACAACTTTAAATTGCTATCGATATCGTC---------AATATCGTGTGTATATCGAATCAT---GATCGTATT-TCT-TA-C--------GATTGTTCGA---CTTCAGCT--TTC--TATCTATATCGT---CGA-T---TTCGAa
gi|2 : AATCATG--------------A--TTGT-AT-----------------T-------------TTCTA-TGG--CTGTTTAATG--ACTA-C-AACCTGCT-G----CATAT-ATCGATATCGAAT---GTTT--------TT-CCCGTGG-T---TGTTTGAAAGCTACAAAAATGTACAACTTGCTATCGATAAGA--TCGAGTATCGTTT----GATAC-CGAATATTGATcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|2 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAATATCGGTTCATCAAATAATT-----TAGAATATGGGTGTTTGGTGGCTACCTATTGCTATCGATATCGTCAATATCGACGATATCGTGTCGATATTGAATCAA---TATCTTTTT-TCTTTACT--------GGGTGTTTAATGGCTATATCT--TGC--TGTCGATAT----------------CGAATCAT-GATCGT-TTT-----TGGGTGTT-TAAT-GGC---AAACT-CATTAT-CCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|2 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgC---------GATATCGTGTCGATATCGATTTGTTGCGAACGTATTATC--TA-TCATAAAATGGTTATCTTT---CGGGAACAAATACAATATCGGT-TCAT---CAAATAATTTAGAAT-AT-GG--GTGTTT------GGTGGCT---AC-CT------A-T-TGCTAT-CGATATCGT--CAATATCGACGATATCGTG--T---------CGATATTGAATCAAT--------------A--TCTT-TT-----------------TTC-----------TT-TACTGG--GTGTTTAATG--GCTA-T-ATCTTGCT------------GTCGATATCGAAT--CA--TGATCG---TT-TTTG--G-G---TGTTTAATGGC-----------A-AACTCATTATCCATtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|2 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgGACGATATCGATAGCAATAGGTAGCCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGATATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAAGATAACCATTTTATG-AT---AGATA--ATA--CG--TTCGCAACAAAT-CGATATCGA-CACGATATC--GTC-AT--------GCTATTAAAAAT--A-TTGT-----------CGAT-AT--CGT--CGATATCG-----A-TGTTGCATTTtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|3 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatatt-----------------T-------------CT-TA-TGG--GTGTTTGATG--ACTA-T-AGCCTGCT-A----CATGT-ATCGATATCGAAT--TT--T--------TTTCTCGT-GGT---TGTTTGACAGC----------TACAACTTGCTATCGATAACA--TCGC-TATCGTTTC---GATAT-CGAATCATGAT
gi|3 : ATATGACAGATAATTAGTTTGCCATCAAACAGCTATAGGAAAAACGATCAAGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCAATATGTAGCCACCAAACACCCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataattagtttgccatcaaacagctataggaaaaacgatcaagattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaatatgtagccaccaaacacccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaataatctaaattatttgataccgacattgcatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataataagttcgtaagaaatcgatatcgacacgatatcgttatgttattgtcgataccgtcgacatcgatcattgtatgtgttttcaaaaaaacaaacatcttatgacagatactgagtttgcaagacgtcaatatcgacacgacatggtcacgttattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgtatttg
gi|3 : tcttatgggtgtttgatgactatagcctgctacatgtatcgatatcgaatttttttctcgtggttgtttgacagctacaacttgctatcgataacatcgctatcgtttcgatatcgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAATCTAAATTAT-TTGAT--ACCGACATT-----GC-----ATTTGTTC-CCGAAAGATAACCATTTTATG-AT---AGATA--ATA--AG--TTCGTAAGAAAT-CGATATCGA-CACGATATC--GTT-AT--------G---------TT--A-TTGT-----------CGAT-AC--CGT--CGACATCG-----ATCATTGTATGTGTTTTCAAAAAAACAAACATCT------TA--TG---ACAGATACTGAG--------T--TTGCAAGACGTCAATA-TCG---------ACACGACATGGTCACGTTATTGTCGATATCG-----------T-----------C-----GATA---TCGATGTTG-TATTTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaataatctaaattatttgataccgacattgcatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataataagttcgtaagaaatcgatatcgacacgatatcgttatgttattgtcgataccgtcgacatcgatcattgtatgtgttttcaaaaaaacaaacatcttatgacagatactgagtttgcaagacgtcaatatcgacacgacatggtcacgttattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgtatttg
gi|4 : tcttatgggtgtttgatgactatagcctgctacatgtatcgatatcgaatttttttctcgtggttgtttgacagctacaacttgctatcgataacatcgctatcgtttcgatatcgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataattagtttgccatcaaacagctataggaaaaacgatcaagattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaatatgtagccaccaaacacccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaTA--TG--TTC--AAGACAG--GATGTAGA-TACGATATC--G---AC--------G---------AT--A-TCGTCAAACACAACACGAT-AT--CGTAACGATATCG-----A-
gi|4 : agtCGATATCGTC---------GATATCGTATCTACATCaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|4 : agttatgttcaagacagTCGATATCG--TTACGATAT-CGTGTT----------------------------GTGTTTGA-----------------CGATATCG-T-CGATATCGTATCTACATCtcaaacacaacacgatatcgtaacgatatcgaaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|4 : agttatgttcaagacagA--CA--TTCATAAGAAACGCGATTTAAAACACGAT-------C-AT--------G---------ATTCA-ATGT-----------CAAC-ACGACAT--CGTCACTA-----A-CATTG--TTTG--------------AATATCA------TAGCCA---CC--------AG--------A--AGGTAACTTTTCGATA-TCG---------TTACGA--------------------TATCG-----------TGTTGTGTTTGAC-----GATATCGTCGATATCG-TATCTaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|4 : agttatgttcaagacaggatgtTCGACGATA-TCGTCAAACACAACACGA--------------------TATCG-----------TAA---------C-----GATA---TCGAttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|4 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgataCGATATCGTAA-CGA-TA--TC-GAA-----AA----GTTACCTTCTGGTGGCTATGATATTC---AAACAATGTTAG-TGA--------C---------GATGTCGTG--T---------TGACATTGAATCATG--------------A--TCGT-GT-----------------TTTAAATCGCGTTTCT-TA-TGA--ATGTTTGATG--GCTA-C-AACTTGCT------------GTCGATATCGaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|4 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgatatcgacgatatcgtcaaacacaaca-----TTGCTTATGTTTGTTTGACAACTTTAAATTGCTATCGATATCGTC---------AATATCGTGTGTATATCGAATCAT---GATCGTATT-TCT-TA-C--------GATTGTTCGA---CTTCAGCT--TTC--TATCTATATCGT---CGA-TT--TCtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|5 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgatatcgacgatatcgtcaaacacaacacgatatcgtaacgatatcgaaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTTTGATGATGGTA-C-TAATT-CT-A-----------TCGATATCGAAT--CA--TGATTGTATTT-CCTAT-GGC---TGTTTGATGAC----------TACAACCTGCTAC--AT-GTA--TCGA-TATCG
gi|5 : aacTA--T---------CGATATCGAATCATG--------------A--TTGT-AT-----------------TT------------CC-TA-TGG--CTGTTTGATG--ACTA-C-AACCTGCT-A----CATGT-ATCGATATCGAATTGTG--T--------TT-CTCGTGG-T---TGTTTGAAAGC----------TACAACTTGTTATCGATAACA--TCGA-TATCAATGC----ATAAACGAATTATGATaattgtgtttctcgtggttgtttgaaagctacaacttgttatcgataacatcgatatcaatgcataaacgaattatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataatggatttgccatcaaacacccataggaaaaac
gi|5 : aacgtttgatgatggtactaattcATATGACAGATAATGGATTTGCCATCAAACACCCATAGGAAAAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataatggatttgccatcaaacacccataggaaaaac
gi|6 : aacgtttgatgatggtactaattctatcgatatcgaatcatgattgtatttcctatggctgtttgatgactacaacctgctacatgtatcgatatcgaattgtgtttctcgtggttgtttgaaagctacaacttgttatcgataacatcgatatcaatgcataaacgaattatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT-----GT-----AGTTGGAC-CTATAGGAAAAC----TTAAC-AT---ACATG--ATA--CC--TTTGTAAAACGA-CTATATGGA-CACGATATC--GTT-AT--------GCCAT-----TC--A-TTGT-----------CGAT-AT--CGT--CGATATCG-----A-CGAAAGATTTGGTCCT-TAGAGACA---ATCTGGTGTATA--TG---AT--------AGAAAA----TGACGGTAAAATGACGATT-TCG---------ATACGA--------------------TATCG-----------C-----------CATGCTGTTG---TCGATATTG-
gi|7 : cacacgtaattgaaattaccttctttgttgaattaagacctttcattcctcttttat-----T---ATCGGTGTTTGGTGGCTATATCTTGCTGTCGATTTCG-A-CGATATCGTATCGATATTGAATCGT--GATCGTT-----TTTCATATGAGTGTTTGATGG--AAAACTCACTATC
gi|7 : acaAACGATCACGATTCAAT--AT---CGATACGATA-------TCGTC-GAAAT-CGA---CAG-CAAGATATA--GCC-ACCAAACACCG---------AT--A-TTGT-----------AAATTAT----T--TGATACTG-----A-CATTGTATTTGTTC-C-AAAA-ATAGCCAT-T------TA--TG---AC--------AGATAATTAGT--TTGCAAGAAGTCGATA-TCG---------ACACGA--------------------CATGGTCAAGTTATTTT-----------C-----GGTA---TCGATGTTG-TAttgtaaattatttgatactgacattgtatttgttccaaaaatagccatttatgacagataattagtttgcaagaagtcgatatcgacacgacatggtcaagttattttcggtatcgatgttgtaac
gi|7 : acagatagtgagttttccatcaaacactcatatgaaaCGAAATCGACAGCAAGATATAGCCACCAAACACCGATATTGTAAATTAT-TTGAT--ACTGACATT-----GT-----ATTTGTTC-C--AAAAATAGCCATTT-ATG-AC---AGATA--ATT--AG--TTTGCAAGAAGT-CGATATCGA-CACGACATG--GTC-AA--------G---------TT--A-TTTT-----------CGGT-AT--CGac
gi|8 : acagatagtgagttttccatcaaacactcatatgaaaaacgatcacgattcaatatcgatacgatatcgtATCATGATT---------CGATATCAA--CACG--------------ACATCGT-CA-------------------------------CT-AA-C----ATGTTTGATA--TCTAGC-CACCAG---AAGGTCACTT-TTCGATATCGTTTA-CG--A--------TA-TCCGT-G-TTTGTGTTTGACG-------------ATAATTCG---TCGATA-CGTATCTA-CATCGTGTCTTGGACATACatgttgtaac
gi|8 : gaTCGATATCG-TTTACGATATCCGTGTTT---------------------------GTGTTTGACG---ATAATT---CGTCGATA-CGTATCTACATCGTGTCcgtgttttttaaatgtgttttctcttactggaaatgtttgatggctacaaacttgctgccgatatcgtt
gi|8 : gagtatgtccaaGATATCGTAAACGA-TA--TC-GAAAAGT-GACC-----TTCT---GGTGGCT-AGAT-ATC---AAACA-TGTTAG-TGA--------C---------GATGTCGTG--T---------TGATATCGAATCATG--------------A--TCGT-GTTTTTTAAATGTGTTTTCT-------------CT-TACTGGAAATGTTTGATG--GCTA-CAAACTTGCT------------GCCGATATCGaaagtgaccttctggtggctagatatcaaacatgttagtgacgatgtcgtgttgatatcgaatcatgatcgtgttttttaaatgtgttttctcttactggaaatgtttgatggctacaaacttgctgccgatatcgtt
gi|9 : gagtatgtccaagacacgatgtagatacgtatcgacgaattatcgtcaaacacaaacacgTCGATAT-GAATCAAGAT---CGT-TTT------------CTCGTTAT---ATGGGTGTTTAATGGCTATATC-TGC-GTTGAT-TCG-A-CGATA-CGTGTCGATATCGA--CAT--GATCGTTTTCTGTTTCTTA---TTGTTTAATGGCtt
gi|9 : tATATCGATA--------T-GCC--CAAACACC-ATATTCTAAATTATATTGATGAAC--GTATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAAGATAACCATTTTATG-AT---AGATA--ATACCCG--CTCGtatgcccaaacaccatattctaaattatattgatgaacgtattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacccgctcgacaag
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1111111 777777777777777777777777777777777777 444444444444444444444444444444 222222222 11 11 111 1 22222 111 111 111 111 222 111 1 777777777777777777777 11 11 111 3333333333333333 22222222222222 5555555555555555555555555555555 33333333333 444444444444 1111111 33333333333 22222 1 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111 11 22222 11111 111111 2222222222222222222222222222222222222222222222222 111 7777777777777777777777777777777777777777 666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111
lowQualScore : 6666666 777777777777777777777777777777777777 000000000000000000000000000000 1 77 0 666666666 22 8 3 99 3 0 11 55 777 0 44444 777 777 777 777 2 8 000 6 222 5 999999999999999999999 99 1 22 666 3 2222222222222222 66 66666666666666 66 55 5555555555555555555555555555555 4 8 666 1 4 4 00000000000 66 000000000000 6 6666666 55 22222222222 1 0 3 8 8 99999 5 0 1 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 7777 0 5 8 00 3 00000 44444 5 33 0 0 2 4 777 66 111111 0 66 3 44 3 2222222222222222222222222222222222222222222222222 3 55 2 99999 3 1 66 000 9 99 2222222222222222222222222222222222222222 77 5555 5 555555555555555555555555555555555555555555555555555555 000 6
lowQualScore : ....... .................................... .............................. . .. . ......... .. . . .. . . .. .. ... . ..... ... ... ... ... . . ... . ... . ..................... .. . .. ... . ................ .. .............. .. .. ............................... . . ... . . . ........... .. ............ . ....... .. ........... . . . . . ..... . . . ......................................................................................................... .... . . . .. . ..... ..... . .. . . . . ... .. ...... . .. . .. . ................................................. . .. . ..... . . .. ... . .. ........................................ .. .... . ...................................................... ... .
lowQualScore : 4444444 777777777777777777777777777777777777 000000000000000000000000000000 7 99 3 777777777 44 0 2 22 7 7 00 66 555 0 55555 555 555 555 555 5 8 888 7 777 0 000000000000000000000 88 0 55 555 0 3333333333333333 99 11111111111111 11 44 4444444444444444444444444444444 0 0 555 4 0 0 33333333333 11 222222222222 7 7777777 88 33333333333 0 7 7 0 0 00000 4 2 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0000 8 0 0 66 2 00000 33333 0 66 8 1 0 4 888 11 111111 8 55 6 66 3 6666666666666666666666666666666666666666666666666 3 00 5 11111 6 2 77 666 3 00 1111111111111111111111111111111111111111 99 4444 7 111111111111111111111111111111111111111111111111111111 000 7
consensus : GTCGATATCGAAT----CACGAT-------------ATCGTGTTTCT-----TAC-GG-TGTTTGA------TGGCTAC--------AACTTGCTGTCGATATCG--ACGATATCGTAT---------CGATATCGA-TC-ATGATCGTTT--TGCTTATGNTTGTTTGACGACTTTAAA--TTGCTATCGATATCGTCGATATCGTGTGTATATCGAATCGT---GATCGTATT-TCT----TA---CGGTTGT---TCG---AC---TTCAGCTTTCTATCGATATCGT---CGA-TA--TCCGAAT-AT-GACCGTGTTTTCTT-TGGTGGCT-TGACNT-CAAACN-TGCTANCGATATCGTC---------GATATCGTG--TCGATATCGAATCATG--------------A--TCGT-NT-----------------T-------------CT-TA-TGG--ATGTTTGATGGCTA-C-AACCTGCT-A----CATGT-GTCGATATCGAAT--CG--T-----TTCC-CGT-G-T---TGTTTGANAGC----------TACAACTCGCTATCGATA-ACATCGA-TATCGTTTC---GATATACGAATCATGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGACAGATAATGAGTTTGCCATCAAACACCNATAGGAAAAACGATCAAGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACGATATCGAT----AGCAATATGTAGCCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGACATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAAGATAACCATTTTATG-AT---AGATA--ATA--CG--TTCGTAAGAAAT-CGATATCGA-CACGATATC--GTC-AT--------G---------CT--A-TT----GT-----------C-----GAT-ATCGT--CGATATCG-----A-CGTTGTATTTGN-TCTC-AAAAGACAANCATCT------TATG---AC--------AG--------T--T-TGC--AAGACGTCGATA-TCGACACGA--------------------TATCG-----------T-----------C-----GATA---TCGATGTTG-TATTTG
Reference ( family-1193 ) : GTCGATATCGAAT----TACGAT-------------ATCGTGTTTCT-----TAT-GG-TGTTTGA------TGGCTAC--------AACTTGCTGTCGATATCG--ACGATATCGTAT---------CGATATCGANTC-ATGATCGTTT--TGCTTATGGTTGTTTGACGGCTTTAAA--TTGCTATCGATATCGTCGATATCGTGTCTATATCGAATCAT---GATCGTATT-TCT----TA---CGGTTGT---TCG---AC---TTCAACTTGCTATCGATATCGT---CGA-TA--TCCGAATCAT-GATCGTGTTTTCTT-TGGTGGCT-TGACNT-CAAACT-TGCTATCGATATCGTC---------GATATCGTG--TCGATATCGAATCATG--------------A--TCGT-NT-----------------T-------------CT-TA-TGG--NTGTTTGATGGCTA-C-AACCTGCT-A----CATGT-GTCGATATCGAAT--CG--T-----TTCC-CGT-G-T---TGTTTGACGGC----------TACAACTCGCTATCGATA-ACATCGA-TATCGTTTC---GATATACGAATCATGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGACAGATAATGAGTTTGCCATCAAACACCNATAGGAAAAACGATCAAGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACGATATCGAT----AGCAATATGTAGCCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGACATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAAGATAACCATTTTATG-AT---AGATA--ATA--CG--TTCGTAAGAAAT-CGATATCGA-CACGATATC--GTC-AT--------G---------NT--A-TT----GT-----------C-----GAT-ATCGT--CGATATCG-----A-CGTTGTATTTGN-TCTC-AAAAGACAAACATCT------TATG---AC--------AG--------T--T-TGC--AAGNCGNCGATA-TCGACACGA--------------------TATCG-----------T-----------C-----GATA---TCGATGTTG-TATTTG
gi|1 : GTTAATATCGAAT----CAAGAC---------------CATGTTTCT-----TATTGG-TGCCTCC------TGACTAC--------AACTTGCTGTCGATATCG--ACGATATTGTTT---------CGATATCGATTC-ATAATAGCTT--TGCTTATGGTTGTTTGACGACTTTAAA--TTGCTATCGATATCGTCAATATCGTGTGGATATCGAATCAT---AATCGTGTT-TC-----TA---CGGTTGT---TTT---AC---TTCAACTTGCTATCGATATCGT---CGA-TA--TCCGAATCATAGATCGTGTTTTTTTATGGTAGTT-TGACTT-CAAACT-TGCTATCGATATTGTC---------GATATCATG--TCGATATCGAATCATG--------------A--T-GT-AT-----------------T-------------CC-TA-TGG--CTCTTTGATGACTA-C-AACCTGCTAA----CATGTAATCGATATCGAAT--TG--T-----TTCT-CGT-G-T---TGTTTGAAAGC----------TACAACTTGCTATCGATA-ACATCGA-TATCGTTT------TATCCGAATCATGAT
gi|1 : ATATGACAGATTATGAGTTTGCCATCAAATACTAATAGGAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACGATATCGAT----AGCAATATGTAGTCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGATATTT----GTTCTTTACTTGTTC-CCTAAAGATAACCATTTTATG-GT---AGATA--ATA--CG--TTCGCAAGAAAT-CGATATCGA-CACGATATC--GTC-AT--------G---------CT--A-TT----GT-----------C-----GAT-ATCAT--CAACAGGG-----A-CATTGAATTTGT-TTTC-AAAAGACAAACATCT------TATG---AC--------AG--------T--T-CGC--AAATTGTCGATA-TCGACACGA--------------------TATCG-----------T-----------C-----GATA---TTGATGTTG-TATTTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagattatgagtttgccatcaaatactaataggaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacgatatcgatagcaatatgtagtcaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatatttgttctttacttgttccctaaagataaccattttatggtagataatacgttcgcaagaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattgtcgatatcatcaacagggacattgaatttgttttcaaaagacaaacatcttatgacagttcgcaaattgtcgatatcgacacgatatcgtcgatattgatgttgtatttg
gi|10 : gttaatatcgaatcaagaccatgtttcttattggtgcctcctgactacaacttgctgtcgatatcgacgatattgtttcgatatcgattcataatagctttgcttatggttgtttgacgactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtggatatcgaatcataatcgtgtttctacggttgttttacttcaacttgctatcgatatcgtcgatatccgaatcatagatcgtgtttttttatggtagtttgacttcaaacttgctatcgatattgtcgatatcatgtcgatatcgaatcatgatgtattcctatggctctttgatgactacaacctgctaacatgtaatcgatatcgaattgtttctcgtgttgtttgaaagctacaacttgctatcgataacatcgatatcgttttatccgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTGGTC-CTTGAAAACAATCAT---ATG--------------TA--CGACTTCGTAAGATGA-CAATATCTA-CACAATACC--CTC-AT--------G---------CT--A-CT------------------------------GT--CAATATTG-----A-CATCATACTTGG-TC----AATGAAAATCGTGTTGTA--TATGGTAACCATA----AC--------T--T-TGT--TAGATGAGGATATTTGTCAAGC--------------------TATTG-----------T-----------T-----GATA---TTGACATTGTTATTTG
gi|11 : TCGTTT--TGCTTATCGC-GTTTGACGACTTCAAA--TTGCTAgtctt
gi|12 : cannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttGACATTTTGGCGT-----ATTTGCTCATTGAA----AACTGTTATGTGTATTAAAGGTT--ACA--AC--TTTGTAA-------GATGTCGA-GATGATGTC--TTT-AC--------C---------CT--G-TT----CT-----------C-----AAT-ATCGG--TGATATTG-----A-CATAACATTTGG-TCT
gi|13 : tattCGATATCATGTT-CT--------G---------T-----TT----GA-----------C-----GAT-ATTGT--CGATACCGTATCTA-CATTGTGTCTt
gi|13 : cagttatgtcgaCGATATTGTCGATACCGTATCTACATTGaaacaaaataaaagtaaccttctggtggctttgataatcaaataat
gi|14 : cagttatgtcgaagaca--------AG--------T--TATGCCCAAGAC-TCGATG-TAGATAAGA--------------------TATCG-----------A-----------C-----GATA---TCGtcaaacagaacatgatatcgaaacaaaataaaagtaaccttctggtggctttgataatcaaataat
gi|14 : TCGATATCG--T----TACGAT-------------ATCATGTT-------------G-TGTTTGA-------------------------------CGATATCG--TCGATATCTTAT---------CTACATCGAGTC-TTGtcaaacacaacatgatatcgtaacgatatcgaaaagtaaccttctggaagccatgataatcaaaca
gi|15 : agttatgccC---------GATATCGTG--TTGATATCGAATCATGATAGTGTTTTTTAAA--TCGTGTT-----------------T-------------CT-TA-TGG--ATGTTCCATGGCTA-C-AACTTACaaagtaaccttctggaagccatgataatcaaaca
gi|16 : gttagtgaCGATATCGAAT----TGTGATCATGTTTTATTAAATCATGCTTCA-----TAT-GGATGTTTGA------TGGCTAC--------AACTTG
gi|17 : acaatgttaatgaGATATCGTC---------GATATCGTG--TCGATATCGAATCCTT--------------A--TCGT-GT-----------------T-------------TT-TA-TGG--AGGTTTGA---CTT-C-AACTTGCT-A----
gi|18 : ATATCGA-CACGATATC--GTCTAT--------G---------CT--ATTT----GT-----------C-----GTT-ATC----------CG-----A-TGTTGTATTTG
gi|19 : -TGTCTGA------TGACTAC--------AACCTGCTATCGATATCG--A
gi|2 : --TGCTTATGTTTGTTTGACAACTTTAAA--TTGCTATCGATATCGTCAATATCGTGTGTATATCGAATCAT---GATCGTATT-TCT----TA---CGATTGT---TCG---AC---TTCAGCTTTCTATCTATATCGT---CGA-T---TTCGAa
gi|2 : AATCATG--------------A--TTGT-AT-----------------T-------------TTCTA-TGG--CTGTTTAATGACTA-C-AACCTGCT-G----CATAT-ATCGATATCGAAT---GTTT-----TTCC-CGTGG-T---TGTTTGAAAGCTACAAAAATGTACAACTTGCTATCGATA-AGATCGAGTATCGTTT----GATAC-CGAATATTGATcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|2 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCGATATCGTGTCGATATCGATTTGTTGCGAACGTATTATCTATCATAAAATGGTTATCTTTCGGGAACAAATACAA-----TATCGGT-TCAT---CAAATAATTTAGAAT-AT-GG--GTGTTT------GGTGGCT---ACCT----A-T-TGCTATCGATATCGTCAATATCGACGATATCGTG--TCGATATTGAATCAAT--------------A--TCTT-TT-----------------TTC-----------TT-TACTGG--GTGTTTAATGGCTA-T-ATCTTGC-----------T-GTCGATATCGAAT--CA--TGATCGTTTT-TG--G-G---TGTTTAATGGC-----------A-AACTCATTATCCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|2 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgGACGATATCGAT----AGCAATAGGTAGCCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGATATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAAGATAACCATTTTATG-AT---AGATA--ATA--CG--TTCGCAACAAAT-CGATATCGA-CACGATATC--GTC-AT--------GCTATTAAAAAT--A-TT----GT-----------C-----GAT-ATCGT--CGATATCG-----A-TGTTGCATTTtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|3 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatatt-----------------T-------------CT-TA-TGG--GTGTTTGATGACTA-T-AGCCTGCT-A----CATGT-ATCGATATCGAAT--TT--T-----TTTCTCGT-GGT---TGTTTGACAGC----------TACAACTTGCTATCGATA-ACATCGC-TATCGTTTC---GATAT-CGAATCATGAT
gi|3 : ATATGACAGATAATTAGTTTGCCATCAAACAGCTATAGGAAAAACGATCAAGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----AGCAATATGTAGCCACCAAACACCCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataattagtttgccatcaaacagctataggaaaaacgatcaagattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaatatgtagccaccaaacacccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaataatctaaattatttgataccgacattgcatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataataagttcgtaagaaatcgatatcgacacgatatcgttatgttattgtcgataccgtcgacatcgatcattgtatgtgttttcaaaaaaacaaacatcttatgacagatactgagtttgcaagacgtcaatatcgacacgacatggtcacgttattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgtatttg
gi|3 : tcttatgggtgtttgatgactatagcctgctacatgtatcgatatcgaatttttttctcgtggttgtttgacagctacaacttgctatcgataacatcgctatcgtttcgatatcgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAATCTAAATTAT-TTGAT--ACCGACATT-----GC-----ATTTGTTC-CCGAAAGATAACCATTTTATG-AT---AGATA--ATA--AG--TTCGTAAGAAAT-CGATATCGA-CACGATATC--GTT-AT--------G---------TT--A-TT----GT-----------C-----GAT-ACCGT--CGACATCG-----ATCATTGTATGTGT-TTTCAAAAAAACAAACATCT------TATG---ACAGATACTGAG--------T--T-TGC--AAGACGTCAATA-TCGACACGACATGGTCACGTTATTGTCGATATCG-----------T-----------C-----GATA---TCGATGTTG-TATTTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaataatctaaattatttgataccgacattgcatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataataagttcgtaagaaatcgatatcgacacgatatcgttatgttattgtcgataccgtcgacatcgatcattgtatgtgttttcaaaaaaacaaacatcttatgacagatactgagtttgcaagacgtcaatatcgacacgacatggtcacgttattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgtatttg
gi|4 : tcttatgggtgtttgatgactatagcctgctacatgtatcgatatcgaatttttttctcgtggttgtttgacagctacaacttgctatcgataacatcgctatcgtttcgatatcgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataattagtttgccatcaaacagctataggaaaaacgatcaagattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaatatgtagccaccaaacacccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaTA--TG--TTC--AAGACAG--GATGTAGA-TACGATATC--G---AC--------G---------AT--A-TC----GTCAAACACAACAC-----GAT-ATCGTAACGATATCG-----A-
gi|4 : agtTCGATATCG--T----TACGAT-------------ATCGTGTT-------------G-TGTTTGA-------------------------------CGATATCG--TCGATATCGTAT---------CTACATCaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|4 : agttatgttcaagacagA--CA--TTCATAAGAAACGCGATTTAAAACACGAT-------C-AT--------G---------ATTCA-AT----GT-----------CAACACGAC-ATCGT--CACTA--------A-CATTGT--TTGAATATC-ATAG--CCACCA------------G---A---------AG--------------GT--AACTTTTCGATA-TCGTTACGA--------------------TATCG-----------TGTTGTGTTTGAC-----GATATCGTCGATATCG-TATCTaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|4 : agttatgttcaagacaggatgtTCAATGTCAA------CACGAC-------------ATCGT--CACT-----AAC-AT-TGTTTGAATATCATAGCCACCAGAAGGTAACTT--T-TCGATATCGTTACGATATCGTGTTGTGTTTGACGATATCG--TCGAT-ATCGTttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|4 : agttatgttcaagacaggatgtagatCGATATCGTAA-CGA-TA--TC-GAA-----AA----GTTACCTTCTGGTGGCTATGATATTCAAACAATGTTAGTGA------C---------GATGTCGTG--TTGACATTGAATCATG--------------A--TCGT-GT-----------------TTTAAATCGCGTTTCT-TA-TGA--ATGTTTGATGGCTA-C-AACTTGC-----------T-GTCGATATCGatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|4 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgatatcgacgatatcgtcaaacacaacaT--TGCTTATGTTTGTTTGACAACTTTAAA--TTGCTATCGATATCGTCAATATCGTGTGTATATCGAATCAT---GATCGTATT-TCT----TA---CGATTGT---TCG---AC---TTCAGCTTTCTATCTATATCGT---CGA-TT--TCtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|5 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgatatcgacgatatcgtcaaacacaacacgatatcgtaacgatatcgaaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTA--TCGATATCGAATCATG--------------A--TTGT-AT-----------------TT------------CC-TA-TGG--CTGTTTGATGACTA-C-AACCTGCT-A----CATGT-ATCGATATCGAATTGTG--T-----TTCT-CGTGG-T---TGTTTGAAAGC----------TACAACTTGTTATCGATA-ACATCGA-TATCAATGC----ATAAACGAATTATGAT
gi|5 : aacgtttgatgatggtactaattcATATGACAGATAATGGATTTGCCATCAAACACCCATAGGAAAAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataatggatttgccatcaaacacccataggaaaaac
gi|6 : aacgtttgatgatggtactaattctatcgatatcgaatcatgattgtatttcctatggctgtttgatgactacaacctgctacatgtatcgatatcgaattgtgtttctcgtggttgtttgaaagctacaacttgttatcgataacatcgatatcaatgcataaacgaattatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT-----GT-----AGTTGGAC-CTATAGGAAAAC----TTAAC-AT---ACATG--ATA--CC--TTTGTAAAACGA-CTATATGGA-CACGATATC--GTT-AT--------G---------CC--A-TTCATTGT-----------C-----GAT-ATCGT--CGATATCG-----A-CGAAAGATTTGG-TCCT-TAGAGACA---ATCTGGTGTATATG---AT--------AGAAAA----TGAC-GGT--AAAATGACGATT-TCGATACGA--------------------TATCG-----------C-----------CATGCTGTTG---TCGATATTG-
gi|7 : cacacgtaattgaaattaccttctttgttgaattaagacctttcattcctcttttatGTCAGTATCAAATAATTTACAAT-------------ATCG-----------------G-TGTTTGG------TGGCTAT--------ATCTTGCTGTCGATTTCG--ACGATATCGTAT---------CGATATTGAATC-GTGATCGTTT--TTCATATGAGTGTTTGATGG----AAAACTCACTATC
gi|7 : acaAACGATCACGATTCAAT--AT---CGATACGATA-------TCGTC-GAAAT-CGA---CAG-CAAGATATA--GCC-ACCAAACACCG---------AT--A-TT----GT-----------A-----AATTAT--T--TGATACTG-----A-CATTGTATTTGT-TC-C-AAAA-ATAGCCAT-T------TATG---AC--------AGATAATTAGT--T-TGC--AAGAAGTCGATA-TCGACACGA--------------------CATGGTCAAGTTATTTT-----------C-----GGTA---TCGATGTTG-TAattgtatttgttccaaaaatagccatttatgacagataattagtttgcaagaagtcgatatcgacacgacatggtcaagttattttcggtatcgatgttgtaac
gi|7 : acagatagtgagttttccatcaaacactcatatgaaaCGAAATCGAC----AGCAAGATATAGCCACCAAACACCGATATTGTAAATTAT-TTGAT--ACTGACATT-----GT-----ATTTGTTC-C--AAAAATAGCCATTT-ATG-AC---AGATA--ATT--AG--TTTGCAAGAAGT-CGATATCGA-CACGACATG--GTC-AA--------G---------TT--A-TT----TT-----------C-----GGT-ATCGac
gi|8 : acagatagtgagttttccatcaaacactcatatgaaaaacgatcacgattcaatatcgatacgatatcgtATCATGATTCGATATCAA--CACG--------------ACATCGT-CA-------------------------------CT-AA-C----ATGTTTGATATCTAGC-CACCAG---AAGGTCACTT-TTCGATATCGTTTA-CG--A-----TATC-CGT-G-TTTGTGTTTGACG-------------ATAATTCG---TCGATACGTATCTA-CATCGTGTCTTGGACATACatgttgtaac
gi|8 : gaGATATCGTAAACGA-TA--TC-GAAAAGT-GACC-----TTCT---GGTGGCT-AGATAT-CAAACA-TGTTAGTGA------C---------GATGTCGTG--TTGATATCGAATCATG--------------A--TCGT-GTTTTTTAAATGTGTTTTCT-------------CT-TACTGGAAATGTTTGATGGCTA-CAAACTTGC-----------T-GCCGATATCGcgtgttttttaaatgtgttttctcttactggaaatgtttgatggctacaaacttgctgccgatatcgtt
gi|9 : gagtatgtccaagacacgatgtagatacgtatcgacgaattatcgtcaaacacaaacacgTCGATAT-GAAT----CAAGAT---------------CGT-TTTCTCGTTATAT-GGGTGTTTAA------TGGCTAT--------ATC-TGC-GTTGAT-TCG--ACGATA-CGTGT---------CGATATCGA--C-ATGATCGTTTTCTGTTTCTTATTGTTTAATGGCtt
gi|9 : tACGATCTTGATTCATATCGATATGC-----CCAAACACC-ATATTCTAAATTATATTGATGAAC--GTATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAAGATAACCATTTTATG-AT---AGATA--ATACCCG--CTCGtatgcccaaacaccatattctaaattatattgatgaacgtattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacccgctcgacaag
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 2222222 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999 222222222 222222 111 1111 11 111 1 333333333 111 111 111 222 111 666666666666666666666 11 11 111 222222222222222222 55555555555555555555555555555555555555555555555555555 2222222222 555555555555555 111 2222222222 2222222 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111 11 22222 11111 111111 11111111111111111111111111111111111111111 11111 1111 11 222222 111 888888888888888888888 7777777777777777777777777777777777777777777
lowQualScore : 6666666 5 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555 3 66 1 2 222222222 000000 3 111 6 77 0000 0 11 2 0 4 444 1 0 333333333 777 777 777 2 3 000 6 222 5 555555555555555555555 99 1 22 333 1 888888888888888888 44444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 8 555 55 7 1 8888888888 666666666666666 6 666 1 9999999999 3 0 8 5555555 0 1 2 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 7777 0 5 8 00 3 00000 44444 5 33 0 0 2 4 777 66 222222 0 1 1 44 44 99999999999999999999999999999999999999999 3 55 00000 4 0 1 7777 3 1 11 666666 444 000000000000000000000 4 1 8 4444444444444444444444444444444444444444444 8
lowQualScore : ....... . ....................................................... . .. . . ......... ...... . ... . .. .... . .. . . . ... . . ......... ... ... ... . . ... . ... . ..................... .. . .. ... . .................. ..................................................... . . ... .. . . .......... ............... . ... . .......... . . . ....... . . . ......................................................................................................... .... . . . .. . ..... ..... . .. . . . . ... .. ...... . . . .. .. ......................................... . .. ..... . . . .... . . .. ...... ... ..................... . . . ........................................... .
lowQualScore : 9999999 0 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4 99 7 7 999999999 222222 2 777 7 99 7777 8 00 2 6 6 000 0 0 000000000 555 555 555 5 0 888 7 777 0 888888888888888888888 88 0 55 555 0 000000000000000000 33333333333333333333333333333333333333333333333333333 0 0 333 00 3 0 7777777777 000000000000000 7 777 0 2222222222 3 8 0 5555555 2 0 3 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0000 8 0 0 66 2 00000 33333 0 66 8 1 0 4 888 11 666666 1 9 0 66 99 33333333333333333333333333333333333333333 3 00 00000 0 7 0 0000 2 0 00 000000 000 000000000000000000000 6 4 0 4444444444444444444444444444444444444444444 0
consensus : GTCGATATCGAAT----CACGACATCGTGTT-CT------AC-GG-TGTTTGA------TGGCTAC--------A-CTTGCTGTCGATATCG--ACGATATCGTNT---------CGATATCG-AT-C-ATGAT---CGT-TT--TGCTTAT-GNTTGTTTGACGACTTTAAATTGCTATCGATATCG--TCGATATCGTGTGTATATCGAATCGT---GATCGTATT-TCT----TA---CGGTTGT---TCG---AC---TTCAGCTTTCTATCGATATCGT---CGA-TA--TCCGAAN-GT-GACCGTGTTTTCT---GGTGGCT-TGACNT-CAAACN-TGCTANCGATATCG--TC---------GATATCGTGTCGATATCGAATCATG--------------ATCGT-NT-----------------T-------------CT-TA-TGG--ATGTTTGATG--GCTAC-AACTTGCTA-CATGTG-TCGATATCGAAT--CG--T--------TTCC-CGT-G-TTGTTTGANAGC----------TACAACTTGCTATCGATAACATCGA-TATCGTTTCGATAT-CGAATCATGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGACAGATAATGAGTTTGCCATCAAACACCCATAGGAAAAACGATCANGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACGATATCGAT----AGCAATATGTAGCCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGACATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAAGATAACCATTTTATG-AT---AGATA--ATA--CG--TTCGTAAGAAATCGATATCGACACGATATC--GTC-AT--------GC---------TA-TT----GT-----------CGAT-ATCGT--CGATATCG-----A-CGTTGTATTTGNTCTC-AAAAGACAANC--GTNT----TATG---AC--------AGA-AA----T--TTGCAAGATGTCGATA-TCGACACGA--------------------TATCG-----------TC-----GATATCGATGTTG-TATTTG
Reference ( family-1193 ) : GTCGATATCGAAT----CACGATATCGTGTTTCT-----TAC-GG-TGTTTGA------TGGCTAC--------AACTTGCTGTCGATATCG--ACGATATCGTAT---------CGATATCG-AT-C-ATGAT---CGT-TT--TGCTTAT-GNTTGTTTGACGACTTTAAATTGCTATCGATATCG--TCGATATCGTGTGTATATCGAATCGT---GATCGTATT-TCT----TA---CGGTTGT---TCG---AC---TTCAGCTTTCTATCGATATCGT---CGA-TA--TCCGAAT-AT-GACCGTGTTTTCTT-TGGTGGCT-TGACNT-CAAACN-TGCTANCGATATCG--TC---------GATATCGTGTCGATATCGAATCATG--------------ATCGT-NT-----------------T-------------CT-TA-TGG--ATGTTTGATG--GCTAC-AACCTGCTA-CATGTG-TCGATATCGAAT--CG--T--------TTCC-CGT-G-TTGTTTGANAGC----------TACAACTCGCTATCGATAACATCGA-TATCGTTTCGATATACGAATCATGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGACAGATAATGAGTTTGCCATCAAACACCNATAGGAAAAACGATCAAGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACGATATCGAT----AGCAATATGTAGCCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGACATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAAGATAACCATTTTATG-AT---AGATA--ATA--CG--TTCGTAAGAAATCGATATCGACACGATATC--GTC-AT--------GC---------TA-TT----GT-----------CGAT-ATCGT--CGATATCG-----A-CGTTGTATTTGNTCTC-AAAAGACAANC--ATCT----TATG---AC--------AG--------T--TTGCAAGACGTCGATA-TCGACACGA--------------------TATCG-----------TC-----GATATCGATGTTG-TATTTG
gi|1 : GTTAATATCGAAT----CAAGAC--CATGTTTCT-----TATTGG-TGCCTCC------TGACTAC--------AACTTGCTGTCGATATCG--ACGATATTGTTT---------CGATATCG-ATTC-ATAAT---AGC-TT--TGCTTAT-GGTTGTTTGACGACTTTAAATTGCTATCGATATCG--TCAATATCGTGTGGATATCGAATCAT---AATCGTGTT-TCT-----A---CGGTTGT---TTT---AC---TTCAACTTGCTATCGATATCGT---CGA-TA--TCCGAATCATAGATCGTGTTTTTTTATGGTAGTT-TGACTT-CAAACT-TGCTATCGATATTG--TC---------GATATCATGTCGATATCGAATCATG--------------AT-GT-AT-----------------T-------------CC-TA-TGG--CTCTTTGATG--ACTAC-AACCTGCTAACATGTAATCGATATCGAAT--TG--T--------TTCT-CGT-G-TTGTTTGAAAGC----------TACAACTTGCTATCGATAACATCGA-TATCGTTT---TATCCGAATCATGAT
gi|1 : ATATGACAGATTATGAGTTTGCCATCAAATACTAATAGGAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACGATATCGAT----AGCAATATGTAGTCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGATATTT----GTTCTTTACTTGTTC-CCTAAAGATAACCATTTTATG-GT---AGATA--ATA--CG--TTCGCAAGAAATCGATATCGACACGATATC--GTC-AT--------GC---------TA-TT----GT-----------CGAT-ATCAT--CAACAGGG-----A-CATTGAATTTGTTTTC-AAAAGACAAAC--ATCT----TATG---AC--------AG--------T--TCGCAAATTGTCGATA-TCGACACGA--------------------TATCG-----------TC-----GATATTGATGTTG-TATTTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagattatgagtttgccatcaaatactaataggaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacgatatcgatagcaatatgtagtcaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatatttgttctttacttgttccctaaagataaccattttatggtagataatacgttcgcaagaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattgtcgatatcatcaacagggacattgaatttgttttcaaaagacaaacatcttatgacagttcgcaaattgtcgatatcgacacgatatcgtcgatattgatgttgtatttg
gi|10 : gttaatatcgaatcaagaccatgtttcttattggtgcctcctgactacaacttgctgtcgatatcgacgatattgtttcgatatcgattcataatagctttgcttatggttgtttgacgactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtggatatcgaatcataatcgtgtttctacggttgttttacttcaacttgctatcgatatcgtcgatatccgaatcatagatcgtgtttttttatggtagtttgacttcaaacttgctatcgatattgtcgatatcatgtcgatatcgaatcatgatgtattcctatggctctttgatgactacaacctgctaacatgtaatcgatatcgaattgtttctcgtgttgtttgaaagctacaacttgctatcgataacatcgatatcgttttatccgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTGGTC-CTTGAAAACAATCAT---ATG--------------TA--CGACTTCGTAAGATGACAATATCTACACAATACC--CTC-AT--------GC---------TA-CT-------------------------GT--CAATATTG-----A-CATCATACTTGGTC----AATGAAAATC--GTGTTGTATATGGTAACCATA----AC--------T--TTGTTAGATGAGGATATTTGTCAAGC--------------------TATTG-----------TT-----GATATTGACATTGTTATTTG
gi|11 : T---CGT-TT--TGCTTATCGC--GTTTGACGACTTCAAATTGCTAgtctt
gi|12 : cannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttGACATTTTGGCGT-----ATTTGCTCATTGAA----AACTGTTATGTGTATTAAAGGTT--ACA--AC--TTTGTAA------GATGTCGAGATGATGTC--TTT-AC--------CC---------TG-TT----CT-----------CAAT-ATCGG--TGATATTG-----A-CATAACATTTGGTCT
gi|13 : tattCGATATC--AT--GT--------TC---------TGTTT----GA-----------CGAT-ATTGT--CGATACCGTATCTA-CATTGTGTCTt
gi|14 : cagttatgtcgaCGATATCG--TCGATATCTTATCTACATCGAGTCTT---GGGCATAaaacaaaataaaagtaaccttctggtggctttgataatcaaataat
gi|14 : agtTCGATATCG--T----TACGATATCATGTT-------------G-TGTTTGA-------------------------------CGATATCG--TCGATATCTTAT---------CTACATCG-Atcaaacacaacatgatatcgtaacgatatcgaaaagtaaccttctggaagccatgataatcaaaca
gi|14 : agttatgcccaagacTCGATATCGTTACGATATCATGTT-GT--------GT---------T---T----GA-----------CGAT-ATCGT--CGATATCaaagtaaccttctggaagccatgataatcaaaca
gi|15 : agttatgcccaagactcgatgtagataaC---------GATATCGTGTTGATATCGAATCATGATAGTGTTTTTTAAATCGTGTT-----------------T-------------CT-TA-TGG--ATGTTCCATG--GCTAC-AACTTACaaagtaaccttctggaagccatgataatcaaaca
gi|16 : gttagtgaTGACGATATCGAATT---------GTGATCATGTTT-TATTAAATCATG--------------------CT-----------------T-------------CA-TA-TGG--ATGTTTGATG--GCTAC-AACTTG
gi|17 : acaatgttaaGATATCG--TC---------GATATCGTGTCGATATCGAATCCTT--------------ATCGT-GT-----------------T-------------TT-TA-TGG--AGGTTTGA-----CTTC-AACTTGCTA-
gi|18 : ATATCGACACGATATC--GTCTAT--------GC---------TATTT----GT-----------CGTT-ATC----------CG-----A-TGTTGTATTTG
gi|19 : -TGTCTGA------TGACTAC--------AACCTGCTATCGATATCG--A
gi|2 : --TGCTTAT-GTTTGTTTGACAACTTTAAATTGCTATCGATATCG--TCAATATCGTGTGTATATCGAATCAT---GATCGTATT-TCT----TA---CGATTGT---TCG---AC---TTCAGCTTTCTATCTATATCGT---CGA-T---TTCGAa
gi|2 : AATCATG--------------ATTGT-AT-----------------T-------------TTCTA-TGG--CTGTTTAATG--ACTAC-AACCTGCTG-CATATA-TCGATATCGAAT---GTTT--------TTCC-CGTGG-TTGTTTGAAAGCTACAAAAATGTACAACTTGCTATCGATAAGATCGAGTATCGTTT-GATAC-CGAATATTGATcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|2 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCGATATCGTGTCGATATCGATTTGTTGCGAACGTATTATCTATCATAAAATGGTTATCTTTCGGGAACAAATACAA-----TATCGGT-TCAT---CAAATAATTTAGAAT-AT-GG--GTGTTT------GGTGGCT---ACCT----A-T-TGCTATCGATATCG--TCAATATCGACGATATCGTGTCGATATTGAATCAAT--------------ATCTT-TT-----------------TTC-----------TT-TACTGG--GTGTTTAATG--GCTAT-ATCTTGC-------TG-TCGATATCGAAT--CA--TGATCG---TTTT-TG--G-GTGTTTAATGGC-----------A-AACTCATTATCCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|2 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgGACGATATCGAT----AGCAATAGGTAGCCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGATATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAAGATAACCATTTTATG-AT---AGATA--ATA--CG--TTCGCAACAAATCGATATCGACACGATATC--GTC-AT--------GCTATTAAAAATA-TT----GT-----------CGAT-ATCGT--CGATATCG-----A-TGTTGCATTTtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|3 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatatt-----------------T-------------CT-TA-TGG--GTGTTTGATG--ACTAT-AGCCTGCTA-CATGTA-TCGATATCGAAT--TT--T--------TTTCTCGT-GGTTGTTTGACAGC----------TACAACTTGCTATCGATAACATCGC-TATCGTTTCGATAT-CGAATCATGAT
gi|3 : ATATGACAGATAATTAGTTTGCCATCAAACAGCTATAGGAAAAACGATCAAGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----AGCAATATGTAGCCACCAAACACCCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataattagtttgccatcaaacagctataggaaaaacgatcaagattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaatatgtagccaccaaacacccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaataatctaaattatttgataccgacattgcatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataataagttcgtaagaaatcgatatcgacacgatatcgttatgttattgtcgataccgtcgacatcgatcattgtatgtgttttcaaaaaaacaaacatcttatgacagatactgagtttgcaagacgtcaatatcgacacgacatggtcacgttattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgtatttg
gi|3 : tcttatgggtgtttgatgactatagcctgctacatgtatcgatatcgaatttttttctcgtggttgtttgacagctacaacttgctatcgataacatcgctatcgtttcgatatcgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAATCTAAATTAT-TTGAT--ACCGACATT-----GC-----ATTTGTTC-CCGAAAGATAACCATTTTATG-AT---AGATA--ATA--AG--TTCGTAAGAAATCGATATCGACACGATATC--GTT-AT--------GT---------TA-TT----GT-----------CGAT-ACCGT--CGACATCG-----ATCATTGTATGTGTTTTCAAAAAAACAAAC--ATCT----TATG---ACAGATACTGAG--------T--TTGCAAGACGTCAATA-TCGACACGACATGGTCACGTTATTGTCGATATCG-----------TC-----GATATCGATGTTG-TATTTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaataatctaaattatttgataccgacattgcatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataataagttcgtaagaaatcgatatcgacacgatatcgttatgttattgtcgataccgtcgacatcgatcattgtatgtgttttcaaaaaaacaaacatcttatgacagatactgagtttgcaagacgtcaatatcgacacgacatggtcacgttattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgtatttg
gi|4 : tcttatgggtgtttgatgactatagcctgctacatgtatcgatatcgaatttttttctcgtggttgtttgacagctacaacttgctatcgataacatcgctatcgtttcgatatcgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataattagtttgccatcaaacagctataggaaaaacgatcaagattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaatatgtagccaccaaacacccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaTA--TG--TTC--AAGACAG-GATGTAGATACGATATC--G---AC--------GA---------TA-TC----GTCAAACACAACACGAT-ATCGTAACGATATCG-----A-
gi|4 : agtTCGATATCG--T----TACGATATCGTGTT-------------G-TGTTTGA-------------------------------CGATATCG--TCGATATCGTAT---------CTACATCaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|4 : agttatgttcaagacagTCAATGTCAA------CACGACATCGT--CACT-----AAC-AT-TGTTTGAATATCATAGCCACCAGAAGGTAACTT--T-TCGATATCGTTACGATATCGTGTTGTGTTTGACGATATCG--T-CGAT-AT---CGT-aaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|4 : agttatgttcaagacaggatgtagatCGATATCGTAA-CGA-TA--TCGAAAA-GT-TACC-----TTCT---GGTGGCTATGATATTCAAACAATGTTAGTGA--------C---------GATGTCGTGTTGACATTGAATCATG--------------ATCGT-GT-----------------TTTAAATCGCGTTTCT-TA-TGA--ATGTTTGATG--GCTAC-AACTTGC-------TG-TCGATATCGatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|4 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgatatcgacgatatcgtcaaacacaacaT--TGCTTAT-GTTTGTTTGACAACTTTAAATTGCTATCGATATCG--TCAATATCGTGTGTATATCGAATCAT---GATCGTATT-TCT----TA---CGATTGT---TCG---AC---TTCAGCTTTCTATCTATATCGT---CGA-TT--TCtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|5 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgatatcgacgatatcgtcaaacacaacacgatatcgtaacgatatcgaaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--ACGTTTGATGATGGTACTAA--TTCTA--------TCGATATCGAAT--CA--TGATTGTATTTCC-TAT-GGCTGTTTGATGAC----------TACAACCTGCTAC--AT-GTATCGA-TATCG
gi|5 : aTATCGATATCGAATCATG--------------ATTGT-AT-----------------TT------------CC-TA-TGG--CTGTTTGATG--ACTAC-AACCTGCTA-CATGTA-TCGATATCGAATTGTG--T--------TTCT-CGTGG-TTGTTTGAAAGC----------TACAACTTGTTATCGATAACATCGA-TATCAATGC-ATAAACGAATTATGATaattgtgtttctcgtggttgtttgaaagctacaacttgttatcgataacatcgatatcaatgcataaacgaattatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataatggatttgccatcaaacacccataggaaaaac
gi|5 : aacgtttgatgatggtactaattcATATGACAGATAATGGATTTGCCATCAAACACCCATAGGAAAAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataatggatttgccatcaaacacccataggaaaaac
gi|6 : aacgtttgatgatggtactaattctatcgatatcgaatcatgattgtatttcctatggctgtttgatgactacaacctgctacatgtatcgatatcgaattgtgtttctcgtggttgtttgaaagctacaacttgttatcgataacatcgatatcaatgcataaacgaattatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT-----GT-----AGTTGGAC-CTATAGGAAAAC----TTAAC-AT---ACATG--ATA--CC--TTTGTAAAACGACTATATGGACACGATATC--GTT-AT--------GC---------CA-TTCATTGT-----------CGAT-ATCGT--CGATATCG-----A-CGAAAGATTTGGTCCT-TAGAGACAATCTGGTGTA---TATG---AT--------AGAAAA----TGACGGTAAAATGACGATT-TCGATACGA--------------------TATCG-----------CCATGCTGTTGTCGATATTG-
gi|7 : cacacgtaattgaaattaccttctttgttgaattaagacctttcattcctcttttatACAGATAGTGAGTTTTCCATCAAACACTCATATGAAAAACGATCACGATT
gi|7 : GTCAGTATCAAATAATTTACAATATCG-----------------G-TGTTTGG------TGGCTAT--------ATCTTGCTGTCGATTTCG--ACGATATCGTAT---------CGATATTGAAT-C-GTGAT---CGT-TT--TTCATAT-GAGTGTTTGATGcaatatcgatacgatatcgtcgaaatcgacagcaagatatagccaccaaacaccgatattgtaaattatttgatactgacattgtatttgttccaaaaatagccatttatgacagataattagtttgcaagaagtcgatatcgacacgacatggtcaagttattttcggtatcgatgttgtaac
gi|7 : acagatagtgagttttcAACGATCACGATTCAAT--AT---CGATACGATA-------TCGTC-GAAATCGA---CAGCAAGATATA--GCC-ACCAAACACCGA---------TA-TT----GT-----------AAATTAT--T--TGATACTG-----A-CATTGTATTTGTTC-C-AAAA-ATAGCC--AT-T----TATG---AC--------AGATAATTAGT--TTGCAAGAAGTCGATA-TCGACACGA--------------------CATGGTCAAGTTATTTTC-----GGTATCGATGTTG-TAattgtatttgttccaaaaatagccatttatgacagataattagtttgcaagaagtcgatatcgacacgacatggtcaagttattttcggtatcgatgttgtaac
gi|7 : acagatagtgagttttccatcaaacactcatatgaaaCGAAATCGAC----AGCAAGATATAGCCACCAAACACCGATATTGTAAATTAT-TTGAT--ACTGACATT-----GT-----ATTTGTTC-C--AAAAATAGCCATTT-ATG-AC---AGATA--ATT--AG--TTTGCAAGAAGTCGATATCGACACGACATG--GTC-AA--------GT---------TA-TT----TT-----------CGGT-ATCGac
gi|8 : acagatagtgagttttccatcaaacactcatatgaaaaacgatcacgattcaatatcgatacgatatcgtTCGATATCAA------CACGACATCGT--CACT-----AAC-A--TGTTTGA------TATCTA--------------GCCACCA-----G--AAGGTCACTTTT---------CGATATCG-TT-T-ACGATATCCGTGTT--TG---------TGTTTGACGA---TAATTCG---TCGATA-CGTATCTACATCGTGTatgttgtaac
gi|8 : gagtatgtccaagGATATCGTAAACGA-TA--TCGAAAA-GT-GACC-----TTCT---GGTGGCT-AGATAT-CAAACA-TGTTAGTGA--------C---------GATGTCGTGTTGATATCGAATCATG--------------ATCGT-GTTTTTTAAATGTGTTTTCT-------------CT-TACTGGAAATGTTTGATG--GCTACAAACTTGC-------TG-CCGATATCGatcatgatcgtgttttttaaatgtgttttctcttactggaaatgtttgatggctacaaacttgctgccgatatcgtt
gi|9 : gagtatgtccaagacacgatgtagatacgtatcgacgaattatcgtcaaacacaaacacgTCGATAT-GAAT----CAAGAT--CGT-TTTCTCGTTATAT-GGGTGTTTAA------TGGCTAT--------ATC-TGC-GTTGAT-TCG--ACGATA-CGTGT---------CGATATCG-A--C-ATGAT---CGT-TTTCTGTTTCT-TATTGTTTAATGGCtt
gi|9 : tACGATCTTGATTCATATCGATATGC-----CCAAACACC-ATATTCTAAATTATATTGATGAAC--GTATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAAGATAACCATTTTATG-AT---AGATA--ATACCCG--CTCGtatgcccaaacaccatattctaaattatattgatgaacgtattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacccgctcgacaag
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 22 888888888888888888888888888888888888888888888 2222 1111 11 111 1 333333333 111 111 111 222 44444 111 22 11 222222222222222222 55555555555555555555555555555555555555555555555555555 3333333333 555555555555555 111 2222222222 11 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111 11 22222 11111 111111 2222222222222222222222222222222222222222222222222 111 555555555555555555555555555555555555 888888888888888888888888888888888888888888888888888888 111
lowQualScore : 22 66 444444444444444444444444444444444444444444444 1 8 1 1 1 5 3333 0 99 66 44 5555 4 2 0 11 2 0 2 777 0 333333333 777 777 777 2 3 555 5 999 6 99 8 3 11111 0 444 22 99 8 11 1 888888888888888888 44444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 8 555 44 3 6666666666 666666666666666 6 666 1 9999999999 88 55 8 8 1 0 1 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 7777 0 5 8 00 3 00000 44444 5 33 0 0 2 4 777 66 111111 0 55 3 44 33 1111111111111111111111111111111111111111111111111 3 44 1 99999 3 1 66 000 44 55 000000000000000000000000000000000000 6 222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111 6
lowQualScore : .. .. ............................................. . . . . . . .... . .. .. .. .... . . . .. . . . ... . ......... ... ... ... . . ... . ... . .. . . ..... . ... .. .. . .. . .................. ..................................................... . . ... .. . .......... ............... . ... . .......... .. .. . . . . . ......................................................................................................... .... . . . .. . ..... ..... . .. . . . . ... .. ...... . .. . .. .. ................................................. . .. . ..... . . .. ... .. .. .................................... . ...................................................... ... .
lowQualScore : 77 88 777777777777777777777777777777777777777777777 4 9 9 7 0 7 4444 8 22 99 88 0000 3 5 8 00 2 6 0 555 0 000000000 555 555 555 5 0 777 7 666 7 00 0 2 22222 8 000 00 00 0 00 0 000000000000000000 33333333333333333333333333333333333333333333333333333 0 0 333 66 3 6666666666 000000000000000 7 777 0 2222222222 66 00 0 0 4 2 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0000 8 0 0 66 2 00000 33333 0 66 8 1 0 4 888 11 111111 8 11 3 22 88 8888888888888888888888888888888888888888888888888 1 66 6 11111 6 2 77 666 55 00 555555555555555555555555555555555555 7 777777777777777777777777777777777777777777777777777777 777 7
consensus : GTCGATATCGA-TCACGACATCGTGTTC--T------A-C-GG-TGTTTGATG-CTA--CA-CTTG-C-GTCGATATCGACGATATCGTNT-CGATATCG-AT-CGTGAT--CGTTT--TGCTTAT-GNTTGTTTGACGACTTTAAATTGCTATCGATATCG--TCGATATCGTGTGTATATCGAATCGT---GATCGTATT-TCT----TA---CGGTTGT---TCG---AC---TTCAGCTTTCTATCGATATCGTAA-CGA-TA--TCGGAAA-GT-GACCGTGTTTTCT---GGTGGCTATGAT-AT-CAAACN-TGCTANCGATATCG--TC---------GATATCGTGTCGATATCGAATCATG--------------ATCGT-NT-----------------T-------------CT-TA-TGG--ATGTTTGATG--GCTAC-AACTTGCTA-CATGTG-TCGATATCGAAT--CG--T--------TTCC-CGT-G-TTGTTTGANAGC----------TACAACTTGCTATCGATAACATCGA-TATCGTTTCGAT-ATC-GAATCGTGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGACAGATAATGAGTTTGCCATCAAACACCCATAGGAAAAACGATCANGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACGATATCGAT----AGCAATATGTAGCCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGACATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAAGATAACCATTTTATG-AT---AGATA--ATA--CG--TTCGTAAGAAAT-CGATATCGA-CACGATATC--GTC-AT--------GC---------T--A-TT----GT-----------C-----GAT-ATCGT--CGATATCG-----A-CGTTGTATTTGN-TCTC-AAAAGACAANC--GT-T----TATGA----CAGA-----AGTT---TGCAAGATGTCGATA-TCGACACGA--------------------TATCG-----------T-----------C-----GATA---TCGATGTTG-TATTTG
Reference ( family-1193 ) : GTCGATATCGAATCACGACATCGTGTTC--T------A-C-GG-TGTTTGATGGCTA--CA-CTTG-CTGTCGATATCGACGATATCGTNT-CGATATCG-AT-CATGAT--CGTTT--TGCTTAT-GNTTGTTTGACGACTTTAAATTGCTATCGATATCG--TCGATATCGTGTGTATATCGAATCGT---GATCGTATT-TCT----TA---CGGTTGT---TCG---AC---TTCAGCTTTCTATCGATATCGT---CGA-TA--TCCGAAN-GT-GACCGTGTTTTCT---GGTGGCT-TGAC-NT-CAAACN-TGCTANCGATATCG--TC---------GATATCGTGTCGATATCGAATCATG--------------ATCGT-NT-----------------T-------------CT-TA-TGG--ATGTTTGATG--GCTAC-AACTTGCTA-CATGTG-TCGATATCGAAT--CG--T--------TTCC-CGT-G-TTGTTTGANAGC----------TACAACTTGCTATCGATAACATCGA-TATCGTTTCGAT-ATC-GAATCATGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGACAGATAATGAGTTTGCCATCAAACACCCATAGGAAAAACGATCANGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACGATATCGAT----AGCAATATGTAGCCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGACATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAAGATAACCATTTTATG-AT---AGATA--ATA--CG--TTCGTAAGAAAT-CGATATCGA-CACGATATC--GTC-AT--------GC---------T--A-TT----GT-----------C-----GAT-ATCGT--CGATATCG-----A-CGTTGTATTTGN-TCTC-AAAAGACAANC--GTNT----TATGA----CAGA-----AATT---TGCAAGATGTCGATA-TCGACACGA--------------------TATCG-----------T-----------C-----GATA---TCGATGTTG-TATTTG
gi|1 : GTTAATATCGAATCAAGAC--CATGTTTCTT------A-TTGG-TGCCTCCTGACTA--CAACTTG-CTGTCGATATCGACGATATTGTTT-CGATATCG-ATTCATAAT--AGCTT--TGCTTAT-GGTTGTTTGACGACTTTAAATTGCTATCGATATCG--TCAATATCGTGTGGATATCGAATCAT---AATCGTGTT-TCT-----A---CGGTTGT---TTT---AC---TTCAACTTGCTATCGATATCGT---CGA-TA--TCCGAATCATAGATCGTGTTTTTTTATGGTAGTT-TGAC-TT-CAAACT-TGCTATCGATATTG--TC---------GATATCATGTCGATATCGAATCATG--------------AT-GT-AT-----------------T-------------CC-TA-TGG--CTCTTTGATG--ACTAC-AACCTGCTAACATGTAATCGATATCGAAT--TG--T--------TTCT-CGT-G-TTGTTTGAAAGC----------TACAACTTGCTATCGATAACATCGA-TATCGTTT---T-ATCCGAATCATGAT
gi|1 : ATATGACAGATTATGAGTTTGCCATCAAATACTAATAGGAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACGATATCGAT----AGCAATATGTAGTCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGATATTT----GTTCTTTACTTGTTC-CCTAAAGATAACCATTTTATG-GT---AGATA--ATA--CG--TTCGCAAGAAAT-CGATATCGA-CACGATATC--GTC-AT--------GC---------T--A-TT----GT-----------C-----GAT-ATCAT--CAACAGGG-----A-CATTGAATTTGT-TTTC-AAAAGACAAAC--ATCT----TATGA----CAG--------TT---CGCAAATTGTCGATA-TCGACACGA--------------------TATCG-----------T-----------C-----GATA---TTGATGTTG-TATTTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagattatgagtttgccatcaaatactaataggaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacgatatcgatagcaatatgtagtcaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatatttgttctttacttgttccctaaagataaccattttatggtagataatacgttcgcaagaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattgtcgatatcatcaacagggacattgaatttgttttcaaaagacaaacatcttatgacagttcgcaaattgtcgatatcgacacgatatcgtcgatattgatgttgtatttg
gi|10 : gttaatatcgaatcaagaccatgtttcttattggtgcctcctgactacaacttgctgtcgatatcgacgatattgtttcgatatcgattcataatagctttgcttatggttgtttgacgactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtggatatcgaatcataatcgtgtttctacggttgttttacttcaacttgctatcgatatcgtcgatatccgaatcatagatcgtgtttttttatggtagtttgacttcaaacttgctatcgatattgtcgatatcatgtcgatatcgaatcatgatgtattcctatggctctttgatgactacaacctgctaacatgtaatcgatatcgaattgtttctcgtgttgtttgaaagctacaacttgctatcgataacatcgatatcgttttatccgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTGGTC-CTTGAAAACAATCAT---ATG--------------TA--CGACTTCGTAAGATGA-CAATATCTA-CACAATACC--CTC-AT--------GC---------T--A-CT------------------------------GT--CAATATTG-----A-CATCATACTTGG-TC----AATGAAAATC--GTGTTGTATATGGTAACCATA-----ACTT---TGTTAGATGAGGATATTTGTCAAGC--------------------TATTG-----------T-----------T-----GATA---TTGACATTGTTATTTG
gi|11 : T--CGTTT--TGCTTATCGC--GTTTGACGACTTCAAATTGCTAgtctt
gi|12 : cannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttGACATTTTGGCGT-----ATTTGCTCATTGAA----AACTGTTATGTGTATTAAAGGTT--ACA--AC--TTTGTAA-------GATGTCGA-GATGATGTC--TTT-AC--------CC---------T--G-TT----CT-----------C-----AAT-ATCGG--TGATATTG-----A-CATAACATTTGG-TCT
gi|13 : tattCGATATC--AT--GT--------TC---------T--GTTT----GA-----------C-----GAT-ATTGT--CGATACCGTATCTA-CATTGTGTCTt
gi|14 : cagttatgtcgaTCGATATCG--TTACGATATCATGTT---------------G-TGTTTGA--------------------CGATATCGTCGATATCTTAT-CTACATCG-Aaaacaaaataaaagtaaccttctggtggctttgataatcaaataat
gi|14 : agttatgcccaagacT-CGATATCGT-TACGATATCATGTT-GT--------GT---------T-----T----GA-----------C-----GAT-ATCGT--CGATATCaaagtaaccttctggaagccatgataatcaaaca
gi|14 : agttatgcccaagactcgatgtagataaGATATCGTAA-CGA-TA--TCGAAAA-GT-AACC-----TTCT---GGAAGCCATGATAAT-CAAACaaagtaaccttctggaagccatgataatcaaaca
gi|15 : agttatgcccaagactcgatgtagataagatatcgacgatatcgtcaaacacaacatC---------GATATCGTGTTGATATCGAATCATGATAGTGTTTTTTAAATCGTGTT-----------------T-------------CT-TA-TGG--ATGTTCCATG--GCTAC-AACTTACa
gi|16 : gttagtgaTGACGATATCGAATT---------GTGATCATGTTT-TATTAAATCATG--------------------CT-----------------T-------------CA-TA-TGG--ATGTTTGATG--GCTAC-AACTTG
gi|17 : acaatgttaaGATATCG--TC---------GATATCGTGTCGATATCGAATCCTT--------------ATCGT-GT-----------------T-------------TT-TA-TGG--AGGTTTGA-----CTTC-AACTTGCTA-
gi|18 : ATATCGA-CACGATATC--GTCTAT--------GC---------T--ATTT----GT-----------C-----GTT-ATC----------CG-----A-TGTTGTATTTG
gi|19 : TGTCTGATG--ACTAC-AACCTGCTA--------TCGATATCGAA
gi|2 : --TGCTTAT-GTTTGTTTGACAACTTTAAATTGCTATCGATATCG--TCAATATCGTGTGTATATCGAATCAT---GATCGTATT-TCT----TA---CGATTGT---TCG---AC---TTCAGCTTTCTATCTATATCGT---CGA-T---TTCGA
gi|2 : AATCATG--------------ATTGT-AT-----------------T-------------TTCTA-TGG--CTGTTTAATG--ACTAC-AACCTGCTG-CATATA-TCGATATCGAAT---GTTT--------TTCC-CGTGG-TTGTTTGAAAGCTACAAAAATGTACAACTTGCTATCGATAAGATCGAGTATCGTTT-GAT-ACC-GAATATTGATcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|2 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCGATATCGTGTCGATATCGATTTGTTGCGAACGTATTATCTATCATAAAATGGTTATCTTTCGGGAACAAATACAA-----TATCGGT-TCAT---CAAATAATTTAGAAT-AT-GG--GTGTTT------GGTGGCT---AC-CT----A-T-TGCTATCGATATCG--TCAATATCGACGATATCGTGTCGATATTGAATCAAT--------------ATCTT-TT-----------------TTC-----------TT-TACTGG--GTGTTTAATG--GCTAT-ATCTTGC-------TG-TCGATATCGAAT--CA--TGATCG---TTTT-TG--G-GTGTTTAATGGC-----------A-AACTCATTATCCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|2 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgGACGATATCGAT----AGCAATAGGTAGCCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGATATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAAGATAACCATTTTATG-AT---AGATA--ATA--CG--TTCGCAACAAAT-CGATATCGA-CACGATATC--GTC-AT--------GCTATTAAAAAT--A-TT----GT-----------C-----GAT-ATCGT--CGATATCG-----A-TGTTGCATTTtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|3 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatatt-----------------T-------------CT-TA-TGG--GTGTTTGATG--ACTAT-AGCCTGCTA-CATGTA-TCGATATCGAAT--TT--T--------TTTCTCGT-GGTTGTTTGACAGC----------TACAACTTGCTATCGATAACATCGC-TATCGTTTCGAT-ATC-GAATCATGAT
gi|3 : ATATGACAGATAATTAGTTTGCCATCAAACAGCTATAGGAAAAACGATCAAGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----AGCAATATGTAGCCACCAAACACCCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataattagtttgccatcaaacagctataggaaaaacgatcaagattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaatatgtagccaccaaacacccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaataatctaaattatttgataccgacattgcatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataataagttcgtaagaaatcgatatcgacacgatatcgttatgttattgtcgataccgtcgacatcgatcattgtatgtgttttcaaaaaaacaaacatcttatgacagatactgagtttgcaagacgtcaatatcgacacgacatggtcacgttattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgtatttg
gi|3 : tcttatgggtgtttgatgactatagcctgctacatgtatcgatatcgaatttttttctcgtggttgtttgacagctacaacttgctatcgataacatcgctatcgtttcgatatcgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAATCTAAATTAT-TTGAT--ACCGACATT-----GC-----ATTTGTTC-CCGAAAGATAACCATTTTATG-AT---AGATA--ATA--AG--TTCGTAAGAAAT-CGATATCGA-CACGATATC--GTT-AT--------GT---------T--A-TT----GT-----------C-----GAT-ACCGT--CGACATCG-----ATCATTGTATGTGT-TTTCAAAAAAACAAAC--ATCT----TATGA----CAGATACTGAGTT---TGCAAGACGTCAATA-TCGACACGACATGGTCACGTTATTGTCGATATCG-----------T-----------C-----GATA---TCGATGTTG-TATTTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaataatctaaattatttgataccgacattgcatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataataagttcgtaagaaatcgatatcgacacgatatcgttatgttattgtcgataccgtcgacatcgatcattgtatgtgttttcaaaaaaacaaacatcttatgacagatactgagtttgcaagacgtcaatatcgacacgacatggtcacgttattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgtatttg
gi|4 : tcttatgggtgtttgatgactatagcctgctacatgtatcgatatcgaatttttttctcgtggttgtttgacagctacaacttgctatcgataacatcgctatcgtttcgatatcgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataattagtttgccatcaaacagctataggaaaaacgatcaagattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaatatgtagccaccaaacacccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaTA--TG--TTC--AAGACAG--GATGTAGA-TACGATATC--G---AC--------GA---------T--A-TC----GTCAAACACAACAC-----GAT-ATCGTAACGATATCG-----A-
gi|4 : agtTCGATATCG--TTACGATATCGTGTT---------------G-TGTTTGA--------------------CGATATCGTCGATATCGTAT-CTACATCaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|4 : agttatgttcaagacagTCAATGTCAA--CACGACATCGT-CAC--T------AAC-AT-TGTTTGA---ATAT-CA--TAG-CCACCA-----GAAGGTAACTTTT-CGATATCG--T-TACGATATCGTGT--TG---------TGTTTGACGA-----------------TATCG--TCGATATCGTATCTACATCaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|4 : agttatgttcaagacagA--CA--TTCATAAGAAACGCGATTTAAAACACGAT-------C-AT--------GA---------TTCA-AT----GT-----------CAACACGAC-ATCGT--CACTA--------A-CATTGT--TTGAATATC-ATA-GCCA--C-------------------CAGA-----AG------GTAACTTTTCGATA-TCGTTACGA--------------------TATCG-----------TGTTGTGTTTGAC-----GATATCGTCGATATCG-TATCTatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|4 : agttatgttcaagacaggatgtCGATATCGTAA-CGA-TA--TCGAAAA-GT-TACC-----TTCT---GGTGGCTATGAT-ATTCAAACAATGTTAGTGA--------C---------GATGTCGTGTTGACATTGAATCATG--------------ATCGT-GT-----------------TTTAAATCGCGTTTCT-TA-TGA--ATGTTTGATG--GCTAC-AACTTGC-------TG-TCGATATCGttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|4 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgatatcgacgatatcgtcaaacacaacaT--TGCTTAT-GTTTGTTTGACAACTTTAAATTGCTATCGATATCG--TCAATATCGTGTGTATATCGAATCAT---GATCGTATT-TCT----TA---CGATTGT---TCG---AC---TTCAGCTTTCTATCTATATCGT---CGA-TT--TCtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|5 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgatatcgacgatatcgtcaaacacaacacgatatcgtaacgatatcgaaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--ACGTTTGATGATGGTAC-TAATT-CTA--------TCGATATCGAAT--CA--TGATTGTATTTCC-TAT-GGCTGTTTGATGAC----------TACAACCTGCTA-------CAT--------GTATCGAT-ATC-GAATTGTG
gi|5 : aTATCGATATCGAATCATG--------------ATTGT-AT-----------------TT------------CC-TA-TGG--CTGTTTGATG--ACTAC-AACCTGCTA-CATGTA-TCGATATCGAATTGTG--T--------TTCT-CGTGG-TTGTTTGAAAGC----------TACAACTTGTTATCGATAACATCGA-TATCAATGC-ATAAAC-GAATTATGATtttctcgtggttgtttgaaagctacaacttgttatcgataacatcgatatcaatgcataaacgaattatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataatggatttgccatcaaacacccataggaaaaac
gi|5 : aacgtttgatgatggtactaattcATATGACAGATAATGGATTTGCCATCAAACACCCATAGGAAAAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataatggatttgccatcaaacacccataggaaaaac
gi|6 : aacgtttgatgatggtactaattctatcgatatcgaatcatgattgtatttcctatggctgtttgatgactacaacctgctacatgtatcgatatcgaattgtgtttctcgtggttgtttgaaagctacaacttgttatcgataacatcgatatcaatgcataaacgaattatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT-----GT-----AGTTGGAC-CTATAGGAAAAC----TTAAC-AT---ACATG--ATA--CC--TTTGTAAAACGA-CTATATGGA-CACGATATC--GTT-AT--------GC---------C--A-TTCATTGT-----------C-----GAT-ATCGT--CGATATCG-----A-CGAAAGATTTGG-TCCT-TAGAGACAATCTGGTGTA---TATGA----TAGA-----AAATGACGGTAAAATGACGATT-TCGATACGA--------------------TATCG-----------C-----------CATGCTGTTG---TCGATATTG-
gi|7 : cacacgtaattgaaattaccttctttgttgaattaagacctttcattcctcttttatACAGATAGTGAGTTTTCCATCAAACACTCATATGAAAAACGATCACGATT
gi|7 : -C-GG-TGTTTGGTGGCTA--TATCTTG-CTGTCGATTTCGACGATATCGTAT-CGATATTGAAT-CGTGAT--CGTTT--TTCATAT-GAGTGTTTGATGcaatatcgatacgatatcgtcgaaatcgacagcaagatatagccaccaaacaccgatattgtaaattatttgatactgacattgtatttgttccaaaaatagccatttatgacagataattagtttgcaagaagtcgatatcgacacgacatggtcaagttattttcggtatcgatgttgtaac
gi|7 : acagatagtgagttttcAACGATCACGATTCAAT--AT---CGATACGATA-------TCGTC-GAAAT-CGA---CAG-CAAGATATA--GCC-ACCAAACACCGA---------T--A-TT----GT-----------A-----AATTAT--T--TGATACTG-----A-CATTGTATTTGT-TC-C-AAAA-ATAGCC--AT-T----TATGA----CAGATAATTAGTT---TGCAAGAAGTCGATA-TCGACACGA--------------------CATGGTCAAGTTATTTT-----------C-----GGTA---TCGATGTTG-TAatattgtaaattatttgatactgacattgtatttgttccaaaaatagccatttatgacagataattagtttgcaagaagtcgatatcgacacgacatggtcaagttattttcggtatcgatgttgtaac
gi|7 : acagatagtgagttttccatcaaacactcatatgaaaCGAAATCGAC----AGCAAGATATAGCCACCAAACACCGATATTGTAAATTAT-TTGAT--ACTGACATT-----GT-----ATTTGTTC-C--AAAAATAGCCATTT-ATG-AC---AGATA--ATT--AG--TTTGCAAGAAGT-CGATATCGA-CACGACATG--GTC-AA--------GT---------T--A-TT----TT-----------C-----GGT-ATCGac
gi|8 : acagatagtgagttttccatcaaacactcatatgaaaaacgatcacgattcaatatcgatacgatatcgtTCGATATCAA--CACGACATCGT-CAC--T------A-A-CA-TGTTTGATATCTAGCCA-CCAGAAGGTCACTTTT--CGATATCGTTTACGATATC-----CGTG-------TT--TG---------TGTTTGACGA---TAATTCG---TCGATA-CGTATCTACATCGTGTatgttgtaac
gi|8 : gagtatgtccaagGATATCGTAAACGA-TA--TCGAAAA-GT-GACC-----TTCT---GGTGGCT-AGAT-AT-CAAACA-TGTTAGTGA--------C---------GATGTCGTGTTGATATCGAATCATG--------------ATCGT-GTTTTTTAAATGTGTTTTCT-------------CT-TACTGGAAATGTTTGATG--GCTACAAACTTGC-------TG-CCGATATCGatcatgatcgtgttttttaaatgtgttttctcttactggaaatgtttgatggctacaaacttgctgccgatatcgtt
gi|9 : gagtatgtccaagacacgatgtagatacgtatcgacgaattatcgtcaaacacaaacacgTCGATAT-GAATCAAGA--TCGTTTTC--TCGTTATA-T-GGGTGTTTAATGGCTA--TA-TCTG-C-GTTGAT-TCGACGATA-CGTGT-CGATATCG-A--CATGAT--CGTTTTCTGTTTCT-TATTGTTTAATGGCtt
gi|9 : tACGATCTTGATTCATATCGATATGC-----CCAAACACC-ATATTCTAAATTATATTGATGAAC--GTATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAAGATAACCATTTTATG-AT---AGATA--ATACCCG--CTCGtatgcccaaacaccatattctaaattatattgatgaacgtattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacccgctcgacaag
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 11 00000000000000000000000000000000000000000 2222 1111 11 111 1 22222 111 111 111 111 1111 444444 1111 1 2222 33333333333 55555555555555555555555555555555555555555555555555555 11111 44444444444444444 7777777777777777777777777777777777777777777777777 2222222222 11 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111 11 22222 11111 111111 1111111111111111111 11111111111111111 11111 1111 5555555555555555555555555555555555 7777777777777777777777777777777777777777777
lowQualScore : 999 22 5 66666666666666666666666666666666666666666 7 3 1 6 3333 3 77 0000 0 11 2 0 4 444 1 0 44444 777 777 777 777 2 3 66 4444 3 0 77 1 888888 1111 66 33 0 5 0000 2 777 3 66 88888888888 00000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 7 22222 44 3 44444444444444444 0000000000000000000000000000000000000000000000000 1 5555555555 1 0 6 11 8 8 66 0 1 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 7777 0 5 8 00 3 00000 44444 5 33 0 0 2 4 777 66 222222 0 222 44 9999999999999999999 7 99999999999999999 3 55 00000 4 0 1 7777 3 1 3333333333333333333333333333333333 1 8 4444444444444444444444444444444444444444444 8
lowQualScore : ... .. . ......................................... . . . . .... . .. .... . .. . . . ... . . ..... ... ... ... ... . . .. .... . . .. . ...... .... .. .. . . .... . ... . .. ........... ..................................................... . . ..... .. . ................. ................................................. . .......... . . . .. . . .. . . ......................................................................................................... .... . . . .. . ..... ..... . .. . . . . ... .. ...... . ... .. ................... . ................. . .. ..... . . . .... . . .................................. . . ........................................... .
lowQualScore : 444 00 0 22222222222222222222222222222222222222222 8 7 0 7 1111 2 99 7777 8 00 2 6 6 000 0 0 55555 555 555 555 555 5 0 99 8888 6 2 99 7 333333 4444 99 11 0 0 4444 2 444 2 99 99999999999 55555555555555555555555555555555555555555555555555555 6 3 99999 22 1 44444444444444444 7777777777777777777777777777777777777777777777777 0 0000000000 4 7 7 77 0 0 00 2 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0000 8 0 0 66 2 00000 33333 0 66 8 1 0 4 888 11 666666 1 777 88 7777777777777777777 3 66666666666666666 6 55 00000 0 7 0 0000 2 0 6666666666666666666666666666666666 4 0 4444444444444444444444444444444444444444444 0
consensus : GTCGATATCGA-TCACGACATCGTGTTC--T------A--GG-TGTTTGATGGCTA--CA-CCTGC--GTCGATATCGACGATATCGTNT-CGATATCG-AT-CGTGATCGTTT--TGCTTAT-GNTTGTTTGACGACTTTAAATTGCTATCGATATCG--TCGATATCGTGTGTATATCGAATCGT---GATCGTATT-TCT----TA---CGGTTGT---TCG---AC---TTCAGCTTTCTATCGAT--ATCGTAA-CGATATCGGAA--AGTGACC---TTTTC---TGGTG--GCTACGAT-AT-CAAAC--TGTT-ANCGATATCG--TC-----------GATATCGTGTCGATATCGAATCATG--------------ATCGT-NT-----------------T-------------CT-TA-TGG-----ATGTTTGATG--GCTAC-AACTTGCT-A----C-ATGT---GTCGATATCGAAT--C--------G--T--------TTC---C-CGT-G-TT----------GTTTGACGGC----------TACAACTTGCTATCGATAACATCGA-TATCGTTTCGAT-AT-CGAATCGTGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGACAGATAATGAGTTTGCCATCAAACACCCATAGGAAAAACGATCANGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACGATATCGAT----AGCAATATGTAGCCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGACATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAAGATAACCATTTTATG-AT---AGATA--ATA--CG--TTCGTAAGAAATCGATATCGACACGATATCGTC-AC--------GC---------TA-TT----GT-----------CGAT-ATCGT--CGATATCG-----A-CGTTGTATTTGNTCTC-AAAAGACAANC----GTCT----TATGA----CAGATA-T-A---GTTTGCAAGATGTCGATA-TCGACACGA--------------------TATCG-----------TC-----GATATCGATGTTG-TATTTG
Reference ( family-1193 ) : GTCGATATCGA-TCACGACATCGTGTTC--T------AC-GG-TGTTTGATG-CTA--CA-CTTGC--GTCGATATCGACGATATCGTNT-CGATATCG-AT-CGTGATCGTTT--TGCTTAT-GNTTGTTTGACGACTTTAAATTGCTATCGATATCG--TCGATATCGTGTGTATATCGAATCGT---GATCGTATT-TCT----TA---CGGTTGT---TCG---AC---TTCAGCTTTCTATCGAT--ATCGTAA-CGATATCGGAA--AGTGACCGTGTTTTC---TGGTG--GCTATGAT-AT-CAAACN-TGCT-ANCGATATCG--TC-----------GATATCGTGTCGATATCGAATCATG--------------ATCGT-NT-----------------T-------------CT-TA-TGG-----ATGTTTGATG--GCTAC-AACTTGCT-A----C-ATGT---GTCGATATCGAAT--C--------G--T--------TTC---C-CGT-G-TT----------GTTTGANAGC----------TACAACTTGCTATCGATAACATCGA-TATCGTTTCGAT-AT-CGAATCGTGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGACAGATAATGAGTTTGCCATCAAACACCCATAGGAAAAACGATCANGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACGATATCGAT----AGCAATATGTAGCCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGACATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAAGATAACCATTTTATG-AT---AGATA--ATA--CG--TTCGTAAGAAATCGATATCGACACGATATCGTC-AT--------GC---------TA-TT----GT-----------CGAT-ATCGT--CGATATCG-----A-CGTTGTATTTGNTCTC-AAAAGACAANC----GT-T----TATGA----CAGA-----A---GTTTGCAAGATGTCGATA-TCGACACGA--------------------TATCG-----------TC-----GATATCGATGTTG-TATTTG
gi|1 : GTTAATATCGAATCAAGAC--CATGTTTCTT------ATTGG-TGCCTCCTGACTA--CAACTTGCT-GTCGATATCGACGATATTGTTT-CGATATCG-ATTCATAATAGCTT--TGCTTAT-GGTTGTTTGACGACTTTAAATTGCTATCGATATCG--TCAATATCGTGTGGATATCGAATCAT---AATCGTGTT-TC-----TA---CGGTTGT---TTT---AC---TTCAACTTGCTATCGAT--ATCGT---CGATATCCGAATCATAGATCGTGTTTTTTTATGGTA--GTT-TGAC-TT-CAAACT-TGCT-ATCGATATTG--TC-----------GATATCATGTCGATATCGAATCATG--------------AT-GT-AT-----------------T-------------CC-TA-TGG-----CTCTTTGATG--ACTAC-AACCTGCTAA----C-ATGTA--ATCGATATCGAAT--T--------G--T--------TTC---T-CGT-G-TT----------GTTTGAAAGC----------TACAACTTGCTATCGATAACATCGA-TATCGTTT---T-ATCCGAATCATGAT
gi|1 : ATATGACAGATTATGAGTTTGCCATCAAATACTAATAGGAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACGATATCGAT----AGCAATATGTAGTCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGATATTT----GTTCTTTACTTGTTC-CCTAAAGATAACCATTTTATG-GT---AGATA--ATA--CG--TTCGCAAGAAATCGATATCGACACGATATCGTC-AT--------GC---------TA-TT----GT-----------CGAT-ATCAT--CAACAGGG-----A-CATTGAATTTGTTTTC-AAAAGACAAAC----ATCT----TATGA----C--------A---GTTCGCAAATTGTCGATA-TCGACACGA--------------------TATCG-----------TC-----GATATTGATGTTG-TATTTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagattatgagtttgccatcaaatactaataggaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacgatatcgatagcaatatgtagtcaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatatttgttctttacttgttccctaaagataaccattttatggtagataatacgttcgcaagaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattgtcgatatcatcaacagggacattgaatttgttttcaaaagacaaacatcttatgacagttcgcaaattgtcgatatcgacacgatatcgtcgatattgatgttgtatttg
gi|10 : gttaatatcgaatcaagaccatgtttcttattggtgcctcctgactacaacttgctgtcgatatcgacgatattgtttcgatatcgattcataatagctttgcttatggttgtttgacgactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtggatatcgaatcataatcgtgtttctacggttgttttacttcaacttgctatcgatatcgtcgatatccgaatcatagatcgtgtttttttatggtagtttgacttcaaacttgctatcgatattgtcgatatcatgtcgatatcgaatcatgatgtattcctatggctctttgatgactacaacctgctaacatgtaatcgatatcgaattgtttctcgtgttgtttgaaagctacaacttgctatcgataacatcgatatcgttttatccgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTGGTC-CTTGAAAACAATCAT---ATG--------------TA--CGACTTCGTAAGATGACAATATCTACACAATACCCTC-AT--------GC---------TA-CT-------------------------GT--CAATATTG-----A-CATCATACTTGGTC----AATGAAAATC----GTGTTGTATATGGTAACCATA-----A---CTTTGTTAGATGAGGATATTTGTCAAGC--------------------TATTG-----------TT-----GATATTGACATTGTTATTTG
gi|11 : TCGTTT--TGCTTATCGC--GTTTGACGACTTCAAATTGCTAgtctt
gi|12 : cannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttGACATTTTGGCGT-----ATTTGCTCATTGAA----AACTGTTATGTGTATTAAAGGTT--ACA--AC--TTTGTAA------GATGTCGAGATGATGTCTTT-AC--------CC---------TG-TT----CT-----------CAAT-ATCGG--TGATATTG-----A-CATAACATTTGGTCT
gi|13 : tattCGATATCAT--GT--------TC---------TGTTT----GA-----------CGAT-ATTGT--CGATACCGTATCTA-CATTGTGTCTt
gi|13 : cagttatgtcgaGAT--ATCGAAA-CAAAAT--AAA--AGTAACC-----TTC---TGGTG--GCTTTGATAAT-CAAAaaacaaaataaaagtaaccttctggtggctttgataatcaaataat
gi|14 : cagttatgtcgaagacacaatgtagatacggtatcgacaatatcgtcaaacagaacatCGATATCG--TCGATATCTTATCTACATCGAGTCTT---GGGCATAtaat
gi|14 : agtCAGAA--GGTTAC----TTTTC----GATATCGTTACGAT-AT-CATGTTGTGTTTGACGATATCG--TC-----------GATATCTTATCTACATCGAGTCTTG--------------tcaaacacaacatgatatcgtaacgatatcgaaaagtaaccttctggaagccatgataatcaaaca
gi|14 : agttatgccTCGATATCG--TTACGATATCATGTT--------------G-TGTTTGA--------------------CGATATCGTCGATATCTTAT-CTACATCG-Agaagccatgataatcaaaca
gi|14 : agttatgcccaagacGAT--ATCGTAA-CGATATCGAAA--AGTAACC-----TTC---TGGAA--GCCATGATAAT-CAAACaaagtaaccttctggaagccatgataatcaaaca
gi|15 : agttatgcccaagactcgatgtagataagatatcgacgatatcgtcaaacacaacatC-----------GATATCGTGTTGATATCGAATCATGATAGTGTTTTTTAAATCGTGTT-----------------T-------------CT-TA-TGG-----ATGTTCCATG--GCTAC-AACTTACa
gi|16 : gttagtgaT-GACGATATCGAATT-----------GTGATCATGTTT-TATTAAATCATG--------------------CT-----------------T-------------CA-TA-TGG-----ATGTTTGATG--GCTAC-AACTTG
gi|17 : acaatgttaaGATATCG--TC-----------GATATCGTGTCGATATCGAATCCTT--------------ATCGT-GT-----------------T-------------TT-TA-TGG-----AGGTTTGA-----CTTC-AACTTGCT-A----
gi|18 : ATATCGACACGATATCGTCTAT--------GC---------TATTT----GT-----------CGTT-ATC----------CG-----A-TGTTGTATTTG
gi|19 : TGTCTGATG--ACTAC-AACCTGCT-A--------------TCGATATCGAA
gi|2 : --TGCTTAT-GTTTGTTTGACAACTTTAAATTGCTATCGATATCG--TCAATATCGTGTGTATATCGAATCAT---GATCGTATT-TCT----TA---CGATTGT---TCG---AC---TTCAGCTTTCTATCTAT--ATCGT---CGATTTCG
gi|2 : AATCATG--------------ATTGT-AT-----------------T-------------TTCTA-TGG-----CTGTTTAATG--ACTAC-AACCTGCT-G----C-ATAT---ATCGATATCGAAT-----------GTTT--------TTC---C-CGTGG-TT----------GTTTGAAAGCTACAAAAATGTACAACTTGCTATCGATAAGATCGAGTATCGTTT-GAT-AC-CGAATATTGATacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|2 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCGATATCGTGTCGATATCGATTTGTTGCGAACGTATTATCTATCATAAAATGGTTATCTTTCGGGAACAAATACAA-----TATCGGTTCATCA-AA-TAAT-TTAGAA--TATGG--GTGTTT------GGTG--GCTACC-T-AT--------TGCT-ATCGATATCG--TCAATATCGAC--GATATCGTGTCGATATTGAATCAAT--------------ATCTT-TT-----------------TTC-----------TT-TACTGG-----GTGTTTAATG--GCTAT-ATCTTGC------------T---GTCGATATCGAAT--C--------A--TGATCG---TTT---T-TG--G-GT----------GTTTAATGGC-----------A-AACTCATTATCCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|2 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgGACGATATCGAT----AGCAATAGGTAGCCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGATATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAAGATAACCATTTTATG-AT---AGATA--ATA--CG--TTCGCAACAAATCGATATCGACACGATATCGTC-AT--------GCTATTAAAAATA-TT----GT-----------CGAT-ATCGT--CGATATCG-----A-TGTTGCATTTtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|3 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatatt-----------------T-------------CT-TA-TGG-----GTGTTTGATG--ACTAT-AGCCTGCT-A----C-ATGT---ATCGATATCGAAT--T--------T--T--------TTT---CTCGT-GGTT----------GTTTGACAGC----------TACAACTTGCTATCGATAACATCGC-TATCGTTTCGAT-AT-CGAATCATGAT
gi|3 : ATATGACAGATAATTAGTTTGCCATCAAACAGCTATAGGAAAAACGATCAAGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----AGCAATATGTAGCCACCAAACACCCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataattagtttgccatcaaacagctataggaaaaacgatcaagattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaatatgtagccaccaaacacccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaataatctaaattatttgataccgacattgcatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataataagttcgtaagaaatcgatatcgacacgatatcgttatgttattgtcgataccgtcgacatcgatcattgtatgtgttttcaaaaaaacaaacatcttatgacagatactgagtttgcaagacgtcaatatcgacacgacatggtcacgttattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgtatttg
gi|3 : tcttatgggtgtttgatgactatagcctgctacatgtatcgatatcgaatttttttctcgtggttgtttgacagctacaacttgctatcgataacatcgctatcgtttcgatatcgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAATCTAAATTAT-TTGAT--ACCGACATT-----GC-----ATTTGTTC-CCGAAAGATAACCATTTTATG-AT---AGATA--ATA--AG--TTCGTAAGAAATCGATATCGACACGATATCGTT-AT--------GT---------TA-TT----GT-----------CGAT-ACCGT--CGACATCG-----ATCATTGTATGTGTTTTCAAAAAAACAAAC----ATCT----TATGA----CAGATACTGA---GTTTGCAAGACGTCAATA-TCGACACGACATGGTCACGTTATTGTCGATATCG-----------TC-----GATATCGATGTTG-TATTTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaataatctaaattatttgataccgacattgcatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataataagttcgtaagaaatcgatatcgacacgatatcgttatgttattgtcgataccgtcgacatcgatcattgtatgtgttttcaaaaaaacaaacatcttatgacagatactgagtttgcaagacgtcaatatcgacacgacatggtcacgttattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgtatttg
gi|4 : tcttatgggtgtttgatgactatagcctgctacatgtatcgatatcgaatttttttctcgtggttgtttgacagctacaacttgctatcgataacatcgctatcgtttcgatatcgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataattagtttgccatcaaacagctataggaaaaacgatcaagattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaatatgtagccaccaaacacccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaTA--TG--TTC--AAGACAG-GATGTAGATACGATATCG---AC--------GA---------TA-TC----GTCAAACACAACACGAT-ATCGTAACGATATCG-----A-
gi|4 : agtTCGATATCG--TTACGATATCGTGTT--------------G-TGTTTGA--------------------CGATATCGTCGATATCGTAT-CTACATCaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|4 : agttatgttcaagacagGTA--GATACGAT-AT-CGA-----------CGATATCG--TCAAACACAACACGATATCGTAACGATATCGAA--AAG---------------TTAC-CT-----------------T-------------CT-GG-TGGCTATGATATTCAA-------AC-AA--TGTT-AGTGACGATGTCGTGTTGACATTGAAT--CATGATCGTG--T--------TTTAAAT-CGC-G-TTTCTTATGAATGTTTGATGGC----------TACAACTTGCT---------GTCGA-TATCGTTTCaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|4 : agttatgttcaagacaggatCGAT--ATCGTAA-CGATATCGAAA--AGTTACC-----TTC---TGGTG--GCTATGAT-ATTCAAACAATGTT-AGTGA--------C-----------GATGTCGTGTTGACATTGAATCATG--------------ATCGT-GT-----------------TTTAAATCGCGTTTCT-TA-TGA-----ATGTTTGATG--GCTAC-AACTTGC------------T---GTCGATATCGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|4 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgatatcgacgatatcgtcaaacacaacaT--TGCTTAT-GTTTGTTTGACAACTTTAAATTGCTATCGATATCG--TCAATATCGTGTGTATATCGAATCAT---GATCGTATT-TCT----TA---CGATTGT---TCG---AC---TTCAGCTTTCTATCTAT--ATCGT---CGATTTCtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|5 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgatatcgacgatatcgtcaaacacaacacgatatcgtaacgatatcgaaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-----ACGTTTGATGATGGTAC-TAATT-CT-A--------------TCGATATCGAAT--C--------A--TGATTGTATTTC---C-TAT-GGCT----------GTTTGATGAC----------TACAACCTGCTA-------CAT--------GTATCGAT-AT-CGAATTGTG
gi|5 : aTATCGATATCGAATCATG--------------ATTGT-AT-----------------TT------------CC-TA-TGG-----CTGTTTGATG--ACTAC-AACCTGCT-A----C-ATGT---ATCGATATCGAATTGT--------G--T--------TTC---T-CGTGG-TT----------GTTTGAAAGC----------TACAACTTGTTATCGATAACATCGA-TATCAATGC-ATAAA-CGAATTATGATtttctcgtggttgtttgaaagctacaacttgttatcgataacatcgatatcaatgcataaacgaattatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataatggatttgccatcaaacacccataggaaaaac
gi|5 : aacgtttgatgatggtactaattcATATGACAGATAATGGATTTGCCATCAAACACCCATAGGAAAAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataatggatttgccatcaaacacccataggaaaaac
gi|6 : aacgtttgatgatggtactaattctatcgatatcgaatcatgattgtatttcctatggctgtttgatgactacaacctgctacatgtatcgatatcgaattgtgtttctcgtggttgtttgaaagctacaacttgttatcgataacatcgatatcaatgcataaacgaattatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT-----GT-----AGTTGGAC-CTATAGGAAAAC----TTAAC-AT---ACATG--ATA--CC--TTTGTAAAACGACTATATGGACACGATATCGTT-AT--------GC---------CA-TTCATTGT-----------CGAT-ATCGT--CGATATCG-----A-CGAAAGATTTGGTCCT-TAGAGACAATCTGGTGT-A----TATGA----TAGA-----AAATGACGGTAAAATGACGATT-TCGATACGA--------------------TATCG-----------CCATGCTGTTGTCGATATTG-
gi|7 : cacacgtaattgaaattaccttctttgttgaattaagacctttcattcctcttttatACAGATAGTGAGTTTTCCATCAAACACTCATATGAAAAACGATCACGATT
gi|7 : C-GG-TGTTTGGTGGCTA--TATCTTGCT-GTCGATTTCGACGATATCGTAT-CGATATTGAAT-CGTGATCGTTT--TTCATAT-GAGTGTTTGATGcaatatcgatacgatatcgtcgaaatcgacagcaagatatagccaccaaacaccgatattgtaaattatttgatactgacattgtatttgttccaaaaatagccatttatgacagataattagtttgcaagaagtcgatatcgacacgacatggtcaagttattttcggtatcgatgttgtaac
gi|7 : acagatagtgagttttcAACGATCACGATTCAAT--AT---CGATACGATA-------TCGTC-GAAATCGA---CAGCAAGATATAGCC-ACCAAACACCGA---------TA-TT----GT-----------AAATTAT--T--TGATACTG-----A-CATTGTATTTGTTC-C-AAAA-ATAGCC----AT-T----TATGA----CAGATAATTA---GTTTGCAAGAAGTCGATA-TCGACACGA--------------------CATGGTCAAGTTATTTTC-----GGTATCGATGTTG-TAatattgtaaattatttgatactgacattgtatttgttccaaaaatagccatttatgacagataattagtttgcaagaagtcgatatcgacacgacatggtcaagttattttcggtatcgatgttgtaac
gi|7 : acagatagtgagttttccatcaaacactcatatgaaaCGAAATCGAC----AGCAAGATATAGCCACCAAACACCGATATTGTAAATTAT-TTGAT--ACTGACATT-----GT-----ATTTGTTC-C--AAAAATAGCCATTT-ATG-AC---AGATA--ATT--AG--TTTGCAAGAAGTCGATATCGACACGACATGGTC-AA--------GT---------TA-TT----TT-----------CGGT-ATCGac
gi|8 : acagatagtgagttttccatcaaacactcatatgaaaaacgatcacgattcaatatcgatacgatatcgtTCGATATCAA--CACGACATCGT-CAC--T------AA-CA-TGTTTGATATCTAGCCA-CCAGAAGGTCACTTTT--CGATATCGTTTACGATATC-----CGTG-----TT--TG---------TGTTTGACGA---TAATTCG---TCGATA-CGTATCTACATCGTGTatgttgtaac
gi|8 : gagtatgtccaagGAT--ATCGTAAACGATATCGAAA--AGTGACC-----TTC---TGGTG--GCTA-GAT-AT-CAAACA-TGTT-AGTGA--------C-----------GATGTCGTGTTGATATCGAATCATG--------------ATCGT-GTTTTTTAAATGTGTTTTCT-------------CT-TACTGGAA---ATGTTTGATG--GCTACAAACTTGC------------T---GCCGATATCGatcatgatcgtgttttttaaatgtgttttctcttactggaaatgtttgatggctacaaacttgctgccgatatcgtt
gi|9 : gagtatgtccaagacacgatgtagatacgtatcgacgaattatcgtcaaacacaaacacgTCGATATGAA-TCAAGA--TCGTTTTC--TCGTTATAT-GGGTGTTTAATGGCTA--TA-TCTGC--GTTGAT-TCGACGATA-CGTGT-CGATATCG-A--CATGATCGTTTTCTGTTTCT-TATTGTTTAATGGCtt
gi|9 : tACGATCTTGATTCATATCGATATGC-----CCAAACACC-ATATTCTAAATTATATTGATGAAC--GTATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAAGATAACCATTTTATG-AT---AGATA--ATACCCG--CTCGtatgcccaaacaccatattctaaattatattgatgaacgtattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacccgctcgacaag
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 22 22 77777777777777777777 22222222222222 1 222222222 22222 555555555555555555 111 2222 111111111 2222222222 333333333333333333333333333333333 11 22222222222222222222 22222222222222222 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11111 3333333333333333 6666666666666666666666666666666666666666666666666 2222222222 11 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111 111111111111 111111 22222222222222222222 11111111111111111 1111 2222222222 2222222222 44444444444444444444 333333333333333333
lowQualScore : 0 00 6 22 77777777777777777777 11 0 44444444444444 1 666666666 1 6 99999 1 0 0 66 5 4 99 4 5 777777777777777777 4 0 222 0 4444 8 0 999999999 1 3 5 5555555555 3 777777777777777777777777777777777 777 55 7 3 55555555555555555555 33333333333333333 3 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 3 11111 33 3 3333333333333333 3333333333333333333333333333333333333333333333333 88 9999999999 3 6 11 8 8 66 33 1 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 4444 2 6 9 5 999999999999 0 4 11 4 55 4 888888 55 666666 0 0 1 3 44444444444444444444 3 99999999999999999 7 11 55 55 4 0 1 4444 1 1 2222222222 2222222222 5 5 77 2 5 66666666666666666666 000000000000000000 8
lowQualScore : . .. . .. .................... .. . .............. . ......... . . ..... . . . .. . . .. . . .................. . . ... . .... . . ......... . . . .......... . ................................. ... .. . . .................... ................. . ......................................................... . ..... .. . ................ ................................................. .. .......... . . .. . . .. .. . ......................................................................................................... .... . . . . ............ . . .. . .. . ...... .. ...... . . . . .................... . ................. . .. .. .. . . . .... . . .......... .......... . . .. . . .................... .................. .
lowQualScore : 7 77 7 00 44444444444444444444 00 2 22222222222222 2 777777777 0 7 88888 0 7 3 11 7 4 99 4 0 777777777777777777 8 6 000 8 6666 0 6 666666666 4 2 4 6666666666 6 222222222222222222222222222222222 666 55 3 6 44444444444444444444 77777777777777777 3 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 3 99999 99 1 4444444444444444 7777777777777777777777777777777777777777777777777 55 2222222222 2 7 77 0 0 00 55 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2222 5 7 3 2 000000000000 9 4 00 0 77 0 333333 55 555555 5 8 0 6 44444444444444444444 6 55555555555555555 3 99 55 55 0 7 0 6666 0 0 0000000000 8888888888 7 7 99 7 7 44444444444444444444 666666666666666666 0
consensus : GTCGATATCGA-TCAAGAC-TCGT-TTC--T--------A--G-GTGTTTGATGGCTA--CA-CCT-G--CTGTCGATNTCGACGATAT---------CGTNT-CGATATCG-AT-CGTGATCGTTT--TGCTTAT-GNTTGT-TTGACGA-CTTTAAATTGCTATCGATATCG--------T---------CAATATCGTGTGTATATCGAATCATGATCGTATTTC-T--TAC-GGTTGTT---CGA---CTTCANCTTGCTATCGATATCGT-------AA-CGAT-ATCG----GAA--A------GTGA-------CCTTT-TCTGGTG--GCTACGAT-AT-CAAA--C--T-GT---T-GN---CGATATCG--TC-----------GATATCG-TGTCGATATCGAATCATG--------------ATCG-T-NT-----------------T-------------CT-TA-TGG-----ATGTTTGATG--GCTAC-AACTTGCT-A----C-ATGT---GTCGATATCGAAT--C--------G--T--------TTC---C-CGT-G-TT----------GTTTGANAGC----------TACAACTTGCTATCGATAACATCGA-TATCGTTTCGAT-AT-CGAATCGTGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGACGGATAATGAGTTTGCCATCAAACACCCATAGGAAAAACGATCANGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACGATATCGAT----AGCAATATGTAGCCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGACATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAA-GATAACCATTTTATG-AT---A--GATA--ATA--CG--TTCGTAAGAAATCGATATCGACACGATATCGTC-AC--------GC---------TA-TT----GT-----------CGAT-ATCGT--CGAT--ATCGA-CGTTGTATTTGTTCTC-GAAAGACAANC--GTNT----TATGACAGAT-A--T--A-G-TT-CGC--AAGACGTCGATA-TCGACACGA--------------------TATCG-----------TC-----GATATCGATGTTG-TATTTG
Reference ( family-1193 ) : GTCGATATCGA-TCACGACATCGTGTTC--T--------A--G-GTGTTTGATGGCTA--CA-CCT-G--C-GTCGATATCGACGATAT---------CGTNT-CGATATCG-AT-CGTGATCGTTT--TGCTTAT-GNTTGT-TTGACGA-CTTTAAATTGCTATCGATATCG--------T---------CGATATCGTGTGTATATCGAATCGTGATCGTATTTC-T--TAC-GGTTGTT---CGA---CTTCAGCTTTCTATCGATATCGT-------AA-CGAT-ATCG----GAA--A------GTGA-------CCTTT-TCTGGTG--GCTACGAT-AT-CAAA--C--T-GT---T-AN---CGATATCG--TC-----------GATATCG-TGTCGATATCGAATCATG--------------ATCG-T-NT-----------------T-------------CT-TA-TGG-----ATGTTTGATG--GCTAC-AACTTGCT-A----C-ATGT---GTCGATATCGAAT--C--------G--T--------TTC---C-CGT-G-TT----------GTTTGACGGC----------TACAACTTGCTATCGATAACATCGA-TATCGTTTCGAT-AT-CGAATCGTGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGACAGATAATGAGTTTGCCATCAAACACCCATAGGAAAAACGATCANGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACGATATCGAT----AGCAATATGTAGCCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGACATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAA-GATAACCATTTTATG-AT---A--GATA--ATA--CG--TTCGTAAGAAATCGATATCGACACGATATCGTC-AC--------GC---------TA-TT----GT-----------CGAT-ATCGT--CGAT--ATCGA-CGTTGTATTTGNTCTC-AAAAGACAANC--GTCT----TATGACAGAT-A--T--A-G-TT-TGC--AAGATGTCGATA-TCGACACGA--------------------TATCG-----------TC-----GATATCGATGTTG-TATTTG
gi|1 : GTTAATATCGAATCAAGAC--CATGTTTCTT--------ATTG-GTGCCTCCTGACTA--CAACTT-G--CTGTCGATATCGACGATAT---------TGTTT-CGATATCG-ATTCATAATAGCTT--TGCTTAT-GGTTGT-TTGACGA-CTTTAAATTGCTATCGATATCG--------T---------CAATATCGTGTGGATATCGAATCATAATCGTGTTTC----TAC-GGTTGTT---TTA---CTTCAACTTGCTATCGATATCGT----------CGAT-ATCC----GAATCATAGATCGTGT-------TTTTT-TATGGTA--GTT-TGAC-TT-CAAA--CT-T-GC---T-AT---CGATATTG--TC-----------GATATCA-TGTCGATATCGAATCATG--------------AT-G-T-AT-----------------T-------------CC-TA-TGG-----CTCTTTGATG--ACTAC-AACCTGCTAA----C-ATGTA--ATCGATATCGAAT--T--------G--T--------TTC---T-CGT-G-TT----------GTTTGAAAGC----------TACAACTTGCTATCGATAACATCGA-TATCGTTT---T-ATCCGAATCATGAT
gi|1 : ATATGACAGATTATGAGTTTGCCATCAAATACTAATAGGAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACGATATCGAT----AGCAATATGTAGTCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGATATTT----GTTCTTTACTTGTTC-CCTAAA-GATAACCATTTTATG-GT---A--GATA--ATA--CG--TTCGCAAGAAATCGATATCGACACGATATCGTC-AT--------GC---------TA-TT----GT-----------CGAT-ATCAT--CAAC--AGGGA-CATTGAATTTGTTTTC-AAAAGACAAAC--ATCT----TATGAC-----------A-G-TT-CGC--AAATTGTCGATA-TCGACACGA--------------------TATCG-----------TC-----GATATTGATGTTG-TATTTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagattatgagtttgccatcaaatactaataggaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacgatatcgatagcaatatgtagtcaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatatttgttctttacttgttccctaaagataaccattttatggtagataatacgttcgcaagaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattgtcgatatcatcaacagggacattgaatttgttttcaaaagacaaacatcttatgacagttcgcaaattgtcgatatcgacacgatatcgtcgatattgatgttgtatttg
gi|10 : gttaatatcgaatcaagaccatgtttcttattggtgcctcctgactacaacttgctgtcgatatcgacgatattgtttcgatatcgattcataatagctttgcttatggttgtttgacgactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtggatatcgaatcataatcgtgtttctacggttgttttacttcaacttgctatcgatatcgtcgatatccgaatcatagatcgtgtttttttatggtagtttgacttcaaacttgctatcgatattgtcgatatcatgtcgatatcgaatcatgatgtattcctatggctctttgatgactacaacctgctaacatgtaatcgatatcgaattgtttctcgtgttgtttgaaagctacaacttgctatcgataacatcgatatcgttttatccgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTGGTC-CTTGAA-AACAATCAT---ATG----------------TA--CGACTTCGTAAGATGACAATATCTACACAATACCCTC-AT--------GC---------TA-CT-------------------------GT--CAAT--ATTGA-CATCATACTTGGTC----AATGAAAATC--GTGTTGTATATGGTAACC-A--T--A-ACTT-TGT--TAGATGAGGATATTTGTCAAGC--------------------TATTG-----------TT-----GATATTGACATTGTTATTTG
gi|11 : TCGTTT--TGCTTATCGC--GT-TTGACGA-CTTCAAATTGCTAgtctt
gi|12 : cannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttGACATTTTGGCGT-----ATTTGCTCATTGAA-----AACTGTTATGTGTATTAAA--GGTT--ACA--AC--TTTGTAA------GATGTCGAGATGATGTCTTT-AC--------CC---------TG-TT----CT-----------CAAT-ATCGG--TGAT--ATTGA-CATAACATTTGGTCT
gi|13 : tatt-ACCA----GAA--G------GTTA-------CTTTTATTTTGT-----TTCGAT-AT-CATGTTC--T-GT---TTGA---CGATATTG--TC-----------GATACCG-TATCTACATTGt
gi|13 : cagttatgtcgaagacaGATATCGA-------AA-CAAA-AT------AAA--A------GTAA-------CCTT---CTGGTG--GCTTTGATAAT-CAAA--ggctttgataatcaaataat
gi|14 : cagttatgtcgaagacacaatgtagatacggtatcgacaatatcgtcaaacagaacat--A-G-TTATGCCCAAGAC-TCGATG-TAGATAAGA--------------------TATCG-----------AC-----GATATCGtaat
gi|14 : CA----GAA--G------GTTA-------C-TTT-TC-GATATCGTTACGAT-AT-CATG--T--T-GTGTTT-GA---CGATATCG--TC-----------GATATCT-TATCTACATCGAGTCTTG--------------tcaaacacaacatgatatcgtaacgatatcgaaaagtaaccttctggaagccatgataatcaaaca
gi|14 : agttatgccGATATCGT-------AA-CGAT-ATCG----AAA--A------GTAA-------CC--T-TCTGGAA--GCCATGATAAT-CAAA--C--gaagccatgataatcaaaca
gi|15 : agttatgcccaagactcgatgtagataagatatcgacgatatcgtcaaacacaacat---T-GA---CGATAT----------------------CG-TGTTGATATCGAATCATGATAGTGTTTTTTAAATCG-TGTT-----------------T-------------CT-TA-TGG-----ATGTTCCATG--GCTAC-AACTTACa
gi|16 : gttag--T-GT---T-AATGACGATATCGAATT-----------GTGATCA-TGTTT-TATTAAATCATG---------------------CT-----------------T-------------CA-TA-TGG-----ATGTTTGATG--GCTAC-AACTTG
gi|17 : acaaGATATCG--TC-----------GATATCG-TGTCGATATCGAATCCTT--------------ATCG-T-GT-----------------T-------------TT-TA-TGG-----AGGTTTGA-----CTTC-AACTTGCT-A----
gi|18 : ATATCGACACGATATCGTCTAT--------GC---------TATTT----GT-----------CGTT-ATC------------CGA-TGTTGTATTTG
gi|19 : TGTCTGATG--ACTAC-AACCTGCT-A--------------TCGATATCGAA
gi|2 : --TGCTTAT-GTTTGT-TTGACAA-CTTTAAATTGCTATCGATATCG--------T---------CAATATCGTGTGTATATCGAATCATGATCGTATTTC-T--TAC-GATTGTT---CGA---CTTCAGCTTTCTATCTATATCGT----------CGAT-TTCG----
gi|2 : AATCATG--------------ATTG-T-AT-----------------T-------------TTCTA-TGG-----CTGTTTAATG--ACTAC-AACCTGCT-G----C-ATAT---ATCGATATCGAAT-----------GTTT--------TTC---C-CGTGG-TT----------GTTTGAAAGCTACAAAAATGTACAACTTGCTATCGATAAGATCGAGTATCGTTT-GAT-AC-CGAATATTGATacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|2 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTATGATGGATAATGAGTTTGCCATTAAACACCC-----AAAAACGATCATGATTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|2 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngACAATAT---------CGGTT-C---ATCA-A------ATAATTT--AGAATAT-GGGTGT-TTGGTGG-CTACCTATTGCTATCGATATCG--------TCAATATCGACGATATCGTGTCGATATTGAATCAATATCTTTTTTCTT--TACTGGGTGTTTAATGG---CTATATCTTGCTGTCGATATCG--------AA-TCATGATCG-----------------------------TTT-TTGGGTG--TTTA--AT-GG-CAAA--C--TCAT---T-AT---CCATcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|2 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatg--C-GACGATATCGACAATATTTTTAATAGCATGA-CGATATCGTGT-CGATATCGATT--TG-TTGC-GAACGTATTATCTATCATAAAATGGTTATC--TTTCGGGAACAAATA--------CAATATCG---GTTCATCAAAT----A----ATTTA-GAATAT-GGGTGTT---TGGTGGCTACCTATTGCTATCGATATCGTCAATATCGA-CGAT-ATCGTGTCGAT--A------TTGAATCAATATCTTT-TTTCTTT--ACTG-GGT-GT-TTAA------------T-GG---CTATATC--------------------TTGCTGTCGATATCGAATCATG--------------ATCG-T-TT-----------------T-------------------TGG-----GTGTTTAATG--GCatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|2 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttCGATATCGAC----AGCAAGATATAGCCATTAAACACCCAG----TAAA-------GA-AAAAAGATATT-----G------ATTCAATA-TCGACACGATA-TCGTC----G-AT---ATTGACG--ATA-------TCGATAGCAATAGGTAGC--CACCAAA----C-AC--------CCA--------TA-TT----CT-----------AAATTAT--T--TGATGAACCGA-TATTGTATTTGTTCCC-GAAAGATAACC--ATTT----TATGATAGATAA--T--ACG-TT-CGC--AACAAATCGATA-TCGACACGA--------------------TATCG-----------TC-----atatcgatgttgcattt
gi|2 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattGACGATATCGAT----AGCAATAGGTAGCCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGATATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAA-GATAACCATTTTATG-AT---A--GATA--ATA--CG--TTCGCAACAAATCGATATCGACACGATATCGTC-AT--------GCTATTAAAAATA-TT----GT-----------CGAT-ATCGT--CGAT--ATCGA-TGTTGCATTTatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|3 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatatt-----------------T-------------CT-TA-TGG-----GTGTTTGATG--ACTAT-AGCCTGCT-A----C-ATGT---ATCGATATCGAAT--T--------T--T--------TTT---CTCGT-GGTT----------GTTTGACAGC----------TACAACTTGCTATCGATAACATCGC-TATCGTTTCGAT-AT-CGAATCATGAT
gi|3 : ATATGACAGATAATTAGTTTGCCATCAAACAGCTATAGGAAAAACGATCAAGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----AGCAATATGTAGCCACCAAACACCCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataattagtttgccatcaaacagctataggaaaaacgatcaagattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaatatgtagccaccaaacacccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaataatctaaattatttgataccgacattgcatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataataagttcgtaagaaatcgatatcgacacgatatcgttatgttattgtcgataccgtcgacatcgatcattgtatgtgttttcaaaaaaacaaacatcttatgacagatactgagtttgcaagacgtcaatatcgacacgacatggtcacgttattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgtatttg
gi|3 : tcttatgggtgtttgatgactatagcctgctacatgtatcgatatcgaatttttttctcgtggttgtttgacagctacaacttgctatcgataacatcgctatcgtttcgatatcgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAATCTAAATTAT-TTGAT--ACCGACATT-----GC-----ATTTGTTC-CCGAAA-GATAACCATTTTATG-AT---A--GATA--ATA--AG--TTCGTAAGAAATCGATATCGACACGATATCGTT-AT--------GT---------TA-TT----GT-----------CGAT-ACCGT--CGAC--ATCGATCATTGTATGTGTTTTCAAAAAAACAAAC--ATCT----TATGACAGAT-A--CTGA-G-TT-TGC--AAGACGTCAATA-TCGACACGACATGGTCACGTTATTGTCGATATCG-----------TC-----GATATCGATGTTG-TATTTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaataatctaaattatttgataccgacattgcatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataataagttcgtaagaaatcgatatcgacacgatatcgttatgttattgtcgataccgtcgacatcgatcattgtatgtgttttcaaaaaaacaaacatcttatgacagatactgagtttgcaagacgtcaatatcgacacgacatggtcacgttattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgtatttg
gi|4 : tcttatgggtgtttgatgactatagcctgctacatgtatcgatatcgaatttttttctcgtggttgtttgacagctacaacttgctatcgataacatcgctatcgtttcgatatcgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataattagtttgccatcaaacagctataggaaaaacgatcaagattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaatatgtagccaccaaacacccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaTA--TG--TTC--AAGACAG-GATGTAGATACGATATCG---AC--------GA---------TA-TC----GTCAAACACAACACGAT-ATCGTAACGAT--ATCGA-
gi|4 : agtGTA--GATACGAT-AT-CGA--------------------CGATATCG--TCAAACACAACACGATATCG-TAACGATATCGAA--AAG---------------TTA-C-CT-----------------T-------------CT-GG-TGGCTATGATATTCAA-------AC-AA--TGTT-AGTGACGATGTCGTGTTGACATTGAAT--CATGATCGTG--T--------TTTAAAT-CGC-G-TTTCTTATGAATGTTTGATGGC----------TACAACTTGCT---------GTCGA-TATCGTTTCaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|4 : agttatgttcaagacaggatCGATATCGT-------AA-CGAT-ATCG----AAA--A------GTTA-------CCTT---CTGGTG--GCTATGAT-ATTCAAA--CAAT-GT---T-AG---TGA--------C-----------GATGTCG-TGTTGACATTGAATCATG--------------ATCG-T-GT-----------------TTTAAATCGCGTTTCT-TA-TGA-----ATGTTTGATG--GCTAC-AACTTGC------------T---GTCGATATCGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|4 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgatatcgacgatatcgtcaaacacaacaT--TGCTTAT-GTTTGT-TTGACAA-CTTTAAATTGCTATCGATATCG--------T---------CAATATCGTGTGTATATCGAATCATGATCGTATTTC-T--TAC-GATTGTT---CGA---CTTCAGCTTTCTATCTATATCGT----------CGAT-TTCtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|5 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgatatcgacgatatcgtcaaacacaacacgatatcgtaacgatatcgaaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-----ACGTTTGATGATGGTAC-TAATT-CT-A--------------TCGATATCGAAT--C--------A--TGATTGTATTTC---C-TAT-GGCT----------GTTTGATGAC----------TACAACCTGCTA-------CAT--------GTATCGAT-AT-CGAATTGTG
gi|5 : a-TATCGATATCGAATCATG--------------ATTG-T-AT-----------------TT------------CC-TA-TGG-----CTGTTTGATG--ACTAC-AACCTGCT-A----C-ATGT---ATCGATATCGAATTGT--------G--T--------TTC---T-CGTGG-TT----------GTTTGAAAGC----------TACAACTTGTTATCGATAACATCGA-TATCAATGC-ATAAA-CGAATTATGATtttctcgtggttgtttgaaagctacaacttgttatcgataacatcgatatcaatgcataaacgaattatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataatggatttgccatcaaacacccataggaaaaac
gi|5 : aacgtttgatgatggtactaattcATATGACAGATAATGGATTTGCCATCAAACACCCATAGGAAAAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataatggatttgccatcaaacacccataggaaaaac
gi|6 : aacgtttgatgatggtactaattctatcgatatcgaatcatgattgtatttcctatggctgtttgatgactacaacctgctacatgtatcgatatcgaattgtgtttctcgtggttgtttgaaagctacaacttgttatcgataacatcgatatcaatgcataaacgaattatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT-----GT-----AGTTGGAC-CTATAG-GAAAAC----TTAAC-AT---A--CATG--ATA--CC--TTTGTAAAACGACTATATGGACACGATATCGTT-AT--------GC---------CA-TTCATTGT-----------CGAT-ATCGT--CGAT--ATCGA-CGAAAGATTTGGTCCT-TAGAGACAATCTGGTGTA---TATGATAGAA-A--A--T-G-AC-GGT--AAAATGACGATT-TCGATACGA--------------------TATCG-----------CCATGCTGTTGTCGATATTG-
gi|7 : cacacgtaattgaaattaccttctttgttgaattaagacctttcattcctcttttatA-CAAT-ATCG----G------------TG--------------TTTGGTG--GCTA---T-AT-C-----T--T-GC---T-GT---CGATTTCG--AC-----------GATATCG-TATCGATATTGAATCGTG--------------ATCGTT-TT-----------------T-------------CA-TA-TGA-----GTGTTTGATG--G--AA-AACTCACT-A----T-CTGT---
gi|7 : --G-GTGTTTGGTGGCTA--TA-TCTTG--CTGTCGATTTCGACGATAT---------CGTAT-CGATATTGAAT-CGTGATCGTTT--TTCATAT-GAGTGT-TTGATGaaattatttgatactgacattgtatttgttccaaaaatagccatttatgacagataattagtttgcaagaagtcgatatcgacacgacatggtcaagttattttcggtatcgatgttgtaac
gi|7 : acagatagtgagttttcAAC-GATCACGATTCAAT--AT---C--GATACGATA-------TCGTC-GAAATCGA---CAGCAAGATATAGCC-ACCAAACACCGA---------TA-TT----GT-----------AAATTAT--T--TGAT--ACTGA-CATTGTATTTGTTC-C-AAAA-ATAGCC--AT-T----TATGACAGAT-AATT--A-G-TT-TGC--AAGAAGTCGATA-TCGACACGA--------------------CATGGTCAAGTTATTTTC-----GGTATCGATGTTG-TAgatattgtaaattatttgatactgacattgtatttgttccaaaaatagccatttatgacagataattagtttgcaagaagtcgatatcgacacgacatggtcaagttattttcggtatcgatgttgtaac
gi|7 : acagatagtgagttttccatcaaacactcatatgaaaCGAAATCGAC----AGCAAGATATAGCCACCAAACACCGATATTGTAAATTAT-TTGAT--ACTGACATT-----GT-----ATTTGTTC-C--AAA-AATAGCCATTT-ATG-AC---A--GATA--ATT--AG--TTTGCAAGAAGTCGATATCGACACGACATGGTC-AA--------GT---------TA-TT----TT-----------CGGT-ATCGac
gi|8 : acagatagtgagttttccatcaaacactcatatgaaaaacgatcacgattcaatatcgatacgatatcgtTCGATATCAA--CACGACATCGT-CAC--T--------A--ACATGTTTGATATCTAGCCA-CCA-GAAG-GTCACTTTT--CGATAT---------CGTTTACGATATC-----CGTG-----TT--TG---------TGT-TTGACGA----TAATTCG---TCGATA-CGTA------T---------CTACATCGTGTatgttgtaac
gi|8 : gagtatgtccaagGATATCGT-------AAACGAT-ATCG----AAA--A------GTGA-------CCTT---CTGGTG--GCTA-GAT-AT-CAAA--CA-T-GT---T-AG---TGA--------C-----------GATGTCG-TGTTGATATCGAATCATG--------------ATCG-T-GTTTTTTAAATGTGTTTTCT-------------CT-TACTGGAA---ATGTTTGATG--GCTACAAACTTGC------------T---GCCGATATCGatcatgatcgtgttttttaaatgtgttttctcttactggaaatgtttgatggctacaaacttgctgccgatatcgtt
gi|9 : gagtatgtccaagacacgatgtagatacgtatcgacgaattatcgtcaaacacaaacacgTCGATATGAA-TCAAGA--TCGTTTTC--TCGTTATATG--G-GTGTTTAATGGCTA--TA-TCT-G--C-GTTGAT-TCGACGATA----------CGTGT-CGATATCG-A--CATGATCGTTTTCTGTTTCT-TATTGT-TTAATGG-Ctt
gi|9 : tACGATCTTGATTCATATCGATATGC-----CCAAACACC-ATATTCTAAATTATATTGATGAAC--GTATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAA-GATAACCATTTTATG-AT---A--GATA--ATACCCG--CTCGtatgcccaaacaccatattctaaattatattgatgaacgtattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacccgctcgacaag
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 22 66666666666666666666666666666 11111 22222 1111 11 111 111111111 11111 111 333333333333333 3333333333333 444444444444444444444444444444444444444444444444444444 111111 44444444444444 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2222222222 11 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111 111111111111 111111 22222222222222222222 11111111111111111 2222 2222 2222222222 55555555555555555555 333333333333333333
lowQualScore : 0 33 77777777777777777777777777777 1 77777 8 888 8 5 3 8 22222 0 66 11 0000 3 33 7 0 1 6 444 777777777 3 77777 1 444 3 6 3 333333333333333 4 1 55 55 4444444444444 3 666666666666666666666666666666666666666666666666666666 3 3 222222 555 2 3 11111111111111 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1 5555555555 5 33 6 11 8 8 66 2 33 1 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 4444 2 6 9 5 999999999999 0 4 11 4 55 4 888888 55 666666 0 0 1 3 44444444444444444444 3 99999999999999999 7 11 55 55 4 0 1 4444 1 999 7 0000 5555555555 6 2 6 6 44444444444444444444 444444444444444444 8
lowQualScore : . .. ............................. . ..... . ... . . . . ..... . .. .. .... . .. . . . . ... ......... . ..... . ... . . . ............... . . .. .. ............. . ...................................................... . . ...... ... . . .............. ........................................................... . .......... . .. . .. . . .. . .. . ......................................................................................................... .... . . . . ............ . . .. . .. . ...... .. ...... . . . . .................... . ................. . .. .. .. . . . .... . ... . .... .......... . . . . .................... .................. .
lowQualScore : 2 22 77777777777777777777777777777 4 66666 0 666 8 6 8 0 44444 8 99 66 1111 2 88 3 7 0 7 555 666666666 7 33333 9 000 7 7 3 999999999999999 0 0 00 00 2222222222222 1 888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3 3 666666 000 9 3 88888888888888 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 0000000000 7 77 7 77 0 0 00 0 55 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2222 5 7 3 2 000000000000 9 4 00 0 77 0 333333 55 555555 5 8 0 6 44444444444444444444 6 55555555555555555 3 99 55 55 0 7 3 1111 0 888 5 8888 7777777777 7 2 3 7 22222222222222222222 555555555555555555 0
consensus : GTCGATATCGAATCAAGAT------C-T-CGTT-TCTT----G--G-GTGTTTGATGGCTA--TA-CCT-G-CTGTCGATNTCGACGATATCGTNT-CGATATCG-AT-CGTGATCGTTT--TGCTTAT-GNTTGTTTGACGACTTTAAATTGCTATCGATATCG--TCAATATCGTGTGTATATCGAATCATGATCGTATTTCTTACGATTGTTCGACTTCAGCTTTCTATCGATATCGTAA-CGATATCGGAA--A------GTNACCTTT-TCTGGTG--GCTACGAT-AT-CAA-A--C--TGT---T-GACGA--TATCG--TC-------------GATATCGTGT-CGATATCGAATCATG--------------ATCG-T-NT-----------------T-------------CT-TA-TGG-----ATGTTTGATG--GCTAC-AACCTGCT-A----C-ATGT---GTCGATATCGAAT--C--------G--T--------TTC---C-C----GT-G-TT----------------GTTTGACGGC----------TACAA-CTTGCTATCGATAACATCGA-TATCGTTTCGAT-AT-CGAATCGTGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGACGGATAATGAGTTTGCCATCAAACACCCATAGGAAAAACGATCANGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACGATATCGAT----AGCAATATGTAGCCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGACATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAA-GATAACCATTTTATG-AT---A--GATA--ATA--CG--TTCGTAAGAAATCGATATCGACACGATATCGTC-AC--------GC---------TA-TT----GT-----------CGAT-ATCGT--CGAT--ATCGA-CGTTGTATTTGTTCCC--AAAGACAANC--GTNT----TATGACAGAT-A--T--A-G-TTCGCAAGACGTCGATA-TCGACACGA--------------------TATCG-----------TC-----GATATCGATGTTG-TATTTG
Reference ( family-1193 ) : GTCGATATCGA-TCAAGA-------C-T-CGTT-TCT-----A--G-GTGTTTGATGGCTA--CA-CCT-G-CTGTCGATNTCGACGATATCGTNT-CGATATCG-AT-CGTGATCGTTT--TGCTTAT-GNTTGTTTGACGACTTTAAATTGCTATCGATATCG--TCAATATCGTGTGTATATCGAATCATGATCGTATTTCTTACGGTTGTTCGACTTCANCTTGCTATCGATATCGTAA-CGATATCGGAA--A------GTGACCTTT-TCTGGTG--GCTACGAT-AT-CAA-A--C--TGT---T-GNCGA--TATCG--TC-------------GATATCGTGT-CGATATCGAATCATG--------------ATCG-T-NT-----------------T-------------CT-TA-TGG-----ATGTTTGATG--GCTAC-AACTTGCT-A----C-ATGT---GTCGATATCGAAT--C--------G--T--------TTC---C-C----GT-G-TT----------------GTTTGANAGC----------TACAA-CTTGCTATCGATAACATCGA-TATCGTTTCGAT-AT-CGAATCGTGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGACGGATAATGAGTTTGCCATCAAACACCCATAGGAAAAACGATCANGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACGATATCGAT----AGCAATATGTAGCCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGACATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAA-GATAACCATTTTATG-AT---A--GATA--ATA--CG--TTCGTAAGAAATCGATATCGACACGATATCGTC-AC--------GC---------TA-TT----GT-----------CGAT-ATCGT--CGAT--ATCGA-CGTTGTATTTGTTCTC-GAAAGACAANC--GTNT----TATGACAGAT-A--T--A-G-TTCGCAAGACGTCGATA-TCGACACGA--------------------TATCG-----------TC-----GATATCGATGTTG-TATTTG
gi|1 : GTTAATATCGAATCAAGA-------C-CATGTT-TCTT----ATTG-GTGCCTCCTGACTA--CAACTT-G-CTGTCGATATCGACGATATTGTTT-CGATATCG-ATTCATAATAGCTT--TGCTTAT-GGTTGTTTGACGACTTTAAATTGCTATCGATATCG--TCAATATCGTGTGGATATCGAATCATAATCGTGTTTC-TACGGTTGTTTTACTTCAACTTGCTATCGATATCGT---CGATATCCGAATCATAGATCGTGTTTTTT-TATGGTA--GTT-TGAC-TT-CAA-A--CT-TGC---T-ATCGA--TATTG--TC-------------GATATCATGT-CGATATCGAATCATG--------------AT-G-T-AT-----------------T-------------CC-TA-TGG-----CTCTTTGATG--ACTAC-AACCTGCTAA----C-ATGTA--ATCGATATCGAAT--T--------G--T--------TTC---T-C----GT-G-TT----------------GTTTGAAAGC----------TACAA-CTTGCTATCGATAACATCGA-TATCGTTT---T-ATCCGAATCATGAT
gi|1 : ATATGACAGATTATGAGTTTGCCATCAAATACTAATAGGAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACGATATCGAT----AGCAATATGTAGTCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGATATTT----GTTCTTTACTTGTTC-CCTAAA-GATAACCATTTTATG-GT---A--GATA--ATA--CG--TTCGCAAGAAATCGATATCGACACGATATCGTC-AT--------GC---------TA-TT----GT-----------CGAT-ATCAT--CAAC--AGGGA-CATTGAATTTGTTTTC-AAAAGACAAAC--ATCT----TATGAC-----------A-G-TTCGCAAATTGTCGATA-TCGACACGA--------------------TATCG-----------TC-----GATATTGATGTTG-TATTTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagattatgagtttgccatcaaatactaataggaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacgatatcgatagcaatatgtagtcaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatatttgttctttacttgttccctaaagataaccattttatggtagataatacgttcgcaagaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattgtcgatatcatcaacagggacattgaatttgttttcaaaagacaaacatcttatgacagttcgcaaattgtcgatatcgacacgatatcgtcgatattgatgttgtatttg
gi|10 : gttaatatcgaatcaagaccatgtttcttattggtgcctcctgactacaacttgctgtcgatatcgacgatattgtttcgatatcgattcataatagctttgcttatggttgtttgacgactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtggatatcgaatcataatcgtgtttctacggttgttttacttcaacttgctatcgatatcgtcgatatccgaatcatagatcgtgtttttttatggtagtttgacttcaaacttgctatcgatattgtcgatatcatgtcgatatcgaatcatgatgtattcctatggctctttgatgactacaacctgctaacatgtaatcgatatcgaattgtttctcgtgttgtttgaaagctacaacttgctatcgataacatcgatatcgttttatccgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTGGTC-CTTGAA-AACAATCAT---ATG----------------TA--CGACTTCGTAAGATGACAATATCTACACAATACCCTC-AT--------GC---------TA-CT-------------------------GT--CAAT--ATTGA-CATCATACTTGGTC----AATGAAAATC--GTGTTGTATATGGTAACC-A--T--A-ACTTTGTTAGATGAGGATATTTGTCAAGC--------------------TATTG-----------TT-----GATATTGACATTGTTATTTG
gi|11 : TCGTTT--TGCTTATCGC--GTTTGACGACTTCAAATTGCTAgtctt
gi|12 : cannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttGACATTTTGGCGT-----ATTTGCTCATTGAA-----AACTGTTATGTGTATTAAA--GGTT--ACA--AC--TTTGTAA------GATGTCGAGATGATGTCTTT-AC--------CC---------TG-TT----CT-----------CAAT-ATCGG--TGAT--ATTGA-CATAACATTTGGTCT
gi|13 : tattACCAGAA--G------GTTACTTTTATTTTGT-----TTCGAT-AT-CAT-GTTC--TGT---TTGACGA--TATTG--TC-------------GATACCGTAT-CTACATTGt
gi|13 : cagttatgtcgaagacaGATATCGAAA-CAAAAT--AAA--A------GTAACCTT---CTGGTG--GCTTTGATAAT-CAA-A--ggctttgataatcaaataat
gi|14 : cagttatgtcgaagacacaatgtagatacggtatcgacaatatcgtcaaacagaacatCAGAA--G------GTTAC-TTT-TC-GATATCGTTACGAT-AT-CAT-G--T--TGTGTTT-GACGA--TATCG--TC-------------GATATCTTAT-CTACATCGAGTCTTG--------------taat
gi|14 : agttatgccGATATCGTAA-CGATATCGAAA--A------GTAACC--T-TCTGGAA--GCCATGATAAT-CAA-A--C--gaagccatgataatcaaaca
gi|15 : agttatgcccaagactcgatgtagataagatatcgacgatatcgtcaaacacaacatC-------------GATATCGTGT-TGATATCGAATCATGATAGTGTTTTTTAAATCG-TGTT-----------------T-------------CT-TA-TGG-----ATGTTCCATG--GCTAC-AACTTACa
gi|16 : gttagtgaACAAT-GT-TAA-------------T-GACGA--TATCGAATT-------------GTGATCATGT-TT-TATTAAATCATG---------------------CT-----------------T-------------CA-TA-TGG-----ATGTTTGATG--GCTAC-AACTTG
gi|17 : GA--TATCG--TC-------------GATATCGTGT-CGATATCGAATCCTT--------------ATCG-T-GT-----------------T-------------TT-TA-TGG-----AGGTTTGA-----CTTC-AACTTGCT-A----
gi|18 : ATATCGACACGATATCGTCTAT--------GC---------TATTT----GT-----------CGTT-ATC------------CGA-TGTTGTATTTG
gi|19 : TGTCTGATG--ACTAC-AACCTGCT-A--------------TCGATATCGAA
gi|2 : --TGCTTAT-GTTTGTTTGACAACTTTAAATTGCTATCGATATCG--TCAATATCGTGTGTATATCGAATCATGATCGTATTTCTTACGATTGTTCGACTTCAGCTTTCTATCTATATCGT---CGATTTCG
gi|2 : AATCATG--------------ATTG-T-AT-----------------T-------------TTCTA-TGG-----CTGTTTAATG--ACTAC-AACCTGCT-G----C-ATAT---ATCGATATCGAAT-----------GTTT--------TTC---C-C----GTGG-TT----------------GTTTGAAAGCTACAAAAATGTACAA-CTTGCTATCGATAAGATCGAGTATCGTTT-GAT-AC-CGAATATTGATacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|2 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTATGATGGATAATGAGTTTGCCATTAAACACCC-----AAAAACGATCATGATTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|2 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngGTCGATATTGAATCAATAT------C-T-TTTT-TCTTTACTG--G-GTGTTTAATGGCTA--TATCTT-G-CTGTCGATATCGA---------------------AT-CATGATCGTTT--T-----T-GGGTGTTTAATGGCcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|2 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttCGATATCGAC----AGCAAGATATAGCCATTAAACACCCAG----TAAA-------GA-AAAAAGATATT-----G------ATTCAATA-TCGACACGATA-TCGTC----G-AT---ATTGACG--ATA-------TCGATAGCAATAGGTAGC--CACCAAA----C-AC--------CCA--------TA-TT----CT-----------AAATTAT--T--TGATGAACCGA-TATTGTATTTGTTCCC-GAAAGATAACC--ATTT----TATGATAGATAA--T--ACG-TTCGCAACAAATCGATA-TCGACACGA--------------------TATCG-----------TC-----acgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|2 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattGACGATATCGAT----AGCAATAGGTAGCCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGATATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAA-GATAACCATTTTATG-AT---A--GATA--ATA--CG--TTCGCAACAAATCGATATCGACACGATATCGTC-AT--------GCTATTAAAAATA-TT----GT-----------CGAT-ATCGT--CGAT--ATCGA-TGTTGCATTTatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|3 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatatt-----------------T-------------CT-TA-TGG-----GTGTTTGATG--ACTAT-AGCCTGCT-A----C-ATGT---ATCGATATCGAAT--T--------T--T--------TTT---CTC----GT-GGTT----------------GTTTGACAGC----------TACAA-CTTGCTATCGATAACATCGC-TATCGTTTCGAT-AT-CGAATCATGAT
gi|3 : ATATGACAGATAATTAGTTTGCCATCAAACAGCTATAGGAAAAACGATCAAGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----AGCAATATGTAGCCACCAAACACCCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataattagtttgccatcaaacagctataggaaaaacgatcaagattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaatatgtagccaccaaacacccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaataatctaaattatttgataccgacattgcatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataataagttcgtaagaaatcgatatcgacacgatatcgttatgttattgtcgataccgtcgacatcgatcattgtatgtgttttcaaaaaaacaaacatcttatgacagatactgagtttgcaagacgtcaatatcgacacgacatggtcacgttattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgtatttg
gi|3 : tcttatgggtgtttgatgactatagcctgctacatgtatcgatatcgaatttttttctcgtggttgtttgacagctacaacttgctatcgataacatcgctatcgtttcgatatcgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAATCTAAATTAT-TTGAT--ACCGACATT-----GC-----ATTTGTTC-CCGAAA-GATAACCATTTTATG-AT---A--GATA--ATA--AG--TTCGTAAGAAATCGATATCGACACGATATCGTT-AT--------GT---------TA-TT----GT-----------CGAT-ACCGT--CGAC--ATCGATCATTGTATGTGTTTTCAAAAAAACAAAC--ATCT----TATGACAGAT-A--CTGA-G-TTTGCAAGACGTCAATA-TCGACACGACATGGTCACGTTATTGTCGATATCG-----------TC-----GATATCGATGTTG-TATTTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaataatctaaattatttgataccgacattgcatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataataagttcgtaagaaatcgatatcgacacgatatcgttatgttattgtcgataccgtcgacatcgatcattgtatgtgttttcaaaaaaacaaacatcttatgacagatactgagtttgcaagacgtcaatatcgacacgacatggtcacgttattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgtatttg
gi|4 : tcttatgggtgtttgatgactatagcctgctacatgtatcgatatcgaatttttttctcgtggttgtttgacagctacaacttgctatcgataacatcgctatcgtttcgatatcgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataattagtttgccatcaaacagctataggaaaaacgatcaagattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaatatgtagccaccaaacacccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaTA--TG--TTC--AAGACAG-GATGTAGATACGATATCG---AC--------GA---------TA-TC----GTCAAACACAACACGAT-ATCGTAACGAT--ATCGA-
gi|4 : agtATATCATAG-C--CACCAGAA--G------GTAAC-TTT-TC-GATATCGTTACGAT-AT-CGT-G--T--TGTGTTT-GACGA--TATCG--TC-------------GATATCGTAT-CTACATCaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|4 : agttatgttcaagacagGTA--GATACGAT-AT-C-----------------GACGA--TATCG--TCAAACACAACAC--GATATCGTAA-CGATATCGAA--AAG---------------TTA-C-CT-----------------T-------------CT-GG-TGGCTATGATATTCAA-------AC-AA--TGTT-AGTGACGATGTCGTGTTGACATTGAAT--CATGATCGTG--T--------TTTAAAT-C----GC-G-TTTCTTATGAAT------GTTTGATGGC----------TACAA-CTTGCT---------GTCGA-TATCGTTTCtcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|4 : agttatgttcaagacaggatCGATATCGTAA-CGATATCGAAA--A------GTTACCTT---CTGGTG--GCTATGAT-ATTCAA-A--CAATGT---T-AGTGA----------C-------------GATGTCGTGT-TGACATTGAATCATG--------------ATCG-T-GT-----------------TTTAAATCGCGTTTCT-TA-TGA-----ATGTTTGATG--GCTAC-AACTTGC------------T---GTCGATATCGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|4 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgatatcgacgatatcgtcaaacacaacaT--TGCTTAT-GTTTGTTTGACAACTTTAAATTGCTATCGATATCG--TCAATATCGTGTGTATATCGAATCATGATCGTATTTCTTACGATTGTTCGACTTCAGCTTTCTATCTATATCGT---CGATTTCtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|5 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgatatcgacgatatcgtcaaacacaacacgatatcgtaacgatatcgaaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-----ACGTTTGATGATGGTAC-TAATT-CT-A--------------TCGATATCGAAT--C--------A--TGATTGTATTTC---C-T----AT-GGCT----------------GTTTGATGAC----------TACAA-CCTGCTA-------CAT--------GTATCGAT-AT-CGAATTGTG
gi|5 : aTAT-CGATATCGAATCATG--------------ATTG-T-AT-----------------TT------------CC-TA-TGG-----CTGTTTGATG--ACTAC-AACCTGCT-A----C-ATGT---ATCGATATCGAATTGT--------G--T--------TTC---T-C----GTGG-TT----------------GTTTGAAAGC----------TACAA-CTTGTTATCGATAACATCGA-TATCAATGC-ATAAA-CGAATTATGATtttctcgtggttgtttgaaagctacaacttgttatcgataacatcgatatcaatgcataaacgaattatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataatggatttgccatcaaacacccataggaaaaac
gi|5 : aacgtttgatgatggtactaattcATATGACAGATAATGGATTTGCCATCAAACACCCATAGGAAAAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataatggatttgccatcaaacacccataggaaaaac
gi|6 : aacgtttgatgatggtactaattctatcgatatcgaatcatgattgtatttcctatggctgtttgatgactacaacctgctacatgtatcgatatcgaattgtgtttctcgtggttgtttgaaagctacaacttgttatcgataacatcgatatcaatgcataaacgaattatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT-----GT-----AGTTGGAC-CTATAG-GAAAAC----TTAAC-AT---A--CATG--ATA--CC--TTTGTAAAACGACTATATGGACACGATATCGTT-AT--------GC---------CA-TTCATTGT-----------CGAT-ATCGT--CGAT--ATCGA-CGAAAGATTTGGTCCT-TAGAGACAATCTGGTGTA---TATGATAGAA-A--A--T-G-ACGGTAAAATGACGATT-TCGATACGA--------------------TATCG-----------CCATGCTGTTGTCGATATTG-
gi|7 : cacacgtaattgaaattaccttctttgttgaattaagacctttcattcctcttttatA-CAATATCGG------------TG-------TTTGGTG--GCTA---T-AT-C------T--TGC---T-GTCGA--TTTCG--AC-------------GATATCGTAT-CGATATTGAATCGTG--------------ATCGTT-TT-----------------T-------------CA-TA-TGA-----GTGTTTGATG--G--AA-AACTCACT-A----T-CTGT---
gi|7 : --G-GTGTTTGGTGGCTA--TA-TCTTG-CTGTCGATTTCGACGATATCGTAT-CGATATTGAAT-CGTGATCGTTT--TTCATAT-GAGTGTTTGATGaaattatttgatactgacattgtatttgttccaaaaatagccatttatgacagataattagtttgcaagaagtcgatatcgacacgacatggtcaagttattttcggtatcgatgttgtaac
gi|7 : acagatagtgagttttcAAC-GATCACGATTCAAT--AT---C--GATACGATA-------TCGTC-GAAATCGA---CAGCAAGATATAGCC-ACCAAACACCGA---------TA-TT----GT-----------AAATTAT--T--TGAT--ACTGA-CATTGTATTTGTTCC---AAAAATAGCC--AT-T----TATGACAGAT-AATT--A-G-TTTGCAAGAAGTCGATA-TCGACACGA--------------------CATGGTCAAGTTATTTTC-----GGTATCGATGTTG-TAgatattgtaaattatttgatactgacattgtatttgttccaaaaatagccatttatgacagataattagtttgcaagaagtcgatatcgacacgacatggtcaagttattttcggtatcgatgttgtaac
gi|7 : acagatagtgagttttccatcaaacactcatatgaaaCGAAATCGAC----AGCAAGATATAGCCACCAAACACCGATATTGTAAATTAT-TTGAT--ACTGACATT-----GT-----ATTTGTTC-C--AAA-AATAGCCATTT-ATG-AC---A--GATA--ATT--AG--TTTGCAAGAAGTCGATATCGACACGACATGGTC-AA--------GT---------TA-TT----TT-----------CGGT-ATCGac
gi|8 : acagatagtgagttttccatcaaacactcatatgaaaaacgatcacgattcaatatcgatacgatatcgtTCGATATCAA--CACGA-------CAT-CGTC-ACT-----A--ACATGTTTGATATCTAGCCA-CCA-GAAGGTCACTTTT--CGATATCGTTTACGATATC-----CGTG-----TT--TG---------TGTTTGACGA---TAATTCG---TCGATA-CGTATCTACATCGTGTatgttgtaac
gi|8 : gagtatgtccaagACGAT-GT-AGATA--CG-TAT---C-GACGAATTATCG--TCAAACACAAACACGGATATCGTAAACGATATCGAAAAGTG--------------ACC-----T-----------------T-------------CT-GG-TGG-----CTA---GATA--TC-A--AACATGTT-AGTGACGATGTCGTGTTGATATCGAAT--CATGATCGTG--T--------TTT---T-TAAATGT-G-TTTTCTCTTACTGGAAATGTTTGATGGC----------TACAAACTTGCTGCCGATAatcatgatcgtgttttttaaatgtgttttctcttactggaaatgtttgatggctacaaacttgctgccgatatcgtt
gi|8 : gagtatgtccaagacGATATCGTAAACGATATCGAAA--A------GTGACCTT---CTGGTG--GCTA-GAT-AT-CAA-A--CA-TGT---T-AGTGA----------C-------------GATGTCGTGT-TGATATCGAATCATG--------------ATCG-T-GTTTTTTAAATGTGTTTTCT-------------CT-TACTGGAA---ATGTTTGATG--GCTACAAACTTGC------------T---GCCGATATCGtcgtt
gi|9 : gagtatgtccaagacacgatgtagatacgtatcgacgaattatcgtcaaacacaaacacgTCGATATGAA-TCAAGATCGTTTTC-T-CGTTATAT-----G--G-GTGTTTAATGGCTA--TA-TCT-G-C-GTTGAT-TCGACGATA-CGTGT-CGATATCG-A--CATGATCGTTTTCTGTTTCT-TATTGTTTAATGGCtt
gi|9 : tACGATCTTGATTCATATCGATATGC-----CCAAACACC-ATATTCTAAATTATATTGATGAAC--GTATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAA-GATAACCATTTTATG-AT---A--GATA--ATACCCG--CTCGtatgcccaaacaccatattctaaattatattgatgaacgtattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacccgctcgacaag
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 6666666 11 11 1 1 2222 111 111111111 11111 111 4444444444444444444444 2222222222222 444444444444444444444444444444444444444444444444444444 44444444444444444 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2222222222 11 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111 111111111111 111111 22222222222222222222 11111111111111111 333333 2222 2222222 55555555555555555555 333333333333333333
lowQualScore : 5 1111111 666 88 77 44 3 7 4 7 1 5555 0 99 6 44 7 222 3 0 666666666 2 44444 4 111 555 888888 5 2 6666666666666666666666 3 555555 33 9999999999999 2 444444444444444444444444444444444444444444444444444444 3 6 666 555 5 444 44444444444444444 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 7 1111111111 5 2 6 11 8 8 66 6 3 1 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 4444 2 6 9 5 999999999999 0 4 11 4 55 4 888888 55 666666 0 0 1 3 44444444444444444444 3 99999999999999999 7 11 55 55 4 0 1 000000 1 999 7 0000 1 8888888 6 2 6 6 44444444444444444444 444444444444444444 8
lowQualScore : . ....... ... .. .. .. . . . . . .... . .. . .. . ... . . ......... . ..... . ... ... ...... . . ...................... . ...... .. ............. . ...................................................... . . ... ... . ... ................. ........................................................... . .......... . . . .. . . .. . . . ......................................................................................................... .... . . . . ............ . . .. . .. . ...... .. ...... . . . . .................... . ................. . .. .. .. . . . ...... . ... . .... . ....... . . . . .................... .................. .
lowQualScore : 0 5555555 000 33 77 00 3 3 0 3 0 0000 7 22 7 22 3 555 2 4 444444444 4 11111 4 333 888 999999 7 9 5555555555555555555555 1 666666 99 3333333333333 7 333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 2 777 777 3 555 99999999999999999 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 4 9999999999 0 0 7 77 0 0 00 0 7 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2222 5 7 3 2 000000000000 9 4 00 0 77 0 333333 55 555555 5 8 0 6 44444444444444444444 6 55555555555555555 3 99 55 55 0 7 3 222222 0 888 5 8888 8 8888888 7 2 3 7 22222222222222222222 555555555555555555 0
consensus : GTCGATATCGAATCAAGACCGTTTTCNCGTTNCNTG--GGTGTTTNNTGGCTATA-TCT-GCTGTCGAT-TCGACGATATCGTNTCGATATCG-AT-CGTGATCGTTT--TGCTTAT-GNTTGTTTGACGACTTTAAATTGCTATCGATATCGTCAATATCGTGTGTATATCGAATCATGATCGTATTTCTTACGATTGTTCGACTTCAGCTTTCTATCGATATCGTAA-CGATATCGGAA--G------GTNACCTTT-TCTGGTG--GC---TAC-----GAT-AT-CAA-A--C--TG-------T---T-GACGA--TA--TCG--TC-------------GATATCGTGT-CGATATCGAATCATG--------------ATCG-T-NT-----------------T-------------CT-TA-TGG--NTGTTTGATG--GCTAC-AACC--TGCT-A----C-ATGT---GTCGATATCGAAT--C--------G--T--------TTC---T-C----GT-G-TT----------------GTTTGACGGC----------TAC-AACTTGCTATCGATAACATCGA-TATCGTTTCGAT-AT-CGAATCGTGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGACAGATAATGAGTTTGCCATCAAACACCNATAGGAAAAACGATCAAGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACGATATCGAT----AGCAATATGTAGCCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGACATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAA-GATAACCATTTTATG-AT---A--GATA--ATA--CG--TTCGTAAGAAATCGATATCGACACGATATCGTC-AC--------GC---------TA-TT----GT-----------CGAT-ATCGT--CGAT--ATCGA-CGTTGTATTTGTTCC-CG-AAAGACAANC--GTNT----TATGACAGATA--T--A-G-TTCGCAAGACGTCGATA-TCGACACGA--------------------TATCG-----------TC-----GATATCGATGTTG-TATTTG
Reference ( family-1193 ) : GTCGATATCGAATCAAGATC------TCGTTTCTTG--GGTGTTTGATGGCTATA-CCT-GCTGTCGATNTCGACGATATCGTNTCGATATCG-AT-CGTGATCGTTT--TGCTTAT-GNTTGTTTGACGACTTTAAATTGCTATCGATATCGTCAATATCGTGTGTATATCGAATCATGATCGTATTTCTTACGATTGTTCGACTTCAGCTTTCTATCGATATCGTAA-CGATATCGGAA--A------GTNACCTTT-TCTGGTG--GC---TAC-----GAT-AT-CAA-A--C--TG-------T---T-GACGA--TA--TCG--TC-------------GATATCGTGT-CGATATCGAATCATG--------------ATCG-T-NT-----------------T-------------CT-TA-TGG--ATGTTTGATG--GCTAC-AACC--TGCT-A----C-ATGT---GTCGATATCGAAT--C--------G--T--------TTC---C-C----GT-G-TT----------------GTTTGACGGC----------TAC-AACTTGCTATCGATAACATCGA-TATCGTTTCGAT-AT-CGAATCGTGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGACGGATAATGAGTTTGCCATCAAACACCCATAGGAAAAACGATCANGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACGATATCGAT----AGCAATATGTAGCCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGACATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAA-GATAACCATTTTATG-AT---A--GATA--ATA--CG--TTCGTAAGAAATCGATATCGACACGATATCGTC-AC--------GC---------TA-TT----GT-----------CGAT-ATCGT--CGAT--ATCGA-CGTTGTATTTGTTCC-C--AAAGACAANC--GTNT----TATGACAGATA--T--A-G-TTCGCAAGACGTCGATA-TCGACACGA--------------------TATCG-----------TC-----GATATCGATGTTG-TATTTG
gi|1 : GTTAATATCGAATCAAGACC------ATGTTTCTTATTGGTGCCTCCTGACTACAACTT-GCTGTCGATATCGACGATATTGTTTCGATATCG-ATTCATAATAGCTT--TGCTTAT-GGTTGTTTGACGACTTTAAATTGCTATCGATATCGTCAATATCGTGTGGATATCGAATCATAATCGTGTTTC-TACGGTTGTTTTACTTCAACTTGCTATCGATATCGT---CGATATCCGAATCATAGATCGTGTTTTTT-TATGGTA--GT---T-T-----GAC-TT-CAA-A--CT-TG-------C---T-ATCGA--TA--TTG--TC-------------GATATCATGT-CGATATCGAATCATG--------------AT-G-T-AT-----------------T-------------CC-TA-TGG--CTCTTTGATG--ACTAC-AACC--TGCTAA----C-ATGTA--ATCGATATCGAAT--T--------G--T--------TTC---T-C----GT-G-TT----------------GTTTGAAAGC----------TAC-AACTTGCTATCGATAACATCGA-TATCGTTT---T-ATCCGAATCATGAT
gi|1 : ATATGACAGATTATGAGTTTGCCATCAAATACTAATAGGAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACGATATCGAT----AGCAATATGTAGTCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGATATTT----GTTCTTTACTTGTTC-CCTAAA-GATAACCATTTTATG-GT---A--GATA--ATA--CG--TTCGCAAGAAATCGATATCGACACGATATCGTC-AT--------GC---------TA-TT----GT-----------CGAT-ATCAT--CAAC--AGGGA-CATTGAATTTGTTTT-CA-AAAGACAAAC--ATCT----TATGAC----------A-G-TTCGCAAATTGTCGATA-TCGACACGA--------------------TATCG-----------TC-----GATATTGATGTTG-TATTTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagattatgagtttgccatcaaatactaataggaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacgatatcgatagcaatatgtagtcaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatatttgttctttacttgttccctaaagataaccattttatggtagataatacgttcgcaagaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattgtcgatatcatcaacagggacattgaatttgttttcaaaagacaaacatcttatgacagttcgcaaattgtcgatatcgacacgatatcgtcgatattgatgttgtatttg
gi|10 : gttaatatcgaatcaagaccatgtttcttattggtgcctcctgactacaacttgctgtcgatatcgacgatattgtttcgatatcgattcataatagctttgcttatggttgtttgacgactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtggatatcgaatcataatcgtgtttctacggttgttttacttcaacttgctatcgatatcgtcgatatccgaatcatagatcgtgtttttttatggtagtttgacttcaaacttgctatcgatattgtcgatatcatgtcgatatcgaatcatgatgtattcctatggctctttgatgactacaacctgctaacatgtaatcgatatcgaattgtttctcgtgttgtttgaaagctacaacttgctatcgataacatcgatatcgttttatccgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTGGTC-CTTGAA-AACAATCAT---ATG----------------TA--CGACTTCGTAAGATGACAATATCTACACAATACCCTC-AT--------GC---------TA-CT-------------------------GT--CAAT--ATTGA-CATCATACTTGGT---C--AATGAAAATC--GTGTTGTATATGGTAACCA--T--A-ACTTTGTTAGATGAGGATATTTGTCAAGC--------------------TATTG-----------TT-----GATATTGACATTGTTATTTG
gi|11 : TCGTTT--TGCTTATCGC--GTTTGACGACTTCAAATTGCTAgtctt
gi|12 : cannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttGACATTTTGGCGT-----ATTTGCTCATTGAA-----AACTGTTATGTGTATTAAA--GGTT--ACA--AC--TTTGTAA------GATGTCGAGATGATGTCTTT-AC--------CC---------TG-TT----CT-----------CAAT-ATCGG--TGAT--ATTGA-CATAACATTTGGTC
gi|13 : tattACCAGAA--G------GTTACTTTTATTTTGT--------TTC-----GAT-AT-CAT-GTTC--TG-------T---TTGACGA--TA--TTG--TC-------------GATACCGTAT-CTACATTGtt
gi|13 : cagttatgtcgaagacaGATATCGAAA-CAAAAT--AAA--A------GTAACCTT---CTGGTG--GC---TTT-----GATAAT-CAA-A--ggctttgataatcaaataat
gi|14 : cagttatgtcgaagacacaatgtagatacggtatcgacaatatcgtcaaacagaacatCAGAA--G------GTTAC-TTT-TC-GATATCGT---TAC-----GAT-AT-CAT-G--T--TG-------TGTTT-GACGA--TA--TCG--TC-------------GATATCTTAT-CTACATCGAGTCTTG--------------taat
gi|14 : agttatgccGATATCGTAA-CGATATCGAAA--A------GTAACC--T-TCTGGAA--GC---CAT-----GATAAT-CAA-A--C--gaagccatgataatcaaaca
gi|15 : agttatgcccaagactcgatgtagataagatatcgacgatatcgtcaaacacaacat---T-GAC----------------------------GATATCGTGT-TGATATCGAATCATGATAGTGTTTTTTAAATCG-TGTT-----------------T-------------CT-TA-TGG--ATGTTCCATG--GCTAC-AACT--TACa
gi|16 : gttagAC-----AAT-GT-TAA--------------------T-GACGA--TA--TCGAATT-------------GTGATCATGT-TT-TATTAAATCATG---------------------CT-----------------T-------------CA-TA-TGG--ATGTTTGATG--GCTAC-AACT--TG
gi|17 : GA--TA--TCG--TC-------------GATATCGTGT-CGATATCGAATCCTT--------------ATCG-T-GT-----------------T-------------TT-TA-TGG--AGGTTTGA-----CTTC-AACT--TGCT-A----
gi|18 : ATATCGACACGATATCGTCTAT--------GC---------TATTT----GT-----------CGTT-ATC------------CGA-TGTTGTATTTG
gi|19 : TGTCTGATG--ACTAC-AACC--TGCT-A--------------TCGATATCGAA
gi|2 : --TGCTTAT-GTTTGTTTGACAACTTTAAATTGCTATCGATATCGTCAATATCGTGTGTATATCGAATCATGATCGTATTTCTTACGATTGTTCGACTTCAGCTTTCTATCTATATCGT---CGATTTCG
gi|2 : AATCATG--------------ATTG-T-AT-----------------T-------------TTCTA-TGG--CTGTTTAATG--ACTAC-AACC--TGCT-G----C-ATAT---ATCGATATCGAAT-----------GTTT--------TTC---C-C----GTGG-TT----------------GTTTGAAAGCTACAAAAATGTAC-AACTTGCTATCGATAAGATCGAGTATCGTTT-GAT-AC-CGAATATTGATacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|2 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-TTTGGTG--GC---TACCTATTGCT-AT-CGA-------TA-------T---C-GTCAA--TA--TCG--AC-------------GATATCGTGT-CGATATTGAATCAAT--------------ATCT-T-TT-----------------TTC-----------TT-TACTGG--GTGTTTAATG--GCTAT-ATCT--TGC------------T---GTCGATATCGAAT--C--------A--TGATCG---TTT---T-T----G--G-GT----------------GTTTAATGGC-----------A--AACTCATTATCCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|2 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgCGATATCGAC----AGCAAGATATAGCCATTAAACACCCAG----TAAA-------GA-AAAAAGATATT-----G------ATTCAATA-TCGACACGATA-TCGTC----G-AT---ATTGACG--ATA-------TCGATAGCAATAGGTAGC--CACCAAA----C-AC--------CCA--------TA-TT----CT-----------AAATTAT--T--TGATGAACCGA-TATTGTATTTGTTCC-CG-AAAGATAACC--ATTT----TATGATAGATAA-T--ACG-TTCGCAACAAATCGATA-TCGACACGA--------------------TATCG-----------TC-----cacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|2 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattGACGATATCGAT----AGCAATAGGTAGCCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGATATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAA-GATAACCATTTTATG-AT---A--GATA--ATA--CG--TTCGCAACAAATCGATATCGACACGATATCGTC-AT--------GCTATTAAAAATA-TT----GT-----------CGAT-ATCGT--CGAT--ATCGA-TGTTGCATTTatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|3 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatatt-----------------T-------------CT-TA-TGG--GTGTTTGATG--ACTAT-AGCC--TGCT-A----C-ATGT---ATCGATATCGAAT--T--------T--T--------TTT---CTC----GT-GGTT----------------GTTTGACAGC----------TAC-AACTTGCTATCGATAACATCGC-TATCGTTTCGAT-AT-CGAATCATGAT
gi|3 : ATATGACAGATAATTAGTTTGCCATCAAACAGCTATAGGAAAAACGATCAAGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----AGCAATATGTAGCCACCAAACACCCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataattagtttgccatcaaacagctataggaaaaacgatcaagattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaatatgtagccaccaaacacccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaataatctaaattatttgataccgacattgcatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataataagttcgtaagaaatcgatatcgacacgatatcgttatgttattgtcgataccgtcgacatcgatcattgtatgtgttttcaaaaaaacaaacatcttatgacagatactgagtttgcaagacgtcaatatcgacacgacatggtcacgttattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgtatttg
gi|3 : tcttatgggtgtttgatgactatagcctgctacatgtatcgatatcgaatttttttctcgtggttgtttgacagctacaacttgctatcgataacatcgctatcgtttcgatatcgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAATCTAAATTAT-TTGAT--ACCGACATT-----GC-----ATTTGTTC-CCGAAA-GATAACCATTTTATG-AT---A--GATA--ATA--AG--TTCGTAAGAAATCGATATCGACACGATATCGTT-AT--------GT---------TA-TT----GT-----------CGAT-ACCGT--CGAC--ATCGATCATTGTATGTGTTTT-CAAAAAAACAAAC--ATCT----TATGACAGATA--CTGA-G-TTTGCAAGACGTCAATA-TCGACACGACATGGTCACGTTATTGTCGATATCG-----------TC-----GATATCGATGTTG-TATTTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaataatctaaattatttgataccgacattgcatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataataagttcgtaagaaatcgatatcgacacgatatcgttatgttattgtcgataccgtcgacatcgatcattgtatgtgttttcaaaaaaacaaacatcttatgacagatactgagtttgcaagacgtcaatatcgacacgacatggtcacgttattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgtatttg
gi|4 : tcttatgggtgtttgatgactatagcctgctacatgtatcgatatcgaatttttttctcgtggttgtttgacagctacaacttgctatcgataacatcgctatcgtttcgatatcgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataattagtttgccatcaaacagctataggaaaaacgatcaagattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaatatgtagccaccaaacacccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaTA--TG--TTC--AAGACAG-GATGTAGATACGATATCG---AC--------GA---------TA-TC----GTCAAACACAACACGAT-ATCGTAACGAT--ATCGA-
gi|4 : agtATATCATAG-C--CACCAGAA--G------GTAAC-TTT-TC-GATATCGT---TAC-----GAT-AT-CGT-G--T--TG-------TGTTT-GACGA--TA--TCG--TC-------------GATATCGTAT-CTACATCaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|4 : agttatgttcaagacagGTA--GA---TAC-----GAT-AT-C------------------------GACGA--TA--TCG--TCAAACACAACAC--GATATCGTAA-CGATATCGAA--AAG---------------TTA-C-CT-----------------T-------------CT-GG-TGG--CTAT--GATA----TTC-AAACAATGTT-AGTGACGATGTCGTGTTGACATTGAAT--CATGATCGTG--T--------TTTAAAT-C----GC-G-TTTCTTATGAAT------GTTTGATGGC----------TAC-AACTTGCT---------GTCGA-TATCGTTTCtcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|4 : agttatgttcaagacaggatCGATATCGTAA-CGATATCGAAA--A------GTTACCTT---CTGGTG--GC---TAT-----GAT-ATTCAA-A--CAATG-------T---T-AGTGA------------C-------------GATGTCGTGT-TGACATTGAATCATG--------------ATCG-T-GT-----------------TTTAAATCGCGTTTCT-TA-TGA--ATGTTTGATG--GCTAC-AACT--TGC------------T---GTCGATATCGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|4 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgatatcgacgatatcgtcaaacacaacaT--TGCTTAT-GTTTGTTTGACAACTTTAAATTGCTATCGATATCGTCAATATCGTGTGTATATCGAATCATGATCGTATTTCTTACGATTGTTCGACTTCAGCTTTCTATCTATATCGT---CGATTTCtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|5 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgatatcgacgatatcgtcaaacacaacacgatatcgtaacgatatcgaaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--ACGTTTGATGATGGTACTAA----TTCT-A--------------TCGATATCGAAT--C--------A--TGATTGTATTTC---C-T----AT-GGCT----------------GTTTGATGAC----------TAC-AACCTGCTA-------CAT--------GTATCGAT-AT-CGAATTGTG
gi|5 : aTAT-CGATATCGAATCATG--------------ATTG-T-AT-----------------TT------------CC-TA-TGG--CTGTTTGATG--ACTAC-AACC--TGCT-A----C-ATGT---ATCGATATCGAATTGT--------G--T--------TTC---T-C----GTGG-TT----------------GTTTGAAAGC----------TAC-AACTTGTTATCGATAACATCGA-TATCAATGC-ATAAA-CGAATTATGATtttctcgtggttgtttgaaagctacaacttgttatcgataacatcgatatcaatgcataaacgaattatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataatggatttgccatcaaacacccataggaaaaac
gi|5 : aacgtttgatgatggtactaattcATATGACAGATAATGGATTTGCCATCAAACACCCATAGGAAAAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataatggatttgccatcaaacacccataggaaaaac
gi|6 : aacgtttgatgatggtactaattctatcgatatcgaatcatgattgtatttcctatggctgtttgatgactacaacctgctacatgtatcgatatcgaattgtgtttctcgtggttgtttgaaagctacaacttgttatcgataacatcgatatcaatgcataaacgaattatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT-----GT-----AGTTGGAC-CTATAG-GAAAAC----TTAAC-AT---A--CATG--ATA--CC--TTTGTAAAACGACTATATGGACACGATATCGTT-AT--------GC---------CA-TTCATTGT-----------CGAT-ATCGT--CGAT--ATCGA-CGAAAGATTTGGTCCTT--AGAGACAATCTGGTGTA---TATGATAGAAA--A--T-G-ACGGTAAAATGACGATT-TCGATACGA--------------------TATCG-----------CCATGCTGTTGTCGATATTG-
gi|7 : cacacgtaattgaaattaccttctttgttgaattaagacctttcattcctcttttatA-CAATATCGG------------------TG-TTTGGTG--GC---TA--------T-AT-C------T--TG-------C---T-GTCGA--TT--TCG--AC-------------GATATCGTAT-CGATATTGAATCGTG--------------ATCGTT-TT-----------------T-------------CA-TA-TGA--GTGTTTGATG--G--AA-AACT--CACT-A----T-CTGT---
gi|7 : --GGTGTTTGGTGGCTATA-TCTTGCTGTCGATTTCGACGATATCGTATCGATATTGAAT-CGTGATCGTTT--TTCATAT-GAGTGTTTGATGaaattatttgatactgacattgtatttgttccaaaaatagccatttatgacagataattagtttgcaagaagtcgatatcgacacgacatggtcaagttattttcggtatcgatgttgtaac
gi|7 : acagatagtgagttttcAAC-GATCACGATTCAAT--AT---C--GATACGATA-------TCGTC-GAAATCGA---CAGCAAGATATAGCC-ACCAAACACCGA---------TA-TT----GT-----------AAATTAT--T--TGAT--ACTGA-CATTGTATTTGTT-C-C--AAAAATAGCC--AT-T----TATGACAGATAATT--A-G-TTTGCAAGAAGTCGATA-TCGACACGA--------------------CATGGTCAAGTTATTTTC-----GGTATCGATGTTG-TAgatattgtaaattatttgatactgacattgtatttgttccaaaaatagccatttatgacagataattagtttgcaagaagtcgatatcgacacgacatggtcaagttattttcggtatcgatgttgtaac
gi|7 : acagatagtgagttttccatcaaacactcatatgaaaCGAAATCGAC----AGCAAGATATAGCCACCAAACACCGATATTGTAAATTAT-TTGAT--ACTGACATT-----GT-----ATTTGTTC-C--AAA-AATAGCCATTT-ATG-AC---A--GATA--ATT--AG--TTTGCAAGAAGTCGATATCGACACGACATGGTC-AA--------GT---------TA-TT----TT-----------CGGT-ATCGac
gi|8 : acagatagtgagttttccatcaaacactcatatgaaaaacgatcacgattcaatatcgatacgatatcgtAC-----GAT-GT-AGATA--CG-TA-------T---C-GACGAATTA--TCG--TCAAACACAAACACGGATATCGTAAACGATATCGAAAAGTG--------------ACC-----T-----------------T-------------CT-GG-TGG--CTA---GATA--TC-A--AACA--TGTT-AGTGACGATGTCGTGTTGATATCGAAT--CATGATCGTG--T--------TTT---T-TAAATGT-G-TTTTCTCTTACTGGAAATGTTTGATGGC----------TACAAACTTGCTGCCGATAatgttgtaac
gi|8 : gagtatgtccaagacTTGATATC-TAG-C--CACCAGAA--G------GTCAC-TTT-TC-GATA--TCGTTTAC-----GAT-AT-C------CG-TGTTTGTGTT---T-GACGA--TAATTCG--TC-------------GATA-CGTAT-CTACATCGtcgtt
gi|8 : gagtatgtccaagacaGATATCGTAAACGATATCGAAA--A------GTGACCTT---CTGGTG--GC---TA------GAT-AT-CAA-A--CA-TG-------T---T-AGTGA------------C-------------GATGTCGTGT-TGATATCGAATCATG--------------ATCG-T-GTTTTTTAAATGTGTTTTCT-------------CT-TACTGGAAATGTTTGATG--GCTACAAACT--TGC------------T---GCCGATATCGacatgttagtgacgatgtcgtgttgatatcgaatcatgatcgtgttttttaaatgtgttttctcttactggaaatgtttgatggctacaaacttgctgccgatatcgtt
gi|9 : gagtatgtccaagacacgatgtagatacgtatcgacgaattatcgtcaaacacaaacacgTCGATAT-GAATCAAGATCGTTTTCTCGTTATATG--GGTGTTTAATGGCTATA-TCT-GC-GTTGAT-TCGACGATA-CGTGTCGATATCG-A--CATGATCGTTTTCTGTTTCT-TATTGTTTAATGGCtt
gi|9 : tACGATCTTGATTCATATCGATATGC-----CCAAACACC-ATATTCTAAATTATATTGATGAAC--GTATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAA-GATAACCATTTTATG-AT---A--GATA--ATACCCG--CTCGtatgcccaaacaccatattctaaattatattgatgaacgtattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacccgctcgacaag
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 111 333 222 2222 1111 111 1111111111 11111 111 333333333333333 3333333333333 444444444444444444444444444444444444444444444444444444 333333333333333 000000000000000000000000000000000000000000000000000 2222222222 11111111 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111 111111111111 111111 22222222222222222222 11111111111111111 2222 2222 2222222222 55555555555555555555 333333333333333333
lowQualScore : 2 0 666 1 3 666 22 111 3 0000 99 1 3 0 4444 2 77 0 5 55 7 444 2222222222 2 44444 1 444 3 6 3 222222222222222 3 555 44 4444444444444 3 666666666666666666666666666666666666666666666666666666 3 3 555 3 3 44 444444444444444 333333333333333333333333333333333333333333333333333 88 9999999999 6 1 8 99999999 88 44 3 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 4444 2 6 9 5 999999999999 0 4 11 4 55 4 888888 55 666666 0 0 1 3 44444444444444444444 3 99999999999999999 7 11 55 55 4 0 1 3333 1 999 7 0000 5555555555 6 2 6 6 44444444444444444444 444444444444444444 8
lowQualScore : . . ... . . ... .. ... . .... .. . . . .... . .. . . .. . ... .......... . ..... . ... . . . ............... . ... .. ............. . ...................................................... . . ... . . .. ............... ................................................... .. .......... . . . ........ .. .. . ......................................................................................................... .... . . . . ............ . . .. . .. . ...... .. ...... . . . . .................... . ................. . .. .. .. . . . .... . ... . .... .......... . . . . .................... .................. .
lowQualScore : 0 7 333 0 7 333 00 000 2 2222 55 0 2 2 2222 0 99 7 7 99 3 555 4444444444 6 77777 9 000 7 7 3 777777777777777 6 888 66 2222222222222 1 888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3 3 666 8 1 22 777777777777777 000000000000000000000000000000000000000000000000000 55 2222222222 7 7 0 00000000 55 22 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2222 5 7 3 2 000000000000 9 4 00 0 77 0 333333 55 555555 5 8 0 6 44444444444444444444 6 55555555555555555 3 99 55 55 0 7 3 3333 0 888 5 8888 7777777777 7 2 3 7 22222222222222222222 555555555555555555 0
consensus : GTCGATATCGAATCAAGATCGT-TTTCTCNTTAC-TGGGTGTTTAATGGCTATATC-TTGCTGTCGAT-T-CGACGATATCGTATCGATATCG-AT-CATGATCGTTT--TGCTTAT-GNTTGTTTGACGACTTTAAATTGCTATCGATATCGTCAATATCGTGTGTATATCGAATCATGATCGTATTTCTTACGATTGTTCGACTTCAGCTTTCTATCGATATCGTAA-CGATATCGGA-----AG---GTNACCTTT-TCTGGTG--GCTACGAT-AT-CAA-A--C--TGT---T-GACGA--TATCG--TC-------------GATATCGTGT-CGATATCGAATCATG--------------ATCG-T-NT-----------------T-------------CT-TA-TGG--NTGTTTGATGGCTAC-AACC--TGCT-A----C-ATGT---GTCGATATCGAAT--C--------G--TTT-C---TC----GT-G-TT----------------GTTTGANAGC----------TAC-AACTTGCTATCGATAACATCGA-TATCGTTTCGAT-AT-CGAATCATGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGACGGATAATGAGTTTGCCATCAAACACCCATAGGAAAAACGATCANGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACGATATCGAT----AGCAATATGTAGCCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGACATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAA-GATAACCATTTTATG-AT---A--GATA--ATA--CG--TTCGTAAGAAATCGATATCGACACGATATCGTC-AC--------GC---------TA-TT----GT-----------CGAT-ATCGT--CGAT--ATCGA-CGTTGTATTTGTTCCC--AAAGACAANC--GTNT----TATGACAGAT-A--T--A-G-TTCGCAAGACGTCGATA-TCGACACGA--------------------TATCG-----------TC-----GATATCGATGTTG-TATTTG
Reference ( family-1193 ) : GTCGATATCGAATCAAGACCGT-TTTCNCGTTNCNTGGGTGTTTNNTGGCTATATC-T-GCTGTCGAT-T-CGACGATATCGTNTCGATATCG-AT-CGTGATCGTTT--TGCTTAT-GNTTGTTTGACGACTTTAAATTGCTATCGATATCGTCAATATCGTGTGTATATCGAATCATGATCGTATTTCTTACGATTGTTCGACTTCAGCTTTCTATCGATATCGTAA-CGATATCGGA-----AG---GTNACCTTT-TCTGGTG--GCTACGAT-AT-CAA-A--C--TGT---T-GACGA--TATCG--TC-------------GATATCGTGT-CGATATCGAATCATG--------------ATCG-T-NT-----------------T-------------CT-TA-TGG--NTGTTTGATGGCTAC-AACC--TGCT-A----C-ATGT---GTCGATATCGAAT--C--------G--TTT-C---TC----GT-G-TT----------------GTTTGACGGC----------TAC-AACTTGCTATCGATAACATCGA-TATCGTTTCGAT-AT-CGAATCGTGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGACAGATAATGAGTTTGCCATCAAACACCNATAGGAAAAACGATCAAGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACGATATCGAT----AGCAATATGTAGCCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGACATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAA-GATAACCATTTTATG-AT---A--GATA--ATA--CG--TTCGTAAGAAATCGATATCGACACGATATCGTC-AC--------GC---------TA-TT----GT-----------CGAT-ATCGT--CGAT--ATCGA-CGTTGTATTTGTTCCC-GAAAGACAANC--GTNT----TATGACAGAT-A--T--A-G-TTCGCAAGACGTCGATA-TCGACACGA--------------------TATCG-----------TC-----GATATCGATGTTG-TATTTG
gi|1 : GTTAATATCGAATCAAGACCATGTTTCTTATT-----GGTGCCTCCTGACTACAAC-TTGCTGTCGATAT-CGACGATATTGTTTCGATATCG-ATTCATAATAGCTT--TGCTTAT-GGTTGTTTGACGACTTTAAATTGCTATCGATATCGTCAATATCGTGTGGATATCGAATCATAATCGTGTTTC-TACGGTTGTTTTACTTCAACTTGCTATCGATATCGT---CGATATCCGAATCATAGATCGTGTTTTTT-TATGGTA--GTT-TGAC-TT-CAA-A--CT-TGC---T-ATCGA--TATTG--TC-------------GATATCATGT-CGATATCGAATCATG--------------AT-G-T-AT-----------------T-------------CC-TA-TGG--CTCTTTGATGACTAC-AACC--TGCTAA----C-ATGTA--ATCGATATCGAAT--T--------G--TTT-C---TC----GT-G-TT----------------GTTTGAAAGC----------TAC-AACTTGCTATCGATAACATCGA-TATCGTTT---T-ATCCGAATCATGAT
gi|1 : ATATGACAGATTATGAGTTTGCCATCAAATACTAATAGGAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACGATATCGAT----AGCAATATGTAGTCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGATATTT----GTTCTTTACTTGTTC-CCTAAA-GATAACCATTTTATG-GT---A--GATA--ATA--CG--TTCGCAAGAAATCGATATCGACACGATATCGTC-AT--------GC---------TA-TT----GT-----------CGAT-ATCAT--CAAC--AGGGA-CATTGAATTTGTTTTC-AAAAGACAAAC--ATCT----TATGAC-----------A-G-TTCGCAAATTGTCGATA-TCGACACGA--------------------TATCG-----------TC-----GATATTGATGTTG-TATTTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagattatgagtttgccatcaaatactaataggaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacgatatcgatagcaatatgtagtcaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatatttgttctttacttgttccctaaagataaccattttatggtagataatacgttcgcaagaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattgtcgatatcatcaacagggacattgaatttgttttcaaaagacaaacatcttatgacagttcgcaaattgtcgatatcgacacgatatcgtcgatattgatgttgtatttg
gi|10 : gttaatatcgaatcaagaccatgtttcttattggtgcctcctgactacaacttgctgtcgatatcgacgatattgtttcgatatcgattcataatagctttgcttatggttgtttgacgactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtggatatcgaatcataatcgtgtttctacggttgttttacttcaacttgctatcgatatcgtcgatatccgaatcatagatcgtgtttttttatggtagtttgacttcaaacttgctatcgatattgtcgatatcatgtcgatatcgaatcatgatgtattcctatggctctttgatgactacaacctgctaacatgtaatcgatatcgaattgtttctcgtgttgtttgaaagctacaacttgctatcgataacatcgatatcgttttatccgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTGGTC-CTTGAA-AACAATCAT---ATG----------------TA--CGACTTCGTAAGATGACAATATCTACACAATACCCTC-AT--------GC---------TA-CT-------------------------GT--CAAT--ATTGA-CATCATACTTGGTC----AATGAAAATC--GTGTTGTATATGGTAACC-A--T--A-ACTTTGTTAGATGAGGATATTTGTCAAGC--------------------TATTG-----------TT-----GATATTGACATTGTTATTTG
gi|11 : TCGTTT--TGCTTATCGC--GTTTGACGACTTCAAATTGCTAgtctt
gi|12 : cannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttGACATTTTGGCGT-----ATTTGCTCATTGAA-----AACTGTTATGTGTATTAAA--GGTT--ACA--AC--TTTGTAA------GATGTCGAGATGATGTCTTT-AC--------CC---------TG-TT----CT-----------CAAT-ATCGG--TGAT--ATTGA-CATAACATTTGGTC
gi|13 : tattACCAGA-----AG---GTTACTTTTATTTTGT-----TTCGAT-AT-CAT-GTTC--TGT---TTGACGA--TATTG--TC-------------GATACCGTAT-CTACATTGtt
gi|13 : cagttatgtcgaagacaGATATCGAAA-CAAAAT--AA-----AA---GTAACCTT---CTGGTG--GCTTTGATAAT-CAA-A--ggctttgataatcaaataat
gi|14 : cagttatgtcgaagacacaatgtagatacggtatcgacaatatcgtcaaacagaacatCAGA-----AG---GTTAC-TTT-TC-GATATCGTTACGAT-AT-CAT-G--T--TGTGTTT-GACGA--TATCG--TC-------------GATATCTTAT-CTACATCGAGTCTTG--------------taat
gi|14 : agttatgccGATATCGTAA-CGATATCGAA-----AA---GTAACC--T-TCTGGAA--GCCATGATAAT-CAA-A--C--gaagccatgataatcaaaca
gi|15 : agttatgcccaagactcgatgtagataagatatcgacgatatcgtcaaacacaacat---T-GAC--------------------------GATATCGTGT-TGATATCGAATCATGATAGTGTTTTTTAAATCG-TGTT-----------------T-------------CT-TA-TGG--ATGTTCCATGGCTAC-AACT--TACa
gi|16 : gttagACAAT-GT-TAA-------------T-GACGA--TATCGAATT-------------GTGATCATGT-TT-TATTAAATCATG---------------------CT-----------------T-------------CA-TA-TGG--ATGTTTGATGGCTAC-AACT--TG
gi|17 : GA--TATCG--TC-------------GATATCGTGT-CGATATCGAATCCTT--------------ATCG-T-GT-----------------T-------------TT-TA-TGG--AGGTTTGA---CTTC-AACT--TGCT-A----
gi|18 : ATATCGACACGATATCGTCTAT--------GC---------TATTT----GT-----------CGTT-ATC------------CGA-TGTTGTATTTG
gi|19 : TGTCTGATGACTAC-AACC--TGCT-A--------------TCGATATCGAA
gi|2 : --TGCTTAT-GTTTGTTTGACAACTTTAAATTGCTATCGATATCGTCAATATCGTGTGTATATCGAATCATGATCGTATTTCTTACGATTGTTCGACTTCAGCTTTCTATCTATATCGT---CGATTTCG
gi|2 : AATCATG--------------ATTG-T-AT-----------------T-------------TTCTA-TGG--CTGTTTAATGACTAC-AACC--TGCT-G----C-ATAT---ATCGATATCGAAT-----------GTTTTT-C---CC----GTGG-TT----------------GTTTGAAAGCTACAAAAATGTAC-AACTTGCTATCGATAAGATCGAGTATCGTTT-GAT-AC-CGAATATTGATacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|2 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTATGATGGATAATGAGTTTGCCATTAAACACCC-----AAAAACGATCATGATTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|2 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngGTCGATATTGAATCAATATC-T-TTTTTCTTTAC-TGGGTGTTTAATGGCTATATCTT-GCTGTCGA---------------TATCGA------AT-CATGATCGTTT--T-----T-GGGTGTTTAATGGCcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|2 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttCGATATCGAC----AGCAAGATATAGCCATTAAACACCCAG----TAAA-------GA-AAAAAGATATT-----G------ATTCAATA-TCGACACGATA-TCGTC----G-AT---ATTGACG--ATA-------TCGATAGCAATAGGTAGC--CACCAAA----C-AC--------CCA--------TA-TT----CT-----------AAATTAT--T--TGATGAACCGA-TATTGTATTTGTTCCC-GAAAGATAACC--ATTT----TATGATAGATAA--T--ACG-TTCGCAACAAATCGATA-TCGACACGA--------------------TATCG-----------TC-----acgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|2 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattGACGATATCGAT----AGCAATAGGTAGCCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGATATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAA-GATAACCATTTTATG-AT---A--GATA--ATA--CG--TTCGCAACAAATCGATATCGACACGATATCGTC-AT--------GCTATTAAAAATA-TT----GT-----------CGAT-ATCGT--CGAT--ATCGA-TGTTGCATTTatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|3 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatatt-----------------T-------------CT-TA-TGG--GTGTTTGATGACTAT-AGCC--TGCT-A----C-ATGT---ATCGATATCGAAT--T--------T--TTTTC---TC----GT-GGTT----------------GTTTGACAGC----------TAC-AACTTGCTATCGATAACATCGC-TATCGTTTCGAT-AT-CGAATCATGAT
gi|3 : ATATGACAGATAATTAGTTTGCCATCAAACAGCTATAGGAAAAACGATCAAGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----AGCAATATGTAGCCACCAAACACCCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataattagtttgccatcaaacagctataggaaaaacgatcaagattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaatatgtagccaccaaacacccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaataatctaaattatttgataccgacattgcatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataataagttcgtaagaaatcgatatcgacacgatatcgttatgttattgtcgataccgtcgacatcgatcattgtatgtgttttcaaaaaaacaaacatcttatgacagatactgagtttgcaagacgtcaatatcgacacgacatggtcacgttattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgtatttg
gi|3 : tcttatgggtgtttgatgactatagcctgctacatgtatcgatatcgaatttttttctcgtggttgtttgacagctacaacttgctatcgataacatcgctatcgtttcgatatcgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAATCTAAATTAT-TTGAT--ACCGACATT-----GC-----ATTTGTTC-CCGAAA-GATAACCATTTTATG-AT---A--GATA--ATA--AG--TTCGTAAGAAATCGATATCGACACGATATCGTT-AT--------GT---------TA-TT----GT-----------CGAT-ACCGT--CGAC--ATCGATCATTGTATGTGTTTTCAAAAAAACAAAC--ATCT----TATGACAGAT-A--CTGA-G-TTTGCAAGACGTCAATA-TCGACACGACATGGTCACGTTATTGTCGATATCG-----------TC-----GATATCGATGTTG-TATTTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaataatctaaattatttgataccgacattgcatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataataagttcgtaagaaatcgatatcgacacgatatcgttatgttattgtcgataccgtcgacatcgatcattgtatgtgttttcaaaaaaacaaacatcttatgacagatactgagtttgcaagacgtcaatatcgacacgacatggtcacgttattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgtatttg
gi|4 : tcttatgggtgtttgatgactatagcctgctacatgtatcgatatcgaatttttttctcgtggttgtttgacagctacaacttgctatcgataacatcgctatcgtttcgatatcgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataattagtttgccatcaaacagctataggaaaaacgatcaagattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaatatgtagccaccaaacacccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaTA--TG--TTC--AAGACAG-GATGTAGATACGATATCG---AC--------GA---------TA-TC----GTCAAACACAACACGAT-ATCGTAACGAT--ATCGA-
gi|4 : agtATATCATAG-C--CACCAGA-----AG---GTAAC-TTT-TC-GATATCGTTACGAT-AT-CGT-G--T--TGTGTTT-GACGA--TATCG--TC-------------GATATCGTAT-CTACATCaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|4 : agttatgttcaagacagGTA--GATACGAT-AT-C-----------------GACGA--TATCG--TCAAACACAACAC--GATATCGTAA-CGATATCGAA--AAG---------------TTA-C-CT-----------------T-------------CT-GG-TGG--CTAT--GATA--TTC-AAACAATGTT-AGTGACGATGTCGTGTTGACATTGAAT--CATGATCGTG--TTT-TAAATC----GC-G-TTTCTTATGAAT------GTTTGATGGC----------TAC-AACTTGCT---------GTCGA-TATCGTTTCtcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|4 : agttatgttcaagacaggatCGATATCGTAA-CGATATCGAA-----AA---GTTACCTT---CTGGTG--GCTATGAT-ATTCAA-A--CAATGT---T-AGTGA----------C-------------GATGTCGTGT-TGACATTGAATCATG--------------ATCG-T-GT-----------------TTTAAATCGCGTTTCT-TA-TGA--ATGTTTGATGGCTAC-AACT--TGC------------T---GTCGATATCGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|4 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgatatcgacgatatcgtcaaacacaacaT--TGCTTAT-GTTTGTTTGACAACTTTAAATTGCTATCGATATCGTCAATATCGTGTGTATATCGAATCATGATCGTATTTCTTACGATTGTTCGACTTCAGCTTTCTATCTATATCGT---CGATTTCtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|5 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgatatcgacgatatcgtcaaacacaacacgatatcgtaacgatatcgaaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTAT-CGATATCGAATCATG--------------ATTG-T-AT-----------------TT------------CC-TA-TGG--CTGTTTGATGACTAC-AACC--TGCT-A----C-ATGT---ATCGATATCGAATTGT--------G--TTT-C---TC----GTGG-TT----------------GTTTGAAAGC----------TAC-AACTTGTTATCGATAACATCGA-TATCAATGC-ATAAA-CGAATTATGAT
gi|5 : aacgtttgatgatggtactaattcATATGACAGATAATGGATTTGCCATCAAACACCCATAGGAAAAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataatggatttgccatcaaacacccataggaaaaac
gi|6 : aacgtttgatgatggtactaattctatcgatatcgaatcatgattgtatttcctatggctgtttgatgactacaacctgctacatgtatcgatatcgaattgtgtttctcgtggttgtttgaaagctacaacttgttatcgataacatcgatatcaatgcataaacgaattatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT-----GT-----AGTTGGAC-CTATAG-GAAAAC----TTAAC-AT---A--CATG--ATA--CC--TTTGTAAAACGACTATATGGACACGATATCGTT-AT--------GC---------CA-TTCATTGT-----------CGAT-ATCGT--CGAT--ATCGA-CGAAAGATTTGGTCCT-TAGAGACAATCTGGTGTA---TATGATAGAA-A--A--T-G-ACGGTAAAATGACGATT-TCGATACGA--------------------TATCG-----------CCATGCTGTTGTCGATATTG-
gi|7 : cacacgtaattgaaattaccttctttgttgaattaagacctttcattcctcttttatA-CAATATCGG------------------TG-TTTGGTG--GCTA---T-AT-C------T--TGC---T-GTCGA--TTTCG--AC-------------GATATCGTAT-CGATATTGAATCGTG--------------ATCGTT-TT-----------------T-------------CA-TA-TGA--GTGTTTGATGG--AA-AACT--CACT-A----T-CTGT---
gi|7 : GGTGTTTGGTGGCTATATC-TTGCTGTCGAT-TTCGACGATATCGTATCGATATTGAAT-CGTGATCGTTT--TTCATAT-GAGTGTTTGATGaaattatttgatactgacattgtatttgttccaaaaatagccatttatgacagataattagtttgcaagaagtcgatatcgacacgacatggtcaagttattttcggtatcgatgttgtaac
gi|7 : acagatagtgagttttcAAC-GATCACGATTCAAT--AT---C--GATACGATA-------TCGTC-GAAATCGA---CAGCAAGATATAGCC-ACCAAACACCGA---------TA-TT----GT-----------AAATTAT--T--TGAT--ACTGA-CATTGTATTTGTTCC---AAAAATAGCC--AT-T----TATGACAGAT-AATT--A-G-TTTGCAAGAAGTCGATA-TCGACACGA--------------------CATGGTCAAGTTATTTTC-----GGTATCGATGTTG-TAgatattgtaaattatttgatactgacattgtatttgttccaaaaatagccatttatgacagataattagtttgcaagaagtcgatatcgacacgacatggtcaagttattttcggtatcgatgttgtaac
gi|7 : acagatagtgagttttccatcaaacactcatatgaaaCGAAATCGAC----AGCAAGATATAGCCACCAAACACCGATATTGTAAATTAT-TTGAT--ACTGACATT-----GT-----ATTTGTTC-C--AAA-AATAGCCATTT-ATG-AC---A--GATA--ATT--AG--TTTGCAAGAAGTCGATATCGACACGACATGGTC-AA--------GT---------TA-TT----TT-----------CGGT-ATCGac
gi|8 : acagatagtgagttttccatcaaacactcatatgaaaaacgatcacgattcaatatcgatacgatatcgtACGAT-GT-AGATA--CG-TAT---C-GACGAATTATCG--TCAAACACAAACACGGATATCGTAAACGATATCGAAAAGTG--------------ACC-----T-----------------T-------------CT-GG-TGG--CTA---GATATC-A--AACA--TGTT-AGTGACGATGTCGTGTTGATATCGAAT--CATGATCGTG--TTT-T---TTAAATGT-G-TTTTCTCTTACTGGAAATGTTTGATGGC----------TACAAACTTGCTGCCGATAatgttgtaac
gi|8 : gagtatgtccaagacGATATCGTAAACGATATCGAA-----AA---GTGACCTT---CTGGTG--GCTA-GAT-AT-CAA-A--CA-TGT---T-AGTGA----------C-------------GATGTCGTGT-TGATATCGAATCATG--------------ATCG-T-GTTTTTTAAATGTGTTTTCT-------------CT-TACTGGAAATGTTTGATGGCTACAAACT--TGC------------T---GCCGATATCGtcgtt
gi|9 : gagtatgtccaagacacgatgtagatacgtatcgacgaattatcgtcaaacacaaacacgTCGATAT-GAATCAAGATCGT-TTTCTCGTTATATGGGTGTTTAATGGCTATATC-T-GC-GTTGAT-T-CGACGATA-CGTGTCGATATCG-A--CATGATCGTTTTCTGTTTCT-TATTGTTTAATGGCtt
gi|9 : tACGATCTTGATTCATATCGATATGC-----CCAAACACC-ATATTCTAAATTATATTGATGAAC--GTATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAA-GATAACCATTTTATG-AT---A--GATA--ATACCCG--CTCGtatgcccaaacaccatattctaaattatattgatgaacgtattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacccgctcgacaag
blockSeqs : T GT T T ATA AA TT T TTT TC A T AAT A TC C TT T AAA AG T TTTTA T ATC C A T ATGTTGTGTT T ATT AA AAACACAAACACG A ATCGTGTTTTTTAAATGTGTTTTCT C C AAA G A AA AGTGACGATGTCGT CATGATCGTGTTTTTTAAATGTGTTTTCTCTTACTGGAAAT AA TACAAAAATG A A G CGATAT AT TA T NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN TCAT C A A A TTGGCGT A TT C AT T TAAA CG CGAC A T TGCTATTAAAAA T GTCAAACACAACA T CG AA GA T G TCAA T TGG G TGTA TAATAC C T T T CATGGTCACGTTATTGTCGA TCAAGTTATTTTC T
blockSeqs : . T T G AC GG TT T TT C A T AT G . . GG T AA AA A CTT T ATC T A . GTGTTGTGTT . T . AAACACAACAC . ATAGTGTTTTTTAAATCGTGTTT . . A G . . AGTGACGATGTCGT CATGATCGTGTTTTAAATCGCGTTTCTTATGAAT CA . . A . CATAAA CA CA A . C . G C GT . TG . TT . ATT . CCCG T . CCAAACACCGA . CATTGT T CG . . . G CCG C G T A TACTGA . C A . . CCATGCT .
blockSeqs : AA T . . . G . A A . . TT AA AG T TTT T G C . . ATGTTCTGT . T . . . ATCGTGTTTTAAATCGCGTTT . . A A . . GCATAT TGTGTTTCTCGTGGTT TG . . A . GATAC TA C . C . G C GC . CG . TT . A . AC T . CCCA . CT . CG . . . T CTT A A C . TAATTA . T C . . TT .
blockSeqs : . . AG AG AA A TTT T A T . . AAACAATGT . T . . . ATTGTATTT . . A A . . ACATGT GTTTTTCCCGTGGTT AA . . G . . G . . T GT . CG . TT . A . CG T . TGC . GT . CG . . . T C T A G . CATA . G T . . TC .
blockSeqs : . . AT AA AG A CTT T A C . . GATACGTAT . T . . . ATCGTTTTT . . C A . . ACATGT TTTTTTCTCGTGGTT TG . . . . . . . . GT . CG . CA . A . AG G . CCC . CT . CG . . . G . C A . . AAAT . T A . . TC
blockSeqs : . . C . AA T CTT T G C . . AAACATGT . T . . . ATCGTGTT . . G G . . ATCTGT GT . TA . TT . C . TG A . TGC . GT . CG . . . T
blockSeqs : . AA G CT . G C . . TTGC . T . . . ATTGTATT . . C A . . A G . CG . T . A . CC T . TGT . GT . G . . .
blockSeqs : . . TG . G T . . AA . T . . . TTACCTT . . A G . . T . . . . . A . AG T . CGA . GT . C . . .
blockSeqs : . C . . . . . . . . ACCTT . . C T . . T . . . . . . . . TGC . TT . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . CTT . . G G . . . . AGT . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . C . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons : AA* AG******** CTT** AGTTATGT******* ACATGT********* GT********** TAATNA****
originalCons : GTCGATATCGAATCAAGATCGT-TTTCTCNTTAC-TGGGTGTTTAATGGCTATATC-TTGCTGTCGAT-T-CGACGATATCGTATCGATATCG-AT-CATGATCGTTT--TGCTTAT-GNTTGTTTGACGACTTTAAATTGCTATCGATATCGTCAATATCGTGTGTATATCGAATCATGATCGTATTTCTTACGATTGTTCGACTTCAGCTTTCTATCGATATCGTAA-CGATATCGGA-----AG---GTNACCTTT-TCTGGTG--GCTACGAT-AT-CAA-A--C--TGT---T-GACGA--TATCG--TC-------------GATATCGTGT-CGATATCGAATCATG--------------ATCG-T-NT-----------------T-------------CT-TA-TGG--NTGTTTGATGGCTAC-AACC--TGCT-A----C-ATGT---GTCGATATCGAAT--C--------G--TTT-C---TC----GT-G-TT----------------GTTTGANAGC----------TAC-AACTTGCTATCGATAACATCGA-TATCGTTTCGAT-AT-CGAATCATGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGACGGATAATGAGTTTGCCATCAAACACCCATAGGAAAAACGATCANGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACGATATCGAT----AGCAATATGTAGCCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGACATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAA-GATAACCATTTTATG-AT---A--GATA--ATA--CG--TTCGTAAGAAATCGATATCGACACGATATCGTC-AC--------GC---------TA-TT----GT-----------CGAT-ATCGT--CGAT--ATCGA-CGTTGTATTTGTTCCC--AAAGACAANC--GTNT----TATGACAGAT-A--T--A-G-TTCGCAAGACGTCGATA-TCGACACGA--------------------TATCG-----------TC-----GATATCGATGTTG-TATTTG
finalCons : GTCGATATCGAATCAAGATCGT-TTTCTCNTTAC-TGGGTGTTTAATGGCTATATC-TTGCTGTCGAT-T-CGACGATATCGTATCGATATCG-AT-CATGATCGTTT--TGCTTAT-GNTTGTTTGACGACTTTAAATTGCTATCGATATCGTCAATATCGTGTGTATATCGAATCATGATCGTATTTCTTACGATTGTTCGACTTCAGCTTTCTATCGATATCGTAA-CGATATCGGAAG--------GTNACCTT--TCTGGTG--GCTACGAT-AT-CAGTTATGT-------T-GACGA--TATCG--TC-------------GATATCGTGT-CGATATCGAATCATG--------------ATCG-T-NT-----------------T-------------CT-TA-TGG--NTGTTTGATGGCTAC-AACC--TGCTACATGT---------GTCGATATCGAAT--C--------G--TTT-C---TC----GT-G-TT----------------GTTTGANAGC----------TAC-AACTTGCTATCGATAACATCGA-TATCGTTTCGAT-AT-CGAATCATGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGACGGATAATGAGTTTGCCATCAAACACCCATAGGAAAAACGATCANGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACGATATCGAT----AGCAATATGTAGCCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGACATTGT----------ATTTGTTC-CCGAAA-GATAACCATTTTATG-AT---A--GATA--ATA--CG--TTCGTAAGAAATCGATATCGACACGATATCGTC-AC--------GC---------TA-TT----GT-----------CGAT-ATCGT--CGAT--ATCGA-CGTTGTATTTGTTCCC--AAAGACAANC--GTNT----TATGACAGATAATNA----G-TTCGCAAGACGTCGATA-TCGACACGA--------------------TATCG-----------TC-----GATATCGATGTTG-TATTTG
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 111 222 222 1111 111 1111111 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 333333333333333333333333333333333333333333333333333333 44444444444444 000000000000000000000000000000000000000000000000000 2222222222 11111111 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111 111111111111 111111 22222222222222222222 11111111111111111 333333 111 55555555555555555555 333333333333333333
lowQualScore : 2 666 1 444 11 3 3 333 99 1 3 0 4444 77 0 5 55 7 3 666 3 0 99999 2 7777 1 99999 0000000 66 6 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 33 2 2 777777777777777777777777777777777777777777777777777777 3 3 555 555 5 444 3 11111111111111 888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 5555555555 5 0 0 1 1 6 99999999 0 2 33 1 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 4444 2 6 9 5 999999999999 0 4 11 4 55 4 888888 55 666666 0 0 1 3 44444444444444444444 3 99999999999999999 7 11 55 55 4 0 1 111111 1 999 7 6 6 111 3 2 6 6 6 44444444444444444444 444444444444444444 8
lowQualScore : . ... . ... .. . . ... .. . . . .... .. . . .. . . ... . . ..... . .... . ..... ....... .. . .......................................................... .. . . ...................................................... . . ... ... . ... . .............. ................................................... . .......... . . . . . . ........ . . .. . ......................................................................................................... .... . . . . ............ . . .. . .. . ...... .. ...... . . . . .................... . ................. . .. .. .. . . . ...... . ... . . . ... . . . . . .................... .................. .
lowQualScore : 0 333 0 333 55 2 2 222 55 2 2 2 2222 99 7 7 99 3 0 777 5 4 11111 3 7777 8 77777 0000000 99 2 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 99 7 7 999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 1 222 777 7 444 3 88888888888888 333333333333333333333333333333333333333333333333333 0 0000000000 7 1 7 4 0 7 00000000 2 0 55 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2222 5 7 3 2 000000000000 9 4 00 0 77 0 333333 55 555555 5 8 0 6 44444444444444444444 6 55555555555555555 3 99 55 55 0 7 3 444444 0 888 5 7 7 777 3 5 7 3 7 22222222222222222222 555555555555555555 0
consensus : GTCGATATCGAATCAAGATCGT-TTTCTCNTTAC-TGGGTGTTTAATGGCTATATCTTGCTGTCGA-T-TCGACGATATCGTATCGATATCG-AT-CATGATCGTTT--TGCTTAT-GNTTGTTTGACGACTTTAAATTGCTATCGATATCGTCAATATCGTGTGTATATCGAATCATGATCGTATTTCTTACGATTGTTCGACTTCAGCTTNCTATCGATATCGTAA-CGATATCGGA-----AGGTNA----CCTTTC--TGGTG--GC---TACGAT-ATC--A-G---TTNTG-T--T---GAC--GA--TA--TC----G--TC-------------GATATC--G-TGT-CGATATCGAATCATG--------------ATCG-T-NT-----------------T-------------CT-TA-TGG--NTGTTTGATG--GCTAC-AACC--TGCT-A----C-ATGT---GTCGATATCGAAT--CATGAT-GTG--TTT-C---TC----GTGG-TT----------------GTTTGACGGC----------TAC-AACTTGCTATCGATAACATCGA-TATCGTTTCGAT-AT-CGAATCATGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGACGGATAATGAGTTTGCCATCAAACACCCATAGGAAAAACGATCANGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACGATATCGAT----AGCAATATGTAGCCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGACATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAA-GATAACCATTTTATG-AT---A--GATA--ATA--CG--TTCGTAAGAAATCGATATCGACACGATATCGTC-AC--------GC---------TA-TT----GT-----------CGAT-ATCGT--CGAT--ATCGA-CGTTGTATTTGTTCC-CG-AAAGACAANC--GTNT-TATGACA-GATA---ATGAGTTC-GCAAGACGTCGATA-TCGACACGA--------------------TATCG-----------TC-----GATATCGATGTTG-TATTTG
Reference ( family-1193 ) : GTCGATATCGAATCAAGATCGT-TTTCTCNTTAC-TGGGTGTTTAATGGCTATATCTTGCTGTCGA-T-TCGACGATATCGTATCGATATCG-AT-CATGATCGTTT--TGCTTAT-GNTTGTTTGACGACTTTAAATTGCTATCGATATCGTCAATATCGTGTGTATATCGAATCATGATCGTATTTCTTACGATTGTTCGACTTCAGCTTTCTATCGATATCGTAA-CGATATCGGA-----AGGTNA----CCTTTC--TGGTG--GC---TACGAT-ATC--A-G---TTATG-T--T---GAC--GA--TA--TC----G--TC-------------GATATC--G-TGT-CGATATCGAATCATG--------------ATCG-T-NT-----------------T-------------CT-TA-TGG--NTGTTTGATG--GCTAC-AACC--TGCT-A----C-ATGT---GTCGATATCGAAT--C--------G--TTT-C---TC----GT-G-TT----------------GTTTGANAGC----------TAC-AACTTGCTATCGATAACATCGA-TATCGTTTCGAT-AT-CGAATCATGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGACGGATAATGAGTTTGCCATCAAACACCCATAGGAAAAACGATCANGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACGATATCGAT----AGCAATATGTAGCCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGACATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAA-GATAACCATTTTATG-AT---A--GATA--ATA--CG--TTCGTAAGAAATCGATATCGACACGATATCGTC-AC--------GC---------TA-TT----GT-----------CGAT-ATCGT--CGAT--ATCGA-CGTTGTATTTGTTCC-C--AAAGACAANC--GTNT-TATGACA-GATA---ATNAGTTC-GCAAGACGTCGATA-TCGACACGA--------------------TATCG-----------TC-----GATATCGATGTTG-TATTTG
gi|1 : GTTAATATCGAATCAAGACCATGTTTCTTATT-----GGTGCCTCCTGACTACAACTTGCTGTCGA-TATCGACGATATTGTTTCGATATCG-ATTCATAATAGCTT--TGCTTAT-GGTTGTTTGACGACTTTAAATTGCTATCGATATCGTCAATATCGTGTGGATATCGAATCATAATCGTGTTTC-TACGGTTGTTTTACTTCAACTTGCTATCGATATCGT---CGATATCCGAATCATAGATCGTGTTTTTTTA--TGGTA--GT---T-TGAC-TTC--A-A---ACTTG-C--T---ATC--GA--TA--TT----G--TC-------------GATATC--A-TGT-CGATATCGAATCATG--------------AT-G-T-AT-----------------T-------------CC-TA-TGG--CTCTTTGATG--ACTAC-AACC--TGCTAA----C-ATGTA--ATCGATATCGAAT--T--------G--TTT-C---TC----GT-G-TT----------------GTTTGAAAGC----------TAC-AACTTGCTATCGATAACATCGA-TATCGTTT---T-ATCCGAATCATGAT
gi|1 : ATATGACAGATTATGAGTTTGCCATCAAATACTAATAGGAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACGATATCGAT----AGCAATATGTAGTCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGATATTT----GTTCTTTACTTGTTC-CCTAAA-GATAACCATTTTATG-GT---A--GATA--ATA--CG--TTCGCAAGAAATCGATATCGACACGATATCGTC-AT--------GC---------TA-TT----GT-----------CGAT-ATCAT--CAAC--AGGGA-CATTGAATTTGTTTT-CA-AAAGACAAAC--ATCT-TATGAC------------AGTTC-GCAAATTGTCGATA-TCGACACGA--------------------TATCG-----------TC-----GATATTGATGTTG-TATTTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagattatgagtttgccatcaaatactaataggaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacgatatcgatagcaatatgtagtcaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatatttgttctttacttgttccctaaagataaccattttatggtagataatacgttcgcaagaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattgtcgatatcatcaacagggacattgaatttgttttcaaaagacaaacatcttatgacagttcgcaaattgtcgatatcgacacgatatcgtcgatattgatgttgtatttg
gi|10 : gttaatatcgaatcaagaccatgtttcttattggtgcctcctgactacaacttgctgtcgatatcgacgatattgtttcgatatcgattcataatagctttgcttatggttgtttgacgactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtggatatcgaatcataatcgtgtttctacggttgttttacttcaacttgctatcgatatcgtcgatatccgaatcatagatcgtgtttttttatggtagtttgacttcaaacttgctatcgatattgtcgatatcatgtcgatatcgaatcatgatgtattcctatggctctttgatgactacaacctgctaacatgtaatcgatatcgaattgtttctcgtgttgtttgaaagctacaacttgctatcgataacatcgatatcgttttatccgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTGGTC-CTTGAA-AACAATCAT---ATG----------------TA--CGACTTCGTAAGATGACAATATCTACACAATACCCTC-AT--------GC---------TA-CT-------------------------GT--CAAT--ATTGA-CATCATACTTGGT---C--AATGAAAATC--GTGT-TGT-ATATGGTAACCATAACTTT-GTTAGATGAGGATATTTGTCAAGC--------------------TATTG-----------TT-----GATATTGACATTGTTATTTG
gi|11 : TCGTTT--TGCTTATCGC--GTTTGACGACTTCAAATTGCTAgtctt
gi|12 : cannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttGACATTTTGGCGT-----ATTTGCTCATTGAA-----AACTGTTATGTGTATTAAA--GGTT--ACA--AC--TTTGTAA------GATGTCGAGATGATGTCTTT-AC--------CC---------TG-TT----CT-----------CAAT-ATCGG--TGAT--ATTGA-CATAACATTTGGTC
gi|13 : tattACCAGA-----AGGTTA----CTTTTA--TTTTG--TT---T-CGAT-ATC--ATG---TTCTG-T--TT--GAC--GA--TA--TT----G--TC-------------GATACC--G-TAT-CTACATTGtt
gi|13 : cagttatgtcgaagacaGATATCGAAA-CAAAAT--AA-----AAGTAA----CCTT-C--TGGTG--GC---TTTGATAATC--A-ggctttgataatcaaataat
gi|14 : cagttatgtcgaagacacaatgtagatacggtatcgacaatatcgtcaaacagaacatCAGA-----AGGTTA----CTTTTC---GATATCGT---TACGAT-ATC--ATG---TTGTG-T--TT--GAC--GA--TA--TC----G--TC-------------GATATC--T-TAT-CTACATCGAGTCTTG--------------aataat
gi|14 : agttatgccGATATCGTAA-CGATATCGAA-----AAGTAA----CC-TTC--TGGAA--GC---CATGATAATC--A-gaagccatgataatcaaaca
gi|15 : agttatgcccaagactcgatgtagataagatatcgacgatatcgtcaaacacaacat--T---GAC----------------------------------GATATC--G-TGT-TGATATCGAATCATGATAGTGTTTTTTAAATCG-TGTT-----------------T-------------CT-TA-TGG--ATGTTCCATG--GCTAC-AACT--TACaaca
gi|16 : gttagATG-T--TAATGAC--GA--TA--TC----GAATT-------------GTGATC--A-TGT-TT-TATTAAATCATG---------------------CT-----------------T-------------CA-TA-TGG--ATGTTTGATG--GCTAC-AACT--TG
gi|17 : aca--GA--TA--TC----G--TC-------------GATATC--G-TGT-CGATATCGAATCCTT--------------ATCG-T-GT-----------------T-------------TT-TA-TGG--AGGTTTGA-----CTTC-AACT--TGCT-A----
gi|18 : ATATCGACACGATATCGTCTAT--------GC---------TATTT----GT-----------CGTT-ATC------------CGA-TGTTGTATTTG
gi|19 : TGTCTGATG--ACTAC-AACC--TGCT-A--------------TCGATATCGAA
gi|2 : --TGCTTAT-GTTTGTTTGACAACTTTAAATTGCTATCGATATCGTCAATATCGTGTGTATATCGAATCATGATCGTATTTCTTACGATTGTTCGACTTCAGCTTTCTATCTATATCGT---CGATTTCG
gi|2 : AATCATG--------------ATTG-T-AT-----------------T-------------TTCTA-TGG--CTGTTTAATG--ACTAC-AACC--TGCT-G----C-ATAT---ATCGATATCGAAT-----------GTTTTT-C---CC----GTGG-TT----------------GTTTGAAAGCTACAAAAATGTAC-AACTTGCTATCGATAAGATCGAGTATCGTTT-GAT-AC-CGAATATTGATacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|2 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTATGATGGATAATGAGTTTGCCATTAAACACCC-----AAAAACGATCATGATTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|2 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngGTCGATATTGAATCAATATC-T-TTTTTCTTTAC-TGGGTGTTTAATGGCTATATCTTGCTGTCGA---------------TATCGA------AT-CATGATCGTTT--T-----T-GGGTGTTTAATGGCcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|2 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttTTGCTATCGATATCGT---CAATATCG-A-----CGATAT----CGTGTCGATATTG--AA---T-CAAT-ATC--T-T---TTTTC-T--T---TACTGGG--TG--TTTAATG--GC-------------TATATCTTGCTGT-CGATATCGAATCATG--------------ATCG-T-TT-----------------T-------------------TGG--GTGTTTAATG--GCacgatatcgtcgatattgacgatatcgatagcaataggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|2 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttCGATATCGAC----AGCAAGATATAGCCATTAAACACCCAG----TAAA-------GA-AAAAAGATATT-----G------ATTCAATA-TCGACACGATA-TCGTC----G-AT---ATTGACG--ATA-------TCGATAGCAATAGGTAGC--CACCAAA----C-AC--------CCA--------TA-TT----CT-----------AAATTAT--T--TGATGAACCGA-TATTGTATTTGTTCC-CG-AAAGATAACC--ATTT-TATGATA-GATA---ATACGTTC-GCAACAAATCGATA-TCGACACGA--------------------TATCG-----------TC-----taggtagccaccaaacacccatattctaaattatttgatgaaccgatattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacgttcgcaacaaatcgatatcgacacgatatcgtcatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|2 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattGACGATATCGAT----AGCAATAGGTAGCCACCAAACACCCATATTCTAAATTAT-TTGATGAACCGATATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAA-GATAACCATTTTATG-AT---A--GATA--ATA--CG--TTCGCAACAAATCGATATCGACACGATATCGTC-AT--------GCTATTAAAAATA-TT----GT-----------CGAT-ATCGT--CGAT--ATCGA-TGTTGCATTTatgctattaaaaatattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgcattt
gi|3 : tgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcatgattgtattttctatggctgtttaatgactacaacctgctgcatatatcgatatcgaatgtttttcccgtggttgtttgaaagctacaaaaatgtacaacttgctatcgataagatcgagtatcgtttgataccgaatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatgatggataatgagtttgccattaaacacccaaaaacgatcatgattcgatatcgacagcaagatatagccattaaacacccagtaaagaaaaaagatattgattcaatatcgacacgatatcgtcgatatt-----------------T-------------CT-TA-TGG--GTGTTTGATG--ACTAT-AGCC--TGCT-A----C-ATGT---ATCGATATCGAAT--T--------T--TTTTC---TC----GT-GGTT----------------GTTTGACAGC----------TAC-AACTTGCTATCGATAACATCGC-TATCGTTTCGAT-AT-CGAATCATGAT
gi|3 : ATATGACAGATAATTAGTTTGCCATCAAACAGCTATAGGAAAAACGATCAAGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----AGCAATATGTAGCCACCAAACACCCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataattagtttgccatcaaacagctataggaaaaacgatcaagattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaatatgtagccaccaaacacccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaataatctaaattatttgataccgacattgcatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataataagttcgtaagaaatcgatatcgacacgatatcgttatgttattgtcgataccgtcgacatcgatcattgtatgtgttttcaaaaaaacaaacatcttatgacagatactgagtttgcaagacgtcaatatcgacacgacatggtcacgttattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgtatttg
gi|3 : tcttatgggtgtttgatgactatagcctgctacatgtatcgatatcgaatttttttctcgtggttgtttgacagctacaacttgctatcgataacatcgctatcgtttcgatatcgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAATCTAAATTAT-TTGAT--ACCGACATT-----GC-----ATTTGTTC-CCGAAA-GATAACCATTTTATG-AT---A--GATA--ATA--AG--TTCGTAAGAAATCGATATCGACACGATATCGTT-AT--------GT---------TA-TT----GT-----------CGAT-ACCGT--CGAC--ATCGATCATTGTATGTGTTTT-CAAAAAAACAAAC--ATCT-TATGACA-GATA---CTGAGTTT-GCAAGACGTCAATA-TCGACACGACATGGTCACGTTATTGTCGATATCG-----------TC-----GATATCGATGTTG-TATTTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaataatctaaattatttgataccgacattgcatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataataagttcgtaagaaatcgatatcgacacgatatcgttatgttattgtcgataccgtcgacatcgatcattgtatgtgttttcaaaaaaacaaacatcttatgacagatactgagtttgcaagacgtcaatatcgacacgacatggtcacgttattgtcgatatcgtcgatatcgatgttgtatttg
gi|4 : tcttatgggtgtttgatgactatagcctgctacatgtatcgatatcgaatttttttctcgtggttgtttgacagctacaacttgctatcgataacatcgctatcgtttcgatatcgaatcatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataattagtttgccatcaaacagctataggaaaaacgatcaagattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcaatatgtagccaccaaacacccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatattggaagtatttaTA--TG--TTC--AAGACAG-GATGTAGATACGATATCG---AC--------GA---------TA-TC----GTCAAACACAACACGAT-ATCGTAACGAT--ATCGA-
gi|4 : agtATATCATAG-C--CACCAGA-----AGGTAA----CTTTTC---GATATCGT---TACGAT-ATC--GTG---TTGTG-T--TT--GAC--GA--TA--TC----G--TC-------------GATATC--G-TAT-CTACATCaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|4 : agttatgttcaagacagGTA--GA---TACGAT-ATC---------------------GAC--GA--TA--TC----G--TCAAACACAACAC--GATATC--G-TAA-CGATATCGAA--AAG---------------TTA-C-CT-----------------T-------------CT-GG-TGG--CTAT--GATA----TTC-AAACAATGTT-AGTGACGATGTCGTGTTGACATTGAAT--CATGATCGTG--TTT-TAAATC----GC-G-TTTCTTATGAAT------GTTTGATGGC----------TAC-AACTTGCT---------GTCGA-TATCGTTTCtcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|4 : agttatgttcaagacaggatCGATATCGTAA-CGATATCGAA-----AAGTTA----CCTT-C--TGGTG--GC---TATGAT-ATTCAA-A---CAATG-T--T---AGT--GA----------------C-------------GATGTC--G-TGT-TGACATTGAATCATG--------------ATCG-T-GT-----------------TTTAAATCGCGTTTCT-TA-TGA--ATGTTTGATG--GCTAC-AACT--TGC------------T---GTCGATATCGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|4 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgatatcgacgatatcgtcaaacacaacaT--TGCTTAT-GTTTGTTTGACAACTTTAAATTGCTATCGATATCGTCAATATCGTGTGTATATCGAATCATGATCGTATTTCTTACGATTGTTCGACTTCAGCTTTCTATCTATATCGT---CGATTTCtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgcttatgtttgtttgacaactttaaattgctatcgatatcgtcaatatcgtgtgtatatcgaatcatgatcgtatttcttacgattgttcgacttcagctttctatctatatcgtcgatttc
gi|5 : agttatgttcaagacaggatgtagatacgatatcgacgatatcgtcaaacacaacacgatatcgtaacgatatcgaaaagttaccttctggtggctatgatattcaaacaatgttagtgacgatgtcgtgttgacattgaatcatgatcgtgttttaaatcgcgtttcttatgaatgtttgatggctacaacttgctgtcgatatcgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTTTGATGATGGTACTAA----TTCT-A--------------TCGATATCGAAT--CATGATTGTA--TTT-C---CT----ATGG-CT----------------GTTTGATGAC----------TAC-AACCTGCTAC--AT-GTATCGA-TATCG
gi|5 : aac-TAT-CGATATCGAATCATG--------------ATTG-T-AT-----------------TT------------CC-TA-TGG--CTGTTTGATG--ACTAC-AACC--TGCT-A----C-ATGT---ATCGATATCGAATTGT--------G--TTT-C---TC----GTGG-TT----------------GTTTGAAAGC----------TAC-AACTTGTTATCGATAACATCGA-TATCAATGC-ATAAA-CGAATTATGATaattgtgtttctcgtggttgtttgaaagctacaacttgttatcgataacatcgatatcaatgcataaacgaattatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataatggatttgccatcaaacacccataggaaaaac
gi|5 : aacgtttgatgatggtactaattcATATGACAGATAATGGATTTGCCATCAAACACCCATAGGAAAAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgacagataatggatttgccatcaaacacccataggaaaaac
gi|6 : aacgtttgatgatggtactaattctatcgatatcgaatcatgattgtatttcctatggctgtttgatgactacaacctgctacatgtatcgatatcgaattgtgtttctcgtggttgtttgaaagctacaacttgttatcgataacatcgatatcaatgcataaacgaattatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT-----GT-----AGTTGGAC-CTATAG-GAAAAC----TTAAC-AT---A--CATG--ATA--CC--TTTGTAAAACGACTATATGGACACGATATCGTT-AT--------GC---------CA-TTCATTGT-----------CGAT-ATCGT--CGAT--ATCGA-CGAAAGATTTGGTCCTT--AGAGACAATCTGGTGTATATGATA-GAAA---ATGA---CGGTAAAATGACGATT-TCGATACGA--------------------TATCG-----------CCATGCTGTTGTCGATATTG-
gi|7 : cacacgtaattgaaattaccttctttgttgaattaagacctttcattcctcttttatA-CAATATCGG------------------TGTT--TGGTG--GC---TA---T-ATC---------T-TG-C--T---GTC--GA--TT--TC----G--AC-------------GATATC--G-TAT-CGATATTGAATCGTG--------------ATCGTT-TT-----------------T-------------CA-TA-TGA--GTGTTTGATG--G--AA-AACT--CACT-A----T-CTGT---
gi|7 : GGTGTTTGGTGGCTATATCTTGCTGTCGATT-TCGACGATATCGTATCGATATTGAAT-CGTGATCGTTT--TTCATAT-GAGTGTTTGATGaaattatttgatactgacattgtatttgttccaaaaatagccatttatgacagataattagtttgcaagaagtcgatatcgacacgacatggtcaagttattttcggtatcgatgttgtaac
gi|7 : acagatagtgagttttcAAC-GATCACGATTCAAT--AT---C--GATACGATA-------TCGTC-GAAATCGA---CAGCAAGATATAGCC-ACCAAACACCGA---------TA-TT----GT-----------AAATTAT--T--TGAT--ACTGA-CATTGTATTTGTTCC----AAAAATAGCC--AT-T-TATGACA-GATA---ATTAGTTT-GCAAGAAGTCGATA-TCGACACGA--------------------CATGGTCAAGTTATTTTC-----GGTATCGATGTTG-TAgatattgtaaattatttgatactgacattgtatttgttccaaaaatagccatttatgacagataattagtttgcaagaagtcgatatcgacacgacatggtcaagttattttcggtatcgatgttgtaac
gi|7 : acagatagtgagttttccatcaaacactcatatgaaaCGAAATCGAC----AGCAAGATATAGCCACCAAACACCGATATTGTAAATTAT-TTGAT--ACTGACATT-----GT-----ATTTGTTC-C--AAA-AATAGCCATTT-ATG-AC---A--GATA--ATT--AG--TTTGCAAGAAGTCGATATCGACACGACATGGTC-AA--------GT---------TA-TT----TT-----------CGGT-ATCGac
gi|8 : acagatagtgagttttccatcaaacactcatatgaaaaacgatcacgattcaatatcgatacgatatcgtACGAT-GT---A-G---ATACG-TATC---GAC--GAATTA--TC----G--TCAAACACAAACACGGATATC--G-TAAACGATATCGAAAAGTG--------------ACC-----T-----------------T-------------CT-GG-TGG--CTA---GATA--TC-A--AACA--TGTT-AGTGACGATGTCGTGTTGATATCGAAT--CATGATCGTG--TTT-T---TTAAATGT-G-TTTTCTCTTACTGGAAATGTTTGATGGC----------TACAAACTTGCTGCCGATAatgttgtaac
gi|8 : gagtatgtccaagacTTGATATC-TAG-C--CACCAGA-----AGGTCA----CTTTTC---GATA--TCGTTTACGAT-ATC--C-GTGTTTGTGTT--T---GAC--GA--TAATTC----G--TC-------------GATA-C--G-TAT-CTACATCGtcgtt
gi|8 : gagtatgtccaagacaGATATCGTAAACGATATCGAA-----AAGTGA----CCTT-C--TGGTG--GC---TA-GAT-ATC--A-A---ACATG-T--T---AGT--GA----------------C-------------GATGTC--G-TGT-TGATATCGAATCATG--------------ATCG-T-GTTTTTTAAATGTGTTTTCT-------------CT-TACTGGAAATGTTTGATG--GCTACAAACT--TGC------------T---GCCGATATCGacatgttagtgacgatgtcgtgttgatatcgaatcatgatcgtgttttttaaatgtgttttctcttactggaaatgtttgatggctacaaacttgctgccgatatcgtt
gi|9 : gagtatgtccaagacacgatgtagatacgtatcgacgaattatcgtcaaacacaaacacgTCGATAT-GAATCAAGATCGT-TTTCTCGTTATATGGGTGTTTAATGGCTATATC-TGC-GTTGA-T-TCGACGATA-CGTGTCGATATCG-A--CATGATCGTTTTCTGTTTCT-TATTGTTTAATGGCtt
gi|9 : tACGATCTTGATTCATATCGATATGC-----CCAAACACC-ATATTCTAAATTATATTGATGAAC--GTATT-----GT-----ATTTGTTC-CCGAAA-GATAACCATTTTATG-AT---A--GATA--ATACCCG--CTCGtatgcccaaacaccatattctaaattatattgatgaacgtattgtatttgttcccgaaagataaccattttatgatagataatacccgctcgacaag