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1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Alignments
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Reference ( family-405 ) : GGTGGC-TCAGTGG----TAGAGCTCT-CGCC-TC-GT-GATCGG-GAGGTCGTGAGT-T-CGAGCCCCG-C-GCTCGG-ACC-------CG-GCCG------CGT-CAAACCTAAGA-C--CG--AA------------A-ATA-G--GTA-GT-GATTGCTCCT-TCGCC-AA--GAG----CTCGGC-ATTTAGAAGTG-AGAATCACGGGTCTTTCGGATA-TGACCTTAAAAAC-G---GAGGTCCC-----GTGTC-GC-AGC--A--NG--T-TGGC-ACGT----NAAAGAA---CCCTCGC-TGCT--AAAAGCCAT-GAGC-GCTAAGC--ATAGGTCTAAA-TTTG-CGGCCC---TT---CACCGGCAA--T-GG----CGA--CGTCTC-AATATGAGTGAAANATTCTCGACGG-GACGNAA--AACAAACAAT
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blockSeqs : . . AA T T T . G TA G A . . GCTG G ATGA . . T CGTTAAAA . . . . CC . . GAG A T . T AT . . C GC ATAT . GTGGCACGCT . A . AAA . . . . . TA . . ATAATT C . G G A . T . T
blockSeqs : . . AG C . C . G AA G A . . CGTG T ACAA . . C GGTAAAC . . . . CT . . GAG T T . T AT . . C GT AG . GGGCACGTT . G . AAA . . . . . CC . . GCAAT T . G A T . A . A
blockSeqs : . . GG C . T . A GT G C . . CGCG G TGA . . C CTCGAAA . . . . CC . . ACG A T . T AT . . A CC AG . TGGCACGTT . A . AAA . . . . . CC . . ACAAT T . A A T . A . T
blockSeqs : . . A T . C . G GA G C . . CGC A CGG . . C CGTGAAA . . . . TC . . GAG G T . T AT . . C GC AG . TGGCAAGTA . A . ACA . . . . . TA . . GAAAT T . G A C . T .
blockSeqs : . . . C . T . G TA G A . . TGC G AGG . . C CGTTAAA . . . . CC . . GAG C T . T T . . T AC AT . GCCGTTAG . G . AAC . . . . . TT . . T C . G A C .
blockSeqs : T . C . . G . A . . CG A CG . . C CGTAAA . . . . TT . . ACT A T . . . . . C AC GT . TGCACGC . C . TC . . . . . CC . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . TG . . . . T . . . . . . . . ACG A G . . . . . C GC AG . ATGACAG . A . AC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . G A AT . TG . A . GC . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G GC . GG . G . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqCons : AG CGCG** CGA******** ****** CGTAAA****************** ** GAG****** A* AT* *** C***** GC** AN**** TGGCACGT******* AAN** ** A*
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Reference ( family-405 ) : GGTGGC-TCAGTGG----TAGAGCTCT-CGCC-TC-GT-GATCGG-GAGGTCGTGAGT-T-CGAGCCCCG---C-GCTCGG-ACC-------CGACCG------CGT-CAAAC-----------CTAAGA--C--G-T--A-AA-AT-AG--GT-AGT-GATTGCTCCT-TCGCC-AA--GAG----CTCGGC-ATTTAGAAGTG-AGAATCACGGGTCTTTCGGATA-TGACCTTAAAAAC-G---GAGGTCCC-----GTGTC-GC-AGC--A--NG--T-TGGC-AC-----G--T---AAAGAACCCTCGC-TGCT--AANAGCCAT-GAGC-GCTAAGC--ATAGGTCTAAA-TTTG-CGGCCC---TT---CACCGGCAA--T-GG----CGA--CGTCTC-AATATGAGTGAAANATTCTCGACGG-GACGNAA--AACAAACAAT
gi|1 : GTGGC-TCAGTTG----TAT-GCT-T-CACC-TCCGT-GATTCG-GAG-TCGTGCGT-TGCGAGCCCCGGTGC-CCTCAC-ACG-------CG-CCGTGCGTTCGT-CAAAC-----------TTAAGATCC--G-T--G-AG-AT-GACTGT-AGTTGATTGCTCGTCTCGCCCAA--GAGAGAACTCGGCCACTGAGAAGGG-AGAATCAC-GGTC-TTCGGAGA--GGCCTTAAAAAC-GCCCGATGGCCCAGGATGTGTCTACTAGC--A---G--T-TGGCTACCCCTAA--C---AAAGAAACC-CGCATGCTAAAAAAACCAG-GAG--GCTAAGCA-ATACGTCTAA---TTGATAGCCC---TT---CAGCACCCA--A-GG----GGA--C-TCCCAAATATGA-TG-AATA-TCTC-AC-G-TACGCAA--AA
gi|10 : accggatcgcGGTGGC-TCAGTGG----TAGAGCTCT-CGCT-TC-GT-GATTGG-TAGGTCTTGAGT-T-CGAACCCCG---C---------------------TCG------CGT-CA---------------------------------------G--GT-AGT-GATTGCTCCT-TCGCC-AA--GAG----TTCGGC-ATAGAGAAAGG-AGAATCACGGGTCTTTTGGAT--TGACCTTAAAAAC-G---GAGGTCCC-----GTGTC-GC-AGC--A--GG--TGTAGC-AC-----acaccacaataagcgaaatcaatcaatc
gi|11 : ga-TGACTTTAAAGAC-G---GAGGTCAC-----GTGTC-GC-GGT--A--GGCCT-GGGC-AC-----GT-T---AAAGTACTCTCAC-TACT---TCGGCCAT-G------TA-------------------TG-GGG--C---TT---CACCGG-AAGCT-GGTATCTGAACCATCTC-TATAGGAGTGAAA-ATTCTCGAacc
gi|12 : atTCACTGGTCTTTCAGATA-TGACATTTAAAAC-G---GAGGTCCC-----GTGTC-GT-AGC--A--GG--TGTGGC-AC-----G--TA--AAAGAACCCTCAC-TACT--AAAACCCATAAAACGGCTAAGC--
gi|13 : C-TCAGT-GATCGG-AAAGTCGTGAGT-T-CGAGCCCCG---T-GCTCGG-A-----------AC--------------AAC-----------CCA----------------------G--GT-AGT-GACTGCGCCT-TCGCC-AA--GAG----CTCGGC-ATTTAGAAGTt
gi|14 : ggC-------TGACTG------TGT-CAAACTTAAGTCTGAATTAAGA--C--A-T--ACAA-GTAAG--GTAAGT-GATTGCTCTT-TCATC-AA--ttg
gi|15 : caC-GACGTGAGTGAAAAATTCTCGACGG-GACGTAA--AACAAACAATatgttc
gi|16 : aGC-GTTAAGC--ATAGGACTAAA-TTTG-TGGTAC---TT---Cttcagaaacttttcatctcggtaaaat
gi|2 : gGGTAGC-TCAGTG-----------TTTACGCT-TC-AT-AATCGA-GTGGTCGCGAGT-T-CGAGCCC-----C-GCTCGT-GCCA------TGACCA------CGT-CCAAC-----------CTAAGA--G--G-T--A-AACAC-AG--GC-AGT-GATTACCCCT-TCCCC-AA--ACG----TCCGGG-TTTTAGAAGTA-AGAATCATGGGTC--------A-TGATTTT-AAGAC-G---CAAGTCCA-----GTGTC-CC-GGC--AGTCG--T-TGGC-AC-----GT-T---CATGAACTCTTGC-TGCT---ACAGTCCT-GAGC-GCTAAGC--ATAGGTCTAAA-TTTG-CGGTATAAGTT---C----------T-GG----CGA--TGCCTC-AATACGAGTGACAAATTCTCAACGG-GACGTAA--AACAAACAAtgacacctacaactgg
gi|3 : acGGTGAC-TCAATGG----TAGAACTCT-CGCC-TC-GT-GATCGGCGAGGTCGTGCGT-T-CGAGCCC-G---CTGCCCGG-ACC-------CGGCCG------TGT-CAAAC-----------CTAAGA--CTCG----A-AA-AT-AG--GT-AGT-GATTGCTTCT-TGGCC-AA--GAG----CTCGGC-ATTTAGAAGTG-AGAATCACGGGTCTCTCAGATA-TGACCTTAAAAAC-G---AAGGTCCC-----GTGTC-GC-AGC--A--TG--T-TGGC-AA-----G--TA--AAAGAACCCTCAC-TGCT--AAAAGCCAT-GAGT-GCTAAGC--ATAGGTCTAAA-TTTG-CAGCCC---TT---CACCGGCAA--T-GG----TGA--CGTCTC-AATATGAGTAAAATATTCTCGACGG-GACGAAA--TTCAATCAATccaaccaatacaacctgtcattgggtaaaatgctgtctgacgtgtttcataccaatcgt
gi|4 : C-TCAGTGGGGGGTAGAGCTCTTCGCCATC-GTTGATCAG-GAGGTCGTGCGT-T-CGAGCCCCG---T-GCTCGGCACC-------CG-CTG------TGT-CAAAC-----------CTAAGA--C--G-TG-A-AA-AA-AG--GT-AGT-GATTGCTCCT-TCACC-AA--GAG----TTCAGC-GTTTTG-AGTG-AGAATCAC-GGTCTTTCGGATATTGACCTAAAAAAC-G---GAGGTCAT-----GAGTC-AC-AGCATA--TG--T-T-GC-AC-----G--C----AAGACCCCTCAC-TGCT--AAAAGCGAT-GGGC-ACTAGGC--TTAGGTCTAAA-TTTG-CAGCCC---TT---CACCGACAA--T-GG----TGT--CATCTC-AGTATGAGTGAAATATTCTCGACGG-GACAAAAACAACAAATAATgagaataatttgattttactttta
gi|5 : GGTTGC-TCAGTGA----TGGGGCATG-TGCT-TC-GC--ATCAG-G-------GAGTGT-CGAGCTCTG---C---TCGA-GCCA------CAACAG------CGT-CGCAC--------------------------------AT-AG--GT-AGT-ACTTGCTTTT-TCGCC-AA--ACT----CTCGGC-CTTTCGAAGTG-AGAATCACGGGTATTTTGGATA-TGTCCCTAAATAT-G---AAGGCCCC-----GT----------------G--T-TG--------------------------TCGC----------AGGCGT-TGGC-GTTAAGC--ATAGGTCTAAA-CTTG-TGGTAC---TTGAACACCTATAA--TTGG----TGA--TGTCTC-AGTATGAGTAAAACTGTCTCGGCGG-GACGTAA--AATAATCAcaatcaa
gi|6 : tcgcAAAAA------GAAGCCTC-----ATATC-AC-AGC--A--GG--TATGAC-A------GAAT---AAATCTCCCTCCC-CGATC-AAAAGCCGT-AAGC-TCCGACC--ATAGCCCTAAAGTCTG-CAGTTC---TT---CGCTGGAAA--T-GT----CGA--AGTCTC---CATGAGTGCAACATTATCGGGGGAGACGtccaa
gi|7 : tggatcctggttaggatcccttacttctcggaagaggcgatgaaatgggagcggtcctgttaattagtccgcaGGTGGAGTCAGTGG----TAGA--TCT-CGCC-TC-GT-GA---------------AT-T-CGAGCCCCG---C-GTTCGG-ACC-------AGGCCG------CGT-CAAAC-----------CTAAGA--C--GTT--A-AA-AT-GG--GT-AGT-GATT----------------------------GC-ATTTAGAAGTG-AGAATCACGGtgt
gi|7 : ggtcgcAC-G---GAGATCCC-----GTGTC-GC-AAC--A--TG--TGTGGC-AC-----GC-T---AAAGAACCCTTAC-TGCT--ACAAGCCAT-AAGT-GCTAAGC--ATAGGTCTAAA-TGTG-CAGCCC---TT---CACCagatcccgtgtcgcaacatgtgtggcacgctaaagaacccttactgctacaagccataagtgctaagcataggtctaaatgtgcagcccttcaccta
gi|8 : ggtcgcggtggagtcagtggtagatctcgcctcgtgaattcgagccccgcgttcggaccaggccgcgtcaaacctaagacgttaaaatgggtagtgattgcatttagaagtgagaatcGCTTT-CGC---------ATCGG-TAGGTCGTGAGT-T-CGA---------T-GTTCGA-ATCGTGCAAATGACAG------TGTTCAAAA-----------CTAAGA--C--G-TTAA-AA-AT-AG--GT-AGT--ATTGTT--T-TTACCTAACCGA-----CTCGGC-ATGTAGTAGGGCAGAA-CACGGG------G---------CTTACAAACTG---GAGGCCC-------TGTC-A--AGC--G--CG--T---GC--C-----G--TTAGAAGGAACTTTCA--TGCT--AACGGCCCT-Gta
gi|9 : cttttCCG------TGT-CAAAA-----------TTAAAA--C--G-T--A-AA-AT-AC--CA-AGT-GATT---------GCC-AA--ACG----CCAGAT-TTTTAGAAG---------ACG----TCTCGGAT-----CTTTTCAACT-C---GAGCTTCG-----GCGTC-G-----------------GG------------------AGGACCCTTGC-TGCT---GCAGCCCT-GAGC-GCCATGCCTATAGgaggcctag