lowQualScore : 2 111 11111111 111 1111111 1 4
lowQualScore : 6 3 44 3 5 1 7 33 2 2 2 33 33 2 2 2 2 000 4 4 4 8 4 66 4 4 66666666 222 5 0000000 5 4 33 3 9999 6 0 2 6 6
lowQualScore : . . .. . . . . .. . . . .. .. . . . . ... . . . . . .. . . ........ ... . ....... . . .. . .... . . . . .
lowQualScore : 7 3 22 1 3 8 5 44 5 5 5 44 44 5 7 7 7 000 0 0 4 9 4 11 4 9 00000000 333 7 0000000 7 6 33 3 3333 7 0 5 7 7
consensus : GTTCTGTT-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGCATATCCTA--ACA-TG-ATG-AAT--TAG--A-TGAAA-GAT-G-AG---AT-AT-TGT-TA-T-G--AGA-TGCCA-------TTTGTGAGA-T-TCTA-T-GT--GAA-ATAAAGACATA-TTAA--TT-TCAAGGTTCTCAGGCCCTCAGTC-ATT-ACTTT
Reference ( gi|4 ) : GTTCTGTT-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGCATATTC-A--ACA-TG-ATG-AAT--TAG--A-TGAAA-GAT-G-AG---AT-AT-TGT-TA-T-G--AGA-TGTCA-------TTTGTGAGA-T-TCTA-T-AT--GAA-ATAAAGACATA-TTGA--TT-TCAAGGTT-TCAGGCCCTCAGTC-ATT-ACTTT
gi|1 : GTTCTGTT-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGAATTTCT-A--ACA-TG-ATG-AAT--TAG--A-TGAAA-GAT-G-AG---AT-AT-TGT-TA-T-G--AAA-TGCCA-------ATTGTGAGA-T-TCTA-T-AT--GAA-TTAAAAACATATTTAA--TT-TCAAGGTTCTCAGGACCTCAGTC-ATT-ACTTT
gi|2 : TTCTGTTTCA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAA-GCATATTCTA--ACA-TG-ATGAAATTGTAG--A-TGAAA-GATCG-AG---ATGAT-TGTATA-T-G--AGA-TGCC--------TTTGCGAGA-T-TCTACT-AT--G-A-AT-AAGAC--A-TTAA--TT-TCAAGGTTCTCAGGCCCTCAGTC-ATT-ACT
gi|6 : aTTCTGTG-CA-AGTTTA--CCAG-A-TGA-CAATGCAT-TCT-A--ACA-TG-A-G-AAT--TGG--C-TGAAA-GAT-G-AG---AT-AT-TAT-CATT-G--AGA-TGCTA--------TTGTGAGATT-TCTA-T-CT--G-A-ATAAAGACATATTTAA--TT-TTAAGGTTCTCAGG--CTCAGTC-ATT-ACT
gi|9 : TTCTGTT-CA-AGTTTA--CGAA-AATGA-CAATGCAT-TTT-A--ACA-TG-ATG-AAT--TAG--A-TGAAA-GAT-G-AG---AT-AT-TGT-TA-T-G--AGA-TGCCA-------TT
gi|11 : TCCTGTTTCATGGTTTA--C-AG-AATGAACAATGCATATCCTA--ACA-TG-ATT-AAT--TAA--ATTGGAA-GAT-G-A
gi|14 : tTCTGTT-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGCATATTCTA--ACA-TG-ATG-AAT--TAG--A-TGAAA-GAT-G-A
gi|13 : TCTGTT-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGCATATTCTA--ACA-TG-ATG-AAT--TAG--A-TGAAA-GAT-G-A
gi|8 : TTTGTT-CA-AGTTTAAACCAGTAATGAACAATGCATATCCTA--ACA-TG-ATG-AAT--TAA--A-TGAAATGAT-G-AG---AT-AT-TTT-TA-TAA--AGA-TGCCAATTGTGGTTTGTGAGA-TGTCTA-TCGT--GAATATAA
gi|3 : TGTT-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGCACATTCTA--ACA-TG-ATG-AAT--TAG--A-TGAAA-GAT-G-AGNNNNN-NN-NNN-NN-N-N--NNN-NNNNN-------NNNNNNNNN-N-NNNN-N-NN--NNN-NNNNNNNNNNN-NNNN--NN-NCAAGGTTCTCAGGCCCCCAGTC-ATT-AATTTga
gi|12 : TT-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGCATATCCTA--ACA-TG-ATG-AAT--TAG--A-TGAAA-GAT-G-AG---AT-AT-
gi|15 : TT-CA-AATTTA--CCAT-AATGA-CAATGCATATTCTA--ACA-TG-ATG-AAT--TAG--A-TGAAA-GAT---AG---A
gi|16 : T-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGCAT-TCT-G--TCA-TG-ATG-AAT--GAG--A-TGAAA-GAT-G-A
gi|17 : --CCAG-AATGG-CATTGCATATCCTA--ACT-TG-ATG-AAT--TAG--A-TGAA
gi|5 : ATGA-CATGGCATATTC-ATAACAATGGATG-ATT--TGGCGA-TGAAA-GAT-GGAGT--AT-AT-TGT-TAAT-G--AGA-TGCCA-------TTTGTAAGA-----TA-T-GTCCGAA-ATTAAGATACA-TTTAAGTTGTCAAGGTTCTCAGGCCCTCAGTCAATTAACTT
gi|10 : gacTGA-CAATGCATATCCTA--ACA-TG-A----------G--A-TGAA--GAT---AG---AT-AT-TGT-TA-T-G--AGATTGCCA-------TTTGTGA
gi|7 : tcaagtgtgaacgctGCATATTCTA--ACA-TG-ATG-AAT--TAG--A-TGAAA-GTT-G-AG---AT-ATGTGA-CA-T-GNNNNN-NNNNN-------NNNNNNNNN-N-NNNN-N-NN--NNN-NNNNNNNNNNN-NNNN--NN-NNNNNGTTCTCAGGCCCTCAGTC-ATT-ACTTT
Alignments
lowQualScore : 11111111 11
lowQualScore : 6 3 33 2 5 3 2 2 2 33 2 33 2 2 2 2 999 3 3 4 8 4 55 4 33333333 5 5 5 77777 77 0 22 77 5 0 5 5
lowQualScore : . . .. . . . . . . .. . .. . . . . ... . . . . . .. . ........ . . . ..... .. . .. .. . . . .
lowQualScore : 2 1 99 9 0 3 4 4 4 22 4 22 4 5 5 5 222 6 6 0 0 0 55 0 55555555 0 0 0 22222 99 9 33 99 7 7 7 7
consensus : GTTCTGTT-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGCATATTC-TAACA-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAAA-GAT-G-AG---AT-AT-TGT-TA-T-G--AGA-TGCCA-------TTTGTGAGA-T-TCTA-T-AT--GAA-ATAAAGACATA-TT--AATT-TCAAGGTTCTCAGGCCCTCAGTC-ATT-ACTTT
Reference ( family-267 ) : GTTCTGTT-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGCATATCC-TAACA-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAAA-GAT-G-AG---AT-AT-TGT-TA-T-G--AGA-TGCCA-------TTTGTGAGA-T-TCTA-T-GT--GAA-ATAAAGACATA-TT--AATT-TCAAGGTTCTCAGGCCCTCAGTC-ATT-ACTTT
gi|1 : GTTCTGTT-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGAAT-TTC-TAACA-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAAA-GAT-G-AG---AT-AT-TGT-TA-T-G--AAA-TGCCA-------ATTGTGAGA-T-TCTA-T-AT--GAA-TTAAAAACATATTT--AATT-TCAAGGTTCTCAGGACCTCAGTC-ATT-ACTTT
gi|10 : TGA-CAATGCATATCC-TAACA-TG-----------AG--A-TG-AA-GAT---AG---AT-AT-TGT-TA-T-G--AGATTGCCA-------TTTGTGA
gi|11 : tcaagtgtgaacgctTCCTGTTTCATGGTTTA--C-AG-AATGAACAATGCATATCC-TAACA-TG-ATTAA--T-TAA--ATTGGAA-GAT-G-A
gi|12 : tTT-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGCATATCC-TAACA-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAAA-GAT-G-AG---AT-AT-
gi|13 : TCTGTT-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGCATATTC-TAACA-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAAA-GAT-G-A
gi|14 : TCTGTT-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGCATATTC-TAACA-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAAA-GAT-G-A
gi|15 : TT-CA-AATTTA--CCAT-AATGA-CAATGCATATTC-TAACA-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAAA-GAT---AG---A
gi|16 : T-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGC--ATTC-TGTCA-TG-ATGAA--T-GAG--A-TGAAA-GAT-G-A
gi|17 : --CCAG-AATGG-CATTGCATATCC-TAACT-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAA
gi|2 : TTCTGTTTCA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAA-GCATATTC-TAACA-TG-ATGAAATTGTAG--A-TGAAA-GATCG-AG---ATGAT-TGTATA-T-G--AGA-TGCC--------TTTGCGAGA-T-TCTACT-AT--GAA--TAA-GACAT---T--AATT-TCAAGGTTCTCAGGCCCTCAGTC-ATT-ACT
gi|3 : aTGTT-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGCACATTC-TAACA-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAAA-GAT-G-AGNNNNN-NN-NNN-NN-N-N--NNN-NNNNN-------NNNNNNNNN-N-NNNN-N-NN--NNN-NNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NCAAGGTTCTCAGGCCCCCAGTC-ATT-AATTT
gi|4 : GTTCTGTT-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGCATATTC--AACA-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAAA-GAT-G-AG---AT-AT-TGT-TA-T-G--AGA-TGTCA-------TTTGTGAGA-T-TCTA-T-AT--GAA-ATAAAGACATA-TT--GATT-TCAAGGTT-TCAGGCCCTCAGTC-ATT-ACTTT
gi|5 : ATGA-CATGGCATATTCATAACAATGGATGAT--T-TGGCGA-TGAAA-GAT-GGAGT--AT-AT-TGT-TAAT-G--AGA-TGCCA-------TTTGTAAGA-T----A-T-GTCCGAA-ATTAAGATACA-TTTAAGTTGTCAAGGTTCTCAGGCCCTCAGTCAATTAACTT
gi|6 : gacTTCTGTG-CA-AGTTTA--CCAG-A-TGA-CAATGCAT--TC-TAACA-TG-A-GAA--T-TGG--C-TGAAA-GAT-G-AG---AT-AT-TAT-CATT-G--AGA-TGCTA--------TTGTGAGATT-TCTA-T-CT--G-A-ATAAAGACATATTT--AATT-TTAAGGTTCTCAGG--CTCAGTC-ATT-ACT
gi|7 : GCATATTC-TAACA-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAAA-GTT-G-AG---AT-ATGTGA-CA-T-GNNNNN-NNNNN-------NNNNNNNNN-N-NNNN-N-NN--NNN-NNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNNNNGTTCTCAGGCCCTCAGTC-ATT-ACTTT
gi|8 : TTTGTT-CA-AGTTTAAACCAGTAATGAACAATGCATATCC-TAACA-TG-ATGAA--T-TAA--A-TGAAATGAT-G-AG---AT-AT-TTT-TA-TAA--AGA-TGCCAATTGTGGTTTGTGAGA-TGTCTA-TCGT--GAATATAA
gi|9 : TTCTGTT-CA-AGTTTA--CGAA-AATGA-CAATGCATTT---TAACA-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAAA-GAT-G-AG---AT-AT-TGT-TA-T-G--AGA-TGCCA-------TTga
Alignments
lowQualScore : 11111111 11
lowQualScore : 6 3 33 2 5 2 2 2 33 2 33 2 2 2 2 999 3 3 4 8 4 55 4 33333333 5 5 5 55 66 77 0 22 77 5 0 5 5
lowQualScore : . . .. . . . . . .. . .. . . . . ... . . . . . .. . ........ . . . .. .. .. . .. .. . . . .
lowQualScore : 2 1 99 9 0 4 4 4 22 4 22 4 5 5 5 222 6 6 0 0 0 55 0 55555555 0 0 0 22 99 99 9 33 99 7 7 7 7
consensus : GTTCTGTT-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGCATATTC-TAACA-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAAA-GAT-G-AG---AT-AT-TGT-TA-T-G--AGA-TGCCA-------TTTGTGAGA-T-TCTA-T-AT--GAA-ATAAAGACATA-TT--AATT-TCAAGGTTCTCAGGCCCTCAGTC-ATT-ACTTT
Reference ( family-267 ) : GTTCTGTT-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGCATATTC-TAACA-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAAA-GAT-G-AG---AT-AT-TGT-TA-T-G--AGA-TGCCA-------TTTGTGAGA-T-TCTA-T-AT--GAA-ATAAAGACATA-TT--AATT-TCAAGGTTCTCAGGCCCTCAGTC-ATT-ACTTT
gi|1 : GTTCTGTT-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGAAT-TTC-TAACA-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAAA-GAT-G-AG---AT-AT-TGT-TA-T-G--AAA-TGCCA-------ATTGTGAGA-T-TCTA-T-AT--GAA-TTAAAAACATATTT--AATT-TCAAGGTTCTCAGGACCTCAGTC-ATT-ACTTT
gi|10 : TGA-CAATGCATATCC-TAACA-TG-----------AG--A-TG-AA-GAT---AG---AT-AT-TGT-TA-T-G--AGATTGCCA-------TTTGTGA
gi|11 : tcaagtgtgaacgctTCCTGTTTCATGGTTTA--C-AG-AATGAACAATGCATATCC-TAACA-TG-ATTAA--T-TAA--ATTGGAA-GAT-G-A
gi|12 : tTT-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGCATATCC-TAACA-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAAA-GAT-G-AG---AT-AT-
gi|13 : TCTGTT-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGCATATTC-TAACA-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAAA-GAT-G-A
gi|14 : TCTGTT-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGCATATTC-TAACA-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAAA-GAT-G-A
gi|15 : TT-CA-AATTTA--CCAT-AATGA-CAATGCATATTC-TAACA-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAAA-GAT---AG---A
gi|16 : T-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGC--ATTC-TGTCA-TG-ATGAA--T-GAG--A-TGAAA-GAT-G-A
gi|17 : --CCAG-AATGG-CATTGCATATCC-TAACT-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAA
gi|2 : TTCTGTTTCA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAA-GCATATTC-TAACA-TG-ATGAAATTGTAG--A-TGAAA-GATCG-AG---ATGAT-TGTATA-T-G--AGA-TGCC--------TTTGCGAGA-T-TCTACT-AT--GAA--TAA-GACAT---T--AATT-TCAAGGTTCTCAGGCCCTCAGTC-ATT-ACT
gi|3 : aTGTT-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGCACATTC-TAACA-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAAA-GAT-G-AGNNNNN-NN-NNN-NN-N-N--NNN-NNNNN-------NNNNNNNNN-N-NNNN-N-NN--NNN-NNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NCAAGGTTCTCAGGCCCCCAGTC-ATT-AATTT
gi|4 : GTTCTGTT-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGCATATTC--AACA-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAAA-GAT-G-AG---AT-AT-TGT-TA-T-G--AGA-TGTCA-------TTTGTGAGA-T-TCTA-T-AT--GAA-ATAAAGACATA-TT--GATT-TCAAGGTT-TCAGGCCCTCAGTC-ATT-ACTTT
gi|5 : ATGA-CATGGCATATTCATAACAATGGATGAT--T-TGGCGA-TGAAA-GAT-GGAGT--AT-AT-TGT-TAAT-G--AGA-TGCCA-------TTTGTAAGA-T----A-T-GTCCGAA-ATTAAGATACA-TTTAAGTTGTCAAGGTTCTCAGGCCCTCAGTCAATTAACTT
gi|6 : gacTTCTGTG-CA-AGTTTA--CCAG-A-TGA-CAATGCAT--TC-TAACA-TG-A-GAA--T-TGG--C-TGAAA-GAT-G-AG---AT-AT-TAT-CATT-G--AGA-TGCTA--------TTGTGAGATT-TCTA-T-CT--G-A-ATAAAGACATATTT--AATT-TTAAGGTTCTCAGG--CTCAGTC-ATT-ACT
gi|7 : GCATATTC-TAACA-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAAA-GTT-G-AG---AT-ATGTGA-CA-T-GNNNNN-NNNNN-------NNNNNNNNN-N-NNNN-N-NN--NNN-NNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNNNNGTTCTCAGGCCCTCAGTC-ATT-ACTTT
gi|8 : TTTGTT-CA-AGTTTAAACCAGTAATGAACAATGCATATCC-TAACA-TG-ATGAA--T-TAA--A-TGAAATGAT-G-AG---AT-AT-TTT-TA-TAA--AGA-TGCCAATTGTGGTTTGTGAGA-TGTCTA-TCGT--GAATATAA
gi|9 : TTCTGTT-CA-AGTTTA--CGAA-AATGA-CAATGCAT--TT-TAACA-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAAA-GAT-G-AG---AT-AT-TGT-TA-T-G--AGA-TGCCA-------TTga
blockSeqs : T T AA T A A A G AT G CG T T C G NNN G G A A A NN T ATTGTGGT T G C CG CC TA AT TA G A A
blockSeqs : T . . . A . . . . . . . . . . T . . . T . . . T . . . A . N N . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . N . A A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N . . . A . A A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . G . A N . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . C . N . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N . . . N . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqCons : A*
originalCons : GTTCTGTT-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGCATATTC-TAACA-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAAA-GAT-G-AG---AT-AT-TGT-TA-T-G--AGA-TGCCA-------TTTGTGAGA-T-TCTA-T-AT--GAA-ATAAAGACATA-TT--AATT-TCAAGGTTCTCAGGCCCTCAGTC-ATT-ACTTT
finalCons : GTTCTGTT-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGCATATTC-TAACA-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAAA-GAT-G-AG---AT-AT-TGT-TA-T-G--AGA-TGCCA-------TTTGTGAGA-T-TCTA-T-AT--GAA-ATAAAGACATA-TT--AATT-TCAAGGTTCTCAGGCCCTCAGTC-ATT-ACTTT
Alignments
lowQualScore : 11111111 11
lowQualScore : 6 3 33 2 5 2 2 2 33 2 33 2 2 2 2 999 3 3 4 8 4 55 4 33333333 5 5 5 55 66 77 0 22 77 5 0 5 5
lowQualScore : . . .. . . . . . .. . .. . . . . ... . . . . . .. . ........ . . . .. .. .. . .. .. . . . .
lowQualScore : 2 1 99 9 0 4 4 4 22 4 22 4 5 5 5 222 6 6 0 0 0 55 0 55555555 0 0 0 22 99 99 9 33 99 7 7 7 7
consensus : GTTCTGTT-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGCATATTC-TAACA-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAAA-GAT-G-AG---AT-AT-TGT-TA-T-G--AGA-TGCCA-------TTTGTGAGA-T-TCTA-T-AT--GAA-ATAAAGACATA-TT--AATT-TCAAGGTTCTCAGGCCCTCAGTC-ATT-ACTTT
Reference ( family-267 ) : GTTCTGTT-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGCATATTC-TAACA-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAAA-GAT-G-AG---AT-AT-TGT-TA-T-G--AGA-TGCCA-------TTTGTGAGA-T-TCTA-T-AT--GAA-ATAAAGACATA-TT--AATT-TCAAGGTTCTCAGGCCCTCAGTC-ATT-ACTTT
gi|1 : GTTCTGTT-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGAAT-TTC-TAACA-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAAA-GAT-G-AG---AT-AT-TGT-TA-T-G--AAA-TGCCA-------ATTGTGAGA-T-TCTA-T-AT--GAA-TTAAAAACATATTT--AATT-TCAAGGTTCTCAGGACCTCAGTC-ATT-ACTTT
gi|10 : TGA-CAATGCATATCC-TAACA-TG-----------AG--A-TG-AA-GAT---AG---AT-AT-TGT-TA-T-G--AGATTGCCA-------TTTGTGA
gi|11 : tcaagtgtgaacgctTCCTGTTTCATGGTTTA--C-AG-AATGAACAATGCATATCC-TAACA-TG-ATTAA--T-TAA--ATTGGAA-GAT-G-A
gi|12 : tTT-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGCATATCC-TAACA-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAAA-GAT-G-AG---AT-AT-
gi|13 : TCTGTT-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGCATATTC-TAACA-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAAA-GAT-G-A
gi|14 : TCTGTT-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGCATATTC-TAACA-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAAA-GAT-G-A
gi|15 : TT-CA-AATTTA--CCAT-AATGA-CAATGCATATTC-TAACA-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAAA-GAT---AG---A
gi|16 : T-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGC--ATTC-TGTCA-TG-ATGAA--T-GAG--A-TGAAA-GAT-G-A
gi|17 : --CCAG-AATGG-CATTGCATATCC-TAACT-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAA
gi|2 : TTCTGTTTCA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAA-GCATATTC-TAACA-TG-ATGAAATTGTAG--A-TGAAA-GATCG-AG---ATGAT-TGTATA-T-G--AGA-TGCC--------TTTGCGAGA-T-TCTACT-AT--GAA--TAA-GACAT---T--AATT-TCAAGGTTCTCAGGCCCTCAGTC-ATT-ACT
gi|3 : aTGTT-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGCACATTC-TAACA-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAAA-GAT-G-AGNNNNN-NN-NNN-NN-N-N--NNN-NNNNN-------NNNNNNNNN-N-NNNN-N-NN--NNN-NNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NCAAGGTTCTCAGGCCCCCAGTC-ATT-AATTT
gi|4 : GTTCTGTT-CA-AGTTTA--CCAG-AATGA-CAATGCATATTC--AACA-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAAA-GAT-G-AG---AT-AT-TGT-TA-T-G--AGA-TGTCA-------TTTGTGAGA-T-TCTA-T-AT--GAA-ATAAAGACATA-TT--GATT-TCAAGGTT-TCAGGCCCTCAGTC-ATT-ACTTT
gi|5 : ATGA-CATGGCATATTCATAACAATGGATGAT--T-TGGCGA-TGAAA-GAT-GGAGT--AT-AT-TGT-TAAT-G--AGA-TGCCA-------TTTGTAAGA-T----A-T-GTCCGAA-ATTAAGATACA-TTTAAGTTGTCAAGGTTCTCAGGCCCTCAGTCAATTAACTT
gi|6 : gacTTCTGTG-CA-AGTTTA--CCAG-A-TGA-CAATGCAT--TC-TAACA-TG-A-GAA--T-TGG--C-TGAAA-GAT-G-AG---AT-AT-TAT-CATT-G--AGA-TGCTA--------TTGTGAGATT-TCTA-T-CT--G-A-ATAAAGACATATTT--AATT-TTAAGGTTCTCAGG--CTCAGTC-ATT-ACT
gi|7 : GCATATTC-TAACA-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAAA-GTT-G-AG---AT-ATGTGA-CA-T-GNNNNN-NNNNN-------NNNNNNNNN-N-NNNN-N-NN--NNN-NNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNNNNGTTCTCAGGCCCTCAGTC-ATT-ACTTT
gi|8 : TTTGTT-CA-AGTTTAAACCAGTAATGAACAATGCATATCC-TAACA-TG-ATGAA--T-TAA--A-TGAAATGAT-G-AG---AT-AT-TTT-TA-TAA--AGA-TGCCAATTGTGGTTTGTGAGA-TGTCTA-TCGT--GAATATAA
gi|9 : TTCTGTT-CA-AGTTTA--CGAA-AATGA-CAATGCAT--TT-TAACA-TG-ATGAA--T-TAG--A-TGAAA-GAT-G-AG---AT-AT-TGT-TA-T-G--AGA-TGCCA-------TTga