lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 11 11 2222 3333333333333333333333333333333333 22 2222222222 333333333333333333333 22 11 11111111111 333333333333333333333333 222 2222222 11 11111 22222222 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111111111 11111111111 33333333333333333 11111 222222 2222222222 111 111 1 1111111111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11111111 111 5555555555555555555555555 111111111111 111 1111111111 2222222 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 111111111111111111 1111111111111 1111111111111111111111111 1111111111111 11111 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 2222222222
lowQualScore : 6 7 11 1 8 00 5 6 00 6666 66 4 22 7 888888 3 2 2 1 8888888888888888888888888888888888 0 00 2 2 9999999999 000000000000000000000 77777 4 99 0 77 00 999 88888888888 33 9 888888888888888888888888 22 5555 1 333 88888 3333 1 66666666 1 3333 555 1 555 2 77777 4 22 77777777 6 6 777777 1 11 2222222 1 5555555 222 1 1 44444 3 3333 1 22 7777 22 3 1 1 22 1 33 1 1 11 11 999999999999 3333 1 1 222 1 00000 222 1 222 1 1 777777 1 444 22222222 222 88 11 2222 2 1 444 4444 1 55555555 1 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1 1111111111 222 1 1 1 22 1 22 1 1 55555555555 222 22 666666666 5555555 66666666666666666 1 222 66666 0 44 777777 2 4444444444 222 22 88 22 1 3 666 1 33333 1 1 3333 22 333 0 1 1 444 3 7 222 3333 1 1 222 444 0000000000 222 222 222 77777 555 33 6666666 22 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 4444 999999999 1 1 8888888888 1 1 4444 33333333 2 3 222 77 1111111111111111111111111 333333333333 1 5555 1 22 66666 2 2 6666 2 333 2 555 0000000000 55 666 2 88888 1111111 2 2 33 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 2 88888 0 22 4 4444 2 0 333 2 66666 0 000000000000000000 5555555555555 333 55555 44 3333 1 1 44 1 3333333333333333333333333 888888 0000000000000 444 4 444 22 33333 2 444 33 2 99 33 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 44 5 44 0 5 4444444444 4
lowQualScore : . . .. . . .. . . .. .... .. . .. . ...... . . . . .................................. . .. . . .......... ..................... ..... . .. . .. .. ... ........... .. . ........................ .. .... . ... ..... .... . ........ . .... ... . ... . ..... . .. ........ . . ...... . .. ....... . ....... ... . . ..... . .... . .. .... .. . . . .. . .. . . .. .. ............ .... . . ... . ..... ... . ... . . ...... . ... ........ ... .. .. .... . . ... .... . ........ . ........................................................................................................... . .......... ... . . . .. . .. . . ........... ... .. ......... ....... ................. . ... ..... . .. ...... . .......... ... .. .. .. . . ... . ..... . . .... .. ... . . . ... . . ... .... . . ... ... .......... ... ... ... ..... ... .. ....... .. .................................................................... .... ......... . . .......... . . .... ........ . . ... .. ......................... ............ . .... . .. ..... . . .... . ... . ... .......... .. ... . ..... ....... . . .. ................................................................................................................................................... . ..... . .. . .... . . ... . ..... . .................. ............. ... ..... .. .... . . .. . ......................... ...... ............. ... . ... .. ..... . ... .. . .. .. .......................................................................... .. . .. . . .......... .
lowQualScore : 0 0 00 0 4 99 7 0 11 1111 22 2 99 2 555555 0 0 1 4 5555555555555555555555555555555555 7 44 9 9 3333333333 333333333333333333333 11111 9 99 6 77 00 999 33333333333 44 4 111111111111111111111111 88 4444 9 333 22222 9999 8 66666666 8 9999 000 8 777 0 88888 0 88 22222222 0 0 222222 8 99 5555555 8 7777777 888 6 6 22222 3 5555 6 22 7777 11 1 6 6 44 5 55 5 5 99 99 888888888888 6666 5 5 666 5 22222 777 4 444 4 4 222222 4 111 33333333 444 44 88 8888 7 3 777 2222 4 00000000 4 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 5 0000000000 888 6 6 6 22 6 22 6 6 66666666666 777 11 222222222 2222222 99999999999999999 6 888 88888 8 88 222222 8 8888888888 666 11 00 77 5 2 111 5 88888 5 5 3333 11 888 1 6 6 888 1 7 777 3333 6 6 888 444 6666666666 888 777 999 11111 888 00 8888888 99 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 0000 555555555 9 9 4444444444 9 9 2222 00000000 0 3 000 55 7777777777777777777777777 666666666666 9 0000 9 66 77777 1 1 6666 5 777 5 111 3333333333 66 999 4 22222 1111111 3 2 22 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 22222 9 99 2 5555 0 5 555 0 55555 5 111111111111111111 2222222222222 222 00000 88 7777 7 7 33 7 1111111111111111111111111 333333 9999999999999 666 8 888 55 00000 1 111 22 7 11 22 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 66 7 99 5 8 0000000000 0
consensus : AACTGAATCT--TCAACCCAAGG-ATGATTTGTACCAAGTTTG--GTTGAA-AT-T--GGCCC------AGTGGT-TC-TGGAGAAGA--------ANA----TTT-T--------------ATGTAAAACTNTGATC-CCCT-ATTGTGGCCCC-NTC----CTACCCCC--------GGGG--G--TC-A-----TGATTTGAACAAACTTG-AAT--CT--AC--TA-T-ATGTCAG--GAAGCTTTCATGTAAATATC--GT--CT--T-T--TCTGG---CC-C---A-G---T----GGT-T--------CT-T----GA---GAA-GA-GATTT-TT-----AAA-G--A--------T-TTTCCC-TA----T-AT-A-TTCA--C---AT-GTAAA-------AC---T-TTGATCCC-CT-----A-T----TGTGG-C--CCCATCG-T--A-C-C-CC--G-GGG--GT-C-ATG--ATT--TGAA------------CAAA--C-TT-G-AA---TC-T-CCA-CTAT-A-TCAGGA-A---GCTT-TCATA-TAA------AT-T---T--N-AG-CT---T--T--T----CTGGCC-CA-G---T----G-GTT--------CT-T----------G----A-------------G-------------A-------A--------------G-A-------------TT----------T-----------TC-CCTA-----T-A-TA---TTC-A-CA-T--G-TA--A-A-AN-TT---TN--ATC---CC--C---------T-------A--G---T---G------G-CC---CC-ATCGTACCCC-CGGGG-G--TCATGATTTGAA-CAAA-N----T--TGAA---TC--T-CCA-C-T-AT-ATC-A-----GG-AAGCTT-T----CA--TAT-N-AATTTCAGC-TT-T---TCT-GGCCCAG---T----G-GT-TC---T---T------G---AG---AA---G---A-----TTTTT---AAA-GA-------T--T--------T-CCC--------------AT----AT----G--------T---A-A-----A-------A----C---------T-TTG-ATC---------CC-C-T----AT-T---G-TGG-CCCCATCG--TA--CCCC---GAGGGTCATGA--T-------TTGAA------------C-AAA--C-TT-GA--ATCTCCAC----TAT-ATCAGGA-A----GCTT---TCATAT-AAA----------TTTCAGC--TTT--TCT-G----GCC-C-----AGT-GGT--TCTTG---------A-A--AGAAG---A-TT-TT-----T-----------AAATG-AT--------AC-CA--------C-CCT-ATT----TTT---GCATT-T-------------CCNTTTGA-----A-----GGGGGT----CN-GGT-CCT-----TCAT--T-T----GAAC-AAACTTGA---ATC-CC--C--TTCA-CCCAA-GG-----ATGATTT---GC---A-C-CA---AG----TTT--G----GT-TGA-AT-T-T-----G--------G--C-------CC------AG------T---G--GT---TCTGGAGAA---GAA--G--A--TGAAA-ATGTG---AAA--AGTT-NA--C-G-AC-----A-A--CA-----AC---------GATN----ACNGACA--------ACGGGAA-AA-T-CG---ATCAG--AAAA-GCTCACTTGAGCCT---TCGGCTCAGGTGAGC-TAAAAA
Reference ( gi|2 ) : AGCTGTATCT--TNAACCCAAGG-ACGATTAGTACCAAGTTTC--CTTGAA-AT-T--GACCC------AATGGT-TC-TGGAGAAGA--------ACA----TTT-T--------------ATGCAAAACTGAGATC-CCCT-ATTGTGGCCCC-TCC----CTACCCCC--------GGGG--G--T--A-----TGATCTGCTCAAATTTG-GAT--CT--AC--TA-T-ATGTCAG--GAACCTTTAAGGTAAATATT--GT--TT--C-T--TCTGG---TC-C---A-A---T----GGT-T--------CT-T----GA---GAA-GACGATTT-TT-----AAA-G--A--------T-TTTCCC-TA----T-AT-A-TTCT--T---AT-GTAAA-------AC---T-TTGATCCC-CT-----A-T----TGTGG-C--CCCATCG-T--A-C-C-CC--G-GGG--GT-C-ATG--ATT--TGAA------------CAAA--C-TT-G-AA---TC-T-TCA-CTAT-A-TCAGGA-A---GCTT-TCATA-TAA------AT-T---T--A-AG-TT---T--T--T----CTGGCC-CA-G---T----G-GTT--------CT-T----------G----A-------------G-------------A-------A--------------G-A-------------TT----------T-----------CC-CCTA-----T-A-CA---TTC-A-CA-T--G-TA--A-A-AA-TC---TT--ATC---CC--C---------T-------A--A---T---G------G-CC---CC-ATGGTACCCC-CGGGG-T--TTATGATTTGAA-CAAA-A----T--GGAA---TC--T-TCA-C-T-AT-TTC-A-----GG-AAGCTT-T----CA--TAT-C-AATTTCAGC-TT-T---TCT-GTCCCAG---T----G-GT-TC---T---T------G---AG---AA---G---A-----TTTTT---AAA-GA-------T--T--------T------------------AT----AT----A--------T---A-A-----A-------A----C---------T-TTG-ATT---------CC-C-T----AA-T---A-TGG-CCCCACCG--TA--CCCA-AGGAGGGTCGTGG--T-------TTGAA------------C-AAA--C-TT-GA--ATCTCCAT----TAT-ATCAGGA-A----GCTT---TTATAT-CAA----------TTTCAGC--TTC--TCT-G----ACC-A-----AAT-GGT--TCTTG-------TCA-A--AGAAG---A-TT-TT-----T-----------AAATG-AT--------AC-CA--------C-CCT-ATT----TTT---GCA-----------------CCATTTGA-----A-----AGGGGT----CA-GGT-CCT-----TCAT--T-T----GAAC-AAACTTGA---ATC-CC--C--TTTA-CCCAA-GG-----ATGATTT---GC---A-C-CA---AG----TTT--G----GT-TGA-AT-T-T-----G--------G--C-------CC------AG------T---A--GT---TCTGGAGAA---GAA--G--A--TGAAA-ATGTG---AAA--AGTT-TA--C-A-AC-----A-A--CA-----AC---------GATT----ACTGACA--------ACGGGAA-AATTTTG---ATCAG--AATA-GCTCACTTAAGCAT---TCGGGTCAGGTGAGC-TAAAAA
gi|1 : AACTGAATCTCCTTCACCCAAGGGATGATTGGTATCAAGTTTG--GTTGAATAT-T--GGCCC------AGTGGTCTC-TTGAGAAAA--------A
gi|10 : acaagaggcccatgggccacatcgctcacctgagtgaccttggccctcgcactctatatcaggaagctttaaggtaaatgttgtaactttggtcttgagaagattacccctatatataatcatgtgtaaaactttgatccctattgggcgcccaccatcgtacctccgggggtcatgatttgaacaaacttgaatctccttatatcacggaagcgtcataaaatatcagctttcctggtccccagtgggttttgagaagaaaactttttaaaaaattttccctgattcttgaaacaaatttgcaatcccactatatcagtagagctttccaatgaatctcagctttcctggcccaaggttggttttcttttcctttttcgaacagaagaagatttttaagacttcctcaatatcaatcacatgctaaaccttgatccctattgtggcccctcgtaccccgggggtcatgatttgaaccaaactttaatctccactatattcaggacttcccatattaatctcagcttcctggtccagacatgtgttcttcgaaagaatttttaaaggatttttccctatataatcatatgtagaaactcttgatcccataattgtggcccatcataccccaggggtcaatttgaacaaaacttgaatctcctctatattaggagcttccatatacaatttcagctttcgtctggcccagtggttcttgaagaagaagaattgttttgttaaaatcacaccacctattttttgcgcattgtttgtgattatctcccctttgaaggggctcggtccttcattgaacaTCT--TCAACC-AAGG-ATAATTTGTGCAACGTTTG--GTTGAA-AT-T--GGCCT------AGTGGT-TC-TGGAGAAGgtcgaaaatgtgaaaagttagacgacagacagaagg
gi|6 : ggggatcatgaattgaacaaacttaaatatctcctacatcaggtagctttaatgccaatctcagcttttccggcccaatgattctcgagaagatttttaaagattttccctttatatccacatgtaaaactttgatcccctattgtgtccccatcttacccctgggggtcatgatttgaacaaacttgattttccactataccaggaaggttctggagaagatgatttgtaaatgaccacaccttattttgcattttggtgattatcttgcctttgaagggggcctagtccttcattcgaacaaacttgaattcCT--TCACCCC--GG-ATGATTTGTA--AAGTTTG--GTTGAA--T-T--GGCCCCC----AGTGGT-TT-TGGAGAAGA--------Attgaaaatgtgaaaagttaacagacagacaaaagacagacaaagggcaatcagaaaaaaactcacttgagtcttcggctcaggcgagctaaaa
gi|17 : ttttgctttactgagtttgtttcttcatacgatcatgaagaaatttgtttaaaagatctttccctatatatcaaatgcaaaactataaccccctattgtggcatagtaccccctggggatcatggtttgaacaacttgaatatacattataatcaggaagctttcattaaatttgcagcttttctgcccagtggtcttgagaaagaagattttaaagattgtccctatatattcacatgaaaattttgatctcctactgtaccccaagtactccgggtcatatttgaaacaacttgaatctcctattctggaagctttcatataaattcagcttttttagccgtagtggttcttcagaagaagaagatttttaaagattttccctttatattcacatgcaacaactttgatccactaatgttggccctcgtccccggagtcatgattgaaccaaacttgaatctcaattatattaagaacttatataattcagcttttctgggccaggttcttgttgagaatgttataaatggggcacaccctattttgcatttttgtgatatctctcctttgaaggggtctgagtcttctttgagcaaacctaaagtccCT--TCA-CCCAAGG-ATGATGTGTACCAAGTTTG--GTTGAA-TT-T--G-CCC------AGCGGT-TT-T-GAGAAGA--------Atcgatgtgaagttaaagacagaacgacagtcagggacagacgacggagaaaggcaatcagaaaagctcattgcccacaagtgagctatataaa
gi|16 : accaccctatttttgcattttcgtgattatctcccctttgatgagggcctggtccttcatttgaacaaaattgaagcccCT--TTA-TCCAAGG-ATGATTTGCACCAAGTTTG--GTTGAA-ATGT--G-CCC------AGTTGT-gttgaaaatttggaaagtttacgacgacccaacggctcaggtgagctaaaaataggtcagagattaaatactcg
gi|4 : accacaccatttattttatttctgtattatctcccctttaagggacccggtccttcctttaattgaacaaacatgaatccACCGAAGA-ATGATTTTTACTAAGTTTG--GTTGAA-TT-T--GGTCC------AGTGGT-TC-TGGAGAAGA--------Actaaatgtgaaaagttaacggacaacgtgcagatgacggacaacaggcgatcagaaaagctacttgcctcggctcaggtgacta
gi|5 : actatatcaggaatctttcatataaagcttttcctgcccagtggttctcaagaacattttccctatatattcacatgtaaatctttgatcccctattttggccccaccgtctccctgggggtgatgatttgaacgaatttcaatctccactatatcaggaagctttcatatgaattttggcttttctggccaagtggttcttgagaagaagatatttaaagattttccctatatattcacatgtaaaactttgatccccctattgccctattgtagccccaccatatccccagggatcatgatttaaacgaatttcaatctccactatatcaggaagctttcatatgaattttggcttttctggccaagtggttcttgagaagaagatatttaaagattttccctatatattcacatgtaaaactttgatccccctattgccctattgtagccccaccatatccccagggatcatgatttaagcgaatttcaatctccactatatcaggaagcgtacattaaaaatttcagcttttctggtccagtggttcttgagaatatttttaaatgacaccacccaatttttacattttcgtgattatatcccctttgaagaaagcccagtacttcattttaacaagcttgaatcccctgcACTCGAGG-ATGATTTGTACCAAGTTTG--GTTGAA-TT-T--GGTCCAGCGTGAGCGGT-TC-TGAAGAAGgtcgaaaatgtgaaatgttaacggacagacagatagacagaaagacggactgactgacatacgacggacaggaggcgatcagaaaagctcgattgag
gi|10 : ttgtggccccattttgatccctgggaccactatttgaacaaactttaatttacactttgcaatgatgctttcatattaatttgacatttttgaacattcactattcttcagatgaagattttttttaaaaagttatttttgataaacttatgctaaattttgcccattactgtcccccacccttaaccctgggtcaccatttgaacaaacttgaatttacacttcctcaagaagctttcacataagtttggtaatttctgtcctagtggttctggagaagaatttcccttatatcagcatgtaaaactttgattgcgatcccatcctacctcatggaacacaatctgaacaaaaagttgaatctactccatattaggaagctttcagaccaggtacaaggagtcttgagaagaacattttgaagaatttccctatatattcgcatgtttaactttgatcccctattgtggttcctacttatcccgggggtcaaaatttcaacatttttgaatctccgctatatcaggaagctttcatataaatttcagtctttctagaaaagcggttcttgaaaaaatagttctaaatgacaccatcctatttctgcattttcatgattatccctggtccttccctgcTTAATGCCAA-TCTCAGCTT-----T-TCCGGCCC------AATGAT-TC-TCGAGAAGATTTTTAA-AGA----TTT-TCCCTTTATATCCACATGTAAAACTTTGATC-CCCT-ATTGTGTCCCC-ATC----TTACCCCT--------GGGG--G--TC-A-----TGATTTGAACAAACTT--GAT--TT--TC--CACT-ATACCAG--GAAtggaaaatgtgaaaagctaacagacagatagatggacagacgacagacaaaaggagaccatgagaaaaactcacttgaatctttagatcatgtgaagtaaa
gi|23 : ggggatcatgaattgaacaaacttaaatatctcctacatcaggtagctTTA-TGCCACATTTG--TTTGAA-AT-T--TACCA------AATGGT-CG-TGCAGAAAA--------Aggttctggagaagatgatttgtaaatgaccacaccttattttgcattttggtgattatcttgcctttgaagggggcctagtccttcattcgaacaaacttgaattctcttcaaccaaggataatttgtgcaacgtttggttgaaattggcctagtggttctggagaagttgaaaatgtgaaaagttaacagacagacaaaagacagacaaagggcaatcagaaaaaaactcacttgagtcttcggctcaggcgagctaaaa
gi|11 : ttgaagagcagcccctcatcatcatgaactttgaatctcccttcatgtaatatgACCAAATTTG--GTTGAA-TTAT--GGCCC------AGCGGT-TC-TGGAGAAGG--------Agtgaaaacagttgattatgaggaaagagctttgcattagaaaactcagtaacttttttcagctc
gi|7 : aagcttttctggcccagttccaggttcttgagaagaagatttttaaatattttccctatttaaacacatgtaaataattaaattatgataccctaatgtggccccatcataccccccggggtcatgatttgaacaaactcaaatctctactatatcaagaagctttgatataaatttaagctttttttggcccagtggttcttgagaagaagatttttaaatgacaccaccctagttttgcattttcgtgattatctcctctttcatgagggcctagtccttcatttgaacaaacttggatccccttcacCAAGTTTC--CTTAAA-AC-T--GACCC------AGTGGT-TC--GGAGAAGA--------ACA----TTT-T--------------ATGCAAAACTCCGATC-CCTT-ATTGTGCCCCC-CCC----CAACTCCG--------GGGA--G--TT-A-----TGATCTGATAAATTTTG-GAT--CT--AC--CC-T-ATCTCAG--AAAGCTTTCAGGTAAATATT--GT--TT--C-T--TTTGG---TC-C---A-A---T----GGT-T--------CT-T----GA---GAA-AATGATTT-TT-----AAAAG--A--------T-TTTCCC-TA----T-AT-A-TTTA--C---AT-GTAAG-------AC---T-TTGATCCC-CT-----A-T----TGTGG-C--CCTATCG-T--A-CTC-CC--G-AGG--GT-C-AAG--ATT--TGAA------------CAGA--C-TT-G-AA---TC-T-CCA-TTAC-A-TCAGGA-A---GCTT-TCTTA-TAA------AT-T---T--C-AG-CT---T--T--T----CTGGCC-CA-G---T----G-GTT--------CT-T----------C----A-------------GAAAAAGATTTTTAA-------A--------------G-A-------------TT----------T-----------CC-TCTAGCCATT-A-TA---TTC-A-CA-T--G-TA--C-A-AC-TT---TT--GAT---CC--C---------T-------A--AGG-T---G------T-CC---CC-ATCGTA-CCC-CGGGG----TCATGA-TTGAA-C--A-A----T--TGAA---TC--T-CCA-C-agtcgaaaatgtgaaaagttaacagacagacaacatacaaaaggcgatcagaaaagctcacttgagcctttggctcaggtgagctaata
gi|8 : tgcgtgtaattaaactctgaatttagaatttttagtatttattttaaaagcatgtatagacaacaagaggcccatgggccacatcgctcaccttggccctggctcagcagtggtgattttgaaaagaattttAAATTTC-------A-AC-T--GGTCC------AGTGGT-TT-TTGAGAAGA-----------------T-T--------------ATGCAAAccggggacctcttcactat
gi|15 : cctattctctttagagaagtggacagacatagcctggatgtaggctatgcctgtccacttctctaaagagaatacccctaccccaattctctgcatgtgaaattttgatctcatattatggccccatcaataccctgtggaccgttttaaaaaacacacacaccaaaaacttgaatctgcatcatgtcaggaagttttcaacttttctagtcaagactagtggttttgagaagaatctaaaagattttatgtataacagatttgatcatctattgtggccccacaggggtcatgaattgaacaaacttgaatctagtccatgccaggaagctttagggcaaattttaattttcctcacaaagtagttctttcctatacatccgcatgtacacaactttcatcccctaatgttgccccaatcgtaatatccatacgctgcatcaagaagctttgatgtAAATTTG--ATTGAA-AT-T--AGCCC------TGCAGT-TA-TGGAGAAGA--------ttatttaatttcattttaaggtgattac
gi|32 : taattttcagcttttcttgcccagtgattcttataagaatcctacttttgcattttcttgattttctcccctttcaaaggagcatgtttttttttaacatgatcaatcccgctttatgggGTTTA--GTTGAA-AT-T--GATCC------AACGAT-TC-CGGAGAAGgatcgaaagaaaaaaagtatacagatggacagacagacaacggacaaaatataagcttttggctcaggtgagcttaaaaaa
gi|29 : TTGAA-AT-A--AGTCT------AATTGT-TC-TGGAGAAGttgaagacgacggagaccgagatattaaacagaaaagctgagctcacttcagtcctcagatcaagt
gi|39 : actctatgtttgacttttcttgattatctcccttcatttctacaaacttgaattttgaatttccttaactaaagttggGAA-TT-T--GGTCC------AGTGGT-TC-TAGAGAAGA--------Acatcgtcggaa
gi|11 : T-T--GGCCC------AGTGGT-TC-TTGAGAAGA--------AGA----TTT-T-----------------TAAA--TGACACCACCCT-AGTTTTGCATT-TTCGTGATTATCTCCTCTTTCATGAGG--GCCT--AGTCCTTCATTTGAACAAACTTG-GAT--CC--CC--T-------TCA----CACC--------AAAT-TT--GG--TTGAA-T--TATGG---CC-C---A-G---C----GGT-T--------CT-G----GA---GAA-Gggtgaaaatgtgaaaagtttataacgacggcgacgacaacaga
gi|13 : aagcttttctggcccagttccaggttcttgagaagaagatttttaaatattttccctatttaaacacatgtaaataattaaattatgataccctaatgtggccccatcataccccccggggtcatgatttgaacaaactcaaatctctactatatcaagaagctttgatataaatttaagctttttT-T--AGCCT------AGTGGT-TC-TTGAGAAGATTTTTTCTACC----TAT-TCAC-----------ATGTACAACTTTGATT-CCCT-ATTGTGGCCCC-ATC----GTATCTCC--------TGGG--G--TC-A-----TGATTTTAATAAAGTTG-AATATCC--AC--TA-T-ATG--AG--GAAGCTTTCATATAAATTTC--AT--CT--T-C--TCTGG---CC-C---A-A---T----GAT-T--------CT-T----GA---TGA-GAAGAATT-TT-----GAA-G--A--------T-TTGCCC-TA----T--T-A-TTCA--C---AT-GTAAA-------AC---T-TTGATCCC-Cgaagtcgaaaatgtgaaaagttaacagacagacaacatacaaaaggcgatcagaaaagctcacttgagcctttggctcaggtgagctaata
gi|1 : cagggcttccgtagtttcagctttt-T--GGCCC------AGTGGT-TCTTGAAGAAGA--------AGAATTGTTT-T--------------GT-TAAAA-TCACACC-ACCT-ATT
gi|9 : acaagaggcccatgggccacatcgctcacctgagtgaccttggccctcgcactctatatcaggaagctttaaggtaaatgttgtaactttggtcttgagaagattacccctatatataatcatgtgtaaaactttgatccctattgggcgcccaccatcgtacctccgggggtcatgatttgaacaaacttgaatctccttatatcacggaagcgtcataaaatatcagctttcctggtccccagtgggttttgagaagaaaactttttaaaaaattttccctgattcttgaaacaaatttgcaatcccactatatcagtagagctttccaatgaatctcagctttcctggcccaaggttggttttcttttcctttttcgaacagaagaagatttttaagacttcctcaatatcaatcacatgctaaaccttgatccctattgtggcccctcgtaccccgggggtcatgatttgaaccaaactttaatctccactatattcaggacttcccatattaatctcagcttcctggtccagacatgtgttcttcgaaagaatttttaaaggatttttccctatataatcatatgtagaaactcttgatcccataattgtggcccatcataccccaggggtcaatttgaacaaaacttgaatctcctctatattaggagcttccatatacaatttcagctttcgtcCC------AGTGGT-TC-TTGAAAAGA--------AGA----TTT-T--------------ttttgcgcattgtttgtgattatctcccctttgaaggggctcggtccttcattgaacaaactgaatctccttcacccaagggatgattggtatcaagtttggttgaatattggcccagtggtctcttgagaaaaagtcgaaaatgtgaaaagttagacgacagacagaagg
gi|20 : agaagctttcatataattatatattcatacatttactgtcccgtggttctgagaagatttttaaagattttcccctattatattcaatgcaaaattttgattccctaattgtggcccatagtaccctaggggtcattatttgaacaaacttgaatctccactatatcagaaagctttcatatcattcagctttttgaccagtgtttatgagaagattattaaagattttccctaatgttcacatgtcaaactttatccctattgtggccccatctaccccagaggacataatttgaataaacattgaatctccactataaggaagctttatatttatttcagcttttctgggaagaagattcacaggtaaaactttgatcccctattgtggcccatcgtaccccgggtctatatttgaacaaacatgaatctccactatatcaggaaactttcatgtaaatttcagcttttctggA--------ATA----TTCGC--------------ATGTAAAACTTTGATT-CCCT-ATTGTAGAACC-ACC----CTACCCAA--------AAGGCAA--T--A-----GTATTTG--CAAATTTG-AAT--CT--GCA-CA---ATGCCAG--AAAGCTTTTATGTA
gi|9 : atgttagaaagtaattttccacttttctggcccagttgttcgtgagagtttttaaaaattcccata--------ATA----TTC-A--------------ATGCAAAATTTTGATT-CCCTAATTGTGGCCCA-T-A----GTACCCTA--------GGGG--T--C--A-----TTATTTGAACAAACTTG-AAT--CTCCAC--TA-T-A--TCAG--AAAGCTTT------CATATC--AT--TCAGC-T--TTTTG---AC-C---A-G---T-----GT-T--------TA-T----GA---GAA----GATTA-TT-----AAA-G--A--------T-TTTCCC-TA------AT-G-TTCA--C---AT-GTCAA-------AC---T-TT-AT-CC-CT-----A-T----TGTGG-C--CCCATC--T--A-C-C-CC--A-GAG--GA-C-ATA--ATT--TGAA------------TAAA--CATT-G-AA---TC-T-CCA-CTAT-A---AGGA-A---GCTT-T-ATA-TTT------AT-T---T--C-AG-CT---T--T--T----CTGG-------------------------------------------------------------G-------------A-------A--------------G-A---------------------------------------------------A-GA---TTC-A-CA-G--G-TA--A-A-AC-TT---TG--ATC---CC--C---------T-------A--T---T---GT-----G-GC---CC-ATCGTACCCC---GGG-T--CTAT-ATTTGAA-CAAACA----T---GAA---TC--T-CCA-C-T-AT-ATC-A-----GG-AAACTT-T----CA--TGT-A-AATTTCAGC-TT-T---TCT-G-GCCAG---T----G-GT-TC---T---T------GAAAAG---AA---G---A-----TTTT
gi|6 : agaagctttcatataattatatattcatacatttactgtcccgtggttctgagaagatttttaaagattttcccctatt--------------ATGCAAAACTATAACC-CCCT-ATTGTGGCATA-G-------TACCCCCT-------GGGG--A--TC-A-----TGGTTTGAACAA-CTTG-AAT--AT--ACATTA-T-A-ATCAG--GAAGCTTTCAT-TAAAT-TT--GCAGCT--T-T--TCTG----CC-C---A-G---T----GGT----------CT-T----GA---GAAAGAAGATTT-T------AAA-G--A--------T-TGTCCC-TA----T-AT-A-TTCA--C---AT-G-AAA-------AT---T-TTGATCTC-CT-----A-C----TGTA--C--CCCA-AG-T--A-C-T-CC--G-GG----T-C-AT---ATT--TGAA------------ACAA--C-TT-G-AA---TC-T-CC---TAT---TCTGGA-A---GCTT-TCATA-TAA------AT-T---C--A--G-CT---T--T--T----TTAGCCGTA-G---T----G-GTT--------CT-TCAGAAG----A----A-------------G-------------A-------A--------------G-ATTTTTAAAGA---TT----------T-----------TC-CCTT-----T-A-TA---TTC-A-CA-T--G-CA--A-C-AA-CT---TTG-ATC---CA--C---------T-------A--ATGTT---G------G-CC---C---TCGT--CCC-CGGAG----TCATGA-TTGAACCAAA-C----T--TGAA---TC--T-CAA-T-T-AT-ATT-A-----AG-AA-CTT-------A--TAT---AA-TTCAGC-TT-T---TCT-GGGCCA---------G-GT-TCTTGT---T------G---AG---AA---
gi|21 : ttttgctttactgagtttgtttcttcatacgatcatgaagaaatttgtttaaaagatctttccctatatatcaaTGTACAACTTTGATC-CCTT-TTTGTGG-CCT-TTC----CTACCCA---------------------A-----AGATTTGAACAAATTGA-AAT--CT--Atgttataaatggggcacaccctattttgcatttttgtgatatctctcctttgaaggggtctgagtcttctttgagcaaacctaaagtcccttcaccccggatgatttgtaaagtttggttgaattggcccccagtggttttggagaagaatcgatgtgaagttaaagacagaacgacagtcagggacagacgacggagaaaggcaatcagaaaagctcattgcccacaagtgagctatataaa
gi|11 : aagctttcaactgtattctactttctggcccagttgttcgatgggaagattttaaagatgcttccctaatatgctgcatAAATTATGATA-CCCT-AATGTGGCCCC-ATC----ATACCCCC--------CGGG--G--TC-A-----TGATTTGAACAAACTCA-AAT--CT---C--TACT-ATATCAA--GAAGCTTTGATATAAAT-TTAAGC--TT--T-T--TTTGG---CC-C---A-G---T----GGT-T--------CT-T----GA---GAA-GAAGATTT-TT-----AAATG--A--------CACCACCC-TAGTTTT-GC-A-TTTT--C---GT-G-----------AT---T----ATCTC-CT-----C-TTTCATGAGG-G--CCTA--G-T--C-C-T-TC-------------------ATT--TGAA------------CAAA--C-TT-G-GA---TC-C------------------------CCT-TCACACCAA------AT-T---T----GG-TT---GAAT--T----ATGGCC-CA-G---C----G-GTT--------CT-G----------G----A-------------G-------------A-------A--------------G-tcctgatcagaggcgttcatgaaatcc
gi|27 : aagcttttctggcccagttccaggttcttgagaagaagatttttaaatattttccctatttaaacacatgtaaataattAGCTC-CCCT-ATTGTGGCTCA-AAC----CTACCCCT--------GGGG--G--CA-A-----TGATTTGAATAGATTGG-AAT--CT--AC--TT-T-ATATAAG--AAAACTTCA--TTAAATAgaagtcgaaaatgtgaaaagttaacagacagacaacatacaaaaggcgatcagaaaagctcacttgagcctttggctcaggtgagctaata
gi|3 : ccctatacatgtacataggcatcaaaGATC-CTTT-G--GTGGCCCA--CA----TTACCCT----------GGG--G--TTCA-----TGAATTGGACAGCTTTT--ATG-CTC-GC--TA-T-AT--CAG--GAGCTTATA---CAAATCTA--AG--CT--T-T--CCTGG---CC-CTTTA-T---T----GGTCT--------CT-T----GAC--GAA-GAT--TTT-TT-----AAA-G--A--------T-TTTCCCATA----T-AT-A-ATCTGAT---AT-ATAAA-------TC---TATTGATTCC-CT-----AAT----TGGGG-C--CCCATTG-T--A-C-C-CCT-G-GGG--GTGC-ATG--AAT--TAGA-------------AAA--CGTT-G-AA---TC---TAA-CTAT-A-TCAGGA-AAATG-TT-TCATA-TAA------AT-T---C----CG-AT---T--T--T----C-GGCC-TA-G---TG---G-GTT--------CT-T----------G----A-------------G-------------AAT-----A--------------G-AAGATTAAAGAAT-TT----------T-----------TC-CCTA-----T-A-TA---ATC-A-TA-C--G-TA--A-C-AA-CT---GT--TTT---CC--C---------T-------A--T---T---GAACCGTG-CC---CCTATCGTACCCC-CGGGA----TCATGATTTGAA-CGAA-ATTTTT--TGAA---TT--T-CCA-CAT-AT-ATC-A-----GGAAAGCTT-T----CA--TATACAAATTTCAGTACT-T---TCT-AGCCC-G---T----G-GTGTC---C---TG-----G---AG---AA---G---ATTTTTTTTTT---AAA-GA-------T--T--------TTTCCATTATAAATC----AT----AT----G--------T---G-A-----A-------ATACTC---------T-TTG-A-T---------CC-C-T----CA-T---A-TGG-CCTCATCG--TA--CCCC-GGGA--GTCATTA--T-------TTGAA------------C-AAA--C-TT-GA--ATCTCCAT----TAG-ATCAGAA-A----TTTT---TCATTT-AAA----------TTTCAGC--TTT--TCT-A----GTC-C-----AGT-GGT--TCTTG-------actgcatactattggtgtgcatt
gi|43 : cttataagaatctatctctacaatacgtttgtaagattgctttatccctaatttgtgccacccaacccccggggggtttacgaggcattaatctgaaaaactcaatctacgtccaaatatcgatgaagttcaggataatatccactttcttgtgttcaatgtatgtattttttaaaagaatttccctactaatataattgcactgtaaaaatattctGATC-CCTT-ATTGTGACTGC-ACA----TTACCCCT--------AGGG--G--TC-A-----TGATTTGATCAAAagaacaaaa
gi|49 : taaaatgttGATC-CCCT-ATTGTGGCCCc
gi|5 : ctttTTGTGGCCCCATTT----TGATCCCT--------GGGA--C--C--A-----CTATTTGAACAAACTTT-AAT--TT--AC--AC-T-TTGCAAT--GATGCTTTCATATTAAT-TT--GA--CA--T-T--TTTGAACATT-C---A-C---T----A-T-T--------CT-T----CA---GAT-GAAGATTT-TTTTTAAAAA-GTTA--------T-TTTTG---A----T-AA-A---CT--T---AT-GCTAA-------AT---T-TTG--CCCATT-----A-C----TGTC--C--CCCACCC-TTAA-C-C-CT--G-GG----T-C-ACC--ATT--TGAA------------CAAA--C-TT-G-AA---TT-T-ACA-CTTC-C-TCAAGA-A---GCTT-TCACA-TAA------GT-TTGGT--A-A-------T--T--T----CTGTCC-TA-G---T----G-GTT--------CT-G----------G----A-------------G-------------A-------A--------------GAA-------------TT----------T-----------CC-CTTA-----T-A-------TC-AGCA-T--G-TA--A-A-AC-TT---TG--ATT---GC-------------------------------G------A-TC---CC-ATCCTACCTCATGGAA-----CACAATCTGAA-CAAA-AAG--T--TGAA---TC--T-ACT-C-C-AT-ATT-A-----GG-AAGCTT-T----CA--GAC-C-AG-------------------GTACAAG--------G-AG-TC---T---T------G---AG---AA---GAACA-----TTTTG---AAG-AA-------T--TTCCC----T------------------AT----AT----A--------TTCGC-ATGTTTA-------A----C---------T-TTG-ATC---------CC-C-T----AT-T---G-TGG-TTCCTACT--TAT-CCC----GGGGGTCAAAA--T-------TTCAA------------C-ATT--T-TT-GA--ATCTCCGC----TAT-ATCAGGA-A----GCTT---TCATAT-AAA----------TTTCAGT--CTT--TCT-A----GAA-A-----AGC-GGT--TCTTG---------A-A--AAAAT---A-GT-TC-----T-----------AAATG-AC--------AC-CA--------T-CCT-ATT----TCT---GCA-----------------T--TTTCA-------------TGAT----TA---T-CCC-----TGGT--C--------------CTT---------CC--C--TGCA-CTCGA-GG-----ATGATTT---GT---A-C-CA---AG----TTT--G----GT-TGA-AT-T-T-----G--------G--T-------CCAGCGTGAG------C---G--GT---TCT---GAA---GAA--G--T--GGAAA-ATGTG---AAA--AGCT-AA--C-AGAC-----AGA--TAGATGGACA--------GACG----ACAGACA--------AAAGGAG-A----CC---ATGAG--AAAA-ACTCACTTGAATCT---TTAGATCATGTGAAG-TAAAtatcata
gi|10 : --------GGGG--A--TC-A-----TGAATTGAACAAACTTA-AATATCT--CC--TA-C-AT--CAG--GTAGCTTTAATGCCAATCTC--AG--CT--T-T--TCCGG---CC-C---A-A---T----GAT-T--------CT-C----GA---GAA-GA---TTT-TT-----AAA-G--A--------T-TTTCCC-TT----T-AT-A-TCCA--C---AT-GTAAA-------AC---T-TTGATCCC-CT-----A-T----TGTGT-C--CCCATCT-T--A-C-C-CCT-G-GGG--GT-C-ATG--ATT--TGAA------------CAAA--C-TT-G-AT---TT-T-CCA-CTAT-A-CCAGGA-A---GGTT-
gi|1 : CAAATTTGCAAT--CCC-AC--TA-T-AT--CAGTAGAGCTTTCCAA-TGAATCTC--AG--CT--T-T--CCTGG---CC-C---A-AGGTT----GGT-TTTCTTTTCCT-TTTTCGAACAGAA-GAAGATTT-TT-----AA--G--A--------C-TTCCTC-AA----T-ATCA-ATCA--C---AT-GCTAA-------AC---C-TTGATCCC--T-----A-T----TGTGG-C--CCC-TCG-T--A-C-C-CC--G-GGG--GT-C-ATG--ATT--TGAAC-----------CAAA--C-TT-T-AA---TC-T-CCA-CTAT-ATTCAGGA------CTTCCCATA-TTA------AT-C---T--C-AG--C---T--T--C----CTGGTC-CA-GACAT----GTGTT--------CT-T----------C----G-------------A-------------A-------A--------------G-AATTTTTAAAGGATTT----------T-----------TC-CCTA-----T-A-TA---ATC-A-TA-T--G-TA--G-A-AACTC---TTG-ATC---CC--A---------T-------A--ATTGT---G------G--C---CC-ATCATACCCC-AGGGG-T-----CAATTTGAA-CAAA-AC---T--TGAA---TC--T-CCT-C-T-AT-ATT-A-----GG--AGCTT-C----CA--TATAC-AATTTCAGC-TT-TCG-TCT-GGCCCAG---T----G-GT-TC---T---T------GA--AG---AA---G---A-----ctggagaagatgatttgtaaatgaccacaccttattttgcattttggtgattatcttgcctttgaagggggcctagtccttcattcgaacaaacttgaattctcttcaaccaaggataatttgtgcaacgtttggttgaaattggcctagtggttctggagaagttgaaaatgtgaaaagttaacagacagacaaaagacagacaaagggcaatcagaaaaaaactcacttgagtcttcggctcaggcgagctaaaa
gi|8 : acaagaggcccatgggccacatcgctcacctgagtgaccttggccctcgcactctatatcaggaagctttaaggtaaatgttgtaactttggtcttgagaagattacccctatatataatcatgtgtaaaactttgatccctattgggcgcccaccatcgtacctccgggggtcatgatttgaacaaacttgaatctccttatatcacggaagcgtcataaaatatcagctttcctggtccccagtgggttttgagaagaaaactttttaaaaaattttccctgattcttgaaaAAACTTG-AAT--CT--GC---A-TCATGTCAG--GAAGTTTTCA-------ACT---T--TT--C-TAGTCAAG---AC-T---A-G---T----GGT-T---------T-T----GA---GAA-GA--ATCT-A------AAA-G--A--------T-TTT---------------------------AT-GTATA-------ACAGAT-TTGATCAT-CT-----A-T----TGTGG-C--CCCA--------------C--A-GGG--GT-C-ATG--AAT--TGAA------------CAAA--C-TT-G-AA---TC-T-AGT-CCAT-G-CCAGGA-A---GCTT-TAGGG-CAA------AT-T---T--T-AA-TT---T--T--C----CTCACA-AA-G---T----A-GTT--------CT-T-----------------------------------------------------------------------------------------------------------T-CCTA-----T-A-CA---TCC-G-CA-T--G-TA--C-A-CA-AC---TTTCATC---CC--C---------T-------A---------------------------ATGTTGCCCC--------------AAT------CGTA-A----T-----A---TCCAT-ACG-C-T-GC-ATC-A-----AG-AAGCTT-T----GA--TGT-A-AATTTCAAC-T----------GGTCCAG---T----G-GT-TT---T---T------G---AG---AA---G---A-----TTagaattgttttgttaaaatcacaccacctattttttgcgcattgtttgtgattatctcccctttgaaggggctcggtccttcattgaacaaactgaatctccttcacccaagggatgattggtatcaagtttggttgaatattggcccagtggtctcttgagaaaaagtcgaaaatgtgaaaagttagacgacagacagaagg
gi|4 : cctattctctttagagaagtggacagacatagcctggatgtaggctatgcctgtccacttctctaaagagaatacccctaccccaattctctgcatgtgaaattttgatctcatattatggccccatcaataccctgtggaccgttttaaaaaacacacacaccaa--AC--TA-T-AT--CAG--GAATCTTTCATATAAA------GC--TT--T-T--CCTG----CC-C---A-G---T----GGT-T--------CT-C----AA---GAA---C--------------------A--------T-TTTCCC-TA----T-AT-A-TTCA--C---AT-GTAAA-------TC---T-TTGATCCC-CT-----A-T----TTTGG-C--CCCACCG-T--C-T-C-CCT-G-GGG--GT-G-ATG--ATT--TGAA------------CGAA--T-TT-C-AA---TC-T-CCA-CTAT-A-TCAGGA-A---GCTT-TCATA-TGA------AT-T---T--T-GG-CT---T--T--T----CTGGCC-AA-G---T----G-GTT--------CT-T----------G----A-------------G-------------A-------A--------------G-AAGATATTTAAAGATT----------T-----------TC-CCTA-----T-A-TA---TTC-A-CA-T--G-TA--A-A-AC-TT---TG--ATC---CC--CCTATTGCCCT-------A--T---T---GTA----G-CC---CC-ACCATATCCC-CAGGG-A--TCATGATTTAAA-CGAA-T----T--TCAA---TC--T-CCA-C-T-AT-ATC-A-----GG-AAGCTT-T----CA--TAT-G-AATTTTGGC-TT-T---TCT-GGCCAAG---T----G-GT-TC---T---T------GAGAAG---AA---G---A-----TATTT---AAA-GA-------T--TTTCCC---T------------------AT----AT----ATTCACATGT---A-A-----A-------A----C---------T-TTG-ATCCCCCTATTGCC-C-T----AT-T---G-TAG-CCCCACCA--TATCCCCA-GGGA---TCATGA--T-------TTAAG------------C-GAA--T-TT-CA--ATCTCCAC----TAT-ATCAGGA-A----GCGTACATTAAA---AA----------TTTCAGC--TTT--TCT-G----GTC-C-----AGT-GGT--TCTTG--------------AGAAT---A-TT-TT-----T-----------AAATG-AC--------AC-CA--------C-CCA-ATT----TTT---ACATTTTCGTGATTATATC-CCCTTTGA-----A-----GAAAGC----CC-AGT-ACT-----TCAT--T-T----TAAC-AAGCTTGA---ATC-CC--C--TGCA-CCGAA-GA-----ATGATTT---TT---A-C-TA---AG----TTT--G----GT-TGA-AT-T-T-----G--------G--T-------CC------AG------T---G--GT---TCTGGAGAA---GAA--G--T--CGAAA-ATGTG---AAA--TGTT-AA--CGG-AC-----AGA--CAGATAGACAGAAAGACGGACTG---ACTGACATACGACGGACAGGAG-G----CG---ATCAG--AAAA-GCTCGATTGAGatgcaaattatttaatttcattttaaggtgattac
gi|19 : TTAG--GAAGTTTTCATGTAAA-ATA--GT--CA--CAT--TCTGG---TCGC---ATG---T----GGT-C--------CT-T----AA---GAA-GAC-ATT
gi|35 : AGATAT---GT--TT--A-T--TCTGG---TC-C---A-C---T----GGT-T--------CT-T----GA---GAA-TACcaaatgcccacaacctagtttgggcattttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattatctctcctttaaaaggggaatagtcctgcatttgaacaaaacatgaatat
gi|21 : gaggatccatggtttgaacaagaagatgaagaagcttctacacaTATT--CT--AC--T-T--TCTGG---CC-C---A-G---T----TGT-T--------CGAT----GG---GAA-GA----TT-TT-----AAA-G--A--------TGCTTCCC-TA------AT-A-TGCTG-C---ATTGTACA-------AC---T-TTGATCCC-TT-----T-T----TGTGG-C--CTT-TCC-T--A-C-C-C-------------A-AAG--ATT--TGAA------------CAAA--T-TG-A-AA---TC-TATC--CTG--A-TCA-GA-G---GCGT-TCATG--AA------AT-ccatcccc
gi|6 : aagctttcaactgTT--GT--TT--C-T--TC--A---TA-C---G-A---T----CAT-----------------------GAA-GA-AATTTGTTTA---AAA-G--A--------TCTTTCCC-TA----T-AT-A--TCA--A---AT-GCAAA-------AC---T-ATAACCCC-CT-----A-T----TGTGG------CATAG-T--A-C-C-CCCTG-GGG--AT-C-ATG--GTT--TGAA------------C-AA--C-TT-G-AA---TA-T-ACA-TTATAA-TCAGGA-A---GCTT-TCAT--TAA------AT-T---T--GCAG-CT---T--T--T----CT-GCC-CA-G---T----G-G-T--------CT-T----------GAGAAA-------------G-------------A-------A--------------G-A-------------TT----------TTAAAGATTG--TC-CCTA-----T-A-TA---TTC-A-CA-T--G-----A-A-AA-TT---TTG-ATC---TC--C---------T-------A--C---T---GT-----A-CC---CC-A-AGTA-CTC-CGGG-----TCAT-ATTTGAA-ACAA-C----T--TGAA---TC--T-C---C-T-A--TTC-T-----GG-AAGCTT-T----CA--TAT-A-AA-TTCAGC-TT-T---TTTAGCCGTAG---T----G-GT-TC---T---TCAGAAGA---AG---AA---G---A-----TTTTT---AAA-GATTTTCCCT--T--------T------------------AT----ATTCACA--------TGC-A-AC----A-------A----C---------T-TTG-ATC---------CA-C-T----AA-T---GTTGG-CCC--TCG--TC--CCC---GGA--GTCATGA----------TTGAAC-----------C-AAA--C-TT-GA--ATCTCAAT----TAT-ATTAAGA-A-------C---TTATAT--AA-----------TTCAGC--TTT--TCTGG----GCC-A---------GGT--TCTTG-------TT------GAGA---A-TG-TTA----T-----------AAATG-GG--------GCACA--------C-CCT-A-T----TTT---GCATTTTTGTGATATCTCT-CC-TTTG------A-----AGGGGT----CT-GAG-TCT-----TC-T--T-T----GAGC-AAACCTAA---AGT-CC--C--TTCA-CCC-C-GG-----ATGATTT---GT---A----A---AG----TTT--G----GT-TGA-A--T-T-----G--------GCCC-------CC------AG------T---G--GT---TTTGGAGAA---GAATCG--A--TGTGA-A-GTT---AAA--G-----A--C-A-G------A-A--CG-----AC---------AGTCAGGGACAGACG--------ACGGAGA-AA----GGCAATCAG--AAAA-GCTCA-TTGCCCA----------CAAGTGAGC-TAcc
gi|11 : ttttgctttactgagtT--T-T--TCTGG---CC-C---A-G---TTCCAGGT-T--------CT-T----GA---GAA-GAAGATTT-TT-----AAA-T--A--------T-TTTCCC-TA----T-TT-A-AACA--C---AT-GTAAATAATTAAAT---T-ATGATACC-CT-----A-A----TGTGG-C--CCCATCA-T--A-C-C-CC--CCGGG--GT-C-ATG--ATT--TGAA------------CAAA--C-TC-A-AA---TC-T-CTA-CTAT-A-TCAAGA-A---GCTT-TGATA-TAA------AT-T---T--A-AGCTT---T--T--T----TTGGCC-CA-G---T----G-GTT--------CT-T----------G----A-------------G-------------A-------A--------------G-A-------------tataaa
gi|13 : aagcT--T-T--TTTAG---CC-T---A-G---T----GGT-T--------CT-T----GA---G--------------------AA-G--A--------T-TTTTTC-TA----C-CT-A-TTCA--C---AT-GTACA-------AC---T-TTGATTCC-CT-----A-T----TGTGG-C--CCCATCG-T--ATC-T-CC--T-GGG--GT-C-ATG--ATT--TTAA------------TAAA--G-TT-G-AA---TA-T-CCA-CTAT-A-TGAGGA-A---GCTT-TCATA-TAA------AT-T---T--C-AT-CT---T--C--T----CTGGCC-CA-A---T----G-ATT--------CT-T----------G----ATGAGAAGAATTTTG-------------A-------A--------------G-A-------------TT----------T-----------GC-CCTA-----T---TA---TTC-A-CA-T--G-TA--A-A-AC-TT---TG--ATC---CC--C---------agatttttaaatgacaccaccctagttttgcattttcgtgattatctcctctttcatgagggcctagtccttcatttgaacaaacttggatccccttcacaccaaatttggttgaattatggcccagcggttctggagaaggaagtcgaaaatgtgaaaagttaacagacagacaacatacaaaaggcgatcagaaaagctcacttgagcctttggctcaggtgagctaata
gi|20 : cagggcttccgtagtttcagcT--T-T--TCTGG---CC-C---A-G---T----TGT-T--------CG-T----GA---GAG------TTT-TT-----AAA-A--A--------T-T--CCCATA----A-AT-A-TTCG--C---AT-GTAAA-------AC---T-TTGATTCC-CT-----A-T----TGTAG-A--ACCACCC-T--A-C-C-CA--A-AAG--GC-A-ATAGTATT--TG--------------CAAA--T-TT-G-AA---TC-T-GCA-CAAT-G-CCAGAA-A---GCTT-TTATG-TA
gi|39 : atgttagaaagtaattttccac--TTTGG---TC-C---A-G---T----GGT-T--------CT-A----GA---GAA-GA
gi|9 : gaaG---TC-C---C-G---T----GGT-T--------CT------GA---GAA-GA---TTT-TT-----AAA-G--A--------T-TTTCCCCTA----TTAT-A-TTCA------AT-GCAAA-------AT---T-TTGATTCC-CT-----AAT----TGTGG-C--CC-ATAG-T--A-C-C-CT--A-GGG--GT-C-ATT--ATT--TGAA------------CAAA--C-TT-G-AA---TC-T-CCA-CTAT-A-TCAGAA-A---GCTT-TCATA-TCA---------T---T--C-AG-CT---T--T--T-----TGA-C-CA-G---T------GTT--------TA-T----------G----A-------------GAAGATTATTA---A-------A--------------G-A-------------TT----------T-----------TC-CCTA-------A-TG---TTC-A-CA-T--G-TC--A-A-AC-T----TT--AT----CC--C---------T-------ATTG---T---G------G-CC---CC-AT-CTACCCC-AGAGG----ACATAATTTGAA-TAAACA----T--TGAA---TC--T-CCA-C-T-A---TA-A-----GG-AAGCTT-T-----A--TAT-T-TATTTCAGC-TT-T---TC-------------------------------T------G---GG---AA---G------------------AA-GA-------T--T--------C------------------AC----AG----G--------T---A-A-----A-------A----C---------T-TTG-ATC---------CC-C-T----AT-T---G-TGG--CCCATCG--TA--CCC-----CGGGTCTATA--T-------TTGAA------------C-AAA--C-AT-GA--ATCTCCAC----TAT-ATCAGGA-A----ACTT---TCATGT-AAA----------TTTCAGC--TTT--TCT-G----GCC-------AGT-GGT--TCTTG--------AA-A--AGAAG---A-TT-TT-----aggtgaaaatgtgaaaagtttataacgacggcgacgacaacaga
gi|18 : agaagctttcatataattatatattcatacatttact-A---T----GGT-A--------CT-T----TG---GAG-G------T-TT-----AAA-G--AGAAATTTGT-TTTCCA-TA----TCAT-A-TTCC--A---AT-ATATA-------AT---T-T--------CT-----G-T----TGT------CCCATCC-T--GGT-C-CT--G-GAA--TT-C-ATG--GTT--TAAA------------CAGA--G-AT-G-GA---TCCT-TCAACT-C-A-T-AAGA-A---GCTT-TCATG-CAAGG----AT-T---G--A-A---T---T--T--A----CTA--C-TA-G---T----A-ATT--------C
gi|37 : tggttcaacagtttcagagaagaaaattaatTT-TT-----AAA-G--G--------A-CTTTCC-AA----T-AT-AATCCC--T---AT-TCTAA-------TC---T-ATGATCCC--T-----A-T-----ATGG-T--CC-ATCC-A--A-C-C-CC--G-GGA--GT-T-ACA--ATT--TGAA------------
gi|48 : T-TT-----AAA-G--A--------T-TTTCAG-TA----T-AT-A-TTTA--C---AT-GTCAA-------AT---T-TTGATCCattg
gi|7 : -AC-A-TT-T--T---AT-GCAAA-------AC---T-CCGATCCC-TT-----A-T----TGTGC-C--CCCCCCC-A--A-C-T-CC--G-GGGA-GT-T-ATG--ATC--TGA-------------TAAA--T-TTTG-GA---TC-T-ACC-CTAT-C-TCAGAA-A---GCTT-TCAGG-TAA------ATAT---T-----G-TT---TC-T--T----TTGGTC-CA-A---T----G-GTT--------CT-T----------G----A-------------G-------------A-------AAATGATTTTTAAAAG-A-------------TT----------T-----------TC-CCTA-----T-A-TA---TTT-A-CA-T--G-TA--A-G-AC-TT---TG--ATC---CC--C---------T-------ATTG---T---G------G-CC---CT-ATCGTACTCC-CGAGG-G--TCAAGATTTGAA-CAGA-C----T--TGAA---TC--T-CCA-T-T-AC-ATC-A-----GG-AAGCTT-T----CT--TAT-A-AATTTCAGC-TT-T---TCT-GGCCCAG---T----G-GT-TC---T---T------C---AGAAAAA---G---A-----TTTTT---AAA-GA-------T--T--------TCCTCTAGCCATTATATTCAC----AT----G--------T---A-C-----A-------A----CT--------T-TTG-A-T---------CC-C-T----AA-G---G-TGT-CCCCATCG--TA--CCC----CGGGGTCATGA----------TTGAA------------C-AA-----TT-GA--ATCTCCA
gi|8 : tgcgtgtaattaaactctgaatttagaatttttagtatttattttaaaagcatgtatagacaacaagaggcccatgggccacatcgctcaccttggccctggctcagcagtggtgattttgaaaagaattttcaagtttccttaaaactgacccagtggttcggagaaga-A-TTCT--CTGCAT-GTGAA-------AT---T-TTGATCTC-AT-----A-T----TATGG-C--CCCATCAAT--A-C-C-CT--G-TGG--AC-C-GT----TT--TAAAAAACACACACACCAAAAAC-TT-G-AA---TC-T-GCA-TCAT-G-TCAGGA-A---GTTT-TCA------------AC-T---T-------TT---C--TAGT----CAAGAC-TA-G---T----G-GTT---------T-T----------G----A-------------G-------------A-------A--------------G-A-------------AT--------------------------CTA-------A-AAGATTTT-A-TG-T--A-TA--ACA-GA-TT---TG--ATC---AT--C---------T-------ATTG---T---G------G-CC---CC-A----------CAGGG-G--TCATGAATTGAA-CAAA-C----T--TGAA---TC--T-AGT-C-C-AT-GCC-A-----GG-AAGCTT-TAGGGCA--------AATTTTAAT-TT-T---CCT-CACAAAG---T----A-GT-TC---T---T-------------------------------TCCT---ATA-CA-------T--C--------CGC----------------AT----GT----A--------C---A-C-----A-------A----C---------T-TTC-ATC---------CC-C-T----AA-T---G-TTG-CCC-------------CA-A------TCGT------------------------------------------A--ATATCCATACGCTGC-ATCAAGA-A----GCTT---TGATGT-AAA----------TTTCAA---------CT-G----GTC-C-----AGT-GGT--TTTTG--------------AGAAG---A-TTATG-----C-----------AAATT-AT--------cccggggacctcttcactat
gi|43 : cctattctctttagagaagtggacagacatagcctggatgtaggctatgcctgtccacttctctaaagagaatacccctaccccaTAAA-------AT---G-TTGATCCC-TT-----A-T----TGTGA-CTGCACAT---T--A-C-C-CCT-A-GGG--GT-C-ATG--ATT--TGAT------------CAAA--C-ttaatttcattttaaggtgattac
gi|36 : C---T-TT-ATTCC-CTTGAAAA-T----GATGGTC--CCCACTT-T--A-C-C-CCC-G-GGG--GG-C-ATG--GTT--TGAA------------CAAA-------G-AA---T
gi|49 : gatctttgaaatgtctttttgagtC---T-TTGATCCC-CT-----A-T----TGTGG-C--CCTATCA-T--A-
gi|27 : TCCC-CT-----A-T----TGTGG-C--TCAAACC-T--A-C-C-CCT-G-GGG--GC-A-ATG--ATT--TGAA------------TAGA--T-TG-G-AA---TC-T-ACT-TTAT-A-TAAGAA-A---AC-T-TCAT--TAA------AT-
gi|46 : ccctatacatgtacataggcatcaaaagcTGG-C--CCCATAT-T--G-C-C-CCT-G-GAG--GT-C-ATA--ATA--TGAA------------CACA--C-TT---CA---TC-T-Taactgcatactattggtgtgcatt
gi|34 : -T--A-C-CACC--A-GGGCGGC-C-ACG--ATT--T-AA------------TGGA--C-TT-A-AA---TA-T-TT---TAT---TTACGG-A---ACTT-TCATA-TAA------AT-T---T-----T-TT---T--T--T----CT-GCC-TA-G---T----
gi|10 : gtgccacacctc--G-GGG--AT-C-ATG--AAT--TGAA------------CAAA--C-TT-A-AA---TA-T-CTC-CTAC-A-TCAGGT-A---GCTT-TAATG-CCA------AT-C---T--C-AG-CT---T--T--T----CCGGCC-CA-A---T----G-ATT--------CT-C----------G----A-------------GAAGATTTTTA---A-------A--------------G-A-------------TT----------T-----------TC-CCTT-----T-A-TA---TCC-A-CA-T--G-TA--A-A-AC-TT---TG--ATC---CC--C---------T-------ATTG---T---G------T-CC---CC-ATCTTACCCC-TGGGG-G--TCATGATTTGAA-CAAA-C----T--TGAT---TT--T-CCA-C-T-AT-ACC-A-----GG-AAGGTT-
gi|35 : --G-AGG--AT-CCATG--GTT--TGAA------------CAA--------G-AA---G-------------A-TGAAGA-A---GCTT-CTACA-CAAG-----AT-A---T-----G-TT---TA-T--T----CTGGTC-CA-C---T----G-GTT--------CT-T----------G----A-------------G-------------A-------A--------------T-A-------------CCCA--------T-----------CC-CCctggagaagatgatttgtaaatgaccacaccttattttgcattttggtgattatcttgcctttgaagggggcctagtccttcattcgaacaaacttgaattctcttcaaccaaggataatttgtgcaacgtttggttgaaattggcctagtggttctggagaagttgaaaatgtgaaaagttaacagacagacaaaagacagacaaagggcaatcagaaaaaaactcacttgagtcttcggctcaggcgagctaaaa
gi|1 : TG--ATTCTTGAAA-----------CAAA--T-TT-GCAA---TC-C--CA-CTAT-A-TCAGTAGA---GCTT-TCCAA-TGA------AT-C---T--C-AG-CT---T--T--C----CTGGCC-CA-AGGTT----G-GTTTTCTTTTCCT-TTTTCGAACAGA----A-------------G-------------A-------A--------------G-A-------------TT----------TTTAAGACTT--CC-TCAA-----T-ATCA---ATC-A-CA-T--GCT-----A-AA-CC---TT--GAT---CC--C---------T-------ATTG---T---G------G-CC---CC--TCGTA-CCC-CGGGG-G--TCATGATTTGAACCAAA-C----T--TTAA---TC--T-CCA-C-T-ATATTC-A-----GG-A--CTTCC----CA--TAT-T-AATCTCAGC--T-T---CCT-GGTCCAGACAT----GTGT-TC---T---TC-----G---AA---AG---A---A-----TTTTT---AAAGGA-------T--T--------TTTCCCTATATAATC----AT----AT----G--------T---AGA-----A-------A----C---------TCTTG-ATC---------CC-A-T----AATT---G-TGG--CCCATCA--TA--CCCC-AG--GGGTC--AA--T-------TTGAA------------CAAAA--C-TT-GA--ATCTCCTC----TAT-ATTAGG--A----GCTT---CCATATACAA----------TTTCAGC--TTTCGTCT-G----GCC-C-----AGT-GGT--TCTTG-------AAG-A--AGAAGA--A-TTGTT-----TTGTTA------AAATC-AC--------AC-CA----------CCT-ATT----TTTTGCGCATTGTTTGTGATTATCTCCCCTTTGA-----A-----GGGGCT----C--GGT-CCT-----TCA---T-T----GAAC-AAAC-TGA---ATC-TC--C--TTCA-CCCAAGGG-----ATGATTG---GT---A-T-CA---AG----TTT--G----GT-TGA-ATAT-T-----G--------G--C-------CC------AG------T---G--GTC--TCTTGAGAA---AAA--G--T--CGAAA-ATGTG---AAA--AGTTAGA--C-G-AC-----AGA--CA-----
gi|17 : acaagaggcccatgggccacatcgctcacctgagtgaccttggccctcgcactctatatcaggaagctttaaggtaaatgttgtaactttggtcttgagaagattacccctatatataatcatgtgtaaaactttgatccctattgggcgcccaccatcgtacctccgggggtcatgatttgaacaaacttgaatctccttatatcacggaagcgtcataaaatatcagctttcctggtccccagtgggttttgagaagaaaactttttaaaaaattttccc--ATT--TGAA------------CAAA--A-TT-G-AAGCCCC-T-TCA-CC-C-A---AGGA-T---GATG-T-GTA-CCA------AG-T---T--T-GG-TTGAAT--T--T-------GCC-CA-G---C----G-GTT---------T-T----------G----A-------------G-------------A-------A--------------G-A-------------gaagg
gi|19 : accaccctatttttgcattttcgtgattatctcccctttgatgagggcctggtccttc-TTAGGA-A---GTTT-TCATG-TAA------AA-T--------AG-TC---ACAT--T----CTGGTCGCATG---T----G-GTC--------CT-T----------A----A-------------G-------------A-------A--------------G-A-----------------------------------------------------CA---TTC-A-AA-T--G-agttgaaaatttggaaagtttacgacgacccaacggctcaggtgagctaaaaataggtcagagattaaatactcg
gi|13 : CAGG------GCTT-CCGTA----------GT-T---T--C-AG-CT---T--T--T----TTAGCC-TA-G---T----G-GTT--------CT-T----------G----A-------------G-------------A-------A--------------G-A-------------TT----------T-----------TT-TCTA-----C-C-TA---TTC-A-CA-T--G-TA--C-A-AC-TT---TG--ATT---CC--C---------T-------ATTG---T---G------G-CC---CC-ATCGTATCTC-CTGGG-G--TCATGATTTTAA-TAAA-G----T--TGAA---TA--T-CCA-C-T-AT-ATG-A-----GG-AAGCTT-T----CA--TAT-A-AATTTCATC-TT-C---TCT-GGCCCAA---T----G-AT-TC---TTGAT------G---AG---AA---G---A-----ATTTT---GAA-GA-------T--T--------TGCCCTATTATTC------AC----AT----G--------T---A-A-----A-------A----C---------T-TTG-ATC---------CC-C-cccacaacctagtttgggcattttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattatctctcctttaaaaggggaatagtcctgcatttgaacaaaacatgaatat
gi|9 : GA-A---GCTT-TCATA-TAATTATATAT-T---C--ATAC-AT---T--T--A----CTGTCC-C--G---T----G-GTT--------CT------------G----A-------------G-------------A-------A--------------G-A-------------TT----------TTTAAAGATTTTCC-CCTA-----TTA-TA---TTC-A--A-T--G-CA--A-A-AT-TT---TG--ATT---CC--C---------T-------A--A---TTGTG------G-CC---C--ATAGTACCCT-AGGGG-T--C-ATTATTTGAA-CAAA-C----T--TGAA---TC--T-CCA-C-T-AT-ATC-A-----GA-AAGCTT-T----CA--TAT-C-A--TTCAGC-TT-T---T-T-G-ACCAG---T------GT-TT---A---T------G---AG---AA---G---A-----TTATT---AAA-GA-------T--T--------TTCCCTAATGTTC------AC----AT----G--------T---C-A-----A-------A----C---------T-TTA---T---------CC-C-T----AT-T---G-TGG-CCCCATC---TA--CCCC-A-GAGGA-CATAA--T-------TTGAA------------T-AAA--CATT-GA--ATCTCCAC----TAT-A--AGGA-A----GC-T---TTATAT-TTA----------TTTCAGC--TTT--TCT-G----GGA-A-----GAA-GAT--TC----------ACA-G--GTAAA---A-CT-T---------------------TG-AT---------C-----------C-CCT-ATT----GTG---GC------------------CCATC------------------GTACCCCG-GGT--CT-----ATAT--T-T----GAAC-AAACATGA---ATC-TCCAC--TATA-TC--A-GG-----A-AACTT---TC---A-TGTA---AA----TTTCAG----CT-TT---T-C-T-----G--------G----------CC------AG------T---G--GT---TCTTGAAAA---GAA--G--A--T
gi|21 : aA-A---GCTT-TCAAC-TGT------AT-TC--T--A-----C---T--T--T----CTGGCC-CA-G---T----T-GTT--------CGAT----------G----G-------------G-------------A-------A--------------G-A-------------TTTTAAAGATGCT-----------TC-CCTA-------A-TA---TGCTG-CATT--G-TA--C-A-AC-TT---TG--ATC---CCTTT---------T-------T--G---T---G------G-CCTTTCC-----TACCCA------------AAGATTTGAA-CAAA-T----T--GAAA---TC--TATC--C-TGA---TC-A------G-AGGCGT-T----CA--Tttt
gi|15 : -TAA------TT-T---T--C-AG-CT---T--T--T----CTTGCC-CA-G---T----G-ATT--------CT-T---------------A-------------T-------------A-------A--------------G-A-------------AT----------C-----------CTACTTT-----T-G-CA---TTT-T-CT-T--G----------A-TT---TT--CTC---CC--C---------T-------gaaatcc
gi|7 : A------AT-T---TTCA-AG-TT---TCCT--TAAAACTGACC-CA-G---T----G-GTT--------CG------------G----A-------------G-------------A-------A--------------G-A---------------------------------------------------A-CA---TTT---TA-T--G-CA--A-A-AC-TC---CG--ATC---CC--T---------T-------A--T---T---GT-----G-CC---CC-CCCCCAACTC-CGGGGAG--TTATGATCTGA--TAAA-T----TTTGGA----TC--T-ACC-C-T-AT-CTC-A-----GA-AAGCTT-T----CA--GGT-A-AATATTGTT-TC-T---TTT-GGTCCAA---T----G-GT-TC---T---T------G---AG---AAAATG---A-----TTTTTA--AAA-GA-------T--TTTCCC---T------------------AT----AT----ATTTACATGT---A-A-----G-------A----C---------T-TTG-ATC---------CC-C-T----AT-T---G-TGG-CCCTATCG--TACTCCC----GAGGGTCAAGA--T-------TTGAA------------C-AGA--C-TT-GA--ATCTCCAT----TAC-ATCAGGA-A----GCTT---TCTTAT-AAA----------TTTCAGC--TTT--TCT-G----GCC-C-----AGT-GGT--TCT---------TCAGA--AAAAG---A-TT-TT-----T-----------AAA-G-ATTTCCTCTAGC-CA--------T-TAT-ATTCACATGT---ACA-----------------ACTTTTGATCCCTA-----AGGTGTCCC-CATCGTACCCCGGGGTCATGAT-T----GAAC-AA--TTGA---ATC-TC--C-----A-CCCGG-GG-----Attcaaaggagcatgtttttttttaacatgatcaatcccgctttatgggaaatttgattgaaattagccctgcagttatggagaagagatcgaaagaaaaaaagtatacagatggacagacagacaacggacaaaatataagcttttggctcaggtgagcttaaaaaa
gi|11 : tgcgtgtaattaaactctgaatttagaatttttagtatttattttaaaagcatgtatagacaacaagaggcccatgggccacatcgctcaccttggccctggctcagcagtggtgattttgaaaag--A-AG-CT---T--T--T----CTGGCC-CA-G---TTCCAG-GTT--------CT-T----------G----A-------------G-------------A-------A--------------G-AAGATTTTTAAATATT----------T-----------TC-CCTA-----T-T-TA---AAC-A-CA-T--G-TA--A-ATAA-TTAAATT--ATGATACC--C---------T-------A--A---T---GTG----G-CC---CC-ATCATACCCC-CCGGG-G--TCATGATTTGAA-CAAA-C----T--CAAA---TC--T-CTA-C-T-AT-ATC-A-----AG-AAGCTT-T----GA--TAT-A-AATTTAAGC-TT-T---TTTTGGCCCAG---T----G-GT-TC---T---T------G---AG---AA---G---A---------------A-GA-------T--T--------T------------------TT----AA----A--------T---G-A-----C-------A----CCACCCTAGTT-TTGCATT---------TT-CGT----GA-T-----TAT-CTCCTCTT--T-----CA--TGAGGGCC-TAG--TCCTTCATTTGAA------------C-AAA--C-TT-GG--ATCCCCTT----CAC-ACCAcctcttcactat
gi|20 : T---T--T--T----CTGGCC-CA-G---T----T-GTT--------CG-T----------G----A-------------G-------------AGTTTTTAA--------------A-A-------------AT----------T-----------CC-CATA-----A-A-TA---TTC-G-CA-T--G-TA--A-A-AC-TT---TG--ATT---CC--C---------T-------A--T---T---GTA----G-AA---CC-ACCCTACCCA-AAAGG-CA-ATAGTATTTG---CAAA-T----T--TGAA---TC--T-GCA-C-A-AT-GCC-A-----GA-AAGCTT-T----TA--TGT-aatttggttgaattatggcccagcggttctggagaaggaagtcgaaaatgtgaaaagttaacagacagacaacatacaaaaggcgatcagaaaagctcacttgagcctttggctcaggtgagctaata
gi|39 : atgttagaaagtaattttccac--T----TTGGTC-CA-G---T----G-GTT--------CT-A----------G----A-------------G-------------A-------A--------------G-A-------------a
gi|18 : gaa-------------TT----------T-----------TC-CATA-----TCA-TA---TTC-C-AA-T--A-TA--T-A-AT-TTCTGTT--GTC---CC-----------------------A---T-----------------CC--TGGT---CC-TGGAA-T--TCATGGTTTAAA-CAGAGA----T--GGAT---CC--T-TCAAC-TCAT-----A-----AG-AAGCTT-T----CA--Taggtgaaaatgtgaaaagtttataacgacggcgacgacaacaga
gi|27 : tggttcaacagtttcagagaagaaaattaatatggtactttggaggtttaaagagaaatttgC-CCTA-----T-A-CA---TGT-A-CA-TAGG-CATCA-A-AA-GC---T-----C---CC--C---------T-------ATTG---T---G------G-CT---CA-AACCTACCCC-TGGGG-G--CAATGATTTGAA-TAGA-T----T--GGAA---TC--T-ACT-T-T-AT-ATA-A-----GA-AAAC-T-T----CA--Tgcaaggattgaatttactactagtaattc
gi|43 : --A-A-AA-TG---TTG-ATC---CC--T---------T-------ATTG---T---G------A-CT---GC-ACATTACCCC-TAGGG-G--TCATGATTTGAT-CAAA-taaataactgcatactattggtgtgcatt
gi|36 : t---TT--ATT---CC--C---------TTGAAAATG--A---T---G------GTCC---CC-ACTTTACCCC-CGGGG-G--GCATGGTTTGAA-CAAA----------GAA---Tc
gi|46 : gatctttgaaatgtctttttgagtct---T---G------G-CC---CC-ATATTGCCCC-TGGAG-G--TCATAATATGAA-CA
gi|34 : TACCAC-CAGGG-CGGCCACGATTT-------A-A----T--GGA-----C--T-TAA-A-T-AT-TTT-ATTTACGG-AA-CTT-T----CA--TAT-A-AATTTT--T-TT-T---TCT-G-CCTAG---T----cacttcatctt
gi|10 : gtgccacacctcGGGG-A--TCATGAATTGAA-CAAA-C----T--TAAA---TA--T-CTC-C-T-AC-ATC-A-----GG-TAGCTT-T----AA--TGC-C-AATCTCAGC-TT-T---TCC-GGCCCAA---T----G-AT-TC---T---C------G---AG---AA---G---A-----TTTTT---AAA-GA-------T--T--------TTCCCTTTATATCC-----AC----AT----G--------T---A-A-----A-------A----C---------T-TTG-ATC---------CC-C-T----AT-T---G-TGT-CCCCATCT--TA--CCCC-TGG-GGGTCATGA--T-------TTGAA------------C-AAA--C-TT-GA--TTTTCCAC----TAT-ACCAGGA-A----GGTT---CT
gi|35 : GGA-T--CCATGGTTTGAA-CAAG-A-------AGA----------------------TG-A-----AG-AAGCTT-C----TA--CA--C-AAGATATGT-TTAT---TCT-GGTCCAC---T----G-GT-TC---T---T------G---AG---AA---ggagaagatgatttgtaaatgaccacaccttattttgcattttggtgattatcttgcctttgaagggggcctagtccttcattcgaacaaacttgaattctcttcaaccaaggataatttgtgcaacgtttggttgaaattggcctagtggttctggagaagttgaaaatgtgaaaagttaacagacagacaaaagacagacaaagggcaatcagaaaaaaactcacttgagtcttcggctcaggcgagctaaaa
gi|17 : gaATTTGAA-CAAA-A----T--TGAAGCCCC--T-TCA-C-------CCAA-----GG-ATGATG-T-----G--TAC-C-AAGTTTGG---T-TGAATTT-G-CCCAG---C----G-GT-T----T---T------G---AG---AA---G---A-----AGTTG---AAA--A-------T--T--------T------------------tacccatcccc
gi|13 : accaccctatttttgcattttcgtgattatctcccctttgatgagggcctggtccttcC-A-----GG---GCTT-C----CG--TA-----GTTTCAGC-TT-T---TTT-AGCCTAG---T----G-GT-TC---T---T------G---AG---AA---G---A-----TTTTTTCTACC-TA-------T--T--------C------------------AC----AT----G--------T---A-C-----A-------A----C---------T-TTG-ATT---------CC-C-T----AT-T---G-TGG-CCCCATCG--TA--TCTC-CTG-GGGTCATGA--T-------TTTAA------------T-AAA--G-TT-GA--ATATCCAC----TAT-ATGAGGA-A----GCTT---TCATAT-AAA----------TTTCATC--TTC--TCT-G----GCC-C-----AAT-GAT--TCTTGA------T---G--AGAAG---A-AT-TT-----T-----------GAA-G-AT---------T-TG--------C-CCT-ATT----ATT----CA------------------CATGTAA-----A-----Aggaaagtttacgacgacccaacggctcaggtgagctaaaaataggtcagagattaaatactcg
gi|21 : -AAGCTT-T----CAACTGT----ATTCTA---CT-T---TCT-GGCCCAG---T----T-GT-TC---GA--T------G---GG---AA---G---A-----TTTT----AAA-GA-------TGCT--------TCCCTA-------------AT----AT----GCTGCATTGT---A-C-----A-------A----C---------T-TTG-ATC---------CC-T-T----TT-T---G-TGG-CCTTTCC---TA--CCCA-AAGA-----------T-------TTGAA------------C-AAA--T-TG-AA--ATCT--AT----CCTGATCA-GA-G----GCGT---TCATctttgatcccc
gi|20 : TTTCCAC-TT-T---TCT-GGCCCAG---T----T-GT-TC---G---T------G---AG---AG-------------TTTTT---AAA-AA-------T--TCCCATAAAT------------------ATTCGCAT----G--------T---A-A-----A-------A----C---------T-TTG-ATT---------CC-C-T----AT-T---G-TAG-AACCACCC--TA--CCCA-A--AAGGCAATAGTAT-------TTG--------------C-AAA--T-TT-GA--ATCTGCAC----AAT-GCCAGAA-A----GCTT---TTATGT-gaaatcc
gi|15 : atgttagaaagtaatTTTCAGC-TT-T---TCT-TGCCCAG---T----G-AT-TC---T---T----------AT---AA---G---A-----a
gi|11 : taatAGC-TT-T---TCT-GGCCCAG---TTCCAG-GT-TC---T---T------G---AG---AA---G---AAGA--TTTTT---AAA-TA-------T--T--------TTCCCTATTTAAAC-----AC----AT----G--------T---A-A-----ATAATTAAA----T---------T-ATG-ATA---------CC-C-T----AA-T---G-TGG-CCCCATCA--TA--CCCC-CCG-GGGTCATGA--T-------TTGAA------------C-AAA--C-TC-AA--ATCTCTAC----TAT-ATCAAGA-A----GCTT---TGATAT-AAA----------TTTAAGCT-TTT--TTT-G----GCC-C-----AGT-GGT--TCTTG--------AG-A--AGAAG---A-TT-TT-----T-----------AAATG-AC--------AC-CA--------C-CCT-AGT----TTT---GCATTTTCGTGATTATCTC-CTCTTTCA-----T-----GAGGGC----CT-AGT-CCT-----TCAT--T-T----GAAC-AAACTTGG---ATC-CC--C--TTCA-------------------------C---A-C-CA---AA----TTT--G----GT-TGA-AT-TAT-----G--------G--C-------CC------AG------C---G--GT---TCTGGAGAAG--GAA--G--T--CGAAA-ATGTG---AAA--AGTT-AA--C-AGAC-----AGA--CA-----AC----------AT---------ACA--------AAAGG--------CG---ATCAG--AAAA-GCTCACTTGAGCCT---TTGGCTCAGGTGAGC-TAAatcctacttttgcattttcttgattttctcccctttcaaaggagcatgtttttttttaacatgatcaatcccgctttatgggaaatttgattgaaattagccctgcagttatggagaagagatcgaaagaaaaaaagtatacagatggacagacagacaacggacaaaatataagcttttggctcaggtgagcttaaaaaa
gi|39 : a---TTT-GGTCCAG---T----G-GT-TC---T---A------G---AG---AA---G---A-----ta
gi|36 : gaa---G---A-----TCTTT---GAA--A-------T--G--------T------------------CT----TT----T--------T---G-A-----G-------T----C---------T-TT--ATT---------CC-C-TTGAAAA-TG--A-TGGTCCCCACTT--TA--CCCC-CGGGGGG-CATGG--T-------TTGAA------------C-AAA-------GA--ATaggtgaaaatgtgaaaagtttataacgacggcgacgacaacaga
gi|8 : ----AT----G--------T---G-A-----A-------A----T---------T-TTG-ATC---------TC-A-T----AT-T---A-TGG-CCCCATCAA-TA--CCC---TGTGGACCGT----T-------TTAAAAAACACACACACC-AAAAAC-TT-GA--ATCTGCAT----CAT-GTCAGGA-A----GT-------------------------TTTCAAC--TTT--TCT-A----GTC-AAGACTAGT-GGT--T-TTGAGAAGAATCT-A--A-AAG---A-TT-TTATGTAT-----------AACAG-ATTTG-----AT-CA----------TCT-ATT----GTG---GCC-----------------CCAC---------------AGGGGT----CA-TG------------AA--T-T----GAAC-AAACTTGA---ATC-TA--G--TCCA-TGCCA-GG-----AAGCTTT---AG---G-G-CA---AA----TTT--------T---A-AT-T-T-----T--------C--C-------TCACAA--AG------T---A--GT---TCT
gi|12 : cctattctctttagagaagtggacagacatagcctggatgtaggctatgcctgtccacttctctaaagagaatacccctaccccaattctctgc-------A----C---------T-TTG-ACT---------CCGC-C----AT-TGCAA-TGG-ACTCAACAATTA--CCTACACGACGATCA-GA--C-------TTGAAA-----------C-AAA--T-TTCGA--GATGCCACA---TAT-ATTGAGA-AATGTGCTT---TTACAA-TAAATAAATTGTGTTTCAGTCTTTC--TCT-GCGGGACC-GC----AGTCGGTGATCTTG---------A-AGGAGAAG---AGTC-TT-----TGTTTGA-----AAATGTAT--------CG-CA--------CACCC-AT------------AA-----------------CCATTTGA-----A-----ttcctatacatccgcatgtacacaactttcatcccctaatgttgccccaatcgtaatatccatacgctgcatcaagaagctttgatgtaaatttcaactggtccagtggtttttgagaagattatgcaaattatttaatttcattttaaggtgattac
gi|49 : ----C---------T-TTG-ATC---------CC-C-T----AT-T---G-TGG-CCCTATCA--TA--tatgctaatctgcgatattactccctttagcagagggacctcacgcctccatgatgtagtaacaaaaacaatgatgagaatgccccacggcctcttacacgaacacggatgatttgcactaggagaaggtttgagatatcgacacggttggctacacatttttctggagaagagagtcgaaatatggtataaaaaatgatattaacagagaggaga
gi|10 : GGGGATCATGA--A-------TTGAA------------C-AAA--C-TT-AAATATCTCC------TAC-ATCAGGT-A----GCTT---TAATGC-CAA----------TCTCAGC--TTT--TCC-G----GCC-C-----AAT-GAT--TCTCG--------------AGAAG---A-TT-TT-----T-----------AAA-G-AT---------T-TT--------C-CCT-TTA----TAT---CCA------------------CATGTAA-----A-----A---CT----TT-GAT-CCC-----CTAT--TGT----G----------------TC-CC--CATCTTA-CCCCT-GGGGGTCATGATTT---G----A-A-CA---AA----CTT--G----AT-T----T-T-C-----C--------A--CTATA---CC------AG------G---AAGGT---TCTGGAGAA---GAT--G--ATTTGTAA-ATG
gi|14 : --T-------TTGAA------------C-AGA--T-TT-GA--AT-TCCCT----T-C-ATCAAAATAT---GC-T---TTATGG-CAA-------------CAGT--TAC--TTT-G----ATTGA-----AAT-GGaccacaccttattttgcattttggtgattatcttgcctttgaagggggcctagtccttcattcgaacaaacttgaattctcttcaaccaaggataatttgtgcaacgtttggttgaaattggcctagtggttctggagaagttgaaaatgtgaaaagttaacagacagacaaaagacagacaaagggcaatcagaaaaaaactcacttgagtcttcggctcaggcgagctaaaa
gi|13 : cacccattttttcatttgctgatcatattttctcccctttcgatgggaaatgcatgcaccttcaCAGG-------GCTT---CCGTA----G----------TTTCAGC--TTT--TTT-A----GCC-T-----AGT-GGT--TCTTG--------------AGAAG---A-TT-TT-----TTCTACCTATTCACATG--T--------AC-AACTTTGATTC-CCT-ATT----GTG---GCC-----------------CCA-TCGT-----ATCTCCTGGGGT----CA-TG------------AT--T-T----TAAT-AAAGTTGA---ATA-TC--C--ACTA-TATGA-GG-----AAGCTTT----C---A-TATA---AA----TTT--C----AT-CTT-CT-C-T-----G--------G--C-------CC------AA------T---G--AT---TCTTGATGA---GAA--G--------AA-TTTTG---AAG--A-TT-TG--C----C------------------C---------TATT----ATTCACA----------TGTAA-AACTTTG---ATCcccagcttttttttttttaagatttaaaaatatattcaaagttttacatatggatgaacagactgacaattaacaattagcaaaatgtgatcagaaaagctcacttcag
gi|15 : ----------TTTCAGC--TTT--TCT-T----GCC-C-----AGT-GAT--TCTTA-------T---A--AGAATCCTA-CT-TT-----T-----------GCATT-TT-----------------------CTTGATT----TTC---TCC-----------------CC-TTTCA-----A-----AGGAG-----CA-TGT-TTT-----T--T--T-T----TAAC-A----TGATCAATC-CCG-C--TTTA-T-----GG-----G-------------------A---AA----TTT--G----AT-TGA-AA-T-T-----A--------G--C-------CC------TG------C---A--GT---TATGGAGAA---G-A--G--A--TCGAA-AGAAA---AAA--AGTA-TA--C-AGATG----G-A--CA-----G------------------ACAGACA--------ACGGA---------------CAA--AATA--------TAAGCTT---TTGGCTCAGGTGAGCTTAAAAAccc
gi|10 : taat----ACC-AGG---AA--GGT--TCTGG---------AGA--AGATG---A-TT-TG-----T-----------AAATG-AC--------CA-CA--------C-CTT-ATT----TT----GCATTTTGGTGATTATCTTGCC-TTTGA-----A-----GGGGGC----CT-AGT-CCT-----TCAT--T-C----GAAC-AAACTTGA---ATT-CT--C--TTCA-ACCAA-GG-----ATAATTT---GT---G-C-AA---CG----TTT--G----GT-TGA-AA-T-T-----G--------G--C-------CT------AG------T---G--GT---TCTGG---A---GAA--G--T--TGAAA-ATGTG---AAA--AGTT-AA--C-AGAC-----AGA--CA-----A-----------AAG----ACAGACA--------AAGGGCA-----------ATCAGAAAAAA-ACTCACTTGAGTCT---TCGGCTCAGGCGAGC-TAAAAa
gi|17 : ggggatcatgaattgaacaaacttaaatatctcctacatcaggtagctttaatgccaatctcagcttttccggcccaatgattctcgagaagatttttaaagattttccctttatatccacatgtaaaactttgatcccctattgtgtccccatcttacccctgggggtcatgatttgaacaaacttgattttccactat--------AC-CA--------C-CCT-ATT----TTT---GCATTTTCGTGATTATCTC-CCCTTTGA-----T-----GAGGGC----CT-GGT-CCT-----TCAT--T-T----GAAC-AAAATTGA---AGC-CC--C--TTCA-CCCAA-GG-----ATGATGT---GT---A-C-CA---AG----TTT--G----GT-TGA-AT-T-T--------------G--C-------CC------AG------C---G--GT---TTT-GAGAA---GAA--G--T--TGAAA-ATTTG---GAA--AGTT-TA--C-G-AC-----G-ACCCA-----AC---------G
gi|16 : T-ATT----TCT---GTATTATCTC----------CCCTTT-------A-----AGGGAC----CC-GGT-CCT-----TCCT--T-TAATTGAAC-AAACATGA---ATC-CC-----TTTA-TCCAA-GG-----ATGATTT---GC---A-C-CA---AG----TTT--G----GT-TGA-AA-T-G-----T--------G--C-------CC------AG------T---T--G----TCT-----------------------AA-ATGTG---AAA--AGTT-AA--CGG-AC-----A-A--CGT----GCA--------GATG----ACGGACA--------ACAGG--------CG---ATCAG--AAAA-GCT-ACTT--GC-C---TCGGCTCAGGTGA-C-TAgctcaggtgagctaaaaataggtcagagattaaatactcg
gi|19 : accacaccatttatttTTTAA-----A-----AGGGGA----AT-AGT-CCT-----GCAT--T-T----GAACAAAACATGA---AT
gi|23 : ttaggaagttttcatgtaaaatagtcacattctggtcgcatgtggtccttaagaagacattcaaatgcccacaacctagtttgggcattttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattatctctccTTGA-----A-----GAG-------CA-GCC-CCTCA---TCAT--CAT----GAAC----TTTGA---ATCTCC--C--TTCA-TGTAA-T------ATG--TT---AT---G-C-CA---CA----TTT--G----TT-TGA-AA-T-T-----T--------A--C-------CA------AA------T---G--GT---CGTGCAGAA---AAA--G--------------TG---AAAACAGTT---------------------------------------GATT----A-TGA------------GGAAAGAGCTTTGC--ATTAG--AA-A-ACTCAat
gi|3 : GT-CAT-----T-AT--T-T----GAAC-AAACTTGA---ATC-TC--C--ATTAGATCAG-AA-----AT--TTT---TC---ATT-TA---AA----TTTCAG----CT-TT---T-C-T-----A--------G--T-------CC------AG------T---G--GT---TCTTGAGAA---CAA--A--A--gtaacttttttcagctc
gi|14 : cttataagaatctatctctacaatacgtttgtaagattgctttatccctaatttgtgccacccaacccccggggggtttacgaggcattaatctgaaaaactcaatctacgtccaaatatcgatgaagttcaggataatatccactttcttgtgttcaatgtatgtattttttaaaagaatttccctactaatataattgcactgtaaaaatattctgatcctttggtggcccacattaccctggggttcatgaattggacagcttttatgctcgctatatcaggagcttatacaaatctaagctttcctggccctttattggtctcttgacgaagattttttaaagattttcccatatataatctgatatataaatctattgattccctaattggggccccattgtacccctgggggtgcatgaattagaaaacgttgaatctaactatatcaggaaaatgtttcatataaattccgattttcggcctagtgggttcttgagaatagaagattaaagaatttttccctatataatcatacgtaacaactgttttccctattgaaccgtgcccctatcgtacccccgggatcatgatttgaacgaaattttttgaatttccacatatatcaggaaagctttcatatacaaatttcagtactttctagcccgtggtgtcctggagaagattttttttttaaagatttttccattataaatcatatgtgaaatactctttgatccctcatatggcctcatcgtaccccggga-CCT-----TCAT--T-T----GAAC-AGATTTGA---ATT-CC--C--TTCA-TCAAA-AT-----ATGCTTTATGGC---A-A-CAGTTAC----TTT--G----AT-TGA-A--A-T-----G--------G--C-------CC------AGCTTTTTT---T--TT---TTT----------AA--G--ATTTAAAA-ATATATTCAAA--GTTT-TA--C-ATATGGATGA-A--CAG----ACT--------GACA----ATTAACA--------ATTAGCA-AAATGTG---ATCAG--AAAA-GCTCACTTCAG
gi|29 : cacccattttttcatttgctgatcatattttctcccctttcgatgggaaatgcatgca-CCT-----TCAT--T-T----CTAC-AAACTTGA---AT---------TTT---------G-----A--ATTT---CCTTAA-C-TA---AA----GTT--G----GT-TGA-AA-T-A-----A--------G--T-------CT------AA------T---T--GT---TCTGGAGAA---G
gi|25 : actctatgtttgacttttcttgattatctc-AAACTTGA---ATA-TC--AAATTTA-CCAAA-GA-----AAAACTT---AC---A--------AT----TTT--G----AT-TGA-CA-C-T-----A--------G--C-------TG------AA------A---A--GT---TCAGGAGAA---GAA--AACA--TGAAG-----G---AAA--A----CA--C-A--------A-A--CA----------------GA----------AAG--------GCGGCA-----TCTG---ATCAG--A-------CATTTAAATAA---GTGACTCAGGTGAGC-TAAAAAcatcgtcggaa
gi|26 : TC-TT--C--TTCA-TCCAA-AG------TG-TTT---GT---A-C-AA---AA----TGT--GTAATGA-TGG-AT-T-T-----GATGATGAGG--CAAACTGGCC------AG------T---G--AT---TCTGGAGAT---AAA--G--A--AAAAATATTTG---CAA--AGTT-AA--C-AGAC-----A-A--
gi|24 : gaactaattaggaaatg-GG-----ACGTTTT---GG---G-T-CA---A-----TTT--A----AA-GGA-AT-T-T-----AAA------G--C-------TC------AG------TTTTA--GTGCCTCTGGAGAA---GAA--G--T--TGAAA-A-GTT---AA-----TT-TATCC-A-AG-----G-A--CA-----A-----------ATC-----CTA--------------GTTA-AATGTTG---ATCAG--AACACACTCACTTGAGCCTTTATTAGCTCAGGTGAGC-TACAAatggatggacagac
gi|42 : TTT---GC---A-T--A---AG----TTT--G----G--TGATTT-T-T-----G--------G--C-------CC------CA------T---T--GT---TCTGGA
gi|8 : cctcaactT---GC---A-T-CA---AGAAGCTTT--G----ATGTAA-AT-T-TCAACTG--------G--T-------CC------AG------T---G--GT---TTTTGAGAA---GAT--T--A--TGCAA-ATcagattttgcctatatc
gi|32 : cctattctctttagagaagtggacagacatagcctggatgtaggctatgcctgtccacttctctaaagagaatacccctaccccaattctctgcatgtgaaattttgatctcatattatggccccatcaataccctgtggaccgttttaaaaaacacacacaccaaaaacttgaatctgcatcatgtcaggaagttttcaacttttctagtcaagactagtggttttgagaagaatctaaaagattttatgtataacagatttgatcatctattgtggccccacaggggtcatgaattgaacaaacttgaatctagtccatgccaggaagctttagggcaaattttaattttcctcacaaagtagttctttcctatacatccgcatgtacacaactttcatcccctaatgttgccccaatcgtaatatccatacgcG----TTT--A----GT-TGA-AA-T-T-----G--------A--T-------CC------AA------C---G--AT---TCCGGAGAAGTTGAA--G--A--CGAtatttaatttcattttaaggtgattac
gi|39 : GA-AT-T-T-----G--------G--T-------CC------AG------T---G--GT---TCTAGAGAA---GAA--G--G--TGAAA-ATGTG---AAA--AGTT-TA--T-A-AC-----G-A--CG-----GC---------GA--------CGACA--------ACAGcggagaccgagatattaaacagaaaagctgagctcacttcagtcctcagatcaagt
gi|45 : ---GAA--G--A--TGAAA-ATGTG---AAA--AATT-TA--C-G-AC-----A-A--TA-----a
gi|38 : A-AACTTCA---ATCAG--AAAA-GCTCACTTAAGTTT---TCAGCTAAAGTGAGC-TAAAAAgaaacggacaggtgagctaaaaat
gi|17 : atagatgccagacaacttaaacCGGCTCAGGTGAGC-TAAAAA
9 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): AAACTCTGATGACATCATAGAGTTTTTAATGATATTTGGAATTTATAAGCTGAACAAAAAAAAAAAAAACCAAAACAAGAGGCCCATGGGCCACATCGTTCACCTGAGTACCAATGGTCCTGGTTTAGCAGTGGTGATTTAAAAAGAAAATTTTCATAATTTTTTT
Unaligned ( gi|28 ): TTCTGGAGAAGAGAGTCGAAATATGGTATAAAAAATGATATTAACAGAGAGGAGAAGACTCAGAACGTGACGCACGGACACAAAAAGAGCAACTCAGAAAAGATCACCTCAGCCTCGCGCAGGTGAGCCTCAA
Unaligned ( gi|30 ): CCTCTTCTTCTTACCATATATAAGAGGACAGAAATAAGCTACATATGTCCGTGGGTGAAGGCTGTACCTGTCCTATTCTCTATCTAAACAGAATACCTCCTACCACTATTCTT
Unaligned ( gi|31 ): GCGTGTAGGCTAATTAATTAAGGATTTCAACACATAGTAGCTAAAATAAAACCTGAACTAGAGGCCCATAGGCCATACTGCTCACCCTGTCCCTTTGCTCA
Unaligned ( gi|33 ): AAAGAAGACGTCCATGATCCACATCACCCACCTGAGTAACATCGACTCTGCTGTCCAAATTCCCACTCCGTATTATGGGGATGCTTCAATATCAATAT
Unaligned ( gi|40 ): AAACAAGACCGGCCCATGGACCACTTTCGCTGCTCACTGCCTATAGTTGACACTTCGGCCCTCGCACTCT
Unaligned ( gi|41 ): AAATTATTCCAATCATATCCTATTCTGAAGTGATAAAATTTATATTCAACTCGCATAATACAATAAT
Unaligned ( gi|44 ): AAAGTGGATTGGCATCAGGGTGTAGACAATGCCTGTCCGCTTCTTTAGAAATAATATCC
Unaligned ( gi|47 ): TTGAAAACAAGAGGCCCATGGACCACAATACTTACCCGAGTCATATT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 2 4444 1 11 11 11 111 11111111111111111111 111111 1111 11111111 111111111111 11111111111111111111 3333333333333333333333 11111 333 11111 11111 111 11111111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777 11111111111111111 4444444444 11111111 1111111111 11111111 111 11111111111111111111111111111111111 1111111 111111111 111111111 22222222 11111 111111 22222222 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111111 11111111 111111 1111 11111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11111
lowQualScore : 6 7 0 3 4 2222 4 5 2 33 00 66 11 3 1 7 777 2 2 777 5 88888888888888888888 3 3 000000 0000 44444 5 77777 00000000 444444444444 33 44 77777777777777777777 0000000000000000000000 66 5555 2 11111 444 444 66 33 2 222 33 22222 2 33 9999999999 777777 5 11111 5 66666 444 444 2 2 5 44 5 33 5 2 222 2 33 33 2 2 2 33 55 33 2 2 333 1 33 2 77777 0 1 555 555 2 2 00000000 3333333333333333333333333333333333333333333333333333 33 55555555555555555 2 33 77777 2 2 44 44 3 6 1 3 5 88 0000000000 555 8888 44 88 444 77 66 6666 88 1 3 3 3 999 3 666 3 44 3 11111111 3 3 555 5555555555 44 33333333 99999 777 11111111111111111111111111111111111 3 7 0000000 7777 555 6 44 3 333333333 3 3 000000000 4 4 55 11111111 4 4 55 4 8 8888 4 8 3 7777 3 88888 44 3 22222 3 44 222222 2 6 3 3 77 55555555 55 3 3 99999 88 4 55 3 8888 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 7777777 4 33 2 6666 2 2 555 2 2 444444 0 4 88888888 444 5555 55 2 11111111 7777777 000000 666666 444 666 3 555 2 33 1111 4 444 444 33 00000 33 33 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 3 44 3 1 00000 4
lowQualScore : . . . . . .... . . . .. .. .. .. . . . ... . . ... . .................... . . ...... .... ..... . ..... ........ ............ .. .. .................... ...................... .. .... . ..... ... ... .. .. . ... .. ..... . .. .......... ...... . ..... . ..... ... ... . . . .. . .. . . ... . .. .. . . . .. .. .. . . ... . .. . ..... . . ... ... . . ........ .................................................... .. ................. . .. ..... . . .. .. . . . . . .. .......... ... .... .. .. ... .. .. .... .. . . . . ... . ... . .. . ........ . . ... .......... .. ........ ..... ... ................................... . . ....... .... ... . .. . ......... . . ......... . . .. ........ . . .. . . .... . . . .... . ..... .. . ..... . .. ...... . . . . .. ........ .. . . ..... .. . .. . .... .............................................................. ....... . .. . .... . . ... . . ...... . . ........ ... .... .. . ........ ....... ...... ...... ... ... . ... . .. .... . ... ... .. ..... .. .. .................................................................................. . .. . . ..... .
lowQualScore : 0 0 5 0 0 5555 0 5 5 00 22 00 00 8 0 3 555 8 5 888 4 55555555555555555555 3 3 222222 7777 22222 7 11111 44444444 666666666666 99 11 66666666666666666666 9999999999999999999999 88 7777 7 33333 777 444 33 88 5 444 44 22222 5 44 8888888888 444444 0 33333 0 22222 444 111 4 5 0 99 1 44 0 7 000 7 44 22 4 5 5 44 44 44 5 2 999 2 44 5 33333 1 2 000 000 9 9 44444444 2222222222222222222222222222222222222222222222222222 99 99999999999999999 9 99 11111 9 9 22 22 1 2 0 1 1 88 4444444444 444 6666 22 00 999 33 22 5555 55 7 1 3 3 222 3 000 3 66 3 22222222 3 3 888 5555555555 66 88888888 11111 777 88888888888888888888888888888888888 6 3 8888888 1111 888 7 66 3 333333333 3 6 222222222 0 1 55 33333333 0 0 00 0 0 5555 0 0 6 7777 6 33333 66 3 99999 3 66 999999 3 7 3 1 33 77777777 88 3 3 11111 11 0 55 6 5555 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 7777777 2 99 9 1111 9 7 000 9 9 222222 1 1 99999999 777 3333 44 4 88888888 6666666 000000 888888 111 111 4 888 2 11 1111 7 111 111 22 00000 44 22 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1 22 3 0 77777 0
consensus : AGCTGTATCTT-ANCCCNGGGGGTCACGATTNGTANCAAGTTTNNTTG-AAACTGACCCAGT--GGTTCTGGAGAAGAANATTTTATGTAAAA---CTTTGATC---CCCT-----A--TT----------GTGG-CCC-CACC-C-TACCCCC---GGGG--G--TC-A-----TG--------ATTTGAA------------CAAA--CTT-GAAT--CT-A---CTNT-ATGTC-AGGAAGCTTTCA--TGTAA--ATATCGTC-----T--TTT----CTG-GCC-----C---AG---TGGT--TCT-TGA-GAAGA--ATTT--TT-----AAA-G--A--------T-TTTCCC-T----AT-ATATTC--AC-A-TG-----TAAA---AC---T-TTGATCCC-CTA-TTGTGGCCC-CATCNT--A-C-CCC--GGGGGT-CATG--ATT--TGAA-CAAAC-TTG-AATC--TN-CACT--ATA-TCAGGA-A---GCTTTCATATAA--AT-TT-N-A-GCTTTTCTGGCCC---AG---TGG-T-T--------CTT----------GA------------G-------------AA------------GA--TTTT---------C-------CC-T--A-----T-AT-AT--TC--ACATGTA-A-AACT-TTGAT-CCCCTATT--------GT---G---GCC--CCATCGTACCCCCGGGGGT-CATGATTTGAAC--AAA-NTT----GAATC--TCCAC-TATA-TCA-GGAA---GCTT-TCATATA--AATTTCAGC-TTTTCTGG--CC-CAG---T----G-GT-TCT---T------G---AGA--AG---A----TTTTT-----AAAGA---TTT--CCCT--------C----------AC--------ATGTA-A-A-------A----C---T-TTG--A-TC---------CC-CT-ATT-----G---T-GGCCCCATCG--TACCC---C--GGGGG-TC-ATGATTTGAA-C-AAA----CTT-GAATCTCCAC-TATATCAGG-AA----GCTTTCA-TA-----T--A-AATT-----TCAGC-TTT--TCT------GGCC-CA-GT-GGT--TCTTG--A--A--AGAAG-ATT-TT-T-----AAATGACAC-CAC--CCTA-TTTTT---GCAT--------------T---T-------------C-------------CCT-------------TTGAAGGGGGC-----CTGGTCCT--TCATT-T----GAAC-AAACTTGA---ATC-CC-CTTCACCCAA-GGATGATTT---GT---ACCA---AGTTTG----GTTGAAT-T-TG--------GC-------CC------AG------C---GGT---TCTGGAGAA---GA-A--GN--CGAAA-ATG---TG---AAA--AGT-----T-NA--CA----------GAC----A-A--CA-------------AC-GA--C----GACAGACA-A-CG--G-G-A---A--AA--T-CGA-TCAG--AAAA-GCTCACTTGAGCCTTCG---GCTCAGGTGAGC-TAAAAA
Reference ( family-218 ) : AACTGAATCTTCAACCCAAGG----ATGATTTGTACCAAGTTTGGTTG-AAATTGGCCCAGT--GGTTCTGGAGAAGAANATTTTATGTAAAA---CTNTGATC---CCCT-----A--TT----------GTGG-CCC-CNTC-C-TACCCCC---GGGG--G--TC-A-----TG--------ATTTGAA------------CAAA--CTT-GAAT--CT-A---CTAT-ATGTC-AGGAAGCTTTCA--TGTAA--ATATCGTC-----T--TTT----CTG-GCC-----C---AG---TGGT--TCT-TGA-GAAGA-GATTT--TT-----AAA-G--A--------T-TTTCCC-T----AT-ATATTC--AC-A-TG-----TAAA---AC---T-TTGATCCC-CTA-TTGTGGCCC-CATCGT--A-C-CCC--GGGGGT-CATG--ATT--TGAA-CAAAC-TTG-AATC--TC-CACT--ATA-TCAGGA-A---GCTTTCATATAA--AT-TT-N-A-GCTTTTCTGGCCC---AG---TGG-T-T--------CTT----------GA------------G-------------AA------------GA--TTTT---------C-------CC-T--A-----T-AT-AT--TC--ACATGTA-A-AANT-TTNAT-CCCCTA----------GT---G---GCC--CCATCGTACCCCCGGGGGT-CATGATTTGAAC--AAA-NTT----GAATC--TCCAC-TATA-TCA-GGAA---GCTT-TCATATN--AATTTCAGC-TTTTCTGG--CC-CAG---T----G-GT-TCT---T------G---AGA--AG---A----TTTTT-----AAAGA---TTT--CC----------C----------AT--------ATGTA-A-A-------A----C---T-TTG--A-TC---------CC-CT-ATT-----G---T-GGCCCCATCG--TACCC---C--GAGGG-TC-ATGATTTGAA-C-AAA----CTT-GAATCTCCAC-TATATCAGG-AA----GCTTTCA-TA-----T--A-AATT-----TCAGC-TTT--TCT------GGCC-CA-GT-GGT--TCTTG--A--A--AGAAG-ATT-TT-T-----AAATGATAC-CAC--CCTA-TTTTT---GCAT--------------T---T-------------C-------------CNT-------------TTGAAGGGGGT-----CNGGTCCT--TCATT-T----GAAC-AAACTTGA---ATC-CC-CTTCACCCAA-GGATGATTT---GC---ACCA---AGTTTG----GTTGAAT-T-TG--------GC-------CC------AG------T---GGT---TCTGGAGAA---GA-A--GA--TGAAA-ATG---TG---AAA--AGT-----T-NA--C-----------GAC----A-A--CA-------------AC-GA--T----NACNGACA-A-CG--G-G-A---A--AA--T-CGA-TCAG--AAAA-GCTCACTTGAGCCTTCG---GCTCAGGTGAGC-TAAAAA
gi|1 : --TGAG-TGACC-TTG-GCCC--TCGCACTCTATA-TCAGGA-A---GCTTTAAGGTAA--ATGTTGT-A-ACTT---TGG-----------------T--------CTT----------GA------------G-------------AA------------GA--TTAC---------C-------CC-T--A-----T-AT-ATAATC--ATGTGTA-A-AACT-TTGAT--CCCTA----------TT---GGGCGCCCACCATCGTACCTCCGGGGGT-CATGATTTGAAC--AAA-CTT----GAATC--TCC-T-TATA-TCACGGAA---GC-G-TCATA-A--AATATCAGC-TTTCCTGGTCCC-CAG---T----G-GG-TTT---T------G---AGA--AG---AAAACTTTTT-----AAAAAAT-TTT--CC----------CTG--------AT--------TCTTG-A-A-------A----CAAAT-TTGCAA-TC---------CCACT-AT
gi|1 : acaagaggcccatgggccacatcgctcaccTG--ATTCTTGAAACAAAT-TTGCAATC---C-CACT--ATA-TCAGTAGA---GCTTTCCAATGA--AT-CT-C-A-GCTTTCCTGGCCC---AAGGTTGG-T-TTTCTTTTCCTTTTTCGAACAGAA------------G-------------AA------------GA--TTTT---------TAAGACTTCC-TCAA-----T-ATCAA--TC--ACATGCT-A-AACC-TTGAT-CCC-TATT--------GT---G---GCC--CC-TCGTACCCC-GGGGGT-CATGATTTGAACC-AAA-CTT----TAATC--TCCAC-TATATTCA-GGA-----CTTCCCATATT--AATCTCAGC--TTCCTGG--TC-CAGACAT----GTGT-TCT---TC-----G---AAA--GA---A----TTTTT-----AAAGGATTTTT--CCCTATATAAT-C----------AT--------ATGTAGA-A-------A----C---TCTTG--A-TC---------CC-ATAATT-----G---T-GG-CCCATCA--TACCC---C--AGGGG-TC-A--ATTTGAA-CAAAA----CTT-GAATCTCCTC-TATATTAGG--A----GCTTCCA-TA-----T--ACAATT-----TCAGC-TTTCGTCT------GGCC-CA-GT-GGT--TCTTG--AAGA--AGAAGAATTGTT-TTGTTAAAATCACAC-CA---CCTA-TTTTTTGCGCATTGTTTGTGATTATCT---C-------------C-------------CCT-------------TTGAAGGGGCT-----C-GGTCCT--TCA-T-T----GAAC-AAAC-TGA---ATC-TC-CTTCACCCAAGGGATGATTG---GT---ATCA---AGTTTG----GTTGAATAT-TG--------GC-------CC------AG------T---GGTC--TCTTGAGAA---AA-A--GT--CGAAA-ATG---TG---AAA--AGT-----TAGA--C-----------GAC----AGA--CA-------------atcagtagagctttccaatgaatctcagctttcctggcccaaggttggttttcttttcctttttcgaacagaagaagatttttaagacttcctcaatatcaatcacatgctaaaccttgatccctattgtggcccctcgtaccccgggggtcatgatttgaaccaaactttaatctccactatattcaggacttcccatattaatctcagcttcctggtccagacatgtgttcttcgaaagaatttttaaaggatttttccctatataatcatatgtagaaactcttgatcccataattgtggcccatcataccccaggggtcaatttgaacaaaacttgaatctcctctatattaggagcttccatatacaatttcagctttcgtctggcccagtggttcttgaagaagaagaattgttttgttaaaatcacaccacctattttttgcgcattgtttgtgattatctcccctttgaaggggctcggtccttcattgaacaaactgaatctccttcacccaagggatgattggtatcaagtttggttgaatattggcccagtggtctcttgagaaaaagtcgaaaatgtgaaaagttagacgacagacagaagg
gi|10 : acaagaggcccatgggccacatcgctcacctgagtgaccttggccctcgcactctatatcaggaagctttaaggtaaatgttgtaactttggtcttgagaagattacccctatatataatcatgtgtaaaactttgatccctattgggcgcccaccatcgtacctccgggggtcatgatttgaacaaacttgaatctccttatatcacggaagcgtcataaaatatcagctttcctggtccccagtgggttttgagaagaaaactttttaaaaaattttccc---GGGG--A--TC-A-----TG--------AATTGAA------------CAAA--CTT-AAATATCT-C---CTAC-AT--C-AGGTAGCTTTAA--TGCCA--ATCTCAGC-----T--TTT----CCG-GCC-----C---AA---TGAT--TCT-CGA-GAAGA---TTT--TT-----AAA-G--A--------T-TTTCCC-T----TT-ATATCC--AC-A-TG-----TAAA---AC---T-TTGATCCC-CTA-TTGTGTCCC-CATCTT--A-C-CCCT-GGGGGT-CATG--ATT--TGAA-CAAAC-TTG-ATTT--TC-CACT--ATA-CCAGGA-A---GGTTgaagg
gi|10 : ATCTT-ACCCCTGGGGGTCATGATTTG-AACAAACTTGATTTTCCACTATACCAGGAAGGTTCTGGAGAAGATGATT---TGTAAA-------TGACCACACCTT-----A--TTTTGCATTTTGGTGA---T-TATC-T-TGCCTTTGAAGGGG--G--CCTAGTCCTTC--------ATTCGAA------------CAAA--CTT-GAAT--TC-T---CTTC-A-ACC-AAGGATAATTTG--TGCAA------CGTT-----TG-GTTGAAATTG-GCC-----T---AG---TGGT--TCT-GGA-GAAGctggagaagatgatttgtaaatgaccacaccttattttgcattttggtgattatcttgcctttgaagggggcctagtccttcattcgaacaaacttgaattctcttcaaccaaggataatttgtgcaacgtttggttgaaattggcctagtggttctggagaagttgaaaatgtgaaaagttaacagacagacaaaagacagacaaagggcaatcagaaaaaaactcacttgagtcttcggctcaggcgagctaaaa
gi|10 : ggggatcatgaattgaacaaacttaaatatctcctacatcaggtagctttaatgccaatctcagcttttccggcccaatgattctcgagaagatttttaaagattttccctttatatccacatgtaaaactttgatcccctattgtgtcccc-GGT--TCTGG--AG-A--AGATG-ATT-TG-T-----AAATGACCA-CAC--CTTA-TTTT----GCAT--------------T---T-------------TGGTGATTATCTTGCCT-------------TTGAAGGGGGC-----CTAGTCCT--TCATT-C----GAAC-AAACTTGA---ATT-CT-CTTCAACCAA-GGATAATTT---GT---GCAA---CGTTTG----GTTGAAA-T-TG--------GC-------CT------AG------T---GGT---TCTGG---A---GA-A--GT--TGAAA-ATG---TG---AAA--AGT-----T-AA--CA----------GAC----AGA--CA-------------A---A--A----GACAGACA-A-AG--G-G--------------CAA-TCAGAAAAAA-ACTCACTTGAGTCTTCG---GCTCAGGCGAGC-TAAAAttgaaaatgtgaaaagttaacagacagacaaaagacagacaaagggcaatcagaaaaaaactcacttgagtcttcggctcaggcgagctaaaa
gi|11 : ggggatcatgaattgaacaaacttaaatatctcctacatcaggtagctttaatgccaatctcagcttttccggcccaatgattctcgagaagatttttaaagattttccctttatatccacatgtaaaactttgatcccctattgtgtccccatcttacccctgggggtcatgatttgaacaaacttgattttccactataccaggaaAGC-TTTTCTGG--CC-CAG---TTCCAG-GT-TCT---T------G---AGA--AG---AAGA-TTTTT-----AAATA---TTT--TC----------CCTATTTAAACAC--------ATGTA-A-ATAATTAAA----T---T-ATG--A-TA---------CC-CT-AAT-----G---T-GGCCCCATCA--TACCC---CCCG-GGG-TC-ATGATTTGAA-C-AAA----CTC-AAATCTCTAC-TATATCAAG-AA----GCTTTGA-TA-----T--A-AATT-----TAAGC-TTT--TTTT-----GGCC-CA-GT-GGT--TCTTG--AG-A--AGAAG-ATT-TT-T-----AAATGACAC-CAC--CCTA-GTTTT---GCAT--------------T---T-------------T-------------CGTGATTATCTCCTCTTTCATGAGGGC-----CTAGTCCT--TCATT-T----GAAC-AAACTTGG---ATC-CC-CTTCA-------------------C---ACCA---AATTTG----GTTGAAT-TATG--------GC-------CC------AG------C---GGT---TCTGGAGAAG--GA-A--GT--CGAAA-ATG---TG---AAA--AGT-----T-AA--CA----------GAC----A----------------------GA--C----AACATACA-A-AA--G-G--------------CGA-TCAG--AAAA-GCTCACTTGAGCCTTTG---GCTCAGGTGAGC-TAA
gi|12 : a-------A----C---T-TTG--ACTC---------CG-CC-ATT-----GCAAT-GGACTCAACAATTACCTACAC--GACGA-TC-A-GACTTGAAAC-AAA----TTTCGAGATGCCACATATATTGAG-AAATGTGCTTTTA-CAATAAAT--A-AATTGTGTTTCAGT-CTT--TCTCTGCGGGACCGCA-GTCGGTGATCTTG--A--AGGAGAAG-AGT-CT-T-----ta
gi|13 : CAGG------GCTTCCGTA-----GT-TT-C-A-GCTTTTTTAGCCT---AG---TGG-T-T--------CTT----------GA------------G-------------AA------------GA--TTTT---------T-------TC-T--A-----C-CT-AT--TC--ACATGTA-C-AACT-TTGAT-TCCCTATT--------GT---G---GCC--CCATCGTATCTCCTGGGGT-CATGATTTTAAT--AAA-GTT----GAATA--TCCAC-TATA-TGA-GGAA---GCTT-TCATATA--AATTTCATC-TTCTCTGG--CC-CAA---T----G-AT-TCTTGAT------G---AGA--AG---A----ATTTT-----GAAGA---TTTG-CCCTATTATT--C----------AC--------ATGTA-A-A-------A----C---T-TTG--A-TC---------CC-Ctgtttgaaaatgtatcgcacacccataaccatttgaatatgctaatctgcgatattactccctttagcagagggacctcacgcctccatgatgtagtaacaaaaacaatgatgagaatgccccacggcctcttacacgaacacggatgatttgcactaggagaaggtttgagatatcgacacggttggctacacatttttctggagaagagagtcgaaatatggtataaaaaatgatattaacagagaggaga
gi|14 : CCT--TCATT-T----GAAC-AGATTTGA---ATT-CC-CTTCATCAAA-ATATGCTTTATGGC---AACAGTTACTTTG----ATTGAA--A-TG--------GC-------CC------AGCTTTTTT---TTT---TTT----------A-A--GATTTAAAA-ATA---TATTCAAA--GTT-----T-TA--CATATG------GATG---A-A--CAG------------ACTGA--C----AATTAACA-ATTA--G-C-A---A--AA--TGTGA-TCAG--AAAA-GCTCACTTCAG
gi|15 : cacccattttttcatttgctgatcatattttctcccctttcgatgggaaatgcatgca-----T--A-ATTT-----TCAGC-TTT--TCT------TGCC-CA-GT-GAT--TCTTA--T--A--AGAA---------------------------T--CCTA-CTTTT---GCAT--------------T---TTCTTGATTTTCTCC-------------CCT-------------TTCAAAGGAG------CATGTTTT--T--TT-T----TAAC-A----TGATCAATC-CCGCTTTAT-----GGG-----------------A---AATTTG----ATTGAAA-T-TA--------GC-------CC------TG------C---AGT---TATGGAGAA---GA----GA--TCGAA-AGA---AA---AAA--AGT-----A-TA--CA----------GAT----GGA--CA-------------------------GACAGACA-A-CG--G-ACA---A--AA--T---A-T-------AA-GCT----------TTTG---GCTCAGGTGAGCTTAAAAA
gi|16 : TA-TTTCT---GTAT--------------TATCT-------------C-------------CCC-------------TTTAAGGGA-C-----CCGGTCCT--TCCTT-TAATTGAAC-AAACATGA---ATC-CC-TTT-ATCCAA-GGATGATTT---GC---ACCA---AGTTTG----GTTGAAA-T-GT--------GC-------CC------AG------T---TG----TCT----------------------AA-ATG---TG---AAA--AGT-----T-AA--CG----------GAC----A-A--CGT------------GCAGA--T----GACGGACA-A-CA--G-G--------------CGA-TCAG--AAAA-GCT-ACTTG---CCTCG---GCTCAGGTGA-C-TAa
gi|17 : accacaccatttatttAC-CAC--CCTA-TTTTT---GCAT--------------T---TTCGTGATTATCTCC-------------CCT-------------TTGATGAGGGC-----CTGGTCCT--TCATT-T----GAAC-AAAATTGA---AGC-CC-CTTCACCCAA-GGATGATGT---GT---ACCA---AGTTTG----GTTGAAT-T-T---------GC-------CC------AG------C---GGT---TTT-GAGAA---GA-A--GT--TGAAA-ATT---TG---GAA--AGT-----T-TA--C-----------GAC----G-ACCCA-------------AC-GG--C----T-CAGGTG-A-GC--T-A-A---A--AA--T-AGG-TCAG--AGA
gi|18 : ---TGGT--ACT-TTG-GAGG------T--TT-----AAA-G--AGAAATTTGT-TTTCCA-T----ATCATATTC--CA-A-TA-----TATA---AT---T-T--------CTG-TTGT---CC-CATCCT--GGT-CCT--GGAATT-CATG--GTT--TAAA-CAGAG-ATG-GATCCTTC-AACT---CA-T-AAGA-A---GCTTTCATGCAAGGAT-TG-A-A---TTTACTA--CT---AG---TAA-T-T--------Cttaaatactcg
gi|18 : tggttcaacagtttcagagaagaaaattaata--TTTT---------C-------CA-T--A-----TCAT-AT--TC--CAATATA-T-AATT-T--------CT-----------GT---T---GTC--CCATCCTGGTCCTGGAATT-CATGGTTTAAAC--AGA-GAT----GGATCCTTCAAC-T-CA-T-A-AGAA---GCTT-TCAT
gi|19 : tggttcaacagtttcagagaagaaaattaatatggtactttggaggtttaaagagaaatttgTTAGG-AA----GTTTTCA-TG-----T--A-AAATAG---TCA---CAT--TCT------GGTCGCATGT-GGT--CCTT------A--AGAAG-ACA-TT-C-----AAATG--CC-CACAACCTAGTTTGG---GCAT--------------T---T-------------gcaaggattgaatttactactagtaattc
gi|19 : AT--------------C---T-------------CT------------CCT-------------TTAAAAGGGGA-----ATAGTCCT--GCATT-T----GAACAAAACATGA---ATtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattatctctcctttaaaaggggaatagtcctgcatttgaacaaaacatgaatat
gi|2 : ttaggaagttttcatgtaaaatagtcacattctggtcgcatgtggtccttaagaagacattcaaatgcccacaacctagtttgggcattttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattAGCTGTATCTTNAACCCAAGG----ACGATTAGTACCAAGTTTCCTTG-AAATTGACCCAAT--GGTTCTGGAGAAGAACATTTTATGCAAAA---CTGAGATC---CCCT-----A--TT----------GTGG-CCC-CTCC-C-TACCCCC---GGGG--G--T--A-----TG--------ATCTGCT------------CAAA--TTT-GGAT--CT-A---CTAT-ATGTC-AGGAACCTTTAA--GGTAA--ATATTGTT-----T--CTT----CTG-GTC-----C---AA---TGGT--TCT-TGA-GAAGACGATTT--TT-----AAA-G--A--------T-TTTCCC-T----AT-ATATTC--TT-A-TG-----TAAA---AC---T-TTGATCCC-CTA-TTGTGGCCC-CATCGT--A-C-CCC--GGGGGT-CATG--ATT--TGAA-CAAAC-TTG-AATC--TT-CACT--ATA-TCAGGA-A---GCTTTCATATAA--AT-TT-A-A-GTTTTTCTGGCCC---AG---TGG-T-T--------CTT----------GA------------G-------------AA------------GA--TTTC---------C-------CC-T--A-----T-AC-AT--TC--ACATGTA-A-AAAT-CTTAT-CCCCTA----------AT---G---GCC--CCATGGTACCCCCGGGGTT-TATGATTTGAAC--AAA-ATG----GAATC--TTCAC-TATT-TCA-GGAA---GCTT-TCATATC--AATTTCAGC-TTTTCTGT--CC-CAG---T----G-GT-TCT---T------G---AGA--AG---A----TTTTT-----AAAGA---TTT-------------------------AT--------ATATA-A-A-------A----C---T-TTG--A-TT---------CC-CT-AAT-----A---T-GGCCCCACCG--TACCCAA-G--GAGGG-TC-GTGGTTTGAA-C-AAA----CTT-GAATCTCCAT-TATATCAGG-AA----GCTTTTA-TA-----T--C-AATT-----TCAGC-TTC--TCT------GACC-AA-AT-GGT--TCTTGTCA--A--AGAAG-ATT-TT-T-----AAATGATAC-CAC--CCTA-TTTTT---GCA---------------------------------C-------------CAT-------------TTGAAAGGGGT-----CAGGTCCT--TCATT-T----GAAC-AAACTTGA---ATC-CC-CTTTACCCAA-GGATGATTT---GC---ACCA---AGTTTG----GTTGAAT-T-TG--------GC-------CC------AG------T---AGT---TCTGGAGAA---GA-A--GA--TGAAA-ATG---TG---AAA--AGT-----T-TA--C-----------AAC----A-A--CA-------------AC-GA--T----TACTGACA-A-CG--G-G-A---A--AATTT-TGA-TCAG--AATA-GCTCACTTAAGCATTCG---GGTCAGGTGAGC-TAAAAAat
gi|20 : -ATGTT-AGAAAG----------TAA--TTTTCCAC-----T--TTT----CTG-GCC-----C---AG---TTGT--TCG-TGA-GAG-----TTT--TT-----AAA-A--A--------T-T--CCCAT----AA-ATATTC--GC-A-TG-----TAAA---AC---T-TTGATTCC-CTA-TTGTAGAAC-CACCCT--A-C-CCA--AAAGGC-AATAGTATT--TG---CAAAT-TTG-AATC--TG-CACA--ATG-CCAGAA-A---GCTTTTATGTA
gi|21 : AAGCTTTCAACTGTA------T--TC-----TACTTT----CTG-GCC-----C---AG---TTGT--TCGATGG-GAAGA----TT--TT-----AAA-G--A--------TGCTTCCC-T----A--ATATGCT-GC-ATTG-----TACA---AC---T-TTGATCCC-TTT-TTGTGGCCT-T-TCCT--A-C-CC----------AAAG--ATT--TGAA-CAAAT-TGA-AATC--TA-TCCT--G-A-TCA-GA-G---GCGTTCATG-AA--AT-
gi|23 : -------------TTGAAGAG--------CAGCCCCTCATCATCAT----GAAC----TTTGA---ATCTCC-CTTCATGTAA-T-ATG--TT---AT---GCCA---CATTTG----TTTGAAA-T-TT--------AC-------CA------AA------T---GGT---CGTGCAGAA---AA-A--G---------------TG---AAAACAGT-----T-GA--cc
gi|24 : -GGACGTTTT---GG---GTCA---A-TTTA----AAGGAAT-T-TAAA------GC-------TC------AG------TTTTAGTGCCTCTGGAGAA---GA-A--GT--TGAAA-A-G---TT---AA-----T-----T-TATCC-----------AAG----G-A--CA-------------A---A--T----CCTAGTTA-A-------------A--TG--T-TGA-TCAG--AACACACTCACTTGAGCCTTTATTAGCTCAGGTGAGC-TACAAttatgaggaaagagctttgcattagaaaactcagtaacttttttcagctc
gi|26 : TC-TT-CTTCATCCAA-AG-TG-TTT---GT---ACAA---AATGTGTAATGATGGAT-T-TGATGATGAGGCAAACTGGCC------AG------T---GAT---TCTGGAGAT---AA-A--GA--AAAAATATT---TG---CAA--AGT-----T-AA--CA----------GAC----A-A---A-------------TG-GA--TG---GACAGAC
gi|27 : gaactaattaggaaatgCCC-T----AT-ACATGT--AC-A-TAGGCATCAAA---A--------GCTCCC-CTA-TTGTGGCTC-AAACCT--A-C-CCCT-GGGGGC-AATG--ATT--TGAA-TAGAT-TGG-AATC--TA-CTTT--ATA-TAAGAA-A---AC-TTCAT-TAA--AT-
gi|27 : TC---CCCT-----A--TT----------GTGG-CTC-AAAC-C-TACCCCT---GGGG--G--CA-A-----TG--------ATTTGAA------------TAGA--TTG-GAAT--CT-A---CTTT-ATATA-AGAAAAC-TTCA--T-TAA--ATAaactgcatactattggtgtgcatt
gi|28 : ccctatacatgtacataggcatcaaaagcT---TCTGGAGAA---GAGA--GT--CGAAATATGGTATA---AAA--AATGATATT-AA--CAGAGAGGAGAAGACTCAGA-A--CGTG-----------AC-G--------CACGGACA---CA--A-A-A---A--GA--G-CAACTCAG--AAAA-GATCACCTCAGCCTC-----GCGCAGGTGAGC-actgcatactattggtgtgcatt
gi|29 : CCT--TCATT-T----CTAC-AAACTTGA---ATT-----TT---------GA--ATTT---CCTTAACTA---AAGTTG----GTTGAAA-T-AA--------GT-------CT------AA------T---TGT---TCTGGAGAA---Gctcaa
gi|3 : actctatgtttgacttttcttgattatctcTGTAAGATTGCTTT-ATC---CC-T-----AATTT----------GTG----C-CACC-C-AACCCCC---GGGG--GGTTT-A-----CGAGGCATTAATCTGAA-------------AAA--CTC--AAT--CT-ACGTCCAA-ATATCGATGAAG--TTCA--GGATA--ATATCCAC-----T--TTC----TTGTGTT-----C---AA---TGTA--TGT------------ATTT--TTTA---AAA-G--A--------A-TTTCCC-TACTAAT-ATAATT--GC-ACTG-----TAAAAATAT---T-CTGATCCT-TTG---GTGGCCCACAT--T--A-C-CCT--GGGGTT-CATG--AAT--TGGA-C-AGC-TTT-TATG--CT-CGCT--ATA-TCAGG--A---GCTT--ATACAA--AT-CT-A-A-GCTTTCCTGGCCCTTTAT---TGG-TCT--------CTT----------GACGAAGATTTTTTA-------------AA------------GA--TTTT---------C-------CCAT--A-----T-AT-AA--TCTGATATATA-A-ATCTATTGAT-TCCCTA----------ATTGGG---GCC--CCATTGTACCCCTGGGGGTGCATGAATTAGAA--AAC-GTT----GAATC--T-AAC-TATA-TCA-GGAAAATG-TT-TCATATA--AATTCC-GA-TTTTC-GG--CC-TAG---TG---G-GT-TCT---T------G---AGAATAG---A----AGATT-----AAAGAATTTTT--CCCTATATAAT-C----------AT--------ACGTA-ACA-------A----C---TGTT-----TT---------CC-CT-ATTGAACCG---T-GCCCCTATCG--TACCC---C--CGGGA-TC-ATGATTTGAA-C-GAAATTTTTT-GAATTTCCACATATATCAGGAAA----GCTTTCA-TA-----TACA-AATT-----TCAGTACTT--TCT------AGCC-C--GT-GGTG-TCCTG-----G--AGAAG-ATT-TT-T-----catcgtcggaa
gi|3 : cttataagaatctatctctacaatacgttTGTAAAAATATTCTGATC---CTTT-----G--------------GTGG-CCCACAT----TACCCT----GGGG--T--TC-A-----TG--------AATTGGA------------CAG---CTT-TTATG-CTCG---CTAT-AT--C-AGGA-GCTT--A--TACAA--ATCTAAGC-----T--TTC----CTG-GCC-----CTTTAT---TGGTC-TCT-TGACGAAGA-T-TTT--TT-----AAA-G--A--------T-TTTCCCAT----AT-ATAATCTGAT-A-TA-----TAAA---TC---TATTGATTCC-CTAATTGGGGCCC-CATTGT--A-C-CCCT-GGGGGTGCATG--AAT--TAGA--AAACGTTG-AATC--TA--ACT--ATA-TCAGGA-AAATG-TTTCATATAA--AT-TC-C---GATTTTC-GGCCT---AG---TGGGT-T--------CTT----------GA------------G-------------AATAGAAGATTAAAGAATTTTT---------C-------CC-T--A-----T-AT-AA--TC--ATACGTA-ACAACT-GTT-T-TCCCTATTGAACC---GT---G---CCC--CTATCGTACCCCCGGGA-T-CATGATTTGAAC--GAA-ATTTTTTGAATT--TCCACATATA-TCA-GGAAA--GCTT-TCATATACAAATTTCAGTACTTTCTAG--CC-C-G---T----G-GTGTCC---T------GG--AGA--AG---A----TTTTTTTTTTAAAGA---TTTTTCCATTATAAAT-C----------AT--------ATGTG-A-A-------ATACTC---T-TTG--A-TC---------CC-TC-AT------A---T-GGCCTCATCG--TACCC---C--GGGAG-TC-ATTATTTGAA-C-AAA----CTT-GAATCTCCAT-TAGATCAGA-AA----TTTTTCA-TT-----T--A-AATT-----TCAGC-TTT--TCT------AGTC-CA-GT-GGT--TCTTG--A--G--Atttttaaagatttttccattataaatcatatgtgaaatactctttgatccctcatatggcctcatcgtaccccgggagtcattatttgaacaaacttgaatctccattagatcagaaatttttcatttaaatttcagcttttctagtccagtggttcttgagaacaaaa
gi|3 : cttataagaatctatctctacaatacgtttgtaagattgctttatccctaatttgtgccacccaacccccggggggtttacgaggcattaatctgaaaaactcaatctacgtccaaatatcgatgaagttcaggataatatccactttcttgtgttcaatgtatgtattttttaaaagaatttccctactaatataattgcacTAGTCCAGT--GGTTCTTGAGAACAAAAacaaaa
gi|32 : cttataagaatctatctctacaatacgtttgtaagattgctttatccctaatttgtgccacccaacccccggggggtttacgaggcattaatctgaaaaactcaatctacgtccaaatatcgatgaagttcaggataatatccactttcttgtgttcaatgtatgtattttttaaaagaatttccctactaatataattgcactgtaaaaatattctgatcctttggtggcccacattaccctggggttcatgaattggacagcttttatgctcgctatatcaggagcttatacaaatctaagctttcctggccctttattggtctcttgacgaagattttttaaagattttcccatatataatctgatatataaatctattgattccctaattggggccccattgtacccctgggggtgcatgaattagaaaacgttgaatctaactatatcaggaaaatgtttcatataaattccgattttcggcctagtgggttcttgagaatagaagattaaagaatttttccctatataatcatacgtaacaactgttttccctattgaaccgtgcccctatcgtacccccgggatcatgatttgaacgaaattttttgaatttccacatatatcaggaaagctttcatatacaaatttcagtactttctagcccgtggtgtcctggagaagattttttttttaaagatttttccattataaatcatatgtgaaatactctttgatccctcatatggcctcatcgtaccccgggagtcattatttgaacaaacttgaatctccattagatcagaaatttttcatttaaatttcagcttttcGTTTAGTTG-AAATTGATCCAAC--GATTCCGGAGAAG
gi|32 : GTTTA----GTTGAAA-T-TG--------AT-------CC------AA------C---GAT---TCCGGAGAAGTTGA-A--GA--CGAttgaagacgacggagaccgagatattaaacagaaaagctgagctcacttcagtcctcagatcaagt
gi|34 : G-CCA-CACCTC-TACCACC---AGGGCGG--CC-A-----CG--------ATTT-AA------------TGGA--CTT-AAAT-----A---TTTT-AT-TT-ACGGAACTTTCA--TATAA--ATTT--TT-----T--TTT----CT--GCC-----T---AG---Tcggagaccgagatattaaacagaaaagctgagctcacttcagtcctcagatcaagt
gi|35 : gt---GAGG--A--TCCA-----TG--------GTTTGAA------------CAA-------GAAG--------------ATG---AAGAAGCTTCTA--CACAAG-ATAT-GTT-----T--ATT----CTG-GTC-----C---AC---TGGT--TCT-TGA-GAA
gi|36 : ---CTTT-ATT---CCCTTGAAAA--TG----------ATGGTCCC-CACT-T-TACCCCC---GGGG--G--GC-A-----TG--------GTTTGAA------------CAAA------GAAT--tacccatcccc
gi|37 : gatctttgaaatgtctttttgagtTT--TT-----AAA-G--G--------A-CTTTCC-A----AT-ATAATC--CCTA-TT-----CTAA---TC---T-ATGATCCC--TA-T-ATGGTCC--ATCCA--A-C-CCC--GGGAGT-TACA--ATT--TGAA-
gi|38 : -GA--T----GCCAGACA-A-CT--T-A-A---ACAAACTT-CAA-TCAG--AAAA-GCTCACTTAAGTTTTCA---GCTAAAGTGAGC-TAAAAAattg
gi|39 : ataGAAT-T-TG--------GT-------CC------AG------T---GGT---TCTAGAGAA---GA-A--GG--TGAAA-ATG---TG---AAA--AGTTTA--T-AA--C-----------GAC----G-G--CG-------------AC-GA--C----AACAGA
gi|4 : -A---CTAT-AT--C-AGGAATCTTTCA--TATAA--A----G-C-----T--TTT----CCT-GCC-----C---AG---TGGT--TCT-CAA-G--------------------AA-C--A--------T-TTTCCC-T----AT-ATATTC--AC-A-TG-----TAAA---TC---T-TTGATCCC-CTA-TTTTGGCCC-CACCGT--CTC-CCT--GGGGGT-GATG--ATT--TGAA-CGAAT-TTC-AATC--TC-CACT--ATA-TCAGGA-A---GCTTTCATATGA--AT-TT-T-G-GCTTTTCTGGCCA---AG---TGG-T-T--------CTT----------GA------------GAAGAAGATATTTAAA------------GA--TTTT---------C-------CC-T--A-----T-AT-AT--TC--ACATGTA-A-AACT-TTGATCCCCCTATTGCCCTATTGT---A---GCC--CCACCATATCCCCAGGGAT-CATGATTTAAAC--GAA-TTT----CAATC--TCCAC-TATA-TCA-GGAA---GCTT-TCATATG--AATTTTGGC-TTTTCTGG--CC-AAG---T----G-GT-TCT---T------GAGAAGA--AG---A----TATTT-----AAAGA---TTT--TCCCTATATATTC----------AC--------ATGTA-A-A-------A----C---T-TTG--A-TCCCCCTATTGCC-CT-ATT-----G---T-AGCCCCACCA--TATCC---C--CAGGGATC-ATGATTTAAG-C-GAA----TTT-CAATCTCCAC-TATATCAGG-AA----GCGTACATTA-----A--A-AATT-----TCAGC-TTT--TCT------GGTC-CA-GT-GGT--TCTTG--------AGAAT-ATT-TT-T-----AAATGACAC-CAC--CCAA-TTTTT---ACAT--------------T---TTCGTGATTATATCC-------------CCT-------------TTGAAGAAAGC-----CCAGTACT--TCATT-T----TAAC-AAGCTTGA---ATC-CC-CTGCACCGAA-GAATGATTT---TT---ACTA---AGTTTG----GTTGAAT-T-TG--------GT-------CC------AG------T---GGT---TCTGGAGAA---GA-A--GT--CGAAA-ATG---TG---AAA--TGT-----T-AA--CG----------GAC----AGA--CAGATAGACAGAAAGAC-GGACT----GACTGACATA-CGACG-G-ACAGG--AG--G-CGA-TCAG--AAAA-GCTCGATTGAG
gi|42 : -A---ACTTTTGCATAA--GT-TT-G-GTGATTTT-TGGCCC---CA---TTG-T-T--------CTG----------GA------------C-------------A-------------GA--TTTT---------G-------CC-T--A-----T-AT-
gi|43 : cctcTAAAA---TGTTGATC---CCTT-----A--TT----------GTGA-CTG-CACA-T-TACCCCT---AGGG--G--TC-A-----TG--------ATTTGAT------------CAAA--Cc
gi|45 : ---GA-A--GA--TGAAA-ATG---TG---AAA--AAT-----T-TA--C-----------GAC----A-A--TA----------------GA-------AACGGACA-
gi|46 : TGG-CCC-CATA-T-TGCCCCT---GGAG--G--TC-A-----TA--------ATATGAA------------CACA--CTT-ggtgagctaaaaat
gi|48 : T--TT-----AAA-G--A--------T-TTTCAG-T----AT-ATATTT--AC-A-TG-----TCAA---AT---T-TTGATCCcatctt
gi|49 : C---T-TTGATCCC-CTA-TTGTGGCCC-TATCAT--A-
gi|5 : --TT----------GTGG-CCC-CATT-T-TGATCCC---TGGG--A--CC-A-----CT--------ATTTGAA------------CAAA--CTT-TAAT--TT-A---CACT-TTGCA-ATGATGCTTTCA--TATTA--AT-TTGAC-----A--TTT----TTG-AACATT--C---AC---TA-T--TCT-TCA-GATGAAGATTT--TTTTTAAAAA-GTTA--------T-TTTTG-------AT-AAACTT--A----TG-----CTAA---AT---T-TTG--CCCATTA-CTGTC-CCC-CACCCTTAA-C-CCT--GGG--T-CACC--ATT--TGAA-CAAAC-TTG-AATT--TA-CACT--TCC-TCAAGA-A---GCTTTCACATAA--GT-TT-G-G-TAATTTCTGTCCT---AG---TGG-T-T--------CTG----------GA------------G-------------AA------------GA--ATTT---------C-------CC-T--------T-AT-AT--CA--GCATGTA-A-AACT-TTGAT-T---------------GC---G---ATC--CCATCCTACCTCATGGAA--CACAATCTGAACAAAAA-GTT----GAATC--TACTC-CATA-TTA-GGAA---GCTT-TCAGACC--A---------------GG--TA-CAA---G----G-AG-TCT---T------G---AGA--AGAACA----TTTTG-----AAGAA---TTT--CC----------CT---------ATATATTCGCATGTT-T-A-------A----C---T-TTG--A-TC---------CC-CT-ATT-----G---T-GGTTCCTACT--TATCC---C--GGGGG-TC-AAAATTTCAA-C-ATT----TTT-GAATCTCCGC-TATATCAGG-AA----GCTTTCA-TA-----T--A-AATT-----TCAGT-CTT--TCT------AGAA-AA-GC-GGT--TCTTG--A--A--AAAAT-AGT-TC-T-----AAATGACAC-CAT--CCTA-TTTCT---GCAT--------------T---T-------------T-------------CAT---------------------GATTATCCCTGGTCCT--T------------------------------CC-CTGCACTCGA-GGATGATTT---GT---ACCA---AGTTTG----GTTGAAT-T-TG--------GT-------CCAGCGTGAG------C---GGT---TCT---GAA---GA-A--GT--GGAAA-ATG---TG---AAA--AGC-----T-AA--CA----------GAC----AGA--TAGATGG--------ACAGA--C----GACAGACA-A-AA--G-G-A---G--A-----CCA-TGAG--AAAA-ACTCACTTGAATCTTTA---GATCATGTGAAG-TAAA
gi|6 : -GAAGA-AATTTGTTT-----AAAAG--A--------TCTTTCCC-T----AT-ATAT-C--AA-A-TG-----CAAA---AC---T-ATAACCCC-CTA-TTGTGGC----ATAGT--A-C-CCCCTGGGGAT-CATG--GTT--TGAA-CAA-C-TTG-AATA--TA-CATT--ATAATCAGGA-A---GCTTTCAT-TAA--AT-TT-GCA-GCTTTTCTG-CCC---AG---TGG-T----------CTT----------GA------------G-------------AAAGAA--------GA--TTTTAAAGATTGTC-------CC-T--A-----T-AT-AT--TC--ACATG-A-A-AATT-TTGAT-CTCCTA----------CT---GT--ACC--CCA-AGTACTCC---GGGT-CAT-ATTTGAAA--CAA-CTT----GAATC--TCC---TAT--TCT-GGAA---GCTT-TCATATA--AATT-CAGC-TTTTTTAG--CCGTAG---T----G-GT-TCT---TCAGAAGA---AGA--AG---A----TTTTT-----AAAGA---TTT--TC----------CCTTTATATTCAC--------ATGCA-ACA-------A----C---T-TTG--A-TC---------CA-CT-AAT-----G---TTGGCCC--TCG--T-CCC---C--G-GAG-TC-ATGATT-GAA-CCAAA----CTT-GAATCTCAAT-TATATTAAG-AA-----CTT--A-TA-----T--A-A--T-----TCAGC-TTT--TCT------GGGC-CA-G---GT--TCTTG--TT-G--AGAA---TG-TTAT-----AAATGGGGCACAC--CCTA-TTTT----GCAT--------------T---T-------------TTGTGATATCTCT-CCT-------------TTGAAGGGG-T-----CTGAGTCT--TC-TT-T----GAGC-AAACCTAA---AGT-CC-CTTCACCCC--GGATGATTT---GT---A--A---AGTTTG----GTTGAAT-T--G--------GC-------CCCC----AG------T---GGT---TTTGGAGAA---GA-ATCGA--TG-----TG----------A--AGT-----T-AA--A-----------GACAG--A-A--CG-------------AC-AG--TCAGGGACAGACG-A-CG--GAG-A---A--AG--G-CAA-TCAG--AAAA-GCTCATT---GCC--------CACAAGTGAGC-TA
gi|7 : ttttgctttactgagtttgtttcttcatacgatcat----CTG-GCT-----C---AGCAGTGGTGATTT-TGA-AAAGA--ATTT--TC-----AAG---------------TTTCCT-T----Atataaa
gi|7 : tgcgtgtaattaaactctgaatttagaatttttagtatttattttaaaagcatgtatagacaacaagaggcccatgggccacatcgctcaccttggccCAAGTTTCCTTA-AAACTGACCCAGT--GGTTC-GGAGAAGAACATTTTATGCAAAA---CTCCGATC---CCTT-----A--TT----------GTGC-CCC-CCCC-C-AACTCCG---GGGA--G--TT-A-----TG--------ATCTGA-------------TAAA--TTTTGGAT--CT-A---CCCT-ATCTC-AGAAAGCTTTCA--GGTAA--ATATTGTT-----T--CTT----TTG-GTC-----C---AA---TGGT--TCT-TGA-GAAAATGATTT--TTA----AAA-G--A--------T-TTTCCC-T----AT-ATATTT--AC-A-TG-----TAAG---AC---T-TTGATCCC-CTA-TTGTGGCCC-TATCGT--A-CTCCC--GAGGGT-CAAG--ATT--TGAA-CAGAC-TTG-AATC--TC-CATT--ACA-TCAGGA-A---GCTTTCTTATAA--AT-TT-C-A-GCTTTTCTGGCCC---AG---TGG-T-T--------CTT----------CA------------GAAAAAGATTTTTAAA------------GA--TTTC---------C-------TC-T--AGCCATT-AT-AT--TC--ACATGTA-C-AACT-TTTGA-TCCCTAAG--------GT---G---TCC--CCATCGTACCCC--GGGGT-CATGA-TTGAAC--AA---TT----GAATC--TCCAC-aaactgacccagtggttcggagaagaacattttatgcaaaactccgatcccttattgtgcccccccccaactccggggagttatgatctgataaattttggatctaccctatctcagaaagctttcaggtaaatattgtttcttttggtccaatggttcttgagaaaatgatttttaaaagattttccctatatatttacatgtaagactttgatcccctattgtggccctatcgtactcccgagggtcaagatttgaacagacttgaatctccattacatcaggaagctttcttataaatttcagcttttctggcccagtggttcttcagaaaaagatttttaaagatttcctctagccattatattcacatgtacaacttttgatccctaaggtgtccccatcgtaccccggggtcatgattgaacaattgaatctccacccggggacctcttcactat
gi|8 : tgcgtgtaattaaactctgaatttagaatttttagtatttattttaaaagcatgtatagacaacaagaggcccatgggccacatcgctcaccttggccctggctcagcagtggtgattttgaaaagaattttATGTGAAA---TTTTGATC---TCAT-----A--TT----------ATGG-CCC-CATC-AATACCCT----GTGG--A--CC-G-----T----------TTTAAAAAACACACACACCAAAAACTT-GAAT--CT-G---C-ATCATGTC-AGGAAGTTTTCA-----------A----C-----T--TTT----CTA-GTCAAGACT---AG---TGGT--T-T-TGA-GAAGA-A--TC--TA-----AAA-G--A--------T-TTT-----------------------A-TG-----TATA---ACAGAT-TTGATCAT-CTA-TTGTGGCCC-CA------------C--AGGGGT-CATG--AAT--TGAA-CAAAC-TTG-AATC--TA-GTCC--ATG-CCAGGA-A---GCTTTAGGGCAA--AT-TT-T-A-ATTTTCCTCACAA---AG---TAG-T-T--------CTT---------------------------------------------------------------------T-------CC-T--A-----T-AC-AT--CC--GCATGTACACAACT-TTCAT-CCCCTA----------AT---G-----------TTG---CCCCAA---T-CGTAAT---------------------ATCCATACGC-TGCA-TCA-AGAA---GCTT-TGATGTA--AATTTCAAC-T-----GG--TC-CAG---T----G-GT-TTT---T------G---AGA--AG---A----TTccggggacctcttcactat
gi|9 : cctattctctttagagaagtggacagacatagcctggatgtaggctatgcctgtccacttctctaaagagaatacccctaccccaattctctgcGAAGCTTTCA--TATAATTATATATTCATACAT--TTA----CTG-TCC-----C----G---TGGT--TCT--GA-GAAGA---TTT--TT-----AAA-G--A--------T-TTTCCCCT----ATTATATTC--A--A-TG-----CAAA---AT---T-TTGATTCC-CTAATTGTGGCCC--ATAGT--A-C-CCT--AGGGGT-CATT--ATT--TGAA-CAAAC-TTG-AATC--TC-CACT--ATA-TCAGAA-A---GCTTTCATATCA-----TT-C-A-GCTTTT-TGA-CC---AG---T-G-T-T--------TAT----------GA------------GAAGATTATTA---AA------------GA--TTTT---------C-------CC-T--A-------AT-GT--TC--ACATGTC-A-AACT-TT-AT--CCCTATT--------GT---G---GCC--CCATC-TACCCCAGAGGA--CATAATTTGAAT--AAACATT----GAATC--TCCAC-TATA---A-GGAA---GCTT-T-ATATT--TATTTCAGC-TTTTCTGG---------------------------------------GA--AG-------------------AAGA---TT---------------C----------AC--------AGGTA-A-A-------A----C---T-TTG--A-TC---------CC-CT-ATT-----G---T-GG-CCCATCG--TACCC---C----GGG-TCTAT-ATTTGAA-C-AAA----CAT-GAATCTCCAC-TATATCAGG-AA----ACTTTCA-TG-----T--A-AATT-----TCAGC-TTT--TCT------GG-C-CA-GT-GGT--TCTTGA-A--A--AGAAG-ATT-TT-atgcaaattatttaatttcattttaaggtgattac
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): AAACTCTGATGACATCATAGAGTTTTTAATGATATTTGGAATTTATAAGCTGAACAAAAAAAAAAAAAACCAAAACAAGAGGCCCATGGGCCACATCGTTCACCTGAGTACCAATGGTCCTGGTTTAGCAGTGGTGATTTAAAAAGAAAATTTTCATAATTTTTTT
Unaligned ( gi|25 ): AAACTTGAATATCAAATTTACCAAAGAAAAACTTACAATTTTGATTGACACTAGCTGAAAAGTTCAGGAGAAGAAAACATGAAGGAAAACACAAACAGAAAGGCGGCATCTGATCAGACATTTAAATAAGTGACTCAGGTGAGCTAAAAA
Unaligned ( gi|30 ): CCTCTTCTTCTTACCATATATAAGAGGACAGAAATAAGCTACATATGTCCGTGGGTGAAGGCTGTACCTGTCCTATTCTCTATCTAAACAGAATACCTCCTACCACTATTCTT
Unaligned ( gi|31 ): GCGTGTAGGCTAATTAATTAAGGATTTCAACACATAGTAGCTAAAATAAAACCTGAACTAGAGGCCCATAGGCCATACTGCTCACCCTGTCCCTTTGCTCA
Unaligned ( gi|33 ): AAAGAAGACGTCCATGATCCACATCACCCACCTGAGTAACATCGACTCTGCTGTCCAAATTCCCACTCCGTATTATGGGGATGCTTCAATATCAATAT
Unaligned ( gi|40 ): AAACAAGACCGGCCCATGGACCACTTTCGCTGCTCACTGCCTATAGTTGACACTTCGGCCCTCGCACTCT
Unaligned ( gi|41 ): AAATTATTCCAATCATATCCTATTCTGAAGTGATAAAATTTATATTCAACTCGCATAATACAATAAT
Unaligned ( gi|44 ): AAAGTGGATTGGCATCAGGGTGTAGACAATGCCTGTCCGCTTCTTTAGAAATAATATCC
Unaligned ( gi|47 ): TTGAAAACAAGAGGCCCATGGACCACAATACTTACCCGAGTCATATT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 2 2222 1 111 11 111 11111111111111111111 1111 111111111111111111111111 111111111111 11111111111 3333333333333333333333 11111 22222222 1111111111 11111 11 11111111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777 11111111111111111 2222222222 11 11111111 1111111111 11111111 111 99999999999999999 111111111 111111111 111111111 111 11111 111111 22222222 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11111111 111111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777
lowQualScore : 0 1 1 3333 1 5 1 555 3 88 7 1 7 777 0 2 777 5 88888888888888888888 3 666 1111 111111111111111111111111 555555555555 44 44 22222222222 3 3 0000000000000000000000 66 5555 2 11111 444 444 66 33 2 55555555 2 55 2 1111111111 2 888888 5 11111 2 2 66666 444 444 2 2 5 44 2 33 2 2 55 2 33 33 2 2 2 2 1 2 2 2 333 1 33 2 77777 0 1 555 555 2 2 00000000 3333333333333333333333333333333333333333333333333333 33 55555555555555555 2 33 77777 2 2 44 44 3 6 3 6 3 1111111111 3 999999999 44 0 22 444 77 66 6666 88 1 3 3 3 999 3 5555 3 44 3 11111111 3 3 555 5555555555 44 33333333 99999 777 88 11111111111111111 55 3 222222222 7777 6 44 3 333333333 3 3 000000000 4 4 55 4 222 77 4 55 3 7 7777 3 3 7 55 3 7777 3 77777 44 3 3 11111 3 3 44 111111 5 6 3 2 66 77777777 44 3 3 99999 4 0 3 8888 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 44 33 66666 0 33 2 6666 2 1 444 2 2 33 22 2 4 333 33 5555 5555 88 2 11111111 33 7777777 666666 000000 555 1 2 2 9999999 4 333 333 22 55555 3 88888 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 2 33 66666 2 2 0 88888 3
lowQualScore : . . . .... . . . ... . .. . . . ... . . ... . .................... . ... .... ........................ ............ .. .. ........... . . ...................... .. .... . ..... ... ... .. .. . ........ . .. . .......... . ...... . ..... . . ..... ... ... . . . .. . .. . . .. . .. .. . . . . . . . . ... . .. . ..... . . ... ... . . ........ .................................................... .. ................. . .. ..... . . .. .. . . . . . .......... . ......... .. . .. ... .. .. .... .. . . . . ... . .... . .. . ........ . . ... .......... .. ........ ..... ... .. ................. .. . ......... .... . .. . ......... . . ......... . . .. . ... .. . .. . . .... . . . .. . .... . ..... .. . . ..... . . .. ...... . . . . .. ........ .. . . ..... . . . .... ............................................................ .. .. ..... . .. . .... . . ... . . .. .. . . ... .. .... .... .. . ........ .. ....... ...... ...... ... . . . ....... . ... ... .. ..... . ..... ............................................................................. . .. ..... . . . ..... .
lowQualScore : 0 0 0 0000 0 5 0 333 7 33 3 0 3 555 8 5 888 4 55555555555555555555 6 888 1111 555555555555555555555555 888888888888 22 33 88888888888 2 1 9999999999999999999999 88 7777 7 33333 777 444 33 88 5 77777777 5 99 5 3333333333 5 444444 0 33333 5 5 22222 444 111 4 5 0 00 6 22 4 5 99 5 22 22 4 5 7 7 0 5 5 2 999 2 44 5 33333 1 2 000 000 9 9 44444444 2222222222222222222222222222222222222222222222222222 99 99999999999999999 9 99 11111 9 9 22 22 1 2 1 2 5 4444444444 1 555555555 22 8 55 222 33 22 5555 55 7 1 3 3 222 3 6666 3 66 3 22222222 3 3 888 5555555555 66 88888888 11111 777 55 88888888888888888 00 6 777777777 1111 7 66 3 333333333 3 6 222222222 0 1 55 0 555 22 0 00 6 3 7777 6 6 3 00 3 1111 3 77777 22 1 1 99999 1 1 22 999999 2 2 1 9 88 88888888 66 1 3 11111 0 7 3 2222 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 22 99 55555 2 99 9 1111 7 9 777 7 7 77 11 5 8 999 44 0000 0000 88 2 11111111 11 2222222 444444 666666 888 4 0 0 5555555 0 777 777 99 33333 1 66666 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 7 77 77777 9 4 8 22222 6
consensus : AGCTGTATCTT-ANCCCNGGGGGTCACGATTNGTANCAAGTTT-CCTTNAAACTGACCCAGT--GGTTCTGGAGAAGAACATTTTATGTAAAA---CTTTGATC---CCCT-----A--TT----------GTGG-CCCCACC-C-TACCCCC---GGGG--G--CC-A-----TG--------ATTTGAA------------CAAA--CTT-GAAT-CTAC-NCT--ATGTC-AGGAAGCTTTCA--TGTAA--ATATCGTC-----T--TTT----CTG-GCC-----C---AG---TGGT--TCT-TGA-GAAGA--A-----TT-TTT--AAA-GA--------T-TT-TCCC-T----AT-ATATTC--AC-A-T-G-----TAAA---AC---T-TTGATCCC-CTA-TTGTGGCCC-CATCNT--A-C-CCC--GGGGGT-CATG--ATT--TGAA-CAAAC-TTG-AATC-TNCA-CTATA-TCAGGA-A---GCTTTCATATAA--AT-TT-N-A-GCTTTTCTGGCCC---AG---TGG-T-T--------CTT----------GA------------G-------------AA------------GA--TTTT---------C-------CC-T--A-----T-AT-AT--TC--ACATGTA-A-AAC-T-TTGATC---------CCCT-ATTG-----TG-GCC--CCATCGTACCCCCGGGGGT-CATGATTTGAAC--AAA-NTT----GAATC--TCCAC-TATA-TCA-GGAA---GCTT-TCATATA--AATTTCAGC-TTTTCTGG--CC-CAG---T----G-GT-TCT---T------G---AGA--AG---A----TTTTT-----AAAGA---TTT-CCCCAT---A--T-------CA--CATGTA-A-A-------A----CT-TTG--A-TC---------CC-CT-ATT-----G---T-GGCCCCATCG--TA-CCC---CG-GGGGTC-ATGATTTGAA-C-GAA----CTT-GAATCTC-CAC-T--ATATCAGG-AA----GCTTTCA-TA-----T--A-AAT-T-----T-CAGC-TTT--TCT------GGCC-CA-GT-GGT--TCTTG--A--A--AGAAG-ATT-TT-T-----AAATGACAC-CACCCTA-TTTTT---GCAT--------------T---T-------------C-------------C-------------CT--TT-GAAGGG-G---GCCTGGTCCT--TCATT-T----GAAC-AAACTTGA---ATC-CC-C--TTCACCCAA-GGATGATTTGT--ACCA--AG----TTTG----GTTGAAN-T-TG--------G--C-------CC------AGC-----GGT---TCTGGAGAA-GA-A--GTC--GAAA-ATG---TG---AAA--AGT-----TNACA----GAC-A-------A--C----A-----AC-----G--AC---------G-A----CAGACAA-CGG-G-AA--AA--T-C-GA-TCAG--AAA-----A-GCTCACTTGAGCCTTCG---GCTCAGGTGAGC-TAAAAA
Reference ( family-218 ) : AGCTGTATCTT-ANCCCNGGGGGTCACGATTNGTANCAAGTTT-NNTTGAAACTGACCCAGT--GGTTCTGGAGAAGAANATTTTATGTAAAA---CTTTGATC---CCCT-----A--TT----------GTGG-CCCCACC-C-TACCCCC---GGGG--G--TC-A-----TG--------ATTTGAA------------CAAA--CTT-GAAT-CTAC-TNT--ATGTC-AGGAAGCTTTCA--TGTAA--ATATCGTC-----T--TTT----CTG-GCC-----C---AG---TGGT--TCT-TGA-GAAGA--A-----TT-TTT--AAA-GA--------T-TT-TCCC-T----AT-ATATTC--AC-A-T-G-----TAAA---AC---T-TTGATCCC-CTA-TTGTGGCCC-CATCNT--A-C-CCC--GGGGGT-CATG--ATT--TGAA-CAAAC-TTG-AATC-TNCA-CTATA-TCAGGA-A---GCTTTCATATAA--AT-TT-N-A-GCTTTTCTGGCCC---AG---TGG-T-T--------CTT----------GA------------G-------------AA------------GA--TTTT---------C-------CC-T--A-----T-AT-AT--TC--ACATGTA-A-AAC-T-TTGATC---------CCCT-ATTG-----TG-GCC--CCATCGTACCCCCGGGGGT-CATGATTTGAAC--AAA-NTT----GAATC--TCCAC-TATA-TCA-GGAA---GCTT-TCATATA--AATTTCAGC-TTTTCTGG--CC-CAG---T----G-GT-TCT---T------G---AGA--AG---A----TTTTT-----AAAGA---TTT-CCC---------T-------CA--CATGTA-A-A-------A----CT-TTG--A-TC---------CC-CT-ATT-----G---T-GGCCCCATCG--TA-CCC---CG-GGGGTC-ATGATTTGAA-C-AAA----CTT-GAATCTC-CAC-T--ATATCAGG-AA----GCTTTCA-TA-----T--A-AAT-T-----T-CAGC-TTT--TCT------GGCC-CA-GT-GGT--TCTTG--A--A--AGAAG-ATT-TT-T-----AAATGACAC-CACCCTA-TTTTT---GCAT--------------T---T-------------C-------------C-------------CT--TT-GAAGGG-G---GCCTGGTCCT--TCATT-T----GAAC-AAACTTGA---ATC-CC-C--TTCACCCAA-GGATGATTTGT--ACCA--AG----TTTG----GTTGAAT-T-TG--------G--C-------CC------AGC-----GGT---TCTGGAGAA-GA-A--GNC--GAAA-ATG---TG---AAA--AGT-----TNACA----GAC-A-------A--C----A-----AC-----G--AC---------G-A----CAGACAA-CGG-G-AA--AA--T-C-GA-TCAG--AAA-----A-GCTCACTTGAGCCTTCG---GCTCAGGTGAGC-TAAAAA
gi|1 : TGAG-T-GAC----CTT-GGCCCTCGCAC-TCTATATCAGG-AA----GCTTTAA-GG-----T--A-AATGT-----TGTAAC-TT-----T------GG--------------TCTTG--------AGAAG-ATT-
gi|1 : acaagaggcccatgggccacatcgctcacc-CTATA-TCAGGA-A---GCTTTAAGGTAA--ATGTTGT-A-ACTT---TGG-----------------T--------CTT----------GA------------G-------------AA------------GA--TTAC---------C-------CC-T--A-----T-AT-ATAATC--ATGTGTA-A-AAC-T-TTGAT----------CCCT-ATTG-----GGCGCCCACCATCGTACCTCCGGGGGT-CATGATTTGAAC--AAA-CTT----GAATC--TCC-T-TATA-TCACGGAA---GC-G-TCATA-A--AATATCAGC-TTTCCTGGTCCC-CAG---T----G-GG-TTT---T------G---AGA--AG---AAAACTTTTT-----AAAAAAT-TTT-CCC---------T-------GATTCTTGAA-ACA-------A----AT-TTGCAA-TC---------CCACT-ATacccctatatataatcatgtgtaaaactttgatccctattgggcgcccaccatcgtacctccgggggtcatgatttgaacaaacttgaatctccttatatcacggaagcgtcataaaatatcagctttcctggtccccagtgggttttgagaagaaaactttttaaaaaattttccctgattcttgaaacaaatttgcaatcccactatatcagtagagctttccaatgaatctcagctttcctggcccaaggttggttttcttttcctttttcgaacagaagaagatttttaagacttcctcaatatcaatcacatgctaaaccttgatccctattgtggcccctcgtaccccgggggtcatgatttgaaccaaactttaatctccactatattcaggacttcccatattaatctcagcttcctggtccagacatgtgttcttcgaaagaatttttaaaggatttttccctatataatcatatgtagaaactcttgatcccataattgtggcccatcataccccaggggtcaatttgaacaaaacttgaatctcctctatattaggagcttccatatacaatttcagctttcgtctggcccagtggttcttgaagaagaagaattgttttgttaaaatcacaccacctattttttgcgcattgtttgtgattatctcccctttgaaggggctcggtccttcattgaacaaactgaatctccttcacccaagggatgattggtatcaagtttggttgaatattggcccagtggtctcttgagaaaaagtcgaaaatgtgaaaagttagacgacagacagaagg
gi|1 : acaagaggcccatgggccacatcgctcacctgagtgaccttggccctcgcactTG--ATTCTTGAAACAAAT-TTGCAATC--CCA-CTATA-TCAGTAGA---GCTTTCCAATGA--AT-CT-C-A-GCTTTCCTGGCCC---AAGGTTGG-T-TTTCTTTTCCTTTTTCGAACAGAA------------G-------------AA------------GA--TTTT---------TAAGACTTCC-TCAA-----T-ATCAA--TC--ACATGCT-A-AAC-C-TTGATC---------CC-T-ATTG-----TG-GCC--CC-TCGTACCCC-GGGGGT-CATGATTTGAACC-AAA-CTT----TAATC--TCCAC-TATATTCA-GGA-----CTTCCCATATT--AATCTCAGC--TTCCTGG--TC-CAGACAT----GTGT-TCT---TC-----G---AAA--GA---A----TTTTT-----AAAGGATTTTT-CCCTATATAA--T-------CA--TATGTAGA-A-------A----CTCTTG--A-TC---------CC-ATAATT-----G---T-GG-CCCATCA--TA-CCC---CA-GGGGTC-A--ATTTGAA-CAAAA----CTT-GAATCTC-CTC-T--ATATTAGG--A----GCTTCCA-TA-----T--ACAAT-T-----T-CAGC-TTTCGTCT------GGCC-CA-GT-GGT--TCTTG--AAGA--AGAAGAATTGTT-TTGTTAAAATCACAC-CA-CCTA-TTTTTTGCGCATTGTTTGTGATTATCT---C-------------C-------------C-------------CT--TT-GAA-GG-G---GCTCGGTCCT--TCA-T-T----GAAC-AAAC-TGA---ATC-TC-C--TTCACCCAAGGGATGATTGGT--ATCA--AG----TTTG----GTTGAATAT-TG--------G--C-------CC------AGT-----GGTC--TCTTGAGAA-AA-A--GTC--GAAA-ATG---TG---AAA--AGT-----T---A----GAC-G-------A--C----A--------------------------G-A----CAGAatcagtagagctttccaatgaatctcagctttcctggcccaaggttggttttcttttcctttttcgaacagaagaagatttttaagacttcctcaatatcaatcacatgctaaaccttgatccctattgtggcccctcgtaccccgggggtcatgatttgaaccaaactttaatctccactatattcaggacttcccatattaatctcagcttcctggtccagacatgtgttcttcgaaagaatttttaaaggatttttccctatataatcatatgtagaaactcttgatcccataattgtggcccatcataccccaggggtcaatttgaacaaaacttgaatctcctctatattaggagcttccatatacaatttcagctttcgtctggcccagtggttcttgaagaagaagaattgttttgttaaaatcacaccacctattttttgcgcattgtttgtgattatctcccctttgaaggggctcggtccttcattgaacaaactgaatctccttcacccaagggatgattggtatcaagtttggttgaatattggcccagtggtctcttgagaaaaagtcgaaaatgtgaaaagttagacgacagacagaagg
gi|10 : acaagaggcccatgggccacatcgctcacctgagtgaccttggccctcgcactctatatcaggaagctttaaggtaaatgttgtaactttggtcttgagaagattacccctatatataatcatgtgtaaaactttgatccctattgggcgcccaccatcgtacctccgggggtcatgatttgaacaaacttgaatctccttatatcacggaagcgtcataaaatatcagctttcctggtccccagtgggttttgagaagaaaactttttaaaaaattttccc---GGGG--A--TC-A-----TG--------AATTGAA------------CAAA--CTT-AAAT-ATCT-CCT--ACATC-AGGTAGCTTTAA--TGCCA--ATCTCAGC-----T--TTT----CCG-GCC-----C---AA---TGAT--TCT-CGA-GAAGA--------TT-TTT--AAA-GA--------T-TT-TCCC-T----TT-ATATCC--AC-A-T-G-----TAAA---AC---T-TTGATCCC-CTA-TTGTGTCCC-CATCTT--A-C-CCCT-GGGGGT-CATG--ATT--TGAA-CAAAC-TTG-ATTT-TCCA-CTATA-CCAGGA-A---GGTTagg
gi|10 : ATCTT-ACCCCTGGGGGTCATGATTTG-AACAAACTTGATTTTCCACTATACCAGGAAGGTTCTGGAGAAGATGATT---TGTAAA-------TGACCACACCTT-----A--TTTTGCATTTTGGTGA---TTATC-T-TGCCTTTGAAGGGG--G--CCTAGTCCTTC--------ATTCGAA------------CAAA--CTT-GAAT-TCTC-TTC--A-ACC-AAGGATAATTTG--TGCAA------CGTT-----TG-GTTGAAATTG-GCC-----T---AG---TGGT--TCT-GGA-GAAGctggagaagatgatttgtaaatgaccacaccttattttgcattttggtgattatcttgcctttgaagggggcctagtccttcattcgaacaaacttgaattctcttcaaccaaggataatttgtgcaacgtttggttgaaattggcctagtggttctggagaagttgaaaatgtgaaaagttaacagacagacaaaagacagacaaagggcaatcagaaaaaaactcacttgagtcttcggctcaggcgagctaaaa
gi|10 : ggggatcatgaattgaacaaacttaaatatctcctacatcaggtagctttaatgccaatctcagcttttccggcccaatgattctcgagaagatttttaaagattttccctttatatccacatgtaaaactttgatcccctattgtgtcccc-GGT--TCTGG--AG-A--AGATG-ATT-TG-T-----AAATGACCA-CACCTTA-TTTT----GCAT--------------T---T-------------TGGTGATTATCTTGC-------------CT--TT-GAAGGG-G---GCCTAGTCCT--TCATT-C----GAAC-AAACTTGA---ATT-CT-C--TTCAACCAA-GGATAATTTGT--GCAA--CG----TTTG----GTTGAAA-T-TG--------G--C-------CT------AGT-----GGT---TCTGG---A-GA-A--GTT--GAAA-ATG---TG---AAA--AGT-----TAACA----GAC-AG------A--C----A-----A---------AA---------G-A----CAGACAA-AGG-G-----------C-AA-TCAGAAAAA-----A-ACTCACTTGAGTCTTCG---GCTCAGGCGAGC-TAAAAttgaaaatgtgaaaagttaacagacagacaaaagacagacaaagggcaatcagaaaaaaactcacttgagtcttcggctcaggcgagctaaaa
gi|11 : ggggatcatgaattgaacaaacttaaatatctcctacatcaggtagctttaatgccaatctcagcttttccggcccaatgattctcgagaagatttttaaagattttccctttatatccacatgtaaaactttgatcccctattgtgtccccatcttacccctgggggtcatgatttgaacaaacttgattttccactataccaggaaAGC-TTTTCTGG--CC-CAG---TTCCAG-GT-TCT---T------G---AGA--AG---AAGA-TTTTT-----AAATA---TTTTCCC---------TATTTAAACA--CATGTA-A-ATAATTAAA----TT-ATG--A-TA---------CC-CT-AAT-----G---T-GGCCCCATCA--TA-CCC---CCCGGGGTC-ATGATTTGAA-C-AAA----CTC-AAATCTC-TAC-T--ATATCAAG-AA----GCTTTGA-TA-----T--A-AAT-T-----T-AAGC-TTT--TTTT-----GGCC-CA-GT-GGT--TCTTG--AG-A--AGAAG-ATT-TT-T-----AAATGACAC-CACCCTA-GTTTT---GCAT--------------T---T-------------T-------------CGTGATTATCTCCTCT--TT-CATGAG-G---GCCTAGTCCT--TCATT-T----GAAC-AAACTTGG---ATC-CC-C--TTCAC------------------ACCA--AA----TTTG----GTTGAAT-TATG--------G--C-------CC------AGC-----GGT---TCTGGAGAAGGA-A--GTC--GAAA-ATG---TG---AAA--AGT-----TAACA----GAC-A----------------------------G--AC---------A-A----CATACAA-AAG-G-----------C-GA-TCAG--AAA-----A-GCTCACTTGAGCCTTTG---GCTCAGGTGAGC-TAA
gi|12 : a-------A----CT-TTG--ACTC---------CG-CC-ATT-----GCAAT-GGACTCAACAATTA-CCTACACG-ACGATC-A-GACTTGAAAC-AAA----TTTCGAGATGC-CACAT--ATATTGAG-AAATGTGCTTTTA-CAATAAAT--A-AAT-TGTGTTT-CAGT-CTT--TCTCTGCGGGACCGCA-GTCGGTGATCTTG--A--AGGAGAAG-AGT-CT-T-----ta
gi|13 : CAGG------GCTTCCGTA-----GT-TT-C-A-GCTTTTTTAGCCT---AG---TGG-T-T--------CTT----------GA------------G-------------AA------------GA--TTTT---------T-------TC-T--A-----C-CT-AT--TC--ACATGTA-C-AAC-T-TTGATT---------CCCT-ATTG-----TG-GCC--CCATCGTATCTCCTGGGGT-CATGATTTTAAT--AAA-GTT----GAATA--TCCAC-TATA-TGA-GGAA---GCTT-TCATATA--AATTTCATC-TTCTCTGG--CC-CAA---T----G-AT-TCTTGAT------G---AGA--AG---A----ATTTT-----GAAGA---TTTGCCCTATTAT---T-------CA--CATGTA-A-A-------A----CT-TTG--A-TC---------CC-Ctgtttgaaaatgtatcgcacacccataaccatttgaatatgctaatctgcgatattactccctttagcagagggacctcacgcctccatgatgtagtaacaaaaacaatgatgagaatgccccacggcctcttacacgaacacggatgatttgcactaggagaaggtttgagatatcgacacggttggctacacatttttctggagaagagagtcgaaatatggtataaaaaatgatattaacagagaggaga
gi|14 : TA-TTTTC---------------------T---C-------------C-------------C-------------CT--TTCGATGGG-AAATGCATGCACCT--TCATT-T----GAAC-AGATTTGA---ATT-CC-C--TTCATCAAA-ATATGCTTTAT--GGCAACAGTTACTTTG----ATTGAA--A-TG--------G--C-------CC------AGCTTTTTTTT---TTTTAAG------A--TTT--AAAA-ATA---TATTCAAA--GTT-----TTACATATGGATGA-------A--C----AG----ACT----G--AC---------A-A----TTAACAATTAG-C-AA--AA--TGT-GA-TCAG--AAA-----A-GCTCACTTCAG
gi|15 : cacccattttttcatttgctgatca-----T--A-ATT-T-----T-CAGC-TTT--TCT------TGCC-CA-GT-GAT--TCTTA--T--A--AGAA---------------------------TCCTA-CTTTT---GCAT--------------T---TTCTTGATTTTCTCC-------------C-------------CT--TT-CAAAGG-A---GCATGTTTTT--T--TT-T-----AAC-A----TGATCAATC-CCGC--TTTAT-----GGG-------------A--AA----TTTG----ATTGAAA-T-TA--------G--C-------CC------TGC-----AGT---TATGGAGAA-GA-G--ATC--GAAA-G-A---AA---AAA--AGT-----ATACA----GAT-G----------------------------G--ACA--------G-A----CAGACAA-CGG-ACAA--AA--T----A-T-------A-----A-GCT----------TTTG---GCTCAGGTGAGCTTAAAAA
gi|16 : TA-TTTCT---GTAT--------------TATCT-------------C-------------C-------------CC--TT-TAAGGG-A----CCCGGTCCT--TCCTT-TAATTGAAC-AAACATGA---ATC-CC-T--TT-ATCCAA-GGATGATTTGC--ACCA--AG----TTTG----GTTGAAA-T-GT--------G--C-------CC------AGT-----TG----TCT--------------------AA-ATG---TG---AAA--AGT-----TAACG----GAC-A-------A--C----GT----GCA----G--AT---------G-A----CGGACAA-CAG-G-----------C-GA-TCAG--AAA-----A-GCT-ACTTG---CCTCG---GCTCAGGTGA-C-TAa
gi|17 : accacaccatttatttAC-CACCCTA-TTTTT---GCAT--------------T---TTCGTGATTATCTCC-------------C-------------CT--TT-GATGAG-G---GCCTGGTCCT--TCATT-T----GAAC-AAAATTGA---AGC-CC-C--TTCACCCAA-GGATGATGTGT--ACCA--AG----TTTG----GTTGAAT-T-T---------G--C-------CC------AGC-----GGT---TTT-GAGAA-GA-A--GTT--GAAA-ATT---TG---GAA--AGT-----TTAC-----GAC-G-------ACCC----A-----AC-----G--GC---------T------CAGGTGA-GCT-A-AA--AA--T-A-GG-TCAG--AGA-----
gi|18 : ---TGGT--ACT-TTG-GAGG------------TTT--AAA-GAGAAATTTGT-TT-TCCA-T----ATCATATTC--CA-A-T-A-----TATA---AT---T-T--------CTG-TTGT---CC-CATCCT--GGT-CCT--GGAATT-CATG--GTT--TAAA-CAGAG-ATG-GATCCTTCAACT-CA-T-AAGA-A---GCTTTCATGCAAGGAT-TG-A-A---TTTACTA--CT---AG---TAA-T-T--------Cttaaatactcg
gi|18 : tggttcaacagtttcagagaagaaaattaata--TTTT---------C-------CA-T--A-----TCAT-AT--TC--CAATATA-T-AAT-T-T----------------CT-GTTG-----T----C--CCATCCTGGTCCTGGAATT-CATGGTTTAAAC--AGA-GAT----GGATCCTTCAAC-T-CA-T-A-AGAA---GCTT-TCATGCA--A
gi|19 : tggttcaacagtttcagagaagaaaattaatatggtactttggaggtttaaagagaaatttgTTAGG-AA----GTTTTCA-TG-----T--A-AAA-TAG---T-CA---CAT--TCT------GGTCGCATGT-GGT--CCTT------A--AGAAG-ACA-TT-C-----AAATGCCCA-CAACCTAGTTTGG---GCAT--------------T---T-------------ggattgaatttactactagtaattc
gi|19 : AT--------------C---T-------------CT------------C-------------CT--TT-AAAAGG-G---GAATAGTCCT--GCATT-T----GAACAAAACATGA---ATtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattatctctcctttaaaaggggaatagtcctgcatttgaacaaaacatgaatat
gi|2 : ttaggaagttttcatgtaaaatagtcacattctggtcgcatgtggtccttaagaagacattcaaatgcccacaacctagtttgggcattttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattAGCTGTATCTTNAACCCAAGG----ACGATTAGTACCAAGTTT-CCTTGAAATTGACCCAAT--GGTTCTGGAGAAGAACATTTTATGCAAAA---CTGAGATC---CCCT-----A--TT----------GTGG-CCCCTCC-C-TACCCCC---GGGG--G--T--A-----TG--------ATCTGCT------------CAAA--TTT-GGAT-CTAC-TAT--ATGTC-AGGAACCTTTAA--GGTAA--ATATTGTT-----T--CTT----CTG-GTC-----C---AA---TGGT--TCT-TGA-GAAGACGA-----TT-TTT--AAA-GA--------T-TT-TCCC-T----AT-ATATTC--TT-A-T-G-----TAAA---AC---T-TTGATCCC-CTA-TTGTGGCCC-CATCGT--A-C-CCC--GGGGGT-CATG--ATT--TGAA-CAAAC-TTG-AATC-TTCA-CTATA-TCAGGA-A---GCTTTCATATAA--AT-TT-A-A-GTTTTTCTGGCCC---AG---TGG-T-T--------CTT----------GA------------G-------------AA------------GA--TTTC---------C-------CC-T--A-----T-AC-AT--TC--ACATGTA-A-AAA-T-CTTATC---------CCCT-A--A-----TG-GCC--CCATGGTACCCCCGGGGTT-TATGATTTGAAC--AAA-ATG----GAATC--TTCAC-TATT-TCA-GGAA---GCTT-TCATATC--AATTTCAGC-TTTTCTGT--CC-CAG---T----G-GT-TCT---T------G---AGA--AG---A----TTTTT-----AAAGA---TTT----------------------A--TATATA-A-A-------A----CT-TTG--A-TT---------CC-CT-AAT-----A---T-GGCCCCACCG--TA-CCCAA-GG-AGGGTC-GTGGTTTGAA-C-AAA----CTT-GAATCTC-CAT-T--ATATCAGG-AA----GCTTTTA-TA-----T--C-AAT-T-----T-CAGC-TTC--TCT------GACC-AA-AT-GGT--TCTTGTCA--A--AGAAG-ATT-TT-T-----AAATGATAC-CACCCTA-TTTTT---GCA---------------------------------C-------------C-------------AT--TT-GAAAGG-G---GTCAGGTCCT--TCATT-T----GAAC-AAACTTGA---ATC-CC-C--TTTACCCAA-GGATGATTTGC--ACCA--AG----TTTG----GTTGAAT-T-TG--------G--C-------CC------AGT-----AGT---TCTGGAGAA-GA-A--GAT--GAAA-ATG---TG---AAA--AGT-----TTACA-----AC-A-------A--C----A-----AC-----G--AT---------T-A----CTGACAA-CGG-G-AA--AATTT-T-GA-TCAG--AAT-----A-GCTCACTTAAGCATTCG---GGTCAGGTGAGC-TAAAAAat
gi|20 : --ATGTT-AGAAAG----------TAA--TTTTCCAC-----T--TTT----CTG-GCC-----C---AG---TTGT--TCG-TGA-GAG----------TT-TTT--AAA-AA--------T-T---CCCAT----AA-ATATTC--GC-A-T-G-----TAAA---AC---T-TTGATTCC-CTA-TTGTAGAAC-CACCCT--A-C-CCA--AAAGGC-AATAGTATT--TG---CAAAT-TTG-AATC-TGCA-CAATG-CCAGAA-A---GCTTTTATGTA
gi|21 : AAGCTTTCAACTGTA------T--TC-----TACTTT----CTG-GCC-----C---AG---TTGT--TCGATGG-GAAGA---------T-TTT--AAA-GA--------TGCT-TCCC-T----A--ATATGCT-GC-A-TTG-----TACA---AC---T-TTGATCCC-TTT-TTGTGGCCT-T-TCCT--A-C-CC----------AAAG--ATT--TGAA-CAAAT-TGA-AATC-TATC-CTG-A-TCA-GA-G---GCGTTCATG-AA--AT-
gi|23 : --TT-GAAGAGCA---GCC----CCTCATCATCAT----GAAC----TTTGA---ATCTCC-C--TTCATGTAA-T-ATG--TTAT--GCCA--CA----TTTG----TTTGAAA-T-TT--------A--C-------CA------AAT-----GGT---CGTGCAGAA-AA-A--G---------------TG---AAAACAGT-----TGAcc
gi|24 : -GGACGTTTTGG--GTCA--A-----TTTA----AAGGAAT-T-TAAA------G--C-------TC------AGTTTT--AGTGCCTCTGGAGAA-GA-A--GTT--GAAA-A-G---TT---AA-----T-----TTAT-------C------------C----A-----AG-----G--AC---------A-AATCCTAGTTAA--------A--TG--T-T-GA-TCAG--AAC-----ACACTCACTTGAGCCTTTATTAGCTCAGGTGAGC-TACAAttatgaggaaagagctttgcattagaaaactcagtaacttttttcagctc
gi|25 : -AAACTTGA---ATA-TC-AAATTTACCAAA-GAAAAACTTA-----CA--AT----TTTG----ATTGACA-C-TA--------G--C-------TG------AAA-----AGT---TCAGGAGAA-GA-A--AACATGAAG--------G---AAA--A--------CACA----AAC-A-------G-------A-----AA-----G--GC---------G-G----C------------------A--T-CTGA-TCAG--A------------CATTTAAATAAGTG---ACTCAGGTGAGC-TAAAAA
gi|26 : TC-TT-C--TTCATCCAA-AG-TG-TTTGT--ACAA--AA----TGTGTAATGATGGAT-T-TGATGATGAGG--CAAACTGGCC------AGT-----GAT---TCTGGAGAT-AA-A--GAA--AAAATATT---TG---CAA--AGT-----TAACA----GAC-A-------A-------A-----TG-----G--ATG--------G-A----CAGAC
gi|27 : gaactaattaggaaatgCCC-T----AT-ACATGT--AC-A-T-AGGCATCAAA---A--------GCTCCC-CTA-TTGTGGCTC-AAACCT--A-C-CCCT-GGGGGC-AATG--ATT--TGAA-TAGAT-TGG-AATC-TACT-TTATA-TAAGAA-A---AC-TTCAT-TAA--AT-
gi|27 : TC---CCCT-----A--TT----------GTGG-CTCAAAC-C-TACCCCT---GGGG--G--CA-A-----TG--------ATTTGAA------------TAGA--TTG-GAAT-CTAC-TTT--ATATA-AGAAAAC-TTCA--T-TAA--ATAaactgcatactattggtgtgcatt
gi|28 : ccctatacatgtacataggcatcaaaagcT---TCTGGAGAA-GAGA--GTC--GAAATATGGTATA---AAA--AATGATATTAACA----GAG-AGGAGAAGA--CTCAGA-----AC-----GTGAC---------GCA----CGGACA--CAA-A-AA--GA--G-C-AACTCAG--AAA-----A-GATCACCTCAGCCTC-----GCGCAGGTGAGC-actgcatactattggtgtgcatt
gi|29 : CCT--TCATT-T----CTAC-AAACTTGA---ATT-------TT--------GAAT--TTCCTTAACTA--AA----GTTG----GTTGAAA-T-AA--------G--T-------CT------AAT-----TGT---TCTGGAGAA-GC-ATCGTC--GGAA-ctcaa
gi|3 : actctatgtttgacttttcttgattatctcTGTAAGATTGCTTT-ATC---CC-T-----AATTT----------GTG----CCACC-C-AACCCCC---GGGG--GGTTT-A-----CGAGGCATTAATCTGAA-------------AAA--CTC--AAT-CTACGTCCAAATATCGATGAAG--TTCA--GGATA--ATATCCAC-----T--TTC----TTGTGTT-----C---AA---TG----TAT--------GT--A-----TT-TTTTAAAA-GA--------A-TT-TCCC-TACTAAT-ATAATT--GC-ACT-G-----TAAAAATAT---T-CTGATCCT-TTG---GTGGCCCACAT--T--A-C-CCT--GGGGTT-CATG--AAT--TGGA-C-AGC-TTT-TATG-CTCG-CTATA-TCAGG--A---GCTT--ATACAA--AT-CT-A-A-GCTTTCCTGGCCCTTTAT---TGG-TCT--------CTT----------GACGAAGATTTTTTA-------------AA------------GA--TTTT---------C-------CCAT--A-----T-AT-AA--TCTGATATATA-A-ATC-TATTGATT---------CCCTAATTG-----GG-GCC--CCATTGTACCCCTGGGGGTGCATGAATTAGAA--AAC-GTT----GAATC--T-AAC-TATA-TCA-GGAAAATG-TT-TCATATA--AATTCC-GA-TTTTC-GG--CC-TAG---TG---G-GT-TCT---T------G---AGAATAG---A----AGATT-----AAAGAATTTTT-CCCTATATAA--T-------CA--TACGTA-ACA-------A----CTGTT-----TT---------CC-CT-ATTGAACCG---T-GCCCCTATCG--TA-CCC---CC-GGGATC-ATGATTTGAA-C-GAAATTTTTT-GAATTTC-CACAT--ATATCAGGAAA----GCTTTCA-TA-----TACA-AAT-T-----T-CAGTACTT--TCT------AGCC-C--GT-GGTG-TCCTG-----G--AGAAG-ATT-TT-T-----
gi|3 : cttataagaatctatctctacaatacgttTGTAAAAATATTCTGATC---CTTT-----G--------------GTGG-CCC-ACA-T-TACCCT----GGGG--T--TC-A-----TG--------AATTGGA------------CAG---CTT-TTATGCT-C-GCT--ATATC-AGGA-GCTT--A--TACAA--ATCTAAGC-----T--TTC----CTG-GCC-----CTTTAT---TGGTC-TCT-TGACGAAGA--T-----TT-TTT--AAA-GA--------T-TT-TCCCAT----AT-ATAATCTGAT-A-T-A-----TAAA---TC---TATTGATTCC-CTAATTGGGGCCC-CATTGT--A-C-CCCT-GGGGGTGCATG--AAT--TAGA--AAACGTTG-AATC-TA-A-CTATA-TCAGGA-AAATG-TTTCATATAA--AT-TC-C---GATTTTC-GGCCT---AG---TGGGT-T--------CTT----------GA------------G-------------AATAGAAGATTAAAGAATTTTT---------C-------CC-T--A-----T-AT-AA--TC--ATACGTA-ACAAC-TGTT--TT---------CCCT-ATTGAACCGTG-CCC--CTATCGTACCCCCGGGA-T-CATGATTTGAAC--GAA-ATTTTTTGAATT--TCCACATATA-TCA-GGAAA--GCTT-TCATATACAAATTTCAGTACTTTCTAG--CC-C-G---T----G-GTGTCC---T------GG--AGA--AG---A----TTTTTTTTTTAAAGA---TTT-TTCCATTATAAAT-------CA--TATGTG-A-A-------ATACTCT-TTG--A-TC---------CC-TC-AT------A---T-GGCCTCATCG--TA-CCC---CG-GGAGTC-ATTATTTGAA-C-AAA----CTT-GAATCTC-CAT-T--AGATCAGA-AA----TTTTTCA-TT-----T--A-AAT-T-----T-CAGC-TTT--TCT------AGTC-CA-GT-GGT--TCTTG--A--G--Atttttaaagatttttccattataaatcatatgtgaaatactctttgatccctcatatggcctcatcgtaccccgggagtcattatttgaacaaacttgaatctccattagatcagaaatttttcatttaaatttcagcttttctagtccagtggttcttgagaacaaaa
gi|32 : cttataagaatctatctctacaatacgtttgtaagattgctttatccctaatttgtgccacccaacccccggggggtttacgaggcattaatctgaaaaactcaatctacgtccaaatatcgatgaagttcaggataatatccactttcttgtgttcaatgtatgtattttttaaaagaatttccctactaatataattgcacG----TTTA----GTTGAAA-T-TG--------A--T-------CC------AAC-----GAT---TCCGGAGA----------------------------------AGT-----TGA-A----G-------------------------AC-----G--AC---------G-G-----AGAC---CGA-G--A--TA--T-T-AA-ACAG--AAAAGCTGA-GCTCACTTCAGTCCTCA---GATCAAGTacaaaa
gi|34 : G-CCACACCTC-TACCACC---AGGGCGG--CC-A-----CG--------ATTT-AA------------TGGA--CTT-AAAT---AT-TTT--AT-TT-ACGGAACTTTCA--TATAA--ATTT--TT-----T--TTT----CT--GCC-----T---AG---T
gi|35 : gt---GAGG--A--TCCA-----TG--------GTTTGAA------------CAA-------GAAG-----------ATG---AAGAAGCTTCTA--CACAAG-ATAT-GTT-----T--ATT----CTG-GTC-----C---AC---TGGT--TCT-TGA-GAA
gi|36 : ---CTTT-ATT---CCCTTGAAAA--TG----------ATGGTCCCCACT-T-TACCCCC---GGGG--G--GC-A-----TG--------GTTTGAA------------CAAA------GAAT-tacccatcccc
gi|37 : gatctttgaaatgtctttttgagtT-TTT--AAA-GG--------A-CT-TTCC-A----AT-ATAATC--CCTA-T-T-----CTAA---TC---T-ATGATCCC--TA-T-ATGGTCC--ATCCA--A-C-CCC--GGGAGT-TACA--ATT--TGAA-
gi|38 : -----G--AT---------G-C----CAGACAA-CTT-A-AACAAACTT-C-AA-TCAG--AAA-----A-GCTCACTTAAGTTTTCA---GCTAAAGTGAGC-TAAAAAattg
gi|39 : ataGAAT-T-TG--------G--T-------CC------AGT-----GGT---TCTAGAGAA-GA-A--GGT--GAAA-ATG---TG---AAA--AGT-----TTATAAC--GAC-G-------G--C----G-----AC-----G--AC---------A-A----CAGA
gi|4 : T--ATATC-AGGAATCTTTCA--TATAA--A----G-C-----T--TTT----CCT-GCC-----C---AG---TGGT--TCT-C----AAGA--A-----C------------A--------T-TT-TCCC-T----AT-ATATTC--AC-A-T-G-----TAAA---TC---T-TTGATCCC-CTA-TTTTGGCCC-CACCGT--C-T-CCCT-GGGGGT-GATG--ATT--TGAA-CGAAT-TTC-AATC-TCCA-CTATA-TCAGGA-A---GCTTTCATATGA--AT-TT-T-G-GCTTTTCTGGCCA---AG---TGG-T-T--------CTT----------GA------------GAAGAAGATATTTAAA------------GA--TTTT---------C-------CC-T--A-----T-AT-AT--TC--ACATGTA-A-AAC-T-TTGATCCCCCTATTGCCCT-ATTG-----TA-GCC--CCACCATATCCCCAGGGAT-CATGATTTAAAC--GAA-TTT----CAATC--TCCAC-TATA-TCA-GGAA---GCTT-TCATATG--AATTTTGGC-TTTTCTGG--CC-AAG---T----G-GT-TCT---T------GAGAAGA--AG---A----TATTT-----AAAGA---TTT-TCCCTATATAT-T-------CA--CATGTA-A-A-------A----CT-TTG--A-TCCCCCTATTGCC-CT-ATT-----G---T-AGCCCCACCA--TATCCC---CA-GGGATC-ATGATTTAAG-C-GAA----TTT-CAATCTC-CAC-T--ATATCAGG-AA----GCGTACATTA-----A--A-AAT-T-----T-CAGC-TTT--TCT------GGTC-CA-GT-GGT--TCTTG--------AGAAT-ATT-TT-T-----AAATGACAC-CACCCAA-TTTTT---ACAT--------------T---TTCGTGATTATATCC-------------C-------------CT--TT-GAAGAA-A---GCCCAGTACT--TCATT-T----TAAC-AAGCTTGA---ATC-CC-C--TGCACCGAA-GAATGATTTTT--ACTA--AG----TTTG----GTTGAAT-T-TG--------G--T-------CC------AGT-----GGT---TCTGGAGAA-GA-A--GTC--GAAA-ATG---TG---AAA--TGT-----TAACG----GAC-AG------A--C----AGATAGACAGAAAG--ACGGACTGACTG-A----CATACGA-CGG-A-CAGGAG--G-C-GA-TCAG--AAA-----A-GCTCGATTGAG
gi|42 : ac-A---ACTTTTGCATAA--GT-TT-G-GTGATTTT-TGGCCC---CA---TTG-T-T--------CTG----------GA------------C-------------A-------------GA--TTTT---------G-------CC-T--A-----T-AT-
gi|43 : cctcTAAAA---TGTTGATC---CCTT-----A--TT----------GTGA-CTGCACA-T-TACCCCT---AGGG--G--TC-A-----TG--------ATTTGAT------------CAAA--Cc
gi|45 : -GA-A--GAT--GAAA-ATG---TG---AAA--AAT-----TTAC-----GAC-A-------A--T----A-----GA-----A--ACG--------G-A----CAG
gi|46 : TGGCCC-CATATT--G-C-CCCT-GGAGGT-CATA--ATA--TGAA-CACAC-TTgtgagctaaaaat
gi|48 : -TTT--AAA-GA--------T-TT-TCAG-T----AT-ATATTT--AC-A-T-G-----TCAA---AT---T-TTGATCCcatctt
gi|49 : C---T-TTGATCCC-CTA-TTGTGGCCC-TATCAT--A-
gi|5 : --TT----------GTGG-CCCCATT-T-TGATCCC---TGGG--A--CC-A-----CT--------ATTTGAA------------CAAA--CTT-TAAT-TTAC-ACT--TTGCA-ATGATGCTTTCA--TATTA--AT-TTGAC-----A--TTT----TTG-AACATT--C---AC---TA-T--TCT-TCA-GATGA--AGATTTTT-TTT--AAA-AA--------G-TTATTTT-TG---AT-AAACTT--A----T-G-----CTAA---AT---T-TTG--CCCATTA-CTGTC-CCC-CACCCTTAA-C-CCT--GGG--T-CACC--ATT--TGAA-CAAAC-TTG-AATT-TACA-CTTCC-TCAAGA-A---GCTTTCACATAA--GT-TT-G-G-TAATTTCTGTCCT---AG---TGG-T-T--------CTG----------GA------------G-------------AA------------GA--ATTT---------C-------CC-T--------T-AT-AT--CA--GCATGTA-A-AAC-T-TTG-----------------ATTG-----CG-ATC--CCATCCTACCTCATGGAA--CACAATCTGAACAAAAA-GTT----GAATC--TACTC-CATA-TTA-GGAA---GCTT-TCAGA--------CCA---------GG--TA-CAA---G----G-AG-TCT---T------G---AGA--AGAACA----TTTTG-----AAGAA---TTT-CCCTATATAT--T-------CG--CATGTT-T-A-------A----CT-TTG--A-TC---------CC-CT-ATT-----G---T-GGTTCCTACT--TA-TCC---CG-GGGGTC-AAAATTTCAA-C-ATT----TTT-GAATCTC-CGC-T--ATATCAGG-AA----GCTTTCA-TA-----T--A-AAT-T-----T-CAGT-CTT--TCT------AGAA-AA-GC-GGT--TCTTG--A--A--AAAAT-AGT-TC-T-----AAATGACAC-CATCCTA-TTTCT---GCAT--------------T---T-------------T-------------C-------------ATGATT------A-T---CCCTGGTCCT--T------------------------------CC-C--TGCACTCGA-GGATGATTTGT--ACCA--AG----TTTG----GTTGAAT-T-TG--------G--T-------CCAGCGTGAGC-----GGT---TCT---GAA-GA-A--GTG--GAAA-ATG---TG---AAA--AGC-----TAACA----GAC-AG------A--T----AGATGGACA----G--AC---------G-A----CAGACAA-AAG-G-AG--A-----C-CA-TGAG--AAA-----A-ACTCACTTGAATCTTTA---GATCATGTGAAG-TAAA
gi|6 : -GAAGA--AAT---TTGTTT--AAAAGA--------TCTT-TCCC-T----AT-ATAT-C--AA-A-T-G-----CAAA---AC---T-ATAACCCC-CTA-TTGTGGC----ATAGT--A-C-CCCCTGGGGAT-CATG--GTT--TGAA-CAA-C-TTG-AATA-TACA-TTATAATCAGGA-A---GCTTTCAT-TAA--AT-TT-GCA-GCTTTTCTG-CCC---AG---TGG-T----------CTT----------GA------------G-------------AAAGAA--------GA--TTTTAAAGATTGTC-------CC-T--A-----T-AT-AT--TC--ACATG-A-A-AAT-T-TTGATC---------TCCT-ACTG-----TA--CC--CCA-AGTACTCC---GGGT-CAT-ATTTGAAA--CAA-CTT----GAATC--TCC---TAT--TCT-GGAA---GCTT-TCATATA--AATT-CAGC-TTTTTTAG--CCGTAG---T----G-GT-TCT---TCAGAAGA---AGA--AG---A----TTTTT-----AAAGA---TTT-TCCCTTTATAT-T-------CA--CATGCA-ACA-------A----CT-TTG--A-TC---------CA-CT-AAT-----G---TTGGCCC--TCG--T--CCC---CG-GAG-TC-ATGATT-GAA-CCAAA----CTT-GAATCTC-AAT-T--ATATTAAG-AA-----CTT--A-TA-----T--A-A---T-----T-CAGC-TTT--TCT------GGGC-CA-G---GT--TCTTG--TT-G--AGAA---TG-TTAT-----AAATGGGGCACACCCTA-TTTT----GCAT--------------T---T-------------TTGTGATATCTCT-C-------------CT--TT-GAAGGG-G----TCTGAGTCT--TC-TT-T----GAGC-AAACCTAA---AGT-CC-C--TTCACCCC--GGATGATTTGT--A--A--AG----TTTG----GTTGAA--T-TG--------GCCC-------CC------AGT-----GGT---TTTGGAGAA-GA-A---TC--G----ATG---TG-----A--AGT-----TAA-A----GAC-A-------G-------A-----AC-----G--ACAGTCAGG--G-A----CAGACGA-CGGAG-AA--AG--G-C-AA-TCAG--AAA-----A-GCTCATT---GCC--------CACAAGTGAGC-TA
gi|7 : ttttgctttactgagtttgtttcttcatacgatcat----CTG-GCT-----C---AGCAGTGGTGATTT-TGA-AAAGA--A-----TT-TTC--AAG-------------TT-TCCT-T----Atataaa
gi|7 : tgcgtgtaattaaactctgaatttagaatttttagtatttattttaaaagcatgtatagacaacaagaggcccatgggccacatcgctcaccttggccCAAGTTT-CCTTAAAACTGACCCAGT--GGTTC-GGAGAAGAACATTTTATGCAAAA---CTCCGATC---CCTT-----A--TT----------GTGC-CCCCCCC-C-AACTCCG---GGGA--G--TT-A-----TG--------ATCTGA-------------TAAA--TTTTGGAT-CTAC-CCT--ATCTC-AGAAAGCTTTCA--GGTAA--ATATTGTT-----T--CTT----TTG-GTC-----C---AA---TGGT--TCT-TGA-GAAAATGA-----TT-TTTA-AAA-GA--------T-TT-TCCC-T----AT-ATATTT--AC-A-T-G-----TAAG---AC---T-TTGATCCC-CTA-TTGTGGCCC-TATCGT--A-CTCCC--GAGGGT-CAAG--ATT--TGAA-CAGAC-TTG-AATC-TCCA-TTACA-TCAGGA-A---GCTTTCTTATAA--AT-TT-C-A-GCTTTTCTGGCCC---AG---TGG-T-T--------CTT----------CA------------GAAAAAGATTTTTAAA------------GA--TTTC---------C-------TC-T--AGCCATT-AT-AT--TC--ACATGTA-C-AACTT-TTGAT----------CCCT-AAGG-----TG-TCC--CCATCGTACCCC--GGGGT-CATGA-TTGAAC--AA---TT----GAATC--TCCAC-aaactgacccagtggttcggagaagaacattttatgcaaaactccgatcccttattgtgcccccccccaactccggggagttatgatctgataaattttggatctaccctatctcagaaagctttcaggtaaatattgtttcttttggtccaatggttcttgagaaaatgatttttaaaagattttccctatatatttacatgtaagactttgatcccctattgtggccctatcgtactcccgagggtcaagatttgaacagacttgaatctccattacatcaggaagctttcttataaatttcagcttttctggcccagtggttcttcagaaaaagatttttaaagatttcctctagccattatattcacatgtacaacttttgatccctaaggtgtccccatcgtaccccggggtcatgattgaacaattgaatctccacccggggacctcttcactat
gi|8 : tgcgtgtaattaaactctgaatttagaatttttagtatttattttaaaagcatgtatagacaacaagaggcccatgggccacatcgctcaccttggccctggctcagcagtggtgattttgaaaagaattttATGTGAAA---TTTTGATC---TCAT-----A--TT----------ATGG-CCCCATC-AATACCCT----GTGG--A--CC-G-----T----------TTTAAAAAACACACACACCAAAAACTT-GAAT-CTGC-ATC--ATGTC-AGGAAGTTTTCA-----------A----C-----T--TTT----CTA-GTCAAGACT---AG---TGGT--T-T-TGA-GAAGA--A-----TC-TA---AAA-GA--------T-TT-T-----------------------A-T-G-----TATA---ACAGAT-TTGATCAT-CTA-TTGTGGCCC-CA------------C--AGGGGT-CATG--AAT--TGAA-CAAAC-TTG-AATC-TAGT-CCATG-CCAGGA-A---GCTTTAGGGCAA--AT-TT-T-A-ATTTTCCTCACAA---AG---TAG-T-T--------CTT---------------------------------------------------------------------T-------CC-T--A-----T-AC-AT--CC--GCATGTACACAAC-T-TTCATC---------CCCT-AATG-----T-------------TGCCCC----AAT-CGTAAT---------------------ATCCATACGC-TGCA-TCA-AGAA---GCTT-TGATGTA--AATTTCAAC-T-----GG--TC-CAG---T----G-GT-TTT---T------G---AGA--AG---A----TTccggggacctcttcactat
gi|9 : cctattctctttagagaagtggacagacatagcctggatgtaggctatgcctgtccacttctctaaagagaatacccctaccccaattctctgcGAAGCTTTCA--TATAATTATATATTCATACAT--TTA----CTG-TCC-----C----G---TGGT--TCT--GA-GAAGA--------TT-TTT--AAA-GA--------T-TT-TCCCCT----ATTATATTC--A--A-T-G-----CAAA---AT---T-TTGATTCC-CTAATTGTGGCCC--ATAGT--A-C-CCT--AGGGGT-CATT--ATT--TGAA-CAAAC-TTG-AATC-TCCA-CTATA-TCAGAA-A---GCTTTCATATCA-----TT-C-A-GCTTTT-TGA-CC---AG---T-G-T-T--------TAT----------GA------------GAAGATTATTA---AA------------GA--TTTT---------C-------CC-T--A-------AT-GT--TC--ACATGTC-A-AAC-T-TT-AT----------CCCT-ATTG-----TG-GCC--CCATC-TACCCCAGAGGA--CATAATTTGAAT--AAACATT----GAATC--TCCAC-TATA---A-GGAA---GCTT-T-ATATT--TATTTCAGC-TTTTCTGG---------------------------------------GA--AG-------------------AAGA---T---------------T-------CA--CAGGTA-A-A-------A----CT-TTG--A-TC---------CC-CT-ATT-----G---T-GG-CCCATCG--TA-CCC---C---GGGTCTAT-ATTTGAA-C-AAA----CAT-GAATCTC-CAC-T--ATATCAGG-AA----ACTTTCA-TG-----T--A-AAT-T-----T-CAGC-TTT--TCT------GG-C-CA-GT-GGT--TCTTGA-A--A--AGAAG-ATT-TT-atgcaaattatttaatttcattttaaggtgattac
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): AAACTCTGATGACATCATAGAGTTTTTAATGATATTTGGAATTTATAAGCTGAACAAAAAAAAAAAAAACCAAAACAAGAGGCCCATGGGCCACATCGTTCACCTGAGTACCAATGGTCCTGGTTTAGCAGTGGTGATTTAAAAAGAAAATTTTCATAATTTTTTT
Unaligned ( gi|30 ): CCTCTTCTTCTTACCATATATAAGAGGACAGAAATAAGCTACATATGTCCGTGGGTGAAGGCTGTACCTGTCCTATTCTCTATCTAAACAGAATACCTCCTACCACTATTCTT
Unaligned ( gi|31 ): GCGTGTAGGCTAATTAATTAAGGATTTCAACACATAGTAGCTAAAATAAAACCTGAACTAGAGGCCCATAGGCCATACTGCTCACCCTGTCCCTTTGCTCA
Unaligned ( gi|33 ): AAAGAAGACGTCCATGATCCACATCACCCACCTGAGTAACATCGACTCTGCTGTCCAAATTCCCACTCCGTATTATGGGGATGCTTCAATATCAATAT
Unaligned ( gi|40 ): AAACAAGACCGGCCCATGGACCACTTTCGCTGCTCACTGCCTATAGTTGACACTTCGGCCCTCGCACTCT
Unaligned ( gi|41 ): AAATTATTCCAATCATATCCTATTCTGAAGTGATAAAATTTATATTCAACTCGCATAATACAATAAT
Unaligned ( gi|44 ): AAAGTGGATTGGCATCAGGGTGTAGACAATGCCTGTCCGCTTCTTTAGAAATAATATCC
Unaligned ( gi|47 ): TTGAAAACAAGAGGCCCATGGACCACAATACTTACCCGAGTCATATT
Alignments
lowQualScore : 2 2222 1 1 11 111 11111111111111111111 1111 111111111111111111111 111111111111 11111 3333333333333333333333333 11111 22222222222 1111111111 11111 11 1111111111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777 11111111111111111 1111111111 11 1111111111 11111111 11111 111 5555555555555555555555 111111111 111111111 111111111 1111111 11111 111111 22222222 111111 111111 111111111111 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777
lowQualScore : 0 1 1 3333 1 5 1 3 1 88 7 7 777 0 2 777 5 88888888888888888888 3 666 2222 444444444444444444444 3 777777777777 888 0 9999 22 555 3 11111 0 0 4444444444444444444444444 6666 2 22222 555 444 77777 66 2 2 55555555555 2 2 2222222222 2 999999 5 33333 2 2 66666 444 444 2 2 5 44 33 33 2 2 44 2 33 33 2 2 2 2 1 2 2 2 444 1 33 2 7777 0 3 555 555 2 1111111111 3333333333333333333333333333333333333333333333333333 33 55555555555555555 2 33 77777 2 2 44 44 3 6 3 6 3 7777777777 3 999999999 44 0 11 333 66 55 6666 77 2 2 3 3 888 3 6666 3 44 3 99999999 3 3 555 3333333333 44 22222222 11111 555 66 2222222222222222222222 3 111111111 6666 6 44 3 222222222 3 3 222222222 2 555 3 7777777 3 22 6 55 7777 3 3 6 44 3 6666 3 77777 44 3 3 11111 3 3 44 111111 5 6 3 2 66 77777777 3 3 3 3 999999 111111 3 7777 3 555555555555 555 555 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 33 55 2 55555 2 2 33 5 999999999 2 88888888 777 999999999 2 2 33 2 6666666 3 33 33 111111 555555555 333 55 2 88888888 33 7777777 2 666666 555555 2 22 0 2 4 22 3 6 777 333 22 55555 55555 4 88888 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 33 66666 2 2 0 88888 3
lowQualScore : . . . .... . . . . . .. . . ... . . ... . .................... . ... .... ..................... . ............ ... . .... .. ... . ..... . . ......................... .... . ..... ... ... ..... .. . . ........... . . .......... . ...... . ..... . . ..... ... ... . . . .. .. .. . . .. . .. .. . . . . . . . . ... . .. . .... . . ... ... . .......... .................................................... .. ................. . .. ..... . . .. .. . . . . . .......... . ......... .. . .. ... .. .. .... .. . . . . ... . .... . .. . ........ . . ... .......... .. ........ ..... ... .. ...................... . ......... .... . .. . ......... . . ......... . ... . ....... . .. . .. .... . . . .. . .... . ..... .. . . ..... . . .. ...... . . . . .. ........ . . . . ...... ...... . .... . ............ ... ... ............................................................ .. .. . ..... . . .. . ......... . ........ ... ......... . . .. . ....... . .. .. ...... ......... ... .. . ........ .. ....... . ...... ...... . .. . . . .. . . ... ... .. ..... ..... . ..... ............................................................................. . .. ..... . . . ..... .
lowQualScore : 0 0 0 0000 0 5 0 3 0 33 3 3 555 8 5 888 4 55555555555555555555 6 888 1111 555555555555555555555 3 111111111111 222 5 7777 88 888 7 77777 1 1 8888888888888888888888888 1111 9 11111 000 777 11111 88 9 7 99999999999 7 7 5555555555 7 444444 3 33333 7 7 77777 777 444 5 7 3 99 11 44 5 7 33 7 44 44 5 7 9 9 0 7 7 4 111 2 44 5 3333 1 0 000 000 9 2222222222 2222222222222222222222222222222222222222222222222222 99 99999999999999999 9 99 11111 9 9 22 22 1 2 1 2 5 5555555555 1 555555555 22 8 88 777 88 99 1111 99 6 9 1 1 555 1 8888 1 22 1 77777777 1 1 444 5555555555 22 11111111 77777 000 22 1111111111111111111111 3 000000000 5555 2 22 1 333333333 1 3 000000000 8 444 6 5555555 6 88 7 33 1111 3 3 7 66 1 5555 3 77777 22 1 1 99999 1 1 22 999999 2 2 1 9 88 88888888 1 1 1 3 555555 555555 6 7777 1 888888888888 444 000 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 99 88 4 44444 9 7 77 3 777777777 5 22222222 888 444444444 5 5 44 5 2222222 1 44 44 888888 222222222 999 44 2 11111111 11 2222222 2 111111 888888 0 88 8 0 0 88 1 0 444 777 99 33333 33333 5 66666 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 7 77 77777 9 4 8 22222 6
consensus : AGCTGTATCTT-ANCCCNGGGGGTCACGATTNGTANCAAGTTT-CCTTNAAACTGACCCAGT--GGTTCTGGAGAAGAACATTTTATGTAAAA---CTTTGATC---CCCT-----A--TT----------GTGG-CCCCACC-C-TACCCCC---GGGG--G-----C----C-A-----T-GATTTGAA------------CAAA--CTTGAAT-CTACNCT---ATGTC-----AGGAAGCTTTCA--TGTAA--ATAT-GTC-----T--TTT----CTG-GCC-----C---AG---TG-----GT--TCT-TGA-GAAGA--A-----TT-TTT-AAA-GA--------T-TT-TCCC-T----AT-ATATTC--AC-A-T-G-----TAAA---AC---T-TTGATCCC-CTA-TTGTGGCCC-CATCNT--A-C-CCC--GGGGGT-CATG--ATT--TGAA-CAAAC-TTG-AATC-TNCA-CTATA-TCAGGA-A---GCTTTCATATAA--AT-TTN-A-GCTTTTCTGGCCC---AG---TGG-T-T--------CTT----------GA------------G-------------AA------------GA--TTTT---------C-------CC-T--A-----T-AT-AT--TC--ACATGTA-A-AAC-T-TTGATC---------CCCT-ATTG-----TG-GCCC--CATCGTACCCCCGGGGGT-CATGATTTGAAC--AAA-NTT----GAATC--TCCAC-TATA-TCA-GGAA---GCTT-TCATATA--AATTTCAGC-TTTTCTGG--CC-CAG---T----G-GT-TCT---T------G---AGA--AG---A----TTTTT-----AAAGA---TTT-CCCC---A-T-----A---T-----CACATGTA-A-A-------A----CT-TTG--A-TC---------CC-CT-ATT-----G---TGGCCCCATCG--TA-CCC---C-G-GGGGTC-ATGATTTGAA-C-AAA----CTT-GAATCTC-CAC-T--ATATCAGG-AA----GCTTTCA-TA-----T--A-AAT-T-----T-CAGC-TTT--TCT------GGCC-CA-GT-GGT--TCTTG--A--A--AGAAG-A-TT-TT-T------AAATG------ACAC-C----ACCCTA-TTT------------TT---GC---AT--------------T---T-------------C-------------C-------------CT--TT-GAAGGG-G---G-CCTGGT-CCT--TCATT-T----G----AAC-AAA--C--T--TGA---AT---------C-CC-C--TT-CACC--CAA-GGATGATTTGT--ACCA--AG------TTTG----G----TTGA---A-NT-TG--------G--C-------C-C------AGC-----GGT-T--CTGGAGAA-GA-A--GTCGAAA-ATG---TG---AAA--A-----GT-----TAACA----GAC-A-------A--C----A-----AC-----G--AC---------G-A----CAGACAA-CGG-G-AA--AA--T-C-GA-TCAG--AAA-----A-GCTCACTTGAGCCTTCG---GCTCAGGTGAGC-TAAAAA
Reference ( family-218 ) : AGCTGTATCTT-ANCCCNGGGGGTCACGATTNGTANCAAGTTT-CCTTNAAACTGACCCAGT--GGTTCTGGAGAAGAACATTTTATGTAAAA---CTTTGATC---CCCT-----A--TT----------GTGG-CCCCACC-C-TACCCCC---GGGG--G-----C----C-A-----T-GATTTGAA------------CAAA--CTTGAAT-CTACNCT---ATGTC-----AGGAAGCTTTCA--TGTAA--ATATCGTC-----T--TTT----CTG-GCC-----C---AG---TG-----GT--TCT-TGA-GAAGA--A-----TT-TTT-AAA-GA--------T-TT-TCCC-T----AT-ATATTC--AC-A-T-G-----TAAA---AC---T-TTGATCCC-CTA-TTGTGGCCC-CATCNT--A-C-CCC--GGGGGT-CATG--ATT--TGAA-CAAAC-TTG-AATC-TNCA-CTATA-TCAGGA-A---GCTTTCATATAA--AT-TTN-A-GCTTTTCTGGCCC---AG---TGG-T-T--------CTT----------GA------------G-------------AA------------GA--TTTT---------C-------CC-T--A-----T-AT-AT--TC--ACATGTA-A-AAC-T-TTGATC---------CCCT-ATTG-----TG-GCCC--CATCGTACCCCCGGGGGT-CATGATTTGAAC--AAA-NTT----GAATC--TCCAC-TATA-TCA-GGAA---GCTT-TCATATA--AATTTCAGC-TTTTCTGG--CC-CAG---T----G-GT-TCT---T------G---AGA--AG---A----TTTTT-----AAAGA---TTT-CCCC---A-T-----A---T-----CACATGTA-A-A-------A----CT-TTG--A-TC---------CC-CT-ATT-----G---TGGCCCCATCG--TA-CCC---C-G-GGGGTC-ATGATTTGAA-C-GAA----CTT-GAATCTC-CAC-T--ATATCAGG-AA----GCTTTCA-TA-----T--A-AAT-T-----T-CAGC-TTT--TCT------GGCC-CA-GT-GGT--TCTTG--A--A--AGAAG-A-TT-TT-T------AAATG------ACAC-C----ACCCTA-TTT------------TT---GC---AT--------------T---T-------------C-------------C-------------CT--TT-GAAGGG-G---G-CCTGGT-CCT--TCATT-T----G----AAC-AAA--C--T--TGA---AT---------C-CC-C--TT-CACC--CAA-GGATGATTTGT--ACCA--AG------TTTG----G----TTGA---A-NT-TG--------G--C-------C-C------AGC-----GGT-T--CTGGAGAA-GA-A--GTCGAAA-ATG---TG---AAA--A-----GT-----TNACA----GAC-A-------A--C----A-----AC-----G--AC---------G-A----CAGACAA-CGG-G-AA--AA--T-C-GA-TCAG--AAA-----A-GCTCACTTGAGCCTTCG---GCTCAGGTGAGC-TAAAAA
gi|1 : TGAG-T-GAC----CTT-GGCCCTCGCAC-TCTATATCAGG-AA----GCTTTAA-GG-----T--A-AATGT-----TGTAAC-TT-----T------GG--------------TCTTG--------AGAAG-A-TT-
gi|1 : acaagaggcccatgggccacatcgctcacc-CTATA-TCAGGA-A---GCTTTAAGGTAA--ATGTTGTA-ACTTT-----------------GG-T----------CTT----------GA------------G-------------AA------------GA--TTAC---------C-------CC-T--A-----T-AT-ATAATC--ATGTGTA-A-AAC-T-TTGATC---------CC-T-ATTG-----GGCGCCCACCATCGTACCTCCGGGGGT-CATGATTTGAAC--AAA-CTT----GAATC--TCC-T-TATA-TCACGGAA---GC-G-TCATA-A--AATATCAGC-TTTCCTGGTCCC-CAG---T----G-GG-TTT---T------G---AGA--AG---AAAACTTTTTA----AAAAA---TTT-TCCC---T-G-----A---T-----T-CTTGAA-ACA-------A----AT-TTGCAA-TC---------CCACT-ATacccctatatataatcatgtgtaaaactttgatccctattgggcgcccaccatcgtacctccgggggtcatgatttgaacaaacttgaatctccttatatcacggaagcgtcataaaatatcagctttcctggtccccagtgggttttgagaagaaaactttttaaaaaattttccctgattcttgaaacaaatttgcaatcccactatatcagtagagctttccaatgaatctcagctttcctggcccaaggttggttttcttttcctttttcgaacagaagaagatttttaagacttcctcaatatcaatcacatgctaaaccttgatccctattgtggcccctcgtaccccgggggtcatgatttgaaccaaactttaatctccactatattcaggacttcccatattaatctcagcttcctggtccagacatgtgttcttcgaaagaatttttaaaggatttttccctatataatcatatgtagaaactcttgatcccataattgtggcccatcataccccaggggtcaatttgaacaaaacttgaatctcctctatattaggagcttccatatacaatttcagctttcgtctggcccagtggttcttgaagaagaagaattgttttgttaaaatcacaccacctattttttgcgcattgtttgtgattatctcccctttgaaggggctcggtccttcattgaacaaactgaatctccttcacccaagggatgattggtatcaagtttggttgaatattggcccagtggtctcttgagaaaaagtcgaaaatgtgaaaagttagacgacagacagaagg
gi|1 : acaagaggcccatgggccacatcgctcacctgagtgaccttggccctcgcactTG--ATTCTTGAAACAAAT-TTGCAATC--CCA-CTATA-TCAGTAGA---GCTTTCCAATGA--AT-CTC-A-GCTTTCCTGGCCC---AAGGTTGG-T-TTTCTTTTCCTTTTTCGAACAGAA------------G-------------AA------------GA--TTTT---------TAAGACTTCC-TCAA-----T-ATCAA--TC--ACATGCT-A-AAC-C-TTGATC---------CC-T-ATTG-----TG-GCCC--C-TCGTACCCC-GGGGGT-CATGATTTGAACC-AAA-CTT----TAATC--TCCAC-TATATTCA-GGA-----CTTCCCATATT--AATCTCAGC--TTCCTGG--TC-CAGACAT----GTGT-TCT---TC-----G---AAA--GA---A----TTTTT-----AAAGGATTTTT-CCCT---A-TATA--A---T-----CATATGTAGA-A-------A----CTCTTG--A-TC---------CC-ATAATT-----G---TGG-CCCATCA--TA-CCC---C-A-GGGGTC-A--ATTTGAA-CAAAA----CTT-GAATCTC-CTC-T--ATATTAGG--A----GCTTCCA-TA-----T--ACAAT-T-----T-CAGC-TTTCGTCT------GGCC-CA-GT-GGT--TCTTG--AAGA--AGAAGAA-TTGTT-TTGTTA-AAATC------ACAC-C----A-CCTA-TTT------------TTTGCGC---ATTGTTTGTGATTATCT---C-------------C-------------C-------------CT--TT-GAA-GG-G---G-CTCGGT-CCT--TCA-T-T----G----AAC-AAA--C-----TGA---AT---------C-TC-C--TT-CACC--CAAGGGATGATTGGT--ATCA--AG------TTTG----G----TTGA---ATAT-TG--------G--C-------C-C------AGT-----GGTCT--CTTGAGAA-AA-A--GTCGAAA-ATG---TG---AAA--A-----GT-----T---A----GAC-G-------A--C----A--------------------------G-A----CAGAatcagtagagctttccaatgaatctcagctttcctggcccaaggttggttttcttttcctttttcgaacagaagaagatttttaagacttcctcaatatcaatcacatgctaaaccttgatccctattgtggcccctcgtaccccgggggtcatgatttgaaccaaactttaatctccactatattcaggacttcccatattaatctcagcttcctggtccagacatgtgttcttcgaaagaatttttaaaggatttttccctatataatcatatgtagaaactcttgatcccataattgtggcccatcataccccaggggtcaatttgaacaaaacttgaatctcctctatattaggagcttccatatacaatttcagctttcgtctggcccagtggttcttgaagaagaagaattgttttgttaaaatcacaccacctattttttgcgcattgtttgtgattatctcccctttgaaggggctcggtccttcattgaacaaactgaatctccttcacccaagggatgattggtatcaagtttggttgaatattggcccagtggtctcttgagaaaaagtcgaaaatgtgaaaagttagacgacagacagaagg
gi|10 : acaagaggcccatgggccacatcgctcacctgagtgaccttggccctcgcactctatatcaggaagctttaaggtaaatgttgtaactttggtcttgagaagattacccctatatataatcatgtgtaaaactttgatccctattgggcgcccaccatcgtacctccgggggtcatgatttgaacaaacttgaatctccttatatcacggaagcgtcataaaatatcagctttcctggtccccagtgggttttgagaagaaaactttttaaaaaattttcccGGGGAT-CATGAATTGAAC--AAA-CTT----AAATA--TCTCC-TACA-TCA-GGTA---GCTT-TAATGCC--AATCTCAGC-TTTTCCGG--CC-CAA---T----G-AT-TCT---C------G---AGA--AG---A----TTTTT-----AAAGA---TTT-TCCCTTTA-T-----A---TC----CACATGTA-A-A-------A----CT-TTG--A-TC---------CC-CT-ATT-----G---TGTCCCCATCT--TA-CCC---CTG-GGGGTC-ATGATTTGAA-C-AAA----CTT-GATTTTC-CAC-T--ATACCAGG-AA----GGTTagg
gi|10 : ATCTT-ACCCCTGGGGGTCATGATTTG-AACAAACTTGATTTTCCACTATACCAGGAAGGTTCTGGAGAAGATGATT---TGTAAA-------TGACCACACCTT-----A--TTTTGCATTTTGGTGA---TTATC-T-TGCCTTTGAAGGGG--G-----C----CTAGTCCTT-CATTCGAA------------CAAA--CTTGAAT-T--CTCT------TCAACCAAGGATAATTT-G--TGCAA------CGTT-----TG-GTTGAAATTG-GCC-----T---AG---TG-----GT--TCT-GGA-GAAGctggagaagatgatttgtaaatgaccacaccttattttgcattttggtgattatcttgcctttgaagggggcctagtccttcattcgaacaaacttgaattctcttcaaccaaggataatttgtgcaacgtttggttgaaattggcctagtggttctggagaagttgaaaatgtgaaaagttaacagacagacaaaagacagacaaagggcaatcagaaaaaaactcacttgagtcttcggctcaggcgagctaaaa
gi|10 : ggggatcatgaattgaacaaacttaaatatctcctacatcaggtagctttaatgccaatctcagcttttccggcccaatgattctcgagaagatttttaaagattttccctttatatccacatgtaaaactttgatcccctattgtgtcccc-GGT--TCTGG--AG-A--AGATG-A-TT-TG-T------AAATG------ACCA-C----ACCTTA-TTT------------T----GC---AT--------------T---T-------------TGGTGATTATCTTGC-------------CT--TT-GAAGGG-G---G-CCTAGT-CCT--TCATT-C----G----AAC-AAA--C--T--TGA---AT---------T-CT-C--TT-CAAC--CAA-GGATAATTTGT--GCAA--CG------TTTG----G----TTGA---A-AT-TG--------G--C-------C-T------AGT-----GGT-T--CTGG---A-GA-A--GTTGAAA-ATG---TG---AAA--A-----GT-----TAACA----GAC-AG------A--C----A-----A---------AA---------G-A----CAGACAA-AGG-G-----------C-AA-TCAGAAAAA-----A-ACTCACTTGAGTCTTCG---GCTCAGGCGAGC-TAAAAttgaaaatgtgaaaagttaacagacagacaaaagacagacaaagggcaatcagaaaaaaactcacttgagtcttcggctcaggcgagctaaaa
gi|11 : ggggatcatgaattgaacaaacttaaatatctcctacatcaggtagctttaatgccaatctcagcttttccggcccaatgattctcgagaagatttttaaagattttccctttatatccacatgtaaaactttgatcccctattgtgtccccatcttacccctgggggtcatgatttgaacaaacttgattttccactataccaggaaAGC-TTTTCTGG--CC-CAG---TTCCAG-GT-TCT---T------G---AGA--AG---AAGA-TTTTT-----AAATA---TTT-TCCC-----T-----A---TTTAAACACATGTA-A-ATAATTAAA----TT-ATG--A-TA---------CC-CT-AAT-----G---TGGCCCCATCA--TA-CCC---C-CCGGGGTC-ATGATTTGAA-C-AAA----CTC-AAATCTC-TAC-T--ATATCAAG-AA----GCTTTGA-TA-----T--A-AAT-T-----T-AAGC-TTT--TTTT-----GGCC-CA-GT-GGT--TCTTG--AG-A--AGAAG-A-TT-TT-T------AAATG------ACAC-C----ACCCTA-GTT------------TT---GC---AT--------------T---T-------------T-------------CGTGATTATCTCCTCT--TT-CATGAG-G---G-CCTAGT-CCT--TCATT-T----G----AAC-AAA--C--T--TGG---AT---------C-CC-C--TT-CAC--------------------ACCA--AA------TTTG----G----TTGA---A-TTATG--------G--C-------C-C------AGC-----GGT-T--CTGGAGAAGGA-A--GTCGAAA-ATG---TG---AAA--A-----GT-----TAACA----GAC-A----------------------------G--AC---------A-A----CATACAA-AAG-G-----------C-GA-TCAG--AAA-----A-GCTCACTTGAGCCTTTG---GCTCAGGTGAGC-TAA
gi|12 : a-------A----CT-TTG--ACTC---------CG-CC-ATT-----GCAATGGACTCAACAATTA-CCTACAC-G-ACGATC-A-GACTTGAAAC-AAA----TTTCGAGATGC-CACAT--ATATTGAG-AAATGTGCTTTTA-CAATAAAT--A-AAT-TGTGTTT-CAGT-CTT--TCTCTGCGGGACCGCA-GTCGGTGATCTTG--A--AGGAGAAG-AGTC-TT-TGTTTGAAAATGTATCGCACAC-CCATAACC--A-TTTGAATATGCTAATCT---GCGATAT--------------TAC-T-------------C-------------C-------------CT--TTAGCAGAG-G---GACCTCACGCCT--CCATGAT----GTAGTAAC-AAAAACAATGATGAGA-ATGCCCCACGGC-CT-C--TTACACGAACAC-GGATGATTTGC--ACTA--GGAGAAGGTTTG----AGATATCGACACG-GT-TG--------G--C-------TAC------A-C-----ATT-TTTCTGGAGAA-GAGA--GTCGAAATATGGTATA---AAA--AATGATAT-----TAACA----GAta
gi|13 : CAGG------GCTTCCGTA-----GT-TTC-A-GCTTTTTTAGCCT---AG---TGG-T-T--------CTT----------GA------------G-------------AA------------GA--TTTT---------T-------TC-T--A-----C-CT-AT--TC--ACATGTA-C-AAC-T-TTGATT---------CCCT-ATTG-----TG-GCCC--CATCGTATCTCCTGGGGT-CATGATTTTAAT--AAA-GTT----GAATA--TCCAC-TATA-TGA-GGAA---GCTT-TCATATA--AATTTCATC-TTCTCTGG--CC-CAA---T----G-AT-TCTTGAT------G---AGA--AG---A----ATTTT-----GAAGA---TTTGCCCT---ATT-----AT--T-----CACATGTA-A-A-------A----CT-TTG--A-TC---------CC-Cgaggaga
gi|14 : TA-TTT------------TC------------------------T---C-------------C-------------C-------------CT--TTCGATGGG-AAATG-CATGCA-CCT--TCATT-T----G----AAC-AGA--T--T--TGA---AT---------T-CC-C--TT-CATC--AAA-ATATGCTTTAT--GGCAACAGTTAC--TTTG----A----TTGA---A-A--TG--------G--C-------C-C------AGCTTTTTTTT-T--TTTAAG------A--TTTAAAA-ATA---TATTCAAA--G-----TT-----TTACATATGGATGA-------A--C----AG----ACT----G--AC---------A-A----TTAACAATTAG-C-AA--AA--TGT-GA-TCAG--AAA-----A-GCTCACTTCAG
gi|15 : cacccattttttcatttgctgatca-----T--A-ATT-T-----T-CAGC-TTT--TCT------TGCC-CA-GT-GAT--TCTTA--T--A--AGAA---------------------------------------TCCTA-CTT------------TT---GC---AT--------------T---TTCTTGATTTTCTCC-------------C-------------CT--TT-CAAAGG-A---G-CATGTT-TTT--T--TT-T---------AAC-A----------TGATCAAT---------C-CCGC--TT-TAT-------GGG-------------A--AA------TTTG----A----TTGA---A-AT-TA--------G--C-------C-C------TGC-----AGT-T--ATGGAGAA-GA-G--ATCGAAA-G-A---AA---AAA--A-----GT-----ATACA----GAT-G----------------------------G--ACA--------G-A----CAGACAA-CGG-ACAA--AA--T----A-T-------A-----A-GCT----------TTTG---GCTCAGGTGAGCTTAAAAA
gi|16 : TA-TTT------------CT---GT---AT--------------TATCT-------------C-------------C-------------CC--TT-TAAGGG-A-----CCCGGT-CCT--TCCTT-TAATTG----AAC-AAA--C--A--TGA---AT---------C-CC-T--TT--ATC--CAA-GGATGATTTGC--ACCA--AG------TTTG----G----TTGA---A-AT-GT--------G--C-------C-C------AGT-----TG--T--CT------------------AA-ATG---TG---AAA--A-----GT-----TAACG----GAC-A-------A--C----GT----GCA----G--AT---------G-A----CGGACAA-CAG-G-----------C-GA-TCAG--AAA-----A-GCT-ACTTG---CCTCG---GCTCAGGTGA-C-TAa
gi|17 : accacaccatttatttAC-C----ACCCTA-TTT------------TT---GC---AT--------------T---TTCGTGATTATCTCC-------------C-------------CT--TT-GATGAG-G---G-CCTGGT-CCT--TCATT-T----G----AAC-AAA--A--T--TGA---AG---------C-CC-C--TT-CACC--CAA-GGATGATGTGT--ACCA--AG------TTTG----G----TTGA---A-TT-T---------G--C-------C-C------AGC-----GGT-T--TT-GAGAA-GA-A--GTTGAAA-ATT---TG---GAA--A-----GT-----TTAC-----GAC-G-------ACCC----A-----AC-----G--GC---------T------CAGGTGA-GCT-A-AA--AA--T-A-GG-TCAG--AGA-----
gi|18 : ---TG-----GT--ACT-TTG-GAGG------------TTT-AAA-GAGAAATTTGT-TT-TCCA-T----ATCATATTC--CA-A-T-A-----TATA---AT---T-T--------CTG-TTGT---CC-CATCCT--GGT-CCT--GGAATT-CATG--GTT--TAAA-CAGAG-ATG-GATCCTTCAACT-CA-T-AAGA-A---GCTTTCATGCAAGGAT-TGA-A---TTTACTA--CT---AG---TAA-T-T--------Cttaaatactcg
gi|18 : tggttcaacagtttcagagaagaaaattaata--TTTT---------C-------CA-T--A-----TCAT-AT--TC--CAATATA-T-AAT-T-T----------------CT-GTTG-----T----CC--CATCCTGGTCCTGGAATT-CATGGTTTAAAC--AGA-GAT----GGATCCTTCAAC-T-CA-T-A-AGAA---GCTT-TCATGCA--A
gi|19 : tggttcaacagtttcagagaagaaaattaatatggtactttggaggtttaaagagaaatttgTTAGG-AA----GTTTTCA-TG-----T--A-AAA-TAG---T-CA---CAT--TCT------GGTCGCATGT-GGT--CCTT------A--AGAAG-A-CA-TT-C------AAATG------CCCA-C----AACCTAGTTT------------GG---GC---AT--------------T---T-------------ggattgaatttactactagtaattc
gi|19 : ---AT--------------C---T-------------CT------------C-------------CT--TT-AAAAGG-G---G-AATAGT-CCT--GCATT-T----G----AACAAAA--C--A--TGA---AT---------tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattatctctcctttaaaaggggaatagtcctgcatttgaacaaaacatgaatat
gi|2 : ttaggaagttttcatgtaaaatagtcacattctggtcgcatgtggtccttaagaagacattcaaatgcccacaacctagtttgggcattttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattAGCTGTATCTTNAACCCAAGG----ACGATTAGTACCAAGTTT-CCTTGAAATTGACCCAAT--GGTTCTGGAGAAGAACATTTTATGCAAAA---CTGAGATC---CCCT-----A--TT----------GTGG-CCCCTCC-C-TACCCCC---GGGG--G-----T------A-----T-GATCTGCT------------CAAA--TTTGGAT-CTACTAT---ATGTC-----AGGAACCTTTAA--GGTAA--ATATTGTT-----T--CTT----CTG-GTC-----C---AA---TG-----GT--TCT-TGA-GAAGACGA-----TT-TTT-AAA-GA--------T-TT-TCCC-T----AT-ATATTC--TT-A-T-G-----TAAA---AC---T-TTGATCCC-CTA-TTGTGGCCC-CATCGT--A-C-CCC--GGGGGT-CATG--ATT--TGAA-CAAAC-TTG-AATC-TTCA-CTATA-TCAGGA-A---GCTTTCATATAA--AT-TTA-A-GTTTTTCTGGCCC---AG---TGG-T-T--------CTT----------GA------------G-------------AA------------GA--TTTC---------C-------CC-T--A-----T-AC-AT--TC--ACATGTA-A-AAA-T-CTTATC---------CCCT-A--A-----TG-GCCC--CATGGTACCCCCGGGGTT-TATGATTTGAAC--AAA-ATG----GAATC--TTCAC-TATT-TCA-GGAA---GCTT-TCATATC--AATTTCAGC-TTTTCTGT--CC-CAG---T----G-GT-TCT---T------G---AGA--AG---A----TTTTT-----AAAGA---TTT---------------------------ATATATA-A-A-------A----CT-TTG--A-TT---------CC-CT-AAT-----A---TGGCCCCACCG--TA-CCCAA-G-G-AGGGTC-GTGGTTTGAA-C-AAA----CTT-GAATCTC-CAT-T--ATATCAGG-AA----GCTTTTA-TA-----T--C-AAT-T-----T-CAGC-TTC--TCT------GACC-AA-AT-GGT--TCTTGTCA--A--AGAAG-A-TT-TT-T------AAATG------ATAC-C----ACCCTA-TTT------------TT---GC---A---------------------------------C-------------C-------------AT--TT-GAAAGG-G---G-TCAGGT-CCT--TCATT-T----G----AAC-AAA--C--T--TGA---AT---------C-CC-C--TT-TACC--CAA-GGATGATTTGC--ACCA--AG------TTTG----G----TTGA---A-TT-TG--------G--C-------C-C------AGT-----AGT-T--CTGGAGAA-GA-A--GATGAAA-ATG---TG---AAA--A-----GT-----TTACA-----AC-A-------A--C----A-----AC-----G--AT---------T-A----CTGACAA-CGG-G-AA--AATTT-T-GA-TCAG--AAT-----A-GCTCACTTAAGCATTCG---GGTCAGGTGAGC-TAAAAAat
gi|20 : ---ATGTT-----AGAAAG----------TAA--TTTTCCAC-----T--TTT----CTG-GCC-----C---AG---TT-----GT--TCG-TGA-GAG----------TT-TTT-AAA-AA--------T-T---CCCAT----AA-ATATTC--GC-A-T-G-----TAAA---AC---T-TTGATTCC-CTA-TTGTAGAAC-CACCCT--A-C-CCA--AAAGGC-AATAGTATT--TG---CAAAT-TTG-AATC-TGCA-CAATG-CCAGAA-A---GCTTTTATGTA
gi|21 : AAGCTTTCAACTGTA------T--TC-----TACTTT----CTG-GCC-----C---AG---TT-----GT--TCGATGG-GAAGA---------T-TTT-AAA-GA--------TGCT-TCCC-T----A--ATATGCT-GC-A-TTG-----TACA---AC---T-TTGATCCC-TTT-TTGTGGCCT-T-TCCT--A-C-CC----------AAAG--ATT--TGAA-CAAAT-TGA-AATC-TATC-CTG-A-TCA-GA-G---GCGTTCATG-AA--AT-
gi|23 : --TT-GAAGAGCA---G-CC-----CCTCATCATCAT----G----AAC------T--T--TGA---AT---------CTCC-C--TT-CATG--TAA-T-ATG--TTAT--GCCA--CA------TTTG----T----TTGA---A-AT-TT--------A--C-------C-A------AAT-----GGT-C--GTGCAGAA-AA-A--GT-------------G---AAAACA-----GT-----TGAcc
gi|24 : ------AGT-----GCC-T--CTGGAGAA-GA-A--GTTGAAA-A-G---TT---AA----------T-----TTAT-------C------------C----A-----AG-----G--AC---------A-AATCCTAGTTAA--------A--TG--T-T-GA-TCAG--AAC-----ACACTCACTTGAGCCTTTATTAGCTCAGGTGAGC-TACAAttatgaggaaagagctttgcattagaaaactcagtaacttttttcagctc
gi|25 : ggacgttttgggtcaatttaaaggaatttaaagctcagtttt-AAA--C--T--TGA---AT---------A-TC-AAATT-TACC--AAA-GAAAAACTTA-----CA--AT------TTTG----A----TTGA---C-AC-TA--------G--C-------T-G------AAA-----AGT-T--CAGGAGAA-GA-A------AAC-ATG----------A--A-----G---------------GAA-A-------A--C----------AC-----A--A------------A----CAGA-AA--GG-C-GG--CA--T-CTGA-TCAG--A------------CATTTAAATAAGTG---ACTCAGGTGAGC-TAAAAA
gi|26 : T---------C-TT-C--TT-CATC--CAA-AG-TG-TTTGT--ACAA--AA------TGTGTAATG----ATGG---A-TT-TGATGATGAGG--CAAACTGGC-C------AGT-----GAT-T--CTGGAGAT-AA-A--GAAAAAATATT---TG---CAA--A-----GT-----TAACA----GAC-A-------A-------A-----TG-----G--ATG--------G-A----CAGAC
gi|27 : gaactaattaggaaatgCCC-T----AT-ACATGT--AC-A-T-AGGCATCAAA---A--------GCTCCC-CTA-TTGTGGCTC-AAACCT--A-C-CCCT-GGGGGC-AATG--ATT--TGAA-TAGAT-TGG-AATC-TACT-TTATA-TAAGAA-A---AC-TTCAT-TAA--AT-
gi|27 : TC---CCCT-----A--TT----------GTGG-CTCAAAC-C-TACCCCT---GGGG--G-----C----A-A-----T-GATTTGAA------------TAGA--TTGGAAT-CTACTTT---ATATA-----AGAAAAC-TTCA--T-TAA--ATAaactgcatactattggtgtgcatt
gi|28 : ccctatacatgtacataggcatcaaaagcT-T--CTGGAGAA-GAGA--GTCGAAATATGGTATA---AAA--A-----ATGATATTAACA----GAG-AGGAGAAGA--CTCAGA-----AC-----GTGAC---------GCA----CGGACA--CAA-A-AA--GA--G-C-AACTCAG--AAA-----A-GATCACCTCAGCCTC-----GCGCAGGTGAGC-actgcatactattggtgtgcatt
gi|29 : -CCT--TCATT-T----C----TAC-AAA--C--T--TGA---AT---------T-------TT-----------GAAT--TTCCTTAACTA--AA------GTTG----G----TTGA---A-AT-AA--------G--T-------C-T------AAT-----TGT-T--CTGGAGAA-GC-ATCGTCGGAA-ctcaa
gi|3 : actctatgtttgacttttcttgattatctcTGTAAGATTGCTTT-ATC---CC-T-----AATTT----------GTG----CCACC-C-AACCCCC---GGGG--GGTTTACGAGGC-A-----TTAATCTGAA-------------AAA--CTC-AAT-CTACGTCCAAATATCG----ATGAAG--TTCA--GGATA--ATATCCAC-----T--TTC----TTGTGTT-----C---AA---TGTATGTAT--TTT-TTA-AAAGA--A----------------------------TT-TCCC-TACTAAT-ATAATT--GC-ACT-G-----TAAAAATAT---T-CTGATCCT-TTG---GTGGCCCACAT--T--A-C-CCT--GGGGTT-CATG--AAT--TGGA-C-AGC-TTT-TATG-CTCG-CTATA-TCAGG--A---GCTT--ATACAA--AT-CTA-A-GCTTTCCTGGCCCTTTAT---TGG-TCT--------CTT----------GACGAAGATTTTTTA-------------AA------------GA--TTTT---------C-------CCAT--A-----T-AT-AA--TCTGATATATA-A-ATC-TATTGATT---------CCCTAATTG-----GG-GCCC--CATTGTACCCCTGGGGGTGCATGAATTAGAA--AAC-GTT----GAATC--T-AAC-TATA-TCA-GGAAAATG-TT-TCATATA--AATTCC-GA-TTTTC-GG--CC-TAG---TG---G-GT-TCT---T------G---AGAATAG---A----AGATT-----AAAGAATTTTT-CCCT---A-TATA--A---T-----CATACGTA-ACA-------A----CTGTT-----TT---------CC-CT-ATTGAACCG---TGCCCCTATCG--TA-CCC---C-C-GGGATC-ATGATTTGAA-C-GAAATTTTTT-GAATTTC-CACAT--ATATCAGGAAA----GCTTTCA-TA-----TACA-AAT-T-----T-CAGTACTT--TCT------AGCC-C--GT-GGTG-TCCTG-----G--AGAAG-A-TT-TT-T------
gi|3 : cttataagaatctatctctacaatacgttTGTAAAAATATTCTGATC---CTTT-----G--------------GTGG-CCC-ACA-T-TACCCT----GGGG--T-----T----C-A-----T-GAATTGGA------------CAG---CTTTTATGCT-CGCT---ATATC-----AGGA-GCTT--A--TACAA--ATCTAAGC-----T--TTC----CTG-GCC-----CTTTAT---TG-----GTC-TCT-TGACGAAGA--T-----TT-TTT-AAA-GA--------T-TT-TCCCAT----AT-ATAATCTGAT-A-T-A-----TAAA---TC---TATTGATTCC-CTAATTGGGGCCC-CATTGT--A-C-CCCT-GGGGGTGCATG--AAT--TAGA--AAACGTTG-AATC-TA-A-CTATA-TCAGGA-AAATG-TTTCATATAA--AT-TCC---GATTTTC-GGCCT---AG---TGGGT-T--------CTT----------GA------------G-------------AATAGAAGATTAAAGAATTTTT---------C-------CC-T--A-----T-AT-AA--TC--ATACGTA-ACAAC-TGTT--TT---------CCCT-ATTGAACCGTG-CCCC--TATCGTACCCCCGGGA-T-CATGATTTGAAC--GAA-ATTTTTTGAATT--TCCACATATA-TCA-GGAAA--GCTT-TCATATACAAATTTCAGTACTTTCTAG--CC-C-G---T----G-GTGTCC---T------GG--AGA--AG---A----TTTTTTTTTTAAAGA---TTT-TTCC---A-TTATAAA---T-----CATATGTG-A-A-------ATACTCT-TTG--A-TC---------CC-TC-AT------A---TGGCCTCATCG--TA-CCC---C-G-GGAGTC-ATTATTTGAA-C-AAA----CTT-GAATCTC-CAT-T--AGATCAGA-AA----TTTTTCA-TT-----T--A-AAT-T-----T-CAGC-TTT--TCT------AGTC-CA-GT-GGT--TCTTG--A--G--Atttttaaagatttttccattataaatcatatgtgaaatactctttgatccctcatatggcctcatcgtaccccgggagtcattatttgaacaaacttgaatctccattagatcagaaatttttcatttaaatttcagcttttctagtccagtggttcttgagaacaaaa
gi|32 : cttataagaatctatctctacaatacgtttgtaagattgctttatccctaatttgtgccacccaacccccggggggtttacgaggcattaatctgaaaaactcaatctacgtccaaatatcgatgaagttcaggataatatccactttcttgtgttcaatgtatgtattttttaaaagaatttccctactaatataattgcacG------TTTA----G----TTGA---A-AT-TG--------A--T-------C-C------AAC-----GAT-T--CCGGAGA-----A--GTTGAA------------------------------------------------------------G-----AC-----G--AC---------G-G-----AGAC---CGA-G--A--TA--T-T-AA-ACAG--AAAAGCTGA-GCTCACTTCAGTCCTCA---GATCAAGTacaaaa
gi|34 : G-CCACACCTC-TACCACC---AGGGCGG-----C----C-A-----C-GATTT-AA------------TGGA--CTTAAAT---ATTTT---AT-TT-----ACGGAACTTTCA--TATAA--ATTT--TT-----T--TTT----CT--GCC-----T---AG---T
gi|35 : gt-----C----C-A-----T-GGTTTGAA------------CAA------GAAG-----------ATG-------AAGAAGCTTCTA--CACAAG-ATAT-GTT-----T--ATT----CTG-GTC-----C---AC---TG-----GT--TCT-TGA-GAA
gi|36 : gaggat---CTTT-ATT---CCCTTGAAAA--TG----------ATGGTCCCCACT-T-TACCCCC---GGGG--G-----G----C-A-----T-GGTTTGAA------------CAAA-----GAAT-tacccatcccc
gi|37 : gatctttgaaatgtctttttgagtT-TTT-AAA-GG--------A-CT-TTCC-A----AT-ATAATC--CCTA-T-T-----CTAA---TC---T-ATGATCCC--TA-T-ATGGTCC--ATCCA--A-C-CCC--GGGAGT-TACA--ATT--TGAA-
gi|38 : -----G--AT---------G-C----CAGACAA-CTT-A-AACAAACTT-C-AA-TCAG--AAA-----A-GCTCACTTAAGTTTTCA---GCTAAAGTGAGC-TAAAAAattg
gi|39 : ataGA---A-TT-TG--------G--T-------C-C------AGT-----GGT-T--CTAGAGAA-GA-A--GGTGAAA-ATG---TG---AAA--A-----GT-----TTATAAC--GAC-G-------G--C----G-----AC-----G--AC---------A-A----CAGA
gi|4 : CT---ATATC-----AGGAATCTTTCA--TATAA--A----G-C-----T--TTT----CCT-GCC-----C---AG---TG-----GT--TCT-C----AAGA--A-----C-----------A--------T-TT-TCCC-T----AT-ATATTC--AC-A-T-G-----TAAA---TC---T-TTGATCCC-CTA-TTTTGGCCC-CACCGT--C-T-CCCT-GGGGGT-GATG--ATT--TGAA-CGAAT-TTC-AATC-TCCA-CTATA-TCAGGA-A---GCTTTCATATGA--AT-TTT-G-GCTTTTCTGGCCA---AG---TGG-T-T--------CTT----------GA------------GAAGAAGATATTTAAA------------GA--TTTT---------C-------CC-T--A-----T-AT-AT--TC--ACATGTA-A-AAC-T-TTGATCCCCCTATTGCCCT-ATTG-----TA-GCCC--CACCATATCCCCAGGGAT-CATGATTTAAAC--GAA-TTT----CAATC--TCCAC-TATA-TCA-GGAA---GCTT-TCATATG--AATTTTGGC-TTTTCTGG--CC-AAG---T----G-GT-TCT---T------GAGAAGA--AG---A----TATTT-----AAAGAT--TTT-CCCT---A-T-----ATATT-----CACATGTA-A-A-------A----CT-TTG--A-TCCCCCTATTGCC-CT-ATT-----G---TAGCCCCACCA--TATCCC---C-A-GGGATC-ATGATTTAAG-C-GAA----TTT-CAATCTC-CAC-T--ATATCAGG-AA----GCGTACATTA-----A--A-AAT-T-----T-CAGC-TTT--TCT------GGTC-CA-GT-GGT--TCTTG--------AGAAT-A-TT-TT-T------AAATG------ACAC-C----ACCCAA-TTT------------TT---AC---AT--------------T---TTCGTGATTATATCC-------------C-------------CT--TT-GAAGAA-A---G-CCCAGT-ACT--TCATT-T----T----AAC-AAG--C--T--TGA---AT---------C-CC-C--TG-CACC--GAA-GAATGATTTTT--ACTA--AG------TTTG----G----TTGA---A-TT-TG--------G--T-------C-C------AGT-----GGT-T--CTGGAGAA-GA-A--GTCGAAA-ATG---TG---AAA--T-----GT-----TAACG----GAC-AG------A--C----AGATAGACAGAAAG--ACGGACTGACTG-A----CATACGA-CGG-A-CAGGAG--G-C-GA-TCAG--AAA-----A-GCTCGATTGAG
gi|42 : a-A---ACTTTTGCATAA--GT-TTG-GTGATTTT-TGGCCC---CA---TTG-T-T--------CTG----------GA------------C-------------A-------------GA--TTTT---------G-------CC-T--A-----T-AT-
gi|43 : cctcTAAAA---TGTTGATC---CCTT-----A--TT----------GTGA-CTGCACA-T-TACCCCT---AGGG--G-----T----C-A-----T-GATTTGAT------------CAAA--Cc
gi|46 : TGGCCC-CATATT--G-C-CCCT-GGAGGT-CATA--ATA--TGAA-CACAC-TT
gi|48 : -TTT-AAA-GA--------T-TT-TCAG-T----AT-ATATTT--AC-A-T-G-----TCAA---AT---T-TTGATCCcatctt
gi|49 : C---T-TTGATCCC-CTA-TTGTGGCCC-TATCAT--A-
gi|5 : --TT----------GTGG-CCCCATT-T-TGATCCC---TGGG--A-----C----C-A-----C-TATTTGAA------------CAAA--CTTTAAT-TTACACT---TTGCA-----ATGATGCTTTCA--TATTA--AT-TTGAC-----A--TTT----TTG-AACATT--C---AC---TA------T--TCT-TCA-GATGA--AGATTTTT-TTT-AAA-AA--------G-TTATTTT-TG---AT-AAACTT--A----T-G-----CTAA---AT---T-TTG--CCCATTA-CTGTC-CCC-CACCCTTAA-C-CCT--GGG--T-CACC--ATT--TGAA-CAAAC-TTG-AATT-TACA-CTTCC-TCAAGA-A---GCTTTCACATAA--GT-TTG-G-TAATTTCTGTCCT---AG---TGG-T-T--------CTG----------GA------------G-------------AA------------GA--ATTT---------C-------CC-T--------T-AT-AT--CA--GCATGTA-A-AAC-T-TTG-----------------ATTG-----CG-ATCC--CATCCTACCTCATGGAA--CACAATCTGAACAAAAA-GTT----GAATC--TACTC-CATA-TTA-GGAA---GCTT-TCAGA--------CCA---------GG--TA-CAA---G----G-AG-TCT---T------G---AGA--AGAACA----TTTTG-----AAGAA---TTT-CCCT---A-T-----ATATT-----CGCATGTT-T-A-------A----CT-TTG--A-TC---------CC-CT-ATT-----G---TGGTTCCTACT--TA-TCC---C-G-GGGGTC-AAAATTTCAA-C-ATT----TTT-GAATCTC-CGC-T--ATATCAGG-AA----GCTTTCA-TA-----T--A-AAT-T-----T-CAGT-CTT--TCT------AGAA-AA-GC-GGT--TCTTG--A--A--AAAAT-A-GT-TC-T------AAATG------ACAC-C----ATCCTA-TTT------------CT---GC---AT--------------T---T-------------T-------------C-------------ATGATT------A-T---C-CCTGGT-CCT--T-------------------------------------------------CC-C--TG-CACT--CGA-GGATGATTTGT--ACCA--AG------TTTG----G----TTGA---A-TT-TG--------G--T-------C-CAGCGTGAGC-----GGT-T--CT---GAA-GA-A--GTGGAAA-ATG---TG---AAA--A-----GC-----TAACA----GAC-AG------A--T----AGATGGACA----G--AC---------G-A----CAGACAA-AAG-G-AG--A-----C-CA-TGAG--AAA-----A-ACTCACTTGAATCTTTA---GATCATGTGAAG-TAAA
gi|6 : -GAAGA--AAT---TTGTTT-AAAAGA--------TCTT-TCCC-T----AT-ATAT-C--AA-A-T-G-----CAAA---AC---T-ATAACCCC-CTA-TTGTGGC----ATAGT--A-C-CCCCTGGGGAT-CATG--GTT--TGAA-CAA-C-TTG-AATA-TACA-TTATAATCAGGA-A---GCTTTCAT-TAA--AT-TTGCA-GCTTTTCTG-CCC---AG---TGG-T----------CTT----------GA------------G-------------AAAGAA--------GA--TTTTAAAGATTGTC-------CC-T--A-----T-AT-AT--TC--ACATG-A-A-AAT-T-TTGATC---------TCCT-ACTG-----TA--CCC--CA-AGTACTCC---GGGT-CAT-ATTTGAAA--CAA-CTT----GAATC--TCC---TAT--TCT-GGAA---GCTT-TCATATA--AA-TTCAGC-TTTTTTAG--CCGTAG---T----G-GT-TCT---TCAGAAGA---AGA--AG---A----TTTTT-----AAAGA---TTT-TCCCTTTA-T-----AT--T-----CACATGCA-ACA-------A----CT-TTG--A-TC---------CA-CT-AAT-----GT--TGGCCC--TCG--T--CCC---C---GGAGTC-ATGA-TTGAACC-AAA----CTT-GAATCTC-AAT-T--ATATTAAG-AA-----CTT--A-TA-----T--A-A---T-----T-CAGC-TTT--TCT------GGGC-CA----GGT--TCTTGT-T--G--AGA---A-TG-TTAT------AAATG------GGGCAC----ACCCTA--TT------------TT---GC---AT--------------T---TTTGTGATATCTC-T-------------C-------------CT--TT-GAA-GG-G---G-TCTGAG-TCT--TC-TT-T----G----AGC-AAA--C--C--TAA---AG---------T-CC-C--TT-CACC--C-C-GGATGATTTGT--A--A--AG------TTTG----G----TTGA---A--T-TG--------GCCC-------C-C------AGT-----GGT-T--TTGGAGAA-GA-A---TCG----ATG---TG-----A--A-----GT-----TAA-A----GAC-A-------G-------A-----AC-----G--ACAGTCAGG--G-A----CAGACGA-CGGAG-AA--AG--G-C-AA-TCAG--AAA-----A-GCTCATT---GCC--------CACAAGTGAGC-TA
gi|7 : ttttgctttactgagtttgtttcttcatacgatcat----CTG-GCT-----C---AGCAGTG-----GTGATTT-TGA-AAAGA--A-----TT-TTC-AAG-------------TT-TCCT-T----Atataaa
gi|7 : tgcgtgtaattaaactctgaatttagaatttttagtatttattttaaaagcatgtatagacaacaagaggcccatgggccacatcgctcaccttggccCAAGTTT-CCTTAAAACTGACCCAGT--GGTTC-GGAGAAGAACATTTTATGCAAAA---CTCCGATC---CCTT-----A--TT----------GTGC-CCCCCCC-C-AACTCCG---GGGA--G-----T----T-A-----T-GATCTG-A------------TAAAT-TTTGGAT-CTACCCT---ATCTC-----AGAAAGCTTTCA--GGTAA--ATATTGTT-----T--CTT----TTG-GTC-----C---AA---TG-----GT--TCT-TGA-GAAAATGA-----TT-TTTAAAA-GA--------T-TT-TCCC-T----AT-ATATTT--AC-A-T-G-----TAAG---AC---T-TTGATCCC-CTA-TTGTGGCCC-TATCGT--A-CTCCC--GAGGGT-CAAG--ATT--TGAA-CAGAC-TTG-AATC-TCCA-TTACA-TCAGGA-A---GCTTTCTTATAA--AT-TTC-A-GCTTTTCTGGCCC---AG---TGG-T-T--------CTT----------CA------------GAAAAAGATTTTTAAA------------GA--TTTC---------C-------TC-T--AGCCATT-AT-AT--TC--ACATGTA-C-AACTT-TTGAT----------CCCT-AAGG-----TG-TCCC--CATCGTACCCC--GGGGT-CATGA-TTGAAC--AA---TT----GAATC--TCCAC-aaactgacccagtggttcggagaagaacattttatgcaaaactccgatcccttattgtgcccccccccaactccggggagttatgatctgataaattttggatctaccctatctcagaaagctttcaggtaaatattgtttcttttggtccaatggttcttgagaaaatgatttttaaaagattttccctatatatttacatgtaagactttgatcccctattgtggccctatcgtactcccgagggtcaagatttgaacagacttgaatctccattacatcaggaagctttcttataaatttcagcttttctggcccagtggttcttcagaaaaagatttttaaagatttcctctagccattatattcacatgtacaacttttgatccctaaggtgtccccatcgtaccccggggtcatgattgaacaattgaatctccacccggggacctcttcactat
gi|8 : tgcgtgtaattaaactctgaatttagaatttttagtatttattttaaaagcatgtatagacaacaagaggcccatgggccacatcgctcaccttggccctggctcagcagtggtgattttgaaaagaattttATGTGAAA---TTTTGATC---TCAT-----A--TT----------ATGG-CCCCATC-AATACCCT----GTGG--A-----C----C-G-----T---TTTAAAAAACACACACACCAAAAACTTGAAT-CTGCATC---ATGTC-----AGGAAGTTTTCA-----------A----C-----T--TTT----CTA-GTCAAGACT---AG---TG-----GT--T-T-TGA-GAAGA--A-----TC-TA--AAA-GA--------T-TT-T-----------------------A-T-G-----TATA---ACAGAT-TTGATCAT-CTA-TTGTGGCCC-CA------------C--AGGGGT-CATG--AAT--TGAA-CAAAC-TTG-AATC-TAGT-CCATG-CCAGGA-A---GCTTTAGGGCAA--AT-TTT-A-ATTTTCCTCACAA---AG---TAG-T-T--------CTT---------------------------------------------------------------------T-------CC-T--A-----T-AC-AT--CC--GCATGTACACAAC-T-TTCATC---------CCCT-AATG-----T-------------TGCCCC----AAT-CGTAAT---------------------ATCCATACGC-TGCA-TCA-AGAA---GCTT-TGATGTA--AATTTCAAC-T-----GG--TC-CAG---T----G-GT-TTT---T------G---AGA--AG---A----TTccggggacctcttcactat
gi|9 : cctattctctttagagaagtggacagacatagcctggatgtaggctatgcctgtccacttctctaaagagaatacccctaccccaattctctgcGAAGCTTTCA--TATAATTATATATTCATACAT--TTA----CTG-TCC-----C----G---TG-----GT--TCT--GA-GAAGA--------TT-TTT-AAA-GA--------T-TT-TCCCCT----ATTATATTC--A--A-T-G-----CAAA---AT---T-TTGATTCC-CTAATTGTGGCCC--ATAGT--A-C-CCT--AGGGGT-CATT--ATT--TGAA-CAAAC-TTG-AATC-TCCA-CTATA-TCAGAA-A---GCTTTCATATCA-----TTC-A-GCTTTT-TGA-CC---AG---T-G-T-T--------TAT----------GA------------GAAGATTATTA---AA------------GA--TTTT---------C-------CC-T--A-------AT-GT--TC--ACATGTC-A-AAC-T-TT-AT----------CCCT-ATTG-----TG-GCCC--CATC-TACCCCAGAGGA--CATAATTTGAAT--AAACATT----GAATC--TCCAC-TATA---A-GGAA---GCTT-T-ATATT--TATTTCAGC-TTTTCTGG---------------------------------------GA--AG-------------------AAGA---T----------------------T-----CACAGGTA-A-A-------A----CT-TTG--A-TC---------CC-CT-ATT-----G---TGG-CCCATCG--TA-CCC---C----GGGTCTAT-ATTTGAA-C-AAA----CAT-GAATCTC-CAC-T--ATATCAGG-AA----ACTTTCA-TG-----T--A-AAT-T-----T-CAGC-TTT--TCT------GG-C-CA-GT-GGT--TCTTGA-A--A--AGAAG-A-TT-TT-atgcaaattatttaatttcattttaaggtgattac
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): AAACTCTGATGACATCATAGAGTTTTTAATGATATTTGGAATTTATAAGCTGAACAAAAAAAAAAAAAACCAAAACAAGAGGCCCATGGGCCACATCGTTCACCTGAGTACCAATGGTCCTGGTTTAGCAGTGGTGATTTAAAAAGAAAATTTTCATAATTTTTTT
Unaligned ( gi|30 ): CCTCTTCTTCTTACCATATATAAGAGGACAGAAATAAGCTACATATGTCCGTGGGTGAAGGCTGTACCTGTCCTATTCTCTATCTAAACAGAATACCTCCTACCACTATTCTT
Unaligned ( gi|31 ): GCGTGTAGGCTAATTAATTAAGGATTTCAACACATAGTAGCTAAAATAAAACCTGAACTAGAGGCCCATAGGCCATACTGCTCACCCTGTCCCTTTGCTCA
Unaligned ( gi|33 ): AAAGAAGACGTCCATGATCCACATCACCCACCTGAGTAACATCGACTCTGCTGTCCAAATTCCCACTCCGTATTATGGGGATGCTTCAATATCAATAT
Unaligned ( gi|40 ): AAACAAGACCGGCCCATGGACCACTTTCGCTGCTCACTGCCTATAGTTGACACTTCGGCCCTCGCACTCT
Unaligned ( gi|41 ): AAATTATTCCAATCATATCCTATTCTGAAGTGATAAAATTTATATTCAACTCGCATAATACAATAAT
Unaligned ( gi|44 ): AAAGTGGATTGGCATCAGGGTGTAGACAATGCCTGTCCGCTTCTTTAGAAATAATATCC
Unaligned ( gi|45 ): GAAGATGAAAATGTGAAAAATTTACGACAATAGAAACGGACAGGTGAGCTAAAAAT
Unaligned ( gi|47 ): TTGAAAACAAGAGGCCCATGGACCACAATACTTACCCGAGTCATATT
Alignments
lowQualScore : 2 2222 1 1 11 111 11111111111111111111 1111 111111111111111111111 111111111111 11111 3333333333333333333333333333 11111 22222222222 1111111111 11111 11 11111111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777 11111111111111111 2222222222 11 1111111111 11111111 11111 111 5555555555555555555555 111111111 111111111 1111111 11111 111111 22222222 111111 111111 111111111111 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666
lowQualScore : 0 1 1 3333 1 5 1 3 1 88 7 7 777 0 2 777 5 88888888888888888888 3 666 2222 444444444444444444444 3 777777777777 444 44 9999 22 666 4 22222 6666666666666666666666666666 6666 2 22222 555 444 77777 66 2 2 55555555555 5 2222222222 2 999999 5 33333 2 2 66666 444 444 2 2 5 44 33 33 2 2 44 2 33 33 2 2 2 2 1 2 2 2 444 1 33 2 77777 0 1 555 555 2 2 00000000 3333333333333333333333333333333333333333333333333333 33 55555555555555555 2 33 77777 2 2 44 44 3 6 3 6 3 1111111111 3 999999999 44 0 11 333 66 55 6666 77 2 2 3 3 888 3 6666 3 44 3 99999999 3 3 555 3333333333 44 22222222 11111 555 66 2222222222222222222222 3 111111111 6666 6 44 3 222222222 3 3 99999 666 3 2 555 3 2222222 3 22 3 6 7777 3 3 6 44 3 6666 3 77777 33 2 2 11111 2 2 33 111111 4 5 2 2 66 55555555 33 2 2 3 777777 111111 3 7777 3 555555555555 555 555 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 33 55 2 55555 2 2 33 5 999999999 2 88888888 777 999999999 2 2 33 2 6666666 3 33 33 111111 555555555 333 55 2 88888888 33 7777777 2 666666 555555 2 22 0 2 4 22 4 6 777 333 55555 99999 22 66666 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 2 33 66666 2 2 0 88888 3
lowQualScore : . . . .... . . . . . .. . . ... . . ... . .................... . ... .... ..................... . ............ ... .. .... .. ... . ..... ............................ .... . ..... ... ... ..... .. . . ........... . .......... . ...... . ..... . . ..... ... ... . . . .. .. .. . . .. . .. .. . . . . . . . . ... . .. . ..... . . ... ... . . ........ .................................................... .. ................. . .. ..... . . .. .. . . . . . .......... . ......... .. . .. ... .. .. .... .. . . . . ... . .... . .. . ........ . . ... .......... .. ........ ..... ... .. ...................... . ......... .... . .. . ......... . . ..... ... . . ... . ....... . .. . . .... . . . .. . .... . ..... .. . . ..... . . .. ...... . . . . .. ........ .. . . . ...... ...... . .... . ............ ... ... ............................................................ .. .. . ..... . . .. . ......... . ........ ... ......... . . .. . ....... . .. .. ...... ......... ... .. . ........ .. ....... . ...... ...... . .. . . . .. . . ... ... ..... ..... .. ..... .......................................................................... . .. ..... . . . ..... .
lowQualScore : 0 0 0 0000 0 5 0 3 0 33 3 3 555 8 5 888 4 55555555555555555555 6 888 1111 555555555555555555555 3 111111111111 888 22 7777 88 444 9 77777 4444444444444444444444444444 1111 9 11111 000 777 11111 88 9 7 99999999999 3 5555555555 7 444444 3 33333 7 7 77777 777 444 5 7 3 99 11 44 5 7 33 7 44 44 5 7 9 9 0 7 7 4 111 2 44 5 33333 1 2 000 000 9 9 44444444 2222222222222222222222222222222222222222222222222222 99 99999999999999999 9 99 11111 9 9 22 22 1 2 1 2 5 4444444444 1 555555555 22 8 88 777 88 99 1111 99 6 9 1 1 555 1 8888 1 22 1 77777777 1 1 444 5555555555 22 11111111 77777 000 22 1111111111111111111111 3 000000000 5555 2 22 1 333333333 1 3 11111 444 6 8 444 6 9999999 6 88 3 7 1111 3 3 7 66 1 5555 3 11111 99 9 9 11111 9 9 99 111111 1 7 9 7 33 77777777 66 9 9 1 999999 555555 6 7777 1 888888888888 444 000 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 99 88 4 44444 9 7 77 3 777777777 5 22222222 888 444444444 5 5 44 5 2222222 1 44 44 888888 222222222 999 44 2 11111111 11 2222222 2 111111 888888 0 88 8 0 0 88 8 0 888 999 66666 44444 99 99999 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 77 77777 9 4 8 22222 6
consensus : AGCTGTATCTT-ANCCCNGGGGGTCACGATTNGTANCAAGTTT-CCTTNAAACTGACCCAGT--GGTTCTGGAGAAGAACATTTTATGTAAAA---CTTTGATC---CCCT-----A--TT----------GTGG-CCCCACC-C-TACCCCC---GGGG--G-----C----C-A-----T-GATTTGAA------------CAAA--CTT-GAAT-CTACNCT---ATGTC-----AGGAAGCTTTCA--TGTAA--ATAT--GT-C------T--TTT----CTG-GCC-----C---AG---TG-----GT--TCT-TGA-GAAGA--A-----TT-TTTAAA-GA--------T-TT-TCCC-T----AT-ATATTC--AC-A-T-G-----TAAA---AC---T-TTGATCCC-CTA-TTGTGGCCC-CATCNT--A-C-CCC--GGGGGT-CATG--ATT--TGAA-CAAAC-TTG-AATC-TNCA-CTATA-TCAGGA-A---GCTTTCATATAA--AT-TT-N-A-GCTTTTCTGGCCC---AG---TGG-T-T--------CTT----------GA------------G-------------AA------------GA--TTTT---------C-------CC-T--A-----T-AT-AT--TC--ACATGTA-A-AAC-T-TTGATC---------CCCT-ATTG-----TG-GCC--CCATCGTACCCCCGGGGGT-CATGATTTGAAC--AAA-NTT----GAATC--TCCAC-TATA-TCA-GGAA---GCTT-TCATATA--AATTTCAGC-TTTTCTGG--CC-CAG---T----G-GT-TCT---T------G---AGA--AG---A----TTTTT-----AAAGA---TTT-CCCC---A-T-----A---T-----CACATGTA-A-A-------A----CT-TTG--A-TC---------CC-CT-ATT-----G---T-GGCCCCATCG--TA-CCC---C-G-GGGGTC-ATGATTTGAA-C-AAA----CTT-GAATCTC-CAC-T--ATATCAGG-AA----GCTTTCA-TA-----T--A-AAT-T-----T-CAGC-TTT--TCT------GGCC-CA-GT-GGT--TCTTG--A--A--AGAAG-A-TT-TT-T------AAATG------ACAC-C----ACCCTA-TTT------------TT---GC---AT--------------T---T-------------C-------------C-------------CT--TT-GAAGGG-G---G-CCTGGT-CCT--TCATT-T----G----AAC-AAA--C--T--TGA---AT---------C-CC-C--TT-CACC--CAA-GGATGATTTGT--ACCA--AG------TTTG----G----TTGA---A-NT-TG--------G--C-------C-C------AGC-----GGT-T--CTGGAGAA-GA-A--GTCGAAA-ATG---TG---AAAA-----GT-----TA-ACA----GAC-A-------A--C----A-----AC-----G--AC---------G-ACAGACAA-CGG-G-AA--AA--T--C-GA-TCAG--AAA-----A-GCTCACTTGAGCCTTCG---GCTCAGGTGAGC-TAAAAA
Reference ( family-218 ) : AGCTGTATCTT-ANCCCNGGGGGTCACGATTNGTANCAAGTTT-CCTTNAAACTGACCCAGT--GGTTCTGGAGAAGAACATTTTATGTAAAA---CTTTGATC---CCCT-----A--TT----------GTGG-CCCCACC-C-TACCCCC---GGGG--G-----C----C-A-----T-GATTTGAA------------CAAA--CTT-GAAT-CTACNCT---ATGTC-----AGGAAGCTTTCA--TGTAA--ATAT--GT-C------T--TTT----CTG-GCC-----C---AG---TG-----GT--TCT-TGA-GAAGA--A-----TT-TTTAAA-GA--------T-TT-TCCC-T----AT-ATATTC--AC-A-T-G-----TAAA---AC---T-TTGATCCC-CTA-TTGTGGCCC-CATCNT--A-C-CCC--GGGGGT-CATG--ATT--TGAA-CAAAC-TTG-AATC-TNCA-CTATA-TCAGGA-A---GCTTTCATATAA--AT-TT-N-A-GCTTTTCTGGCCC---AG---TGG-T-T--------CTT----------GA------------G-------------AA------------GA--TTTT---------C-------CC-T--A-----T-AT-AT--TC--ACATGTA-A-AAC-T-TTGATC---------CCCT-ATTG-----TG-GCC--CCATCGTACCCCCGGGGGT-CATGATTTGAAC--AAA-NTT----GAATC--TCCAC-TATA-TCA-GGAA---GCTT-TCATATA--AATTTCAGC-TTTTCTGG--CC-CAG---T----G-GT-TCT---T------G---AGA--AG---A----TTTTT-----AAAGA---TTT-CCCC---A-T-----A---T-----CACATGTA-A-A-------A----CT-TTG--A-TC---------CC-CT-ATT-----G---T-GGCCCCATCG--TA-CCC---C-G-GGGGTC-ATGATTTGAA-C-AAA----CTT-GAATCTC-CAC-T--ATATCAGG-AA----GCTTTCA-TA-----T--A-AAT-T-----T-CAGC-TTT--TCT------GGCC-CA-GT-GGT--TCTTG--A--A--AGAAG-A-TT-TT-T------AAATG------ACAC-C----ACCCTA-TTT------------TT---GC---AT--------------T---T-------------C-------------C-------------CT--TT-GAAGGG-G---G-CCTGGT-CCT--TCATT-T----G----AAC-AAA--C--T--TGA---AT---------C-CC-C--TT-CACC--CAA-GGATGATTTGT--ACCA--AG------TTTG----G----TTGA---A-NT-TG--------G--C-------C-C------AGC-----GGT-T--CTGGAGAA-GA-A--GTCGAAA-ATG---TG---AAAA-----GT-----TA-ACA----GAC-A-------A--C----A-----AC-----G--AC---------G-ACAGACAA-CGG-G-AA--AA--T--C-GA-TCAG--AAA-----A-GCTCACTTGAGCCTTCG---GCTCAGGTGAGC-TAAAAA
gi|1 : TGAG-T-GAC----CTT-GGCCCTCGCAC-TCTATATCAGG-AA----GCTTTAA-GG-----T--A-AATGT-----TGTAAC-TT-----T------GG--------------TCTTG--------AGAAG-A-TT-
gi|1 : acaagaggcccatgggccacatcgctcacc-CTATA-TCAGGA-A---GCTTTAAGGTAA--ATGTTGT-A-ACTT---TGG-----------------T--------CTT----------GA------------G-------------AA------------GA--TTAC---------C-------CC-T--A-----T-AT-ATAATC--ATGTGTA-A-AAC-T-TTGAT----------CCCT-ATTG-----GGCGCCCACCATCGTACCTCCGGGGGT-CATGATTTGAAC--AAA-CTT----GAATC--TCC-T-TATA-TCACGGAA---GC-G-TCATA-A--AATATCAGC-TTTCCTGGTCCC-CAG---T----G-GG-TTT---T------G---AGA--AG---AAAACTTTTTA----AAAAA---TTT-TCCC---T-G-----A---T-----T-CTTGAA-ACA-------A----AT-TTGCAA-TC---------CCACT-ATacccctatatataatcatgtgtaaaactttgatccctattgggcgcccaccatcgtacctccgggggtcatgatttgaacaaacttgaatctccttatatcacggaagcgtcataaaatatcagctttcctggtccccagtgggttttgagaagaaaactttttaaaaaattttccctgattcttgaaacaaatttgcaatcccactatatcagtagagctttccaatgaatctcagctttcctggcccaaggttggttttcttttcctttttcgaacagaagaagatttttaagacttcctcaatatcaatcacatgctaaaccttgatccctattgtggcccctcgtaccccgggggtcatgatttgaaccaaactttaatctccactatattcaggacttcccatattaatctcagcttcctggtccagacatgtgttcttcgaaagaatttttaaaggatttttccctatataatcatatgtagaaactcttgatcccataattgtggcccatcataccccaggggtcaatttgaacaaaacttgaatctcctctatattaggagcttccatatacaatttcagctttcgtctggcccagtggttcttgaagaagaagaattgttttgttaaaatcacaccacctattttttgcgcattgtttgtgattatctcccctttgaaggggctcggtccttcattgaacaaactgaatctccttcacccaagggatgattggtatcaagtttggttgaatattggcccagtggtctcttgagaaaaagtcgaaaatgtgaaaagttagacgacagacagaagg
gi|1 : acaagaggcccatgggccacatcgctcacctgagtgaccttggccctcgcactTG--ATTCTTGAAACAAAT-TTGCAATC--CCA-CTATA-TCAGTAGA---GCTTTCCAATGA--AT-CT-C-A-GCTTTCCTGGCCC---AAGGTTGG-T-TTTCTTTTCCTTTTTCGAACAGAA------------G-------------AA------------GA--TTTT---------TAAGACTTCC-TCAA-----T-ATCAA--TC--ACATGCT-A-AAC-C-TTGATC---------CC-T-ATTG-----TG-GCC--CC-TCGTACCCC-GGGGGT-CATGATTTGAACC-AAA-CTT----TAATC--TCCAC-TATATTCA-GGA-----CTTCCCATATT--AATCTCAGC--TTCCTGG--TC-CAGACAT----GTGT-TCT---TC-----G---AAA--GA---A----TTTTT-----AAAGGATTTTT-CCCT---A-TATA--A---T-----CATATGTAGA-A-------A----CTCTTG--A-TC---------CC-ATAATT-----G---T-GG-CCCATCA--TA-CCC---C-A-GGGGTC-A--ATTTGAA-CAAAA----CTT-GAATCTC-CTC-T--ATATTAGG--A----GCTTCCA-TA-----T--ACAAT-T-----T-CAGC-TTTCGTCT------GGCC-CA-GT-GGT--TCTTG--AAGA--AGAAGAA-TTGTT-TTGTTA-AAATC------ACAC-C----A-CCTA-TTT------------TTTGCGC---ATTGTTTGTGATTATCT---C-------------C-------------C-------------CT--TT-GAA-GG-G---G-CTCGGT-CCT--TCA-T-T----G----AAC-AAA--C-----TGA---AT---------C-TC-C--TT-CACC--CAAGGGATGATTGGT--ATCA--AG------TTTG----G----TTGA---ATAT-TG--------G--C-------C-C------AGT-----GGTCT--CTTGAGAA-AA-A--GTCGAAA-ATG---TG---AAAA-----GT-----T----A----GAC-G-------A--C----A--------------------------G-ACAGAatcagtagagctttccaatgaatctcagctttcctggcccaaggttggttttcttttcctttttcgaacagaagaagatttttaagacttcctcaatatcaatcacatgctaaaccttgatccctattgtggcccctcgtaccccgggggtcatgatttgaaccaaactttaatctccactatattcaggacttcccatattaatctcagcttcctggtccagacatgtgttcttcgaaagaatttttaaaggatttttccctatataatcatatgtagaaactcttgatcccataattgtggcccatcataccccaggggtcaatttgaacaaaacttgaatctcctctatattaggagcttccatatacaatttcagctttcgtctggcccagtggttcttgaagaagaagaattgttttgttaaaatcacaccacctattttttgcgcattgtttgtgattatctcccctttgaaggggctcggtccttcattgaacaaactgaatctccttcacccaagggatgattggtatcaagtttggttgaatattggcccagtggtctcttgagaaaaagtcgaaaatgtgaaaagttagacgacagacagaagg
gi|10 : acaagaggcccatgggccacatcgctcacctgagtgaccttggccctcgcactctatatcaggaagctttaaggtaaatgttgtaactttggtcttgagaagattacccctatatataatcatgtgtaaaactttgatccctattgggcgcccaccatcgtacctccgggggtcatgatttgaacaaacttgaatctccttatatcacggaagcgtcataaaatatcagctttcctggtccccagtgggttttgagaagaaaactttttaaaaaattttcccGGGGAT-CATGAATTGAAC--AAA-CTT----AAATA--TCTCC-TACA-TCA-GGTA---GCTT-TAATGCC--AATCTCAGC-TTTTCCGG--CC-CAA---T----G-AT-TCT---C------G---AGA--AG---A----TTTTT-----AAAGA---TTT-TCCCTTTA-T-----A---TC----CACATGTA-A-A-------A----CT-TTG--A-TC---------CC-CT-ATT-----G---T-GTCCCCATCT--TA-CCC---CTG-GGGGTC-ATGATTTGAA-C-AAA----CTT-GATTTTC-CAC-T--ATACCAGG-AA----GGTTagg
gi|10 : ATCTT-ACCCCTGGGGGTCATGATTTG-AACAAACTTGATTTTCCACTATACCAGGAAGGTTCTGGAGAAGATGATT---TGTAAA-------TGACCACACCTT-----A--TTTTGCATTTTGGTGA---TTATC-T-TGCCTTTGAAGGGG--G-----C----CTAGTCCTT-CATTCGAA------------CAAA--CTT-GAAT-T--CTCT------TCAACCAAGGATAATTT-G--TGCA-----AC--GT-T------TG-GTTGAAATTG-GCC-----T---AG---TG-----GT--TCT-GGA-GAAGctggagaagatgatttgtaaatgaccacaccttattttgcattttggtgattatcttgcctttgaagggggcctagtccttcattcgaacaaacttgaattctcttcaaccaaggataatttgtgcaacgtttggttgaaattggcctagtggttctggagaagttgaaaatgtgaaaagttaacagacagacaaaagacagacaaagggcaatcagaaaaaaactcacttgagtcttcggctcaggcgagctaaaa
gi|10 : ggggatcatgaattgaacaaacttaaatatctcctacatcaggtagctttaatgccaatctcagcttttccggcccaatgattctcgagaagatttttaaagattttccctttatatccacatgtaaaactttgatcccctattgtgtcccc-GGT--TCTGG--AG-A--AGATG-A-TT-TG-T------AAATG------ACCA-C----ACCTTA-TTT------------T----GC---AT--------------T---T-------------TGGTGATTATCTTGC-------------CT--TT-GAAGGG-G---G-CCTAGT-CCT--TCATT-C----G----AAC-AAA--C--T--TGA---AT---------T-CT-C--TT-CAAC--CAA-GGATAATTTGT--GCAA--CG------TTTG----G----TTGA---A-AT-TG--------G--C-------C-T------AGT-----GGT-T--CTGG---A-GA-A--GTTGAAA-ATG---TG---AAAA-----GT-----TA-ACA----GAC-AG------A--C----A-----A---------AA---------G-ACAGACAA-AGG-G------------C-AA-TCAGAAAAA-----A-ACTCACTTGAGTCTTCG---GCTCAGGCGAGC-TAAAAttgaaaatgtgaaaagttaacagacagacaaaagacagacaaagggcaatcagaaaaaaactcacttgagtcttcggctcaggcgagctaaaa
gi|11 : ggggatcatgaattgaacaaacttaaatatctcctacatcaggtagctttaatgccaatctcagcttttccggcccaatgattctcgagaagatttttaaagattttccctttatatccacatgtaaaactttgatcccctattgtgtccccatcttacccctgggggtcatgatttgaacaaacttgattttccactataccaggaaAGC-TTTTCTGG--CC-CAG---TTCCAG-GT-TCT---T------G---AGA--AG---AAGA-TTTTT-----AAATA---TTT-TCCC-----T-----A---TTTAAACACATGTA-A-ATAATTAAA----TT-ATG--A-TA---------CC-CT-AAT-----G---T-GGCCCCATCA--TA-CCC---C-CCGGGGTC-ATGATTTGAA-C-AAA----CTC-AAATCTC-TAC-T--ATATCAAG-AA----GCTTTGA-TA-----T--A-AAT-T-----T-AAGC-TTT--TTTT-----GGCC-CA-GT-GGT--TCTTG--AG-A--AGAAG-A-TT-TT-T------AAATG------ACAC-C----ACCCTA-GTT------------TT---GC---AT--------------T---T-------------T-------------CGTGATTATCTCCTCT--TT-CATGAG-G---G-CCTAGT-CCT--TCATT-T----G----AAC-AAA--C--T--TGG---AT---------C-CC-C--TT-CAC--------------------ACCA--AA------TTTG----G----TTGA---A-TTATG--------G--C-------C-C------AGC-----GGT-T--CTGGAGAAGGA-A--GTCGAAA-ATG---TG---AAAA-----GT-----TA-ACA----GAC-A----------------------------G--AC---------A-ACATACAA-AAG-G------------C-GA-TCAG--AAA-----A-GCTCACTTGAGCCTTTG---GCTCAGGTGAGC-TAA
gi|12 : a-------A----CT-TTG--ACTC---------CG-CC-ATT-----GCAAT-GGACTCAACAATTA-CCTACAC-G-ACGATC-A-GACTTGAAAC-AAA----TTTCGAGATGC-CACAT--ATATTGAG-AAATGTGCTTTTA-CAATAAAT--A-AAT-TGTGTTT-CAGT-CTT--TCTCTGCGGGACCGCA-GTCGGTGATCTTG--A--AGGAGAAG-AGTC-TT-TGTTTGAAAATGTATCGCACAC-CCATAACC--A-TTTGAATATGCTAATCT---GCGATAT--------------TAC-T-------------C-------------C-------------CT--TTAGCAGAG-G---GACCTCACGCCT--CCATGAT----GTAGTAAC-AAAAACAATGATGAGA-ATGCCCCACGGC-CT-C--TTACACGAACAC-GGATGATTTGC--ACTA--GGAGAAGGTTTG----AGATATCGACACG-GT-TG--------G--C-------TAC------A-C-----ATT-TTTCTGGAGAA-GAGA--GTCGAAATATGGTATA---AAAAATGATAT-----TA-ACA----GAta
gi|13 : CAGG------GCTTCCGTA-----GT-TT-C-A-GCTTTTTTAGCCT---AG---TGG-T-T--------CTT----------GA------------G-------------AA------------GA--TTTT---------T-------TC-T--A-----C-CT-AT--TC--ACATGTA-C-AAC-T-TTGATT---------CCCT-ATTG-----TG-GCC--CCATCGTATCTCCTGGGGT-CATGATTTTAAT--AAA-GTT----GAATA--TCCAC-TATA-TGA-GGAA---GCTT-TCATATA--AATTTCATC-TTCTCTGG--CC-CAA---T----G-AT-TCTTGAT------G---AGA--AG---A----ATTTT-----GAAGA---TTTGCCCT---ATT-----AT--T-----CACATGTA-A-A-------A----CT-TTG--A-TC---------CC-Cgaggaga
gi|14 : TA-TTT------------TC------------------------T---C-------------C-------------C-------------CT--TTCGATGGG-AAATG-CATGCA-CCT--TCATT-T----G----AAC-AGA--T--T--TGA---AT---------T-CC-C--TT-CATC--AAA-ATATGCTTTAT--GGCAACAGTTAC--TTTG----A----TTGA---A-A--TG--------G--C-------C-C------AGCTTTTTTTT-T--TTTAAG------A--TTTAAAA-ATA---TATTCAAAG-----TT-----TT-ACATATGGATGA-------A--C----AG----ACT----G--AC---------A-ATTAACAATTAG-C-AA--AA--TG-T-GA-TCAG--AAA-----A-GCTCACTTCAG
gi|15 : cacccattttttcatttgctgatca-----T--A-ATT-T-----T-CAGC-TTT--TCT------TGCC-CA-GT-GAT--TCTTA--T--A--AGAA---------------------------------------TCCTA-CTT------------TT---GC---AT--------------T---TTCTTGATTTTCTCC-------------C-------------CT--TT-CAAAGG-A---G-CATGTT-TTT--T--TT-T---------AAC-A----------TGATCAAT---------C-CCGC--TT-TAT-------GGG-------------A--AA------TTTG----A----TTGA---A-AT-TA--------G--C-------C-C------TGC-----AGT-T--ATGGAGAA-GA-G--ATCGAAA---G---AA---AAAA-----AG-----TATACA----GAT-G----------------------------G--ACA--------G-ACAGACAA-CGG-ACAA--AA--T-----A-T-------A-----A-GCT----------TTTG---GCTCAGGTGAGCTTAAAAA
gi|16 : TA-TTT------------CT---GT---AT--------------TATCT-------------C-------------C-------------CC--TT-TAAGGG-A-----CCCGGT-CCT--TCCTT-TAATTG----AAC-AAA--C--A--TGA---AT---------C-CC-T--TT--ATC--CAA-GGATGATTTGC--ACCA--AG------TTTG----G----TTGA---A-AT-GT--------G--C-------C-C------AGT-----TG--T--CT------------------AA-ATG---TG---AAAA-----GT-----TA-ACG----GAC-A-------A--C----GT----GCA----G--AT---------G-ACGGACAA-CAG-G------------C-GA-TCAG--AAA-----A-GCT-ACTTG---CCTCG---GCTCAGGTGA-C-TAa
gi|17 : accacaccatttatttAC-C----ACCCTA-TTT------------TT---GC---AT--------------T---TTCGTGATTATCTCC-------------C-------------CT--TT-GATGAG-G---G-CCTGGT-CCT--TCATT-T----G----AAC-AAA--A--T--TGA---AG---------C-CC-C--TT-CACC--CAA-GGATGATGTGT--ACCA--AG------TTTG----G----TTGA---A-TT-T---------G--C-------C-C------AGC-----GGT-T--TT-GAGAA-GA-A--GTTGAAA-ATT---TG---GAAA-----GT-----TT-AC-----GAC-G-------ACCC----A-----AC-----G--GC---------T--CAGGTGA-GCT-A-AA--AA--T--A-GG-TCAG--AGA-----
gi|18 : ---TG-----GT--ACT-TTG-GAGG------------TTTAAA-GAGAAATTTGT-TT-TCCA-T----ATCATATTC--CA-A-T-A-----TATA---AT---T-T--------CTG-TTGT---CC-CATCCT--GGT-CCT--GGAATT-CATG--GTT--TAAA-CAGAG-ATG-GATCCTTCAACT-CA-T-AAGA-A---GCTTTCATGCAAGGAT-TG-A-A---TTTACTA--CT---AG---TAA-T-T--------Cttaaatactcg
gi|18 : tggttcaacagtttcagagaagaaaattaata--TTTT---------C-------CA-T--A-----TCAT-AT--TC--CAATATA-T-AAT-T-T----------------CT-GTTG-----T----C--CCATCCTGGTCCTGGAATT-CATGGTTTAAAC--AGA-GAT----GGATCCTTCAAC-T-CA-T-A-AGAA---GCTT-TCATGCA--A
gi|19 : tggttcaacagtttcagagaagaaaattaatatggtactttggaggtttaaagagaaatttgTTAGG-AA----GTTTTCA-TG-----T--A-AAA-TAG---T-CA---CAT--TCT------GGTCGCATGT-GGT--CCTT------A--AGAAG-A-CA-TT-C------AAATG------CCCA-C----AACCTAGTTT------------GG---GC---AT--------------T---T-------------ggattgaatttactactagtaattc
gi|19 : ---AT--------------C---T-------------CT------------C-------------CT--TT-AAAAGG-G---G-AATAGT-CCT--GCATT-T----G----AACAAAA--C--A--TGA---AT---------tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattatctctcctttaaaaggggaatagtcctgcatttgaacaaaacatgaatat
gi|2 : ttaggaagttttcatgtaaaatagtcacattctggtcgcatgtggtccttaagaagacattcaaatgcccacaacctagtttgggcattttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattAGCTGTATCTTNAACCCAAGG----ACGATTAGTACCAAGTTT-CCTTGAAATTGACCCAAT--GGTTCTGGAGAAGAACATTTTATGCAAAA---CTGAGATC---CCCT-----A--TT----------GTGG-CCCCTCC-C-TACCCCC---GGGG--G-----T------A-----T-GATCTGCT------------CAAA--TTT-GGAT-CTACTAT---ATGTC-----AGGAACCTTTAA--GGTAA--ATATT-GT-T------T--CTT----CTG-GTC-----C---AA---TG-----GT--TCT-TGA-GAAGACGA-----TT-TTTAAA-GA--------T-TT-TCCC-T----AT-ATATTC--TT-A-T-G-----TAAA---AC---T-TTGATCCC-CTA-TTGTGGCCC-CATCGT--A-C-CCC--GGGGGT-CATG--ATT--TGAA-CAAAC-TTG-AATC-TTCA-CTATA-TCAGGA-A---GCTTTCATATAA--AT-TT-A-A-GTTTTTCTGGCCC---AG---TGG-T-T--------CTT----------GA------------G-------------AA------------GA--TTTC---------C-------CC-T--A-----T-AC-AT--TC--ACATGTA-A-AAA-T-CTTATC---------CCCT-A--A-----TG-GCC--CCATGGTACCCCCGGGGTT-TATGATTTGAAC--AAA-ATG----GAATC--TTCAC-TATT-TCA-GGAA---GCTT-TCATATC--AATTTCAGC-TTTTCTGT--CC-CAG---T----G-GT-TCT---T------G---AGA--AG---A----TTTTT-----AAAGA---TTT---------------------------ATATATA-A-A-------A----CT-TTG--A-TT---------CC-CT-AAT-----A---T-GGCCCCACCG--TA-CCCAA-G-G-AGGGTC-GTGGTTTGAA-C-AAA----CTT-GAATCTC-CAT-T--ATATCAGG-AA----GCTTTTA-TA-----T--C-AAT-T-----T-CAGC-TTC--TCT------GACC-AA-AT-GGT--TCTTGTCA--A--AGAAG-A-TT-TT-T------AAATG------ATAC-C----ACCCTA-TTT------------TT---GC---A---------------------------------C-------------C-------------AT--TT-GAAAGG-G---G-TCAGGT-CCT--TCATT-T----G----AAC-AAA--C--T--TGA---AT---------C-CC-C--TT-TACC--CAA-GGATGATTTGC--ACCA--AG------TTTG----G----TTGA---A-TT-TG--------G--C-------C-C------AGT-----AGT-T--CTGGAGAA-GA-A--GATGAAA-ATG---TG---AAAA-----GT-----TT-ACA-----AC-A-------A--C----A-----AC-----G--AT---------T-ACTGACAA-CGG-G-AA--AATTT--T-GA-TCAG--AAT-----A-GCTCACTTAAGCATTCG---GGTCAGGTGAGC-TAAAAAat
gi|20 : -----T--A-ATT-T-----T-CCAC-TTT--TCT------GGCC-CA-GT-TGT--TCGTG--A--G--AG------TT-TT-T------AAA
gi|20 : atgttagaaag-C------T--TTT----CTG-GCC-----C---AG---TT-----GT--TCG-TGA-GAG----------TT-TTTAAA-AA--------T-T---CCCAT----AA-ATATTC--GC-A-T-G-----TAAA---AC---T-TTGATTCC-CTA-TTGTAGAAC-CACCCT--A-C-CCA--AAAGGC-AATAGTATT--TG---CAAAT-TTG-AATC-TGCA-CAATG-CCAGAA-A---GCTTTTATGTAaattcccataaatattcgcatgtaaaactttgattccctattgtagaaccaccctacccaaaaggcaatagtatttgcaaatttgaatctgcacaatgccagaaagcttttatgta
gi|21 : atgttagaaagtaattttccaAAGCTTTCAACTGTA------T---T-C------TACTTT----CTG-GCC-----C---AG---TT-----GT--TCGATGG-GAAGA---------T-TTTAAA-GA--------TGCT-TCCC-T----A--ATATGCT-GC-A-TTG-----TACA---AC---T-TTGATCCC-TTT-TTGTGGCCT-T-TCCT--A-C-CC----------AAAG--ATT--TGAA-CAAAT-TGA-AATC-TATC-CTG-A-TCA-GA-G---GCGTTCATG-AA--AT-
gi|23 : --TT-GAAGAGCA---G-CC-----CCTCATCATCAT----G----AAC------T--T--TGA---AT---------CTCC-C--TT-CATG--TAA-T-ATG--TTAT--GCCA--CA------TTTG----T----TTGA---A-AT-TT--------A--C-------C-A------AAT-----GGT-C--GTGCAGAA-AA-A--GT-GAAA-Acc
gi|24 : ------AGT-----GCC-T--CTGGAGAA-GA-A--GT------------TG---AAAA-----GT-----TA-ATT----TAT------------C-----------C-----A--AG---------G-ACAAATCC-TAG-T-TA--AA--TGTT-GA-TCAG--AAC-----ACACTCACTTGAGCCTTTATTAGCTCAGGTGAGC-TACAAcagttgattatgaggaaagagctttgcattagaaaactcagtaacttttttcagctc
gi|25 : ggacgttttgggtcaatttaaaggaatttaaagctcagtttt-AAA--C--T--TGA---AT---------A-TC-AAATT-TACC--AAA-GAAAAACTTA-----CA--AT------TTTG----A----TTGA---C-AC-TA--------G--C-------T-G------AAA-----AGT-T--CAGGAGAA-GA-A------AAC-ATG----------AA-----G----------------GAA-A-------A--C----------AC-----A--A------------ACAGA-AA--GG-C-GG--CA--T--CTGA-TCAG--A------------CATTTAAATAAGTG---ACTCAGGTGAGC-TAAAAA
gi|26 : T---------C-TT-C--TT-CATC--CAA-AG-TG-TTTGT--ACAA--AA------TGTGTAATG----ATGG---A-TT-TGATGATGAGG--CAAACTGGC-C------AGT-----GAT-T--CTGGAGAT-AA-A--GAAAAAATATT---TG---CAAA-----GT-----TA-ACA----GAC-A-------A-------A-----TG-----G--ATG--------G-ACAGAC
gi|27 : gaactaattaggaaatgCCC-T----AT-ACATGT--AC-A-T-AGGCATCAAA---A--------GCTCCC-CTA-TTGTGGCTC-AAACCT--A-C-CCCT-GGGGGC-AATG--ATT--TGAA-TAGAT-TGG-AATC-TACT-TTATA-TAAGAA-A---AC-TTCAT-TAA--AT-
gi|27 : TC---CCCT-----A--TT----------GTGG-CTCAAAC-C-TACCCCT---GGGG--G-----C----A-A-----T-GATTTGAA------------TAGA--TTG-GAAT-CTACTTT---ATATA-----AGAAAAC-TTCA--T-TAA--ATAaactgcatactattggtgtgcatt
gi|28 : ccctatacatgtacataggcatcaaaagcT-T--CTGGAGAA-GAGA--GTCGAAATATGGTATA---AAAA-----ATGATATTA-ACA----GAG-AGGAGAAGA--CTCAGA-----AC-----GTGAC---------GCACGGACA--CAA-A-AA--GA--G--C-AACTCAG--AAA-----A-GATCACCTCAGCCTC-----GCGCAGGTGAGC-actgcatactattggtgtgcatt
gi|29 : -CCT--TCATT-T----C----TAC-AAA--C--T--TGA---AT---------T-------TT-----------GAAT--TTCCTTAACTA--AA------GTTG----G----TTGA---A-AT-AA--------G--T-------C-T------AAT-----TGT-T--CTGGAGAA-GC-ATCGTCGGAA-ctcaa
gi|3 : actctatgtttgacttttcttgattatctcTGTAAGATTGCTTT-ATC---CC-T-----AATTT----------GTG----CCACC-C-AACCCCC---GGGG--GGTTTACGAGGC-A-----TTAATCTGAA-------------AAA--CTC--AAT-CTACGTCCAAATATCG----ATGAAG--TTCA--GGATA--ATAT--CCAC------T--TTC----TTGTGTT-----C---AA---TGTATGTAT--TTT-TTA-AAAGA--A---------------------------TT-TCCC-TACTAAT-ATAATT--GC-ACT-G-----TAAAAATAT---T-CTGATCCT-TTG---GTGGCCCACAT--T--A-C-CCT--GGGGTT-CATG--AAT--TGGA-C-AGC-TTT-TATG-CTCG-CTATA-TCAGG--A---GCTT--ATACAA--AT-CT-A-A-GCTTTCCTGGCCCTTTAT---TGG-TCT--------CTT----------GACGAAGATTTTTTA-------------AA------------GA--TTTT---------C-------CCAT--A-----T-AT-AA--TCTGATATATA-A-ATC-TATTGATT---------CCCTAATTG-----GG-GCC--CCATTGTACCCCTGGGGGTGCATGAATTAGAA--AAC-GTT----GAATC--T-AAC-TATA-TCA-GGAAAATG-TT-TCATATA--AATTCC-GA-TTTTC-GG--CC-TAG---TG---G-GT-TCT---T------G---AGAATAG---A----AGATT-----AAAGAATTTTT-CCCT---A-TATA--A---T-----CATACGTA-ACA-------A----CTGTT-----TT---------CC-CT-ATTGAACCG---T-GCCCCTATCG--TA-CCC---C-C-GGGATC-ATGATTTGAA-C-GAAATTTTTT-GAATTTC-CACAT--ATATCAGGAAA----GCTTTCA-TA-----TACA-AAT-T-----T-CAGTACTT--TCT------AGCC-C--GT-GGTG-TCCTG-----G--AGAAG-A-TT-TT-T------
gi|3 : cttataagaatctatctctacaatacgttTGTAAAAATATTCTGATC---CTTT-----G--------------GTGG-CCC-ACA-T-TACCCT----GGGG--T-----T----C-A-----T-GAATTGGA------------CAG---CTT-TTATGCT-CGCT---ATATC-----AGGA-GCTT--A--TACAA--ATCTAAG--C------T--TTC----CTG-GCC-----CTTTAT---TG-----GTC-TCT-TGACGAAGA--T-----TT-TTTAAA-GA--------T-TT-TCCCAT----AT-ATAATCTGAT-A-T-A-----TAAA---TC---TATTGATTCC-CTAATTGGGGCCC-CATTGT--A-C-CCCT-GGGGGTGCATG--AAT--TAGA--AAACGTTG-AATC-TA-A-CTATA-TCAGGA-AAATG-TTTCATATAA--AT-TC-C---GATTTTC-GGCCT---AG---TGGGT-T--------CTT----------GA------------G-------------AATAGAAGATTAAAGAATTTTT---------C-------CC-T--A-----T-AT-AA--TC--ATACGTA-ACAAC-TGTT--TT---------CCCT-ATTGAACCGTG-CCC--CTATCGTACCCCCGGGA-T-CATGATTTGAAC--GAA-ATTTTTTGAATT--TCCACATATA-TCA-GGAAA--GCTT-TCATATACAAATTTCAGTACTTTCTAG--CC-C-G---T----G-GTGTCC---T------GG--AGA--AG---A----TTTTTTTTTTAAAGA---TTT-TTCC---A-TTATAAA---T-----CATATGTG-A-A-------ATACTCT-TTG--A-TC---------CC-TC-AT------A---T-GGCCTCATCG--TA-CCC---C-G-GGAGTC-ATTATTTGAA-C-AAA----CTT-GAATCTC-CAT-T--AGATCAGA-AA----TTTTTCA-TT-----T--A-AAT-T-----T-CAGC-TTT--TCT------AGTC-CA-GT-GGT--TCTTG--A--G--Atttttaaagatttttccattataaatcatatgtgaaatactctttgatccctcatatggcctcatcgtaccccgggagtcattatttgaacaaacttgaatctccattagatcagaaatttttcatttaaatttcagcttttctagtccagtggttcttgagaacaaaa
gi|32 : cttataagaatctatctctacaatacgtttgtaagattgctttatccctaatttgtgccacccaacccccggggggtttacgaggcattaatctgaaaaactcaatctacgtccaaatatcgatgaagttcaggataatatccactttcttgtgttcaatgtatgtattttttaaaagaatttccctactaatataattgcacG------TTTA----G----TTGA---A-AT-TG--------A--T-------C-C------AAC-----GAT-T--CCGGAGA-----A--GTTGAA-----------------------------------------------------------G-----AC-----G--AC---------G-G-AGAC---CGA-G--A--TA--T--T-AA-ACAG--AAAAGCTGA-GCTCACTTCAGTCCTCA---GATCAAGTacaaaa
gi|34 : G-CCACACCTC-TACCACC---AGGGCGG-----C----C-A-----C-GATTT-AA------------TGGA--CTT-AAAT---ATTTT---AT-TT-----ACGGAACTTTCA--TATAA--AT-T--TT-T------T--TTT----CT--GCC-----T---AG---T
gi|35 : gt-----C----C-A-----T-GGTTTGAA------------CAA-------GAAG-----------ATG-------AAGAAGCTTCTA--CACAAG-ATAT--GT-T------T--ATT----CTG-GTC-----C---AC---TG-----GT--TCT-TGA-GAA
gi|36 : gaggat---CTTT-ATT---CCCTTGAAAA--TG----------ATGGTCCCCACT-T-TACCCCC---GGGG--G-----G----C-A-----T-GGTTTGAA------------CAAA------GAAT-tacccatcccc
gi|37 : gatctttgaaatgtctttttgagtT-TTTAAA-GG--------A-CT-TTCC-A----AT-ATAATC--CCTA-T-T-----CTAA---TC---T-ATGATCCC--TA-T-ATGGTCC--ATCCA--A-C-CCC--GGGAGT-TACA--ATT--TGAA-
gi|38 : -----G--AT---------G-CCAGACAA-CTT-A-AACAAACTT--C-AA-TCAG--AAA-----A-GCTCACTTAAGTTTTCA---GCTAAAGTGAGC-TAAAAAattg
gi|39 : ataGA---A-TT-TG--------G--T-------C-C------AGT-----GGT-T--CTAGAGAA-GA-A--GGTGAAA-ATG---TG---AAAA-----GTTTA--TA-AC-----GAC-G-------G--C----G-----AC-----G--AC---------A-ACAGA
gi|4 : CT---ATATC-----AGGAATCTTTCA--TATAA--A-----G--C------T--TTT----CCT-GCC-----C---AG---TG-----GT--TCT-C----AAGA--A-----C----------A--------T-TT-TCCC-T----AT-ATATTC--AC-A-T-G-----TAAA---TC---T-TTGATCCC-CTA-TTTTGGCCC-CACCGT--C-T-CCCT-GGGGGT-GATG--ATT--TGAA-CGAAT-TTC-AATC-TCCA-CTATA-TCAGGA-A---GCTTTCATATGA--AT-TT-T-G-GCTTTTCTGGCCA---AG---TGG-T-T--------CTT----------GA------------GAAGAAGATATTTAAA------------GA--TTTT---------C-------CC-T--A-----T-AT-AT--TC--ACATGTA-A-AAC-T-TTGATCCCCCTATTGCCCT-ATTG-----TA-GCC--CCACCATATCCCCAGGGAT-CATGATTTAAAC--GAA-TTT----CAATC--TCCAC-TATA-TCA-GGAA---GCTT-TCATATG--AATTTTGGC-TTTTCTGG--CC-AAG---T----G-GT-TCT---T------GAGAAGA--AG---A----TATTT-----AAAGAT--TTT-CCCT---A-T-----ATATT-----CACATGTA-A-A-------A----CT-TTG--A-TCCCCCTATTGCC-CT-ATT-----G---T-AGCCCCACCA--TATCCC---C-A-GGGATC-ATGATTTAAG-C-GAA----TTT-CAATCTC-CAC-T--ATATCAGG-AA----GCGTACATTA-----A--A-AAT-T-----T-CAGC-TTT--TCT------GGTC-CA-GT-GGT--TCTTG--------AGAAT-A-TT-TT-T------AAATG------ACAC-C----ACCCAA-TTT------------TT---AC---AT--------------T---TTCGTGATTATATCC-------------C-------------CT--TT-GAAGAA-A---G-CCCAGT-ACT--TCATT-T----T----AAC-AAG--C--T--TGA---AT---------C-CC-C--TG-CACC--GAA-GAATGATTTTT--ACTA--AG------TTTG----G----TTGA---A-TT-TG--------G--T-------C-C------AGT-----GGT-T--CTGGAGAA-GA-A--GTCGAAA-ATG---TG---AAAT-----GT-----TA-ACG----GAC-AG------A--C----AGATAGACAGAAAG--ACGGACTGACTG-ACATACGA-CGG-A-CAGGAG--G--C-GA-TCAG--AAA-----A-GCTCGATTGAG
gi|42 : a-A---ACTTTTGCATAA--GT-TT-G-GTGATTTT-TGGCCC---CA---TTG-T-T--------CTG----------GA------------C-------------A-------------GA--TTTT---------G-------CC-T--A-----T-AT-
gi|43 : cctcTAAAA---TGTTGATC---CCTT-----A--TT----------GTGA-CTGCACA-T-TACCCCT---AGGG--G-----T----C-A-----T-GATTTGAT------------CAAA--Cc
gi|46 : TGGCCC-CATATT--G-C-CCCT-GGAGGT-CATA--ATA--TGAA-CACAC-TT
gi|48 : -TTTAAA-GA--------T-TT-TCAG-T----AT-ATATTT--AC-A-T-G-----TCAA---AT---T-TTGATCCcatctt
gi|49 : C---T-TTGATCCC-CTA-TTGTGGCCC-TATCAT--A-
gi|5 : --TT----------GTGG-CCCCATT-T-TGATCCC---TGGG--A-----C----C-A-----C-TATTTGAA------------CAAA--CTT-TAAT-TTACACT---TTGCA-----ATGATGCTTTCA--TATTA--ATTT--GA-C------A--TTT----TTG-AACATT--C---AC---TA------T--TCT-TCA-GATGA--AGATTTTT-TTTAAA-AA--------G-TTATTTT-TG---AT-AAACTT--A----T-G-----CTAA---AT---T-TTG--CCCATTA-CTGTC-CCC-CACCCTTAA-C-CCT--GGG--T-CACC--ATT--TGAA-CAAAC-TTG-AATT-TACA-CTTCC-TCAAGA-A---GCTTTCACATAA--GT-TT-G-G-TAATTTCTGTCCT---AG---TGG-T-T--------CTG----------GA------------G-------------AA------------GA--ATTT---------C-------CC-T--------T-AT-AT--CA--GCATGTA-A-AAC-T-TTG-----------------ATTG-----CG-ATC--CCATCCTACCTCATGGAA--CACAATCTGAACAAAAA-GTT----GAATC--TACTC-CATA-TTA-GGAA---GCTT-TCAGA--------CCA---------GG--TA-CAA---G----G-AG-TCT---T------G---AGA--AGAACA----TTTTG-----AAGAA---TTT-CCCT---A-T-----ATATT-----CGCATGTT-T-A-------A----CT-TTG--A-TC---------CC-CT-ATT-----G---T-GGTTCCTACT--TA-TCC---C-G-GGGGTC-AAAATTTCAA-C-ATT----TTT-GAATCTC-CGC-T--ATATCAGG-AA----GCTTTCA-TA-----T--A-AAT-T-----T-CAGT-CTT--TCT------AGAA-AA-GC-GGT--TCTTG--A--A--AAAAT-A-GT-TC-T------AAATG------ACAC-C----ATCCTA-TTT------------CT---GC---AT--------------T---T-------------T-------------C-------------ATGATT------A-T---C-CCTGGT-CCT--T-------------------------------------------------CC-C--TG-CACT--CGA-GGATGATTTGT--ACCA--AG------TTTG----G----TTGA---A-TT-TG--------G--T-------C-CAGCGTGAGC-----GGT-T--CT---GAA-GA-A--GTGGAAA-ATG---TG---AAAA-----GC-----TA-ACA----GAC-AG------A--T----AGATGGACA----G--AC---------G-ACAGACAA-AAG-G-AG--A------C-CA-TGAG--AAA-----A-ACTCACTTGAATCTTTA---GATCATGTGAAG-TAAA
gi|6 : -GAAGA--AAT---TTGTTTAAAAGA--------TCTT-TCCC-T----AT-ATAT-C--AA-A-T-G-----CAAA---AC---T-ATAACCCC-CTA-TTGTGGC----ATAGT--A-C-CCCCTGGGGAT-CATG--GTT--TGAA-CAA-C-TTG-AATA-TACA-TTATAATCAGGA-A---GCTTTCAT-TAA--AT-TT-GCA-GCTTTTCTG-CCC---AG---TGG-T----------CTT----------GA------------G-------------AAAGAA--------GA--TTTTAAAGATTGTC-------CC-T--A-----T-AT-AT--TC--ACATG-A-A-AAT-T-TTGATC---------TCCT-ACTG-----TA--CC--CCA-AGTACTCC---GGGT-CAT-ATTTGAAA--CAA-CTT----GAATC--TCC---TAT--TCT-GGAA---GCTT-TCATATA--AATT-CAGC-TTTTTTAG--CCGTAG---T----G-GT-TCT---TCAGAAGA---AGA--AG---A----TTTTT-----AAAGA---TTT-TCCCTTTA-T-----A---TT----CACATGCA-ACA-------A----CT-TTG--A-TC---------CA-CT-AAT-----G---TTGGCCC--TCG--T--CCC---C-G-GAG-TC-ATGATT-GAA-CCAAA----CTT-GAATCTC-AAT-T--ATATTAAG-AA-----CTT--A-TA-----T--A-A---T-----T-CAGC-TTT--TCT------GGGC-CA----GGT--TCTTGT-T--G--AGA---A-TG-TTAT------AAATG------GGGCAC----ACCCTA--TT------------TT---GC---AT--------------T---TTTGTGATATCTC-T-------------C-------------CT--TT-GAA-GG-G---G-TCTGAG-TCT--TC-TT-T----G----AGC-AAA--C--C--TAA---AG---------T-CC-C--TT-CACC--C-C-GGATGATTTGT--A--A--AG------TTTG----G----TTGA---A--T-TG--------GCCC-------C-C------AGT-----GGT-T--TTGGAGAA-GA-A---TCG----ATG---TG-----AA-----GT-----TA-A-A----GAC-A-------G-------A-----AC-----G--ACAGTCAGG--G-ACAGACGA-CGGAG-AA--AG--G--C-AA-TCAG--AAA-----A-GCTCATT---GCC--------CACAAGTGAGC-TA
gi|7 : ttttgctttactgagtttgtttcttcatacgatcat----CTG-GCT-----C---AGCAGTG-----GTGATTT-TGA-AAAGA--A-----TT-TTCAAG-------------TT-TCCT-T----Atataaa
gi|7 : tgcgtgtaattaaactctgaatttagaatttttagtatttattttaaaagcatgtatagacaacaagaggcccatgggccacatcgctcaccttggccCAAGTTT-CCTTAAAACTGACCCAGT--GGTTC-GGAGAAGAACATTTTATGCAAAA---CTCCGATC---CCTT-----A--TT----------GTGC-CCCCCCC-C-AACTCCG---GGGA--G-----T----T-A-----T-GATCTGA-------------TAAA--TTTTGGAT-CTACCCT---ATCTC-----AGAAAGCTTTCA--GGTAA--ATATT-GT-T------T--CTT----TTG-GTC-----C---AA---TG-----GT--TCT-TGA-GAAAATGA-----TT-TTTAAAAGA--------T-TT-TCCC-T----AT-ATATTT--AC-A-T-G-----TAAG---AC---T-TTGATCCC-CTA-TTGTGGCCC-TATCGT--A-CTCCC--GAGGGT-CAAG--ATT--TGAA-CAGAC-TTG-AATC-TCCA-TTACA-TCAGGA-A---GCTTTCTTATAA--AT-TT-C-A-GCTTTTCTGGCCC---AG---TGG-T-T--------CTT----------CA------------GAAAAAGATTTTTAAA------------GA--TTTC---------C-------TC-T--AGCCATT-AT-AT--TC--ACATGTA-C-AACTT-TTGAT----------CCCT-AAGG-----TG-TCC--CCATCGTACCCC--GGGGT-CATGA-TTGAAC--AA---TT----GAATC--TCCAC-aaactgacccagtggttcggagaagaacattttatgcaaaactccgatcccttattgtgcccccccccaactccggggagttatgatctgataaattttggatctaccctatctcagaaagctttcaggtaaatattgtttcttttggtccaatggttcttgagaaaatgatttttaaaagattttccctatatatttacatgtaagactttgatcccctattgtggccctatcgtactcccgagggtcaagatttgaacagacttgaatctccattacatcaggaagctttcttataaatttcagcttttctggcccagtggttcttcagaaaaagatttttaaagatttcctctagccattatattcacatgtacaacttttgatccctaaggtgtccccatcgtaccccggggtcatgattgaacaattgaatctccacccggggacctcttcactat
gi|8 : tgcgtgtaattaaactctgaatttagaatttttagtatttattttaaaagcatgtatagacaacaagaggcccatgggccacatcgctcaccttggccctggctcagcagtggtgattttgaaaagaattttATGTGAAA---TTTTGATC---TCAT-----A--TT----------ATGG-CCCCATC-AATACCCT----GTGG--A-----C----C-G-----T---TTTAAAAAACACACACACCAAAAACTT-GAAT-CTGCATC---ATGTC-----AGGAAGTTTTCA-----------A------C------T--TTT----CTA-GTCAAGACT---AG---TG-----GT--T-T-TGA-GAAGA--A-----TC-TA-AAA-GA--------T-TT-T-----------------------A-T-G-----TATA---ACAGAT-TTGATCAT-CTA-TTGTGGCCC-CA------------C--AGGGGT-CATG--AAT--TGAA-CAAAC-TTG-AATC-TAGT-CCATG-CCAGGA-A---GCTTTAGGGCAA--AT-TT-T-A-ATTTTCCTCACAA---AG---TAG-T-T--------CTT---------------------------------------------------------------------T-------CC-T--A-----T-AC-AT--CC--GCATGTACACAAC-T-TTCATC---------CCCT-AATG-----T-------------TGCCCC----AAT-CGTAAT---------------------ATCCATACGC-TGCA-TCA-AGAA---GCTT-TGATGTA--AATTTCAAC-T-----GG--TC-CAG---T----G-GT-TTT---T------G---AGA--AG---A----TTccggggacctcttcactat
gi|9 : cctattctctttagagaagtggacagacatagcctggatgtaggctatgcctgtccacttctctaaagagaatacccctaccccaattctctgcGAAGCTTTCA--TATAATTATAT--AT-TCATACAT--TTA----CTG-TCC-----C----G---TG-----GT--TCT--GA-GAAGA--------TT-TTTAAA-GA--------T-TT-TCCCCT----ATTATATTC--A--A-T-G-----CAAA---AT---T-TTGATTCC-CTAATTGTGGCCC--ATAGT--A-C-CCT--AGGGGT-CATT--ATT--TGAA-CAAAC-TTG-AATC-TCCA-CTATA-TCAGAA-A---GCTTTCATATCA-----TT-C-A-GCTTTT-TGA-CC---AG---T-G-T-T--------TAT----------GA------------GAAGATTATTA---AA------------GA--TTTT---------C-------CC-T--A-------AT-GT--TC--ACATGTC-A-AAC-T-TT-AT----------CCCT-ATTG-----TG-GCC--CCATC-TACCCCAGAGGA--CATAATTTGAAT--AAACATT----GAATC--TCCAC-TATA---A-GGAA---GCTT-T-ATATT--TATTTCAGC-TTTTCTGG---------------------------------------GA--AG-------------------AAGA---T----------------------T-----CACAGGTA-A-A-------A----CT-TTG--A-TC---------CC-CT-ATT-----G---T-GG-CCCATCG--TA-CCC---C----GGGTCTAT-ATTTGAA-C-AAA----CAT-GAATCTC-CAC-T--ATATCAGG-AA----ACTTTCA-TG-----T--A-AAT-T-----T-CAGC-TTT--TCT------GG-C-CA-GT-GGT--TCTTGA-A--A--AGAAG-A-TT-TT-atgcaaattatttaatttcattttaaggtgattac
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): AAACTCTGATGACATCATAGAGTTTTTAATGATATTTGGAATTTATAAGCTGAACAAAAAAAAAAAAAACCAAAACAAGAGGCCCATGGGCCACATCGTTCACCTGAGTACCAATGGTCCTGGTTTAGCAGTGGTGATTTAAAAAGAAAATTTTCATAATTTTTTT
Unaligned ( gi|30 ): CCTCTTCTTCTTACCATATATAAGAGGACAGAAATAAGCTACATATGTCCGTGGGTGAAGGCTGTACCTGTCCTATTCTCTATCTAAACAGAATACCTCCTACCACTATTCTT
Unaligned ( gi|31 ): GCGTGTAGGCTAATTAATTAAGGATTTCAACACATAGTAGCTAAAATAAAACCTGAACTAGAGGCCCATAGGCCATACTGCTCACCCTGTCCCTTTGCTCA
Unaligned ( gi|33 ): AAAGAAGACGTCCATGATCCACATCACCCACCTGAGTAACATCGACTCTGCTGTCCAAATTCCCACTCCGTATTATGGGGATGCTTCAATATCAATAT
Unaligned ( gi|40 ): AAACAAGACCGGCCCATGGACCACTTTCGCTGCTCACTGCCTATAGTTGACACTTCGGCCCTCGCACTCT
Unaligned ( gi|41 ): AAATTATTCCAATCATATCCTATTCTGAAGTGATAAAATTTATATTCAACTCGCATAATACAATAAT
Unaligned ( gi|44 ): AAAGTGGATTGGCATCAGGGTGTAGACAATGCCTGTCCGCTTCTTTAGAAATAATATCC
Unaligned ( gi|45 ): GAAGATGAAAATGTGAAAAATTTACGACAATAGAAACGGACAGGTGAGCTAAAAAT
Unaligned ( gi|47 ): TTGAAAACAAGAGGCCCATGGACCACAATACTTACCCGAGTCATATT
Alignments
lowQualScore : 2 2222 1 1 11 111 11111111111111111111 1111 111111111111111111111 111111111111 11111 3333333333333333333333333333 11111 22222222222 1111111111 11111 11 11111111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777 11111111111111111 2222222222 11 1111111111 11111111 11111 111 5555555555555555555555 111111111 111111111 1111111 11111 111111 22222222 111111 111111 111111111111 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666
lowQualScore : 0 1 1 3333 1 5 1 3 1 88 7 7 777 0 2 777 5 88888888888888888888 3 666 2222 444444444444444444444 3 777777777777 444 44 9999 22 666 4 22222 6666666666666666666666666666 6666 2 22222 555 444 77777 66 2 2 55555555555 5 2222222222 2 999999 5 33333 2 2 66666 444 444 2 2 5 44 33 33 2 2 44 2 33 33 2 2 2 2 1 2 2 2 444 1 33 2 77777 0 1 555 555 2 2 00000000 3333333333333333333333333333333333333333333333333333 33 55555555555555555 2 33 77777 2 2 44 44 3 6 3 6 3 1111111111 3 999999999 44 0 11 333 66 55 6666 77 2 2 3 3 888 3 6666 3 44 3 99999999 3 3 555 3333333333 44 22222222 11111 555 66 2222222222222222222222 3 111111111 6666 6 44 3 222222222 3 3 99999 666 3 2 555 3 2222222 3 22 3 6 7777 3 3 6 44 3 6666 3 77777 33 2 2 11111 2 2 33 111111 4 5 2 2 66 55555555 33 2 2 3 777777 111111 3 7777 3 555555555555 555 555 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 33 55 2 55555 2 2 33 5 999999999 2 88888888 777 999999999 2 2 33 2 6666666 3 33 33 111111 555555555 333 55 2 88888888 33 7777777 2 666666 555555 2 22 0 2 4 22 4 6 777 333 55555 99999 22 66666 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 2 33 66666 2 2 0 88888 3
lowQualScore : . . . .... . . . . . .. . . ... . . ... . .................... . ... .... ..................... . ............ ... .. .... .. ... . ..... ............................ .... . ..... ... ... ..... .. . . ........... . .......... . ...... . ..... . . ..... ... ... . . . .. .. .. . . .. . .. .. . . . . . . . . ... . .. . ..... . . ... ... . . ........ .................................................... .. ................. . .. ..... . . .. .. . . . . . .......... . ......... .. . .. ... .. .. .... .. . . . . ... . .... . .. . ........ . . ... .......... .. ........ ..... ... .. ...................... . ......... .... . .. . ......... . . ..... ... . . ... . ....... . .. . . .... . . . .. . .... . ..... .. . . ..... . . .. ...... . . . . .. ........ .. . . . ...... ...... . .... . ............ ... ... ............................................................ .. .. . ..... . . .. . ......... . ........ ... ......... . . .. . ....... . .. .. ...... ......... ... .. . ........ .. ....... . ...... ...... . .. . . . .. . . ... ... ..... ..... .. ..... .......................................................................... . .. ..... . . . ..... .
lowQualScore : 0 0 0 0000 0 5 0 3 0 33 3 3 555 8 5 888 4 55555555555555555555 6 888 1111 555555555555555555555 3 111111111111 888 22 7777 88 444 9 77777 4444444444444444444444444444 1111 9 11111 000 777 11111 88 9 7 99999999999 3 5555555555 7 444444 3 33333 7 7 77777 777 444 5 7 3 99 11 44 5 7 33 7 44 44 5 7 9 9 0 7 7 4 111 2 44 5 33333 1 2 000 000 9 9 44444444 2222222222222222222222222222222222222222222222222222 99 99999999999999999 9 99 11111 9 9 22 22 1 2 1 2 5 4444444444 1 555555555 22 8 88 777 88 99 1111 99 6 9 1 1 555 1 8888 1 22 1 77777777 1 1 444 5555555555 22 11111111 77777 000 22 1111111111111111111111 3 000000000 5555 2 22 1 333333333 1 3 11111 444 6 8 444 6 9999999 6 88 3 7 1111 3 3 7 66 1 5555 3 11111 99 9 9 11111 9 9 99 111111 1 7 9 7 33 77777777 66 9 9 1 999999 555555 6 7777 1 888888888888 444 000 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 99 88 4 44444 9 7 77 3 777777777 5 22222222 888 444444444 5 5 44 5 2222222 1 44 44 888888 222222222 999 44 2 11111111 11 2222222 2 111111 888888 0 88 8 0 0 88 8 0 888 999 66666 44444 99 99999 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 77 77777 9 4 8 22222 6
consensus : AGCTGTATCTT-ANCCCNGGGGGTCACGATTNGTANCAAGTTT-CCTTNAAACTGACCCAGT--GGTTCTGGAGAAGAACATTTTATGTAAAA---CTTTGATC---CCCT-----A--TT----------GTGG-CCCCACC-C-TACCCCC---GGGG--G-----C----C-A-----T-GATTTGAA------------CAAA--CTT-GAAT-CTACNCT---ATGTC-----AGGAAGCTTTCA--TGTAA--ATAT--GT-C------T--TTT----CTG-GCC-----C---AG---TG-----GT--TCT-TGA-GAAGA--A-----TT-TTTAAA-GA--------T-TT-TCCC-T----AT-ATATTC--AC-A-T-G-----TAAA---AC---T-TTGATCCC-CTA-TTGTGGCCC-CATCNT--A-C-CCC--GGGGGT-CATG--ATT--TGAA-CAAAC-TTG-AATC-TNCA-CTATA-TCAGGA-A---GCTTTCATATAA--AT-TT-N-A-GCTTTTCTGGCCC---AG---TGG-T-T--------CTT----------GA------------G-------------AA------------GA--TTTT---------C-------CC-T--A-----T-AT-AT--TC--ACATGTA-A-AAC-T-TTGATC---------CCCT-ATTG-----TG-GCC--CCATCGTACCCCCGGGGGT-CATGATTTGAAC--AAA-NTT----GAATC--TCCAC-TATA-TCA-GGAA---GCTT-TCATATA--AATTTCAGC-TTTTCTGG--CC-CAG---T----G-GT-TCT---T------G---AGA--AG---A----TTTTT-----AAAGA---TTT-CCCC---A-T-----A---T-----CACATGTA-A-A-------A----CT-TTG--A-TC---------CC-CT-ATT-----G---T-GGCCCCATCG--TA-CCC---C-G-GGGGTC-ATGATTTGAA-C-AAA----CTT-GAATCTC-CAC-T--ATATCAGG-AA----GCTTTCA-TA-----T--A-AAT-T-----T-CAGC-TTT--TCT------GGCC-CA-GT-GGT--TCTTG--A--A--AGAAG-A-TT-TT-T------AAATG------ACAC-C----ACCCTA-TTT------------TT---GC---AT--------------T---T-------------C-------------C-------------CT--TT-GAAGGG-G---G-CCTGGT-CCT--TCATT-T----G----AAC-AAA--C--T--TGA---AT---------C-CC-C--TT-CACC--CAA-GGATGATTTGT--ACCA--AG------TTTG----G----TTGA---A-NT-TG--------G--C-------C-C------AGC-----GGT-T--CTGGAGAA-GA-A--GTCGAAA-ATG---TG---AAAA-----GT-----TA-ACA----GAC-A-------A--C----A-----AC-----G--AC---------G-ACAGACAA-CGG-G-AA--AA--T--C-GA-TCAG--AAA-----A-GCTCACTTGAGCCTTCG---GCTCAGGTGAGC-TAAAAA
Reference ( family-218 ) : AGCTGTATCTT-ANCCCNGGGGGTCACGATTNGTANCAAGTTT-CCTTNAAACTGACCCAGT--GGTTCTGGAGAAGAACATTTTATGTAAAA---CTTTGATC---CCCT-----A--TT----------GTGG-CCCCACC-C-TACCCCC---GGGG--G-----C----C-A-----T-GATTTGAA------------CAAA--CTT-GAAT-CTACNCT---ATGTC-----AGGAAGCTTTCA--TGTAA--ATAT--GT-C------T--TTT----CTG-GCC-----C---AG---TG-----GT--TCT-TGA-GAAGA--A-----TT-TTTAAA-GA--------T-TT-TCCC-T----AT-ATATTC--AC-A-T-G-----TAAA---AC---T-TTGATCCC-CTA-TTGTGGCCC-CATCNT--A-C-CCC--GGGGGT-CATG--ATT--TGAA-CAAAC-TTG-AATC-TNCA-CTATA-TCAGGA-A---GCTTTCATATAA--AT-TT-N-A-GCTTTTCTGGCCC---AG---TGG-T-T--------CTT----------GA------------G-------------AA------------GA--TTTT---------C-------CC-T--A-----T-AT-AT--TC--ACATGTA-A-AAC-T-TTGATC---------CCCT-ATTG-----TG-GCC--CCATCGTACCCCCGGGGGT-CATGATTTGAAC--AAA-NTT----GAATC--TCCAC-TATA-TCA-GGAA---GCTT-TCATATA--AATTTCAGC-TTTTCTGG--CC-CAG---T----G-GT-TCT---T------G---AGA--AG---A----TTTTT-----AAAGA---TTT-CCCC---A-T-----A---T-----CACATGTA-A-A-------A----CT-TTG--A-TC---------CC-CT-ATT-----G---T-GGCCCCATCG--TA-CCC---C-G-GGGGTC-ATGATTTGAA-C-AAA----CTT-GAATCTC-CAC-T--ATATCAGG-AA----GCTTTCA-TA-----T--A-AAT-T-----T-CAGC-TTT--TCT------GGCC-CA-GT-GGT--TCTTG--A--A--AGAAG-A-TT-TT-T------AAATG------ACAC-C----ACCCTA-TTT------------TT---GC---AT--------------T---T-------------C-------------C-------------CT--TT-GAAGGG-G---G-CCTGGT-CCT--TCATT-T----G----AAC-AAA--C--T--TGA---AT---------C-CC-C--TT-CACC--CAA-GGATGATTTGT--ACCA--AG------TTTG----G----TTGA---A-NT-TG--------G--C-------C-C------AGC-----GGT-T--CTGGAGAA-GA-A--GTCGAAA-ATG---TG---AAAA-----GT-----TA-ACA----GAC-A-------A--C----A-----AC-----G--AC---------G-ACAGACAA-CGG-G-AA--AA--T--C-GA-TCAG--AAA-----A-GCTCACTTGAGCCTTCG---GCTCAGGTGAGC-TAAAAA
gi|1 : TGAG-T-GAC----CTT-GGCCCTCGCAC-TCTATATCAGG-AA----GCTTTAA-GG-----T--A-AATGT-----TGTAAC-TT-----T------GG--------------TCTTG--------AGAAG-A-TT-
gi|1 : acaagaggcccatgggccacatcgctcacc-CTATA-TCAGGA-A---GCTTTAAGGTAA--ATGTTGT-A-ACTT---TGG-----------------T--------CTT----------GA------------G-------------AA------------GA--TTAC---------C-------CC-T--A-----T-AT-ATAATC--ATGTGTA-A-AAC-T-TTGAT----------CCCT-ATTG-----GGCGCCCACCATCGTACCTCCGGGGGT-CATGATTTGAAC--AAA-CTT----GAATC--TCC-T-TATA-TCACGGAA---GC-G-TCATA-A--AATATCAGC-TTTCCTGGTCCC-CAG---T----G-GG-TTT---T------G---AGA--AG---AAAACTTTTTA----AAAAA---TTT-TCCC---T-G-----A---T-----T-CTTGAA-ACA-------A----AT-TTGCAA-TC---------CCACT-ATacccctatatataatcatgtgtaaaactttgatccctattgggcgcccaccatcgtacctccgggggtcatgatttgaacaaacttgaatctccttatatcacggaagcgtcataaaatatcagctttcctggtccccagtgggttttgagaagaaaactttttaaaaaattttccctgattcttgaaacaaatttgcaatcccactatatcagtagagctttccaatgaatctcagctttcctggcccaaggttggttttcttttcctttttcgaacagaagaagatttttaagacttcctcaatatcaatcacatgctaaaccttgatccctattgtggcccctcgtaccccgggggtcatgatttgaaccaaactttaatctccactatattcaggacttcccatattaatctcagcttcctggtccagacatgtgttcttcgaaagaatttttaaaggatttttccctatataatcatatgtagaaactcttgatcccataattgtggcccatcataccccaggggtcaatttgaacaaaacttgaatctcctctatattaggagcttccatatacaatttcagctttcgtctggcccagtggttcttgaagaagaagaattgttttgttaaaatcacaccacctattttttgcgcattgtttgtgattatctcccctttgaaggggctcggtccttcattgaacaaactgaatctccttcacccaagggatgattggtatcaagtttggttgaatattggcccagtggtctcttgagaaaaagtcgaaaatgtgaaaagttagacgacagacagaagg
gi|1 : acaagaggcccatgggccacatcgctcacctgagtgaccttggccctcgcactTG--ATTCTTGAAACAAAT-TTGCAATC--CCA-CTATA-TCAGTAGA---GCTTTCCAATGA--AT-CT-C-A-GCTTTCCTGGCCC---AAGGTTGG-T-TTTCTTTTCCTTTTTCGAACAGAA------------G-------------AA------------GA--TTTT---------TAAGACTTCC-TCAA-----T-ATCAA--TC--ACATGCT-A-AAC-C-TTGATC---------CC-T-ATTG-----TG-GCC--CC-TCGTACCCC-GGGGGT-CATGATTTGAACC-AAA-CTT----TAATC--TCCAC-TATATTCA-GGA-----CTTCCCATATT--AATCTCAGC--TTCCTGG--TC-CAGACAT----GTGT-TCT---TC-----G---AAA--GA---A----TTTTT-----AAAGGATTTTT-CCCT---A-TATA--A---T-----CATATGTAGA-A-------A----CTCTTG--A-TC---------CC-ATAATT-----G---T-GG-CCCATCA--TA-CCC---C-A-GGGGTC-A--ATTTGAA-CAAAA----CTT-GAATCTC-CTC-T--ATATTAGG--A----GCTTCCA-TA-----T--ACAAT-T-----T-CAGC-TTTCGTCT------GGCC-CA-GT-GGT--TCTTG--AAGA--AGAAGAA-TTGTT-TTGTTA-AAATC------ACAC-C----A-CCTA-TTT------------TTTGCGC---ATTGTTTGTGATTATCT---C-------------C-------------C-------------CT--TT-GAA-GG-G---G-CTCGGT-CCT--TCA-T-T----G----AAC-AAA--C-----TGA---AT---------C-TC-C--TT-CACC--CAAGGGATGATTGGT--ATCA--AG------TTTG----G----TTGA---ATAT-TG--------G--C-------C-C------AGT-----GGTCT--CTTGAGAA-AA-A--GTCGAAA-ATG---TG---AAAA-----GT-----T----A----GAC-G-------A--C----A--------------------------G-ACAGAatcagtagagctttccaatgaatctcagctttcctggcccaaggttggttttcttttcctttttcgaacagaagaagatttttaagacttcctcaatatcaatcacatgctaaaccttgatccctattgtggcccctcgtaccccgggggtcatgatttgaaccaaactttaatctccactatattcaggacttcccatattaatctcagcttcctggtccagacatgtgttcttcgaaagaatttttaaaggatttttccctatataatcatatgtagaaactcttgatcccataattgtggcccatcataccccaggggtcaatttgaacaaaacttgaatctcctctatattaggagcttccatatacaatttcagctttcgtctggcccagtggttcttgaagaagaagaattgttttgttaaaatcacaccacctattttttgcgcattgtttgtgattatctcccctttgaaggggctcggtccttcattgaacaaactgaatctccttcacccaagggatgattggtatcaagtttggttgaatattggcccagtggtctcttgagaaaaagtcgaaaatgtgaaaagttagacgacagacagaagg
gi|10 : acaagaggcccatgggccacatcgctcacctgagtgaccttggccctcgcactctatatcaggaagctttaaggtaaatgttgtaactttggtcttgagaagattacccctatatataatcatgtgtaaaactttgatccctattgggcgcccaccatcgtacctccgggggtcatgatttgaacaaacttgaatctccttatatcacggaagcgtcataaaatatcagctttcctggtccccagtgggttttgagaagaaaactttttaaaaaattttcccGGGGAT-CATGAATTGAAC--AAA-CTT----AAATA--TCTCC-TACA-TCA-GGTA---GCTT-TAATGCC--AATCTCAGC-TTTTCCGG--CC-CAA---T----G-AT-TCT---C------G---AGA--AG---A----TTTTT-----AAAGA---TTT-TCCCTTTA-T-----A---TC----CACATGTA-A-A-------A----CT-TTG--A-TC---------CC-CT-ATT-----G---T-GTCCCCATCT--TA-CCC---CTG-GGGGTC-ATGATTTGAA-C-AAA----CTT-GATTTTC-CAC-T--ATACCAGG-AA----GGTTagg
gi|10 : ATCTT-ACCCCTGGGGGTCATGATTTG-AACAAACTTGATTTTCCACTATACCAGGAAGGTTCTGGAGAAGATGATT---TGTAAA-------TGACCACACCTT-----A--TTTTGCATTTTGGTGA---TTATC-T-TGCCTTTGAAGGGG--G-----C----CTAGTCCTT-CATTCGAA------------CAAA--CTT-GAAT-T--CTCT------TCAACCAAGGATAATTT-G--TGCA-----AC--GT-T------TG-GTTGAAATTG-GCC-----T---AG---TG-----GT--TCT-GGA-GAAGctggagaagatgatttgtaaatgaccacaccttattttgcattttggtgattatcttgcctttgaagggggcctagtccttcattcgaacaaacttgaattctcttcaaccaaggataatttgtgcaacgtttggttgaaattggcctagtggttctggagaagttgaaaatgtgaaaagttaacagacagacaaaagacagacaaagggcaatcagaaaaaaactcacttgagtcttcggctcaggcgagctaaaa
gi|10 : ggggatcatgaattgaacaaacttaaatatctcctacatcaggtagctttaatgccaatctcagcttttccggcccaatgattctcgagaagatttttaaagattttccctttatatccacatgtaaaactttgatcccctattgtgtcccc-GGT--TCTGG--AG-A--AGATG-A-TT-TG-T------AAATG------ACCA-C----ACCTTA-TTT------------T----GC---AT--------------T---T-------------TGGTGATTATCTTGC-------------CT--TT-GAAGGG-G---G-CCTAGT-CCT--TCATT-C----G----AAC-AAA--C--T--TGA---AT---------T-CT-C--TT-CAAC--CAA-GGATAATTTGT--GCAA--CG------TTTG----G----TTGA---A-AT-TG--------G--C-------C-T------AGT-----GGT-T--CTGG---A-GA-A--GTTGAAA-ATG---TG---AAAA-----GT-----TA-ACA----GAC-AG------A--C----A-----A---------AA---------G-ACAGACAA-AGG-G------------C-AA-TCAGAAAAA-----A-ACTCACTTGAGTCTTCG---GCTCAGGCGAGC-TAAAAttgaaaatgtgaaaagttaacagacagacaaaagacagacaaagggcaatcagaaaaaaactcacttgagtcttcggctcaggcgagctaaaa
gi|11 : ggggatcatgaattgaacaaacttaaatatctcctacatcaggtagctttaatgccaatctcagcttttccggcccaatgattctcgagaagatttttaaagattttccctttatatccacatgtaaaactttgatcccctattgtgtccccatcttacccctgggggtcatgatttgaacaaacttgattttccactataccaggaaAGC-TTTTCTGG--CC-CAG---TTCCAG-GT-TCT---T------G---AGA--AG---AAGA-TTTTT-----AAATA---TTT-TCCC-----T-----A---TTTAAACACATGTA-A-ATAATTAAA----TT-ATG--A-TA---------CC-CT-AAT-----G---T-GGCCCCATCA--TA-CCC---C-CCGGGGTC-ATGATTTGAA-C-AAA----CTC-AAATCTC-TAC-T--ATATCAAG-AA----GCTTTGA-TA-----T--A-AAT-T-----T-AAGC-TTT--TTTT-----GGCC-CA-GT-GGT--TCTTG--AG-A--AGAAG-A-TT-TT-T------AAATG------ACAC-C----ACCCTA-GTT------------TT---GC---AT--------------T---T-------------T-------------CGTGATTATCTCCTCT--TT-CATGAG-G---G-CCTAGT-CCT--TCATT-T----G----AAC-AAA--C--T--TGG---AT---------C-CC-C--TT-CAC--------------------ACCA--AA------TTTG----G----TTGA---A-TTATG--------G--C-------C-C------AGC-----GGT-T--CTGGAGAAGGA-A--GTCGAAA-ATG---TG---AAAA-----GT-----TA-ACA----GAC-A----------------------------G--AC---------A-ACATACAA-AAG-G------------C-GA-TCAG--AAA-----A-GCTCACTTGAGCCTTTG---GCTCAGGTGAGC-TAA
gi|12 : a-------A----CT-TTG--ACTC---------CG-CC-ATT-----GCAAT-GGACTCAACAATTA-CCTACAC-G-ACGATC-A-GACTTGAAAC-AAA----TTTCGAGATGC-CACAT--ATATTGAG-AAATGTGCTTTTA-CAATAAAT--A-AAT-TGTGTTT-CAGT-CTT--TCTCTGCGGGACCGCA-GTCGGTGATCTTG--A--AGGAGAAG-AGTC-TT-TGTTTGAAAATGTATCGCACAC-CCATAACC--A-TTTGAATATGCTAATCT---GCGATAT--------------TAC-T-------------C-------------C-------------CT--TTAGCAGAG-G---GACCTCACGCCT--CCATGAT----GTAGTAAC-AAAAACAATGATGAGA-ATGCCCCACGGC-CT-C--TTACACGAACAC-GGATGATTTGC--ACTA--GGAGAAGGTTTG----AGATATCGACACG-GT-TG--------G--C-------TAC------A-C-----ATT-TTTCTGGAGAA-GAGA--GTCGAAATATGGTATA---AAAAATGATAT-----TA-ACA----GAta
gi|13 : CAGG------GCTTCCGTA-----GT-TT-C-A-GCTTTTTTAGCCT---AG---TGG-T-T--------CTT----------GA------------G-------------AA------------GA--TTTT---------T-------TC-T--A-----C-CT-AT--TC--ACATGTA-C-AAC-T-TTGATT---------CCCT-ATTG-----TG-GCC--CCATCGTATCTCCTGGGGT-CATGATTTTAAT--AAA-GTT----GAATA--TCCAC-TATA-TGA-GGAA---GCTT-TCATATA--AATTTCATC-TTCTCTGG--CC-CAA---T----G-AT-TCTTGAT------G---AGA--AG---A----ATTTT-----GAAGA---TTTGCCCT---ATT-----AT--T-----CACATGTA-A-A-------A----CT-TTG--A-TC---------CC-Cgaggaga
gi|14 : TA-TTT------------TC------------------------T---C-------------C-------------C-------------CT--TTCGATGGG-AAATG-CATGCA-CCT--TCATT-T----G----AAC-AGA--T--T--TGA---AT---------T-CC-C--TT-CATC--AAA-ATATGCTTTAT--GGCAACAGTTAC--TTTG----A----TTGA---A-A--TG--------G--C-------C-C------AGCTTTTTTTT-T--TTTAAG------A--TTTAAAA-ATA---TATTCAAAG-----TT-----TT-ACATATGGATGA-------A--C----AG----ACT----G--AC---------A-ATTAACAATTAG-C-AA--AA--TG-T-GA-TCAG--AAA-----A-GCTCACTTCAG
gi|15 : cacccattttttcatttgctgatca-----T--A-ATT-T-----T-CAGC-TTT--TCT------TGCC-CA-GT-GAT--TCTTA--T--A--AGAA---------------------------------------TCCTA-CTT------------TT---GC---AT--------------T---TTCTTGATTTTCTCC-------------C-------------CT--TT-CAAAGG-A---G-CATGTT-TTT--T--TT-T---------AAC-A----------TGATCAAT---------C-CCGC--TT-TAT-------GGG-------------A--AA------TTTG----A----TTGA---A-AT-TA--------G--C-------C-C------TGC-----AGT-T--ATGGAGAA-GA-G--ATCGAAA---G---AA---AAAA-----AG-----TATACA----GAT-G----------------------------G--ACA--------G-ACAGACAA-CGG-ACAA--AA--T-----A-T-------A-----A-GCT----------TTTG---GCTCAGGTGAGCTTAAAAA
gi|16 : TA-TTT------------CT---GT---AT--------------TATCT-------------C-------------C-------------CC--TT-TAAGGG-A-----CCCGGT-CCT--TCCTT-TAATTG----AAC-AAA--C--A--TGA---AT---------C-CC-T--TT--ATC--CAA-GGATGATTTGC--ACCA--AG------TTTG----G----TTGA---A-AT-GT--------G--C-------C-C------AGT-----TG--T--CT------------------AA-ATG---TG---AAAA-----GT-----TA-ACG----GAC-A-------A--C----GT----GCA----G--AT---------G-ACGGACAA-CAG-G------------C-GA-TCAG--AAA-----A-GCT-ACTTG---CCTCG---GCTCAGGTGA-C-TAa
gi|17 : accacaccatttatttAC-C----ACCCTA-TTT------------TT---GC---AT--------------T---TTCGTGATTATCTCC-------------C-------------CT--TT-GATGAG-G---G-CCTGGT-CCT--TCATT-T----G----AAC-AAA--A--T--TGA---AG---------C-CC-C--TT-CACC--CAA-GGATGATGTGT--ACCA--AG------TTTG----G----TTGA---A-TT-T---------G--C-------C-C------AGC-----GGT-T--TT-GAGAA-GA-A--GTTGAAA-ATT---TG---GAAA-----GT-----TT-AC-----GAC-G-------ACCC----A-----AC-----G--GC---------T--CAGGTGA-GCT-A-AA--AA--T--A-GG-TCAG--AGA-----
gi|18 : ---TG-----GT--ACT-TTG-GAGG------------TTTAAA-GAGAAATTTGT-TT-TCCA-T----ATCATATTC--CA-A-T-A-----TATA---AT---T-T--------CTG-TTGT---CC-CATCCT--GGT-CCT--GGAATT-CATG--GTT--TAAA-CAGAG-ATG-GATCCTTCAACT-CA-T-AAGA-A---GCTTTCATGCAAGGAT-TG-A-A---TTTACTA--CT---AG---TAA-T-T--------Cttaaatactcg
gi|18 : tggttcaacagtttcagagaagaaaattaata--TTTT---------C-------CA-T--A-----TCAT-AT--TC--CAATATA-T-AAT-T-T----------------CT-GTTG-----T----C--CCATCCTGGTCCTGGAATT-CATGGTTTAAAC--AGA-GAT----GGATCCTTCAAC-T-CA-T-A-AGAA---GCTT-TCATGCA--A
gi|19 : tggttcaacagtttcagagaagaaaattaatatggtactttggaggtttaaagagaaatttgTTAGG-AA----GTTTTCA-TG-----T--A-AAA-TAG---T-CA---CAT--TCT------GGTCGCATGT-GGT--CCTT------A--AGAAG-A-CA-TT-C------AAATG------CCCA-C----AACCTAGTTT------------GG---GC---AT--------------T---T-------------ggattgaatttactactagtaattc
gi|19 : ---AT--------------C---T-------------CT------------C-------------CT--TT-AAAAGG-G---G-AATAGT-CCT--GCATT-T----G----AACAAAA--C--A--TGA---AT---------tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattatctctcctttaaaaggggaatagtcctgcatttgaacaaaacatgaatat
gi|2 : ttaggaagttttcatgtaaaatagtcacattctggtcgcatgtggtccttaagaagacattcaaatgcccacaacctagtttgggcattttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattAGCTGTATCTTNAACCCAAGG----ACGATTAGTACCAAGTTT-CCTTGAAATTGACCCAAT--GGTTCTGGAGAAGAACATTTTATGCAAAA---CTGAGATC---CCCT-----A--TT----------GTGG-CCCCTCC-C-TACCCCC---GGGG--G-----T------A-----T-GATCTGCT------------CAAA--TTT-GGAT-CTACTAT---ATGTC-----AGGAACCTTTAA--GGTAA--ATATT-GT-T------T--CTT----CTG-GTC-----C---AA---TG-----GT--TCT-TGA-GAAGACGA-----TT-TTTAAA-GA--------T-TT-TCCC-T----AT-ATATTC--TT-A-T-G-----TAAA---AC---T-TTGATCCC-CTA-TTGTGGCCC-CATCGT--A-C-CCC--GGGGGT-CATG--ATT--TGAA-CAAAC-TTG-AATC-TTCA-CTATA-TCAGGA-A---GCTTTCATATAA--AT-TT-A-A-GTTTTTCTGGCCC---AG---TGG-T-T--------CTT----------GA------------G-------------AA------------GA--TTTC---------C-------CC-T--A-----T-AC-AT--TC--ACATGTA-A-AAA-T-CTTATC---------CCCT-A--A-----TG-GCC--CCATGGTACCCCCGGGGTT-TATGATTTGAAC--AAA-ATG----GAATC--TTCAC-TATT-TCA-GGAA---GCTT-TCATATC--AATTTCAGC-TTTTCTGT--CC-CAG---T----G-GT-TCT---T------G---AGA--AG---A----TTTTT-----AAAGA---TTT---------------------------ATATATA-A-A-------A----CT-TTG--A-TT---------CC-CT-AAT-----A---T-GGCCCCACCG--TA-CCCAA-G-G-AGGGTC-GTGGTTTGAA-C-AAA----CTT-GAATCTC-CAT-T--ATATCAGG-AA----GCTTTTA-TA-----T--C-AAT-T-----T-CAGC-TTC--TCT------GACC-AA-AT-GGT--TCTTGTCA--A--AGAAG-A-TT-TT-T------AAATG------ATAC-C----ACCCTA-TTT------------TT---GC---A---------------------------------C-------------C-------------AT--TT-GAAAGG-G---G-TCAGGT-CCT--TCATT-T----G----AAC-AAA--C--T--TGA---AT---------C-CC-C--TT-TACC--CAA-GGATGATTTGC--ACCA--AG------TTTG----G----TTGA---A-TT-TG--------G--C-------C-C------AGT-----AGT-T--CTGGAGAA-GA-A--GATGAAA-ATG---TG---AAAA-----GT-----TT-ACA-----AC-A-------A--C----A-----AC-----G--AT---------T-ACTGACAA-CGG-G-AA--AATTT--T-GA-TCAG--AAT-----A-GCTCACTTAAGCATTCG---GGTCAGGTGAGC-TAAAAAat
gi|20 : -----T--A-ATT-T-----T-CCAC-TTT--TCT------GGCC-CA-GT-TGT--TCGTG--A--G--AG------TT-TT-T------AAA
gi|20 : atgttagaaag-C------T--TTT----CTG-GCC-----C---AG---TT-----GT--TCG-TGA-GAG----------TT-TTTAAA-AA--------T-T---CCCAT----AA-ATATTC--GC-A-T-G-----TAAA---AC---T-TTGATTCC-CTA-TTGTAGAAC-CACCCT--A-C-CCA--AAAGGC-AATAGTATT--TG---CAAAT-TTG-AATC-TGCA-CAATG-CCAGAA-A---GCTTTTATGTAaattcccataaatattcgcatgtaaaactttgattccctattgtagaaccaccctacccaaaaggcaatagtatttgcaaatttgaatctgcacaatgccagaaagcttttatgta
gi|21 : atgttagaaagtaattttccaAAGCTTTCAACTGTA------T---T-C------TACTTT----CTG-GCC-----C---AG---TT-----GT--TCGATGG-GAAGA---------T-TTTAAA-GA--------TGCT-TCCC-T----A--ATATGCT-GC-A-TTG-----TACA---AC---T-TTGATCCC-TTT-TTGTGGCCT-T-TCCT--A-C-CC----------AAAG--ATT--TGAA-CAAAT-TGA-AATC-TATC-CTG-A-TCA-GA-G---GCGTTCATG-AA--AT-
gi|23 : --TT-GAAGAGCA---G-CC-----CCTCATCATCAT----G----AAC------T--T--TGA---AT---------CTCC-C--TT-CATG--TAA-T-ATG--TTAT--GCCA--CA------TTTG----T----TTGA---A-AT-TT--------A--C-------C-A------AAT-----GGT-C--GTGCAGAA-AA-A--GT-GAAA-Acc
gi|24 : ------AGT-----GCC-T--CTGGAGAA-GA-A--GT------------TG---AAAA-----GT-----TA-ATT----TAT------------C-----------C-----A--AG---------G-ACAAATCC-TAG-T-TA--AA--TGTT-GA-TCAG--AAC-----ACACTCACTTGAGCCTTTATTAGCTCAGGTGAGC-TACAAcagttgattatgaggaaagagctttgcattagaaaactcagtaacttttttcagctc
gi|25 : ggacgttttgggtcaatttaaaggaatttaaagctcagtttt-AAA--C--T--TGA---AT---------A-TC-AAATT-TACC--AAA-GAAAAACTTA-----CA--AT------TTTG----A----TTGA---C-AC-TA--------G--C-------T-G------AAA-----AGT-T--CAGGAGAA-GA-A------AAC-ATG----------AA-----G----------------GAA-A-------A--C----------AC-----A--A------------ACAGA-AA--GG-C-GG--CA--T--CTGA-TCAG--A------------CATTTAAATAAGTG---ACTCAGGTGAGC-TAAAAA
gi|26 : T---------C-TT-C--TT-CATC--CAA-AG-TG-TTTGT--ACAA--AA------TGTGTAATG----ATGG---A-TT-TGATGATGAGG--CAAACTGGC-C------AGT-----GAT-T--CTGGAGAT-AA-A--GAAAAAATATT---TG---CAAA-----GT-----TA-ACA----GAC-A-------A-------A-----TG-----G--ATG--------G-ACAGAC
gi|27 : gaactaattaggaaatgCCC-T----AT-ACATGT--AC-A-T-AGGCATCAAA---A--------GCTCCC-CTA-TTGTGGCTC-AAACCT--A-C-CCCT-GGGGGC-AATG--ATT--TGAA-TAGAT-TGG-AATC-TACT-TTATA-TAAGAA-A---AC-TTCAT-TAA--AT-
gi|27 : TC---CCCT-----A--TT----------GTGG-CTCAAAC-C-TACCCCT---GGGG--G-----C----A-A-----T-GATTTGAA------------TAGA--TTG-GAAT-CTACTTT---ATATA-----AGAAAAC-TTCA--T-TAA--ATAaactgcatactattggtgtgcatt
gi|28 : ccctatacatgtacataggcatcaaaagcT-T--CTGGAGAA-GAGA--GTCGAAATATGGTATA---AAAA-----ATGATATTA-ACA----GAG-AGGAGAAGA--CTCAGA-----AC-----GTGAC---------GCACGGACA--CAA-A-AA--GA--G--C-AACTCAG--AAA-----A-GATCACCTCAGCCTC-----GCGCAGGTGAGC-actgcatactattggtgtgcatt
gi|29 : -CCT--TCATT-T----C----TAC-AAA--C--T--TGA---AT---------T-------TT-----------GAAT--TTCCTTAACTA--AA------GTTG----G----TTGA---A-AT-AA--------G--T-------C-T------AAT-----TGT-T--CTGGAGAA-GC-ATCGTCGGAA-ctcaa
gi|3 : actctatgtttgacttttcttgattatctcTGTAAGATTGCTTT-ATC---CC-T-----AATTT----------GTG----CCACC-C-AACCCCC---GGGG--GGTTTACGAGGC-A-----TTAATCTGAA-------------AAA--CTC--AAT-CTACGTCCAAATATCG----ATGAAG--TTCA--GGATA--ATAT--CCAC------T--TTC----TTGTGTT-----C---AA---TGTATGTAT--TTT-TTA-AAAGA--A---------------------------TT-TCCC-TACTAAT-ATAATT--GC-ACT-G-----TAAAAATAT---T-CTGATCCT-TTG---GTGGCCCACAT--T--A-C-CCT--GGGGTT-CATG--AAT--TGGA-C-AGC-TTT-TATG-CTCG-CTATA-TCAGG--A---GCTT--ATACAA--AT-CT-A-A-GCTTTCCTGGCCCTTTAT---TGG-TCT--------CTT----------GACGAAGATTTTTTA-------------AA------------GA--TTTT---------C-------CCAT--A-----T-AT-AA--TCTGATATATA-A-ATC-TATTGATT---------CCCTAATTG-----GG-GCC--CCATTGTACCCCTGGGGGTGCATGAATTAGAA--AAC-GTT----GAATC--T-AAC-TATA-TCA-GGAAAATG-TT-TCATATA--AATTCC-GA-TTTTC-GG--CC-TAG---TG---G-GT-TCT---T------G---AGAATAG---A----AGATT-----AAAGAATTTTT-CCCT---A-TATA--A---T-----CATACGTA-ACA-------A----CTGTT-----TT---------CC-CT-ATTGAACCG---T-GCCCCTATCG--TA-CCC---C-C-GGGATC-ATGATTTGAA-C-GAAATTTTTT-GAATTTC-CACAT--ATATCAGGAAA----GCTTTCA-TA-----TACA-AAT-T-----T-CAGTACTT--TCT------AGCC-C--GT-GGTG-TCCTG-----G--AGAAG-A-TT-TT-T------
gi|3 : cttataagaatctatctctacaatacgttTGTAAAAATATTCTGATC---CTTT-----G--------------GTGG-CCC-ACA-T-TACCCT----GGGG--T-----T----C-A-----T-GAATTGGA------------CAG---CTT-TTATGCT-CGCT---ATATC-----AGGA-GCTT--A--TACAA--ATCTAAG--C------T--TTC----CTG-GCC-----CTTTAT---TG-----GTC-TCT-TGACGAAGA--T-----TT-TTTAAA-GA--------T-TT-TCCCAT----AT-ATAATCTGAT-A-T-A-----TAAA---TC---TATTGATTCC-CTAATTGGGGCCC-CATTGT--A-C-CCCT-GGGGGTGCATG--AAT--TAGA--AAACGTTG-AATC-TA-A-CTATA-TCAGGA-AAATG-TTTCATATAA--AT-TC-C---GATTTTC-GGCCT---AG---TGGGT-T--------CTT----------GA------------G-------------AATAGAAGATTAAAGAATTTTT---------C-------CC-T--A-----T-AT-AA--TC--ATACGTA-ACAAC-TGTT--TT---------CCCT-ATTGAACCGTG-CCC--CTATCGTACCCCCGGGA-T-CATGATTTGAAC--GAA-ATTTTTTGAATT--TCCACATATA-TCA-GGAAA--GCTT-TCATATACAAATTTCAGTACTTTCTAG--CC-C-G---T----G-GTGTCC---T------GG--AGA--AG---A----TTTTTTTTTTAAAGA---TTT-TTCC---A-TTATAAA---T-----CATATGTG-A-A-------ATACTCT-TTG--A-TC---------CC-TC-AT------A---T-GGCCTCATCG--TA-CCC---C-G-GGAGTC-ATTATTTGAA-C-AAA----CTT-GAATCTC-CAT-T--AGATCAGA-AA----TTTTTCA-TT-----T--A-AAT-T-----T-CAGC-TTT--TCT------AGTC-CA-GT-GGT--TCTTG--A--G--Atttttaaagatttttccattataaatcatatgtgaaatactctttgatccctcatatggcctcatcgtaccccgggagtcattatttgaacaaacttgaatctccattagatcagaaatttttcatttaaatttcagcttttctagtccagtggttcttgagaacaaaa
gi|32 : cttataagaatctatctctacaatacgtttgtaagattgctttatccctaatttgtgccacccaacccccggggggtttacgaggcattaatctgaaaaactcaatctacgtccaaatatcgatgaagttcaggataatatccactttcttgtgttcaatgtatgtattttttaaaagaatttccctactaatataattgcacG------TTTA----G----TTGA---A-AT-TG--------A--T-------C-C------AAC-----GAT-T--CCGGAGA-----A--GTTGAA-----------------------------------------------------------G-----AC-----G--AC---------G-G-AGAC---CGA-G--A--TA--T--T-AA-ACAG--AAAAGCTGA-GCTCACTTCAGTCCTCA---GATCAAGTacaaaa
gi|34 : G-CCACACCTC-TACCACC---AGGGCGG-----C----C-A-----C-GATTT-AA------------TGGA--CTT-AAAT---ATTTT---AT-TT-----ACGGAACTTTCA--TATAA--AT-T--TT-T------T--TTT----CT--GCC-----T---AG---T
gi|35 : gt-----C----C-A-----T-GGTTTGAA------------CAA-------GAAG-----------ATG-------AAGAAGCTTCTA--CACAAG-ATAT--GT-T------T--ATT----CTG-GTC-----C---AC---TG-----GT--TCT-TGA-GAA
gi|36 : gaggat---CTTT-ATT---CCCTTGAAAA--TG----------ATGGTCCCCACT-T-TACCCCC---GGGG--G-----G----C-A-----T-GGTTTGAA------------CAAA------GAAT-tacccatcccc
gi|37 : gatctttgaaatgtctttttgagtT-TTTAAA-GG--------A-CT-TTCC-A----AT-ATAATC--CCTA-T-T-----CTAA---TC---T-ATGATCCC--TA-T-ATGGTCC--ATCCA--A-C-CCC--GGGAGT-TACA--ATT--TGAA-
gi|38 : -----G--AT---------G-CCAGACAA-CTT-A-AACAAACTT--C-AA-TCAG--AAA-----A-GCTCACTTAAGTTTTCA---GCTAAAGTGAGC-TAAAAAattg
gi|39 : ataGA---A-TT-TG--------G--T-------C-C------AGT-----GGT-T--CTAGAGAA-GA-A--GGTGAAA-ATG---TG---AAAA-----GTTTA--TA-AC-----GAC-G-------G--C----G-----AC-----G--AC---------A-ACAGA
gi|4 : CT---ATATC-----AGGAATCTTTCA--TATAA--A-----G--C------T--TTT----CCT-GCC-----C---AG---TG-----GT--TCT-C----AAGA--A-----C----------A--------T-TT-TCCC-T----AT-ATATTC--AC-A-T-G-----TAAA---TC---T-TTGATCCC-CTA-TTTTGGCCC-CACCGT--C-T-CCCT-GGGGGT-GATG--ATT--TGAA-CGAAT-TTC-AATC-TCCA-CTATA-TCAGGA-A---GCTTTCATATGA--AT-TT-T-G-GCTTTTCTGGCCA---AG---TGG-T-T--------CTT----------GA------------GAAGAAGATATTTAAA------------GA--TTTT---------C-------CC-T--A-----T-AT-AT--TC--ACATGTA-A-AAC-T-TTGATCCCCCTATTGCCCT-ATTG-----TA-GCC--CCACCATATCCCCAGGGAT-CATGATTTAAAC--GAA-TTT----CAATC--TCCAC-TATA-TCA-GGAA---GCTT-TCATATG--AATTTTGGC-TTTTCTGG--CC-AAG---T----G-GT-TCT---T------GAGAAGA--AG---A----TATTT-----AAAGAT--TTT-CCCT---A-T-----ATATT-----CACATGTA-A-A-------A----CT-TTG--A-TCCCCCTATTGCC-CT-ATT-----G---T-AGCCCCACCA--TATCCC---C-A-GGGATC-ATGATTTAAG-C-GAA----TTT-CAATCTC-CAC-T--ATATCAGG-AA----GCGTACATTA-----A--A-AAT-T-----T-CAGC-TTT--TCT------GGTC-CA-GT-GGT--TCTTG--------AGAAT-A-TT-TT-T------AAATG------ACAC-C----ACCCAA-TTT------------TT---AC---AT--------------T---TTCGTGATTATATCC-------------C-------------CT--TT-GAAGAA-A---G-CCCAGT-ACT--TCATT-T----T----AAC-AAG--C--T--TGA---AT---------C-CC-C--TG-CACC--GAA-GAATGATTTTT--ACTA--AG------TTTG----G----TTGA---A-TT-TG--------G--T-------C-C------AGT-----GGT-T--CTGGAGAA-GA-A--GTCGAAA-ATG---TG---AAAT-----GT-----TA-ACG----GAC-AG------A--C----AGATAGACAGAAAG--ACGGACTGACTG-ACATACGA-CGG-A-CAGGAG--G--C-GA-TCAG--AAA-----A-GCTCGATTGAG
gi|42 : a-A---ACTTTTGCATAA--GT-TT-G-GTGATTTT-TGGCCC---CA---TTG-T-T--------CTG----------GA------------C-------------A-------------GA--TTTT---------G-------CC-T--A-----T-AT-
gi|43 : cctcTAAAA---TGTTGATC---CCTT-----A--TT----------GTGA-CTGCACA-T-TACCCCT---AGGG--G-----T----C-A-----T-GATTTGAT------------CAAA--Cc
gi|46 : TGGCCC-CATATT--G-C-CCCT-GGAGGT-CATA--ATA--TGAA-CACAC-TT
gi|48 : -TTTAAA-GA--------T-TT-TCAG-T----AT-ATATTT--AC-A-T-G-----TCAA---AT---T-TTGATCCcatctt
gi|49 : C---T-TTGATCCC-CTA-TTGTGGCCC-TATCAT--A-
gi|5 : --TT----------GTGG-CCCCATT-T-TGATCCC---TGGG--A-----C----C-A-----C-TATTTGAA------------CAAA--CTT-TAAT-TTACACT---TTGCA-----ATGATGCTTTCA--TATTA--ATTT--GA-C------A--TTT----TTG-AACATT--C---AC---TA------T--TCT-TCA-GATGA--AGATTTTT-TTTAAA-AA--------G-TTATTTT-TG---AT-AAACTT--A----T-G-----CTAA---AT---T-TTG--CCCATTA-CTGTC-CCC-CACCCTTAA-C-CCT--GGG--T-CACC--ATT--TGAA-CAAAC-TTG-AATT-TACA-CTTCC-TCAAGA-A---GCTTTCACATAA--GT-TT-G-G-TAATTTCTGTCCT---AG---TGG-T-T--------CTG----------GA------------G-------------AA------------GA--ATTT---------C-------CC-T--------T-AT-AT--CA--GCATGTA-A-AAC-T-TTG-----------------ATTG-----CG-ATC--CCATCCTACCTCATGGAA--CACAATCTGAACAAAAA-GTT----GAATC--TACTC-CATA-TTA-GGAA---GCTT-TCAGA--------CCA---------GG--TA-CAA---G----G-AG-TCT---T------G---AGA--AGAACA----TTTTG-----AAGAA---TTT-CCCT---A-T-----ATATT-----CGCATGTT-T-A-------A----CT-TTG--A-TC---------CC-CT-ATT-----G---T-GGTTCCTACT--TA-TCC---C-G-GGGGTC-AAAATTTCAA-C-ATT----TTT-GAATCTC-CGC-T--ATATCAGG-AA----GCTTTCA-TA-----T--A-AAT-T-----T-CAGT-CTT--TCT------AGAA-AA-GC-GGT--TCTTG--A--A--AAAAT-A-GT-TC-T------AAATG------ACAC-C----ATCCTA-TTT------------CT---GC---AT--------------T---T-------------T-------------C-------------ATGATT------A-T---C-CCTGGT-CCT--T-------------------------------------------------CC-C--TG-CACT--CGA-GGATGATTTGT--ACCA--AG------TTTG----G----TTGA---A-TT-TG--------G--T-------C-CAGCGTGAGC-----GGT-T--CT---GAA-GA-A--GTGGAAA-ATG---TG---AAAA-----GC-----TA-ACA----GAC-AG------A--T----AGATGGACA----G--AC---------G-ACAGACAA-AAG-G-AG--A------C-CA-TGAG--AAA-----A-ACTCACTTGAATCTTTA---GATCATGTGAAG-TAAA
gi|6 : -GAAGA--AAT---TTGTTTAAAAGA--------TCTT-TCCC-T----AT-ATAT-C--AA-A-T-G-----CAAA---AC---T-ATAACCCC-CTA-TTGTGGC----ATAGT--A-C-CCCCTGGGGAT-CATG--GTT--TGAA-CAA-C-TTG-AATA-TACA-TTATAATCAGGA-A---GCTTTCAT-TAA--AT-TT-GCA-GCTTTTCTG-CCC---AG---TGG-T----------CTT----------GA------------G-------------AAAGAA--------GA--TTTTAAAGATTGTC-------CC-T--A-----T-AT-AT--TC--ACATG-A-A-AAT-T-TTGATC---------TCCT-ACTG-----TA--CC--CCA-AGTACTCC---GGGT-CAT-ATTTGAAA--CAA-CTT----GAATC--TCC---TAT--TCT-GGAA---GCTT-TCATATA--AATT-CAGC-TTTTTTAG--CCGTAG---T----G-GT-TCT---TCAGAAGA---AGA--AG---A----TTTTT-----AAAGA---TTT-TCCCTTTA-T-----A---TT----CACATGCA-ACA-------A----CT-TTG--A-TC---------CA-CT-AAT-----G---TTGGCCC--TCG--T--CCC---C-G-GAG-TC-ATGATT-GAA-CCAAA----CTT-GAATCTC-AAT-T--ATATTAAG-AA-----CTT--A-TA-----T--A-A---T-----T-CAGC-TTT--TCT------GGGC-CA----GGT--TCTTGT-T--G--AGA---A-TG-TTAT------AAATG------GGGCAC----ACCCTA--TT------------TT---GC---AT--------------T---TTTGTGATATCTC-T-------------C-------------CT--TT-GAA-GG-G---G-TCTGAG-TCT--TC-TT-T----G----AGC-AAA--C--C--TAA---AG---------T-CC-C--TT-CACC--C-C-GGATGATTTGT--A--A--AG------TTTG----G----TTGA---A--T-TG--------GCCC-------C-C------AGT-----GGT-T--TTGGAGAA-GA-A---TCG----ATG---TG-----AA-----GT-----TA-A-A----GAC-A-------G-------A-----AC-----G--ACAGTCAGG--G-ACAGACGA-CGGAG-AA--AG--G--C-AA-TCAG--AAA-----A-GCTCATT---GCC--------CACAAGTGAGC-TA
gi|7 : ttttgctttactgagtttgtttcttcatacgatcat----CTG-GCT-----C---AGCAGTG-----GTGATTT-TGA-AAAGA--A-----TT-TTCAAG-------------TT-TCCT-T----Atataaa
gi|7 : tgcgtgtaattaaactctgaatttagaatttttagtatttattttaaaagcatgtatagacaacaagaggcccatgggccacatcgctcaccttggccCAAGTTT-CCTTAAAACTGACCCAGT--GGTTC-GGAGAAGAACATTTTATGCAAAA---CTCCGATC---CCTT-----A--TT----------GTGC-CCCCCCC-C-AACTCCG---GGGA--G-----T----T-A-----T-GATCTGA-------------TAAA--TTTTGGAT-CTACCCT---ATCTC-----AGAAAGCTTTCA--GGTAA--ATATT-GT-T------T--CTT----TTG-GTC-----C---AA---TG-----GT--TCT-TGA-GAAAATGA-----TT-TTTAAAAGA--------T-TT-TCCC-T----AT-ATATTT--AC-A-T-G-----TAAG---AC---T-TTGATCCC-CTA-TTGTGGCCC-TATCGT--A-CTCCC--GAGGGT-CAAG--ATT--TGAA-CAGAC-TTG-AATC-TCCA-TTACA-TCAGGA-A---GCTTTCTTATAA--AT-TT-C-A-GCTTTTCTGGCCC---AG---TGG-T-T--------CTT----------CA------------GAAAAAGATTTTTAAA------------GA--TTTC---------C-------TC-T--AGCCATT-AT-AT--TC--ACATGTA-C-AACTT-TTGAT----------CCCT-AAGG-----TG-TCC--CCATCGTACCCC--GGGGT-CATGA-TTGAAC--AA---TT----GAATC--TCCAC-aaactgacccagtggttcggagaagaacattttatgcaaaactccgatcccttattgtgcccccccccaactccggggagttatgatctgataaattttggatctaccctatctcagaaagctttcaggtaaatattgtttcttttggtccaatggttcttgagaaaatgatttttaaaagattttccctatatatttacatgtaagactttgatcccctattgtggccctatcgtactcccgagggtcaagatttgaacagacttgaatctccattacatcaggaagctttcttataaatttcagcttttctggcccagtggttcttcagaaaaagatttttaaagatttcctctagccattatattcacatgtacaacttttgatccctaaggtgtccccatcgtaccccggggtcatgattgaacaattgaatctccacccggggacctcttcactat
gi|8 : tgcgtgtaattaaactctgaatttagaatttttagtatttattttaaaagcatgtatagacaacaagaggcccatgggccacatcgctcaccttggccctggctcagcagtggtgattttgaaaagaattttATGTGAAA---TTTTGATC---TCAT-----A--TT----------ATGG-CCCCATC-AATACCCT----GTGG--A-----C----C-G-----T---TTTAAAAAACACACACACCAAAAACTT-GAAT-CTGCATC---ATGTC-----AGGAAGTTTTCA-----------A------C------T--TTT----CTA-GTCAAGACT---AG---TG-----GT--T-T-TGA-GAAGA--A-----TC-TA-AAA-GA--------T-TT-T-----------------------A-T-G-----TATA---ACAGAT-TTGATCAT-CTA-TTGTGGCCC-CA------------C--AGGGGT-CATG--AAT--TGAA-CAAAC-TTG-AATC-TAGT-CCATG-CCAGGA-A---GCTTTAGGGCAA--AT-TT-T-A-ATTTTCCTCACAA---AG---TAG-T-T--------CTT---------------------------------------------------------------------T-------CC-T--A-----T-AC-AT--CC--GCATGTACACAAC-T-TTCATC---------CCCT-AATG-----T-------------TGCCCC----AAT-CGTAAT---------------------ATCCATACGC-TGCA-TCA-AGAA---GCTT-TGATGTA--AATTTCAAC-T-----GG--TC-CAG---T----G-GT-TTT---T------G---AGA--AG---A----TTccggggacctcttcactat
gi|9 : cctattctctttagagaagtggacagacatagcctggatgtaggctatgcctgtccacttctctaaagagaatacccctaccccaattctctgcGAAGCTTTCA--TATAATTATAT--AT-TCATACAT--TTA----CTG-TCC-----C----G---TG-----GT--TCT--GA-GAAGA--------TT-TTTAAA-GA--------T-TT-TCCCCT----ATTATATTC--A--A-T-G-----CAAA---AT---T-TTGATTCC-CTAATTGTGGCCC--ATAGT--A-C-CCT--AGGGGT-CATT--ATT--TGAA-CAAAC-TTG-AATC-TCCA-CTATA-TCAGAA-A---GCTTTCATATCA-----TT-C-A-GCTTTT-TGA-CC---AG---T-G-T-T--------TAT----------GA------------GAAGATTATTA---AA------------GA--TTTT---------C-------CC-T--A-------AT-GT--TC--ACATGTC-A-AAC-T-TT-AT----------CCCT-ATTG-----TG-GCC--CCATC-TACCCCAGAGGA--CATAATTTGAAT--AAACATT----GAATC--TCCAC-TATA---A-GGAA---GCTT-T-ATATT--TATTTCAGC-TTTTCTGG---------------------------------------GA--AG-------------------AAGA---T----------------------T-----CACAGGTA-A-A-------A----CT-TTG--A-TC---------CC-CT-ATT-----G---T-GG-CCCATCG--TA-CCC---C----GGGTCTAT-ATTTGAA-C-AAA----CAT-GAATCTC-CAC-T--ATATCAGG-AA----ACTTTCA-TG-----T--A-AAT-T-----T-CAGC-TTT--TCT------GG-C-CA-GT-GGT--TCTTGA-A--A--AGAAG-A-TT-TT-atgcaaattatttaatttcattttaaggtgattac
blockSeqs : N A A . A T C . G . T T TTG G . C TGAAAATG T TC C GGTTTACGAGGCA T AAACACACACAC AAC TG CTA TA CAA G G TATAATTATATATTCATACAT . T AAGAC TTT CAG TATGT GA A C AGATTTTT A TG A TACTA T TGAT C T GGCAT AAT AGA A A A AC CG TA . T CT G GT . . G . C T A A G AAT A GG . GGT G TTT GGT G C TTCTTTTC GAGAAGAAGATATTTAAA AT AAAGATTGTC A CA GCCAT C C . TG C C T A G CCCCCTATTG A AACCGTGC . CT GTG AA CA TTTT CT A A T . AAT C TACA A . G TTCCA T G TGA CAGAAGA AT AAGA TTTTT ATT GC CATTATAAAT G ATAATTAA TACT C . C CCCCTATTG . A GAACC CAA T C AAT T ACACG T TG A A ATTT C . A . A ATGT T ATAAA AC C . GTGTT . A CG CTGCGG C G T C GA AAGA GA G G A GTTTGA TATCGC A CATA G GAATATGCTAAT . GAT TTTGGTGATTATCTTGC GA AG G AAAT A G CA A GTAGT A AACAATGA TCA GCCCCACGG T G AA A GAACAC A TA AC AGAAGG AGATA CAC A A ATGATGAG CC AAACTGG A AGCGTG CTTTTT . TT G G TC T T GTA TTC ATGAT GATAT AT ATATG AGACAGATAGACAGAAAGACGGACTGACTGACATACGACGGACAGGAGGC C . AGCTG C G TATTA T
blockSeqs : . A . . T ATA G . C AATTT . AA T CGGCCA . . T G CTA TT . A . GGTAAATATTGTTT . . ATT . . . C . . AATTTG A TC . AT . TGC . . . . . . . A C CC . . . T . . . . . . . T . . . . A . . GCA G . . . . . CAGAAAAAGATTTTTAAA . TAAGACTT . . . . . . . . C . G G C . TGG . TG GT C C . CA C . . . A . TT . . . ACAT . . . GAGA . AACA . ATT C CTTTATATC . CA . G . . . . . . . . C T . AAGG . TG . C . . . A . . . . . . . . AG . . . T C G . . G AAGG G . . . . . . . . . . . TTTCGTGATTATCTCCT . CG G CA . . . A AATTG . CT GA . . . . . CCAA A . . TTAC TAATG . T . . . . . . T . . . G . C T GTA . . TTA A A AGGAGAAGACTCAGAACGTGACGCACGGACACAAAAAGAGC . . . . C TG .
blockSeqs : . G . T ATT . C C GCAA . . T G CTA GT . A . GGATAATATCCACT . . . . . . . . . CGATT . T . AT . CCT . . . . . . . . C CC . . . T . . . . . . . G . . . . G . . CA G . . . . . GACGAAGATTTTTTAAA . T . . . . . . . . . . . T T . TGG . CG AT . C . . A . . . . . CC . . . TG . . . CG . A . T T CTATTTAAA . CA . . . . . . . . . . A A . CTG . TG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . TCAA G . . . . . . . . . . . TTTCTTGATTTTCTCCC . G G G . . . . G . CT . . . . . . CAAA C . . . G . G . . . . . . C . . . . . C T . . . . A A AGAACGACAGTCAGGGACAGACGACGGAGAAAGGC . . . . G TG .
blockSeqs : . G . C ATT . C C TTCA . . C T GCT GC . A . TACAAATCTAAGCT . . . . . . . . . TGATT . T . TG . TT . . . . . . . . T CC . . . T . . . . . . . A . . . . A . . CA G . . . . . GAGAATAGAAGATTAAA . C . . . . . . . . . . . G C . TGG . TG GT . G . . A . . . . . TA . . . T . . . GG . A . . T CTTTATATT . A . . . . . . . . . . C G . CCC . TG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . AGA G . . . . . . . . . . . TTTCGTGATTATCTCCC . C G G . . . . G . TT . . . . . . CCAA A . . . G . A . . . . . . C . . . . . T . . . . . A A GAACAGACTGACAATTAACAATTAGCAAAATGT . . . . A CG .
blockSeqs : . G . T ATT . C C GGCA . . C A TTA TT . G . CACAAGATATGTTT . . . . . . . . . TTT . T . CT . GC . . . . . . . . A TG . . . T . . . . . . . A . . . . G . . AA G . . . . . TTTCGAACAGAAGAA . C . . . . . . . . . . . G T . GGG . CG TT . G . . A . . . . . CA . . . T . . . G . A . . C TATATAAT . A . . . . . . . . . . C G . CC . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . AGA G . . . . . . . . . . . TTTCGTGATTATATCCC . C A G . . . . G . CA . . . . . . CCAA A . . . A . A . . . . . . C . . . . . C . . . . . T A AGATAGATGGACAGACGACAGACAAAAGGAGAC . . . . G CG .
blockSeqs : . . . T ATT . T T GTCA . . C G CTA AC . A . GGTAAATATTGTTT . . . . . . . . . ATT . A . T . AC . . . . . . . . C CC . . . . . . . . . . . T . . . . G . . AA G . . . . . GAGAAGATTATTAAA . C . . . . . . . . . . . G T . TAG . CA TT . A . . A . . . . . TC . . . T . . . G . A . . T TATATAAT . A . . . . . . . . . . C G . CG . TG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . TTG G . . . . . . . . . . . TTTTGTGATATCTCTC . T G A . . . . G . AT . . . . . . CCAA A . . . A . A . . . . . . T . . . . . T . . . . . A G AACAACGATTACTGACAACGGGAAAATTTT . . . . A TG .
blockSeqs : . . . A ATT . T C ACCA . . C G CTG CC . G . TATTAATTTGACA . . . . . . . . . ATC . T . T . GC . . . . . . . . C CG . . . . . . . . . . . A . . . . A . . AA G . . . . . GAGAAAGAA . C . . . . . . . . . . . G C . CGA . AT AT . G . . A . . . . . TA . . . T . . . G . A . . C TATATATT . A . . . . . . . . . . C A . CA . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . AAA G . . . . . . . . . . . TATCTCC . G G A . . . . G . CA . . . . . . GTAA A . . . G . T . . . . . . C . . . . . T . . . . . T A GACCCAACGGCTCAGGTGAGCTAAAAATA . . . . C CA .
blockSeqs : . . G . T G GTTA . . C T A AT . C . ACTGTATTCTAC . . . . . . . . . TT . T . T . AC . . . . . . . . C AT . . . . . . . . . . . C . . . . A . . TG T . . . . . GAGAA . C . . . . . . . . . . . G C . TGT . AG GT . A . . A . . . . . TG . . . T . . . G . A . . C TATATATT . A . . . . . . . . . . T T . CG . TG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . TA T . . . . . . . . . . . TACTCC . A A G . . . . G . CT . . . . . . CAAA A . . . G . T . . . . . . T . . . . . A . . . . . T T CCAAGGACAAATCCTAGTTAAATGTT . . . . C CA .
blockSeqs : . T . ACCG . . T G . . . G . TATAAATTTTTT . . . . . . . . . AC . G . A . AC . . . . . . . . T CA . . . . . . . . . . . A . . . . A . . GG G . . . . . GAGAA . G . . . . . . . . . . . C . . TGG . G GT . T . . T . . . . . TA . . . G . . . G . A . . T TATTATT . A . . . . . . . . . . C G . CG . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . AG T . . . . . . . . . . . CTCTC . G A G . . . . G . TT . . . . . . CCAA A . . . G . A . . . . . . T . . . . . C . . . . . A A AACGTGCAGATGACGGACAACAGGC . . . . A TA .
blockSeqs : . C . GTA . . . . . . . TATAAAGCT . . . . . . . . . TT . T . T . AA . . . . . . . . C CC . . . . . . . . . . . A . . . . A . . CA A . . . . . GAGAA . C . . . . . . . . . . . . . . TA . . AT . G . . A . . . . . TA . . . T . . . G . A . . . T . A . . . . . . . . . . . G . C . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . AG G . . . . . . . . . . TCCC . G G G . . . . C . CT . . . . . . CGAA A . . . T . A . . . . . . T . . . . . C . . . . . A A GGACAGACAGACAACGGACAAAAT . . . . G . .
blockSeqs : . . . ACT . . . . . . . . . T . T . T . AC . . . . . . . . T AG . . . . . . . . . . . C . . . . A . . TA A . . . . . GACA . C . . . . . . . . . . . . . . T . . T . C . . G . . . . . TT . . . T . . . G . A . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . AA . . . . . . . . . TTTC . G G A . . . . T . CT . . . . . . TCGA . . . . A . T . . . . . . A . . . . . T . . . . . A G AACACAAACAGAAAGGCGGCATCT . . . . G .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . T . T . A . . . . . . . . C CG . . . . . . . . . . . A . . . . A . . CA . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . A . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . A . . . . . . . . CC . G . T . . . . G . CT . . . . . . CCC . . . . G . A . . . . . . T . . . . . T . . . . . A A GACGACGGAGACCGAGATATT . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . A . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . C . . . . G . . C . . . . . . . C . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . G . . . . . . CC . . . . . . . . . . . G . A . . . . . . T . . . . . C . . . . . A A AGACAACATACAAAAGGC . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . T . . . . . . C . . . . . G . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . T . . . . . . T . . . . . C . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . G . T . . . . . . T . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqCons : *** ATT***************** C*** GCCA***************** CTA* ***** NATAAATTCGCT**************** **** ATT******** T********* ** NA*** ** C********* TGG****** ** TN** ** A******* ***** TATATATT************** A******** ** TG ** AA****** ****** *** CT****** CCAA*** N* A* **
originalCons : AGCTGTATCTT-ANCCCNGGGGGTCACGATTNGTANCAAGTTT-CCTTNAAACTGACCCAGT--GGTTCTGGAGAAGAACATTTTATGTAAAA---CTTTGATC---CCCT-----A--TT----------GTGG-CCCCACC-C-TACCCCC---GGGG--G-----C----C-A-----T-GATTTGAA------------CAAA--CTT-GAAT-CTACNCT---ATGTC-----AGGAAGCTTTCA--TGTAA--ATAT--GT-C------T--TTT----CTG-GCC-----C---AG---TG-----GT--TCT-TGA-GAAGA--A-----TT-TTTAAA-GA--------T-TT-TCCC-T----AT-ATATTC--AC-A-T-G-----TAAA---AC---T-TTGATCCC-CTA-TTGTGGCCC-CATCNT--A-C-CCC--GGGGGT-CATG--ATT--TGAA-CAAAC-TTG-AATC-TNCA-CTATA-TCAGGA-A---GCTTTCATATAA--AT-TT-N-A-GCTTTTCTGGCCC---AG---TGG-T-T--------CTT----------GA------------G-------------AA------------GA--TTTT---------C-------CC-T--A-----T-AT-AT--TC--ACATGTA-A-AAC-T-TTGATC---------CCCT-ATTG-----TG-GCC--CCATCGTACCCCCGGGGGT-CATGATTTGAAC--AAA-NTT----GAATC--TCCAC-TATA-TCA-GGAA---GCTT-TCATATA--AATTTCAGC-TTTTCTGG--CC-CAG---T----G-GT-TCT---T------G---AGA--AG---A----TTTTT-----AAAGA---TTT-CCCC---A-T-----A---T-----CACATGTA-A-A-------A----CT-TTG--A-TC---------CC-CT-ATT-----G---T-GGCCCCATCG--TA-CCC---C-G-GGGGTC-ATGATTTGAA-C-AAA----CTT-GAATCTC-CAC-T--ATATCAGG-AA----GCTTTCA-TA-----T--A-AAT-T-----T-CAGC-TTT--TCT------GGCC-CA-GT-GGT--TCTTG--A--A--AGAAG-A-TT-TT-T------AAATG------ACAC-C----ACCCTA-TTT------------TT---GC---AT--------------T---T-------------C-------------C-------------CT--TT-GAAGGG-G---G-CCTGGT-CCT--TCATT-T----G----AAC-AAA--C--T--TGA---AT---------C-CC-C--TT-CACC--CAA-GGATGATTTGT--ACCA--AG------TTTG----G----TTGA---A-NT-TG--------G--C-------C-C------AGC-----GGT-T--CTGGAGAA-GA-A--GTCGAAA-ATG---TG---AAAA-----GT-----TA-ACA----GAC-A-------A--C----A-----AC-----G--AC---------G-ACAGACAA-CGG-G-AA--AA--T--C-GA-TCAG--AAA-----A-GCTCACTTGAGCCTTCG---GCTCAGGTGAGC-TAAAAA
finalCons : AGCTGTATCTT-ANCCCNGGGGGTCACGATTNGTANCAAGTTT-CCTTNAAACTGACCCAGT--GGTTCTGGAGAAGAACATTTTATGTAAAA---CTTTGATC---CCCTATT-----------------GTGG-CCCCACC-C-TACCCCC---GGGGGCCA-----------------T-GATTTGAA------------CAAA--CTT-GAATCTA-CNCT---ATGTC-----AGGAAGCTTTCANATAAATTCGCT----------------TTT----CTG-GCC-----C---AG---TG-----GT--TCT-TGA-GAAGAATT--------TTTAAA-GAT---------TT-TCCC-T----AT-ATATTC--AC-A-T-G-----TAAA---AC---T-TTGATCCC-CTA-TTGTGGCCC-CATCNT--A-C-CCC--GGGGGT-CATG--ATT--TGAA-CAAAC-TTG-AATC-TNCA-CTATA-TCAGGA-A---GCTTTCATATAA--AT-TTNA---GCTTTTCTGGCCC---AG---TGG-T-T--------CTT----------GA------------G-------------AA------------GA--TTTT---------C-------CC-T--A-----T-AT-AT--TC--ACATGTA-A-AAC-T-TTGATC---------CCCT-ATTGTGG------CC--CCATCGTACCCCCGGGGGT-CATGATTTGAAC--AAA-NTT----GAATC--TCCAC-TATA-TCA-GGAA---GCTT-TCATATN--AATTTCAGC-TTTTCTGG--CC-CAG---T----G-GT-TCT---T------G---AGA--AGA-------TTTTT-----AAAGA---TTT-CCCTATATATT--------------CACATGTA-AA--------A----CT-TTG--A-TC---------CC-CT-ATT-----G---T-GGCCCCATCG--TA-CCC---C-G-GGGGTC-ATGATTTGAA-C-AAA----CTT-GAATCTC-CAC-T--ATATCAGG-AA----GCTTTCA-TA-----T--A-AAT-T-----T-CAGC-TTT--TCT------GGCC-CA-GT-GGT--TCTTGAA------AGAAG-A-TT-TT-T------AAATG------ACAC-C----ACCCTA-TTT------------TT---GC---AT--------------T---T-------------C-------------C-------------CT--TT-GAAGGG-G---G-CCTGGT-CCT--TCATT-T----G----AAC-AAACT------TGA---AT---------C-CC-C--TT-CACCCAA---GGATGATTTGT--ACCA--AG------TTTG----G----TTGA---AN-T-TG--------G--C-------C-C------AGC-----GGT-T--CTGGAGAA-GA-A--GTCGAAA-ATG---TG---AAAA-----GT-----TA-ACA----GAC-A-------A--C----A-----AC-----G--AC---------G-ACAGACAA-CGG-G-AA--AA--T--C-GA-TCAG--AAA-----A-GCTCACTTGAGCCTTCG---GCTCAGGTGAGC-TAAAAA
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): AAACTCTGATGACATCATAGAGTTTTTAATGATATTTGGAATTTATAAGCTGAACAAAAAAAAAAAAAACCAAAACAAGAGGCCCATGGGCCACATCGTTCACCTGAGTACCAATGGTCCTGGTTTAGCAGTGGTGATTTAAAAAGAAAATTTTCATAATTTTTTT
Unaligned ( gi|30 ): CCTCTTCTTCTTACCATATATAAGAGGACAGAAATAAGCTACATATGTCCGTGGGTGAAGGCTGTACCTGTCCTATTCTCTATCTAAACAGAATACCTCCTACCACTATTCTT
Unaligned ( gi|31 ): GCGTGTAGGCTAATTAATTAAGGATTTCAACACATAGTAGCTAAAATAAAACCTGAACTAGAGGCCCATAGGCCATACTGCTCACCCTGTCCCTTTGCTCA
Unaligned ( gi|33 ): AAAGAAGACGTCCATGATCCACATCACCCACCTGAGTAACATCGACTCTGCTGTCCAAATTCCCACTCCGTATTATGGGGATGCTTCAATATCAATAT
Unaligned ( gi|40 ): AAACAAGACCGGCCCATGGACCACTTTCGCTGCTCACTGCCTATAGTTGACACTTCGGCCCTCGCACTCT
Unaligned ( gi|41 ): AAATTATTCCAATCATATCCTATTCTGAAGTGATAAAATTTATATTCAACTCGCATAATACAATAAT
Unaligned ( gi|44 ): AAAGTGGATTGGCATCAGGGTGTAGACAATGCCTGTCCGCTTCTTTAGAAATAATATCC
Unaligned ( gi|45 ): GAAGATGAAAATGTGAAAAATTTACGACAATAGAAACGGACAGGTGAGCTAAAAAT
Unaligned ( gi|47 ): TTGAAAACAAGAGGCCCATGGACCACAATACTTACCCGAGTCATATT
Alignments
lowQualScore : 2 2222 1 1 11 111 11111111111111111111 1111 111111111111111 111111111111 111111111111111 3333333333333333333333333 11 111111111 22222222222 11111 11 1111111111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777 11111111111111111 1111111111 11 1111111111 11111111 333333333 111111111 1111111 11111 111111 22222222 111111 111111 111111111111 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666
lowQualScore : 0 1 1 3333 1 5 1 3 1 88 7 7 777 0 2 777 5 66666666666666666666 3 555 1111 333333333333333 77777 3 555555555555 555 3 666666666666666 9999 33 33 33 5555555555555555555555555 22 5555 2 0 111111111 444 33 77777 66 9999999999999 66666666666 6 6 3 999999 3 0 33333 6 77777 55555555 2 3 6 77 44 33 3 66 3 33 2 3 3 1 3 2 444 0 2 8888 0 0 555 555 3 2222222222 3333333333333333333333333333333333333333333333333333 33 55555555555555555 2 33 77777 2 2 44 44 3 6 3 6 3 7777777777 3 999999999 44 0 11 333 66 55 6666 77 2 2 3 3 888 3 555 2 33 2 444 8888 2 2 444 2222222222 33 44444444 77777 111111111 8 66 6666 0 2 5 8888888 5555 444 5 33 2 000000000 2 2 77777 555 3 4 666 6 2222222 3 4444 2 5 6666 2 33 2 5 33 2 5555 2 66666 33 2 3 11111 3 3 44 111111 5 6 3 2 66 77777777 3 3 3 3 999999 111111 3 7777 3 555555555555 555 555 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 33 55 2 55555 2 2 33 5 999999999 2 88888888 777 999999999 2 2 33 2 6666666 3 33 33 111111 555555555 333 55 2 88888888 33 7777777 2 666666 555555 2 22 0 2 4 22 4 6 777 333 22 55555 88888 33 66666 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 2 33 66666 2 2 0 88888 3
lowQualScore : . . . .... . . . . . .. . . ... . . ... . .................... . ... .... ............... ..... . ............ ... . ............... .... .. .. .. ......................... .. .... . . ......... ... .. ..... .. ............. ........... . . . ...... . . ..... . ..... ........ . . . .. .. .. . .. . .. . . . . . . ... . . .... . . ... ... . .......... .................................................... .. ................. . .. ..... . . .. .. . . . . . .......... . ......... .. . .. ... .. .. .... .. . . . . ... . ... . .. . ... .... . . ... .......... .. ........ ..... ......... . .. .... . . . ....... .... ... . .. . ......... . . ..... ... . . ... . ....... . .... . . .... . .. . . .. . .... . ..... .. . . ..... . . .. ...... . . . . .. ........ . . . . ...... ...... . .... . ............ ... ... ............................................................ .. .. . ..... . . .. . ......... . ........ ... ......... . . .. . ....... . .. .. ...... ......... ... .. . ........ .. ....... . ...... ...... . .. . . . .. . . ... ... .. ..... ..... .. ..... .......................................................................... . .. ..... . . . ..... .
lowQualScore : 0 0 0 0000 0 5 0 3 0 33 3 3 555 8 5 888 4 55555555555555555555 3 444 6666 888888888888888 77777 1 888888888888 666 3 333333333333333 2222 33 99 99 6666666666666666666666666 55 7777 7 3 999999999 777 77 11111 88 8888888888888 88888888888 2 2 1 222222 1 3 44444 2 77777 55555555 9 1 2 00 99 99 1 55 1 99 9 1 3 0 1 7 777 5 7 5555 8 2 444 444 1 8888888888 2222222222222222222222222222222222222222222222222222 99 99999999999999999 9 99 11111 9 9 22 22 1 2 1 2 5 5555555555 1 555555555 22 8 88 777 88 99 1111 99 6 9 1 1 555 1 666 9 99 9 777 3333 7 7 777 1111111111 77 11111111 11111 111111111 6 11 8888 1 9 7 7777777 7777 777 3 77 7 777777777 7 9 77777 444 1 7 888 2 2222222 1 9999 9 7 1111 9 99 9 7 99 7 7777 9 77777 77 7 1 99999 1 1 22 999999 2 2 1 9 88 88888888 1 1 1 3 555555 555555 6 7777 1 888888888888 444 000 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 99 88 4 44444 9 7 77 3 777777777 5 22222222 888 444444444 5 5 44 5 2222222 1 44 44 888888 222222222 999 44 2 11111111 11 2222222 2 111111 888888 0 88 8 0 0 88 8 0 444 777 99 33333 99999 11 99999 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 77 77777 9 4 8 22222 6
consensus : AGCTGTATCTT-ANCCCNGGGGGTCACGATTNGTANCAAGTTT-CCTTNAAACTGACCCAGT--GGTTCTGGAGAAGAACATTTTATGTAAAA---CTTTGATC---CCCT-----A--TT----------GTGG-CCCCACC-C-TACCCCC---GGGG--G-----C----C-A-----T-GATTTGAA------------CAAA--CTT-GAAT-CT----ACNCT---ATGTC-AG-GAAGCTT--TCAN-ATAA------AT-T------C--G-C---TT--TT----CTG-GCC-----C---AG---T--G-----GT--TCT-T-----GA----GAAGA--A-----TT-TTTAAA-GAT-TT-TCCC-T----AT-ATATTC--AC-A-TG-----TAAA---AC---T-TTGATCCC-CTA-TTGTGGCCC-CATCGT--AC-CCC--GGGGGT-CATGATT--TGAA-CAAAC-TTG-AATCTNCACTATA-TCAGGA-A---GCTTTCATATAAAT-TTN-A-GCTTTTCTGGCCC---AG---TGG-T-T--------CTT----------GA------------G-------------AA------------GA--TTTT---------C-------CC-T--A-----T-AT-AT--TC--ACATGTA-A-AAC-T-TTGATC---------CCCT-ATTG-----TG-GCCC--CATCGTACCCCCGGGGGT-CATGATTTGAAC--AAA-NTT----GAATC--TCCAC-TATA-TCA-GGAA---GCTT-TCATATN--AATTTCAGC-TTTTCTGG--CC-CAG---T----G-GT-TCT---T------G---AGA--AG---A----TTTTT-----AAAGA---------TTT-CCCTAT-ATAT---TCACATGTA-A-A-------A----C---T-TTG--A-TC---------CC-CT-ATT-----G---T-GGCCCCATCG--TA-CCC---C-G-GGGGTC-ATG--ATTTGAA-C-AAA----CTT-GAATC--TC-CAC-T--ATATCAGG-AA----GCTTTCA-TA-----T--A-AAT-T-----T-CAGC-TTT--TCT------GGCC-CA-GT-GGT--TCTTG--A--A--AGAAG-A-TT-TT-T------AAATG------ACAC-C----ACCCTA-TTT------------TT---GC---AT--------------T---T-------------C-------------C-------------CT--TT-GAAGGG-G---G-CCTGGT-CCT--TCATT-T----G----AAC-AAA--C--T--TGA---AT---------C-CC-C--TT-CACC--CAA-GGATGATTTGT--ACCA--AG------TTTG----G----TTGA---A-NT-TG--------G--C-------C-C------AGC-----GGT-T--CTGGAGAA-GA-A--GTCGAAA-ATG---TG---AAA--A-----GT-----TA-ACA----GAC-A-------A--C----A-----AC-----G--AC---------G-ACAGACAA-CGG-G-AA--AA--T--C-GA-TCAG--AAA-----A-GCTCACTTGAGCCTTCG---GCTCAGGTGAGC-TAAAAA
Reference ( family-218 ) : AGCTGTATCTT-ANCCCNGGGGGTCACGATTNGTANCAAGTTT-CCTTNAAACTGACCCAGT--GGTTCTGGAGAAGAACATTTTATGTAAAA---CTTTGATC---CCCT-----A--TT----------GTGG-CCCCACC-C-TACCCCC---GGGG--G-----C----C-A-----T-GATTTGAA------------CAAA--CTT-GAAT-CT----ACNCT---ATGTC-AG-GAAGCTT--TCAN-ATAA------AT-T------C--G-C---TT--TT----CTG-GCC-----C---AG---T--G-----GT--TCT-T-----GA----GAAGA--A-----TT-TTTAAA-GAT-TT-TCCC-T----AT-ATATTC--AC-A-TG-----TAAA---AC---T-TTGATCCC-CTA-TTGTGGCCC-CATCNT--AC-CCC--GGGGGT-CATGATT--TGAA-CAAAC-TTG-AATCTNCACTATA-TCAGGA-A---GCTTTCATATAAAT-TTN-A-GCTTTTCTGGCCC---AG---TGG-T-T--------CTT----------GA------------G-------------AA------------GA--TTTT---------C-------CC-T--A-----T-AT-AT--TC--ACATGTA-A-AAC-T-TTGATC---------CCCT-ATTG-----TG-GCCC--CATCGTACCCCCGGGGGT-CATGATTTGAAC--AAA-NTT----GAATC--TCCAC-TATA-TCA-GGAA---GCTT-TCATATN--AATTTCAGC-TTTTCTGG--CC-CAG---T----G-GT-TCT---T------G---AGA--AG---A----TTTTT-----AAAGA---------TTT-CCCTAT-ATAT---TCACATGTA-A-A-------A----C---T-TTG--A-TC---------CC-CT-ATT-----G---T-GGCCCCATCG--TA-CCC---C-G-GGGGTC-ATG--ATTTGAA-C-AAA----CTT-GAATC--TC-CAC-T--ATATCAGG-AA----GCTTTCA-TA-----T--A-AAT-T-----T-CAGC-TTT--TCT------GGCC-CA-GT-GGT--TCTTG--A--A--AGAAG-A-TT-TT-T------AAATG------ACAC-C----ACCCTA-TTT------------TT---GC---AT--------------T---T-------------C-------------C-------------CT--TT-GAAGGG-G---G-CCTGGT-CCT--TCATT-T----G----AAC-AAA--C--T--TGA---AT---------C-CC-C--TT-CACC--CAA-GGATGATTTGT--ACCA--AG------TTTG----G----TTGA---A-NT-TG--------G--C-------C-C------AGC-----GGT-T--CTGGAGAA-GA-A--GTCGAAA-ATG---TG---AAA--A-----GT-----TA-ACA----GAC-A-------A--C----A-----AC-----G--AC---------G-ACAGACAA-CGG-G-AA--AA--T--C-GA-TCAG--AAA-----A-GCTCACTTGAGCCTTCG---GCTCAGGTGAGC-TAAAAA
gi|1 : TGAG-T-GAC----CTT-GGCCC--TCGCAC-TCTATATCAGG-AA----GCTTTAA-GG-----T--A-AATGT-----TGTAAC-TT-----T------GG--------------TCTTG--------AGAAG-A-TT-
gi|1 : acaagaggcccatgggccacatcgctcaccCTATA-TCAGGA-A---GCTTTAAGGTAAATGTTGTA-ACTTT-----------------GG-T----------CTT----------GA------------G-------------AA------------GA--TTAC---------C-------CC-T--A-----T-AT-ATAATC--ATGTGTA-A-AAC-T-TTGATC---------CC-T-ATTG-----GGCGCCCACCATCGTACCTCCGGGGGT-CATGATTTGAAC--AAA-CTT----GAATC--TCC-T-TATA-TCACGGAA---GC-G-TCATA-A--AATATCAGC-TTTCCTGGTCCC-CAG---T----G-GG-TTT---T------G---AGA--AG---AAAACTTTTT-----AAAAAAT-------TTT-CCCTG----AT---TC---T-TG-A-A-------A----CAAAT-TTGCAA-TC---------CCACT-ATacccctatatataatcatgtgtaaaactttgatccctattgggcgcccaccatcgtacctccgggggtcatgatttgaacaaacttgaatctccttatatcacggaagcgtcataaaatatcagctttcctggtccccagtgggttttgagaagaaaactttttaaaaaattttccctgattcttgaaacaaatttgcaatcccactatatcagtagagctttccaatgaatctcagctttcctggcccaaggttggttttcttttcctttttcgaacagaagaagatttttaagacttcctcaatatcaatcacatgctaaaccttgatccctattgtggcccctcgtaccccgggggtcatgatttgaaccaaactttaatctccactatattcaggacttcccatattaatctcagcttcctggtccagacatgtgttcttcgaaagaatttttaaaggatttttccctatataatcatatgtagaaactcttgatcccataattgtggcccatcataccccaggggtcaatttgaacaaaacttgaatctcctctatattaggagcttccatatacaatttcagctttcgtctggcccagtggttcttgaagaagaagaattgttttgttaaaatcacaccacctattttttgcgcattgtttgtgattatctcccctttgaaggggctcggtccttcattgaacaaactgaatctccttcacccaagggatgattggtatcaagtttggttgaatattggcccagtggtctcttgagaaaaagtcgaaaatgtgaaaagttagacgacagacagaagg
gi|1 : acaagaggcccatgggccacatcgctcacctgagtgaccttggccctcgcactTGATTCTTGAAACAAAT-TTGCAATC-CCACTATA-TCAGTAGA---GCTTTCCAATGAAT-CTC-A-GCTTTCCTGGCCC---AAGGTTGG-T-TTTCTTTTCCTTTTTCGAACAGAA------------G-------------AA------------GA--TTTT---------TAAGACTTCC-TCAA-----T-ATCAA--TC--ACATGCT-A-AAC-C-TTGATC---------CC-T-ATTG-----TG-GCCC--C-TCGTACCCC-GGGGGT-CATGATTTGAACC-AAA-CTT----TAATC--TCCAC-TATATTCA-GGA-----CTTCCCATATT--AATCTCAGC--TTCCTGG--TC-CAGACAT----GTGT-TCT---TC-----G---AAA--GA---A----TTTTT-----AAAGGATT------TTT-CCCTAT-ATAA---TCATATGTAGA-A-------A----C---TCTTG--A-TC---------CC-ATAATT-----G---T-GG-CCCATCA--TA-CCC---C-A-GGGGTC-A----ATTTGAA-CAAAA----CTT-GAATC--TC-CTC-T--ATATTAGG--A----GCTTCCA-TA-----T--ACAAT-T-----T-CAGC-TTTCGTCT------GGCC-CA-GT-GGT--TCTTG--AAGA--AGAAGAA-TTGTT-TTGTTA-AAATC------ACAC-C----A-CCTA-TTT------------TTTGCGC---ATTGTTTGTGATTATCT---C-------------C-------------C-------------CT--TT-GAA-GG-G---G-CTCGGT-CCT--TCA-T-T----G----AAC-AAA--C-----TGA---AT---------C-TC-C--TT-CACC--CAAGGGATGATTGGT--ATCA--AG------TTTG----G----TTGA---ATAT-TG--------G--C-------C-C------AGT-----GGTCT--CTTGAGAA-AA-A--GTCGAAA-ATG---TG---AAA--A-----GT-----T----A----GAC-G-------A--C----A--------------------------G-ACAGAatcagtagagctttccaatgaatctcagctttcctggcccaaggttggttttcttttcctttttcgaacagaagaagatttttaagacttcctcaatatcaatcacatgctaaaccttgatccctattgtggcccctcgtaccccgggggtcatgatttgaaccaaactttaatctccactatattcaggacttcccatattaatctcagcttcctggtccagacatgtgttcttcgaaagaatttttaaaggatttttccctatataatcatatgtagaaactcttgatcccataattgtggcccatcataccccaggggtcaatttgaacaaaacttgaatctcctctatattaggagcttccatatacaatttcagctttcgtctggcccagtggttcttgaagaagaagaattgttttgttaaaatcacaccacctattttttgcgcattgtttgtgattatctcccctttgaaggggctcggtccttcattgaacaaactgaatctccttcacccaagggatgattggtatcaagtttggttgaatattggcccagtggtctcttgagaaaaagtcgaaaatgtgaaaagttagacgacagacagaagg
gi|10 : acaagaggcccatgggccacatcgctcacctgagtgaccttggccctcgcactctatatcaggaagctttaaggtaaatgttgtaactttggtcttgagaagattacccctatatataatcatgtgtaaaactttgatccctattgggcgcccaccatcgtacctccgggggtcatgatttgaacaaacttgaatctccttatatcacggaagcgtcataaaatatcagctttcctggtccccagtgggttttgagaagaaaactttttaaaaaattttcccGGGGAT-CATGAATTGAAC--AAA-CTT----AAATA--TCTCC-TACA-TCA-GGTA---GCTT-TAATGCC--AATCTCAGC-TTTTCCGG--CC-CAA---T----G-AT-TCT---C------G---AGA--AG---A----TTTTT-----AAAGAT--------TTT-CCCTTT-ATAT---CCACATGTA-A-A-------A----C---T-TTG--A-TC---------CC-CT-ATT-----G---T-GTCCCCATCT--TA-CCC---CTG-GGGGTC-ATG--ATTTGAA-C-AAA----CTT-GATTT--TC-CAC-T--ATACCAGG-AA----GGTTagg
gi|10 : ATCTT-ACCCCTGGGGGTCATGATTTG-AACAAACTTGATTTTCCACTATACCAGGAAGGTTCTGGAGAAGATGATT---TGTAAA-------TGACCACACCTT-----A--TTTTGCATTTTGGTGA---TTATC-T-TGCCTTTGAAGGGG--G-----C----CTAGTCCTT-CATTCGAA------------CAAA--CTT-GAAT-T------CTCT------TC-AACCAAG--------G-ATAA------TT-TGTGCAAC--G-T---TTGGTTGAAATTG-GCC-----T---AG---T--G-----GT--TCT-G-----GA----GAAGctggagaagatgatttgtaaatgaccacaccttattttgcattttggtgattatcttgcctttgaagggggcctagtccttcattcgaacaaacttgaattctcttcaaccaaggataatttgtgcaacgtttggttgaaattggcctagtggttctggagaagttgaaaatgtgaaaagttaacagacagacaaaagacagacaaagggcaatcagaaaaaaactcacttgagtcttcggctcaggcgagctaaaa
gi|10 : ggggatcatgaattgaacaaacttaaatatctcctacatcaggtagctttaatgccaatctcagcttttccggcccaatgattctcgagaagatttttaaagattttccctttatatccacatgtaaaactttgatcccctattgtgtcccc-GGT--TCTGG--AG-A--AGATG-A-TT-TG-T------AAATG------ACCA-C----ACCTTA-TTT------------T----GC---AT--------------T---T-------------TGGTGATTATCTTGC-------------CT--TT-GAAGGG-G---G-CCTAGT-CCT--TCATT-C----G----AAC-AAA--C--T--TGA---AT---------T-CT-C--TT-CAAC--CAA-GGATAATTTGT--GCAA--CG------TTTG----G----TTGA---A-AT-TG--------G--C-------C-T------AGT-----GGT-T--CTGG---A-GA-A--GTTGAAA-ATG---TG---AAA--A-----GT-----TA-ACA----GAC-AG------A--C----A-----A---------AA---------G-ACAGACAA-AGG-G------------C-AA-TCAGAAAAA-----A-ACTCACTTGAGTCTTCG---GCTCAGGCGAGC-TAAAAttgaaaatgtgaaaagttaacagacagacaaaagacagacaaagggcaatcagaaaaaaactcacttgagtcttcggctcaggcgagctaaaa
gi|11 : ggggatcatgaattgaacaaacttaaatatctcctacatcaggtagctttaatgccaatctcagcttttccggcccaatgattctcgagaagatttttaaagattttccctttatatccacatgtaaaactttgatcccctattgtgtccccatcttacccctgggggtcatgatttgaacaaacttgattttccactataccaggaaAGC-TTTTCTGG--CC-CAG---TTCCAG-GT-TCT---T------G---AGA--AG---AAGA-TTTTT-----AAATA---------TTTTCCCTAT-TTAA---ACACATGTA-A-ATAATTAAA----T---T-ATG--A-TA---------CC-CT-AAT-----G---T-GGCCCCATCA--TA-CCC---C-CCGGGGTC-ATG--ATTTGAA-C-AAA----CTC-AAATC--TC-TAC-T--ATATCAAG-AA----GCTTTGA-TA-----T--A-AAT-T-----T-AAGC-TTT--TTTT-----GGCC-CA-GT-GGT--TCTTG--AG-A--AGAAG-A-TT-TT-T------AAATG------ACAC-C----ACCCTA-GTT------------TT---GC---AT--------------T---T-------------T-------------CGTGATTATCTCCTCT--TT-CATGAG-G---G-CCTAGT-CCT--TCATT-T----G----AAC-AAA--C--T--TGG---AT---------C-CC-C--TT-CAC--------------------ACCA--AA------TTTG----G----TTGA---A-TTATG--------G--C-------C-C------AGC-----GGT-T--CTGGAGAAGGA-A--GTCGAAA-ATG---TG---AAA--A-----GT-----TA-ACA----GAC-A----------------------------G--AC---------A-ACATACAA-AAG-G------------C-GA-TCAG--AAA-----A-GCTCACTTGAGCCTTTG---GCTCAGGTGAGC-TAA
gi|12 : a-------A----C---T-TTG--ACTC---------CG-CC-ATT-----GCAAT-GGACTCAACAATTA-CCTACAC-G-ACGATC-A-G--ACTTGAAAC-AAA----TTTCGAGAT--GC-CACAT--ATATTGAG-AAATGTGCTTTTA-CAATAAAT--A-AAT-TGTGTTT-CAGT-CTT--TCTCTGCGGGACCGCA-GTCGGTGATCTTG--A--AGGAGAAG-AGTC-TT-TGTTTGAAAATGTATCGCACAC-CCATAACC--A-TTTGAATATGCTAATCT---GCGATAT--------------TAC-T-------------C-------------C-------------CT--TTAGCAGAG-G---GACCTCACGCCT--CCATGAT----GTAGTAAC-AAAAACAATGATGAGA-ATGCCCCACGGC-CT-C--TTACACGAACAC-GGATGATTTGC--ACTA--GGAGAAGGTTTG----AGATATCGACACG-GT-TG--------G--C-------TAC------A-C-----ATT-TTTCTGGAGAA-GAGA--GTCGAAATATGGTATA---AAA--AATGATAT-----TA-ACA----GAta
gi|13 : CAGG------GCTTCCGTA---GT-TTC-A-GCTTTTTTAGCCT---AG---TGG-T-T--------CTT----------GA------------G-------------AA------------GA--TTTT---------T-------TC-T--A-----C-CT-AT--TC--ACATGTA-C-AAC-T-TTGATT---------CCCT-ATTG-----TG-GCCC--CATCGTATCTCCTGGGGT-CATGATTTTAAT--AAA-GTT----GAATA--TCCAC-TATA-TGA-GGAA---GCTT-TCATATA--AATTTCATC-TTCTCTGG--CC-CAA---T----G-AT-TCTTGAT------G---AGA--AG---A----ATTTT-----GAAGA---------TTTGCCCTAT--TAT---TCACATGTA-A-A-------A----C---T-TTG--A-TC---------CC-Cgaggaga
gi|14 : TA-TTT------------TC------------------------T---C-------------C-------------C-------------CT--TTCGATGGG-AAATG-CATGCA-CCT--TCATT-T----G----AAC-AGA--T--T--TGA---AT---------T-CC-C--TT-CATC--AAA-ATATGCTTTAT--GGCAACAGTTAC--TTTG----A----TTGA---A-A--TG--------G--C-------C-C------AGCTTTTTTTT-T--TTTAAG------A--TTTAAAA-ATA---TATTCAAA--G-----TT-----TT-ACATATGGATGA-------A--C----AG----ACT----G--AC---------A-ATTAACAATTAG-C-AA--AA--TG-T-GA-TCAG--AAA-----A-GCTCACTTCAG
gi|15 : cacccattttttcatttgctgatca-----T--A-ATT-T-----T-CAGC-TTT--TCT------TGCC-CA-GT-GAT--TCTTA--T--A--AGAA---------------------------------------TCCTA-CTT------------TT---GC---AT--------------T---TTCTTGATTTTCTCC-------------C-------------CT--TT-CAAAGG-A---G-CATGTT-TTT--T--TT-T---------AAC-A----------TGATCAAT---------C-CCGC--TT-TAT-------GGG-------------A--AA------TTTG----A----TTGA---A-AT-TA--------G--C-------C-C------TGC-----AGT-T--ATGGAGAA-GA-G--ATCGAAA---G---AA---AAA--A-----AG-----TATACA----GAT-G----------------------------G--ACA--------G-ACAGACAA-CGG-ACAA--AA--T-----A-T-------A-----A-GCT----------TTTG---GCTCAGGTGAGCTTAAAAA
gi|16 : TA-TTT------------CT---GT---AT--------------TATCT-------------C-------------C-------------CC--TT-TAAGGG-A-----CCCGGT-CCT--TCCTT-TAATTG----AAC-AAA--C--A--TGA---AT---------C-CC-T--TT--ATC--CAA-GGATGATTTGC--ACCA--AG------TTTG----G----TTGA---A-AT-GT--------G--C-------C-C------AGT-----TG--T--CT------------------AA-ATG---TG---AAA--A-----GT-----TA-ACG----GAC-A-------A--C----GT----GCA----G--AT---------G-ACGGACAA-CAG-G------------C-GA-TCAG--AAA-----A-GCT-ACTTG---CCTCG---GCTCAGGTGA-C-TAa
gi|17 : accacaccatttatttAC-C----ACCCTA-TTT------------TT---GC---AT--------------T---TTCGTGATTATCTCC-------------C-------------CT--TT-GATGAG-G---G-CCTGGT-CCT--TCATT-T----G----AAC-AAA--A--T--TGA---AG---------C-CC-C--TT-CACC--CAA-GGATGATGTGT--ACCA--AG------TTTG----G----TTGA---A-TT-T---------G--C-------C-C------AGC-----GGT-T--TT-GAGAA-GA-A--GTTGAAA-ATT---TG---GAA--A-----GT-----TT-AC-----GAC-G-------ACCC----A-----AC-----G--GC---------T--CAGGTGA-GCT-A-AA--AA--T--A-GG-TCAG--AGA-----
gi|18 : ---T----G-GT-ACT---T------T---GGA--GG----------TTT-----AAAGAGAAATTTGTTTT-CCATATCATAT---TCCAATATA-T-A-------A----T---T-T--------------------CT-GTT-----G---T----CCCATCC--TGGTCC---T-G-GAATTC-ATG--GTTTAAA-C-AGA----GAT-GGATCCTTC-AAC-T---CAT-AAG-AA----GCTTTCA-TG-----C--A-Attaaatactcg
gi|18 : tggttcaacagtttcagagaagaaaattaata--TTTT---------C-------CA-T--A-----TCAT-AT--TC--CAATATA-T-AAT-T-T----------------CT-GTTG-----T----CC--CATCCTGGTCCTGGAATT-CATGGTTTAAAC--AGA-GAT----GGATCCTTCAAC-T-CA-T-A-AGAA---GCTT-TCATggattgaatttactactagtaattc
gi|18 : tggttcaacagtttcagagaagaaaattaatatggtactttggaggtttaaagagaaatttgT----------GTTG-TCCCATC-C-TGGTCCT---GGAA--T-----T----C-A-----T-GGTTTAAA------------CAGA--GAT-GGAT-CCTTCAACTC----AT----AA-GAAGCTT--TCAT-GCAAGG----AT-T------G--A-A---TT--TA----CTA---C-----T---AG---T--A-----AT--TCgcaaggattgaatttactactagtaattc
gi|19 : tggttcaacagtttcagagaagaaaattaatatggtactttggaggtttaaagagaaatttgttttccatatcatattccaatatataatttcTTAGG-AA----GTTTTCA-TG-----T--A-AAA-TAG---T-CA---CAT--TCT------GGTCGCATGT-GGT--CCTT------A--AGAAG-A-CA-TT-C------AAATG------CCCA-C----AACCTAGTTT------------GG---GC---AT--------------T---T-------------
gi|19 : ---AT--------------C---T-------------CT------------C-------------CT--TT-AAAAGG-G---G-AATAGT-CCT--GCATT-T----G----AACAAAA--C--A--TGA---AT---------tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattatctctcctttaaaaggggaatagtcctgcatttgaacaaaacatgaatat
gi|2 : ttaggaagttttcatgtaaaatagtcacattctggtcgcatgtggtccttaagaagacattcaaatgcccacaacctagtttgggcattttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattAGCTGTATCTTNAACCCAAGG----ACGATTAGTACCAAGTTT-CCTTGAAATTGACCCAAT--GGTTCTGGAGAAGAACATTTTATGCAAAA---CTGAGATC---CCCT-----A--TT----------GTGG-CCCCTCC-C-TACCCCC---GGGG--G-----T------A-----T-GATCTGCT------------CAAA--TTT-GGAT-CT----ACTAT---ATGTC-AG-GAACCTT--TAAG-GTAA------ATAT------T--G-T---TTC-TT----CTG-GTC-----C---AA---T--G-----GT--TCT-T-----GA----GAAGACGA-----TT-TTTAAA-GAT-TT-TCCC-T----AT-ATATTC--TT-A-TG-----TAAA---AC---T-TTGATCCC-CTA-TTGTGGCCC-CATCGT--AC-CCC--GGGGGT-CATGATT--TGAA-CAAAC-TTG-AATCTTCACTATA-TCAGGA-A---GCTTTCATATAAAT-TTA-A-GTTTTTCTGGCCC---AG---TGG-T-T--------CTT----------GA------------G-------------AA------------GA--TTTC---------C-------CC-T--A-----T-AC-AT--TC--ACATGTA-A-AAA-T-CTTATC---------CCCT-A--A-----TG-GCCC--CATGGTACCCCCGGGGTT-TATGATTTGAAC--AAA-ATG----GAATC--TTCAC-TATT-TCA-GGAA---GCTT-TCATATC--AATTTCAGC-TTTTCTGT--CC-CAG---T----G-GT-TCT---T------G---AGA--AG---A----TTTTT-----AAAGA---------TT-----TAT-ATA-----------TA-A-A-------A----C---T-TTG--A-TT---------CC-CT-AAT-----A---T-GGCCCCACCG--TA-CCCAA-G-G-AGGGTC-GTG--GTTTGAA-C-AAA----CTT-GAATC--TC-CAT-T--ATATCAGG-AA----GCTTTTA-TA-----T--C-AAT-T-----T-CAGC-TTC--TCT------GACC-AA-AT-GGT--TCTTGTCA--A--AGAAG-A-TT-TT-T------AAATG------ATAC-C----ACCCTA-TTT------------TT---GC---A---------------------------------C-------------C-------------AT--TT-GAAAGG-G---G-TCAGGT-CCT--TCATT-T----G----AAC-AAA--C--T--TGA---AT---------C-CC-C--TT-TACC--CAA-GGATGATTTGC--ACCA--AG------TTTG----G----TTGA---A-TT-TG--------G--C-------C-C------AGT-----AGT-T--CTGGAGAA-GA-A--GATGAAA-ATG---TG---AAA--A-----GT-----TT-ACA-----AC-A-------A--C----A-----AC-----G--AT---------T-ACTGACAA-CGG-G-AA--AATTT--T-GA-TCAG--AAT-----A-GCTCACTTAAGCATTCG---GGTCAGGTGAGC-TAAAAAat
gi|20 : TTTCCAC-TTTTCTGG--CC-CAG---T----T-GT-TCG---T------G---AGA--G---------TTTTT-----AAAAA---------TTC-CCATAA-ATAT---TCGCATGTA-A-A-------A----C---T-TTG--A-TT---------CC-CT-ATT-----G---T-AGAACCACCC--TA-CCC---A-A-AAGGCA-ATAGTATTTG---C-AAA----TTT-GAATC--TG-CAC-A--ATGCCAGA-AA----GCTTTTA-TG-----T--A-
gi|21 : atgttagaaagtaatAAGCTT--TCAA-CTGT------AT-T------C--T-A---CT--TT----CTG-GCC-----C---AG---T--T-----GT--TCGAT-----GG----GAAGA---------T-TTTAAA-GATGCT-TCCC-T----A--ATATGCT-GC-ATTG-----TACA---AC---T-TTGATCCC-TTT-TTGTGGCCT-T-TCCT--AC-CC----------AAAGATT--TGAA-CAAAT-TGA-AATCTATCCTG-A-TCA-GA-G---GCGTTCATG-AAAT-
gi|23 : --TT-GAAGAGCA---G-CC-----CCTCATCATCAT----G----AAC------T--T--TGA---AT---------CTCC-C--TT-CATG--TAA-T-ATG--TTAT--GCCA--CA------TTTG----T----TTGA---A-AT-TT--------A--C-------C-A------AAT-----GGT-C--GTGCAGAA-AA-A--GT-------------G---AAAACA-----GT-----TG-Acc
gi|24 : ------AGT-----GCC-T--CTGGAGAA-GA-A--GT------------TG---AAA--A-----GT-----TA-ATT----TAT------------C-----------C-----A--AG---------G-ACAAATCC-TAG-T-TA--AA--TGTT-GA-TCAG--AAC-----ACACTCACTTGAGCCTTTATTAGCTCAGGTGAGC-TACAAttatgaggaaagagctttgcattagaaaactcagtaacttttttcagctc
gi|25 : ggacgttttgggtcaatttaaaggaatttaaagctcagtttt-AAA--C--T--TGA---AT---------A-TC-AAATT-TACC--AAA-GAAAAACTTA-----CA--AT------TTTG----A----TTGA---C-AC-TA--------G--C-------T-G------AAA-----AGT-T--CAGGAGAA-GA-A------AAC-ATG----------A--A-----G----------------GAA-A-------A--C----------AC-----A--A------------ACAGA-AA--GG-C-GG--CA--T--CTGA-TCAG--A------------CATTTAAATAAGTG---ACTCAGGTGAGC-TAAAAA
gi|26 : T---------C-TT-C--TT-CATC--CAA-AG-TG-TTTGT--ACAA--AA------TGTGTAATG----ATGG---A-TT-TGATGATGAGG--CAAACTGGC-C------AGT-----GAT-T--CTGGAGAT-AA-A--GAAAAAATATT---TG---CAA--A-----GT-----TA-ACA----GAC-A-------A-------A-----TG-----G--ATG--------G-ACAGAC
gi|27 : gaactaattaggaaatgCCC-T----AT-ACATGT--AC-A-TAGGCATCAAA---A--------GCTCCC-CTA-TTGTGGCTC-AAACCT--AC-CCCT-GGGGGC-AATGATT--TGAA-TAGAT-TGG-AATCTACTTTATA-TAAGAA-A---AC-TTCAT-TAAAT-
gi|27 : TC---CCCT-----A--TT----------GTGG-CTCAAAC-C-TACCCCT---GGGG--G-----C----A-A-----T-GATTTGAA------------TAGA--TTG-GAAT-CT----ACTTT---ATATA-AG-AAAACTTCATTAA-ATAA------aactgcatactattggtgtgcatt
gi|28 : ccctatacatgtacataggcatcaaaagcT-T--CTGGAGAA-GAGA--GTCGAAATATGGTATA---AAA--A-----ATGATATTA-ACA----GAG-AGGAGAAGA--CTCAGA-----AC-----GTGAC---------GCACGGACA--CAA-A-AA--GA--G--C-AACTCAG--AAA-----A-GATCACCTCAGCCTC-----GCGCAGGTGAGC-ctgcatactattggtgtgcatt
gi|29 : -CCT--TCATT-T----C----TAC-AAA--C--T--TGA---AT---------T-------TT-----------GAAT--TTCCTTAACTA--AA------GTTG----G----TTGA---A-AT-AA--------G--T-------C-T------AAT-----TGT-T--CTGGAGAA-GC-ATCGTCGGAA-ctcaa
gi|3 : actctatgtttgacttttcttgattatctcTGTAAGATTGCTTT-ATC---CC-T-----AATTT----------GTG----CCACC-C-AACCCCC---GGGG--GGTTTACGAGGC-A-----TTAATCTGAA-------------AAA--CTC--AAT-CT----ACGTCCAAATATCGAT-GAAG--T--TCAGGATAAT-----AT-C------C--A-C---TT--TC----TTGTGTT-----C---AA---T--GTATGTAT--TTT-T-----TA----AAAGA--A-------------------TT-TCCC-TACTAAT-ATAATT--GC-ACTG-----TAAAAATAT---T-CTGATCCT-TTG---GTGGCCCACAT--T--AC-CCT--GGGGTT-CATGAAT--TGGA-C-AGC-TTT-TATGCTCGCTATA-TCAGG--A---GCTT--ATACAAAT-CTA-A-GCTTTCCTGGCCCTTTAT---TGG-TCT--------CTT----------GACGAAGATTTTTTA-------------AA------------GA--TTTT---------C-------CCAT--A-----T-AT-AA--TCTGATATATA-A-ATC-TATTGATT---------CCCTAATTG-----GG-GCCC--CATTGTACCCCTGGGGGTGCATGAATTAGAA--AAC-GTT----GAATC--T-AAC-TATA-TCA-GGAAAATG-TT-TCATATA--AATTCC-GA-TTTTC-GG--CC-TAG---TG---G-GT-TCT---T------G---AGAATAG---A----AGATT-----AAAGAATT------TTT-CCCTAT-ATAA---TCATACGTA-ACA-------A----C---TGTT-----TT---------CC-CT-ATTGAACCG---T-GCCCCTATCG--TA-CCC---C-C-GGGATC-ATG--ATTTGAA-C-GAAATTTTTT-GAATT--TC-CACAT--ATATCAGGAAA----GCTTTCA-TA-----TACA-AAT-T-----T-CAGTACTT--TCT------AGCC-C--GT-GGTG-TCCTG-----G--AGAAG-A-TT-TT-T------
gi|3 : cttataagaatctatctctacaatacgttTGTAAAAATATTCTGATC---CTTT-----G--------------GTGG-CCC-ACA-T-TACCCT----GGGG--T-----T----C-A-----T-GAATTGGA------------CAG---CTT-TTATGCT-----CGCT---ATATC-AG-GA-GCTT----AT-ACAA------AT-C------TAAG-C---TT--TC----CTG-GCC-----CTTTAT---T--G-----GTC-TCT-T-----GAC---GAAGA--T-----TT-TTTAAA-GAT-TT-TCCCAT----AT-ATAATCTGAT-A-TA-----TAAA---TC---TATTGATTCC-CTAATTGGGGCCC-CATTGT--AC-CCCT-GGGGGTGCATGAAT--TAGA--AAACGTTG-AATCTA-ACTATA-TCAGGA-AAATG-TTTCATATAAAT-TCC---GATTTTC-GGCCT---AG---TGGGT-T--------CTT----------GA------------G-------------AATAGAAGATTAAAGAATTTTT---------C-------CC-T--A-----T-AT-AA--TC--ATACGTA-ACAAC-TGTT--TT---------CCCT-ATTGAACCGTG-CCCC--TATCGTACCCCCGGGA-T-CATGATTTGAAC--GAA-ATTTTTTGAATT--TCCACATATA-TCA-GGAAA--GCTT-TCATATACAAATTTCAGTACTTTCTAG--CC-C-G---T----G-GTGTCC---T------GG--AGA--AG---A----TTTTTTTTTTAAAGA---------TTT-TTCCAT--TATAAATCATATGTG-A-A-------ATACTC---T-TTG--A-TC---------CC-TC-AT------A---T-GGCCTCATCG--TA-CCC---C-G-GGAGTC-ATT--ATTTGAA-C-AAA----CTT-GAATC--TC-CAT-T--AGATCAGA-AA----TTTTTCA-TT-----T--A-AAT-T-----T-CAGC-TTT--TCT------AGTC-CA-GT-GGT--TCTTG--A--G--Atttttaaagatttttccattataaatcatatgtgaaatactctttgatccctcatatggcctcatcgtaccccgggagtcattatttgaacaaacttgaatctccattagatcagaaatttttcatttaaatttcagcttttctagtccagtggttcttgagaacaaaa
gi|32 : cttataagaatctatctctacaatacgtttgtaagattgctttatccctaatttgtgccacccaacccccggggggtttacgaggcattaatctgaaaaactcaatctacgtccaaatatcgatgaagttcaggataatatccactttcttgtgttcaatgtatgtattttttaaaagaatttccctactaatataattgcacG------TTTA----G----TTGA---A-AT-TG--------A--T-------C-C------AAC-----GAT-T--CCGGAGA-----A--GTTGAA-------------------------------------------------------------G-----AC-----G--AC---------G-G-AGAC---CGA-G--A--TA--T--T-AA-ACAG--AAAAGCTGA-GCTCACTTCAGTCCTCA---GATCAAGTacaaaa
gi|34 : G-CCACACCTC-TACCACC---AGGGCGG-----C----C-A-----C-GATTT-AA------------TGGA--CTT-AAAT-------ATTTT---AT-TT-AC-GGAACTT--TCAT-ATAA------AT-T------T--T-T---TT--TT----CT--GCC-----T---AG---T--
gi|35 : gt-----C----C-A-----T-GGTTTGAA------------CAA-------GAAG---------------ATG---AA-GAAGCTT--CTAC-ACAAG-----AT-A------T--G-T---TTA-TT----CTG-GTC-----C---AC---T--G-----GT--TCT-T-----GA----GAA
gi|36 : gaggat---CTTT-ATT---CCCTTGAAAA--TG----------ATGGTCCCCACT-T-TACCCCC---GGGG--G-----G----C-A-----T-GGTTTGAA------------CAAA------GAAT-tacccatcccc
gi|37 : gatctttgaaatgtctttttgagtT-TTTAAA-GGA-CT-TTCC-A----AT-ATAATC--CCTA-TT-----CTAA---TC---T-ATGATCCC--TA-T-ATGGTCC--ATCCA--AC-CCC--GGGAGT-TACAATT--TGAA-
gi|38 : -----G--AT---------G-CCAGACAA-CTT-A-AACAAACTT--C-AA-TCAG--AAA-----A-GCTCACTTAAGTTTTCA---GCTAAAGTGAGC-TAAAAAattg
gi|39 : ataGA---A-TT-TG--------G--T-------C-C------AGT-----GGT-T--CTAGAGAA-GA-A--GGTGAAA-ATG---TG---AAA--A-----GTTTA--TA-AC-----GAC-G-------G--C----G-----AC-----G--AC---------A-ACAGA
gi|4 : CT---ATATC-AG-GAATCTT--TCAT-ATAA------A------------G-C---TT--TT----CCT-GCC-----C---AG---T--G-----GT--TCT-C------------AAGA--A-----C----------AT-TT-TCCC-T----AT-ATATTC--AC-A-TG-----TAAA---TC---T-TTGATCCC-CTA-TTTTGGCCC-CACCGT--CT-CCCT-GGGGGT-GATGATT--TGAA-CGAAT-TTC-AATCTCCACTATA-TCAGGA-A---GCTTTCATATGAAT-TTT-G-GCTTTTCTGGCCA---AG---TGG-T-T--------CTT----------GA------------GAAGAAGATATTTAAA------------GA--TTTT---------C-------CC-T--A-----T-AT-AT--TC--ACATGTA-A-AAC-T-TTGATCCCCCTATTGCCCT-ATTG-----TA-GCCC--CACCATATCCCCAGGGAT-CATGATTTAAAC--GAA-TTT----CAATC--TCCAC-TATA-TCA-GGAA---GCTT-TCATATG--AATTTTGGC-TTTTCTGG--CC-AAG---T----G-GT-TCT---T------GAGAAGA--AG---A----TATTT-----AAAGAT--------TTT-CCCTAT-ATAT---TCACATGTA-A-A-------A----C---T-TTG--A-TCCCCCTATTGCC-CT-ATT-----G---T-AGCCCCACCA--TATCCC---C-A-GGGATC-ATG--ATTTAAG-C-GAA----TTT-CAATC--TC-CAC-T--ATATCAGG-AA----GCGTACATTA-----A--A-AAT-T-----T-CAGC-TTT--TCT------GGTC-CA-GT-GGT--TCTTG--------AGAAT-A-TT-TT-T------AAATG------ACAC-C----ACCCAA-TTT------------TT---AC---AT--------------T---TTCGTGATTATATCC-------------C-------------CT--TT-GAAGAA-A---G-CCCAGT-ACT--TCATT-T----T----AAC-AAG--C--T--TGA---AT---------C-CC-C--TG-CACC--GAA-GAATGATTTTT--ACTA--AG------TTTG----G----TTGA---A-TT-TG--------G--T-------C-C------AGT-----GGT-T--CTGGAGAA-GA-A--GTCGAAA-ATG---TG---AAA--T-----GT-----TA-ACG----GAC-AG------A--C----AGATAGACAGAAAG--ACGGACTGACTG-ACATACGA-CGG-A-CAGGAG--G--C-GA-TCAG--AAA-----A-GCTCGATTGAG
gi|42 : a-A---ACTTTTGCATAAGT-TTG-GTGATTTT-TGGCCC---CA---TTG-T-T--------CTG----------GA------------C-------------A-------------GA--TTTT---------G-------CC-T--A-----T-AT-
gi|43 : cctcTAAAA---TGTTGATC---CCTT-----A--TT----------GTGA-CTGCACA-T-TACCCCT---AGGG--G-----T----C-A-----T-GATTTGAT------------CAAA--Cc
gi|46 : TGGCCC-CATATT--GC-CCCT-GGAGGT-CATAATA--TGAA-CACAC-TT
gi|48 : -TTTAAA-GAT-TT-TCAG-T----AT-ATATTT--AC-A-TG-----TCAA---AT---T-TTGATCCcatctt
gi|49 : C---T-TTGATCCC-CTA-TTGTGGCCC-TATCAT--A
gi|5 : --TT----------GTGG-CCCCATT-T-TGATCCC---TGGG--A-----C----C-A-----C-TATTTGAA------------CAAA--CTT-TAAT-TT----ACACT---TTGCA-AT-GATGCTT--TCAT-ATTA------AT-T------T--GAC---AT--TT----TTG-AACATT--C---AC---T--A------T--TCT-T-----CA----GATGA--AGATTTTT-TTTAAA-AAG-TTATTTT-TG---AT-AAACTT--A----TG-----CTAA---AT---T-TTG--CCCATTA-CTGTC-CCC-CACCCTTAAC-CCT--GGG--T-CACCATT--TGAA-CAAAC-TTG-AATTTACACTTCC-TCAAGA-A---GCTTTCACATAAGT-TTG-G-TAATTTCTGTCCT---AG---TGG-T-T--------CTG----------GA------------G-------------AA------------GA--ATTT---------C-------CC-T--------T-AT-AT--CA--GCATGTA-A-AAC-T-TTG-----------------ATTG-----CG-ATCC--CATCCTACCTCATGGAA--CACAATCTGAACAAAAA-GTT----GAATC--TACTC-CATA-TTA-GGAA---GCTT-TCAGACC--A---------------GG--TA-CAA---G----G-AG-TCT---T------G---AGA--AGAACA----TTTTG-----AAGAA---------TTT-CCCTAT-ATAT---TCGCATGTT-T-A-------A----C---T-TTG--A-TC---------CC-CT-ATT-----G---T-GGTTCCTACT--TA-TCC---C-G-GGGGTC-AAA--ATTTCAA-C-ATT----TTT-GAATC--TC-CGC-T--ATATCAGG-AA----GCTTTCA-TA-----T--A-AAT-T-----T-CAGT-CTT--TCT------AGAA-AA-GC-GGT--TCTTG--A--A--AAAAT-A-GT-TC-T------AAATG------ACAC-C----ATCCTA-TTT------------CT---GC---AT--------------T---T-------------T-------------C-------------ATGATT------A-T---C-CCTGGT-CCT--T-------------------------------------------------CC-C--TG-CACT--CGA-GGATGATTTGT--ACCA--AG------TTTG----G----TTGA---A-TT-TG--------G--T-------C-CAGCGTGAGC-----GGT-T--CT---GAA-GA-A--GTGGAAA-ATG---TG---AAA--A-----GC-----TA-ACA----GAC-AG------A--T----AGATGGACA----G--AC---------G-ACAGACAA-AAG-G-AG--A------C-CA-TGAG--AAA-----A-ACTCACTTGAATCTTTA---GATCATGTGAAG-TAAA
gi|6 : T-T------T--G-C---TT--TA----CTG-------------AG---TTTG-----TT--TCT-TCATACGATCATGAAGA--AAT---TTGTTTAAAAGATCTT-TCCC-T----AT-ATAT-C--AA-A-TG-----CAAA---AC---T-ATAACCCC-CTA-TTGTGGC----ATAGT--AC-CCCCTGGGGAT-CATGGTT--TGAA-CAA-C-TTG-AATATACATTATAATCAGGA-A---GCTTTCAT-TAAAT-TTGCA-GCTTTTCTG-CCC---AG---TGG-T----------CTT----------GA------------G-------------AAAGAA--------GA--TTTTAAAGATTGTC-------CC-T--A-----T-AT-AT--TC--ACATG-A-A-AAT-T-TTGATC---------TCCT-ACTG-----TA--CCC--CA-AGTACTCC---GGGT-CAT-ATTTGAAA--CAA-CTT----GAATC--TCC---TAT--TCT-GGAA---GCTT-TCATATA--AATT-CAGC-TTTTTTAG--CCGTAG---T----G-GT-TCT---TCAGAAGA---AGA--AG---A----TTTTT-----AAAGA---------TTTTCCCTTT-ATAT---TCACATGCA-ACA-------A----C---T-TTG--A-TC---------CA-CT-AAT-----G---TTGGCCC--TCG--T--CCC---C-G-GAG-TC-ATG--ATT-GAA-CCAAA----CTT-GAATC--TC-AAT-T--ATATTAAG-AA-----CTT--A-TA-----T--A-A---T-----T-CAGC-TTT--TCT------GGGC-CA----GGT--TCTTGT-T--G--AGA---A-TG-TTAT------AAATG------GGGCAC----ACCCTA--TT------------TT---GC---AT--------------T---TTTGTGATATCTC-T-------------C-------------CT--TT-GAA-GG-G---G-TCTGAG-TCT--TC-TT-T----G----AGC-AAA--C--C--TAA---AG---------T-CC-C--TT-CACC--C-C-GGATGATTTGT--A--A--AG------TTTG----G----TTGA---A--T-TG--------GCCC-------C-C------AGT-----GGT-T--TTGGAGAA-GA-A---TCG----ATG---TG-----A--A-----GT-----TA-A-A----GAC-A-------G-------A-----AC-----G--ACAGTCAGG--G-ACAGACGA-CGGAG-AA--AG--G--C-AA-TCAG--AAA-----A-GCTCATT---GCC--------CACAAGTGAGC-TA
gi|7 : t----CTG-GCT-----C---AGCAGT--G-----GTGATTT-T-----GA----AAAGA--A-----TT-TTCAAG-----TT-TCCT-T----Atataaa
gi|7 : tgcgtgtaattaaactctgaatttagaatttttagtatttattttaaaagcatgtatagacaacaagaggcccatgggccacatcgctcaccttggccCAAGTTT-CCTTAAAACTGACCCAGT--GGTTC-GGAGAAGAACATTTTATGCAAAA---CTCCGATC---CCTT-----A--TT----------GTGC-CCCCCCC-C-AACTCCG---GGGA--G-----T----T-A-----T-GATCTGA-------------TAAA--TTTTGGAT-CT----ACCCT---ATCTC-AG-AAAGCTT--TCAG-GTAA------ATAT------T--G-T---TTC-TT----TTG-GTC-----C---AA---T--G-----GT--TCT-T-----GA----GAAAATGA-----TT-TTTAAAAGAT-TT-TCCC-T----AT-ATATTT--AC-A-TG-----TAAG---AC---T-TTGATCCC-CTA-TTGTGGCCC-TATCGT--ACTCCC--GAGGGT-CAAGATT--TGAA-CAGAC-TTG-AATCTCCATTACA-TCAGGA-A---GCTTTCTTATAAAT-TTC-A-GCTTTTCTGGCCC---AG---TGG-T-T--------CTT----------CA------------GAAAAAGATTTTTAAA------------GA--TTTC---------C-------TC-T--AGCCATT-AT-AT--TC--ACATGTA-C-AACTT-TTGAT----------CCCT-AAGG-----TG-TCCC--CATCGTACCCC--GGGGT-CATGA-TTGAAC--AA---TT----GAATC--TCCAC-aaactgacccagtggttcggagaagaacattttatgcaaaactccgatcccttattgtgcccccccccaactccggggagttatgatctgataaattttggatctaccctatctcagaaagctttcaggtaaatattgtttcttttggtccaatggttcttgagaaaatgatttttaaaagattttccctatatatttacatgtaagactttgatcccctattgtggccctatcgtactcccgagggtcaagatttgaacagacttgaatctccattacatcaggaagctttcttataaatttcagcttttctggcccagtggttcttcagaaaaagatttttaaagatttcctctagccattatattcacatgtacaacttttgatccctaaggtgtccccatcgtaccccggggtcatgattgaacaattgaatctccacccggggacctcttcactat
gi|8 : tgcgtgtaattaaactctgaatttagaatttttagtatttattttaaaagcatgtatagacaacaagaggcccatgggccacatcgctcaccttggccctggctcagcagtggtgattttgaaaagaattttATGTGAAA---TTTTGATC---TCAT-----A--TT----------ATGG-CCCCATC-AATACCCT----GTGG--A-----C----C-G-----T---TTTAAAAAACACACACACCAAAAACTT-GAAT-CT----GCATC---ATGTC-AG-GAAGTTT--TCAA--------------------------C---TT--TT----CTA-GTCAAGACT---AG---T--G-----GT--T-T-T-----GA----GAAGA--A-----TC-TA-AAA-GAT-TT-T-----------------------A-TG-----TATA---ACAGAT-TTGATCAT-CTA-TTGTGGCCC-CA-----------C--AGGGGT-CATGAAT--TGAA-CAAAC-TTG-AATCTAGTCCATG-CCAGGA-A---GCTTTAGGGCAAAT-TTT-A-ATTTTCCTCACAA---AG---TAG-T-T--------CTT---------------------------------------------------------------------T-------CC-T--A-----T-AC-AT--CC--GCATGTACACAAC-T-TTCATC---------CCCT-AATG-----T-------------TGCCCC----AAT-CGTAAT---------------------ATCCATACGC-TGCA-TCA-AGAA---GCTT-TGATGTA--AATTTCAAC-T-----GG--TC-CAG---T----G-GT-TTT---T------G---AGA--AG---A----TTccggggacctcttcactat
gi|9 : cctattctctttagagaagtggacagacatagcctggatgtaggctatgcctgtccacttctctaaagagaatacccctaccccaattctctgc-GAAGCTT--TCAT-ATAATTATATAT-T------C--A-TACATT--TA----CTG-TCC-----C----G---T--G-----GT--TCT-------GA----GAAGA--------TT-TTTAAA-GAT-TT-TCCCCT----ATTATATTC--A--A-TG-----CAAA---AT---T-TTGATTCC-CTAATTGTGGCCC--ATAGT--AC-CCT--AGGGGT-CATTATT--TGAA-CAAAC-TTG-AATCTCCACTATA-TCAGAA-A---GCTTTCATATCA---TTC-A-GCTTTT-TGA-CC---AG---T-G-T-T--------TAT----------GA------------GAAGATTATTA---AA------------GA--TTTT---------C-------CC-T--A-------AT-GT--TC--ACATGTC-A-AAC-T-TT-AT----------CCCT-ATTG-----TG-GCCC--CATC-TACCCCAGAGGA--CATAATTTGAAT--AAACATT----GAATC--TCCAC-TATA---A-GGAA---GCTT-T-ATATT--TATTTCAGC-TTTTCTGG---------------------------------------GA--AG-------------------AAGA---------T-----------------TCACAGGTA-A-A-------A----C---T-TTG--A-TC---------CC-CT-ATT-----G---T-GG-CCCATCG--TA-CCC---C----GGGTCTAT---ATTTGAA-C-AAA----CAT-GAATC--TC-CAC-T--ATATCAGG-AA----ACTTTCA-TG-----T--A-AAT-T-----T-CAGC-TTT--TCT------GG-C-CA-GT-GGT--TCTTGA-A--A--AGAAG-A-TT-TT-atgcaaattatttaatttcattttaaggtgattac
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): AAACTCTGATGACATCATAGAGTTTTTAATGATATTTGGAATTTATAAGCTGAACAAAAAAAAAAAAAACCAAAACAAGAGGCCCATGGGCCACATCGTTCACCTGAGTACCAATGGTCCTGGTTTAGCAGTGGTGATTTAAAAAGAAAATTTTCATAATTTTTTT
Unaligned ( gi|30 ): CCTCTTCTTCTTACCATATATAAGAGGACAGAAATAAGCTACATATGTCCGTGGGTGAAGGCTGTACCTGTCCTATTCTCTATCTAAACAGAATACCTCCTACCACTATTCTT
Unaligned ( gi|31 ): GCGTGTAGGCTAATTAATTAAGGATTTCAACACATAGTAGCTAAAATAAAACCTGAACTAGAGGCCCATAGGCCATACTGCTCACCCTGTCCCTTTGCTCA
Unaligned ( gi|33 ): AAAGAAGACGTCCATGATCCACATCACCCACCTGAGTAACATCGACTCTGCTGTCCAAATTCCCACTCCGTATTATGGGGATGCTTCAATATCAATAT
Unaligned ( gi|40 ): AAACAAGACCGGCCCATGGACCACTTTCGCTGCTCACTGCCTATAGTTGACACTTCGGCCCTCGCACTCT
Unaligned ( gi|41 ): AAATTATTCCAATCATATCCTATTCTGAAGTGATAAAATTTATATTCAACTCGCATAATACAATAAT
Unaligned ( gi|44 ): AAAGTGGATTGGCATCAGGGTGTAGACAATGCCTGTCCGCTTCTTTAGAAATAATATCC
Unaligned ( gi|45 ): GAAGATGAAAATGTGAAAAATTTACGACAATAGAAACGGACAGGTGAGCTAAAAAT
Unaligned ( gi|47 ): TTGAAAACAAGAGGCCCATGGACCACAATACTTACCCGAGTCATATT