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Reference ( gi|7 )            :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GGGT-GTA--CCTA-T--GGGCAC-TAACTG-T-G-CCCCCT-TATTGG-------TAGA--C--T---T-GTTT--T-TA-TGTT-C----------A-T---ATGAAGC---ATAAT-TTGT-G-C-GGAGA-C---T--AT--TGC-------G-GGAT------AAG-------AGCAG-------GA-------------GGC-T-T--GC-CG-TGTCCTTCG--G-CATT--G-CA-----T-ATAGGTAT-ATA-G-ATGA----TGTG-T-------TG-----T----------C--A-A-TT-GACA--AT--C------GTG------GTTTTC-A-C-AGTT----GTG--------TC--C-GTTTGA-T-GTA--T-CCCGAGGAGGTCGGTGT-GGGGGA-CAC-CAC-GGAG-----TCTGGCATGT-CTGCTT-CG----TG--T-TTGGATATTTTA-AT-T--AAC-AT-T-GAC--T------CT-GATG--G-C--GGACT---GACAGCT------AC-ATTATAT---GAT-AAACG-T--GATGACT-TT-AGCTTTG-CAA-TCATCG-ACTTTCCCTTT-CTG-TGTGGT-AATA--T-A-C--C-ACTA-TCACCT-GC--T--TG-TGGTGT-----TTG-T-GT--CT-CCC-GG---T-T--ATTTCG-ATGCGCAAAA--GCA-TGC----TGTG---TG-TATG--GTGACTTTTT-----AGAGCG-AGG-CCA---ACT--A--CTGA-G-AGAGGGGTTA-AT----------GCTGC-----A-GGG-CTA-TAACG---AATCT-CGTT-T-A--AA-G--TCA--T-CA----TT-T--C---GC--AAA-----TTCTAC-GG-TTGC---TA-TA-ATGA---CC-T----T-G-TTT-G-CG--A--TTA--CAA---A--TTA-TC-ACTAA-G-T-CA-TA-TG---TTGACTG-AT---TT------G--TTTCATACC-CTTTG---T-TAG-A-----------TTGTC-ATTTT-CC-TAC--T--AGA--TTT--GA-C-T-ACG--GGTAA-TCCCG---TTTTC--TTT-ATT--TC-G--AC-TA--AG-GGCT-CACGGC-GG----------GTGTGACCG---G----T-CA-GCAGAG---G-ATAC-TTACT-C-C-TC-C-ATGGCA-AC-TGA--T-CCT--A--CC--TTCGC-C-T-----TTGT-CGGA-G-G--T---CCGTG-TTGCC--C--T-AC--A-CTT-G-ATT-----TTT--TA---A-AT-GT-TT----TT-T------ATT-AT-G-A--TTA-CG--T--TTGA-C--AC-A-A--TG-TT--AACTT-CGCCT-TTTTG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GGT-ATT--CTTA-T--GGACACATAATTG-T-G-GCCCCT-TATTGG-------CAGA--C--T---T-ATTT--T-TA-TATT-C----------A-T---ATGAAGC---AGAAT-TTGA-A-CAGAAAA-C---T--GT--TAA-------G-GGAT------AA--------AACAA-------AA-------------AAC-T-T--GC-CG-TGTCC-TCA--A-CCTT--A-CA-----T-ATAGGTAT-ATA-T-ATGA----TGTG-T-------TA-----T----------C--A-A-TTAAACA--AT--C------ATA------ATTTTC-A-C-AATT----ATG--------TC--C-ATTTGA-T-ATA--T-CCCGAAGAACT-GATATCAAAGGA-CAC-CAC-AGAA-----TCTGACATAT-C
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                 tacatgttccttcttcctcatttaattatagtcccgcgtggtcatattaattacgggggatataaaatatggtccaaaaatgaggatctcaagtcccttattttgaaaagtcctaaattcgagaaacctcgctcatttaaatggcgacatgatttcatgactatcatgaattctgtggaagaatacgccagacgctggacaaaatctgagggagaggagcttgacactttgtctgaatggataaaaagttattcggagtttattaaaatcccgttatcaccatttattggggaaaatgcgtactatttatccctctgttttaaagataaccagaagtggtaaatgaagttacatagactacatgaaaattttgtactggttccagctgataaagctagtgaacaacgttgtctttgtttgtaaaagttactattataattgtcctttaaatgaactaggatttacttcaacatctgggaatcctacttacactcaaagcaatttcacaaaagataaattcttcaaaatcacctttctgttttaaagacttgtaatattccgaagaatcaggatcaatttgaattaccataccttatttggattccgaaattgcataaaaaaccttacaaacaaagatacatcgctggctcctaatggctctaccaagcctctttctttacttttgactaaactactaacagctatcaaagaatccttcagagatactgttcaccactaaatattccagaagtggtgtcaatcagatgtggattcttaaaaaactctaaagagcttttggataacctaaaatcatgagaattttcaaaaatgacttgcatcaaaaacgcatgatctctccacactttacacaatgattcctcacgataaattaaaatctaggccttcagattatagataattgctttttaaaacaaatacggcacccgaaaatacgaatttctgagtcgttggaaacaagacacatattttgttaaaaaaacactctgattgcccacacaagtactctgaagtagatattaagagcatgcttgggtgtcttatagataatatctatgtagtctttgagaccaggtcttccaacaatccgtaGGTAGTC--CCTAAT--GGGCAC-TAATTG-T-G--CCCCT-TA-TGG-------CAGATGC--T---TAGTTT--TCTA-TTAT-C----------A-TGC-ACGAA-----AGAA--TTGT-G-caacaagattgaaactaggagattgccttaaattc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ttctcaaaaactccaaagagcttatagaaatcttcaagcagcacgctttttctaaaattgctgcatcaaaacgctagattctccacacctatatgcagacaattctcgtgtacatttacaaatctagtctttttcagataattgaataattgctttgaacaaaacggtccactcgaaaatagcaagttgttctgggtcgtttgggaatcaagatacatattttggtcagaataccagcttctgatgttgcctccacattaatgtactctgagtagatattaaggcatgccttgggtttgtcttattgcataatactatgtgtcttgcgagaccatgtcttccaacaatcctgttGT-ATT--CCTA-T--GGGCAC-TAATTG-T---CCCGCT-TATTGG-------CAGA--C--T---T-ATTT--T-TG-TATT-C----------AGT---ATGAAGC---A-AAT-TT-T-A-C-AGAAAAC---T--GT--TAC-------G-GGAT------AAA-------AACAA-------AA-------------AAC-T-G--CC-CG-TGTCCT-CA--A-CCTT--AACA-----TCATAGGTATCATA-G-ATGA-----ATG-C-------TA-----T----------C--A-A-TT-AACA--AT--C------ATC------ATTTTC-A-C-AATT----ATG--------TC--C-ATTTGA-T-ATA--TTCCCGAAGAACTCGACAT-AAAGGA-CACTCACAGGAA-----TCTGACATATTCTGCTT-CA----TA--T-TTGGA-ATTTTACGT-T--AAC-AG-T-GAC--T------CT-AATC--G-C--AGACT---GACAACT------AC-ATTATATT--AAT-AAGCG-T--GATGACT-TG-AA-TTTG-CAA-TCGTCA-ACTTTCCTTTT-CTA--GTAGT-A-TA--T-ATC--C-ACTA-TCACCTTGC--T--TA-TGTTGC-----GTGGT-AT--AT-CCC-AG---T-TG-AT--CGTATACGCGA----GCAGTGC----TATGATTCG-TATG--CGGACTTT--------AAGCG-AGGTCCA---ACTG-A--CT-A-C-AAAACAGTTG-ATC---------GATGC-----A-GGG-TTA-TA-C----AATCT-CGTTAT-A--AAAG--TCAG-T-CA----TT----C---GC--AAA-----TTCTACTGG-CGGC---TA-TA-ATGA---CC-T------G-T---G-CG--A--TTAA-CAA---A--TTA-TC-ACTAAAG-T-CA-TAATG---T-GACTG-AT---TT------G--TTTCATACC--TTTG---T-TAG-A-----------CTGTC-ATTTT-CCCTAC--T--A-A--TTT---A-C-T-ACG--GGTAA-TCCCG---TTTAC--TTT-ATT--TC-G--AC-TA--AG-GGCT-CACGGC-GG----------GTGTGACCG---G----TCCA-GCAGAG---GAATGC-TTACT-C-C--C-C-AT-GCA-CC-T-A--T-CCT--A---C--TTCG--C-T-----TTGTCCGGA-GTG--TGACCTGTG-TTGCC--C--T-AC--A-CTC-G-ATT-----TTG--TA---T-CA-GT-TT----TT-TGG----ATT-AT-G-A--TTA-CG--TTGTTGATC--AC---A--TG-TT---ACTT-CGCCT-TTTtcaaaacaacaagaaaagtatcaaaccgtaatgatatccacaaaaaa
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gi|21                         : acattgttccatactgtcactctatattaaattatagtcccgctggtctattatacgggggtgaatatagggatatagtcaatatattgagagtgaggaatctctcaagtccctattttttgaaggtcctacaaatttcggaaacaccacactcctcatactttcgataatggtcgcataatttcatgagctatcaatggattctggataggcataaacaagatttagcgccaaggacgctcgggacactctaagaaatactgagggaggaaggagtgaaaagccctaacgatacttctactcgaattggaaaaaagtattcgaggtttattaaaatccacgtattcagccatttacgacaggggaaataattggtcgtacgtaattaatattccctctgtttttaaaaaccagatagtggtaaatgaagttacatgtaactacattgaaaattccctatgtggtactgtttttcgcaagctgatgtaaaagcgtagagttaaaatccaacaattgtcattgtttctgttaaaagtttaactgattataccattgattcttttttaaatgaaactagggactttacttcaacaatttctgcggaatcctagccaatggcattcaacacttccttaagcaactttcacaaccaacgtactgaaatttcttcaccccaaatttcactcttttctgtttctaatacactcttcctccaatattcgaagaatcacggatttcaagttgagagaagcaattaccattaaccttttactggcattccgataattgcatgaatatagcgccaatgtacaaacaaagatacatcgctggctccaagtaaaaagtgcttactaccaagcctcttcttatactttgactcccctaaactatcaacagctatcaaaagaatctcttcagaagatactgcctcacattacattattccagacagtgccgatgtgtcaatcagatgtggtttcttaaaaaaactctaaagaagctttataggatagtagcctacaaatcacaaaagattttcaccaaaatttgaccaagtgcattcttaagagatacgtatattcttccacactttgcacatctgacgattcctcacagatacattaaaaaatctaggcttttttcagatttagtaagataaattgctttttaaacaaaaactcggcacccaatgaaactccaccgcgaatttatactagtttcgttgggaaaacaagggaaacatcactatcccttgttatatatagattaattacaactctggatgcccacacatagtactctgaggtgaatatttaatcgatgcttgtgccttacttgatagattaaatatttatgtcgtgctaatgtggaggaaccagaagagtctatactacaaatccgtaggtaattcctaaatgT-C----------A-TCTGATGAAGC---AGAATCTTTT-A-------------T--AT--TAC-------G-GGAT------AAA-------AACAA-------AA-------------AACTT-T--GC-CGTTCTCCTTCA--A-TCTC--T-TATCTATT-ATAGGTAT-CAA-G-ATAG----TGTG-T-------ggttaaatacccaggaagaaacacgacgcattaaagacagcccatccgacgaatctgata
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              agaatagacaggaaaactgtacag-T-T--GC-CG-TTTCCTTCA--A-CCTT--A-CA-----T-ACAGTTAT-ATA-G-ACGA----TGTC-T-------TA-----T----------C----G-TT-CACATCAT--T------AT--------TTTTC-A-C-AATT----TTG--------TC--C-ATTg
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aagatctttgatttatactacgaaacttttcatatttttttgtcagatccactataattgccgcacacaagtactctaaagggatatccaatagaaattcttgggtttcttataaaactgatatttaatgtcagtcttgggccatgtcatccaacaattatgtttgatattcctattcggctgccaattgttgccccttattgacagaccataatccttattattgcataacgaagcagatttgttcaaaaactgttatcgcgggaactaaaaaaaaacaaaaaaaacaaaaaaataaagcaacacaacttG-TGTCCTTCA--AACCTT--A-CT-----T-ATAGGTAT-TTA-G-ACGA----TGTC-T-------TAAATCCT----------C--G-A-TT-AACA--AT--CA-----ATAAACAATGTTCTC-ACC-AATT----ATGAAGAAGGTTCAGC-ATTTGAGT-ATA--T-CCTGAatattgcctgacgaacttagaataaaggatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  caaaatgactagg-GACA--AT--C------ATA--------TTTC-AAC-AATT----ATG--------GT--C-ATTTGA-T-ATA--T-CCTGACGAACTTGAAAT-AAGG-A-CAC-TAC-AGAA-----TCTGACAGAT-GTGCTTTCA----TA--T-TTGGATATTTTA-CT-TTTAAT-AT-T-GAC--T------CTTAATG--G-C--GA--T---GACAACT------ACGATTATAT---GAT-AAACG-T--GATGACT-TT-ACTTTCG-CAAATTGTCA-ACTTTCCTTTT-TTG-TGTAGT-AA-A--T-G-CTAC-ACTA-TCACCT-GC--T--TA-TGGTGT-----GTA-T-GT--CT-CTC-AT---T-TGAAATTCG-ATACGCAAGG--GCA-TGT----CATG---CG-TATG--ATGA-TTTTT-----GAAGCG-AGG-C-A---ACT--A--CTAACGCAAAGAGGTTG-AT----------GTTGC-----A-GGGGTTA-TAAC----AATCT-CGTT---A--AA-G--TCA--T-CAAA--TA-T--C---GC--AA------TTCTAC-GG-TC-C---TAATA-ATGA---CC-T----T-G-TTTTG-CG--GACTTA--CAA------TTA-T--ACTAA-A-AACA-TA-T----TTGACTG--T---TT------A--TTTAATAAC-CTTTG---T-TAG-A-----------CTGTC-ATTTT-CA-TGCATT--AGA--TTT--GA-C-CGACG--GGTAA-CCCCG---TTTAC--TTT-GTT--TC-G--AC-TACGAG-GCCT-CACGGG-CG----------GTGTGACCG---G----T-CA-GCAGAG---G-ATGC-TTACTTC-C-TC-C-ATGGCA-CC-TGA--T-CCT--G--CC--TTCGC-T-T-----TCGT-CGAA-G-G--T---CCGTG-TTG-C--C--T-AC--A-CTC-G-A-T-----TTG--TA---T-GT-GT-TT----TT-TTGGG--ACT-AT-G-A--TTA-CG--T--TTGATT--AC---T--TT-TT--TACTT-CGCCT-TTTcgcatccaaactaactacaatagaattgaaaaagatttataaaaggacacacccctctcacagaatctgagcagatgtggcttcacgtatatttttggaatat
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gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         attgaggcaggctacttacaaacaagttgaaattgcaagggtttcaacagtcctatttaaaggcagcgctttgcaaattctatggtcgttatagtgatcaagtttgccaatataacctttataggaatatcaaacccagatgttacatgccagaatgattgctatttgtattgtaaaaaaattcaacaaatgagatatgatttattaagacccagtacaggtatatactttgtagccaaggttaacgtttcagacagG-AGCT-CAGGGT-GG----------TTGTGAACG---G----T-CA-GCAGAG---A-ATGC-TTACT-C-C-TC-C-ATGGCA-CC-TGA--T-GCT--A--TC--ATCCT-T-T-----TTGT-TGGA-G-G--T---CCGCG-TTGTC--C--T-AC--A-CTC-G-ATT-----TTG--T------AT-AT-TT----TT-TATGG--ATT-AT-GCA--TTA-CG--T--TTAA-C--AC-G-A--TG-CT--ACCTT-CGCCT-ATTTaattta
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          G-GGTT-CACGGC-GG----------GCTTGACCA---G----T-CG-GCAGAG---G-ATGC-TTACT-C-C-TC-
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atttcgaaaggctcaatttcat-GG----------GTGTG---G---G----T-TA-GC-----------------CT-C-CGTCTC-ATGGCA-CCCTGC--T-CCT--G--CC--TTCGC-T-T-----TTGT-CGGA-G-G--G---TCATG-TTGCC--C--T-AC--AGCTC-G-TTT-----TGTAGTA---T-AT-GT-TTA---TT-TGG----ACT--T-G-A--TTA-CG--T--GTAA-C--AC-A-GT-TG-TTTCTACTT-TGCCA-TTTT
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gtctttggtttgtgaaaaacacgttactattaatactatttcttcttaataactagggtctcacttgtcagacaatctgggacatctacaatgatactccaagacaaatctgcacctcaaagatgacacatcttaaaatcaccttatctgattttgcaatatttcatcattccgcaagacatcactcaatctttgaattaccagacctttgtgcgattgcgaaattacactaaagaatccattacaaaaaacagacatacatcaacttggttttcactccccgttggttcgctaccagcctctttcccttcatactaacctaaactactaaacagctgttaaagagtcacttcacaaagatactactgtttccactacatattccagaagggggggaaatcagatgtggattctcaagaaactctaaatgagcttttagtcacgagattatttcgtataattgactgcatcaaaagccgtccggtccctgacattctcacacactataatacacaattccctccgcaaattaaattccctaatatatatagctaggctttttcaggataacttgatccacccacttgctttttaaacaaaaacgggcacccgaaccaccccacaagttatcggggttcagttgggaaaacaagatacatattgttagaacacactcttgtaatgctcacaccacagtactctggaagtagataattaagagcaatgcttgtggtttctatgagtgcttggaagaccatgtcatttccaacaatctgtctgtattcctaatgggcactaattgatgatccccttattggcagactgtatacttctttatttcatacaaagccgaaatttattgtaaaaaacttagtttcacggataaaaacagccacaaaaaaacttaagcaggtgtccttcaaccttgcatctaggcatatagacgactgtcttatacacgtataacacatcaataatcacaaatcgacatttatgtccatctgatataattacctaacgaaatcgaaataaaggacacggagacgaatctgacagatctgcttcaattgaagttggatattttactgtaatattcgacattctaatgggcaggactgacaactacattatatgataaacgttgaatgacttgactttggcaatcgtcaactttcctttttatggtagtaagtacactaatcacctgcttattgcgtgtgtagtggctctcggttgattcgcatacgcaagggcactgccatgcgctatgggactttttaaagcgcaggccacttacttaaccgaacaccgattggatgttgcaggtataacgaatcacgtttaaaggtcaaattatcgcaaattctgcgggtcgcgtataatgacctttgttttgcgattacaagaaattatccacctagtcatatgttgactgattgattttcatacccttgttaggactggtcacacctgtcatttttcgtactaatgggacagacggcggtaaccccgttacctgttgcgactaccgggctcacggcgggtgtgaccgcttacaagaaactagtcacaaatacaaaaatatgccgtta----T-CA-GCAGAG---G-ATGC-TTACT-C-C-TC-C-ATGACA-CC-TGA--T-TCT--G--TC--TTCGC-T-T-----TTGT-CGGA-G-G--T---CCGTG-TTGCC--C--T-AC--A-CTC-G-ATT-----TTG--TA---T-ATGGT-TT----TG-G------ATT-TT-G-A--TTA-CG--T--TTAA-C--AC-G-A--TG-TT--AACTT-CGCCT-at
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -ATGC-TTACT-C-C-TC-C-ATGGCA-CC-TGA--T-CCT--G--CC--TTGGC-T-T-----TTGC-CGGA-A-G--T---CTGTA-TTGCA--C--T-AC--A-CTC-G-ACT-----TTG--TA---A-AT-GA-TT----TT-GGA----ACT-AT-G-A--TTA-CG--T--TTAA-C--AC-A-T--TG-TT--TACTT-CGCCactt
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -CCT--G--CC--TTCGC-T-T-----TCGT-CG----------------A-TTGCC--C--T-ACA-A-CTCGG-ATT-----TTG--TAT--G-CT-GT-TT----TT-TGGG---ACG-AT-G-AG-TTA-CG-----TTGA-T--ACTC-T--TG-TT---ACTT-CGCCA-TTaattta
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   C--TCCGA-T-T-----TTGC-CGGA-G-G--T---CCTTT-TAGCC--T--T-AC--A-CTC-G-GTT-----TTG--TA---C-AT-ATGTT----TT-TGGG---ATG-AT-G-A--TTA-CG--T--TTAG-C--AT-A-T--TA-TA--TATTT-CGCCat
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   t---CCGTC-TTGTC--C--T-AC--A-T-------------------------AT-GT-TT----TT-GGG----ACT-AT-G-A--TTG-CG--T--TTA-----AC-A-G--TG-TT--TACTT-CACCA-TTTTaatcta
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gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TA-CG--T--TTAA-C--AC-ATA--TG-T---AACTT-CGCCTGTTTTGa
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttataGA-C--AC-G-A--TG-TT--AACTT-CGCCT-TTTTtatgca
7 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): ATGGAGTTACATAGAGCTACTAGATGAAAAACTTAGGCCTGGTTCCGGCGGATAAAAGCAAGTAAATAACAGAACGATTGTCTAATTGTTTGTAAAATCTCCCTATCTTTAACTTGTGGTGTTTAAAAGTGTAACTTTAGAGGATTTTTGACTTCGAATAACAATCTGGTTTTTTTCGCATAACCCTTAGGACTTACCTAGCAATTCTGACTAAAGATGAAAATTCTATTCAAAGGATATCTACCTTATCTGTTGTTTGAATTAGCTTATCAATATTCCGAAGAATCAGGAATCAATTTGAATTACAATTAATGCTATAAGCCTTCTCAGCTGGATTCCTCGAAATGCATCAAGAATCCGTACAAGAAATTATAATTTGCCAATCCGCTGAGTATTGCCAGTAAGTGGCTATCTCTAAGCCCTATCACTCTCTGACTAATTAAGATCTCTATTAAACCCCTGGCGTATCAAATTTAGAATCTCTACATTCTTGGATGACTTGTATGTCACTACCTATTCCAGATATTGGGAGTCTTCCCGTGTTTGTTACAATGAGATGTAGAGAACTCATATCTCCAACGATAAAGCGTCACATAAATAATGCTAGTCTAGATGCAACTATTGCTGTTCATCAAGTCATCACACTAGAGTTATTGCCTACAAATAAACCTGACTTCATCCGAACATACGTAGATGCACTGGTGAGTATTCGTACAGCTCAGTTGCTATCACAATTCCTACACTGAATCAAATCAAATAAAATCTAAGGGCGTTTATTATGGTTGGAACTAATGTTTCCGTTCTAATTAGTTATAACAAAAGTAACAGCACTCGAAAATACAAGTTCTTCTGGCATGGGAAAAGATACCATATCCGTGTTTTGTACTCACAAAATACATGCTCTGGATTTGTGCTTTCCAAGATCTACAGCAGCTACTCTGTAAGTAAGATATCATATAGAGCATGCTTGGAAGCATTGTCTTCTTATAGAATAGAATATGTGCTTATAGT
Unaligned ( gi|22 ): TTAAAAATTAACGAAAAGTGATAAAAGAATGAGATTACATGAGGGTTATGTATTAGTTTCCAGCTGACAACCGCTTGTACAACATTGTCTTTGTTTGGAAGGCTCGTTATTAAAACTTGTTTGTAAGGCTCATTGATAAAAACAGTATTTCAAACGAATTCAAATCCTTAATTCCCCATTTGGTATAACAACTTATACTCCAACTGAAACTTCTCCACAATCATGCTTCAGTTTTAAACACTTTAA
Unaligned ( gi|24 ): TTAAGTCCCTTATTTTAAAAGGCCCTAAATTCTGAGAACCTCCCTCATTTAAGTGGCGACATAATTTCATGACTATCATGGATTCTGTGGAAGAATACGCCAGACGTTGGACAAAATCTGAGGGAGAGGAGCTTGACACTTTGTCTGAATGGATCAAAACTATTCGGAAATCATAAAATCACGTATTAACCATTTAGCGGGGAATAT
Unaligned ( gi|25 ): CCAACGAAAGCGAGATCGCGGCGCACGGAGTGCACTCTTTGAGGGGTGGTGATAATTTCGACGTTGGTACGTATCACGTGACTACTCTAATCGACGAGATCCTGACAACACTACATACGGAACTGGATAAAATTTCTGTTGATATACTTTTAGTACTTTGGCAATTTCGGTCAACTTTCTTTTTTTAGTA
Unaligned ( gi|26 ): ATATAGTTTGAAAATGAGGACCTGAGATCACTTATTTAAAAAACTCTTAAATTCATACAATTGGCGACATAACTTCATTTCCATTATAAATTCTATCGAAGATTGTGCCAGACGATCGGACAAATATGACAAAGAATTTGATACCTTGTCAGAATAGATAAAAC
Unaligned ( gi|33 ): TTTCTCCCGTTACATGAAACTGCGATTTTTACAAATGTTTGTTTTGCTTAAATTAGGATACGTTCACAATGTTTCACCTCCATTTTTGCG
Unaligned ( gi|37 ): CTACACTCGATTTTGTACACATGTGTATATGTTTTTTGGACTATGATTATGTTT






Alignments
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Reference ( family-36 )       :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        NGGT-GTTCCTAA-TGGGC-A-C-TAATTG-TGN-CCCCT--TATTG-GC------AGA--C--T---TATTT--TTAT-AT----T-C----------A-T---A-CGAAG-CAGA-A---T-T-TGT-ACA-AAAAC--T--GTT--A---C-------GGGA-----TA---------AAA-A-------------CA-------A---AAAA----------------C-T-T--GC-CG-TGTCCTTCA----A-CCT------TA-CA----T-ATAGGTAT-ATAG-ACGA----TGTG-------T---------T-A-----T-C--A-A-T-TA--A-CA-A--T--C-A---TAA------T---TTTCA-C-AA--------TT----ATG--------TC--C-ATTTG---A-TAT------A--T-CCC--GA---------------------A-G-AACTCGA--NA--------T-AA-AGGA-CA--C--------CA--C-G--GAATCTGA-CATAT-CT-GCTT-C----ATAT-T-----TGGAT-ATTTTAC-T-T--AAC-AT-T-GAC--T------CT-AAT-G--G-C--G-GA--CT---GACAACT------AC-ATTATAT---------GAT-AAA-----CGT--GATG-ACTTT-A--ACTTT-G-C-AA-TC---GTCAACTTTCCTTTT-CT-AT-GTAGT-A-A-TAT-AC--C-ACTATCACCT-GCT--TA-TG-GTGTGT-----A-TGTCT-CCCAG---TTGA--TTCG-ATACGCAAGA--GCA-TGC--TATG---CG-T---ATGA-GGACTTTTT-----AAAGCG-AGG-CCA--ACT-A--C-TAAC--AAAAAA---GTT-G-AT-GT------TGC-----A-GGG-TTA-TAACG---AATCT-CGTT-T-A--AA-G--TCA--T-CA----TT-T--C---GC--AA---A-----TT-CTAC-GG-T-CGC-T-A-TA-AT-----GA---CC-T----TG-TTT-G-CG--A--TTA--C---AAA--TTA-T-CACTAA-G-T-CA-TA-TG---TTGACTG-AT---TT------G--TTTCATACC-CTTTG---T-TAG-A-----------CT-GT--C-ATTTT-CC-TAC--T--AGA--TTT--GA-C-T-ACG--GGTAA-TCCCG---TTTAC--TTT-G-TT--TC-G--AC-TA--AG-GGCT-CACGGC-GG----------GTGTGACCG---G----T-CA-GCAGAG---G-A-TGC-TTACT-C-C-TC-C-ATGGCA-C-C-TGAT--CCT--G--CCTT--CGC-T-TTTGT-C-----GGA-G-G--T---CC-GTG-TTGCC--C--TA-C--A-CTC-G-A--TTTT---GT--ANA----------TG----TT--T----TTT--GGACTAT----G-A--TTA-CG--T--TTGA-C--AC--A-N-TG-T-T--NACTT-CGCCT-TTTTG
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GGTAGTCCCTAA-TGGGC-A-C-TAATTG-TG--CCCCT--TA-TG-GC------AGATGC--T---TAGTT--TTCT-ATTA--T-C----------A-TGC-A-CGAA---AGA-A---T-TGTGT--CA-AAA
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAA---ATT-GCAT-GT------TGC-----A-GG--TTA-TAACG---AATCT-CGTT-T-A-----G--TCA--T-CA----TT-TGTC---GC--AA---C-----TT-CTAC-G--T-CGC-T-A-TA-AT-----AAGTACC-T----TGGTTT-GGCG--A--TTA--C---AAAA-TTA-T-CACCAA-AAT-CA-TT-AG---TTGACTG-AT---TT------G--TTTCATAACACTTTG---T-TAA-A-----------CA-GT--C-ATTTT-CT-TAC--T--AGA--TTT--GA-C-GGACG--GGTAA--CCCG---TTTAC--TAT-G-TT--TT-G--AC-AA--CG-GGCT-CACGGC-GG----------GTGTGATCG---G----T-CA-GCAGAG---G-A-TGC-TTACT-C-C-TC-C-ATGACA-CAC-TGAT--CCTCGG--CCTT--CAC-T-TTT---------------G--T---CC-GTGTTTGCC--T--GA-C--A-CTC-G-A--TTTT---GT----A----------TG----TT--C----TTT--GGACTAT----G-A--TTA-CG--T--TTAA-T--AC--A-T-TG-T-T--TACTT-CGCCA-TTTTgcaggttataacgaatctcgtttagtcatcatttgtcgcaacttctacgtcgctataataagtaccttggtttggcgattacaaaattatcaccaaaatcattagttgactgatttgtttcataacactttgttaaacagtcattttcttactagatttgacggacgggtaacccgtttactatgttttgacaacgggctcacggcgggtgtgatcggtcagcagaggatgcttactcctccatgacacactgatcctcggccttcacttttgtccgtgtttgcctgacactcgattttgtatgttctttggactatgattacgtttaatacattgtttacttcgccatttt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tttgactttgcgaatcgtactttccttttactatgtagtaatgtcaccactatcgcctgctattgtggtatgtctctcaggtttaatttcgaaccGAT-ATTCCTAT-TCGGCTG-C-CAATTG-TTG-CCCCT--TATTG-AC------AGA--CCAT---AATCC--TTATTAT----TGC----------A-T---AACGAAG-CAGA-----T-T-TGT-TCA-AAAAC--T--GTT--ATCGC-------GGGAAC---TA---------AAA-AAAAACAAAAAAAACA-------A---AAAAATAAAGCAACACAACTT-T-T--GC-CG-TTTCCTTCA----A-CCT------TA-CA----T-ACAGTTAT-ATAG-ACGA----TGTC-------T---------T-A-----T-C----G-T-TC--A-C--A--T--C-AT--TAT------T---TTTCA-C-AA--------TT----TTG--------TC--C-ATT-----A-TAT------T--G-CCT--GA---------------------C-G-AACTTAG--AA--------T-AA-AGGA-
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aagatctttgatttatactacgaaacttttcatatttttttgtcagatccactataattgccgcacacaagtactctaaagggatatccaatagaaattcttgggtttcttataaaactgatatttaatgtcagtcttgggccatgtcatccaacaattatgtttG-AGG-CAG--GCT-A--C-TTAC--AAACAA---GTT-G-AA-AT------TGC-----AAGGG-TTT-CAAC----AGTCC-TATT-T-A--AA-G--GCA--G-CG----CT-T--T---GC--AA---A-----TT-CTAT-GG-T-CGT-T-A-TA-GT-----GA---TC-A----AG-TTT-G-CC--A--ATA--T---AAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                att-G-TT--TC-G--AC-TA--AG-GGCT-CACGGC-GG----------GTGTGACCG---G----T-CA-GCAGAG---G-A-TGC-TTACT-C-C-TC-C-ATGGCA-C-C-TGAT--CCT--A--CCTT--CGC-T-TTTGT-C-----GGA-G-G--T---CT-GTG-TTGCC--C--TA-C--A-CTC-A-A--TTTT---GT--ATA----------TG----TT--T----TTT--GGACTAT----G-A--TTA-CG--T--TTAA-C--AC--A-A-TG-T-T--TACTT-CGCCcctttataggaatatcaaacccagatgttacatgccagaatgattgctatttgtattgtaaaaaaattcaacaaatgagatatgatttattaagacccagtacaggtatatactttgtagccaaggttaacgtttcagacagtttcgactaagggctcacggcgggtgtgaccggtcagcagaggatgcttactcctccatggcacctgatcctaccttcgcttttgtcggaggtctgtgttgccctacactcaattttgtatatgttttttggactatgattacgtttaacacaatgtttacttcgccaattta
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               attgaggcaggctacttacaaacaagttgaaattgcaagggtttcaacagtcctatttaaaggcagcgctttgcaaattctatggtcgttatagtgatcaagtttgccaatataacctttataggaatatcaaacccagatgttacatgccagaatgattgctatttgtattgtaaaaaaattcaacaaatgagatatgatttattaagacccagtacaggtatatactttgtagccaaggttaacgtttcagacaTCTGCGTT-T-AGAAA-G--TCA--TTCA----TT-T--CCCCAC--AA---AATATCTT-ATACAGG-TGCGC-TCA-TA-AT-----GA---CAAT----TG-TTT-G-CG--A--TTA--C---AAA--TTA-T-CACAAG-A-T-CAGTA-TGAAATAGACTG-ATATATA------G--TTTCATACC-CTTTGAGATATAG-AGAC--------CT-CTC-C-ATATT-CC-TACT-T--AGA--TTTTGAA-C-T-ACG--GGTAA-GCCCGAAATTTACATTTC-A-TT--TCTG--AC-TAT-AG-GGCT-CACGGG-GGCGCCGCTTCCGTGCATCCG---GCTTTT-CA-GCAGAGAGTG-A-TGC-TTACT-C-C-TCGC-ATGG-A-C-C-TGATG-CCT--ATCCTTT--CGCTT-TTTGT-C-----GGA-A-GGCT---CC-GTG-TTGCC--C--TA-C--A-CTC-G-AATTTTT---GTA-ATA----------TG----GT--TAATATTT--GGAGGATCATAG-A--TTATCGATT--TTGA-CTTAC--A-A-TG-T-TG-AACTT-TACCaattta
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   G-CCA--ACT-A--C-TAAC--CAAAAA---GTTTG-AT-GT------TGC-----A-GGG-TTA-TAACG---AATCT-CCTT-TTA--AA-G--TCA--T-CA----TT-T--C---GC--AA---A-----T--CTAC-GGGT-CGCCT-G-TG-AT-----GA---CC-T----TG-TTT-G-CG--A--TTA--C---AAA--TTA-T-CACTAA-G-T-CA-TC-TG---TTGATTG--T---TT------G--TTTCATACC-CTTTG---T-TAG-A-----------CT-GT--C-ATTTT-CCGTTC--T--AGA--TTT--GA-C-G-ACG--GGTAA-CCCCG---TTTAC--TTT-G-TT--TC-G--AC-TA--CG-GGCT-CAC-GC-GG----------GTGTGACCG---G----TCCA-GCAGAG---G-A-TGC-TTACT-C-C-TC-C-ATGGCA-C-C-TGAT--CCT--G--CCTT--CGC-T-TTTGT-T-----GAA-G-G--T---CT-GTG-TTGCC--C--TA-C--A-CTC-G-A--TTTT---TA--ATG----------TG----TT--T----TTTTGAGACTAT----G-A--TTA-CGT-T--TTGA-T--AC----T-TG-T-T--TACTT-CGCCA-TTTTggc
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gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 acattgttccatactgtcactctatattaaattatagtcccgctggtctattatacgggggtgaatatagggatatagtcaatatattgagagtgaggaatctctcaagtccctattttttgaaggtcctacaaatttcggaaacaccacactcctcatactttcgataatggtcgcataatttcatgagctatcaatggattctggataggcataaacaagatttagcgccaaggacgctcgggacactctaagaaatactgagggaggaaggagtgaaaagccctaacgatacttctactcgaattggaaaaaagtattcgaggtttattaaaatccacgtattcagccatttacgacaggggaaataattggtcgtacgtaattaatattccctctgtttttaaaaaccagatagtggtaaatgaagttacatgtaactacattgaaaattccctatgtggtactgtttttcgcaagctgatgtaaaagcgtagagttaaaatccaacaattgtcattgtttctgttaaaagtttaactgattataccattgattcttttttaaatgaaactagggactttacttcaacaatttctgcggaatcctagccaatggcattcaacacttccttaagcaactttcacaaccaacgtactgaaatttcttcaccccaaatttcactcttttctgtttctaatacactcttcctccaatattcgaagaatcacggatttcaagttgagagaagcaattaccattaaccttttactggcattccgataattgcatgaatatagcgccaatgtacaaacaaagatacatcgctggctccaagtaaaaagtgcttactaccaagcctcttcttatactttgactcccctaaactatcaacagctatcaaaagaatctcttcagaagatactgcctcacattacattattccagacagtgccgatgtgtcaatcagatgtggtttcttaaaaaaactctaaagaagctttataggatagtagcctacaaatcacaaaagattttcaccaaaatttgaccaagtgcattcttaagagatacgtatattcttccacactttgcacatctgacgattcctcacagatacattaaaaaatctaggcttttttcagatttagtaagataaattgctttttaaacaaaaactcggcacccaatgaaactccaccgcgaatttatactagtttcgttgggaaaacaagggaaacatcactatcccttgttatatatagattaattacaactctggatgcccacacatagtactctgaggtgaatatttaatcgatgcttgtgccttacttgatagattaaatatttatgtcgtgctaatgtggaggaaccagaagagtctatactacaaatccgtaggtaa-T-CT-TA-TG---TTG--CG-AT---TTACGAATG--TTTCATACC-CTTTG---T-TAG-T-----------CTCGT----ATTTT-CG-TAC--T--AGAGATTT--GA-C-G-AAG--GGTAACTCCCG---TTTAC--TTT-G-TTGTTC-G--AC-TA--CG-GGCT-TCCGAC-GG----------GTTTGAC-G---G----T-CAAGCAAAG---G-A-TAC-TTAT----A-TC-C-ATGACA-C-C-T-AT--CCT--G--CCTT--CGC-T-TTTTG-C-----GAA-G-G--T---CC-GTG-TTGCC--C--TA-C--T-CTC-G----TACT---GT--ATG----------TG----TT--T----TTTG-GGACTAT----G-A--TTA-CGT-T--TTGA-T--AT--A---TG-TGT--TACTT-CGCC
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     t--T---TATTT--CTAG-ACGCTAT-C----------A-TCTGA-TGAAG-CAGA-A---TCT-TTT-ATA------------TT--A---C-------GGGA-----TA---------AAA-A-------------CA-------A---AAAA----------------CTT-T--GC-CGTTCTCCTTCA----A-TCTCTTATCTA-T-----T-ATAGGTAT-CAAG-ATAG----TGTG-------TGTGATCCAAT-A-----T-C----A-T-TACTA-CA-AGTT--T-A---TAA------TACACTTC--------------TT----ATG--------TC--A-ATatattat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gaccagttcttccaactaaattccgtatacggtaattgccttaactcactataatataatatttgtgtgcccccacttacttcaatcaactcacaactG-TGTCCTTCA----AACCT------TA-CT----T-ATAGGTAT-TTAG-ACGA----TGTC-------T---------T-AAATCCT-C--G-A-T-TA--A-CA-A--T--CAA---TAAACAATGT---TCTCACC-AA--------TT----ATGAAGAAGGTTCAGC-ATTTG---AGTAT------A--T-CCT--GACGCATCCAAACTAACTACAATA-G-AA-TTGA--AAAAGATTTAT-AAAAGGA-CA--CACCCCTCTCA--C-A--GAATCTGAGCAGAT-GTGGCTT-C----ACGT----------AT-ATTTTat
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           caaaatgactaggAC--T------CT-AATCG--A-C--GAGATCCT---GACAAC----------ACTACATACGGAACTGGAT-AAAATTTCTGTT-GATATACTTTTAGTACTTT-GGC-AA-TTTCGGTCAACTTTCTTTTT-TT-A--GTAtggaatat
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ccaacgaaagcgagatcgcggcgcacggagtgcactctttgaggggtggtgataatttcgacgttggtacgtatcacgtgactG-AGCT-CAGGGT-GG----------TTGTGAACG---G----T-CA-GCAGAG---A-A-TGC-TTACT-C-C-TC-C-ATGGCA-C-C-TGAT--GCT--A--TCAT--CCT-T-TTTGT-T-----GGA-G-G--T---CC-GCG-TTGTC--C--TA-C--A-CTC-G-A--TTTT---GT--ATA----------TT----TT--T----TAT--GGATTAT----GCA--TTA-CG--T--TTAA-C--AC--G-A-TG-C-T--ACCTT-CGCCT-ATTT
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CAACTTTTCCTTT-CT-AT-GTAGT-A-A-TAT-AC--C-ACTAGCACCT-GTT--TA-TG-GTGTGT-----A-TATCT-CCCAG---TTGA--TTCG-ATACGCAAGA--GCA-TGC--TA
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atcaattttgatgccagacttttcatgtgaaacggtcatggcaattatatataataa----T-CA-GCAGAG---G-A-TGC-TTACT-C-C-TC-C-ATGACA-C-C-TGAT--TCT--G--TCTT--CGC-T-TTTGT-C-----GGA-G-G--T---CC-GTG-TTGCC--C--TA-C--A-CTC-G-A--TTTT---GT--ATA----------TG-----G--T----TTT--GGATTTT----G-A--TTA-CG--T--TTAA-C--AC--G-A-TG-T-T--AACTT-CGCCT-
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GGT-ATTCTTA--TGGAC-A-CATAATTG-TGG-CCCCT--TATTG-GC------AGA--C--T---TATTT--TTAT-AT----T-C----------A-T---A-TGAAG-CAGA-A---T-T-TGA-ACAGAAAAC--T--GTT--A---A-------GGGA-----TA---------AAA---------------CA-------A---AAAA----------------C-T-T--GC-CG-TGTCCT-CA----A-CCT------TA-CA----T-ATAGGTAT-ATAT-ATGA----TGTG-------T---------T-A-----T-C--A-A-T-TA--AACA-A--T--C-A---TAA------T---TTTCA-C-AA--------TT----ATG--------TC--C-ATTTG---A-TAT------A--T-CCC--GA---------------------A-G-AACT-GA--TA--------TCAA-AGGA-CA--C--------CA--C-A--GAATCTGA-CATAT-Cactt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tacatgttccttcttcctcatttaattatagtcccgcgtggtcatattaattacgggggatataaaatatggtccaaaaatgaggatctcaagtcccttattttgaaaagtcctaaattcgagaaacctcgctcatttaaatggcgacatgatttcatgactatcatgaattctgtggaagaatacgccagacgctggacaaaatctgagggagaggagcttgacactttgtctgaatggataaaaagttattcggagtttattaaaatcccgttatcaccatttattggggaaaatgcgtactatttatccctctgttttaaagataaccagaagtggtaaatgaagttacatagactacatgaaaattttgtactggttccagctgataaagctagtgaacaacgttgtctttgtttgtaaaagttactattataattgtcctttaaatgaactaggatttacttcaacatctgggaatcctacttacactcaaagcaatttcacaaaagataaattcttcaaaatcacctttctgttttaaagacttgtaatattccgaagaatcaggatcaatttgaattaccataccttatttggattccgaaattgcataaaaaaccttacaaacaaagatacatcgctggctcctaatggctctaccaagcctctttctttacttttgactaaactactaacagctatcaaagaatccttcagagatactgttcaccactaaatattccagaagtggtgtcaatcagatgtggattcttaaaaaactctaaagagcttttggataacctaaaatcatgagaattttcaaaaatgacttgcatcaaaaacgcatgatctctccacactttacacaatgattcctcacgataaattaaaatctaggccttcagattatagataattgctttttaaaacaaatacggcacccgaaaatacgaatttctgagtcgttggaaacaagacacatattttgttaaaaaaacactctgattgcccacacaagtactctgaagtagatattaagagcatgcttgggtgtcttatagataatatctatgtagtctttgagaccaggtcttccaacaatccgta-A-TGC-TTACT-C-C-TC-C-ATGGCA-C-C-TGAT--CCT--G--CCTT--GGC-T-TTTGC-C-----GGA-A-G--T---CT-GTA-TTGCA--C--TA-C--A-CTC-G-A--CTTT---GT--AAA----------TG----AT--T----TTG--GAACTAT----G-A--TTA-CG--T--TTAA-C--AC--A-T-TG-T-T--TACTT-CGCCcaacaagattgaaactaggagattgccttaaattc
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CTC--CGA-T-TTTGC-C-----GGA-G-G--T---CC-TTT-TAGCC--T--TA-C--A-CTC-G-G--TTTT---GTACATA----------TG----TT--T----TTG--GGATGAT----G-A--TTA-CG--T--TTAG-C--AT--A-T-TA-T-A--TATTT-CGCCaattta
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      t--CCT--G--CCTT--CGC-T-TTCGT-C-----G-----------------A-TTGCC--C--TA-CA-A-CTCGG-A--TTTT---GT--ATGC---------TG----TT--T----TTTG-GGACGAT----G-AG-TTA-CG-----TTGA-T--ACT-C-T-TG-T-T---ACTT-CGCCA-TTaatcta
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gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TA-CG--T--TTAA-C--AC--A-TATG-T----AACTT-CGCCTGTTTTGca
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gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cacgaattttcaaaaaattgattggccatcaaaaacgtatgatttctccaagcactttacacaacgattcccacgataaattaatctaggcttttcagattaatagatcattgcttttaacaagaaacggcacccgaaatacgaatttctagccgttggggaaacaagacacatattttgttagaaaacactctgatgccacacaaatactctgaagtagatattaagcatgcttgggttctgtatagatatatttatgtagtcttggagacgcaggtcttcaacaatccgtaT----G-A--TTT-TG--T--TTAA-C--AC--A-T-TG-T-T--TACTT-CGCCA-TTTT
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GA-C--AC--G-A-TG-T-T--AACTT-CGCCT-TTTTa
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ---GACTACT------AC-ATTATAT---------GAT-AAA-----CGT--GATG-Aatatgataaaa
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|22 ): TTAAAAATTAACGAAAAGTGATAAAAGAATGAGATTACATGAGGGTTATGTATTAGTTTCCAGCTGACAACCGCTTGTACAACATTGTCTTTGTTTGGAAGGCTCGTTATTAAAACTTGTTTGTAAGGCTCATTGATAAAAACAGTATTTCAAACGAATTCAAATCCTTAATTCCCCATTTGGTATAACAACTTATACTCCAACTGAAACTTCTCCACAATCATGCTTCAGTTTTAAACACTTTAA
Unaligned ( gi|24 ): TTAAGTCCCTTATTTTAAAAGGCCCTAAATTCTGAGAACCTCCCTCATTTAAGTGGCGACATAATTTCATGACTATCATGGATTCTGTGGAAGAATACGCCAGACGTTGGACAAAATCTGAGGGAGAGGAGCTTGACACTTTGTCTGAATGGATCAAAACTATTCGGAAATCATAAAATCACGTATTAACCATTTAGCGGGGAATAT
Unaligned ( gi|26 ): ATATAGTTTGAAAATGAGGACCTGAGATCACTTATTTAAAAAACTCTTAAATTCATACAATTGGCGACATAACTTCATTTCCATTATAAATTCTATCGAAGATTGTGCCAGACGATCGGACAAATATGACAAAGAATTTGATACCTTGTCAGAATAGATAAAAC
Unaligned ( gi|33 ): TTTCTCCCGTTACATGAAACTGCGATTTTTACAAATGTTTGTTTTGCTTAAATTAGGATACGTTCACAATGTTTCACCTCCATTTTTGCG






Alignments
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Reference ( family-36 )       :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       NGGTA-TTCCTAA-TGGGC-A-C-TAATTG-TGG-CCC-CT--TATTG-GC------AGA--C--T---TATTT--TTAT-AT----T-C----------A-T---A-CGAAG-CAGA-A---T-T-TGT-ACA-AAAAC--T--GTT--A---C-------GGGA-----TA---------AAA-A-------------CA-------A---AAAA----------------C-T-T--GC-CG-TGTCCTTCA----A-CCT------TA-CA----T-ATAGGTAT-ATAG-ACGA----TGTG-------T---------T-A-----T-C--A-A-T-T-A--ACA-A--T--C-A---TAA------T---TTTCA-C-AA--------TT----ATG--------TC--C-ATTTG---A-TAT------A--T-CCC--GA---------------------A-G-AACTCGA--NA--------T-AA-AGGA-CA--C--------CA--C-G--GAATCTGA-CATAT-CT-GCTT-C----ATAT-T-----TGGAT-ATTTTAC-T-T--AAC-AT-T-GAC--T------CT-AAT-G--G-C--G-GA--CT---GACAACT------AC-ATTATAT---------GAT-AAA-----CGT--GATG-ACTTT-A--ACTTT-G-C-AA-TC---GTCAACTTTCCTTTT-CT-AT-GTAGT-A-A-TAT-AC--C-ACTATCACCT-GCT--TA-TG-GTGTGT-----A-TGTCT-CCCAG---TTGA--TTCG-ATACGCAAGA--GCA-TGC--TATG---CG-T---ATGA-GGACTTTTT-----AAAGCG-AGG-CCA--ACT-A--C-TAAC--AAAAAA---GTT-G-AT-GT------TGC-----A-GGG-TTA-TAACG---AATCT-CGTT-T-A--AA-G--TCA--T-CA----TT-T--C---GC--AA---A-----TT-CTAC-GG-T-CGC-T-A-TA-AT-----GA---CC-T----TG-TTT-G-CG--A--TTA--C---AAA--TTA-T-CACTAA-G-T-CA-TA-TG---TTGACTG-AT---TT------G--TTTCATACC-CTTTG---T-TAG-A-----------CT-GT--C-ATTTT-CC-TAC--T--AGA--TTT--GA-C-T-ACG--GGTAA-TCCCG---TTTAC--TTT-G-TT--TC-G--AC-TA--AG-GGCT-CACGGC-GG----------GTGTGACCG---G----T-CA-GCAGAG---G-A-TGC-TTACT-C-C-TC-C-ATGGCA-C-C-TGAT--CCT--G--CCTT--CGC-T-TTTGT-C-----GGA-G-G--T---CC-GTG-TTGCC--C--TA-C--A-CTC-G-A--TTTT---GT--A----------TA-TG----TT---T----TTT--GGACTAT----G-A--TTA-CG--T--TTGA-C--AC--A-N-TG-T-T--NACTT-CGCCT-TTTTG
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GGTAGTCCCTAA-TGGGC-A-C-TAATTG-T-G-CCC-CT--TA-TG-GC------AGATGC--T---TAGTT--TTCT-ATTA--T-C----------A-TGC-A-CGAA---AGA-A---T-TGTGT--CA-AAA
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tttgactttgcgaatcgtactttccttttactatgtagtaatgtcaccactatcgcctgctattgtggtatgtctctcaggtttaatttcgaaccGATA-TTCCTAT-TCGGCTG-C-CAATTG-TTG-CCC-CT--TATTG-AC------AGA--CCAT---AATCC--TTATTAT----TGC----------A-T---AACGAAG-CAGA-----T-T-TGT-TCA-AAAAC--T--GTT--ATCGC-------GGGAAC---TA---------AAA-AAAAACAAAAAAAACA-------A---AAAAATAAAGCAACACAACTT-T-T--GC-CG-TTTCCTTCA----A-CCT------TA-CA----T-ACAGTTAT-ATAG-ACGA----TGTC-------T---------T-A-----T-C----G-T-T-C--AC--A--T--C-AT--TAT------T---TTTCA-C-AA--------TT----TTG--------TC--C-ATT-----A-TAT------T--G-CCT--GA---------------------C-G-AACTTAG--AA--------T-AA-AGGA-
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aagatctttgatttatactacgaaacttttcatatttttttgtcagatccactataattgccgcacacaagtactctaaagggatatccaatagaaattcttgggtttcttataaaactgatatttaatgtcagtcttgggccatgtcatccaacaattatgtttG-AGG-CAG--GCT-A--C-TTAC--AAACAA---GTT-G-AA-AT------TGC-----AAGGG-TTT-CAAC----AGTCC-TATT-T-A--AA-G--GCA--G-CG----CT-T--T---GC--AA---A-----TT-CTAT-GG-T-CGT-T-A-TA-GT-----GA---TC-A----AG-TTT-G-CC--A--ATA--T---AAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                att-G-TT--TC-G--AC-TA--AG-GGCT-CACGGC-GG----------GTGTGACCG---G----T-CA-GCAGAG---G-A-TGC-TTACT-C-C-TC-C-ATGGCA-C-C-TGAT--CCT--A--CCTT--CGC-T-TTTGT-C-----GGA-G-G--T---CT-GTG-TTGCC--C--TA-C--A-CTC-A-A--TTTT---GT--A----------TA-TG----TT---T----TTT--GGACTAT----G-A--TTA-CG--T--TTAA-C--AC--A-A-TG-T-T--TACTT-CGCCcctttataggaatatcaaacccagatgttacatgccagaatgattgctatttgtattgtaaaaaaattcaacaaatgagatatgatttattaagacccagtacaggtatatactttgtagccaaggttaacgtttcagacagtttcgactaagggctcacggcgggtgtgaccggtcagcagaggatgcttactcctccatggcacctgatcctaccttcgcttttgtcggaggtctgtgttgccctacactcaattttgtatatgttttttggactatgattacgtttaacacaatgtttacttcgccaattta
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               attgaggcaggctacttacaaacaagttgaaattgcaagggtttcaacagtcctatttaaaggcagcgctttgcaaattctatggtcgttatagtgatcaagtttgccaatataacctttataggaatatcaaacccagatgttacatgccagaatgattgctatttgtattgtaaaaaaattcaacaaatgagatatgatttattaagacccagtacaggtatatactttgtagccaaggttaacgtttcagacaTCTGCGTT-T-AGAAA-G--TCA--TTCA----TT-T--CCCCAC--AA---AATATCTT-ATACAGG-TGCGC-TCA-TA-AT-----GA---CAAT----TG-TTT-G-CG--A--TTA--C---AAA--TTA-T-CACAAG-A-T-CAGTA-TGAAATAGACTG-ATATATA------G--TTTCATACC-CTTTGAGATATAG-AGAC--------CT-CTC-C-ATATT-CC-TACT-T--AGA--TTTTGAA-C-T-ACG--GGTAA-GCCCGAAATTTACATTTC-A-TT--TCTG--AC-TAT-AG-GGCT-CACGGG-GGCGCCGCTTCCGTGCATCCG---GCTTTT-CA-GCAGAGAGTG-A-TGC-TTACT-C-C-TCGC-ATGG-A-C-C-TGATG-CCT--ATCCTTT--CGCTT-TTTGT-C-----GGA-A-GGCT---CC-GTG-TTGCC--C--TA-C--A-CTC-G-AATTTTT---GTA-A----------TA-TG----GT---TAATATTT--GGAGGATCATAG-A--TTATCGATT--TTGA-CTTAC--A-A-TG-T-TG-AACTT-TACCaattta
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   G-CCA--ACT-A--C-TAAC--CAAAAA---GTTTG-AT-GT------TGC-----A-GGG-TTA-TAACG---AATCT-CCTT-TTA--AA-G--TCA--T-CA----TT-T--C---GC--AA---A-----T--CTAC-GGGT-CGCCT-G-TG-AT-----GA---CC-T----TG-TTT-G-CG--A--TTA--C---AAA--TTA-T-CACTAA-G-T-CA-TC-TG---TTGATTG--T---TT------G--TTTCATACC-CTTTG---T-TAG-A-----------CT-GT--C-ATTTT-CCGTTC--T--AGA--TTT--GA-C-G-ACG--GGTAA-CCCCG---TTTAC--TTT-G-TT--TC-G--AC-TA--CG-GGCT-CAC-GC-GG----------GTGTGACCG---G----TCCA-GCAGAG---G-A-TGC-TTACT-C-C-TC-C-ATGGCA-C-C-TGAT--CCT--G--CCTT--CGC-T-TTTGT-T-----GAA-G-G--T---CT-GTG-TTGCC--C--TA-C--A-CTC-G-A--TTTT---TA--A----------TG-TG----TT---T----TTTTGAGACTAT----G-A--TTA-CGT-T--TTGA-T--AC----T-TG-T-T--TACTT-CGCCA-TTTTggc
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gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      acattgttccatactgtcactctatattaaattatagtcccgctggtctattatacgggggtgaatatagggatatagtcaatatattgagagtgaggaatctctcaagtccctattttttgaaggtcctacaaatttcggaaacaccacactcctcatactttcgataatggtcgcataatttcatgagctatcaatggattctggataggcataaacaagatttagcgccaaggacgctcgggacactctaagaaatactgagggaggaaggagtgaaaagccctaacgatacttctactcgaattggaaaaaagtattcgaggtttattaaaatccacgtattcagccatttacgacaggggaaataattggtcgtacgtaattaatattccctctgtttttaaaaaccagatagtggtaaatgaagttacatgtaactacattgaaaattccctatgtggtactgtttttcgcaagctgatgtaaaagcgtagagttaaaatccaacaattgtcattgtttctgttaaaagtttaactgattataccattgattcttttttaaatgaaactagggactttacttcaacaatttctgcggaatcctagccaatggcattcaacacttccttaagcaactttcacaaccaacgtactgaaatttcttcaccccaaatttcactcttttctgtttctaatacactcttcctccaatattcgaagaatcacggatttcaagttgagagaagcaattaccattaaccttttactggcattccgataattgcatgaatatagcgccaatgtacaaacaaagatacatcgctggctccaagtaaaaagtgcttactaccaagcctcttcttatactttgactcccctaaactatcaacagctatcaaaagaatctcttcagaagatactgcctcacattacattattccagacagtgccgatgtgtcaatcagatgtggtttcttaaaaaaactctaaagaagctttataggatagtagcctacaaatcacaaaagattttcaccaaaatttgaccaagtgcattcttaagagatacgtatattcttccacactttgcacatctgacgattcctcacagatacattaaaaaatctaggcttttttcagatttagtaagataaattgctttttaaacaaaaactcggcacccaatgaaactccaccgcgaatttatactagtttcgttgggaaaacaagggaaacatcactatcccttgttatatatagattaattacaactctggatgcccacacatagtactctgaggtgaatatttaatcgatgcttgtgccttacttgatagattaaatatttatgtcgtgctaatgtggaggaaccagaagagtctatactacaaatccgta-T-CT-TA-TG---TTG--CG-AT---TTACGAATG--TTTCATACC-CTTTG---T-TAG-T-----------CTCGT----ATTTT-CG-TAC--T--AGAGATTT--GA-C-G-AAG--GGTAACTCCCG---TTTAC--TTT-G-TTGTTC-G--AC-TA--CG-GGCT-TCCGAC-GG----------GTTTGAC-G---G----T-CAAGCAAAG---G-A-TAC-TTAT----A-TC-C-ATGACA-C-C-T-AT--CCT--G--CCTT--CGC-T-TTTTG-C-----GAA-G-G--T---CC-GTG-TTGCC--C--TA-C--T-CTC-G----TACT---GT--A----------TG-TG----TT---T----TTTG-GGACTAT----G-A--TTA-CGT-T--TTGA-T--AT--A---TG-TGT--TACTT-CGCC
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     t--T---TATTT--CTAG-ACGCTAT-C----------A-TCTGA-TGAAG-CAGA-A---TCT-TTT-ATA------------TT--A---C-------GGGA-----TA---------AAA-A-------------CA-------A---AAAA----------------CTT-T--GC-CGTTCTCCTTCA----A-TCTCTTATCTA-T-----T-ATAGGTAT-CAAG-ATAG----TGTG-------TGTGATCCAAT-A-----T-C----A-T-T-ACTACA-AGTT--T-A---TAA------TACACTTC--------------TT----ATG--------TC--A-ATatattat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gaccagttcttccaactaaattccgtatacggtaattgccttaactcactataatataatatttgtgtgcccccacttacttcaatcaactcacaactG-TGTCCTTCA----AACCT------TA-CT----T-ATAGGTAT-TTAG-ACGA----TGTC-------T---------T-AAATCCT-C--G-A-T-T-A--ACA-A--T--CAA---TAAACAATGT---TCTCACC-AA--------TT----ATGAAGAAGGTTCAGC-ATTTG---AGTAT------A--T-CCT--GACGCATCCAAACTAACTACAATA-G-AA-TTGA--AAAAGATTTAT-AAAAGGA-CA--CACCCCTCTCA--C-A--GAATCTGAGCAGAT-GTGGCTT-C----ACGT----------AT-ATTTTat
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           caaaatgactaggAC--T------CT-AATCG--A-C--GAGATCCT---GACAAC----------ACTACATACGGAACTGGAT-AAAATTTCTGTT-GATATACTTTTAGTACTTT-GGC-AA-TTTCGGTCAACTTTCTTTTT-TT-A--GTAtggaatat
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ccaacgaaagcgagatcgcggcgcacggagtgcactctttgaggggtggtgataatttcgacgttggtacgtatcacgtgactG-AGCT-CAGGGT-GG----------TTGTGAACG---G----T-CA-GCAGAG---A-A-TGC-TTACT-C-C-TC-C-ATGGCA-C-C-TGAT--GCT--A--TCAT--CCT-T-TTTGT-T-----GGA-G-G--T---CC-GCG-TTGTC--C--TA-C--A-CTC-G-A--TTTT---GT--A----------TA-TT----TT---T----TAT--GGATTAT----GCA--TTA-CG--T--TTAA-C--AC--G-A-TG-C-T--ACCTT-CGCCT-ATTT
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CAACTTTTCCTTT-CT-AT-GTAGT-A-A-TAT-AC--C-ACTAGCACCT-GTT--TA-TG-GTGTGT-----A-TATCT-CCCAG---TTGA--TTCG-ATACGCAAGA--GCA-TGC--TA
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atcaattttgatgccagacttttcatgtgaaacggtcatggcaattatatataataa----T-CA-GCAGAG---G-A-TGC-TTACT-C-C-TC-C-ATGACA-C-C-TGAT--TCT--G--TCTT--CGC-T-TTTGT-C-----GGA-G-G--T---CC-GTG-TTGCC--C--TA-C--A-CTC-G-A--TTTT---GT--A----------TA-TG-----G---T----TTT--GGATTTT----G-A--TTA-CG--T--TTAA-C--AC--G-A-TG-T-T--AACTT-CGCCT-
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GGTA-TTCTTA--TGGAC-A-CATAATTG-TGG-CCC-CT--TATTG-GC------AGA--C--T---TATTT--TTAT-AT----T-C----------A-T---A-TGAAG-CAGA-A---T-T-TGA-ACAGAAAAC--T--GTT--A---A-------GGGA-----T----------AAA-A-------------CA-------A---AAAA----------------C-T-T--GC-CG-TGTCC-TCA----A-CCT------TA-CA----T-ATAGGTAT-ATAT-ATGA----TGTG-------T---------T-A-----T-C--A-A-T-TAA--ACA-A--T--C-A---TAA------T---TTTCA-C-AA--------TT----ATG--------TC--C-ATTTG---A-TAT------A--T-CCC--GA---------------------A-G-AACT-GA--TA--------TCAA-AGGA-CA--C--------CA--C-A--GAATCTGA-CATAT-Cactt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tacatgttccttcttcctcatttaattatagtcccgcgtggtcatattaattacgggggatataaaatatggtccaaaaatgaggatctcaagtcccttattttgaaaagtcctaaattcgagaaacctcgctcatttaaatggcgacatgatttcatgactatcatgaattctgtggaagaatacgccagacgctggacaaaatctgagggagaggagcttgacactttgtctgaatggataaaaagttattcggagtttattaaaatcccgttatcaccatttattggggaaaatgcgtactatttatccctctgttttaaagataaccagaagtggtaaatgaagttacatagactacatgaaaattttgtactggttccagctgataaagctagtgaacaacgttgtctttgtttgtaaaagttactattataattgtcctttaaatgaactaggatttacttcaacatctgggaatcctacttacactcaaagcaatttcacaaaagataaattcttcaaaatcacctttctgttttaaagacttgtaatattccgaagaatcaggatcaatttgaattaccataccttatttggattccgaaattgcataaaaaaccttacaaacaaagatacatcgctggctcctaatggctctaccaagcctctttctttacttttgactaaactactaacagctatcaaagaatccttcagagatactgttcaccactaaatattccagaagtggtgtcaatcagatgtggattcttaaaaaactctaaagagcttttggataacctaaaatcatgagaattttcaaaaatgacttgcatcaaaaacgcatgatctctccacactttacacaatgattcctcacgataaattaaaatctaggccttcagattatagataattgctttttaaaacaaatacggcacccgaaaatacgaatttctgagtcgttggaaacaagacacatattttgttaaaaaaacactctgattgcccacacaagtactctgaagtagatattaagagcatgcttgggtgtcttatagataatatctatgtagtctttgagaccaggtcttccaacaatccgta-A-TGC-TTACT-C-C-TC-C-ATGGCA-C-C-TGAT--CCT--G--CCTT--GGC-T-TTTGC-C-----GGA-A-G--T---CT-GTA-TTGCA--C--TA-C--A-CTC-G-A--CTTT---GT--A----------AA-TG----AT---T----TTG--GAACTAT----G-A--TTA-CG--T--TTAA-C--AC--A-T-TG-T-T--TACTT-CGCCcaacaagattgaaactaggagattgccttaaattc
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CTC--CGA-T-TTTGC-C-----GGA-G-G--T---CC-TTT-TAGCC--T--TA-C--A-CTC-G-G--TTTT---GTACA----------TA-TG----TT---T----TTG--GGATGAT----G-A--TTA-CG--T--TTAG-C--AT--A-T-TA-T-A--TATTT-CGCCaattta
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      t--CCT--G--CCTT--CGC-T-TTCGT-C-----G-----------------A-TTGCC--C--TA-CA-A-CTCGG-A--TTTT---GT--A----------TGCTG----TT---T----TTTG-GGACGAT----G-AG-TTA-CG-----TTGA-T--ACT-C-T-TG-T-T---ACTT-CGCCA-TTaatcta
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gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     C-----A-TGG-TTA-TAACG---AATCT-CGTT-T-C--AA-G--TCATTT-CA----TC-A--C---TC--AA---A-----
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TA-CG--T--TTAA-C--AC--A-TATG-T----AACTT-CGCCTGTTTTGca
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gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       cacgaattttcaaaaaattgattggccatcaaaaacgtatgatttctccaagcactttacacaacgattcccacgataaattaatctaggcttttcagattaatagatcattgcttttaacaagaaacggcacccgaaatacgaatttctagccgttggggaaacaagacacatattttgttagaaaacactctgatgccacacaaatactctgaagtagatattaagcatgcttgggttctgtatagatatatttatgtagtcttggagacgcaggtcttcaacaatccgtaT----G-A--TTT-TG--T--TTAA-C--AC--A-T-TG-T-T--TACTT-CGCCA-TTTT
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GA-C--AC--G-A-TG-T-T--AACTT-CGCCT-TTTTa
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ---GACTACT------AC-ATTATAT---------GAT-AAA-----CGT--GATG-Aatatgataaaa
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|22 ): TTAAAAATTAACGAAAAGTGATAAAAGAATGAGATTACATGAGGGTTATGTATTAGTTTCCAGCTGACAACCGCTTGTACAACATTGTCTTTGTTTGGAAGGCTCGTTATTAAAACTTGTTTGTAAGGCTCATTGATAAAAACAGTATTTCAAACGAATTCAAATCCTTAATTCCCCATTTGGTATAACAACTTATACTCCAACTGAAACTTCTCCACAATCATGCTTCAGTTTTAAACACTTTAA
Unaligned ( gi|24 ): TTAAGTCCCTTATTTTAAAAGGCCCTAAATTCTGAGAACCTCCCTCATTTAAGTGGCGACATAATTTCATGACTATCATGGATTCTGTGGAAGAATACGCCAGACGTTGGACAAAATCTGAGGGAGAGGAGCTTGACACTTTGTCTGAATGGATCAAAACTATTCGGAAATCATAAAATCACGTATTAACCATTTAGCGGGGAATAT
Unaligned ( gi|26 ): ATATAGTTTGAAAATGAGGACCTGAGATCACTTATTTAAAAAACTCTTAAATTCATACAATTGGCGACATAACTTCATTTCCATTATAAATTCTATCGAAGATTGTGCCAGACGATCGGACAAATATGACAAAGAATTTGATACCTTGTCAGAATAGATAAAAC
Unaligned ( gi|33 ): TTTCTCCCGTTACATGAAACTGCGATTTTTACAAATGTTTGTTTTGCTTAAATTAGGATACGTTCACAATGTTTCACCTCCATTTTTGCG






Alignments
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Reference ( family-36 )       :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       NGGTA-TTCCTAA-TGGGC-A-C-TAATTG-TGG-CCC-CT--TATTG-GC------AGA--C--T---TATTT--TTAT-AT----T-C----------A-T---A-CGAAG-CAGA-A---T-T-TGT-ACA-AAAAC--T--GTT--A---C-------GGGA-----TA---------AAA-A-------------CA-------A---AAAA----------------C-T-T--GC-CG-TGTCCTTCA----A-CCT------TA-CA----T-ATAGGTAT-ATAG-ACGA----TGTG-------T---------T-A-----T-C--A-A-T-T-A--ACA-A--T--C-A---TAA------T---TTTCA-C-AA--------TT----ATG--------TC--C-ATTTG---A-TAT------A--T-CCC--GA---------------------A-G-AACTCGA--NA--------T-AA-AGGA-CA--C--------CA--C-G--GAATCTGA-CATAT-CT-GCTT-C----ATAT-T-----TGGAT-ATTTTAC-T-T--AAC-AT-T-GAC--T------CT-AAT-G--G-C--G-GA--CT---GACAACT------AC-ATTATAT---------GAT-AAA-----CGT--GATG-ACTTT-A--ACTTT-G-C-AA-TC---GTCAACTTTCCTTTT-CT-AT-GTAGT-A-A-TAT-AC--C-ACTATCACCT-GCT--TA-TG-GTGTGT-----A-TGTCT-CCCAG---TTGA--TTCG-ATACGCAAGA--GCA-TGC--TATG---CG-T---ATGA-GGACTTTTT-----AAAGCG-AGG-CCA--ACT-A--C-TAAC--AAAAAA---GTT-G-AT-GT------TGC-----A-GGG-TTA-TAACG---AATCT-CGTT-T-A--AA-G--TCA--T-CA----TT-T--C---GC--AA---A-----TT-CTAC-GG-T-CGC-T-A-TA-AT-----GA---CC-T----TG-TTT-G-CG--A--TTA--C---AAA--TTA-T-CACTAA-G-T-CA-TA-TG---TTGACTG-AT---TT------G--TTTCATACC-CTTTG---T-TAG-A-----------CT-GT--C-ATTTT-CC-TAC--T--AGA--TTT--GA-C-T-ACG--GGTAA-TCCCG---TTTAC--TTT-G-TT--TC-G--AC-TA--AG-GGCT-CACGGC-GG----------GTGTGACCG---G----T-CA-GCAGAG---G-A-TGC-TTACT-C-C-TC-C-ATGGCA-C-C-TGAT--CCT--G--CCTT--CGC-T-TTTGT-C-----GGA-G-G--T---CC-GTG-TTGCC--C--TA-C--A-CTC-G-A--TTTT---GT--A----------TA-TG----TT---T----TTT--GGACTAT----G-A--TTA-CG--T--TTGA-C--AC--A-N-TG-T-T--NACTT-CGCCT-TTTTG
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GGTAGTCCCTAA-TGGGC-A-C-TAATTG-T-G-CCC-CT--TA-TG-GC------AGATGC--T---TAGTT--TTCT-ATTA--T-C----------A-TGC-A-CGAA---AGA-A---T-TGTGT--CA-AAA
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tttgactttgcgaatcgtactttccttttactatgtagtaatgtcaccactatcgcctgctattgtggtatgtctctcaggtttaatttcgaaccGATA-TTCCTAT-TCGGCTG-C-CAATTG-TTG-CCC-CT--TATTG-AC------AGA--CCAT---AATCC--TTATTAT----TGC----------A-T---AACGAAG-CAGA-----T-T-TGT-TCA-AAAAC--T--GTT--ATCGC-------GGGAAC---TA---------AAA-AAAAACAAAAAAAACA-------A---AAAAATAAAGCAACACAACTT-T-T--GC-CG-TTTCCTTCA----A-CCT------TA-CA----T-ACAGTTAT-ATAG-ACGA----TGTC-------T---------T-A-----T-C----G-T-T-C--AC--A--T--C-AT--TAT------T---TTTCA-C-AA--------TT----TTG--------TC--C-ATT-----A-TAT------T--G-CCT--GA---------------------C-G-AACTTAG--AA--------T-AA-AGGA-
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aagatctttgatttatactacgaaacttttcatatttttttgtcagatccactataattgccgcacacaagtactctaaagggatatccaatagaaattcttgggtttcttataaaactgatatttaatgtcagtcttgggccatgtcatccaacaattatgtttG-AGG-CAG--GCT-A--C-TTAC--AAACAA---GTT-G-AA-AT------TGC-----AAGGG-TTT-CAAC----AGTCC-TATT-T-A--AA-G--GCA--G-CG----CT-T--T---GC--AA---A-----TT-CTAT-GG-T-CGT-T-A-TA-GT-----GA---TC-A----AG-TTT-G-CC--A--ATA--T---AAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                att-G-TT--TC-G--AC-TA--AG-GGCT-CACGGC-GG----------GTGTGACCG---G----T-CA-GCAGAG---G-A-TGC-TTACT-C-C-TC-C-ATGGCA-C-C-TGAT--CCT--A--CCTT--CGC-T-TTTGT-C-----GGA-G-G--T---CT-GTG-TTGCC--C--TA-C--A-CTC-A-A--TTTT---GT--A----------TA-TG----TT---T----TTT--GGACTAT----G-A--TTA-CG--T--TTAA-C--AC--A-A-TG-T-T--TACTT-CGCCcctttataggaatatcaaacccagatgttacatgccagaatgattgctatttgtattgtaaaaaaattcaacaaatgagatatgatttattaagacccagtacaggtatatactttgtagccaaggttaacgtttcagacagtttcgactaagggctcacggcgggtgtgaccggtcagcagaggatgcttactcctccatggcacctgatcctaccttcgcttttgtcggaggtctgtgttgccctacactcaattttgtatatgttttttggactatgattacgtttaacacaatgtttacttcgccaattta
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               attgaggcaggctacttacaaacaagttgaaattgcaagggtttcaacagtcctatttaaaggcagcgctttgcaaattctatggtcgttatagtgatcaagtttgccaatataacctttataggaatatcaaacccagatgttacatgccagaatgattgctatttgtattgtaaaaaaattcaacaaatgagatatgatttattaagacccagtacaggtatatactttgtagccaaggttaacgtttcagacaTCTGCGTT-T-AGAAA-G--TCA--TTCA----TT-T--CCCCAC--AA---AATATCTT-ATACAGG-TGCGC-TCA-TA-AT-----GA---CAAT----TG-TTT-G-CG--A--TTA--C---AAA--TTA-T-CACAAG-A-T-CAGTA-TGAAATAGACTG-ATATATA------G--TTTCATACC-CTTTGAGATATAG-AGAC--------CT-CTC-C-ATATT-CC-TACT-T--AGA--TTTTGAA-C-T-ACG--GGTAA-GCCCGAAATTTACATTTC-A-TT--TCTG--AC-TAT-AG-GGCT-CACGGG-GGCGCCGCTTCCGTGCATCCG---GCTTTT-CA-GCAGAGAGTG-A-TGC-TTACT-C-C-TCGC-ATGG-A-C-C-TGATG-CCT--ATCCTTT--CGCTT-TTTGT-C-----GGA-A-GGCT---CC-GTG-TTGCC--C--TA-C--A-CTC-G-AATTTTT---GTA-A----------TA-TG----GT---TAATATTT--GGAGGATCATAG-A--TTATCGATT--TTGA-CTTAC--A-A-TG-T-TG-AACTT-TACCaattta
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   G-CCA--ACT-A--C-TAAC--CAAAAA---GTTTG-AT-GT------TGC-----A-GGG-TTA-TAACG---AATCT-CCTT-TTA--AA-G--TCA--T-CA----TT-T--C---GC--AA---A-----T--CTAC-GGGT-CGCCT-G-TG-AT-----GA---CC-T----TG-TTT-G-CG--A--TTA--C---AAA--TTA-T-CACTAA-G-T-CA-TC-TG---TTGATTG--T---TT------G--TTTCATACC-CTTTG---T-TAG-A-----------CT-GT--C-ATTTT-CCGTTC--T--AGA--TTT--GA-C-G-ACG--GGTAA-CCCCG---TTTAC--TTT-G-TT--TC-G--AC-TA--CG-GGCT-CAC-GC-GG----------GTGTGACCG---G----TCCA-GCAGAG---G-A-TGC-TTACT-C-C-TC-C-ATGGCA-C-C-TGAT--CCT--G--CCTT--CGC-T-TTTGT-T-----GAA-G-G--T---CT-GTG-TTGCC--C--TA-C--A-CTC-G-A--TTTT---TA--A----------TG-TG----TT---T----TTTTGAGACTAT----G-A--TTA-CGT-T--TTGA-T--AC----T-TG-T-T--TACTT-CGCCA-TTTTggc
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gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      acattgttccatactgtcactctatattaaattatagtcccgctggtctattatacgggggtgaatatagggatatagtcaatatattgagagtgaggaatctctcaagtccctattttttgaaggtcctacaaatttcggaaacaccacactcctcatactttcgataatggtcgcataatttcatgagctatcaatggattctggataggcataaacaagatttagcgccaaggacgctcgggacactctaagaaatactgagggaggaaggagtgaaaagccctaacgatacttctactcgaattggaaaaaagtattcgaggtttattaaaatccacgtattcagccatttacgacaggggaaataattggtcgtacgtaattaatattccctctgtttttaaaaaccagatagtggtaaatgaagttacatgtaactacattgaaaattccctatgtggtactgtttttcgcaagctgatgtaaaagcgtagagttaaaatccaacaattgtcattgtttctgttaaaagtttaactgattataccattgattcttttttaaatgaaactagggactttacttcaacaatttctgcggaatcctagccaatggcattcaacacttccttaagcaactttcacaaccaacgtactgaaatttcttcaccccaaatttcactcttttctgtttctaatacactcttcctccaatattcgaagaatcacggatttcaagttgagagaagcaattaccattaaccttttactggcattccgataattgcatgaatatagcgccaatgtacaaacaaagatacatcgctggctccaagtaaaaagtgcttactaccaagcctcttcttatactttgactcccctaaactatcaacagctatcaaaagaatctcttcagaagatactgcctcacattacattattccagacagtgccgatgtgtcaatcagatgtggtttcttaaaaaaactctaaagaagctttataggatagtagcctacaaatcacaaaagattttcaccaaaatttgaccaagtgcattcttaagagatacgtatattcttccacactttgcacatctgacgattcctcacagatacattaaaaaatctaggcttttttcagatttagtaagataaattgctttttaaacaaaaactcggcacccaatgaaactccaccgcgaatttatactagtttcgttgggaaaacaagggaaacatcactatcccttgttatatatagattaattacaactctggatgcccacacatagtactctgaggtgaatatttaatcgatgcttgtgccttacttgatagattaaatatttatgtcgtgctaatgtggaggaaccagaagagtctatactacaaatccgta-T-CT-TA-TG---TTG--CG-AT---TTACGAATG--TTTCATACC-CTTTG---T-TAG-T-----------CTCGT----ATTTT-CG-TAC--T--AGAGATTT--GA-C-G-AAG--GGTAACTCCCG---TTTAC--TTT-G-TTGTTC-G--AC-TA--CG-GGCT-TCCGAC-GG----------GTTTGAC-G---G----T-CAAGCAAAG---G-A-TAC-TTAT----A-TC-C-ATGACA-C-C-T-AT--CCT--G--CCTT--CGC-T-TTTTG-C-----GAA-G-G--T---CC-GTG-TTGCC--C--TA-C--T-CTC-G----TACT---GT--A----------TG-TG----TT---T----TTTG-GGACTAT----G-A--TTA-CGT-T--TTGA-T--AT--A---TG-TGT--TACTT-CGCC
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     t--T---TATTT--CTAG-ACGCTAT-C----------A-TCTGA-TGAAG-CAGA-A---TCT-TTT-ATA------------TT--A---C-------GGGA-----TA---------AAA-A-------------CA-------A---AAAA----------------CTT-T--GC-CGTTCTCCTTCA----A-TCTCTTATCTA-T-----T-ATAGGTAT-CAAG-ATAG----TGTG-------TGTGATCCAAT-A-----T-C----A-T-T-ACTACA-AGTT--T-A---TAA------TACACTTC--------------TT----ATG--------TC--A-ATatattat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gaccagttcttccaactaaattccgtatacggtaattgccttaactcactataatataatatttgtgtgcccccacttacttcaatcaactcacaactG-TGTCCTTCA----AACCT------TA-CT----T-ATAGGTAT-TTAG-ACGA----TGTC-------T---------T-AAATCCT-C--G-A-T-T-A--ACA-A--T--CAA---TAAACAATGT---TCTCACC-AA--------TT----ATGAAGAAGGTTCAGC-ATTTG---AGTAT------A--T-CCT--GACGCATCCAAACTAACTACAATA-G-AA-TTGA--AAAAGATTTAT-AAAAGGA-CA--CACCCCTCTCA--C-A--GAATCTGAGCAGAT-GTGGCTT-C----ACGT----------AT-ATTTTat
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           caaaatgactaggAC--T------CT-AATCG--A-C--GAGATCCT---GACAAC----------ACTACATACGGAACTGGAT-AAAATTTCTGTT-GATATACTTTTAGTACTTT-GGC-AA-TTTCGGTCAACTTTCTTTTT-TT-A--GTAtggaatat
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ccaacgaaagcgagatcgcggcgcacggagtgcactctttgaggggtggtgataatttcgacgttggtacgtatcacgtgactG-AGCT-CAGGGT-GG----------TTGTGAACG---G----T-CA-GCAGAG---A-A-TGC-TTACT-C-C-TC-C-ATGGCA-C-C-TGAT--GCT--A--TCAT--CCT-T-TTTGT-T-----GGA-G-G--T---CC-GCG-TTGTC--C--TA-C--A-CTC-G-A--TTTT---GT--A----------TA-TT----TT---T----TAT--GGATTAT----GCA--TTA-CG--T--TTAA-C--AC--G-A-TG-C-T--ACCTT-CGCCT-ATTT
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CAACTTTTCCTTT-CT-AT-GTAGT-A-A-TAT-AC--C-ACTAGCACCT-GTT--TA-TG-GTGTGT-----A-TATCT-CCCAG---TTGA--TTCG-ATACGCAAGA--GCA-TGC--TA
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atcaattttgatgccagacttttcatgtgaaacggtcatggcaattatatataataa----T-CA-GCAGAG---G-A-TGC-TTACT-C-C-TC-C-ATGACA-C-C-TGAT--TCT--G--TCTT--CGC-T-TTTGT-C-----GGA-G-G--T---CC-GTG-TTGCC--C--TA-C--A-CTC-G-A--TTTT---GT--A----------TA-TG-----G---T----TTT--GGATTTT----G-A--TTA-CG--T--TTAA-C--AC--G-A-TG-T-T--AACTT-CGCCT-
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GGTA-TTCTTA--TGGAC-A-CATAATTG-TGG-CCC-CT--TATTG-GC------AGA--C--T---TATTT--TTAT-AT----T-C----------A-T---A-TGAAG-CAGA-A---T-T-TGA-ACAGAAAAC--T--GTT--A---A-------GGGA-----T----------AAA-A-------------CA-------A---AAAA----------------C-T-T--GC-CG-TGTCC-TCA----A-CCT------TA-CA----T-ATAGGTAT-ATAT-ATGA----TGTG-------T---------T-A-----T-C--A-A-T-TAA--ACA-A--T--C-A---TAA------T---TTTCA-C-AA--------TT----ATG--------TC--C-ATTTG---A-TAT------A--T-CCC--GA---------------------A-G-AACT-GA--TA--------TCAA-AGGA-CA--C--------CA--C-A--GAATCTGA-CATAT-Cactt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tacatgttccttcttcctcatttaattatagtcccgcgtggtcatattaattacgggggatataaaatatggtccaaaaatgaggatctcaagtcccttattttgaaaagtcctaaattcgagaaacctcgctcatttaaatggcgacatgatttcatgactatcatgaattctgtggaagaatacgccagacgctggacaaaatctgagggagaggagcttgacactttgtctgaatggataaaaagttattcggagtttattaaaatcccgttatcaccatttattggggaaaatgcgtactatttatccctctgttttaaagataaccagaagtggtaaatgaagttacatagactacatgaaaattttgtactggttccagctgataaagctagtgaacaacgttgtctttgtttgtaaaagttactattataattgtcctttaaatgaactaggatttacttcaacatctgggaatcctacttacactcaaagcaatttcacaaaagataaattcttcaaaatcacctttctgttttaaagacttgtaatattccgaagaatcaggatcaatttgaattaccataccttatttggattccgaaattgcataaaaaaccttacaaacaaagatacatcgctggctcctaatggctctaccaagcctctttctttacttttgactaaactactaacagctatcaaagaatccttcagagatactgttcaccactaaatattccagaagtggtgtcaatcagatgtggattcttaaaaaactctaaagagcttttggataacctaaaatcatgagaattttcaaaaatgacttgcatcaaaaacgcatgatctctccacactttacacaatgattcctcacgataaattaaaatctaggccttcagattatagataattgctttttaaaacaaatacggcacccgaaaatacgaatttctgagtcgttggaaacaagacacatattttgttaaaaaaacactctgattgcccacacaagtactctgaagtagatattaagagcatgcttgggtgtcttatagataatatctatgtagtctttgagaccaggtcttccaacaatccgta-A-TGC-TTACT-C-C-TC-C-ATGGCA-C-C-TGAT--CCT--G--CCTT--GGC-T-TTTGC-C-----GGA-A-G--T---CT-GTA-TTGCA--C--TA-C--A-CTC-G-A--CTTT---GT--A----------AA-TG----AT---T----TTG--GAACTAT----G-A--TTA-CG--T--TTAA-C--AC--A-T-TG-T-T--TACTT-CGCCcaacaagattgaaactaggagattgccttaaattc
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CTC--CGA-T-TTTGC-C-----GGA-G-G--T---CC-TTT-TAGCC--T--TA-C--A-CTC-G-G--TTTT---GTACA----------TA-TG----TT---T----TTG--GGATGAT----G-A--TTA-CG--T--TTAG-C--AT--A-T-TA-T-A--TATTT-CGCCaattta
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      t--CCT--G--CCTT--CGC-T-TTCGT-C-----G-----------------A-TTGCC--C--TA-CA-A-CTCGG-A--TTTT---GT--A----------TGCTG----TT---T----TTTG-GGACGAT----G-AG-TTA-CG-----TTGA-T--ACT-C-T-TG-T-T---ACTT-CGCCA-TTaatcta
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gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     C-----A-TGG-TTA-TAACG---AATCT-CGTT-T-C--AA-G--TCATTT-CA----TC-A--C---TC--AA---A-----
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TA-CG--T--TTAA-C--AC--A-TATG-T----AACTT-CGCCTGTTTTGca
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gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       cacgaattttcaaaaaattgattggccatcaaaaacgtatgatttctccaagcactttacacaacgattcccacgataaattaatctaggcttttcagattaatagatcattgcttttaacaagaaacggcacccgaaatacgaatttctagccgttggggaaacaagacacatattttgttagaaaacactctgatgccacacaaatactctgaagtagatattaagcatgcttgggttctgtatagatatatttatgtagtcttggagacgcaggtcttcaacaatccgtaT----G-A--TTT-TG--T--TTAA-C--AC--A-T-TG-T-T--TACTT-CGCCA-TTTT
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GA-C--AC--G-A-TG-T-T--AACTT-CGCCT-TTTTa
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ---GACTACT------AC-ATTATAT---------GAT-AAA-----CGT--GATG-Aatatgataaaa
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|22 ): TTAAAAATTAACGAAAAGTGATAAAAGAATGAGATTACATGAGGGTTATGTATTAGTTTCCAGCTGACAACCGCTTGTACAACATTGTCTTTGTTTGGAAGGCTCGTTATTAAAACTTGTTTGTAAGGCTCATTGATAAAAACAGTATTTCAAACGAATTCAAATCCTTAATTCCCCATTTGGTATAACAACTTATACTCCAACTGAAACTTCTCCACAATCATGCTTCAGTTTTAAACACTTTAA
Unaligned ( gi|24 ): TTAAGTCCCTTATTTTAAAAGGCCCTAAATTCTGAGAACCTCCCTCATTTAAGTGGCGACATAATTTCATGACTATCATGGATTCTGTGGAAGAATACGCCAGACGTTGGACAAAATCTGAGGGAGAGGAGCTTGACACTTTGTCTGAATGGATCAAAACTATTCGGAAATCATAAAATCACGTATTAACCATTTAGCGGGGAATAT
Unaligned ( gi|26 ): ATATAGTTTGAAAATGAGGACCTGAGATCACTTATTTAAAAAACTCTTAAATTCATACAATTGGCGACATAACTTCATTTCCATTATAAATTCTATCGAAGATTGTGCCAGACGATCGGACAAATATGACAAAGAATTTGATACCTTGTCAGAATAGATAAAAC
Unaligned ( gi|33 ): TTTCTCCCGTTACATGAAACTGCGATTTTTACAAATGTTTGTTTTGCTTAAATTAGGATACGTTCACAATGTTTCACCTCCATTTTTGCG






Alignments
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Reference ( family-36 )       :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           NGGTA-TTCCTAA-TGGGC-A-C-TAATTGTNG--CCCCT--TATTG-GC------AGA--C--T---TATTT--TTAT-AT----T-C----------A-T---A-CGAAG-CAGA-A---T-T-TGT-ACA-AAAAC--T--GTT--A---C-------GGGA-----TA---------AAA-A-------------CA-------A---AAAA----------------C-T-T--GC-CG-TGTCCTTCA----A-CCT------TA-CA----T-ATAGGTAT-ATAG-ACGA----TGTG-------T---------T-A-----T-C--A-A-T-TA--A-CA-A--T--C-A---TAA------T---TTTCA-C-AA--------TT----ATG--------TC--C-ATTTG---A-TAT------A--T-CCC--GA---------------------A-G-AACTCGA--NA--------T-AA-AGGA-CA--C--------CA--C-G--GAATCTGA-CATAT-CT-GCTT-C----ATAT-----TTGGAT-ATTTTAC-T-T--AAC-AT-T-GAC--T------CT-AAT-G--GC-A-GA--CTGA--CAACT------AC-ATTATAT---------GAT-AAA-----CGT--GATG-ACTTT-A--ACTTT-G-C-AA-TC---GTCAACTTTCCTTTT-CT-AT-GTAGT-A-A-TAT-AC--C-ACTATCACCT-GCT--TA-TG-GTGTGT-----A-TGTCT-CCCAG---TTGA--TTCG-ATACGCAAGA--GCA-TGC--TATG---CG-T---ATGA-GGACTTTTT-----AAAGCG-AGG-CCA--ACT-A--C-TAAC--AAAAAA---GTT-G-AT-GT------TGC-----A-GGG-TTA-TAACG---AATCT-CGTT-T-A--AA-G--TCA--T-CA----TT-T--C---GC--AA---A-----TT-CTAC-GG-T-CGC-T-A-TA-AT-----GA---CC-T----TG-TTT-G-CG--A--TTA--C---AAA--TTA-T-CACTAA-G-T-CA-TA-TG---TTGACTG-AT---TT------G--TTTCATACC-CTTTG---T-TAG-A-----------CT-GT--C-ATTTT-CC-TAC--T--AGA--TTT--GA-C-T-ACG--GGTAA-TCCCG---TTTAC--TTT-G-TT--TC-G--AC-TA--AG-GGCT-CACGGC-GG----------GTGTGACCG---G----T-CA-GCAGAG---G-A-TGC-TTACT-C-C-TC-C-ATGGCA-C-C-TGAT--CCT--G--CCTT--CGC-T-TTTGT-C-----GGA-G-G--T---CC-GTG-TTGCC--C--TA-C--A-CTC-G-A--TTTT---GT--A----------TA-TG----TT---T----TTT--GGACTAT----G-A--TTA-CG--T--TTGA-C--ACA-A--TG-T-T--NACTT-CGCCT-TTTTG
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GGTAGTCCCTAA-TGGGC-A-C-TAATTGT-G--CCCCT--TA-TG-GC------AGATGC--T---TAGTT--TTCT-ATTA--T-C----------A-TGC-A-CGAA---AGA-A---T-TGTGT--CA-AAA
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AAA---ATT-GCAT-GT------TGC-----A-GG--TTA-TAACG---AATCT-CGTT-T-A-----G--TCA--T-CA----TT-TGTC---GC--AA---C-----TT-CTAC-G--T-CGC-T-A-TA-AT-----AAGTACC-T----TGGTTT-GGCG--A--TTA--C---AAAA-TTA-T-CACCAA-AAT-CA-TT-AG---TTGACTG-AT---TT------G--TTTCATAACACTTTG---T-TAA-A-----------CA-GT--C-ATTTT-CT-TAC--T--AGA--TTT--GA-C-GGACG--GGTAA--CCCG---TTTAC--TAT-G-TT--TT-G--AC-AA--CG-GGCT-CACGGC-GG----------GTGTGATCG---G----T-CA-GCAGAG---G-A-TGC-TTACT-C-C-TC-C-ATGACA-CAC-TGAT--CCTCGG--CCTT--CAC-T-TTT---------------G--T---CC-GTGTTTGCC--T--GA-C--A-CTC-G-A--TTTT---G--------------TA-TG----TT---C----TTT--GGACTAT----G-A--TTA-CG--T--TTAA-T--ACA-T--TG-T-T--TACTT-CGCCA-TTTTgcaggttataacgaatctcgtttagtcatcatttgtcgcaacttctacgtcgctataataagtaccttggtttggcgattacaaaattatcaccaaaatcattagttgactgatttgtttcataacactttgttaaacagtcattttcttactagatttgacggacgggtaacccgtttactatgttttgacaacgggctcacggcgggtgtgatcggtcagcagaggatgcttactcctccatgacacactgatcctcggccttcacttttgtccgtgtttgcctgacactcgattttgtatgttctttggactatgattacgtttaatacattgtttacttcgccatttt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tttgactttgcgaatcgtactttccttttactatgtagtaatgtcaccactatcgcctgctattgtggtatgtctctcaggtttaatttcgaaccGATA-TTCCTAT-TCGGCTG-C-CAATTGTTG--CCCCT--TATTG-AC------AGA--CCAT---AATCC--TTATTAT----TGC----------A-T---AACGAAG-CAGA-----T-T-TGT-TCA-AAAAC--T--GTT--ATCGC-------GGGAAC---TA---------AAA-AAAAACAAAAAAAACA-------A---AAAAATAAAGCAACACAACTT-T-T--GC-CG-TTTCCTTCA----A-CCT------TA-CA----T-ACAGTTAT-ATAG-ACGA----TGTC-------T---------T-A-----T-C----G-T-TC--A-C--A--T--C-AT--TAT------T---TTTCA-C-AA--------TT----TTG--------TC--C-ATT-----A-TAT------T--G-CCT--GA---------------------C-G-AACTTAG--AA--------T-AA-AGGA-
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aagatctttgatttatactacgaaacttttcatatttttttgtcagatccactataattgccgcacacaagtactctaaagggatatccaatagaaattcttgggtttcttataaaactgatatttaatgtcagtcttgggccatgtcatccaacaattatgtttG-AGG-CAG--GCT-A--C-TTAC--AAACAA---GTT-G-AA-AT------TGC-----AAGGG-TTT-CAAC----AGTCC-TATT-T-A--AA-G--GCA--G-CG----CT-T--T---GC--AA---A-----TT-CTAT-GG-T-CGT-T-A-TA-GT-----GA---TC-A----AG-TTT-G-CC--A--ATA--T---AAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               att-G-TT--TC-G--AC-TA--AG-GGCT-CACGGC-GG----------GTGTGACCG---G----T-CA-GCAGAG---G-A-TGC-TTACT-C-C-TC-C-ATGGCA-C-C-TGAT--CCT--A--CCTT--CGC-T-TTTGT-C-----GGA-G-G--T---CT-GTG-TTGCC--C--TA-C--A-CTC-A-A--TTTT---GT--A----------TA-TG----TT---T----TTT--GGACTAT----G-A--TTA-CG--T--TTAA-C--ACA-A--TG-T-T--TACTT-CGCCcctttataggaatatcaaacccagatgttacatgccagaatgattgctatttgtattgtaaaaaaattcaacaaatgagatatgatttattaagacccagtacaggtatatactttgtagccaaggttaacgtttcagacagtttcgactaagggctcacggcgggtgtgaccggtcagcagaggatgcttactcctccatggcacctgatcctaccttcgcttttgtcggaggtctgtgttgccctacactcaattttgtatatgttttttggactatgattacgtttaacacaatgtttacttcgccaattta
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              attgaggcaggctacttacaaacaagttgaaattgcaagggtttcaacagtcctatttaaaggcagcgctttgcaaattctatggtcgttatagtgatcaagtttgccaatataacctttataggaatatcaaacccagatgttacatgccagaatgattgctatttgtattgtaaaaaaattcaacaaatgagatatgatttattaagacccagtacaggtatatactttgtagccaaggttaacgtttcagacaTCTGCGTT-T-AGAAA-G--TCA--TTCA----TT-T--CCCCAC--AA---AATATCTT-ATACAGG-TGCGC-TCA-TA-AT-----GA---CAAT----TG-TTT-G-CG--A--TTA--C---AAA--TTA-T-CACAAG-A-T-CAGTA-TGAAATAGACTG-ATATATA------G--TTTCATACC-CTTTGAGATATAG-AGAC--------CT-CTC-C-ATATT-CC-TACT-T--AGA--TTTTGAA-C-T-ACG--GGTAA-GCCCGAAATTTACATTTC-A-TT--TCTG--AC-TAT-AG-GGCT-CACGGG-GGCGCCGCTTCCGTGCATCCG---GCTTTT-CA-GCAGAGAGTG-A-TGC-TTACT-C-C-TCGC-ATGG-A-C-C-TGATG-CCT--ATCCTTT--CGCTT-TTTGT-C-----GGA-A-GGCT---CC-GTG-TTGCC--C--TA-C--A-CTC-G-AATTTTT---GTA-A----------TA-TG----GT---TAATATTT--GGAGGATCATAG-A--TTATCGATT--TTGA-CTTACA-A--TG-T-TG-AACTT-TACCaattta
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  G-CCA--ACT-A--C-TAAC--CAAAAA---GTTTG-AT-GT------TGC-----A-GGG-TTA-TAACG---AATCT-CCTT-TTA--AA-G--TCA--T-CA----TT-T--C---GC--AA---A-----T--CTAC-GGGT-CGCCT-G-TG-AT-----GA---CC-T----TG-TTT-G-CG--A--TTA--C---AAA--TTA-T-CACTAA-G-T-CA-TC-TG---TTGATTG--T---TT------G--TTTCATACC-CTTTG---T-TAG-A-----------CT-GT--C-ATTTT-CCGTTC--T--AGA--TTT--GA-C-G-ACG--GGTAA-CCCCG---TTTAC--TTT-G-TT--TC-G--AC-TA--CG-GGCT-CAC-GC-GG----------GTGTGACCG---G----TCCA-GCAGAG---G-A-TGC-TTACT-C-C-TC-C-ATGGCA-C-C-TGAT--CCT--G--CCTT--CGC-T-TTTGT-T-----GAA-G-G--T---CT-GTG-TTGCC--C--TA-C--A-CTC-G-A--TTTT---TA--A----------TG-TG----TT---T----TTTTGAGACTAT----G-A--TTA-CGT-T--TTGA-T--AC--T--TG-T-T--TACTT-CGCCA-TTTTggc
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gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     acattgttccatactgtcactctatattaaattatagtcccgctggtctattatacgggggtgaatatagggatatagtcaatatattgagagtgaggaatctctcaagtccctattttttgaaggtcctacaaatttcggaaacaccacactcctcatactttcgataatggtcgcataatttcatgagctatcaatggattctggataggcataaacaagatttagcgccaaggacgctcgggacactctaagaaatactgagggaggaaggagtgaaaagccctaacgatacttctactcgaattggaaaaaagtattcgaggtttattaaaatccacgtattcagccatttacgacaggggaaataattggtcgtacgtaattaatattccctctgtttttaaaaaccagatagtggtaaatgaagttacatgtaactacattgaaaattccctatgtggtactgtttttcgcaagctgatgtaaaagcgtagagttaaaatccaacaattgtcattgtttctgttaaaagtttaactgattataccattgattcttttttaaatgaaactagggactttacttcaacaatttctgcggaatcctagccaatggcattcaacacttccttaagcaactttcacaaccaacgtactgaaatttcttcaccccaaatttcactcttttctgtttctaatacactcttcctccaatattcgaagaatcacggatttcaagttgagagaagcaattaccattaaccttttactggcattccgataattgcatgaatatagcgccaatgtacaaacaaagatacatcgctggctccaagtaaaaagtgcttactaccaagcctcttcttatactttgactcccctaaactatcaacagctatcaaaagaatctcttcagaagatactgcctcacattacattattccagacagtgccgatgtgtcaatcagatgtggtttcttaaaaaaactctaaagaagctttataggatagtagcctacaaatcacaaaagattttcaccaaaatttgaccaagtgcattcttaagagatacgtatattcttccacactttgcacatctgacgattcctcacagatacattaaaaaatctaggcttttttcagatttagtaagataaattgctttttaaacaaaaactcggcacccaatgaaactccaccgcgaatttatactagtttcgttgggaaaacaagggaaacatcactatcccttgttatatatagattaattacaactctggatgcccacacatagtactctgaggtgaatatttaatcgatgcttgtgccttacttgatagattaaatatttatgtcgtgctaatgtggaggaaccagaagagtctatactacaaatccgta-T-CT-TA-TG---TTG--CG-AT---TTACGAATG--TTTCATACC-CTTTG---T-TAG-T-----------CTCGT----ATTTT-CG-TAC--T--AGAGATTT--GA-C-G-AAG--GGTAACTCCCG---TTTAC--TTT-G-TTGTTC-G--AC-TA--CG-GGCT-TCCGAC-GG----------GTTTGAC-G---G----T-CAAGCAAAG---G-A-TAC-TTAT----A-TC-C-ATGACA-C-C-T-AT--CCT--G--CCTT--CGC-T-TTTTG-C-----GAA-G-G--T---CC-GTG-TTGCC--C--TA-C--T-CTC-G----TACT---GT--A----------TG-TG----TT---T----TTTG-GGACTAT----G-A--TTA-CGT-T--TTGA-T--AT--A--TG-TGT--TACTT-CGCC
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        t--T---TATTT--CTAG-ACGCTAT-C----------A-TCTGA-TGAAG-CAGA-A---TCT-TTT-ATA------------TT--A---C-------GGGA-----TA---------AAA-A-------------CA-------A---AAAA----------------CTT-T--GC-CGTTCTCCTTCA----A-TCTCTTATCTA-T-----T-ATAGGTAT-CAAG-ATAG----TGTG-------TGTGATCCAAT-A-----T-C----A-T-TACTA-CA-AGTT--T-A---TAA------TACACTTC--------------TT----ATG--------TC--A-ATatattat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gaccagttcttccaactaaattccgtatacggtaattgccttaactcactataatataatatttgtgtgcccccacttacttcaatcaactcacaactG-TGTCCTTCA----AACCT------TA-CT----T-ATAGGTAT-TTAG-ACGA----TGTC-------T---------T-AAATCCT-C--G-A-T-TA--A-CA-A--T--CAA---TAAACAATGT---TCTCACC-AA--------TT----ATGAAGAAGGTTCAGC-ATTTG---AGTAT------A--T-CCT--GACGCATCCAAACTAACTACAATA-G-AA-TTGA--AAAAGATTTAT-AAAAGGA-CA--CACCCCTCTCA--C-A--GAATCTGAGCAGAT-GTGGCTT-C----ACGT---------AT-ATTTTat
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             caaaatgactaggAC--T------CT-AATCG--ACGA-GATCCTGA--CAAC----------ACTACATACGGAACTGGAT-AAAATTTCTGTT-GATATACTTTTAGTACTTT-GGC-AA-TTTCGGTCAACTTTCTTTTT-TT-A--GTAtggaatat
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ccaacgaaagcgagatcgcggcgcacggagtgcactctttgaggggtggtgataatttcgacgttggtacgtatcacgtgactG-AGCT-CAGGGT-GG----------TTGTGAACG---G----T-CA-GCAGAG---A-A-TGC-TTACT-C-C-TC-C-ATGGCA-C-C-TGAT--GCT--A--TCAT--CCT-T-TTTGT-T-----GGA-G-G--T---CC-GCG-TTGTC--C--TA-C--A-CTC-G-A--TTTT---GT--A----------TA-TT----TT---T----TAT--GGATTAT----GCA--TTA-CG--T--TTAA-C--ACG-A--TG-C-T--ACCTT-CGCCT-ATTT
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CAACTTTTCCTTT-CT-AT-GTAGT-A-A-TAT-AC--C-ACTAGCACCT-GTT--TA-TG-GTGTGT-----A-TATCT-CCCAG---TTGA--TTCG-ATACGCAAGA--GCA-TGC--TA
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atcaattttgatgccagacttttcatgtgaaacggtcatggcaattatatataataa----T-CA-GCAGAG---G-A-TGC-TTACT-C-C-TC-C-ATGACA-C-C-TGAT--TCT--G--TCTT--CGC-T-TTTGT-C-----GGA-G-G--T---CC-GTG-TTGCC--C--TA-C--A-CTC-G-A--TTTT---GT--A----------TA-TG-----G---T----TTT--GGATTTT----G-A--TTA-CG--T--TTAA-C--ACG-A--TG-T-T--AACTT-CGCCT-
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GGTA-TTCTTA--TGGAC-A-CATAATTGTGG--CCCCT--TATTG-GC------AGA--C--T---TATTT--TTAT-AT----T-C----------A-T---A-TGAAG-CAGA-A---T-T-TGA-ACAGAAAAC--T--GTT--A---A-------GGGA-----TA---------AAA---------------CA-------A---AAAA----------------C-T-T--GC-CG-TGTCCT-CA----A-CCT------TA-CA----T-ATAGGTAT-ATAT-ATGA----TGTG-------T---------T-A-----T-C--A-A-T-TA--AACA-A--T--C-A---TAA------T---TTTCA-C-AA--------TT----ATG--------TC--C-ATTTG---A-TAT------A--T-CCC--GA---------------------A-G-AACT-GA--TA--------TCAA-AGGA-CA--C--------CA--C-A--GAATCTGA-CATAT-Cactt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tacatgttccttcttcctcatttaattatagtcccgcgtggtcatattaattacgggggatataaaatatggtccaaaaatgaggatctcaagtcccttattttgaaaagtcctaaattcgagaaacctcgctcatttaaatggcgacatgatttcatgactatcatgaattctgtggaagaatacgccagacgctggacaaaatctgagggagaggagcttgacactttgtctgaatggataaaaagttattcggagtttattaaaatcccgttatcaccatttattggggaaaatgcgtactatttatccctctgttttaaagataaccagaagtggtaaatgaagttacatagactacatgaaaattttgtactggttccagctgataaagctagtgaacaacgttgtctttgtttgtaaaagttactattataattgtcctttaaatgaactaggatttacttcaacatctgggaatcctacttacactcaaagcaatttcacaaaagataaattcttcaaaatcacctttctgttttaaagacttgtaatattccgaagaatcaggatcaatttgaattaccataccttatttggattccgaaattgcataaaaaaccttacaaacaaagatacatcgctggctcctaatggctctaccaagcctctttctttacttttgactaaactactaacagctatcaaagaatccttcagagatactgttcaccactaaatattccagaagtggtgtcaatcagatgtggattcttaaaaaactctaaagagcttttggataacctaaaatcatgagaattttcaaaaatgacttgcatcaaaaacgcatgatctctccacactttacacaatgattcctcacgataaattaaaatctaggccttcagattatagataattgctttttaaaacaaatacggcacccgaaaatacgaatttctgagtcgttggaaacaagacacatattttgttaaaaaaacactctgattgcccacacaagtactctgaagtagatattaagagcatgcttgggtgtcttatagataatatctatgtagtctttgagaccaggtcttccaacaatccgta-A-TGC-TTACT-C-C-TC-C-ATGGCA-C-C-TGAT--CCT--G--CCTT--GGC-T-TTTGC-C-----GGA-A-G--T---CT-GTA-TTGCA--C--TA-C--A-CTC-G-A--CTTT---GT--A----------AA-TG----AT---T----TTG--GAACTAT----G-A--TTA-CG--T--TTAA-C--ACA-T--TG-T-T--TACTT-CGCCcaacaagattgaaactaggagattgccttaaattc
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTC--CGA-T-TTTGC-C-----GGA-G-G--T---CC-TTT-TAGCC--T--TA-C--A-CTC-G-G--TTTT---GTACA----------TA-TG----TT---T----TTG--GGATGAT----G-A--TTA-CG--T--TTAG-C--ATA-T--TA-T-A--TATTT-CGCCaattta
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     t--CCT--G--CCTT--CGC-T-TTCGT-C-----G-----------------A-TTGCC--C--TA-CA-A-CTCGG-A--TTTT---GT--A----------TGCTG----TT---T----TTTG-GGACGAT----G-AG-TTA-CG-----TTGA-T--ACT-C--TT-G-T--TACTT-CGCCA-TTaatcta
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gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    C-----A-TGG-TTA-TAACG---AATCT-CGTT-T-C--AA-G--TCATTT-CA----TC-A--C---TC--AA---A-----
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TA-CG--T--TTAA-C--ACATA--TG-T----AACTT-CGCCTGTTTTGca
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttataGTA-TTCCTA--TGGGC-A-C-TAATTGTC---CCGCT--TATTG-GC------AGA--C--T---TATTT--TTGT-AT----T-C----------AGT---A-TGAAG-CA-A-A---T-T-T-T-ACAGAAAAC--T--GTT--A---C-------GGGA-----TA---------AAA-A-------------CA-------A---AAAA----------------C-T-G--CC-CG-TGTCCT-CA----A-CCT------TAACA----TCATAGGTATCATAG-ATGA-----ATG-------C---------T-A-----T-C--A-A-T-TA--A-CA-A--T--C-A---TCA------T---TTTCA-C-AA--------TT----ATG--------TC--C-ATTTG---A-TAT------A--TTCCC--GA---------------------A-G-AACTCGA--CA--------T-AA-AGGA-CA--CT-------CA--CAG--GAATCTGA-CATATTCT-GCTT-C----ATAT-----TTGGA--ATTTTACGT-T--AAC-AG-T-GAC--T------CT-AAT-C--GC-A-GA--CTGA--CAACT------AC-ATTATATT--------AAT-AAG-----CGT--GATG-ACTTG-A--A-TTT-G-C-AA-TC---GTCAACTTTCCTTTT-CT-A--GTAGT-ATA-TAT--C--C-ACTATCACCTTGCT--TA-TG-TTGCGT-----GGTATAT-CCCAG---TTGA--T-CGTATACGC--GA--GCAGTGC--TATGATTCG-T---ATGC-GGACTTT--------AAGCG-AGGTCCA--ACTGA--C-TA-C--AAAACA---GTT-G-ATCGA------TGC-----A-GGG-TTA-TA-C----AATCT-CGTTAT-A--AAAG--TCAG-T-CA----TT----C---GC--AA---A-----TT-CTACTGG-C-GGC-T-A-TA-AT-----GA---CC-T-----G-T---G-CG--A--TTAA-C---AAA--TTA-T-CACTAAAG-T-CA-TAATG---T-GACTG-AT---TT------G--TTTCATACC--TTTG---T-TAG-A-----------CT-GT--C-ATTTT-CCCTAC--T--A-A--TTT---A-C-T-ACG--GGTAA-TCCCG---TTTAC--TTT-A-TT--TC-G--AC-TA--AG-GGCT-CACGGC-GG----------GTGTGACCG---G----TCCA-GCAGAG---GAA-TGC-TTACT-C-C--C-C-AT-GCA-C-C-T-AT--CCT--A---CTT--CGC---TTTGTCC-----GGA-GTG--TGACCT-GTG-TTGCC--C--TA-C--A-CTC-G-A--TTTT---GT--A----------TC-AG----TT---T----TTT--GGATTAT----G-A--TTA-CG--TTGTTGATC--AC--A--TG-T-T---ACTT-CGCCT-TTTtatgca
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cacgaattttcaaaaaattgattggccatcaaaaacgtatgatttctccaagcactttacacaacgattcccacgataaattaatctaggcttttcagattaatagatcattgcttttaacaagaaacggcacccgaaatacgaatttctagccgttggggaaacaagacacatattttgttagaaaacactctgatgccacacaaatactctgaagtagatattaagcatgcttgggttctgtatagatatatttatgtagtcttggagacgcaggtcttcaacaatccgtaT----G-A--TTT-TG--T--TTAA-C--ACA-T--TG-T-T--TACTT-CGCCA-TTTT
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GA-C--ACG-A--TG-T-T--AACTT-CGCCT-TTTTa
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GA--CTACT------AC-ATTATAT---------GAT-AAA-----CGT--GATG-Aatatgataaaa
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): ATGGAGTTACATAGAGCTACTAGATGAAAAACTTAGGCCTGGTTCCGGCGGATAAAAGCAAGTAAATAACAGAACGATTGTCTAATTGTTTGTAAAATCTCCCTATCTTTAACTTGTGGTGTTTAAAAGTGTAACTTTAGAGGATTTTTGACTTCGAATAACAATCTGGTTTTTTTCGCATAACCCTTAGGACTTACCTAGCAATTCTGACTAAAGATGAAAATTCTATTCAAAGGATATCTACCTTATCTGTTGTTTGAATTAGCTTATCAATATTCCGAAGAATCAGGAATCAATTTGAATTACAATTAATGCTATAAGCCTTCTCAGCTGGATTCCTCGAAATGCATCAAGAATCCGTACAAGAAATTATAATTTGCCAATCCGCTGAGTATTGCCAGTAAGTGGCTATCTCTAAGCCCTATCACTCTCTGACTAATTAAGATCTCTATTAAACCCCTGGCGTATCAAATTTAGAATCTCTACATTCTTGGATGACTTGTATGTCACTACCTATTCCAGATATTGGGAGTCTTCCCGTGTTTGTTACAATGAGATGTAGAGAACTCATATCTCCAACGATAAAGCGTCACATAAATAATGCTAGTCTAGATGCAACTATTGCTGTTCATCAAGTCATCACACTAGAGTTATTGCCTACAAATAAACCTGACTTCATCCGAACATACGTAGATGCACTGGTGAGTATTCGTACAGCTCAGTTGCTATCACAATTCCTACACTGAATCAAATCAAATAAAATCTAAGGGCGTTTATTATGGTTGGAACTAATGTTTCCGTTCTAATTAGTTATAACAAAAGTAACAGCACTCGAAAATACAAGTTCTTCTGGCATGGGAAAAGATACCATATCCGTGTTTTGTACTCACAAAATACATGCTCTGGATTTGTGCTTTCCAAGATCTACAGCAGCTACTCTGTAAGTAAGATATCATATAGAGCATGCTTGGAAGCATTGTCTTCTTATAGAATAGAATATGTGCTTATAGT
Unaligned ( gi|22 ): TTAAAAATTAACGAAAAGTGATAAAAGAATGAGATTACATGAGGGTTATGTATTAGTTTCCAGCTGACAACCGCTTGTACAACATTGTCTTTGTTTGGAAGGCTCGTTATTAAAACTTGTTTGTAAGGCTCATTGATAAAAACAGTATTTCAAACGAATTCAAATCCTTAATTCCCCATTTGGTATAACAACTTATACTCCAACTGAAACTTCTCCACAATCATGCTTCAGTTTTAAACACTTTAA
Unaligned ( gi|24 ): TTAAGTCCCTTATTTTAAAAGGCCCTAAATTCTGAGAACCTCCCTCATTTAAGTGGCGACATAATTTCATGACTATCATGGATTCTGTGGAAGAATACGCCAGACGTTGGACAAAATCTGAGGGAGAGGAGCTTGACACTTTGTCTGAATGGATCAAAACTATTCGGAAATCATAAAATCACGTATTAACCATTTAGCGGGGAATAT
Unaligned ( gi|26 ): ATATAGTTTGAAAATGAGGACCTGAGATCACTTATTTAAAAAACTCTTAAATTCATACAATTGGCGACATAACTTCATTTCCATTATAAATTCTATCGAAGATTGTGCCAGACGATCGGACAAATATGACAAAGAATTTGATACCTTGTCAGAATAGATAAAAC
Unaligned ( gi|33 ): TTTCTCCCGTTACATGAAACTGCGATTTTTACAAATGTTTGTTTTGCTTAAATTAGGATACGTTCACAATGTTTCACCTCCATTTTTGCG