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lowQualScore                  :                               . .       ..       ..............  .       ..... .  ..    .  ...  . .............     .   ...   ......     .. . ..     .   .....   .      .    ....  . .     .........   ...    .  ...    .  .......  .. .. .   . ..  ..    ..     .   . .      ..  .. ..  .....................      ...   ..   ..   ..         . .  .  ....    ..        .    .  ..     .   . .         
lowQualScore                  :                               0 8       99       44444444444444  0       99999 7  55    1  888  5 5555555555555     4   888   666666     11 4 22     4   88888   9      0    0000  7 4     111111111   888    9  666    4  7777777  00 11 4   4 11  11    11     0   4 0      55  55 55  666666666666666666666      444   44   99   99         0 0  4  6666    22        6    0  99     7   0 2         
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Reference ( gi|3 )            :                          ATTATCTCTTGTTTT--ACGTCCCA-CTTTGAAC-AG-AACATTTCACCC-ACATGG--AGACGTC---ACCATTTGCCGG--TGTAGGGC-TGC---AAA-A-TT-TAGGC--C-TA-TGCTC-GGC---ACTCAGGGCCTTTGAGCA---GGGA-GGGAT--C------TTTAT-CGTG-CC-A-CACC-TG-C-TG--TG--A--C-ACG-G--GA--CCTC--GGTTT-TTC-C-GGTCTC--AT--C--CG-AATG--A-------------CCGCCC--CATTCAGTC--GCC--TCTTACGAC-A-CGCAA----GGGGA-TGCTGGGGACCTA-TT--CTAAC-CCGAACCCCCACGGG
gi|11                         :                          ATTGTATGTTGTTCT--GCGTCCCG-CTT-GA----G-AATATTTCACTC-ATATGG--AGACATC---ACCAAC-ACCGG--TGAAGGGC-TGC---AAA-A-TT-AAGGC--T-TG-TGCTC-GAA---GCTGATGGCCTTT
gi|15                         :                      attgATTATTTATTGTTTT--ACGTCCCA--TTCG----AG-AATATTTCAATC-ATATGG--AGACGT
gi|4                          :                       tgattgATTTATTGTCTT--ACTTTTC-----TATAG-AG-AATATTTAACTC-ATATGG--AGACGTC---ACCATT-GCCAG--TGAAGGGC-TGC---AAA---TT-TAGGC--C-TG-TGCTC-GAC---ACTCGTGGCCTCTGAGCA---GGAA-GGGAT--C------TTTAT-CGTG-CA-A-TACC-TG-C-TG--TA--A--C-ACG-G--AG--CCTC--GATTT-TTG-T-GATCCC--AT--C--CG--ATGA-A-------------TTGTCC--CATTTAGTC--GCC--TCTTGCGAC-A-AGCAA----GGGG--TACGGAAGACCTA-TT--CTAAC-CTGGGTCACCACGGGattgctcggatttga
gi|16                         :                               gTTTTGTTTTTTACGTCCCA-CT-------AA-AATATTTCACTC-AGATGG--AGAgt
gi|1                          :                    attgatttgattaaTTGTTTT--ACGTCCCT-CTC-GA----G-AATATTTCACTC-ATATGG--AGACGTC---ACCATT-GCCGG--TGAAGGGC-TG----AAA-A-TT-TAGAC--C-TG-TGCTC-GGC---ACTCAGGGTCTTTGAGCT---GTGA-GGGAT--C------TTTAT-CGTG-CC-C-CTCC-TG-C-TG--TG--A--C-ACT-G--GA--CCTC--GGTTT-TTTGC-GGTCTC--AT--C--CG-AATG--A-------------CCGCCC--CATTCAGTC--GCC--TCTTACGAC-A-CGCAA----GGGGA-TGCTAGGGACCTA-TT--CTATC-CCGGAACACCACGGGg
gi|7                          :             tgattgattaatttttttttaTCGTTTT--ATGTCTCA-C-----ACGAA-AATATTT---------------GACGTC---ACCATT-GCCGG--TA-AGGGC-TGC---AAA-A-CT-CAGGT--C-T---GCGT-GGC---GATTAAGGCCTTTGAGCA---GG-A-GGGATATC------TTT-T-CGTG-TCGA-CACC-TG-CCTG--TG--A--CCACG-G---A--CC-C--ATTTT-TTC-C-GGTCTC--AT--C--CG-AATG--A-------------
gi|6                          :                                   TGTTTT--ACGTCCCAGCC--GAA-----AATATTTCACTC----------------------------CGG--TGAGAGGCGTGC---AAA-A-TG-TCGGC--C-TAGTGTTC-GGC---ATTTAGGGCCTT-GAGCA---CGAA-GGAAT--C------TTTTTTCGTG-CC---CACT-TG-------TG--A--C-ACA-GAGGA--C-TC--AGTTT-T-C-C-GGTTTC--AT--CGATG-A--G--A-------------CCGCCC---ATTTAGTC--GCC--T--TACGAC-A-CG-AA----AAGGA-TGCTGGGGACCTT-AT--CTAA
gi|9                          : aaacattagaagattggatgtgattttgttttacTGGTTT--ATGTT--A-CTTCGA----G-AGTTTTTCATTC-ATTTGA--AGACCTT---ACAA----------------GC-TGT---AAA----------C--C-TC-TGCTT-AGC---GCTCACGGCCTT---GCT---GTAA-GGGTT--T------CTTAG-CGTA-TC-ATCACC-TG-T-CT--CC--A--C-ACG-G--GA--CTTC--CGTTT-TTacgcgacc
gi|2                          :                                            CGTTCCA-ACTTCAAG-AGTAATATTTCACGTGATATAGGAAGACGTTCAAATCATTGGCGAGGTTGAAGGGC-TGCCAAAAACA-TG-TAGGC--CATA-TGCTCAGGCTCAAATCAGGCCTTTTGAGCACCAGGGA-AGGAT--CTTC---TTTGC-AGTGCCC-C-CACC-TT-C-TGTTTGCCACTC-ACA-G--GA--TTCA--GGTTCATTA-C-GGCCTC--AT--C--CC-TCTG-----------------TGCCC----TGC-GT----CT--TCTTACGAC-A-CACAGATGTGGTGACTGCTGGGG-CCTAGTT--CTAAC-Cgaagtcata
gi|14                         :                                                                     TTCACTC-ATA-GG--AGAGCTC---AC-ATA-GCCGG--TG-AGGGC-TGC---AAA-CTTT-TAGGC--A-TA-TGT-----------------CCTCGAAGCA---GGAA-GGG-----------TTTAT-C
gi|5                          :                                                                                                atgtgTGCCGGC-TG-AGGGC-TGC---AAA-C-TGGTAGGCTCC-TG-TGTTC-GGC----TTCAGGGCCTT-GAGC-----GGACGGAAT--C------TTTGG-CGTG-CC---CACCCTG-C--G--TGT-A--C-ACACG--GA--CCTC--GGTTT-TTT-C--GTCTC--ACTGC--CGCCATG--GTCTTTCGTCGATTCCGCCCCGCATTCCGTCGGGCC--TATTACT-C-ATCGAAAC---GGGGA-TCCTGGAG-CCT
gi|8                          :                                                                                                                           gattgactgattgattttttactgttgacgcccaccgaaatatatttcacaA---AGGA-GGGAT--CCTCTTTTTTTC-CGTG-CCCA-CACC-TGGC-TG--TG--A--C-ACG-G--GGGGCCTCCGGGTTT-TTC-CCGGTCTTCAAT--C--CGGAATGGGA-------------CC-CCC--CATTTAGTC--GCC--TCTTACGAC-A-CGCAA-----GGGA-TGCTGGGACCTTA-TT--TCAAC-CCGGACCCCtct
gi|10                         :                                                                                                                                                                                       tGGATG-C------TTT-T-CGTGATC-A-CACC-TG-C-TG--TGG-A--C-ACG-G--GA--CCTC--AGTTTATTC-C-GGTCTC--AT--C--CG-Aactggt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                          caccgttaccgttgtgaacgtcatagtctgatagacgtactgccatttgttttaggctaatgtaaacgttTT-TTC-C-GGTCTC--AT--T--CG-AAGG--A-------------CCGCCCT-CATTTAGTC--ACC--TCTTACGAC-A-CGCAA----GGGGA-TGCTGAGGATCTA-TT--CTAAC-CCGGACCCCCACGGG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                        -GGTCTC--AT--C--GG-A--G--A-------------CAGGCC--CATT-AGTC--TCTCTTCTTACGACTA-AGTAA----GGGG--TACCTGAGACCTA-TTACCCAACGACGGATCCCCGAGGG
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Reference ( family-34 )       :                                                                       ATTA--TTTATTGTTTTACGTCCCA-CTT-GAA-AG-AATATTTCAC-TCATATGG--AGACGTC---ACCATT-GC-CGG---TGAAGGGC-TG-CAAA---A-TT-TAGGC--C-T-GTGCTC-GGCGC---TCAGGGCCTTTGAG---CAGGGA-GGG--A---T-C------TTTAT-CGTG-CC-A-CACCTG-CTG--TG--A--CACG-G--GA--CCTC--GGTTT-TTC-C-GGTCTC--AT--C--CG-AATG--A-------------CCGCCC--CATTCAGTC--GCC--TCTTACGAC-A-CGCAA----GGGGA-TGCTGGGGACCTA-TT--CTAAC-CCGGATCCCCACGGG
gi|1                          :                                                                        TTT--TTTATTGTTTTACGTCCCT-CTC-GA---G-AATATTTCAC-TCATATGG--AGACGTC---ACCATT-GC-CGG---TGAAGGGC-TG--AAA---A-TT-TAGAC--C-T-GTGCTC-GGCAC---TCAGGGTCTTTGAG---CTGTGA-GGG--A---T-C------TTTAT-CGTG-CC-C-CTCCTG-CTG--TG--A--CACT-G--GA--CCTC--GGTTT-TTTGC-GGTCTC--AT--C--CG-AATG--A-------------CCGCCC--CATTCAGTC--GCC--TCTTACGAC-A-CGCAA----GGGGA-TGCTAGGGACCTA-TT--CTATC-CCGGAACACCACGGG
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gi|16                         :                                                                 tgattgATTAATTTTGTT-TTTTACGTCCCA--CT------AA-AATATTTCAC-TCAGATGG--AGAatttga
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          attgatttgGCTGAGGATCTA-TT--CTAAC-CTGGGTCCACACGGg
gi|2                          :                                                                                         CGTTCCAACTTC-AAG-AGTAATATTTCACGTGATATAGGAAGACGTTCAAATCATT-GG-CGAGGTTGAAGGGC-TGCCAAAAACA-TG-TAGGC--CAT-ATGCTCAGGCTCAAATCAGGCCTTTTGAGCACCAGGGA-AGG--ATCTT-C------TTTGC-AGTGCCC-C-CACCTT-CTGTTTGCCACTCACA-G--GA--TTCA--GGTTCATTA-C-GGCCTC--AT--C--CC-TCTG-----------------TGCCC----TGC-GT----CT--TCTTACGAC-A-CACAGATGTGGTGACTGCTGGGG-CCTAGTT--CTAAC-Caattc
gi|3                          :                                                                       ATTA--TCTCTTGTTTTACGTCCCA--CTTTGAACAG-AACATTTCAC-CCACATGG--AGACGTC---ACCATTTGC-CGG---TGTAGGGC-TG-CAAA---A-TT-TAGGC--C-T-ATGCTC-GGCAC---TCAGGGCCTTTGAG---CAGGGA-GGG--A---T-C------TTTAT-CGTG-CC-A-CACCTG-CTG--TG--A--CACG-G--GA--CCTC--GGTTT-TTC-C-GGTCTC--AT--C--CG-AATG--A-------------CCGCCC--CATTCAGTC--GCC--TCTTACGAC-A-CGCAA----GGGGA-TGCTGGGGACCTA-TT--CTAAC-CCGAACCCCCACGGG
gi|4                          :                                                                          A--TTTATTGTCTTACTTTTC----TA-TAG-AG-AATATTTAAC-TCATATGG--AGACGTC---ACCATT-GC-CAG---TGAAGGGC-TG-CAAA-----TT-TAGGC--C-T-GTGCTC-GACAC---TCGTGGCCTCTGAG---CAGGAA-GGG--A---T-C------TTTAT-CGTG-CA-A-TACCTG-CTG--TA--A--CACG-G--AG--CCTC--GATTT-TTG-T-GATCCC--AT--C--CG--ATGA-A-------------TTGTCC--CATTTAGTC--GCC--TCTTGCGAC-A-AGCAA----GGGG--TACGGAAGACCTA-TT--CTAAC-CTGGGTCACCACGGG
gi|5                          :                                                                      gATTT--TTTACTGTTG-ACG-CCCA--C-C-GAA-AT-A-TATTTCAC------------------------AT--GC-CGG---CTGAGGGC-TG-CAAA---C-TGGTAGGCTCC-T-GTGTTC-GGC-T---TCAGGGCCTT-GAG---C--GGACGGA--A---T-C------TTTGG-CGTG-CCCA-C-CCTG-C-G--TGT-A--CACACG--GA--CCTC--GGTTT-TTT-C--GTCTC--ACTGC--CGCCATG--GTCTTTCGTCGATTCCGCCCCGCATTCCGTCGGGCC--TATTACT-C-ATCGAAAC---GGGGA-TCCTGGAG-CCTgt
gi|6                          :                                                              gattgactgattg--TTTACTGTTTTACGTCCCA--GCC-GAA-A---ATATTTCAC-TC----------------------------CGG---TGAGAGGCGTG-CAAA---A-TG-TCGGC--C-TAGTGTTC-GGCAT---TTAGGGCCTT-GAG---CACGAA-GGA--A---T-C------TTTTTTCGTG-CC---CACTTG------TG--A--CACA-GAGGA--C-TC--AGTTT-T-C-C-GGTTTC--AT--CGATG-A--G--A-------------CCGCCC---ATTTAGTC--GCC--T--TACGAC-A-CG-AA----AAGGA-TGCTGGGGACCTT-AT--CTAAtct
gi|7                          :                                                    aaacattagaagattggatgtgattttgtTCGTTTTATGTCTCA--CAC-GAA-A---ATATTT---------------GACGTC---ACCATT-GC-CGG---T-AAGGGC-TG-CAAA---A-CT-CAGGT--C-T-GCG--T-GGCGA---TTAAGGCCTTTGAG---CA-GGA-GGGATA---T-C------TTT-T-CGTG-TCGA-CACCTGCCTG--TG--AC-CAC--G--GA--CC-C--ATTTT-TTC-C-GGTCTC--AT--C--CG-AATG--A-------------acgcgacc
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Reference ( family-34 )       :                                                                       ATTA--TTTATTGTTTTACGTCCCA--CTC-GAG-AG-AATATTTCAC-TCATATGG--AGACGTC---ACCATT-GC-CGG---TGAAGGGC-TG-CAAA---A-TT-TAGGC--C-T-GTGCTC-GGCGC---TCAGGGCCTTTGAG---CAGGGA-GGG--A---T-C------TTTAT-CGTG-CC-A-CACCTG-CTG--TG--A--CACG-G--GA--CCTC--GGTTT-TTC-C-GGTCTC--AT--C--CG-AATG--A-------------CCGCCC--CATTCAGTC--GCC--TCTTACGAC-A-CGCAA----GGGGA-TGCTGGGGACCTA-TT--CTAAC-CCGGATCCCCACGGG
gi|1                          :                                                                        TTT--TTTATTGTTTTACGTCCCT--CTC-GAG-A---ATATTTCAC-TCATATGG--AGACGTC---ACCATT-GC-CGG---TGAAGGGC-TG--AAA---A-TT-TAGAC--C-T-GTGCTC-GGCAC---TCAGGGTCTTTGAG---CTGTGA-GGG--A---T-C------TTTAT-CGTG-CC-C-CTCCTG-CTG--TG--A--CACT-G--GA--CCTC--GGTTT-TTTGC-GGTCTC--AT--C--CG-AATG--A-------------CCGCCC--CATTCAGTC--GCC--TCTTACGAC-A-CGCAA----GGGGA-TGCTAGGGACCTA-TT--CTATC-CCGGAACACCACGGG
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            attgTT-TTC-C-GGTCTC--AT--T--CG-AAGG--A-------------CCGCCCT-CATTTAGTC--ACC--TCTTACGAC-A-CGCAA----GGGGA-TGCTGAGGATCTA-TT--CTAAC-CCGGACCCCCACGGG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -GGTCTC--AT--C--GG-A--G--A-------------CAGGCC--CATT-AGTC--TCTCTTCTTACGACTA-AGTAA----GGGG--TACCTGAGACCTA-TTACCCAACGACGGATCCCCGAGGG
gi|14                         :                                                                                                                 tTTCAC-TCATA-GG--AGAGCTC---AC-ATA-GC-CGG---TGA-GGGC-TG-CAAA---CTTT-TAGGC--A-T-ATGT-----------------CCTCGAAG---CAGGAA-GGG---------------TTTAT-Cg
gi|15                         :                                                                  atgtgATTA--TTTATTGTTTTACGTCCCA--TTC---G-AG-AATATTTCAA-TCATATGG--AGACGT-------ATT-GCTCGG---
gi|16                         :                                                                 tgattgATTAATTTTGTT-TTTTACGTCCCA--CT------AA-AATATTTCAC-TCAGATGG--AGAatttga
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          attgatttgGCTGAGGATCTA-TT--CTAAC-CTGGGTCCACACGGg
gi|2                          :                                                                                         CGTTCCAACTTC-AAG-AGTAATATTTCACGTGATATAGGAAGACGTTCAAATCATT-GG-CGAGGTTGAAGGGC-TGCCAAAAACA-TG-TAGGC--CAT-ATGCTCAGGCTCAAATCAGGCCTTTTGAGCACCAGGGA-AGG--ATCTT-C------TTTGC-AGTGCCC-C-CACCTT-CTGTTTGCCACTCACA-G--GA--TTCA--GGTTCATTA-C-GGCCTC--AT--C--CC-TCTG-----------------TGCCC----TGC-GT----CT--TCTTACGAC-A-CACAGATGTGGTGACTGCTGGGG-CCTAGTT--CTAAC-Caattc
gi|3                          :                                                                       ATTA--TCTCTTGTTTTACGTCCCA--CTTTGAACAG-AACATTTCAC-CCACATGG--AGACGTC---ACCATTTGC-CGG---TGTAGGGC-TG-CAAA---A-TT-TAGGC--C-T-ATGCTC-GGCAC---TCAGGGCCTTTGAG---CAGGGA-GGG--A---T-C------TTTAT-CGTG-CC-A-CACCTG-CTG--TG--A--CACG-G--GA--CCTC--GGTTT-TTC-C-GGTCTC--AT--C--CG-AATG--A-------------CCGCCC--CATTCAGTC--GCC--TCTTACGAC-A-CGCAA----GGGGA-TGCTGGGGACCTA-TT--CTAAC-CCGAACCCCCACGGG
gi|4                          :                                                                          A--TTTATTGTCTTACTTTTC----TA-TAG-AG-AATATTTAAC-TCATATGG--AGACGTC---ACCATT-GC-CAG---TGAAGGGC-TG-CAAA-----TT-TAGGC--C-T-GTGCTC-GACAC---TCGTGGCCTCTGAG---CAGGAA-GGG--A---T-C------TTTAT-CGTG-CA-A-TACCTG-CTG--TA--A--CACG-G--AG--CCTC--GATTT-TTG-T-GATCCC--AT--C--CG--ATGA-A-------------TTGTCC--CATTTAGTC--GCC--TCTTGCGAC-A-AGCAA----GGGG--TACGGAAGACCTA-TT--CTAAC-CTGGGTCACCACGGG
gi|5                          :                                                                      gATTT--TTTACTGTTG-ACG-CCCA--C-C-GAA-AT-A-TATTTCAC------------------------AT--GC-CGG---CTGAGGGC-TG-CAAA---C-TGGTAGGCTCC-T-GTGTTC-GGC-T---TCAGGGCCTT-GAG---C--GGACGGA--A---T-C------TTTGG-CGTG-CCCA-C-CCTG-C-G--TGT-A--CACACG--GA--CCTC--GGTTT-TTT-C--GTCTC--ACTGC--CGCCATG--GTCTTTCGTCGATTCCGCCCCGCATTCCGTCGGGCC--TATTACT-C-ATCGAAAC---GGGGA-TCCTGGAG-CCTgt
gi|6                          :                                                              gattgactgattg--TTTACTGTTTTACGTCCCA--GCC-GAA-A---ATATTTCAC-TC----------------------------CGG---TGAGAGGCGTG-CAAA---A-TG-TCGGC--C-TAGTGTTC-GGCAT---TTAGGGCCTT-GAG---CACGAA-GGA--A---T-C------TTTTTTCGTG-CC---CACTTG------TG--A--CACA-GAGGA--C-TC--AGTTT-T-C-C-GGTTTC--AT--CGATG-A--G--A-------------CCGCCC---ATTTAGTC--GCC--T--TACGAC-A-CG-AA----AAGGA-TGCTGGGGACCTT-AT--CTAAtct
gi|7                          :                                                    aaacattagaagattggatgtgattttgtTCGTTTTATGTCTCA--CAC-GAA-A---ATATTT---------------GACGTC---ACCATT-GC-CGG---T-AAGGGC-TG-CAAA---A-CT-CAGGT--C-T-GCG--T-GGCGA---TTAAGGCCTTTGAG---CA-GGA-GGGATA---T-C------TTT-T-CGTG-TCGA-CACCTGCCTG--TG--AC-CAC--G--GA--CC-C--ATTTT-TTC-C-GGTCTC--AT--C--CG-AATG--A-------------acgcgacc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                AAGGA-GGG--A---T-CCTCTTTTTTTC-CGTG-CCCA-CACCTGGCTG--TG--A--CACG-G--GGGGCCTCCGGGTTT-TTC-CCGGTCTTCAAT--C--CGGAATGGGA-------------CC-CCC--CATTTAGTC--GCC--TCTTACGAC-A-CGCAA-----GGGA-TGCTGGGACCTTA-TT--TCAAC-CCGGA-CCCCACTGG
gi|9                          :                                                                                 tTGGTTTATGTTAC---TTC-GAG-AG---TTTTTCAT-TCATTTGA--AGACCTT---AC----------------AAG--C-TG-TAAA------------C--C-T-CTGCTT-AGCGC---TCACGGCCTT---G---CTGTAA-GGG--T---T-T------CTTAG-CGTA-TC-ATCACCTG-TCT--CC--A--CACG-G--GA--CTTC--CGTTT-TTt


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Reference ( family-34 )       :                                                                       ATTA--TTTATTGTTTTACGTCCCA--CTC-GAG-AG-AATATTTCAC-TCATATGG--AGACGTC---ACCATT-GC-CGG---TGAAGGGC-TG-CAAA---A-TT-TAGGC--C-T-GTGCTC-GGCGC---TCAGGGCCTTTGAG---CAGGGA-GGG--A---T-C------TTTAT-CGTG-CC-A-CACCTG-CTG--TG--A--CACG-G--GA--CCTC--GGTTT-TTC-C-GGTCTC--AT--C--CG-AATG--A-------------CCGCCC--CATTCAGTC--GCC--TCTTACGAC-A-CGCAA----GGGGA-TGCTGGGGACCTA-TT--CTAAC-CCGGATCCCCACGGG
gi|1                          :                                                                        TTT--TTTATTGTTTTACGTCCCT--CTC-GAG-A---ATATTTCAC-TCATATGG--AGACGTC---ACCATT-GC-CGG---TGAAGGGC-TG--AAA---A-TT-TAGAC--C-T-GTGCTC-GGCAC---TCAGGGTCTTTGAG---CTGTGA-GGG--A---T-C------TTTAT-CGTG-CC-C-CTCCTG-CTG--TG--A--CACT-G--GA--CCTC--GGTTT-TTTGC-GGTCTC--AT--C--CG-AATG--A-------------CCGCCC--CATTCAGTC--GCC--TCTTACGAC-A-CGCAA----GGGGA-TGCTAGGGACCTA-TT--CTATC-CCGGAACACCACGGG
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gi|4                          :                                                                          A--TTTATTGTCTTACTTTTC----TA-TAG-AG-AATATTTAAC-TCATATGG--AGACGTC---ACCATT-GC-CAG---TGAAGGGC-TG-CAAA-----TT-TAGGC--C-T-GTGCTC-GACAC---TCGTGGCCTCTGAG---CAGGAA-GGG--A---T-C------TTTAT-CGTG-CA-A-TACCTG-CTG--TA--A--CACG-G--AG--CCTC--GATTT-TTG-T-GATCCC--AT--C--CG--ATGA-A-------------TTGTCC--CATTTAGTC--GCC--TCTTGCGAC-A-AGCAA----GGGG--TACGGAAGACCTA-TT--CTAAC-CTGGGTCACCACGGG
gi|5                          :                                                                      gATTT--TTTACTGTTG-ACG-CCCA--C-C-GAA-AT-A-TATTTCAC------------------------AT--GC-CGG---CTGAGGGC-TG-CAAA---C-TGGTAGGCTCC-T-GTGTTC-GGC-T---TCAGGGCCTT-GAG---C--GGACGGA--A---T-C------TTTGG-CGTG-CCCA-C-CCTG-C-G--TGT-A--CACACG--GA--CCTC--GGTTT-TTT-C--GTCTC--ACTGC--CGCCATG--GTCTTTCGTCGATTCCGCCCCGCATTCCGTCGGGCC--TATTACT-C-ATCGAAAC---GGGGA-TCCTGGAG-CCTgt
gi|6                          :                                                              gattgactgattg--TTTACTGTTTTACGTCCCA--GCC-GAA-A---ATATTTCAC-TC----------------------------CGG---TGAGAGGCGTG-CAAA---A-TG-TCGGC--C-TAGTGTTC-GGCAT---TTAGGGCCTT-GAG---CACGAA-GGA--A---T-C------TTTTTTCGTG-CC---CACTTG------TG--A--CACA-GAGGA--C-TC--AGTTT-T-C-C-GGTTTC--AT--CGATG-A--G--A-------------CCGCCC---ATTTAGTC--GCC--T--TACGAC-A-CG-AA----AAGGA-TGCTGGGGACCTT-AT--CTAAtct
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gi|9                          :                                                                                 tTGGTTTATGTTAC---TTC-GAG-AG---TTTTTCAT-TCATTTGA--AGACCTT---AC----------------AAG--C-TG-TAAA------------C--C-T-CTGCTT-AGCGC---TCACGGCCTT---G---CTGTAA-GGG--T---T-T------CTTAG-CGTA-TC-ATCACCTG-TCT--CC--A--CACG-G--GA--CTTC--CGTTT-TTt