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Alignments
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lowQualScore                  :            33    2    2   2     2 2      33   2 555            44 6        5   3 0        00000 1       3           33   
lowQualScore                  :            ..    .    .   .     . .      ..   . ...            .. .        .   . .        ..... .       .           ..   
lowQualScore                  :            77    7    7   7     7 7      99   9 444            66 7        0   3 3        22222 4       3           88   
consensus                     : CAGGGGTTCAA--AATT-CCTC-AAG-CCCGA-C-GCCCGG--GAC-T---AACTAATTCTGG--A-TTCGGACTCGGC-ATTTAGATTC---GCCGAAAGTCC-AGGGACTTGGC-ATTA
Reference ( family-962 )      : CAGGGGTTCAA--AATT-CCTC-AAG-CCCGA-C-GCCCGG--GAC-T---AACTAATTCTGG--A-TTCGGACTCGGC-ATTTAGATTC---GCCGAAAGTCC-AGGGACTTGGC-ATTA
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gi|85395                      : CAGGGGTTGAA--AATT-CCTT-AAG-CCTGA-T-GCCTGG--GACTT---AAATAAT--TGT--ACCTCAGACTTGCC-GTTT---TTCAAAGAAAAAAGTCCGACGGGCTTAGC-TTT
gi|85396                      : CAGGGTTTCAA--AAGT-CCTC-AAG-CCCGA-C-GCCCGG--GAC-
gi|85397                      : CAGGGGTTCAA--AATT-CCTC-AAG-CCCAA-C-GTC
gi|85398                      : CAGGGGTTGAA--AATT-CCTT-AAGCCCCGA-C-GCCCGGACGAC-T---TAATAATT
gi|85399                      :  AGGGGTTCAT--CATTGCCTC-AA--CCCGA-C-GCCGGG--TGT-TCTAAACTAATTCTGGCAA-TTCG-ATTAGGC-ATTTTGATTTT--GCCAAAAGTCC-AAGGACTTGG
gi|85400                      :   GGGGTTCAA--AATT-CCTC-AAG-TCCGA-C-GTCCGG--AAC-T---AACTAATTTTAG--A-TTCAGACTTGGC-ACTTAAATTC---ACCGAAAGTCC-AGGGACTTGGC-ATTA
gi|85401                      :                                                     ACTAATTCTAG--A-TTCGGACTTG-C-ACTTAAATTC---ACCGAAAGTCC-A-GGAC-TGGC--TTA