lowQualScore                  :                                  2           33     33     33     2       
lowQualScore                  :                                  .           ..     ..     ..     .       
lowQualScore                  :                                  7           77     77     77     7       
consensus                     : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAAATATTCCTGT-AACTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT
Reference ( gi|66524 )        : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAAATATTCCTGT-AACTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT
gi|66527                      : CCTCAGGTAAACAACATATGGAAATATTCCTGT-AACTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT
gi|66528                      : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAAATATTCCTGTTAACTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT
gi|66523                      : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAAATATTCCTGT-AACTGACATTT--ATGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT
gi|66522                      : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAAATATTCCTGT-AACTGACATTT--ATGAG--TAATT--CCATA-AATGTAT
gi|66529                      : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAAATATTCCTGT-AACTGACAAAT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT
gi|66525                      : CCTCAGGTAAACAAAAAATGGAAACATTTCTGT-AACTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATG-AATGTAT
gi|66530                      : CTTCAGATAAACAAAATATAGAAATATTCCTGT-ACTTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT
gi|66531                      : CCTGAGGTAA-CAATATATAGAAATATTCCTGT-AACTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT
gi|66534                      : CCTCAGGTATACAAAATATGGAAATATTCCTGT--ACTGACATTT--AAGAA--TAATT--ACATA-AAAGTAT
gi|66526                      : CCTCAGGTAAACAAAA-ATGGAAACATTTCTGT-AACTGACATTT--AAGAA--T-ATT--CCATG-AATGTAT
gi|66532                      : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAGATATTCCTGT-CACTGACATTT--AAGAT--TAATT--CCAAA-TATGTAT
gi|66535                      : CCTCAGGTAA-CAAAATATGGAAATACTCCTGT-AACTGAC------AAGAA--TAATT--CCATC-AATGTAT
gi|66533                      : CCTCAGATAAACAAAATATGGAAATATTCCTGT-AACTGATACTG--AGGAA--TGATTTACCATA-AATG
gi|66536                      : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAGATATTCCTGT-TACTGACATTTAGAAGAAATTAAAT--CCATGTAATGTAT
gi|66537                      :     AGGTAAACAAAATATGGAAATATTCCTGT-AACTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT

lowQualScore                  :                                  2           33     33     33     2       
lowQualScore                  :                                  .           ..     ..     ..     .       
lowQualScore                  :                                  5           44     44     44     5       
consensus                     : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAAATATTCCTGT-AACTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT
Reference ( family-959 )      : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAAATATTCCTGT-AACTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT
gi|66522                      : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAAATATTCCTGT-AACTGACATTT--ATGAG--TAATT--CCATA-AATGTAT
gi|66523                      : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAAATATTCCTGT-AACTGACATTT--ATGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT
gi|66524                      : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAAATATTCCTGT-AACTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT
gi|66525                      : CCTCAGGTAAACAAAAAATGGAAACATTTCTGT-AACTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATG-AATGTAT
gi|66526                      : CCTCAGGTAAACAAAA-ATGGAAACATTTCTGT-AACTGACATTT--AAGAA--T-ATT--CCATG-AATGTAT
gi|66527                      : CCTCAGGTAAACAACATATGGAAATATTCCTGT-AACTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT
gi|66528                      : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAAATATTCCTGTTAACTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT
gi|66529                      : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAAATATTCCTGT-AACTGACAAAT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT
gi|66530                      : CTTCAGATAAACAAAATATAGAAATATTCCTGT-ACTTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT
gi|66531                      : CCTGAGGTAA-CAATATATAGAAATATTCCTGT-AACTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT
gi|66532                      : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAGATATTCCTGT-CACTGACATTT--AAGAT--TAATT--CCAAA-TATGTAT
gi|66533                      : CCTCAGATAAACAAAATATGGAAATATTCCTGT-AACTGATACTG--AGGAA--TGATTTACCATA-AATG
gi|66534                      : CCTCAGGTATACAAAATATGGAAATATTCCTGT--ACTGACATTT--AAGAA--TAATT--ACATA-AAAGTAT
gi|66535                      : CCTCAGGTAA-CAAAATATGGAAATACTCCTGT-AACTGAC------AAGAA--TAATT--CCATC-AATGTAT
gi|66536                      : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAGATATTCCTGT-TACTGACATTTAGAAGAAATTAAAT--CCATGTAATGTAT
gi|66537                      :     AGGTAAACAAAATATGGAAATATTCCTGT-AACTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT

lowQualScore                  :                                  2           33     33     33     2       
lowQualScore                  :                                  .           ..     ..     ..     .       
lowQualScore                  :                                  5           44     44     44     5       
consensus                     : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAAATATTCCTGT-AACTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT
Reference ( family-959 )      : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAAATATTCCTGT-AACTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT
gi|66522                      : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAAATATTCCTGT-AACTGACATTT--ATGAG--TAATT--CCATA-AATGTAT
gi|66523                      : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAAATATTCCTGT-AACTGACATTT--ATGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT
gi|66524                      : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAAATATTCCTGT-AACTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT
gi|66525                      : CCTCAGGTAAACAAAAAATGGAAACATTTCTGT-AACTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATG-AATGTAT
gi|66526                      : CCTCAGGTAAACAAAA-ATGGAAACATTTCTGT-AACTGACATTT--AAGAA--T-ATT--CCATG-AATGTAT
gi|66527                      : CCTCAGGTAAACAACATATGGAAATATTCCTGT-AACTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT
gi|66528                      : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAAATATTCCTGTTAACTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT
gi|66529                      : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAAATATTCCTGT-AACTGACAAAT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT
gi|66530                      : CTTCAGATAAACAAAATATAGAAATATTCCTGT-ACTTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT
gi|66531                      : CCTGAGGTAA-CAATATATAGAAATATTCCTGT-AACTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT
gi|66532                      : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAGATATTCCTGT-CACTGACATTT--AAGAT--TAATT--CCAAA-TATGTAT
gi|66533                      : CCTCAGATAAACAAAATATGGAAATATTCCTGT-AACTGATACTG--AGGAA--TGATTTACCATA-AATG
gi|66534                      : CCTCAGGTATACAAAATATGGAAATATTCCTGT--ACTGACATTT--AAGAA--TAATT--ACATA-AAAGTAT
gi|66535                      : CCTCAGGTAA-CAAAATATGGAAATACTCCTGT-AACTGAC------AAGAA--TAATT--CCATC-AATGTAT
gi|66536                      : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAGATATTCCTGT-TACTGACATTTAGAAGAAATTAAAT--CCATGTAATGTAT
gi|66537                      :     AGGTAAACAAAATATGGAAATATTCCTGT-AACTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT


blockSeqs                     :                                  T           AG     AT     TA     T
blockSeqs                     :                                  .           .      .      .      .
blockSeqs                     :                                  .           .      .      .      .
blockSeqs                     :                                  .           .      .      .      .
blockSeqs                     :                                  .           .      .      .      .
blockSeqs                     :                                  .           .      .      .      .
blockSeqs                     :                                  .           .      .      .      .
blockSeqs                     :                                  .           .      .      .      .
blockSeqs                     :                                  .           .      .      .      .
blockSeqs                     :                                  .           .      .      .      .
blockSeqs                     :                                  .           .      .      .      .
blockSeqs                     :                                  .           .      .      .      .
blockSeqs                     :                                  .           .      .      .      .
blockSeqs                     :                                  .           .      .      .      .
blockSeqs                     :                                  .           .      .      .      .


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAAATATTCCTGT-AACTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT
finalCons                     : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAAATATTCCTGT-AACTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT

lowQualScore                  :                                  2           33     33     33     2       
lowQualScore                  :                                  .           ..     ..     ..     .       
lowQualScore                  :                                  5           44     44     44     5       
consensus                     : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAAATATTCCTGT-AACTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT
Reference ( family-959 )      : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAAATATTCCTGT-AACTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT
gi|66522                      : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAAATATTCCTGT-AACTGACATTT--ATGAG--TAATT--CCATA-AATGTAT
gi|66523                      : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAAATATTCCTGT-AACTGACATTT--ATGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT
gi|66524                      : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAAATATTCCTGT-AACTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT
gi|66525                      : CCTCAGGTAAACAAAAAATGGAAACATTTCTGT-AACTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATG-AATGTAT
gi|66526                      : CCTCAGGTAAACAAAA-ATGGAAACATTTCTGT-AACTGACATTT--AAGAA--T-ATT--CCATG-AATGTAT
gi|66527                      : CCTCAGGTAAACAACATATGGAAATATTCCTGT-AACTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT
gi|66528                      : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAAATATTCCTGTTAACTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT
gi|66529                      : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAAATATTCCTGT-AACTGACAAAT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT
gi|66530                      : CTTCAGATAAACAAAATATAGAAATATTCCTGT-ACTTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT
gi|66531                      : CCTGAGGTAA-CAATATATAGAAATATTCCTGT-AACTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT
gi|66532                      : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAGATATTCCTGT-CACTGACATTT--AAGAT--TAATT--CCAAA-TATGTAT
gi|66533                      : CCTCAGATAAACAAAATATGGAAATATTCCTGT-AACTGATACTG--AGGAA--TGATTTACCATA-AATG
gi|66534                      : CCTCAGGTATACAAAATATGGAAATATTCCTGT--ACTGACATTT--AAGAA--TAATT--ACATA-AAAGTAT
gi|66535                      : CCTCAGGTAA-CAAAATATGGAAATACTCCTGT-AACTGAC------AAGAA--TAATT--CCATC-AATGTAT
gi|66536                      : CCTCAGGTAAACAAAATATGGAGATATTCCTGT-TACTGACATTTAGAAGAAATTAAAT--CCATGTAATGTAT
gi|66537                      :     AGGTAAACAAAATATGGAAATATTCCTGT-AACTGACATTT--AAGAA--TAATT--CCATA-AATGTAT