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Reference ( gi|108090 )       : TGCCTCACGGTATATCTT-----G-CGTCTTTCTG--TAAGATTTGGTG-GATTT---TTACGATGTCATTATTGGT-TGTAACTGTAGCA--AGGCGACCTTGGCGAGC-AGCATCTTTGAGGTGTTCGTAACCTG-----TCTTAAATTT
gi|108091                     : TGTCTCACGGTATATCTT-----G-TGTCTTTCTG--TAAGATTTGTTG-GATTT---TTAAGATGTTATTATTGGT-TGTAACTGTTGCA--AGGCGACCCTGGCGATG-AGCATCTTTGAAGCGTTCGTAACCTG-----TTTTAAATT
gi|108092                     : TGCCTTACGGTATATCTT-----G-CGTCTTTCTG--TAAGATTTGGTG-GATTT---TTACGATG--AT-ATTGGT-TATATCTGTTGCA--GGGTGACCTTGGCGAGC-AGCGTCTTTGAGGTAATCGTAACCTG-----TTTTAAATTT
gi|108093                     : TGTCTCGCGGTAGATCTT-----G-CGTCTTTCTG--TAAGATTTGGTG-GATTT---TTACGATGTTATTATTG--------------CA--AGGGGACCTTGGAGAGC-AGCATCCTTGAGGTGATCGTAACCTG-----TTTTAAATTT
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lowQualScore                  :             .     ..... .          ..            .     ...                   .             ..                 .                          .....          
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Reference ( family-947 )      : TGCCTCACGGTATATCTT-----G-CGTCTTTCTG--TAAGATTTGGTG-GATTT---TTACGATGTTATTATTGGT-TGTAACTGTTGCA--GGGCGACCTTGGCGAGC-AGCATCTTTGAGGTGTTCGTAACCTG-----TTTTAAATTT
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Alignments
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Reference ( family-947 )      : TGCCTCACGGTATATCTT-----G-CGTCTTTCTG--TAAGATTTGGTG-GATTT---TTACGATGTTATTATTGGT-TGTAACTGTTGCA--GGGCGACCTTGGCGAGC-AGCATCTTTGAGGTGTTCGTAACCTG-----TTTTAAATTT
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gi|108091                     : TGTCTCACGGTATATCTT-----G-TGTCTTTCTG--TAAGATTTGTTG-GATTT---TTAAGATGTTATTATTGGT-TGTAACTGTTGCA--AGGCGACCCTGGCGATG-AGCATCTTTGAAGCGTTCGTAACCTG-----TTTTAAATT
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gi|108098                     : TACCTCACTGTATATCTT-----G-AGTCTTTCTG--TAAGATTTGGTG-GATTT---TTAC
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gi|108101                     :       ACGGTATATGTT-----T-TGTCTTTCTG--TAAGGTTTGGTG-GATTT---TTACGATGTTATTATTGGT-TGTAACTATTGTA--GGGTGACCTTGGCGAGC-AACATCTTTGAGGTGTTCGTAACCTG-----TTTTAGATTT
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blockSeqs                     :                   .     .          .             .     .                     .                                                                
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blockSeqCons                  : 
originalCons                  : TGCCTCACGGTATATCTT-----G-CGTCTTTCTG--TAAGATTTGGTG-GATTT---TTACGATGTTATTATTGGT-TGTAACTGTTGCA--GGGCGACCTTGGCGAGC-AGCATCTTTGAGGTGTTCGTAACCTG-----TTTTAAATTT
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Alignments
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lowQualScore                  :             .     ..... .          ..            .     ...                   .             ..                 .                          .....          
lowQualScore                  :             4     11111 9          99            9     777                   9             22                 1                          77777          
consensus                     : TGCCTCACGGTATATCTT-----G-CGTCTTTCTG--TAAGATTTGGTG-GATTT---TTACGATGTTATTATTGGT-TGTAACTGTTGCA--GGGCGACCTTGGCGAGC-AGCATCTTTGAGGTGTTCGTAACCTG-----TTTTAAATTT
Reference ( family-947 )      : TGCCTCACGGTATATCTT-----G-CGTCTTTCTG--TAAGATTTGGTG-GATTT---TTACGATGTTATTATTGGT-TGTAACTGTTGCA--GGGCGACCTTGGCGAGC-AGCATCTTTGAGGTGTTCGTAACCTG-----TTTTAAATTT
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gi|108104                     :                                                       T---TTGCGATGTTATTATTGGT-T--AATTGTTGCA--GGGTGACCTTGGTGAGC-AGCATCTTTGAGGTGTTCGTAACCTG-----TTTTAAATTT
gi|108105                     :                                                            TACGATGTTATTATTGGT-TGTAACCGTTGCA--GG-CGACCTTAGCGAGC-AGCATCTTTGAGGTGTTCGTAACCTG-----TTTCAAATTT