lowQualScore                  :                        1                                          333333333333333                        11111                                              
lowQualScore                  :     0  3               2 2  666666       2 2 2           2   2 2  222222222222222    2   5  33 5         44444  2    88     2        3  666      5      6   
lowQualScore                  :     .  .               . .  ......       . . .           .   . .  ...............    .   .  .. .         .....  .    ..     .        .  ...      .      .   
lowQualScore                  :     5  1               3 7  888888       7 7 7           5   5 5  888888888888888    5   0  44 0         00000  5    55     9        1  333      4      8   
consensus                     : TTCTCGC-AATTTAAGACTAAAAAC-TT-AACGGTAAATTC-T-T-AATTTCAGATG-ACA-C-CA---------TGTGT-TTGG-CTT-AA--A-TTTCCTATTC----AA-TGCAA-TAATG-ACACAAAG-TA--CAGACAAACAACTGATAA
Reference ( gi|112504 )       : TTCTCGC-AATTTAAGACTAAAAAC-TT-AACGGTAAATTC-T-T-AATTTCAGATG-ACA-C-CA---------CGT---TTGG-CTT-AA--A-TTTCCTATTC----AA-TGCAG-TAATG-ACACAAAG-TA--TAGACAAGCAACTGGTAA
gi|112503                     : TTCTAGC-AATTTAAGACTAAAATC-TT-AACAGTAAATTC-T-T-AATTTCCAATG-ACA-C-CA---------TGTGT-TTGG-CTT-AA--A-TTTCCTATTC----AA-TGCAA-TAATG-ACACAAAG-TA--TAGACAAACAACTGATAA
gi|112502                     : TTCTCGC-AATTTAAGACTAAAAAC-TT-AACAGTAAATTT-T-T-AATTTCAGATA-ACAAT-CA---------TGTGT-TTGG-CTT-AA--A-TTTCCTATTC----AA-TGCAA-TATTG-ACACAAAG-TA--CAGACAAACAACTGATAAaaata
gi|112505                     : TTTTCGC-AATTTCAGACTAAAAAC-TT-AACGGTAAATTC-T-T-AATTTCAGATG-ACA-C-CATG-------TGT---TTGG-CTTAAA--A-TTTCCTATTC----AA-CGCAA-TAAGT-ATACAAAG-TA--TAGAAAAACAACTGAaaata
gi|112506                     : TTCTTGC-AATCTAAGGCTAAAA-C-TT-ATCGGTAAATTC-T-T-AATTTCAGATG-ACA-C-CA---------TGTGT-TTGG-CTC-AA--A-TTTCCAATGA----AA-TGCAA-TAATG-AAACTAAG-TA--CAGACAAACAACTGATAAtaaaata
gi|112507                     : TTCTCGC-AATTTAAGACTAAAAAC-TT-AATGGTAAATTCTT-T-AATTTCAGATGAATA-CATG---------TGT---TTGG-CTT-AA--A-TTTCCTATTC----AA-Taaata
gi|112509                     : TTCT-GC-AATTTAAGACTAAAAAC-TTAAACGGTAAATTC-T-TAAATTTCAGTTG-ACA-C-TATG-------TGT---TTGG-CTT-AA--ATTTTCCTATTCA---AA-TGCAATTAATGAACACGCAGTTACTTAGAC
gi|112510                     : TTCTCGC-AATTTAAGACTAAAG-C-TT-ACCGGTAAATTC-T-T-AATTTTAGATG-ACA-C-CATTATATATGTGT---TTGG-TTT-AA--A-TTTCCTTTTT----AA-T
gi|112508                     : TTCTCGCCAATTTAATAC--AAAAC-TT-AATG-TA--TTC-T---AAT--CAGATG-AAT-A-CA---------TGTGTCTTGG-CTT-AA--ACTTTCCTATTCAAAAAA-TACAG---ACG-TTAT-AAG-T-----GA-AAACAACTGATGAatgcaa
gi|112511                     :  TCTCGC-AATTTAAGACTAAAG-T-TT-ATCACTAAATTC-T-T-AATTTCTAATT-ACA-C-CATG-------CGT---TTGA-CTT-AA--A-TTTCCAATTA----AA-TGGAA-TGATG-ACACAAAG-TA--CAGACAAACAAGTGATAAaaa
gi|112512                     :   CTCGC-AATTTAAAACTAAAG-C-TT-AA-----AAT-C-T-T-AATTTCAGACA-ACA-T-CA---------TGT------G-TTT--G--A-TTT----TTT----AA-T-CTG-AAATG-ACACAAAA-TA--CGGAC-CGTAACTGAaaata
gi|112513                     :   CTAGC-AATTGAAAACTAAAG-C-TT-AA-----AAT-C-T-T-AATTTCAGAGG-ACA-T-CA---------TGT------G-TTT-GA--T-TTTTTTACCT----GA--------AATG-ACACAAAA-TA--CGGACCTATAACTGAtaaaaa
gi|112514                     :      GC-AATTT----CCAAAAAC-TC---CTCTCAATTT-TAT-GACTTCAGATG-ACA-C-CA---------TGTGT-TTGG-CTT-AA--A-TTTCAAATTA----AAATACAT-TAATG-ACACAAAG-TA--CAGACAAACAACTGATGAtaaa
gi|112515                     :      GC-AATTTAAAACTAATA-C-TT-A----TAAAATC-T-T-ACTTTCAGATG-GCA-T-AA---------TGTG--TTGGACTT-AA--A-TTTGATATTTTGA-AA-TGCAA-TAATG-ACACAAAaaata
gi|112516                     :             TAAGACTAAAAAC-TT-GACGGTAAAGTC-T-T-AATTTCAGATG-ACG-C-CA---------CGTGT-TTGG-CTT-AA--A-TTTCCTATTC----AA-TGCAA-TAATG-ACACAAAG-TA--TAGACAAACAACTGATGA
gi|112517                     :                     AAAACGTT---CAGTAAATTC-T-T-ACTTTTAGATG-ACG-C-AG---------TGT---TTGA-CTT-AATGA-TT--CTA-TA----AA-TGCAC-T-ATT-ACACAAAG-TA--CACACA---AACTGTTAAaaata
gi|112518                     :                                                        TG-ACA-C-CA---------TGTGT-TTGG-CTTTAA--A-TTTCCAATTA----AA-TGCAA-TAATG-ATAGTAAG-TA--CACACAAATTAATGATAAaa





Alignments
lowQualScore                  :                        1                                                                                                                                  
lowQualScore                  :        2               1 2   55555        2 2  2            2  7777777      2       4  33 4         99999 33      2     2   2  2   2   33                 
lowQualScore                  :        .               . .   .....        . .  .            .  .......      .       .  .. .         ..... ..      .     .   .  .   .   ..                 
lowQualScore                  :        9               0 5   33333        5 5  5            4  6666666      4       7  22 7         99999 22      5     7   7  7   9   99                 
consensus                     : TTCTCGC-AATTTAAGACTAAAAAC-TTAA-CGGTAAATTCT-T-AA-TTTCAGATGACA-CC-------ATGTGT-TTGGCTT-AA--A-TTTCCTATT-C---A--ATGCAA-TAATG-ACA-CA-AAG-TAC--AGACAAACAACTGATAA
Reference ( family-939 )      : TTCTCGC-AATTTAAGACTAAAAAC-TTAA-CGGTAAATTCT-T-AA-TTTCAGATGACA-CC-------ATGTGT-TTGGCTT-AA--A-TTTCCTATT-C---A--ATGCAA-TAATG-ACA-CA-AAG-TAC--AGACAAACAACTGATAA
gi|112502                     : TTCTCGC-AATTTAAGACTAAAAAC-TTAA-CAGTAAATTTT-T-AA-TTTCAGATAACAATC-------ATGTGT-TTGGCTT-AA--A-TTTCCTATT-C---A--ATGCAA-TATTG-ACA-CA-AAG-TAC--AGACAAACAACTGATAA
gi|112503                     : TTCTAGC-AATTTAAGACTAAAATC-TTAA-CAGTAAATTCT-T-AA-TTTCCAATGACA-CC-------ATGTGT-TTGGCTT-AA--A-TTTCCTATT-C---A--ATGCAA-TAATG-ACA-CA-AAG-TAT--AGACAAACAACTGATAAaaata
gi|112504                     : TTCTCGC-AATTTAAGACTAAAAAC-TTAA-CGGTAAATTCT-T-AA-TTTCAGATGACA-CC-------A--CGT-TTGGCTT-AA--A-TTTCCTATT-C---A--ATGCAG-TAATG-ACA-CA-AAG-TAT--AGACAAGCAACTGGTAAaaata
gi|112505                     : TTTTCGC-AATTTCAGACTAAAAAC-TTAA-CGGTAAATTCT-T-AA-TTTCAGATGACA-CC-------ATGTGT-TTGGCTTAAA--A-TTTCCTATT-C---A--ACGCAA-TAAGT-ATA-CA-AAG-TAT--AGAAAAACAACTGAT
gi|112506                     : TTCTTGC-AATCTAAGGCTAAAA-C-TTAT-CGGTAAATTCT-T-AA-TTTCAGATGACA-CC-------ATGTGT-TTGGCTC-AA--A-TTTCCAATG-A---A--ATGCAA-TAATG-AAA-CT-AAG-TAC--AGACAAACAACTGATAAtaaaata
gi|112507                     : TTCTCGC-AATTTAAGACTAAAAAC-TTAA-TGGTAAATTCT-TTAA-TTTCAGATGAAT-AC-------ATGTGT-TTGGCTT-AA--A-TTTCCTATT-C---A--ATaaata
gi|112508                     : TTCTCGCCAATTTAATAC--AAAAC-TTAA-TG-TA--TTCT---AA-T--CAGATGAAT-AC-------ATGTGTCTTGGCTT-AA--ACTTTCCTATT-C---A--A-AAAA-TACAG-ACGTTATAAG-T-----GA-AAACAACTGATGA
gi|112509                     : TTCT-GC-AATTTAAGACTAAAAAC-TTAAACGGTAAATTCT-T-AAATTTCAGTTGACA-CT-------ATGTGT-TTGGCTT-AA--ATTTTCCTATT-CA--A--ATGCAATTAATGAACA-CG-CAGTTACTTAGACaaa
gi|112510                     : TTCTCGC-AATTTAAGACTAAAG-C-TTAC-CGGTAAATTCT-T-AA-TTTTAGATGACA-CCATTATATATGTGT-TTGGTTT-AA--A-TTTCCTTTT-T---AATATGCAA-
gi|112511                     :  TCTCGC-AATTTAAGACTAAAG-T-TTAT-CACTAAATTCT-T-AA-TTTCTAATTACA-CC-------ATGCGT-TTGACTT-AA--A-TTTCCAATT-A---A--ATGGAA-TGATG-ACA-CA-AAG-TAC--AGACAAACAAGTGATAA
gi|112512                     :   CTCGC-AATTTAAAACTAAAG-C-TTAA------AAT-CT-T-AA-TTTCAGACAACA-TC-------ATGTGT-TTG---------A-TTT----TT-T---A--ATCTGA--AATG-ACA-CA-AAA-TAC--GGAC-CGTAACTGATaaata
gi|112513                     :   CTAGC-AATTGAAAACTAAAG-C-TTAA------AAT-CT-T-AA-TTTCAGAGGACA-TC-------ATGTGT-TTGATTT-------TTT--TACC-T---G--A-------AATG-ACA-CA-AAA-TAC--GGACCTATAACTGATtaaaaa
gi|112514                     :      GC-AATTT----CCAAAAAC-TC---CTCTCAATTTTAT-GA-CTTCAGATGACA-CC-------ATGTGT-TTGGCTT-AA--A-TTTCAAATTAA---A--ATACAT-TAATG-ACA-CA-AAG-TAC--AGACAAACAACTGATGAtaaa
gi|112515                     :      GC-AATTTAAAACTAATA-C-TTA-----TAAAATCT-T-AC-TTTCAGATGGCA-TA-------ATGTGT-TGGACTT-AA--A-TTTGATATT-TTGAA--ATGCAA-TAATG-ACA-CA-AAaaata
gi|112516                     :             TAAGACTAAAAAC-TTGA-CGGTAAAGTCT-T-AA-TTTCAGATGACG-CC-------ACGTGT-TTGGCTT-AA--A-TTTCCTATT-C---A--ATGCAA-TAATG-ACA-CA-AAG-TAT--AGACAAACAACTGATGA
gi|112517                     :                     AAAACGTT---CAGTAAATTCT-T-AC-TTTTAGATGACG--C-------A-GTGT-TTGACTT-AATGA-TT--CTA-T-A---A--ATGCAC-T-ATT-ACA-CA-AAG-TAC--ACACAAACaaata
gi|112518                     :                                                        TGACA-CC-------ATGTGT-TTGGCTTTAA--A-TTTCCAATT-A---A--ATGCAA-TAATG-ATA-GT-AAG-TAC--ACACAAATTAATGATAAtgttaaaa





Alignments
lowQualScore                  :                        1                                                                                                                                  
lowQualScore                  :        2               1 2   55555        2 2  2            2  7777777      2       4  33 4         99999 33      2     2   2  2   2   33                 
lowQualScore                  :        .               . .   .....        . .  .            .  .......      .       .  .. .         ..... ..      .     .   .  .   .   ..                 
lowQualScore                  :        9               0 5   33333        5 5  5            4  6666666      4       7  22 7         99999 22      5     7   7  7   9   99                 
consensus                     : TTCTCGC-AATTTAAGACTAAAAAC-TTAA-CGGTAAATTCT-T-AA-TTTCAGATGACA-CC-------ATGTGT-TTGGCTT-AA--A-TTTCCTATT-C---A--ATGCAA-TAATG-ACA-CA-AAG-TAC--AGACAAACAACTGATAA
Reference ( family-939 )      : TTCTCGC-AATTTAAGACTAAAAAC-TTAA-CGGTAAATTCT-T-AA-TTTCAGATGACA-CC-------ATGTGT-TTGGCTT-AA--A-TTTCCTATT-C---A--ATGCAA-TAATG-ACA-CA-AAG-TAC--AGACAAACAACTGATAA
gi|112502                     : TTCTCGC-AATTTAAGACTAAAAAC-TTAA-CAGTAAATTTT-T-AA-TTTCAGATAACAATC-------ATGTGT-TTGGCTT-AA--A-TTTCCTATT-C---A--ATGCAA-TATTG-ACA-CA-AAG-TAC--AGACAAACAACTGATAA
gi|112503                     : TTCTAGC-AATTTAAGACTAAAATC-TTAA-CAGTAAATTCT-T-AA-TTTCCAATGACA-CC-------ATGTGT-TTGGCTT-AA--A-TTTCCTATT-C---A--ATGCAA-TAATG-ACA-CA-AAG-TAT--AGACAAACAACTGATAAaaata
gi|112504                     : TTCTCGC-AATTTAAGACTAAAAAC-TTAA-CGGTAAATTCT-T-AA-TTTCAGATGACA-CC-------A--CGT-TTGGCTT-AA--A-TTTCCTATT-C---A--ATGCAG-TAATG-ACA-CA-AAG-TAT--AGACAAGCAACTGGTAAaaata
gi|112505                     : TTTTCGC-AATTTCAGACTAAAAAC-TTAA-CGGTAAATTCT-T-AA-TTTCAGATGACA-CC-------ATGTGT-TTGGCTTAAA--A-TTTCCTATT-C---A--ACGCAA-TAAGT-ATA-CA-AAG-TAT--AGAAAAACAACTGAT
gi|112506                     : TTCTTGC-AATCTAAGGCTAAAA-C-TTAT-CGGTAAATTCT-T-AA-TTTCAGATGACA-CC-------ATGTGT-TTGGCTC-AA--A-TTTCCAATG-A---A--ATGCAA-TAATG-AAA-CT-AAG-TAC--AGACAAACAACTGATAAtaaaata
gi|112507                     : TTCTCGC-AATTTAAGACTAAAAAC-TTAA-TGGTAAATTCT-TTAA-TTTCAGATGAAT-AC-------ATGTGT-TTGGCTT-AA--A-TTTCCTATT-C---A--ATaaata
gi|112508                     : TTCTCGCCAATTTAATAC--AAAAC-TTAA-TG-TA--TTCT---AA-T--CAGATGAAT-AC-------ATGTGTCTTGGCTT-AA--ACTTTCCTATT-C---A--A-AAAA-TACAG-ACGTTATAAG-T-----GA-AAACAACTGATGA
gi|112509                     : TTCT-GC-AATTTAAGACTAAAAAC-TTAAACGGTAAATTCT-T-AAATTTCAGTTGACA-CT-------ATGTGT-TTGGCTT-AA--ATTTTCCTATT-CA--A--ATGCAATTAATGAACA-CG-CAGTTACTTAGACaaa
gi|112510                     : TTCTCGC-AATTTAAGACTAAAG-C-TTAC-CGGTAAATTCT-T-AA-TTTTAGATGACA-CCATTATATATGTGT-TTGGTTT-AA--A-TTTCCTTTT-T---AATATGCAA-
gi|112511                     :  TCTCGC-AATTTAAGACTAAAG-T-TTAT-CACTAAATTCT-T-AA-TTTCTAATTACA-CC-------ATGCGT-TTGACTT-AA--A-TTTCCAATT-A---A--ATGGAA-TGATG-ACA-CA-AAG-TAC--AGACAAACAAGTGATAA
gi|112512                     :   CTCGC-AATTTAAAACTAAAG-C-TTAA------AAT-CT-T-AA-TTTCAGACAACA-TC-------ATGTGT-TTG---------A-TTT----TT-T---A--ATCTGA--AATG-ACA-CA-AAA-TAC--GGAC-CGTAACTGATaaata
gi|112513                     :   CTAGC-AATTGAAAACTAAAG-C-TTAA------AAT-CT-T-AA-TTTCAGAGGACA-TC-------ATGTGT-TTGATTT-------TTT--TACC-T---G--A-------AATG-ACA-CA-AAA-TAC--GGACCTATAACTGATtaaaaa
gi|112514                     :      GC-AATTT----CCAAAAAC-TC---CTCTCAATTTTAT-GA-CTTCAGATGACA-CC-------ATGTGT-TTGGCTT-AA--A-TTTCAAATTAA---A--ATACAT-TAATG-ACA-CA-AAG-TAC--AGACAAACAACTGATGAtaaa
gi|112515                     :      GC-AATTTAAAACTAATA-C-TTA-----TAAAATCT-T-AC-TTTCAGATGGCA-TA-------ATGTGT-TGGACTT-AA--A-TTTGATATT-TTGAA--ATGCAA-TAATG-ACA-CA-AAaaata
gi|112516                     :             TAAGACTAAAAAC-TTGA-CGGTAAAGTCT-T-AA-TTTCAGATGACG-CC-------ACGTGT-TTGGCTT-AA--A-TTTCCTATT-C---A--ATGCAA-TAATG-ACA-CA-AAG-TAT--AGACAAACAACTGATGA
gi|112517                     :                     AAAACGTT---CAGTAAATTCT-T-AC-TTTTAGATGACG--C-------A-GTGT-TTGACTT-AATGA-TT--CTA-T-A---A--ATGCAC-T-ATT-ACA-CA-AAG-TAC--ACACAAACaaata
gi|112518                     :                                                        TGACA-CC-------ATGTGT-TTGGCTTTAA--A-TTTCCAATT-A---A--ATGCAA-TAATG-ATA-GT-AAG-TAC--ACACAAATTAATGATAAtgttaaaa


blockSeqs                     :        C               T G   AACGG        A T  A            .  ATTATAT      C       A  TG C         TTGA  AT      T     A   T  T   T   TT
blockSeqs                     :        .               A .   ACAG         . .  .            .  .            .       T  .  T         CA    .       .     .   .  .   .   . 
blockSeqs                     :        .               A .   ACGG         . .  .            .  .            .       .  .  .         AA    .       .     .   .  .   .   . 
blockSeqs                     :        .               A .   ACGG         . .  .            .  .            .       .  .  .         C     .       .     .   .  .   .   . 
blockSeqs                     :        .               A .   TCGG         . .  .            .  .            .       .  .  .         C     .       .     .   .  .   .   . 
blockSeqs                     :        .               A .   ATGG         . .  .            .  .            .       .  .  .         C     .       .     .   .  .   .   . 
blockSeqs                     :        .               A .   CCGG         . .  .            .  .            .       .  .  .         A     .       .     .   .  .   .   . 
blockSeqs                     :        .               A .   TCAC         . .  .            .  .            .       .  .  .         C     .       .     .   .  .   .   . 
blockSeqs                     :        .               A .   ACGG         . .  .            .  .            .       .  .  .         C     .       .     .   .  .   .   . 
blockSeqs                     :        .               . .   ATG          . .  .            .  .            .       .  .  .         T     .       .     .   .  .   .   . 
blockSeqs                     :        .               . .   CTC          . .  .            .  .            .       .  .  .         A     .       .     .   .  .   .   . 
blockSeqs                     :        .               . .   CAG          . .  .            .  .            .       .  .  .         T     .       .     .   .  .   .   . 
blockSeqs                     :        .               . .   A            . .  .            .  .            .       .  .  .         T     .       .     .   .  .   .   . 
blockSeqs                     :                        . .   A            . .  .            .  .            .       .  .  .         C     .       .     .   .  .         
blockSeqs                     :                        . .   .            . .  .            .  .            .       .  .  .         A     .       .                      
blockSeqs                     :                                                             .  .            .       .  .  .         A     .                              


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : TTCTCGC-AATTTAAGACTAAAAAC-TTAA-CGGTAAATTCT-T-AA-TTTCAGATGACA-CC-------ATGTGT-TTGGCTT-AA--A-TTTCCTATT-C---A--ATGCAA-TAATG-ACA-CA-AAG-TAC--AGACAAACAACTGATAA
finalCons                     : TTCTCGC-AATTTAAGACTAAAAAC-TTAA-CGGTAAATTCT-T-AA-TTTCAGATGACA-CC-------ATGTGT-TTGGCTT-AA--A-TTTCCTATT-C---A--ATGCAA-TAATG-ACA-CA-AAG-TAC--AGACAAACAACTGATAA





Alignments
lowQualScore                  :                        1                                                                                                                                  
lowQualScore                  :        2               1 2   55555        2 2  2            2  7777777      2       4  33 4         99999 33      2     2   2  2   2   33                 
lowQualScore                  :        .               . .   .....        . .  .            .  .......      .       .  .. .         ..... ..      .     .   .  .   .   ..                 
lowQualScore                  :        9               0 5   33333        5 5  5            4  6666666      4       7  22 7         99999 22      5     7   7  7   9   99                 
consensus                     : TTCTCGC-AATTTAAGACTAAAAAC-TTAA-CGGTAAATTCT-T-AA-TTTCAGATGACA-CC-------ATGTGT-TTGGCTT-AA--A-TTTCCTATT-C---A--ATGCAA-TAATG-ACA-CA-AAG-TAC--AGACAAACAACTGATAA
Reference ( family-939 )      : TTCTCGC-AATTTAAGACTAAAAAC-TTAA-CGGTAAATTCT-T-AA-TTTCAGATGACA-CC-------ATGTGT-TTGGCTT-AA--A-TTTCCTATT-C---A--ATGCAA-TAATG-ACA-CA-AAG-TAC--AGACAAACAACTGATAA
gi|112502                     : TTCTCGC-AATTTAAGACTAAAAAC-TTAA-CAGTAAATTTT-T-AA-TTTCAGATAACAATC-------ATGTGT-TTGGCTT-AA--A-TTTCCTATT-C---A--ATGCAA-TATTG-ACA-CA-AAG-TAC--AGACAAACAACTGATAA
gi|112503                     : TTCTAGC-AATTTAAGACTAAAATC-TTAA-CAGTAAATTCT-T-AA-TTTCCAATGACA-CC-------ATGTGT-TTGGCTT-AA--A-TTTCCTATT-C---A--ATGCAA-TAATG-ACA-CA-AAG-TAT--AGACAAACAACTGATAAaaata
gi|112504                     : TTCTCGC-AATTTAAGACTAAAAAC-TTAA-CGGTAAATTCT-T-AA-TTTCAGATGACA-CC-------A--CGT-TTGGCTT-AA--A-TTTCCTATT-C---A--ATGCAG-TAATG-ACA-CA-AAG-TAT--AGACAAGCAACTGGTAAaaata
gi|112505                     : TTTTCGC-AATTTCAGACTAAAAAC-TTAA-CGGTAAATTCT-T-AA-TTTCAGATGACA-CC-------ATGTGT-TTGGCTTAAA--A-TTTCCTATT-C---A--ACGCAA-TAAGT-ATA-CA-AAG-TAT--AGAAAAACAACTGAT
gi|112506                     : TTCTTGC-AATCTAAGGCTAAAA-C-TTAT-CGGTAAATTCT-T-AA-TTTCAGATGACA-CC-------ATGTGT-TTGGCTC-AA--A-TTTCCAATG-A---A--ATGCAA-TAATG-AAA-CT-AAG-TAC--AGACAAACAACTGATAAtaaaata
gi|112507                     : TTCTCGC-AATTTAAGACTAAAAAC-TTAA-TGGTAAATTCT-TTAA-TTTCAGATGAAT-AC-------ATGTGT-TTGGCTT-AA--A-TTTCCTATT-C---A--ATaaata
gi|112508                     : TTCTCGCCAATTTAATAC--AAAAC-TTAA-TG-TA--TTCT---AA-T--CAGATGAAT-AC-------ATGTGTCTTGGCTT-AA--ACTTTCCTATT-C---A--A-AAAA-TACAG-ACGTTATAAG-T-----GA-AAACAACTGATGA
gi|112509                     : TTCT-GC-AATTTAAGACTAAAAAC-TTAAACGGTAAATTCT-T-AAATTTCAGTTGACA-CT-------ATGTGT-TTGGCTT-AA--ATTTTCCTATT-CA--A--ATGCAATTAATGAACA-CG-CAGTTACTTAGACaaa
gi|112510                     : TTCTCGC-AATTTAAGACTAAAG-C-TTAC-CGGTAAATTCT-T-AA-TTTTAGATGACA-CCATTATATATGTGT-TTGGTTT-AA--A-TTTCCTTTT-T---AATATGCAA-
gi|112511                     :  TCTCGC-AATTTAAGACTAAAG-T-TTAT-CACTAAATTCT-T-AA-TTTCTAATTACA-CC-------ATGCGT-TTGACTT-AA--A-TTTCCAATT-A---A--ATGGAA-TGATG-ACA-CA-AAG-TAC--AGACAAACAAGTGATAA
gi|112512                     :   CTCGC-AATTTAAAACTAAAG-C-TTAA------AAT-CT-T-AA-TTTCAGACAACA-TC-------ATGTGT-TTG---------A-TTT----TT-T---A--ATCTGA--AATG-ACA-CA-AAA-TAC--GGAC-CGTAACTGATaaata
gi|112513                     :   CTAGC-AATTGAAAACTAAAG-C-TTAA------AAT-CT-T-AA-TTTCAGAGGACA-TC-------ATGTGT-TTGATTT-------TTT--TACC-T---G--A-------AATG-ACA-CA-AAA-TAC--GGACCTATAACTGATtaaaaa
gi|112514                     :      GC-AATTT----CCAAAAAC-TC---CTCTCAATTTTAT-GA-CTTCAGATGACA-CC-------ATGTGT-TTGGCTT-AA--A-TTTCAAATTAA---A--ATACAT-TAATG-ACA-CA-AAG-TAC--AGACAAACAACTGATGAtaaa
gi|112515                     :      GC-AATTTAAAACTAATA-C-TTA-----TAAAATCT-T-AC-TTTCAGATGGCA-TA-------ATGTGT-TGGACTT-AA--A-TTTGATATT-TTGAA--ATGCAA-TAATG-ACA-CA-AAaaata
gi|112516                     :             TAAGACTAAAAAC-TTGA-CGGTAAAGTCT-T-AA-TTTCAGATGACG-CC-------ACGTGT-TTGGCTT-AA--A-TTTCCTATT-C---A--ATGCAA-TAATG-ACA-CA-AAG-TAT--AGACAAACAACTGATGA
gi|112517                     :                     AAAACGTT---CAGTAAATTCT-T-AC-TTTTAGATGACG--C-------A-GTGT-TTGACTT-AATGA-TT--CTA-T-A---A--ATGCAC-T-ATT-ACA-CA-AAG-TAC--ACACAAACaaata
gi|112518                     :                                                        TGACA-CC-------ATGTGT-TTGGCTTTAA--A-TTTCCAATT-A---A--ATGCAA-TAATG-ATA-GT-AAG-TAC--ACACAAATTAATGATAAtgttaaaa