lowQualScore : 5555555555555555555555555555 111 1111 1111111 1 1
lowQualScore : 3 3 3 88 3 3 3 44 6 2 2 2 33 2 3333333333333333333333333333 44 3 1 77 77 3 3 222 3 3 44 77 3 6 3 3 3 0000 33 3 1 222 8 1 55 1 1 6666666666 99999999999 22 99 1 33 3 1 1 4 3 8888888 33 22 66 1 3 1 1 3333 0 2 1 3 3 3 777 8 5
lowQualScore : . . . .. . . . .. . . . . .. . ............................ .. . . .. .. . . ... . . .. .. . . . . . .... .. . . ... . . .. . . .......... ........... .. .. . .. . . . . . ....... .. .. .. . . . . .... . . . . . . ... . .
lowQualScore : 1 1 1 55 1 1 1 22 2 9 9 9 99 9 0000000000000000000000000000 66 2 2 99 99 3 3 333 3 3 66 99 3 7 3 3 8 7777 77 0 5 666 5 5 00 5 5 5555555555 55555555555 99 88 5 77 1 7 5 6 1 8888888 77 11 77 5 7 5 5 3333 0 2 4 6 6 6 000 0 7
consensus : CACA-TT-T-G--CA-T-A-GCA--TG-T-AAAT-TTAC-ACAT--ATG-T--A---------------T---------TTA--CTTTTGC--ACT--ACC-TC-TCCA-GTC-AG-T--GCAA--A-TTT-G-CTC-CAC-A----TGCA--AA-TTTA-CTT---ACGT-G--T-GC-AA----------A-CG--------CG-TT--C-A--T-GTG-C-C-AT-A-----TT--TG--CA--CA-CCTAA-G-TA----AATTTT-ACATACC-T-A-TG---T-TT-TTTT
Reference ( gi|18361 ) : CACA-TT-T-G--CA-T-A-GCA--TG-T-AAAT-TTAC-ACAT--ATG-T--A---------------T---------TTA--CTTTTGC--ACT--ACC-TC-TCCA-GGC-AG-T--GCAA--A-TTT-G-CTC-CAC-A----TGCA--AA-TTTA-CTT---ACGT-G--T-GC-AA----------A-CG--------CG-TT--C-A--T-GTG-C-C-AT-A-----TT--TG--CA--CA-CCGAA-G-TA----AATTTT-ACATACC-T-A-TG---T-TT-TTTT
gi|18362 : CACA-TT-T-G--CA-T-A-GCA--TG-T-AAAT-TTAC-ACA---ATG-TAAA---------------T---------TTA--C-TTTGC--ACT--ACT-CT-TCCA-GGC-AG-T--GCAA--A-TTT-G-CTC-CAC-A----TGCA--AA-TTTA-CTT---ACGT-G--T-GC-AA----------A--G--------CG-TT--C-A--TGGTG-C-C-AT-A-----TT--TG--CAC-CA-CCGAA-G-TA----AA-TTT-ACATACC-T-A-TG---T-TT-
gi|18363 : CACA-TT-T-G--CA-T-A-GCA--TG-T-AAAT-TTAC-ACAT--ATG-TAAA---------------T---------TTA--C--TTGCG-ACT--ACCTTC-TCCA-GTC-AG-T--GCAA--A--TT-G-CTC-CACAA----TGCA--AA-TTTA-CTT---ACGC-G--T-GCAAA----------A-CG--------CG-TT--C-A--T-GTG-C-C-AT-A-----TT--TG--CA--CA-CCTAA-G-TA----A--TTT-ACATACC-T-A-TGGTAT-TT-TTT
gi|18364 : CACA-TT-T-G--CA-T-A-GCA--TG-T-AAATCTTAC-ACAT--ATG-T--AAA-------------T---------TTA--CTTTTGC--ACT--ACC-TC-TCCA-ATC-AG-T--GCAA--A-TTT-G-CTC-CAC-A----TGCA--AA-TTTA--TT---A-GT-T--T-GC-AA----------A-CG--------CG-TT--C-A--T-GTG-C-C--T-A-----TT--TG--C---CA-CCTAA-G-TA----AA-TTT-ACATAGC-T-A-TG---T-AT-TTTT
gi|18365 : CACA-TT---G--CA-T-A-GCA--TG-T-AAAT-TTAC-ACAT--ATG-TAAA---------------T---------TTA--CTTTTGC--ACT--A-C-TC-TTCA-GTC-AG-T--GCAAATA-TTT-A-CTC-CAC-A----TGCA--AATTTTA-CTT---ACGT-G--T-GC-AA----------A-CG--------CG-TT----A--T-GTG-C-C-ATAA-----TT--TG--CA--CA-CCTAA-GTTA----AATGTTAACATACC-T-A-TG---TATT-TTTT
gi|18366 : CACA-TT-T-GACCA-T-A-GCA--TGGT-AAAT-TTAC-ACCT--ATG-T--AAA-------------T---------TTA--CTTTTGC--ATT--ACC-TC-TCCATTTC-AG-TTAGTAA--A-TTT-GCCTC-CAC-AT---TGCA--AATTTTA-CTA---ACGT-G--T-GC-AA----------A-CG--------CGTTT--C-A--T-GTG-C-C-AT-A-----TT--TG--CAC-CA-CCTAA-G-TA----AATTTT-ACATACCTT-A-TG---T-
gi|18367 : CACAATTGT-G--CA-T-A-GCA--TG-T-AAAA-TTAC-ACAT--ATG-T--AAAAGAGAGACAGGAAT---------TTA--CTTTTGC--ACTG-ACC-GC-CTCA-GTC-AG-T--GCAA--AATTT-G-CCT-CAC-A----TGCA--AA-TTTA-ACT---ACG--GCTT-GC-AA----------A-CG--------CG-TT--CCA--T-GTG-C-C-AT-A-----TT--TG--CA--CA-CT-AA-G-TA----A-TTTT-ACATACC-T-ACTG---T-AT-TTTT
gi|18368 : CACA-TA-T-T--CA-TTA-GCA--TG-TTAAAT-TTAC-ACAT--ATGGT--A---------------A---------TTAGCTTTTTGC--A-T--ACT-CT-TCCA-T-C-AG-T--GCAAT-A-TTTTG-CTC-CAC-A----TGCA--A----TA-CTT---AAGT-G--T-GC-AA----------G-C------------TT--C-AATT-GTG-C-CAAT-A-----TC--TT--CT--CACCCTAA-G-TA----AA--TT-ACATA-C-T-A-TG---T-TTATTTT
gi|18369 : CAAA-TT-T-G--CA-T-A-GCAATTG-T-AAAT-TTACTACATTAATG-T--AAAT------------T---------TTA--CTATTGCCAACT--ACC-TCCTCCA-GTC-A--T--GCAA--T-TTT-G-CTC-CAC-AATCCTGCAGAAA-TATA-TTTTCTACGT-G--T-GC-AA----------A-CG--------CG-TTCGC-A--T-GTGAC-C-AT-GTATT-TT--TG--CACTCT-CCTAA-G-TATTGTAATTAT-AC
gi|18370 : CACT-TT-T-G--CA-T-A-GCA--TG-C-TAAT-TTAC-ACAT-------------------------T---------TTG--CT-------ACT--ACC-TC-TACA-CGT-CA-T--GC-A--A-TTT-G-CCT-CTC-AC---TGCA--AT-TATA-CGT---A-AT-G--T-GC-AA----------A-CA--------CG-TT--C-A--T--TG-C-C-AT-ATT---TT--TG--CA--CA-CCTAACG-TA--------TT-ACATACC-T-A-Tcgtaagtt
gi|18377 : CACA-TT-T-G--CA-T-A-GCA--TG-T-AAAT-TTAC-ACAT--ATG-T--
gi|18375 : aatttactttgcgttcatgtgcCACA-TT-T-GACCA-T-A-GCA--TGGT-AAAT-TTAC-ACCT--ATG-T--
gi|18371 : gtaaacttactatatggcgttcatgtgcACA-TT-TTG--CAAT-A-GCA--TG-T-AAAA-TTAC-AGAT--TTG-TAAA---------------T---------TTA--C-TTTGC--ACT--ATC--C-TCCA-GTC-AG-T--GCAA--A-TTTGG-CTCACAC-A-----GTA--AA-TTTA-CTT---ACGT-G--TGGC-AA----------A-CG--------CG-TT--C-AT-T-GTG-C-CTAT-A-----TTTGTG--CA--CA-CCTAA-G--A----AA-TTT-ACATACC-TGA-TG---TATT-TCTT
gi|18362 : -TT-T-G--CA-C-ACGTA--AG-T-AAAT-TTGC-A--T--GTG-G--A---------------G---------CAA--ATTT-GC--ACT--GCC-TG-GAAG-AGT-AG-T--GCAA--A-GTA-A-ATT-TAC-ATTG-TGTA--AA-TTTA-CAT---GC-T-A--T-GC-AA----------A-TG--------TG-
gi|18372 : -AAAT-TTGC-TCCT--ATA-T--A---------------TGAGCAAATGTTA--ATTT-GC--ACCTAACC-TT------GACTAGAT--GCAA--A-TTT-A-CTT-AGCTG----TGCAG-AA-TTTG-CAT---A--T-A--A-GC-GA----------A-TC--------AG-TT--C-A--T-ATG-A-C-AA-AA----CT--TG--TA--CA-CCTAA-G-TA----AA-TTT-ACACAgcgttcatggtgccatatttgcaccaccgaagtaaatttacatacctatgtttt
gi|18362 : -A----TGTA--AA-TTTA-CTT---CGGT-GG-T-GC-AA----------A-TA--------TG------------GCA-C-C-AT-GAACGCTT--TG--CA--CA-CGTAA-G-TA----AATTT
gi|18363 : cacatttgcatagcatgtaaatttacacaatgtaaatttactttgcactactcttccaggcagtgcaaatttgctccacatgc-A----TGTA--AA-TT-A-CTT---AGGT-G--T-GC-AA----------A-TA--------TG-GCA-C-A--T-GAA-CGC-GT-------TT--TG--CA--CG-CGTAA-G-TA----AATTTacctatgtttt
gi|18364 : cacatttgcatagcatgtaaatttacacatatgtaaatttacttgcgactaccttctccagtcagtgcaaattgctccacaatgc-A----TGTA--AA-TTTA-CTT---AGGT-G----GC-AA----------A-TA--------GG-CA--C-A--T-G-A-A-C-GC-G-----TT--TG--CA--AA-CT--A-A-TA----AATTTacctatggtatttttt
gi|18367 : cacatttgcatagcatgtaaatcttacacatatgtaaatttacttttgcactacctctccaatcagtgcaaatttgctccacatgc-A----TGTA--AA-ATTA-CTT---A-GT-G--T-GC-AA----------A-TA--------TG-GCA-C-A--T-GGA-A-C-GC-G-----TT--TG--CA--AG-CCGTA-G-TT----AAATTT-GCATagctatgtattttt
gi|18376 : cacaattgtgcatagcatgtaaaattacacatatgtaaaagagagacaggaatttacttttgcactgaccgcctcagtcagtgcaaaatttgcctcac-A----TGCA--AA-TTTA-CTT---ACGT-G--T-GC-AA----------A-CG--------CG-TT--C-A--T-GTG-C-C-AT-A-----TT--TG--CA--CA-CCGAA-G-TA----AATTTacctactgtattttt
gi|18374 : -A----TGCA--AA-TTTA-CTT---ACGC-G--T-GC-AA----------AACG--------CG-TT--C-A--T-GTG-C-C-AT-A-----TT--TG--CA--CA-CCTAA-G-TA----A--TTT-ACAT
gi|18374 : -A----TGTA--AA-TT-A-CTT---AGGT-G--T-GC-AA----------A-TA--------TG-GCA-C-A--T-GAA-CGC-GT-------TT--TG--CA--CG-CGTAA-G-TA----AATTT
gi|18373 : -A----TGCA--AA-TTTA-CTT---ACGT-G--T-GC-AA----------A--G--------CG-TT--C-A--TGGTG-C-C-AT-A-----TT--TG--CAC-CA-CCGAA-G-TA----AA-TTT-ACATgcat
gi|18373 : -A----TGTA--AA-TTTA-CTT---CGGTGG--T-GC-AA----------A-TA--------TG------------GCA-C-C-AT-GAACGCTT--TG--CA--CA-CGTAA-G-TA----AATTT
gi|18372 : ----TGTA--AA-TTTA-CTT---AGGT-G--T-AC-AAGTTTTGTCATA-TGAACTGATTCG-CT--T-A--T-ATG-C-A-A--A-----TTC-TG--CA--CA-GCTAA-G-TA----AATTTgcat
gi|18375 : aaatttgctcctatatatgagcaaatgttaatttgcacctaaccttgactagatgcGTA--AA-CTTA-CT------AT-A--T-G-----------------G--------CG-TT--C-A--T-GTG-C-C-AC-A-----TT--TGACCA--TA-GCATG-G-TA----AATTT----ACACC-T-A-TG---T-ca
gi|18366 : A--AA-TTTA-CTT---AGGT-GG-T-GC-AA----------A-TA--------TG-GCA-C-A--T-GAA-A-C-GC-G-----TT--TG--CA--CA-CGTTA-G-TA----AAATTT-GCA
gi|18376 : cacatttgaccatagcatggtaaatttacacctatgtaaatttacttttgcattacctctccatttcagttagtaaatttgcctccacatA--AA-TTTA-CTT---CGGT-G--T-GC-AA----------A-TA--------TG-GCA-C-A--T-G-A-A-C-GC-G-----TT--TG--CA--CA-CGTAA-G-TA----AATTTtacataccttatgt
gi|18377 : --AA-TTTA-CTT------------------------------TG--------CG-TT--C-A--T-GTG-C-C-AC-A-----TT--TG--CA--TA-GC-AT-G-TA----AA-TTT-ACACA---T-A-TG---T-gcat
gi|18365 : A-TTTAACTT---AGGT-G--T-GC-AA----------A---------------T--T-A--T-G-G-CAC-AT-AACGCGTT--TG--CA--CA-CGTAA-G-TA----AAATTT-GCAT
Alignments
lowQualScore : 5555555555555555555555555555 1111 1111 11
lowQualScore : 3 3 3 44 3 3 44 3 3 3 3 44 3 2222222222222222222222222222 44 77 77 3 3 3 3 3 44 77 3 6 3 3 2 1111 2 55 2 2 444 3 33 2 4 55 2 55 4 2 4 2 0000 33 33 77 2 2 1 2 2 5555 66 2 0 3 3 3 666 7 5
lowQualScore : . . . .. . . .. . . . . .. . ............................ .. .. .. . . . . . .. .. . . . . . .... . .. . . ... . .. . . .. . .. . . . . .... .. .. .. . . . . . .... .. . . . . . ... . .
lowQualScore : 3 3 3 66 3 3 66 3 1 1 1 22 1 6666666666666666666666666666 66 99 99 3 3 3 3 3 66 99 3 7 3 3 7 0000 5 66 4 4 111 2 22 4 7 66 4 66 7 4 7 4 6666 22 22 99 4 4 1 4 4 0000 55 5 4 3 3 3 444 3 0
consensus : CACA-TT-T-G--CA-T-AGCA--TG-T-AAAT-TTAC-ACAT--ATG-T--AAA-------------T---------TTA--CTTTTGC--ACT--ACCT-C-T-CCA-GT-CAGT--GCAA--A-TTT-GC-TC-CAC-A----T-GCA--AA-TTT-ACTT---ACGTG--T-GCAAA-CGCGTT--C-A--T-GTG-CC-AT-A----TT--TG--CA--C-A-CCTAA-G-TA----AATTTT-ACATACC-T-A-TG---T-TT-TTTT
Reference ( family-932 ) : CACA-TT-T-G--CA-T-AGCA--TG-T-AAAT-TTAC-ACAT--ATG-T--A---------------T---------TTA--CTTTTGC--ACT--ACCT-C-T-CCA-GT-CAGT--GCAA--A-TTT-GC-TC-CAC-A----T-GCA--AA-TTT-ACTT---ACGTG--T-GCAAA-CGCGTT--C-A--T-GTG-CC-AT-A----TT--TG--CA--C-A-CCTAA-G-TA----AATTTT-ACATACC-T-A-TG---T-TT-TTTT
gi|18361 : CACA-TT-T-G--CA-T-AGCA--TG-T-AAAT-TTAC-ACAT--ATG-T--A---------------T---------TTA--CTTTTGC--ACT--ACCT-C-T-CCA-GG-CAGT--GCAA--A-TTT-GC-TC-CAC-A----T-GCA--AA-TTT-ACTT---ACGTG--T-GCAAA-CGCGTT--C-A--T-GTG-CC-AT-A----TT--TG--CA--C-A-CCGAA-G-TA----AATTTT-ACATACC-T-A-TG---T-TT-TTTT
gi|18362 : CACA-TT-T-G--CA-T-AGCA--TG-T-AAAT-TTAC-ACA---ATG-TAAA---------------T---------TTA--C-TTTGC--ACT--ACTC-T-T-CCA-GG-CAGT--GCAA--A-TTT-GC-TC-CAC-A----T-GCA--AA-TTT-ACTT---ACGTG--T-GCAAA--GCGTT--C-A--TGGTG-CC-AT-A----TT--TG--CAC-C-A-CCGAA-G-TA----AA-TTT-ACATACC-T-A-TG---T-TT-
gi|18363 : CACA-TT-T-G--CA-T-AGCA--TG-T-AAAT-TTAC-ACAT--ATG-T--AAA-------------T---------TTA--CTT--GCG-ACT--ACCTTC-T-CCA-GT-CAGT--GCAA--A-TT--GC-TC-CAC-AA---T-GCA--AA-TTT-ACTT---ACGCG--T-GCAAAACGCGTT--C-A--T-GTG-CC-AT-A----TT--TG--CA--C-A-CCTAA-G-TA----A--TTT-ACATACC-T-A-TGGTAT-TT-TTT
gi|18364 : CACA-TT-T-G--CA-T-AGCA--TG-T-AAATCTTAC-ACAT--ATG-T--AAA-------------T---------TTA--CTTTTGC--ACT--ACCT-C-T-CCA-AT-CAGT--GCAA--A-TTT-GC-TC-CAC-A----T-GCA--AA-TTT-A-TT---A-GTT--T-GCAAA-CGCGTT--C-A--T-GTG-CC--T-A----TT--TG--C---C-A-CCTAA-G-TA----AA-TTT-ACATAGC-T-A-TG---T-AT-TTTT
gi|18365 : CACA-TT---G--CA-T-AGCA--TG-T-AAAT-TTAC-ACAT--ATG-TAAA---------------T---------TTA--CTTTTGC--ACT--A-CT-C-T-TCA-GT-CAGT--GCAAATA-TTT-AC-TC-CAC-A----T-GCA--AATTTT-ACTT---ACGTG--T-GCAAA-CGCGTT----A--T-GTG-CC-ATAA----TT--TG--CA--C-A-CCTAA-GTTA----AATGTTAACATACC-T-A-TG---TATT-TTTT
gi|18366 : CACA-TT-T-GACCA-T-AGCA--TGGT-AAAT-TTAC-ACCT--ATG-T--AAA-------------T---------TTA--CTTTTGC--ATT--ACCT-C-T-CCA-TTTCAGTTAGTAA--A-TTT-GCCTC-CAC-A----TTGCA--AA-TTTTACTA---ACGTG--T-GCAAA-CGCGTTT-C-A--T-GTG-CC-AT-A----TT--TG--CA--CCA-CCTAA-G-TA----AATTTT-ACATACCTT-A-TG---T-
gi|18367 : CACAATTGT-G--CA-T-AGCA--TG-T-AAAA-TTAC-ACAT--ATG-T--AAAAGAGAGACAGGAAT---------TTA--CTTTTGC--ACTG-ACCG-C-C-TCA-GT-CAGT--GCAA--AATTT-GC-CT-CAC-A----T-GCA--AA-TTT-AACT---ACG-GCTT-GCAAA-CGCGTT--CCA--T-GTG-CC-AT-A----TT--TG--CA--C-A-C-TAA-G-TA----A-TTTT-ACATACC-T-ACTG---T-AT-TTTT
gi|18368 : CACA-TA-T-T--CA-TTAGCA--TG-TTAAAT-TTAC-ACAT--ATGGT--A---------------A---------TTAGCTTTTTGC--A-T--ACTC-T-T-CCA--T-CAGT--GCAAT-A-TTTTGC-TC-CAC-A----T-GCA--A----T-ACTT---AAGTG--T-GCAAG-C---TT--C-AATT-GTG-CCAAT-A----TC--TT--CT--C-ACCCTAA-G-TA----AA--TT-ACATA-C-T-A-TG---T-TTATTTT
gi|18369 : CAAA-TT-T-G--CA-T-AGCAATTG-T-AAAT-TTACTACATTAATG-T--AAAT------------T---------TTA--CTATTGCCAACT--ACCT-CCT-CCA-GT-CA-T--GCAA--T-TTT-GC-TC-CAC-AATCCT-GCAGAAA-TAT-ATTTTCTACGTG--T-GCAAA-CGCGTTCGC-A--T-GTGACC-AT-GTATTTT--TG--CACTC-T-CCTAA-G-TATTGTAATTAT-AC
gi|18370 : CACT-TT-T-G--CA-T-AGCA--TG-C-TAAT-TTAC-ACAT-------------------------T---------TTG--CT-------ACT--ACCT-C-T-ACACGT-CA-T--GC-A--A-TTT-GC-CT-CTC-AC---T-GCA--AT-TAT-ACGT---A-ATG--T-GCAAA-CACGTT--C-A--T--TG-CC-AT-ATT--TT--TG--CA--C-A-CCTAACG-TA--------TT-ACATACC-T-A-Tcgtaagtt
gi|18371 : ACA-TT-TTG--CAAT-AGCA--TG-T-AAAA-TTAC-AGAT--TTG-TAAA---------------T---------TTA--C-TTTGC--ACT--ATC--C-T-CCA-GT-CAGT--GCAA--A-TTTGGC-TCACAC-A------GTA--AA-TTT-ACTT---ACGTG--TGGCAAA-CGCGTT--C-AT-T-GTG-CCTAT-A----TTTGTG--CA--C-A-CCTAA-G--A----AA-TTT-ACATACC-TGA-TG---TATT-TCTT
gi|18372 : -AAAT-TTGC-TCCT--ATA-T--A---------------TGAGCAAATGTTA--ATTT-GC--ACCTAACCT-T-GACTA-G----AT--GCAA--A-TTT-AC-TT-AGCTG----T-GCAG-AA-TTT-GCAT---A--TA--A-GCGAA-TCAGTT--C-A--T-ATG-AC-AA-AA---CT--TG--TA--C-A-CCTAA-G-TA----AA-TTT-ACACA
gi|18373 : -A----T-GCA--AA-TTT-ACTT---ACGTG--T-GCAAA--GCGTT--C-A--TGGTG-CC-AT-A----TT--TG--CAC-C-A-CCGAA-G-TA----AA-TTT-ACAT
gi|18374 : -A----T-GCA--AA-TTT-ACTT---ACGCG--T-GCAAAACGCGTT--C-A--T-GTG-CC-AT-A----TT--TG--CA--C-A-CCTAA-G-TA----A--TTT-ACAT
gi|18375 : -GTA--AA-CTT-ACT------ATA--T-G------GCGTT--C-A--T-GTG-CC-AC-A----TT--TGACCA--T-A-GCATG-G-TA----AATTT----ACACC-T-A-TG---T-
gi|18376 : -A----T-GCA--AA-TTT-ACTT---ACGTG--T-GCAAA-CGCGTT--C-A--T-GTG-CC-AT-A----TT--TG--CA--C-A-CCGAA-G-TA----AATTT
gi|18377 : --AA-TTT-ACTT------------------TGCGTT--C-A--T-GTG-CC-AC-A----TT--TG--CA--T-A-GC-AT-G-TA----AA-TTT-ACACA---T-A-TG---T-
gi|18377 : CACA-TT-T-G--CA-T-AGCA--TG-T-AAAT-TTAC-ACAT--ATG-T--
Alignments
lowQualScore : 1111111111111 1111 1111 11 11
lowQualScore : 3 3 3 44 3 3 44 3 3 3 9999 44 44 8888888888888 3 3 3 1 77 77 3 3 3 6 44 77 6 3 3 3 5 1111 55 4 444 3 33 2 2 2 2 33 2 55 4 2 4 2 0000 33 33 00 2 1 2 2 5555 66 2 0 3 3 3 666 7 5
lowQualScore : . . . .. . . .. . . . .... .. .. ............. . . . . .. .. . . . . .. .. . . . . . .... .. . ... . .. . . . . .. . .. . . . . .... .. .. .. . . . . .... .. . . . . . ... . .
lowQualScore : 3 3 3 66 3 3 66 3 1 1 6666 22 22 3333333333333 3 3 3 2 99 99 3 3 3 7 66 99 7 3 3 3 3 0000 66 7 111 2 22 4 4 4 4 22 4 66 7 4 7 4 6666 22 22 33 4 1 4 4 0000 55 5 4 3 3 3 444 3 0
consensus : CACA-TT-T-G--CA-T-AGCA--TG-T-AAAT-TTAC----ACAT--ATG--TAAA-------------T-TT-AC-TTTTGC--ACT--ACC-TC-T-CCA-GTCAGT--GCAA--A-TTT-G-CTC-CAC-A----TGCA--AA-TTTACTT---ACGTG--T-GC-AAA-CGCG-TT--C-A--T-GTG-CC-AT-A----TT--TG--CA--CA-CCTAA-G-TA----AATTTT-ACATACC-T-A-TG---T-TT-TTTT
Reference ( family-932 ) : CACA-TT-T-G--CA-T-AGCA--TG-T-AAAT-TTAC----ACAT--ATG--TAAA-------------T-TT-AC-TTTTGC--ACT--ACC-TC-T-CCA-GTCAGT--GCAA--A-TTT-G-CTC-CAC-A----TGCA--AA-TTTACTT---ACGTG--T-GC-AAA-CGCG-TT--C-A--T-GTG-CC-AT-A----TT--TG--CA--CA-CCTAA-G-TA----AATTTT-ACATACC-T-A-TG---T-TT-TTTT
gi|18361 : CACA-TT-T-G--CA-T-AGCA--TG-T-AAAT-TTAC----ACAT--ATG--TA---------------T-TT-AC-TTTTGC--ACT--ACC-TC-T-CCA-GGCAGT--GCAA--A-TTT-G-CTC-CAC-A----TGCA--AA-TTTACTT---ACGTG--T-GC-AAA-CGCG-TT--C-A--T-GTG-CC-AT-A----TT--TG--CA--CA-CCGAA-G-TA----AATTTT-ACATACC-T-A-TG---T-TT-TTTT
gi|18362 : CACA-TT-T-G--CA-T-AGCA--TG-T-AAAT-TTAC----ACA---ATG--TAAA-------------T-TT-AC-TTT-GC--ACT--ACT-CT-T-CCA-GGCAGT--GCAA--A-TTT-G-CTC-CAC-A----TGCA--AA-TTTACTT---ACGTG--T-GC-AAA--GCG-TT--C-A--TGGTG-CC-AT-A----TT--TG--CAC-CA-CCGAA-G-TA----AA-TTT-ACATACC-T-A-TG---T-TT-
gi|18363 : CACA-TT-T-G--CA-T-AGCA--TG-T-AAAT-TTAC----ACAT--ATG--TAAA-------------T-TT-AC---TTGCG-ACT--ACCTTC-T-CCA-GTCAGT--GCAA--A--TT-G-CTC-CACAA----TGCA--AA-TTTACTT---ACGCG--T-GCAAAA-CGCG-TT--C-A--T-GTG-CC-AT-A----TT--TG--CA--CA-CCTAA-G-TA----A--TTT-ACATACC-T-A-TGGTAT-TT-TTT
gi|18364 : CACA-TT-T-G--CA-T-AGCA--TG-T-AAATCTTAC----ACAT--ATG--TAAA-------------T-TT-AC-TTTTGC--ACT--ACC-TC-T-CCA-ATCAGT--GCAA--A-TTT-G-CTC-CAC-A----TGCA--AA-TTTA-TT---A-GTT--T-GC-AAA-CGCG-TT--C-A--T-GTG-CC--T-A----TT--TG--C---CA-CCTAA-G-TA----AA-TTT-ACATAGC-T-A-TG---T-AT-TTTT
gi|18365 : CACA-TT---G--CA-T-AGCA--TG-T-AAAT-TTAC----ACAT--ATG--TAAA-------------T-TT-AC-TTTTGC--ACT--A-C-TC-T-TCA-GTCAGT--GCAAATA-TTT-A-CTC-CAC-A----TGCA--AATTTTACTT---ACGTG--T-GC-AAA-CGCG-TT----A--T-GTG-CC-ATAA----TT--TG--CA--CA-CCTAA-GTTA----AATGTTAACATACC-T-A-TG---TATT-TTTT
gi|18366 : CACA-TT-T-GACCA-T-AGCA--TGGT-AAAT-TTAC----ACCT--ATG--TAAA-------------T-TT-AC-TTTTGC--ATT--ACC-TC-T-CCATTTCAGTTAGTAA--A-TTT-GCCTC-CAC-AT---TGCA--AATTTTACTA---ACGTG--T-GC-AAA-CGCGTTT--C-A--T-GTG-CC-AT-A----TT--TG--CAC-CA-CCTAA-G-TA----AATTTT-ACATACCTT-A-TG---T-
gi|18367 : CACAATTGT-G--CA-T-AGCA--TG-T-AAAA-TTAC----ACAT--ATG--TAAAAGAGAGACAGGAAT-TT-AC-TTTTGC--ACTG-ACC-GC-C-TCA-GTCAGT--GCAA--AATTT-G-CCT-CAC-A----TGCA--AA-TTTAACT---ACG-GCTT-GC-AAA-CGCG-TT--CCA--T-GTG-CC-AT-A----TT--TG--CA--CA-C-TAA-G-TA----A-TTTT-ACATACC-T-ACTG---T-AT-TTTT
gi|18368 : CACA-TA-T-T--CA-TTAGCA--TG-TTAAAT-TTAC----ACAT--ATG--GTAA-------------T-TA-GCTTTTTGC--A-T--ACT-CT-T-CCA--TCAGT--GCAAT-ATTTT-G-CTC-CAC-A----TGCA--A----TACTT---AAGTG--T-GC-AAG-C----TT--C-AATT-GTG-CCAAT-A----TC--TT--CT--CACCCTAA-G-TA----AA--TT-ACATA-C-T-A-TG---T-TTATTTT
gi|18369 : CAAA-TT-T-G--CA-T-AGCAATTG-T-AAAT-TTACT---ACATTAATG--TAAA-------------T-TTTAC-TATTGCCAACT--ACC-TCCT-CCA-GTCA-T--GCAA--T-TTT-G-CTC-CAC-AATCCTGCAGAAA-TATATTTTCTACGTG--T-GC-AAA-CGCG-TTCGC-A--T-GTGACC-AT-GTATTTT--TG--CACTCT-CCTAA-G-TATTGTAATTAT-AC
gi|18370 : CACT-TT-T-G--CA-T-AGCA--TG-C-TAAT-TTAC----ACAT------------------------T-TT-GC-T-------ACT--ACC-TC-T-ACACGTCA-T--GC-A--A-TTT-G-CCT-CTC-AC---TGCA--AT-TATACGT---A-ATG--T-GC-AAA-CACG-TT--C-A--T--TG-CC-AT-ATT--TT--TG--CA--CA-CCTAACG-TA--------TT-ACATACC-T-A-Tcgtaagtt
gi|18371 : ACA-TT-TTG--CAAT-AGCA--TG-T-AAAA-TTAC----AGAT--TTG--TAAA-------------T-TT-AC--TTTGC--ACT--ATC--C-T-CCA-GTCAGT--GCAA--A-TTTGG-CTCACAC-A-----GTA--AA-TTTACTT---ACGTG--TGGC-AAA-CGCG-TT--C-AT-T-GTG-CCTAT-A----TTTGTG--CA--CA-CCTAA-G--A----AA-TTT-ACATACC-TGA-TG---TATT-TCTT
gi|18372 : -AAAT-TTGCTCCTATAT--ATGAGCAAA-------------TGTT-AA-TTT-GC--ACCTAACC-TT-GACTA-G---AT--GCAA--A-TTT-A-CTT-AGCTG----TGCAG-AA-TTTGCAT---A--TA--A-GC-GAA-TCAG-TT--C-A--T-ATG-AC-AA-AA---CT--TG--TA--CA-CCTAA-G-TA----AA-TTT-ACACA
gi|18373 : -A----TGCA--AA-TTTACTT---ACGTG--T-GC-AAA--GCG-TT--C-A--TGGTG-CC-AT-A----TT--TG--CAC-CA-CCGAA-G-TA----AA-TTT-ACAT
gi|18374 : -A----TGCA--AA-TTTACTT---ACGCG--T-GC-AAAACGCG-TT--C-A--T-GTG-CC-AT-A----TT--TG--CA--CA-CCTAA-G-TA----A--TTT-ACAT
gi|18375 : GTA--AA-CTTACT------ATA--T-G-------GCG-TT--C-A--T-GTG-CC-AC-A----TT--TGACCA--TA-GCATG-G-TA----AATTT----ACACC-T-A-TG---T-
gi|18376 : -A----TGCA--AA-TTTACTT---ACGTG--T-GC-AAA-CGCG-TT--C-A--T-GTG-CC-AT-A----TT--TG--CA--CA-CCGAA-G-TA----AATTT
gi|18377 : --AA-TTTACTT-------------------TGCG-TT--C-A--T-GTG-CC-AC-A----TT--TG--CA--TA-GC-AT-G-TA----AA-TTT-ACACA---T-A-TG---T-
gi|18377 : CACA-TT-T-G--CA-T-AGCA--TG-T-AAAT-TTAC----ACAT--ATG--T
Alignments
lowQualScore : 1111111111111 1111 1111 11 11
lowQualScore : 3 3 3 44 3 3 44 3 3 3 9999 44 44 8888888888888 3 3 3 1 77 77 3 3 3 6 44 77 6 3 3 3 5 1111 55 4 444 3 33 2 2 2 2 33 2 55 4 2 4 2 0000 33 33 00 2 1 2 2 5555 66 2 0 3 3 3 666 7 5
lowQualScore : . . . .. . . .. . . . .... .. .. ............. . . . . .. .. . . . . .. .. . . . . . .... .. . ... . .. . . . . .. . .. . . . . .... .. .. .. . . . . .... .. . . . . . ... . .
lowQualScore : 3 3 3 66 3 3 66 3 1 1 6666 22 22 3333333333333 3 3 3 2 99 99 3 3 3 7 66 99 7 3 3 3 3 0000 66 7 111 2 22 4 4 4 4 22 4 66 7 4 7 4 6666 22 22 33 4 1 4 4 0000 55 5 4 3 3 3 444 3 0
consensus : CACA-TT-T-G--CA-T-AGCA--TG-T-AAAT-TTAC----ACAT--ATG--TAAA-------------T-TT-AC-TTTTGC--ACT--ACC-TC-T-CCA-GTCAGT--GCAA--A-TTT-G-CTC-CAC-A----TGCA--AA-TTTACTT---ACGTG--T-GC-AAA-CGCG-TT--C-A--T-GTG-CC-AT-A----TT--TG--CA--CA-CCTAA-G-TA----AATTTT-ACATACC-T-A-TG---T-TT-TTTT
Reference ( family-932 ) : CACA-TT-T-G--CA-T-AGCA--TG-T-AAAT-TTAC----ACAT--ATG--TAAA-------------T-TT-AC-TTTTGC--ACT--ACC-TC-T-CCA-GTCAGT--GCAA--A-TTT-G-CTC-CAC-A----TGCA--AA-TTTACTT---ACGTG--T-GC-AAA-CGCG-TT--C-A--T-GTG-CC-AT-A----TT--TG--CA--CA-CCTAA-G-TA----AATTTT-ACATACC-T-A-TG---T-TT-TTTT
gi|18361 : CACA-TT-T-G--CA-T-AGCA--TG-T-AAAT-TTAC----ACAT--ATG--TA---------------T-TT-AC-TTTTGC--ACT--ACC-TC-T-CCA-GGCAGT--GCAA--A-TTT-G-CTC-CAC-A----TGCA--AA-TTTACTT---ACGTG--T-GC-AAA-CGCG-TT--C-A--T-GTG-CC-AT-A----TT--TG--CA--CA-CCGAA-G-TA----AATTTT-ACATACC-T-A-TG---T-TT-TTTT
gi|18362 : CACA-TT-T-G--CA-T-AGCA--TG-T-AAAT-TTAC----ACA---ATG--TAAA-------------T-TT-AC-TTT-GC--ACT--ACT-CT-T-CCA-GGCAGT--GCAA--A-TTT-G-CTC-CAC-A----TGCA--AA-TTTACTT---ACGTG--T-GC-AAA--GCG-TT--C-A--TGGTG-CC-AT-A----TT--TG--CAC-CA-CCGAA-G-TA----AA-TTT-ACATACC-T-A-TG---T-TT-
gi|18363 : CACA-TT-T-G--CA-T-AGCA--TG-T-AAAT-TTAC----ACAT--ATG--TAAA-------------T-TT-AC---TTGCG-ACT--ACCTTC-T-CCA-GTCAGT--GCAA--A--TT-G-CTC-CACAA----TGCA--AA-TTTACTT---ACGCG--T-GCAAAA-CGCG-TT--C-A--T-GTG-CC-AT-A----TT--TG--CA--CA-CCTAA-G-TA----A--TTT-ACATACC-T-A-TGGTAT-TT-TTT
gi|18364 : CACA-TT-T-G--CA-T-AGCA--TG-T-AAATCTTAC----ACAT--ATG--TAAA-------------T-TT-AC-TTTTGC--ACT--ACC-TC-T-CCA-ATCAGT--GCAA--A-TTT-G-CTC-CAC-A----TGCA--AA-TTTA-TT---A-GTT--T-GC-AAA-CGCG-TT--C-A--T-GTG-CC--T-A----TT--TG--C---CA-CCTAA-G-TA----AA-TTT-ACATAGC-T-A-TG---T-AT-TTTT
gi|18365 : CACA-TT---G--CA-T-AGCA--TG-T-AAAT-TTAC----ACAT--ATG--TAAA-------------T-TT-AC-TTTTGC--ACT--A-C-TC-T-TCA-GTCAGT--GCAAATA-TTT-A-CTC-CAC-A----TGCA--AATTTTACTT---ACGTG--T-GC-AAA-CGCG-TT----A--T-GTG-CC-ATAA----TT--TG--CA--CA-CCTAA-GTTA----AATGTTAACATACC-T-A-TG---TATT-TTTT
gi|18366 : CACA-TT-T-GACCA-T-AGCA--TGGT-AAAT-TTAC----ACCT--ATG--TAAA-------------T-TT-AC-TTTTGC--ATT--ACC-TC-T-CCATTTCAGTTAGTAA--A-TTT-GCCTC-CAC-AT---TGCA--AATTTTACTA---ACGTG--T-GC-AAA-CGCGTTT--C-A--T-GTG-CC-AT-A----TT--TG--CAC-CA-CCTAA-G-TA----AATTTT-ACATACCTT-A-TG---T-
gi|18367 : CACAATTGT-G--CA-T-AGCA--TG-T-AAAA-TTAC----ACAT--ATG--TAAAAGAGAGACAGGAAT-TT-AC-TTTTGC--ACTG-ACC-GC-C-TCA-GTCAGT--GCAA--AATTT-G-CCT-CAC-A----TGCA--AA-TTTAACT---ACG-GCTT-GC-AAA-CGCG-TT--CCA--T-GTG-CC-AT-A----TT--TG--CA--CA-C-TAA-G-TA----A-TTTT-ACATACC-T-ACTG---T-AT-TTTT
gi|18368 : CACA-TA-T-T--CA-TTAGCA--TG-TTAAAT-TTAC----ACAT--ATG--GTAA-------------T-TA-GCTTTTTGC--A-T--ACT-CT-T-CCA--TCAGT--GCAAT-ATTTT-G-CTC-CAC-A----TGCA--A----TACTT---AAGTG--T-GC-AAG-C----TT--C-AATT-GTG-CCAAT-A----TC--TT--CT--CACCCTAA-G-TA----AA--TT-ACATA-C-T-A-TG---T-TTATTTT
gi|18369 : CAAA-TT-T-G--CA-T-AGCAATTG-T-AAAT-TTACT---ACATTAATG--TAAA-------------T-TTTAC-TATTGCCAACT--ACC-TCCT-CCA-GTCA-T--GCAA--T-TTT-G-CTC-CAC-AATCCTGCAGAAA-TATATTTTCTACGTG--T-GC-AAA-CGCG-TTCGC-A--T-GTGACC-AT-GTATTTT--TG--CACTCT-CCTAA-G-TATTGTAATTAT-AC
gi|18370 : CACT-TT-T-G--CA-T-AGCA--TG-C-TAAT-TTAC----ACAT------------------------T-TT-GC-T-------ACT--ACC-TC-T-ACACGTCA-T--GC-A--A-TTT-G-CCT-CTC-AC---TGCA--AT-TATACGT---A-ATG--T-GC-AAA-CACG-TT--C-A--T--TG-CC-AT-ATT--TT--TG--CA--CA-CCTAACG-TA--------TT-ACATACC-T-A-Tcgtaagtt
gi|18371 : ACA-TT-TTG--CAAT-AGCA--TG-T-AAAA-TTAC----AGAT--TTG--TAAA-------------T-TT-AC--TTTGC--ACT--ATC--C-T-CCA-GTCAGT--GCAA--A-TTTGG-CTCACAC-A-----GTA--AA-TTTACTT---ACGTG--TGGC-AAA-CGCG-TT--C-AT-T-GTG-CCTAT-A----TTTGTG--CA--CA-CCTAA-G--A----AA-TTT-ACATACC-TGA-TG---TATT-TCTT
gi|18372 : -AAAT-TTGCTCCTATAT--ATGAGCAAA-------------TGTT-AA-TTT-GC--ACCTAACC-TT-GACTA-G---AT--GCAA--A-TTT-A-CTT-AGCTG----TGCAG-AA-TTTGCAT---A--TA--A-GC-GAA-TCAG-TT--C-A--T-ATG-AC-AA-AA---CT--TG--TA--CA-CCTAA-G-TA----AA-TTT-ACACA
gi|18373 : -A----TGCA--AA-TTTACTT---ACGTG--T-GC-AAA--GCG-TT--C-A--TGGTG-CC-AT-A----TT--TG--CAC-CA-CCGAA-G-TA----AA-TTT-ACAT
gi|18374 : -A----TGCA--AA-TTTACTT---ACGCG--T-GC-AAAACGCG-TT--C-A--T-GTG-CC-AT-A----TT--TG--CA--CA-CCTAA-G-TA----A--TTT-ACAT
gi|18375 : GTA--AA-CTTACT------ATA--T-G-------GCG-TT--C-A--T-GTG-CC-AC-A----TT--TGACCA--TA-GCATG-G-TA----AATTT----ACACC-T-A-TG---T-
gi|18376 : -A----TGCA--AA-TTTACTT---ACGTG--T-GC-AAA-CGCG-TT--C-A--T-GTG-CC-AT-A----TT--TG--CA--CA-CCGAA-G-TA----AATTT
gi|18377 : --AA-TTTACTT-------------------TGCG-TT--C-A--T-GTG-CC-AC-A----TT--TG--CA--TA-GC-AT-G-TA----AA-TTT-ACACA---T-A-TG---T-
gi|18377 : CACA-TT-T-G--CA-T-AGCA--TG-T-AAAT-TTAC----ACAT--ATG--T
blockSeqs : A G T AC A T AT G T C TCCT TA AG AGAGAGACAGGAA G T T T CA TA T C A T TA AT A G C A A ATCC GA T TCT C CT G A A T CG C AT G A A A TATT TG AC CT C G C T TTGT AT A T G C GTA A A
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . . . . . . T G G . . . C . T T . . . T T G T . C . . . . . . . T G . T . TT . . C . T . . . AT . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . C . . . C . . . . . . . . . . . . A . . C . T . . . AT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . C . T . . . AT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . AT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : A*
originalCons : CACA-TT-T-G--CA-T-AGCA--TG-T-AAAT-TTAC----ACAT--ATG--TAAA-------------T-TT-AC-TTTTGC--ACT--ACC-TC-T-CCA-GTCAGT--GCAA--A-TTT-G-CTC-CAC-A----TGCA--AA-TTTACTT---ACGTG--T-GC-AAA-CGCG-TT--C-A--T-GTG-CC-AT-A----TT--TG--CA--CA-CCTAA-G-TA----AATTTT-ACATACC-T-A-TG---T-TT-TTTT
finalCons : CACA-TT-T-G--CA-T-AGCA--TG-T-AAAT-TTAC----ACAT--ATG--TAAA-------------T-TT-AC-TTTTGC--ACT--ACC-TC-T-CCA-GTCAGT--GCAA--A-TTT-G-CTC-CAC-A----TGCA--AA-TTTACTT---ACGTG--T-GC-AAA-CGCG-TT--C-A--T-GTG-CC-AT-A----TT--TG--CA--CA-CCTAA-G-TA----AA-TTT-ACATACC-T-A-TG---T-TT-TTTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111 1111 1111 11
lowQualScore : 3 3 3 44 3 3 44 3 3 3 9999 44 44 8888888888888 3 3 3 1 77 77 3 3 3 6 44 77 6 3 3 3 5 1111 55 4 444 3 33 2 2 2 2 55 55 4 2 4 2 0000 33 33 00 2 1 2 2 5555 4 2 2 6 3 3 555 6 5
lowQualScore : . . . .. . . .. . . . .... .. .. ............. . . . . .. .. . . . . .. .. . . . . . .... .. . ... . .. . . . . .. .. . . . . .... .. .. .. . . . . .... . . . . . . ... . .
lowQualScore : 3 3 3 66 3 3 66 3 1 1 6666 22 22 3333333333333 3 3 3 2 99 99 3 3 3 7 66 99 7 3 3 3 3 0000 66 7 111 2 22 4 4 4 4 66 66 7 4 7 4 6666 22 22 33 4 1 4 4 0000 7 4 4 2 1 1 888 7 0
consensus : CACA-TT-T-G--CA-T-AGCA--TG-T-AAAT-TTAC----ACAT--ATG--TAAA-------------T-TT-AC-TTTTGC--ACT--ACC-TC-T-CCA-GTCAGT--GCAA--A-TTT-G-CTC-CAC-A----TGCA--AA-TTTACTT---ACGTG--T-GC-AAA-CGCG-TT--CA--T-GTG-CC-AT-A----TT--TG--CA--CA-CCTAA-G-TA----AA-T-TT-ACATACC-T-A-TG---T-TT-TTTT
Reference ( family-932 ) : CACA-TT-T-G--CA-T-AGCA--TG-T-AAAT-TTAC----ACAT--ATG--TAAA-------------T-TT-AC-TTTTGC--ACT--ACC-TC-T-CCA-GTCAGT--GCAA--A-TTT-G-CTC-CAC-A----TGCA--AA-TTTACTT---ACGTG--T-GC-AAA-CGCG-TT--CA--T-GTG-CC-AT-A----TT--TG--CA--CA-CCTAA-G-TA----AA-T-TT-ACATACC-T-A-TG---T-TT-TTTT
gi|18361 : CACA-TT-T-G--CA-T-AGCA--TG-T-AAAT-TTAC----ACAT--ATG--TA---------------T-TT-AC-TTTTGC--ACT--ACC-TC-T-CCA-GGCAGT--GCAA--A-TTT-G-CTC-CAC-A----TGCA--AA-TTTACTT---ACGTG--T-GC-AAA-CGCG-TT--CA--T-GTG-CC-AT-A----TT--TG--CA--CA-CCGAA-G-TA----AATT-TT-ACATACC-T-A-TG---T-TT-TTTT
gi|18362 : CACA-TT-T-G--CA-T-AGCA--TG-T-AAAT-TTAC----ACA---ATG--TAAA-------------T-TT-AC-TTT-GC--ACT--ACT-CT-T-CCA-GGCAGT--GCAA--A-TTT-G-CTC-CAC-A----TGCA--AA-TTTACTT---ACGTG--T-GC-AAA--GCG-TT--CA--TGGTG-CC-AT-A----TT--TG--CAC-CA-CCGAA-G-TA----AA-T-TT-ACATACC-T-A-TG---T-TT-
gi|18363 : CACA-TT-T-G--CA-T-AGCA--TG-T-AAAT-TTAC----ACAT--ATG--TAAA-------------T-TT-AC---TTGCG-ACT--ACCTTC-T-CCA-GTCAGT--GCAA--A--TT-G-CTC-CACAA----TGCA--AA-TTTACTT---ACGCG--T-GCAAAA-CGCG-TT--CA--T-GTG-CC-AT-A----TT--TG--CA--CA-CCTAA-G-T-----AA-T-TT-ACATACC-T-A-TGGTAT-TT-TTT
gi|18364 : CACA-TT-T-G--CA-T-AGCA--TG-T-AAATCTTAC----ACAT--ATG--TAAA-------------T-TT-AC-TTTTGC--ACT--ACC-TC-T-CCA-ATCAGT--GCAA--A-TTT-G-CTC-CAC-A----TGCA--AA-TTTA-TT---A-GTT--T-GC-AAA-CGCG-TT--CA--T-GTG-CC--T-A----TT--TG--C---CA-CCTAA-G-TA----AA-T-TT-ACATAGC-T-A-TG---T-AT-TTTT
gi|18365 : CACA-TT---G--CA-T-AGCA--TG-T-AAAT-TTAC----ACAT--ATG--TAAA-------------T-TT-AC-TTTTGC--ACT--A-C-TC-T-TCA-GTCAGT--GCAAATA-TTT-A-CTC-CAC-A----TGCA--AATTTTACTT---ACGTG--T-GC-AAA-CGCG-TT---A--T-GTG-CC-ATAA----TT--TG--CA--CA-CCTAA-GTTA----AA-TGTTAACATACC-T-A-TG---TATT-TTTT
gi|18366 : CACA-TT-T-GACCA-T-AGCA--TGGT-AAAT-TTAC----ACCT--ATG--TAAA-------------T-TT-AC-TTTTGC--ATT--ACC-TC-T-CCATTTCAGTTAGTAA--A-TTT-GCCTC-CAC-AT---TGCA--AATTTTACTA---ACGTG--T-GC-AAA-CGCGTTT--CA--T-GTG-CC-AT-A----TT--TG--CAC-CA-CCTAA-G-TA----AATT-TT-ACATACCTT-A-TG---T-
gi|18367 : CACAATTGT-G--CA-T-AGCA--TG-T-AAAA-TTAC----ACAT--ATG--TAAAAGAGAGACAGGAAT-TT-AC-TTTTGC--ACTG-ACC-GC-C-TCA-GTCAGT--GCAA--AATTT-G-CCT-CAC-A----TGCA--AA-TTTAACT---ACG-GCTT-GC-AAA-CGCG-TTC-CA--T-GTG-CC-AT-A----TT--TG--CA--CA--CTAA-G-TA----AT-T-TT-ACATACC-T-ACTG---T-AT-TTTT
gi|18368 : CACA-TA-T-T--CA-TTAGCA--TG-TTAAAT-TTAC----ACAT--ATG--GTAA-------------T-TA-GCTTTTTGC--A-T--ACT-CT-T-CCA--TCAGT--GCAAT-ATTTT-G-CTC-CAC-A----TGCA--A----TACTT---AAGTG--T-GC-AAG-C----TT--CAATT-GTG-CCAAT-A----TC--TT--CT--CACCCTAA-G-TA----AA---TT-ACATA-C-T-A-TG---T-TTATTTT
gi|18369 : CAAA-TT-T-G--CA-T-AGCAATTG-T-AAAT-TTACT---ACATTAATG--TAAA-------------T-TTTAC-TATTGCCAACT--ACC-TCCT-CCA-GTCA-T--GCAA--T-TTT-G-CTC-CAC-AATCCTGCAGAAA-TATATTTTCTACGTG--T-GC-AAA-CGCG-TTCGCA--T-GTGACC-AT-GTATTTT--TG--CACTCT-CCTAA-G-TATTGTAA-T-T----ATACCGT-A-AG---T-T
gi|18370 : CACT-TT-T-G--CA-T-AGCA--TG-C-TAAT-TTAC----ACAT------------------------T-TT-GC-T-------ACT--ACC-TC-T-ACACGTCA-T--GC-A--A-TTT-G-CCT-CTC-AC---TGCA--AT-TATACGT---A-ATG--T-GC-AAA-CACG-TT--CA--T--TG-CC-AT-ATT--TT--TG--CA--CA-CCTAACG-TA---------TT-ACATACC-T-A-T
gi|18371 : ACA-TT-TTG--CAAT-AGCA--TG-T-AAAA-TTAC----AGAT--TTG--TAAA-------------T-TT-AC--TTTGC--ACT--ATC--C-T-CCA-GTCAGT--GCAA--A-TTTGG-CTCACAC-A-----GTA--AA-TTTACTT---ACGTG--TGGC-AAA-CGCG-TT--CAT-T-GTG-CCTAT-A----TTTGTG--CA--CA-CCTAA-G--A----AA-T-TT-ACATACC-TGA-TG---TATT-TCTT
gi|18372 : -AAAT-TTGCTCCTATAT--ATGAGCAAA-------------TGTT-AA-TTT-GC--ACCTAACC-TT-GACTA-G---AT--GCAA--A-TTT-A-CTT-AGCTG----TGCAG-AA-TTTGCAT---A--TA--A-GC-GAA-TCAG-TT--CA--T-ATG-AC-AA-AA---CT--TG--TA--CA-CCTAA-G-TA----AA-T-TT-ACACA
gi|18373 : -A----TGCA--AA-TTTACTT---ACGTG--T-GC-AAA--GCG-TT--CA--TGGTG-CC-AT-A----TT--TG--CAC-CA-CCGAA-G-TA----AA-T-TT-ACAT
gi|18374 : -A----TGCA--AA-TTTACTT---ACGCG--T-GC-AAAACGCG-TT--CA--T-GTG-CC-AT-A----TT--TG--CA--CA-CCTAA-G-T-----AA-T-TT-ACAT
gi|18375 : GTA--AA-CTTACT------ATA--T-G-------GCG-TT--CA--T-GTG-CC-AC-A----TT--TGACCA--TA-GCATG-G-TA----AA-T-TT-AC--ACC-T-A-TG---T-
gi|18376 : -A----TGCA--AA-TTTACTT---ACGTG--T-GC-AAA-CGCG-TT--CA--T-GTG-CC-AT-A----TT--TG--CA--CA-CCGAA-G-TA----AA-T-TT-
gi|18377 : --AA-TTTACTT-------------------TGCG-TT--CA--T-GTG-CC-AC-A----TT--TG--CA--TA-GC-AT-G-TA----AA-T-TT-ACACA---T-A-TG---T-
gi|18377 : CACA-TT-T-G--CA-T-AGCA--TG-T-AAAT-TTAC----ACAT--ATG--T