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gi|17399                      :  GTGCTGAGATT-C-ACCC----G-TAAAGGA-A-AT--GA--CTTG--CC-CG---GTA------A-C--CTC-AG-CT-GAA-CGACGTGC--CGT-GCAA-G--GG-TT-TTG-T---GC--AT--G-G-CCTAGGTGCAT-GTA-T--TA-TTA-G--ATGCATGGA-TAT
gi|17400                      :   TGC-GAG--T-C-ATTC----TCT----GG-A-AT--GAA-CTCG--CC-CG---GTA------A-CTTCT--AGTCT-GAATCA-CGGAC--CCT-GTGC-GTTGG-TT-TTG-G---GC--ATT-G-G-CCTATGTGCAT-GTA-A--CA-TTA-GTAATGCATGGA-TATtat
gi|17401                      :    GC-GAGGTTAC-ACTC----T-T----GT-ATAT---A--CTCG--CCGCGTATGTA------AAC--TT--AG-CTTGA--CG-CAGGCGTC-T-G-GT-G--GG-TT-TTT-T---GC--ATT-GCG-CCTAGGTGCAT-GTGTA--AA-TTA-G--ATGCATGGACTATta
gi|17402                      :      -GAG--C-T-ACTC----T-TT---GG-T-AT--AA--CTCG----------GTA------A-C--CT--AG-CT-GAC-CGTTAGG---TGT-GCGT-G--GG-TTCTTGCT---GC--ACATG-G-CCTAGGT-CAT-GTA-A--CA-TTAGG--ATGCATGtat
gi|17403                      :             -C-ACTC----T-T----GG-A-AT--GA--CTCG--CC-CG---ATA------A-C--CT--AA-CT-GA--CG-CAGGT--CGT-ACGC-G--GG-GT-TTG-T---GC--AC--G-G-TCTAGGTGCAT-GTA-A--CA-TTA-G--ATGCATGGA-TAT
gi|17404                      :                    ----T-T----GG-G--T--GA--CTCG--CC-CG---GTA------A-C--CT--AG-CT-GA--CG-CAGGC--AGT-CCGT-A--GG-TT-TTG-T---GC--AT--G-G-CATAGGTGCCT-GTA-A--CA-TTA-G--ATGCATGGA-TATtat


blockSeqs                     :      T   GTTA A    GATC C AAAG  T T  AT  AA    TG  G  TAT   TCTTAC A TT  GT  T  T  AT  A     GT   A    G TT  T  C   C TTT  TT  AT C T           A   T TG  T   G TA         C
blockSeqs                     :      .   ATT  .    .    . T     . .  .   A     .   .  .     .      . .   C   .  .  A   T     G    .    . .   .  .   . .    .   T  . .           .   . .   .   . .          .
blockSeqs                     :      .   T    .    .    . .     . .  .   .     .   .  .     .      . .   .   .  .  C   .     .    .    . .   .  .   . .    .   T  . .           .   . .   .   . .          .
blockSeqs                     :      .   T    .    .    . .     . .  .   .     .   .  .     .      . .   .   .  .  .   .     .    .    . .   .  .   . .    .   .  . .           .   . .   .   . .          .
blockSeqs                     :      .   T    .    .    . .     . .  .   .     .   .  .     .      . .   .   .  .  .   .     .    .    . .   .  .   . .    .   .  . .           .   . .   .   . .          .
blockSeqs                     :      .   T    .    .    . .     . .  .   .     .   .  .     .      . .   .   .  .  .   .     .    .    . .   .  .   . .    .   .  . .           .   . .   .   . .          .
blockSeqs                     :      .   T    .    .    . .     . .  .   .     .   .  .     .      . .   .   .  .  .   .     .    .    . .   .  .   . .    .   .  . .           .   . .   .   . .          .
blockSeqs                     :      .   T    .    .    . .     . .  .   .     .   .  .     .      . .   .   .  .  .   .     .    .    . .   .  .   . .    .   .  . .           .   . .   .   . .          .
blockSeqs                     :      .   T    .    .    . .     . .  .   .     .   .  .     .      . .   .   .  .  .   .     .    .    . .   .  .   . .    .   .  . .           .   . .   .   . .          .
blockSeqs                     :      .   T    .    .    . .     . .  .   .     .   .  .     .      . .   .   .  .  .   .     .    .    . .   .  .   . .    .   .  . .           .   . .   .   . .          .
blockSeqs                     :      .   T    .    .    . .     . .  .   .     .   .  .     .      . .   .   .  .  .   .     .    .    . .   .  .   . .    .   .  . .           .   . .   .   . .          .
blockSeqs                     :      .   C    .    .    . .     . .  .   .     .   .  .     .      . .   .   .  .  .   .     .    .    . .   .  .   . .    .   .  . .           .   . .   .   . .           
blockSeqs                     :      .   .    .    .    . .     . .  .   .     .   .  .     .      . .   .   .  .  .   .     .    .    . .   .  .   . .    .   .  . .           .   . .   .   . .           
blockSeqs                     :      .   .    .    .    . .     . .  .   .     .   .  .     .      . .   .   .  .  .   .     .    .    . .   .  .   . .    .   .  . .           .   . .   .   . .           
blockSeqs                     :               .    .    . .     . .  .   .     .   .  .     .      . .   .   .  .  .   .     .    .    . .   .  .   . .    .   .                                            
blockSeqs                     :                    .    . .     . .  .   .     .   .  .     .      . .   .   .  .  .   .     .    .    . .   .                                                              


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : GGTGC-GAG--T-C-ACTC----T-T----GG-A-AT--GA--CTCG--CC-CG---GTA------A-C--CT--AG-CT-GA--CG-CAGGC--CGT-GCGC-G--GG-TT-TTG-T---GC--AC--G-G-CCTAGGTGCAT-GTA-A--CA-TTA-G--ATGCATGGA-TAT
finalCons                     : GGTGC-GAG--T-C-ACTC----T-T----GG-A-AT--GA--CTCG--CC-CG---GTA------A-C--CT--AG-CT-GA--CG-CAGGC--CGT-GCGC-G--GG-TT-TTG-T---GC--AC--G-G-CCTAGGTGCAT-GTA-A--CA-TTA-G--ATGCATGGA-TAT





Alignments
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lowQualScore                  :      .   .... .    .... . ....  . .  ..  ..    ..  .  ...   ...... . ..  ..  .  .  ..  .     ..   .    . ..  .  .   . ...  ..  .. . .           .   . ..  .   . ..         .   
lowQualScore                  :      7   4444 5    0000 4 4444  4 4  22  66    22  4  111   888888 4 22  66  4  4  99  7     66   4    4 22  4  5   5 444  44  44 7 7           7   7 77  7   7 77         3   
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Reference ( family-916 )      : GGTGC-GAG--T-C-ACTC----T-T----GG-A-AT--GA--CTCG--CC-CG---GTA------A-C--CT--AG-CT-GA--CG-CAGGC--CGT-GCGC-G--GG-TT-TTG-T---GC--AC--G-G-CCTAGGTGCAT-GTA-A--CA-TTA-G--ATGCATGGA-TAT
gi|17388                      : GGTGC-GAG--T-C-ACTC----T-T----GG-A-AT--GA--CTCG--CC-CG---GTA------A-C--CT--AG-CT-GA--CG-CAGGT--CAT-GCGT-G--GG-TT-TTG-T---GC--AT--G-G-CCTAGGTGCAT-GTA-A--CA-TTA-G--ATGCACGGA-TAT
gi|17389                      : GGCAC-GAG--T-C-ACTC----T-T----GA-A-AT--GA--CTCG--CC-CG---GTA------A-C--CT--AG-CT-GA--CG-CAAGC--CGT-GCGT-G--GGTTT-TTT-T---GC--AC--G-A-CCTAGGTGCAT-GTA-A--CA-TTA-G--ATGCATGGA-TAT
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gi|17392                      : GATGC-GAG----C-ACTC----T-T----GGTA-AT---A--CTCG--CC-CG---G--------A-C--CT--AG-CT-GA--CG-CAGGC--CGT-GCGT-G--GG-TT-TAG-T---GC---C--G-GTCCTAGGTACAT-GTA-ATGCATTTA-G--ATGCATGGA-TAtat
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gi|17394                      : GGTGC-GAG--T-C-ACTC----T-T----AG-A-AC--GA--CTCG--CT-CG---GTA------A-C--CT--TG-CT-GA--C-----AC--TGT-GCAC-G--GG-TT-TTG-C---GC--AC--G-G-CCTAGATGGTT-GCG-A--CA-TTA-G--TTGCATGcat
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gi|17396                      : GGTGC-GAG--T-CAAGTC----T-T----GG-A-AT--A----TCG--CC-C----GTA------A-C--TA--AG-CT-GA---G-CAGGT--CGTAGTGCGG--GG-TT-TTG-T---GCTTAT--G-G--CTAGGTGCATAGTA-A--AC-TTA----ATGAATGGA-TAT
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gi|17399                      :  GTGCTGAGATT-C-ACCC----G-TAAAGGA-A-AT--GA--CTTG--CC-CG---GTA------A-C--CTC-AG-CT-GAA-CGACGTGC--CGT-GCAA-G--GG-TT-TTG-T---GC--AT--G-G-CCTAGGTGCAT-GTA-T--TA-TTA-G--ATGCATGGA-TAT
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gi|17401                      :    GC-GAGGTTAC-ACTC----T-T----GT-ATAT---A--CTCG--CCGCGTATGTA------AAC--TT--AG-CTTGA--CG-CAGGCGTC-T-G-GT-G--GG-TT-TTT-T---GC--ATT-GCG-CCTAGGTGCAT-GTGTA--AA-TTA-G--ATGCATGGACTATta
gi|17402                      :      -GAG--C-T-ACTC----T-TT---GG-T-AT--AA--CTCG----------GTA------A-C--CT--AG-CT-GAC-CGTTAGG---TGT-GCGT-G--GG-TTCTTGCT---GC--ACATG-G-CCTAGGT-CAT-GTA-A--CA-TTAGG--ATGCATGtat
gi|17403                      :             -C-ACTC----T-T----GG-A-AT--GA--CTCG--CC-CG---ATA------A-C--CT--AA-CT-GA--CG-CAGGT--CGT-ACGC-G--GG-GT-TTG-T---GC--AC--G-G-TCTAGGTGCAT-GTA-A--CA-TTA-G--ATGCATGGA-TAT
gi|17404                      :                    ----T-T----GG-G--T--GA--CTCG--CC-CG---GTA------A-C--CT--AG-CT-GA--CG-CAGGC--AGT-CCGT-A--GG-TT-TTG-T---GC--AT--G-G-CATAGGTGCCT-GTA-A--CA-TTA-G--ATGCATGGA-TATtat