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Reference ( gi|24638 ) : CCTGCCCAC-CTTAGAACGCGGG-GACTC---GTTCAGG----CTTGG-GTATCTATG---CT--CAC-ATA-GGCCCCCA---G--T-G-C-GTCCCCTACG---TGTGT-AGTTAAACTGG-GCT----CACT--GTTCGG---C---TCCCC-A-GTT-CC-C-CAC---A-AA-AATGTT-TCTATGTG-GC---C-ATTTACCACCAT
gi|24639 : CCTGCCCAC-CTTAGTACGCGGG-GACTC---GTTCAGG----CTTGG-GTATCTATG---CT--CAC-ATA-GTCCCCCA---G--T-G-C-GTCCCCTACG---TGTGT-AGTTAAACTGG-GCT----CACT--GGTCGG---C---TCCCC-A-GTT-CC-C-CAC---A-A
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gi|24643 : CCTGC-CTTAGAACGTGTGT-CAGT-GTTCAGA----CTTGG-ATA--TATG---CT--CA--AT-A-GGTCC--CCGT-T-A-T-GCCCGCTACGCCTTG-GTAAGTT-AACTGG-TAT-----AC--GTC-GC---C---TCCCC-C-GTT--C-C-CAC--A-AACAAAATTTTC-GTGCGAAC-ATTT-CCACCAT
gi|24644 : ctccCCTGC-CTTAGAACGTG-TTCAACT-GTTCAGGACTGCCTGG-ACACCTATG---CT--CAC-AT-AGGGTCC--CCGGTT-A-T-G-CCCCTACG---TTGGT-AGTTAAACTGG-TAT-----ACCAGTC-GC---T---TCCCC-A-GTT-CC-C-CAC--A-C--AAATTTTCC
gi|24645 : tCCTGC-CTTAGAACGTG-TTCAACT-GTTCAGG----ACTGG-ACACC-ATG---CT--CAC-AT-A-GGGTC--CCGG-T-G-TTGCCCCTCAT----TGT-T-AGTTAAACTGGTGC------ACCGGTC-C----C---TCCCC-A-GTT-CC-C-CAC--ACA--AAATTTTAC-GTGCGA-C-ATTTTCCACCATa
gi|24646 : CCTGC-CTAAGAAAGGT-TC-AACT-GTTCAGG----ATTGGAGCACCTATG---CT--CAC-AA-AAGGTCC--CAGG-TTA-T-G-CCCCTACG---TTGGT-AGTTAAAC-GG-TATAATATACCGGTC-GC---C---TCCCC-A-GTC-CC-A-CAC--A-A--AACTTGTGC--GGCGAAC-ATTTTCCACCAT
gi|24647 : C-CTTA-AACGTG-TTCAACT-GTTCAGG----ACTGG-ACACCTATG---TT--CAC-AT-A-GGGTC--CCGG-T---T-TTGCCCTACT---TTGGT-AGTTAAACTG----TA---TACTGGTC------C---TCCCCGA-ATT-CC-CACAC--A-A--AA---TTTGCGTGCGA-C-ATTTTCCACCAT
gi|24648 : -AACT-GTTCAGG----ATTGGAGCACCTATG---CT--CAC-AA-A-AGGTC--CCGG-TTA-T-GCCCCTTACG---TTGGT-AGTTAAAC--G-GTTATA-TACCGGTC-GC---C---TCCCC-A-GTT-CC-CACAC--A-A--AA--CTGTGCGTGCGA-C-ATTT-CCACCAT
gi|24649 : CGTTCAGG----CCTGG-GTACCTATG---TC--CAC-AT-A-GGGCC--CCTG-T-G-T-TTCCCTTACG---T-TTT-AGTTAAACTGA---TA---CACTGGTTAGG---CGCGTCCCC-A-GAT-CC-C-CAC--A-A--AAA---TTGTATACGACC--TTTTCCAACAT
gi|24650 : CGTTCAGG----CCTGG-GTACCTATATGTCC--CACAATAA-GGCCCCACCTG-T-GTT-GTCCCCTAC----T-TGT-AGTTAAACTG----T----AATTGGGT-GGCCCC---TCCGC-A-GTT-TCGC-CACAAA-A--AAAATGTTAT-TGCGACC--TT--CCACCA
gi|24651 : TTGG-GTATCTATG---TT--GAC-AT-T-GGCCC--CCGG-T-G-T-GTCCACTATA---TGGTT-AGTTAAACTGG-GCA----TACC--------------------------CC-C-GAT--A---------TTTCTATGTGGCC---TTATCACCAT
gi|24652 : g-AGTTAAACTGGAGC------ACTGGGC-GA---C---TCCCC-A-GGTACC-C-CAC--A-A--CAATTCATC-ATGCGGCCGATT
blockSeqs : G T TGT C ACTG A TGT TT A A G CA T T T T CCT GT A TATAATAT T A GCCC GCG G C A G A AA C AC AT T C GA A
blockSeqs : G . TTC C . A . . . . A . . T . . . GT . GTTATAT T . G . . . . . A . T . AT T C A A
blockSeqs : G . TTC C . . . . . . . . . . . . . GT . ACTC T . G . . . . . . . C . TT T C A A
blockSeqs : . . TTC C . . . . . . . . . . . . . GA . GCTC C . G . . . . . . . . . AA T C A A
blockSeqs : . . GT C . . . . . . . . . . . . . GT . GCTC T . G . . . . . . . . . TT T C A A
blockSeqs : . GG C . . . . . . . . . . . . . GT . ACAC T . G . . . . . . . . . AA C A A T
blockSeqs : . GG C . . . . . . . . . . . . . TG . ACTC C . G . . . . . . . . . AT C A A T
blockSeqs : . GG C . . . . . . . . . . . . . GT . GCTC C . C . . . . . . . . . AT T C A T
blockSeqs : . GG . . . . . . . . . . . . . . TG . GCAT C . C . . . . . . . . . CT T C A T
blockSeqs : . AG . . . . . . . . . . . . . . TG . TAT T . C . . . . . . . . . AA T C . A
blockSeqs : . TC . . . . . . . . . . . . . . TG . TAT C . C . . . . . . . . . AT . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . GG . TGC T . G . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . TAT T . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . TAC C . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . AGC T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . TA . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : **
originalCons : CCTGCCCGC-CTTAGAACGCG-GN-AACTCGTTCAGG----CTTGG-GTACCTATG---CT--CAC-AT-A-GGCCC--CCGG-T-G-T-GTCCCCTACG---TGTGT-AGTTAAACTGG-GCT----CACCGGTC-GG---C---TCCCC-A-GTT-CC-C-CAC--A-A--AAATTTTTCTATGCGACC-ATTTACCACCAT
finalCons : CCTGCCCGC-CTTAGAACGCG-GN-AACTCGTTCAGG----CTTGG-GTACCTATG---CT--CAC-AT-A-GGCCC--CCGG-T-G-T-GTCCCCTACG---TGTGT-AGTTAAACTGG-GCT----CACCGGTC-GG---C---TCCCC-A-GTT-CC-C-CAC--A-A--AAATTTTTCTATGCGACC-ATTTACCACCAT
Alignments
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consensus : CCTGCCCGC-CTTAGAACGCG-GN-AACTCGTTCAGG----CTTGG-GTACCTATG---CT--CAC-AT-A-GGCCC--CCGG-T-G-T-GTCCCCTACG---TGTGT-AGTTAAACTGG-GCT----CACCGGTC-GG---C---TCCCC-A-GTT-CC-C-CAC--A-A--AAATTTTTCTATGCGACC-ATTTACCACCAT
Reference ( family-915 ) : CCTGCCCGC-CTTAGAACGCG-GN-AACTCGTTCAGG----CTTGG-GTACCTATG---CT--CAC-AT-A-GGCCC--CCGG-T-G-T-GTCCCCTACG---TGTGT-AGTTAAACTGG-GCT----CACCGGTC-GG---C---TCCCC-A-GTT-CC-C-CAC--A-A--AAATTTTTCTATGCGACC-ATTTACCACCAT
gi|24636 : CCT-CCCAC-CTTAGAACGCG-GT-AACTCGTTCAG-----TTTGG-GTACCTATG---CTTTCGC-AT-A-GGCCC--CCGG-T-G-T-GTTCCCTACG---TGTGT-AGTTAAACTGA-ACT----CACTGGTC-GG---C---TCCCC-A-GTT-CC-C-C-C--ACA--AAATTTTTCTATGCGACT-A-TTACCACCAT
gi|24637 : CCT-CCCAC-CTTAGAACGCG-GT-AACTCGTTCAG-----TTTGG-GTACCTATG---CTTTCGC-AT-A-GGCCC--CCGG-T-G-T-GTTCCCTACG---TGTGT-AGTTAAACTGA-ACT----CACTGGTC-GG---C---TCCCC-A-GTT-CC-C-C-C--ACA--AAATTTTTCTATGCGACT-A-TTACCACCAT
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gi|24640 : CCAC-CTTAGAACGCG-GG-CACTCGTTCAGG----CTAGG-GTATCTATG---CT--CAT-AC-A-GACCC--CAGG-T-G-C-GTCCCCTACA---TGATT-GGTTAAATTGG-ACA----CTTCGGTC-GG---C---TCCCC-ACCTC-CC-C-CAC--ATA--ATTTTTTTCTATGCGACC--TTTACCACCAT
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