lowQualScore : 1111 2
lowQualScore : 2 2 5 2 2 33 33 22 2 1111 0 2 2 777777 2 55 666666 2 22 55555 33 7 2 33 5 2 55 7 33 2 0 8888888 2 33 444 66 2 2 6 6 3
lowQualScore : . . . . . .. .. .. . .... . . . ...... . .. ...... . .. ..... .. . . .. . . .. . .. . . ....... . .. ... .. . . . . .
lowQualScore : 5 5 0 5 5 44 44 66 5 2222 0 5 5 222222 5 99 888888 5 88 00000 44 5 5 44 0 5 99 5 44 5 1 1111111 5 44 777 33 7 7 7 2 3
consensus : CCAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTAAAACA-ACA-C----AAAT-T-CT------T-CCAA--CAA-TA--CAC-CAAA-TGAT-A---TA--TT-GAG-T--AG-A-T--A-TA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAAT--AAAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGANTTTC-AATGAT-TATA
Reference ( gi|102357 ) : CCAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTAAAACA-ACA-C----AA-T-T-CT------T-CCAA--CAA-TA--CAC-CAAA-TGAT-A---TA--TT-GAG-T--AG-A-T--A-TA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAAT--AAAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGAATTTC-AATGAT-TATA
gi|102354 : CCAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTAAAACA-ACA-C----AAAT-T-CT------T-CCAA--CAA-TA--CAC-CAAA-TAAT-A---TA--TT-GAG-T--AG-A-TT-A-TA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAAT--AAAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGAATTTC-AATGAT-TATA
gi|102355 : CCAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTAAAACA-ACA-CA---AA-T-T-CT------T-CCAA--CAA-TA--CAC-CAAA-TAAT-A---TA---T-GAG-T--AG-A-T--A-TA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAAT--AAAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGAATTTC-AATGAT-TATA
gi|102358 : CCAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTAAAACA-ACA-C----AAAT-T-CT------T-CCAA--CAA-TA--CAC-CAAA-TGAT-A---TA--TT-GAG-T--AG-A-T--A-TA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAAT--AAAATCCA---A--TG-GCT-TCTAAGAATTTC-AATGAT-AATA
gi|102356 : CCAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTAAAACA-ACA-C----AAAT-T-CT------T-CCAAA-CAA-TA--CAC-CAAA-TAAT-----TA--TT-GAG-T--AG-A-T--ATTA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAAT--AAAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGAATTTC-AATGAT-TATA
gi|102359 : CCAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTGAAACA-ACA-CGTCAAA-T-T-CT------T-CGAA--CAA-CA--CAT-CAAA-GGAT-T---TA--TT-GTG-T--AG-A-T--A-CA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAGT--AAAAGACAATCA--TG-GCT-TCTAAGATTTT
gi|102362 : CCAAGT-T-A-T-CG-ATA--G--CTAAAACATACAAC----AA-T-T-CT------T-CCAA--CAA-CA--CAT-CAA--TGAT-G---TA--TTCGAG-TTAGG-A-T--A-TACAGC-CTTTGTTT-------GT-CAAAAT--AAAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGA--TTC-AATGAT-TATA
gi|102361 : CCAA-T-TTA-T-CGGATA--G--CTAAAACA-A-A-CCA--AA-T-T-CT------T-CCAAAACAA-T---CAC-CAAAATGAC-A---TA--TT-GAG-T--AG-ATT--A-T---AC-CTTTGTTT-------GT-AAATAC--AACAGACA---A--TG-GCT-T-TAAGATTTTCAAATGAT-TATA
gi|102360 : CCAA-T-TTA-T-CGGATA--GACCTAAAACA-ACC-C----AAAT-T-CT------TTCCAA--CAAATA--CAC--AAA-TGA--A---TA--TT-GAG-T--A--A-T--A-TT--AC-CTTTGTTT-------GTTACAAAT--AAAAGACA---AGGCG-GCTGTCTAAGATTTTC-AATGAT-
gi|102363 : CCTA-T-T-AAT-CAGATA--G--CTAAAGCA--CA-C----AAAT-T-CT------T-CCA---CAG-CA--CAT-CAA--TGAT-A---TA--TT-GAG-T--CG-A-T--A-TA--TA-CTTTGTTT-------GT-ACAAGT--AAGA-ACA---A--TG-G-T-TCTAAGATTTTCAAATGGT-
gi|102364 : CCAA-T-T-A-T-CGGATA------CAAAACA-ACA-C----AAAT-T-CT------T-CCAA--CAAACA--CAT-CAAA-TGAG-A----A--T--GA--T--AGTA-T--A-TA--AC-CTTTG-------------ACAAGTTTAAAAGACA---AT-TG-GCT-TCT-AGATTTTC-AATGGT-
gi|102365 : CTAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTGAAATA-ACA-T----AAAT-T-AT------T-CCAA--CA----------------------------TT-GAA-T--AG-A-T--A-TA--AC-CTTT---T--------C-ACAAGT--AAAATACA---A--TG-GCT-TCTAAACTTTTC-AATGGT-
gi|102366 : CCAA-T-T-A-T-CGGATATAG--CTAAAACA-ACA-T----GA-CGC-CC------T-CCAA--CAA-CA--CCT-CAAA-TGAC-A---T------GAG-T--AG-A-TGTA-TA--AC-CTTTGTTT-------TT-ACGAGT--AA
gi|102367 : CCAA-TGT-A-TACGAGTA--G---TAAAACA--CA-C----AA-T-T-CCGCGATGT-TCAA--CA--TAGCCAC-CAAA-TGAT-AATATAATTTAGAGAT--AGGA-T--ACTA--ACACTATGTGTCTATGACGT-ACAAAT--CTAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGGATTTC-AATGATATAT
gi|102368 : CAA-T-G-A-T-TGCATA--A--CTACAACA-ACA-A----AAAT-T-AG------T-CCAA--CA------CAT-TAAA-GGAC-A---CA--TT-GTG-T--AG-A-T--A-TA--AC-CT--------------T-ACAAAT--AAAACACA---A--TC-CTT-TCTA
gi|102369 : AA-T-T-A-T-CGGATT--G--CTAAAACA-CCA-C----AA-T-TTCT------T-CCAA--CAA-TA--CAC-CAAA-TGAT-A---TA--TT-GAG-T--AG-A-T--A-TA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAAT--AAAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGAATTTC-AATGAT-TATA
gi|102370 : -T-T-A-T-TCGATA--G--CTAAA-CA-CCA-C----AA-T-T-CT------T-CCAA--CAA-TC--AACTCAAT-TGATAA---TG--TTCGAG-T---G-A-T--ATTA--AC-CTTTG-TT-------GT-A-AAGT--AAAAG-CA---A--TGTGC--TCTAAG-GTTTC-A
Alignments
lowQualScore : 2 2 4 2 2 33 33 2 444 2 666666 2 55 2 22 33 2 2 44444 33 7 2 33 4 55 7 55 2 7777777 2 33 444 55 2 2 3 5
lowQualScore : . . . . . .. .. . ... . ...... . .. . .. .. . . ..... .. . . .. . .. . .. . ....... . .. ... .. . . . .
lowQualScore : 4 4 7 4 4 22 22 4 111 6 888888 4 66 4 99 22 4 4 22222 22 1 4 22 7 66 1 66 4 6666666 4 22 444 99 5 5 6 7
consensus : CCAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTAAAACA-ACAC---AAATTCT------T-CCAA--C-AA-TA--CAC-CAAA-TGAT-A---TA--TT-GAG-T--AG-A--TA-TA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAA--TAAAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGANTTTC-AATGATTATA
Reference ( family-914 ) : CCAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTAAAACA-ACAC---AAATTCT------T-CCAA--C-AA-TA--CAC-CAAA-TGAT-A---TA--TT-GAG-T--AG-A--TA-TA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAA--TAAAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGANTTTC-AATGATTATA
gi|102354 : CCAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTAAAACA-ACAC---AAATTCT------T-CCAA--C-AA-TA--CAC-CAAA-TAAT-A---TA--TT-GAG-T--AG-AT-TA-TA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAA--TAAAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGAATTTC-AATGATTATA
gi|102355 : CCAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTAAAACA-ACAC---AAATTCT------T-CCAA--C-AA-TA--CAC-CAAA-TAAT-A---TA--T--GAG-T--AG-A--TA-TA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAA--TAAAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGAATTTC-AATGATTATA
gi|102356 : CCAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTAAAACA-ACAC---AAATTCT------T-CCAAA-C-AA-TA--CAC-CAAA-TAAT-----TA--TT-GAG-T--AG-A--TATTA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAA--TAAAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGAATTTC-AATGATTATA
gi|102357 : CCAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTAAAACA-ACAC---AA-TTCT------T-CCAA--C-AA-TA--CAC-CAAA-TGAT-A---TA--TT-GAG-T--AG-A--TA-TA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAA--TAAAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGAATTTC-AATGATTATA
gi|102358 : CCAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTAAAACA-ACAC---AAATTCT------T-CCAA--C-AA-TA--CAC-CAAA-TGAT-A---TA--TT-GAG-T--AG-A--TA-TA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAA--TAAAATCCA---A--TG-GCT-TCTAAGAATTTC-AATGATAATA
gi|102359 : CCAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTGAAACA-ACACGTCAAATTCT------T-CGAA--C-AA-CA--CAT-CAAA-GGAT-T---TA--TT-GTG-T--AG-A--TA-CA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAG--TAAAAGACAATCA--TG-GCT-TCTAAGATTTT
gi|102360 : CCAA-T-TTA-T-CGGATA--GACCTAAAACA-ACCC---AAATTCT------TTCCAA--C-AAATA--CAC--AAA-TGA--A---TA--TT-GAG-T--A--A--TA-TT--AC-CTTTGTTT-------GTTACAAA--TAAAAGACA---AGGCG-GCTGTCTAAGATTTTC-AATGATT
gi|102361 : CCAA-T-TTA-T-CGGATA--G--CTAAAACA-AACC---AAATTCT------T-CCAAAAC-AA-T---CAC-CAAAATGAC-A---TA--TT-GAG-T--AG-A--T--TAT-AC-CTTTGTTT-------GT-AAATA--CAACAGACA---A--TG-GCT-T-TAAGATTTTCAAATGATTATA
gi|102362 : CCAAGT-T-A-T-CG-ATA--G--CTAAAACATACAA---CAATTCT------T-CCAA--C-AA-CA--CAT-CAA--TGAT-G---TA--TTCGAG-TTAGG-A--TA-TACAGC-CTTTGTTT-------GT-CAAAA--TAAAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGA--TTC-AATGATTATA
gi|102363 : CCTA-T-T-AAT-CAGATA--G--CTAAAGCA--CAC---AAATTCT------T-CCA---C-AG-CA--CAT-CAA--TGAT-A---TA--TT-GAG-T--CG-A--TA-TA--TA-CTTTGTTT-------GT-ACAAG--TAAGA-ACA---A--TG-G-T-TCTAAGATTTTCAAATGGTT
gi|102364 : CCAA-T-T-A-T-CGGATA------CAAAACA-ACAC---AAATTCT------T-CCAA--CAAA-CA--CAT-CAAA-TGAG-A----A---T-GA--T--AGTA--TA-TA--AC-CTTTG-------------ACAAGTTTAAAAGACA---AT-TG-GCT-TCT-AGATTTTC-AATGGTT
gi|102365 : CTAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTGAAATA-ACAT---AAATTAT------T-CCAA--C-A----------------------------TT-GAA-T--AG-A--TA-TA--AC-CTTT---T--------C-ACAAG--TAAAATACA---A--TG-GCT-TCTAAACTTTTC-AATGGTT
gi|102366 : CCAA-T-T-A-T-CGGATATAG--CTAAAACA-ACAT---GACGCCC------T-CCAA--C-AA-CA--CCT-CAAA-TGAC-A--------T-GAG-T--AG-ATGTA-TA--AC-CTTTGTTT-------TT-ACGAG--TAA
gi|102367 : CCAA-TGT-A-TACGAGTA--G---TAAAACA--CAC---AA-TTCCGCGATGT-TCAA--C-A--TAGCCAC-CAAA-TGAT-AATATAATTTAGAGAT--AGGA--TACTA--ACACTATGTGTCTATGACGT-ACAAA--TCTAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGGATTTC-AATGA-TATA
gi|102368 : CAA-T-G-A-T-TGCATA--A--CTACAACA-ACAA---AAATTAG------T-CCAA--C-A------CAT-TAAA-GGAC-A---CA--TT-GTG-T--AG-A--TA-TA--AC-CT--------------T-ACAAA--TAAAACACA---A--TC-CTT-TCTAt
gi|102369 : AA-T-T-A-T-CGGATT--G--CTAAAACA-CCAC---AATTTCT------T-CCAA--C-AA-TA--CAC-CAAA-TGAT-A---TA--TT-GAG-T--AG-A--TA-TA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAA--TAAAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGAATTTC-AATGATTATA
gi|102370 : -T-T-A-T-TCGATA--G--CTAAA-CA-CCAC---AA-TTCT------T-CCAA--C-AA-TC--AACTCAAT-TGATAA---TG--TTCGAG-T---G-A--TATTA--AC-CTTTG-TT-------GT-A-AAG--TAAAAG-CA---A--TGTGC--TCTAAG-GTTTC-
Alignments
lowQualScore : 2 2 4 2 2 33 33 2 444 2 666666 2 55 2 22 33 2 2 44444 33 7 2 33 4 55 7 55 2 7777777 2 33 444 55 2 2 3 5
lowQualScore : . . . . . .. .. . ... . ...... . .. . .. .. . . ..... .. . . .. . .. . .. . ....... . .. ... .. . . . .
lowQualScore : 4 4 7 4 4 22 22 4 111 6 888888 4 66 4 99 22 4 4 22222 22 1 4 22 7 66 1 66 4 6666666 4 22 444 99 5 5 6 7
consensus : CCAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTAAAACA-ACAC---AAATTCT------T-CCAA--C-AA-TA--CAC-CAAA-TGAT-A---TA--TT-GAG-T--AG-A--TA-TA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAA--TAAAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGANTTTC-AATGATTATA
Reference ( family-914 ) : CCAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTAAAACA-ACAC---AAATTCT------T-CCAA--C-AA-TA--CAC-CAAA-TGAT-A---TA--TT-GAG-T--AG-A--TA-TA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAA--TAAAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGANTTTC-AATGATTATA
gi|102354 : CCAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTAAAACA-ACAC---AAATTCT------T-CCAA--C-AA-TA--CAC-CAAA-TAAT-A---TA--TT-GAG-T--AG-AT-TA-TA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAA--TAAAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGAATTTC-AATGATTATA
gi|102355 : CCAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTAAAACA-ACAC---AAATTCT------T-CCAA--C-AA-TA--CAC-CAAA-TAAT-A---TA--T--GAG-T--AG-A--TA-TA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAA--TAAAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGAATTTC-AATGATTATA
gi|102356 : CCAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTAAAACA-ACAC---AAATTCT------T-CCAAA-C-AA-TA--CAC-CAAA-TAAT-----TA--TT-GAG-T--AG-A--TATTA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAA--TAAAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGAATTTC-AATGATTATA
gi|102357 : CCAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTAAAACA-ACAC---AA-TTCT------T-CCAA--C-AA-TA--CAC-CAAA-TGAT-A---TA--TT-GAG-T--AG-A--TA-TA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAA--TAAAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGAATTTC-AATGATTATA
gi|102358 : CCAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTAAAACA-ACAC---AAATTCT------T-CCAA--C-AA-TA--CAC-CAAA-TGAT-A---TA--TT-GAG-T--AG-A--TA-TA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAA--TAAAATCCA---A--TG-GCT-TCTAAGAATTTC-AATGATAATA
gi|102359 : CCAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTGAAACA-ACACGTCAAATTCT------T-CGAA--C-AA-CA--CAT-CAAA-GGAT-T---TA--TT-GTG-T--AG-A--TA-CA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAG--TAAAAGACAATCA--TG-GCT-TCTAAGATTTT
gi|102360 : CCAA-T-TTA-T-CGGATA--GACCTAAAACA-ACCC---AAATTCT------TTCCAA--C-AAATA--CAC--AAA-TGA--A---TA--TT-GAG-T--A--A--TA-TT--AC-CTTTGTTT-------GTTACAAA--TAAAAGACA---AGGCG-GCTGTCTAAGATTTTC-AATGATT
gi|102361 : CCAA-T-TTA-T-CGGATA--G--CTAAAACA-AACC---AAATTCT------T-CCAAAAC-AA-T---CAC-CAAAATGAC-A---TA--TT-GAG-T--AG-A--T--TAT-AC-CTTTGTTT-------GT-AAATA--CAACAGACA---A--TG-GCT-T-TAAGATTTTCAAATGATTATA
gi|102362 : CCAAGT-T-A-T-CG-ATA--G--CTAAAACATACAA---CAATTCT------T-CCAA--C-AA-CA--CAT-CAA--TGAT-G---TA--TTCGAG-TTAGG-A--TA-TACAGC-CTTTGTTT-------GT-CAAAA--TAAAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGA--TTC-AATGATTATA
gi|102363 : CCTA-T-T-AAT-CAGATA--G--CTAAAGCA--CAC---AAATTCT------T-CCA---C-AG-CA--CAT-CAA--TGAT-A---TA--TT-GAG-T--CG-A--TA-TA--TA-CTTTGTTT-------GT-ACAAG--TAAGA-ACA---A--TG-G-T-TCTAAGATTTTCAAATGGTT
gi|102364 : CCAA-T-T-A-T-CGGATA------CAAAACA-ACAC---AAATTCT------T-CCAA--CAAA-CA--CAT-CAAA-TGAG-A----A---T-GA--T--AGTA--TA-TA--AC-CTTTG-------------ACAAGTTTAAAAGACA---AT-TG-GCT-TCT-AGATTTTC-AATGGTT
gi|102365 : CTAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTGAAATA-ACAT---AAATTAT------T-CCAA--C-A----------------------------TT-GAA-T--AG-A--TA-TA--AC-CTTT---T--------C-ACAAG--TAAAATACA---A--TG-GCT-TCTAAACTTTTC-AATGGTT
gi|102366 : CCAA-T-T-A-T-CGGATATAG--CTAAAACA-ACAT---GACGCCC------T-CCAA--C-AA-CA--CCT-CAAA-TGAC-A--------T-GAG-T--AG-ATGTA-TA--AC-CTTTGTTT-------TT-ACGAG--TAA
gi|102367 : CCAA-TGT-A-TACGAGTA--G---TAAAACA--CAC---AA-TTCCGCGATGT-TCAA--C-A--TAGCCAC-CAAA-TGAT-AATATAATTTAGAGAT--AGGA--TACTA--ACACTATGTGTCTATGACGT-ACAAA--TCTAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGGATTTC-AATGA-TATA
gi|102368 : CAA-T-G-A-T-TGCATA--A--CTACAACA-ACAA---AAATTAG------T-CCAA--C-A------CAT-TAAA-GGAC-A---CA--TT-GTG-T--AG-A--TA-TA--AC-CT--------------T-ACAAA--TAAAACACA---A--TC-CTT-TCTAt
gi|102369 : AA-T-T-A-T-CGGATT--G--CTAAAACA-CCAC---AATTTCT------T-CCAA--C-AA-TA--CAC-CAAA-TGAT-A---TA--TT-GAG-T--AG-A--TA-TA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAA--TAAAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGAATTTC-AATGATTATA
gi|102370 : -T-T-A-T-TCGATA--G--CTAAA-CA-CCAC---AA-TTCT------T-CCAA--C-AA-TC--AACTCAAT-TGATAA---TG--TTCGAG-T---G-A--TATTA--AC-CTTTG-TT-------GT-A-AAG--TAAAAG-CA---A--TGTGC--TCTAAG-GTTTC-
blockSeqs : G G T A A TA AC T GTC A GCGATG T AA A AA GC T A AATA AT C A TA T TG T CA A CTATGAC T TT ATC GG T G A A
blockSeqs : . . T . . . . . . A . . A . A . . . AA . A . . G . C T . . . . . T . . A A
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . A . . . A . C . . . . T . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . A . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . A . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . A . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . A . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . A . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . G . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . A . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . C . . . . A . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . A . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . T . . . . A . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . G .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : **
originalCons : CCAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTAAAACA-ACAC---AAATTCT------T-CCAA--C-AA-TA--CAC-CAAA-TGAT-A---TA--TT-GAG-T--AG-A--TA-TA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAA--TAAAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGANTTTC-AATGATTATA
finalCons : CCAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTAAAACA-ACAC---AAATTCT------T-CCAA--C-AA-TA--CAC-CAAA-TGAT-A---TA--TT-GAG-T--AG-A--TA-TA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAA--TAAAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGANTTTC-AATGATTATA
Alignments
lowQualScore : 2 2 4 2 2 33 33 2 444 2 666666 2 55 2 22 33 2 2 44444 33 7 2 33 4 55 7 55 2 7777777 2 33 444 55 2 2 3 5
lowQualScore : . . . . . .. .. . ... . ...... . .. . .. .. . . ..... .. . . .. . .. . .. . ....... . .. ... .. . . . .
lowQualScore : 4 4 7 4 4 22 22 4 111 6 888888 4 66 4 99 22 4 4 22222 22 1 4 22 7 66 1 66 4 6666666 4 22 444 99 5 5 6 7
consensus : CCAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTAAAACA-ACAC---AAATTCT------T-CCAA--C-AA-TA--CAC-CAAA-TGAT-A---TA--TT-GAG-T--AG-A--TA-TA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAA--TAAAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGANTTTC-AATGATTATA
Reference ( family-914 ) : CCAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTAAAACA-ACAC---AAATTCT------T-CCAA--C-AA-TA--CAC-CAAA-TGAT-A---TA--TT-GAG-T--AG-A--TA-TA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAA--TAAAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGANTTTC-AATGATTATA
gi|102354 : CCAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTAAAACA-ACAC---AAATTCT------T-CCAA--C-AA-TA--CAC-CAAA-TAAT-A---TA--TT-GAG-T--AG-AT-TA-TA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAA--TAAAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGAATTTC-AATGATTATA
gi|102355 : CCAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTAAAACA-ACAC---AAATTCT------T-CCAA--C-AA-TA--CAC-CAAA-TAAT-A---TA--T--GAG-T--AG-A--TA-TA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAA--TAAAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGAATTTC-AATGATTATA
gi|102356 : CCAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTAAAACA-ACAC---AAATTCT------T-CCAAA-C-AA-TA--CAC-CAAA-TAAT-----TA--TT-GAG-T--AG-A--TATTA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAA--TAAAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGAATTTC-AATGATTATA
gi|102357 : CCAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTAAAACA-ACAC---AA-TTCT------T-CCAA--C-AA-TA--CAC-CAAA-TGAT-A---TA--TT-GAG-T--AG-A--TA-TA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAA--TAAAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGAATTTC-AATGATTATA
gi|102358 : CCAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTAAAACA-ACAC---AAATTCT------T-CCAA--C-AA-TA--CAC-CAAA-TGAT-A---TA--TT-GAG-T--AG-A--TA-TA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAA--TAAAATCCA---A--TG-GCT-TCTAAGAATTTC-AATGATAATA
gi|102359 : CCAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTGAAACA-ACACGTCAAATTCT------T-CGAA--C-AA-CA--CAT-CAAA-GGAT-T---TA--TT-GTG-T--AG-A--TA-CA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAG--TAAAAGACAATCA--TG-GCT-TCTAAGATTTT
gi|102360 : CCAA-T-TTA-T-CGGATA--GACCTAAAACA-ACCC---AAATTCT------TTCCAA--C-AAATA--CAC--AAA-TGA--A---TA--TT-GAG-T--A--A--TA-TT--AC-CTTTGTTT-------GTTACAAA--TAAAAGACA---AGGCG-GCTGTCTAAGATTTTC-AATGATT
gi|102361 : CCAA-T-TTA-T-CGGATA--G--CTAAAACA-AACC---AAATTCT------T-CCAAAAC-AA-T---CAC-CAAAATGAC-A---TA--TT-GAG-T--AG-A--T--TAT-AC-CTTTGTTT-------GT-AAATA--CAACAGACA---A--TG-GCT-T-TAAGATTTTCAAATGATTATA
gi|102362 : CCAAGT-T-A-T-CG-ATA--G--CTAAAACATACAA---CAATTCT------T-CCAA--C-AA-CA--CAT-CAA--TGAT-G---TA--TTCGAG-TTAGG-A--TA-TACAGC-CTTTGTTT-------GT-CAAAA--TAAAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGA--TTC-AATGATTATA
gi|102363 : CCTA-T-T-AAT-CAGATA--G--CTAAAGCA--CAC---AAATTCT------T-CCA---C-AG-CA--CAT-CAA--TGAT-A---TA--TT-GAG-T--CG-A--TA-TA--TA-CTTTGTTT-------GT-ACAAG--TAAGA-ACA---A--TG-G-T-TCTAAGATTTTCAAATGGTT
gi|102364 : CCAA-T-T-A-T-CGGATA------CAAAACA-ACAC---AAATTCT------T-CCAA--CAAA-CA--CAT-CAAA-TGAG-A----A---T-GA--T--AGTA--TA-TA--AC-CTTTG-------------ACAAGTTTAAAAGACA---AT-TG-GCT-TCT-AGATTTTC-AATGGTT
gi|102365 : CTAA-T-T-A-T-CGGATA--G--CTGAAATA-ACAT---AAATTAT------T-CCAA--C-A----------------------------TT-GAA-T--AG-A--TA-TA--AC-CTTT---T--------C-ACAAG--TAAAATACA---A--TG-GCT-TCTAAACTTTTC-AATGGTT
gi|102366 : CCAA-T-T-A-T-CGGATATAG--CTAAAACA-ACAT---GACGCCC------T-CCAA--C-AA-CA--CCT-CAAA-TGAC-A--------T-GAG-T--AG-ATGTA-TA--AC-CTTTGTTT-------TT-ACGAG--TAA
gi|102367 : CCAA-TGT-A-TACGAGTA--G---TAAAACA--CAC---AA-TTCCGCGATGT-TCAA--C-A--TAGCCAC-CAAA-TGAT-AATATAATTTAGAGAT--AGGA--TACTA--ACACTATGTGTCTATGACGT-ACAAA--TCTAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGGATTTC-AATGA-TATA
gi|102368 : CAA-T-G-A-T-TGCATA--A--CTACAACA-ACAA---AAATTAG------T-CCAA--C-A------CAT-TAAA-GGAC-A---CA--TT-GTG-T--AG-A--TA-TA--AC-CT--------------T-ACAAA--TAAAACACA---A--TC-CTT-TCTAt
gi|102369 : AA-T-T-A-T-CGGATT--G--CTAAAACA-CCAC---AATTTCT------T-CCAA--C-AA-TA--CAC-CAAA-TGAT-A---TA--TT-GAG-T--AG-A--TA-TA--AC-CTTTGTTT-------GT-ACAAA--TAAAAGACA---A--TG-GCT-TCTAAGAATTTC-AATGATTATA
gi|102370 : -T-T-A-T-TCGATA--G--CTAAA-CA-CCAC---AA-TTCT------T-CCAA--C-AA-TC--AACTCAAT-TGATAA---TG--TTCGAG-T---G-A--TATTA--AC-CTTTG-TT-------GT-A-AAG--TAAAAG-CA---A--TGTGC--TCTAAG-GTTTC-