lowQualScore                  :                      99999999999999999999999999999999999999999                                                     33333333                                                  222               
lowQualScore                  :      5      3        88888888888888888888888888888888888888888 5  2 444    66666 33  2 5     99999   5555   333    22222222   4     2  4  2  22   777         7777777    333 000               
lowQualScore                  :      .      .        ......................................... .  . ...    ..... ..  . .     .....   ....   ...    ........   .     .  .  .  ..   ...         .......    ... ...               
lowQualScore                  :      7      1        66666666666666666666666666666666666666666 3  7 777    22222 44  5 0     44444   3333   555    99999999   7     4  7  4  88   222         6666666    888 000               
consensus                     : TTCTT-CGTCTGNTCCGCCATA-C--T----T-------G----------A---------TCT-CG-G---AGGT-----G--GA-T-CTAATA----AAA----AAA--AAAAAC---AA--TGA-CAATC-AG-TG-GG-GAAA-A-GTAGTTGTT-------CAAC--AT--CGAACTCGAACCATTC
Reference ( gi|10187 )        : TTCTT-CGTCTAATCCGCCATAAC--T----T-------G----------A---------T-T-CG-G---AGGT-----G--GA-T-CTAATA----AAA----AAA--AAAAAC---AA-TTGA-CAATC-AG-TG-GG-GAAA-A-GTAGTTGTT-------CAAC--AT--CGAACTCGAACCATTC
gi|10188                      : TTCTTTCGTCTAATCCGCCATAAC--T----T-------G----------A---------TGT-CG-G---AGGT-----G--GA-TGCTAATA----AAA----AAA--AAAAAC---AAATTGAGCAATCCAGCTG-GGCGAAA-A-GTAGTTGTT-------CAAC--AT--CGAACTCGAACCATTC
gi|10189                      : TTCTTTCGTCTAATCCGCCAT-----T----T-------GG---------A---------TCT-CG-G---AGGT-----G---A-TGCTAATT----TAA----AAA--AAAAAC---AA-TTGA-CAATC-AGCTG-GG-GAAA-A-GTAGTTGTT-------CAAC--AT--CGAACTCGAACCATTC
gi|10192                      : TTCTT-CGTCTAATCCGCCATA----T----T-------G----------A---------TCT-TG-G---ATAT-----A--CA-T-GTAATA----AAA----TAA--AAATAA---AA-ATGA-CAATC-AG-TG-GG-GAAA-A-GTAGTTGTT-------CAAC--AT---GAACTCGAACCATTC
gi|10190                      : TTCTT-CTCCTAATCCGCCATAA---T----T-------G----------A---------TCT-CG-G---AGGT-----G--GA-T-CTAACATTTT------------AAAAAC---AA-TTGACCAATC-AG-TG-GG-GAAA-A-GTAGTTGTT-------CAAC--ATAAC-AACTCGAACCATTC
gi|10191                      : TTCTT-CGTCTAATCCGCCATA----T----T-------G----------A---------T-TTCG-G---AGGT-----G--GA-T-CTAAAA----AAA----AAC--CAAACC---AA-ATAA-CAATC-GG-T--GG-GATA-A-GTAGTTGTT-------CAAC--AT---GAACTCGAACCATT
gi|10193                      : TTCTT-CGTCTAATCCGCCATA----T----T-------G----------AT--------T-T-CG-G---TGTT-----G--GA-T-C---TA----AAA----AAA--AAATACCCTAA--TGA-CAATC-AG-T--GG-GAAA-A-GTAGTTGTT-------CAAC--AT---GAACTCGAACCATTC
gi|10195                      : TTCTT-CGTCTGCTTCACCATA-C--T----T-------GTTATCACGATA---------TCT-CG-G---AGGT-----G--GA-T-CTAAT-----AAA----AAA--AAAAAC---AA-ATGG-CAATC-GA-TGTGG-AAAA-A-GTAGTTGTT-------CAGC--AT---GAAATCAAACCATTC
gi|10194                      : TTCTT-CGTCTGCACCGCTATGGT--TGTTATCGCGG--G----------A---------TCT-CG-G---AGGT-----G--GA-T-CTAATA----AAA----AAA--AAAAGC---AA-ATGG-CAGTC-AG-TG-GG-AAAA-ATATAGTTGTT-------CAAC--AT---AAACTCGAATTATTC
gi|10196                      : TTTTT-CGTATGTTCCATCATA-C--T----T-------GTTATCACGAAA---------TCT-CG-G---AGGT-----G--GA-T-CTATTA----ACA----AAA--ACAAA--------TGA-CAATC-AG-TG-GG-AAAA-T-GTCATTGTT-------CAAC---T--TGAACTCAAACCATTC
gi|10197                      : TTCTT-CGTCTGCTTCGCCATGATAGT----TATCGCAAG----------A---------TCT-CG-G---AGGT-----G--GA-T-CTAATG----AAA----AAC--CAAAA---------GG-CAATC-AG-AG-GG-AAAA-T-GTAGTTATT-------CCAC--AT--T-AACTCTAACCATTC
gi|10198                      : TTCCT-CGTCTGCTTCGCCATG-T--T----T-------GTTATCGCGAGA---------TCT-CG-G---GGCT-----G--CA-T-CTAATC----AAA----AAA--CCAAA--------TGG-CAATC-GG-TG-GG-AAAA-T-GTA---GTT-------CGAC---T--TGAGCTCGAACCATTC
gi|10199                      : TTCCT-CGTCTGCTTCGCCATG-T--T----T-------G----------T---------TAT-CGCG---AGATCTCGGGCTGA-T-CTAATC----AAA----AAACCAAAA---------TGG-CAATC-GG-TG-GG-AAAA-T-GTAGTT----------CGAC---T--TGAGCTCGAACCATTC
gi|10200                      : TTCTT-CGTCTGCTCCGCCAT-GC--T----T-------GTT--------ATTGCAAGATT-T-CA-G---AGGT-----G--GA-T-CTACTC----AAATTTTAAA---------------TGC-CTATC----TG-CA-GAAATATGTAGCTGTT-------CAAC--A---AGTACTCGAACCATTC
gi|10201                      :  TCTT-CGTCTGATCCGCCATA----T----T-------G----------A---------T-TTCG-G---AGGT-----G--GA-T-CTAA------------------AAAAA-------------AATC-TG-TG-GG--AAA-A-GTAGTTATT-------CAAC--GT---GAACTCGAACCATTC
gi|10202                      :                         --T----T-------G----------AGCC------T-T-CG-GTTCAGGT-----G---A-G-CTAA-------AA----ACC--AAACCC---AA-ATGA-CAATC-AG-TG-GG-AAAA-A-GTTGTTGTTCTTTTTCCCACTGAT--TG-TCTCGAACCATTC
gi|10203                      :                                                                         GAT-----G--GAGT-CTACTA----AAA----ACA--CAAAA--------TGG-CAATC-AG-CT-GG-AAAA-T-GTAGTTGTT-------CCAC--AT---GAACTCGAACCATCC
gi|10204                      :                                                                                                                            TGA-CAATC-AG-TG-GG-GAAA-T-GTTGCTGTT-------CAAC--AT--C-AACTTGAACCATTC





Alignments
lowQualScore                  :                      77777777777777777777777777777                                               22222222                                               111                  
lowQualScore                  :      5      1        33333333333333333333333333333              2 5    7777   5555   55555555 2  33333333 2  4     2  4  2  2    666          55555     888  333             
lowQualScore                  :      .      .        .............................              . .    ....   ....   ........ .  ........ .  .     .  .  .  .    ...          .....     ...  ...             
lowQualScore                  :      3      0        77777777777777777777777777777              5 0    1111   0000   88888888 4  22222222 2  4     2  4  2  2    333          66666     333  999             
consensus                     : TTCTT-CGTCTGNTCCGCCAT---A-CTT----------G----------ATCTCGGAGGTGGA-T-CTAAT--AAAA----AAA----AA--A-AAC---AA--T-GA-CAATC-AG-TG-GG-GAAA-A-GTAGTTGTTC-----AACAT--CGA---ACTCGAACCATTC
Reference ( family-888 )      : TTCTT-CGTCTGNTCCGCCAT---A-CTT----------G----------ATCTCGGAGGTGGA-T-CTAAT--AAAA----AAA----AA--A-AAC---AA--T-GA-CAATC-AG-TG-GG-GAAA-A-GTAGTTGTTC-----AACAT--CGA---ACTCGAACCATTC
gi|10187                      : TTCTT-CGTCTAATCCGCCAT---AACTT----------G----------AT-TCGGAGGTGGA-T-CTAAT--AAAA----AAA----AA--A-AAC---AA--TTGA-CAATC-AG-TG-GG-GAAA-A-GTAGTTGTTC-----AACAT--CGA---ACTCGAACCATTC
gi|10188                      : TTCTTTCGTCTAATCCGCCAT---AACTT----------G----------ATGTCGGAGGTGGA-TGCTAAT--AAAA----AAA----AA--A-AAC---AAATT-GAGCAATCCAGCTG-GGCGAAA-A-GTAGTTGTTC-----AACAT--CGA---ACTCGAACCATTC
gi|10189                      : TTCTTTCGTCTAATCCGCCAT------TT----------GG---------ATCTCGGAGGTG-A-TGCTAATTTAAA------AA----AA--A-AAC---AAT-T-GA-CAATC-AGCTG-GG-GAAA-A-GTAGTTGTTC-----AACAT--CGA---ACTCGAACCATTC
gi|10190                      : TTCTT-CTCCTAATCCGCCAT---A-ATT----------G----------ATCTCGGAGGTGGA-T-CTAAC------------ATTTTAA--A-AAC---AAT-T-GACCAATC-AG-TG-GG-GAAA-A-GTAGTTGTTC-----AACATAAC-A---ACTCGAACCATTC
gi|10191                      : TTCTT-CGTCTAATCCGCCAT---A--TT----------G----------ATTTCGGAGGTGGA-T-CTAA---AAAA----AAA----CC--A-AACCA-AA--T-AA-CAATC-GG-T--GG-GATA-A-GTAGTTGTTC-----AACAT---GA---ACTCGAACCATT
gi|10192                      : TTCTT-CGTCTAATCCGCCAT---A--TT----------G----------ATCTTGGATATACA-T-GTAAT--AAAA----TAA----AA--ATAAA---AA--T-GA-CAATC-AG-TG-GG-GAAA-A-GTAGTTGTTC-----AACAT---GA---ACTCGAACCATTC
gi|10193                      : TTCTT-CGTCTAATCCGCCAT---A--TT----------G----------ATTTCGGTGTTGGA-T-CTAA-----AA----AAA----AA--A-TACCCTAA--T-GA-CAATC-AG-T--GG-GAAA-A-GTAGTTGTTC-----AACAT---GA---ACTCGAACCATTC
gi|10194                      : TTCTT-CGTCTGCACCGCTAT---G-GTT----------GTTATCGCGGGATCTCGGAGGTGGA-T-CTAAT--AAAA----AAA----AA--A-AGCA--AA--T-GG-CAGTC-AG-TG-GG-AAAA-ATATAGTTGTTC-----AACAT---AA---ACTCGAATTATTC
gi|10195                      : TTCTT-CGTCTGCTTCACCAT---A-CTT----------GTTATCACGATATCTCGGAGGTGGA-T-CTAAT--AAAA----AAA----AA--A-ACA---AA--T-GG-CAATC-GA-TGTGG-AAAA-A-GTAGTTGTTC-----AGCAT---GA---AATCAAACCATTC
gi|10196                      : TTTTT-CGTATGTTCCATCAT---A-CTT----------GTTATCACGAAATCTCGGAGGTGGA-T-CTATT--AACA----AAA----AC--A-AA--------T-GA-CAATC-AG-TG-GG-AAAA-T-GTCATTGTTC-----AAC-T--TGA---ACTCAAACCATTC
gi|10197                      : TTCTT-CGTCTGCTTCGCCATGATA-GTTATCGCAA---G----------ATCTCGGAGGTGGA-T-CTAAT--GAAA----AAC----CA--A-AA----------GG-CAATC-AG-AG-GG-AAAA-T-GTAGTTATTC-----CACAT--T-A---ACTCTAACCATTC
gi|10198                      : TTCCT-CGTCTGCTTCGCCAT---G-TTT----------GTTATCGCGAGATCTCGGGGCTGCA-T-CTAAT--CAAA----AAA----CC--A-------AA--T-GG-CAATC-GG-TG-GG-AAAA-T-GTA---GTTC-----GAC-T--TGA---GCTCGAACCATTC
gi|10199                      : TTCCT-CGTCTGCTTCGCCAT---G-TTTGTTATCGCGAG----------ATCTCG--GGCTGA-T-CTAAT--CAAA----AAA----CC--A-A-----AA--T-GG-CAATC-GG-TG-GG-AAAA-T-GTA---GTTC-----GAC-T--TGA---GCTCGAACCATTC
gi|10200                      : TTCTT-CGTCTGCTCCGCCAT---G-CTTGTTATTGCAAG----------ATTTCAGAGGTGGA-T-CTACT--CAAATTTTA------------------AA--T-GC-CTATC----TG-CA-GAAATATGTAGCTGTTC-----AACA---AGT---ACTCGAACCATTC
gi|10201                      :  TCTT-CGTCTGATCCGCCAT---A--TT----------G----------ATTTCGGAGGTGGA-T-CTAA------------------AA--A-AA--------------AATC-TG-TG-GG--AAA-A-GTAGTTATTC-----AACGT---GA---ACTCGAACCATTC
gi|10202                      :                                                                               ----AAA----AACCA-AACCCAAA--T-GA-CAATC-AG-TG-GG-AAAA-A-GTTGTTGTTCTTTTTCCCAC--TGATTGTCTCGAACCATTC
gi|10203                      :                                   ttgagccttcggttcaggtgagctGATGGAGT-CTACT--AAAA----ACA----CA--A-AA--------T-GG-CAATC-AG-CT-GG-AAAA-T-GTAGTTGTTC-----CACAT---GA---ACTCGAACCATCC
gi|10204                      :                                                                                                   ---AG--T-GA-CAATC-AG-TG-GG-GAAA-T-GTTGCTGTTC-----AACAT--C-A---ACTTGAACCATTC





Alignments
lowQualScore                  :                      77777777777777777777777777777                                               22222222                                               111                  
lowQualScore                  :      5      1        33333333333333333333333333333              2 5    7777   5555   55555555 2  33333333 2  4     2  4  2  2    666          55555     888  333             
lowQualScore                  :      .      .        .............................              . .    ....   ....   ........ .  ........ .  .     .  .  .  .    ...          .....     ...  ...             
lowQualScore                  :      3      0        77777777777777777777777777777              5 0    1111   0000   88888888 4  22222222 2  4     2  4  2  2    333          66666     333  999             
consensus                     : TTCTT-CGTCTGNTCCGCCAT---A-CTT----------G----------ATCTCGGAGGTGGA-T-CTAAT--AAAA----AAA----AA--A-AAC---AA--T-GA-CAATC-AG-TG-GG-GAAA-A-GTAGTTGTTC-----AACAT--CGA---ACTCGAACCATTC
Reference ( family-888 )      : TTCTT-CGTCTGNTCCGCCAT---A-CTT----------G----------ATCTCGGAGGTGGA-T-CTAAT--AAAA----AAA----AA--A-AAC---AA--T-GA-CAATC-AG-TG-GG-GAAA-A-GTAGTTGTTC-----AACAT--CGA---ACTCGAACCATTC
gi|10187                      : TTCTT-CGTCTAATCCGCCAT---AACTT----------G----------AT-TCGGAGGTGGA-T-CTAAT--AAAA----AAA----AA--A-AAC---AA--TTGA-CAATC-AG-TG-GG-GAAA-A-GTAGTTGTTC-----AACAT--CGA---ACTCGAACCATTC
gi|10188                      : TTCTTTCGTCTAATCCGCCAT---AACTT----------G----------ATGTCGGAGGTGGA-TGCTAAT--AAAA----AAA----AA--A-AAC---AAATT-GAGCAATCCAGCTG-GGCGAAA-A-GTAGTTGTTC-----AACAT--CGA---ACTCGAACCATTC
gi|10189                      : TTCTTTCGTCTAATCCGCCAT------TT----------GG---------ATCTCGGAGGTG-A-TGCTAATTTAAA------AA----AA--A-AAC---AAT-T-GA-CAATC-AGCTG-GG-GAAA-A-GTAGTTGTTC-----AACAT--CGA---ACTCGAACCATTC
gi|10190                      : TTCTT-CTCCTAATCCGCCAT---A-ATT----------G----------ATCTCGGAGGTGGA-T-CTAAC------------ATTTTAA--A-AAC---AAT-T-GACCAATC-AG-TG-GG-GAAA-A-GTAGTTGTTC-----AACATAAC-A---ACTCGAACCATTC
gi|10191                      : TTCTT-CGTCTAATCCGCCAT---A--TT----------G----------ATTTCGGAGGTGGA-T-CTAA---AAAA----AAA----CC--A-AACCA-AA--T-AA-CAATC-GG-T--GG-GATA-A-GTAGTTGTTC-----AACAT---GA---ACTCGAACCATT
gi|10192                      : TTCTT-CGTCTAATCCGCCAT---A--TT----------G----------ATCTTGGATATACA-T-GTAAT--AAAA----TAA----AA--ATAAA---AA--T-GA-CAATC-AG-TG-GG-GAAA-A-GTAGTTGTTC-----AACAT---GA---ACTCGAACCATTC
gi|10193                      : TTCTT-CGTCTAATCCGCCAT---A--TT----------G----------ATTTCGGTGTTGGA-T-CTAA-----AA----AAA----AA--A-TACCCTAA--T-GA-CAATC-AG-T--GG-GAAA-A-GTAGTTGTTC-----AACAT---GA---ACTCGAACCATTC
gi|10194                      : TTCTT-CGTCTGCACCGCTAT---G-GTT----------GTTATCGCGGGATCTCGGAGGTGGA-T-CTAAT--AAAA----AAA----AA--A-AGCA--AA--T-GG-CAGTC-AG-TG-GG-AAAA-ATATAGTTGTTC-----AACAT---AA---ACTCGAATTATTC
gi|10195                      : TTCTT-CGTCTGCTTCACCAT---A-CTT----------GTTATCACGATATCTCGGAGGTGGA-T-CTAAT--AAAA----AAA----AA--A-ACA---AA--T-GG-CAATC-GA-TGTGG-AAAA-A-GTAGTTGTTC-----AGCAT---GA---AATCAAACCATTC
gi|10196                      : TTTTT-CGTATGTTCCATCAT---A-CTT----------GTTATCACGAAATCTCGGAGGTGGA-T-CTATT--AACA----AAA----AC--A-AA--------T-GA-CAATC-AG-TG-GG-AAAA-T-GTCATTGTTC-----AAC-T--TGA---ACTCAAACCATTC
gi|10197                      : TTCTT-CGTCTGCTTCGCCATGATA-GTTATCGCAA---G----------ATCTCGGAGGTGGA-T-CTAAT--GAAA----AAC----CA--A-AA----------GG-CAATC-AG-AG-GG-AAAA-T-GTAGTTATTC-----CACAT--T-A---ACTCTAACCATTC
gi|10198                      : TTCCT-CGTCTGCTTCGCCAT---G-TTT----------GTTATCGCGAGATCTCGGGGCTGCA-T-CTAAT--CAAA----AAA----CC--A-------AA--T-GG-CAATC-GG-TG-GG-AAAA-T-GTA---GTTC-----GAC-T--TGA---GCTCGAACCATTC
gi|10199                      : TTCCT-CGTCTGCTTCGCCAT---G-TTTGTTATCGCGAG----------ATCTCG--GGCTGA-T-CTAAT--CAAA----AAA----CC--A-A-----AA--T-GG-CAATC-GG-TG-GG-AAAA-T-GTA---GTTC-----GAC-T--TGA---GCTCGAACCATTC
gi|10200                      : TTCTT-CGTCTGCTCCGCCAT---G-CTTGTTATTGCAAG----------ATTTCAGAGGTGGA-T-CTACT--CAAATTTTA------------------AA--T-GC-CTATC----TG-CA-GAAATATGTAGCTGTTC-----AACA---AGT---ACTCGAACCATTC
gi|10201                      :  TCTT-CGTCTGATCCGCCAT---A--TT----------G----------ATTTCGGAGGTGGA-T-CTAA------------------AA--A-AA--------------AATC-TG-TG-GG--AAA-A-GTAGTTATTC-----AACGT---GA---ACTCGAACCATTC
gi|10202                      :                                                                               ----AAA----AACCA-AACCCAAA--T-GA-CAATC-AG-TG-GG-AAAA-A-GTTGTTGTTCTTTTTCCCAC--TGATTGTCTCGAACCATTC
gi|10203                      :                                   ttgagccttcggttcaggtgagctGATGGAGT-CTACT--AAAA----ACA----CA--A-AA--------T-GG-CAATC-AG-CT-GG-AAAA-T-GTAGTTGTTC-----CACAT---GA---ACTCGAACCATCC
gi|10204                      :                                                                                                   ---AG--T-GA-CAATC-AG-TG-GG-GAAA-T-GTTGCTGTTC-----AACAT--C-A---ACTTGAACCATTC


blockSeqs                     :      T      A        GGTTGTTATCGCGGG                            G G    TTTA   TTTT   TTTTAA   T  CCCTAA   .  G     C  C  T  C    TAT          TTTTT     AAC  TTG
blockSeqs                     :      T      A        ACTTGTTATCACGAT                            . G    TA     .      AACC     .  CCCAAA   .  C     .  C  .  .    AT           .         C    .  
blockSeqs                     :      .      A        ACTTGTTATCACGAA                            . .    TA     .      AA       .  CAAAT    .  .     .  .  .  .    A            .         C    .  
blockSeqs                     :      .      A        GATAGTTATCGCAAG                            . .    TA     .      AA       .  CCAAA    .  .     .  .  .  .    A            .         T    .  
blockSeqs                     :      .      A        GTTTGTTATCGCGAG                            . .    TA     .      CC       .  CAAT     .  .     .  .  .  .    A            .         T    .  
blockSeqs                     :      .      A        GTTTGTTATCGCGAG                            . .    TA     .      AA       .  CAAT     .  .     .  .  .  .    A            .         T    .  
blockSeqs                     :      .      C        GCTTGTTATTGCAAG                            . .    TG     .      AA       .  CAAA     .  .     .  .  .  .    A            .         T    .  
blockSeqs                     :      .      C        AACTTG                                     . .    TC     .      AA       .  AAA      .  .     .  .  .  .    A            .         A    .  
blockSeqs                     :      .      T        AATTG                                      . .    TC     .      AA       .  AAA      .  .     .  .  .  .    A            .         T    .  
blockSeqs                     :      .      C        TTGG                                       . .    TC     .      AC       .  AA       .  .     .  .  .  .    T            .         C    .  
blockSeqs                     :      .      C        ATTG                                       . .    TA     .      CA       .  AA       .  .     .  .  .  .    T            .         .    .  
blockSeqs                     :      .      C        ATTG                                       . .    C      .      CC       .  AA       .  .     .  .  .  .    T            .         .    .  
blockSeqs                     :      .      C        ATTG                                       . .    A      .      CC       .  .        .  .     .  .  .  .    T            .         .    .  
blockSeqs                     :      .      A        ATTG                                       . .    .      .      AA       .  .        .  .     .  .  .  .    A            .         .    .  
blockSeqs                     :                                                                 . .    .      .      CA       .  .        .  .     .  .  .  .    A            .         .    .  
blockSeqs                     :                                                                               .      .        .  .        .  .     .  .  .  .    T            .         .    .  
blockSeqs                     :                                                                                                           .  .     .  .  .  .    T            .         .    .  


blockSeqCons                  :                      ANTTGTTATCGCGAG**************                                               CAAA****
originalCons                  : TTCTT-CGTCTGNTCCGCCAT---A-CTT----------G----------ATCTCGGAGGTGGA-T-CTAAT--AAAA----AAA----AA--A-AAC---AA--T-GA-CAATC-AG-TG-GG-GAAA-A-GTAGTTGTTC-----AACAT--CGA---ACTCGAACCATTC
finalCons                     : TTCTT-CGTCTGNTCCGCCATANTTGTTATCGCGAG--------------ATCTCGGAGGTGGA-T-CTAAT--AAAA----AAA----AA--A-AACAAA----T-GA-CAATC-AG-TG-GG-GAAA-A-GTAGTTGTTC-----AACAT--CGA---ACTCGAACCATTC





Alignments
lowQualScore                  :                         55555555555                       1                                                                     111                  
lowQualScore                  :      5      1         1 11111111111               2 5     0      5555     6666  0 2  4     2  4  2  2    666          55555     888  333             
lowQualScore                  :      .      .         . ...........               . .     .      ....     ....  . .  .     .  .  .  .    ...          .....     ...  ...             
lowQualScore                  :      3      0         9 33333333333               5 0     6      0000     8888  2 2  4     2  4  2  2    333          66666     333  999             
consensus                     : TTCTT-CGTCTGNTCCGCCATANTTGTTATCGCGAGATCTCGGAGGTGGA-T-CTAATAAAAAAA----AAAAA---CAAAT-GA-CAATC-AG-TG-GG-GAAA-A-GTAGTTGTTC-----AACAT--CGA---ACTCGAACCATTC
Reference ( family-888 )      : TTCTT-CGTCTGNTCCGCCATANTTGTTATCGCGAGATCTCGGAGGTGGA-T-CTAATAAAAAAA----AAAAA---CAAAT-GA-CAATC-AG-TG-GG-GAAA-A-GTAGTTGTTC-----AACAT--CGA---ACTCGAACCATTC
gi|10187                      : TTCTT-CGTCTAATCCGCCATAACT----T-----GAT-TCGGAGGTGGA-T-CTAATAAAAAAA----AAAAA---CAATT-GA-CAATC-AG-TG-GG-GAAA-A-GTAGTTGTTC-----AACAT--CGA---ACTCGAACCATTC
gi|10188                      : TTCTTTCGTCTAATCCGCCATAACT----T-----GATGTCGGAGGTGGA-TGCTAATAAAAAAA----AAAAA---CAAATTGAGCAATCCAGCTG-GGCGAAA-A-GTAGTTGTTC-----AACAT--CGA---ACTCGAACCATTC
gi|10189                      : TTCTTTCGTCTAATCCGCCAT--TTG---------GATCTCGGAGGT-GA-TGCTAATTTAAAAA----AAAAA---CAATT-GA-CAATC-AGCTG-GG-GAAA-A-GTAGTTGTTC-----AACAT--CGA---ACTCGAACCATTC
gi|10190                      : TTCTT-CTCCTAATCCGCCATAATTG----------ATCTCGGAGGTGGA-T-CTAAC------ATTTTAAAAA---CAATT-GACCAATC-AG-TG-GG-GAAA-A-GTAGTTGTTC-----AACATAAC-A---ACTCGAACCATTC
gi|10191                      : TTCTT-CGTCTAATCCGCCATATT-----------GATTTCGGAGGTGGA-T-CTAAAAAAAAAC----CAAAC---CAAAT-AA-CAATC-GG-T--GG-GATA-A-GTAGTTGTTC-----AACAT---GA---ACTCGAACCATT
gi|10192                      : TTCTT-CGTCTAATCCGCCATATT-----------GATCTTGGATATACA-T-GTAATAAAATAA----AAATA---AAAAT-GA-CAATC-AG-TG-GG-GAAA-A-GTAGTTGTTC-----AACAT---GA---ACTCGAACCATTC
gi|10193                      : TTCTT-CGTCTAATCCGCCATATT-----------GATTTCGGTGTTGGA-T-CTAA-AAAAAAA----ATACC---CTAAT-GA-CAATC-AG-T--GG-GAAA-A-GTAGTTGTTC-----AACAT---GA---ACTCGAACCATTC
gi|10194                      : TTCTT-CGTCTGCACCGCTATGGTTGTTATCGCGGGATCTCGGAGGTGGA-T-CTAATAAAAAAA----AAAAG---CAAAT-GG-CAGTC-AG-TG-GG-AAAA-ATATAGTTGTTC-----AACAT---AA---ACTCGAATTATTC
gi|10195                      : TTCTT-CGTCTGCTTCACCATACTTGTTATCACGATATCTCGGAGGTGGA-T-CTAAT-AAAAAA----AAAAA---CAAAT-GG-CAATC-GA-TGTGG-AAAA-A-GTAGTTGTTC-----AGCAT---GA---AATCAAACCATTC
gi|10196                      : TTTTT-CGTATGTTCCATCATACTTGTTATCACGAAATCTCGGAGGTGGA-T-CTATT----AAC----AAAAA---CAAAT-GA-CAATC-AG-TG-GG-AAAA-T-GTCATTGTTC-----AAC-T--TGA---ACTCAAACCATTC
gi|10197                      : TTCTT-CGTCTGCTTCGCCATGATAGTTATCGCAAGATCTCGGAGGTGGA-T-CTAATGAAAAAC----CAAAA---------GG-CAATC-AG-AG-GG-AAAA-T-GTAGTTATTC-----CACAT--T-A---ACTCTAACCATTC
gi|10198                      : TTCCT-CGTCTGCTTCGCCATGTTTGTTATCGCGAGATCTCGGGGCTGCA-T-CTAAT----CAA----AAAAC---CAAAT-GG-CAATC-GG-TG-GG-AAAA-T-GTA---GTTC-----GAC-T--TGA---GCTCGAACCATTC
gi|10199                      : TTCCT-CGTCTGCTTCGCCATGTTTGTTATCGCGAGATCTCG--GGCTGA-T-CTAATCAAAAAA----CCA------AAAT-GG-CAATC-GG-TG-GG-AAAA-T-GTA---GTTC-----GAC-T--TGA---GCTCGAACCATTC
gi|10200                      : TTCTT-CGTCTGCTCCGCCATGCTTGTTATTGCAAGATTTCAGAGGTGGA-T-CTACT------------CAAATTTTAAAT-GC-CTATC----TG-CA-GAAATATGTAGCTGTTC-----AACA---AGT---ACTCGAACCATTC
gi|10201                      :  TCTT-CGTCTGATCCGCCATATT-----------GATTTCGGAGGTGGA-T-CTAA------------AAAAA-------------AATC-TG-TG-GG--AAA-A-GTAGTTATTC-----AACGT---GA---ACTCGAACCATTC
gi|10202                      :                                                          TAAAAACC----AAACC---CAAAT-GA-CAATC-AG-TG-GG-AAAA-A-GTTGTTGTTCTTTTTCCCAC--TGATTGTCTCGAACCATTC
gi|10203                      :                      ttgagccttcggttcaggtgagcGATGGAGT-CTACTAAAAACA----CAAAA-------T-GG-CAATC-AG-CT-GG-AAAA-T-GTAGTTGTTC-----CACAT---GA---ACTCGAACCATCC
gi|10204                      :                                                                                AGT-GA-CAATC-AG-TG-GG-GAAA-T-GTTGCTGTTC-----AACAT--C-A---ACTTGAACCATTC