lowQualScore : 11 2 111 111 1111 11111111 11 2222222222222 4444444444 11 11 1
lowQualScore : 3 3 888888 3 11 3 3 5 555 2 2 333 3 0 3 333 66 2 2 0000 33 8 2 2 77 77777 5 0 2 2 2 5 3 3 6 3 7 88 4 99999 3 444 2 3 44 00000000 0 66 3 6 3 3 666 5555555555555 8 7777777777 3 7 44 55 55 3 33 444 00 3 3 88 3 3
lowQualScore : . . ...... . .. . . . ... . . ... . . . ... .. . . .... .. . . . .. ..... . . . . . . . . . . . .. . ..... . ... . . .. ........ . .. . . . . ... ............. . .......... . . .. .. .. . .. ... .. . . .. . .
lowQualScore : 6 1 888888 1 55 1 1 7 000 9 3 888 1 2 1 888 22 9 9 6666 99 6 9 9 99 11111 3 8 7 7 7 3 1 1 2 1 5 55 2 44444 1 000 9 1 22 55555555 4 55 3 7 3 6 444 2222222222222 0 4444444444 3 3 11 00 00 6 33 111 00 6 6 66 8 6
consensus : TTTTATG-CTAAGTTTTACCGATAAT-AT------GTAGT-CTT--AAT-GACG-ACCA-C---A-TGCAAAAATT---CAATCTCG-ACACA-CA---AGCAAA-ACTCA-TTACA-A---CTTGT--GGGTAAAATA-TTC-A-CC--TACAAGTA-----TTT-GTGGT-TG-GT-TTT-GTCAAT-G-CA-AA-TGCGGAGC--ACGTACTGTT---CGGT-GTT-GC-GC-GC--A-------TATATGCA-GTGTC-ATTTG-GTAC-C-TTG---GGT--A-N--------TCCA-GACATC-AT---C---AA-TGTAATTA-CATGTGTGTG--A--G-T-GTT-G-AA--A-A-CCGCTT--AATGTCTGAAAT-ACATA
Reference ( gi|27427 ) : TTTTATG-CTAAGTTTTACCAATAAT-AT------GTAGT-CTT--AAT-GACG-ACCA-C---A-TGCTAAAATT---CAATCTCG-ACACA-CA---AGCAAA-ACTCA-TTACA-A---CTTGT--GGGTAAAATA-TTC-A-CC--TACAAGTA-----TTT-GTGGT-TG-GT-TTT-GTCAAT-G-CA-AA-TGTGGAGC--ACGCACTGTT---TAGT-GTT-GC-GC-GC--A-------TATATGCA-TTGTC-ATTTG-GTAC-C-TTG---GGT--A-G--------TCCA-GACATCAAT---T---AA-TGTAATTA-CATGTGTGTG--A--G-T-ATT-G-AA--A-A-CCGCTT--AATGTCAGAAAT-ACATA
gi|27430 : TTTTATG-CTACGTTTTACCAATAAT-AT------GTAGT-CTT--AAT-GACG-ACCT-A---A-TGCATAAATT---CAATCTCG-ACACA-CA---AGCAAA-ACTCA-ATACA-A---TTTGT--GGGTAAAATA-TTC-ACCC--TACAAGTA-----TTT-GTTGT-TG-GT-TTT-GTCAAT-G-CA-AA-TGCGGAGC--ACGTACTGTC---TGGT-GTT-GC-GC-GC--A-------TATATGCA-ATGTC-ATTTG-GTAC-C--TA---AGT--A-T--------TCCA-GACATCAATGTAC---AA-TGTAATTA-CATGTATGTG--A--G-T-GTT-G-AA--A-A-CCGCTT--AATGTCTGAAAT-ACATA
gi|27429 : TTTTATG-CTAAATTTTACCATTAAT-AT------GTA-T-TTT--AAT-GACG-ACCA-C---A-TGCAAAATTT---CAATCTCG-ACACA-CA---AGCAAA-ATTCA-TTACA-A---ATTGT--GGGTAAAATA-TTT-A-CC--TACAAGTA-----TTT-GTGAT-TG-GC-TTT-GTCAAT-G-CA-AA-TGCGGAGC--ACGTACTGTT---CAGT-GTT-GC-GCAAC--A-------TATATGCACTTGTC-ATTTG-GTAC-C-TTG---GGT--A-G--------TCCA-GACATC-----------A-TGTAATTA-CATATGTGTGCAA--G-T-GTT-G-AA--A-A-CCGCTT--AATGTCTGAAAT-ACATA
gi|27428 : TTTTATG-CTAAGTTTTACCGATAAT-AT------GTAGT-CTT--AAT-GACG-ACCA-C---A-CGAAAAAATC---CAATCTCG-ACACA-CA---AGCAAA-TCTCA-TTACA-A---CTTGT--GGGTAAAATA-TTC-G-CC--TACATGTG-----TTT-GTGGT-TG-GT-TTT-GCCAAT-G-CA-AA-TGCGGAGC--ACGTACTGTT---CGGT-GCT-GC-GC-TT--A-------TATATGAA-GTAAC-ATTTG-GTAC-C-TTG---GGT--A-C--------TCCA-GACATC----------AA-TGTAATTA-CATGTATGTG--A--G-T-GTT-G-AA--A-A-CCGCTT--AATGTCTGAAAT-ACATA
gi|27431 : TTTTATG-TTA-GTTTTACCGATAAT-AT------GTAGT-C----------------------A-TGCAAAAATC---CAATCTCG-ACACA-CA---AGCAAA-AATCA-TTACA-A---CTTGT--GGGTAAAGTA-TTC-A-CC--TACAAGTACAGCATTT-GTGGT-TG-GT-TTT-GTCAAT-G-CA-AA-TGCGGAGC--ACATACTGTT---AGGT-GCT-GC-GC-GC--A-------TATATGCA-GTGTC-ATTTG-GTAC-C-TTG---GGT--A-ATAGTGGACTCCA-GATA--------T---AA-TGTAA-TA-CATGTA-GTG--A--G-T-GTT---AA--A-A-CCGTTT--AATGTCTGAAATAACATA
gi|27432 : TTTTATG-TTAAGTTTTACCAATAAT-ACATGTACGTATT-CTT--AAT-GACG-ACCA-C---A-TGCAAAAAATA--CAATCTCG-ACACA-CA---AGCAAA-ACTCATTTACA-A---CTTGT--GAGTAAAATATTTC-A-CC--TACAAATA-----TTT-GTAAT-TG-GTGTTT-GTCAAT-G-CA-AATTGCGGAGC--ACGTACTGTT---TTGTGGCT-GC-GC-GT--A-------TATATGCA-GTGACAATTTG-GTAC-CTTTG---GGT--A-C--------TC
gi|27434 : TTTTATG-CTAAGGTT-ACCATTAAT-AT------GTAGT-TTTTAAAT-GACG-ACCAGC---A-TGC-AAAATTTCACAATCTCG-ACA-A-CACCCAGCAAA--CTCC-TTACA-A---ATTGT--GGGTAAAATA-TTT-A-CCTTTACAAGTA-----TTTGGTGAT-TG-GC-TTTGGTCAAT-G-CAGAA-TGCGGAGCAAACGCACTGTT---CAGT-GT-----GC-GC--A----------GTG-----ATC-ATTTGAGTA--C-TTG---GGTAGA-G--------TCCAGGACATC----------AA-TGTAATTAGCATGTCTGTG--A--G-TGGTT-G-AAATA-A-CCGCTT--AATGCTGAAAAT-ACATA
gi|27433 : TTTTATG-CTAAGGTT-ACCATTAAT-AT------GTAGT-TTTTAAAT-GACG-ACCAGC---A-TGC-AAAATTTCACAATCTCG-ACA-A-CACCCAGCAAA--CTCC-TTACA-A---ATTGT--GGGTAAAATA-TTT-A-CCTTTACAAGTA-----TTTGGTGAT-TG-GC-TTTGGTCAAT-G-CAGAA-TGCGGAGCAAACGCACTGTT---CAGT-GT-----GC-GC--A----------GTG-----ATC-ATTTGAGTA--C-TTG---GGTAGA-G--------TCCAGGACATC----------AA-TGTAATTAGCATGTCTGTG--A--G-TGGTT-G-AAATA-A-CCGCTT--AATGCTGAAAAT-ACATA
gi|27435 : TTTTATG-CTAAGTTTTACCAATAAT-AT--------------T--AAT-GACG-ACCA-C---A-TGCAAAAATT---CAATCTCG-ACACA-CA---AGCGAA-ACTCA-TTACA-A---CATGT--GGATAAAATA-TTC-A-CC--TACAAGTA-----CTT-GTG----------------AAT-G-CA-AA-TGCGGAGC--ACGTACTGTT---GGGT-GTT-TC-GC-GC--A-------TATATG
gi|27436 : TTTTATGGCTAAGTTTT-CCATTAAT-AT------GTAGT-CTTT-AATTGGCG-ACCA-C---AATGC-AAAATT---CAATCTCGGACATA-CAC--AGCAAA--TTCA-TTACACA---ATTGCTGGGGTAAAATAATTT-A-TC--TA-AAGTA-----TTT-GTGATGTG-GC-TTT-GTCAATTG-TA-AA-TCCGGAGC--ACGTACTGTT---TAGT-GTTGGCGGC-GC--A-------TATA-GC---TGTC-A-TTG-GTACGC-TTGGCCGGT--A-G--------TCC--GACATCAAT---TGTAAA-TG
gi|27437 : TTTTATG-C-AAGTTTTACAGATAATTAT------TAAGT-CTT--AAT-GACA-ACCA-CACTA-TGCAAAAATC---CAATCT-G-ACACAGCA---AGCAA
gi|27438 : TTTTATG-CTAAGTTTTAACGATAAA-AT------GTAGT-CTT--AAT-GACGCACTA-C---A-
gi|27439 : TTTTACCAATAAT-AT------G----------AAT-GACG-AACA-C---A-TGCAAAAATT---CAATCTCG-ACACA-CA---AACAAA-ACTCA-TTACA-A---CTTGT--GGGTAAAATA-TTC-A-CC--TACAAGTA-----TTT-GTGGC-TG-GT-TTT-GTCAGT-G-CA-AA-TGCGGAGC--ACGTACTGTT---CGGT-GTT-GC-GC-GCATA-------TATATGCA-GTGTC-ATTTG-GTAC-C-TTG---GGT--A-C--------TCGA-GACATCAAT---T---GA-TGTAATTA-CATGTGAGAG--A--G-T-GTT-G-AC--A-A-CCGCTT--AATGTCTAAAAT-ACAT
gi|27440 : TTTACCAATAAT-AT------GTAGTATTT--AAT-GACA-ACCA-C---A-TGCAAAAATC---CAATCTCG-ACACA-CA---AGCAAA-ACTAA-TTACA-A---CCTGT--GGGTAAAATA-TTC-A-CC--TACATGTA-----TTC-GTTGT-TG-GT-TTT-GTCAAT-GCCA-AA-TACGGAGC--ACGTACTGTT---CGGT-TGT-GT-AC-GC--A-------AATATGCA-GTGCC-ATTTG-GTAC-C-TTG---GGT--ACT--------TTCA-GACATC----------AA-TGTAATTA-CATGT
gi|27441 : -C---A-TGCAAAAATT---CA-TCTCG-ACATA-CA---AGCAAA-ATTC---TATA-----TTTGT--GGAGAATATA-TTC-A-CC--TACAACTA-----TTT-GCGGT-TG-TT-TTA-ATCAAT-G-CA-AA-TG-------------CTGTTAGATACT-G-C-GC-GC-GC--ATATATTTTATATGCA-GTGTC-ATGT--GTAC-C-GTG---GAT--A------------CA----ATC-AT---C---AG-TGAAATTA-----TGTGTG--ACTG-T-GTT-T-AA--A-A-AAGCTT--ATTGGCGGATAT-GTATA
gi|27439 : CAAA-ACCAG-CCACA-AATACTTGT--AGGTGAA-TA-TTTTA-CC--CACAAGT--------T-GTAAT-GA-GT-TTT-GT
gi|27432 : ttttaccaataatatgaatgacgaacacatgcaaaaattcaatctcgacacacaaCAAACACCAA-TTACA-AATATTTGT--AGGTGAAATATTTT-A-CT--CACAAG--------TT-GTAAA-TGAGT-TTT-Gtcagtgcaaatgcggagcacgtactgttcggtgttgcgcgcatatatatgcagtgtcatttggtaccttgggtactcgagacatcaattgatgtaattacatgtgagagagtgttgacaaccgcttaatgtctaaaatacat
gi|27442 : ttttatgttaagttttaccaataatacatgtacgtattcttaatgacgaccacatgcaaaaaatacaatctcgacacacaag-GTGGT-TG-GT-TTT-GTCAAT-G-CA-AA-TGTGGAGC--GCATACTGTT---CGGT-GCT-GC-Gtcaatgcaaattgcggagcacgtactgttttgtggctgcgcgtatatatgcagtgacaatttggtacctttgggtactc
gi|27443 : -GC-AT--A-------TATATGCA-GTGTC-ATTTG-GTAC-
gi|27444 : AT---C---AA-TGTAATTG-CATGTATGTG--A--G-T-GTT-GAAA--A-A-CCGCTTTAAATGTCTGAAAT-ACATAtatgtgagtgttgaaaaaccgctttaatgtctgaaatacat
gi|27445 : aggcaaaacaaaac---T---AACTGTAATTA-CATGTG-GTG--A--GGT-GTTTG-AA--ATA-TCGCTT--AATGTCCTGAAT-ACATA
gi|27443 : TATGTG--A--G-T-GTT-G-AA--A-AACCGCTTT-AATGTCTGAAAT-ACAT
Alignments
lowQualScore : 11 111 111111111 22222222 1111111111
lowQualScore : 3 1 2 888888 2 00 2 2 5 777 0 2 77 2 2 222 4 3 3 0 44 6 3 88 77777 5 2 2 5 2 2 5 2 77 2 5 2 2 2 33 111111111 3 6 3 6 3 3 555 11111111 77 7777777777 6 22 44 44 3 6 3 3 99 3 3 77 1 6 3
lowQualScore : . . . ...... . .. . . . ... . . .. . . ... . . . . .. . . .. ..... . . . . . . . . .. . . . . . .. ......... . . . . . . ... ........ .. .......... . .. .. .. . . . . .. . . .. . . .
lowQualScore : 3 4 9 222222 9 77 9 9 3 333 1 9 99 9 9 999 3 1 1 2 22 2 1 55 77777 7 9 9 7 9 9 7 9 99 9 1 9 7 9 99 444444444 1 2 1 2 1 3 888 22222222 66 7777777777 7 22 66 66 3 7 3 3 22 3 3 99 2 7 3
consensus : TTTTATG-CTAAGTTTTACCGATAAT-AT------GTAGT-CTT--AAT-GACG-ACCA-CA---TGCAAAAATT-CA--ATCTCG-ACACA-CA---AGCAAAACTCA-TTACA-ACTTGT--GGGTAAAATA-TTCA-CC--TACAAGTA-----TTT-GTGGT-TGGT-TTT-GTCAAT-G-CA-AA-TGCGGAGC--ACGTACTGTTCGGT-GCT-GC-GC-GC--A---------TATATGCA-GTG-TC-ATTTG-GTAC-C-TTG---GGT--------A-NTCCAGACATC-AT---CAATGTAATTA-CATGTGTGTG--A--G-T-GTT-G-AA--A-A-CCGCTT--AATGTCTG-AAAT-ACATA
Reference ( family-873 ) : TTTTATG-CTAAGTTTTACCGATAAT-AT------GTAGT-CTT--AAT-GACG-ACCA-CA---TGCAAAAATT-CA--ATCTCG-ACACA-CA---AGCAAAACTCA-TTACA-ACTTGT--GGGTAAAATA-TTCA-CC--TACAAGTA-----TTT-GTGGT-TGGT-TTT-GTCAAT-G-CA-AA-TGCGGAGC--ACGTACTGTTCGGT-GTT-GC-GC-GC--A---------TATATGCA-GTG-TC-ATTTG-GTAC-C-TTG---GGT--------A-NTCCAGACATC-AT---CAATGTAATTA-CATGTGTGTG--A--G-T-GTT-G-AA--A-A-CCGCTT--AATGTCTG-AAAT-ACATA
gi|27427 : TTTTATG-CTAAGTTTTACCAATAAT-AT------GTAGT-CTT--AAT-GACG-ACCA-CA---TGCTAAAATT-CA--ATCTCG-ACACA-CA---AGCAAAACTCA-TTACA-ACTTGT--GGGTAAAATA-TTCA-CC--TACAAGTA-----TTT-GTGGT-TGGT-TTT-GTCAAT-G-CA-AA-TGTGGAGC--ACGCACTGTTTAGT-GTT-GC-GC-GC--A---------TATATGCA-TTG-TC-ATTTG-GTAC-C-TTG---GGT--------A-GTCCAGACATCAAT---TAATGTAATTA-CATGTGTGTG--A--G-T-ATT-G-AA--A-A-CCGCTT--AATGTCAG-AAAT-ACATA
gi|27428 : TTTTATG-CTAAGTTTTACCGATAAT-AT------GTAGT-CTT--AAT-GACG-ACCA-CA---CGAAAAAATC-CA--ATCTCG-ACACA-CA---AGCAAATCTCA-TTACA-ACTTGT--GGGTAAAATA-TTCG-CC--TACATGTG-----TTT-GTGGT-TGGT-TTT-GCCAAT-G-CA-AA-TGCGGAGC--ACGTACTGTTCGGT-GCT-GC-GC-TT--A---------TATATGAA-GTA-AC-ATTTG-GTAC-C-TTG---GGT--------A-CTCCAGA---C-AT---CAATGTAATTA-CATGTATGTG--A--G-T-GTT-G-AA--A-A-CCGCTT--AATGTCTG-AAAT-ACATA
gi|27429 : TTTTATG-CTAAATTTTACCATTAAT-AT------GTA-T-TTT--AAT-GACG-ACCA-CA---TGCAAAATTT-CA--ATCTCG-ACACA-CA---AGCAAAATTCA-TTACA-AATTGT--GGGTAAAATA-TTTA-CC--TACAAGTA-----TTT-GTGAT-TGGC-TTT-GTCAAT-G-CA-AA-TGCGGAGC--ACGTACTGTTCAGT-GTT-GC-GCAAC--A---------TATATGCACTTG-TC-ATTTG-GTAC-C-TTG---GGT--------A-GTCCAGACATC--------ATGTAATTA-CATATGTGTGCAA--G-T-GTT-G-AA--A-A-CCGCTT--AATGTCTG-AAAT-ACATA
gi|27430 : TTTTATG-CTACGTTTTACCAATAAT-AT------GTAGT-CTT--AAT-GACG-ACCT-AA---TGCATAAATT-CA--ATCTCG-ACACA-CA---AGCAAAACTCA-ATACA-ATTTGT--GGGTAAAATA-TTCACCC--TACAAGTA-----TTT-GTTGT-TGGT-TTT-GTCAAT-G-CA-AA-TGCGGAGC--ACGTACTGTCTGGT-GTT-GC-GC-GC--A---------TATATGCA-ATG-TC-ATTTG-GTAC-C--TA---AGT--------A-TTCCAGACATCAATGTACAATGTAATTA-CATGTATGTG--A--G-T-GTT-G-AA--A-A-CCGCTT--AATGTCTG-AAAT-ACATA
gi|27431 : TTTTATG-TTA-GTTTTACCGATAAT-AT------GTAGT-C-------------------A---TGCAAAAATC-CA--ATCTCG-ACACA-CA---AGCAAAAATCA-TTACA-ACTTGT--GGGTAAAGTA-TTCA-CC--TACAAGTACAGCATTT-GTGGT-TGGT-TTT-GTCAAT-G-CA-AA-TGCGGAGC--ACATACTGTTAGGT-GCT-GC-GC-GC--A---------TATATGCA-GTG-TC-ATTTG-GTAC-C-TTG---GGTAATAGTGGA-CTCCAGATAT--------AATGTAA-TA-CATGTA-GTG--A--G-T-GTT---AA--A-A-CCGTTT--AATGTCTG-AAATAACATA
gi|27432 : TTTTATG-TTAAGTTTTACCAATAAT-ACATGTACGTATT-CTT--AAT-GACG-ACCA-CA---TGCAAAAAATACA--ATCTCG-ACACA-CA---AGCAAAACTCATTTACA-ACTTGT--GAGTAAAATATTTCA-CC--TACAAATA-----TTT-GTAAT-TGGTGTTT-GTCAAT-G-CA-AATTGCGGAGC--ACGTACTGTTTTGTGGCT-GC-GC-GT--A---------TATATGCA-GTG-ACAATTTG-GTAC-CTTTG---GGT--------A-CTC
gi|27433 : TTTTATG-CTAAGGTT-ACCATTAAT-AT------GTAGT-TTTTAAAT-GACG-ACCAGCA---TGCAAAATTT-CACAATCTCG-ACA-A-CACCCAGCAAA-CTCC-TTACA-AATTGT--GGGTAAAATA-TTTA-CCTTTACAAGTA-----TTTGGTGAT-TGGC-TTTGGTCAAT-G-CAGAA-TGCGGAGCAAACGCACTGTTCAGT-G-T-GC-----------------------GCA-GTGATC-ATTTGAGTA--C-TTG---GGTAG------A-GTCCAGG-A-C-AT---CAATGTAATTAGCATGTCTGTG--A--G-TGGTT-G-AAATA-A-CCGCTT--AATG-CTGAAAAT-ACATA
gi|27434 : TTTTATG-CTAAGGTT-ACCATTAAT-AT------GTAGT-TTTTAAAT-GACG-ACCAGCA---TGCAAAATTT-CACAATCTCG-ACA-A-CACCCAGCAAA-CTCC-TTACA-AATTGT--GGGTAAAATA-TTTA-CCTTTACAAGTA-----TTTGGTGAT-TGGC-TTTGGTCAAT-G-CAGAA-TGCGGAGCAAACGCACTGTTCAGT-G-T-GC-----------------------GCA-GTGATC-ATTTGAGTA--C-TTG---GGTAG------A-GTCCAGG-A-C-AT---CAATGTAATTAGCATGTCTGTG--A--G-TGGTT-G-AAATA-A-CCGCTT--AATG-CTGAAAAT-ACATA
gi|27435 : TTTTATG-CTAAGTTTTACCAATAAT-AT--------------T--AAT-GACG-ACCA-CA---TGCAAAAATT-CA--ATCTCG-ACACA-CA---AGCGAAACTCA-TTACA-ACATGT--GGATAAAATA-TTCA-CC--TACAAGTA-----CTT-GTG---------------AAT-G-CA-AA-TGCGGAGC--ACGTACTGTTGGGT-GTT-TC-GC-GC--A---------TATATG
gi|27436 : TTTTATGGCTAAGTTTT-CCATTAAT-AT------GTAGT-CTTT-AATTGGCG-ACCA-CAA--TGCAAAA-TT-CA--ATCTCGGACATA-CAC--AGCAAA-TTCA-TTACACAATTGCTGGGGTAAAATAATTTA-TC--TA-AAGTA-----TTT-GTGATGTGGC-TTT-GTCAATTG-TA-AA-TCCGGAGC--ACGTACTGTTTAGT-GTTGGCGGC-GC--A---------TATA-GC---TG-TC-A-TTG-GTACGC-TTGGCCGGT--------A-GTCC-GACATC-A-----ATTGTAA
gi|27437 : TTTTATG-C-AAGTTTTACAGATAATTAT------TAAGT-CTT--AAT-GACA-ACCA-CACTATGCAAAAATC-CA--ATCT-G-ACACAGCA---AGCAAatg
gi|27438 : TTTTATG-CTAAGTTTTAACGATAAA-AT------GTAGT-CTT--AAT-GACGCACTA-CA---
gi|27439 : TTTTACCAATAAT-AT------G----------AAT-GACG-AACA-CA---TGCAAAAATT-CA--ATCTCG-ACACA-CA---AACAAAACTCA-TTACA-ACTTGT--GGGTAAAATA-TTCA-CC--TACAAGTA-----TTT-GTGGC-TGGT-TTT-GTCAGT-G-CA-AA-TGCGGAGC--ACGTACTGTTCGGT-GTT-GC-GC-GCATA---------TATATGCA-GTG-TC-ATTTG-GTAC-C-TTG---GGT--------A-CTCGAGACATCAAT---TGATGTAATTA-CATGTGAGAG--A--G-T-GTT-G-AC--A-A-CCGCTT--AATGTCTA-AAAT-ACAT
gi|27440 : TTTACCAATAAT-AT------GTAGTATTT--AAT-GACA-ACCA-CA---TGCAAAAATC-CA--ATCTCG-ACACA-CA---AGCAAAACTAA-TTACA-ACCTGT--GGGTAAAATA-TTCA-CC--TACATGTA-----TTC-GTTGT-TGGT-TTT-GTCAAT-GCCA-AA-TACGGAGC--ACGTACTGTTCGGT-TGT-GT-AC-GC--A---------AATATGCA-GTG-CC-ATTTG-GTAC-C-TTG---GGT--------ACTTTCAGA---C-AT---CAATGTAATTA-CATGT
gi|27441 : -CA---TGCAAAAATT-CA---TCTCG-ACATA-CA---AGCAAAATTC---TATA--TTTGT--GGAGAATATA-TTCA-CC--TACAACTA-----TTT-GCGGT-TGTT-TTA-ATCAAT-G-CA-AA-TG-------------CTGTTAGAT-ACT-GC-GC-GC--GCATATATTTTATATGCA-GTG-TC-ATGT--GTAC-C-GTG---GAT--------A----CA---ATC-AT---CAGTGAAATTA-----TGTGTG--ACTG-T-GTT-T-AA--A-A-AAGCTT--ATTGGCGG-ATAT-GTATA
gi|27442 : -GTGGT-TGGT-TTT-GTCAAT-G-CA-AA-TGTGGAGC--GCATACTGTTCGGT-GCT-GC-G
gi|27443 : -GC-AT--A---------TATATGCA-GTG-TC-ATTTG-GTAC-
gi|27443 : TATGTG--A--G-T-GTT-G-AA--A-AACCGCTTT-AATGTCTG-AAAT-ACATtatgtgagtgttgaaaaaccgctttaatgtctgaaatacat
gi|27444 : gcatatatatgcagtgtcatttggtacC-AT---CAATGTAATTG-CATGTATGTG--A--G-T-GTT-GAAA--A-A-CCGCTTTAAATGTCTG-AAAT-ACATA
gi|27445 : aggcaaaacaaaaTGTAATTA-CATGTG-GTG--A--GGT-GTTTG-AA--ATA-TCGCTT--AATGTCCT-GAAT-ACATA
Alignments
lowQualScore : 11 111 111111111 22222222 1111111111
lowQualScore : 3 1 2 888888 2 00 2 2 5 777 0 2 77 2 2 222 4 3 3 0 44 6 3 88 77777 5 2 2 5 2 2 5 2 77 2 5 2 2 2 33 111111111 3 6 3 6 3 3 555 11111111 77 7777777777 6 22 44 44 3 6 3 3 99 3 3 77 1 6 3
lowQualScore : . . . ...... . .. . . . ... . . .. . . ... . . . . .. . . .. ..... . . . . . . . . .. . . . . . .. ......... . . . . . . ... ........ .. .......... . .. .. .. . . . . .. . . .. . . .
lowQualScore : 3 4 9 222222 9 77 9 9 3 333 1 9 99 9 9 999 3 1 1 2 22 2 1 55 77777 7 9 9 7 9 9 7 9 99 9 8 9 7 9 99 444444444 1 2 1 2 1 3 888 22222222 66 7777777777 7 22 66 66 3 7 3 3 22 3 3 99 2 7 3
consensus : TTTTATG-CTAAGTTTTACCGATAAT-AT------GTAGT-CTT--AAT-GACG-ACCA-CA---TGCAAAAATT-CA--ATCTCG-ACACA-CA---AGCAAAACTCA-TTACA-ACTTGT--GGGTAAAATA-TTCA-CC--TACAAGTA-----TTT-GTGGT-TGGT-TTT-GTCAAT-G-CA-AA-TGCGGAGC--ACGTACTGTTCGGT-GCT-GC-GC-GC--A---------TATATGCA-GTG-TC-ATTTG-GTAC-C-TTG---GGT--------A-NTCCAGACATC-AT---CAATGTAATTA-CATGTGTGTG--A--G-T-GTT-G-AA--A-A-CCGCTT--AATGTCTG-AAAT-ACATA
Reference ( family-873 ) : TTTTATG-CTAAGTTTTACCGATAAT-AT------GTAGT-CTT--AAT-GACG-ACCA-CA---TGCAAAAATT-CA--ATCTCG-ACACA-CA---AGCAAAACTCA-TTACA-ACTTGT--GGGTAAAATA-TTCA-CC--TACAAGTA-----TTT-GTGGT-TGGT-TTT-GTCAAT-G-CA-AA-TGCGGAGC--ACGTACTGTTCGGT-GCT-GC-GC-GC--A---------TATATGCA-GTG-TC-ATTTG-GTAC-C-TTG---GGT--------A-NTCCAGACATC-AT---CAATGTAATTA-CATGTGTGTG--A--G-T-GTT-G-AA--A-A-CCGCTT--AATGTCTG-AAAT-ACATA
gi|27427 : TTTTATG-CTAAGTTTTACCAATAAT-AT------GTAGT-CTT--AAT-GACG-ACCA-CA---TGCTAAAATT-CA--ATCTCG-ACACA-CA---AGCAAAACTCA-TTACA-ACTTGT--GGGTAAAATA-TTCA-CC--TACAAGTA-----TTT-GTGGT-TGGT-TTT-GTCAAT-G-CA-AA-TGTGGAGC--ACGCACTGTTTAGT-GTT-GC-GC-GC--A---------TATATGCA-TTG-TC-ATTTG-GTAC-C-TTG---GGT--------A-GTCCAGACATCAAT---TAATGTAATTA-CATGTGTGTG--A--G-T-ATT-G-AA--A-A-CCGCTT--AATGTCAG-AAAT-ACATA
gi|27428 : TTTTATG-CTAAGTTTTACCGATAAT-AT------GTAGT-CTT--AAT-GACG-ACCA-CA---CGAAAAAATC-CA--ATCTCG-ACACA-CA---AGCAAATCTCA-TTACA-ACTTGT--GGGTAAAATA-TTCG-CC--TACATGTG-----TTT-GTGGT-TGGT-TTT-GCCAAT-G-CA-AA-TGCGGAGC--ACGTACTGTTCGGT-GCT-GC-GC-TT--A---------TATATGAA-GTA-AC-ATTTG-GTAC-C-TTG---GGT--------A-CTCCAGA---C-AT---CAATGTAATTA-CATGTATGTG--A--G-T-GTT-G-AA--A-A-CCGCTT--AATGTCTG-AAAT-ACATA
gi|27429 : TTTTATG-CTAAATTTTACCATTAAT-AT------GTA-T-TTT--AAT-GACG-ACCA-CA---TGCAAAATTT-CA--ATCTCG-ACACA-CA---AGCAAAATTCA-TTACA-AATTGT--GGGTAAAATA-TTTA-CC--TACAAGTA-----TTT-GTGAT-TGGC-TTT-GTCAAT-G-CA-AA-TGCGGAGC--ACGTACTGTTCAGT-GTT-GC-GCAAC--A---------TATATGCACTTG-TC-ATTTG-GTAC-C-TTG---GGT--------A-GTCCAGACATC--------ATGTAATTA-CATATGTGTGCAA--G-T-GTT-G-AA--A-A-CCGCTT--AATGTCTG-AAAT-ACATA
gi|27430 : TTTTATG-CTACGTTTTACCAATAAT-AT------GTAGT-CTT--AAT-GACG-ACCT-AA---TGCATAAATT-CA--ATCTCG-ACACA-CA---AGCAAAACTCA-ATACA-ATTTGT--GGGTAAAATA-TTCACCC--TACAAGTA-----TTT-GTTGT-TGGT-TTT-GTCAAT-G-CA-AA-TGCGGAGC--ACGTACTGTCTGGT-GTT-GC-GC-GC--A---------TATATGCA-ATG-TC-ATTTG-GTAC-C--TA---AGT--------A-TTCCAGACATCAATGTACAATGTAATTA-CATGTATGTG--A--G-T-GTT-G-AA--A-A-CCGCTT--AATGTCTG-AAAT-ACATA
gi|27431 : TTTTATG-TTA-GTTTTACCGATAAT-AT------GTAGT-C-------------------A---TGCAAAAATC-CA--ATCTCG-ACACA-CA---AGCAAAAATCA-TTACA-ACTTGT--GGGTAAAGTA-TTCA-CC--TACAAGTACAGCATTT-GTGGT-TGGT-TTT-GTCAAT-G-CA-AA-TGCGGAGC--ACATACTGTTAGGT-GCT-GC-GC-GC--A---------TATATGCA-GTG-TC-ATTTG-GTAC-C-TTG---GGTAATAGTGGA-CTCCAGATAT--------AATGTAA-TA-CATGTA-GTG--A--G-T-GTT---AA--A-A-CCGTTT--AATGTCTG-AAATAACATA
gi|27432 : TTTTATG-TTAAGTTTTACCAATAAT-ACATGTACGTATT-CTT--AAT-GACG-ACCA-CA---TGCAAAAAATACA--ATCTCG-ACACA-CA---AGCAAAACTCATTTACA-ACTTGT--GAGTAAAATATTTCA-CC--TACAAATA-----TTT-GTAAT-TGGTGTTT-GTCAAT-G-CA-AATTGCGGAGC--ACGTACTGTTTTGTGGCT-GC-GC-GT--A---------TATATGCA-GTG-ACAATTTG-GTAC-CTTTG---GGT--------A-CTC
gi|27433 : TTTTATG-CTAAGGTT-ACCATTAAT-AT------GTAGT-TTTTAAAT-GACG-ACCAGCA---TGCAAAATTT-CACAATCTCG-ACA-A-CACCCAGCAAA-CTCC-TTACA-AATTGT--GGGTAAAATA-TTTA-CCTTTACAAGTA-----TTTGGTGAT-TGGC-TTTGGTCAAT-G-CAGAA-TGCGGAGCAAACGCACTGTTCAGT-G-T-GC-----------------------GCA-GTGATC-ATTTGAGTA--C-TTG---GGTAG------A-GTCCAGG-A-C-AT---CAATGTAATTAGCATGTCTGTG--A--G-TGGTT-G-AAATA-A-CCGCTT--AATG-CTGAAAAT-ACATA
gi|27434 : TTTTATG-CTAAGGTT-ACCATTAAT-AT------GTAGT-TTTTAAAT-GACG-ACCAGCA---TGCAAAATTT-CACAATCTCG-ACA-A-CACCCAGCAAA-CTCC-TTACA-AATTGT--GGGTAAAATA-TTTA-CCTTTACAAGTA-----TTTGGTGAT-TGGC-TTTGGTCAAT-G-CAGAA-TGCGGAGCAAACGCACTGTTCAGT-G-T-GC-----------------------GCA-GTGATC-ATTTGAGTA--C-TTG---GGTAG------A-GTCCAGG-A-C-AT---CAATGTAATTAGCATGTCTGTG--A--G-TGGTT-G-AAATA-A-CCGCTT--AATG-CTGAAAAT-ACATA
gi|27435 : TTTTATG-CTAAGTTTTACCAATAAT-AT--------------T--AAT-GACG-ACCA-CA---TGCAAAAATT-CA--ATCTCG-ACACA-CA---AGCGAAACTCA-TTACA-ACATGT--GGATAAAATA-TTCA-CC--TACAAGTA-----CTT-GTG---------------AAT-G-CA-AA-TGCGGAGC--ACGTACTGTTGGGT-GTT-TC-GC-GC--A---------TATATG
gi|27436 : TTTTATGGCTAAGTTTT-CCATTAAT-AT------GTAGT-CTTT-AATTGGCG-ACCA-CAA--TGCAAAA-TT-CA--ATCTCGGACATA-CAC--AGCAAA-TTCA-TTACACAATTGCTGGGGTAAAATAATTTA-TC--TA-AAGTA-----TTT-GTGATGTGGC-TTT-GTCAATTG-TA-AA-TCCGGAGC--ACGTACTGTTTAGT-GTTGGCGGC-GC--A---------TATA-GC---TG-TC-A-TTG-GTACGC-TTGGCCGGT--------A-GTCC-GACATC-A-----ATTGTAA
gi|27437 : TTTTATG-C-AAGTTTTACAGATAATTAT------TAAGT-CTT--AAT-GACA-ACCA-CACTATGCAAAAATC-CA--ATCT-G-ACACAGCA---AGCAAatg
gi|27438 : TTTTATG-CTAAGTTTTAACGATAAA-AT------GTAGT-CTT--AAT-GACGCACTA-CA---
gi|27439 : TTTTACCAATAAT-AT------G----------AAT-GACG-AACA-CA---TGCAAAAATT-CA--ATCTCG-ACACA-CA---AACAAAACTCA-TTACA-ACTTGT--GGGTAAAATA-TTCA-CC--TACAAGTA-----TTT-GTGGC-TGGT-TTT-GTCAGT-G-CA-AA-TGCGGAGC--ACGTACTGTTCGGT-GTT-GC-GC-GCATA---------TATATGCA-GTG-TC-ATTTG-GTAC-C-TTG---GGT--------A-CTCGAGACATCAAT---TGATGTAATTA-CATGTGAGAG--A--G-T-GTT-G-AC--A-A-CCGCTT--AATGTCTA-AAAT-ACAT
gi|27440 : TTTACCAATAAT-AT------GTAGTATTT--AAT-GACA-ACCA-CA---TGCAAAAATC-CA--ATCTCG-ACACA-CA---AGCAAAACTAA-TTACA-ACCTGT--GGGTAAAATA-TTCA-CC--TACATGTA-----TTC-GTTGT-TGGT-TTT-GTCAAT-GCCA-AA-TACGGAGC--ACGTACTGTTCGGT-TGT-GT-AC-GC--A---------AATATGCA-GTG-CC-ATTTG-GTAC-C-TTG---GGT--------ACTTTCAGA---C-AT---CAATGTAATTA-CATGT
gi|27441 : -CA---TGCAAAAATT-CA---TCTCG-ACATA-CA---AGCAAAATTC---TATA--TTTGT--GGAGAATATA-TTCA-CC--TACAACTA-----TTT-GCGGT-TGTT-TTA-ATCAAT-G-CA-AA-TG-------------CTGTTAGAT-ACT-GC-GC-GC--GCATATATTTTATATGCA-GTG-TC-ATGT--GTAC-C-GTG---GAT--------A----CA---ATC-AT---CAGTGAAATTA-----TGTGTG--ACTG-T-GTT-T-AA--A-A-AAGCTT--ATTGGCGG-ATAT-GTATA
gi|27442 : -GTGGT-TGGT-TTT-GTCAAT-G-CA-AA-TGTGGAGC--GCATACTGTTCGGT-GCT-GC-G
gi|27443 : -GC-AT--A---------TATATGCA-GTG-TC-ATTTG-GTAC-
gi|27443 : TATGTG--A--G-T-GTT-G-AA--A-AACCGCTTT-AATGTCTG-AAAT-ACATtatgtgagtgttgaaaaaccgctttaatgtctgaaatacat
gi|27444 : gcatatatatgcagtgtcatttggtacC-AT---CAATGTAATTG-CATGTATGTG--A--G-T-GTT-GAAA--A-A-CCGCTTTAAATGTCTG-AAAT-ACATA
gi|27445 : aggcaaaacaaaaTGTAATTA-CATGTG-GTG--A--GGT-GTTTG-AA--ATA-TCGCTT--AATGTCCT-GAAT-ACATA
blockSeqs : G G T ATGTAC A TA T C G CTA A CA G G CCC T T C TG T C TT CAGCA G G G G T C G T AA G C G G A AT CATATATTT C A A A G T GCC AATAGTGG CT CATCAATGTA G AT CA CT G G T A AT T A TA T A A
blockSeqs : . A . . . TA . . G A . CA . . CCC A . . . A . TT . G . . G . . G . AA . T . . . . . . A . A . . . AG C CATCAAT G GT . . . G . . AT . . T T A .
blockSeqs : . A . . . T . . . . . . . . C A . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . AG G CATCA . AT . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . T ATCAT . CT . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . C CATC . CT . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . C ACAT . GA . . . . . . . . . . G . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . G ACAT . GT . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . G CAT . AT . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . G TAT . AT . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . C CAT . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons : CAT*******
originalCons : TTTTATG-CTAAGTTTTACCGATAAT-AT------GTAGT-CTT--AAT-GACG-ACCA-CA---TGCAAAAATT-CA--ATCTCG-ACACA-CA---AGCAAAACTCA-TTACA-ACTTGT--GGGTAAAATA-TTCA-CC--TACAAGTA-----TTT-GTGGT-TGGT-TTT-GTCAAT-G-CA-AA-TGCGGAGC--ACGTACTGTTCGGT-GCT-GC-GC-GC--A---------TATATGCA-GTG-TC-ATTTG-GTAC-C-TTG---GGT--------A-NTCCAGACATC-AT---CAATGTAATTA-CATGTGTGTG--A--G-T-GTT-G-AA--A-A-CCGCTT--AATGTCTG-AAAT-ACATA
finalCons : TTTTATG-CTAAGTTTTACCGATAAT-AT------GTAGT-CTT--AAT-GACG-ACCA-CA---TGCAAAAATT-CA--ATCTCG-ACACA-CA---AGCAAAACTCA-TTACA-ACTTGT--GGGTAAAATA-TTCA-CC--TACAAGTA-----TTT-GTGGT-TGGT-TTT-GTCAAT-G-CA-AA-TGCGGAGC--ACGTACTGTTCGGT-GCT-GC-GC-GC--A---------TATATGCA-GTG-TC-ATTTG-GTAC-C-TTG---GGT--------A-NTCCAGACAT-------CAATGTAATTA-CATGTGTGTG--A--G-T-GTT-G-AA--A-A-CCGCTT--AATGTCTG-AAAT-ACATA
Alignments
lowQualScore : 11 111 111111111 22222222 11111111111111111
lowQualScore : 3 1 2 888888 2 00 2 2 5 777 0 2 77 2 2 222 4 3 3 0 44 6 3 88 77777 5 2 2 5 2 2 5 2 77 2 5 2 2 2 33 111111111 3 6 3 6 3 3 555 11111111 77 6 44444444444444444 3 6 22 44 44 3 6 3 3 99 3 3 77 1 6 3
lowQualScore : . . . ...... . .. . . . ... . . .. . . ... . . . . .. . . .. ..... . . . . . . . . .. . . . . . .. ......... . . . . . . ... ........ .. . ................. . . .. .. .. . . . . .. . . .. . . .
lowQualScore : 3 4 9 222222 9 77 9 9 3 333 1 9 99 9 9 999 3 1 1 2 22 2 1 55 77777 7 9 9 7 9 9 7 9 99 9 8 9 7 9 99 444444444 1 2 1 2 1 3 888 22222222 66 7 22222222222222222 1 7 22 66 66 3 7 3 3 22 3 3 99 2 7 3
consensus : TTTTATG-CTAAGTTTTACCGATAAT-AT------GTAGT-CTT--AAT-GACG-ACCA-CA---TGCAAAAATT-CA--ATCTCG-ACACA-CA---AGCAAAACTCA-TTACA-ACTTGT--GGGTAAAATA-TTCA-CC--TACAAGTA-----TTT-GTGGT-TGGT-TTT-GTCAAT-G-CA-AA-TGCGGAGC--ACGTACTGTTCGGT-GCT-GC-GC-GC--A---------TATATGCA-GTG-TC-ATTTG-GTAC-C-TTG---GGT--------A-NTCCA-GACAT-------C----A----A-TGTAATTA-CATGTGTGTG--A--G-T-GTT-G-AA--A-A-CCGCTT--AATGTCTG-AAAT-ACATA
Reference ( family-873 ) : TTTTATG-CTAAGTTTTACCGATAAT-AT------GTAGT-CTT--AAT-GACG-ACCA-CA---TGCAAAAATT-CA--ATCTCG-ACACA-CA---AGCAAAACTCA-TTACA-ACTTGT--GGGTAAAATA-TTCA-CC--TACAAGTA-----TTT-GTGGT-TGGT-TTT-GTCAAT-G-CA-AA-TGCGGAGC--ACGTACTGTTCGGT-GCT-GC-GC-GC--A---------TATATGCA-GTG-TC-ATTTG-GTAC-C-TTG---GGT--------A-NTCCA-GACAT-------C----A----A-TGTAATTA-CATGTGTGTG--A--G-T-GTT-G-AA--A-A-CCGCTT--AATGTCTG-AAAT-ACATA
gi|27427 : TTTTATG-CTAAGTTTTACCAATAAT-AT------GTAGT-CTT--AAT-GACG-ACCA-CA---TGCTAAAATT-CA--ATCTCG-ACACA-CA---AGCAAAACTCA-TTACA-ACTTGT--GGGTAAAATA-TTCA-CC--TACAAGTA-----TTT-GTGGT-TGGT-TTT-GTCAAT-G-CA-AA-TGTGGAGC--ACGCACTGTTTAGT-GTT-GC-GC-GC--A---------TATATGCA-TTG-TC-ATTTG-GTAC-C-TTG---GGT--------A-GTCCA-GACAT-------CAATTA----A-TGTAATTA-CATGTGTGTG--A--G-T-ATT-G-AA--A-A-CCGCTT--AATGTCAG-AAAT-ACATA
gi|27428 : TTTTATG-CTAAGTTTTACCGATAAT-AT------GTAGT-CTT--AAT-GACG-ACCA-CA---CGAAAAAATC-CA--ATCTCG-ACACA-CA---AGCAAATCTCA-TTACA-ACTTGT--GGGTAAAATA-TTCG-CC--TACATGTG-----TTT-GTGGT-TGGT-TTT-GCCAAT-G-CA-AA-TGCGGAGC--ACGTACTGTTCGGT-GCT-GC-GC-TT--A---------TATATGAA-GTA-AC-ATTTG-GTAC-C-TTG---GGT--------A-CTCCA-GACAT-------C----A----A-TGTAATTA-CATGTATGTG--A--G-T-GTT-G-AA--A-A-CCGCTT--AATGTCTG-AAAT-ACATA
gi|27429 : TTTTATG-CTAAATTTTACCATTAAT-AT------GTA-T-TTT--AAT-GACG-ACCA-CA---TGCAAAATTT-CA--ATCTCG-ACACA-CA---AGCAAAATTCA-TTACA-AATTGT--GGGTAAAATA-TTTA-CC--TACAAGTA-----TTT-GTGAT-TGGC-TTT-GTCAAT-G-CA-AA-TGCGGAGC--ACGTACTGTTCAGT-GTT-GC-GCAAC--A---------TATATGCACTTG-TC-ATTTG-GTAC-C-TTG---GGT--------A-GTCCA-GACAT-------C---------A-TGTAATTA-CATATGTGTGCAA--G-T-GTT-G-AA--A-A-CCGCTT--AATGTCTG-AAAT-ACATA
gi|27430 : TTTTATG-CTACGTTTTACCAATAAT-AT------GTAGT-CTT--AAT-GACG-ACCT-AA---TGCATAAATT-CA--ATCTCG-ACACA-CA---AGCAAAACTCA-ATACA-ATTTGT--GGGTAAAATA-TTCACCC--TACAAGTA-----TTT-GTTGT-TGGT-TTT-GTCAAT-G-CA-AA-TGCGGAGC--ACGTACTGTCTGGT-GTT-GC-GC-GC--A---------TATATGCA-ATG-TC-ATTTG-GTAC-C--TA---AGT--------A-TTCCA-GACATCAATGTAC----A----A-TGTAATTA-CATGTATGTG--A--G-T-GTT-G-AA--A-A-CCGCTT--AATGTCTG-AAAT-ACATA
gi|27431 : TTTTATG-TTA-GTTTTACCGATAAT-AT------GTAGT-C-------------------A---TGCAAAAATC-CA--ATCTCG-ACACA-CA---AGCAAAAATCA-TTACA-ACTTGT--GGGTAAAGTA-TTCA-CC--TACAAGTACAGCATTT-GTGGT-TGGT-TTT-GTCAAT-G-CA-AA-TGCGGAGC--ACATACTGTTAGGT-GCT-GC-GC-GC--A---------TATATGCA-GTG-TC-ATTTG-GTAC-C-TTG---GGTAATAGTGGA-CTCCA-GATAT------------A----A-TGTAA-TA-CATGTA-GTG--A--G-T-GTT---AA--A-A-CCGTTT--AATGTCTG-AAATAACATA
gi|27432 : TTTTATG-TTAAGTTTTACCAATAAT-ACATGTACGTATT-CTT--AAT-GACG-ACCA-CA---TGCAAAAAATACA--ATCTCG-ACACA-CA---AGCAAAACTCATTTACA-ACTTGT--GAGTAAAATATTTCA-CC--TACAAATA-----TTT-GTAAT-TGGTGTTT-GTCAAT-G-CA-AATTGCGGAGC--ACGTACTGTTTTGTGGCT-GC-GC-GT--A---------TATATGCA-GTG-ACAATTTG-GTAC-CTTTG---GGT--------A-CTC
gi|27433 : TTTTATG-CTAAGGTT-ACCATTAAT-AT------GTAGT-TTTTAAAT-GACG-ACCAGCA---TGCAAAATTT-CACAATCTCG-ACA-A-CACCCAGCAAA-CTCC-TTACA-AATTGT--GGGTAAAATA-TTTA-CCTTTACAAGTA-----TTTGGTGAT-TGGC-TTTGGTCAAT-G-CAGAA-TGCGGAGCAAACGCACTGTTCAGT-G-T-GC-----------------------GCA-GTGATC-ATTTGAGTA--C-TTG---GGTAG------A-GTCCAGGACAT-------C----A----A-TGTAATTAGCATGTCTGTG--A--G-TGGTT-G-AAATA-A-CCGCTT--AATG-CTGAAAAT-ACATA
gi|27434 : TTTTATG-CTAAGGTT-ACCATTAAT-AT------GTAGT-TTTTAAAT-GACG-ACCAGCA---TGCAAAATTT-CACAATCTCG-ACA-A-CACCCAGCAAA-CTCC-TTACA-AATTGT--GGGTAAAATA-TTTA-CCTTTACAAGTA-----TTTGGTGAT-TGGC-TTTGGTCAAT-G-CAGAA-TGCGGAGCAAACGCACTGTTCAGT-G-T-GC-----------------------GCA-GTGATC-ATTTGAGTA--C-TTG---GGTAG------A-GTCCAGGACAT-------C----A----A-TGTAATTAGCATGTCTGTG--A--G-TGGTT-G-AAATA-A-CCGCTT--AATG-CTGAAAAT-ACATA
gi|27435 : TTTTATG-CTAAGTTTTACCAATAAT-AT--------------T--AAT-GACG-ACCA-CA---TGCAAAAATT-CA--ATCTCG-ACACA-CA---AGCGAAACTCA-TTACA-ACATGT--GGATAAAATA-TTCA-CC--TACAAGTA-----CTT-GTG---------------AAT-G-CA-AA-TGCGGAGC--ACGTACTGTTGGGT-GTT-TC-GC-GC--A---------TATATG
gi|27436 : TTTTATGGCTAAGTTTT-CCATTAAT-AT------GTAGT-CTTT-AATTGGCG-ACCA-CAA--TGCAAAA-TT-CA--ATCTCGGACATA-CAC--AGCAAA-TTCA-TTACACAATTGCTGGGGTAAAATAATTTA-TC--TA-AAGTA-----TTT-GTGATGTGGC-TTT-GTCAATTG-TA-AA-TCCGGAGC--ACGTACTGTTTAGT-GTTGGCGGC-GC--A---------TATA-GC---TG-TC-A-TTG-GTACGC-TTGGCCGGT--------A-GTCC--GACAT-------C----A----ATTGTAA
gi|27437 : TTTTATG-C-AAGTTTTACAGATAATTAT------TAAGT-CTT--AAT-GACA-ACCA-CACTATGCAAAAATC-CA--ATCT-G-ACACAGCA---AGCAAatg
gi|27438 : TTTTATG-CTAAGTTTTAACGATAAA-AT------GTAGT-CTT--AAT-GACGCACTA-CA---
gi|27439 : TTTTACCAATAAT-AT------G----------AAT-GACG-AACA-CA---TGCAAAAATT-CA--ATCTCG-ACACA-CA---AACAAAACTCA-TTACA-ACTTGT--GGGTAAAATA-TTCA-CC--TACAAGTA-----TTT-GTGGC-TGGT-TTT-GTCAGT-G-CA-AA-TGCGGAGC--ACGTACTGTTCGGT-GTT-GC-GC-GCATA---------TATATGCA-GTG-TC-ATTTG-GTAC-C-TTG---GGT--------A-CTCGA-GACAT-------C----AATTGA-TGTAATTA-CATGTGAGAG--A--G-T-GTT-G-AC--A-A-CCGCTT--AATGTCTA-AAAT-ACAT
gi|27440 : TTTACCAATAAT-AT------GTAGTATTT--AAT-GACA-ACCA-CA---TGCAAAAATC-CA--ATCTCG-ACACA-CA---AGCAAAACTAA-TTACA-ACCTGT--GGGTAAAATA-TTCA-CC--TACATGTA-----TTC-GTTGT-TGGT-TTT-GTCAAT-GCCA-AA-TACGGAGC--ACGTACTGTTCGGT-TGT-GT-AC-GC--A---------AATATGCA-GTG-CC-ATTTG-GTAC-C-TTG---GGT--------ACTTTCA-GACAT-------C----A----A-TGTAATTA-CATGT
gi|27441 : -CA---TGCAAAAATT-CA---TCTCG-ACATA-CA---AGCAAAATTC---TATA--TTTGT--GGAGAATATA-TTCA-CC--TACAACTA-----TTT-GCGGT-TGTT-TTA-ATCAAT-G-CA-AA-TG-------------CTGTTAGAT-ACT-GC-GC-GC--GCATATATTTTATATGCA-GTG-TC-ATGT--GTAC-C-GTG---GAT--------A----CA-ATCAT-------C----A----G-TGAAATTA-----TGTGTG--ACTG-T-GTT-T-AA--A-A-AAGCTT--ATTGGCGG-ATAT-GTATA
gi|27442 : -GTGGT-TGGT-TTT-GTCAAT-G-CA-AA-TGTGGAGC--GCATACTGTTCGGT-GCT-GC-G
gi|27443 : -GC-AT--A---------TATATGCA-GTG-TC-ATTTG-GTAC-
gi|27443 : TATGTG--A--G-T-GTT-G-AA--A-AACCGCTTT-AATGTCTG-AAAT-ACATtatgtgagtgttgaaaaaccgctttaatgtctgaaatacat
gi|27444 : gcatatatatgcagtgtcatttggtacA-AACAT-------C----A----A-TGTAATTG-CATGTATGTG--A--G-T-GTT-GAAA--A-A-CCGCTTTAAATGTCTG-AAAT-ACATA
gi|27445 : aggcaaaaca-TGTAATTA-CATGTG-GTG--A--GGT-GTTTG-AA--ATA-TCGCTT--AATGTCCT-GAAT-ACATA