lowQualScore                  :                           333                                                                                                                        1111                                                                                  
lowQualScore                  :        5  111 22222 333 0 222    2 1111111 222 0 00  11  0 0 0  111  0 0 77777777777 0 222222  00 0000 111  1111 111 0 0 0 0000 2222 1 00 0 0 33333  8888 0 0 0   0   0 111 000 11111 0 0 0 000  0   22 0  0   0 0   11111  1 0      0 0   
lowQualScore                  :        .  ... ..... ... . ...    . ....... ... . ..  ..  . . .  ...  . . ........... . ......  .. .... ...  .... ... . . . .... .... . .. . . .....  .... . . .   .   . ... ... ..... . . . ...  .   .. .  .   . .   .....  . .      . .   
lowQualScore                  :        2  000 22222 444 5 222    6 7777777 777 5 77  00  4 4 8  444  4 4 00000000000 4 111111  55 9999 222  3333 111 4 8 8 9999 6666 2 66 4 8 88888  3333 4 4 4   4   4 555 777 88888 4 4 8 777  8   66 4  4   4 4   00000  6 8      8 4   
consensus                     :     ATACAC---A-----A---G-A-GATTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC-A-CA-A-A--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
Reference ( gi|120351 )       :     ATATAC---A-----A---G-A---TTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC-A-CA-A-A--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-C--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120344                     :     ATACAC---A-----A---G-AAGAGTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC-A-CA-A-A--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA----T-G-A-AAT-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120345                     :     ATACAC---A-----A---G-AAGATTTT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC-A-CA-A-A--T-G-G-T-AT-T---G--TT-AA----C-C-AT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120346                     :     ATACAC---A-----A---G-AAGATTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-T-TC-A-CA-A-A--G-G-A-T-AT-T---G--TT-AA----C-C-GT----T---C-A-A-G----ATTCAA-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120347                     :     ATACAC---A-----A---G-AAGATTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-T-TC---CA-A-A--G-G-A-T-AT-T---G--TT-AA----C-C-GT----T---C-A-A-G----ATTCAA-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120352                     :     ATACAC---A-----A---G-ACGATTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC-A-CA-A-A--T-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-GT----T---C-A-A-A----A----T-T--T-T-T-----AA-A--A-G-A-AAA-CCA-T---A---C-----T-G-C-A---AC-TTT--A-AT-GCC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120348                     :     ATACAC---A-----A---G-AAGATTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-T-TC-A-CA-A-A--G-G-A---ATAT---G--TT-AA----C-C-GT----T---C-A-A-G----ATTCAA-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AA--CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120353                     :     ATACAT---A-----A---G-ACAATCAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC-A-CA-A-A--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-GT----T-------A-A----A----A-T--G-T-T-----AA-A--A-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---GC-TTT--A-AT-GCC-C-AGT-----GA-G-CTTAAC-C-TTT
gi|120377                     :     ATACAC---A-----A---G-A---TTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC-A-CA-A-A--G---------------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA----T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-C-TGAC-C-TTT
gi|120364                     :     ATACAC---A-----A---G-ACGATTAT-C-------A---T-T--TT--AA-T-C-TC-A-CA-T-A--G-A-G-T-GT-T---C--TT-AA----C-C-GT----T---G-G-A-G----A----A-T--T-T-T-----CA-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AT-TTT--C-AT-GTC-T-AGT-----GA-G-CTTGAT-C-TTT
gi|120357                     :     ATACAC---A-----A---G-AAGATTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC-A-C--A-A--T-A-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-AT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-TA----AA-A--T-G-G-AAA-CCA-T---A---A-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-A-TATGAC-C-
gi|120378                     :     ATACAC---A-----A---G-A---TTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC-A-CA-A-G------------------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AA--CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120359                     :     ATACAC---A-----A---G-ACAATTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC-A-CA-A-A--T-G---T-GT-T---G--TT-AA----C-C-GT----T---C-A-A-A----A----T-T--T-T-T-----AA-A--A-G-A-AA--CCA-C---A---C-----T-G-C-A---AC-TTT--A-AT-GCC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120381                     :     ATACAC---A-----A---G-A---TTAT-C-----------T-T--TC--AA-T-C-TC-A-CA-------------------------C-AA----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTC--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120362                     :     ATACAC---A-----A---G-ACGATCAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-CC-A-CA-A-A--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-T-GT----T---C-A-A-A----A----A-T--T-C-T-----AA------A-G-GAA-TCA-G---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT----AT-GCC-C-AGT-----GA-G-CTTGAT-C-TTT
gi|120360                     :     ATACAT---A-----A---G-ACGATTAT-C-------A---T-T--TC--A--T-C-TC-A-CA-A-A--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-GT----T---C-A-A-A----A----T-T--T-T-T-----AA-A--A-T-A-GAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-A---AC-TTT--A-AT-ACG-T-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120372                     :     ATACAC---A-----A---G-A---TTAA-C-------AGA-T-T--TC--A--T-C-TC-A-CATA-A--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AT----C-C-AT----T---C-A-A-A----A----A-T--T-A-A-----AA-A--A-G-A-AAATCCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-ATT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120370                     :     ATATACCACA-----A---G-A---TTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC---CA-A-A--G---------------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--A-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-A-TTT
gi|120392                     :     ATACAC---A-----A---G-A---TTAT-C-------A---T-T---C--AA-TTC-TC-A-CA-A--------G-A-GT-T---G--TT---------------------C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC--TT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120373                     :     ATACAC---AGA---A---G-A---TTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC-A-CA-------------------------C-GA----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----TA-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120367                     :     ATACAC---A-----A---G-AAGATTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC-A-CA-------------------------C-GA----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----TA-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120366                     :     ATACAC---A-----A---G-AAGATTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC-A-CA-------------------------C-GA----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----TA-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120399                     :     ATACAC---A-----A---G-A---TTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC-A-CA-A-------------------------GA----T-T-GT----T---C-A-ATG----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-TATGA---T-----T-G-C-T---AC-TTTA-A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120365                     :     ATACAC---A-----A---G-AGA-TTAT-T-------A---T-T--TT--AA-T---TC-T-CA-ATA--G-A-G-T-GT-T---T--TT-AA----C-C-GT----T---G-G-A-G----A----A-T--T-T-T-----CA-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AT-TTT--C-AT-GTC-T-AGT-----GA-G-CTTGAT-C-TTT
gi|120400                     :     ATACAC---A-----A---G-A---TTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC-A-CA-A-A-----------T-T-------------------GT----T---C-A-A-A----A----A----T-T-T-----AA-A--T-G-A-AA---CA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120368                     :     ATACAG---A-----A---G-ACAATTAT-C-------A---T-T--TCC-AA-T-CCTC-A-CA-A-A--TTG-G-T-GT-T---G--TT-AA----A-T-GT----T---C-A-A-A----A----A-T--T-T-T-----AA-A--A-G-A-AAA-CCA-T---A---C-----T-G-C-A---AC-TTT--A-A--GCC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120369                     :     ATACAC---A-----A---G-A---AGAT-T-------A---T-TCATC--AA-T-C-TC-A-CA-A-A--G-G-G-T-GT-A---G--TT-AA----C-A-GT----T---C-A-A-ATTTCA----ATT--T-T-T-----AA-A--T-G---AAA-CCA-T---A---C-----T-G-C-C---AC--TT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TCT
gi|120371                     :     ATACAC---A-----A---G-AAGATTAT-T-------A---T-T--TC--AA-T-T-TC---CA-A-C--G-A---------------TT-A----------T----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120391                     :     ATATAC---A-----AAGAG-A---T-ATAC-------A---T-T--TC--AA-T-C-CCCA-CA-A-C--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-ATG---T---C-A-A-A----A----A-GGGT-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-G---A---T-----T-G-C-T---AC-TTA--A-AT-GCC-C-AGT-----GC-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120387                     :     ATACAC---A-----A---G-A---TTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC-A------A--G-A------T-T---G--TT-CA--------------------A-A-G----A----A-T--T-T-TA----AA-A--T-G---AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120388                     :     ATACAC---A-----A---G-A---TTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC-A-CA-G-A--G-G-G-T-GT-T---G--TA-AA----C-C-A------------------------------T-T-T-----AA-T--T-G-A-ATA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC------A-AT-GTC-A-ATT-----GA-G-CATGAC-C-TTT
gi|120405                     :     ATACAC---A-----A---G-A---TTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC---CA-A-G--A--------T-T---G--TT-CA--------------------A-A-G----A----A-T--T---------AA----T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120404                     :     ATACAC---A-----A---G-A---TTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC-A-C--A-A--G-A-T-T-GT--------TT-AA----C-------------------G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---ACATAT--T-AT-GTC-C-AGA-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120389                     :     ATACAC---A-----AAAAG-A---TTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-AC-A-CA-A-A--T-G-G-T-GT-T---T--TA-AA----C-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-C--T-T-T-----AA-T--T-G-A-ATA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---GC-AAT--A-AT-GTC-A-ATT-----GG-G-ATTGAC-A-TTT
gi|120374                     :     ATACAC---A-----A---G-AAGATTATTC-------A---T-T---C--AA-T-C-TC-A-CA-A-A--G-G-G-T-GC-T---G--TT--A----T-C-AT----T---C-A-A-A----G----A-T--T-C-T-----AA-A--T-G---AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---GC-TTT--A-AT-GGC-C-A-T-----GA-G-CTTGAC-T-TT
gi|120397                     :     ATACAC---A-----AA--G-A---TTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC-A-CA-A-G------------------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-------------------C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120406                     :     ATACAC---A-----A---G-A---TTAT-C-------A-----T--TC--AA-T-C-TC-A-CA-G-A-----------T-T-------------------GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA--CA-T---A---------T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TT
gi|120380                     :     ATACAC---A-----AAAAG-A---TTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC-A-CA-------------------------C-GA----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TAT--A-CT-GTC-C-AGT-----GA-C-CTTGAC-C-TTT
gi|120375                     :     ATACAC---A-----A---G-AAGATTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC-A-CA-A-G------------------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-------------------C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120386                     :     ATACAC---A-----A---G-AAGATTAT-C-------A---C-T--TC--AT-T-C-TC-A-CA-------------------------C-GA----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA----T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC--TT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120379                     :     ATACAC---A-----A---G-AAGATTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC-G-C-----------G-C-G-------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----TA-A--T-G-A-AAA-CTA-T---A---T-----T-G-C-T---AT-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-ATTGAC-C-TTT
gi|120376                     :     ATACAC---A-----A---G-ACGATTAT-C-------A---T-T---C--AA-T-C-TC-A-CA-A-AT-G-G-G-T-----------TT-AA----C-C-GT----T---C-ATA-T----A----A-T--T-T-T-----AA-AAAG-G-A-AAA-CCA-T---A---C-----T-GGC-A---AC-TTT--A-AT-GCC-C-AAT-----GA-G-CTTGAC-C-T
gi|120384                     :     ATACAC---A-----A---G-AAGATTAT-C-------A---A-T--TC--AA-T-C-TC-A-CG-A-C--A-A-T-T-G------G--TT-----------------T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-TT----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-TA--A---T-----T-G-C-T----C-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120383                     :     ATACAC---A-----A---G-AAGATTAT-C-------A---A-T--TC--AA-T-C-TC-A-CG-A-C--A-A-T-T-G------G--TT-----------------T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-TT----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-TA--A---T-----T-G-C-T----C-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120382                     :     ATACAC---A-----A---G-ACAATTAT-C-------A---T-G--TC--AA-T-C-TC-A-CA-A-AT-G-GTG-T-GT-T---A--TT-AA----CAC-GT----T---C-AGA-A----A----A-T--T-T-T-----AAGA--A-G-A-AAA-CCA-T---A---G-----C-G-C-A---AC-TTT--A-AT-G-C-C-AGT-----GA-G-C-TGACAC-TTT
gi|120394                     :     ATACAC---A-----A---G-ACATTTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC-A-CA-A-A--T-G-G-T-GT-TCCCG--TT-AA----C-C-AT----T-------------------A-T--T-T-TTTTTTAA-A--A-G-A-AAA-CCA-T---A---C-----T-G-G-T---AC-TTT--A-AT-GCC-C-AGT-----GA-G-CTT
gi|120390                     :     ATACAC---A-----A---G-AAGATTAT-C-----------T-T--TC--AA-T-C-TC-A-CA-C-A-----------T-T-------------------GT----T---C-A-A-G----A----C-T--T-T-T-----AA-A--T-G---AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGCC-C-TTT
gi|120385                     :     ATACAC---A-----A---G-ACAATTAT-C-------A---T-T---C--AA-T-C-TC-A-CA-A-ATTG-T-G-T-GT-T---G--TTAAA----C-C-GT----T---C-A-A-A----A----A-T--TAT-T-----AA-A--A-G-A-AAA-CCATT---ACTTT-----C-G-C-A---ACTTTT--A-AT-GCC-C-ATT-----GA-GTCTTGAC-C-TTT
gi|120402                     :     ATACAC---A-----A---G-----TTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC-C-CA-A-A----G-G-T-GT-T---G---C-AT----T-T-GT----T---C-A-A-A----A----A-T--T-TAA-----AA-A--A-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AT-CTT-----T-GCC-C-AGT-----GA-G-CTTGACGC-TTT
gi|120408                     :     ATACAC---A-----A---GGA---TTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC-A-CA-A-G------------------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AA--CCA-------------------C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-A-TTTGAC-C-TTT
gi|120401                     :     ATACAC---A-----A---G-AAGATTAT-C-------A---T-T--TC--AT-T-C-TC-A-CC-G-A-----------T-T-------------------GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----TA-A--T-G-G-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-CTT---AC-TTT----AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120403                     :     ATACAC---A-----A---G-AAGATTAT-C-------A---T----------------------------G-G-G-T-GT-T---------AA----C-C-GT----A---C-T-A-G----A----A-A--T-T-C-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-ATC-C-AGT-----GA-G-TTTGAC-C-TTT
gi|120393                     :     ATACAC---A-----A---G-AAGATTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC-A-CA-A-------------------------GA----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A----T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-------------------C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-T-AGT-----GA-G-C-TGAC-C-TTT
gi|120358                     :     ATACAC---A-----A---G-AAGATTAT-C-------A---T-----C--AA-T-C-TC-T-CA-A-A--G-G---T-GT-T---G--TT-AA----C-A-TT----T---CAA-A-G----A----A------T-T-----AA-A--T-G-A-AAA--CA-T---A---------T-G-T-A---GC-TTTA-A-AT-GTC-C-AGT-----G--G-CTTGAC-C-TTT
gi|120407                     :     ATACAC---A-----A---G-AAGATTAT-C-------A---T-T--T---AA-T-T-TC-A-CA---------------T-C---G--AT-------C-T-AT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-AA-T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----TGG-C-T---AC-TTTA-A-AT-GTC-C-AGT-----G--G-CTTGGA-C-TTT
gi|120454                     :      TACAC---A-----A---G-A---TTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC-A-CA-A-------------------------GA----T-T-GT----T---C-A-A-G---------A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--ATAT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120455                     :      TACAC---A-----A---G-A---TTAT-C-------A---T-T--TC--A--T-CATC-AACA-A-A--G-A---T-GT-T---G--TT-AT----C-C-AT----TTTTC-A-A-A----A----A-T--T-G-A-----AA-A--AAG-A-AAA-TCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GCC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-T-TTT
gi|120355                     :       ATAC---ATAAGTA---G-A---TTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC-A-CA-G-A--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-AT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--C-G---TAA-TCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TCT--A-AT-GTC-T-AGT-----GT-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120466                     :       ACAC---A-----A---G-AGA-TTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC-A-CA-G-A-----------T-T-------------------GT----T---C-A-A-T----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-GAA-AAA-ACA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-T-CTTGAC-C-TTT
gi|120473                     :         AC---A-----A---G-A---ATGT-T-------A---TAT--TT--AA-T-C-TC-A-CA-A-A--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA------C-GT----T---C-A-A-G----A---------T-T-T-----AA-T--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-C-CAT---AC-TTTAAA-AT-GTC-C-AGCACAAGAA-G-CCAGAC-C-TTT
gi|120478                     :         cC---A-----A---G-A---ATAT-CCCCGCTTA---C-C--CC--AG-T-C-TC-C-TA-A-A--G-G-G-T-GT-T---A--TT-AA----T-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AA-TTT--A-CT-GTC-C-CAT-----CA-G-CTTGAT-C-ATT
gi|120354                     :           ---A-----A---G-A---TTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-AC-A-AG-A-A--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----TA-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---C-----C-C-C-T---AT-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TT
gi|120361                     :  acacacaag---A-----A---G-A---TAAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC-A-CA-A-A--A-A-G-T-GT-T---G--TT-AA----T-C-AT----T---C-A-A-G----A----A-T--C-TAT-----AA----T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-CTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-TTTGAC-T-TT
gi|120363                     :  atacataag---A-----A---A-A---TTATGC-------AG--T-T--TC--AA-T-C-TC-A-CA-A-A--G-G-G-TTGT-T---G--TT-AA----C-C-AT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-TT----AA-A--T-A-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTC--A-AT-GTC-A-AGT-----GACG-CTTGAC-C-TTT
gi|120451                     : atacacacag---A-----A---G-A---TTAT-C-----------T-T--TC--A--T-C-TC-A-CA-A-A--G-G-G-T-AT-T---G--TT-AA----C-C-AT----T-----A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--A-G-G-AAA-TCA-T---A---T-----T-G-C-T---AA-TTT--A-AT-GTC-C-AAT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120452                     :   tacacaag---A-----A---A-A---TTATGC-------AG--T-T--TC--AA-T-C-CA-A-CA-A-A--G-G-T-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-AT----T---C-A-A-G----A----A----T-T-T-----AA-A--T-A-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTC--A-AT-GTC-A-AGT-----GACG-CTTGAC-C-TTT
gi|120453                     :  tacacacag---A-----A---A-A---TTATGC-------GAGTT-T--TC--AA-T-C-TC-AACA-A-A--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-AT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-TT----AA-A--T-A-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTC--A-AT-GT--C-AAT-----GACG-CTTGAC-C-TTT
gi|120465                     :  tacacacag---A-----A---G-A---TTAT-A-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC-A-CA-A-A--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C---------------------------A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----
gi|120486                     :    acacaag---A-----A---G-A---TTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC-A-CA-A-G------------------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT----AT-GT--C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120396                     :           ---A-----A---G-A---TTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC---TA-A-C--G---------------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-TATAAC-TTCG-A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120458                     : ataccacaag---A-----A---G-A---TTA--C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TT-A-CA-A-C--G-GTG-T-TT-T---G--TT-AA----C-A-GT----TA--C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-TG-T-G-A-AAA-CCA-T---A---TG----T-A-C-C---AC---T--A-AT-TTC-C-AGT-----GA-GCCTTGAC-T-TTT
gi|120398                     : tacacaaagg---A-----A---G-A---TTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TT-G-CA-C------G-A-T-GT-T---G--T----------------------C-A-A-G----A----AAT--T-T-T-----AA-AA-T-G-A-AAA-CCA-T---A---TCAAATT-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GAGG-CTTGAC-C-TCT
gi|120457                     : atatcacaag---A-----A---G-A---TTAT-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC-A-CA-------------------------C-AA----T-T-GT----T---C-A-A------A----A-T--T-T-G-----AA-A--T-G---AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTT-C--GT-----GA-G-CTTG-C-C-TTT
gi|120456                     :             tacacaag---G-A---TTAT-C-------A---T-G--TC--AAAT-C-TC-A-CA-C-A--G-G-G-T-----------TT-----------GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----TA-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---TA----T-G-C-T---AC-TTTA-A-AT-GTC-C-AGT-----AA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120489                     :                  tactacaggaaggTAC-C-------A---T-T--TC--AA-T-C-TC-A-GA-A-A--G-G-GAT-GT-T---G--TT-AATTTTC-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-G-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCG-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGA-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120472                     :                                 T-T-------A---T-C--CC--AT-T-C-TC-C-CA-A-A--G-G-G-T-GT-T---G--TC-AG----C-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-ATC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120490                     :               cactaagaatatccctacT-T-------A---C-T--CC--AA-T-T-TC-C-CA-A-A--T-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-TT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-ATT-----GA-G-TTCGGC-C-TTT
gi|120493                     :                                  -C-------A---C-T--TCCAAA-A-C-TC-C-CA-A-A--G-G-G-C-GT-T---G--TG-AA----C-C-GT----A---C-A-A-G----A----C-G--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-T-TTT
gi|120494                     :                                                  --TC--AA-T-C-TC-C-CG-A-A--G-G-G-T-AT-T---A--TT-AA----T-T-CT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-G-----AA-A--T-G-G-AAA-TCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--T-AT-GTC-C-AGA-----GG-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120467                     :                                                  --TC--AA-T-C-TC-A-CA-A-A--G-G-G-T-AT-T---GAGCT-AT----T-T-GT----T---C-A-A-A----A----G-A--T-T-T-----AA-A--A-A-AGAAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GCCGC-AGT-----GA-G-CTTGAC-T-TTT
gi|120496                     :                              acataaaataatcaatcaatcaaC--AA-A-C-TC-C-CA-A-A--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-C---A---T-----A-A-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120497                     :                                                     C--AA-T-C-TC-T-CA-A-A--G-G-G-T-AT-T---G--TT-AA----C-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-G-----AA-A--T-G-G-AAA-TCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120498                     :                                                     C--AA-T-C-TC-C-CA-A-A--G-G--------T---G--TT-AA----C-C-AT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-TCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120499                     :                                                     C--AA-T-C-TC-C-AA-A-A--G-G-G-T-GT-T---C--TT-AA----C-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--C-G-G-AAA-CCA-G---A---T-----T-G-T-T---AC-TTC--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120500                     :                                                     C--AA-T-C-CC-C-CA-A-A--G-G-G-T-GT-T---G--GT-TA----C-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-TTA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-A-AGT-----GA-G-CATGAC-C-TTT
gi|120501                     :                                                     C--AA-T-C-TC-C-TA-A-A--A-T-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-G-ATA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AT-TTA--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAT-CATTT
gi|120502                     :                                                     C--AA-T-C-TC-C-CG-A-A--G-G-G-T-AT-T---G--TT-AA----C-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-A-----AA-A--T-A-G-AAA-TCA-T---A---T-----C-A-C-T---AC-CTT--T-AT-GTC-C-AGA-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120504                     :                                                     C--AA-T-C-TC-C-CG-A-A--G-G-G-C-AT-T---G--TT-AA----C-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-G-----AA-A--T-A-G-AAA-TCA-T---A---T-----T-G-C-A---AC-CTT--T-AT-GTC-C-AGA-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120503                     :                                                     C--AA-T-C-TC-C-CG-A-A--G-G-G-T-GT-C---G--T---A----C-CTGT----T---C-A-AAG----A----A-T--T-T-TG----AA-A--T-G-G-AAA-TCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-A-ATT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
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gi|120519                     :                                                      --AA-T-C-TC-C-CG-A-A--G-G-G-T-AT-T---G--TT-AA----C-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-G-----AA-A--T-G-G-AAA-TCA-T---A---T-----T-G-C-T---AT-CTT--T-AT-GTC-C-AGA-----GA-G-TTTGAC-C-TTT
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Alignments
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lowQualScore                  :                   . .     ... ...  . .  .  ...    ..  . . .  ...  .  ........ ..  ......  .. .... ...  .... ... . . . .... .... . .. . . .....  . .. . . .   .   . ... ... ..... . . . ...  .   .. .  .   . .   .....  . .      . .   
lowQualScore                  :                   6 1     555 666  5 5  6  777    00  8 4 8  111  4  11111111 11  222222  55 9999 111  3333 111 4 8 8 9999 5555 2 66 4 4 88888  8 33 4 4 4   4   4 555 777 88888 4 4 8 777  8   55 4  4   4 4   00000  6 8      8 4   
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Reference ( family-87 )       :                ATA-C-ACAAG---A-G-AT-T-AT-CA---TTTC--AA-T-C-TC-A-CA-AA--G-G-G-T-GTT---G--TT-AA----C-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120344                     :                ATA-C-ACAAG---AAG-AG-T-AT-CA---TTTC--AA-T-C-TC-A-CA-AA--G-G-G-T-GTT---G--TT-AA----C-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T------A-A--T-G-A-AAT-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
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gi|120352                     :                ATA-C-ACAAG---ACG-AT-T-AT-CA---TTTC--AA-T-C-TC-A-CA-AA--T-G-G-T-GTT---G--TT-AA----C-C-GT----T---C-A-A-A----A----T-T--T-T-T-----AA-A--A-G-A-AAA-CCA-T---A---C-----T-G-C-A---AC-TTT--A-AT-GCC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
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gi|120368                     :                ATA-C-AGAAG---ACA-AT-T-AT-CA---TTTCC-AA-T-CCTC-A-CA-AA--TTG-G-T-GTT---G--TT-AA----A-T-GT----T---C-A-A-A----A----A-T--T-T-T-----AA-A--A-G-A-AAA-CCA-T---A---C-----T-G-C-A---AC-TTT--A-A--GCC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120369                     :                ATA-C-ACAAG---AAG-AT-T-ATTCA---T--C--AA-T-C-TC-A-CA-AA--G-G-G-T-GTA---G--TT-AA----C-A-GT----T---C-A-A-ATTTCA----ATT--T-T-T-----AA-A--T-G---AAA-CCA-T---A---C-----T-G-C-C---AC--TT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TCT
gi|120370                     :                ATA-CCACAAG---A----T-T-AT-CA---TTTC--AA-T-C-TC---CA-AA--G--------------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--A-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-A-TTT
gi|120371                     :              atATA-C-ACAAG---AAG-AT-T-AT-TA---TTTC--AA-T-T-TC---CA-AC--G-A--------------TT-A----------T----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120372                     :                ATA-C-ACAAG---A----T-T-AA-CAGA-TTTC--A--T-C-TC-A-CATAA--G-G-G-T-GTT---G--TT-AT----C-C-AT----T---C-A-A-A----A----A-T--T-A-A-----AA-A--A-G-A-AAATCCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-ATT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120373                     :                ATA-C-ACAGA---A-G-AT-T-AT-CA---TTTC--AA-T-C-TC-A-CA-----------------------C-GA----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----TA-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120374                     :                ATA-C-ACAAG---AAG-AT-T-ATTCA---TT-C--AA-T-C-TC-A-CA-AA--G-G-G-T-GCT---G--TT--A----T-C-AT----T---C-A-A-A----G----A-T--T-C-T-----AA-A--T-G---AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---GC-TTT--A-AT-GGC-C-A-T-----GA-G-CTTGAC-T-TT
gi|120375                     :                ATA-C-ACAAG---AAG-AT-T-AT-CA---TTTC--AA-T-C-TC-A-CA-AG-----------------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-------------------C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120376                     :                ATA-C-ACAAG---ACG-AT-T-AT-CA---TT-C--AA-T-C-TC-A-CA-AAT-G-G-G-T----------TT-AA----C-C-GT----T---C-ATA-T----A----A-T--T-T-T-----AA-AAAG-G-A-AAA-CCA-T---A---C-----T-GGC-A---AC-TTT--A-AT-GCC-C-AAT-----GA-G-CTTGAC-C-T
gi|120377                     :                ATA-C-ACAAG---A----T-T-AT-CA---TTTC--AA-T-C-TC-A-CA-AA--G--------------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA----T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-C-TGAC-C-TTT
gi|120378                     :                ATA-C-ACAAG---A----T-T-AT-CA---TTTC--AA-T-C-TC-A-CA-AG-----------------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AA--CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120379                     :                ATA-C-ACAAG---AAG-AT-T-AT-CA---TTTC--AA-T-C-TC-G-C----------G-C-G------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----TA-A--T-G-A-AAA-CTA-T---A---T-----T-G-C-T---AT-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-ATTGAC-C-TTT
gi|120380                     :                ATA-C-ACAAA---AAG-AT-T-AT-CA---TTTC--AA-T-C-TC-A-CA-----------------------C-GA----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TAT--A-CT-GTC-C-AGT-----GA-C-CTTGAC-C-TTT
gi|120381                     :                ATA-C-ACAAG---A----T-T-AT-C----TTTC--AA-T-C-TC-A-CA-----------------------C-AA----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTC--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120382                     :                ATA-C-ACAAG---ACA-AT-T-AT-CA---TGTC--AA-T-C-TC-A-CA-AAT-G-GTG-T-GTT---A--TT-AA----CAC-GT----T---C-AGA-A----A----A-T--T-T-T-----AAGA--A-G-A-AAA-CCA-T---A---G-----C-G-C-A---AC-TTT--A-AT-G-C-C-AGT-----GA-G-C-TGACAC-TTT
gi|120383                     :                ATA-C-ACAAG---AAG-AT-T-AT-CA---ATTC--AA-T-C-TC-A-CG-AC--A-A-T-T-G-----G--TT-----------------T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-TT----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-TA--A---T-----T-G-C-T----C-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120384                     :                ATA-C-ACAAG---AAG-AT-T-AT-CA---ATTC--AA-T-C-TC-A-CG-AC--A-A-T-T-G-----G--TT-----------------T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-TT----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-TA--A---T-----T-G-C-T----C-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120385                     :                ATA-C-ACAAG---ACA-AT-T-AT-CA---TT-C--AA-T-C-TC-A-CA-AATTG-T-G-T-GTT---G--TTAAA----C-C-GT----T---C-A-A-A----A----A-T--TAT-T-----AA-A--A-G-A-AAA-CCATT---ACTTT-----C-G-C-A---ACTTTT--A-AT-GCC-C-ATT-----GA-GTCTTGAC-C-TTT
gi|120386                     :                ATA-C-ACAAG---AAG-AT-T-AT-CA---CTTC--AT-T-C-TC-A-CA-----------------------C-GA----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T------A-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC--TT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120387                     :                ATA-C-ACAAG---A----T-T-AT-CA---TTTC--AA-T-C-TC-A-----A--G-A------TT---G--TT-CA--------------------A-A-G----A----A-T--T-T-TA----AA-A--T-G---AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120388                     :                ATA-C-ACAAG---A----T-T-AT-CA---TTTC--AA-T-C-TC-A-CA-GA--G-G-G-T-GTT---G--TA-AA----C-C-AT----T---T-A-A------------------T-T-----GA-A--T-------A-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC------A-AT-GTC-A-ATT-----GA-G-CATGAC-C-TTT
gi|120389                     :                ATA-C-ACAAA---AAG-AT-T-AT-CA---TTTC--AA-T-C-AC-A-CA-AA--T-G-G-T-GTT---T--TA-AA----C-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-C--T-T-T-----AA-T--T-G-A-ATA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---GC-AAT--A-AT-GTC-A-ATT-----GG-G-ATTGAC-A-TTT
gi|120390                     :                ATA-C-ACAAG---AAG-AT-T-AT-C----TTTC--AA-T-C-TC-A-CA-CA-----------TT-------------------GT----T---C-A-A-G----A----C-T--T-T-T-----AA-A--T-G---AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGCC-C-TTT
gi|120391                     :                ATA-C-A-AAG---A-G-ATAT-A--CA---TTTC--AA-T-C-CCCA-CA-AC--G-G-G-T-GTT---G--TT-AA----C-C-ATG---T---C-A-A-A----A----A-GGGT-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-G---A---T-----T-G-C-T---AC-TTA--A-AT-GCC-C-AGT-----GC-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120392                     :              atATA-C-ACAAG---A----T-T-AT-CA---TT-C--AA-TTC-TC-A-CA-A-------G-A-GTT---G--TT---------------------C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC--TT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120393                     :                ATA-C-ACAAG---AAG-AT-T-AT-CA---TTTC--AA-T-C-TC-A-CA-A-----------------------GA----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A----T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-------------------C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-T-AGT-----GA-G-C-TGAC-C-TTT
gi|120394                     :                ATA-C-ACAAG---A-C-AT-TTAT-CA---TTTC--AA-T-C-TC-A-CA-AA--T-G-G-T-GTTCCCG--TT-AA----C-C-AT----T-------------------A-T--T-T-TTTTTTAA-A--A-G-A-AAA-CCA-T---A---C-----T-G-G-T---AC-TTT--A-AT-GCC-C-AGT-----GA-G-CTT
gi|120396                     :                ATA-CCACAAG---AAG-AT-T-AT-CA---TTTC--AA-T-C-TC---TA-AC--G--------------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-TATAAC-TTCG-A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120397                     :                ATA-C-ACAA----A-G-AT-T-AT-CA---TTTC--AA-T-C-TC-A-CA-AG-----------------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-------------------C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120398                     :                ATATC-ACAAG---AAG-AT-T-AT-CA---TTTC--AA-T-C-TT-G-CA-C-----G-A-T-GTT---G--T----------------------C-A-A-G----A----AAT--T-T-T-----AA-AA-T-G-A-AAA-CCA-T---A---TCAAATT-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GAGG-CTTGAC-C-TCT
gi|120399                     :                ATA-C-ACAAG---A----T-T-AT-CA---TTTC--AA-T-C-TC-A-CA-A-----------------------GA----T-T-GT----T---C-A-ATG----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-TATGA---T-----T-G-C-T---AC-TTTA-A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120400                     :                ATA-C-ACAAG---A----T-T-AT-CA---TTTC--AA-T-C-TC-A-CA-AA-----------TT-------------------GT----T---C-A-A-A----A----A----T-T-T-----AA-A--T-G-A-AA---CA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120401                     :                ATA-C-ACAAG---AAG-AT-T-AT-CA---TTTC--AT-T-C-TC-A-CC-GA-----------TT-------------------GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----TA-A--T-G-G-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-CTT---AC-TTT----AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120402                     :                ATA-C-ACAAG--------T-T-AT-CA---TTTC--AA-T-C-TC-C-CA-AA----G-G-T-GTT---G---C-AT----T-T-GT----T---C-A-A-A----A----A-T--T-TAA-----AA-A--A-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AT-CTT-----T-GCC-C-AGT-----GA-G-CTTGACGC-TTT
gi|120403                     :                ATA-C-ACAAG---AAG-AT-T-AT-CA---T------------------------G-G-G-T-GTT---------AA----C-C-GT----A---C-T-A-G----A----A-A--T-T-C-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-ATC-C-AGT-----GA-G-TTTGAC-C-TTT
gi|120404                     :                ATA-C-ACAAG---A----T-T-AT-CA---TTTC--AA-T-C-TC-A-CA-A---G-A-T-T-GTT-------T-AA----C-------------------G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---ACATAT--T-AT-GTC-C-AGA-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120405                     :                ATA-C-ACAAG---A----T-T-AT-CA---TTTC--AA-T-C-TC---CA-AG--A--------TT---G--TT-CA--------------------A-A-G----A----A-T--T----------A-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120406                     :                ATA-C-ACAAG---A----T-T-AT-CA---TT-C--AA-T-C-TC-A-CA-GA-----------TT-------------------GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA--CA-T---A---------T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TT
gi|120407                     :                ATA-C-ACAAG---AAG-AT-T-AT-CA---TTT---AA-T-T-TC-A-CA--------------TC---G--AT-------C-T-AT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-AA-T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----TGG-C-T---AC-TTTA-A-AT-GTC-C-AGT-----G--G-CTTGGA-C-TTT
gi|120408                     :                ATA-C-ACAAG-----G-AT-T-AT-CA---TTTC--AA-T-C-TC-A-CA-AG-----------------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AA--CCA-------------------C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-A-TTTGAC-C-TTT
gi|120451                     :                 TA-C-ACAAG---AAG-AT-T-AT-C----TTTC--A--T-C-TC-A-CA-AA--G-G-G-T-ATT---G--TT-AA----C-C-AT----T-----A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--A-G-G-AAA-TCA-T---A---T-----T-G-C-T---AA-TTT--A-AT-GTC-C-AAT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120452                     :                ACA-C-ACAGA---A-A-AT-T-ATGCAG--TTTC--AA-T-C-CA-A-CA-AA--G-G-T-T-GTT---G--TT-AA----C-C-AT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-------AA-A--T-A-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTC--A-AT-GTC-A-AGT-----GACG-CTTGAC-C-TTT
gi|120453                     :               tACA-C-ACAGA---A-A-AT-T-ATGCGAGTTTTC--AA-T-C-TC-AACA-AA--G-G-G-T-GTT---G--TT-AA----C-C-AT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-TT----AA-A--T-A-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTC--A-AT-GT--C-AAT-----GACG-CTTGAC-C-TTT
gi|120454                     :                tTA-C-ACAAG---A----T-T-AT-CA---TTTC--AA-T-C-TC-A-CA-AG-----------------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A------T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--ATAT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120455                     :                 TA-C-ACAAG---A----T-T-AT-CA---TTTC--A--T-CATC-AACA-AA--G-A---T-GTT---G--TT-AT----C-C-AT----TTTTC-A-A-A----A----A-T--T-G-A-----AA-A--AAG-A-AAA-TCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GCC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-T-TTT
gi|120456                     :                        AAG---G-G-AT-T-AT-CA---TGTC--AAAT-C-TC-A-CA-CA--G-G-G-T----------TT-----------GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----TA-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---TA----T-G-C-T---AC-TTTA-A-AT-GTC-C-AGT-----AA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120457                     :        tactacaggTA-C-ACAAG---AAG-AT-T-AT-CA---TTTC--AA-T-C-TC-A-CA-----------------------C-AA----T-T-GT----T---C-A-A------A----A-T--T-T-G-----AA-A--T-G---AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTT-C--GT-----GA-G-CTTG-C-C-TTT
gi|120458                     :                 TA-C-ACAAAGGAA-G-AT-T-A--CA---TTTC--AA-T-C-TT-A-CA-AC--G-GTG-T-TTT---G--TT-AA----C-A-GT----TA--C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AATG--T-G-A-AAA-CCA-T---A---TG----T-A-C-C---AC---T--A-AT-TTC-C-AGT-----GA-GCCTTGAC-T-TTT
gi|120465                     :                  A-C-ACAAG---AAG-AT-T-AT-AA---TTTC--AA-T-C-TC-A-CA-AA--G-G-G-T-GTT---G--TT-AA----C-C---------------------------A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----
gi|120466                     :                  A-C-ACAAG---A-G-AT-T-AT-CA---TTTC--AA-T-C-TC-A-CA-GA-----------TT-------------------GT----T---C-A-A-T----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-GAA-AAA-ACA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-T-CTTGAC-C-TTT
gi|120467                     :                                                 TC--AA-T-C-TC-A-CA-AA--G-G-G-T-ATT---GAGCT-AT----T-T-GT----T---C-A-A-A----A----G-A--T-T-T-----AA-A--A-A-AGAAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GCCGC-AGT-----GA-G-CTTGAC-T-TTT
gi|120472                     :                 acataaaataatcaatcaatcaaT-TA---TCCC--AT-T-C-TC-C-CA-AA--G-G-G-T-GTT---G--TC-AG----C-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-ATC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120473                     : cactaagaatatccctac-C-ACAAG---A-ATGT-T-AT--A---TTT---AA-T-C-TC-A-CA-AA--G-G-G-T-GTT---G--TT-AA------C-GT----T---C-A-A-G----A---------T-T-T-----AA-T--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-C-CAT---AC-TTTAAA-AT-GTC-C-AGCACAAGAA-G-CCAGAC-C-TTT
gi|120478                     :                                                  C--AG-T-C-TC-C-TA-AA--G-G-G-T-GTT---A--TT-AA----T-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AA-TTT--A-CT-GTC-C-CAT-----CA-G-CTTGAT-C-ATT
gi|120486                     :      caagaatatccccgcttaccc---A-G-AT-T-AT-CA---TTTC--AA-T-C-TC-A-CA-AG-----------------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT----AT-GT--C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120489                     :                                   a-T-AC-CA---TTTC--AA-T-C-TC-A-GA-AA--G-G-GAT-GTT---G--TT-AATTTTC-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-G-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCG-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGA-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120490                     :                                        T-TA---CTCC--AA-T-T-TC-C-CA-AA--T-G-G-T-GTT---G--TT-AA----C-C-TT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-ATT-----GA-G-TTCGGC-C-TTT
gi|120493                     :                                         -CA---CTTCCAAA-A-C-TC-C-CA-AA--G-G-G-C-GTT---G--TG-AA----C-C-GT----A---C-A-A-G----A----C-G--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-CCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-T-TTT
gi|120494                     :                                                 TC--AA-T-C-TC-C-CG-AA--G-G-G-T-ATT---A--TT-AA----T-T-CT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-G-----AA-A--T-G-G-AAA-TCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--T-AT-GTC-C-AGA-----GG-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120496                     :                                                  C--AA-A-C-TC-C-CA-AA--G-G-G-T-GTT---G--TT-AA----C-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-C---A---T-----A-A-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120497                     :                                                  C--AA-T-C-TC-T-CA-AA--G-G-G-T-ATT---G--TT-AA----C-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-G-----AA-A--T-G-G-AAA-TCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120498                     :                                                  C--AA-T-C-TC-C-CA-AA--G-G-------T---G--TT-AA----C-C-AT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-TCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120499                     :                                                  C--AA-T-C-TC-C-AA-AA--G-G-G-T-GTT---C--TT-AA----C-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--C-G-G-AAA-CCA-G---A---T-----T-G-T-T---AC-TTC--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120500                     :                                                  C--AA-T-C-CC-C-CA-AA--G-G-G-T-GTT---G--GT-TA----C-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-TTA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-A-AGT-----GA-G-CATGAC-C-TTT
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gi|120503                     :                                                  C--AA-T-C-TC-C-CG-AA--G-G-G-T-GTC---G--T---A----C-CTGT----T---C-A-AAG----A----A-T--T-T-TG----AA-A--T-G-G-AAA-TCA-T---A---T-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-A-ATT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120504                     :                                                  C--AA-T-C-TC-C-CG-AA--G-G-G-C-ATT---G--TT-AA----C-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-G-----AA-A--T-A-G-AAA-TCA-T---A---T-----T-G-C-A---AC-CTT--T-AT-GTC-C-AGA-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
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gi|120518                     :                                                   --AA-T-C-TC-C-CA-AA--C-G-G-T-GTT---G--TT-TA----C-C-GT----T---C-A-C-A----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-CCA-T---G---T-----T-G-C-T---AA-TTT--A-AT-GTC-A-AGT-----GA-A-CTTGAC-C-TTT
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Alignments
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lowQualScore                  :    . .  . . ..  . ..  ...  . .  ...  ... .... ..  . . .  ...  .  ........... . ......  .  .... ...  .... ... . . . .... .... . .. . . .....  . .. . . .   .   . ..... ... . . . . ...  .   .. .  .   . .   .....  . .      . .   
lowQualScore                  :    5 1  5 6 77  4 77  444  5 0  666  999 9999 00  4 8 8  111  4  55555555555 4 222222  4  9999 111  3333 111 4 8 8 1111 7777 8 55 4 4 22222  8 99 4 4 4   4   4 55555 777 8 4 4 8 777  8   55 4  4   4 4   00000  6 8      8 4   
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Reference ( family-87 )       : ATA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AA--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120344                     : ATA-C-AC-A-A--GAAG--AG---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AA--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T------A-A--T-G-A-AAT-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120345                     : ATA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TT-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AA--T-G-G-T-AT-T---G--TT-AA----C-C-AT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120346                     : ATA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-T-TC-A-CA-AA--G-G-A-T-AT-T---G--TT-AA----C-C-GT----T---C-A-A-G----ATTCAA-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120347                     : ATA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-T-TC---CA-AA--G-G-A-T-AT-T---G--TT-AA----C-C-GT----T---C-A-A-G----ATTCAA-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120348                     : ATA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-T-TC-A-CA-AA--G-G-A---ATAT---G--TT-AA----C-C-GT----T---C-A-A-GATTCA----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G---AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120351                     : ATA-T-AC-A-A--GA-----T---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AA--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-C--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120352                     : ATA-C-AC-A-A--GACG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AA--T-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-GT----T---C-A-A-A----A----T-T--T-T-T-----AA-A--A-G-A-AAA-CCA-T-----A---C-T-G-C-A---AC-TTT--A-AT-GCC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120353                     : ATA-C-AT-A-A--GACA--AT---CA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AA--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-GT----T-------A-A----A----A-T--G-T-T-----AA-A--A-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---GC-TTT--A-AT-GCC-C-AGT-----GA-G-CTTAAC-C-TTT
gi|120354                     : ACA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-AC-A-AG-AA--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----TA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---C-C-C-C-T---AT-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TT
gi|120355                     : ATA-C-AT-A-A--GTAG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-GA--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-AT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--C-G---TAA-TCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TCT--A-AT-GTC-T-AGT-----GT-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120357                     : ATA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-C--AA--T-A-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-AT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-TA----AA-A--T-G-G-AAA-CCA-T-----A---A-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-A-TATGAC-C-
gi|120358                     : ATA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA--------T----C--AA-T-C-TC-T-CA-AA----G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-A-TT----T---CAA-A-G----A----A------T-T-----AA-A--T-G-A-AAA--CA-T-----A-----T-G-T-A---GC-TTTA-A-AT-GTC-C-AGT-----G--G-CTTGAC-C-TTT
gi|120359                     : ATA-C-AC-A-A--GACA--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AA--T-G---T-GT-T---G--TT-AA----C-C-GT----T---C-A-A-A----A----T-T--T-T-T-----AA-A--A-G-A-AA--CCA-C-----A---C-T-G-C-A---AC-TTT--A-AT-GCC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120360                     : ATA-C-AT-A-A--GACG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--A--T-C-TC-A-CA-AA--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-GT----T---C-A-A-A----A----T-T--T-T-T-----AA-A--A-T-A-GAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-A---AC-TTT--A-AT-ACG-T-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120361                     : ATA-C-AT-A-A--GAAG--AT---AA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AA--A-A-G-T-GT-T---G--TT-AA----T-C-AT----T---C-A-A-G----A----A-T--C-T-A-----TA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-CTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-TTTGAC-T-TT
gi|120362                     : ATA-C-AC-A-A--GACG--AT---CA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-CC-A-CA-AA--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-T-GT----T---C-A-A-A----A----A-T--T-C-T-----AA-A--G-G----AA-TCA-G-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT----AT-GCC-C-AGT-----GA-G-CTTGAT-C-TTT
gi|120363                     : ATA-C-AC-ACA--GAAA--AT---TA-TGCAG--TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AA--G-G-G-TTGT-T---G--TT-AA----C-C-AT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-TT----AA-A--T-A-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTC--A-AT-GTC-A-AGT-----GACG-CTTGAC-C-TTT
gi|120364                     : ATA-C-AC-A-A--GACG--AT---TA-T-CA---TT---T----T--AA-T-C-TC-A-CA-TA--G-A-G-T-GT-T---C--TT-AA----C-C-GT----T---G-G-A-G----A----A-T--T-T-T-----CA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AT-TTT--C-AT-GTC-T-AGT-----GA-G-CTTGAT-C-TTT
gi|120365                     : ATA-C-AC-A-A--GA-G--AT---TA-T-TA---TT---T----T--AA-TTC-TC-A--A-TA--G-A-G-T-GT-T---T--TT-AA----C-C-GT----T---G-G-A-G----A----A-T--T-T-T-----CA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AT-TTT--C-AT-GTC-T-AGT-----GA-G-CTTGAT-C-TTT
gi|120366                     : ATA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA------------------------C-GA----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----TA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120367                     : ATA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA------------------------C-GA----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----TA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120368                     : ATA-C-AG-A-A--GACA--AT---TA-T-CA---TT---T----CC-AA-T-CCTC-A-CA-AA--TTG-G-T-GT-T---G--TT-AA----A-T-GT----T---C-A-A-A----A----A-T--T-T-T-----AA-A--A-G-A-AAA-CCA-T-----A---C-T-G-C-A---AC-TTT--A-A--GCC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120369                     : ATA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-TTCA---T---------C--AA-T-C-TC-A-CA-AA--G-G-G-T-GT-A---G--TT-AA----C-A-GT----T---C-A-A-ATTTCA----ATT--T-T-T-----AA-A--T-G---AAA-CCA-T-----A---C-T-G-C-C---AC--TT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TCT
gi|120370                     : ATA-T-AC-C-A--CAAG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC---CA-AA--G---------------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--A-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-A-TTT
gi|120371                     : ATA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-TA---TT---T----C--AA-T-T-TC---CA-AC--G-A---------------TT-A----------T----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120372                     : ATA-C-AC-A-A--GA-----T---TA-A-CAGA-TT---T----C--A--T-C-TC-A-CATAA--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AT----C-C-AT----T---C-A-A-A----A----A-T--T-A-A-----AA-A--A-G-A-AAATCCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-ATT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120373                     : ATA-C-AC-A----GAAG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA------------------------C-GA----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----TA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120374                     : ATA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TATT-CA----T---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AA--G-G-G-T-GC-T---G--TT--A----T-C-AT----T---C-A-A-A----G----A-T--T-C-T-----AA-A--T-G---AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---GC-TTT--A-AT-GGC-C-A-T-----GA-G-CTTGAC-T-TT
gi|120375                     : ATA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-A------------------------GA----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-----------------C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120376                     : ATA-C-AC-A-A--GACG--AT---TA-T-CA---TT--------C--AA-T-C-TC-A-CA-AAT-G-G-G-T-----------TT-AA----C-C-GT----T---C-ATA-T----A----A-T--T-T-T-----AA-AAAG-G-A-AAA-CCA-T-----A---C-T-GGC-A---AC-TTT--A-AT-GCC-C-AAT-----GA-G-CTTGAC-C-T
gi|120377                     : ATA-C-AC-A-A--GA-----T---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AA--G---------------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA----T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-C-TGAC-C-TTT
gi|120378                     : ATA-C-AC-A-A--GA-----T---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AG------------------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AA--CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120379                     : ATA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-G-C----------G-C-G-------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----TA-A--T-G-A-AAA-CTA-T-----A---T-T-G-C-T---AT-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-ATTGAC-C-TTT
gi|120380                     : ATA-C-AC-A-A--AAAG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA------------------------C-GA----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TAT--A-CT-GTC-C-AGT-----GA-C-CTTGAC-C-TTT
gi|120381                     : ATA-C-AC-A-A--GA-----T---TA-T-C----TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA------------------------C-AA----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTC--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120382                     : ATA-C-AC-A-A--GACA--AT---TA-T-CA---TG---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AAT-G-GTG-T-GT-T---A--TT-AA----CAC-GT----T---C-AGA-A----A----A-T--T-T-T-----AAGA--A-G-A-AAA-CCA-T-----A---G-C-G-C-A---AC-TTT--A-AT-G-C-C-AGT-----GA-G-C-TGACAC-TTT
gi|120383                     : ATA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---AT---T----C--AA-T-C-TC-A-CG-AC--A-A-T-T-G------G--TT-----------------T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-TT----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-TA----A---T-T-G-C-T----C-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120384                     : ATA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---AT---T----C--AA-T-C-TC-A-CG-AC--A-A-T-T-G------G--TT-----------------T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-TT----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-TA----A---T-T-G-C-T----C-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120385                     : ATA-C-AC-A-A--GACA--AT---TA-T-CA----T---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AATTG-T-G-T-GT-T---G--TTAAA----C-C-GT----T---C-A-A-A----A----A-T--TAT-T-----AA-A--A-G-A-AAA-CCATT-----ACTTT-C-G-C-A---ACTTTT--A-AT-GCC-C-ATT-----GA-GTCTTGAC-C-TTT
gi|120386                     : ATA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---CT---T----C--AT-T-C-TC-A-CA------------------------C-GA----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T------A-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC--TT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120387                     : ATA-C-AC-A-A--GA-----T---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-----A--G-A------T-T---G--TT-CA--------------------A-A-G----A----A-T--T-T-TA----AA-A--T-G---AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120388                     : ATA-C-AC-A-A--GA-----T---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-GA--G-G-G-T-GT-T---G--TA-AA----C-C-AT----T---T-A-A------------------T-T-----GA-A--T-------A-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC------A-AT-GTC-A-ATT-----GA-G-CATGAC-C-TTT
gi|120389                     : ATA-C-AC-A-A--AAAG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-AC-A-CA-AA--T-G-G-T-GT-T---T--TA-AA----C-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-C--T-T-T-----AA-T--T-G-A-ATA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---GC-AAT--A-AT-GTC-A-ATT-----GG-G-ATTGAC-A-TTT
gi|120390                     : ATA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-C----TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-CA-----------T-T-------------------GT----T---C-A-A-G----A----C-T--T-T-T-----AA-A--T-G---AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGCC-C-TTT
gi|120391                     : ATA-T-AC-A-A--AGAG--ATA--TA---CA---TT---T----C--AA-T-C-CCCA-CA-AC--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-ATG---T---C-A-A-A----A----A-GGGT-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-G-----A---T-T-G-C-T---AC-TTA--A-AT-GCC-C-AGT-----GC-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120392                     : ATA-C-AC-A-A--GA-----T---TA-T-CA---TT--------C--AA-TTC-TC-A-CA-A-------G-A-GT-T---G--TT---------------------C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC--TT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120393                     : ATA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-A------------------------GA----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A----T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-----------------C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-T-AGT-----GA-G-C-TGAC-C-TTT
gi|120394                     : ATA-C-AC-A-A--GACA--TT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AA--T-G-G-T-GT-TCCCG--TT-AA----C-C-AT----T-------------------A-T--T-T-TTTTTTAA-A--A-G-A-AAA-CCA-T-----A---C-T-G-G-T---AC-TTT--A-AT-GCC-C-AGT-----GA-G-CTT
gi|120396                     : ATA-CCAC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC---TA-AC--G---------------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-TATAAC-TTCG-A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120397                     : ATA-C-AC-A-A----AG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AG------------------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-----------------C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120398                     : ATATC-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TT-G-C---A--C-G-A-T-GT-T---G---------------------T---C-A-A-GA---A----A-T--T-T-TA----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-TATCAAA---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GAGG-CTTGAC-C-TCT
gi|120399                     : ATA-C-AC-A-A--GA-----T---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-A------------------------GA----T-T-GT----T---C-A-ATG----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-TATG--A---T-T-G-C-T---AC-TTTA-A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120400                     : ATA-C-AC-A-A--GA-----T---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AA-----------T-T-------------------GT----T---C-A-A-A----A----A----T-T-T-----AA-A--T-G-A-AA---CA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120401                     : ATA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AT-T-C-TC-A-CC-GA-----------T-T-------------------GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----TA-A--T-G-G-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-CTT---AC-TTT----AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120402                     : ATA-C-AC-A-A--G------T---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-C-CA-AA----G-G-T-GT-T---G---C-AT----T-T-GT----T---C-A-A-A----A----A-T--T-TAA-----AA-A--A-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AT-CTT-----T-GCC-C-AGT-----GA-G-CTTGACGC-TTT
gi|120403                     : ATA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---T-------------------------------G-G-G-T-GT-T---------AA----C-C-GT----A---C-T-A-G----A----A-A--T-T-C-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-ATC-C-AGT-----GA-G-TTTGAC-C-TTT
gi|120404                     : ATA-C-AC-A-A--GA-----T---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-A---G-A-T-T-GT-T-------T-AA----C-------------------G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---ACATAT--T-AT-GTC-C-AGA-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120405                     : ATA-C-AC-A-A--GA-----T---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC---CA-AG--A--------T-T---G--TT-CA--------------------A-A-G----A----A-T--T----------A-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120406                     : ATA-C-AC-A-A--GA-----T---TA-T-CA---TT--------C--AA-T-C-TC-A-CA-GA-----------T-T-------------------GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA--CA-T-----A-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TT
gi|120407                     : ATA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---TT---T-------AA-T-T-TC-A-CA--------------T-C---G--AT-------C-T-AT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-AA-T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-TGG-C-T---AC-TTTA-A-AT-GTC-C-AGT-----G--G-CTTGGA-C-TTT
gi|120408                     : ATA-C-AC-A-A--G--G--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AG------------------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AA--CCA-----------------C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-A-TTTGAC-C-TTT
gi|120451                     :  TA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-C----TT---T----C--A--T-C-TC-A-CA-AA--G-G-G-T-AT-T---G--TT-AA----C-C-AT----T-----A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--A-G-G-AAA-TCA-T-----A---T-T-G-C-T---AA-TTT--A-AT-GTC-C-AAT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120452                     :  TA-C-AC-ACA--GAAA--AT---TA-TGCAG--TT---T----C--AA-T-C-CA-A-CA-AA--G-G-T-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-AT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-------AA-A--T-A-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTC--A-AT-GTC-A-AGT-----GACG-CTTGAC-C-TTT
gi|120453                     :  TA-C-AC-ACA--GAAA--AT---TA-TGCGAGTTT---T----C--AA-T-C-TC-AACA-AA--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-AT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-TT----AA-A--T-A-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTC--A-AT-GT--C-AAT-----GACG-CTTGAC-C-TTT
gi|120454                     :  TA-C-AC-A-A--GA-----T---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AG------------------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A------T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--ATAT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120455                     :  TA-C-AC-A-A--GA-----T---TA-T-CA---TT---T----C--A--T-CATC-AACA-AA--G-A---T-GT-T---G--TT-AT----C-C-AT----TTTTC-A-A-A----A----A-T--T-G-A-----AA-A--AAG-A-AAA-TCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GCC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-T-TTT
gi|120456                     :  TA-CTAC-A-G--GAAGGGAT---TA-T-CA---TG---T----C--AAAT-C-TC-A-CA-CA--G-G-G-T-----------TT-----------GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----TA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---TAT-G-C-T---AC-TTTA-A-AT-GTC-C-AGT-----AA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120457                     :  TA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA------------------------C-AA----T-T-GT----T---C-A-A------A----A-T--T-T-G-----AA-A--T-G---AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTT-C--GT-----GA-G-CTTG-C-C-TTT
gi|120458                     :  TA-C-AC-A-AAGGAAG--AT---TA---CA---TT---T----C--AA-T-C-TT-A-CA-AC--G-GTG-T-TT-T---G--TT-AA----C-A-GT----TA--C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AATG--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---TGT-A-C-C---AC---T--A-AT-TTC-C-AGT-----GA-GCCTTGAC-T-TTT
gi|120465                     :   A-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-AA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AA--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C---------------------------A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----
gi|120466                     :   A-C-AC-A-A--GA-G--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-GA-----------T-T-------------------GT----T---C-A-A-T----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-GAA-AAA-ACA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-T-CTTGAC-C-TTT
gi|120467                     :   A-C-AT-A-A--AATA--AT---CAAT-CA---ATCAAT----C--AA-T-C-TC-A-CA-AA--G-G-G-T-AT-T---GAGCT-AT----T-T-GT----T---C-A-A-A----A----G-A--T-T-T-----AA-A--A-A-AGAAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GCCGC-AGT-----GA-G-CTTGAC-T-TTT
gi|120472                     :    -C-ACTA-A--GAAT--ATCCCTACT-TA---TC---C----C--AT-T-C-TC-C-CA-AA--G-G-G-T-GT-T---G--TC-AG----C-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-ATC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120473                     :    -C-AC-A-A--GAAT--GT---TA-T--A---TT---T-------AA-T-C-TC-A-CA-AA--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA------C-GT----T---C-A-A-G----A---------T-T-T-----AA-T--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-C-CAT---AC-TTTAAA-AT-GTC-C-AGCACAAGAA-G-CCAGAC-C-TTT
gi|120478                     :        C-A-A--GAAT--AT---CC-C-CG---CT---TACCCC--AG-T-C-TC-C-TA-AA--G-G-G-T-GT-T---A--TT-AA----T-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AA-TTT--A-CT-GTC-C-CAT-----CA-G-CTTGAT-C-ATT
gi|120486                     :                AAG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AG------------------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT----AT-GT--C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120489                     :                       ---TA-C-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-GA-AA--G-G-GAT-GT-T---G--TT-AATTTTC-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-G-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCG-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGA-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120490                     :                            -T-TA---CT---C----C--AA-T-T-TC-C-CA-AA--T-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-TT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-ATT-----GA-G-TTCGGC-C-TTT
gi|120493                     :                              -CA---CT---T----CCAAA-A-C-TC-C-CA-AA--G-G-G-C-GT-T---G--TG-AA----C-C-GT----A---C-A-A-G----A----C-G--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-T-TTT
gi|120494                     :                                      ---T----C--AA-T-C-TC-C-CG-AA--G-G-G-T-AT-T---A--TT-AA----T-T-CT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-G-----AA-A--T-G-G-AAA-TCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--T-AT-GTC-C-AGA-----GG-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120496                     :                                          ----C--AA-A-C-TC-C-CA-AA--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-C-----A---T-A-A-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120497                     :                                          ----C--AA-T-C-TC-T-CA-AA--G-G-G-T-AT-T---G--TT-AA----C-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-G-----AA-A--T-G-G-AAA-TCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120498                     :                                          ----C--AA-T-C-TC-C-CA-AA--G-G--------T---G--TT-AA----C-C-AT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-TCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120499                     :                                          ----C--AA-T-C-TC-C-AA-AA--G-G-G-T-GT-T---C--TT-AA----C-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--C-G-G-AAA-CCA-G-----A---T-T-G-T-T---AC-TTC--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120500                     :                                          ----C--AA-T-C-CC-C-CA-AA--G-G-G-T-GT-T---G--GT-TA----C-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-TTA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-A-AGT-----GA-G-CATGAC-C-TTT
gi|120501                     :                                          ----C--AA-T-C-TC-C-TA-AA--A-T-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-G-ATA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AT-TTA--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAT-CATTT
gi|120502                     :                                          ----C--AA-T-C-TC-C-CG-AA--G-G-G-T-AT-T---G--TT-AA----C-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-A-----AA-A--T-A-G-AAA-TCA-T-----A---T-C-A-C-T---AC-CTT--T-AT-GTC-C-AGA-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120503                     :                                          ----C--AA-T-C-TC-C-CG-AA--G-G-G-T-GT-C---G--T---A----C-CTGT----T---C-A-AAG----A----A-T--T-T-TG----AA-A--T-G-G-AAA-TCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-A-ATT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120504                     :                                          ----C--AA-T-C-TC-C-CG-AA--G-G-G-C-AT-T---G--TT-AA----C-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-G-----AA-A--T-A-G-AAA-TCA-T-----A---T-T-G-C-A---AC-CTT--T-AT-GTC-C-AGA-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120505                     :                                          ----C--AA-T-C-TC-C-CG-AA--G-G-G-T-AT-T---G--TT-AA----C-T-GT----T---C-A-A-G----A----T-T--T-T-G-----AA-A--T-A-G-AAA-TCA-T-----A---T-C-G-C-T---AC-TTT--T-AT-GTC-C--GA-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120518                     :                                               --AA-T-C-TC-C-CA-AA--C-G-G-T-GT-T---G--TT-TA----C-C-GT----T---C-A-C-A----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-CCA-T-----G---T-T-G-C-T---AA-TTT--A-AT-GTC-A-AGT-----GA-A-CTTGAC-C-TTT
gi|120519                     :                                               --AA-T-C-TC-C-CG-AA--G-G-G-T-AT-T---G--TT-AA----C-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-G-----AA-A--T-G-G-AAA-TCA-T-----A---T-T-G-C-T---AT-CTT--T-AT-GTC-C-AGA-----GA-G-TTTGAC-C-TTT
gi|120520                     :                                               --AA-T-C-TC-C-CG-AA--G-G-G-T-AT-C---G--TT-AA----C-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-G-----AA-A--T-G-G-AAA-TCA-T-----A---T-T-G-C-T---AT-CTT--T-AT-GTC-C-AGA-----GA-G-TTTGAC-C-TTT
gi|120521                     :                                               --AA-T-C-TC-C-CG-AA--G-G-G-T-AT-T---G--TT-AG----C-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-G--T-T-G-----AA-A--T-G-G-AAA-TCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTG-C-AGT-----CA-G-CTCGAC-T-TTT
gi|120524                     :                                                  A-T-C-TC-T-CA-AA--G-T-G-T-GT-T---G--GT-A-----C-C-GT----T---C-A-A-G----A----AAT--T-T-C-----AA-A--T-G-G-AAA-TCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGC-----AA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120531                     :                                                     -C-TC-C-TA-GA--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-T-GC----T---C-A-T-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-TCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-ATGGTC-CTAGT-----GA-G-CTTGAC-C-TT
gi|120532                     :                                                       -TC-A-CA-AA--G-T-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-ATACATT---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGA-----AA-G-CTTTAC-C-TTT
gi|120536                     :                                                            -CA-AA--G-G-G-T-GT-T---G--GT-AA----C-C-GT----T---T-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-A-T---AC-TTT--A-AT-GTC-A-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120537                     :                                                            -CA-AA--A-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-T-GT----T---C-A-A-A----G----T-T--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-T-T---AC-TTC--A-AT-GTC-C-AGA-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
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gi|120390                     : ATA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-C----TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-CA-----------T-T-------------------GT----T---C-A-A-G----A----C-T--T-T-T-----AA-A--T-G---AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGCC-C-TTT
gi|120391                     : ATA-T-AC-A-A--AGAG--ATA--TA---CA---TT---T----C--AA-T-C-CCCA-CA-AC--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-ATG---T---C-A-A-A----A----A-GGGT-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-G-----A---T-T-G-C-T---AC-TTA--A-AT-GCC-C-AGT-----GC-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120392                     : ATA-C-AC-A-A--GA-----T---TA-T-CA---TT--------C--AA-TTC-TC-A-CA-A-------G-A-GT-T---G--TT---------------------C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC--TT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120393                     : ATA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-A------------------------GA----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A----T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-----------------C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-T-AGT-----GA-G-C-TGAC-C-TTT
gi|120394                     : ATA-C-AC-A-A--GACA--TT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AA--T-G-G-T-GT-TCCCG--TT-AA----C-C-AT----T-------------------A-T--T-T-TTTTTTAA-A--A-G-A-AAA-CCA-T-----A---C-T-G-G-T---AC-TTT--A-AT-GCC-C-AGT-----GA-G-CTT
gi|120396                     : ATA-CCAC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC---TA-AC--G---------------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-TATAAC-TTCG-A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120397                     : ATA-C-AC-A-A----AG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AG------------------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-----------------C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120398                     : ATATC-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TT-G-C---A--C-G-A-T-GT-T---G---------------------T---C-A-A-GA---A----A-T--T-T-TA----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-TATCAAA---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GAGG-CTTGAC-C-TCT
gi|120399                     : ATA-C-AC-A-A--GA-----T---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-A------------------------GA----T-T-GT----T---C-A-ATG----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-TATG--A---T-T-G-C-T---AC-TTTA-A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120400                     : ATA-C-AC-A-A--GA-----T---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AA-----------T-T-------------------GT----T---C-A-A-A----A----A----T-T-T-----AA-A--T-G-A-AA---CA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120401                     : ATA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AT-T-C-TC-A-CC-GA-----------T-T-------------------GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----TA-A--T-G-G-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-CTT---AC-TTT----AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120402                     : ATA-C-AC-A-A--G------T---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-C-CA-AA----G-G-T-GT-T---G---C-AT----T-T-GT----T---C-A-A-A----A----A-T--T-TAA-----AA-A--A-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AT-CTT-----T-GCC-C-AGT-----GA-G-CTTGACGC-TTT
gi|120403                     : ATA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---T-------------------------------G-G-G-T-GT-T---------AA----C-C-GT----A---C-T-A-G----A----A-A--T-T-C-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-ATC-C-AGT-----GA-G-TTTGAC-C-TTT
gi|120404                     : ATA-C-AC-A-A--GA-----T---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-A---G-A-T-T-GT-T-------T-AA----C-------------------G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---ACATAT--T-AT-GTC-C-AGA-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120405                     : ATA-C-AC-A-A--GA-----T---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC---CA-AG--A--------T-T---G--TT-CA--------------------A-A-G----A----A-T--T----------A-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120406                     : ATA-C-AC-A-A--GA-----T---TA-T-CA---TT--------C--AA-T-C-TC-A-CA-GA-----------T-T-------------------GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA--CA-T-----A-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TT
gi|120407                     : ATA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---TT---T-------AA-T-T-TC-A-CA--------------T-C---G--AT-------C-T-AT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-AA-T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-TGG-C-T---AC-TTTA-A-AT-GTC-C-AGT-----G--G-CTTGGA-C-TTT
gi|120408                     : ATA-C-AC-A-A--G--G--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AG------------------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AA--CCA-----------------C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-A-TTTGAC-C-TTT
gi|120451                     :  TA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-C----TT---T----C--A--T-C-TC-A-CA-AA--G-G-G-T-AT-T---G--TT-AA----C-C-AT----T-----A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--A-G-G-AAA-TCA-T-----A---T-T-G-C-T---AA-TTT--A-AT-GTC-C-AAT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120452                     :  TA-C-AC-ACA--GAAA--AT---TA-TGCAG--TT---T----C--AA-T-C-CA-A-CA-AA--G-G-T-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-AT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-------AA-A--T-A-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTC--A-AT-GTC-A-AGT-----GACG-CTTGAC-C-TTT
gi|120453                     :  TA-C-AC-ACA--GAAA--AT---TA-TGCGAGTTT---T----C--AA-T-C-TC-AACA-AA--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-AT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-TT----AA-A--T-A-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTC--A-AT-GT--C-AAT-----GACG-CTTGAC-C-TTT
gi|120454                     :  TA-C-AC-A-A--GA-----T---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AG------------------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A------T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--ATAT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120455                     :  TA-C-AC-A-A--GA-----T---TA-T-CA---TT---T----C--A--T-CATC-AACA-AA--G-A---T-GT-T---G--TT-AT----C-C-AT----TTTTC-A-A-A----A----A-T--T-G-A-----AA-A--AAG-A-AAA-TCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GCC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-T-TTT
gi|120456                     :  TA-CTAC-A-G--GAAGGGAT---TA-T-CA---TG---T----C--AAAT-C-TC-A-CA-CA--G-G-G-T-----------TT-----------GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----TA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---TAT-G-C-T---AC-TTTA-A-AT-GTC-C-AGT-----AA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120457                     :  TA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA------------------------C-AA----T-T-GT----T---C-A-A------A----A-T--T-T-G-----AA-A--T-G---AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTT-C--GT-----GA-G-CTTG-C-C-TTT
gi|120458                     :  TA-C-AC-A-AAGGAAG--AT---TA---CA---TT---T----C--AA-T-C-TT-A-CA-AC--G-GTG-T-TT-T---G--TT-AA----C-A-GT----TA--C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AATG--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---TGT-A-C-C---AC---T--A-AT-TTC-C-AGT-----GA-GCCTTGAC-T-TTT
gi|120465                     :   A-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-AA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AA--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C---------------------------A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----
gi|120466                     :   A-C-AC-A-A--GA-G--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-GA-----------T-T-------------------GT----T---C-A-A-T----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-GAA-AAA-ACA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-T-CTTGAC-C-TTT
gi|120467                     :   A-C-AT-A-A--AATA--AT---CAAT-CA---ATCAAT----C--AA-T-C-TC-A-CA-AA--G-G-G-T-AT-T---GAGCT-AT----T-T-GT----T---C-A-A-A----A----G-A--T-T-T-----AA-A--A-A-AGAAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GCCGC-AGT-----GA-G-CTTGAC-T-TTT
gi|120472                     :    -C-ACTA-A--GAAT--ATCCCTACT-TA---TC---C----C--AT-T-C-TC-C-CA-AA--G-G-G-T-GT-T---G--TC-AG----C-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-ATC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120473                     :    -C-AC-A-A--GAAT--GT---TA-T--A---TT---T-------AA-T-C-TC-A-CA-AA--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA------C-GT----T---C-A-A-G----A---------T-T-T-----AA-T--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-C-CAT---AC-TTTAAA-AT-GTC-C-AGCACAAGAA-G-CCAGAC-C-TTT
gi|120478                     :        C-A-A--GAAT--AT---CC-C-CG---CT---TACCCC--AG-T-C-TC-C-TA-AA--G-G-G-T-GT-T---A--TT-AA----T-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AA-TTT--A-CT-GTC-C-CAT-----CA-G-CTTGAT-C-ATT
gi|120486                     :                AAG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AG------------------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT----AT-GT--C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120489                     :                       ---TA-C-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-GA-AA--G-G-GAT-GT-T---G--TT-AATTTTC-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-G-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCG-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGA-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120490                     :                            -T-TA---CT---C----C--AA-T-T-TC-C-CA-AA--T-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-TT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-ATT-----GA-G-TTCGGC-C-TTT
gi|120493                     :                              -CA---CT---T----CCAAA-A-C-TC-C-CA-AA--G-G-G-C-GT-T---G--TG-AA----C-C-GT----A---C-A-A-G----A----C-G--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-T-TTT
gi|120494                     :                                      ---T----C--AA-T-C-TC-C-CG-AA--G-G-G-T-AT-T---A--TT-AA----T-T-CT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-G-----AA-A--T-G-G-AAA-TCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--T-AT-GTC-C-AGA-----GG-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120496                     :                                          ----C--AA-A-C-TC-C-CA-AA--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-C-----A---T-A-A-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120497                     :                                          ----C--AA-T-C-TC-T-CA-AA--G-G-G-T-AT-T---G--TT-AA----C-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-G-----AA-A--T-G-G-AAA-TCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120498                     :                                          ----C--AA-T-C-TC-C-CA-AA--G-G--------T---G--TT-AA----C-C-AT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-TCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120499                     :                                          ----C--AA-T-C-TC-C-AA-AA--G-G-G-T-GT-T---C--TT-AA----C-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--C-G-G-AAA-CCA-G-----A---T-T-G-T-T---AC-TTC--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120500                     :                                          ----C--AA-T-C-CC-C-CA-AA--G-G-G-T-GT-T---G--GT-TA----C-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-TTA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-A-AGT-----GA-G-CATGAC-C-TTT
gi|120501                     :                                          ----C--AA-T-C-TC-C-TA-AA--A-T-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-G-ATA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AT-TTA--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAT-CATTT
gi|120502                     :                                          ----C--AA-T-C-TC-C-CG-AA--G-G-G-T-AT-T---G--TT-AA----C-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-A-----AA-A--T-A-G-AAA-TCA-T-----A---T-C-A-C-T---AC-CTT--T-AT-GTC-C-AGA-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120503                     :                                          ----C--AA-T-C-TC-C-CG-AA--G-G-G-T-GT-C---G--T---A----C-CTGT----T---C-A-AAG----A----A-T--T-T-TG----AA-A--T-G-G-AAA-TCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-A-ATT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120504                     :                                          ----C--AA-T-C-TC-C-CG-AA--G-G-G-C-AT-T---G--TT-AA----C-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-G-----AA-A--T-A-G-AAA-TCA-T-----A---T-T-G-C-A---AC-CTT--T-AT-GTC-C-AGA-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120505                     :                                          ----C--AA-T-C-TC-C-CG-AA--G-G-G-T-AT-T---G--TT-AA----C-T-GT----T---C-A-A-G----A----T-T--T-T-G-----AA-A--T-A-G-AAA-TCA-T-----A---T-C-G-C-T---AC-TTT--T-AT-GTC-C--GA-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120518                     :                                               --AA-T-C-TC-C-CA-AA--C-G-G-T-GT-T---G--TT-TA----C-C-GT----T---C-A-C-A----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-CCA-T-----G---T-T-G-C-T---AA-TTT--A-AT-GTC-A-AGT-----GA-A-CTTGAC-C-TTT
gi|120519                     :                                               --AA-T-C-TC-C-CG-AA--G-G-G-T-AT-T---G--TT-AA----C-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-G-----AA-A--T-G-G-AAA-TCA-T-----A---T-T-G-C-T---AT-CTT--T-AT-GTC-C-AGA-----GA-G-TTTGAC-C-TTT
gi|120520                     :                                               --AA-T-C-TC-C-CG-AA--G-G-G-T-AT-C---G--TT-AA----C-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-G-----AA-A--T-G-G-AAA-TCA-T-----A---T-T-G-C-T---AT-CTT--T-AT-GTC-C-AGA-----GA-G-TTTGAC-C-TTT
gi|120521                     :                                               --AA-T-C-TC-C-CG-AA--G-G-G-T-AT-T---G--TT-AG----C-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-G--T-T-G-----AA-A--T-G-G-AAA-TCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTG-C-AGT-----CA-G-CTCGAC-T-TTT
gi|120524                     :                                                  A-T-C-TC-T-CA-AA--G-T-G-T-GT-T---G--GT-A-----C-C-GT----T---C-A-A-G----A----AAT--T-T-C-----AA-A--T-G-G-AAA-TCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGC-----AA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120531                     :                                                     -C-TC-C-TA-GA--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-T-GC----T---C-A-T-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-TCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-ATGGTC-CTAGT-----GA-G-CTTGAC-C-TT
gi|120532                     :                                                       -TC-A-CA-AA--G-T-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-ATACATT---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGA-----AA-G-CTTTAC-C-TTT
gi|120536                     :                                                            -CA-AA--G-G-G-T-GT-T---G--GT-AA----C-C-GT----T---T-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-A-T---AC-TTT--A-AT-GTC-A-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120537                     :                                                            -CA-AA--A-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-T-GT----T---C-A-A-A----G----T-T--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-T-T---AC-TTC--A-AT-GTC-C-AGA-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120543                     :                                                                  --G-G-G-T-CT-T-------T-AA----C-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-CTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT


blockSeqs                     :      C    C     A     CCC  T G  AGT           CA         CA      TGGTGTG       CCCG            AC   ACAT TTT       ATTC TTCA          TTTTT                     ATCAA                      AA                     C
blockSeqs                     :      T    C     A     A    A T  GA            C          AA      TTGTGTG       GAG             CT   G    A         TTTC TTCA          A                         ATG                        A                      G
blockSeqs                     :      .    C     A     .    C G  G             .          AA      GGGTTG        G               C    .    .         A    .             T                         A                          G                      C
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . G  G             .          A       TTGGTG        G               C    .    .         .    .             T                         A                          A                      C
blockSeqs                     :      .    .     C     .    . .  .             .          A       GGTGTT        G               C    .    .         .    .             T                         .                          A                      .
blockSeqs                     :      .    .     C     .    . .  .             .          A       GGGATG        G               C    .    .         .    .             A                         .                          A                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       TGGTA         G               C    .    .         .    .             A                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       GGATA         G               C    .    .         .    .             T                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       GGATA         G               C    .    .         .    .             G                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       GGGTG         G               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     C     .    . .  .             .          A       TGGTG         G               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     C     .    . .  .             .          A       GGGTG         G               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          T       GGGTG         G               A    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     C     .    . .  .             .          A       GGGTG         G               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       TAGTG         G               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     C     .    . .  .             .          A       GGGTG         G               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       AAGTG         G               T    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       GGGTG         G               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     C     .    . .  .             .          A       GAGTG         C               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       GAGTG         T               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       GGGTG         G               T    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       GGGTG         G               T    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       GGGTG         G               T    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       TGGGT         G               A    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       AATTG         A               T    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     C     .    . .  .             .          A       AATTG         G               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       GGGTG         G               T    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       TGGTG         G               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     C     .    . .  .             .          A       GGGTG         G               T    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       TGGTG         G               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       CGATG         T               T    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     C     .    . .  .             .          G       GGGTG         G               T    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       GATTG         G               T    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       GGGTA         G               T    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       GGTTG         G               T    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       GGGTG         G               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       GGGTG         G               T    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     C     .    . .  .             .          A       GGGTA         G               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       GGGTG         G               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       GGGTG         G               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       GGGTG         G               T    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       TGGTG         G               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       GGGCG         G               T    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       GGGTA         G               T    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       GGGTG         G               T    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       GGGTA         A               T    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       GGGTG         G               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          G       GGGTG         G               T    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       ATGTG         G               T    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       GGGTA         A               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       GGGTG         G               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     T     .    . .  .             .          C       GGGCA         G               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       GGGTA         G               T    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       CGGTG         C               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       GGGTA         G               T    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     A     .    . .  .             .          A       GGGTA         G               A    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     .     .    . .  .             .          A       GGGTA         G               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     .     .    . .  .             .          A       GTGTG         G               T    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     .     .    . .  .             .          A       GGGTG         G               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     .     .    . .  .             .          A       GTGTG         G               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     .     .    . .  .             .          A       GGGTG         G               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     .     .    . .  .             .          A       AGGTG         G               T    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     .     .    . .  .             .          A       GGGTC         G               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     .     .    . .  .             .          A       GGAA          G               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     .     .    . .  .             .          A       GGTG          G               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     .     .    . .  .             .          C       TGTG          G               T    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     .     .    . .  .             .          A       GGTG          G               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     .     .    . .  .             .          C       GATG          G               T    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     .     .    . .  .             .          A       GGGT          G               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     .     .    . .  .             .          A       GCG           .               T    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     .     .    . .  .             .          C       GAG           .               T    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     .     .    . .  .             .          C       GA            .               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :      .    .     .     .    . .  .             .          C       GA            .               T    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :           .     .     .    . .  .             .          C       GG            .               T    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :                 .     .    . .  .             .          T       G             .               T    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :                       .    . .  .             .          C       G             .               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :                            . .  .             .          C       G             .               T    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :                              .  .             .          C       A             .               T    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :                                               .          C       .             .               T    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :                                               .          C       .             .               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :                                               .          C       .             .               T    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :                                               .          C       .             .               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :                                               .          C       .             .               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :                                               .          C       .             .               T    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :                                               .          C       .             .               C    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :                                               .          C       .             .               .    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :                                               .          C       .             .               .    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :                                               .          T       .             .               .    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :                                               .          C       .             .               .    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :                                               .          A       .             .               .    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :                                               .          .       .             .               .    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :                                               .          .       .             .               .    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :                                               .          .       .             .               .    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :                                                          .       .             .               .    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :                                                          .       .             .               .    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
blockSeqs                     :                                                          .       .             .               .    .    .         .    .             .                         .                          .                      .
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gi|120381                     : ATA-C-AC-A-A--GA-----T---TA-T-C----TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA------------------------C-AA----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTC--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120382                     : ATA-C-AC-A-A--GACA--AT---TA-T-CA---TG---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AAT-G-GTG-T-GT-T---A--TT-AA----CAC-GT----T---C-AGA-A----A----A-T--T-T-T-----AAGA--A-G-A-AAA-CCA-T-----A---G-C-G-C-A---AC-TTT--A-AT-G-C-C-AGT-----GA-G-C-TGACAC-TTT
gi|120383                     : ATA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---AT---T----C--AA-T-C-TC-A-CG-AC--A-A-T-T-G------G--TT-----------------T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-TT----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-TA----A---T-T-G-C-T----C-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120384                     : ATA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---AT---T----C--AA-T-C-TC-A-CG-AC--A-A-T-T-G------G--TT-----------------T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-TT----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-TA----A---T-T-G-C-T----C-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120385                     : ATA-C-AC-A-A--GACA--AT---TA-T-CA----T---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AATTG-T-G-T-GT-T---G--TTAAA----C-C-GT----T---C-A-A-A----A----A-T--TAT-T-----AA-A--A-G-A-AAA-CCATT-----ACTTT-C-G-C-A---ACTTTT--A-AT-GCC-C-ATT-----GA-GTCTTGAC-C-TTT
gi|120386                     : ATA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---CT---T----C--AT-T-C-TC-A-CA------------------------C-GA----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T------A-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC--TT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120387                     : ATA-C-AC-A-A--GA-----T---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-----A--G-A------T-T---G--TT-CA--------------------A-A-G----A----A-T--T-T-TA----AA-A--T-G---AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120388                     : ATA-C-AC-A-A--GA-----T---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-GA--G-G-G-T-GT-T---G--TA-AA----C-C-AT----T---T-A-A------------------T-T-----GA-A--T-------A-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC------A-AT-GTC-A-ATT-----GA-G-CATGAC-C-TTT
gi|120389                     : ATA-C-AC-A-A--AAAG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-AC-A-CA-AA--T-G-G-T-GT-T---T--TA-AA----C-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-C--T-T-T-----AA-T--T-G-A-ATA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---GC-AAT--A-AT-GTC-A-ATT-----GG-G-ATTGAC-A-TTT
gi|120390                     : ATA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-C----TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-CA-----------T-T-------------------GT----T---C-A-A-G----A----C-T--T-T-T-----AA-A--T-G---AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGCC-C-TTT
gi|120391                     : ATA-T-AC-A-A--AGAG--ATA--TA---CA---TT---T----C--AA-T-C-CCCA-CA-AC--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-ATG---T---C-A-A-A----A----A-GGGT-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-G-----A---T-T-G-C-T---AC-TTA--A-AT-GCC-C-AGT-----GC-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120392                     : ATA-C-AC-A-A--GA-----T---TA-T-CA---TT--------C--AA-TTC-TC-A-CA-A-------G-A-GT-T---G--TT---------------------C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC--TT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120393                     : ATA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-A------------------------GA----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A----T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-----------------C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-T-AGT-----GA-G-C-TGAC-C-TTT
gi|120394                     : ATA-C-AC-A-A--GACA--TT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AA--T-G-G-T-GT-TCCCG--TT-AA----C-C-AT----T-------------------A-T--T-T-TTTTTTAA-A--A-G-A-AAA-CCA-T-----A---C-T-G-G-T---AC-TTT--A-AT-GCC-C-AGT-----GA-G-CTT
gi|120396                     : ATA-CCAC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC---TA-AC--G---------------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-TATAAC-TTCG-A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120397                     : ATA-C-AC-A-A----AG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AG------------------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-----------------C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120398                     : ATATC-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TT-G-C---A--C-G-A-T-GT-T---G---------------------T---C-A-A-GA---A----A-T--T-T-TA----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-TATCAAA---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GAGG-CTTGAC-C-TCT
gi|120399                     : ATA-C-AC-A-A--GA-----T---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-A------------------------GA----T-T-GT----T---C-A-ATG----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-TATG--A---T-T-G-C-T---AC-TTTA-A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120400                     : ATA-C-AC-A-A--GA-----T---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AA-----------T-T-------------------GT----T---C-A-A-A----A----A----T-T-T-----AA-A--T-G-A-AA---CA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120401                     : ATA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AT-T-C-TC-A-CC-GA-----------T-T-------------------GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----TA-A--T-G-G-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-CTT---AC-TTT----AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120402                     : ATA-C-AC-A-A--G------T---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-C-CA-AA----G-G-T-GT-T---G---C-AT----T-T-GT----T---C-A-A-A----A----A-T--T-TAA-----AA-A--A-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AT-CTT-----T-GCC-C-AGT-----GA-G-CTTGACGC-TTT
gi|120403                     : ATA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---T-------------------------------G-G-G-T-GT-T---------AA----C-C-GT----A---C-T-A-G----A----A-A--T-T-C-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-ATC-C-AGT-----GA-G-TTTGAC-C-TTT
gi|120404                     : ATA-C-AC-A-A--GA-----T---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-A---G-A-T-T-GT-T-------T-AA----C-------------------G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---ACATAT--T-AT-GTC-C-AGA-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120405                     : ATA-C-AC-A-A--GA-----T---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC---CA-AG--A--------T-T---G--TT-CA--------------------A-A-G----A----A-T--T----------A-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120406                     : ATA-C-AC-A-A--GA-----T---TA-T-CA---TT--------C--AA-T-C-TC-A-CA-GA-----------T-T-------------------GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA--CA-T-----A-----T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TT
gi|120407                     : ATA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---TT---T-------AA-T-T-TC-A-CA--------------T-C---G--AT-------C-T-AT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-AA-T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-TGG-C-T---AC-TTTA-A-AT-GTC-C-AGT-----G--G-CTTGGA-C-TTT
gi|120408                     : ATA-C-AC-A-A--G--G--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AG------------------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AA--CCA-----------------C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-A-TTTGAC-C-TTT
gi|120451                     :  TA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-C----TT---T----C--A--T-C-TC-A-CA-AA--G-G-G-T-AT-T---G--TT-AA----C-C-AT----T-----A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--A-G-G-AAA-TCA-T-----A---T-T-G-C-T---AA-TTT--A-AT-GTC-C-AAT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120452                     :  TA-C-AC-ACA--GAAA--AT---TA-TGCAG--TT---T----C--AA-T-C-CA-A-CA-AA--G-G-T-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-AT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-------AA-A--T-A-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTC--A-AT-GTC-A-AGT-----GACG-CTTGAC-C-TTT
gi|120453                     :  TA-C-AC-ACA--GAAA--AT---TA-TGCGAGTTT---T----C--AA-T-C-TC-AACA-AA--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-AT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-TT----AA-A--T-A-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTC--A-AT-GT--C-AAT-----GACG-CTTGAC-C-TTT
gi|120454                     :  TA-C-AC-A-A--GA-----T---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AG------------------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A------T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--ATAT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120455                     :  TA-C-AC-A-A--GA-----T---TA-T-CA---TT---T----C--A--T-CATC-AACA-AA--G-A---T-GT-T---G--TT-AT----C-C-AT----TTTTC-A-A-A----A----A-T--T-G-A-----AA-A--AAG-A-AAA-TCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GCC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-T-TTT
gi|120456                     :  TA-CTAC-A-G--GAAGGGAT---TA-T-CA---TG---T----C--AAAT-C-TC-A-CA-CA--G-G-G-T-----------TT-----------GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----TA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---TAT-G-C-T---AC-TTTA-A-AT-GTC-C-AGT-----AA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120457                     :  TA-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA------------------------C-AA----T-T-GT----T---C-A-A------A----A-T--T-T-G-----AA-A--T-G---AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTT-C--GT-----GA-G-CTTG-C-C-TTT
gi|120458                     :  TA-C-AC-A-AAGGAAG--AT---TA---CA---TT---T----C--AA-T-C-TT-A-CA-AC--G-GTG-T-TT-T---G--TT-AA----C-A-GT----TA--C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AATG--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---TGT-A-C-C---AC---T--A-AT-TTC-C-AGT-----GA-GCCTTGAC-T-TTT
gi|120465                     :   A-C-AC-A-A--GAAG--AT---TA-T-AA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AA--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C---------------------------A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----
gi|120466                     :   A-C-AC-A-A--GA-G--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-GA-----------T-T-------------------GT----T---C-A-A-T----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-GAA-AAA-ACA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-T-CTTGAC-C-TTT
gi|120467                     :   A-C-AT-A-A--AATA--AT---CAAT-CA---ATCAAT----C--AA-T-C-TC-A-CA-AA--G-G-G-T-AT-T---GAGCT-AT----T-T-GT----T---C-A-A-A----A----G-A--T-T-T-----AA-A--A-A-AGAAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GCCGC-AGT-----GA-G-CTTGAC-T-TTT
gi|120472                     :    -C-ACTA-A--GAAT--ATCCCTACT-TA---TC---C----C--AT-T-C-TC-C-CA-AA--G-G-G-T-GT-T---G--TC-AG----C-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-ATC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120473                     :    -C-AC-A-A--GAAT--GT---TA-T--A---TT---T-------AA-T-C-TC-A-CA-AA--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA------C-GT----T---C-A-A-G----A---------T-T-T-----AA-T--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-C-CAT---AC-TTTAAA-AT-GTC-C-AGCACAAGAA-G-CCAGAC-C-TTT
gi|120478                     :        C-A-A--GAAT--AT---CC-C-CG---CT---TACCCC--AG-T-C-TC-C-TA-AA--G-G-G-T-GT-T---A--TT-AA----T-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AA-TTT--A-CT-GTC-C-CAT-----CA-G-CTTGAT-C-ATT
gi|120486                     :                AAG--AT---TA-T-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-CA-AG------------------------A----T-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT----AT-GT--C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120489                     :                       ---TA-C-CA---TT---T----C--AA-T-C-TC-A-GA-AA--G-G-GAT-GT-T---G--TT-AATTTTC-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-G-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCG-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGA-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120490                     :                            -T-TA---CT---C----C--AA-T-T-TC-C-CA-AA--T-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-TT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-ATT-----GA-G-TTCGGC-C-TTT
gi|120493                     :                              -CA---CT---T----CCAAA-A-C-TC-C-CA-AA--G-G-G-C-GT-T---G--TG-AA----C-C-GT----A---C-A-A-G----A----C-G--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-T-TTT
gi|120494                     :                                      ---T----C--AA-T-C-TC-C-CG-AA--G-G-G-T-AT-T---A--TT-AA----T-T-CT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-G-----AA-A--T-G-G-AAA-TCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--T-AT-GTC-C-AGA-----GG-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120496                     :                                          ----C--AA-A-C-TC-C-CA-AA--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-C-----A---T-A-A-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120497                     :                                          ----C--AA-T-C-TC-T-CA-AA--G-G-G-T-AT-T---G--TT-AA----C-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-G-----AA-A--T-G-G-AAA-TCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120498                     :                                          ----C--AA-T-C-TC-C-CA-AA--G-G--------T---G--TT-AA----C-C-AT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-TCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120499                     :                                          ----C--AA-T-C-TC-C-AA-AA--G-G-G-T-GT-T---C--TT-AA----C-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--C-G-G-AAA-CCA-G-----A---T-T-G-T-T---AC-TTC--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
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gi|120501                     :                                          ----C--AA-T-C-TC-C-TA-AA--A-T-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-G-ATA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AT-TTA--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAT-CATTT
gi|120502                     :                                          ----C--AA-T-C-TC-C-CG-AA--G-G-G-T-AT-T---G--TT-AA----C-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-A-----AA-A--T-A-G-AAA-TCA-T-----A---T-C-A-C-T---AC-CTT--T-AT-GTC-C-AGA-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120503                     :                                          ----C--AA-T-C-TC-C-CG-AA--G-G-G-T-GT-C---G--T---A----C-CTGT----T---C-A-AAG----A----A-T--T-T-TG----AA-A--T-G-G-AAA-TCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-A-ATT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120504                     :                                          ----C--AA-T-C-TC-C-CG-AA--G-G-G-C-AT-T---G--TT-AA----C-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-G-----AA-A--T-A-G-AAA-TCA-T-----A---T-T-G-C-A---AC-CTT--T-AT-GTC-C-AGA-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120505                     :                                          ----C--AA-T-C-TC-C-CG-AA--G-G-G-T-AT-T---G--TT-AA----C-T-GT----T---C-A-A-G----A----T-T--T-T-G-----AA-A--T-A-G-AAA-TCA-T-----A---T-C-G-C-T---AC-TTT--T-AT-GTC-C--GA-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120518                     :                                               --AA-T-C-TC-C-CA-AA--C-G-G-T-GT-T---G--TT-TA----C-C-GT----T---C-A-C-A----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-CCA-T-----G---T-T-G-C-T---AA-TTT--A-AT-GTC-A-AGT-----GA-A-CTTGAC-C-TTT
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gi|120520                     :                                               --AA-T-C-TC-C-CG-AA--G-G-G-T-AT-C---G--TT-AA----C-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-G-----AA-A--T-G-G-AAA-TCA-T-----A---T-T-G-C-T---AT-CTT--T-AT-GTC-C-AGA-----GA-G-TTTGAC-C-TTT
gi|120521                     :                                               --AA-T-C-TC-C-CG-AA--G-G-G-T-AT-T---G--TT-AG----C-T-GT----T---C-A-A-G----A----A-G--T-T-G-----AA-A--T-G-G-AAA-TCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTG-C-AGT-----CA-G-CTCGAC-T-TTT
gi|120524                     :                                                  A-T-C-TC-T-CA-AA--G-T-G-T-GT-T---G--GT-A-----C-C-GT----T---C-A-A-G----A----AAT--T-T-C-----AA-A--T-G-G-AAA-TCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGC-----AA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120531                     :                                                     -C-TC-C-TA-GA--G-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-T-GC----T---C-A-T-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-TCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-ATGGTC-CTAGT-----GA-G-CTTGAC-C-TT
gi|120532                     :                                                       -TC-A-CA-AA--G-T-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-C-ATACATT---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-TTT--A-AT-GTC-C-AGA-----AA-G-CTTTAC-C-TTT
gi|120536                     :                                                            -CA-AA--G-G-G-T-GT-T---G--GT-AA----C-C-GT----T---T-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-A-T---AC-TTT--A-AT-GTC-A-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120537                     :                                                            -CA-AA--A-G-G-T-GT-T---G--TT-AA----C-T-GT----T---C-A-A-A----G----T-T--T-T-T-----AA-A--T-G-G-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-T-T---AC-TTC--A-AT-GTC-C-AGA-----GA-G-CTTGAC-C-TTT
gi|120543                     :                                                                  --G-G-G-T-CT-T-------T-AA----C-C-GT----T---C-A-A-G----A----A-T--T-T-T-----AA-A--T-G-A-AAA-CCA-T-----A---T-T-G-C-T---AC-CTT--A-AT-GTC-C-AGT-----GA-G-CTTGAC-C-TTT