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gi|91197                      : GGGGTTC-GCAGAGAT-ATCCGA-AAGT-T--GAC-T---TCCAA-TAT-CA--T-TTA------GTT-TT-GAA-T--TACT-G-CCT--C-ACTA-TCGCTTT--G---G----GCCA-AA--CAG-T---A-CTC---ATTCAAC---A----TATACATCGTT---A-AT---T-TT-A----TC-GACATT---TT---TCA-G-CC-A-TACT-CG-AA--AGC-GTGTT-GC-GT--GGG-ACACC--GTA-T-TTCT--------C--GG-C----TAT---G-A-C-GG-C---TT-----TT--GAT-A---GTTCAC---C--TTTCT-TCACATCAT-TTACTGCT-TGAA
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Reference ( family-867 )      : GGGGTTC-G---AG-AT-ATCCGA-A-GT-T--GACT---TCC-A-A-TAT-C-A-C-TTT------GTT-TTGAA-T--TACC-ATC-T-C-ACTA-TCGCTTT--G---G----GCCA-AA--C-G-T---A-CTC---ATTT--CA----T-ACGCA-TCGTN-TTA-AT---T-TTA----TC-GACATT---TT---TCA-G-CC-A-TG-T-CG-AA--AGC-GTGTT-GC-GT--GGG-ACACC--GTA-T-TTCT--------C--G--C----G--AT---G-G-C-GG-C---TT--TT--GAT-A---GTTCAC---C--TTTCT-TCACATCAT-TTACTGCT-TGAA
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Reference ( family-867 )      : GGGGTTC-G---AG-A-TATCCGA-A-GT-T--GACT---TCC-A-A-TAT-C-A-C-TTT------GTT-TTGAA-T--TACC-ATC-T-C-ACTA-TCGCTTT--G---G----GCCA-AA--C-G-T---A-CTC---ATTT--CA----T-ACGCA-T--CGT--TTAA---T---T-TT-A----TC-GACATT---TT---TCA-G-CC-A-TG-T-CG-AA--AGC-GTGTT-GC-GT--GGG-ACACC--GTA-T-TTCT--------C--G--C----G--AT---G-G-C-GG-C---TT--TT--GAT-A---GTTCAC---C--TTTCT-TCACATCAT-TTACTGCT-TGAA
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Reference ( family-867 )      : GGGGTTC-G---AG-AT-ATCCGA-A-GT-T--GACT---TCC-A-A-TAT-C-A-C-TTT------GTT-TTGAA-T--TACC-ATC-T-C-ACTA-TCGCTTT--G---G----GCCA-AA--C-G-T---A-CTC---ATTT--CA----T-ACGCA-T--CG--T------T--A-AT-T-TTA----TC-GACATT---TT---TCA-G-CC-A-TG-T-CG-AA--AGC-GTGTT-GC-GT--GGG-ACACC--GTA-T-TTCT--------C--G--C----G--AT---G-G-C-GG-C---TT--TT--GAT-A---GTTCAC---C--TTTCT-TCACATCAT-TTACTGCT-TGAA
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Reference ( family-867 )      : GGGGTTC-G---AG-AT-ATCCGA-A-GT-T--GACT---TCC-A-A-TAT-C-A-C-TTT------GTT-TTGAA-T--TACC-ATC-T-C-ACTA-TCGCTTT--G---G----GCCA-AA--C-G-T---A-CTC---ATTT--CA----T-ACGCA-T--CG--T------T--A-AT-T-TTA----TC-GACATT---TT---TCA-G-CC-A-TG-T-CG-AA--AGC-GTGTT-GC-GT--GGG-ACACC--GTA-T-TTCT--------C--G--C----G--AT---G-G-C-GG-C---TT--TT--GAT-A---GTTCAC---C--TTTCT-TCACATCAT-TTACTGCT-TGAA
gi|91196                      : GGGGTTC-G---AG-ATTATCCGA-A-GT-T--GACT---TCC-A-A-TAT-C-A-T-TTT------GTT-TTGAA-T--TACC-A-C-T-C-ACTA-TCGCTTT--G---G----GCCA-AA--C-G-T---A-CTC---ATTT--CA----T-ACACA-T---G--T------TTTA-AT-T-TTA----TC-GACATT---TT---TCA-G-CC-A-TG-T-CG-AA--AGC-GTGTT-GC-GT--GGG-ACACC--GTA-T-TTCT--------C--G--C----G--AT---G-A-C-GG-C---TT--TT--GAT-A---GTTCAC---C--TTTCT-TCACATCAT-TTACTGCT-TGAA
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blockSeqs                     :        . .    .  .      . .  . .     .     . . A   . . . .   .        .     . .     .   . . .    .       .  .   .       .  .  . . .   .   .      .   .    . TG  . T   .  TAC          . . T .     .      .    .     . .  . .  . .  .  G    .     .  .  A    .     .    . .    CTGGCG                  .   A   .  . .    .   .    . .        .   A      .         .        .
blockSeqs                     :        . .    .  .      . .  . .     .     . . .   . . . .   .        .     . .     .   . . .    .       .  .   .       .  .  . . .   .   .      .   .    . TG  . T   .  TA           . . T .     .      .    .     . .  . .  . .  .  .    .     .  .  A    .     .    . .    CAGGCG                  .   G   .  . .    .   .    . .        .   .      .         .        .
blockSeqs                     :        . .    .  .      . .  . .     .     . . .   . . . .   .        .     . .     .   . . .    .       .  .   .       .  .  . . .   .   .      .   .    . CA  . T   .  TA           . . T .     .      .    .     . .  . .  . .  .  .    .     .  .  G    .     .    . .    CGGCTG                  .   G   .  . .    .   .    . .        .   .      .         .        .
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blockSeqs                     :        . .    .  .      . .  . .     .     . . .   . . . .   .        .     . .     .   . . .    .       .  .   .       .  .  . . .   .   .      .   .    . TG  . C   .  AA           . . T .     .      .    .     . .  . .  . .  .  .    .     .  .  G    .     .    . .    TGGCG                   .   A   .  . .    .   .    . .        .   .      .         .        .
blockSeqs                     :        . .    .  .      . .  . .     .     . . .   . . . .   .        .     . .     .   . . .    .       .  .   .       .  .  . . .   .   .      .   .    . TA  . A   .  TA           . . T .     .      .    .     . .  . .  . .  .  .    .     .  .  G    .     .    . .    TGGCG                   .   G   .  . .    .   .    . .        .   .      .         .        .
blockSeqs                     :        . .    .  .      . .  . .     .     . . .   . . . .   .        .     . .     .   . . .    .       .  .   .       .  .  . . .   .   .      .   .    . TT  . C   .  TA           . . T .     .      .    .     . .  . .  . .  .  .    .     .  .  G    .     .    . .    CGGCG                   .   G   .  . .    .   .    . .        .   .      .         .        .
blockSeqs                     :        . .    .  .      . .  . .     .     . . .   . . . .   .        .     . .     .   . . .    .       .  .   .       .  .  . . .   .   .      .   .    . AG  . T   .  TA           . . T .     .      .    .     . .  . .  . .  .  .    .     .  .  A    .     .    . .    CTGTG                   .   G   .  . .    .   .    . .        .   .      .         .        .
blockSeqs                     :        . .    .  .      . .  . .     .     . . .   . . . .   .        .     . .     .   . . .    .       .  .   .       .  .  . . .   .   .      .   .    . CG  . C   .  TA           . . T .     .      .    .     . .  . .  . .  .  .    .     .  .  G    .     .    . .    GGGCG                   .   G   .  . .    .   .    . .        .   .      .         .        .
blockSeqs                     :        . .    .  .      . .  . .     .     . . .   . . . .   .        .     . .     .   . . .    .       .  .   .       .  .  . . .   .   .      .   .    . CG  . C   .  TG           . . . .     .      .    .     . .  . .  . .  .  .    .     .  .  T    .     .    . .    CGGC                    .   T   .  . .    .   .    . .        .   .      .                   
blockSeqs                     :        . .    .  .      . .  . .     .     . . .   . . . .   .        .     . .     .   . . .    .       .  .   .       .  .  . . .   .   .      .   .    . TA  . C   .  AA           . . . .     .      .    .     . .  . .  . .  .  .    .     .  .  .    .     .    . .    CCG                     .   A   .  . .    .   .    . .        .   .      .                   
blockSeqs                     :        . .    .  .      . .  . .     .     . . .   . . . .   .        .     . .     .   . . .    .       .  .   .       .  .  . . .   .   .      .   .    . C   . C   .  TA           . . . .     .      .    .     . .  . .  . .  .  .    .     .  .  .    .     .    . .    GGC                     .   .   .  . .    .   .    . .        .   .                          
blockSeqs                     :                                                                       .     . .     .   . . .    .       .  .   .       .  .  . . .   .   .      .   .    . .   . .   .  .            . . . .     .      .    .     . .  . .  . .  .  .    .     .                                                                                                                         
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originalCons                  : GGGGTTC-G---AG-AT-ATCCGA-A-GT-T--GACT---TCC-A-A-TAT-C-A-C-TTT------GTT-TTGAA-T--TACC-ATC-T-C-ACTA-TCGCTTT--G---G----GCCA-AA--C-G-T---A-CTC---ATTT--CA----T-ACGCA-T--CG--T------T--A-AT-T-TTA----TC-GACATT---TT---TCA-G-CC-A-TG-T-CG-AA--AGC-GTGTT-GC-GT--GGG-ACACC--GTA-T-TTCT--------C--G--C----G--AT---G-G-C-GG-C---TT--TT--GAT-A---GTTCAC---C--TTTCT-TCACATCAT-TTACTGCT-TGAA
finalCons                     : GGGGTTC-G---AG-AT-ATCCGA-A-GT-T--GACT---TCC-A-A-TAT-C-A-C-TTT------GTT-TTGAA-T--TACC-ATC-T-C-ACTA-TCGCTTT--G---G----GCCA-AA--C-G-T---A-CTC---ATTT--CA----T-ACGCA-TC--G--TTA---------AT-T-TTA----TC-GACATT---TT---TCA-G-CC-A-TG-T-CG-AA--AGC-GTGTT-GC-GT--GGG-ACACC--GTA-T-TTCTCGGCG-----------------AT---G-G-C-GG-C---TT--TT--GAT-A---GTTCAC---C--TTTCT-TCACATCAT-TTACTGCT-TGAA





Alignments
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lowQualScore                  :        . ...  .  .      . .  . ..    ...   . . .   . . . .   ......   .     . ..    .   . . .    .       .. ... ....    .  .. . . ... .   ...    ..  .... . ..  . ... .. ...........  . . . ....  .      ...  ...   . .  . .  . .  .  ..   .     .  .  ...  .     ..   . .    .......   .........  . ... .  . ...  ..  ..   . ...      ... ..     .         .        .    
lowQualScore                  :        7 777  7  7      7 7  7 77    777   7 7 0   7 7 7 3   333333   5     7 22    4   4 4 4    7       44 444 3333    5  99 5 5 444 5   444    44  3333 5 99  5 777 44 22222222222  5 5 7 3333  5      444  444   5 5  0 5  5 5  5  44   5     5  7  222  7     33   7 7    9999999   888888888  7 777 7  7 777  77  77   7 777      777 00     9         7        3    
consensus                     : GGGGTTC-G---AG-AT-ATCCGA-A-GT-T--GACT---TCC-A-A-TAT-C-A-C-TTT------GTT-TTGAA-T--TACC-ATC-T-C-ACTA-TCGCTTT--G---G----GCCA-AA--C-G-T---A-CTC---ATTT--CA----T-ACGCA-T--CG--T------T--A-AT-T-TTA----TC-GACATT---TT---TCA-G-CC-A-TG-T-CG-AA--AGC-GTGTT-GC-GT--GGG-ACACC--GTA-T-TTCT-----C-GGC------G--AT-G-G-C-GG-C---TT--TT--GAT-A---GTTCAC---C--TTTCT-TCACATCAT-TTACTGCT-TGAA
Reference ( family-867 )      : GGGGTTC-G---AG-AT-ATCCGA-A-GT-T--GACT---TCC-A-A-TAT-C-A-C-TTT------GTT-TTGAA-T--TACC-ATC-T-C-ACTA-TCGCTTT--G---G----GCCA-AA--C-G-T---A-CTC---ATTT--CA----T-ACGCA-T--CG--T------T--A-AT-T-TTA----TC-GACATT---TT---TCA-G-CC-A-TG-T-CG-AA--AGC-GTGTT-GC-GT--GGG-ACACC--GTA-T-TTCT-----C-GGC------G--AT-G-G-C-GG-C---TT--TT--GAT-A---GTTCAC---C--TTTCT-TCACATCAT-TTACTGCT-TGAA
gi|91196                      : GGGGTTC-G---AG-ATTATCCGA-A-GT-T--GACT---TCC-A-A-TAT-C-A-T-TTT------GTT-TTGAA-T--TACC-A-C-T-C-ACTA-TCGCTTT--G---G----GCCA-AA--C-G-T---A-CTC---ATTT--CA----T-ACACA-T---G--T------TTTA-AT-T-TTA----TC-GACATT---TT---TCA-G-CC-A-TG-T-CG-AA--AGC-GTGTT-GC-GT--GGG-ACACC--GTA-T-TTCT-----C--GC------G--AT-G-A-C-GG-C---TT--TT--GAT-A---GTTCAC---C--TTTCT-TCACATCAT-TTACTGCT-TGAA
gi|91197                      : GGGGTTC-GCAGAG-AT-ATCCGA-AAGT-T--GACT---TCC-A-A-TAT-C-A-T-TTA------GTT-TTGAA-T--TACT-GCC-T-C-ACTA-TCGCTTT--G---G----GCCA-AA--CAG-T---A-CTC---ATTCAACA----T-ATACA-T--CG--T------T--A-AT-T-TTA----TC-GACATT---TT---TCA-G-CC-A-TACT-CG-AA--AGC-GTGTT-GC-GT--GGG-ACACC--GTA-T-TTCT-----C-GGC------T--AT-G-A-C-GG-C---TT--TT--GAT-A---GTTCAC---C--TTTCT-TCACATCAT-TTACTGCT-TGAA
gi|91198                      : GGGGTTC-G---AG-AT-ATCCGA-A-GT-C--AACT---TCC-ATA-T-T-C-A-CATTT------GTT-TTCAA-T--TACC-ATC-T-C-ACTA-TCGCTTT--G---G----GCCC-AA--C-G-T---A-ATC---ATTT--CA----T-ATGCA-T--TG--T------T--A-AT-T-TTA----TC-GACATT---TT---TCA-G-CC-A-TT-T-TG-AA--AGC-GTGTT-GC-GT--AGG-ACACT--GTA-TATTCT-----T-GGC------G--AT-G-G-C-GG-C---TT--TT--GAT-A---GTTCAC---CT-TTTCT-TCACATCAT-TTACTGCC-TGAA
gi|91199                      : GGGGTTC-G---AG-AT-ATCCGA-A-GT-C--AACT---TCC-A-A-TAT-C-A-CATTT------GTT-TTCAA-T--TACC-ATC-T-CCACTA-TCGCTTT--G---G-----CCA-AA--C-G-T---A-ATC---ATTT--CA----T-ATGCA-T--TG--T------T--A-AT-T-T-A----TC-GACATT---TT---TCA-G-CCCA-TT-T-TG-AA---GC-GTGTT-G--GT--AGG-ACACT--GTA-T-TTCT-----T-GGC------G--AT-G-G-C-GG-C---TT--TT--GAT-A---GTTCAC---CTTTTTCT-TCACATCAT-TTACTGCC-TGAA
gi|91200                      : GGGGTTC-G---AG-AT-ATC-GA-A-GT-T--AACT---TCC-A-A-TATTC-A-C-TTT------GTT-TTGAA-T--TACC-ATC-T-C-ACTA-TCGCTTT--G---G----GC-A-AA--T-G-T---A-CTC---ATTT--CA----T-ATGCA-T--TG--T------A--A-TT-T-TTA----TT-GACATT---TT---TCA-G-CT-A-TG-T-CG-AA--AAC-GTGTT-GC-GC--GGG-ACACC--GTA-T-TTCT-----CTGGC------G--AT-G-G-CGGG-C---TT--TT--GAT-A---GTTCAC---CA-TTTTT-TCACAT-GT-TTACTGCT-TGAA
gi|91201                      : GGGGTTC-G---AG-AT-ATCCGATA-GT-T--GACT---TCC-A-AATAT-A-A-T-TTT------TTT-TTAAAAT--TACC-ACG-T-C-GTTA-TCGCTTT--G---G------CA-AA----G-TCTAA-CT----ATTT--CA----T-ACAAAAT--CG--T------T--A-AT-T-T-A----TC-GACATT---TT---TTC-G-CC-AATG-T-CG-AA--AGC-ATGTT-GC-GT--GGG-ACACC--GTA-T-TTCT-----CAGGC------G--AT-G-A-C-GG-C----T--TT--GATAA---GTTCAC---C--ATTCT-TCACATCA
gi|91202                      : GGGGTTCCG---AG-AT-ATCCGA-A-GT-T--GACT---TCA-A-AATAT-C-A-T-TTT------GTT-TTGTA-T--TAAC-ACC-T-C-ACTA-TCGCTTA--G---G----GCCA-AA--C-G-T---A--TC---ATAT--CAAAACC-AAACA-T--CGTCT------C--ACATCT-TTATTCTTT-GACTTT---ATGGATCA-GACC-A-TG-T-CG-AA--AGC-GTGTT-GC-GT--GGGTACACCGGGTA-T-TTCTTGTTCC-GGCGCAGAAG--AT-GAA-C-GGAC---TT--TT--GAT-A---GTTCAC---C--TTTCT-TCACATCA--TTACTGCT-TGA
gi|91203                      : GGGGTTC-G---AG-AT-ACCCGA-A-GT-T--AACT---TCC-A-A-TAT-C-A-C-TTT------GTT-TTGAA-T--TACC-ATC-T-C-ACTA-TCGCTTT------G----GCCA-AA--C-G-T---A-CTC---ATTT--CT----TAATGCA-T--AG--T------T--A-AT-T-TTA----TC-GACATT---TT---TCA-G-AC-A-TG-T-CA-AA--AGC-GTATT-
gi|91204                      : GAGGTTC-G---AG-AT-ATCGGA-A-GT-TTTGACT---TCC-A-A-TAT-C-A-T-TTTATATATGTT-TTTGA-T--TACC-ACC-T-C-ACTA-TCGCTCT--G---G----GCCA-AA--C-G-T-------------TT--TA----T--------------------------------------TC-GACATT---TT---TCA-G-CCCA-TG-T-CA-AACAAGCAGT-TT-GC-ATTTGGG-ACACC--GTA-T-TTCT-----C---C------G--AT-G-G-C-GA-C---TT--TT--GAT-G---GTTCAC---C--TTTCT-TCAC-TCATATTACTGCT-TGAA
gi|91205                      : GGAGTTC-G---A--AT-ATCCGA-A-GT-T--AACT---TTCTA-A-TAT-C-AGC-TTT------GTT-TTAAAAT--TACC-ATC-T-C-TCTATTCGA-TT--G---G----GCCA-AA--C-GCT---A-CTC----TGT--CA----T-AC-CA-T--CG--T------T--A-AT-TCTTA----TCAAACATT---TT---TCA-G-CC-A-TG-T-CGTAA--AGC-GTGTT-GC-GT---TG-ACACC---TA-T-TTCT-----C-GGC------AT-ATGG-G-C-AG-C---TT--TTTGGAT-ACAGATTTAA---C--TTTC
gi|91206                      : GGGGGTC-G---AGCAT-ATCCGA-A-GTAT--GACTCAATCC-A-AATAT-CGA-C-TTTT-----GTTATTGA--T--TACCCACC-TAC-ACTACTCGCTTT--T---GCCGCGCCAGAA--C---T---AGCTCCCAATTT--CA----T-ATACA-TATCG--T------T--ACAT-T-TTA----TC-GACATT---TT----CA-G-CA-A-TG-T-CG-AAG-ACC-CTGTTCGCAGT--GGG-ACACC--GTATT-TTCT-----C-GGCT-----G--AT-G-ACC-GG-CTTGTT--TT--GAT-A---G-TCACCCTC--TTCTT-TCACATCATATTACTGC--TGAA
gi|91207                      : GGGGTTT-G---AG-AT-ATCCGA-A-GT-T--AACT---TCC-A-A-TCT-C-A-C-TTT------GTT-TTGAA-T--TACC-ATC-T-C-ACTA-TGGCTT
gi|91208                      : GGAGTTC-G---AG-AT-ATCCGA-A-GT-T--AACT---TTC-A-G-TAT-C-A-C-TTT------GTT-TTGAA-T--TGCC-ATC-T-C-ACCA-TGGCTT
gi|91209                      :  GGGTTC-G---AG-AT-ATCCGA-A-GT-T--AACT---TC--A-A-TAT---A-C-TT-------GTT-T-GAA-T--TACC-ATC---C-ACTA-TCGCTTT--GTTTA----GCCA-AAA-C-G-T---A-CTC---ATTT--CA----T--TTCA-T--TG--T------T--A-AT-T-TTA----TT-GACATT---TT----CA-G-CC-A-TG-T--G-AA--AGC-GTGTT-GC-GT--GGA-CCAC---GTA-T-TTCT-----C-GGC------G--AT-G---C-G--C---TT--T----AT-C---GTTAAC---C--TTTCT-TCACATCAT-TTACTGCTATGAA
gi|91210                      :  GGGTTC-G---AG-AT-ATCCGA-A-GT-T--GACT---TCC-A-A-TAT-C-A-T-TTT------GTT-TTGAA-T--CACC-AAT-T-C-ACTA-TCTCTTT--G---G----GCCA-AA--C-G-T---A-CTC---ATT
gi|91211                      :                                                                      T-TTGAA-TGTTATC-ATCCT-C-A----TCG--TC--A---A----GTCA-AAAAC---T---A-CTC---TTTT--CG----T-AAGCA-T--CC--T------T--G-AC-T-TTT----GC-AGCATT---GT---TCA-G-CC-A-TG-T-TG-AC--AAA-GTGTT-A--GG--AGG-ATTTC--ATA-T-TTAT-----T-GAC------AATAT-A-G-C-CT-C---TTTATT--GTT-G---GTT------C--TTTCT-CTACATC
gi|91212                      :                                                                          GAA-T--TACC-ATG-T-C-ACTA-TCGCTTT--G---G----GCCA-A---C-G-T---A-CTC---ATTT--TA----T-ACGCA-T--CG--T------A--A-AT-C-T-A----TT-GACATT---TT---TCA-G-CC-A-TG-T-CG-AA--AGC-GTGTT-GC-GT--GGG-ATACC--GTA-T-TTCT-----C-TGT------G--AT-G-G-C-GG-C---TT--TT--CAT-A---GTTCAC---C--TTTCT-TCACATCAT-TTACTGCT-TGAA
gi|91213                      :                                                                                                    CGCTTTCTG---G----GCCA-AA--C-G-T---A-CTC---ATTT--CA----T-ACGCA-T--CG--T------T--A-AT-T-TTA----TC-GACATT---TT---TCA-G-CC-A-TG-T-CG-AA--AGC-GTGTT-GC-GT---GG-ACACC--GTA-T-TTCT-----G-GGC------G--AT-G-T-C-TG-C---CT--TT--GAT-A---GTTCAC---C--TTTCTCTCACATCAT-TCACTGCT-TGAA
gi|91214                      :                                                                                                                                                TT--CA----T-ATACA-T--CG--TGATGAAT--ACAT-G-TTA----TC-GACATTATGTC---TCACG-CC-A-GG-TTCG-TACGAGC-GTGT--GC-GA--TGG-ACACCC-GTT-A-TTC------C-GGC---------AT-G-A-C-AG-----TT--TT--GAT-G---GTTTAC---C--TT-CT-TCACATCAT-TTACTGCT-TGGA