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gi|6363                       : CGGAAAATTGAC--------AGC-GG-TGGGA-TATTT--AACA-T--G-ATATC-------------AGAGAACTTTATAATT-------CA-------GTATCAGGGCGGTTAAAGGAAGGTATAT
gi|6364                       :  GGAAATTGGAC--------TGT-G--TGGGA-AATTT--A-CA-T--G-GTATT-------------C-------------TT-------CA-------ATACAAGGCCGGCCAAAGG-AGCTAT
gi|6365                       :  GAAAATTGGAC--------TGT-GGTCGGGA-AATTT--T-TA-T--GTGTATC-------------A-------------TT-------CA-------ATACCAGGGCGGCTAAAGG-AGCTAT
gi|6366                       :  GGAAATTGGA---------TGT-G--GGGGG-AATTTTAA-CA-T--G-GTATC---------------------------TT-------CA-------ATAGTAGG-CGGCTAAAGG-AGCTAT
gi|6367                       :   GAAATTGGAC--------TGT-G--CGAGA-AATTT--A-CA-T--G-ATATC-------------A-------------TT-------CA-------ATACCAGGGCGGCTAAAGG-AACTAT
gi|6368                       :         GGAC--------TATAG--TGGGA-AATT------A----G-ATATT-------------A-------------TT-------CA-------ATACCAGGACGGCTAAAG---TGTATAT


blockSeqs                     :             AGTGTGAC   A GT     G     TA A  TAC  T     AGACACCTTTATAA               TATAATA  TAACTTC                   A
blockSeqs                     :             .          . G      .     .  .  AT   .     AGAGACCTTTATTA               .        .                         .
blockSeqs                     :             .          . .      .     .  .  T    .     AGAGACCTTTATAA               .        .                         .
blockSeqs                     :             .          . .      .     .  .  T    .     AGAGAACTTTATAA               .        .                         .
blockSeqs                     :             .          . .      .     .  .  T    .     AGAGACTTTATAA                .        .                         .
blockSeqs                     :             .          . .      .     .  .  C    .     AGAGACC                      .        .                         .
blockSeqs                     :             .          . .      .     .  .  T    .     AGAGACT                      .        .                         .
blockSeqs                     :             .          . .      .     .  .  T    .     A                            .        .                         .
blockSeqs                     :             .          . .      .     .  .  C    .     A                            .        .                         .
blockSeqs                     :             .          . .      .     .  .  C    .     A                            .        .                         .
blockSeqs                     :             .          . .      .     .  .  G    .     A                            .        .                         .
blockSeqs                     :             .          . .      .     .  .  T    .     A                            .        .                         .
blockSeqs                     :             .          . .      .     .  .  T    .     A                            .        .                         .
blockSeqs                     :             .          . .      .     .  .  T    .     C                            .        .                         .
blockSeqs                     :             .          . .      .     .  .  T    .     A                            .        .                         .
blockSeqs                     :             .          . .      .     .  .  T    .     A                            .        .                         .
blockSeqs                     :             .          . .      .     .  .  .    .     A                            .        .                         .
blockSeqs                     :             .          . .      .     .  .  .    .     .                            .        .                          


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : CGGAAATTGGAC--------TGT-G--TGGGA-AATTT--A-CA-T--G-ATATC-------------A-------------TT-------CA-------ATACCAGGGCGGCTAAAGG-AGGTATAT
finalCons                     : CGGAAATTGGAC--------TGT-G--TGGGA-AATTT--A-CA-T--G-ATATC-------------A-------------TT-------CA-------ATACCAGGGCGGCTAAAGG-AGGTATAT





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lowQualScore                  :             77777777   2 55     2     22 2  3333 2     444444444444444444444444444  6666666  6666666        0          2        
lowQualScore                  :             ........   . ..     .     .. .  .... .     ...........................  .......  .......        .          .        
lowQualScore                  :             66666666   1 00     1     99 1  5555 1     111111111111111111111111111  8888888  8888888        4          2        
consensus                     : CGGAAATTGGAC--------TGT-G--TGGGA-AATTT--A-CA-T--G-ATATC-------------A-------------TT-------CA-------ATACCAGGGCGGCTAAAGG-AGGTATAT
Reference ( family-866 )      : CGGAAATTGGAC--------TGT-G--TGGGA-AATTT--A-CA-T--G-ATATC-------------A-------------TT-------CA-------ATACCAGGGCGGCTAAAGG-AGGTATAT
gi|6350                       : CGGAAATTGGAC--------TGT-G--TGGGA-AATGT--A-CA-T--G-ATATC-------------A-------------TT-------CA-------ACATCAGGACGGCTAAAGG-AGGTATAT
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gi|6353                       : CGGAAGTTGGAC--------TCT-G--TGGGA-AATTT--A-CA-T--G-ATATC-------------A-------------TT-------CA-------ATACCATGACGGCTAAAGG-AGGTATAT
gi|6354                       : CGGAAATTGGAC--------TGT-G--TGGGA-AATTT--A-CA-C--A-GTATC-------------A-------------TT-------TA-------ATACCAGGGCGGCTAAAGG-AGGTATA
gi|6355                       : CGAAAACTGGAC--------AGT-G--TGGGA-AATCT--A-CA-T--G-ATATCAGACACCTTTATAA-------------TT-------CA-------ATACCAGGGCGACTAAGGA-GGGTATAT
gi|6356                       : CGAAAATTGGAC--------TGT-G--TGG-A-AATTT--A-CA-T--G-ATATC-------------A-------------TT-------CA-------ATACCA
gi|6357                       : CGGAAATTGGAC--------AGC-A--TGGGA-AATTT--A-TA-C--G-ATATC-------------AGAGACC-------TTTATAATATA-------ATACCAGGATGACTAAAGG-ATGTAT
gi|6358                       : CGGATATTGGAC--------AGC-G--TGGAA-AATTT--A-CA-C--G-ATATCAGAGACTTTATA-A-------------TT-------TA-------ATACCAGGGTGATTAAAGA-AGGTATA
gi|6359                       : CGGAAATTGGAC--------AGC-A--TGGGA-AATGT--A-TG-TACG-ATATC-------------AGAGACCTTTATTATC-------TA-------ATACCAGGGTGACTTAAGG-AGGTATA
gi|6360                       : CGGAAATTG-AC--------AGT-A--TGGGGGAATTT--A-CAAT--G-ATATC-------------AGAGACCTTTATAATT-------GA-------ATACCAGAGCGGCTAAAGG-AGGTATA
gi|6361                       : CGGAAATTGGACAGTGTGACTGT-G--TGGGA-AATTT--A-CA-G--G-ATATC-------------AGAGACT-------TT-------TATAACTTCATACCAGAGCGACTAAAGG-GGGT
gi|6362                       : CAGAAATTGGAC--------TGT-G--T------------------------ATT-------------A-------------TT-------CA-------ATACCAGGACGGCTAAAGA-AGG
gi|6363                       : CGGAAAATTGAC--------AGC-GG-TGGGA-TATTT--AACA-T--G-ATATC-------------AGAGAACTTTATAATT-------CA-------GTATCAGGGCGGTTAAAGGAAGGTATAT
gi|6364                       :  GGAAATTGGAC--------TGT-G--TGGGA-AATTT--A-CA-T--G-GTATT-------------C-------------TT-------CA-------ATACAAGGCCGGCCAAAGG-AGCTAT
gi|6365                       :  GAAAATTGGAC--------TGT-GGTCGGGA-AATTT--T-TA-T--GTGTATC-------------A-------------TT-------CA-------ATACCAGGGCGGCTAAAGG-AGCTAT
gi|6366                       :  GGAAATTGGA---------TGT-G--GGGGG-AATTTTAA-CA-T--G-GTATC---------------------------TT-------CA-------ATAGTAGG-CGGCTAAAGG-AGCTAT
gi|6367                       :   GAAATTGGAC--------TGT-G--CGAGA-AATTT--A-CA-T--G-ATATC-------------A-------------TT-------CA-------ATACCAGGGCGGCTAAAGG-AACTAT
gi|6368                       :         GGAC--------TATAG--TGGGA-AATT------A----G-ATATT-------------A-------------TT-------CA-------ATACCAGGACGGCTAAAG---TGTATAT