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Reference ( gi|84062 )        : CAGTGTT--CCAGCTA-G-GATTT-C-AGA-GGG---GCAG--GGCG-CA-T------A-------C-A----G-GG-GCAAAAA---G-----GG----C-AC-TCT-GGT--T-T-GAAAAG-GGCACA--T-GG-AA-TA--TCATCTGCATAAA-ATAACTGGGTTTTTT
gi|84063                      : CAGTGTT--CCAGCTA-G-GATTT-C-AGA-GGG---GCAG--GCCA-CA-T------A-------C-A----G-GG-GCAAAAA---G-----GG----C-AC-TCT-GGT--T-T-GAAAAG-GGCACA--T-GG-AA-TA--TCATCTGCATAAA-ATAACTGGGTTTTTT
gi|84064                      : CAGTGTT--CCAGCTA-G-GATTT-T-AGA-GGG---ACAG--GGCG-CA-T------A-------C-A----G-GG-GCAAAAA---G-----GG----C-AC-TCT-GGT--T-T-GAAAAG-GGCACA--T-GG-AA-TA--TCATCTGTATAAA-ATAACTGGGTTTTTT
gi|84065                      : CAGTGTT--CCAGCTA-G-GGTTT-C-AGA-GGG---GCAG--GGCG-CA-T------A-------C-A----G-GG-GTTAAAA---G-----GG----C-AC-TCT-GGT--T-T-GAAAAG-GGCACA--T-GG-AA-TA--TCATCTGCATAAA-ATAACTGGGTTTTTT
gi|84066                      : CAGTGTT--CCAGCTA-G-GGTTT-C-AGA-GGG---GCAG--GGCG-CA-T------A-------C-A----G-GG-GTTAAAA---G-----GG----C-AC-TCT-GGT--T-T-GAAAAG-GG-ACA--T-GG-AA-TA--TCATCTGCATAAA-ATAACTGGGTTTTTT
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Reference ( family-862 )      : CAGTGTT--CCAGCTA-G-GATTT-C-AGA-GGG---GCAG--GGCG-CA-T------A-------C-A----G-GG-GCAAAAA---G-----GG----C-AC-TCT-GGT--T-T-GAAAAG-GGCACA--T-GG-AA-TA--TCATCTGCATAAA-ATAACTGGGTTTTTT
gi|84062                      : CAGTGTT--CCAGCTA-G-GATTT-C-AGA-GGG---GCAG--GGCG-CA-T------A-------C-A----G-GG-GCAAAAA---G-----GG----C-AC-TCT-GGT--T-T-GAAAAG-GGCACA--T-GG-AA-TA--TCATCTGCATAAA-ATAACTGGGTTTTTT
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gi|84073                      : CAGTGTT--CCAGCTA-G-GATTT-C-AGA-GGG---
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gi|84075                      :   GTGTTGTCCAGCTA-G-GATTT-C-A-A-GGG---GCAG--GGCG-CAGT------A-------C-ATTGTG-AG-GCAAAAAG--G-----GG----C-AC-TCT-GGTTCT-T-GAAAAGAGGCACATTT-GG-AACTGATTCATTTGCACAAATATAG
gi|84076                      :   GTGTT--CAAGCTA-GAGATTT-C-AG-----------G--AGTG-GA-T------AAAA----C-A----G-GG-GCAAG-----G-----GG----C-AC-TTT-GGT--T-TGGAAAAC-GGGACA--A-TG-AA-TA--TTTTTTCCATAAA-ATA--TAGCCTTTTT
gi|84077                      :     GTT--CCAGCTA-G-GATTT-A-GAA-AGG---GCAGAGGGCG-CA-T------A-------C-A----G-GG-GCAAAAA---G-----GG----C-AC-TTT-GGTG-T-T-GAAAAG-GGCACA--T-GG-AA-TA--TCATTTCCATAAA-ATA
gi|84078                      :            AGCTACG-GATTT-CTAGA-GGG---GCAG--GGCGCCA-T------A-------C-A----G-GGTGCAAAAA---AATTGTGG----C-AT-TCA-AGT--T-TCGAATAG-GGCACA--T-GT-AA--A--TTATTTGCATAAA-ATA
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gi|84080                      :                                  G---GCAGC-GGCG-CA-T------A-------CGA----GCGG-GCAAAAAAGAG-----GG----CGAC-TTT-GGT--T-TAGAAAAG-GGCACA--T-GG-AA-TA--T-ATCTTCGTGCA-AT





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Reference ( family-862 )      : CAGTGTT--CCAGCTA-G-GATTT-C-AGA-GGG---GCAG--GGCG-CA-T------A-------C-A----G-GG-GCAAAAA---G-----GG----C-AC-TCT-GGT--T-T-GAAAAG-GGCACA--T-GG-AA-TA--TCATCTGCATAAA-ATAACTGGGTTTTTT
gi|84062                      : CAGTGTT--CCAGCTA-G-GATTT-C-AGA-GGG---GCAG--GGCG-CA-T------A-------C-A----G-GG-GCAAAAA---G-----GG----C-AC-TCT-GGT--T-T-GAAAAG-GGCACA--T-GG-AA-TA--TCATCTGCATAAA-ATAACTGGGTTTTTT
gi|84063                      : CAGTGTT--CCAGCTA-G-GATTT-C-AGA-GGG---GCAG--GCCA-CA-T------A-------C-A----G-GG-GCAAAAA---G-----GG----C-AC-TCT-GGT--T-T-GAAAAG-GGCACA--T-GG-AA-TA--TCATCTGCATAAA-ATAACTGGGTTTTTT
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gi|84069                      : CAGTGTT--CCATCTA-T-TATTT-C-A-A-GGGCACGCAT--TGCG-CA-T------A-------C-A----G-GA--CAAAAA---G-----G-----C-ACCTCT-GGT--T-T-GAAAAG-GGCACA--T-GG-AA-TA--TCATCTGC--AAA-ATAACTGGGTTTT
gi|84070                      : CAGTGTT--CCAACTA-G-GATTT-C-AGAAGGG---GCAG--GGCG-CA-T------ACACCATAC-A----G-GG-GCAAAAA---G-----GA----C-AC-TCT-GGT--T-T-GAAAAG-GGCACA--T-GG-AA-TA--TCATCTGCAT-CA-ATAACTGAGTTTTTT
gi|84071                      : CAGTGTT--CCAGCTA-G-GATTT-C-AGAGGGG---GCAG--GGCG-C--T------A-------C-A----G-GG-GCAAAAA---G-----GG----C-AC-TCTGGGT--T-T-G--AAG-GGCACA--T-GGAAA-TA--TCATTTGCACAAA-ATA--TAGCCTTTTT
gi|84072                      : CAGTGTTT-CCAGCTA-G-GATTT-C-AGA-GGG---GCAG--GGCG-AA-T------A-------C-A----G-GG-GCCAAAA---G-----GGCACTC-AC-TCT-GGT--TGG-GAAAAG-GGCACA--TGGG-AA-TA--TCATTTGCACAAG-ATA
gi|84073                      : CAGTGTT--CCAGCTA-G-GATTT-C-AGA-GGG---
gi|84074                      :  AGTGTT--CCAGCTA-G-GATTT-C-AGA-GGG---GCAG--GGCG-CA-TGCGCATA-------C-A----G-GG-ACAAAA----G-----GG----C-AC-TCT-GGT--T-T-GAAAAG-GGCACA--T-GG-AA-TA--TCATCTGC--AAA-ATAACTGGGTTTTT
gi|84075                      :   GTGTTGTCCAGCTA-G-GATTT-C-A-A-GGG---GCAG--GGCG-CAGT------A-------C-ATTGTG-AG-GCAAAAAG--G-----GG----C-AC-TCT-GGTTCT-T-GAAAAGAGGCACATTT-GG-AACTGATTCATTTGCACAAATATAG
gi|84076                      :   GTGTT--CAAGCTA-GAGATTT-C-AG-----------G--AGTG-GA-T------AAAA----C-A----G-GG-GCAAG-----G-----GG----C-AC-TTT-GGT--T-TGGAAAAC-GGGACA--A-TG-AA-TA--TTTTTTCCATAAA-ATA--TAGCCTTTTT
gi|84077                      :     GTT--CCAGCTA-G-GATTT-A-GAA-AGG---GCAGAGGGCG-CA-T------A-------C-A----G-GG-GCAAAAA---G-----GG----C-AC-TTT-GGTG-T-T-GAAAAG-GGCACA--T-GG-AA-TA--TCATTTCCATAAA-ATA
gi|84078                      :            AGCTACG-GATTT-CTAGA-GGG---GCAG--GGCGCCA-T------A-------C-A----G-GGTGCAAAAA---AATTGTGG----C-AT-TCA-AGT--T-TCGAATAG-GGCACA--T-GT-AA--A--TTATTTGCATAAA-ATA
gi|84079                      :                      TTT-C-AGA-GGG---GCAG--GGAG-CA-T------A-------C-A----G-GG-GCAAAAA---G-----G-----C-AC-TCT-GGT--T-T-GAAAAG-GGCACA--T-GG-AA-T
gi|84080                      :                                  G---GCAGC-GGCG-CA-T------A-------CGA----GCGG-GCAAAAAAGAG-----GG----CGAC-TTT-GGT--T-TAGAAAAG-GGCACA--T-GG-AA-TA--T-ATCTTCGTGCA-AT


blockSeqs                     :        GT       C A     T T   A   CAC    AG    C  G GCGCAT CACCATA G TTGT C  T       AGA ATTGT  CACT G  C   G   TC G G      A      TT G  A  C  AT             T   A
blockSeqs                     :        T        . .     . .   G   .      C     .  . .      AAA     . .    .  .       G   .      .    .  .   .   G  . C      .      .  .  .  .  .              .   A
blockSeqs                     :        .        . .     . .   .   .      .     .  . .      .       . .    .  .       .   .      .    .  .   .   .  . A      .      .  .  .  .  .              .   A
blockSeqs                     :        .        . .     . .   .   .      .     .  . .      .       . .    .  .       .   .      .    .  .   .   .  . .      .      .  .  .  .  .              .   A
blockSeqs                     :        .        . .     . .   .   .      .     .  . .      .       . .    .  .       .   .      .    .  .   .   .  . .      .      .  .  .  .  .              .   A
blockSeqs                     :        .        . .     . .   .   .      .     .  . .      .       . .    .  .       .   .      .    .  .   .   .  . .      .      .  .  .  .  .              .   A
blockSeqs                     :        .        . .     . .   .   .      .     .  . .      .       . .    .  .       .   .      .    .  .   .   .  . .      .      .  .  .  .  .              .   A
blockSeqs                     :        .        . .     . .   .   .      .     .  . .      .       . .    .  .       .   .      .    .  .   .   .  . .      .      .  .  .  .  .              .   A
blockSeqs                     :        .        . .     . .   .   .      .     .  . .      .       . .    .  .       .   .      .    .  .   .   .  . .      .      .  .  .  .  .              .   G
blockSeqs                     :        .        . .     . .   .   .      .     .  . .      .       . .    .  .       .   .      .    .  .   .   .  . .      .      .  .  .  .  .              .   .
blockSeqs                     :        .        . .     . .   .   .      .     .  . .      .       . .    .  .       .   .      .    .  .   .   .  . .      .      .  .  .  .  .              .   .
blockSeqs                     :        .        . .     . .   .   .      .     .  . .      .       . .    .  .       .   .      .    .  .   .   .  . .      .      .  .  .  .  .              .   .
blockSeqs                     :        .        . .     . .   .   .      .     .  . .      .       . .    .  .       .   .      .    .  .   .   .  . .      .      .  .  .  .  .              .    
blockSeqs                     :        .        . .     . .   .   .      .     .  . .      .       . .    .  .       .   .      .    .  .   .   .  . .      .      .  .  .  .  .              .    
blockSeqs                     :        .        . .     . .   .   .      .     .  . .      .       . .    .  .       .   .      .    .  .   .   .  . .      .      .  .  .  .  .              .    
blockSeqs                     :                 . .     . .   .   .      .     .  . .      .       . .    .  .       .   .      .    .  .   .   .  . .      .      .  .  .  .  .              .    
blockSeqs                     :                         . .   .   .      .     .  . .      .       . .    .  .       .   .      .    .  .   .   .  . .      .      .  .  .  .                      
blockSeqs                     :                                   .                                                                                                                                


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : CAGTGTT--CCAGCTA-G-GATTT-C-AGA-GGG---GCAG--GGCG-CA-T------A-------C-A----G-GG-GCAAAAA---G-----GG----C-AC-TCT-GGT--T-T-GAAAAG-GGCACA--T-GG-AA-TA--TCATCTGCATAAA-ATAACTGGGTTTTTT
finalCons                     : CAGTGTT--CCAGCTA-G-GATTT-C-AGA-GGG---GCAG--GGCG-CA-T------A-------C-A----G-GG-GCAAAAA---G-----GG----C-AC-TCT-GGT--T-T-GAAAAG-GGCACA--T-GG-AA-TA--TCATCTGCATAAA-ATAACTGGGTTTTTT





Alignments
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lowQualScore                  :        ..       . .     . .   .   ...    ..    .  . ...... ....... . .... .  .       ... .....  .... .  .   .   .. . .      .      .. .  .  .  ..             .   .           
lowQualScore                  :        99       4 4     2 2   4   777    33    2  2 444444 1111111 2 7777 2  2       111 66666  7777 2  2   2   33 2 7      2      11 2  2  2  22             4   5           
consensus                     : CAGTGTT--CCAGCTA-G-GATTT-C-AGA-GGG---GCAG--GGCG-CA-T------A-------C-A----G-GG-GCAAAAA---G-----GG----C-AC-TCT-GGT--T-T-GAAAAG-GGCACA--T-GG-AA-TA--TCATCTGCATAAA-ATAACTGGGTTTTTT
Reference ( family-862 )      : CAGTGTT--CCAGCTA-G-GATTT-C-AGA-GGG---GCAG--GGCG-CA-T------A-------C-A----G-GG-GCAAAAA---G-----GG----C-AC-TCT-GGT--T-T-GAAAAG-GGCACA--T-GG-AA-TA--TCATCTGCATAAA-ATAACTGGGTTTTTT
gi|84062                      : CAGTGTT--CCAGCTA-G-GATTT-C-AGA-GGG---GCAG--GGCG-CA-T------A-------C-A----G-GG-GCAAAAA---G-----GG----C-AC-TCT-GGT--T-T-GAAAAG-GGCACA--T-GG-AA-TA--TCATCTGCATAAA-ATAACTGGGTTTTTT
gi|84063                      : CAGTGTT--CCAGCTA-G-GATTT-C-AGA-GGG---GCAG--GCCA-CA-T------A-------C-A----G-GG-GCAAAAA---G-----GG----C-AC-TCT-GGT--T-T-GAAAAG-GGCACA--T-GG-AA-TA--TCATCTGCATAAA-ATAACTGGGTTTTTT
gi|84064                      : CAGTGTT--CCAGCTA-G-GATTT-T-AGA-GGG---ACAG--GGCG-CA-T------A-------C-A----G-GG-GCAAAAA---G-----GG----C-AC-TCT-GGT--T-T-GAAAAG-GGCACA--T-GG-AA-TA--TCATCTGTATAAA-ATAACTGGGTTTTTT
gi|84065                      : CAGTGTT--CCAGCTA-G-GGTTT-C-AGA-GGG---GCAG--GGCG-CA-T------A-------C-A----G-GG-GTTAAAA---G-----GG----C-AC-TCT-GGT--T-T-GAAAAG-GGCACA--T-GG-AA-TA--TCATCTGCATAAA-ATAACTGGGTTTTTT
gi|84066                      : CAGTGTT--CCAGCTA-G-GGTTT-C-AGA-GGG---GCAG--GGCG-CA-T------A-------C-A----G-GG-GTTAAAA---G-----GG----C-AC-TCT-GGT--T-T-GAAAAG-GG-ACA--T-GG-AA-TA--TCATCTGCATAAA-ATAACTGGGTTTTTT
gi|84067                      : CAGTGTT--CCAGCTA-G-GGTTTTC-AGA-GGG---GCAG--GGCG-CA-T------A-------C-A----G-GG-GTAAAA----G-----GG----C-AC-TCT-G-T--T-T-GAAAAG-GGCACA--T-GG-AA-TA--TCATCTGCATAAA-ATAACTGGGTTTTTT
gi|84068                      : CAGTGTT--CCAGCTA-G-GATTT-C-AGA-GGG---GCAG--GACG-CA-T------A-------C-A----G-GG-GCAAAAA---G-----GG----C-AC-TCT-GGT--T-T-GAAAAG-GGCACA--T-GG-AA-TA--TCATTTGCACAAA-ATA--TAGCCTTTTT
gi|84069                      : CAGTGTT--CCATCTA-T-TATTT-C-A-A-GGGCACGCAT--TGCG-CA-T------A-------C-A----G-GA--CAAAAA---G-----G-----C-ACCTCT-GGT--T-T-GAAAAG-GGCACA--T-GG-AA-TA--TCATCTGC--AAA-ATAACTGGGTTTT
gi|84070                      : CAGTGTT--CCAACTA-G-GATTT-C-AGAAGGG---GCAG--GGCG-CA-T------ACACCATAC-A----G-GG-GCAAAAA---G-----GA----C-AC-TCT-GGT--T-T-GAAAAG-GGCACA--T-GG-AA-TA--TCATCTGCAT-CA-ATAACTGAGTTTTTT
gi|84071                      : CAGTGTT--CCAGCTA-G-GATTT-C-AGAGGGG---GCAG--GGCG-C--T------A-------C-A----G-GG-GCAAAAA---G-----GG----C-AC-TCTGGGT--T-T-G--AAG-GGCACA--T-GGAAA-TA--TCATTTGCACAAA-ATA--TAGCCTTTTT
gi|84072                      : CAGTGTTT-CCAGCTA-G-GATTT-C-AGA-GGG---GCAG--GGCG-AA-T------A-------C-A----G-GG-GCCAAAA---G-----GGCACTC-AC-TCT-GGT--TGG-GAAAAG-GGCACA--TGGG-AA-TA--TCATTTGCACAAG-ATA
gi|84073                      : CAGTGTT--CCAGCTA-G-GATTT-C-AGA-GGG---
gi|84074                      :  AGTGTT--CCAGCTA-G-GATTT-C-AGA-GGG---GCAG--GGCG-CA-TGCGCATA-------C-A----G-GG-ACAAAA----G-----GG----C-AC-TCT-GGT--T-T-GAAAAG-GGCACA--T-GG-AA-TA--TCATCTGC--AAA-ATAACTGGGTTTTT
gi|84075                      :   GTGTTGTCCAGCTA-G-GATTT-C-A-A-GGG---GCAG--GGCG-CAGT------A-------C-ATTGTG-AG-GCAAAAAG--G-----GG----C-AC-TCT-GGTTCT-T-GAAAAGAGGCACATTT-GG-AACTGATTCATTTGCACAAATATAG
gi|84076                      :   GTGTT--CAAGCTA-GAGATTT-C-AG-----------G--AGTG-GA-T------AAAA----C-A----G-GG-GCAAG-----G-----GG----C-AC-TTT-GGT--T-TGGAAAAC-GGGACA--A-TG-AA-TA--TTTTTTCCATAAA-ATA--TAGCCTTTTT
gi|84077                      :     GTT--CCAGCTA-G-GATTT-A-GAA-AGG---GCAGAGGGCG-CA-T------A-------C-A----G-GG-GCAAAAA---G-----GG----C-AC-TTT-GGTG-T-T-GAAAAG-GGCACA--T-GG-AA-TA--TCATTTCCATAAA-ATA
gi|84078                      :            AGCTACG-GATTT-CTAGA-GGG---GCAG--GGCGCCA-T------A-------C-A----G-GGTGCAAAAA---AATTGTGG----C-AT-TCA-AGT--T-TCGAATAG-GGCACA--T-GT-AA--A--TTATTTGCATAAA-ATA
gi|84079                      :                      TTT-C-AGA-GGG---GCAG--GGAG-CA-T------A-------C-A----G-GG-GCAAAAA---G-----G-----C-AC-TCT-GGT--T-T-GAAAAG-GGCACA--T-GG-AA-T
gi|84080                      :                                  G---GCAGC-GGCG-CA-T------A-------CGA----GCGG-GCAAAAAAGAG-----GG----CGAC-TTT-GGT--T-TAGAAAAG-GGCACA--T-GG-AA-TA--T-ATCTTCGTGCA-AT