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Reference ( gi|127074 ) : CGGCAAAGTT--CACCACCTC-CCCAA-CAAC--GC--CCAAT-CAAA-G-TT---------T-GGCACCGC--T-A--GA--CGCA-AGT-T--C-GTG-G--ACG-CT-TGG--GTTCGCTAG-GCCAA-CG-CAGA--AAT-CTT-GAA-C-GC-T-GGACCA-C--C--GCTT-C--T---TC-GC--CAAC--TTTG---CCAGG------------GCG---G------------TG--A--------T-G---AAA-----------------CGTTGCACAAAC-TTTG----------GTGGA-A---T-GGTTG-TA-A-GCA-TTT--TACGAGC--GGA--CAC-A-------GGATT---GCT-GGA--ACG-G-----TGTCG----G-G-CGTT-GA-AG-CAGC-G-ATCC-ATT-GCTG-TGAT---G---A-AC-TTT--GG-TTTGGC--GTT--G--T-TA----T--GGA--------------GG-TGT--C-GC-----A-AA------C-G----C---TCT----AT-C-AA----C--G--CT-CG-CGTCACC-GCTAAACTA---AC-GC-----TT--T-CTA-CCG----TT-A--AACCAACGC-T-AA--A--GCA-A--CG--CC-G--GC-TTCAGCG-G-TG-CACCGCT-AA-GGCAACGC--CTGTGTTTTCGAT
gi|127076 : CGGCAAAGTT--CACCGCCGC-TCCAA-CAAC--GC--CCAGT-CAAA-G-TT---------T-GGCACCGC--T-A--GA--CGCA-AGT-T--C-GTG----ACG-CT-TCG--GTCCGCTAG-GCCAA-CG-CAGA--AAT-CTT-GAA-C-GC-T-GGACGA-C--C--GTTT-C--T---TC-GT--CAGC--TTTG---CCCGG------------GCG---G------------TG--A--------T-T---AAA-----------------CGTTGCACAAAC-GTTG----------GTGGA-G---CGGGTTG-TT-A-GCA-TTT--TACGAGC--GGA--CAC-G-------GGATTG--GCT-GGA--ACG-G-----T-TCG----G-G-CGTT-GA-AG-CAGC-G-ATCC-ATT-GCGG-TGAT---C---A-AC-TTT--GG-TTTGGC--GTT--G--G-TA----T--GGA--------------GG-TGT--C-GCG----G-AA------C-GCCC-C---TCT----AT-G-AA----C--G--CT-CG-CGTCACC-GCTAAACCA---AC-GC------T--T-CTA-CCG----TT-A--AACCAACGC-T-AA--A--GCA-A--CG--CC-C--GC-TTCAGCG-G-TG-CACCGCT-AA-GGCAACGC--CCGTG-TTTCGAT
gi|127077 : CGGCAAAGTT--CTACGCCGC-TCCAA-CGAT--GC--CCAGT-CAAA-G-TT---------T-GGCACCGC--T-A--GA--CGCA-AGT-T--C-GTG-G--ACG-CT-TGG--GTCCGCTAG-GCTAA-CG-CAGA--AAT-CTT-GAA-C-GC-T-GGACCA-C--C--GTTT-T--T---TC-GC--CAGC--TTTG---CCCGA------------GCG---G------------TG--A--------T-T---AAA-----------------CGTTGCACAAAC-TTTA----------GTTGA-G---C-GGTTG-TA-A-GCA-TTT--TATGAGC--TGA--CAC-G-------GGATT---GCT-AGA--ACG-G-----TGTCC----G-G-TGTT-GA-AG-CAGC-G-ATCC-AAT-GCGG-TGAT---C---A-AC-TTT--GG-TTTGGC--GTT--G--A-TA----T--GGA--------------GG-TGT--C-GA-----AGAA------C-G----CCGATCT----AT-C-AA----C--G--CT-AG-CGTCACC-GCTAAACCA---AC-GC-----TT--T-CTA-CCG----TT-A--AACCAACGC-T-AA--A--GCA-A--CG--CC-G--GC-TTCAGCG-T-TG-CACAGCT-AA-GGCAACGC--CTGTATTTTCGAT
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gi|127087 : GCAAAGTT--CACCACCGC-TCCAA-CAAC--GC--CCAGT-CAAA-G-TT---------T-TGCACCGC--T-A--GA--CGCA-AGT-T--C-GTG-G--ACG-TT-TGG---TTCGCTAG-GCCAA-CG-CAGA--AAT-CTT--AA-C-GC-T-GGACCA-C--C--GCT--C--T---TC-GT--CAGC--TTTG---CCAAG------------GCG---G------------TG--A--------T-T---AAA-----------------CGTTGCACAA-C-TTTG----------GTGGA-G-----GGCTG-TA-ACGCA-TTT---ACGAGC--GG---CAC-G-------GGATT---GC--GGA--ACG-G-----T-TCA----G-G-CGTT-GA-AG-CAGC-G-ATCA-ATT-GCGG-TGAT---G---A-AC-TTT--G--TTTGGC--GTT--G--G-TA----T--GGA--------------GG-TGT--C-GCGGGAGA-GA------CCG----C---TCT----AA-C-AA----CCTG--CT-CG-CGTCACC-GCTAAACCA---AC-GC-----TC--G-CTA-CCG----TT-A--AACCAACGC-T-AA--A--GCA-A--CG--CT-G--GC-TTCAGCG-G-TA-CACCGCT-AA-TGCAACGCCGCCGTGTTT
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gi|127091 : cggcaaagttcacctcctctccaacaacgcccaatcaatgtttggcaccgttagacgcgagttcatgaacgcttgagtccgctaggccaacgcagaaatcttgaacgctggaccaccgcttcttcggcagctttgcccgagcggtgattaattgttgcacaaactttggtagagcggttgtaagcattttacgagcggacacgggattgctggaacggtgtcgggcgttgaagtagcgTC--CACCGACCG-TCCAA-CAACCTGCTACCAGTTCAAA-G-TTGATATTCTAC-GCCAC-GC--T-ACAAA--CACA-AGTAT--C-GTG----ACG-CTGTGGCAGTCCACTAG-GCCAA-CGTCAGATAAAT-CTT-AAATC-GC-T-TGGCTA-CAAC--GCTT-C--T---TC-GC--AAGC--TTTGGCGTCAGGCGTGTAATTATAACGCCTG------------TG--A--------A-T---AAG-----------------CGTTGCACAAAC-CTTGTTCTGGTCGTGTGTC-GCCTT-GGTTG-TT-A-GCA-TTT---A-GAGC--GGA--CAC-AAAAACATGGATT---GCTTGGA--ACG-G-----TGTCG----G-G-CGTT-GA-AG-CAGCTG-ATCA-ATTTGCGG-TGAT---CC--A-AC-TTT--GGATGTGGC--GTT--G--A-TA----T--GGA--------------GGGTGT--TTGC-----G-GAACGC--C-G----C---CCT----AT-C-AA----C--G--CT-CG-CGTCACC-GCTAAACCA---ACCGC-----TT--TTCTA-CCG----TTTA--AACCAACGC-T-AA--A--GCA-A--CG--CTGG--GC-TTCAGCG-G-T--CACCGCC-TA-GGCAACGC--CCGTGTTTTCGATgcgggac
gi|127083 : CACCTC-CATAC-CAAC--GC--CAAAC-CAAA-G-TT---------G-ATCACCGCAAT-G--GAT-CGCA-GCT-T--C-
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blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . C . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . G . . . . . . . T . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . G . . CGAGAACGC CCA . . . . . . . . G . TT . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . C . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . CGGAACGC . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . G . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . CGGAACGC . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . G . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . CGGAA . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . G . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . CGGAA . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . G . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . AAGAA . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . G . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . CGGAA . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . G . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . GAG . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . G . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . GAG . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . C . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . GAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . G . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . GAG .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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Alignments
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Reference ( family-847 ) : CGGCAAAGTT--CACCG-CCGCTCC-AA-CAAC--GC--CCAGT-CAAA-G-TT---------T-GGCACCGCT-A--GA--CGCA-AGT-T--C-GTG-G--ACG-CT-TGG--GTCCGCTAG-GCCAA-CG-CAGA--AAT-CTT-GAA-C-GC-T-GGACCA-C--C--GCTT-C--T---TC-GC--C-A-GCTTTGCC--CGGGCG----------------G------------TG--AT-----------T-AAA-----------------CGTTGCACAAAC-TTTG----------GTGGAG-C---GGTTG-TA-A-GCA-TTT--TACGAGC--GGA--CAC-G-------GGATT---GCT-GGA--ACG-G-----TG-TCG----G-G-CGTT-GA-AG-CAGC-G-ATCC-ATT-G-CGG-TGAT---N-A-AC-TTT--GG-TTTGGC--GTTGG---TAT--GGAGG-TGTC---GCG-GAA-----CG----C---T---CT--AT-C-AAC--G--CT-CG-CGTCACCGCTAAACCA---AC-GCTT--T-CTA-CCG----TT-A--AACC-AACGC-T-AAAGCA-A--CG-CC-GGC-TTCAGCGG-TG-CACCGCTAA-GGCAACGC--CCGTGTTTTCGAT
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gi|127075 : CGGCAAAGTT--CACCA-CCGCTTC-AA-CAAC--GC--CCAGT-CATA-G-TT---------T-GGCATCGCT-A--GA--CGCT-AGT-T--C--------------------GTCCGCTAG-GC----CG-CAGA--AAT-CTT-GAA-C-GC-T-GAACCA-C--C--GCTT-CAATCGATC-GC--C-A-GCGTTGCC--CGGGCG----------------G------------TG--AT-----------T-AAA-----------------CGTTGCACAAACTTTTT----------ATGGAG-C---GGTTG-TA-A-GCA--TT--TACGAGC--GGA--CAC-A-------GGTTT---GCT-GGA--ACG-G-----TG-TCG----G-GCCGTT-GA-AG-CAGC-G-ATCC-ATT-GTC---TGAT---G-A-AA-CTT--GG--TTGGC--GTT-G---CAT--GGAGG-TGTC---GCG-GAA-----CGCCACC---T---CT--AT-C-AAT--G--CT-CGTTGTCACCGCTAAACCA---AC-GC-T--T-CTA-CTG----TA-A--CACC-AACGC-T--AAGCA-ACGCG-CC-GGC-TTCAGCGG-TGACACCGCTAA-GGCAACGC--CC--GTTTTCGAT
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gi|127081 : CGGCAAAGTTT-CACGA-CAGCTCC-AA-CAAC--GC--CCAGT-CAAA-G-TT---------T-GGCATCGCT-A--GA--CGTA-AGT-T--CTGTG-G--ACG-CT-T-G--GTCCGCTAG-GCCAT-CG-CAGA--AATAGTT-GAA-C-GC-T-GGACCA-C--C--GCTT-A------TC-GC--C-A-GCTTTGCC--CGGGCG----------------G------------TG--AT-----------T-AAA-----------------CGTTGCACAAAT-TTGG----------GTG--G-C---GGTTG-TA-A-GCA-TTT--TAC-AGC--GGA--C-C-G-------GGATT---GTT-GGA--ACG-GTTTTATG-TCG----G-T-CGTT--A-AG-CAGC-G--TTC-A-T-G-CGGCTGAT---G-AGACTTTT--GG-TTTGGC--ATTGGA--CAC--GGAGGCTGTT----CG-GAG-----CG----
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gi|127084 : GGCAAAGTT--CAGCA-CCGCTCC-AA-CAAC--GC--CCATT-CAAA-G-TT---------T-GGCACCGCT-A--GA--CGCA-TGT-T--C-GTG-A--ACG-CT-TGA--GTCCACTAG-TCCAA-CG-CAGA--AAT-CTT-GAA-G-GC-T-GGACCT-C--C--GCGT-T--T---TC-GC--C-A-GCTTTGCC--CGAGCG----------------G------------TG--AT-----------T-AAA-----------------CGTTGTACAAAC-TGTG----------GTAGAG-A---GGTTG-TA-A-ACA-TTT--TACGAAC--GGA--CAC-G-------GGATT---GCT-GGA--ACG-G-----TG-TCG----G-G-CGTT-GA-AA-AAGC-G-ATCC-ATT-G-TGG-TGAT---G-A-AC-TTT--GGTTTTGGC--GTTGG---TAA--GGATA-TGTCGGAGCG-GGA-----C
gi|127085 : GGCAAAGTTT-CACCG-CC---CA-AA-CAAC--GC--CACGT-CAAA-GATT---------T-GGCACCACTTA--GA--CGCA-AGT-TTTC-GTG-GT-ATG-CTCTGG--GGTCGCTAGCGCCAA-CG-C-GA--AAT-CTTAGAA-T-GC-TTAGAC-A-C--CCGGCTT-C--T---TCAGC--C-A-GCTTTGCC--CTGGCG----------------G------------TG--AT-----------TCAAA-----------------CTGTGAACAAAC-TTTG----------GTGGAG-A---GATTG-TA-A-GTA-TTG--TACGAGC--GGA--CAC-A-------CGATT---GCT-GGA--ACG-G-----GT-TCG----G-G-CGTT-GATAG-CAGC-G-ATCC-ATT-G-CGG-TGATAGGA-A-AC-TTT--GA-TTTGGC--GTTGG---TAT--GGAGGCTGTCGGAGCG-GA
gi|127086 : GGCAAA--T--TACCC-ACGCT---AA--AAC--GC----AATGCAAA-G-TT---------TTGGCACAGCT-A--AA--CGCA-GGT-T----ATG-G--ACG-CT-TGA--GTCCG-TAG-GCCAA-CG--AAA--AAT-
gi|127087 : GCAAAGTT--CACCA-CCGCTCC-AA-CAAC--GC--CCAGT-CAAA-G-TT---------T-TGCACCGCT-A--GA--CGCA-AGT-T--C-GTG-G--ACG-TT-TGG---TTCGCTAG-GCCAA-CG-CAGA--AAT-CTT--AA-C-GC-T-GGACCA-C--C--GCT--C--T---TC-GT--C-A-GCTTTGCC--AAGGCG----------------G------------TG--AT-----------T-AAA-----------------CGTTGCACAA-C-TTTG----------GTGGAG-----GGCTG-TA-ACGCA-TTT---ACGAGC--GG---CAC-G-------GGATT---GC--GGA--ACG-G-----T--TCA----G-G-CGTT-GA-AG-CAGC-G-ATCA-ATT-G-CGG-TGAT---G-A-AC-TTT--G--TTTGGC--GTTGG---TAT--GGAGG-TGTC---GCG-GGAGAGACCG----C---T---CT--AA-C-AACCTG--CT-CG-CGTCACCGCTAAACCA---AC-GCTC--G-CTA-CCG----TT-A--AACC-AACGC-T-AAAGCA-A--CG-CT-GGC-TTCAGCGG-TA-CACCGCTAA-TGCAACGCCGCCGTGTTT
gi|127088 : GCACAGTT--CACCG-CCGCTCC-AAACAAC--GC--CCAGC---AA-G-TT---------T-GGCACCGCT-A--GA--CGCA-AGT-T--C-GTG-G--ACG-CT-TCG--GTCCGCT-G-ACCAA-CG-CAGA--AAT-TTT-GAA-C-GC-T-GGACGA-C--C--GCTT-C--T---TC-GCCTC-A-GCTTTGCC--CGGGCG----------------GTTGATTAAACGTTG--AT-----------T-AAA-----------------CGTTGCACAAAC-TTTG----------GTGGAGTC---GGTTG-TT-A-GCA-TTT--TACGAGC--GGA--CACGG-------GGATT---GCT-GGA--AC--G-----TGTTCA----G-G-CGTT-GA-AC-CAGC-G-ATTC-ATA-G-CGG-TGAT---C---AC-TTT--GG-TTTGGCGTGTTGG---TAT--GGA---TGTC---GCG-GAA-----CGCCA-C---T---TC--AT-C-AACT-C--CT-CG-CGTCCCCGCT-AACCAT--AC-GCTT--T-CTATCCG----TT----AACC-AACGC-C------------------GC-TTCAGCGG-TG-CACCGCTAAGGGCAACGC--CCATGTTTTCG
gi|127089 : GCAAAATT--CACCG-CCGCTTC-AA-CAAT--GC--CCAGT-TAAA-G-TT---------T-GGCACCGCT-A--GA--CATA-AGT-C--C-GTG-G--ACG-CT-TGG--GTCCGC
gi|127089 : A--AAT-CTT-GAA-CTGCAT-TGACCAAC--C--GCTTTC--T---TC--C--C-A-GCTTTGCT--CTGGCT----------------G------------TGGGAT-----------T-AAAAAAGCGTTGATTATAATCGTTGCACAAAC--ATG----------ATGTAT-CT--GGTTG-TACA-ACA-TTTTATACGAGCCTCAA--CAC-G-------GGAAT---G-T-GCATCACG-GA----TA-ACAGAACG-G-CGTT-GACAG-CAGC-G-ACTC-Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttagagtgcctccaaaccaattgctaaatcttgaactgcattgaccaaccgctttcttcccagctttgctctggctgtgggattaaaaaagcgttgattataatcgttgcacaaacatgatgtatctggttgtacaacattttatacgagcctcaacacgggaatgtgcatcacggataacagaacggcgttgacagcagcgactca
gi|127090 : gcaaaattcaccgccgcttcaacaatgcccagttaaagtttggcaccgctagacataagtccgtggacgcttgggtccgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttagagtgcctccaaaccaattgctAAAGTTTACACCG-CCGCTCC-AA-CAAC--GC--CCAGT-CAAA-G-TT---------T-TGCACCG-T-A--GAAACGCA-AGT-T----GTG-GGAACGACT-TCG--GTCCGCTAG-GCCAA-CG-CAAG--AAT-CTT-GAA-C-GC-T-----------------T-C--T---TC-GC--C-A-GCTTTGCC--CGGGCG----------------G------------TG--AT-----------T-AAA-----------------CGTTGCACAAAC-TTTG----------GTGGAG-C---GGTTG-TT-A-GCA-TTT--TACGAGC--GGA--CACAG-------GGATT---GCT-GGA--ACG-G-----TG-TCG----G-G-CGTT-GA-AG-CAGC-G-ATCCTATT-G-CGG-TGAT---C-A-ACTTTT--GG-TTTGGC--GTTGA---TACTAGGAGG-TGTC---GCGAGAACGC--CG----C---T---TT--ATACAAAC--GATCT-CG-CGTCACTGCTAAACAA---AC-GCTTC-T-CTA-CCG----TT-A--AACC-AACGC-TAAAAGCA-A--CG-CC-AGCTTTCACAGG-TG-CACCGCTAA-GGCAACGC--CCATGTTTTCGAT
gi|127091 : TC--CACCGACCG-TCC-AA-CAACCTGCTACCAGTTCAAA-G-TTGATATTCTAC-GCCAC-GCT-ACAAA--CACA-AGTAT--C-GTG----ACG-CTGTGGCAGTCCACTAG-GCCAA-CGTCAGATAAAT-CTT-AAATC-GC-T-TGGCTA-CAAC--GCTT-C--T---TC-GC--A-A-GCTTTGGCGTCAGGCGTGTAATTATAACGCCTG------------TG--AA-----------T-AAG-----------------CGTTGCACAAAC-CTTGTTCTGGTCGTGTGTCG-CCTTGGTTG-TT-A-GCA-TTT---A-GAGC--GGA--CAC-AAAAACATGGATT---GCTTGGA--ACG-G-----TG-TCG----G-G-CGTT-GA-AG-CAGCTG-ATCA-ATTTG-CGG-TGAT---CCA-AC-TTT--GGATGTGGC--GTTGA---TAT--GGAGGGTGTTT--GCG-GAA-----CG----C---CGCCCT--AT-C-AAC--G--CT-CG-CGTCACCGCTAAACCA---ACCGCTT--TTCTA-CCG----TTTA--AACC-AACGC-T-AAAGCA-A--CG-CTGGGC-TTCAGCGG-T--CACCGCCTA-GGCAACGC--CCGTGTTTTCGAT
gi|127092 : C---GTG-GAA-----CA----CCACT---CTGCAT-C-AAC--G--CTTCG-CGCAACCGCTAAACCAG--AC-GCTCGGC-CTG-C-G----T--A--AACC-AACGC-T-AAAGCA-A--CGGCC-GGC-TGCAGCGG-TG-CACCGCTAA-GGCAACGC--CCGTATTTTCAAT
gi|127093 : C---GTG-GAA-----CA----CCGTT---CT--AC-C-AAC--G--CT-CG-GGTCACCGCTAAACCA---AC-GCTC--G-TTA-CCGGCCGTC-A--AACT-AACGT-T-AAAGCA-A--CG-AA-GGC-TTAGGCGG-TG-CACCGCTTA-GGCAACGC--CCATATTTTCTAT