lowQualScore : 1111111111 111111111
lowQualScore : 4 777 7777777777 22 4 2 2 2 333 777777777 55 2 2 777777777 2 999999 2 22 2 77 22 6 2 55 2 2 6 2 22 77 2 2 2
lowQualScore : . ... .......... .. . . . . ... ......... .. . . ......... . ...... . .. . .. .. . . .. . . . . .. .. . . .
lowQualScore : 0 000 5555555555 99 2 1 1 1 777 888888888 00 1 1 777777777 1 777777 1 99 1 11 99 3 1 00 1 1 3 1 99 11 1 1 1
consensus : GGGGGGGTCCAA-CC---TTA----------AGTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAA---AT-A-T-----GA--AAA-ATA-ACTA---A-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--T-C-GG-CG-A--T--A-TT-A-AGCTTT
Reference ( gi|110670 ) : GGGGGGGTCCAA-CC---TTA----------AGTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAA---AT-G-T-----GA--AAA-ATA-ACTA---A-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--T-C-GG-CG-A--T--A-TT-A-AGCTTT
gi|110671 : GGGGGGGTCCA--CC---TTA----------AGTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAA---AT-A-------GA--AAA-ATA-GCTA---A-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GTAAATAA--T-C-GG-CG-A--T--A-TT-A-AGCTT
gi|110672 : GGGGGGGTCCAA-CC---TTA----------AGTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAA---AT-A-T-----GA--AAA-A-A-A-TA---T-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-CCT-A--T-C-GG-CG-A--T--A--T-A-AG
gi|110673 : GGGGGGGTCCAAACC---TTAGTAAGAAAAAAACATTACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAA----T-A-T-----GA--AAA-ATA-ACTT---T-----T-TTTTTTTTTTTTC-A--TTCTCC--A--GT-AAT-A--T-C-GG-CA-A--T--A-TT-A-AGCTTT
gi|110674 : GGGGGGGTTCAA-CC---TTA----------AG-ATAGCTGTG---A-A-GT-GC-ACTA---AT-A-T-----GA--AAA-ATA-ACT----------T-ATTTTT------C-A--TT--------------T-A--T-C-GG-CG-A--T--A-TT-A-A-CTT
gi|110676 : GGGGGGGGC--A-CC---TTA----------GTCATAACCGTG--GA-A-GT-GCTACCA----T-GCT-----GA--AAA-ATACACTA---A-----T-TTTTG-------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-AT-T-T-GG-TG-A--TG-A-TTAA-AGCTTT
gi|110675 : GGGAGGGTCCCA-CCATCTTA----------AGAATAACTGTG--AA-CCGT-GC--CAA---AC-A-T-----AATGAAA-ATA-ACTA---C-----T-TTTTTTATT---C-AATTT-TCC--ACAGT-AAT-A--T-C-GG-CGAA--T--A-TT-A-AAC
gi|110677 : GGGGGGTCTAA------TTA----------AGTAAGACTGTG--GATA-GT-GC-ACAA---AT-A-T-----GA--AAA-A-A-ATCA---A-----TATTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--T-CGGG-CG-ATTT--A-TT---AGCTTT
gi|110679 : GGGGGTCCAA-CC---TTA----------AGTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAA---ATAG-T-----GA--AAA-ATA-GCTA---A-----T-TTTTTT--------A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--T-C-GGTCG-A--T--A-TT-A-AGCTTT
gi|110678 : GGGGGTCCAA-CC---TTA----------AGTATA-CTGTG--GA-A-GT-GC-ACAA---AT-A-T-----GA--AAA-ATA-ACTA-----------TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--TCC-GG-CG-A--T--ATTT-A-AGCTTT
gi|110680 : GGGGTCCAA-CC---TTA----------AGTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAA---AT-A-T-----GA--AAA-ATA-ACTA---T-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--T-C-GG-CG-A--T--A-TT-A-AGCTTT
gi|110682 : GTATAACTG----GA-A-GT-GC-ACAA---AT-A-T-----GA--AAA-ATA-ACTA---A-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--T-C-GG-CG-A--T--A-TT-A-AGCTTT
gi|110681 : GTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAA---AT-A-T-----GA--AAA-ATA-ACTA---AT----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC-----GT-AAT-A--T-C-GG-CG-A--T--A-TT-A-AACTTT
gi|110683 : GTATAACTGTG--AA-A-GT-GC-ACAA---AT-A-T-----AA--AAA-ATA-ACTA-----------TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--C-C-GG-CG-A--T--A-TT-A-AGCTTT
gi|110684 : GTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAA---AT-A-T-----GAG-AAG-AT--ACCA------------TTTTT------CAA--TT-TCC--A--GTAAAT-A--T-C-GG-CG-A--T--A-TT-A-AGC
gi|110685 : GTATAAGTGTG--AATA-GTTGC-ACAA---AT-A-T-----GA--AAAAATA-ACTA---A-------TTTTTT------C-A--TT-TTCCAA--GT-AAT-A--T-C-GG-CG-G--TA-A-TT-A-AGCGTT
gi|110686 : GTATA-CTGTG--GA-A-GT-GC-ACAA---GT-A-G-----GG--AAA-ATA-ACTA---ATTTTTT-TTTTTT------C-A--TT-TCCA-A--GT--AT-AGTC-C-GGTCG-A--T--A-TT-A-CGCTTT
gi|110687 : ATAACTGTGGCGA-A-GT-GC-ACAA---GT-A-T------A--AAA-ATA-AC-A---A-----T-TTTATT------C-A--TT-TCCA-A--GT-AAC----T-C-GG-CG-C--A--A-TT-A-AACTTT
gi|110688 : ATAACTGTG--GC-G-AT-GC-ACAAGTAAT-G-TTACTAAA--AGA-ATA-ACGA---A-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GTAAAT-A--T-C-GGCCG-A--TGAA-TT-ATAACTT
gi|110689 : TAACTG----GA-A-GT-GC-ACAA---AT-A-T-----GA--AAA--TA-ACTATTTC-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--T-C--G-CG-A--T--A-TT---AGCTTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111 111111111
lowQualScore : 3 666 5555555555 22 4 2 2 2 4 8888888 44 2 666666666 2 999999 2 22 2 66 22 6 2 44 2 2 6 2 66 2 2 44
lowQualScore : . ... .......... .. . . . . . ....... .. . ......... . ...... . .. . .. .. . . .. . . . . .. . . ..
lowQualScore : 6 444 9999999999 88 0 0 0 0 0 5555555 88 0 444444444 0 222222 0 88 0 88 88 0 0 88 0 0 0 0 88 0 0 88
consensus : GGGGGGGTCCAA-CC---TTA----------AGTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAAATA-TG-------A--AAAATA-ACTA---A-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--T-C-GG-CG-AT--A-TT-A--AGCTTT
Reference ( family-836 ) : GGGGGGGTCCAA-CC---TTA----------AGTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAAATA-TG-------A--AAAATA-ACTA---A-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--T-C-GG-CG-AT--A-TT-A--AGCTTT
gi|110670 : GGGGGGGTCCAA-CC---TTA----------AGTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAAATG-TG-------A--AAAATA-ACTA---A-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--T-C-GG-CG-AT--A-TT-A--AGCTTT
gi|110671 : GGGGGGGTCCA--CC---TTA----------AGTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAAATA--G-------A--AAAATA-GCTA---A-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GTAAATAA--T-C-GG-CG-AT--A-TT-A--AGCTT
gi|110672 : GGGGGGGTCCAA-CC---TTA----------AGTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAAATA-TG-------A--AAAA-A-A-TA---T-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-CCT-A--T-C-GG-CG-AT--A--T-A--AG
gi|110673 : GGGGGGGTCCAAACC---TTAGTAAGAAAAAAACATTACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAA-TA-TG-------A--AAAATA-ACTT---T-----T-TTTTTTTTTTTTC-A--TTCTCC--A--GT-AAT-A--T-C-GG-CA-AT--A-TT-A--AGCTTT
gi|110674 : GGGGGGGTTCAA-CC---TTA----------AG-ATAGCTGTG---A-A-GT-GC-ACTAATA-TG-------A--AAAATA-ACT----------T-ATTTTT------C-A--TT--------------T-A--T-C-GG-CG-AT--A-TT-A--A-CTT
gi|110675 : GGGAGGGTCCCA-CCATCTTA----------AGAATAACTGTG--AA-CCGT-GC--CAAACA-TA-------ATGAAAATA-ACTA---C-----T-TTTTTTATT---C-AATTT-TCC--ACAGT-AAT-A--T-C-GG-CGAAT--A-TT-A--AAC
gi|110676 : GGGGGGGGC--A-CC---TTA----------GTCATAACCGTG--GA-A-GT-GCTACCATGC-TG-------A--AAAATACACTA---A-----T-TTTTG-------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-AT-T-T-GG-TG-ATG-A-TTAA--AGCTTT
gi|110677 : GGGGGGTCTAA------TTA----------AGTAAGACTGTG--GATA-GT-GC-ACAAATA-TG-------A--AAAA-A-ATCA---A-----TATTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--T-CGGG-CG-AT----TT-ATTAGCTTT
gi|110678 : GGGGGTCCAA-CC---TTA----------AGTATA-CTGTG--GA-A-GT-GC-ACAAATA-TG-------A--AAAATA-ACTA-----------TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--TCC-GG-CG-AT--ATTT-A--AGCTTT
gi|110679 : GGGGGTCCAA-CC---TTA----------AGTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAAATAGTG-------A--AAAATA-GCTA---A-----T-TTTTTT--------A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--T-C-GGTCG-AT--A-TT-A--AGCTTT
gi|110680 : GGGGTCCAA-CC---TTA----------AGTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAAATA-TG-------A--AAAATA-ACTA---T-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--T-C-GG-CG-AT--A-TT-A--AGCTTT
gi|110681 : GTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAAATA-TG-------A--AAAATA-ACTA---AT----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC-----GT-AAT-A--T-C-GG-CG-AT--A-TT-A--AACTTT
gi|110682 : GTATAACTG----GA-A-GT-GC-ACAAATA-TG-------A--AAAATA-ACTA---A-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--T-C-GG-CG-AT--A-TT-A--AGCTTT
gi|110683 : GTATAACTGTG--AA-A-GT-GC-ACAAATA-TA-------A--AAAATA-ACTA-----------TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--C-C-GG-CG-AT--A-TT-A--AGCTTT
gi|110684 : GTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAAATA-TG-------AG-AAGAT--ACCA------------TTTTT------CAA--TT-TCC--A--GTAAAT-A--T-C-GG-CG-AT--A-TT-A--AGC
gi|110685 : GTATAAGTGTG--AATA-GTTGC-ACAAATA-TGA------A--AAAATA-ACTA---A-------TTTTTT------C-A--TT-TTCCAA--GT-AAT-A--T-C-GG-CG-GTA-A-TT-A--AGCGTT
gi|110686 : GTATA-CTGTG--GA-A-GT-GC-ACAAGTA-GG-------G--AAAATA-ACTA---ATTTTTT-TTTTTT------C-A--TT-TCCA-A--GT--AT-AGTC-C-GGTCG-AT--A-TT-A--CGCTTT
gi|110687 : ATAACTGTGGCGA-A-GT-GC-ACAAGTA-T--------A--AAAATA-AC-A---A-----T-TTTATT------C-A--TT-TCCA-A--GT-AAC----T-C-GG-CG-CA--A-TT-A--AACTTT
gi|110688 : ATAACTGTG--GC-G-AT-GC-ACAAGTAATGTTACTAAA--AGAATA-ACGA---A-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GTAAAT-A--T-C-GGCCG-ATGAA-TT-AT-AACTT
gi|110689 : TAACTG----GA-A-GT-GC-ACAAATA-TG-------A--AAA-TA-ACTATTTC-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--T-C--G-CG-AT--A-TT----AGCTTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111 111111111
lowQualScore : 3 666 5555555555 22 4 2 2 2 4 8888888 44 2 666666666 2 999999 2 22 2 66 22 6 2 44 2 2 6 2 66 2 2 44
lowQualScore : . ... .......... .. . . . . . ....... .. . ......... . ...... . .. . .. .. . . .. . . . . .. . . ..
lowQualScore : 6 444 9999999999 88 0 0 0 0 0 5555555 88 0 444444444 0 222222 0 88 0 88 88 0 0 88 0 0 0 0 88 0 0 88
consensus : GGGGGGGTCCAA-CC---TTA----------AGTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAAATA-TG-------A--AAAATA-ACTA---A-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--T-C-GG-CG-AT--A-TT-A--AGCTTT
Reference ( family-836 ) : GGGGGGGTCCAA-CC---TTA----------AGTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAAATA-TG-------A--AAAATA-ACTA---A-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--T-C-GG-CG-AT--A-TT-A--AGCTTT
gi|110670 : GGGGGGGTCCAA-CC---TTA----------AGTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAAATG-TG-------A--AAAATA-ACTA---A-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--T-C-GG-CG-AT--A-TT-A--AGCTTT
gi|110671 : GGGGGGGTCCA--CC---TTA----------AGTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAAATA--G-------A--AAAATA-GCTA---A-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GTAAATAA--T-C-GG-CG-AT--A-TT-A--AGCTT
gi|110672 : GGGGGGGTCCAA-CC---TTA----------AGTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAAATA-TG-------A--AAAA-A-A-TA---T-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-CCT-A--T-C-GG-CG-AT--A--T-A--AG
gi|110673 : GGGGGGGTCCAAACC---TTAGTAAGAAAAAAACATTACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAA-TA-TG-------A--AAAATA-ACTT---T-----T-TTTTTTTTTTTTC-A--TTCTCC--A--GT-AAT-A--T-C-GG-CA-AT--A-TT-A--AGCTTT
gi|110674 : GGGGGGGTTCAA-CC---TTA----------AG-ATAGCTGTG---A-A-GT-GC-ACTAATA-TG-------A--AAAATA-ACT----------T-ATTTTT------C-A--TT--------------T-A--T-C-GG-CG-AT--A-TT-A--A-CTT
gi|110675 : GGGAGGGTCCCA-CCATCTTA----------AGAATAACTGTG--AA-CCGT-GC--CAAACA-TA-------ATGAAAATA-ACTA---C-----T-TTTTTTATT---C-AATTT-TCC--ACAGT-AAT-A--T-C-GG-CGAAT--A-TT-A--AAC
gi|110676 : GGGGGGGGC--A-CC---TTA----------GTCATAACCGTG--GA-A-GT-GCTACCATGC-TG-------A--AAAATACACTA---A-----T-TTTTG-------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-AT-T-T-GG-TG-ATG-A-TTAA--AGCTTT
gi|110677 : GGGGGGTCTAA------TTA----------AGTAAGACTGTG--GATA-GT-GC-ACAAATA-TG-------A--AAAA-A-ATCA---A-----TATTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--T-CGGG-CG-AT----TT-ATTAGCTTT
gi|110678 : GGGGGTCCAA-CC---TTA----------AGTATA-CTGTG--GA-A-GT-GC-ACAAATA-TG-------A--AAAATA-ACTA-----------TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--TCC-GG-CG-AT--ATTT-A--AGCTTT
gi|110679 : GGGGGTCCAA-CC---TTA----------AGTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAAATAGTG-------A--AAAATA-GCTA---A-----T-TTTTTT--------A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--T-C-GGTCG-AT--A-TT-A--AGCTTT
gi|110680 : GGGGTCCAA-CC---TTA----------AGTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAAATA-TG-------A--AAAATA-ACTA---T-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--T-C-GG-CG-AT--A-TT-A--AGCTTT
gi|110681 : GTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAAATA-TG-------A--AAAATA-ACTA---AT----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC-----GT-AAT-A--T-C-GG-CG-AT--A-TT-A--AACTTT
gi|110682 : GTATAACTG----GA-A-GT-GC-ACAAATA-TG-------A--AAAATA-ACTA---A-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--T-C-GG-CG-AT--A-TT-A--AGCTTT
gi|110683 : GTATAACTGTG--AA-A-GT-GC-ACAAATA-TA-------A--AAAATA-ACTA-----------TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--C-C-GG-CG-AT--A-TT-A--AGCTTT
gi|110684 : GTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAAATA-TG-------AG-AAGAT--ACCA------------TTTTT------CAA--TT-TCC--A--GTAAAT-A--T-C-GG-CG-AT--A-TT-A--AGC
gi|110685 : GTATAAGTGTG--AATA-GTTGC-ACAAATA-TGA------A--AAAATA-ACTA---A-------TTTTTT------C-A--TT-TTCCAA--GT-AAT-A--T-C-GG-CG-GTA-A-TT-A--AGCGTT
gi|110686 : GTATA-CTGTG--GA-A-GT-GC-ACAAGTA-GG-------G--AAAATA-ACTA---ATTTTTT-TTTTTT------C-A--TT-TCCA-A--GT--AT-AGTC-C-GGTCG-AT--A-TT-A--CGCTTT
gi|110687 : ATAACTGTGGCGA-A-GT-GC-ACAAGTA-T--------A--AAAATA-AC-A---A-----T-TTTATT------C-A--TT-TCCA-A--GT-AAC----T-C-GG-CG-CA--A-TT-A--AACTTT
gi|110688 : ATAACTGTG--GC-G-AT-GC-ACAAGTAATGTTACTAAA--AGAATA-ACGA---A-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GTAAAT-A--T-C-GGCCG-ATGAA-TT-AT-AACTT
gi|110689 : TAACTG----GA-A-GT-GC-ACAAATA-TG-------A--AAA-TA-ACTATTTC-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--T-C--G-CG-AT--A-TT----AGCTTT
blockSeqs : A ATC GTAAGAAAAA GC T C T T G TTACTAA TG C ATTTTT A TTTTTT A AT C CA CA A A GT C G T A GA T A TT
blockSeqs : . . . . T . . . A A G . TTTC . ATT . . . A . A . T . . T . G . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . AT . . . . . A . A . . . . C . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : GGGGGGGTCCAA-CC---TTA----------AGTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAAATA-TG-------A--AAAATA-ACTA---A-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--T-C-GG-CG-AT--A-TT-A--AGCTTT
finalCons : GGGGGGGTCCAA-CC---TTA----------AGTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAAATA-TG-------A--AAAATA-ACTA---A-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--T-C-GG-CG-AT--A-TT-A--AGCTTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111 111111111
lowQualScore : 3 666 5555555555 22 4 2 2 2 4 8888888 44 2 666666666 2 999999 2 22 2 66 22 6 2 44 2 2 6 2 66 2 2 44
lowQualScore : . ... .......... .. . . . . . ....... .. . ......... . ...... . .. . .. .. . . .. . . . . .. . . ..
lowQualScore : 6 444 9999999999 88 0 0 0 0 0 5555555 88 0 444444444 0 222222 0 88 0 88 88 0 0 88 0 0 0 0 88 0 0 88
consensus : GGGGGGGTCCAA-CC---TTA----------AGTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAAATA-TG-------A--AAAATA-ACTA---A-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--T-C-GG-CG-AT--A-TT-A--AGCTTT
Reference ( family-836 ) : GGGGGGGTCCAA-CC---TTA----------AGTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAAATA-TG-------A--AAAATA-ACTA---A-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--T-C-GG-CG-AT--A-TT-A--AGCTTT
gi|110670 : GGGGGGGTCCAA-CC---TTA----------AGTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAAATG-TG-------A--AAAATA-ACTA---A-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--T-C-GG-CG-AT--A-TT-A--AGCTTT
gi|110671 : GGGGGGGTCCA--CC---TTA----------AGTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAAATA--G-------A--AAAATA-GCTA---A-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GTAAATAA--T-C-GG-CG-AT--A-TT-A--AGCTT
gi|110672 : GGGGGGGTCCAA-CC---TTA----------AGTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAAATA-TG-------A--AAAA-A-A-TA---T-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-CCT-A--T-C-GG-CG-AT--A--T-A--AG
gi|110673 : GGGGGGGTCCAAACC---TTAGTAAGAAAAAAACATTACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAA-TA-TG-------A--AAAATA-ACTT---T-----T-TTTTTTTTTTTTC-A--TTCTCC--A--GT-AAT-A--T-C-GG-CA-AT--A-TT-A--AGCTTT
gi|110674 : GGGGGGGTTCAA-CC---TTA----------AG-ATAGCTGTG---A-A-GT-GC-ACTAATA-TG-------A--AAAATA-ACT----------T-ATTTTT------C-A--TT--------------T-A--T-C-GG-CG-AT--A-TT-A--A-CTT
gi|110675 : GGGAGGGTCCCA-CCATCTTA----------AGAATAACTGTG--AA-CCGT-GC--CAAACA-TA-------ATGAAAATA-ACTA---C-----T-TTTTTTATT---C-AATTT-TCC--ACAGT-AAT-A--T-C-GG-CGAAT--A-TT-A--AAC
gi|110676 : GGGGGGGGC--A-CC---TTA----------GTCATAACCGTG--GA-A-GT-GCTACCATGC-TG-------A--AAAATACACTA---A-----T-TTTTG-------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-AT-T-T-GG-TG-ATG-A-TTAA--AGCTTT
gi|110677 : GGGGGGTCTAA------TTA----------AGTAAGACTGTG--GATA-GT-GC-ACAAATA-TG-------A--AAAA-A-ATCA---A-----TATTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--T-CGGG-CG-AT----TT-ATTAGCTTT
gi|110678 : GGGGGTCCAA-CC---TTA----------AGTATA-CTGTG--GA-A-GT-GC-ACAAATA-TG-------A--AAAATA-ACTA-----------TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--TCC-GG-CG-AT--ATTT-A--AGCTTT
gi|110679 : GGGGGTCCAA-CC---TTA----------AGTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAAATAGTG-------A--AAAATA-GCTA---A-----T-TTTTTT--------A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--T-C-GGTCG-AT--A-TT-A--AGCTTT
gi|110680 : GGGGTCCAA-CC---TTA----------AGTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAAATA-TG-------A--AAAATA-ACTA---T-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--T-C-GG-CG-AT--A-TT-A--AGCTTT
gi|110681 : GTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAAATA-TG-------A--AAAATA-ACTA---AT----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC-----GT-AAT-A--T-C-GG-CG-AT--A-TT-A--AACTTT
gi|110682 : GTATAACTG----GA-A-GT-GC-ACAAATA-TG-------A--AAAATA-ACTA---A-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--T-C-GG-CG-AT--A-TT-A--AGCTTT
gi|110683 : GTATAACTGTG--AA-A-GT-GC-ACAAATA-TA-------A--AAAATA-ACTA-----------TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--C-C-GG-CG-AT--A-TT-A--AGCTTT
gi|110684 : GTATAACTGTG--GA-A-GT-GC-ACAAATA-TG-------AG-AAGAT--ACCA------------TTTTT------CAA--TT-TCC--A--GTAAAT-A--T-C-GG-CG-AT--A-TT-A--AGC
gi|110685 : GTATAAGTGTG--AATA-GTTGC-ACAAATA-TGA------A--AAAATA-ACTA---A-------TTTTTT------C-A--TT-TTCCAA--GT-AAT-A--T-C-GG-CG-GTA-A-TT-A--AGCGTT
gi|110686 : GTATA-CTGTG--GA-A-GT-GC-ACAAGTA-GG-------G--AAAATA-ACTA---ATTTTTT-TTTTTT------C-A--TT-TCCA-A--GT--AT-AGTC-C-GGTCG-AT--A-TT-A--CGCTTT
gi|110687 : ATAACTGTGGCGA-A-GT-GC-ACAAGTA-T--------A--AAAATA-AC-A---A-----T-TTTATT------C-A--TT-TCCA-A--GT-AAC----T-C-GG-CG-CA--A-TT-A--AACTTT
gi|110688 : ATAACTGTG--GC-G-AT-GC-ACAAGTAATGTTACTAAA--AGAATA-ACGA---A-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GTAAAT-A--T-C-GGCCG-ATGAA-TT-AT-AACTT
gi|110689 : TAACTG----GA-A-GT-GC-ACAAATA-TG-------A--AAA-TA-ACTATTTC-----T-TTTTTT------C-A--TT-TCC--A--GT-AAT-A--T-C--G-CG-AT--A-TT----AGCTTT