lowQualScore : 1111111 111 11 1111 11 1 44444 111 1111
lowQualScore : 4 66 4 4 8 4 4 4 4 1 4444444 5 5 5 5 5 5 66 66 4 222 4 4 4 4 00 4 4 8 4 4 777 1 3333 999999 11 4 66 8 4 888 66 5 5 0 44444 5 888 66 4 4 4 4 55 3 3 44 0000 555 3 77777 3 3 77777 666666 44 44 555 555 3 6 3 3 2 3 3 3 2 555 2
lowQualScore : . .. . . . . . . . . ....... . . . . . . .. .. . ... . . . . .. . . . . . ... . .... ...... .. . .. . . ... .. . . . ..... . ... .. . . . . .. . . .. .... ... . ..... . . ..... ...... .. .. ... ... . . . . . . . . . ... .
lowQualScore : 4 11 4 4 9 4 4 4 4 9 0000000 0 0 0 0 0 0 99 99 4 222 4 4 4 4 66 4 4 9 4 4 888 1 5555 111111 00 4 11 9 4 444 99 0 0 0 66666 0 666 99 4 4 0 0 00 6 6 66 4444 888 1 44444 1 1 77777 555555 22 22 111 444 1 0 1 1 4 1 1 1 9 000 9
consensus : AACATTTAAT-AC--A-AG-TA-ATAAA-TATCT-AAA-TTATGAGA-CATGTATA----CATGTGA-A-T-G-AA-T-CGCA--T--TAA-GGGCAAAAAGTCCTACA---CT-CT-A-CA-TTTTGT--ATGCG-T-TTATT-TCTTTA-TT-CTGT---TTGA-A-TGAATT---GAAATATTTAGA--GTGG-TTGAATAAA--GG-TTTCC-ATGC--GTCTG--GTC-A-A-TTTACTGAACC----GATACA-ATTAG-ACC--AA-T-TCTT-ATT-CAA--A-GA-AAT--C----ACTCG---CCAT-GTGGGC-A---A-GT-GAGA-----CA-CC-A-A--A--TTTA-G-GA---G-CCCACACAAA-ATTTTA-CTNGCA-A-AT-GGCGAGTGGG-CAAGTGCGAAGTTT---A-AACCCTG
Reference ( gi|127975 ) : AACATTTAAT-AC--A-AG-TA-ATAAA-TATCT-AAA-TTATGAGA-CATGTATA----CATGTGA-A-T-G-AA-T-CGCA--T--TAA-GGGCAAAAAGTCCTACA---CT-CT-A-CA-TTTTGT--ATGCG-T-TTATT-TCTTTA-TT-CTGT---TTGA-A-TGAATT---GAAATATTTAGA--GTGG-TTGAATAAA--GG-TTTCC-ATGC--ATCTG--GTC-A-A-TTTACTGAACCTT--GATACA-ATTTA-ACC--AA-T-TCTT-ATT-CAA--A-GA-AAT--C----ACTCG---CCAT-GTGGGC-A---A-GT-GAGA-----CA-CC-A-A--A--TTTA-G-GA---G-CCCACGCAAA-ATTTTA-CTAGCA-A-AT-GGCGAGTGGG-CAAGTGCGAAGTTT---A-AACCCTG
gi|127976 : AACATTTAAT-AC--A-AG-TA-ATAAA-TATTT-AAA-TTATGAGA-CATGTATA----CATGTGA-A-T-G-AA-T-CGCA--T--TAA-GGGCAAAAAGTCCTACA---CT-CT-A-CA-TTTTGT--ATGCG-T-TTATT-TCTTTA-TT-CTGT---TTGA-A-TGAATT---GAAATATTTAGA--GTGG-TTGAATAAA--GG-TTTCC-ATGC--ATCTG--GTC-A-A-TTTACTGAACCTT--GATACA-ATTAG-ACC--AA-T-TCTT-ATT-CAA--A-GA-AAT--C----ACTCG---CCAT-GT---C-AAACA-GT-GAGA-----CA-GC-A-T--A--TTGA-G-GA---G-CCCACACAAA-ATTTTA-CTAGCA-A-AT-GGCGAGTGGG-CAAGTGCGAAGTTT---A-AACCCTG
gi|127977 : AACATTTA-T-AC--A-AG-TA-ATAAAATATCT-AAA-TTATGAGA-CATGTATA-----ATGTGA-T-T-G-AA-T-CGCA--T--TGA-GGACAAAAAGTCCT-CAG--CT-CT-A-CA-TTTTGT--ATGCG-T-TTATT-TCTTTA-TT-CTGT---TTGA-ATTGAATT---GAAATATTTAGATGGTGG--TGAATAAA--GG-TTTCC-ATGT--GTCTG--GTC-A-A-TTTACTGAACC----AATACA-ATTAG-ACC--AA-T-TTTT-ATT-CAA--A-GG-AAT--C----ACTCA---CCAT-GTGGGC-A---A-GT-GAAA-----CA-CC-A-A--A--TTTA-G-GA---G-CCCACACAAA-ATTTTA-CTAGCA-A-AT-GGCGAGTGGG-CAAGTGCGAAGTTT---A-AACCCTG
gi|127978 : AACATTTAAT-AC--A-AG-TATAT----TATC--AAA-TTATGA-A-C-TG---A----TATGTGA-A-T-G-AA-T-CGCA--T--TGA-GGGCAAAAAG-CCTACA---CT-CT-A-CAATTTTGT--ATGCG-T-TTATT-TCTT-A-T--CTGT---TTGA-AATGAAT-----GAATATTTAGGACGTGG-TTGAATAAA--GG-TTTCC-ATGC--GTCTG--GTC-A-A-TTTAAT-AACC----AATACA-ATTAG-ACC--AA-T-TCTT-ATT-CAA--A----AAT--CG---ACTCG---CCAT-GTGGGC-A---A-GT-GAGA-----CA-CCAA-A--A--TTTA---GA---G-CCCACACAAA-ATTTTA-CTTGCA-A-ATGGGCGAGTGGG-CAATTGCGAAGTGT---A-AACCC
gi|127979 : AACAT--AAT-AC--A--G-TA-ATAAA-T-TCT-AAAATTATGAGA-CATGTA------CATGTGA-A-T-G-AA-TGCACA--T--TAG-GGGCAAAAAGTTTTACA---CT-CT-A-CA-TTTTGT--ATGTAAT-TCATT-TCTTTA-TT-CTGT---TTGA-A-TGAATT---GAAATATTTAGA--GTGA-TTGACT--A--GGTTTTCC-ATGC--GTCTG--GTCTA-ATTTTAATGAACT-----ATACA-G-TTA-GAC--AA-T-TCTT-ATT-CAA--A-G---AT--C----ACTCG---CCAT-GTGGGC-A---A-GTGGAGA-----CA-AC-A-A--A--TTTA-G-GA---G-CCCCAACAAA-ATTTTA-CTAGCA-A-AT-GGCAAGTGGGCCAAGTGCAAAGTTT---A-
gi|127980 : AACATTTAAT-AC--A-AG-TA-ATAGA-TATCT-AAA-TTATGAGAGCATGTATA----CATGTGA-A-TCG-AA-T-GGCA--T--TAA-GGGC-AAAAGTCCCACA---AT-CT-A-CA--TTTGT--ATGCA-TGTTATT-TCTTTATTT-CTGT---TTGA-A--GAA-T---GAAATATTTAGA--GTGG-TTGAATAAA--GG-TTTCC-ATGC--GTCTG--GTC-A-A--TTACTGAACC--------CA-AT----------A-T-ATTT-ATT-C-A--A-GA-AAT--C----ACT-G----CAT-GTGGGC-----A-GT-GAGA-----CAGCA-A-A--A--TGTATA-GA---G-ACCACACAAA-ATTTTA-CTAGCA-A-AT-GG-GAG-GGG-CAAGTGCGGAGTTT---A-AACC
gi|127981 : AACATTTAATCAC--A-AGCTACATAAA-TATCT-AC--TTATGAGA-CATGT-CA----TATGTGACACT-GCAA-T-TGCA--TCTTAATGGGCAAAATGTCCTACA---CTCCT-ACCA-TTTTGTC-ATGCG-T-CTATTCTCTTTA-TT-CTGTCCCTTGACA-TGAATTTCCGAAATATTTAGA--GTGGCTTGAATAAATCGGCCTTCCAATGCCAACCTGTACTC-ACATTTTACAGAACCCTTAGATACACATCTAGACC--AATT-TCTTCATT-CAA--ACGACAATCCC----ACTCGCCCCCATCGTGGGC-A---ACAC-GAGA-----CA-CC-ACA--AACTTTA-GCGA---GCCCCACACAAACATTTTACCTAGCACACAT-GGCCGGT-GG-CAGTTGCGAAGTTTTTCA-AACCCTG
gi|127982 : AACATTTAAT-ACTCATAG-TA-ATAAA-TATCTGAAA-TTATGAGA-C-TGTAAA----TGT-TGA-A-T-G-AAGT-CGCAGGT--GAG-GGGCAAAAAGTCCTACAGGACT-CTTA-CA-TTTTGTCAATGCG-T-TTATTGTCTTTA-TTACTGT---TTGA-AATGA-TT---GAAATATTTAGA--
gi|127983 : ACATCTAAT-GA--A-A---A-ATAAA-TATCT-AAA-TTATGAGA-CATGTACAATGGCATGTGA-A-T-G-AA-T-CACA--T--TAA-GGGCAAAAAGTCCTACT---TT-CT-A-CA-TTTTGT--GTGCA-T-TTAT---CCTTA-TT-CTGT---TT--------------------TTTAGA--GTGG-TTGAATAAA--GG-TTTCC-ATGC--GTCTG--GTC-A-A-TTTACTGAACCC---AATATA-ATTAG-ACC--AA-T-TCTT-ATT-CAA--A-GA-AAT--C----ACTCG---GCAT-GTGGGC-A---A-GT-GAGA-----CA-GC-A-A--A--TTTA-G-GA---G-CCCACACAAA-TTTTTA-CTAGCA-A-AT-GGCGAGTGGG-CAAGTGCGAAG-TT---A-AACCCTG
gi|127984 : ACATTTAAT-AC--A-AG-TA-ATAAA-TATCT-AAA-TTATGAGA-CAAGTA
gi|127985 : A-GGGCAAAAAGTCCTACT---TT-CT-A-CA-TTTTGT--GTGCA-T-TTATT-CCTTTA-TT-CTGT---TT--------------------TTTAGA--GTGG-TTGAATAAA--GG-TTTCC-ATGC--
gi|127986 : -TGAATT---GAAATATTTAGA--GTGG-CTGAATAAA--TG-TTTCC-ATGC--GTCTG--GTC-A-A-TTg
gi|127987 : TTACCGAAACAC--AATACA-ATTAG-ACCGCAA-TCTTTT-GTT-CAA--A-GA-AAT--C----ACTTG---CCAT-GTGGGC-G---A-GC-GAGA-----CA-GC-A-A--A--TTTA-G-GA---G-CCCACACAAA-ATTTTA-CTCACA-A-AT-GGCGAGTGGG-CAAGTGCGAAGTTT---A-AACTCT
gi|127988 : -T-TCCT-GTT-CAC--A-GA-AAT--C----ACTCG---CCAT-GTGGGC-A---A-GA-GAGA-----TG-GT-G-A--A--TTTA-G-GC---G-CCCATACAAA-ATTTTC-CTTGCA-A-AC-ATCGAGTGGG-CGAGTGCTAAGTTT---A-AACCCTG
gi|127989 : TT-GTTGCAATCA-GA-AAT--TTTCTAATCG---CCAT-GTGGGCTA---C-CT-GA--------A-CC-ATA--G--TTT--T-GATTCA-CCCACATGGA-AATTTA-GTCGCA-T-AT-GGCGAGTGGG-CGACCGTTAATTTC---A-AACCCTG
gi|127990 : --A-AA-AGT--C----GCTCA---CCAT-GTGGGC-G---A-AT-G-GA-----TT-TT-G-AATA--TCTA-T-TG---G-CCCACAACAA-ATTTTG-CTCGC--A-TT-GGCGAGTGG
gi|127991 : T--T----ATTCG---CCAT-GTGGG------A-G--GAGGATTTTCA-C----A--A--TTTG-G-TC---G-CCCACACATA-AAATTA-CTCGCA-T-AT--GCGTGTGGT-CAAGTG-GTAATTT---GCAATCCTG
gi|127992 : T-GTGGGC-A---A-GT-GAGA-----CA-CC-A-A--A--TTTA-G-GA---G-CCCACACAAA-TTTTTA-CTAGCA-A-AT-GGCGAGTGGG-CAAATGCTAAGTTT---A-AACC
gi|127993 : GAGTGGG-CAAGTGCGAAGTTT---A-AACCCTG
gi|127994 : AGTGGG-CAAGTGCGAAGTTT---A-AACCCTG
Alignments
lowQualScore : 11111 111 111 11 33333
lowQualScore : 4 55 4 4 8 4 4 4 4 0 5 00000 4 4 4 4 4 4 66 66 4 111 4 4 4 4 99 4 4 8 4 4 777 4 000 666 00 4 55 4 4 4 55 66 4 4 4 4 4 4 44444 4 4 66 4 4 3 3 44 3 3 44 9999 555 2 66666 2 2 77777 3333 5 33 33 444 555 2 2 2 1 2 2 2 2 444 2
lowQualScore : . .. . . . . . . . . . ..... . . . . . . .. .. . ... . . . . .. . . . . . ... . ... ... .. . .. . . . .. .. . . . . . . ..... . . .. . . . . .. . . .. .... ... . ..... . . ..... .... . .. .. ... ... . . . . . . . . ... .
lowQualScore : 0 55 0 0 0 0 0 0 0 8 3 33333 4 4 4 4 4 4 11 11 0 000 0 0 0 0 55 0 0 0 0 0 000 0 777 444 00 0 55 0 0 0 55 11 4 4 4 4 4 4 33333 4 4 11 0 0 6 6 66 3 3 22 6666 444 9 22222 9 9 11111 4444 7 99 99 000 000 9 9 9 0 9 9 9 7 777 7
consensus : AACATTTAAT-AC--A-AG-TA-ATAAA-TATCT-AAA-TTATGAGA-CATGTATA----CATGTGA-A-T-G-AA-T-CGCA--T--TAA-GGGCAAAAAGTCCTACA---CT-CT-A-CA-TTTTGT--ATGCG-T-TTATT-TCTTTA-TT-CTGT---TTGA-A-T-GAATT---GAAATATTTAGA--GTGG-TTGAATAAA--GG-TTT-CC-ATGC--GTCTG--GTC-A-A-TTT-ACTGAA-C-C----GATACA-AT-TAGACC--AA-T-TCTT-ATT-CAA--A-GA-AAT--C----ACTCG---CCAT-GTGGGC-A---A-GTG-AGA-----CA-CC-A-A--A--TTTA-G-GA---G-CCCACACAAA-ATTTTA-CTAGCA-A-AT-GGCGAGTGGG-CAAGTGCGAAGTTT---A-AACCCTG
Reference ( family-825 ) : AACATTTAAT-AC--A-AG-TA-ATAAA-TATCT-AAA-TTATGAGA-CATGTATA----CATGTGA-A-T-G-AA-T-CGCA--T--TAA-GGGCAAAAAGTCCTACA---CT-CT-A-CA-TTTTGT--ATGCG-T-TTATT-TCTTTA-TT-CTGT---TTGA-A-T-GAATT---GAAATATTTAGA--GTGG-TTGAATAAA--GG-TTT-CC-ATGC--GTCTG--GTC-A-A-TTT-ACTGAA-C-C----GATACA-AT-TAGACC--AA-T-TCTT-ATT-CAA--A-GA-AAT--C----ACTCG---CCAT-GTGGGC-A---A-GTG-AGA-----CA-CC-A-A--A--TTTA-G-GA---G-CCCACACAAA-ATTTTA-CTNGCA-A-AT-GGCGAGTGGG-CAAGTGCGAAGTTT---A-AACCCTG
gi|127975 : AACATTTAAT-AC--A-AG-TA-ATAAA-TATCT-AAA-TTATGAGA-CATGTATA----CATGTGA-A-T-G-AA-T-CGCA--T--TAA-GGGCAAAAAGTCCTACA---CT-CT-A-CA-TTTTGT--ATGCG-T-TTATT-TCTTTA-TT-CTGT---TTGA-A-T-GAATT---GAAATATTTAGA--GTGG-TTGAATAAA--GG-TTT-CC-ATGC--ATCTG--GTC-A-A-TTT-ACTGAA-C-CTT--GATACA-AT-TTAACC--AA-T-TCTT-ATT-CAA--A-GA-AAT--C----ACTCG---CCAT-GTGGGC-A---A-GTG-AGA-----CA-CC-A-A--A--TTTA-G-GA---G-CCCACGCAAA-ATTTTA-CTAGCA-A-AT-GGCGAGTGGG-CAAGTGCGAAGTTT---A-AACCCTG
gi|127976 : AACATTTAAT-AC--A-AG-TA-ATAAA-TATTT-AAA-TTATGAGA-CATGTATA----CATGTGA-A-T-G-AA-T-CGCA--T--TAA-GGGCAAAAAGTCCTACA---CT-CT-A-CA-TTTTGT--ATGCG-T-TTATT-TCTTTA-TT-CTGT---TTGA-A-T-GAATT---GAAATATTTAGA--GTGG-TTGAATAAA--GG-TTT-CC-ATGC--ATCTG--GTC-A-A-TTT-ACTGAA-C-CTT--GATACA-AT-TAGACC--AA-T-TCTT-ATT-CAA--A-GA-AAT--C----ACTCG---CCAT-GT---C-AAACA-GTG-AGA-----CA-GC-A-T--A--TTGA-G-GA---G-CCCACACAAA-ATTTTA-CTAGCA-A-AT-GGCGAGTGGG-CAAGTGCGAAGTTT---A-AACCCTG
gi|127977 : AACATTTA-T-AC--A-AG-TA-ATAAAATATCT-AAA-TTATGAGA-CATGTATA-----ATGTGA-T-T-G-AA-T-CGCA--T--TGA-GGACAAAAAGTCCT-CAG--CT-CT-A-CA-TTTTGT--ATGCG-T-TTATT-TCTTTA-TT-CTGT---TTGA-A-TTGAATT---GAAATATTTAGATGGTGG-T-GAATAAA--GG-TTT-CC-ATGT--GTCTG--GTC-A-A-TTT-ACTGAA-C-C----AATACA-AT-TAGACC--AA-T-TTTT-ATT-CAA--A-GG-AAT--C----ACTCA---CCAT-GTGGGC-A---A-GTG-AAA-----CA-CC-A-A--A--TTTA-G-GA---G-CCCACACAAA-ATTTTA-CTAGCA-A-AT-GGCGAGTGGG-CAAGTGCGAAGTTT---A-AACCCTG
gi|127978 : AACATTTAAT-AC--A-AG-TATAT----TATC--AAA-TTATGA-A-C-TG---A----TATGTGA-A-T-G-AA-T-CGCA--T--TGA-GGGCAAAAAG-CCTACA---CT-CT-A-CAATTTTGT--ATGCG-T-TTATT-TCTT-A-T--CTGT---TTGA-AAT-GAAT-----GAATATTTAGGACGTGG-TTGAATAAA--GG-TTT-CC-ATGC--GTCTG--GTC-A-A-TTT-AAT-AA-C-C----AATACA-AT-TAGACC--AA-T-TCTT-ATT-CAA--A----AAT--CG---ACTCG---CCAT-GTGGGC-A---A-GTG-AGA-----CA-CCAA-A--A--TTTA---GA---G-CCCACACAAA-ATTTTA-CTTGCA-A-ATGGGCGAGTGGG-CAATTGCGAAGTGT---A-AACCC
gi|127979 : AACAT--AAT-AC--A--G-TA-ATAAA-T-TCT-AAAATTATGAGA-CATGTA------CATGTGA-A-T-G-AA-TGCACA--T--TAG-GGGCAAAAAGTTTTACA---CT-CT-A-CA-TTTTGT--ATGTAAT-TCATT-TCTTTA-TT-CTGT---TTGA-A-T-GAATT---GAAATATTTAGA--GTGA-TTGACTA----GG-TTTTCC-ATGC--GTCTG--GTCTA-A-TTTTAATGAA-C-T-----ATACA-GT-TAGAC---AA-T-TCTT-ATT-CAA--A-GA---T--C----ACTCG---CCAT-GTGGGC-A---A-GTGGAGA-----CA-AC-A-A--A--TTTA-G-GA---G-CCCCAACAAA-ATTTTA-CTAGCA-A-AT-GGCAAGTGGGCCAAGTGCAAAGTTT---A-
gi|127980 : AACATTTAAT-AC--A-AG-TA-ATAGA-TATCT-AAA-TTATGAGAGCATGTATA----CATGTGA-A-TCG-AA-T-GGCA--T--TAA-GGGC-AAAAGTCCCACA---AT-CT-A-CA--TTTGT--ATGCA-TGTTATT-TCTTTATTT-CTGT---TTGA-A---GAA-T---GAAATATTTAGA--GTGG-TTGAATAAA--GG-TTT-CC-ATGC--GTCTG--GTC-A-A--TT-ACTGAA-C-C--------CA-AT----------A-T-ATTT-ATT-C-A--A-GA-AAT--C----ACT-G----CAT-GTGGGC-----A-GTG-AGA-----CAGCA-A-A--A--TGTATA-GA---G-ACCACACAAA-ATTTTA-CTAGCA-A-AT-GG-GAG-GGG-CAAGTGCGGAGTTT---A-AACC
gi|127981 : AACATTTAATCAC--A-AGCTACATAAA-TATCT-AC--TTATGAGA-CATGT-CA----TATGTGACACT-GCAA-T-TGCA--TCTTAATGGGCAAAATGTCCTACA---CTCCT-ACCA-TTTTGTC-ATGCG-T-CTATTCTCTTTA-TT-CTGTCCCTTGACA-T-GAATTTCCGAAATATTTAGA--GTGGCTTGAATAAATCGGCCTT-CCAATGCCAACCTGTACTC-ACATTTT-ACAGAA-C-CCTTAGATACACATCTAGACC--AATT-TCTTCATT-CAA--ACGACAATCCC----ACTCGCCCCCATCGTGGGC-A---ACACG-AGA-----CA-CC-ACA--AACTTTA-GCGA---GCCCCACACAAACATTTTACCTAGCACACAT-GGCCGGT-GG-CAGTTGCGAAGTTTTTCA-AACCCTG
gi|127982 : AACATTTAAT-ACTCATAG-TA-ATAAA-TATCTGAAA-TTATGAGA-C-TGTAAA----TGT-TGA-A-T-G-AAGT-CGCAGGT--GAG-GGGCAAAAAGTCCTACAGGACT-CTTA-CA-TTTTGTCAATGCG-T-TTATTGTCTTTA-TTACTGT---TTGA-AAT-GA-TT---GAAATATTTAGA--
gi|127983 : ACATCTAAT-GA--A-A---A-ATAAA-TATCT-AAA-TTATGAGA-CATGTACAATGGCATGTGA-A-T-G-AA-T-CACA--T--TAA-GGGCAAAAAGTCCTACT---TT-CT-A-CA-TTTTGT--GTGCA-T-TTAT---CCTTA-TT-CTGT---TT---------------------TTTAGA--GTGG-TTGAATAAA--GG-TTT-CC-ATGC--GTCTG--GTC-A-A-TTT-ACTGAA-C-CC---AATATA-AT-TAGACC--AA-T-TCTT-ATT-CAA--A-GA-AAT--C----ACTCG---GCAT-GTGGGC-A---A-GTG-AGA-----CA-GC-A-A--A--TTTA-G-GA---G-CCCACACAAA-TTTTTA-CTAGCA-A-AT-GGCGAGTGGG-CAAGTGCGAAG-TT---A-AACCCTG
gi|127984 : ACATTTAAT-AC--A-AG-TA-ATAAA-TATCT-AAA-TTATGAGA-CAAGTA
gi|127985 : A-GGGCAAAAAGTCCTACT---TT-CT-A-CA-TTTTGT--GTGCA-T-TTATT-CCTTTA-TT-CTGT---TT---------------------TTTAGA--GTGG-TTGAATAAA--GG-TTT-CC-ATGC--G
gi|127986 : -T-GAATT---GAAATATTTAGA--GTGG-CTGAATAAA--TG-TTT-CC-ATGC--GTCTG--GTC-A-A-TT
gi|127987 : TT-ACCGAAACAC----AATACA-AT-TAGACCGCAA-TCTTTT-GTT-CAA--A-GA-AAT--C----ACTTG---CCAT-GTGGGC-G---A-GCG-AGA-----CA-GC-A-A--A--TTTA-G-GA---G-CCCACACAAA-ATTTTA-CTCACA-A-AT-GGCGAGTGGG-CAAGTGCGAAGTTT---A-AACTCT
gi|127988 : -T-TCCT-GTT-CAC--A-GA-AAT--C----ACTCG---CCAT-GTGGGC-A---A-GAG-AGA-----TG-GT-G-A--A--TTTA-G-GC---G-CCCATACAAA-ATTTTC-CTTGCA-A-AC-ATCGAGTGGG-CGAGTGCTAAGTTT---A-AACCCTG
gi|127989 : TT-GTTGCAATCA-GA-AAT--TTTCTAATCG---CCAT-GTGGGCTA---C-CTG-A--------A-CC-ATA--G--TTT--T-GATTCA-CCCACATGGA-AATTTA-GTCGCA-T-AT-GGCGAGTGGG-CGACCGTTAATTTC---A-AACCCTG
gi|127990 : --A-AA-AGT--C----GCTCA---CCAT-GTGGGC-G---A-ATG--GA-----TT-TT-G-AATA--TCTA-T-TG---G-CCCACAACAA-ATTTTG-CTCGC--A-TT-GGCGAGTGG
gi|127991 : T--T----ATTCG---CCAT-GTGGG------A-G-G-AGGATTTTCA-C----A--A--TTTG-G-TC---G-CCCACACATA-AAATTA-CTCGCA-T-AT--GCGTGTGGT-CAAGTG-GTAATTT---GCAATCCTG
gi|127992 : T-GTGGGC-A---A-GTG-AGA-----CA-CC-A-A--A--TTTA-G-GA---G-CCCACACAAA-TTTTTA-CTAGCA-A-AT-GGCGAGTGGG-CAAATGCTAAGTTT---A-AACC
gi|127993 : GAGTGGG-CAAGTGCGAAGTTT---A-AACCCTG
gi|127994 : AGTGGG-CAAGTGCGAAGTTT---A-AACCCTG
Alignments
lowQualScore : 11111 111 111 11 33333
lowQualScore : 4 55 4 4 8 4 4 4 4 0 5 00000 4 4 4 4 4 4 66 66 4 111 4 4 4 4 99 4 4 8 4 4 777 4 000 666 00 4 55 4 4 4 55 66 4 4 4 4 4 4 44444 4 4 66 4 4 3 3 44 3 3 44 9999 555 2 66666 2 2 77777 3333 5 33 33 444 555 2 2 2 1 2 2 2 2 444 2
lowQualScore : . .. . . . . . . . . . ..... . . . . . . .. .. . ... . . . . .. . . . . . ... . ... ... .. . .. . . . .. .. . . . . . . ..... . . .. . . . . .. . . .. .... ... . ..... . . ..... .... . .. .. ... ... . . . . . . . . ... .
lowQualScore : 0 55 0 0 0 0 0 0 0 8 3 33333 4 4 4 4 4 4 11 11 0 000 0 0 0 0 55 0 0 0 0 0 000 0 777 444 00 0 55 0 0 0 55 11 4 4 4 4 4 4 33333 4 4 11 0 0 6 6 66 3 3 22 6666 444 9 22222 9 9 11111 4444 7 99 99 000 000 9 9 9 6 9 9 9 7 777 7
consensus : AACATTTAAT-AC--A-AG-TA-ATAAA-TATCT-AAA-TTATGAGA-CATGTATA----CATGTGA-A-T-G-AA-T-CGCA--T--TAA-GGGCAAAAAGTCCTACA---CT-CT-A-CA-TTTTGT--ATGCG-T-TTATT-TCTTTA-TT-CTGT---TTGA-A-T-GAATT---GAAATATTTAGA--GTGG-TTGAATAAA--GG-TTT-CC-ATGC--GTCTG--GTC-A-A-TTT-ACTGAA-C-C----GATACA-AT-TAGACC--AA-T-TCTT-ATT-CAA--A-GA-AAT--C----ACTCG---CCAT-GTGGGC-A---A-GTG-AGA-----CA-CC-A-A--A--TTTA-G-GA---G-CCCACACAAA-ATTTTA-CTAGCA-A-AT-GGCGAGTGGG-CAAGTGCGAAGTTT---A-AACCCTG
Reference ( family-825 ) : AACATTTAAT-AC--A-AG-TA-ATAAA-TATCT-AAA-TTATGAGA-CATGTATA----CATGTGA-A-T-G-AA-T-CGCA--T--TAA-GGGCAAAAAGTCCTACA---CT-CT-A-CA-TTTTGT--ATGCG-T-TTATT-TCTTTA-TT-CTGT---TTGA-A-T-GAATT---GAAATATTTAGA--GTGG-TTGAATAAA--GG-TTT-CC-ATGC--GTCTG--GTC-A-A-TTT-ACTGAA-C-C----GATACA-AT-TAGACC--AA-T-TCTT-ATT-CAA--A-GA-AAT--C----ACTCG---CCAT-GTGGGC-A---A-GTG-AGA-----CA-CC-A-A--A--TTTA-G-GA---G-CCCACACAAA-ATTTTA-CTAGCA-A-AT-GGCGAGTGGG-CAAGTGCGAAGTTT---A-AACCCTG
gi|127975 : AACATTTAAT-AC--A-AG-TA-ATAAA-TATCT-AAA-TTATGAGA-CATGTATA----CATGTGA-A-T-G-AA-T-CGCA--T--TAA-GGGCAAAAAGTCCTACA---CT-CT-A-CA-TTTTGT--ATGCG-T-TTATT-TCTTTA-TT-CTGT---TTGA-A-T-GAATT---GAAATATTTAGA--GTGG-TTGAATAAA--GG-TTT-CC-ATGC--ATCTG--GTC-A-A-TTT-ACTGAA-C-CTT--GATACA-AT-TTAACC--AA-T-TCTT-ATT-CAA--A-GA-AAT--C----ACTCG---CCAT-GTGGGC-A---A-GTG-AGA-----CA-CC-A-A--A--TTTA-G-GA---G-CCCACGCAAA-ATTTTA-CTAGCA-A-AT-GGCGAGTGGG-CAAGTGCGAAGTTT---A-AACCCTG
gi|127976 : AACATTTAAT-AC--A-AG-TA-ATAAA-TATTT-AAA-TTATGAGA-CATGTATA----CATGTGA-A-T-G-AA-T-CGCA--T--TAA-GGGCAAAAAGTCCTACA---CT-CT-A-CA-TTTTGT--ATGCG-T-TTATT-TCTTTA-TT-CTGT---TTGA-A-T-GAATT---GAAATATTTAGA--GTGG-TTGAATAAA--GG-TTT-CC-ATGC--ATCTG--GTC-A-A-TTT-ACTGAA-C-CTT--GATACA-AT-TAGACC--AA-T-TCTT-ATT-CAA--A-GA-AAT--C----ACTCG---CCAT-GT---C-AAACA-GTG-AGA-----CA-GC-A-T--A--TTGA-G-GA---G-CCCACACAAA-ATTTTA-CTAGCA-A-AT-GGCGAGTGGG-CAAGTGCGAAGTTT---A-AACCCTG
gi|127977 : AACATTTA-T-AC--A-AG-TA-ATAAAATATCT-AAA-TTATGAGA-CATGTATA-----ATGTGA-T-T-G-AA-T-CGCA--T--TGA-GGACAAAAAGTCCT-CAG--CT-CT-A-CA-TTTTGT--ATGCG-T-TTATT-TCTTTA-TT-CTGT---TTGA-A-TTGAATT---GAAATATTTAGATGGTGG-T-GAATAAA--GG-TTT-CC-ATGT--GTCTG--GTC-A-A-TTT-ACTGAA-C-C----AATACA-AT-TAGACC--AA-T-TTTT-ATT-CAA--A-GG-AAT--C----ACTCA---CCAT-GTGGGC-A---A-GTG-AAA-----CA-CC-A-A--A--TTTA-G-GA---G-CCCACACAAA-ATTTTA-CTAGCA-A-AT-GGCGAGTGGG-CAAGTGCGAAGTTT---A-AACCCTG
gi|127978 : AACATTTAAT-AC--A-AG-TATAT----TATC--AAA-TTATGA-A-C-TG---A----TATGTGA-A-T-G-AA-T-CGCA--T--TGA-GGGCAAAAAG-CCTACA---CT-CT-A-CAATTTTGT--ATGCG-T-TTATT-TCTT-A-T--CTGT---TTGA-AAT-GAAT-----GAATATTTAGGACGTGG-TTGAATAAA--GG-TTT-CC-ATGC--GTCTG--GTC-A-A-TTT-AAT-AA-C-C----AATACA-AT-TAGACC--AA-T-TCTT-ATT-CAA--A----AAT--CG---ACTCG---CCAT-GTGGGC-A---A-GTG-AGA-----CA-CCAA-A--A--TTTA---GA---G-CCCACACAAA-ATTTTA-CTTGCA-A-ATGGGCGAGTGGG-CAATTGCGAAGTGT---A-AACCC
gi|127979 : AACAT--AAT-AC--A--G-TA-ATAAA-T-TCT-AAAATTATGAGA-CATGTA------CATGTGA-A-T-G-AA-TGCACA--T--TAG-GGGCAAAAAGTTTTACA---CT-CT-A-CA-TTTTGT--ATGTAAT-TCATT-TCTTTA-TT-CTGT---TTGA-A-T-GAATT---GAAATATTTAGA--GTGA-TTGACTA----GG-TTTTCC-ATGC--GTCTG--GTCTA-A-TTTTAATGAA-C-T-----ATACA-GT-TAGAC---AA-T-TCTT-ATT-CAA--A-GA---T--C----ACTCG---CCAT-GTGGGC-A---A-GTGGAGA-----CA-AC-A-A--A--TTTA-G-GA---G-CCCCAACAAA-ATTTTA-CTAGCA-A-AT-GGCAAGTGGGCCAAGTGCAAAGTTT---A-
gi|127980 : AACATTTAAT-AC--A-AG-TA-ATAGA-TATCT-AAA-TTATGAGAGCATGTATA----CATGTGA-A-TCG-AA-T-GGCA--T--TAA-GGGC-AAAAGTCCCACA---AT-CT-A-CA--TTTGT--ATGCA-TGTTATT-TCTTTATTT-CTGT---TTGA-A---GAA-T---GAAATATTTAGA--GTGG-TTGAATAAA--GG-TTT-CC-ATGC--GTCTG--GTC-A-A--TT-ACTGAA-C-C--------CA-AT----------A-T-ATTT-ATT-C-A--A-GA-AAT--C----ACT-G----CAT-GTGGGC-----A-GTG-AGA-----CAGCA-A-A--A--TGTATA-GA---G-ACCACACAAA-ATTTTA-CTAGCA-A-AT-GG-GAG-GGG-CAAGTGCGGAGTTT---A-AACC
gi|127981 : AACATTTAATCAC--A-AGCTACATAAA-TATCT-AC--TTATGAGA-CATGT-CA----TATGTGACACT-GCAA-T-TGCA--TCTTAATGGGCAAAATGTCCTACA---CTCCT-ACCA-TTTTGTC-ATGCG-T-CTATTCTCTTTA-TT-CTGTCCCTTGACA-T-GAATTTCCGAAATATTTAGA--GTGGCTTGAATAAATCGGCCTT-CCAATGCCAACCTGTACTC-ACATTTT-ACAGAA-C-CCTTAGATACACATCTAGACC--AATT-TCTTCATT-CAA--ACGACAATCCC----ACTCGCCCCCATCGTGGGC-A---ACACG-AGA-----CA-CC-ACA--AACTTTA-GCGA---GCCCCACACAAACATTTTACCTAGCACACAT-GGCCGGT-GG-CAGTTGCGAAGTTTTTCA-AACCCTG
gi|127982 : AACATTTAAT-ACTCATAG-TA-ATAAA-TATCTGAAA-TTATGAGA-C-TGTAAA----TGT-TGA-A-T-G-AAGT-CGCAGGT--GAG-GGGCAAAAAGTCCTACAGGACT-CTTA-CA-TTTTGTCAATGCG-T-TTATTGTCTTTA-TTACTGT---TTGA-AAT-GA-TT---GAAATATTTAGA--
gi|127983 : ACATCTAAT-GA--A-A---A-ATAAA-TATCT-AAA-TTATGAGA-CATGTACAATGGCATGTGA-A-T-G-AA-T-CACA--T--TAA-GGGCAAAAAGTCCTACT---TT-CT-A-CA-TTTTGT--GTGCA-T-TTAT---CCTTA-TT-CTGT---TT---------------------TTTAGA--GTGG-TTGAATAAA--GG-TTT-CC-ATGC--GTCTG--GTC-A-A-TTT-ACTGAA-C-CC---AATATA-AT-TAGACC--AA-T-TCTT-ATT-CAA--A-GA-AAT--C----ACTCG---GCAT-GTGGGC-A---A-GTG-AGA-----CA-GC-A-A--A--TTTA-G-GA---G-CCCACACAAA-TTTTTA-CTAGCA-A-AT-GGCGAGTGGG-CAAGTGCGAAG-TT---A-AACCCTG
gi|127984 : ACATTTAAT-AC--A-AG-TA-ATAAA-TATCT-AAA-TTATGAGA-CAAGTA
gi|127985 : A-GGGCAAAAAGTCCTACT---TT-CT-A-CA-TTTTGT--GTGCA-T-TTATT-CCTTTA-TT-CTGT---TT---------------------TTTAGA--GTGG-TTGAATAAA--GG-TTT-CC-ATGC--G
gi|127986 : -T-GAATT---GAAATATTTAGA--GTGG-CTGAATAAA--TG-TTT-CC-ATGC--GTCTG--GTC-A-A-TT
gi|127987 : TT-ACCGAAACAC----AATACA-AT-TAGACCGCAA-TCTTTT-GTT-CAA--A-GA-AAT--C----ACTTG---CCAT-GTGGGC-G---A-GCG-AGA-----CA-GC-A-A--A--TTTA-G-GA---G-CCCACACAAA-ATTTTA-CTCACA-A-AT-GGCGAGTGGG-CAAGTGCGAAGTTT---A-AACTCT
gi|127988 : -T-TCCT-GTT-CAC--A-GA-AAT--C----ACTCG---CCAT-GTGGGC-A---A-GAG-AGA-----TG-GT-G-A--A--TTTA-G-GC---G-CCCATACAAA-ATTTTC-CTTGCA-A-AC-ATCGAGTGGG-CGAGTGCTAAGTTT---A-AACCCTG
gi|127989 : TT-GTTGCAATCA-GA-AAT--TTTCTAATCG---CCAT-GTGGGCTA---C-CTG-A--------A-CC-ATA--G--TTT--T-GATTCA-CCCACATGGA-AATTTA-GTCGCA-T-AT-GGCGAGTGGG-CGACCGTTAATTTC---A-AACCCTG
gi|127990 : --A-AA-AGT--C----GCTCA---CCAT-GTGGGC-G---A-ATG--GA-----TT-TT-G-AATA--TCTA-T-TG---G-CCCACAACAA-ATTTTG-CTCGC--A-TT-GGCGAGTGG
gi|127991 : T--T----ATTCG---CCAT-GTGGG------A-G-G-AGGATTTTCA-C----A--A--TTTG-G-TC---G-CCCACACATA-AAATTA-CTCGCA-T-AT--GCGTGTGGT-CAAGTG-GTAATTT---GCAATCCTG
gi|127992 : T-GTGGGC-A---A-GTG-AGA-----CA-CC-A-A--A--TTTA-G-GA---G-CCCACACAAA-TTTTTA-CTAGCA-A-AT-GGCGAGTGGG-CAAATGCTAAGTTT---A-AACC
gi|127993 : GAGTGGG-CAAGTGCGAAGTTT---A-AACCCTG
gi|127994 : AGTGGG-CAAGTGCGAAGTTT---A-AACCCTG
blockSeqs : C TC T C T A G A G T ATGGC C C C C G G GG CT T GGA C T C A CA A G C T A CCC C TT TCC TG C TC C T A CA TA T C T T A A CTTAG C C GC T C C G TC C C CC TTCT CCC C AAAC C G ATTTT CCA C AT AC TA TTC C C C A C C G C TTC C
blockSeqs : . . . . C . . . . T C . . . . . . . . . G . . . . C . . G . . . . AT . AC . . . . . . . . . . . . . TTG . . . . . . . . . . . G . . TA . . . GCA T . . GC . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . A . . . GC . . . G . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . A . . . CC . . . G . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . A . . . AC . . . G . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . C T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . A . . . CC . . . G . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . GC . . . G . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . GC . . . G . . . . C . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . GT . . . T . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . G . . . CC . . . T . . . . C . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . TT . . . G . . . . C . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . CC . . . G . . . . C . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons : A****
originalCons : AACATTTAAT-AC--A-AG-TA-ATAAA-TATCT-AAA-TTATGAGA-CATGTATA----CATGTGA-A-T-G-AA-T-CGCA--T--TAA-GGGCAAAAAGTCCTACA---CT-CT-A-CA-TTTTGT--ATGCG-T-TTATT-TCTTTA-TT-CTGT---TTGA-A-T-GAATT---GAAATATTTAGA--GTGG-TTGAATAAA--GG-TTT-CC-ATGC--GTCTG--GTC-A-A-TTT-ACTGAA-C-C----GATACA-AT-TAGACC--AA-T-TCTT-ATT-CAA--A-GA-AAT--C----ACTCG---CCAT-GTGGGC-A---A-GTG-AGA-----CA-CC-A-A--A--TTTA-G-GA---G-CCCACACAAA-ATTTTA-CTAGCA-A-AT-GGCGAGTGGG-CAAGTGCGAAGTTT---A-AACCCTG
finalCons : AACATTTAAT-AC--A-AG-TA-ATAAA-TATCT-AAA-TTATGAGA-CATGTATA----CATGTGA-A-T-G-AA-T-CGCA--T--TAA-GGGCAAAAAGTCCTACA---CT-CT-A-CA-TTTTGT--ATGCG-T-TTATT-TCTTTA-TT-CTGT---TTGA-A-T-GAATT---GAAATATTTAGA--GTGG-TTGAATAAA--GG-TTT-CC-ATGC--GTCTG--GTC-A-A-TTT-ACTGAA-C-CA----ATACA-AT-TAGACC--AA-T-TCTT-ATT-CAA--A-GA-AAT--C----ACTCG---CCAT-GTGGGC-A---A-GTG-AGA-----CA-CC-A-A--A--TTTA-G-GA---G-CCCACACAAA-ATTTTA-CTAGCA-A-AT-GGCGAGTGGG-CAAGTGCGAAGTTT---A-AACCCTG
Alignments
lowQualScore : 11111 111 111 11 22222
lowQualScore : 4 55 4 4 8 4 4 4 4 0 5 00000 4 4 4 4 4 4 66 66 4 111 4 4 4 4 99 4 4 8 4 4 777 4 000 666 00 4 55 4 4 4 55 66 4 4 4 4 4 4 77777 4 4 66 4 4 3 3 44 3 3 44 9999 555 2 66666 2 2 77777 3333 5 33 33 444 555 2 2 2 1 2 2 2 2 444 2
lowQualScore : . .. . . . . . . . . . ..... . . . . . . .. .. . ... . . . . .. . . . . . ... . ... ... .. . .. . . . .. .. . . . . . . ..... . . .. . . . . .. . . .. .... ... . ..... . . ..... .... . .. .. ... ... . . . . . . . . ... .
lowQualScore : 0 55 0 0 0 0 0 0 0 8 3 33333 4 4 4 4 4 4 11 11 0 000 0 0 0 0 55 0 0 0 0 0 000 0 777 444 00 0 55 0 0 0 55 11 4 4 4 4 4 4 66666 4 4 11 0 0 6 6 66 3 3 22 6666 444 9 22222 9 9 11111 4444 7 99 99 000 000 9 9 9 6 9 9 9 7 777 7
consensus : AACATTTAAT-AC--A-AG-TA-ATAAA-TATCT-AAA-TTATGAGA-CATGTATA----CATGTGA-A-T-G-AA-T-CGCA--T--TAA-GGGCAAAAAGTCCTACA---CT-CT-A-CA-TTTTGT--ATGCG-T-TTATT-TCTTTA-TT-CTGT---TTGA-A-T-GAATT---GAAATATTTAGA--GTGG-TTGAATAAA--GG-TTT-CC-ATGC--GTCTG--GTC-A-A-TTT-ACTGAA-C-C----GATACA-AT-TAGACC--AA-T-TCTT-ATT-CAA--A-GA-AAT--C----ACTCG---CCAT-GTGGGC-A---A-GTG-AGA-----CA-CC-A-A--A--TTTA-G-GA---G-CCCACACAAA-ATTTTA-CTAGCA-A-AT-GGCGAGTGGG-CAAGTGCGAAGTTT---A-AACCCTG
Reference ( family-825 ) : AACATTTAAT-AC--A-AG-TA-ATAAA-TATCT-AAA-TTATGAGA-CATGTATA----CATGTGA-A-T-G-AA-T-CGCA--T--TAA-GGGCAAAAAGTCCTACA---CT-CT-A-CA-TTTTGT--ATGCG-T-TTATT-TCTTTA-TT-CTGT---TTGA-A-T-GAATT---GAAATATTTAGA--GTGG-TTGAATAAA--GG-TTT-CC-ATGC--GTCTG--GTC-A-A-TTT-ACTGAA-C-C----AATACA-AT-TAGACC--AA-T-TCTT-ATT-CAA--A-GA-AAT--C----ACTCG---CCAT-GTGGGC-A---A-GTG-AGA-----CA-CC-A-A--A--TTTA-G-GA---G-CCCACACAAA-ATTTTA-CTAGCA-A-AT-GGCGAGTGGG-CAAGTGCGAAGTTT---A-AACCCTG
gi|127975 : AACATTTAAT-AC--A-AG-TA-ATAAA-TATCT-AAA-TTATGAGA-CATGTATA----CATGTGA-A-T-G-AA-T-CGCA--T--TAA-GGGCAAAAAGTCCTACA---CT-CT-A-CA-TTTTGT--ATGCG-T-TTATT-TCTTTA-TT-CTGT---TTGA-A-T-GAATT---GAAATATTTAGA--GTGG-TTGAATAAA--GG-TTT-CC-ATGC--ATCTG--GTC-A-A-TTT-ACTGAA-C-CTT--GATACA-AT-TTAACC--AA-T-TCTT-ATT-CAA--A-GA-AAT--C----ACTCG---CCAT-GTGGGC-A---A-GTG-AGA-----CA-CC-A-A--A--TTTA-G-GA---G-CCCACGCAAA-ATTTTA-CTAGCA-A-AT-GGCGAGTGGG-CAAGTGCGAAGTTT---A-AACCCTG
gi|127976 : AACATTTAAT-AC--A-AG-TA-ATAAA-TATTT-AAA-TTATGAGA-CATGTATA----CATGTGA-A-T-G-AA-T-CGCA--T--TAA-GGGCAAAAAGTCCTACA---CT-CT-A-CA-TTTTGT--ATGCG-T-TTATT-TCTTTA-TT-CTGT---TTGA-A-T-GAATT---GAAATATTTAGA--GTGG-TTGAATAAA--GG-TTT-CC-ATGC--ATCTG--GTC-A-A-TTT-ACTGAA-C-CTT--GATACA-AT-TAGACC--AA-T-TCTT-ATT-CAA--A-GA-AAT--C----ACTCG---CCAT-GT---C-AAACA-GTG-AGA-----CA-GC-A-T--A--TTGA-G-GA---G-CCCACACAAA-ATTTTA-CTAGCA-A-AT-GGCGAGTGGG-CAAGTGCGAAGTTT---A-AACCCTG
gi|127977 : AACATTTA-T-AC--A-AG-TA-ATAAAATATCT-AAA-TTATGAGA-CATGTATA-----ATGTGA-T-T-G-AA-T-CGCA--T--TGA-GGACAAAAAGTCCT-CAG--CT-CT-A-CA-TTTTGT--ATGCG-T-TTATT-TCTTTA-TT-CTGT---TTGA-A-TTGAATT---GAAATATTTAGATGGTGG-T-GAATAAA--GG-TTT-CC-ATGT--GTCTG--GTC-A-A-TTT-ACTGAA-C-C----AATACA-AT-TAGACC--AA-T-TTTT-ATT-CAA--A-GG-AAT--C----ACTCA---CCAT-GTGGGC-A---A-GTG-AAA-----CA-CC-A-A--A--TTTA-G-GA---G-CCCACACAAA-ATTTTA-CTAGCA-A-AT-GGCGAGTGGG-CAAGTGCGAAGTTT---A-AACCCTG
gi|127978 : AACATTTAAT-AC--A-AG-TATAT----TATC--AAA-TTATGA-A-C-TG---A----TATGTGA-A-T-G-AA-T-CGCA--T--TGA-GGGCAAAAAG-CCTACA---CT-CT-A-CAATTTTGT--ATGCG-T-TTATT-TCTT-A-T--CTGT---TTGA-AAT-GAAT-----GAATATTTAGGACGTGG-TTGAATAAA--GG-TTT-CC-ATGC--GTCTG--GTC-A-A-TTT-AAT-AA-C-C----AATACA-AT-TAGACC--AA-T-TCTT-ATT-CAA--A----AAT--CG---ACTCG---CCAT-GTGGGC-A---A-GTG-AGA-----CA-CCAA-A--A--TTTA---GA---G-CCCACACAAA-ATTTTA-CTTGCA-A-ATGGGCGAGTGGG-CAATTGCGAAGTGT---A-AACCC
gi|127979 : AACAT--AAT-AC--A--G-TA-ATAAA-T-TCT-AAAATTATGAGA-CATGTA------CATGTGA-A-T-G-AA-TGCACA--T--TAG-GGGCAAAAAGTTTTACA---CT-CT-A-CA-TTTTGT--ATGTAAT-TCATT-TCTTTA-TT-CTGT---TTGA-A-T-GAATT---GAAATATTTAGA--GTGA-TTGACTA----GG-TTTTCC-ATGC--GTCTG--GTCTA-A-TTTTAATGAA-C-T----A-TACA-GT-TAGAC---AA-T-TCTT-ATT-CAA--A-GA---T--C----ACTCG---CCAT-GTGGGC-A---A-GTGGAGA-----CA-AC-A-A--A--TTTA-G-GA---G-CCCCAACAAA-ATTTTA-CTAGCA-A-AT-GGCAAGTGGGCCAAGTGCAAAGTTT---A-
gi|127980 : AACATTTAAT-AC--A-AG-TA-ATAGA-TATCT-AAA-TTATGAGAGCATGTATA----CATGTGA-A-TCG-AA-T-GGCA--T--TAA-GGGC-AAAAGTCCCACA---AT-CT-A-CA--TTTGT--ATGCA-TGTTATT-TCTTTATTT-CTGT---TTGA-A---GAA-T---GAAATATTTAGA--GTGG-TTGAATAAA--GG-TTT-CC-ATGC--GTCTG--GTC-A-A--TT-ACTGAA-C-C--------CA-AT----------A-T-ATTT-ATT-C-A--A-GA-AAT--C----ACT-G----CAT-GTGGGC-----A-GTG-AGA-----CAGCA-A-A--A--TGTATA-GA---G-ACCACACAAA-ATTTTA-CTAGCA-A-AT-GG-GAG-GGG-CAAGTGCGGAGTTT---A-AACC
gi|127981 : AACATTTAATCAC--A-AGCTACATAAA-TATCT-AC--TTATGAGA-CATGT-CA----TATGTGACACT-GCAA-T-TGCA--TCTTAATGGGCAAAATGTCCTACA---CTCCT-ACCA-TTTTGTC-ATGCG-T-CTATTCTCTTTA-TT-CTGTCCCTTGACA-T-GAATTTCCGAAATATTTAGA--GTGGCTTGAATAAATCGGCCTT-CCAATGCCAACCTGTACTC-ACATTTT-ACAGAA-C-CCTTAGATACACATCTAGACC--AATT-TCTTCATT-CAA--ACGACAATCCC----ACTCGCCCCCATCGTGGGC-A---ACACG-AGA-----CA-CC-ACA--AACTTTA-GCGA---GCCCCACACAAACATTTTACCTAGCACACAT-GGCCGGT-GG-CAGTTGCGAAGTTTTTCA-AACCCTG
gi|127982 : AACATTTAAT-ACTCATAG-TA-ATAAA-TATCTGAAA-TTATGAGA-C-TGTAAA----TGT-TGA-A-T-G-AAGT-CGCAGGT--GAG-GGGCAAAAAGTCCTACAGGACT-CTTA-CA-TTTTGTCAATGCG-T-TTATTGTCTTTA-TTACTGT---TTGA-AAT-GA-TT---GAAATATTTAGA--
gi|127983 : ACATCTAAT-GA--A-A---A-ATAAA-TATCT-AAA-TTATGAGA-CATGTACAATGGCATGTGA-A-T-G-AA-T-CACA--T--TAA-GGGCAAAAAGTCCTACT---TT-CT-A-CA-TTTTGT--GTGCA-T-TTAT---CCTTA-TT-CTGT---TT---------------------TTTAGA--GTGG-TTGAATAAA--GG-TTT-CC-ATGC--GTCTG--GTC-A-A-TTT-ACTGAA-C-CC---AATATA-AT-TAGACC--AA-T-TCTT-ATT-CAA--A-GA-AAT--C----ACTCG---GCAT-GTGGGC-A---A-GTG-AGA-----CA-GC-A-A--A--TTTA-G-GA---G-CCCACACAAA-TTTTTA-CTAGCA-A-AT-GGCGAGTGGG-CAAGTGCGAAG-TT---A-AACCCTG
gi|127984 : ACATTTAAT-AC--A-AG-TA-ATAAA-TATCT-AAA-TTATGAGA-CAAGTA
gi|127985 : A-GGGCAAAAAGTCCTACT---TT-CT-A-CA-TTTTGT--GTGCA-T-TTATT-CCTTTA-TT-CTGT---TT---------------------TTTAGA--GTGG-TTGAATAAA--GG-TTT-CC-ATGC--G
gi|127986 : -T-GAATT---GAAATATTTAGA--GTGG-CTGAATAAA--TG-TTT-CC-ATGC--GTCTG--GTC-A-A-TT
gi|127987 : TT-ACCGAAACAC----AATACA-AT-TAGACCGCAA-TCTTTT-GTT-CAA--A-GA-AAT--C----ACTTG---CCAT-GTGGGC-G---A-GCG-AGA-----CA-GC-A-A--A--TTTA-G-GA---G-CCCACACAAA-ATTTTA-CTCACA-A-AT-GGCGAGTGGG-CAAGTGCGAAGTTT---A-AACTCT
gi|127988 : -T-TCCT-GTT-CAC--A-GA-AAT--C----ACTCG---CCAT-GTGGGC-A---A-GAG-AGA-----TG-GT-G-A--A--TTTA-G-GC---G-CCCATACAAA-ATTTTC-CTTGCA-A-AC-ATCGAGTGGG-CGAGTGCTAAGTTT---A-AACCCTG
gi|127989 : TT-GTTGCAATCA-GA-AAT--TTTCTAATCG---CCAT-GTGGGCTA---C-CTG-A--------A-CC-ATA--G--TTT--T-GATTCA-CCCACATGGA-AATTTA-GTCGCA-T-AT-GGCGAGTGGG-CGACCGTTAATTTC---A-AACCCTG
gi|127990 : --A-AA-AGT--C----GCTCA---CCAT-GTGGGC-G---A-ATG--GA-----TT-TT-G-AATA--TCTA-T-TG---G-CCCACAACAA-ATTTTG-CTCGC--A-TT-GGCGAGTGG
gi|127991 : T--T----ATTCG---CCAT-GTGGG------A-G-G-AGGATTTTCA-C----A--A--TTTG-G-TC---G-CCCACACATA-AAATTA-CTCGCA-T-AT--GCGTGTGGT-CAAGTG-GTAATTT---GCAATCCTG
gi|127992 : T-GTGGGC-A---A-GTG-AGA-----CA-CC-A-A--A--TTTA-G-GA---G-CCCACACAAA-TTTTTA-CTAGCA-A-AT-GGCGAGTGGG-CAAATGCTAAGTTT---A-AACC
gi|127993 : GAGTGGG-CAAGTGCGAAGTTT---A-AACCCTG
gi|127994 : AGTGGG-CAAGTGCGAAGTTT---A-AACCCTG