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Reference ( gi|114302 )       :   AAAAAA-AAT--CTG---GGAGGACA-A-G---AATAA---GC--TTTCC--CA----C-CT-AAA-T-TCC-T-A-TT--G--AC-G--TTG-G-TT-A-A-C-G-TC-ATT----T-GG---C----T-------G-------C--A----T-T--GT-TA-C-G--T-------AC-GT-----AC---AT-GA-CG-A---T-T----GC----A---A---AGT-G-AC--G-T-A--AAA-TAGCA-T-CAG--GTGC-AT--T-GCTG----CG-TCATCGAAA
gi|114303                     :   AAAAAA-AAT--CTG---G-AGGACA-A-G---AATAA---GC--TTTCC--CA----C-CT-AAA-T-TCC-T-A-TT--G--AC-G--TTG---TT-A-A-C-G-TC-ATT----T-GG---C----T-------G-------C--A----T-T--GT-TA-C-G--T-------AC-GT-----AC---AT-GA-CG-A---T-T----GC----A---A---AGT-G-AC--G---A--AAA-TAGCA-T-CA---GTGC-AT--T-GCTG----CG-TCATCGAAA
gi|114304                     :   AAAAAA-AAT--CTG---G-AGGACA-A-G---AATAA---GC--TTTCC--CA----C-CT-AAAAT-TCC-T-AATT--G--AC-G--TTG---TT-A-A-C-G-TCCATT----T-G----C----T-------G-------C--A----T-TTGGT-TA-C-G--T-------AC-GT-----AC---ATTGA-CG-A---T-T----GC----A---A---AGT-G-AC--G-T-A--AAA-TAGCA-T-CAA--GTGC-AT--T-GCTG----CG-TCATCGAAA
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Reference ( family-820 )      :         AAAAAA-AAT--CTG---GGAGGACA-A-G-----AAA-A-A--GC--TTTCC--CA----C-CT-AAA-T-TCC-T-A-TT--G--AC-G--TTG-G-TT-A-A-C-G-TC-A-TT----TGG---CT-------G-------C--A----T-T--GT-TA-C-G--T-------A-CG-T-----A-C---AT-GA-CGA---T-T----GC----AA---AGT-G-AC--G-T-A--AAA-TAGCA-T-C-A---G--T-GC-AT--T-GTTA----CG-TCATCGAAA
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gi|114303                     :         AAAAAA-AAT--CTG---G-AGGACA-A-G-----AAT-A-A--GC--TTTCC--CA----C-CT-AAA-T-TCC-T-A-TT--G--AC-G--TTG---TT-A-A-C-G-TC-A-TT----TGG---CT-------G-------C--A----T-T--GT-TA-C-G--T-------A-CG-T-----A-C---AT-GA-CGA---T-T----GC----AA---AGT-G-AC--G---A--AAA-TAGCA-T-C-A---G--T-GC-AT--T-GCTG----CG-TCATCGAAA
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gi|114308                     :         AACAAA-TAT--TTG---G-AGGACA---G-----AAA-A-A--GC--TTCCT--CC----C-AT-AAA-T-TTCAT-A-TT--G--A--G--TTG-G-TT-ATA-C-G-T--A-TT----TGG---CT---------------C--A----TGT--GT-TA-C-GA-T-------A-CG-T-----A-C---AT-GA-CT----T-T----GC----AA---AGT-G-AC--G-T-A--AAA-T-GCA-T-CAA---G--T-GC-AT--T-GTTA----CG-TAA-CGAGA
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Reference ( family-820 )      :         AAAAAA-AAT--CTG---GGAGGACA-A-G-----AAA-A-A--GC--TTTCC--CA----C-CT-AAA-T-TCC-T-A-TT--G--AC-G--TTG-G-TT-A-A-C-G-TC-A-TT----TGG---CT-------G-------C--A----T-T--GT-TA-C-G--T-------A-CG-T-----A-C---AT-GA-CGA---T-T----GC----AA---AGT-G-AC--G-T-A--AAA-TAGCA-T-C-A---G--T-GC-AT--T-GTTG----CG-TCATCGAAA
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gi|114311                     :                            GAGAACA-A-GTCGATAAA-A-C--GC--TTTCC--CA----C-C--AAA-T--CC-T-A-TT--G--AC-G--TTGTG-TT-A-A-C-G-TC-A-TT----T-G---CT-------G-------C--G----CAT--GT-TA-C-GACT-------A-CA-T-----G-T---AT-AT-CGT---T-T----GCCATAAA---AGT---AC--G-T-AATAAA-TAGCA-T-C-----G--T-GC-AT--T-ATAT----TG-TCATCGAAA
gi|114312                     :     aacaatattt-AAT--CGT---GGAGAACA-A-G-----AAA-AAA--GC--TTTCC--CA----C-CT-AAA-T-TCC-TAA-TT--GA-AC-G--TTG-GCTT-----C-G-TC-A---------G---C--------G-------T--A----T-T--GT-TA-C-G--TGAGCTGAA-TG-TAGCGGA-C---AT-GA--GT---T-TTG--GC----AA---AGT-G-ATCAG-T-A--AAA-TAGCA-T-CAA---G--T-GC-ATG-T-GTTA----CG-TCATCGAAA
gi|114313                     :             at-AAT--CTG---GA--GACA-A-G-----AAA-A-A--GC--TTTCC--CA----C-CT-AAA-TGTCC-T-A-TT--G--AC-G--TTG-G-TA-A-A-C-G-TC-A-TT----T-G---CT-------G-------C--AC---T-T--GTATA-C----T-------A-CG-T-----A-C---AT-GA--GT---T-T----GC----AAC--AGT-G-AC--G-T-A--AAA-T-GCT-T-C-A---G--T-GC-AT--T-GTTA----CG-TCATCGAAA
gi|114314                     :                tAT--CTG---G-AGGACA-A-G-----AAA-A-A--GC--CTTTC--C-----------------CC-T-A-TT--G--AC-G--TTG-G-TT-T-A-C-G-TC-T-TT----CTG---CT-------G-------C--C----A-T--GT-GA-C-G--T-------A-CG-T-----AAC---AT-GATCGT---T-TT---GC----AA---AGT-G-AC--G-TAA--AAA-TAG-A-T-C-A---G--T-GC-AT--T-GTTA----CG-TCATCGAAA
gi|114315                     :                            GAGGACA-A-G-----AAA-A-A--AC--TTTCC--TT----C-CT-ATA-T-TCC-T-A-TT--G--AA-T--TTG-G-TT-A-A-C-G-TC-A-TT----TGG---CTTTTGGATG-------C--A----T-T--GT-TA-C-G--G-------A-TG-T-----G-C---AT-GA-CGA---T-T----GC----AA---AGT-T-AT--G-T-A--AAG-TAGCA-T-C-A---G--T-GC-AT--T-GACG----CG-TCATCGAAA
gi|114316                     :              tctaT--CTG---GAGAAACAGA-G-----AAA-A-A--GC--TTTCC--CA----C-CT-AAA-T-TCC---A-TT--G--AC-C--GTG-G-TT-A-A-C---TC-ATTT----TGGAA-CTGAGC---G-------C--AT---T-T--GT-TA-C-GT-T-------ACCGTT-----A-CTAGAT-GA-CGT---TAT----GC-----A---AGT-G-AC--G-T-A--AAA-TAGCATT-C-A---G--T-GC-AT--T-GTTA----CG-TCATCGAAA
gi|114317                     :                  T--CTG---GCAGGACA-A-G-----AAA-A-AAGGT--TTTCC--CA----T-CTTAAA-T-TC--T-A-TTTGG--ACCA--TTG-G-TT-A---C-G-TC-A-TT----TGG---TT-------G-------CCGA----T-T--GT-TA-C-A--T-------A-CG-T-----A-C---AT-GG-CGA---T-TTGTGGC----AA---GGT-G-G---G-T-GT-AAA-TAGCA-T-T-T---GT-T-GC-AT--TGGTTGCCCCCG-TCATCAAAA
gi|114318                     :                            GAGCACA-A-G-----AAA-A----GC--TTTCG--CAAATCT-CT-AAA-T-TCC-T-A-TT--G--AC-GGTTTG-G-TT-A-A-T-G-TC-A-TTGGCCTAGCGTCT-------G-------C--A----T-T--GT-TA-CGG--T-------A-CG-T-----A-C---AT-GA-CGGT--T-T----GC----AAGCTAGTGG-AC--G-T-A--AAATTAGCACT-C-A---G--T-GCGATTGT-GTTA----CGTTCATCGAAA
gi|114319                     :                              GGACA-A-AGC---AAATA-A--ACCATTTCCGTTT----C-CT-ATA-T-TCCAT-A-TT--GTAAT-T--TTG-G-TT-A-A-AAG-TC-A-AT----TGG---CT-------GTTTTGGGC--AATGCT-T--GT-TA-C-G--TG------A-TG-T-----G-C---AT-GA-CGA---T-T----GCA---AA---AGT-T-A---G-T-A--AAG-TAGCA-TCC-A---G----GC-AT--T-GACG----CG-TCATCGAAA
gi|114320                     :                                                                                          T--G--AC-C--TTT-G-TTGA-A-C-T-TC-G-TT----TGG---CG-------G-----------------------TA-C-G--T-------A----------A-C---A---A-T-A---T-T----GT----AA---AGT-G-AT--A-T-A--AAA-TAGCA-T-C-A---G--T-AC-AT--T-G
gi|114321                     :                                                                                                                                    G---CT-------G-------C--A----T-T--GT-TA-C-A--A-------A-CG-T-----A-G---AT-GA-C-A---T-T----GC----AA---AGG-A-AT--G-T-A--AAA-TAGCA-C-C-A---G--T-GC-AG--T-GTCG----CG-TCATAGAAAcacg
gi|114322                     :                                                                                                                                                                                                            -GA-CGA---T-T----GC----GA---AGT-G-AC--G-T-A--AAA-TAGCA-T-C-A---A--T-GC-AT--T-


blockSeqs                     :               T   AA   TCT G      G A TCGAT   T A AG  CA     GT  AATC G  T   A G   A A A  TG TA  C GT   T C  G T A G G  C T  GGCC   CGT  TTTGGAT TTTTGGG CG ATGC G TG  A  G G TGAGCTGA   C  T AGCGG A TAG  T  T  AGAT A TGTG  CATA  GCT   GA   CA T A AT   T     T C AGAT  TT G  G  TG G    CCCC  T
blockSeqs                     :               T   .    .   G      G . GC      . . .   .      .   .    .  .   T .   A . .  .  G   . .    . .  . . . A .  . .  .      AA   GAGC    .       .  C    A .   .  C G ACT        .  . .     . .    .  .  GT   . TG    A     CT    GG   .  . . T    T     C . AA    T  .  .  G  .    .     .
blockSeqs                     :               .   .    .   G      . . .       . . .   .      .   .    .  .   A .   . . .  .  A   . .    . .  . . . . .  . .  .      .    TG      .       .  T    . .   .  . . AT         .  . .     . .    .  .  A    . T     .     C     G    .  . . .    .     . . AA    .  .  .  .  .    .     .
blockSeqs                     :               .   .    .   G      . . .       . . .   .      .   .    .  .   . .   . . .  .  .   . .    . .  . . . . .  . .  .      .    .       .       .  .    . .   .  . . TT         .  . .     . .    .  .  A    . .     .     C     G    .  . . .    .     . . AA    .  .  .  .  .    .     .
blockSeqs                     :               .   .    .   G      . . .       . . .   .      .   .    .  .   . .   . . .  .  .   . .    . .  . . . . .  . .  .      .    .       .       .  .    . .   .  . . TG         .  . .     . .    .  .  T    . .     .     .     G    .  . . .    .     . . A     .  .  .  .  .    .     .
blockSeqs                     :               .   .    .   A      . . .       . . .   .      .   .    .  .   . .   . . .  .  .   . .    . .  . . . . .  . .  .      .    .       .       .  .    . .   .  . . T          .  . .     . .    .  .  T    . .     .     .     G    .  . . .    .     . . A     .  .  .  .  .    .     .
blockSeqs                     :               .   .    .   G      . . .       . . .   .      .   .    .  .   . .   . . .  .  .   . .    . .  . . . . .  . .  .      .    .       .       .  .    . .   .  . . T          .  . .     . .    .  .  A    . .     .     .     G    .  . . .    .     . . A     .  .  .  .  .    .     .
blockSeqs                     :               .   .    .   A      . . .       . . .   .      .   .    .  .   . .   . . .  .  .   . .    . .  . . . . .  . .  .      .    .       .       .  .    . .   .  . . T          .  . .     . .    .  .  A    . .     .     .     A    .  . . .    .     . . A     .  .  .  .  .    .     .
blockSeqs                     :               .   .    .   C      . . .       . . .   .      .   .    .  .   . .   . . .  .  .   . .    . .  . . . . .  . .  .      .    .       .       .  .    . .   .  . . T          .  . .     . .    .  .  T    . .     .     .     G    .  . . .    .     . . A     .  .  .  .  .    .     .
blockSeqs                     :               .   .    .   G      . . .       . . .   .      .   .    .  .   . .   . . .  .  .   . .    . .  . . . . .  . .  .      .    .       .       .  .    . .   .  . . T          .  . .     . .    .  .  T    . .     .     .     G    .  . . .    .     . . A     .  .  .  .  .    .     .
blockSeqs                     :                   .    .   .      . . .       . . .   .      .   .    .  .   . .   . . .  .  .   . .    . .  . . . . .  . .  .      .    .       .       .  .    . .   .  . . T          .  . .     . .    .  .  T    . .     .     .     G    .  . . .    .     . . A     .  .  .  .  .    .     .
blockSeqs                     :                   .    .   .      . . .       . . .   .      .   .    .  .   . .   . . .  .  .   . .    . .  . . . . .  . .  .      .    .       .       .  .    . .   .  . . T          .  . .     . .    .  .  T    . .     .     .     T    .  . . .    .     . . A     .  .  .  .  .    .     .
blockSeqs                     :                   .    .   .      . . .       . . .   .      .   .    .  .   . .   . . .  .  .   . .    . .  . . . . .  . .  .      .    .       .       .  .    . .   .  . . T          .  . .     . .    .  .  A    . .     .     .     G    .  . . .    .     . . T     .  .  .  .  .    .     .
blockSeqs                     :                            .      . . .       . . .   .      .   .    .  .   . .   . . .  .  .   . .    . .  . . . . .  . .  .      .    .       .       .  .    . .   .  . . G          .  . .     . .    .  .  T    . .     .     .     G    .  . . .    .     . . A     .  .  .  .  .    .     .
blockSeqs                     :                            .      . . .       . . .   .      .   .    .  .   . .   . . .  .  .   . .    . .  . . . . .  . .  .      .    .       .       .  .    . .   .  . . T          .  . .     . .    .  .  A    . .     .     .     T    .  . . .    .     . . A     .  .  .  .  .    .     .
blockSeqs                     :                            .      . . .       . . .   .      .   .    .  .   . .   . . .  .  .   . .    . .  . . . . .  . .  .      .    .       .       .  .    . .   .  . . T          .  . .     . .    .  .  A    . .     .     .     G    .  . . .    .     . . A     .  .  .  .  .    .     .
blockSeqs                     :                                   . . .       . . .   .      .   .    .  .   . .   . . .  .  .   . .    . .  . . . . .  . .  .      .    .       .       .  .    . .   .  . . T          .  . .     . .    .  .  A    . .     .     .     A    .  . . .    .     . . A     .  .  .  .  .    .     .
blockSeqs                     :                                                                                           .  .   . .    . .  . . . . .  . .  .      .    .       .       .  .    . .   .  . . A          .  . .     . .    .  .  A    . .     .     .     G    .  . . .    .     . . A     .  .  .  .  .    .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                     .    .       .       .  .    . .   .  . . .          .  . .     . .    .  .  A    . .     .     .     .    .  . . .    .     . . .     .  .  .  .  .           
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                            .  .  .    . .     .     .     .    .  . . .    .     . . .     .  .  .  .  .           


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Reference ( family-820 )      :         AAAAAA-AAT--CTG---GGAGGACA-A-G-----AAA-A-A--GC--TTTCC--CA----C-CT-AAA-T-TCC-T-A-TT--G--AC-G--TTG-G-TT-A-A-C-G-TC-A-TT----TGG---CT-------G-------C--A----T-T--GT-TA-C-G--T-------A-CG-T-----A-C---AT-GA-CGA---T-T----GC----AA---AGT-G-AC--G-T-A--AAA-TAGCA-T-C-A---G--T-GC-AT--T-GTTG----CG-TCATCGAAA
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