lowQualScore                  :        1               111                       222                                            1111      111111111111     333333333333333333333                 11111     44444444444444444444                    111111               1111111            1111                                               111                      2222222                                                       111111111  1111111                    11111                                      
lowQualScore                  :     3  0          3    000  44    33 66  77777   111   777 0 77  2    2       2  2 999    444 2 2222 77   222222222222  66 999999999999999999999  7777  99       11111     88888888888888888888 33 444 888  5 2 2  111111  2 33  55555  7777777  2 444 22  6666    1   333  2  2 2 4  2  2 33   1        1    333    2   77         5  0000000 6 0  2   333  33 2 2  9999999  9999    444  2 33    2 777777777  2222222 55  2 33 2    444  33333     777    6    1  7    2      5     
lowQualScore                  :     .  .          .    ...  ..    .. ..  .....   ...   ... . ..  .    .       .  . ...    ... . .... ..   ............  .. .....................  ....  ..       .....     .................... .. ... ...  . . .  ......  . ..  .....  .......  . ... ..  ....    .   ...  .  . . .  .  . ..   .        .    ...    .   ..         .  ....... . .  .   ...  .. . .  .......  ....    ...  . ..    . .........  ....... ..  . .. .    ...  .....     ...    .    .  .    .      .     
lowQualScore                  :     3  2          3    888  22    99 88  33333   444   000 4 00  5    5       5  2 111    444 5 8888 00   444444444444  33 222222222222222222222  5555  99       55555     66666666666666666666 22 111 999  5 4 4  999999  4 22  99999  4444444  5 111 66  9999    9   555  1  7 4 4  4  4 22   8        1    555    2   99         8  7777777 7 4  2   999  11 2 2  3333333  2222    888  2 11    2 111111111  6666666 66  4 22 4    111  22222     333    7    0  2    4      0     
consensus                     : TCCT-TGAAGCGCTTCTT-CTGG---CC--GCCT--T--TGGCG--CGTG-NTCCNT-GCTGTAGCTCGC-CGTACAGGAGCT--GTTTT---G-G-N--A-GACGGTCGTCTTG---CATNC-----TTCG---GA--TA---TG---ACC-NGCCCAGC---GGAGTTGG--T-TTGA--GC-----G-C--A---AN--ATGG-T-GTN-----AA-T--GC-----TGTG-----CANG---TCGGCNCG-GTTAAGGA-TCTCGGTGT-CCGG-AA-T--TTTGTCCTGCCATCTGAC-GCCGA-GAA-GTTTTCGAAGGCA-CGCT--G-TGTG-GAA---AT--G-G-TT---G---AG----TTTCC--TG-G--CGTGCC---T----CTG------GT--AG-A--C-TGTC---CA---G-GTTTC---GCTTNCATACAGTAAGGTTGTCAA-TACAA
Reference ( gi|27650 )        : TCCT-TGTAGCGCTTTTT-CTGG---CC--ACCT--T--TGGTG--CGTG-ATCCGT-GTTGCAGTTCAC-CGTACAGGAGCT--GTTTT---G-G-A--A-TACGGCTGTTTTC---CATTC-----TTCG---GA--TA---TG---ACC-GGCCCAGC---GGAGTTGA--T-TTGA--GC-----G-C--A---AC--ATAG-T-GTC-----AA-T--GC-----TGTA-----CATG---TCGGCTCG-GCTAAGGA-TTTCGGTAT-CCGG-AA-T--TTTATCCTGCCATCTGAC-TCCGA-GAA-TTTTTCGAAGACA-CACT--G-TATG-GAA---AT--G-G-TT---G---AG----TTTCT--TG-G--TGTGCC---T----TTG------AT--AG-A--C-TGTC---CA---A-GTCTC---GCTTGCATACAGTAAGGTTGTCAA-TACAA
gi|27653                      : TCCT-GTTAGCGCTTTTT-CTGG---CC--ACCT--T--TGGTG--CGTG-ATCCGT-GTTGCAGTTCAC-CATACAGGAGCT--GTTTT---T-G-A--A-TACGGTGGTTTTC---CATTC-----TTCG---GA--TA---TG---ACC-GGCCCAGC---GGAGTTGA--T-TTGA--GC-----G-C--A---AC----AG-T-GTC-----AA-T--GC-----TGTA-----CATG---TCGGCTCG-GCTAAGGATTTTCGGTAT-CCGG-AA-T--TTTATCCTGCCATCTGAC-TCCGA-GAA-TATTTTGAAGACA-CACT--GATA-A-GAA---AT--G-G-TT---G---AGT---TTTCT--TG-G--TGTGCC---T----TTG------AT--AG-A--C-TGTC---CA---A-GTCTC---GCTTCCATACAGTAAGGTTGTCAA-TACAA
gi|27651                      : TCCT-TGTAGCGCTTTTT-CTGG---CC--ACCA--T--TGGTT--CGTG-ATCCGT-GTTTCAGTTCAC-CGTACAGGAGCT--GTTTT---G-G-A--A-TACGG-TGTTTTA---AATTC-----TTCG---GA--TA---TG---ACC-GGCCCAGC---GGAGTTGG--T-TTGA--AC-----G-C--A---AC--ATAG-T-GTC-----AA-T--GC-----TGTATATA-CATG---T--G---G-GCTAAGGA-TTTCGGTAT-CCGG-AA-T--TTTATCCTGCCATCTGAC-ACCGA-GAA-TTTTCCGAAGACA-TACT--G-TATG-GAA---AT--G-G-TT---A---AG----AGTCT--TG-G--TGTGCC---T----TTG------AT--AG-A--C-TGTC---CA---A-GTCTC---GCTTGCATACAGTAAGGTTGTCAA-TACAA
gi|27654                      : TCCT-TGTAGCGCTTTTT-CTGG---CC--ACCT--T--TGGTG--CGTG-ATCCGT-GTTGCAG-TCACTCGTACAGGA-CT--GTTTT---G-GAA--A-TACGGTTG-TTTC---CA-TC-----TTCG---GA--TA---TGAGAACC-GGCCCAGC---GGAGTTGA--TATTGA--GCG----G-C--A---AC--ATAG-TGGTC-----AA-TTCGC-----TCTA-----CATG---TC-GCTCG-GCTAAGGA-TTTGGGTAT-CCGG-AA-A--TTTATCATGCCATCTGAC-T-CGA-GAA-TTTTT-GAAGACA-CACT--G-TATG-GAA---AT--G-G-TT---G---AG----TTTCT--TG-G--TGTGCC---T----TTG------AT--AG-A--C-TGTC---CA---ACGTCTC---GCTT-CATACAGTAAG
gi|27652                      : TCCTCTGTAGCGCTTTTTTCTGG---CCTTACCA--TA-TGGTT--CGTG-ATCCGT-GTTTCAGTTCAC-CGTACAGGAGCT--GTTTT---G-G-A--ATTACGG-TGTTTTA---AATTC------TCG---GA--TA---TG---ACCGGGCCCAGC---GGAGTTGG--T-TTGA--AC-----G-C------AC--ATAGCT-GTC-----AATT--GCTTGTATATA-----CATG---T-GGT-----CTAAGGA-TTTCGGTATCCCGG-AATT--TTTATCCTGCCATCTGAC-ACCGG-AGA-TTTTCCGAAGACA-TACT--G-TATG-GAA---AT--G-G-TTTAAG---AG----T---T--TGAG--TGTGCC---T----TTG------AT--AG-A--C-TGTC---CAT--A-GTCTCG--GCTTGCATACAGTAAGG-TGTCAA-TACAA
gi|27655                      : TCCT-TGAAACGCTTCTT-CTGG---CC--GCCT--T--GGGAG--CGTT-TTCCTT-GCTGTAGCTCGT-CGATCGGTAGTT---TCTT---G-G-GGGA-GACGTTCATCTGG---CATGC------------GAGCTACG-TG---ACC-TGTCCTGC---GAAGCTGG------GACTGC-----ATC--A---AG--ATGG-T-GTG-----AA-T--GA-----TATG-----CAGG---TCAGCACGTGTTA-GGA-CCTCAGTGT-CTGG-GA-T--CCTGTCTTGCCATCTGAT-GCCGA-GAA-GTTTTCTGAGGCA-GGTG--G-TGTG-GAA---GT--G-G-TT---C---AG----CTTCC--TG-G--CATGAC---G----CTG------GT--AG-A--C-TGTC---CA---G-GTTCC---AC
gi|27657                      : TCCT-TG----GCTTCTT-CTGG---CC--GCCT--T--GGAAG--CGTT-TTTCTT-GCTATAGCTCGC-CGAACAGCAGTT---TCTT---GAG-G--A-GACGTTCACCTGG---CAGGCGAG--TTAG---G--------TG---ACC-TGCCCAGC---GAAGCTGG--GACTGA--AT-------C--A---AG--AACG-T-GTG-----GA-T--GC-----TAGG-----CAGG---TCAGCACA-GT------------GTGT-CTGG-GA-T--CCTGTCTTGTCACTTGAT-GCCGA-GAA-GTTTTCTAAGGCA-GGTG--G-TGTG-GAA---GT--G-G-TT---C---AG----CTTCC--TG-G--CGTGAC---G----CTG------GT--AG-A--C-TGTC---CA---G-GTTTagccgtagagcaa
gi|27656                      : TCCT-TGAAACGCTCTTC-TTGG---C---GCCT--T--GGGAG--CGTT-TTCCTT-GCTGTAGCTCGT-CGATC----GCTTAGTTTTTGGG-G-G--A-GAC-----TTCTCTGGCATGC-------CGA--GC--TACG-TG---ACC-TGTCTGGC---GAAGCTGG------GACTGC-----ATC--A---AG--ATGG-T-GTG-----AA-T--GA-----TATG-----CAGG---TACGCACGTGTTA-GGA-CCTCAGTGT-CTGG-GA-T--CCTGTCTTGCCATCTGAA-TGCGA-GAA-GTTTTCTGAGGCA-AGGTG-G-TGTG-GAA---GT--G-GTTT---C---AGC---TTTCC--TG-GCATGAGC----------TG------GTA-AG-C--C-TGTC---CA---G-GTTCC---ACtacagccgtagagcaa
gi|27659                      : TCCT-TGAAGCGCTTCCT-CTGCTCTCC--AACT--T--TG-CG--CTT---TCCTTCACTG-AGCTCGC-CATAAAGGAGTT--GTTTT---G-G-T--A-TGTAGTTGTCTGG---CA--------TGCGAGCGA--CG---TG---GCC-TGTCTATC---TCAGTTGGGCT-TT----AC-----G-C--A---TG--GTTG-T-GAT-----GA-C--GA-----TTGG-----CAAG---TTGGCCCG-CTTCAAAA-CCTCTGTGT-CAGG-GA-T--TTTGTCCTGCCAGCGGATGTGC-A-GGA-GGTTTCGAAGGCA--ACT--GAGATG-GAA---AT--G-A-TT---G---AGAACTTTTC---------CATGCCG--T----CTGT-----AT--GG------TGCC---CA---G-GTCTCTGAGC---CATAGAGAAGGGTGGT
gi|27660                      :  CTT-TGAATCGTTTCTT-CTGT---CC--CCCCGAC--TGTT---CGTT-TTCCCT-GACTAAGCTCGT-CATACAACAGTT--GCTTT---G-G-T--A-GCCGACTGTCAGG---CAT-C-----TT-GAC-GA--TG---TG---TCC-CGCCCATC--------TGG--C-CTGT--GCTTTCTG-T--A---AG--AGCG-T-GTA-----AA-A--GC-----TGGG-----TATG---CCAGCTCG-CTCAAGGA-TCTCCGTGT-ATGG-AA-T--TTTGTTCTTCCACTTGAT-GCATA-AAA-GTCTGTGGAGGCA--ACTC-A-TGTA-AAA---AT--G-G-TC---G---AG----TTGTC--TG-G--CGTGTC---TGCTGTAG------ATACAG-A--C-TGTC---CA---G-GTTTC---GCTAGCGTAGAGGAGAGTGGTCAG-TA
gi|27661                      :  CCT-TAAAGCGCTCCCT-CTGCAATCC--AACT--T--TG-CA--CTTG---CCTTCACTG-AATTCAC-CATA---GAGCT--GTTTT---T-A-T--A-TGCGACTGCCTTG---CATAC-----GGGA---GA--CG---TG---GCC-TGTCCATC---TTAGTTGA--G-TT-----CT----A-C--A---A---ATAG-T-GGT-----GA-T--G-------GTACTTGGCAAG---TTGGCCCA-CTTTAGGA-CCTCCGTGT-CGGA-GA-T--TTTGTCCTGCCAGCGGAT-ATGAA-GGA-GACTCAGAAGGCA-T-CT--GAGATG-GAA---TT--G-A-TT---GAACAG----TTTTTCATG-G--TGT
gi|27662                      :     -TGAAACGCTTTTT--TGG---CC--GCCT--T----GTGAACGTTTCTCCTT-GCTGTAGCTCGC-CGAACAGCAGTT---TTTT---G-G-G--A-GACGTTTATCTGG---CATGC------------GAGCTAACGTG---ACC-TGCCCAGC---GAAGCTG-------GA--AC-----T-C--ATCAAG--ATGG-T-GTG-----AA-T--GC-----TG--------AGG---TCAGCACGTGTTAGACA-TCTCAGT-T-CTGG-AA-TCCTGTGTCTTGCCACTTGAT-GCCGA-GAA-GTTTTCTGAG-CA-GGTG--G-T-TG-GAA---GT--G-G-TT---C---AG----CTTCC--TG-G--CG-GAC---G----CTG-------T--AG-A--C-TGTC---CA---
gi|27663                      :     -TGAAACGCTTCTT-CTGG---CC--GCCT--C--TGGAG--CGTT-TTTCTT-GCTGTAGCTCGC-CGAACAGCAGTT--TCTTG---G-G-G--A-GATGTTCATCTGG---CATGC------------GAGCTA---CGTA-ACC-TGCCCAGC---GAAGCTGG------GACTGC-----ATC--A---AG--ATGG-T-GTG-----AA-T--GC-----TAGG-----CAGG---TCAGCACATGTTA--TA-CCTCAGTGT-CTGG-GA-T--CCTGTCTTGCCA
gi|27664                      :                      GG---CG--GCCT--TGCTGACG--TGTG---CCAA-GTTCTAACTGAC-CGTACAAGAGAT--TCTTT---G-G-T--A-GGCGACCTTTCTC---CATGC-----GTCG---TA--CA---TA---TCC-AGGCCACCGTAGGCGTCG-----TTG---GC-----G-CTGA---GC--AT---T-GCA-----AA-G--AC-----TGT--------TG---TTG--T---GCTGAGAA-TATCGGAGT-TTGGTAA-C--CTTGTTCTTCCAGGTGAG-GCCCA-AGA-TCCTTTGCAGACACCAC---A-TGTG-AAACACATTAA-G-CC---T---AG----TCTCT--T--C--TCTACC---C----CCG------GT--AGCA--TATGTCGTACA---T-GTTTC---GCTTCCATATAG
gi|27665                      :                                   --T--TGACG--TGTG---CCAA-GTTCTAACTGAC-CGTACAACAGAT--TCTTT---G-G-T--A-GGCGACCTTTCTC---CATTC-----GTCG---TA--CA---TG---TCC-AAGCCAACGTAGGCGTCG-----TTG---GC-----T-G--A---GC--AT---T-GTA-----AA-G--AC-----GGTG-----TATGATTTTGTCTT--GCTGAAAA-TATCGGAGT-TGGT-AA-C--CTTGTCCTTCCAGGTGAG-GCCCA-AGA-TCCTTCGCAG--A-CACC--G-CATGTGAA---AC--ACA-TT---A---AG-------CC--TA-G--TAT------C----TTGTCCAGCAT--AT-G--T-CGTC---CA---T-GTTTC---GCTTCCATACAGCAGAGT
gi|27666                      :                                                                AATTCAC-CGTACAACAG-----TTTT---G-G--------CGGCCG----A---CAGTCAGAGATCCG---GA--CAAA-TG---CTC-AGCCCATC--------TCA--C-TTA----C-----G-C--T---ATCTGTAG-T-ATTGAGAAAA-T--AC-----TGGG-----CATT---CCGACATG-GTTAAGGA-TCTCCGTAT-CAGG-GA-T--TTTATCCTGCCATTTAAT-GCTAATGAG---TCTCGAGGACA--GCTAAG--ATG-GAA---GT--A-G-TT---G---AG----CT--------A--TGTGACATAT----CTG------CT--AG-AGCC-TGTC---CATTCATGCTTC---TCTTGTATATAG-AAGGATGGTAATTACA
gi|27667                      :                                                                 GTTGAC-CGTACAGGAGCT--GTTTT---G-G-A--A-TACAGTTGTTTTC---CATTC-----TTCG---GA------------------------------GTTGG--T-TTGA--GC-----G-C--A---AC--ATAG-T-GCC-----AA-T--GC-----TGTG-----CATG---TCGGCTTG-GCTAAAGA-TTTCGGTAT-CTGG-AA-T--TTTGCCCTGTCATCTGAC-TCCGA-GAA-TTGTCCGAAGACA-CACT--G-TATG-GAA---AT--G-G-TT---G---AG----TTTCT--TG-G--TGTGCC---T----ATG------AT--AG-A--C-TGTC---CA---A-GTCTC---GCTTGCATACAGTAAGGTTGTCAA-TACAA
gi|27668                      :                                                                                                                                              ---TG---ACC-TGCCCAGC---GAAGCTGG------GACTGC-----ATC--A---AG--ATGG-T-GTG-----AA-T--GC-----TAGG-----CAGG---TCAGCACGTGTT-AGGA-CCTCAGTGT-CTGG-AA-T--CCTGTCTTGCCACTTGAT-GCCGA-GAA-GTTTTCTGAGGCA-GGTG--G-TGTG-GAA---GT--G-G-TT---C---AG----CTTCC--TG-G--CGTGAC---G----CTG------GT--AA-A--C-TGTC---CA---G-GTTTC---AC
gi|27669                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGTCTTGCCACTTGAT-GCCGA-GAAGTTTTTTGAGG-CA-GGTG--G-TGTG-GAA---AT--G-G-TT---C---AG----TTTCC--TG-G--CGTGAC---A----CTG------GT--AG-A--C-TGTC---CA---G-GTTTC---ACAGCCGTAGAGCAATGCTGTGAG-AACAAagccgtagagcaa
gi|27670                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CGG-AAA-GTCTCGGGAGGCA--ACTC-A-TGTG-AAA---GT--G-G-TT---G---AG----TTGTT--TA-G--CGTGTC---TG---CTG-------T--AG-A--C-TGTC---CA---G-GTTTC---GCTATCGTAGAG-GAGAGCGTCAG-TAC

Unaligned ( gi|27658 ): TCCTTGAAGCGCTTCCTCTGCCCTCCAACTTTGCGCTTTTCTTCACTGAACTCGCCATAAAGGAGTTGTTTAGGTATGCGGCTGTCTGACATGCGAGCGACGTGGCCTGTCCATCTCATTTGGGTCTTACGCATGGCTGTGATGACGCTTGGCAAGTTGGCCCGCTTCAGAACCTCTGTGTCAGGGATTTTGTCCTGCCAGCGGATGAGCATGAGATTTCGAAGGCATCTAAGATGGAAGTGATTGAGCACTTTTTCATGCCGTCTGTATGGTGTCCAGGTCTCCGAGCCATAGAGAAGGGTGGT

lowQualScore                  :                                                          111                                                                  33333333333333333333333                                    333333333333333333333                                                    1                                                                          111111                            11111                                                             111  111                         
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lowQualScore                  :            .  .          .    ...  ...  ..  ..   .. ..   ...   . . .   .       .       .  . ...    ... . ... ..   . .    ..   .......................  ......  . .    . ............   . ..................... ..  .  . .  . . ..  .. ...  .......  . ...   .  .  .  . ..      . .     ..  .   ..   .         .    .... .      .     .       ...... .  .     ...  ..  .  ....  .....      . . ...    .....   ........ .  . .. .    ....  ...     ...  ...    .  .    .      .     
lowQualScore                  :            1  8          9    777  111  33  99   33 44   888   0 0 5   9       2       1  8 999    999 2 111 44   4 3    99   11111111111111111111111  666666  7 1    1 000000000000   1 777777777777777777777 99  5  9 2  1 0 99  00 777  6666666  0 777   1  1  5  1 11      1 1     33  1   99   0         3    7777 0      5     0       999999 0  0     555  88  0  9999  22222      0 0 555    00000   00000000 1  1 99 1    2222  888     000  444    6  6    5      4     
consensus                     :        TCCT-TGAAGCGCTTCTT-CTGG---CC--GCC--TT--TGGC-G--CGTGT-TCCNT-G-CTGTAGCTCGC-CGTACAGGAGCT--GTTTT---G-GN--AG-ACGGTCGTCTNGCATGC---TT--CG---GA--TA---TG--A---CCNG-CCCAGC---GNA------GTT-G-G--T-TTGA--GC-----G-C--AANATGG-TG-TNA--AT--G---CTGTG----CANG---TCG-GCNCG-GT-TAAGGATCT-CGGTGTCC-GG-GAT--TTT-GTCCTGCCATCTGAC--GC-CGAGAAGTTTTC-GAAGGCA-CGCT-G-TG-TGGAA---GT--GG-TT---GAG-----TTTCCT-G-G---CGTGCC-T-CTG-----G--T-AG-A--C-TGTC----CA-G-GTCTC---GCTTCCGTANAGCAAGGTTGTCAA-TACAA
Reference ( family-818 )      :        TCCT-TGAAGCGCTTCTT-CTGG---CC--GCC--TT--TGGC-G--CGTGN-TCCNT-G-CTGTAGCTCGC-CGTACAGGAGCT--GTTTT---G-GN--AG-ACGGTCGTCTTGCATNC---TT--CG---GA--TA---TG--A---CCNG-CCCAGC---GGA------GTT-G-G--T-TTGA--GC-----G-C--AANATGG-TG-TNA--AT--G---CTGTG----CANG---TCG-GCNCG-GT-TAAGGATCT-CGGTGTCC-GG-AAT--TTT-GTCCTGCCATCTGAC--GC-CGAGAAGTTTTC-GAAGGCA-CGCT-G-TG-TGGAA---AT--GG-TT---GAG-----TTTCCT-G-G---CGTGCC-T-CTG-----G--T-AG-A--C-TGTC----CA-G-GTTTC---GCTTNCATACAGTAAGGTTGTCAA-TACAA
gi|27650                      :        TCCT-TGTAGCGCTTTTT-CTGG---CC--ACC--TT--TGGT-G--CGTGA-TCCGT-G-TTGCAGTTCAC-CGTACAGGAGCT--GTTTT---G-GA--AT-ACGGCTGTTTTCCATTC---TT--CG---GA--TA---TG--A---CCGG-CCCAGC---GGA------GTT-G-A--T-TTGA--GC-----G-C--AACATAG-TG-TCA--AT--G---CTGTA----CATG---TCG-GCTCG-GC-TAAGGATTT-CGGTATCC-GG-AAT--TTT-ATCCTGCCATCTGAC--TC-CGAGAATTTTTC-GAAGACA-CACT-G-TA-TGGAA---AT--GG-TT---GAG-----TTTCTT-G-G---TGTGCC-T-TTG-----A--T-AG-A--C-TGTC----CA-A-GTCTC---GCTTGCATACAGTAAGGTTGTCAA-TACAA
gi|27651                      :        TCCT-TGTAGCGCTTTTT-CTGG---CC--ACC--AT--TGGT-T--CGTGA-TCCGT-G-TTTCAGTTCAC-CGTACAGGAGCT--GTTTT---G-GA--AT-ACGGT-GTTTTAAATTC---TT--CG---GA--TA---TG--A---CCGG-CCCAGC---GGA------GTT-G-G--T-TTGA--AC-----G-C--AACATAG-TG-TCA--AT--G---CTGTATATACATG---TGG-GC-------TAAGGATTT-CGGTATCC-GG-AAT--TTT-ATCCTGCCATCTGAC--AC-CGAGAATTTTCC-GAAGACA-TACT-G-TA-TGGAA---AT--GG-TT---AAG-----AGTCTT-G-G---TGTGCC-T-TTG-----A--T-AG-A--C-TGTC----CA-A-GTCTC---GCTTGCATACAGTAAGGTTGTCAA-TACAA
gi|27652                      :        TCCTCTGTAGCGCTTTTTTCTGG---CCTTACC--ATA-TGGT-T--CGTGA-TCCGT-G-TTTCAGTTCAC-CGTACAGGAGCT--GTTTT---G-GA--ATTACGGT-GTTTTAAATTC---T---CG---GA--TA---TG--A---CCGGGCCCAGC---GGA------GTT-G-G--T-TTGA--AC-----G-C--A-CATAGCTG-TCA--ATT-G---CT-TG----TATA---TAC-ATGTG-GTCTAAGGATTT-CGGTATCCCGG-AAT--TTTTATCCTGCCATCTGAC--AC-CGGAGATTTTCC-GAAGACA-TACT-G-TA-TGGAA---AT--GG-TTTAAGAG-----TT---T-GAG---TGTGCC-T-TTG-----A--T-AG-A--C-TGTC----CATA-GTCTCG--GCTTGCATACAGTAAGG-TGTCAA-TACAA
gi|27653                      :                AGCGCTTTTT-CTGG---CC--ACC--TT--TGGT-G--CGTGA-TCCGT-G-TTGCAGTTCAC-CATACAGGAGCT--GTTTT---T-GA--AT-ACGGTGGTTTTCCATTC---TT--CG---GA--TA---TG--A---CCGG-CCCAGC---GGA------GTT-G-A--T-TTGA--GC-----G-C--AACA--G-TG-TCA--AT--G---CTGTA----CATG---TCG-GCTCG-GC-TAAGGATTTTCGGTATCC-GG-AAT--TTT-ATCCTGCCATCTGAC--TC-CGAGAATATTTT-GAAGACA-CACT-GATA--AGAA---AT--GG-TT---GAG-----TTTTCTTG-G---TGTGCC-T-TTG-----A--T-AG-A--C-TGTC----CA-A-GTCTC---GCTTCCATACAGTAAGGTTGTCAA-TACAA
gi|27654                      : tcctgttTCCT-TGTAGCGCTTTTT-CTGG---CC--ACC--TT--TGGT-G--CGTGA-TCCGT-G-TTGCAG-TCACTCGTACAGGA-CT--GTTTT---G-GA--AATACGGTTGT-TTCCAT-C---TT--CG---GA--TA---TG--AGAACCGG-CCCAGC---GGA------GTT-G-A--TATTGA--GC-----GGC--AACATAG-TGGTCA--ATTCG---CTCTA----CATG---TCG--CTCG-GC-TAAGGATTT-GGGTATCC-GG-AAA--TTT-ATCATGCCATCTGAC---T-CGAGAA-TTTTT-GAAGACA-CACT-G-TA-TGGAA---AT--GG-TT---GAG-----TTTCTT-G-G---TGTGCC-T-TTG-----A--T-AG-A--C-TGTC----CA-ACGTCTC---GCTT-CATACAGTAAG
gi|27655                      :        TCCT-TGAAACGCTTCTT-CTGG---CC--GCC--TT--GGGA-G--CGTTT-TCCTT-G-CTGTAGCTCGT-CGATCGGTAGTT---TCTT---G-GGGGAG-ACGTTCATCTGGCATGC------------GAGCTACG-TG--A---CCTG-TCCTGC---GAA------GCT-G-G------GACTGC-----ATC--AAGATGG-TG-TGA--AT--G---ATATG----CAGG---TCA-GCACGTGT-TA-GGACCT-CAGTGTCT-GG-GAT--CCT-GTCTTGCCATCTGAT--GC-CGAGAAGTTTTC-TGAGGCA-GGTG-G-TG-TGGAA---GT--GG-TT---CAG-----CTTCCT-G-G---CATGAC-G-CTG-----G--T-AG-A--C-TGTC----CA-G-GTTCC---ACAGCCGTAGAGCAA
gi|27656                      :        TCCT-TGAAACGCT-CTT-CTTG---GC--GCC--TT--GGGA-G--CGTTT-TCCTT-G-CTGTAGCTCGT-CGATC----GCTTAGTTTTTGGG-GG--AG-AC--TTCTCTGGCATGC-------CGA--GC--TACG-TG--A---CCTG-TCTGGC---GAA------GCT-G-G------GACTGC-----ATC--AAGATGG-TG-TGA--AT--G---ATATG----CAGG---TAC-GCACGTGT-T-AGGACCT-CAGTGTCT-GG-GAT--CCT-GTCTTGCCATCTGAA--TG-CGAGAAGTTTTC-TGAGGCA-AGGTGG-TG-TGGAA---GT--GGTTT---CAGC----TTTCCT-G-G---CATG-A-G-CTG-----G--TAAG-C--C-TGTC----CA-G-GTTCC---AC
gi|27657                      :        TCCT-TG----GCTTCTT-CTGG---CC--GCC--TT--GGAA-G--CGTTT-TTCTT-G-CTATAGCTCGC-CGAACAGCAGTT---TCTT---GAGG--AG-ACGTTCACCTGGCAGGCGAGTT--AG---G--------TG--A---CCTG-CCCAGC---GAA------GCT-G-G--GACTGA--AT-------C--AAGAACG-TG-TGG--AT--G---CTAGG----CAGG---TCA-GCACA-GT-------------GTGTCT-GG-GAT--CCT-GTCTTGTCACTTGAT--GC-CGAGAAGTTTTC-TAAGGCA-GGTG-G-TG-TGGAA---GT--GG-TT---CAG-----CTTCCT-G-G---CGTGAC-G-CTG-----G--T-AG-A--C-TGTC----CA-G-GTTTT---ACAGCCGTAGAGCAA
gi|27658                      :        TCCT-TGAAGCGCTTCCT-CTGC---CC--TCCAACT--TTGC-G--C-TTT-TCTTC-A-CTG-AACTCGC-CATAAAGGAGTT--GTTTA---G-GT--AT-GCGGCTGTCTGACATG--------CGAGCGA--CG---TG--G---CCTG-TCCATC---TCA------TTTGG-G--T-CTTA---C-----G-C-----ATGGCTG-TGATGAC--G---CTTGG----CAAG---TTG-GCCCG-CT-TCAGAACCT-CTGTGTCA-GG-GAT--TTT-GTCCTGCCAGCGGATGAGCATGAGA---TTTC-GAAGGCA-T-CT-A-AGATGGAA---GT--GA-TT---GAGCA---CTTTTT-------CATGCCGT-CT------G--T-AT-G--G-TGTC----CA-G-GTCTCCGAGC---CATAGAGAAGGGTGGT
gi|27659                      :        TCCT-TGAAGCGCTTCCT-CTGC---TC--TCCAACT--TTGC-G--CTT---TCCTTCA-CTG-AGCTCGC-CATAAAGGAGTT--GTTTT---G-GT--AT-GTAGTTGTCTGGCATG--------CGAGCGA--CG---TG--G---CCTG-TCTATC---TCA------GTT-G-GGCT-TT----AC-----G-C--ATGGTTG-TG-ATG--AC--G---ATTGG----CAAG---TTG-GCCCG-CT-TCAAAACCT-CTGTGTCA-GG-GAT--TTT-GTCCTGCCAGCGGAT--GT-GCAGGAGGTTTC-GAAGGCA--ACT-G-AGATGGAA---AT--GA-TT---GAGAAC--TTTTC--------CATGCCGT-CT------G--T-AT-G--G-TGCC----CA-G-GTCTCTGAGC---CATAGAGAAGGGTGGT
gi|27660                      :         CTT-TGAATCGTTTCTT-CTGT---CC--CCC--C----GACTGTTCGTTT-TCCCT-GACTA-AGCTCGT-CATACAACAGTT--GCTTT---G-GT--AG-CCGACTGTCAGGCAT-C---TTGACG----A--TG---TG--T---CCCG-CCCATC--------------T-G-G--C-CTGT--GCTTTCTG-T--AAGAGCG-TG-TAA--AA--G---CTGGG----TATG---CCA-GCTCG-CT-CAAGGATCT-CCGTGTAT-GG-AAT--TTT-GTTCTTCCACTTGAT--GC-ATAAAAGTCTGT-GGAGGCA--ACTCA-TG-TAAAA---AT--GG-TC---GAG-----TTGTCT-G-G---CGTGTC-TGCTGTAGATA--C-AG-A--C-TGTC----CA-G-GTTTC---GCTAGCGTAGAGGAGAGTGGTCAG-TA
gi|27661                      :         CCT-TAAAGCGCTCCCT-CTGCAATCC--AAC--TT--TG-C-A--CTTG---CCTTCA-CTG-AATTCAC-CATA---GAGCT--GTTTT---T-AT--AT-GCGACTGCCTTGCATAC---GG--GA---GA--CG---TG--G---CCTG-TCCATC---TTA------GTT-GAG--T-TCTA-----------C--AA-ATAG-TG-GTG--AT--GGTACTTGG----CAAG---TTG-GCCCA-CT-TTAGGACCT-CCGTGTCG-GA-GAT--TTT-GTCCTGCCAGCGGAT--AT-GAAGGAGACTCA-GAAGGCA-T-CT-G-AGATGGAA---TT--GA-TT---GAACAGTTTTTCAT-G-G---TGT
gi|27662                      :            -TGAAACGCTTTTT--TGG---CC--GCC--TT--GTGA-A--CGTTTCTCCTT-G-CTGTAGCTCGC-CGAACAGCAGTT---TTTT---G-GG--AG-ACGTTTATCTGGCATGC------------GAGCTAACGTG--A---CCTG-CCCAGC---GAA------GCT-G--------GA--ACTCA--T-C--AAGATGG-TG-TGA--AT--G---CTG-------AGG---TCA-GCACGTGT-TAGACATCT-CAGT-TCT-GG-AATCCTGT-GTCTTGCCACTTGAT--GC-CGAGAAGTTTTCTGA--GCA-GGTG-G-T--TGGAA---GT--GG-TT---CAG-----CTTCCT-G-G---CG-GAC-G-CT------G--T-AG-A--C-TGTC----CA-
gi|27663                      :            -TGAAACGCTTCTT-CTGG---CC--GCC--TC--TGGA-G--CGTTT-TTCTT-G-CTGTAGCTCGC-CGAACAGCAGTT--TCTTG---G-GG--AG-ATGTTCATCTGGCATGC------------GAGCTA---CGTAA---CCTG-CCCAGC---GAA------GCT-G-G------GACTGC-----ATC--AAGATGG-TG-TGA--AT--G---CTAGG----CAGG---TCA-GCACATGT-TA--TACCT-CAGTGTCT-GG-GAT--CCT-GTCTTGCCA
gi|27664                      :                             GG---CG--GCC--TTGCTGAC-G--TGTG---CCAA-G-TTCTAACTGAC-CGTACAAGAGAT--TCTTT---G-GT--AG-GCGACCTTTCTCCATGC---GT--CG---TA--CA---TA--T---CCAG-GCCACCGTAGGC------GTC-G------TTG---GC-----G-CTGAGCAT---TG-CAA--AG--A---CTGT-------TG---TTGTGC-------TGAGAATAT-CGGAGTTT-GGTAAC--CTT-GTTCTTCCAGGTGAG--GC-CCAAGATCCTTT-GCAGACA-CCAC-A-TG-TGAAACACATTAAG-CC---TAG-----TCTCTT-C-T---C-TACC-C-CCG-----G--T-AGCA--TATGTCGTA-CA-T-GTTTC---GCTTCCATATAG
gi|27665                      :                                            T--TGAC-G--TGTG---CCAA-G-TTCTAACTGAC-CGTACAACAGAT--TCTTT---G-GT--AG-GCGACCTTTCTCCATTC---GT--CG---TA--CA---TG--T---CCAA-GCCAAC---GTAGGCGTCGTT-G-G----CTGA--GC-------------AT---TG-TAA--AG--A---CGGTG----TATGATTTTG-TCTT--GC-TGAAAATAT-CGGAGTTG-GT-AAC--CTT-GTCCTTCCAGGTGAG--GC-CCAAGATCCTTC-GCAGACACCGC--A-TG-TGAAA---CA--CA-TT---AAG--------CCT-A-GTATCTTG---T-CCA-----GCAT-AT-G--T-CGTC----CA-T-GTTTC---GCTTCCATACAGCAGAGT
gi|27666                      :                                                                            TCAC-CGTACAACAG-----TTTT---G-GC--GG-CCGACAGTCAGAGATCC--------G---GA--CAAA-TG--C---TCAG-CCCATC---TCA------CTT-ACG--C-T--A--TCT----G-T--AGTATTG-AG-AAA--AT--A---CTGGG----CATT---CCG-ACATG-GT-TAAGGATCT-CCGTATCA-GG-GAT--TTT-ATCCTGCCATTTAAT--GC-TAATGAG-TCTC-GAGGACA--GCT-A-AGATGGAA---GT--AG-TT---GAG-----CTATGT-G-A---CATA---T-CTG-----C--T-AG-AGCC-TGTCCATTCA-T-GCTTC---TCTTGTATATAG-AAGGATGGTAATTACA
gi|27667                      :                                                                            aatC-CGTACAGGAGCT--GTTTT---G-GA--AT-ACAGTTGTTTTCCATTC---TT--CG---GA--------------------------------------GTT-G-G--T-TTGA--GC-----G-C--AACATAG-TG-CCA--AT--G---CTGTG----CATG---TCG-GCTTG-GC-TAAAGATTT-CGGTATCT-GG-AAT--TTT-GCCCTGTCATCTGAC--TC-CGAGAATTGTCC-GAAGACA-CACT-G-TA-TGGAA---AT--GG-TT---GAG-----TTTCTT-G-G---TGTGCC-T-ATG-----A--T-AG-A--C-TGTC----CA-A-GTCTC---GCTTGCATACAGTAAGGTTGTCAA-TACAA
gi|27668                      :                                                                                                                                              gttga---TG--A---CCTG-CCCAGC---GAA------GCT-G-G------GACTGC-----ATC--AAGATGG-TG-TGA--AT--G---CTAGG----CAGG---TCA-GCACGTGT-TA-GGACCT-CAGTGTCT-GG-AAT--CCT-GTCTTGCCACTTGAT--GC-CGAGAAGTTTTC-TGAGGCA-GGTG-G-TG-TGGAA---GT--GG-TT---CAG-----CTTCCT-G-G---CGTGAC-G-CTG-----G--T-AA-A--C-TGTC----CA-G-GTTTC---ACAGCCGTAGAGCAA
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Reference ( family-818 )      :        TCCT-TGAAGCGCTTCTT-CTG---G---CC--GCC--TT--TGGC-G--CGTGT-TCCNT-G-CTGTAGCTCGC-CGTACAGGAGCT--GTTTT---G-GN--AG-ACGGTCGTCTNGCATGC---TT--CG---GA--TA---TG--A---CCNG-CCCAGCGNA------GTT-G--G--T-TTGA--GC-----G-C--A---ANATGG-TG-TNA--AT--G---CTGTG----CANG---TCG-GCNCG-GT-TAAGGATCT-CGGTGTCCGG-GA--T--TTTGTCCTGCCATCTGAC--GC-CGAGAAGTTTTC-GAAGGCA-CGCT-G-TG-TGGAA---GT--GG-TT---GAG-----TTTCCT-G-G---CGTGCC-T-CTG-----G--T-AG-A--C-TGTC----CA-G-GTCTC---GCTTCCGTANAGCAAGGTTGTCAA-TACAA
gi|27650                      :        TCCT-TGTAGCGCTTTTT-CTG---G---CC--ACC--TT--TGGT-G--CGTGA-TCCGT-G-TTGCAGTTCAC-CGTACAGGAGCT--GTTTT---G-GA--AT-ACGGCTGTTTTCCATTC---TT--CG---GA--TA---TG--A---CCGG-CCCAGCGGA------GTT-G--A--T-TTGA--GC-----G-C--A---ACATAG-TG-TCA--AT--G---CTGTA----CATG---TCG-GCTCG-GC-TAAGGATTT-CGGTATCCGG-AA--T--TTTATCCTGCCATCTGAC--TC-CGAGAATTTTTC-GAAGACA-CACT-G-TA-TGGAA---AT--GG-TT---GAG-----TTTCTT-G-G---TGTGCC-T-TTG-----A--T-AG-A--C-TGTC----CA-A-GTCTC---GCTTGCATACAGTAAGGTTGTCAA-TACAA
gi|27651                      :        TCCT-TGTAGCGCTTTTT-CTG---G---CC--ACC--AT--TGGT-T--CGTGA-TCCGT-G-TTTCAGTTCAC-CGTACAGGAGCT--GTTTT---G-GA--AT-ACGGT-GTTTTAAATTC---TT--CG---GA--TA---TG--A---CCGG-CCCAGCGGA------GTT-G--G--T-TTGA--AC-----G-C--A---ACATAG-TG-TCA--AT--G---CTGTATATACATG---TGG-GC-------TAAGGATTT-CGGTATCCGG-AA--T--TTTATCCTGCCATCTGAC--AC-CGAGAATTTTCC-GAAGACA-TACT-G-TA-TGGAA---AT--GG-TT---AAG-----AGTCTT-G-G---TGTGCC-T-TTG-----A--T-AG-A--C-TGTC----CA-A-GTCTC---GCTTGCATACAGTAAGGTTGTCAA-TACAA
gi|27652                      :        TCCTCTGTAGCGCTTTTTTCTG---G---CCTTACC--ATA-TGGT-T--CGTGA-TCCGT-G-TTTCAGTTCAC-CGTACAGGAGCT--GTTTT---G-GA--ATTACGGT-GTTTTAAATTC---T---CG---GA--TA---TG--A---CCGGGCCCAGCGGA------GTT-G--G--T-TTGA--AC-----G-C--A----CATAGCTG-TCA--ATT-G---CT-TG----TATA---TAC-ATGTG-GTCTAAGGATTT-CGGTATCCCG-GAATT--TTTATCCTGCCATCTGAC--AC-CGGAGATTTTCC-GAAGACA-TACT-G-TA-TGGAA---AT--GG-TTTAAGAG-----TT---T-GAG---TGTGCC-T-TTG-----A--T-AG-A--C-TGTC----CATA-GTCTCG--GCTTGCATACAGTAAGG-TGTCAA-TACAA
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gi|27654                      : tcctgttTCCT-TGTAGCGCTTTTT-CTG---G---CC--ACC--TT--TGGT-G--CGTGA-TCCGT-G-TTGCAG-TCACTCGTACAGGA-CT--GTTTT---G-GA--AATACGGTTGTTTC-CAT-C---TT--CG---GA--TA---TG--AGAACCGG-CCCAGCGGA------GTT-G--A--TATTGA--GC-----GGC--A---ACATAG-TGGTCA--ATTCG---CTCTA----CATG---TCG--CTCG-GC-TAAGGATTT-GGGTATCCGG-AA--A--TTTATCATGCCATCTGAC---T-CGAGAA-TTTTT-GAAGACA-CACT-G-TA-TGGAA---AT--GG-TT---GAG-----TTTCTT-G-G---TGTGCC-T-TTG-----A--T-AG-A--C-TGTC----CA-ACGTCTC---GCTT-CATACAGTAAG
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gi|27661                      :         CCT-TAAAGCGCTCCCT-CTG---CAATCC--AAC--TT--TG-C-A--CTTG---CCTTCA-CTG-AATTCAC-CATA---GAGCT--GTTTT---T-AT--AT-GCGACTGCCTTGCATAC---GG--GA---GA--CG---TG--G---CCTG-TCCATCTTA------GTT-GA-G--T-TCTA-----------C--A---A-ATAG-TG-GTG--AT--GGTACTTGG----CAAG---TTG-GCCCA-CT-TTAGGACCT-CCGTGTCGGA-GA--T--TTTGTCCTGCCAGCGGAT--AT-GAAGGAGACTCA-GAAGGCA-T-CT-G-AGATGGAA---TT--GA-TT---GAACAGTTTTTCAT-G-G---TGT
gi|27662                      :            -TGAAACGCTTTTT--TG---G---CC--GCC--TT--GTGA-A--CGTTTCTCCTT-G-CTGTAGCTCGC-CGAACAGCAGTT---TTTT---G-GG--AG-ACGTTTATCTGGCATGC------------GAGCTAACGTG--A---CCTG-CCCAGCGAA------GCT-G--G-------A--AC-----T-C--ATCAAGATGG-TG-TGA--AT--G---CTG-------AGG---TCA-GCACGTGT-TAGACATCT-CAGT-TCTGG-AA--TCCTGTGTCTTGCCACTTGAT--GC-CGAGAAGTTTTCTGA--GCA-GGTG-G-T--TGGAA---GT--GG-TT---CAG-----CTTCCT-G-G---CG-GAC-G-CT------G--T-AG-A--C-TGTC----CA-
gi|27663                      :            -TGAAACGCTTCTT-CTG---G---CC--GCC--TC--TGGA-G--CGTTT-TTCTT-G-CTGTAGCTCGC-CGAACAGCAGTT--TCTTG---G-GG--AG-ATGTTCATCTGGCATGC------------GAGCTA---CGTAA---CCTG-CCCAGCGAA------GCT-G--G------GACTGC-----ATC--A---AGATGG-TG-TGA--AT--G---CTAGG----CAGG---TCA-GCACATGT-TA--TACCT-CAGTGTCTGG-GA--T--CCTGTCTTGCCA
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gi|27666                      :                                                                               TCAC-CGTACAACAG-----TTTT---G-GC--GG-CCGACAGTC-AG-A-GA---TC--CG---GA--CAAA-TG--C---TCAG-CCCATCTCA------CTT-AC-G--C-T--A--TCT----G-T--A---GTATTG-AG-AAA--AT--A---CTGGG----CATT---CCG-ACATG-GT-TAAGGATCT-CCGTATCAGG-GA--T--TTTATCCTGCCATTTAAT--GC-TAATGAGTCT-C-GAGGACA--GCT-A-AGATGGAA---GT--AG-TT---GAG-----CTATGT-G-A---CATA---T-CTG-----C--T-AG-AGCC-TGTCCATTCA-T-GCTTC---TCTTGTATATAG-AAGGATGGTAATTACA
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Reference ( family-818 )      :        TCCT-TGAAGCGCTTCTT-CTG---G---CC--GCC--TT--TGGC-G--CGTNT-TCCNT-G-CTGTAGCTCGC-CGTACAGGAGCT--GTTTT---G-GN--AG-ACGGTCGTCTNGCATGC---TT--CG---GA--TA---TG--A---CCNG-CCCAGCGNA------GTT-G--G--T-TTGA--GC-----G-C--AANATGG-TG-TNA--AT--G---CTGTG----CANG---TCG-GCNCG-GT-TAAGGATCT-CGGTGTCCGG-GA--T--TTTGTCCTGCCATCTGAC--GC-CGAGAAGTTTTC-GAAGGCA-CGCT-G-TG-TGGAA---GT--GG-TT---GAG-----TTTCCT-G-G---CGTGCC-T-CTG-----G--T-AG-A--C-TGTC----CA-G-GTCTC---GCTTCCGTANAGCAAGGTTGTCAA-TACAA
gi|27650                      :        TCCT-TGTAGCGCTTTTT-CTG---G---CC--ACC--TT--TGGT-G--CGTGA-TCCGT-G-TTGCAGTTCAC-CGTACAGGAGCT--GTTTT---G-GA--AT-ACGGCTGTTTTCCATTC---TT--CG---GA--TA---TG--A---CCGG-CCCAGCGGA------GTT-G--A--T-TTGA--GC-----G-C--AACATAG-TG-TCA--AT--G---CTGTA----CATG---TCG-GCTCG-GC-TAAGGATTT-CGGTATCCGG-AA--T--TTTATCCTGCCATCTGAC--TC-CGAGAATTTTTC-GAAGACA-CACT-G-TA-TGGAA---AT--GG-TT---GAG-----TTTCTT-G-G---TGTGCC-T-TTG-----A--T-AG-A--C-TGTC----CA-A-GTCTC---GCTTGCATACAGTAAGGTTGTCAA-TACAA
gi|27651                      :        TCCT-TGTAGCGCTTTTT-CTG---G---CC--ACC--AT--TGGT-T--CGTGA-TCCGT-G-TTTCAGTTCAC-CGTACAGGAGCT--GTTTT---G-GA--AT-ACGGT-GTTTTAAATTC---TT--CG---GA--TA---TG--A---CCGG-CCCAGCGGA------GTT-G--G--T-TTGA--AC-----G-C--AACATAG-TG-TCA--AT--G---CTGTATATACATG---TGG-GC-------TAAGGATTT-CGGTATCCGG-AA--T--TTTATCCTGCCATCTGAC--AC-CGAGAATTTTCC-GAAGACA-TACT-G-TA-TGGAA---AT--GG-TT---AAG-----AGTCTT-G-G---TGTGCC-T-TTG-----A--T-AG-A--C-TGTC----CA-A-GTCTC---GCTTGCATACAGTAAGGTTGTCAA-TACAA
gi|27652                      :        TCCTCTGTAGCGCTTTTTTCTG---G---CCTTACC--ATA-TGGT-T--CGTGA-TCCGT-G-TTTCAGTTCAC-CGTACAGGAGCT--GTTTT---G-GA--ATTACGGT-GTTTTAAATTC---T---CG---GA--TA---TG--A---CCGGGCCCAGCGGA------GTT-G--G--T-TTGA--AC-----G-C--A-CATAGCTG-TCA--ATT-G---CT-TG----TATA---TAC-ATGTG-GTCTAAGGATTT-CGGTATCCCG-GAATT--TTTATCCTGCCATCTGAC--AC-CGGAGATTTTCC-GAAGACA-TACT-G-TA-TGGAA---AT--GG-TTTAAGAG-----TT---T-GAG---TGTGCC-T-TTG-----A--T-AG-A--C-TGTC----CATA-GTCTCG--GCTTGCATACAGTAAGG-TGTCAA-TACAA
gi|27653                      :                AGCGCTTTTT-CTG---G---CC--ACC--TT--TGGT-G--CGTGA-TCCGT-G-TTGCAGTTCAC-CATACAGGAGCT--GTTTT---T-GA--AT-ACGGTGGTTTTCCATTC---TT--CG---GA--TA---TG--A---CCGG-CCCAGCGGA------GTT-G--A--T-TTGA--GC-----G-C--AACA--G-TG-TCA--AT--G---CTGTA----CATG---TCG-GCTCG-GC-TAAGGATTTTCGGTATCCGG-AA--T--TTTATCCTGCCATCTGAC--TC-CGAGAATATTTT-GAAGACA-CACT-GATA--AGAA---AT--GG-TT---GAG-----TTTTCTTG-G---TGTGCC-T-TTG-----A--T-AG-A--C-TGTC----CA-A-GTCTC---GCTTCCATACAGTAAGGTTGTCAA-TACAA
gi|27654                      : tcctgttTCCT-TGTAGCGCTTTTT-CTG---G---CC--ACC--TT--TGGT-G--CGTGA-TCCGT-G-TTGCAG-TCACTCGTACAGGA-CT--GTTTT---G-GA--AATACGGTTGTTTC-CAT-C---TT--CG---GA--TA---TG--AGAACCGG-CCCAGCGGA------GTT-G--A--TATTGA--GC-----GGC--AACATAG-TGGTCA--ATTCG---CTCTA----CATG---TCG--CTCG-GC-TAAGGATTT-GGGTATCCGG-AA--A--TTTATCATGCCATCTGAC---T-CGAGAA-TTTTT-GAAGACA-CACT-G-TA-TGGAA---AT--GG-TT---GAG-----TTTCTT-G-G---TGTGCC-T-TTG-----A--T-AG-A--C-TGTC----CA-ACGTCTC---GCTT-CATACAGTAAG
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gi|27656                      :        TCCT-TGAAACGCT-CTT-CTT---G---GC--GCC--TT--GGGA-G--CGTTT-TCCTT-G-CTGTAGCTCGT-CGATC----GCTTAGTTTTTGGG-GG--AG-AC--TTCTCTGGCATGC-------CGA--GC--TACG-TG--A---CCTG-TCTGGCGAA------GCT-G--G------GACTGC-----ATC--AAGATGG-TG-TGA--AT--G---ATATG----CAGG---TAC-GCACGTGT-T-AGGACCT-CAGTGTCTGG-GA--T--CCTGTCTTGCCATCTGAA--TG-CGAGAAGTTTTC-TGAGGCA-AGGTGG-TG-TGGAA---GT--GGTTT---CAGC----TTTCCT-G-G---CATG-A-G-CTG-----G--TAAG-C--C-TGTC----CA-G-GTTCC---AC
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gi|27658                      :        TCCT-TGAAGCGCTTCCT-CTG---C---CC--TCCAACT--TTGC-G--C-TTT-TCTTC-A-CTG-AACTCGC-CATAAAGGAGTT--GTTTA---G-GT--AT-GCGGCTGTCTGACATG--------CGAGCGA--CG---TG--G---CCTG-TCCATCTCA------TTTGG--G--T-CTTA---C-----G-C-----ATGGCTG-TGATGAC--G---CTTGG----CAAG---TTG-GCCCG-CT-TCAGAACCT-CTGTGTCAGG-GA--T--TTTGTCCTGCCAGCGGATGAGCATGAGA---TTTC-GAAGGCA-T-CT-A-AGATGGAA---GT--GA-TT---GAGCA---CTTTTT-------CATGCCGT-CT------G--T-AT-G--G-TGTC----CA-G-GTCTCCGAG---CCATAGAGAAGGGTGGT
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gi|27661                      :         CCT-TAAAGCGCTCCCT-CTG---CAATCC--AAC--TT--TG------CACTT-GCCTTCA-CTG-AATTCAC-CATA---GAGCT--GTTTT---T-AT--AT-GCGACTGCCTTGCATAC---GG--GA---GA--CG---TG--G---CCTG-TCCATCTTA------GTT-GA-G--T-TCTA-----------C--AA-ATAG-TG-GTG--AT--GGTACTTGG----CAAG---TTG-GCCCA-CT-TTAGGACCT-CCGTGTCGGA-GA--T--TTTGTCCTGCCAGCGGAT--AT-GAAGGAGACTCA-GAAGGCA-T-CT-G-AGATGGAA---TT--GA-TT---GAACAGTTTTTCAT-G-G---TGT
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gi|27663                      :            -TGAAACGCTTCTT-CTG---G---CC--GCC--TC--TGGA-G--CGTTT-TTCTT-G-CTGTAGCTCGC-CGAACAGCAGTT--TCTTG---G-GG--AG-ATGTTCATCTGGCATGC------------GAGCTA---CGTAA---CCTG-CCCAGCGAA------GCT-G--G------GACTGC-----ATC--AAGATGG-TG-TGA--AT--G---CTAGG----CAGG---TCA-GCACATGT-TA--TACCT-CAGTGTCTGG-GA--T--CCTGTCTTGCCA
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gi|27666                      :                                                                               TCAC-CGTACAACAG-----TTTT---G-GC--GG-CCGACAGTC-AG-A-GA---TC--CG---GA--CAAA-TG--C---TCAG-CCCATCTCA------CTT-AC-G--C-T--A--TCT----G-T--AGTATTG-AG-AAA--AT--A---CTGGG----CATT---CCG-ACATG-GT-TAAGGATCT-CCGTATCAGG-GA--T--TTTATCCTGCCATTTAAT--GC-TAATGAG-TCTC-GAGGACA--GCT-A-AGATGGAA---GT--AG-TT---GAG-----CTATGT-G-A---CATA---T-CTG-----C--T-AG-AGCC-TGTCCATTCA-T-GCTTC---TCTTGTATATAG-AAGGATGGTAATTACA
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Reference ( family-818 )      :        TCCT-TGAAGCGCTTCTT-CTG---G---CC--GCC--TT--TGGC-G--CGTTT-TCCNT-G-CTGTAGCTCGC-CGTACAGGAGCT--GTTTT---G-GN--AG-ACGGTCGTCTNGCATGC---TT--CG---GA--TA---TG--A---CCNG-CCCAGCGNA------GTT-G--G--T-TTGA--GC-----G-C--A---ANATGG-TG-TNA--AT--G---CTGTG----CANG---TCG-GCNCG-GT-TAAGGATCT-CGGTGTCCGG-GA--T--TTTGTCCTGCCATCTGAC--GC-CGAGAAGTTTTC-GAAGGCA-CGCT-G-TG-TGGAA---GT--GG-TT---GAG-----TTTCCT-G-G---CGTGCC-T-CTG-----G--T-AG-A--C-TGTC----CA-G-GTCTC---GCTTCCGTANAGCAAGGTTGTCAA-TACAA
gi|27650                      :        TCCT-TGTAGCGCTTTTT-CTG---G---CC--ACC--TT--TGGT-G--CGTGA-TCCGT-G-TTGCAGTTCAC-CGTACAGGAGCT--GTTTT---G-GA--AT-ACGGCTGTTTTCCATTC---TT--CG---GA--TA---TG--A---CCGG-CCCAGCGGA------GTT-G--A--T-TTGA--GC-----G-C--A---ACATAG-TG-TCA--AT--G---CTGTA----CATG---TCG-GCTCG-GC-TAAGGATTT-CGGTATCCGG-AA--T--TTTATCCTGCCATCTGAC--TC-CGAGAATTTTTC-GAAGACA-CACT-G-TA-TGGAA---AT--GG-TT---GAG-----TTTCTT-G-G---TGTGCC-T-TTG-----A--T-AG-A--C-TGTC----CA-A-GTCTC---GCTTGCATACAGTAAGGTTGTCAA-TACAA
gi|27651                      :        TCCT-TGTAGCGCTTTTT-CTG---G---CC--ACC--AT--TGGT-T--CGTGA-TCCGT-G-TTTCAGTTCAC-CGTACAGGAGCT--GTTTT---G-GA--AT-ACGGT-GTTTTAAATTC---TT--CG---GA--TA---TG--A---CCGG-CCCAGCGGA------GTT-G--G--T-TTGA--AC-----G-C--A---ACATAG-TG-TCA--AT--G---CTGTATATACATG---TGG-GC-------TAAGGATTT-CGGTATCCGG-AA--T--TTTATCCTGCCATCTGAC--AC-CGAGAATTTTCC-GAAGACA-TACT-G-TA-TGGAA---AT--GG-TT---AAG-----AGTCTT-G-G---TGTGCC-T-TTG-----A--T-AG-A--C-TGTC----CA-A-GTCTC---GCTTGCATACAGTAAGGTTGTCAA-TACAA
gi|27652                      :        TCCTCTGTAGCGCTTTTTTCTG---G---CCTTACC--ATA-TGGT-T--CGTGA-TCCGT-G-TTTCAGTTCAC-CGTACAGGAGCT--GTTTT---G-GA--ATTACGGT-GTTTTAAATTC---T---CG---GA--TA---TG--A---CCGGGCCCAGCGGA------GTT-G--G--T-TTGA--AC-----G-C--A----CATAGCTG-TCA--ATT-G---CT-TG----TATA---TAC-ATGTG-GTCTAAGGATTT-CGGTATCCCG-GAATT--TTTATCCTGCCATCTGAC--AC-CGGAGATTTTCC-GAAGACA-TACT-G-TA-TGGAA---AT--GG-TTTAAGAG-----TT---T-GAG---TGTGCC-T-TTG-----A--T-AG-A--C-TGTC----CATA-GTCTCG--GCTTGCATACAGTAAGG-TGTCAA-TACAA
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gi|27654                      : tcctgttTCCT-TGTAGCGCTTTTT-CTG---G---CC--ACC--TT--TGGT-G--CGTGA-TCCGT-G-TTGCAG-TCACTCGTACAGGA-CT--GTTTT---G-GA--AATACGGTTGTTTC-CAT-C---TT--CG---GA--TA---TG--AGAACCGG-CCCAGCGGA------GTT-G--A--TATTGA--GC-----GGC--A---ACATAG-TGGTCA--ATTCG---CTCTA----CATG---TCG--CTCG-GC-TAAGGATTT-GGGTATCCGG-AA--A--TTTATCATGCCATCTGAC---T-CGAGAA-TTTTT-GAAGACA-CACT-G-TA-TGGAA---AT--GG-TT---GAG-----TTTCTT-G-G---TGTGCC-T-TTG-----A--T-AG-A--C-TGTC----CA-ACGTCTC---GCTT-CATACAGTAAG
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gi|27663                      :            -TGAAACGCTTCTT-CTG---G---CC--GCC--TC--TGGA-G--CGTTT-TTCTT-G-CTGTAGCTCGC-CGAACAGCAGTT--TCTTG---G-GG--AG-ATGTTCATCTGGCATGC------------GAGCTA---CGTAA---CCTG-CCCAGCGAA------GCT-G--G------GACTGC-----ATC--A---AGATGG-TG-TGA--AT--G---CTAGG----CAGG---TCA-GCACATGT-TA--TACCT-CAGTGTCTGG-GA--T--CCTGTCTTGCCA
gi|27664                      :                             G---G---CG--GCC--TTGCTGAC-G--TGTG---CCAA-G-TTCTAACTGAC-CGTACAAGAGAT--TCTTT---G-GT--AG-GCGACCTTTCTCCATGC---GT--CG---TA--CA---TA--T---CCAG-GCCACCGTA------GGC-GTCG--T-T--G--GC-----G-CTGA---GCAT---TG-CAA--AG--A---CTGT-------TG---TTGTGC-------TGAGAATAT-CGGAGTTTGGTAA--C--CTTGTTCTTCCAGGTGAG--GC-CCAAGATCCTTT-GCAGACA-CCAC-A-TG-TGAAACACATTAAG-CC---TAG-----TCTCTT-C-T---C-TACC-C-CCG-----G--T-AGCA--TATGTCGTA-CA-T-GTTTC---GCTTCCATATAG
gi|27665                      :                                               T--TGAC-G--TGTG---CCAA-G-TTCTAACTGAC-CGTACAACAGAT--TCTTT---G-GT--AG-GCGACCTTTCTCCATTC---GT--CG---TA--CA---TG--T---CCAA-GCCAACGTAGGCGTCGTT-G--G----CTGA--GC----------------AT---TG-TAA--AG--A---CGGTG----TATGATTTTG-TCTT--GC-TGAAAATAT-CGGAGTTGGT-AA--C--CTTGTCCTTCCAGGTGAG--GC-CCAAGATCCTTC-GCAGACACCGC--A-TG-TGAAA---CA--CA-TT---AAG--------CCT-A-GTATCTTG---T-CCA-----GCAT-AT-G--T-CGTC----CA-T-GTTTC---GCTTCCATACAGCAGAGT
gi|27666                      :                                                                               TCAC-CGTACAACAG-----TTTT---G-GC--GG-CCGACAGTC-AG-A-GA---TC--CG---GA--CAAA-TG--C---TCAG-CCCATCTCA------CTT-AC-G--C-T--A--TCT----G-T--A---GTATTG-AG-AAA--AT--A---CTGGG----CATT---CCG-ACATG-GT-TAAGGATCT-CCGTATCAGG-GA--T--TTTATCCTGCCATTTAAT--GC-TAATGAGTCT-C-GAGGACA--GCT-A-AGATGGAA---GT--AG-TT---GAG-----CTATGT-G-A---CATA---T-CTG-----C--T-AG-AGCC-TGTCCATTCA-T-GCTTC---TCTTGTATATAG-AAGGATGGTAATTACA
gi|27667                      :                                                                               aatC-CGTACAGGAGCT--GTTTT---G-GA--AT-ACAGTTGTTTTCCATTC---TT--CG---GA-----------------------------------GTT-G--G--T-TTGA--GC-----G-C--A---ACATAG-TG-CCA--AT--G---CTGTG----CATG---TCG-GCTTG-GC-TAAAGATTT-CGGTATCTGG-AA--T--TTTGCCCTGTCATCTGAC--TC-CGAGAATTGTCC-GAAGACA-CACT-G-TA-TGGAA---AT--GG-TT---GAG-----TTTCTT-G-G---TGTGCC-T-ATG-----A--T-AG-A--C-TGTC----CA-A-GTCTC---GCTTGCATACAGTAAGGTTGTCAA-TACAA
gi|27668                      :                                                                                                                                                 gttga---TG--A---CCTG-CCCAGCGAA------GCT-G--G------GACTGC-----ATC--A---AGATGG-TG-TGA--AT--G---CTAGG----CAGG---TCA-GCACGTGT-TA-GGACCT-CAGTGTCTGG-AA--T--CCTGTCTTGCCACTTGAT--GC-CGAGAAGTTTTC-TGAGGCA-GGTG-G-TG-TGGAA---GT--GG-TT---CAG-----CTTCCT-G-G---CGTGAC-G-CTG-----G--T-AA-A--C-TGTC----CA-G-GTTTC---ACAGCCGTAGAGCAA
gi|27669                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGTCTTGCCACTTGAT--GC-CGAGAAGTTTTT-TGAGGCA-GGTG-G-TG-TGGAA---AT--GG-TT---CAG-----TTTCCT-G-G---CGTGAC-A-CTG-----G--T-AG-A--C-TGTC----CA-G-GTTTC---ACAGCCGTAGAGCAATGCTGTGAG-AACAA
gi|27670                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -CGGAAAGTCTCG-GGAGGCA--ACTCA-TG-TGAAA---GT--GG-TT---GAG-----TTGTTT-A-G---CGTGTC-TGCT------G--T-AG-A--C-TGTC----CA-G-GTTTC---GCTATCGTAGAG-GAGAGCGTCAG-TAC