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Reference ( gi|124937 )       : AGGCTG--AGCGTAGTG-----GT---GTAC-T--AG-GGC-AGTTACC-AGTGATATATGGG-GT-CCGCC-ACAGT--AC-TGGGTAG-AAACTGCTGT
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blockSeqs                     :       .          .      .      . .   .   .        .            .  .     .     .   .        
blockSeqs                     :       .          .      .      . .   .   .        .            .  .     .     .   .        
blockSeqs                     :       .          .      .      . .   .   .        .            .  .     .     .   .        
blockSeqs                     :                         .      . .   .   .        .                                        


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : AGGCTG--AGCGTAGTG-----GT---GTAC-T--AG-GGC-AGTTACCG-GTGATATCTGGG-GT-CCGCC-ACAGC--AC-TGGGTAG-AAACTGCTGT
finalCons                     : AGGCTG--AGCGTAGTG-----GT---GTAC-T--AG-GGC-AGTTACCG-GTGATATCTGGG-GT-CCGCC-ACAGC--AC-TGGGTAG-AAACTGCTGT





Alignments
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lowQualScore                  :       ..         .....  ...    . ..  .   .    .   .            .  .     .     ..  .       .          
lowQualScore                  :       55         00000  000    9 66  8   7    1   9            0  0     0     88  0       4          
consensus                     : AGGCTG--AGCGTAGTG-----GT---GTAC-T--AG-GGC-AGTTACCG-GTGATATCTGGG-GT-CCGCC-ACAGC--AC-TGGGTAG-AAACTGCTGT
Reference ( family-816 )      : AGGCTG--AGCGTAGTG-----GT---GTAC-T--AG-GGC-AGTTACCG-GTGATATCTGGG-GT-CCGCC-ACAGC--AC-TGGGTAG-AAACTGCTGT
gi|124937                     : AGGCTG--AGCGTAGTG-----GT---GTAC-T--AG-GGC-AGTTACCA-GTGATATATGGG-GT-CCGCC-ACAGT--AC-TGGGTAG-AAACTGCTGT
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gi|124943                     : AGGCTG--AGCTTAGTG-----GTT--GTAC-T--AG-GGCGAGTTACCA-GTGATATCTTGT-GTTCCGCC-ACAGT--AC-TGGGTAG-AAAaaactgt
gi|124944                     : AAGCTG--AGCGTAGTG-----AT---GTAA-T--AC-GGC-AGTTACCG-GCGATATTTGGG-GT-CCGCC-ACAGC--AC-TGGGTCG-AAACTGCCGTaaactgt
gi|124945                     : AGGCTG--AGCGTAGTG-----CT---TTAC-T--AG-GGC-AGTTTACA-GTGACATCTGGG-GT-CCGCC-ACAGT--TC-TGGGTAG-
gi|124946                     : AGGCTG--AGCGTAGTG-----AT---GTAC-----G-GCC-GGTTTCCA-GTGATATCTAGG-GT-CCGCC-ATAGC--AC-TGGGTAG-AAACTGTTGT
gi|124947                     : AGGCTG--AGCGTAGTG-----AT---GTAC-T--TG-GGC-AGTTGTCG-GTGATATATGTG-GT-CTGTC-ACAGC--AC-TGGGTAG-AAA
gi|124948                     : AGGCTG--AAGGTAGTG-----AT---GTAC-G--AG-GGC-AGCTGCCG-ATGATATCTGGG-GT-CTTCC-ACAGC--AC-TGGGTAT-AAACTGTTGT
gi|124949                     : AGACTGTAAGCATAGAG-----GT---GTAT-C--AG-GGC-AGTTGCCA-GTGACATCTGGG-GT-CCGCC-ATAGC--AT-TG
gi|124950                     : AGACTGTAAGCATAGAG-----GT---GTAT-C--AG-GGC-AGTTGCCGAGTGACATCTGGG-GT-CCGCC-ATAGC--AT-TG
gi|124951                     : AGTCTG--AGCATAGTAACACAGTAAGGTAC-T--GG-GGC-AATCACCG-GTGACATCTGGG-GT-CTGCC-ATAGC--AC-TGGGTAG-AGGCTCCTGT
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gi|124953                     : AGGCTG--AGTGTATTG-----AT---GTAC-T--AG-GG----TTGCGG-GTAACATTCGGT-GT-CCGCC-ATAGC--AC-TAGGTAG-AAGCTGCTGT
gi|124954                     : AGGCTG--AGCATTGCA-----AG---GTAC-T--GG-GGC-AGTTACTG-CTGTCATCTGGG-GC-CCGCC-ATATC--AC-GGAGTA
gi|124955                     :   GCTG--AGCGTAGTG-----GT---GTAC-TCCAGTGGC-AGTTACCA-GTGATATCTGGG-GT-CTGCG-CCAGTCGACTTGGGTCG-
gi|124956                     :     TG--AGCGTAGAG-----GT---GTAT-T--GG-GGC-AGTTGCCG-GTGACAGCTGGC-GT-CCGCC-GTAGC--AT-TTGGTAG-ATACTGCTGT
gi|124957                     :                        T---GTACAT--AGTGGC-AGTT-CCA-GTGATATCTGGG-GT-CCGCCAACA----AC-TGGGTAG-AAACTGCTG