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gi|104444                     :                       AAGACGT-A-G--TGG-----A-CCTT--TTT--CAACCTAC--TA-CT-AAAGACTTA--A-C-TA--TTAG-CAG--AA---G---TA-AGGTAGTTA---------TGT----------A------GT-----CTATTATCGG----AAATACAA----ACGT---------------A--T-C-TA--TTGCG--CGTGAAA-TGAAA---C------GTA--CA-----A--AATTAAC-GTG-ATTAA-A--CG-A-T--AATCC-T-TGTAAA-A-GTTA--AAC-T--AAT-G--GCCAATAAA-------CGG-T-AATCCCCGGTAGCAC
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lowQualScore                  :                              7 7 77   22222 5    5 6  22     00 99  2  1   1     88 0 0  88 88 0   88  555 555  0 22222222222222222222222222222222222222222222222222222 2222     1  2222     55555555555555 99 1 1  99 888 99    11 2     999 444444   11 666666 11   11  4   4     4 22    4 8      4 66     4 3    44   5 44   7777       2    5 44     7      000       
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Reference ( family-792 )      :                       AAAACGT-A-G--TGG-----A-CCTT-GGTT--CAAAC--C--TA-CT-AAA-ACCTA--G-C-TA--T--A-CGG--GA---G---TA-A-------A---------CGT----------A------GT-----C--------G----GGATA-AA----ACGTG--------------G--T-C-TA--T---A--CGTG--A-CGAAA---C------GTA--C------A--AAT--AC-GTG-ATAAA-A--CGTA-TCAAAACC-T-NGTAAA-ANGGTA--ACA-T--GAT-A--GCTAATAGAAAA-C--CGGAT-AATCCC---TAGCGCT
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gi|104437                     :                       AAAACGT-A-G--TAG-----A-CCTT-GGCT--CAAAC--C--TA-CT-AAA-ACCTA--G-C-TA--T--AACGG--GA---G---TA-A-------A---------CG-----------A------GT-----C--------G----GGATA-AA-----CGTG--------------G--T-C-TA--T---A--CGTG--A-CGAAA---C------GTA--C------A--AAT--AC-GTG-AT-AA-A--CGTATTCAAAACC-T-TGTAAA-AAGACAACACA-T--GAT-A--GCTCATAGAAAA-C--CGGAT-AATCCC---TAGCGCT
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gi|104448                     :                         AACGT-A-G--TAG-----A-CCT--GGCT--CAAAC--TCTTA-CT-AA----CTACTG-C-TA--T--ATCGG--GA---T---AA-A-------A---------TGT----------A------GT-----C--------G----G-ATA-AA----ACG----------------G--T-C-TA--T---A--CGTG--A-CGAA----C------GTA--C------A--AAT--AC-ATG-ATAAA-A--CATA-CCAAAACC-T-TGTAAA-AAGGCA--ACATT--GAT-A--GCTCATAGACAA-C--CGGATAAATCCC---TAGCGCT
gi|104449                     :                           CGT-ATG--TG------A-CCTT-G-TT--CAAAC--C--TA-CT-AAA-ACTTA--A-C-TA--T--A-CGGAGGAAAGG---TA-C-------A---------TGT----------A------GT-----CTATAC---G----GGACA-AA----ACGTAC-------------G--T-C-TA--T---A--CGTG--A-TGAAA---C------GTA--C------A--AAT--GC--T--ATAAA-A--CGTA-TAAAATCC-T-CGTAAA-ATGGTA--ACA-T--AAT----GCTAAT--AAAA-C--CGGAT-AATCCC---TAGCACT
gi|104450                     :                            GT-A-G--TG------A-CCTT-GTTT--CAA-C--C--TAGCT-AAA---TTA--A-C-TAGGT--G-CGG--GA---G---TA-A-------G---------AGTGACAATGCTCA------GT-----C--------TATACGGATA-AA----A-GTA--------------G--T-AGTA--TG--A--CGTG--A-CGAAA---C------GTA--C------ACGAAT--AC-GTG-ATAAA-A--CGT--TAAGAATC-T-AGTAAA-ATGGTA--ACA-T--AATGG--GCTAATAAAAAAGA--CGGAT-GA
gi|104451                     :                                       -----A-CCTT-GGTT--CAAAC--C--TA-CT-AAA-ACTTA--A-A-TA--T--A-CGG--GA---G---TA-AAGGTAC-A---------TGT----------A------GT-----TTCTAA---G----GGATA-AA----ACGTA--------------G--T-C-T-------------------------------------------------AT--AC-GTG-ATAAA-A--CGTA-TAAAATCC-T-AGTAAA-ATGGTA--ACA-T--AAT-G--GCTAATA-AAAA-G--CGGAT-AATCCC---TAGCACT
gi|104452                     :                                                      T--CAAAC--A--TA-C---AA-ATCTA--G-C-TAC-T--A-CGG--GA---GAAGTA-A-------A---------CGT----------A------GT-----C--------G----GGAT
gi|104453                     :                                                          AAAC--C--TT-CT-AAA-ACCTA--G-C-TA--T--A-CGG--GA---G---TA-A-------A---------CGT----------A------GTTTATAC--------G----GGATA-AA----ACGTG--------------G--T-A-TA--T---ATACGTG--A-CGAAA---C------GTA--CGTGTACA--AAT--AC-GTG-ATAAC-A--CGTA-TCAAAACC-T-AGTAAA-ACAGTA--ACA-T--GAT-AGCGCTAATA-AAAG-C--CGGAT-AATCCC---TAGCACT
gi|104454                     :                                                                                TA--A-C-TT--T--A-CGG--GA---G---TA-A-------A---------CGT----------ACATGTAGT-----CCATAC---G----GGATA-AA----ACATGAAACGTGATGAAATG--T-A-CAAAT---A--CGTG--A-TAAAA---C------GTA--T------A--AAT--AC-GTG-ATGAA-A--CCTA-TAAAATCC-T-AGTAAA-ATGGTA--ACA-T--AAT-A--GCTAATA-AAAA-C--CGGAT-AATCCC---TAGCAC
gi|104455                     :                                                                                                                                                                                    A----ACGGG--------------G--TTC-TA--T---A--CGTG--A-CGAAA---C------G-A--C------A--AAT--ACGGTGAATAAACA--CGTA-TC-AAACC-TATGTTAA-AAG


blockSeqs                     :                              T T CT   GTAAA A    T G  AC     TA CT  A  C   G     CT A A  GG TA A   AG  AAG AAG  T GGTAGTTATGTAGTCTATTATCG                               ATAC     C  CGTT     AAACGTGATGAAAT TA T G  AA TGC TA    AA G     AAC GTCCAT   AT GTGTAC CG   TA  G   A     C AC    T C      A AT     G T    AC   T TA   AGC        G    G TT     A      CGG
blockSeqs                     :                              . . .    .     .    . G  .      T  .   G  .   .     .  . .  G  .  T   .   A   .    . AGCGTACCAGTGTAGTCTATAC                                .        .  .        C              .  . .  .  G   .     .  .     .   .        .  A      .    .   .   .     . .     . C      . A      . A    .    . .    GG         G    . .      .      .  
blockSeqs                     :                              . . .    .     .    . G  .      .  .   .  .   .     .  . .  C  .  T   .   .   .    . AGGTACATGTAGTCTATAA                                   .        .  .        .              .  . .  .  .   .     .  .     .   .        .  .      .    .   .   .     . .     . C      . T      . A    .    . .    A          G    . .      .      .  
blockSeqs                     :                              . . .    .     .    . G  .      .  .   .  .   .     .  . .  .  .  .   .   .   .    . AGGTACATGTAGTTTCTAA                                   .        .  .        .              .  . .  .  .   .     .  .     .   .        .  .      .    .   .   .     . .     . C      . T      . C    .    . .    A          G    . .      .      .  
blockSeqs                     :                              . . .    .     .    . T  .      .  .   .  .   .     .  . .  .  .  .   .   .   .    . ACGTACATGTAGTCCATAC                                   .        .  .        .              .  . .  .  .   .     .  .     .   .        .  .      .    .   .   .     . .     . C      . T      . C    .    . .    A          A    . .      .      .  
blockSeqs                     :                              . . .    .     .    . G  .      .  .   .  .   .     .  . .  .  .  .   .   .   .    . AGTACATGTAGTCTATAC                                    .        .  .        .              .  . .  .  .   .     .  .     .   .        .  .      .    .   .   .     . .     . A      . A      . T    .    . .    A          G    . .      .      .  
blockSeqs                     :                              . . .    .     .    . G  .      .  .   .  .   .     .  . .  .  .  .   .   .   .    . GAGTGACAATGCTCAGTC                                    .        .  .        .              .  . .  .  .   .     .  .     .   .        .  .      .    .   .   .     . .     . C      . A      . A    .    . .    A          A    . .      .      .  
blockSeqs                     :                              . . .    .     .    . G  .      .  .   .  .   .     .  . .  .  .  .   .   .   .    . ACGTATTTTATAC                                         .        .  .        .              .  . .  .  .   .     .  .     .   .        .  .      .    .   .   .     . .     . A      . T      . T    .    . .    G          G    . .      .      .  
blockSeqs                     :                              . . .    .     .    . G  .      .  .   .  .   .     .  . .  .  .  .   .   .   .    . ATGTAGTCTATAC                                         .        .  .        .              .  . .  .  .   .     .  .     .   .        .  .      .    .   .   .     . .     . C      . A      . A    .    . .    G          A    . .      .      .  
blockSeqs                     :                              . . .    .     .    . T  .      .  .   .  .   .     .  . .  .  .  .   .   .   .    . ACGTAGTTTATAC                                         .        .  .        .              .  . .  .  .   .     .  .     .   .        .  .      .    .   .   .     . .     . A      . T      . T    .    . .    A          .    . .      .      .  
blockSeqs                     :                              . . .    .     .    . G  .      .  .   .  .   .     .  . .  .  .  .   .   .   .    . GTAGTTCATAC                                           .        .  .        .              .  . .  .  .   .     .  .     .   .        .  .      .    .   .   .     . .     . A      . C      . T    .    . .    G          .    . .      .      .  
blockSeqs                     :                              . . .    .     .    . .  .      .  .   .  .   .     .  . .  .  .  .   .   .   .    . ACGTAGTC                                              .        .  .        .              .  . .  .  .   .     .  .     .   .        .  .      .    .   .   .     . .     . A      . A      . T    .    . .    A          .    . .      .      .  
blockSeqs                     :                              . . .    .     .    . .  .      .  .   .  .   .     .  . .  .  .  .   .   .   .    . ACGTAGTA                                              .        .  .        .              .  . .  .  .   .     .  .     .   .        .  .      .    .   .   .     . .     . C      . A      . C    .    . .    G          .    . .      .      .  
blockSeqs                     :                              . . .    .     .    . .  .      .  .   .  .   .     .  . .  .  .  .   .   .   .    . ACGTAGTC                                              .        .  .        .              .  . .  .  .   .     .  .     .   .        .  .      .    .   .   .     . .     . A      . A      . T    .    . .    A          .    . .      .         
blockSeqs                     :                                       .     .    . .  .      .  .   .  .   .     .  . .  .  .  .   .   .   .    . AACGTATC                                              .        .  .        .              .  . .  .  .   .     .  .     .   .        .  .      .    .   .   .     . .     . C      . A      . A    .    . .    .          .    . .                
blockSeqs                     :                                                       .      .  .   .  .   .     .  . .  .  .  .   .   .   .    . ATGTAGTC                                              .        .  .        .              .  . .  .  .   .     .  .     .   .        .  .      .    .   .   .     . .     . .      . .      . .                                                   
blockSeqs                     :                                                              .  .   .  .   .     .  . .  .  .  .   .   .   .    . ACGTAGTC                                              .        .  .        .              .  . .  .  .   .     .  .     .   .        .  .      .    .                                                                                             
blockSeqs                     :                                                              .  .   .  .   .     .  . .  .  .  .   .   .   .    . ACGAGTC                                               .        .  .        .              .  . .  .  .   .                                                                                                                                        
blockSeqs                     :                                                                                  .  . .  .  .  .   .   .   .    . ACGT                                                  .           .                                                                                                                                                                               


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