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lowQualScore : . . . . . .. . .. . .. .. . .. .. .. .. . .. . ....... ................. .. ... .. . .. .... . . .. .
lowQualScore : 8 9 9 9 9 55 6 55 8 55 55 8 00 55 33 66 9 66 9 2222222 66666666666666666 66 333 66 9 66 9999 7 7 77 7
consensus : ACCTTCGAA-CC-TGCG-ATT-C-GAAGT--CGCA-GACA--G-A--T--CTT-GCAT-TGTCGTAC--G--ACCA--GTC-G--CAA-AT-------G---------TA----T-AC--G---T--ACC-AC--CAATCGTAC----TCG-TACG-ATC--A-TCTACCACC
Reference ( family-788 ) : ACCTTCGAA-CC-TGCG-ATT-C-GAAGT--CGCA-GACA--G-A--T--CTT-GCAT-TGTCGTAC--G--ACCA--GTC-G--CAA-AT-------G---------TA----T-AC--G---T--ACC-AC--CAATCGTAC----TCG-TACG-ATC--A-TCTACCACC
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gi|133114 : ACCTTCGAA-CC-TGCG-ATT-C-GAAGT--TGCA-GACA--G-A--T--CTT-GCAT-TGTCGTAC--G--ACCA--GTC-G--CAA-AT-------G---------TA----T-AA--G---T--ACC-AC--CAATCGTAC----TCG-TACG-ATC--A-TCTATCACC
gi|133115 : ATCTTCGAA-CC-TACA-ATT-T-GAAGT--CGCA-GACA--G-A--T--CTT-GCAT-TGTTGCAC--G--ACCA--GTC-G--CAA-AT-------G---------------T-AC--A---T--ACC-AC--TAATCGTAC----TCG-TACA-ATC--A-TCTACCACC
gi|133116 : ACCTTCGAA-CC-TG-G-ATTTC-GAAGTATTGCA-GACA--GTA--T--CTT-GCAT-TGTCGTAC--G--ACCA--GTC-G--CAA-AT-------G---------TA----T-AA--G---T--ACC-AC--CAATCGTAC----TCGATTCG-A-C--A-TCTATCACC
gi|133117 : ACCTTCGAAACC-TGCG-ATT-C-GAACT--TGCA-GACA--G-A--T--CTTGGCAT---TCGTAC--G--ACCA--GTCGG--CAA-TT-------G---------TA----T-AA--G---T--ACC-AC--CAATCGT-C----TCG-TACGAATC--A-TCTATCACC
gi|133118 : ACTTTCGAA-CT-TGCG-ATT-C-GAAGT--CGCA-GACA--G-G--T--TTT-GCAT-GGTCGTGC--T--ATCA--GTC-G--TAA-AT-------G---------TA----C-AC--G---T--ACC-AC--CAATAATAC----T
gi|133119 : ACCTTCGAA-CC-TGCC-ATT-C--AAGT--TGCA-GACC--G-A--T--CTT-GCATCTGTCTTACCGG--ACCA--GGT-GCCCAA-AT-------GA--------TA----T-AA--G---TTCACC-ACAGCAATCGTAC----TCG-TAC--ATC--A-TCTATCACC
gi|133120 : ACCTT-GAA-CC--GCGTATT-CCGAAGT--TA-A-GGCAACG-A--TTGCTT-GCAT-TGTCGTAC-----ACCA--TTC-G--CAATAT-------A---------TA----TCAT--GTACT--ACC-GC--CAATCGTAC-----CG--ACG-ATC--A-TCTACCAC
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gi|133122 : CTTCGAA-CA-TGCA-ATT-C-GAAAT--CCGA-GACA--G-A--T--CTT-GTAT-TGTCGTAC--G--ACCA--GTC-G--CAA-AT-------G---------------T-AC--G---T--ATCAAC--CAATCGTAC----TCG-TACG-ATC--A-TCT
gi|133123 : CTTCGAA-CC-TGCG-ATT-C-GAAGT--C--A-GACA--G-A--T--TTT-GCAT-TGTCGTAC--G--AC
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gi|133125 : CTTTGAA-C---GCG-ATT-C-GAAGT--CGCAGGACA--A-A-----CTT-ACAT-TGTCGTGC--GA-ACCA--GTC-G--CAA-ATTCTAATAG---------TA----C-AC--G---C--A-------CAATCGTAC----TCC-TACG-CAC--ATTCTATCAC
gi|133126 : CTTCGAA-CC-TGTG-ATT-C-AAAGT--TGGA-GACA--G-G--T--CCT-GAAT-GGTTGTAC--ACCACCA--GTA-G--CGA-AT-------GTACGTACATTA----T-AT--G---T--ATC-AT--CAATCTTACTGGATCG-TGCG--TC--A-
gi|133127 : CTTTGAA-CC-TGC--ATT-----------GCA-GACA--G-G--T--CTT-GCTT-GGTCGTAC--C--ACCA--ATC-A--CAC-AT-------G---------------G-AC--G---C--ACC-AT--TAATCATGC----
gi|133128 : CTTCGAAACC-TGCG-ATT-C--AAGT--TGCCTGAGA--G-A--T--CTT-GCAT-GGTAAT-C--G--ACCACTTTC-G--CAA-AT-------A-----------------AC--G------ACC-A---CAAT
gi|133129 : TTCAAA-CC-TTCG-ATT-C-GAAGT--CGCA-GACT--G-A--T--CTT-GCAT-GGTCGAGG--G--ACCA--GTC-G--AGA-AT-------G---------------T-AC--G---T--TCC-AC--CAATCGTAC----TCG-TACG-ATC--A-TTTACTATC
gi|133130 : TTCGAA-CC-TGCG-ATT-C-GAAAT--CGCA-GACA--G-G--G--CTT-GCAT-AGTCGTGC--G--ACTA--GTC-G--CGA-AT-------G---------------T-AC--G---T--ACC-AC--TAATCGTACTGGATCG-TGCG--TCAAA-TTTACC
gi|133131 : TCGAA-CC-TGCG-ATT-C-GAAGT--CGCA-GACA--G-A--T--CTT-GCAT-TGTCGTAC--G--ACCA--GTC-G--CAA-AT-------G---------TA----T-AC--G---T--ACC-AC--AAATCGTAC----TCA-TACG-ATC--A-TCTATCGCC
gi|133132 : TCAAA-CC-TTCG-ATT-C-GAAGT--CGCA-GACA--G-A--T--CTT-GCAT-TGTCGTAC--G--ACCA--GTC-G--CAA-AT-------G---------TACC--T-ACCGG---T--ACA-AC--CAATCGTAC----TCG-TACG-ATC--A-TCTACCACC
gi|133133 : AA-CCATGCG-ATT-C-GAAGT--CGCA-GACA--C-G--T--CTT-GCAT-GGTCGTAC--G--ACCA--GTT-A--CAA-AA-------G---------------T-AC--G---T--ACA-AG--CAATCGTTC----T
gi|133134 : GT--CACA-GACA--G-A--T--CTT-GCAT-TGTCGTAC--G--AC-A--GTC-G--CAA-AT-------G---------TA-------C--G---T--AAC-AC--TAATCGTAC----TCG-TACG-ATC--A-TCTACC