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gi|8330                       :             -TG-A--TTA--T---GTCAAAAAA---AC-CAT-TTTTC---TT--GCTTTC-GCT-CGG-T--CC---ACGGT--CAC---ATCC-GTATATT--AT-AATA
gi|8331                       :                                          C-CAC-TT--C---AA--TTTT-C-TCT-CGG-T--CT--AACGGT--CAC---A-CC-GTATA-TGCAT-ATTA


blockSeqs                     :     AT CT T C  C GT   AA AAA  CAA   ACGC  G   A  TT CCAG AT    T G   G   A TC  AA      CA   GTA T  T   T T GC  A
blockSeqs                     :     .  .  . .  . .    .  GG   .     A     .   .  G  T    G     . .   .   T .   .       .    .   .  .   T . A   .
blockSeqs                     :     .  .  . .  . .    .  G    .     G     .   .  .  T    .     . .   .   . .   .       .    .   .  .   T . .   .
blockSeqs                     :     .  .  . .  . .    .  T    .     G     .   .  .  T    .     . .   .   . .   .       .    .   .  .   T . .   .
blockSeqs                     :     .  .  . .  . .    .  T    .     G     .   .  .  T    .     . .   .   . .   .       .    .   .  .   A . .   .
blockSeqs                     :     .  .  . .  . .    .  .    .     G     .   .  .  G    .     . .   .   . .   .       .    .   .  .   T . .   .
blockSeqs                     :     .  .  . .  . .    .  .    .     G     .   .  .  A    .     . .   .   . .   .       .    .   .  .   A . .   .
blockSeqs                     :     .  .  . .  . .    .  .    .     A     .   .  .  A    .     . .   .   . .   .       .    .   .  .   T . .   .
blockSeqs                     :     .  .  . .  . .    .  .    .     G     .   .  .  A    .     . .   .   . .   .       .    .   .  .   T . .   .
blockSeqs                     :     .  .  . .  . .    .  .    .     A     .   .  .  T    .     . .   .   . .   .       .    .   .  .   T . .   .
blockSeqs                     :     .  .  . .  . .    .  .    .     C     .   .  .  G    .     . .   .   . .   .       .    .   .  .   T . .   .
blockSeqs                     :     .  .  . .  . .    .  .    .     A     .   .  .  A    .     . .   .   . .   .       .    .   .  .   T . .   .
blockSeqs                     :     .  .  . .  . .    .  .    .     G     .   .  .  A    .     . .   .   . .   .       .    .   .  .   A . .   .
blockSeqs                     :     .  .  . .  . .    .  .    .     G     .   .  .  T    .     . .   .   . .   .       .    .   .  .   T . .   .
blockSeqs                     :     .  .  . .  . .    .  .    .     G     .   .  .  A    .     . .   .   . .   .       .    .   .  .   A . .   .
blockSeqs                     :     .  .  . .  . .    .  .    .     T     .   .  .  A    .     . .   .   . .   .       .    .   .  .   T . .   .
blockSeqs                     :     .  .  . .  . .    .  .    .     G     .   .  .  T    .     . .   .   . .   .       .    .   .  .   T . .   .
blockSeqs                     :        .  . .  . .    .  .    .     A     .   .  .  A    .     . .   .   . .   .       .    .   .  .   . . .   .
blockSeqs                     :        .  . .  . .    .  .    .     .     .   .  .  A    .     . .   .   . .   .       .    .   .  .   . . .   .
blockSeqs                     :             .  . .    .  .    .     .     .   .  .  T    .     . .   .   . .   .       .    .   .               
blockSeqs                     :                                           .   .  .  A    .     . .   .   . .   .                                


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : TAAA--T--T-A-TG-A--TTA--T---GC---AAAG---AC-CAT-TT--C---NT--GCTT-C-GCT-CGG-T--CC--AACGGT--CAC---A-CC-GTATA-T--AT-ATTA
finalCons                     : TAAA--T--T-A-TG-A--TTA--T---GC---AAAG---AC-CAT-TT--C---NT--GCTT-C-GCT-CGG-T--CC--AACGGT--CAC---A-CC-GTATA-T--AT-ATTA





Alignments
lowQualScore                  :                          111                                                                                        
lowQualScore                  :     33 22 2 1  1 22   22 111  333   4444  1   1  44 4444 44    1 1   1   3 22  22      22   333 1  2   1 2 44  2    
lowQualScore                  :     .. .. . .  . ..   .. ...  ...   ....  .   .  .. .... ..    . .   .   . ..  ..      ..   ... .  .   . . ..  .    
lowQualScore                  :     11 88 0 9  9 66   66 777  333   6666  8   8  33 2222 33    8 8   8   6 55  55      66   333 9  0   1 0 88  0    
consensus                     : TAAA--T--T-A-TG-A--TTA--T---GC---AAAG---AC-CAT-TT--C---NT--GCTT-C-GCT-CGG-T--CC--AACGGT--CAC---A-CC-GTATA-T--AT-ATTA
Reference ( family-783 )      : TAAA--T--T-A-TG-A--TTA--T---GC---AAAG---AC-CAT-TT--C---NT--GCTT-C-GCT-CGG-T--CC--AACGGT--CAC---A-CC-GTATA-T--AT-ATTA
gi|8310                       : TAAA--T--T-A-TG-A--TTA--T---GC---AAAA---AC-CAT-TT--C---TT--GCTT-C-GCT-CGG-T--CC--AACGGT--CAC---A-CC-GTATA-C--AT-ATTA
gi|8311                       : TAAA--T--T-A-TG-A--TTA--T---GC---AAAA---AC-CAT-TT--C---TC--GTTT-C-GCT-CGG-T--CC--AACGGT--CAC---A-CC-GAATA-T--AT-ATTA
gi|8312                       : TAAA--T--T-A-TG-A--TTA--TGG-GC---AAA----AC-CAT-TT--C---TCG-GTTT-C-GCT-C-G-T--CC--AA-GGT--CAC---A-CA-GAATA-T--ATAATTA
gi|8313                       : TAAA--T--T-A-TG-A--TTA--TG--GC---AA-----AC-CAT-TTG-C---TC--GTTT-C-GCT-CGGAT--CC---ATGG---CAC---A-CG-ATA------AT-ATTA
gi|8314                       : TAAA--T--T-A-TG-A--TTA--T---TC---AAAG---CC-CAT-TT--C---TT--GCTT-C-GCT-CGG-T--CC--AACGGT--CAC---A-CC-GTATA-T--AT-ATTA
gi|8315                       : TAAA--T--T-A-TG-A--TTA--T---GC---AAAG---AC-CAT-TT--C---GT--GCTT-C-GCTGCGT-T--CC--AACGGT--CAC---A-CC-GTATA-T--AT-ATCA
gi|8316                       : TAAA--T--T-A-TG-A--TTA--T---GC---AAAG---AC-CAT-TT--C---AT--GCTT-C-GCT-CGG-T--CT--AACGGT--AAC---A-CC-GTAAA-T--AT-ATTA
gi|8317                       : TAAA--T--T-A-TT-A--TCA--T---GC---AAAG---AT-CAT-TT--C---AT--GCTT-C-GCT-CGG-T--CC--AACGGT--CAC---G-CC-GTATA-T--AT-ATTA
gi|8318                       : TAAA--TCTT-A-TG-A--TTA--T---GC---AAAG---AC-CAT-TT--C---AT--GCTT-C-GCT-CGG-T--CT--AACGGT--AAC---A-CC-GTAAA-T--AA-ATTA
gi|8319                       : TAAA--T----A-TG-A--TTA--T---GC---AAAA---ACGCAT-TT--C---TT--GCTT-C-GCT-CGGTT--CC--CACGGT--CAC-----CC-GTATA-T--AT-
gi|8320                       : TAAA--T--T-A-TG-A--TTAAAT---GC---AAAG---AC-CAT-TT--C---GT--GCTT-CGGCT-TGG-T--CC--AACGGT--CACGTAA-CC-G-ATA-TA-AT-ATTA
gi|8321                       : TAAT--T--T-A-TA-T--TTA--T---GC---AAAA---AT-AAT-TC--C---AT--GCTT-C-GCT-CGG-T--CC--AACAGC--CAC---G-CC-ATATA-T--AT-ATTA
gi|8322                       : TAAA--T--T-A-TGCA--TTA--TT--GC---AAAC---AC-CAT-T---C---AT--GCTT-C-GCT-CG--T--CC--AACGGT--CAC---A-CCTATATA-T--AT-ATTA
gi|8323                       : TAAA--T--TTACTG-AGTTTA--TT--GC---AAAA---AC-CATATT--C---TTATGCTT-C-GCT-CGG-T--CCAAAACGGTCACAC---A-CC-GTATA-T--AT-
gi|8324                       : TAAA--T--T-A-TG-A--TT---T---GC---AAAG---AC-CAT-TT--TCCAGT--GCTT-C-GCT-CGG-TTCCT--AACGGC--AAC---A-CC-GTA-A-T--AT-AGTA
gi|8325                       : TAAAATT--T-A-TG-A--TCA--T---GC---AAAACGCAC-CAT-TT--C---AT--GCTT-C-GCT-CGG-T--TC--CAC
gi|8326                       :   AA--T--T-A-AG-A--TTA--T---TC---AATG---AC-CAT-TT--C---AT--GCCT-C-GCT-CGG-T--GT--AACGGT--CAT---A-C
gi|8327                       :    A--T--T-A-TG-A--TCA--A---GC---AAAG---AC-CAT-TT--C---TT--G-TT-C-GCT-CGG-T--CT--AACGGT--AAC---A--C-GTAAA-T--AT-
gi|8328                       :        --T-A-TG-A--TTA--T---GG---TAAT---AC-AAT-TC--A---AT--GCTT-C-GCT-CGA-T--CT--AACAGT--CAC---A-TC-GTATA-T--AT-AT
gi|8329                       :        --T-A-TA-A--TTA--TAAAGC---AA-G---AC--AT-TT--C---AT--GCTT-C-GGC-TGG-T--CC--AACGGT--CAC---A-CC---AAA-T--AT-ATTA
gi|8330                       :             -TG-A--TTA--T---GTCAAAAAA---AC-CAT-TTTTC---TT--GCTTTC-GCT-CGG-T--CC---ACGGT--CAC---ATCC-GTATATT--AT-AATA
gi|8331                       :                                          C-CAC-TT--C---AA--TTTT-C-TCT-CGG-T--CT--AACGGT--CAC---A-CC-GTATA-TGCAT-ATTA