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Reference ( gi|29745 )        :             AAAT--T---A-AAAA--AT-C-TT-C---T--T--T--T--C-T------A--T-------T--T-----C------C-----A----T----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TG-A------TT--ATGAT----G-TC------CA----T----G----AAGCC---------CTC-TA---T-C----A-AG-A-TTA-T----GA-AA---TTCACGG-CCC-CT-G----GGTCTGGGAT
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gi|29884                      :           aaattT--T---A-GAAA--AT-C-TT-C---T--T--C--C--T-T------A--C-------T--T-----C------C-----A----TCT--A--T--A---------T--------T-T--A--A-G---A---A---A-----A-GC--AA--A-----A----TGT----T------TG-A------TT--TTTAT----G-TC------CA----T----G----AAGCC---------CTT-TA---C-T----A-AA-A-TTT-T----GA-AA---TTCATGG-CCC-CT-G----gagg
gi|29892                      :                T--T---A-AAAA--AT-C-TTTC---T--T--T--T--C-T------AATT-------T--T-----A------C-----A----T----A--C--A---------T--------T-T--G--A-C---A---A---A-----A-TC--TG--A-----A----TGC----A------TG-A------TT--A--AT----A-TC------TA----TATATG----AAGCC---------CTC-TA---T-C----A-AG-A-TTT-T----GA-AT---TCCATGG-CCT-TG-G----GGTCAGG
gi|29880                      :                T--T---A-GAAA--AT-C-TT-C---T--T--C--T--C-T------G--C-------T--T-----T------G-----A----T----G--T--A---------T--------T-TT-G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TG-G------TT--ATGAT----G-TT------CA----T----G----AAGCC---------CCC-TA---C-T----A-A-----------------------CATGG-TCC-CT-G----GGTCAGG
gi|29890                      :                T--T---A-CAAA--AT-C-AT-C---G--T--C--T--C-T------T--C-------T--T-----T------C-----A----T----AGAT--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TA-G------TT--ATAAT----A-TC------CA----T----G----GAGCC---------CTT-TA---T-A----A-AC-A-TTT-T----GA-AA---TTCATTG-TCC-CT-T----AATCGAGGA
gi|29749                      :                T--T---A-GAAA-------CT-C---T--T--T--T--C-T------A--T-------T--C-----C------C-----A----T----A--T--ACATTGTATAT--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TA-G------TT--ACAAT----G-CT------CA----T----G----AAACC---------CTCTTG---T-T----T-A--A-TTG-T----GA-AA---TTCATGG-CCC-CT-A----GGTC
gi|29895                      :           aaatcT--T---A-GGAA--AT-C-TT-C---TCCT--T--T--CAT------A--T-----------------------------A----T----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A--C--TA--A-----A----TAC----A------CA-G------TT--ATGAT----T-TC------CA----T----G----AAGCC---------CTC-TG-----C----T-GG-A-----------A-AA---TTCATGG-CCC-CT-G----GGTag
gi|29783                      :                T--T---A-AAAA--AT-C-TT-G---T-----------C-T------A--T-------T--TTTAC-C------C-----A----T----G--G--A---------T--------G-T--G--G-G---ATTAA---A-----A-AC--TA--A-----A----TGT----A------TG-G------TT--ATGA--------------------------------AGCC---------CTC-TA---C-C----A-AA-C-TTG-T----AA-AA---TTCATGG-CCC-CT-G----GGTCAGGGG
gi|29780                      :           aaattT--T---C-AAAG--AT-T-TT-T---A--T--C--T--C-T------G--C-------C--C-----C------C-----A----A----A--C--A---------T--------T-TAGG--A-G---A---A---A-----A-CC--TA--A-----A----TGC----A------TG-G------TT--ATAAT----G-TC------CA----T----G----AAGCC---------CTC-TA---C-C----C-AT-A-ATA-TTC--AG-AA---TTTATGG-CCT-CA-G----GGTCAGGGG
gi|29869                      :           aaattT--T---A-AGAA--AT-T-AT-T---T--T--C--T--C-T------G--C-------T--C-----C------C-----A----T----A--T--G---------TG-------T-T--T--A-A---A---A---A-----A-AC--TA--T-----A----AGT----A------TC-A------TT--GTGAT----G-TC------CA----T----A----AAATC---------CTC-TA---C-T----C-AG-A-TTG-T----GA-AA---TTCATGG-CCC-CT-G----
gi|29784                      :                T--T---C-AAAA--AT-C-TT-C---T--C--T--TA-C-C------A-------------T-----CA-----C-----A----C----A--T--G---------T--------T-G--A--A-G---A---G---A-----A-AC--TA--A-----A----TAG----A------TG-G------TT--ATGAT----A-TT------CA----T----G----AATCC---------CCC-TA---C-T----G-AA-A-TTG-T----AA-AA---TTCATGT-CCC-AT-G----GGTTTAGGGaataaagg
gi|29888                      :           aaattT--T---A-AGAA--AT-C-CT-C---T-----------C-T------A--C-------T--C-----------------------------------------------------T-T--A--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----GGC----A------TG-T------TT--ATTAT----G-TC------CA----T----G----GAATC---------CTC-TATACT-C----A-A--A-CTG-T----GA-AA---TTCATGG-CTC-CT-G----GGTCAGG
gi|29898                      :                T--T---A-AAAG--AT-C-AT-C---C--T--C--T--C-T------A--C-------C--C-----C------CT----A----C----A--C--A---------T--------G-TAGG--A-GCA-A---A---ACGAACA-AC--TA--A-----A----TGC----T------TG-A------TT--ATAAT----G-TC------CA----C----G----AAGCC---------CTC-TA---C-T----A-AA-A-GTG-T----TA-AA---TTCATGG-CCC-CA-A----GGTGAGGGAagt
gi|29868                      :                T--T---A-GAAA--AT-C-CT-C---T-----------C-C------A--C-------T--T-----C------A-----AGA--T----A--T--A---------T--------T-T--A--A-G---A---A---A-----A-AC--AA--A-----A----TGC----T------TG-A------TT--TTGAT----G-TG------CA----T----G----AAGCC---------CTG-CA---C-T----A-AA-C-TTT-T----GA-AA---TGCATGG-CCC-CT-G----
gi|29891                      :                T--T---A-GAAA--AC-A-TT-C---T--T--C--T--C-T------A--CATGTAC-T--T-----C------T-----A----T----A--TATA---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AT--GA--A-----A----TGC----T------TG-A------TT--TTGAT----G-TC------CA----T----G----AAGCC---------CTT-TA-----C----A-AGAA-TTT-T----GA-AT---TCCATGT-TCC-CT-G----
gi|29881                      :                T--T---A-GAAA--AT-C-T------------------C-T------A--C-------T--T-----C------C-----A----T----ACAT--A---------T--------T-T--G--A-T---A---A---A-----A-AA--AA--A-----A----TGT----A------TG-A------TT--ATG--------TT------CA----T----G----AAGCC---------GTT-AA---T-C----A-AA-A-GTG-T----GA-TA---TTCATGG-CCC-TG-G----GGTTCAGGtaggtaagg
gi|29782                      :                T--T---A-GACA--AT-C-TT-C---T-----------C-T------A--C-------T--C-----C------C-----ACA--T----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TC--A-----A----TA-----A------TG-G------TA--ATGAT----G-CC------CA----T----G----AAGCC---------TTC-AA---C-C----T-AA-C-TTG-T----GA-AA---TTCATGG-CC
gi|29894                      : aaatgtattaaaatcT--T---A-GAAA--AT-C-TT-C---T--T--C--T--C-T------G--C-------T--T-----C------T-----A----T----A--TGCA---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AA--CA--A-----A----AGC----T------TG--------TT--TTGAT----G-TC------CA----C----G----AAGCC---------CTT-TA---C-T----A-A--A-TTT-T----G--CA---TTCATGG-CCC-TT-tggacagaggt
gi|29889                      :                T--T---A-TAAA--AT-C-AT-C---C--T--C--T--T-T------A--C-------T--T-----T------C-----A----T----A--TATA---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--AA--A-----A----CAC----T------TG-A------CT--TTGAC----G-TC------CA----C----G----AAGTC---------CTC-TG-----C----A-AGAA-TTT-T----GA-AA---CTCATGA-CCC-CT-
gi|29788                      :                T--T---C-AAAA--AT-T-TT-C---T--T--TAAG--C--------A--C-------T--T-----C------C-----A----C----A--C--A---------T--------G-T--G--G-G---A---G---A-----G-A----A--A-----C----TGC----A------TG-A------TG--ATGAT----G-TC------TA----T----G----AAGCT---------CTC-TA---C-C----C-TA-A-TTG-T----GA-AA---TTCATGG-CCA-CT-G----G
gi|29785                      :           aaattT--T---G-AAAA--TT-G-TT-T---T--C--C--T--T-T------A--C-------T--C-----C------C-----A----C----A--C--A---------T--------G-T--GGGA-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TT-A------TT--ATTAT----G-TC------CA----T-----------GTC---------CTG-TA---C-T----AGAG-A--TG-T----GA-AA---TTCAT-G-CCC-CT-G----GGTCAGGttaagggt
gi|29777                      :          aaatttT--T---C-AAAG--AC-C-TT-C---T-----------C-T------A--C-------C--C-----C------C-----A----C----A--C--A---------T--------T-GAGG--A-G---A---A---A-----A-G---TA--A-----A----TGC----A------TG-G------TT--GTGATATATG-CC------CA----T----G----AAGCC---------CTT-TAC--T-C----A-A--A-TTG-T----AA-AA---TTCATGA-ACC-CA-G----GGTCAGGGagt
gi|29778                      :           aaattT--T---C-AAAG--AC-C-TT-C---T-----------C-T------A--C-------C--------C------C-----A----C----A--C--A---------T--------T-GAGG--A-G---A---A---A-----A-G---TA--A-----A----TGC----A------TG-G------TT--GTGATATATG-CC------CA----T----G----AAGCC---------CTT-TAC--T-C----A-A--A-TTG-T----AA-AA---TTCATGA-ACC-CA-G----GGTCAGGGG
gi|29878                      :           aaattT--T---A-GAAA--AT-C-TT-C---A--TAATA-T--C-T------A--C-------T--T-----C------C-----A----T----A--TGTA---------T--------T-T--G--A-T---A---A---A-----A-AC--AA--A-----AA---TGC----T------CA-A------TT--TTGAT----G-TCTATATACA----T----GTATAAAGCT---------TTC-TG---C-T----A-AA-A-TTT-T----GA-AA---TTCATGG-CCC-CT-G----
gi|29897                      :                T--T---A-GAAA--AT-C-TT-C---A--T--T--CA-C-T------A--C-------TC-T-----C------C-----A----TT---A--T--A---------TACTTTTGAT-T--G--A-T---A---ACATA-----G-AC--TA--A-----A----TGG----A------TGGA------TT--AT----------C------CA----T----G----AAGCC---------CTC-TA---C-T----T-AA-A-TTG-A----CA-AA---TTCATGG-CTC-CT-G----GGTCAGGGG
gi|29787                      :                T--T---G-GAAG--CT-C-TC-G---T--T--T--C--C-T------A--C-------C--A-----A------C-----A----A----A--C--A---------T--------C-T--G--A-G---AGA-A---A-----A-AT--TA--A-----A----TGC----T------TG-G------TT--GTAAA----G-TC------CA----T----G----AAGCC---------CTC-TAC--T-C----A-A--A-TTG-T----AA-AA---TCCATGG-TCC-CA-A----GATCAGGG
gi|29927                      :            aaatt--T---A-AGGA--AT-T-TT-----T--T--T--T--G-T------A--C-------T--T-----C------C-----ACA--T----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-TC--TA--A-----A----TGC----A------TG-A------TT--ATGAT----G-TT------CA----T----G----AAACT---------GTC-TA---T-C----A-AG-A-TTA-T----GA-AA---TTCATGG-TCC-CT-G----GGTTTGGGGg
gi|29925                      :                a--T---A-GAAA--AT-C-AT-C---T-----------C-T------A--C-------T--C-----C------C-----A----T----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TAT----A------TG-G------TT--ATGCC----A-TC------CA----T----G----AAGCC---------CTC-AA---T-C----A-AA-A-TTG-T----GA-AA---TTAATGG-CCC-CT-G----CATCAGGGG
gi|29932                      :                          AAA--AT-C-TT-C---T--T--T--C--C-T------A--C-------T--T-----C------C----------T----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TG-AT-----TT--TTTAT----G-TC------TA----T----G----AAGTT---------CTC-TA---T-C----A-AG-A-TAA-T----GA-AA---TTCATGG-CCC-CT-G----GGTCTAGGG
gi|29930                      :                          AAA--AT-C-TT-C---T--T--C--------------A--C-------T--T-----T------C-----A----T----A--T--A---------T--------T-TTTG--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TG-G------TT--ATAAT----G-TC------CA----T----G----AAGAC---------CCC-TA---C-T----A-AG-G-TTG-T----AA-AA---TTCATGG-CCC-CT-G----GCTCAGGGG
gi|29933                      :                          AAA--AT-C-TT-C---T-----------C-T------A--C-------T--T-----C------C-----A----T----A--TATA---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TG-G------TT--ATGAT----G-TT------CA----T----T----AAGCC---------CTC-TG---T-C----A-AG-A-T---T----GA-AA---TTCGTGGAGTC-TT-G----GGTTCAGG
gi|29935                      :                          AAA--AT-G-TT-C---T--C--T--T--------------T-------T--T-----T------C-----A----C----A--C--A---------T--------G-T--GGGA-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TG-G------TG--ATGAT----G-TC------CA----T----G----AAGCC---------CTT-TA---T-C----A-AA-A-TTG-T----GA-AA---TTCGTGG-CCC-CT-G----GATC
gi|29931                      :                          AAA--AT-C-GT-C---T--T--C--T--C-T------A--C-------T--T-----C------C-----A----T----A--T--A---------TA-------TGT--G--A-G---A---A---A-----A-AC--AA--A-----A----TGC----T------TG-A------TT--TTGAT----G-CC------CA----T----G----AAGCC---------CTT-TA---C-T----A-AA-A-TTT-T----GA-AA---TCCATGG-CCC-CT-G----agaggt
gi|29942                      :                          AAA--AT-C-TT-C---T-----------C-T------A--C-------T--T-----C------C-----A----C----AG-T--A---------G--------T-G--G--AAG---A---T---A-----A-AC--TC--A-----G----TGC----A------TG-A------TT--ATAAT----G-TT------CT----A----G----ACGCC---------TTC-TA---C-C----A-GA-A-TTG-T----GA-AA---TTCATGG-TCC-CT-G----GGTCAGGG
gi|29945                      :                          AAA--AT-C-TT-----------T--T--C-T------A--C-------T--C-----C------C-----A----C----G--T--A---------T--------C-TAGG--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TG-G------TT--ATAAT----G-TC------CA----T----G----GAGCT---------CTC-TA---C-T----G-AA-A-CTA-TGCCGGA-AA---TTAATGG-ACT-CG-A----GGTCAGGG
gi|29944                      :                          AAA--AT-C-TT-C---T-----------C-T------A--T-------C--------C------C-----A----T----A--T--AATA------T--------G-C--G--A-G---A---A---A-----A-AC--AA--A-----A----TGC----A------TG-A------TC--ATGAT----GTTC------CA----T----G----AAG-C---------CTC-TA---C-T----T-AA-A-TTG-T----GA-AA---TT--------C-CT-G----GGTCAGGGGg
gi|29759                      :                          AAG--AT-C-TT-C---T--C--T--A--C-T------A-------------------C------C-----A----C----T--C--A---------T--------T-TATG--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGA----A------TG-G------TT-----AT----G-TC------CA----T----G----AAACC---------CTT-TA---T-T----A-GG-A-TTT-T----AATAA---TTCATGG-CCC-TA-G----GGT
gi|29936                      :                 aaattttcgAAA--AT-C-TT-C---T--T--C--A--T-T------A--C-------T--T-----T------C-----A----T----A--T--A---------TAT------T-T--G--A-G---A---A------------C--TA--A-----A----T-C----A------TT-T------TT--ATGAT----A-TC------CG----T----G----AA-CC---------CCC-TACT-T-T----A-A----CTG-T----AA-AA---TTAATGG-CCC-CT-G----GGTCAGGGGgaggag
gi|29947                      :                          AAA--AT-T-TT-C---T--T--A--A--G-C------A--C-------T--T-----CA-----C-----A----C----A--T--G---------T--------G-G--G--A-G---A---G---A-----A-AC--T---------------GC----A------TG-A------TG--ATGAT----G-TC------TA----T----G----AAGCT---------CTC-TA---C-C----C-TA-A-TTG-T----GA-AA---TTCATGG-CCA-CT-G----G
gi|29789                      :                           AA--AT-T-TT-CAAAT--T--C--T--T-C------A--T-------T--C-----C------C-----A----C----A--C--A---------T--------C-T--G--G-G---A---A---A-----A--C--TA--A-----A----TGC----A------TA-G------TT--ATGAT----G-TC------AA----T----G----AAACC---------CTG-TA---C-C----A-AA-A-TTG-T----GA-AA----TCGTTG-CCC----G----AGTCAGGttaggggt
gi|29769                      :                           AA--AT-C-TT-C---C-----------C-T------A--C-------T--T-----C------C-----G----T----A--T--A---------TAG------T-T--A--A-G---A---A---A-----T-AC--AA--A-----G----TGT----T------TG-A------TT--TTGAT----G-TC------CA----C----G----AAGCC---------CTC-TA-----C----T-TG-ACTTT-T----GA-AA---TTTATGG-CCT-CT-G----GGag
gi|30082                      :                   aacttactAA--AT-A-TT-T---T--T--C--T--C-T------A--A-------T--C-----C------C-----A----T----A--T--G---------TGT------T-T--T--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----AGT----A------TG-A------TT--ATGAT----G-TT------TA----T----G----AAGTA---------CTT-TAC--T-C----A-A--A-TTG-T----AG-AA---TTCATGT-CTC-TT-G----G
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gi|30117                      :                                T-C-TA-C---T--T--T--TATC-T------G--T-------C--TGATGAC------C-----A----T----A--T--GCTGGT----T--------T-T--A--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A-----GC----A------TG-A------TT--ATGAT----G-TC------CA----T----G----AAGTC---------CTC-TAC--T-C----A-A--A-TTG-T----GA-AA---TTTATGG-CAT-CT-T----GGTCAGGGG
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Reference ( family-78 )       :                      AAAT--T---AGAAA--ATC-TT--C---T--T----CTCT------AC-------T--TC------C-----A----T----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TG-A------TT--ATGAT----GT-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TC--TAC-C---A--AAATTGT----GA-AA---TTCA-TGG-CCCCT---G----GG--T-CAGGGGT
gi|29745                      :                      AAAT--T---AAAAA--ATC-TT--C---T--T----TTCT------AT-------T--TC------C-----A----T----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TG-A------TT--ATGAT----GT-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TC--TAT-C---A--AGATTAT----GA-AA---TTCA-CGG-CCCCT---G----GG--T-CTGGGAT
gi|29746                      :                      AAAT--T---AGAAA--ATC-TT--C---T--C----TTCT------AC-------T--TC------C-----ACA--T----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-TC--TA--A-----A----TGC----A------TG-A------TT--ATGAT----GT-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TT--TAT-C---A--AGATTAT----GA-AA---CTCA-TGG-CCCCA---G----GG--T-CTGGGGT
gi|29748                      :                      AACT--T---AGAAA--ATC-TT--C---T---------CT------AC-------T--TC------CTATGTA----TTGG-A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGT----A------TG-C------TT--ATGAT----GT-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TC--TAC-T---T--AAATTAT----AC-AA---TTCA-TGG-CCCCT---G----GG--T-ATGGGGT
gi|29749                      :                         T--T---AGAAA------CT--C---T--T----TTCT------AT-------T--CC------C-----A----T----A--T--ACATTGTATAT--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TA-G------TT--ACAAT----GC-T------CA----T----G----AAACC---------C-----TC--TTG-T---T--TAATTGT----GA-AA---TTCA-TGG-CCCCT---A----GG--T-CAG
gi|29750                      :                 aaatcAAAT--T---AGAAT--ATC-TT--C---T--T----TTCT------AC-------T--TT------C-----A----T----A--T--------------------------G--A-G---A---A---A-----A-TC--TA--A-----A----TGG----A------TG-A------TT--ATGAT----GT-C------CA----T----G----AAGTT---------C-----TC--TAT-C---A--AGATTAT----GA-AA---TTCA-TGG-CCCCT---G----GG--T-CTGGG
gi|29751                      :                                                ---T--T----CTCT------AC-------T--TC------C-----A----T----A--T--A---------TAT------T-T--G----G---A---A---A-----A-A-------A-----A----TGC----T------CG-A------TT---TGAT----GT-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TC--TAC-T---A--ATATTTT----GA-AA---TCCA-TGG-TCCCT---G----
gi|29752                      :            aagttatgaaAAAT--T---AGAAA--ATC-TT--C---T--T----TTCT------AC-------T--TC------T-----A----TGT--A--T--A---------T--------T-T--G--ACA---A---A---A-----A-AT--TA--A-----A----TGC----A------TG-A------TT--ATGAT----GT-C------CA----T----G----AAGCA---------C-----TA--TAT-C---A--AGATTAT----GA-AA---TTCA-TAG-TCCCT---GGAT-GG--T-CAGG
gi|29753                      :                                  AAG--ATC-TT--C---T--T----CCTT------AC-------T--TC------C-----A----C----A--C--A---------T--------T-TAAG--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TG-G------TT--ATAAT----GT-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TC--TAT-T---A--GAATTGT-----A-AA---TTCA-TTG-CCCAA---G----GG--T-GAGG
gi|29754                      :             aaattttcaAAAT--T---AGAAA--ATC-TT--C---T--C----TACT------AC-------T--GC------T-----A----T----A--T--A---------TATAT----T-T--G--A-C---A---A---A-----T-AT--TG--A-----A----TGC----A------TG-A------TT--ATGAT----GT-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TC--T-------A--AGATTAT----GA-AA---TTCA-TGG-TCCCT---G----GG--T-CAG
gi|29755                      :                                  AAG--ATC-TT--C---T--T----CTCT------AC-------T--CC------C-----A----C----A--C--A---------T--------T-TAGG--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TG-----A------TG-G------TT--ATAAT----GT-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TC--TAT-T---A--AAATTAT----AA-AA---TCCA-TGG-CCCCA---A----AG--T-GAGGTGT
gi|29757                      :             aaattttcaAACT--T---AGAAA--ATC-TT--C---T---------CT------AC-------T--CC------C-----G----T----A--TTTA---------T--------T-T--G--A-A---A---A---A-----T-AC--TA--A-----A----TGC----A------TG-A------TT--ATATT----GT-C------CA----T----G----AAACC---------C-----CC--TAC-T---A--AAATTGT----TA-AA---TTCA-TGG-CCTCT---G----AG--T-CAGGGGT
gi|29758                      :                      AAAT--C---AGAAA--ATC-TT--C---T--T----TTCT------TC-------T--TC------T-----A----T----A--T--A---------TAT------T-T--G--G-C---A---A---A-----C-AC--TA--A-----A----TGC----A------TG-A------TT--ATGAT----GT-C------CA----T----G----AAACC---------T-----TC--GAT-C---A--AGATTAT----GA-AA---TTTA-TGC-CCCCT---G----GA--TCCAGG
gi|29759                      :                                            T--C---T--T----CTCT------AC-------T--AC------C-----A----C----T--C--A---------T--------T-TATG--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGA----A------TG-G------TT-----AT----GT-C------CA----T----G----AAACC---------C-----TT--TAT-T---A--GGATTTT----AATAA---TTCA-TGG-CCCTA---G----GG--T-GAGGAG
gi|29762                      :         aaattttcgaagaAAAT--T---GGAAA--ATC-TT--C---C--T----CTCT------AC-------T--TC------C-----A----T----A--TATA---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TA-A------GT--ATGAT----GT-T------CA----T----G----CAGCC---------C-----TC--TAT-C---A--GAATTGT----GA-AA---TTCA-TGA-CCCC
gi|29763                      :                      AACT--T---AGGAA--ATC-TT--C---T---------CT------AA-------T--CC------C-----A----T----A--T--A---------TATGT----T-T--A--A-G---A---A---A-----A-AC--TT--A-----A----TGC----G------TG-G------TT--ATTAT----GC-C------TA----T----G----ATGCCTATGTAGGGC-----TC--TAC-T---C--AAATTGT----GA-AA---TTCA-TGG-CTCGT---A----AG--T-TAGG
gi|29764                      :                      AAAT--T---AGAAA--ATC-AT--C---T--T----TTCT------AC-------T--TA------C-----A----T----A--T--A---------TAA------T-C--G--A-G---A---A---A-----A-TC--TA--C-----A----TGC----A------TG-A------TT--ATGAT----GT-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TC--TAT-C---A--AGATAAT----GA-AA---TTCA-TGG-CTACT---GCATAGG--G-CTGGGGT
gi|29765                      :                         T--T---A-AAA--ATC-GT--C---T--T----TTCT------GC-------T--TC------C-----AAA--T----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-TC--GA--A-----A----ATC----G------TA-A------TT--ATGAT----GT-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TC--TAT-C---A--AGATTAT----AA-AA---TTCG-TGG-TCCCT---G----GG--T-CTAGGGT
gi|29766                      :                 aaattAAAT--T---A-AAA--AT--TT--C---T--T----TTCT------ACAGTGTACT--TC------C-----AAA--T----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TTTTA-----A----TGC----A------CG-A------GC--ATGTT----GT-A------CA----T----G----AAGCC---------C-----TC--TAT-C---A--AAATTAT----GA-AA---TTCA-TGG-CCTTT---G----GG--T-CTGGGGT
gi|29767                      :                      AAAT--G---AGGAA--ATT-GT--C---C--T----CTCT------AC-------T--CC------C-----A----T----AAAT--G---------T--------T-T--A--A-G---A---A---A-----C-AC--CA--A-----A----AGC-----------TT-A------CT--ATGAT----GT-C------CA----T----G----AAGTC---------T-----TC--TAC-T---C--TAATTGT----GA-AC---TTCA-ATA-CCCCT---A----GG--T-CAAGGGT
gi|29768                      :                                  AAG--ATT-TT--C---T--T----CTCT------AT-------C--TC------C-----A----C----A--C--A---------T--------T-TAGG--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------CG-G------TT--ATAAT----GT-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TC--TAT-T---C--AAATTGT----AA-AA---TTCA-TGG-CCTCA---A----AG--T-TAGGGGT
gi|29769                      :                                   aaattttcaT--C---T--T----CCCT------AC-------T--TC------C-----G----T----A--T--A---------TAG------T-T--A--A-G---A---A---A-----T-AC--AA--A-----G----TGT----T------TG-A------TT--TTGAT----GT-C------CA----C----G----AAGCC---------C-----TC--TAC-T---T--GACTTTT----GA-AA---TTTA-TGG-CCTCT---G----GG--
gi|29771                      :                             aacttactaaaTT-TT--T---T--T----CTCT------TG-------T--CC------C-----A----T----A--T--G---------TGT------T-T--A--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A-----GC----A------TG-A------TT--ATGAT----GT-C------CA----T----G----AAGTC---------C-----TC--TAC-T---C--AAATTGT----GA-AA---TCTA-TGG-TATCT---T----CG--T-CAGGGGT
gi|29773                      : aaatgtattaaatctgactttAAGT--T---AAAAATAATC-CT--G---T--T-----TCT------AC-------T--TC------C-----A----T----A--T--A---------T--------------------------A---C-----A-TG--TA--A-----A----TGC----A------TA-A------TT--ATGAT----GT-C------CA----T----A----GAGCC---------C-----TT--TAT-T---T--CAACTGT----GA-AA---TTCA-TGG-CCCCT---G----GG--T-CAGGGGT
gi|29774                      :                      AAAT--T---G---A--ATT-TT--C---T--T----CTCT------AC-------T--TTATACA-C-----A----T----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-A----A--------------GC----A------TG-A------CT--ATGAT----GT-C------CA----T----G----AAGGC---------C-----TC--TAC-T---T--CAGTTGT----GA-AA---TT---TGG-CCACT---G----GG--T-AAGGGG
gi|29775                      :                      AAAT--T---G--AA--TTT-TT--C---T--T----CTCT------AC-------T--TCTATACAC-----A----T----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-A-------------A-----GC----A------TG-A------CT--ATGAT----GT-C------CA----T----G----AAGGC---------C-----TC--TAC-T---T--CAGTTGT----GA-AA---TT---TGG-CCACT---G----GG--T-AAGGGG
gi|29776                      :                      AAAT--T---AGAAA--ATC-TT--T---T---------CT------AC-------T--TC------C-----AAATAT----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGT----A------TG-A------TT--ACAAT----G----------A----T----A----AAG----------------------------------ATTAT----GA-AA---TTCA-TGA-CCCCT---G----GG--T-CAGTGGT
gi|29777                      :                                             --C---T--T----CTCT------AC-------C--CC------C-----A----C----A--C--A---------T--------T-GAGG--A-G---A---A---A-----A-G---TA--A-----A----TGC----A------TG-G------TT--GTGATATATGC-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TT--TAC-T---C--AAATTGT----AA-AA---TTCA-TGA-ACCCA---G----GG--T-CAGGG
gi|29778                      :                               aaattttcaaagac--C---T--T----CTCT------AC-------C---C------C-----A----C----A--C--A---------T--------T-GAGG--A-G---A---A---A-----A-G---TA--A-----A----TGC----A------TG-G------TT--GTGATATATGC-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TT--TAC-T---C--AAATTGT----AA-AA---TTCA-TGA-ACCCA---G----GG--T-CAGGGGT
gi|29779                      :        aaattttcaaagacAAAT--T---AGAAA--ATT-TT--G---T--T----TTCTTTTTTAAT-------C--TA------C-----A----T----G--TGTA---------T--------C-T--A--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----T------TG-A------TT--ATGAT----GT-C------CA----T----A----GAACC---------T-----TC--TAT-C---A--AAAT--T----AA-AA---TCCA-TGG-CCTCT---G----GG--T-TTGGGGT
gi|29780                      :                                  AAG--ATT-TT--T---A--T----CTCT------GC-------C--CC------C-----A----A----A--C--A---------T--------T-TAGG--A-G---A---A---A-----A-CC--TA--A-----A----TGC----A------TG-G------TT--ATAAT----GT-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TC--TAC-CCATA--ATATT-C----AG-AA---TTTA-TGG-CCTCA---G----GG--T-CAGGGGT
gi|29782                      :                aaattttcaT--T---AGACA--ATC-TT--C---T---------CT------AC-------T--CC------C-----ACA--T----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TC--A-----A----TA-----A------TG-G------TA--ATGAT----GC-C------CA----T----G----AAGCC---------T-----TC--AAC-C---T--AACTTGT----GA-AA---TTCA-TGG---CCT---G----GA----CAGAGGT
gi|29783                      :          aaatgtattaaaatcT--T---AAAAA--ATC-TTGTC---TA-T----TTTT------AC-----------C------C-----A----T----G--G--A---------T--------G-T--G--G-G---ATTAA---A-----A-AC--TA--A-----A----TGT----A------TG-G------TT--ATGA--------------------------------AGCC---------C-----TC--TAC-C---A--AACTTGT----AA-AA---TTCA-TGG-CCCCT---G----GG--T-CAGGGGT
gi|29784                      :                             aaattAAA--ATC-TT--C------T----CT-T------AC-------CA-TCA-----C-----A----C----A--T--G---------T--------T-G--A--A-G---A---G---A-----A-AC--TA--A-----A----TAG----A------TG-G------TT--ATGAT----AT-T------CA----T----G----AATCC---------C-----CC--TAC-T---G--AAATTGT----AA-AA---TTCA-TGT-CCCAT---G----GG--T-TTAGGGT
gi|29785                      :                aaattttcaT--T---TGAAA--ATTGTT--T---T--C----CTTT------AC-------T--CC------C-----A----C----A--C--A---------T--------G-T--GGGA-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TT-A------TT--ATTAT----GT-C------CA----T-----------GTC---------C-----TG--TAC-T---A--GAGATGT----GA-AA---TTCA-T-G-CCCCT---G----GG--T-CAGGAGT
gi|29786                      :                 aaattAAATCGT---AGAAA--ATC-TT--T---T--T----CTCT------AC-------T--TA------T-----A----T----A--T--A---------TATAT----C-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TAC----A------TG-A------TT--ATGAT----GT-C------CA----T----G----AAGCT---------T-----TC--T
gi|29787                      :                         T--T---GGAAG--CTC-TC--G---T--T----TCCT------AC-------C--AA------C-----A----A----A--C--A---------T--------C-T--G--A-G---AGA-A---A-----A-AT--TA--A-----A----TGC----T------TG-G------TT--GTAAA----GT-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TC--TAC-T---C--AAATTGT----AA-AA---TCCA-TGG-TCCCA---A----GA--T-CAGGGG
gi|29788                      :                             aaattAAA--ATT-TT--C---T--TTAAGC---------AC-------T--TC------C-----A----C----A--C--A---------T--------G-T--G--G-G---A---G---A-----G-A----A--A-----C----TGC----A------TG-A------TG--ATGAT----GT-C------TA----T----G----AAGCT---------C-----TC--TAC-C---C--TAATTGT----GA-AA---TTCA-TGG-CCACT--------GG--T-TAAGGGT
gi|29789                      :                          aaattttcaAA--ATT-TT--CAAAT--T----CTTC------AT-------T--CC------C-----A----C----A--C--A---------T--------C-T--G--G-G---A---A---A-----A--C--TA--A-----A----TGC----A------TA-G------TT--ATGAT----GT-C------AA----T----G----AAACC---------C-----TG--TAC-C---A--AAATTGT----GA-AA----TCG-TTG-CCC-----G----AG--T-CAGGAG
gi|29790                      :                      AAAT--TTAAAAAAA--ATC-TT--C---T--T----CTCT------ACAA-----T--TG------C-----A----C----A--T--G---------T--------T-T--G--A-G---A---A---G-----A-AC--TA--G-----A----AGT----A------TG-G------T-----GAT----GT-AGAG---CA----G----G----GA-CC---------C-----TC--TAC-C---A--AAATTGT----AA-AT---TTTG-TGA-TCCCC---G----GG--T-CAGGGGT
gi|29791                      :                      AAAT--T---AGAAA--ATC-TT--C---TCTT----TTCT------AC-------G--TC------C-----AAA--T----A--C--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGG----A------TG-A------TT--ATGGT----GT-C------CA----T----A----AACCC---------C-----TC--TA
gi|29833                      :                       AAT--T---ACAAA--ATC-TT--C---T---------CT------AC-------T--TC------C-----A----T----A--T--A---------TAT------T-T--G--A-G---A---A---A-----A--------------------------------------------TT---TGAT----GT-C------CA----T----T----AAGCC---------C-----TC--TAC-T---T--AAATTGT----GA-AA---TTCA-TGT-CCTGTTG-G----GG--T-GAGG
gi|29834                      :                       AAT--T---AGAAA--ATC-TT--T---T---------CT------AC-------T--TC------C-----AAATAT----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGT----A------T--------------TGAT----A--C------AA----T----G----A-----------------------TA------A--AGATTAT----GA-AA---TTCA-TGA-CCCCT---G----GG--T-CAGTGGT
gi|29837                      :                       AAT--T---AGAAA--ATC-TT--C---T--T----TTCT------AT-------T--TC------T-----A----T----A--T--ACA-------T--------T-T--G--G-G---G---A---A-----A-AT--TA--A-----A----TGT----A------TG-T------TT--ATGAT----GT-C------CA----T----G----AACCC---------C-----TC--TAT-T---A--AGATTAT----GA-AG---TTC
gi|29838                      :                       AAT--T---AGAAA--ATCATT--C---T--C----TTCT------AC-------T--TC------C-----A----C----AA-T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-TC--TA--A-----A----TGC-----------TG-A------TTGAATGAT----AT-T------CA----T----G----AAG-C---------C-----TT--TAT-C---AGGAAGATAT----G--AA---TCCA-TGG-TCCCC---A----GG--T-CTGGGG
gi|29868                      :                         T--T---AGAAA--ATC-CT--C---T--C----C---------AC-------T--TC------A-----AGA--T----A--T--A---------T--------T-T--A--A-G---A---A---A-----A-AC--AA--A-----A----TGC----T------TG-A------TT--TTGAT----GT-G------CA----T----G----AAGCC---------C-----TG--CAC-T---A--AACTTTT----GA-AA---TGCA-TGG-CCCCT---G----
gi|29869                      :                         T--T---AAGAA--ATT-AT--T---T--T----CTCT------GC-------T--CC------C-----A----T----A--T--G---------TG-------T-T--T--A-A---A---A---A-----A-AC--TA--T-----A----AGT----A------TC-A------TT--GTGAT----GT-C------CA----T----A----AAATC---------C-----TC--TAC-T---C--AGATTGT----GA-AA---TTCA-TGG-CCCCT---G----AA--T-AAAGG
gi|29870                      :                         T--T---AGAAA--ATC-TT--C---T--T----TTCT------AC-------T--CTGA----T-----A----T----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-CC--TA--A-----A----TGC----A------TT-A------TT--ATGAT----TT-C------CA----T----G----AAGCC---------T-----TC--TTC-C---G--AAATTGT----GA-AA---TCCA-TGG-CCCCT---A----GA--T-CAGGGAT
gi|29873                      :                         T--T---AAGAA--ATC-CT--T---T--T----CTCT------AC-------T--CC------A-----A----T----A--T--G---------TGT------T-T--A--A-G---A---A---A-----A-TC--TA--A-----A----TGC----A------TG-A------TT--ATGAT----AT-C------CA----T----G----AAGTC---------C-----TC--TAT-T---C--AAATTGT----GA-AA---TTCA-TGG-TCCTT---G----GG--C-CAGTGGT
gi|29874                      :                         T--T---AGAAA--ATC-TT--G---T---------CT------AT-------T--TT------C-----A----T----A--T--G---------T--------T-TTTG--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--T-----A----TGC----A------TG-G------TT--ATGAT----GT-C------CA----T----G----AAACC---------C-----CC--TAC-T---A--AAGTTGT----AA-AA---TTCA-TGG-TCCCT---G----GG--T-CAGGGAT
gi|29876                      :                         T--T---AGAAA--ATC-TT--C---T--T----TTCT------AC-------T--TC------T-----A----T----A--T--A---------TAT------T-T--G--A-C---A---A---A-----A-AC--TA--A-----G----TGC----A------TG-A------TT--ATGAT----GT-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TT--TAT-C---A--AGATTTT----AA-AA---TTCACTGG-GCCTG---G----GG--T-CAGG
gi|29877                      :                         T--T---AGAAA--A----T--C---T--T----CTCT------AT-------T--TC------CGT---A----T----G--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-ACA-AA--A-----A----TGC----T------TG-A------TT--TTGAT----GT-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TC--TAC-T---A--AAATTTT----GA-AA---TTCA-TGG-CTCCT---
gi|29878                      :                         T--T---AGAAA--ATC-TT--CA--TAAT----ATCT------AC-------T--TC------C-----A----T----A--TGTA---------T--------T-T--G--A-T---A---A---A-----A-AC--AA--A-----AA---TGC----T------CA-A------TT--TTGAT----GT-CTATATACA----T----GTATAAAGCT---------T-----TC--TGC-T---A--AAATTTT----GA-AA---TTCA-TGG-CCCCT---G----
gi|29879                      :                         T--T---AAAAA--ATC-TT--C---T--T----TTCT------AC-------T--TT------C-----ACA--T----A--T--A---------T--------T-T--G--A-C---A---A---A-----A-TC--TG--A-----A----TGC----A------TG-A------TT--ATGAT----GT-C------TACGTAT----G----AAGCC---------C-----TC--TAT-C---A--AGAATAT----GA-AA---TCCA-TGG-CCCCA---G----GG--T-C
gi|29880                      :                         T--T---AGAAA--ATC-TT--C---T--T----CTCT------GC-------T--TT------G-----A----T----G--T--A---------T--------T-TT-G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TG-G------TT--ATGAT----GT-T------CA----T----G----AAGCC---------C-----CC--TAC-T---A--A--------------------CA-TGG-TCCCT---G----GG--T-CAGG
gi|29881                      :                         T--T---AGAAA--ATC-T-----------------CT------AC-------T--TC------C-----A----T----ACAT--A---------T--------T-T--G--A-T---A---A---A-----A-AA--AA--A-----A----TGT----A------TG-A------TT--ATG-------T-T------CA----T----G----AAGCC---------G-----TT--AAT-C---A--AAAGTGT----GA-TA---TTCA-TGG--CCCT---G----GGGTT-CAGG
gi|29884                      :                         T--T---AGAAA--ATC-TT--C---T--T----CCTT------AC-------T--TC------C-----A----TCT--A--T--A---------T--------T-T--A--A-G---A---A---A-----A-GC--AA--A-----A----TGT----T------TG-A------TT--TTTAT----GT-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TT--TAC-T---A--AAATTTT----GA-AA---TTCA-TGG-CCCCT---G----
gi|29888                      :                         T--T---AAGAA--ATC-CT--C---T---------CT------AC-------T--C------------------------------------------------T-T--A--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----GGC----A------TG-T------TT--ATTAT----GT-C------CA----T----G----GAATC---------C-----TCTATAC-T---C--AAACTGT----GA-AA---TTCA-TGG-CTCCT---G----GG--T-CAGGAGT
gi|29889                      :                         T--T---ATAAA--ATC-AT--C---C--T----CTTT------AC-------T--TT------C-----A----T----A--TATA---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--AA--A-----A----CAC----T------TG-A------CT--TTGAC----GT-C------CA----C----G----AAGTC---------C-----TC--TGC-A---A--GAATTTT----GA-AA---CTCA-TGA-CCCCT---
gi|29890                      :                         T--T---ACAAA--ATC-AT--C---G--T----CTCT------TC-------T--TT------C-----A----T----AGAT--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TA-G------TT--ATAAT----AT-C------CA----T----G----GAGCC---------C-----TT--TAT-A---A--ACATTTT----GA-AA---TTCA-TTG-TCCCT---T----AA--T-CGAGGAT
gi|29891                      :                         T--T---AGAAA--ACA-TT--C---T--T----CTCT------ACATGTAC-T--TC------T-----A----T----A--TATA---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AT--GA--A-----A----TGC----T------TG-A------TT--TTGAT----GT-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TT--TAC-A---A--GAATTTT----GA-AT---TCCA-TGT-TCCCT---GTA--GG--T-AAGG
gi|29892                      :                         T--T---AAAAA--ATC-TTT-C---T--T----TTCT------AA-------T--TTTA----C-----A----T----A--C--A---------T--------T-T--G--A-C---A---A---A-----A-TC--TG--A-----A----TGC----A------TG-A------TT--A--AT----AT-C------TA----TATATG----AAGCC---------C-----TC--TAT-C---A--AGATTTT----GA-AT---TCCA-TGG-CCTTG---G----GG--T-CAGG
gi|29893                      :                                         C-TT--T---T--T----TTCT------GT-------TGTCC------C-----A----T----A--T--G---------TGT------T-T--A--A-G---A---A---A-----A-G---TA--A-----A----AGC----A------TG-A------TT--ATGAT----GT-C------CT----T----G----AAGTC---------C-----TC--TACTC-------AATTGT----GA-AA---TCTA-TGG-CTCTT--------GG--T-CAGGGGT
gi|29894                      :            ttattaaatactaT--T---AGAAA--ATC-TT--C---T--T----CTCT------GC-------T--TC------T-----A----T----A--TGCA---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AA--CA--A-----A----AGC----T------TG--------TT--TTGAT----GT-C------CA----C----G----AAGCC---------C-----TT--TAC-T------AAATTTT----G--CA---TTCA-TGG-CCCTT---
gi|29895                      :                         T--T---AGGAA--ATC-TT--C---T--C----CTTT-------C-------A--TA------T-----A----T----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A--C--TA--A-----A----TAC----A------CA-G------TT--ATGAT----TT-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TC--TGC------------TGG----AA-AA---TTCA-TGG-CCCCT---G----GG--T-
gi|29897                      :                         T--T---AGAAA--ATC-TT--CA--T--T----CACT------AC-------TC-TC------C-----A----TT---A--T--A---------TACTTTTGAT-T--G--A-T---A---ACATA-----G-AC--TA--A-----A----TGG----A------TGGA------TT--AT----------C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TC--TAC-T---T--AAATTGA----CA-AA---TTCA-TGG-CTCCT---G----GG--T-CAGGGGT
gi|29898                      :                         T--T---AAAAG--ATC-AT--C---C--T----CTCT------AC-------C--CC------CT----A----C----A--C--A---------T--------G-TAGG--A-GCA-A---A---ACGAACA-AC--TA--A-----A----TGC----T------TG-A------TT--ATAAT----GT-C------CA----C----G----AAGCC---------C-----TC--TAC-T---A--AAAGTGT----TA-AA---TTCA-TGG-CCCCA---A----GG--T-GAGGGAT
gi|29924                      :                         T--T---AGTAA------TT--C---T--T----CTCT------AC-------T---C------C-----A----T----A--T--A---------TGT------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--AA--A-----AA---TGC----T------CG-A------TT--TTGGT----GT-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TC--TAC-T---T--AAATTTA----GA-AA---TTCA-TGG-CCCCT---G----
gi|29925                      :                 tattaaatc--T---AGAAA--ATC-AT--C---T---------CT------AC-------T--CC------C-----A----T----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TAT----A------TG-G------TT--ATGCC----AT-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TC--AAT-C---A--AAATTGT----GA-AA---TTAA-TGG-CCCCT---G----CA--T-CAGGGGT
gi|29927                      :                                    A--ATT-TT--T---T--T-----TGT------AC-------T--TC------C-----ACA--T----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-TC--TA--A-----A----TGC----A------TG-A------TT--ATGAT----GT-T------CA----T----G----AAACT---------G-----TC--TAT-C---A--AGATTAT----GA-AA---TTCA-TGG-TCCCT---G----GG--T-TTGGGGT
gi|29929                      :                                    ataagg-TT--C---T--C----CTCT------AC-------T--TC------C-----A----T----A--T--AAA-------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----AAAC--TA--A-----A----TGC----A------TG-A------TT--AGGAT----GT-C------CA----T----G----AAATC---------T-----TC--TAC-T---G--AAATGGT----GA-AA---T
gi|29930                      :                          taagattaAAA--ATC-TT--C---T--T----C---------AC-------T--TT------C-----A----T----A--T--A---------T--------T-TTTG--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TG-G------TT--ATAAT----GT-C------CA----T----G----AAGAC---------C-----CC--TAC-T---A--AGGTTGT----AA-AA---TTCA-TGG-CCCCT---G----GC--T-CAGGGGT
gi|29931                      :                                  AAA--ATC-GT--C---T--T----CTCT------AC-------T--TC------C-----A----T----A--T--A---------TA-------TGT--G--A-G---A---A---A-----A-AC--AA--A-----A----TGC----T------TG-A------TT--TTGAT----GC-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TT--TAC-T---A--AAATTTT----GA-AA---TCCA-TGG-CCCCT---G----
gi|29932                      :                                  AAA--ATC-TT--C---T--T----TCCT------AC-------T--TC------C----------T----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TG-AT-----TT--TTTAT----GT-C------TA----T----G----AAGTT---------C-----TC--TAT-C---A--AGATAAT----GA-AA---TTCA-TGG-CCCCT---G----GG--T-CTAGGGT
gi|29933                      :                                  AAA--ATC-TT--C---T---------CT------AC-------T--TC------C-----A----T----A--TATA---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TG-G------TT--ATGAT----GT-T------CA----T----T----AAGCC---------C-----TC--TGT-C---A--AGAT--T----GA-AA---TTCG-TGGAGTCTT---G----GGT-T-CAGG
gi|29935                      :                                  AAA--ATG-TT--C---T--C----TTTT---------------T--TCA-----C-----A----C----A--T--G---------T--------G-G--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TG-G------TG--ATGAT----GT-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TT--TAT-C---A--AAATTGT----GA-AA---TTCG-TGG-CCCCT---G----GA--T-CAGAGGT
gi|29936                      :                                  AAA--ATC-TT--C---T--T----CATT------AC-------T--TT------C-----A----T----A--T--A---------TAT------T-T--G--A-G---A---A------------C--TA--A-----A----T-C----A------TT-T------TT--ATGAT----AT-C------CG----T----G----AA-CC---------C-----CC--TAC-T---T--TAACTGT----AA-AA---TTAA-TGG-CCCCT---G----GG--T-CAGGGGT
gi|29942                      :                                  AAA--ATC-TT--C---T---------CT------AC-------T--TC------C-----A----C----AG-T--A---------G--------T-G--G--AAG---A---T---A-----A-AC--TC--A-----G----TGC----A------TG-A------TT--ATAAT----GT-T------CT----A----G----ACGCC---------T-----TC--TAC-C---A--GAATTGT----GA-AA---TTCA-TGG-TCCCT---G----GG--T-CAGGG
gi|29944                      :                                  AAA--ATC-TT--C---T---------CT------A--------T--CC------C-----A----T----A--T--AATA------T--------G-C--G--A-G---A---A---A-----A-AC--AA--A-----A----TGC----A------TG-A------TC--ATGAT----GTTC------CA----T----G----AAGCC---------------TC--TAC-T---T--AAATTGT----GA-AA---TT---------CCT---G----GG--T-CAGGGGT
gi|29945                      :                                  AAA--ATC-TT--T---T---------CT------AC-------T--CC------C-----A----C----G--T--A---------T--------C-TAGG--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TG-G------TT--ATAAT----GT-C------CA----T----G----GAGCT---------C-----TC--TAC-T---G--AAACTATGCCGGA-AA---TTAA-TGG-ACTCG---A----GG--T-CAGGGG
gi|29947                      :                                  AAA--ATT-TT--C---T--T----AAGC------AC-------T--TCA-----C-----A----C----A--T--G---------T--------G-G--G--A-G---A---G---A-----A-AC--T---------------GC----A------TG-A------TG--ATGAT----GT-C------TA----T----G----AAGCT---------C-----TC--TAC-C---C--TAATTGT----GA-AA---TTCA-TGG-CCACT--------GG--T-TAGGGGT
gi|30082                      :                                   AA--ATA-TT--T---T--T----CTCT------AA-------T--CC------C-----A----T----A--T--G---------TGT------T-T--T--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----AGT----A------TG-A------TT--ATGAT----GT-T------TA----T----G----AAGTA---------C-----TT--TAC-T---C--AAATTGT----AG-AA---TTCA-TGT-CTCTT---G----GA--G-TAGGGGT
gi|30097                      :                                     --ATT-TT--T---T--T----TTCT------TT-------T--TC------C-----A----T----A--T--A---------TAT------T-T--G--A-A---A---A---A-----A-AAAATG--A-----A----TAC----A------TG-G------AT--ATGAT----GT-C------CA----T----G----AAACT---------T-----CC--TAC-T---G--AAATT-T----AA-AA---ATCA-TGG-CCCCT---G----GG--T-
gi|30101                      :                                          -TT--T---T--T----CTCT------AC-------T--CC------C-----T----T----G--T--G---------TA-------T-T--A--A-A---A---A---A-----A-CC--TA--A-----AGGCATGC----A------TA-A------TT--ATGAT----GT-C------CA----T----ATTTAAAGTC---------T-----TC--TAC-T---C--AAATTGT----GA-AA---TTCA-AGT-CCCAT---G----GG--T-CAGTGGT
gi|30103                      :                                         tctT--T---T--T----GTTT------AC-------T--TT------C-----A----C----AAAT--A---------T--------C-T--A--A-A---A---A---G-----A-AC--TA--ATACTAA----TGC----A------TG-G------TT--ATAAT----GT-C------CA----T----A----AAGCC---------A-----TC--TAC-T---C--GAATTTT----GA-AA---TTCA-TGT-CCCCA---A----GG--T-CAGGGGT
gi|30107                      :                                             --C---T--T----CTCA------AC-------T--TT------C-----ACA--T----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-GC--TA--A-----A----TGC----T------TA-A------TT--ATGAT----GT-T------CA----T----G----AAA-----------C-----TC--TAT-C---A--AAATTGT----GA-AA---TTCA-TGA-CCTCT---G----GG--T-C
gi|30111                      :                                                    --T----CTCT------AC-------T--TC------C-----A----TTTATA--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TT--A-----A----TG-----A------TA-A------TT--ATTAT----GT-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TC--TAC-C---T--ATATTGT----GA-AA---TGCA-TGG-CCCCTTGGG----GG--T-GAGG
gi|30112                      :                                                    --T----CTTT------AC-------T--CT------A-----A----T----A--TGCA---------T--------T-T--G--A-G---A---C---A-----A-AC--TA--A-----T----TGC----A------TG-A------TC--ATGAT----GT-C------CA----T----G----AAATA---------C-----TC--TAT-A---T--AAGTAGT----GA-AA---TTAA-TGA-CACTT---G----GG--T-CAGG
gi|30117                      :                                                                                  C------C-----A----T----A--T--GCTGGT----T--------T-T--A--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A-----GC----A------TG-A------TT--ATGAT----GT-C------CA----T----G----AAGTC---------C-----TC--TAC-T---C--AAATTGT----GA-AA---TTTA-TGG-CATCT---T----GG--T-CAGGGGT
gi|30118                      :                                      tctacttttatctgtctgatgaTCT------AC-------T--CCGA----C-----A----T----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TG--A-----A----TGT----A------TG-ATTATGATT--ATGAT----GT-C------CA----T----G----AAGTG---------C-----TC--TAC-A---T--AAATTGT----GA-AA---TCCA-TTG-CCTTT---G----GA--T-CGGAGGT
gi|30119                      :                                                             CT------AC-------T--TC------C-----AAA--T----A--T--A---------T--------T-A--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----CGC----A------TG-A------TC--ATTAT----GT-C------AT----T----G----AAGCC---------T-----TC--TAT-C---A--AAAGTAT----GA-AA---TTCA-TGT-CCGAT---G----GG--T-ATGGGGT
gi|30120                      :                                                                                          -----A----T----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TG-G------TT--ATAAT----GT-C------CG----T----G----AAGCC---------T-----TC--TAC-T---T--GGATTTT----GA-AA---TTCA-TGG-CGTCT---G----GG--T-CAGGGGT
gi|30122                      :                                                              tacatgtat-------T--TC------C-----A----C----A--T--A---------TCT------T-T--G--A-G---AGCAA---A-----ATAC--TA--A-----A----TGC----A------CG-G------TT--ACAAT----GT-C------CA----T----G----AAACC---------CTCTAGTC--TAC-T---A--AAGTTCT----AA-AA---TTCG-TGG-TACCT---G----GG--T-CAGGGGT
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Reference ( family-78 )       :                      AAAT--T---AGAAA--ATC-TT--C---T--T----CTCT------AC-------T--TC------C-----A----T----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TG-A------TT--ATGAT----GT-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TC--TAC-C---A--AAATTGT----GA-AA---TTCA-TGG-CCCCT---G----GG--T-CAGGGGT
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gi|29776                      :                      AAAT--T---AGAAA--ATC-TT--T---T---------CT------AC-------T--TC------C-----AAATAT----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGT----A------TG-A------TT--ACAAT----G----------A----T----A----AAG----------------------------------ATTAT----GA-AA---TTCA-TGA-CCCCT---G----GG--T-CAGTGGT
gi|29777                      :                                             --C---T--T----CTCT------AC-------C--CC------C-----A----C----A--C--A---------T--------T-GAGG--A-G---A---A---A-----A-G---TA--A-----A----TGC----A------TG-G------TT--GTGATATATGC-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TT--TAC-T---C--AAATTGT----AA-AA---TTCA-TGA-ACCCA---G----GG--T-CAGGG
gi|29778                      :                               aaattttcaaagac--C---T--T----CTCT------AC-------C---C------C-----A----C----A--C--A---------T--------T-GAGG--A-G---A---A---A-----A-G---TA--A-----A----TGC----A------TG-G------TT--GTGATATATGC-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TT--TAC-T---C--AAATTGT----AA-AA---TTCA-TGA-ACCCA---G----GG--T-CAGGGGT
gi|29779                      :        aaattttcaaagacAAAT--T---AGAAA--ATT-TT--G---T--T----TTCTTTTTTAAT-------C--TA------C-----A----T----G--TGTA---------T--------C-T--A--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----T------TG-A------TT--ATGAT----GT-C------CA----T----A----GAACC---------T-----TC--TAT-C---A--AAAT--T----AA-AA---TCCA-TGG-CCTCT---G----GG--T-TTGGGGT
gi|29780                      :                                  AAG--ATT-TT--T---A--T----CTCT------GC-------C--CC------C-----A----A----A--C--A---------T--------T-TAGG--A-G---A---A---A-----A-CC--TA--A-----A----TGC----A------TG-G------TT--ATAAT----GT-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TC--TAC-CCATA--ATATT-C----AG-AA---TTTA-TGG-CCTCA---G----GG--T-CAGGGGT
gi|29782                      :                aaattttcaT--T---AGACA--ATC-TT--C---T---------CT------AC-------T--CC------C-----ACA--T----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TC--A-----A----TA-----A------TG-G------TA--ATGAT----GC-C------CA----T----G----AAGCC---------T-----TC--AAC-C---T--AACTTGT----GA-AA---TTCA-TGG---CCT---G----GA----CAGAGGT
gi|29783                      :          aaatgtattaaaatcT--T---AAAAA--ATC-TTGTC---TA-T----TTTT------AC-----------C------C-----A----T----G--G--A---------T--------G-T--G--G-G---ATTAA---A-----A-AC--TA--A-----A----TGT----A------TG-G------TT--ATGA--------------------------------AGCC---------C-----TC--TAC-C---A--AACTTGT----AA-AA---TTCA-TGG-CCCCT---G----GG--T-CAGGGGT
gi|29784                      :                             aaattAAA--ATC-TT--C------T----CT-T------AC-------CA-TCA-----C-----A----C----A--T--G---------T--------T-G--A--A-G---A---G---A-----A-AC--TA--A-----A----TAG----A------TG-G------TT--ATGAT----AT-T------CA----T----G----AATCC---------C-----CC--TAC-T---G--AAATTGT----AA-AA---TTCA-TGT-CCCAT---G----GG--T-TTAGGGT
gi|29785                      :                aaattttcaT--T---TGAAA--ATTGTT--T---T--C----CTTT------AC-------T--CC------C-----A----C----A--C--A---------T--------G-T--GGGA-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TT-A------TT--ATTAT----GT-C------CA----T-----------GTC---------C-----TG--TAC-T---A--GAGATGT----GA-AA---TTCA-T-G-CCCCT---G----GG--T-CAGGAGT
gi|29786                      :                 aaattAAATCGT---AGAAA--ATC-TT--T---T--T----CTCT------AC-------T--TA------T-----A----T----A--T--A---------TATAT----C-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TAC----A------TG-A------TT--ATGAT----GT-C------CA----T----G----AAGCT---------T-----TC--T
gi|29787                      :                         T--T---GGAAG--CTC-TC--G---T--T----TCCT------AC-------C--AA------C-----A----A----A--C--A---------T--------C-T--G--A-G---AGA-A---A-----A-AT--TA--A-----A----TGC----T------TG-G------TT--GTAAA----GT-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TC--TAC-T---C--AAATTGT----AA-AA---TCCA-TGG-TCCCA---A----GA--T-CAGGGG
gi|29788                      :                             aaattAAA--ATT-TT--C---T--TTAAGC---------AC-------T--TC------C-----A----C----A--C--A---------T--------G-T--G--G-G---A---G---A-----G-A----A--A-----C----TGC----A------TG-A------TG--ATGAT----GT-C------TA----T----G----AAGCT---------C-----TC--TAC-C---C--TAATTGT----GA-AA---TTCA-TGG-CCACT--------GG--T-TAAGGGT
gi|29789                      :                          aaattttcaAA--ATT-TT--CAAAT--T----CTTC------AT-------T--CC------C-----A----C----A--C--A---------T--------C-T--G--G-G---A---A---A-----A--C--TA--A-----A----TGC----A------TA-G------TT--ATGAT----GT-C------AA----T----G----AAACC---------C-----TG--TAC-C---A--AAATTGT----GA-AA----TCG-TTG-CCC-----G----AG--T-CAGGAG
gi|29790                      :                      AAAT--TTAAAAAAA--ATC-TT--C---T--T----CTCT------ACAA-----T--TG------C-----A----C----A--T--G---------T--------T-T--G--A-G---A---A---G-----A-AC--TA--G-----A----AGT----A------TG-G------T-----GAT----GT-AGAG---CA----G----G----GA-CC---------C-----TC--TAC-C---A--AAATTGT----AA-AT---TTTG-TGA-TCCCC---G----GG--T-CAGGGGT
gi|29791                      :                      AAAT--T---AGAAA--ATC-TT--C---TCTT----TTCT------AC-------G--TC------C-----AAA--T----A--C--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGG----A------TG-A------TT--ATGGT----GT-C------CA----T----A----AACCC---------C-----TC--TA
gi|29833                      :                       AAT--T---ACAAA--ATC-TT--C---T---------CT------AC-------T--TC------C-----A----T----A--T--A---------TAT------T-T--G--A-G---A---A---A-----A--------------------------------------------TT---TGAT----GT-C------CA----T----T----AAGCC---------C-----TC--TAC-T---T--AAATTGT----GA-AA---TTCA-TGT-CCTGTTG-G----GG--T-GAGG
gi|29834                      :                       AAT--T---AGAAA--ATC-TT--T---T---------CT------AC-------T--TC------C-----AAATAT----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGT----A------T--------------TGAT----A--C------AA----T----G----A-----------------------TA------A--AGATTAT----GA-AA---TTCA-TGA-CCCCT---G----GG--T-CAGTGGT
gi|29837                      :                       AAT--T---AGAAA--ATC-TT--C---T--T----TTCT------AT-------T--TC------T-----A----T----A--T--ACA-------T--------T-T--G--G-G---G---A---A-----A-AT--TA--A-----A----TGT----A------TG-T------TT--ATGAT----GT-C------CA----T----G----AACCC---------C-----TC--TAT-T---A--AGATTAT----GA-AG---TTC
gi|29838                      :                       AAT--T---AGAAA--ATCATT--C---T--C----TTCT------AC-------T--TC------C-----A----C----AA-T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-TC--TA--A-----A----TGC-----------TG-A------TTGAATGAT----AT-T------CA----T----G----AAG-C---------C-----TT--TAT-C---AGGAAGATAT----G--AA---TCCA-TGG-TCCCC---A----GG--T-CTGGGG
gi|29868                      :                         T--T---AGAAA--ATC-CT--C---T--C----C---------AC-------T--TC------A-----AGA--T----A--T--A---------T--------T-T--A--A-G---A---A---A-----A-AC--AA--A-----A----TGC----T------TG-A------TT--TTGAT----GT-G------CA----T----G----AAGCC---------C-----TG--CAC-T---A--AACTTTT----GA-AA---TGCA-TGG-CCCCT---G----
gi|29869                      :                         T--T---AAGAA--ATT-AT--T---T--T----CTCT------GC-------T--CC------C-----A----T----A--T--G---------TG-------T-T--T--A-A---A---A---A-----A-AC--TA--T-----A----AGT----A------TC-A------TT--GTGAT----GT-C------CA----T----A----AAATC---------C-----TC--TAC-T---C--AGATTGT----GA-AA---TTCA-TGG-CCCCT---G----AA--T-AAAGG
gi|29870                      :                         T--T---AGAAA--ATC-TT--C---T--T----TTCT------AC-------T--CTGA----T-----A----T----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-CC--TA--A-----A----TGC----A------TT-A------TT--ATGAT----TT-C------CA----T----G----AAGCC---------T-----TC--TTC-C---G--AAATTGT----GA-AA---TCCA-TGG-CCCCT---A----GA--T-CAGGGAT
gi|29873                      :                         T--T---AAGAA--ATC-CT--T---T--T----CTCT------AC-------T--CC------A-----A----T----A--T--G---------TGT------T-T--A--A-G---A---A---A-----A-TC--TA--A-----A----TGC----A------TG-A------TT--ATGAT----AT-C------CA----T----G----AAGTC---------C-----TC--TAT-T---C--AAATTGT----GA-AA---TTCA-TGG-TCCTT---G----GG--C-CAGTGGT
gi|29874                      :                         T--T---AGAAA--ATC-TT--G---T---------CT------AT-------T--TT------C-----A----T----A--T--G---------T--------T-TTTG--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--T-----A----TGC----A------TG-G------TT--ATGAT----GT-C------CA----T----G----AAACC---------C-----CC--TAC-T---A--AAGTTGT----AA-AA---TTCA-TGG-TCCCT---G----GG--T-CAGGGAT
gi|29876                      :                         T--T---AGAAA--ATC-TT--C---T--T----TTCT------AC-------T--TC------T-----A----T----A--T--A---------TAT------T-T--G--A-C---A---A---A-----A-AC--TA--A-----G----TGC----A------TG-A------TT--ATGAT----GT-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TT--TAT-C---A--AGATTTT----AA-AA---TTCACTGG-GCCTG---G----GG--T-CAGG
gi|29877                      :                         T--T---AGAAA--A----T--C---T--T----CTCT------AT-------T--TC------CGT---A----T----G--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-ACA-AA--A-----A----TGC----T------TG-A------TT--TTGAT----GT-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TC--TAC-T---A--AAATTTT----GA-AA---TTCA-TGG-CTCCT---
gi|29878                      :                         T--T---AGAAA--ATC-TT--CA--TAAT----ATCT------AC-------T--TC------C-----A----T----A--TGTA---------T--------T-T--G--A-T---A---A---A-----A-AC--AA--A-----AA---TGC----T------CA-A------TT--TTGAT----GT-CTATATACA----T----GTATAAAGCT---------T-----TC--TGC-T---A--AAATTTT----GA-AA---TTCA-TGG-CCCCT---G----
gi|29879                      :                         T--T---AAAAA--ATC-TT--C---T--T----TTCT------AC-------T--TT------C-----ACA--T----A--T--A---------T--------T-T--G--A-C---A---A---A-----A-TC--TG--A-----A----TGC----A------TG-A------TT--ATGAT----GT-C------TACGTAT----G----AAGCC---------C-----TC--TAT-C---A--AGAATAT----GA-AA---TCCA-TGG-CCCCA---G----GG--T-C
gi|29880                      :                         T--T---AGAAA--ATC-TT--C---T--T----CTCT------GC-------T--TT------G-----A----T----G--T--A---------T--------T-TT-G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TG-G------TT--ATGAT----GT-T------CA----T----G----AAGCC---------C-----CC--TAC-T---A--A--------------------CA-TGG-TCCCT---G----GG--T-CAGG
gi|29881                      :                         T--T---AGAAA--ATC-T-----------------CT------AC-------T--TC------C-----A----T----ACAT--A---------T--------T-T--G--A-T---A---A---A-----A-AA--AA--A-----A----TGT----A------TG-A------TT--ATG-------T-T------CA----T----G----AAGCC---------G-----TT--AAT-C---A--AAAGTGT----GA-TA---TTCA-TGG--CCCT---G----GGGTT-CAGG
gi|29884                      :                         T--T---AGAAA--ATC-TT--C---T--T----CCTT------AC-------T--TC------C-----A----TCT--A--T--A---------T--------T-T--A--A-G---A---A---A-----A-GC--AA--A-----A----TGT----T------TG-A------TT--TTTAT----GT-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TT--TAC-T---A--AAATTTT----GA-AA---TTCA-TGG-CCCCT---G----
gi|29888                      :                         T--T---AAGAA--ATC-CT--C---T---------CT------AC-------T--C------------------------------------------------T-T--A--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----GGC----A------TG-T------TT--ATTAT----GT-C------CA----T----G----GAATC---------C-----TCTATAC-T---C--AAACTGT----GA-AA---TTCA-TGG-CTCCT---G----GG--T-CAGGAGT
gi|29889                      :                         T--T---ATAAA--ATC-AT--C---C--T----CTTT------AC-------T--TT------C-----A----T----A--TATA---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--AA--A-----A----CAC----T------TG-A------CT--TTGAC----GT-C------CA----C----G----AAGTC---------C-----TC--TGC-A---A--GAATTTT----GA-AA---CTCA-TGA-CCCCT---
gi|29890                      :                         T--T---ACAAA--ATC-AT--C---G--T----CTCT------TC-------T--TT------C-----A----T----AGAT--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TA-G------TT--ATAAT----AT-C------CA----T----G----GAGCC---------C-----TT--TAT-A---A--ACATTTT----GA-AA---TTCA-TTG-TCCCT---T----AA--T-CGAGGAT
gi|29891                      :                         T--T---AGAAA--ACA-TT--C---T--T----CTCT------ACATGTAC-T--TC------T-----A----T----A--TATA---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AT--GA--A-----A----TGC----T------TG-A------TT--TTGAT----GT-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TT--TAC-A---A--GAATTTT----GA-AT---TCCA-TGT-TCCCT---GTA--GG--T-AAGG
gi|29892                      :                         T--T---AAAAA--ATC-TTT-C---T--T----TTCT------AA-------T--TTTA----C-----A----T----A--C--A---------T--------T-T--G--A-C---A---A---A-----A-TC--TG--A-----A----TGC----A------TG-A------TT--A--AT----AT-C------TA----TATATG----AAGCC---------C-----TC--TAT-C---A--AGATTTT----GA-AT---TCCA-TGG-CCTTG---G----GG--T-CAGG
gi|29893                      :                                         C-TT--T---T--T----TTCT------GT-------TGTCC------C-----A----T----A--T--G---------TGT------T-T--A--A-G---A---A---A-----A-G---TA--A-----A----AGC----A------TG-A------TT--ATGAT----GT-C------CT----T----G----AAGTC---------C-----TC--TACTC-------AATTGT----GA-AA---TCTA-TGG-CTCTT--------GG--T-CAGGGGT
gi|29894                      :            ttattaaatactaT--T---AGAAA--ATC-TT--C---T--T----CTCT------GC-------T--TC------T-----A----T----A--TGCA---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AA--CA--A-----A----AGC----T------TG--------TT--TTGAT----GT-C------CA----C----G----AAGCC---------C-----TT--TAC-T------AAATTTT----G--CA---TTCA-TGG-CCCTT---
gi|29895                      :                         T--T---AGGAA--ATC-TT--C---T--C----CTTT-------C-------A--TA------T-----A----T----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A--C--TA--A-----A----TAC----A------CA-G------TT--ATGAT----TT-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TC--TGC------------TGG----AA-AA---TTCA-TGG-CCCCT---G----GG--T-
gi|29897                      :                         T--T---AGAAA--ATC-TT--CA--T--T----CACT------AC-------TC-TC------C-----A----TT---A--T--A---------TACTTTTGAT-T--G--A-T---A---ACATA-----G-AC--TA--A-----A----TGG----A------TGGA------TT--AT----------C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TC--TAC-T---T--AAATTGA----CA-AA---TTCA-TGG-CTCCT---G----GG--T-CAGGGGT
gi|29898                      :                         T--T---AAAAG--ATC-AT--C---C--T----CTCT------AC-------C--CC------CT----A----C----A--C--A---------T--------G-TAGG--A-GCA-A---A---ACGAACA-AC--TA--A-----A----TGC----T------TG-A------TT--ATAAT----GT-C------CA----C----G----AAGCC---------C-----TC--TAC-T---A--AAAGTGT----TA-AA---TTCA-TGG-CCCCA---A----GG--T-GAGGGAT
gi|29924                      :                         T--T---AGTAA------TT--C---T--T----CTCT------AC-------T---C------C-----A----T----A--T--A---------TGT------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--AA--A-----AA---TGC----T------CG-A------TT--TTGGT----GT-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TC--TAC-T---T--AAATTTA----GA-AA---TTCA-TGG-CCCCT---G----
gi|29925                      :                 tattaaatc--T---AGAAA--ATC-AT--C---T---------CT------AC-------T--CC------C-----A----T----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TAT----A------TG-G------TT--ATGCC----AT-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TC--AAT-C---A--AAATTGT----GA-AA---TTAA-TGG-CCCCT---G----CA--T-CAGGGGT
gi|29927                      :                                    A--ATT-TT--T---T--T-----TGT------AC-------T--TC------C-----ACA--T----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-TC--TA--A-----A----TGC----A------TG-A------TT--ATGAT----GT-T------CA----T----G----AAACT---------G-----TC--TAT-C---A--AGATTAT----GA-AA---TTCA-TGG-TCCCT---G----GG--T-TTGGGGT
gi|29929                      :                                    ataagg-TT--C---T--C----CTCT------AC-------T--TC------C-----A----T----A--T--AAA-------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----AAAC--TA--A-----A----TGC----A------TG-A------TT--AGGAT----GT-C------CA----T----G----AAATC---------T-----TC--TAC-T---G--AAATGGT----GA-AA---T
gi|29930                      :                          taagattaAAA--ATC-TT--C---T--T----C---------AC-------T--TT------C-----A----T----A--T--A---------T--------T-TTTG--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TG-G------TT--ATAAT----GT-C------CA----T----G----AAGAC---------C-----CC--TAC-T---A--AGGTTGT----AA-AA---TTCA-TGG-CCCCT---G----GC--T-CAGGGGT
gi|29931                      :                                  AAA--ATC-GT--C---T--T----CTCT------AC-------T--TC------C-----A----T----A--T--A---------TA-------TGT--G--A-G---A---A---A-----A-AC--AA--A-----A----TGC----T------TG-A------TT--TTGAT----GC-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TT--TAC-T---A--AAATTTT----GA-AA---TCCA-TGG-CCCCT---G----
gi|29932                      :                                  AAA--ATC-TT--C---T--T----TCCT------AC-------T--TC------C----------T----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TG-AT-----TT--TTTAT----GT-C------TA----T----G----AAGTT---------C-----TC--TAT-C---A--AGATAAT----GA-AA---TTCA-TGG-CCCCT---G----GG--T-CTAGGGT
gi|29933                      :                                  AAA--ATC-TT--C---T---------CT------AC-------T--TC------C-----A----T----A--TATA---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TG-G------TT--ATGAT----GT-T------CA----T----T----AAGCC---------C-----TC--TGT-C---A--AGAT--T----GA-AA---TTCG-TGGAGTCTT---G----GGT-T-CAGG
gi|29935                      :                                  AAA--ATG-TT--C---T--C----TTTT---------------T--TCA-----C-----A----C----A--T--G---------T--------G-G--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TG-G------TG--ATGAT----GT-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TT--TAT-C---A--AAATTGT----GA-AA---TTCG-TGG-CCCCT---G----GA--T-CAGAGGT
gi|29936                      :                                  AAA--ATC-TT--C---T--T----CATT------AC-------T--TT------C-----A----T----A--T--A---------TAT------T-T--G--A-G---A---A------------C--TA--A-----A----T-C----A------TT-T------TT--ATGAT----AT-C------CG----T----G----AA-CC---------C-----CC--TAC-T---T--TAACTGT----AA-AA---TTAA-TGG-CCCCT---G----GG--T-CAGGGGT
gi|29942                      :                                  AAA--ATC-TT--C---T---------CT------AC-------T--TC------C-----A----C----AG-T--A---------G--------T-G--G--AAG---A---T---A-----A-AC--TC--A-----G----TGC----A------TG-A------TT--ATAAT----GT-T------CT----A----G----ACGCC---------T-----TC--TAC-C---A--GAATTGT----GA-AA---TTCA-TGG-TCCCT---G----GG--T-CAGGG
gi|29944                      :                                  AAA--ATC-TT--C---T---------CT------A--------T--CC------C-----A----T----A--T--AATA------T--------G-C--G--A-G---A---A---A-----A-AC--AA--A-----A----TGC----A------TG-A------TC--ATGAT----GTTC------CA----T----G----AAGCC---------------TC--TAC-T---T--AAATTGT----GA-AA---TT---------CCT---G----GG--T-CAGGGGT
gi|29945                      :                                  AAA--ATC-TT--T---T---------CT------AC-------T--CC------C-----A----C----G--T--A---------T--------C-TAGG--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TG-G------TT--ATAAT----GT-C------CA----T----G----GAGCT---------C-----TC--TAC-T---G--AAACTATGCCGGA-AA---TTAA-TGG-ACTCG---A----GG--T-CAGGGG
gi|29947                      :                                  AAA--ATT-TT--C---T--T----AAGC------AC-------T--TCA-----C-----A----C----A--T--G---------T--------G-G--G--A-G---A---G---A-----A-AC--T---------------GC----A------TG-A------TG--ATGAT----GT-C------TA----T----G----AAGCT---------C-----TC--TAC-C---C--TAATTGT----GA-AA---TTCA-TGG-CCACT--------GG--T-TAGGGGT
gi|30082                      :                                   AA--ATA-TT--T---T--T----CTCT------AA-------T--CC------C-----A----T----A--T--G---------TGT------T-T--T--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----AGT----A------TG-A------TT--ATGAT----GT-T------TA----T----G----AAGTA---------C-----TT--TAC-T---C--AAATTGT----AG-AA---TTCA-TGT-CTCTT---G----GA--G-TAGGGGT
gi|30097                      :                                     --ATT-TT--T---T--T----TTCT------TT-------T--TC------C-----A----T----A--T--A---------TAT------T-T--G--A-A---A---A---A-----A-AAAATG--A-----A----TAC----A------TG-G------AT--ATGAT----GT-C------CA----T----G----AAACT---------T-----CC--TAC-T---G--AAATT-T----AA-AA---ATCA-TGG-CCCCT---G----GG--T-
gi|30101                      :                                          -TT--T---T--T----CTCT------AC-------T--CC------C-----T----T----G--T--G---------TA-------T-T--A--A-A---A---A---A-----A-CC--TA--A-----AGGCATGC----A------TA-A------TT--ATGAT----GT-C------CA----T----ATTTAAAGTC---------T-----TC--TAC-T---C--AAATTGT----GA-AA---TTCA-AGT-CCCAT---G----GG--T-CAGTGGT
gi|30103                      :                                         tctT--T---T--T----GTTT------AC-------T--TT------C-----A----C----AAAT--A---------T--------C-T--A--A-A---A---A---G-----A-AC--TA--ATACTAA----TGC----A------TG-G------TT--ATAAT----GT-C------CA----T----A----AAGCC---------A-----TC--TAC-T---C--GAATTTT----GA-AA---TTCA-TGT-CCCCA---A----GG--T-CAGGGGT
gi|30107                      :                                             --C---T--T----CTCA------AC-------T--TT------C-----ACA--T----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-GC--TA--A-----A----TGC----T------TA-A------TT--ATGAT----GT-T------CA----T----G----AAA-----------C-----TC--TAT-C---A--AAATTGT----GA-AA---TTCA-TGA-CCTCT---G----GG--T-C
gi|30111                      :                                                    --T----CTCT------AC-------T--TC------C-----A----TTTATA--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TT--A-----A----TG-----A------TA-A------TT--ATTAT----GT-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TC--TAC-C---T--ATATTGT----GA-AA---TGCA-TGG-CCCCTTGGG----GG--T-GAGG
gi|30112                      :                                                    --T----CTTT------AC-------T--CT------A-----A----T----A--TGCA---------T--------T-T--G--A-G---A---C---A-----A-AC--TA--A-----T----TGC----A------TG-A------TC--ATGAT----GT-C------CA----T----G----AAATA---------C-----TC--TAT-A---T--AAGTAGT----GA-AA---TTAA-TGA-CACTT---G----GG--T-CAGG
gi|30117                      :                                                                                  C------C-----A----T----A--T--GCTGGT----T--------T-T--A--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A-----GC----A------TG-A------TT--ATGAT----GT-C------CA----T----G----AAGTC---------C-----TC--TAC-T---C--AAATTGT----GA-AA---TTTA-TGG-CATCT---T----GG--T-CAGGGGT
gi|30118                      :                                      tctacttttatctgtctgatgaTCT------AC-------T--CCGA----C-----A----T----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TG--A-----A----TGT----A------TG-ATTATGATT--ATGAT----GT-C------CA----T----G----AAGTG---------C-----TC--TAC-A---T--AAATTGT----GA-AA---TCCA-TTG-CCTTT---G----GA--T-CGGAGGT
gi|30119                      :                                                             CT------AC-------T--TC------C-----AAA--T----A--T--A---------T--------T-A--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----CGC----A------TG-A------TC--ATTAT----GT-C------AT----T----G----AAGCC---------T-----TC--TAT-C---A--AAAGTAT----GA-AA---TTCA-TGT-CCGAT---G----GG--T-ATGGGGT
gi|30120                      :                                                                                          -----A----T----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TG-G------TT--ATAAT----GT-C------CG----T----G----AAGCC---------T-----TC--TAC-T---T--GGATTTT----GA-AA---TTCA-TGG-CGTCT---G----GG--T-CAGGGGT
gi|30122                      :                                                              tacatgtat-------T--TC------C-----A----C----A--T--A---------TCT------T-T--G--A-G---AGCAA---A-----ATAC--TA--A-----A----TGC----A------CG-G------TT--ACAAT----GT-C------CA----T----G----AAACC---------CTCTAGTC--TAC-T---A--AAGTTCT----AA-AA---TTCG-TGG-TACCT---G----GG--T-CAGGGGT
gi|30125                      :                                                                                                                               tatt-T--G--A-GCATA---A---A-----ATAC--TA--A-----A----TGT----AATATGATG-A------TC--ATGAT----GT-C------CA----T----T----AGGCC---------C-----TC--CAC-C---G--AAATTGT----AA-AA---TTCA-TGG-CCTCT---G----GG--T-CAGGG
gi|30127                      :                                                                          acttgactataaatgttaaacg----T----A--T--T---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TAA----A------TG-G------AT--ATGAT----GT-C------CA----C----G----AATCC---------C-----CC--TAC-A---A--AAGTTGT----AA-AA---TTCA-TGG-TCCCT---G----GG--T-CAGTGGT
gi|30135                      :                                                                                      tatg-----A----T----G--T--A---------T--------T-T--G--A-GG--A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TG-A------TT--ATGCT----GT-C------CA----T----G----AAGCG---------A-----TC--TAC-C---T--AAATGTT----GA-AG---TTCA-TGG-CTCCT---G----GG--T-CAGGTGT
gi|30142                      :                                                                                                ----T----G--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----T-AC--TA--A-----A----TGCATGCA------TG-A------TT--ATAAT----GT-C------CA----T----G----AAGCT---------C-----TC--TAC-C------TGATTGT----GA-AA---TTAA-TAA-CTCCTG--G----GG--T-CAGGG
gi|30158                      :                                                                                                                                     --G--A-G---A---T---A-----A-AC--AG--A-----A----TGC----A------TG-A------TT--ATGAT----GT-T------CA----T----A----AAGCC---------C-----TC--TAT-C---A--AAATCGT----GA-AA---CGCA-TGG-CTCCT---G----GG--T-CAGGGGT
gi|30160                      :                                                                                                                                     --G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TG-T------CT--ATGAT----AT-C------CA----T----G----AAGCC---------C------C--GAC-T---A--GAAGTGT-----A-AATGTTTTA-TGG-CCCCT---G----GG--T-CAG
gi|30163                      :                                                                                                                                        --A-G---A---A---A-----A-AG--TG--A-----A----TGT----A------GG-G------CT--ATGAT----GT-C------CA----C----A----AAGCC---------C-----TC--TAC-T---G--ACATTGT----GA-AA---TTCA-CGG-CCCCT---G----GC--T-CAGGG
gi|30169                      :                                                                                                                                             ---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TG-A------TT--ATGAT----GT-C------CA----T----G----AAGTC---------A-----TC--TAC-T---T--CAGCTGT----GA-AA---TTCA-TGA-TCCCA---G----GG--T-CAGGGGT


blockSeqs                     :                          CG TAA          G  GT AAA TTAAGC     TTTTTA  AGTGTAC GT  TATACA TATGT AATA TTAT AA TT CATTGTATA ACTTTTGA   AA      CAT TTA     CGAAC A         TACTA GGCA        ATATGA    TTATGA         ATAT    TATATA            TATA     TATGTAGGG             CCATA                                    TGG CATA  GT
blockSeqs                     :                          .  .            A  T  A   CTTT       .       ATGTAC  A   ATACA  GT    AATA TGG  CA AT CTGGT     ATAT       AG      CA  GCA     .     T         .     A           .         T              ATAT    GAG               TTTA     .                     CAGG                                     TG  GAT   T 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  A   AATA       .       AA      C   GA     T     CA   GT   GA GT ATA       ATGT       AT      G   GA      .     T         .     A           .         .              .       .                 .        .                     CA                                       G   TA    . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   ATT        .       .       .   TA     .     AA   CT   AA GT CA        ATAT       AG      .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TT                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   CT         .       .       .   GA     .     AA   T    A  AT AA        AT         AG      .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TT                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TT         .       .       .   A      .     CA   .    G  AT .         AT         AG      .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     CA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TT         .       .       .   A      .     AA   .    .  GC .         AA         AG      .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TC         .       .       .   A      .     GA   .    .  AT .         AG         TT      .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     CA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TT         .       .       .   .      .     CA   .    .  GC .         GT         AG      .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TC         .       .       .   .      .     CA   .    .  .  .         AT         TT      .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   CT         .       .       .   .      .     CA   .    .  .  .         GT         AG      .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TC         .       .       .   .      .     AA   .    .  .  .         AT         T       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     CA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TT         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         GT         .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         GT         .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     CA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         AT         .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TC                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TT         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         GT         .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     CA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TT         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         AT         .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     CA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TT         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         CT         .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     CA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         G          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TC                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         A          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TC                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         A          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TT                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TC                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TT                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TT                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TT                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TC                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TT         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TC                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     CA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     CT                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   CC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     CA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TG                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TT         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TC                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     CC                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TT         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     CA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   CT         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     CA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   CC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TT                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TT         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TC                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TT         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     CG                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TC                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TT         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     CA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     CA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TT         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     CA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TT         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TC                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   CC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     AA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                          .  .            .  .  .   TC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     AA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                                          .  .  .   TC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     AA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                                          .  .  .   TC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     CA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                                          .  .  .   CC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TC                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                                          .  .  .   TC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TT                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                                          .  .  .   TC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                                          .  .  .   TT         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TT                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                                          .  .  .   CT         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     CA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                                          .  .  .   TC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     CA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                                          .  .  .   TA         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TG                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                                          .  .  .   TC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                                          .  .  .   TT         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                                          .  .  .   TC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     CA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                                          .  .  .   TG         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     CA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                                          .  .  .   TC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     CA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                                          .  .  .   TC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TT                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                                          .  .  .   TC         .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     CA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                                          .  .  .   T          .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TT                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                                          .  .  .   T          .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TG                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                                          .  .  .   .          .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     CC                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                                          .  .  .   .          .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TC                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                                          .  .  .   .          .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TG                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                                          .  .  .   .          .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TC                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                                          .  .  .   .          .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TC                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                                          .  .  .   .          .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     CA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                                             .  .   .          .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     CT                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                                             .  .   .          .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     AT                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                                             .  .   .          .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TC                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                                             .  .   .          .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     AT                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                                             .  .   .          .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     CA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                                             .  .   .          .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TT                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                                                .   .          .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TA                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                                                    .          .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     CG                                       .   .     . 
blockSeqs                     :                                                    .          .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     AA                                       .   .       
blockSeqs                     :                                                               .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     CT                                       .   .       
blockSeqs                     :                                                               .       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     CA                                       .   .       
blockSeqs                     :                                                                       .       .   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TA                                       .   .       
blockSeqs                     :                                                                                   .      .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TG                                       .   .       
blockSeqs                     :                                                                                          .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     TT                                       .   .       
blockSeqs                     :                                                                                          .     .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     A                                        .           
blockSeqs                     :                                                                                                .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     A                                        .           
blockSeqs                     :                                                                                                .    .    .  .  .         .          .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     T                                        .           
blockSeqs                     :                                                                                                                                     .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     C                                                    
blockSeqs                     :                                                                                                                                     .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     .                                                    
blockSeqs                     :                                                                                                                                     .       .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                     .                                                    
blockSeqs                     :                                                                                                                                             .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                                                                          
blockSeqs                     :                                                                                                                                             .   .       .     .         .     .           .         .              .       .                 .        .                                                                          


blockSeqCons                  :                      
originalCons                  :                      AAAT--T---AGAAA--ATC-TT--C---T--T----CTCT------AC-------T--TC------C-----A----T----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TG-A------TT--ATGAT----GT-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TC--TAC-C---A--AAATTGT----GA-AA---TTCA-TGG-CCCCT---G----GG--T-CAGGGGT
finalCons                     :                      AAAT--T---AGAAA--ATC-TT--C---T--T----CTCT------AC-------T--TC------C-----A----T----A--T--A---------T--------T-T--G--A-G---A---A---A-----A-AC--TA--A-----A----TGC----A------TG-A------TT--ATGAT----GT-C------CA----T----G----AAGCC---------C-----TC--TAC-C---A--AAATTGT----GA-AA---TTCA-TGG-CCCCT---G----GG--T-CAGGGGT