lowQualScore : 1111111 22222222 111111111111 1111
lowQualScore : 77 3 2 3 333 2 1 1 888 666666 3 1 3 22 77 333 0000000 1 44444444 22 3 99 1 1 000000000000 44 3 2222 2222 1 11 2 33 1 222 555555 0
lowQualScore : .. . . . ... . . . ... ...... . . . .. .. ... ....... . ........ .. . .. . . ............ .. . .... .... . .. . .. . ... ...... .
lowQualScore : 66 3 2 3 999 2 1 1 666 555555 3 7 3 33 66 000 5555555 7 11111111 22 2 22 6 6 555555555555 22 2 3333 6666 2 77 4 33 2 111 222222 1
consensus : TTTCG-CAT-AG-AG-TGGGT---CAA-GTCT-CCA-T-C-GT------AAACTG-A-GT-A--AA--ATA---TGG-TA---G-TGNATG-TT-CA--T-GTG--TAA-AATG-TTT-----TG-T--AAAT--AAA-AGT--ATG----G-A--GAC-TTGACCCACT--CT-A---T------GAAAAAA
Reference ( gi|88467 ) : TTTCA-CAT-AG-AG-TGGGT---CAA-GTCT-CCA-T-C-GT------AAACTG-A-GT-A--AA--ATA---TGG-TA---G-TGAATG-TC-CA--T-GTG--TAA-AATG-TTT-----TG-T--AAAT--AAA-AGC--ATG----G-A--GAC-TTGACCCACT--CT-A---T------GAAAAAA
gi|88468 : TTTCA-CAT-AG-AG-TGGGT---CAA-GTCT-CCA-T-C-GT------AAACTG-A-GT-A--AA--ATA---TGG-TA---G-TGAATG-TC-CA--T-GTG--TAA-AATG-TTT-----TG-T--AAAT--AAA-AGC--ATG----G-A--GAC-TTGACCCACT--CT-A---T------GAAAAA
gi|88468 : TTTTT-CAT-AG-AG-TGGGT---CAA-GTCT-CCA-TGC-TT------TTATTT-A--C-A--AA--ACA---TTT-TACACA-TGGACA-TT-CA--C------TAC-CATA-TTT-----TACT--CAGT--TTA-CG---ATG----G-A--GAC-TTGACCCACT--CT-A---T------GTGAAA
gi|88465 : TTTTG-CAT-AG-AG-TGGGT---CAA-GTCT-CCA-T-T-GT------AAACTG-A-GT-A--AA--ATA---TGG-TA---G-TATATG-TT-CA--T-GTG--TAA-AATG-TTT-----AG-T--AAAT--AAA-AGT--ATG----G-A--GAC-TTGACCCACT--CT-A---T------GAAAAAA
gi|88465 : TTTTT-CAT-AG-AG-TGGGT---CAA-GTCT-CCA-TAC-TT------TTATTT-A-CT-A--AAC-ATT---TTA-CAC--A-TGAA------CA--T-ATAC-TAC-CATA-TTT-----TACT--CAGTTTACA-A-----TG----G-A--GAC-TTGACCCACT--CT-A---T------GCAAAA
gi|88466 : TTTTG-CAT-AG-AG-TGGGT---CAA-GTCT-CCA-T-T-GT------AAACTG-A-GT-A--AA--ATA---TGG-TA---G-TATATG-TT-CA--T-GTG--TAA-AATG-TTT-----AG-T--AAAT--AAA-AGT--ATG----G-A--GAC-TTGACCCACT--CT-A---T------GAAAAAa
gi|88466 : TTTTT-CAT-AG-AG-TGGGT---CAA-GTCT-CCA-TAC-TT------TTATTT-A-CT-A--AAC-ATT---TTA-CAC--A-TGAA------CA--T-ATAC-TAC-CATA-TTT-----TACT--CAGTTTACA-A-----TG----G-A--GAC-TTGACCCACT--CT-A---T------GCAAAA
gi|88471 : TTTCA-CAT-AG-AG-TGGGT---CAA-GTCT-CCA-T-T-GT------AAACTG-A-GT-A--AA--ATA---TGGTTA---G-TGTATG-TTGCA--TAGTG--AAA-AATG-TTT-----TG-T--AAAT--AAA-AGT--ATG----G-A--GAC-TTGACCCACTACTT-A---T------GAAAAAA
gi|88471 : TTTCA-TA--AGTAG-TGGGT---CAA-GTCT-CCA-T-
gi|88469 : tttcacatagagtgggtcaagtctccattgtaaactgagtaaaatatggttagtgtatgttgcatagtgaaaaatgttttgtaaataaaagtTTTCG-CAT-AG-AG-TGGGT---CAA-GTCT-CCA-T-T-GT------AAACTG-A-GT-A--AA--ATA---TGA-TA---T-TGTATGTTT-CA--T-GTG--TAA-AATG-TTT-----TG-TTAAAAC--AAAGAGT--ATG----G-A--GAC-TTGACCCACT--CT-A---T------GAAAAAAaaa
gi|88469 : TTTTT-CAT-AG-AG-TGGGT---CAA-GTCT-CCA-T-
gi|88472 : tttcgcatagagtgggtcaagtctccattgtaaactgagtaaaatatgatattgtatgtttcatgtgtaaaatgttttgttaaaacaaagagtTTTCA-CAT-AG-AG-TGGGT---CAA-GTCT-CCA-T-T-GT------AAACTG-A-GT-A--AA--ATA---TGGTTA---G-TGTATG-TTGCA--TAGTG--AAA-AATG-TTT-----TG-T--AAAT--AAA-AGT--ATG----G-A--GAC-TTGACCCACTACTT-A---T------GAAAAAa
gi|88472 : TTTCA-TA--AGTAG-TGGGT---CAA-GTCT-CCA-T-
gi|88470 : ttTTTCG-CAT-AG-AG-TGGGT---CAA-GTCT-CCA-T-T-GT------AAACTG-A-GT-A--AA--ATA---TGA-TA---T-TGTATGTTT-CA--T-GTG--TAA-AATG-TTT-----TG-TTAAAAC--AAAGAGT--ATG----G-A--GAC-TTGACCCACT--CT-A---T------GAAAAAacttttatttacaaaacatttttcactatgcaacatacactaaccatattttactcagtttacaatggagacttgacccactctatgtgaaa
gi|88470 : TTTTT-CAT-AG-AG-TGGGT---CAA-GTCT-CCA-T-
gi|88475 : TTTCA-CAT-AG-AG-TGGAT---CAA-GTCT-CCA-T-T-GT------AAACTG-A-GTTA--AA--ATA------------G-TG------T-CA--T-GTG--TAA-AATG-TTT------G-T--AAAT--AAA-AGT--ATG----G-A--GAC-TTGACCCACT--CT-A---T------GAAAAAAactctttgttttaacaaaacattttacacatgaaacatacaatatcatattttactcagtttacaatggagacttgacccactctatgcgaaa
gi|88475 : TTTTT-CAT-AG-AG-TGGGT---CAA-GTCT-CCA-T-
gi|88476 : tttcacatagagtggatcaagtctccattgtaaactgagttaaaatagtgtcatgtgtaaaatgtttgtaaataaaagtTTTCA-CAT-AG-AG-TGGAT---CAA-GTCT-CCA-T-T-GT------AAACTG-A-GTTA--AA--ATA------------G-TG------T-CA--T-GTG--TAA-AATG-TTT------G-T--AAAT--AAA-AGT--ATG----G-A--GAC-TTGACCCACT--CT-A---T------GAAAAAa
gi|88476 : TTTTT-CAT-AG-AG-TGGGT---CAA-GTCT-CCA-T-
gi|88474 : TTTCG-TAT-AG-AG-TGGGT---CAA-GTCT-C-A-T-T-GT------GAACTG-A-GT-G--AA--ATA---TGT-TA---G-TGCATG-TT-CA--T-ATG--T---AATG-TTT-----TG-T---AAT--AAA-AGT--ATG----G----GAC-TTGACCC-CT--CT-A---T------GAAAAAacttttatttacaaacattttacacatgacactattttaactcagtttacaatggagacttgatccactctatgtgaaa
gi|88474 : TTTTT-CAT-AG-AG--GGGT---CAA-GTC--CCA-TAC-TT------TTATTA----C-A--AA--ACA---TTA-CAT--A-TGAA------CA--T-GCAC-TAA-CATA-TTT-----CACT--CAGT--TCA---C--AAT----G-A--GAC-TTGACCCACT--CT-A---TAC----GAAA
gi|88473 : TTTCG-CAT-GG-AG-TGGGT---CAA-GTCT-CCA-T-T-GT------GACCTG-A-GT-G--AA--ATA---TGT-TA---G-TCCATG-TT-CA--T-----------ATA-TTT-----TG-T--ACAT--AAA-AGT--ATGTATCG-A--GAC-TTGACCCACT--CT-A---T------AAAAAAA
gi|88477 : TTTCA-CATTAG-AG-TGGGT---CAA-GTCT-CTA-T-T-GTA-----AAACTG-A-GT-A--AA--ATA---TGG-TA---G-AGTATGTTT-CA--T-GTG--TAA-AATGTTTT-----TG-T--AAAT--
gi|88481 : TTTCGGCATCAG-AGCTGGGTTCCCCA-GT-T-CCA-T-T-GC------AAACTGGA-GT-T--AA--ATC---TGG-TA---G-TGTATG-TT-CC--T-ATG--TAA-AATG-TTG-----TG----AATT--AAA-ATTA-ATG----G-A--GACTTTGACCCA-T--CT-A---T------GAAAAA
gi|88481 : TTTTT-CAT-AG-A--TGGGT---CAAAGTCT-CCA-T-
gi|88480 : tttcggcatcagagctgggttccccagttccattgcaaactggagttaaatctggtagtgtatgttcctatgtaaaatgttgtgaattaaaattaTTTCGGCATCAG-AGCTGGGTTCCCCA-GT-T-CCA-T-T-GC------AAACTGGA-GT-T--AA--ATC---TGG-TA---G-TGTATG-TT-CC--T-ATG--TAA-AATG-TTG-----TG----AATT--AAA-ATTA-ATG----G-A--GACTTTGACCCA-T--CT-A---T------GAAAAA
gi|88480 : TTTTT-CAT-AG-A--TGGGT---CAAAGTCT-CCA-T-
gi|88478 : tttcggcatcagagctgggttccccagttccattgcaaactggagttaaatctggtagtgtatgttcctatgtaaaatgttgtgaattaaaattaTTTCG-CAT-GG-AG-TAGGT---AAA-GCCT-CCA-T-T-GT------CAACGG-A-AT-G--AA--ATAATTTAG------G-TGCATG-TT-CA--T-ATG--TTT-AATG-TTT-------------GT--AAA-AACTGATG----GGA--GAC-TTGA-CCACT--CTAA---T------GAAAAAA
gi|88478 : TTTCA-T-T-AG-AG-TGG-T---CAA-GTCTCCCA-T-CAGTTTTTACAAAC---A-TT-A--AAC-ATA--------------TGAA------CA--T-GCACCTAA-ATTA-TTTCATTCCG-T--TGAC--A--------ATG----G-A--GGC-TTTACCTACT--CC-A---T------GCGAAA
gi|88484 : TTTTT-CAT-AG-AG-TGGGT---CAC-GTCT-CAA-T-aaa
gi|88482 : catgtgtaaaatgttttgtaaataaaagtTTTCG-AAT-GG-AA-TGGGT----AA-ATCT-CCA-T-T-GT--------------------------TA---TGT-TA---G-TGCGTG-TG--A--C-GTG--TAA-AATG-TTT------G-T--AAAT--TAA-AGT--ATG----G-C--GAC-TTGAGCCACT--CT-A---TATGGGGGAAAAAA
gi|88485 : TTTTT-CAT-AG-AG-TGAGC---CAG-GTCT-TCA-T-
gi|88483 : tgtgtataatgttttgtgaataaaagtTTTCA-CAT-AG-AG-TGAGT---CAA-GTCT-CCA-T-T-GT------AAACTG-A-GT-A--a
gi|88486 : TTTTT-CAT-AG-AG-TGGGT---CAA-GTCT-CCA-T-
gi|88482 : ttgtgaactgaaatCA-TAT-AG-AG-TGGCT---CAA-GTCG-CCA-T-a
gi|88479 : tttcgaatggaatgggtaaatctccattgttatgttagtgcgtgtgacgtgtaaaatgtttgtaaattaaagt-CAT-AG-AGCTGGGT---CA--GTCT-ACAAT-T-GT------AA-CTG-A-GT-A--AAACATA---TGG-TA---GCTGTATGTTT-CACTT-ATG--TAATATTG-TTT-----TG-T---TAT--AAA-AGT--ATG----G-ATCAGC-TTGACCCA-T--CT-A---T------GAAAAAAggggaaaaaa
gi|88473 : ttccgtAT-AG-AG-TGGGT---CAA-GTCT-CGA-TAC-AT------ACTTTT-ATGT-ACAAA--ATA---TA---------TGAA------CA--T-G-GACTAA-CATA-TTT-----CA-CTCAGGT--CAC-A----ATG----G-A--GAC-TTGACCCACT--CC-A---T------GCGAAA
gi|88484 : -CA--T-GTG--TAA-AATG-TTT-----TG-T--AAAT--AAA-AGT--ATT----G-A--GAC-GTGACCCACT--CT-A---T------GAAAAAaaaaaaa
gi|88485 : --T-GTG--TAT-AATG-TTT-----TG-T--GAAT--AAA-AGT--ATG----A-A--GAC-CTGGCTCACT--CT-A---T------GAAAAAA
gi|88486 : T-----TG-T--GAAC--TGA-AAT--ATG----G-A--GAC-TTGACCCACT--CT-A---T------GAAAAAA
gi|88471 : --ATG----G-A--GAC-TTGACCCACT--CT-A---T------GTGAAA
gi|88469 : --ATG----G-A--GAC-TTGACCCACT--CT-A---T------GCGAAAtgtaaactgagtaaaatatggttagtgtatgttgcatagtgaaaaatgttttgtaaataaaagtatggagacttgacccactacttatgaaaaaa
gi|88472 : --ATG----G-A--GAC-TTGACCCACT--CT-A---T------GTGAAAtgtaaactgagtaaaatatgatattgtatgtttcatgtgtaaaatgttttgttaaaacaaagagtatggagacttgacccactctatgaaaaaa
gi|88470 : tttttcataagtagtgggtcaagtctccatacttttatttacaaaacatttttcactatgcaacatacactaaccatattttactcagtttaca--ATG----G-A--GAC-TTGACCCACT--CT-A---T------GCGAAA
gi|88475 : tttttcatagagtgggtcaagtctccatactctttgttttaacaaaacattttacacatgaaacatacaatatcatattttactcagtttaca--ATG----G-A--GAC-TTGATCCACT--CT-A---T------GTGAAA
gi|88476 : --ATG----G-A--GAC-TTGATCCACT--CT-A---T------GTGAAAtgtaaactgagttaaaatagtgtcatgtgtaaaatgtttgtaaataaaagtatggagacttgacccactctatgaaaaaa
gi|88477 : tttttcatagagtgggtcaagtctccatacttttatttacaaacattttacacatgacactattttaactcagtttaca--ATA----G-A--GAC-TTGACCCACT--CT-AATGT------GAAA
gi|88483 : --ATG----G-A--GAC-TTGACTCACT--CT-A---T------GTGAAAtgtaaaactgagtaaaatatggtagagtatgtttcatgtgtaaaatgtttttgtaaat
Alignments
lowQualScore : 6 6 6 777 2 4 2 4 4 33 333 4 2 5 8 4 22 4 2 2 0 55 4 6 2 4444 22 4 55 2 555555
lowQualScore : . . . ... . . . . . .. ... . . . . . .. . . . . .. . . . .... .. . .. . ......
lowQualScore : 3 3 3 444 1 3 1 2 2 11 999 4 2 3 9 2 88 0 0 0 5 22 0 0 0 2222 88 0 55 0 888888
consensus : TTTCG-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGT-AAACTG-AGT-AAA--ATA---TGG-TAG-TGTATG-TT-CA--T-GTGTAA-AATG-TTTTGT--AAATAAA-AGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAAA
Reference ( family-767 ) : TTTCG-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TCGT-AAACTG-AGT-AAA--ATA---TGG-TAG-TGNATG-TT-CA--T-GTGTAA-AATG-TTTTGT--AAATAAA-AGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAAA
gi|88465 : TTTTG-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGT-AAACTG-AGT-AAA--ATA---TGG-TAG-TATATG-TT-CA--T-GTGTAA-AATG-TTTAGT--AAATAAA-AGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAAA
gi|88466 : TTTTG-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGT-AAACTG-AGT-AAA--ATA---TGG-TAG-TATATG-TT-CA--T-GTGTAA-AATG-TTTAGT--AAATAAA-AGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAA
gi|88467 : TTTCA-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TCGT-AAACTG-AGT-AAA--ATA---TGG-TAG-TGAATG-TC-CA--T-GTGTAA-AATG-TTTTGT--AAATAAA-AGC-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAAA
gi|88468 : TTTCA-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TCGT-AAACTG-AGT-AAA--ATA---TGG-TAG-TGAATG-TC-CA--T-GTGTAA-AATG-TTTTGT--AAATAAA-AGC-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAA
gi|88469 : TTTCG-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGT-AAACTG-AGT-AAA--ATA---TGA-TAT-TGTATGTTT-CA--T-GTGTAA-AATG-TTTTGTTAAAACAAAGAGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAAA
gi|88470 : TTTCG-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGT-AAACTG-AGT-AAA--ATA---TGA-TAT-TGTATGTTT-CA--T-GTGTAA-AATG-TTTTGTTAAAACAAAGAGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAA
gi|88471 : TTTCA-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGT-AAACTG-AGT-AAA--ATA---TGGTTAG-TGTATG-TTGCA--TAGTGAAA-AATG-TTTTGT--AAATAAA-AGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACTACTT-AT------GAAAAAA
gi|88472 : TTTCA-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGT-AAACTG-AGT-AAA--ATA---TGGTTAG-TGTATG-TTGCA--TAGTGAAA-AATG-TTTTGT--AAATAAA-AGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACTACTT-AT------GAAAAA
gi|88473 : TTTCG-CAT-GGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGT-GACCTG-AGT-GAA--ATA---TGT-TAG-TCCATG-TT-CA--T---------ATA-TTTTGT--ACATAAA-AGT-AT-GTATCGA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------AAAAAAA
gi|88474 : TTTCG-TAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTC-A-TTGT-GAACTG-AGT-GAA--ATA---TGT-TAG-TGCATG-TT-CA--T-ATGT---AATG-TTTTGT---AATAAA-AGT-AT-G----G---GAC-TTGACCC-CT--CT-AT------GAAAAA
gi|88475 : TTTCA-CAT-AGAG-TGGAT---CAAGTCTCCA-TTGT-AAACTG-AGTTAAA--ATA---------G-TG------T-CA--T-GTGTAA-AATG-TTT-GT--AAATAAA-AGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAAA
gi|88476 : TTTCA-CAT-AGAG-TGGAT---CAAGTCTCCA-TTGT-AAACTG-AGTTAAA--ATA---------G-TG------T-CA--T-GTGTAA-AATG-TTT-GT--AAATAAA-AGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAA
gi|88477 : TTTCA-CATTAGAG-TGGGT---CAAGTCTCTA-TTGTAAAACTG-AGT-AAA--ATA---TGG-TAG-AGTATGTTT-CA--T-GTGTAA-AATGTTTTTGT--AAAT
gi|88478 : TTTCG-CAT-GGAG-TAGGT---AAAGCCTCCA-TTGT-CAACGG-AAT-GAA--ATAATTTAG---G-TGCATG-TT-CA--T-ATGTTT-AATG--TTTGT--A---AAA-ACTGATGG----GA--GAC-TTGA-CCACT--CTAAT------GAAAAAA
gi|88479 : TTCCGTCAT-AGAGCTGGGT---CA-GTCTACAATTGT-AA-CTG-AGT-AAAACATA---TGG-TAGCTGTATGTTT-CACTT-ATGTAATATTG-TTTTGT---TATAAA-AGT-AT-G----GATCAGC-TTGACCCA-T--CT-AT------GAAAAAA
gi|88480 : TTTCGGCATCAGAGCTGGGTTCCCCAGT-TCCA-TTGC-AAACTGGAGT-TAA--ATC---TGG-TAG-TGTATG-TT-CC--T-ATGTAA-AATG-TTGTG---AATTAAA-ATTAAT-G----GA--GACTTTGACCCA-T--CT-AT------GAAAAA
gi|88481 : TTTCGGCATCAGAGCTGGGTTCCCCAGT-TCCA-TTGC-AAACTGGAGT-TAA--ATC---TGG-TAG-TGTATG-TT-CC--T-ATGTAA-AATG-TTGTG---AATTAAA-ATTAAT-G----GA--GACTTTGACCCA-T--CT-AT------GAAAAA
gi|88482 : TTTCG-AAT-GGAA-TGGGT----AAATCTCCA-TTGT------------------TA---TGT-TAG-TGCGTG-TG--A--C-GTGTAA-AATG-TTT-GT--AAATTAA-AGT-AT-G----GC--GAC-TTGAGCCACT--CT-ATATGGGGGAAAAAA
gi|88483 : TTTCA-CAT-AGAG-TGAGT---CAAGTCTCCA-TTGT-AAACTG-AGT-A
gi|88484 : -CA--T-GTGTAA-AATG-TTTTGT--AAATAAA-AGT-AT-T----GA--GAC-GTGACCCACT--CT-AT------GAAAAA
gi|88485 : --T-GTGTAT-AATG-TTTTGT--GAATAAA-AGT-AT-G----AA--GAC-CTGGCTCACT--CT-AT------GAAAAAA
gi|88486 : TTGT--GAACTGA-AAT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAAA
Alignments
lowQualScore : 6 6 6 777 2 2 4 4 33 333 4 2 8 4 22 4 2 2 0 55 4 6 2 4444 22 4 55 2 555555
lowQualScore : . . . ... . . . . .. ... . . . . .. . . . . .. . . . .... .. . .. . ......
lowQualScore : 3 3 3 444 1 1 2 2 11 999 4 2 9 2 88 0 0 0 5 22 0 0 0 2222 88 0 55 0 888888
consensus : TTTCG-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGTAAA-CTG-AGT-AAA--ATA---TGG-TAG-TGTATG-TT-CA--T-GTGTAA-AATG-TTTTGT--AAATAAA-AGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAAA
Reference ( family-767 ) : TTTCG-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGTAAA-CTG-AGT-AAA--ATA---TGG-TAG-TGTATG-TT-CA--T-GTGTAA-AATG-TTTTGT--AAATAAA-AGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAAA
gi|88465 : TTTTG-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGTAAA-CTG-AGT-AAA--ATA---TGG-TAG-TATATG-TT-CA--T-GTGTAA-AATG-TTTAGT--AAATAAA-AGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAAA
gi|88466 : TTTTG-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGTAAA-CTG-AGT-AAA--ATA---TGG-TAG-TATATG-TT-CA--T-GTGTAA-AATG-TTTAGT--AAATAAA-AGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAA
gi|88467 : TTTCA-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TCGTAAA-CTG-AGT-AAA--ATA---TGG-TAG-TGAATG-TC-CA--T-GTGTAA-AATG-TTTTGT--AAATAAA-AGC-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAAA
gi|88468 : TTTCA-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TCGTAAA-CTG-AGT-AAA--ATA---TGG-TAG-TGAATG-TC-CA--T-GTGTAA-AATG-TTTTGT--AAATAAA-AGC-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAA
gi|88469 : TTTCG-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGTAAA-CTG-AGT-AAA--ATA---TGA-TAT-TGTATGTTT-CA--T-GTGTAA-AATG-TTTTGTTAAAACAAAGAGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAAA
gi|88470 : TTTCG-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGTAAA-CTG-AGT-AAA--ATA---TGA-TAT-TGTATGTTT-CA--T-GTGTAA-AATG-TTTTGTTAAAACAAAGAGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAA
gi|88471 : TTTCA-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGTAAA-CTG-AGT-AAA--ATA---TGGTTAG-TGTATG-TTGCA--TAGTGAAA-AATG-TTTTGT--AAATAAA-AGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACTACTT-AT------GAAAAAA
gi|88472 : TTTCA-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGTAAA-CTG-AGT-AAA--ATA---TGGTTAG-TGTATG-TTGCA--TAGTGAAA-AATG-TTTTGT--AAATAAA-AGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACTACTT-AT------GAAAAA
gi|88473 : TTTCG-CAT-GGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGTGAC-CTG-AGT-GAA--ATA---TGT-TAG-TCCATG-TT-CA--T---------ATA-TTTTGT--ACATAAA-AGT-AT-GTATCGA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------AAAAAAA
gi|88474 : TTTCG-TAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTC-A-TTGTGAA-CTG-AGT-GAA--ATA---TGT-TAG-TGCATG-TT-CA--T-ATGT---AATG-TTTTGT---AATAAA-AGT-AT-G----G---GAC-TTGACCC-CT--CT-AT------GAAAAA
gi|88475 : TTTCA-CAT-AGAG-TGGAT---CAAGTCTCCA-TTGTAAA-CTG-AGTTAAA--ATA---------G-TGT-------CA--T-GTGTAA-AATG-TTT-GT--AAATAAA-AGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAAA
gi|88476 : TTTCA-CAT-AGAG-TGGAT---CAAGTCTCCA-TTGTAAA-CTG-AGTTAAA--ATA---------G-TGT-------CA--T-GTGTAA-AATG-TTT-GT--AAATAAA-AGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAA
gi|88477 : TTTCA-CATTAGAG-TGGGT---CAAGTCTCTA-TTGTAAAACTG-AGT-AAA--ATA---TGG-TAG-AGTATGTTT-CA--T-GTGTAA-AATGTTTTTGT--AAAT
gi|88478 : TTTCG-CAT-GGAG-TAGGT---AAAGCCTCCA-TTGTCAA-CGG-AAT-GAA--ATAATTTAG---G-TGCATG-TT-CA--T-ATGTTT-AATG--TTTGT--A---AAA-ACTGATGG----GA--GAC-TTGA-CCACT--CTAAT------GAAAAAA
gi|88479 : TTCCGTCAT-AGAGCTGGGT---CA-GTCTACAATTGTAA--CTG-AGT-AAAACATA---TGG-TAGCTGTATGTTT-CACTT-ATGTAATATTG-TTTTGT---TATAAA-AGT-AT-G----GATCAGC-TTGACCCA-T--CT-AT------GAAAAAA
gi|88480 : TTTCGGCATCAGAGCTGGGTTCCCCAGT-TCCA-TTGCAAA-CTGGAGT-TAA--ATC---TGG-TAG-TGTATG-TT-CC--T-ATGTAA-AATG-TTGTG---AATTAAA-ATTAAT-G----GA--GACTTTGACCCA-T--CT-AT------GAAAAA
gi|88481 : TTTCGGCATCAGAGCTGGGTTCCCCAGT-TCCA-TTGCAAA-CTGGAGT-TAA--ATC---TGG-TAG-TGTATG-TT-CC--T-ATGTAA-AATG-TTGTG---AATTAAA-ATTAAT-G----GA--GACTTTGACCCA-T--CT-AT------GAAAAA
gi|88482 : TTTCG-AAT-GGAA-TGGGT----AAATCTCCA-TTGT------------------TA---TGT-TAG-TGCGTG-TG--A--C-GTGTAA-AATG-TTT-GT--AAATTAA-AGT-AT-G----GC--GAC-TTGAGCCACT--CT-ATATGGGGGAAAAAA
gi|88483 : TTTCA-CAT-AGAG-TGAGT---CAAGTCTCCA-TTGTAAA-CTG-AGT-A
gi|88484 : -CA--T-GTGTAA-AATG-TTTTGT--AAATAAA-AGT-AT-T----GA--GAC-GTGACCCACT--CT-AT------GAAAAA
gi|88485 : --T-GTGTAT-AATG-TTTTGT--GAATAAA-AGT-AT-G----AA--GAC-CTGGCTCACT--CT-AT------GAAAAAA
gi|88486 : TTGT--GAACTGA-AAT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAAA
Alignments
lowQualScore : 6 6 6 777 2 2 4 4 33 333 4 2 8 4 22 4 2 2 0 55 4 6 2 4444 22 4 55 2 555555
lowQualScore : . . . ... . . . . .. ... . . . . .. . . . . .. . . . .... .. . .. . ......
lowQualScore : 3 3 3 444 1 1 2 2 11 999 4 2 9 2 88 0 0 0 5 22 0 0 0 2222 88 0 55 0 888888
consensus : TTTCG-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGTAAA-CTG-AGT-AAA--ATA---TGG-TAG-TGTATG-TT-CA--T-GTGTAA-AATG-TTTTGT--AAATAAA-AGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAAA
Reference ( family-767 ) : TTTCG-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGTAAA-CTG-AGT-AAA--ATA---TGG-TAG-TGTATG-TT-CA--T-GTGTAA-AATG-TTTTGT--AAATAAA-AGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAAA
gi|88465 : TTTTG-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGTAAA-CTG-AGT-AAA--ATA---TGG-TAG-TATATG-TT-CA--T-GTGTAA-AATG-TTTAGT--AAATAAA-AGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAAA
gi|88466 : TTTTG-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGTAAA-CTG-AGT-AAA--ATA---TGG-TAG-TATATG-TT-CA--T-GTGTAA-AATG-TTTAGT--AAATAAA-AGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAA
gi|88467 : TTTCA-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TCGTAAA-CTG-AGT-AAA--ATA---TGG-TAG-TGAATG-TC-CA--T-GTGTAA-AATG-TTTTGT--AAATAAA-AGC-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAAA
gi|88468 : TTTCA-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TCGTAAA-CTG-AGT-AAA--ATA---TGG-TAG-TGAATG-TC-CA--T-GTGTAA-AATG-TTTTGT--AAATAAA-AGC-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAA
gi|88469 : TTTCG-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGTAAA-CTG-AGT-AAA--ATA---TGA-TAT-TGTATGTTT-CA--T-GTGTAA-AATG-TTTTGTTAAAACAAAGAGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAAA
gi|88470 : TTTCG-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGTAAA-CTG-AGT-AAA--ATA---TGA-TAT-TGTATGTTT-CA--T-GTGTAA-AATG-TTTTGTTAAAACAAAGAGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAA
gi|88471 : TTTCA-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGTAAA-CTG-AGT-AAA--ATA---TGGTTAG-TGTATG-TTGCA--TAGTGAAA-AATG-TTTTGT--AAATAAA-AGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACTACTT-AT------GAAAAAA
gi|88472 : TTTCA-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGTAAA-CTG-AGT-AAA--ATA---TGGTTAG-TGTATG-TTGCA--TAGTGAAA-AATG-TTTTGT--AAATAAA-AGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACTACTT-AT------GAAAAA
gi|88473 : TTTCG-CAT-GGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGTGAC-CTG-AGT-GAA--ATA---TGT-TAG-TCCATG-TT-CA--T---------ATA-TTTTGT--ACATAAA-AGT-AT-GTATCGA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------AAAAAAA
gi|88474 : TTTCG-TAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTC-A-TTGTGAA-CTG-AGT-GAA--ATA---TGT-TAG-TGCATG-TT-CA--T-ATGT---AATG-TTTTGT---AATAAA-AGT-AT-G----G---GAC-TTGACCC-CT--CT-AT------GAAAAA
gi|88475 : TTTCA-CAT-AGAG-TGGAT---CAAGTCTCCA-TTGTAAA-CTG-AGTTAAA--ATA---------G-TGT-------CA--T-GTGTAA-AATG-TTT-GT--AAATAAA-AGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAAA
gi|88476 : TTTCA-CAT-AGAG-TGGAT---CAAGTCTCCA-TTGTAAA-CTG-AGTTAAA--ATA---------G-TGT-------CA--T-GTGTAA-AATG-TTT-GT--AAATAAA-AGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAA
gi|88477 : TTTCA-CATTAGAG-TGGGT---CAAGTCTCTA-TTGTAAAACTG-AGT-AAA--ATA---TGG-TAG-AGTATGTTT-CA--T-GTGTAA-AATGTTTTTGT--AAAT
gi|88478 : TTTCG-CAT-GGAG-TAGGT---AAAGCCTCCA-TTGTCAA-CGG-AAT-GAA--ATAATTTAG---G-TGCATG-TT-CA--T-ATGTTT-AATG--TTTGT--A---AAA-ACTGATGG----GA--GAC-TTGA-CCACT--CTAAT------GAAAAAA
gi|88479 : TTCCGTCAT-AGAGCTGGGT---CA-GTCTACAATTGTAA--CTG-AGT-AAAACATA---TGG-TAGCTGTATGTTT-CACTT-ATGTAATATTG-TTTTGT---TATAAA-AGT-AT-G----GATCAGC-TTGACCCA-T--CT-AT------GAAAAAA
gi|88480 : TTTCGGCATCAGAGCTGGGTTCCCCAGT-TCCA-TTGCAAA-CTGGAGT-TAA--ATC---TGG-TAG-TGTATG-TT-CC--T-ATGTAA-AATG-TTGTG---AATTAAA-ATTAAT-G----GA--GACTTTGACCCA-T--CT-AT------GAAAAA
gi|88481 : TTTCGGCATCAGAGCTGGGTTCCCCAGT-TCCA-TTGCAAA-CTGGAGT-TAA--ATC---TGG-TAG-TGTATG-TT-CC--T-ATGTAA-AATG-TTGTG---AATTAAA-ATTAAT-G----GA--GACTTTGACCCA-T--CT-AT------GAAAAA
gi|88482 : TTTCG-AAT-GGAA-TGGGT----AAATCTCCA-TTGT------------------TA---TGT-TAG-TGCGTG-TG--A--C-GTGTAA-AATG-TTT-GT--AAATTAA-AGT-AT-G----GC--GAC-TTGAGCCACT--CT-ATATGGGGGAAAAAA
gi|88483 : TTTCA-CAT-AGAG-TGAGT---CAAGTCTCCA-TTGTAAA-CTG-AGT-A
gi|88484 : -CA--T-GTGTAA-AATG-TTTTGT--AAATAAA-AGT-AT-T----GA--GAC-GTGACCCACT--CT-AT------GAAAAA
gi|88485 : --T-GTGTAT-AATG-TTTTGT--GAATAAA-AGT-AT-G----AA--GAC-CTGGCTCACT--CT-AT------GAAAAAA
gi|88486 : TTGT--GAACTGA-AAT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAAA
blockSeqs : T T C TCC A A G T AC ATT T C T G CT A T T TA G G G TATC TC T AC A ATGGGG
blockSeqs : G C C TCC . . G T . . T . T G . A . . TA G A . . . T AC . .
blockSeqs : G C C . . . . . . . . . T . . . . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons :
originalCons : TTTCG-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGTAAA-CTG-AGT-AAA--ATA---TGG-TAG-TGTATG-TT-CA--T-GTGTAA-AATG-TTTTGT--AAATAAA-AGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAAA
finalCons : TTTCG-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGTAAA-CTG-AGT-AAA--ATA---TGG-TAG-TGTATG-TT-CA--T-GTGTAA-AATG-TTTTGT--AAATAAA-AGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAAA
Alignments
lowQualScore : 6 6 6 777 2 2 4 4 33 333 4 2 8 4 22 4 2 2 0 55 4 6 2 4444 22 4 55 2 555555
lowQualScore : . . . ... . . . . .. ... . . . . .. . . . . .. . . . .... .. . .. . ......
lowQualScore : 3 3 3 444 1 1 2 2 11 999 4 2 9 2 88 0 0 0 5 22 0 0 0 2222 88 0 55 0 888888
consensus : TTTCG-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGTAAA-CTG-AGT-AAA--ATA---TGG-TAG-TGTATG-TT-CA--T-GTGTAA-AATG-TTTTGT--AAATAAA-AGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAAA
Reference ( family-767 ) : TTTCG-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGTAAA-CTG-AGT-AAA--ATA---TGG-TAG-TGTATG-TT-CA--T-GTGTAA-AATG-TTTTGT--AAATAAA-AGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAAA
gi|88465 : TTTTG-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGTAAA-CTG-AGT-AAA--ATA---TGG-TAG-TATATG-TT-CA--T-GTGTAA-AATG-TTTAGT--AAATAAA-AGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAAA
gi|88466 : TTTTG-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGTAAA-CTG-AGT-AAA--ATA---TGG-TAG-TATATG-TT-CA--T-GTGTAA-AATG-TTTAGT--AAATAAA-AGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAA
gi|88467 : TTTCA-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TCGTAAA-CTG-AGT-AAA--ATA---TGG-TAG-TGAATG-TC-CA--T-GTGTAA-AATG-TTTTGT--AAATAAA-AGC-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAAA
gi|88468 : TTTCA-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TCGTAAA-CTG-AGT-AAA--ATA---TGG-TAG-TGAATG-TC-CA--T-GTGTAA-AATG-TTTTGT--AAATAAA-AGC-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAA
gi|88469 : TTTCG-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGTAAA-CTG-AGT-AAA--ATA---TGA-TAT-TGTATGTTT-CA--T-GTGTAA-AATG-TTTTGTTAAAACAAAGAGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAAA
gi|88470 : TTTCG-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGTAAA-CTG-AGT-AAA--ATA---TGA-TAT-TGTATGTTT-CA--T-GTGTAA-AATG-TTTTGTTAAAACAAAGAGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAA
gi|88471 : TTTCA-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGTAAA-CTG-AGT-AAA--ATA---TGGTTAG-TGTATG-TTGCA--TAGTGAAA-AATG-TTTTGT--AAATAAA-AGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACTACTT-AT------GAAAAAA
gi|88472 : TTTCA-CAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGTAAA-CTG-AGT-AAA--ATA---TGGTTAG-TGTATG-TTGCA--TAGTGAAA-AATG-TTTTGT--AAATAAA-AGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACTACTT-AT------GAAAAA
gi|88473 : TTTCG-CAT-GGAG-TGGGT---CAAGTCTCCA-TTGTGAC-CTG-AGT-GAA--ATA---TGT-TAG-TCCATG-TT-CA--T---------ATA-TTTTGT--ACATAAA-AGT-AT-GTATCGA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------AAAAAAA
gi|88474 : TTTCG-TAT-AGAG-TGGGT---CAAGTCTC-A-TTGTGAA-CTG-AGT-GAA--ATA---TGT-TAG-TGCATG-TT-CA--T-ATGT---AATG-TTTTGT---AATAAA-AGT-AT-G----G---GAC-TTGACCC-CT--CT-AT------GAAAAA
gi|88475 : TTTCA-CAT-AGAG-TGGAT---CAAGTCTCCA-TTGTAAA-CTG-AGTTAAA--ATA---------G-TGT-------CA--T-GTGTAA-AATG-TTT-GT--AAATAAA-AGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAAA
gi|88476 : TTTCA-CAT-AGAG-TGGAT---CAAGTCTCCA-TTGTAAA-CTG-AGTTAAA--ATA---------G-TGT-------CA--T-GTGTAA-AATG-TTT-GT--AAATAAA-AGT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAA
gi|88477 : TTTCA-CATTAGAG-TGGGT---CAAGTCTCTA-TTGTAAAACTG-AGT-AAA--ATA---TGG-TAG-AGTATGTTT-CA--T-GTGTAA-AATGTTTTTGT--AAAT
gi|88478 : TTTCG-CAT-GGAG-TAGGT---AAAGCCTCCA-TTGTCAA-CGG-AAT-GAA--ATAATTTAG---G-TGCATG-TT-CA--T-ATGTTT-AATG--TTTGT--A---AAA-ACTGATGG----GA--GAC-TTGA-CCACT--CTAAT------GAAAAAA
gi|88479 : TTCCGTCAT-AGAGCTGGGT---CA-GTCTACAATTGTAA--CTG-AGT-AAAACATA---TGG-TAGCTGTATGTTT-CACTT-ATGTAATATTG-TTTTGT---TATAAA-AGT-AT-G----GATCAGC-TTGACCCA-T--CT-AT------GAAAAAA
gi|88480 : TTTCGGCATCAGAGCTGGGTTCCCCAGT-TCCA-TTGCAAA-CTGGAGT-TAA--ATC---TGG-TAG-TGTATG-TT-CC--T-ATGTAA-AATG-TTGTG---AATTAAA-ATTAAT-G----GA--GACTTTGACCCA-T--CT-AT------GAAAAA
gi|88481 : TTTCGGCATCAGAGCTGGGTTCCCCAGT-TCCA-TTGCAAA-CTGGAGT-TAA--ATC---TGG-TAG-TGTATG-TT-CC--T-ATGTAA-AATG-TTGTG---AATTAAA-ATTAAT-G----GA--GACTTTGACCCA-T--CT-AT------GAAAAA
gi|88482 : TTTCG-AAT-GGAA-TGGGT----AAATCTCCA-TTGT------------------TA---TGT-TAG-TGCGTG-TG--A--C-GTGTAA-AATG-TTT-GT--AAATTAA-AGT-AT-G----GC--GAC-TTGAGCCACT--CT-ATATGGGGGAAAAAA
gi|88483 : TTTCA-CAT-AGAG-TGAGT---CAAGTCTCCA-TTGTAAA-CTG-AGT-A
gi|88484 : -CA--T-GTGTAA-AATG-TTTTGT--AAATAAA-AGT-AT-T----GA--GAC-GTGACCCACT--CT-AT------GAAAAA
gi|88485 : --T-GTGTAT-AATG-TTTTGT--GAATAAA-AGT-AT-G----AA--GAC-CTGGCTCACT--CT-AT------GAAAAAA
gi|88486 : TTGT--GAACTGA-AAT-AT-G----GA--GAC-TTGACCCACT--CT-AT------GAAAAAA