lowQualScore : 1111111111 1111111 111111 11 11111 11 111111111111111 11111 11111 1111 11
lowQualScore : 4 2 2 2 2 6 2 2 4 1111111111 333 2 2 2 2 4444 55 4444 2 55 999 1111111 2 6 666 2 2 6666666 22 666 2 333333 22 4 2 2 333 2 22 4 2 2 22 2 22222 44 2 2 2 6666 2 1 11 1 1 44 3 1 1 66 1 1 22 999999999999999 1 1 1 3 22 1 1 44 22 1 2 4 2 555555 2 2 7 2 2 11111 888888 2 55 11111 2 2 3333 555 4 2 55 4 55 2 2 2
lowQualScore : . . . . . . . . . .......... ... . . . . .... .. .... . .. ... ....... . . ... . . ....... .. ... . ...... .. . . . ... . .. . . . .. . ..... .. . . . .... . . .. . . .. . . . .. . . .. ............... . . . . .. . . .. .. . . . . ...... . . . . . ..... ...... . .. ..... . . .... ... . . .. . .. . . .
lowQualScore : 7 4 4 4 2 7 2 2 4 8888888888 999 2 2 2 2 7777 33 7777 2 33 222 9999999 2 7 111 2 1 8888888 99 666 1 222222 11 2 1 1 777 0 88 0 0 0 88 0 55555 88 0 0 0 2222 0 9 00 9 9 55 8 9 9 44 9 9 66 555555555555555 9 9 9 8 66 9 9 55 66 9 0 0 0 888888 0 0 7 0 1 11111 999999 1 88 66666 1 1 6666 888 2 1 88 2 00 1 1 1
consensus : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TC-A-T-G--G-------A---G-TT-A-G-TG----G--T----C-ATTT--TC---AC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-G------AAA-TG-GT-G-TC---TA-T--AA-T-G-AAG--A-AA-----C--GA-T-G-C----AT-ATT-T--G-C-A--AC-A-G-A--A-A-C--A-------CAT-A---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT-G-T-ACAA-A------C-C-AAT-T-GA-T-G-TGG------C-T--A-----TA-CT-C--T-A---AT-A-C-TC-ATA--CA-G-T-ACAA
Reference ( gi|81106 ) : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TC-A-T-G--A-------A---G-TT-A-G-TG----G--T----C-ATTT--TC---AC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-G------AAT-TG-GT-G-TC---TA-T--AA-T-G-AAG--A-AA-----C--GA-T-G-C----AT-ATT-T--G-C-A--AC-A-G-A--A-A-C--A-------CAT-A---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT-G-T-ACAA-A------C-C-AGT-T-GA-C-G-TGG------C-T--A-----TA-CT-C--C-A---AT-A-C-GC-ATA--CA-G-T-ACAA
gi|81107 : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TC-A-T-G--A-------A---G-TT-A-G-TA----G--T----C-ATTT--TT---AC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-G------AAA-TG-GT-G-TC---TA-T--AA-T-G-AAG--A-AA-----C--GA-T-G-C----AT-ATT-T--G-C-A--AC-A-G-A--A-A-CTTT-------CAC-C---AG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT-G-T-ACAA-A------C-C-AAT-T-GA-T-G-TGG------C-T--A-----TA-CT-C--T-A---AT-A-C-TC-ATA--CA-G-T-ACAA
gi|81108 : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TC-A-T-G--G-------A---G-TT-A-G-TG----G--T----C-ATTT--TC---AC-------AAAAA-A-TATT---A-AT-AG-------A--CA---TGAAT-G------AAA-TG-GT-T-CC---TA-T--AA-T-G-AAG--A-AA-----T--GA-T-G-C----AT-ATT-T--G-C-A--AC-A-G-A--A-A-T--A-------C---A---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT-G-T-ACAA-A------C-C-AAT-T-GA-T-G-TGG------C-T--A-----TA-CT-C--T-A---AT-A-C-TC-GTA--CA-G-T-ACAA
gi|81109 : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TC-A-T-G--A-------A---G-TT-A-G-TG----G--T----C-ATTT--TC---AT-------AAAAA-ACTATT---A-AT-AA-------A--CA---TGAAT-G------AAA-TG-GT-G-TT---CA-T--AA-T-G-AAA--A-AA-----C--GA-T-G-C----AT-ATT-T--G-C-A--AC-A-GCG--A-A-C--A-------CAT-A---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT-G-T-ACAA-A------C-C-AAT-T-GA-T-G-TGG------C-CTAA-----TA-CT-C--CTA---AT-A-C-TC-ATA--CA-G-T-ACAA
gi|81111 : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TC-A-T-G--G-------A---G-TT-A-G-TT----G--T----C-ATTT--TC---AC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-G------AAA-TG-GT-G-TC---TA-T--AA-T-G-AAG--A-AA-----C--GA-T-G-C----AT-ATT-T--G-C-A--AC-A-G-A--A-A-C--A-------C---G---GG-T-C-T-A--AA-TA-A--A--AT-G-T-ACAA-ACCTTGGC-C-AAT-T-GA-T-G-TGG------T-T--A-----TA-CT-C--A-A---AG-A-C-TC-ATG--CA-G-T-ACAAat
gi|81110 : GTAGT-A-TGG-A-A-GCC-TC-A-T-G--A-------A---G-TT-A-G-TG----G--T----C-ATTT--TC---AT-------AAAAA-ACTATT---A-AT-AA-------A--CA---TGAATTG------AAA-TG-GT-C-TG---TC-T--AA-T-G-AAA--A-AGGGGGGC--GA-T-G-C----AT-ATT-T--G-C-A--AC-C-G-A--A---C--A-------CAT-A---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT-G-T-ACAA-A------C-C-AAT-T-GA-T-G-TGG------C-CTAA-----TA-CT-C--CTA---AT-A-C-TC-ATA--CA-G-T-ACAA
gi|81112 : GTAGC-A-GGA-A-A-CCA-TC-A-T-G--G-------A---G-TT-A-G-TG----G--T----CCATTT--TC---AC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-G------AAA-TG-GT-G-TTTCATA-T--AA-T-G-AAG--A-AA-----C--GA-T-G-C----AT-ATT-T--G-C-A--AC-A-G-A--A-A-C--A-------C---C---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT-GTT-AC-A-A------C-C-AAT-T-GA-----TTG------C-T--A-----TA--T-C--T-----AT-A-C-TC-ATA--CA-G-TAACAAat
gi|81113 : GTAGTCA-TGG-A-A-CCAATC-A-T-G--G-------A---G-TT-A-G-TG----G--T----C-ATTT--TCCAAGC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CT---TGAAT-G------CAA-TG-GT-G-TC---TA-T--AA-TCG-AAG--A-AA-----TCGGA-T-G-C----AT-A-T-T--G-C-AC-AC-A-G-A------------------AT-C---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT-G-T-ACAATA------C-C-AAT-T-GA-T-G-TGA------C-T--A-----TA-CT-C--T-A---AT-AGC-TC-ATA--CA-GCT-ACGA
gi|81115 : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TC-A-TTG--G-------A---G-TT-A-G-TG----GG-T----C-ATAT--TC---AC-------AACAACA-TACTTCAA-GT-AA-------AAACA---TGAAT-G------AAA-GG-TT-G-TC---TA-T--AA-T-G-A-G--A-AA-----C--GA-T-G-C----AT-ATT-T--G-CCA--AC-A-G-A--A-AAC--AA------CA--A---GG-T-C-TTA--AA-TG-A--A--AT-G-T-ACAA-A------C-C-AAT-T-GA-T-G-TGG------CAT--A-----TA--T-C--T-AC--AT-A-C-TC-ATA--CA-G-T-ACAA
gi|81116 : GTAGT-A-CGG-A-A-ACA-TC-A-T-G--G-------A---G-TT-A-G--G----G--T----C-ATTT--TC---AC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A---A---TG-AT-G------AAA-TG-GT-G-TT---CT-T--AA-T-GAAAG--A-AA-----C--TA-TCG-C----CT-ATT-T--G-C-A--AT-A-G-A--A-A-C--A-------C-------GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT-G-T-GCAA-A--------C-AAT-T-GA-T-G-TGG------C-T--ACTGAGTA-TT------A---AT-A-C-TC-ATA--CA-G-T-ACAA
gi|81117 : GTAGTCA-TGG-A-AACCAATC-AGT-G--G-------A---GATT-A-G-TGCGAAG--C----C-ATTT--TCCA-AC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-G------AA--TG-GT-G-TC---TA-T--AA-T-G-ATA--A-AA-----C--GA-T-G-T----AT-ATC-TTGG-C-A--AC-A-G-A--A-A-C--A-------C-T-A---GG-T-CGT-A--CA-TGAA--A--AT-G-TAACAA-A------CGC-AAT-T-GA-T-G-TGGGC----C-T--A-----TA-CT-C--T-A---AT-T-CTGCAATA--CACG-T-ACAA
gi|81114 : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TCGA-T-G--G-------A---G-TT-A-C-TG----G--T----C-ATTT--TC---AC--------AAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-GA-----AATATG-G--G-TC---T--T--AATT-G-AAG----AA-----C--TA-T-G------AT-ATT-T--G-C-A--AC-A-A-G--A-A-A--A-------CA--A---GGTT-C-T-A--AAGTG-A--A--AT-G-T-A-AA-A------C-CAAAT-T-GA-T-GTTGG------C-T--AT----TA-CT-C--T-A---AT-A-T-TCAATA--CA-G-T-ACAA
gi|81118 : GTTGT-A-TG--A-A-CCA-TC-A-T-G--G-------A---G-TT-A-G-TG----G--T----C-ATTT--TG---AC-------AAAAA-G-TATT------T-AA-------A--CA---TGAAT-G------AAA-TGAAT-G-TC---TA-T--AA-G-T-AGG--A-AAAC---T--GA---G-C-----T-AAT-T--ACC-A--AC-A-G-AT-A-A-C--A-------CAT-A---GG-T-G-TAA--AA-TG-A--AGCAT-T-T-ACAA-A------C-C-AAT-T-GA-T---TGG------C-T--A-----TA-CT-CT-T-A---ATGA-C-TC-ATA--CA-A-T-ACAA
gi|81119 : GTAGT-A-TGG-ACA-CTA-TT-A-T-GGGA-------T---G-TT-A-G-CG----G--T----C-ATTT--TC---AC-------AAAA-----ATT---G-GT-AA-------A--CAAT-TGAAT-GA-----AAT-CA-GT-GTTC---TATT--AA-T-G-AAG--A-AA-----C--GA-T-G-CA---AT-ATT-TG-G-C-A--AT-ATT-A--A-A-C--A-------C---C---GG-T-C-G-A--AA-TT-ATGA--AT-G-T-GCAA-A--------C-AAT-T-GATC-G-TAG------C----A-----TACCT-C--T-A---AT-A-C-TC-ATA--CA-G-T-ACAA
gi|81120 : GTAGT-A-TGG-A-A---------------------------G-TT-A-T-CG----GATC----C-ATTTC-TC---ACTCAA---AAAAA-A-GATT---A-GTGAA-------A--CA---TTAAA-G------AAA-TG-GT-G-TC---TA-TTAAA-T-G-AAG--T-A------C--GA-T-G-CTAAAAT-ATT-TT-G-C-AGTAT-A-G-A--A-A-C--AGAAGAACCATCATCCGG-T-C-T-ATCAA-TG-A--A--AT-G-T-GCAA-A------C-C-AATGT-GA-T---TAG------C-T--A-----TA-CTGC--C-A---ATAA-C-TC-ATA--C--G-T-ACA
gi|81121 : TAGT-ACTGG-G-A-CCA-AC-A-T-G--ACAAGCGAA---G-TTTA-G-TG----G--T----C-ATTTATTC---AC-------AAAAA-AATAAT---T-GT-AA-------A--CGATTTCAAT-G------AAT----GTAG-TC---TA-T--AA-T-G-AAA--A-AAT----C--GA-T-ACC----AA-ATT-TA-A-C-A--AC-A-T-G--T-A-T--AG------CAC-A---GG---C-T-A--AA-TG-A--A--AT-
gi|81122 : AGT-A-TGGGA-A-CCA-TC-A-T-G--G-------A---G-TT-A-GCTG----G--T----C-ATTT--TC---AC--------AAAA-A-TATT---AGGT-AA-------A--CA---TGAAT-GAA----AAT-GG-GT---TC---TA-T--AATT-G-A----A-AA-----C-----T-G-C----AT-ATT-T--G-C-A--ACAA-G-A--A-A-A--A-------CAC-A---GG-T-C-T-A--AA--G-A--A--AT-G-TAACAA-A------C-C-AAT-T-GA-T-G-TGG------C-T--AT----TA-CT-C--T-A---AT-A-T-TC-ATA--CA-G-T-ACAAtgcgtatttgtgacggagtctattgattgtggctcaaactctattactctattacaagt
gi|81123 : T-A-TGG-A-A-CCAATC-A-T-G--G-------A---G-TT-A-G-TG----A--T----C-ATTT--TC---AC-------AAAAA-A-TATTA--A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-G------AAT-GT-GT-A-TC---TA-T--AA-T-G-AAG--A-AA-----CA-GA-T-G-C----AT-ATT-T--G-C-A--AC-A-G-A--ATA-C--A-------GAC-AAGGGG-TAC-T-A--AA-TG-T--A--AT-G-T-ACAA-A------C-C-A-T-T-GA-CTA-TGG------C-T--A-----TA-CT-CTAT-A---AT-A---GC-ATAG-CA---T-ACAA
gi|81124 : -CTA-TC-A-TTG--A-------ACGAG-TT-ATG-TG----G--TGCGAT-ATTT--TCT--ACTTGCTAAAAAAG-A-TAAT---A-AT-AAGATTATAA--CA---TGAAT-AGTGACAAAT-AGTGT-G-CT---TA-C--AA-T-A-AAG--ATAAGC---C--GAAT-G-C----ATTACTGTAAG-C-A--ACGA-G-AT-A-A-C--A-------CAG-A---AT-T-C-T-A--AA-TG-AC-A--ATTG-T-ACAA-A------C-C-AAT-TCGATC-A-TGGGTGGTTC-T--AC----TA-CT-C--T-AAACAT-A-A-CC-ATAATCA-G-T-
gi|81125 : T-AA-------A--CA---TCAAT-G------AAA-TA-GT-G--A---TA-T--AA-T-G-AAGAAA-AA-----C--AA-T-G-C----AT-A---T--G-C----GT-A-G-------------------CAT-G--------C-T-A--AA-TG-A--A--AT-G-T-ACAA-A------C-C-AAT-
gi|81126 : -T--AA-T-G-AAG--A-AA-----C--GA-T-G-C----AT-ATT-T--G-C-A--AA-A-G-AGAA-A-C--C-------CAT-A---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT-G-T-ACAA-A------T-C-AAT-T-GA-T-G-TGG------C-T--A-----TA-CT-C--T-A---AT-A-C-TC-ATA--CA-G-T-ACAA
gi|81127 : T-T--G-C-A--AC-A-G-A--A-A-C--A-------CAT-A---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT-G-T-ACAA-A------C-C-AAT-T-GA-C-G-TGG------C-T--A-----TA-CT-C--T-A---AT-A-C--C-ATA--CA-G-T-ACAA
Alignments
lowQualScore : 1111111 11111 111111111111111 11111
lowQualScore : 4 2 2 2 2 6 2 2 2 6666666 22 2 2 2 2 4444 55 4444 2 55 888 1111111 2 6 555 2 2 6666666 22 666 2 77777 22 2 4 44 333 44 3 1 1 22 1 11111 44 1 1 1 4444 1 1 1 88 3 1 44 3 3 66 1 1 22 666666666666666 1 1 1 3 22 1 1 44 22 555 1 3 66666666 1 555555 1 1 1 1 3 66666 1 55 1 77 5 1 00000 44 555 3 1 1 3 44 1 1 1
lowQualScore : . . . . . . . . . ....... .. . . . . .... .. .... . .. ... ....... . . ... . . ....... .. ... . ..... .. . . .. ... .. . . . .. . ..... .. . . . .... . . . .. . . .. . . .. . . .. ............... . . . . .. . . .. .. ... . . ........ . ...... . . . . . ..... . .. . .. . . ..... .. ... . . . . .. . . .
lowQualScore : 4 2 2 2 2 7 2 2 2 8888888 99 1 1 1 1 5555 00 5555 1 00 777 3333333 1 3 888 1 0 5555555 88 222 0 00000 88 0 0 88 555 55 8 9 9 66 9 99999 55 9 9 9 0000 9 9 8 66 6 8 33 6 6 11 8 8 55 999999999999999 8 8 8 6 55 8 8 33 55 000 8 6 66666666 8 222222 8 8 8 9 8 77777 9 22 9 11 7 9 55555 55 222 8 9 9 8 55 9 9 9
consensus : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TC-A-T-GG-------A--G-TT-A-G-TG----G--T----C-ATTT--TC---AC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-G-----AA--AT-G-GTGT--C---TAT--AA-T-G-AAG--A-AA-----C--GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--AC-AG-A--A-A-C--A-------CAT-A---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AA-A------C-C-AAT-T-GA-T-----G-TGG--C-T--A-TAC-T-----C--TA---AT-A-CT-C-ATA--CA-G-T-ACAA
Reference ( family-766 ) : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TC-A-T-GG-------A--G-TT-A-G-TG----G--T----C-ATTT--TC---AC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-G-----AA--AT-G-GTGT--C---TAT--AA-T-G-AAG--A-AA-----C--GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--AC-AG-A--A-A-C--A-------CAT-A---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AA-A------C-C-AAT-T-GA-T-----G-TGG--C-T--A-TAC-T-----C--TA---AT-A-CT-C-ATA--CA-G-T-ACAA
gi|81106 : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TC-A-T-GA-------A--G-TT-A-G-TG----G--T----C-ATTT--TC---AC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-G-----AA--TT-G-GTGT--C---TAT--AA-T-G-AAG--A-AA-----C--GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--AC-AG-A--A-A-C--A-------CAT-A---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AA-A------C-C-AGT-T-GA-C-----G-TGG--C-T--A-TAC-T-----C--CA---AT-A-CG-C-ATA--CA-G-T-ACAA
gi|81107 : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TC-A-T-GA-------A--G-TT-A-G-TA----G--T----C-ATTT--TT---AC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-G-----AA--AT-G-GTGT--C---TAT--AA-T-G-AAG--A-AA-----C--GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--AC-AG-A--A-A-CTTT-------CAC-C---AG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AA-A------C-C-AAT-T-GA-T-----G-TGG--C-T--A-TAC-T-----C--TA---AT-A-CT-C-ATA--CA-G-T-ACAA
gi|81108 : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TC-A-T-GG-------A--G-TT-A-G-TG----G--T----C-ATTT--TC---AC-------AAAAA-A-TATT---A-AT-AG-------A--CA---TGAAT-G-----AA--AT-G-GTTC--C---TAT--AA-T-G-AAG--A-AA-----T--GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--AC-AG-A--A-A-T--A-------C---A---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AA-A------C-C-AAT-T-GA-T-----G-TGG--C-T--A-TAC-T-----C--TA---AT-A-CT-C-GTA--CA-G-T-ACAA
gi|81109 : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TC-A-T-GA-------A--G-TT-A-G-TG----G--T----C-ATTT--TC---AT-------AAAAA-ACTATT---A-AT-AA-------A--CA---TGAAT-G-----AA--AT-G-GTGT--T---CAT--AA-T-G-AAA--A-AA-----C--GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--AC-AGCG--A-A-C--A-------CAT-A---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AA-A------C-C-AAT-T-GA-T-----G-TGG--C-CTAA-TAC-TC----C--TA---AT-A-CT-C-ATA--CA-G-T-ACAA
gi|81110 : GTAGT-A-TGG-A-A-GCC-TC-A-T-GA-------A--G-TT-A-G-TG----G--T----C-ATTT--TC---AT-------AAAAA-ACTATT---A-AT-AA-------A--CA---TGAATTG-----AA--AT-G-GTCT--G---TCT--AA-T-G-AAA--A-AGGGGGGC--GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--AC-CG-A--A---C--A-------CAT-A---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AA-A------C-C-AAT-T-GA-T-----G-TGG--C-CTAA-TAC-TC----C--TA---AT-A-CT-C-ATA--CA-G-T-ACAAat
gi|81111 : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TC-A-T-GG-------A--G-TT-A-G-TT----G--T----C-ATTT--TC---AC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-G-----AA--AT-G-GTGT--C---TAT--AA-T-G-AAG--A-AA-----C--GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--AC-AG-A--A-A-C--A-------C---G---GG-T-C-T-A--AA-TA-A--A--AT---G-T-AC--------AA-ACCTTGGC-C-AAT-T-GA-T-----G-TGG--T-T--A-TAC-T-----C--AA---AG-A-CT-C-ATG--CA-G-T-ACAAat
gi|81112 : GTAGC-A-GGA-A-A-CCA-TC-A-T-GG-------A--G-TT-A-G-TG----G--T----CCATTT--TC---AC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-G-----AA--AT-G-GTGT--TTCATAT--AA-T-G-AAG--A-AA-----C--GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--AC-AG-A--A-A-C--A-------C---C---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---GTT-AC---------A-A------C-C-AAT-T-GA-T-------T-G--C-T--A-TA--T-----C--T----AT-A-CT-C-ATA--CA-G-TAACAA
gi|81113 : GTAGTCA-TGG-A-A-CCAATC-A-T-GG-------A--G-TT-A-G-TG----G--T----C-ATTT--TCCAAGC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CT---TGAAT-G-----CA--AT-G-GTGT--C---TAT--AA-TCG-AAG--A-AA-----TCGGA-T-G-C----A-T-A-T-T--G-C-AC-AC-AG-A------------------AT-C---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AATA------C-C-AAT-T-GA-T-----G-TGA--C-T--A-TAC-T-----C--TA---AT-AGCT-C-ATA--CA-GCT-ACGA
gi|81114 : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TCGA-T-GG-------A--G-TT-A-C-TG----G--T----C-ATTT--TC---AC--------AAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-G-----AAATAT-G-G-GT--C---T-T--AATT-G-AAG----AA-----C--TA-T-G------A-T-ATT-T--G-C-A--AC-AA-G--A-A-A--A-------CA--A---GGTT-C-T-A--AAGTG-A--A--AT---G-T-A---------AA-A------C-CAAAT-T-GA-T-----GTTGG--C-T--ATTAC-T-----C--TA---AT-A-TT-CAATA--CA-G-T-ACAA
gi|81115 : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TC-A-TTGG-------A--G-TT-A-G-TG----GG-T----C-ATAT--TC---AC-------AACAACA-TACTTCAA-GT-AA-------AAACA---TGAAT-G-----AA--AG-G-TTGT--C---TAT--AA-T-G-A-G--A-AA-----C--GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-CCA--AC-AG-A--A-AAC--AA------CA--A---GG-T-C-TTA--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AA-A------C-C-AAT-T-GA-T-----G-TGG--CAT--A-TA--T-----C--TAC--AT-A-CT-C-ATA--CA-G-T-ACAA
gi|81116 : GTAGT-A-CGG-A-A-ACA-TC-A-T-GG-------A--G-TT-A-G--G----G--T----C-ATTT--TC---AC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A---A---TG-AT-G-----AA--AT-G-GTGT--T---CTT--AA-T-GAAAG--A-AA-----C--TA-TCG-C----C-T-ATT-T--G-C-A--AT-AG-A--A-A-C--A-------C-------GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-GC--------AA-A--------C-AAT-T-GA-T-----G-TGG--C------TAC-TGAGTAT--TA---AT-A-CT-C-ATA--CA-G-T-ACAA
gi|81117 : GTAGTCA-TGG-A-AACCAATC-AGT-GG-------A--GATT-A-G-TGCGAAG--C----C-ATTT--TCCA-AC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-G------A--AT-G-GTGT--C---TAT--AA-T-G-ATA--A-AA-----C--GA-T-G-T----A-T-ATC-TTGG-C-A--AC-AG-A--A-A-C--A-------C-T-A---GG-T-CGT-A--CA-TGAA--A--AT---G-TAAC--------AA-A------CGC-AAT-T-GA-T-----G-TGGGCC-T--A-TAC-T-----C--TA---AT-T-CTGCAATA--CACG-T-ACAA
gi|81118 : GTTGT-A-TG--A-A-CCA-TC-A-T-GG-------A--G-TT-A-G-TG----G--T----C-ATTT--TG---AC-------AAAAA-G-TATT------T-AA-------A--CA---TGAAT-G-----AA--AT-GAATGT--C---TAT--AA-G-T-AGG--A-AAAC---T--GA---G-C------T-AAT-T--ACC-A--AC-AG-AT-A-A-C--A-------CAT-A---GG-T-G-TAA--AA-TG-A--AGCAT---T-T-AC--------AA-A------C-C-AAT-T-GA-T-------TGG--C-T--A-TAC-T-----CT-TA---ATGA-CT-C-ATA--CA-A-T-ACAA
gi|81119 : GTAGT-A-TGG-ACA-CTA-TT-A-T-GG-------GATG-TT-A-G-CG----G--T----C-ATTT--TC---AC-------AAAAA-----TT---G-GT-AA-------A--CAAT-TGAAT-G-----AA--ATCA-GTGTT-C---TATT-AA-T-G-AAG--A-AA-----C--GA-T-G-C----AAT-ATT-T--GGC-A--AT-ATTA--A-A-C--A-------CC------GG-T-C-G-A--AA-TT-ATGA--AT---G-T-GC--------AA-A------C---AAT-T-GA-TC----G-TAG--C----A-TACCT-----C--TA---AT-A-CT-C-ATA--CA-G-T-ACAA
gi|81120 : GTAGT-A-TGG-A-A------------------------G-TT-A-T-CG----GATC----C-ATTTC-TC---ACTCAA---AAAAA-A-GATT---A-GTGAA-------A--CA---TTAAA-G-----AA--AT-G-GTGT--C---TATTAAA-T-G-AAG--T-A------C--GA-T-G-CTAAAA-T-ATT-TT-G-C-AGTAT-AG-A--A-A-C--AGAAGAACCATCATCCGG-T-C-T-ATCAA-TG-A--A--AT---G-T-GC--------AA-A------C-C-AATGT-GA-T-------TAG--C-T--A-TAC-TG----C--CA---ATAA-CT-C-ATA--C--G-T-ACA
gi|81121 : TAGT-ACTGG-G-A-CCA-AC-A-T-GACAAGCGAA--G-TTTA-G-TG----G--T----C-ATTTATTC---AC-------AAAAA-AATAAT---T-GT-AA-------A--CGATTTCAAT-G-----AA---T-G-TAGT--C---TAT--AA-T-G-AAA--A-AAT----C--GA-T-ACC----A-A-ATT-TA-A-C-A--AC-AT-G--T-A-T--AG------CAC-A---GG---C-T-A--AA-TG-A--A--ATTGCG-T-ATTTGTGACGGA-G------T-C-TAT-T-GATT-----G-TGG--C-TC-A-AAC-T-----C--TA---TT-A-CT-C--TA--T----T-ACAA
gi|81122 : AGT-A-TGGGA-A-CCA-TC-A-T-GG-------A--G-TT-A-GCTG----G--T----C-ATTT--TC---AC--------AAAA-A-TATT---AGGT-AA-------A--CA---TGAAT-GA----AA--AT-G-GGTT--C---TAT--AATT-G-A----A-AA-----C-----T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--ACAAG-A--A-A-A--A-------CAC-A---GG-T-C-T-A--AA--G-A--A--AT---G-TAAC--------AA-A------C-C-AAT-T-GA-T-----G-TGG--C-T--ATTAC-T-----C--TA---AT-A-TT-C-ATA--CA-G-T-ACAAgt
gi|81123 : T-A-TGG-A-A-CCAATC-A-T-GG-------A--G-TT-A-G-TG----A--T----C-ATTT--TC---AC-------AAAAA-A-TATTA--A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-G------A--AT-GTGTAT--C---TAT--AA-T-G-AAG--A-AA-----CA-GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--AC-AG-A--ATA-C--A-------GAC-AAGGGG-TAC-T-A--AA-TG-T--A--AT---G-T-AC--------AA-A------C-C--AT-T-GACT-----A-TGG--C-T--A-TAC-T-----CTATA---AT-A--G-C-ATAG-CA---T-ACAA
gi|81124 : G-------A--G-TT-ATG-TG----G--TGCGAT-ATTT--TCT--ACTTGCTAAAAAAG-A-TAAT---A-AT-AAGATTATAA--CA---TGAAT-AGTGACAA--AT-A-GTGTGCT---TAC--AA-T-A-AAG--ATAAGC---C--GAAT-G-C----A-TTACTGTAAG-C-A--ACGAG-AT-A-A-C--A-------CAG-A---AT-T-C-T-A--AA-TG-AC-A--ATT--G-T-AC--------AA-A------C-C-AAT-TCGA-TCATGGG-TGGTTC-T--ACTAC-T-----C--TAAACAT-A-AC-C-ATAATCA-G-T-
gi|81125 : ctatcattgaacT-AA-------A--CA---TCAAT-G-----AA--AT-A-GTG---A---TAT--AA-T-G-AAGAAA-AA-----C--AA-T-G-C----A-T-A---T--G-C----GT-AG-------------------CAT-G--------C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AA-A------C-C-AAT-
gi|81126 : T--AA-T-G-AAG--A-AA-----C--GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--AA-AG-AGAA-A-C--C-------CAT-A---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AA-A------T-C-AAT-T-GA-T-----G-TGG--C-T--A-TAC-T-----C--TA---AT-A-CT-C-ATA--CA-G-T-ACAA
gi|81127 : T-T--G-C-A--AC-AG-A--A-A-C--A-------CAT-A---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AA-A------C-C-AAT-T-GA-C-----G-TGG--C-T--A-TAC-T-----C--TA---AT-A-C--C-ATA--CA-G-T-ACAA
Alignments
lowQualScore : 1111111 11111 111111111111111 11111
lowQualScore : 4 2 2 2 2 6 2 2 2 6666666 22 2 2 2 2 4444 55 4444 2 55 888 1111111 2 6 555 2 2 6666666 22 666 2 77777 22 2 4 44 333 44 3 1 1 22 1 11111 44 1 1 1 4444 1 1 1 88 3 1 44 3 3 66 1 1 22 666666666666666 1 1 1 3 22 1 1 44 22 555 1 3 66666666 1 555555 1 1 1 1 3 66666 1 55 1 77 5 1 00000 44 555 3 1 1 3 44 1 1 1
lowQualScore : . . . . . . . . . ....... .. . . . . .... .. .... . .. ... ....... . . ... . . ....... .. ... . ..... .. . . .. ... .. . . . .. . ..... .. . . . .... . . . .. . . .. . . .. . . .. ............... . . . . .. . . .. .. ... . . ........ . ...... . . . . . ..... . .. . .. . . ..... .. ... . . . . .. . . .
lowQualScore : 4 2 2 2 2 7 2 2 2 8888888 99 1 1 1 1 5555 00 5555 1 00 777 3333333 1 3 888 1 0 5555555 88 222 0 00000 88 0 0 88 555 55 8 9 9 66 9 99999 55 9 9 9 0000 9 9 8 66 6 8 33 6 6 11 8 8 55 999999999999999 8 8 8 6 55 8 8 33 55 000 8 6 66666666 8 222222 8 8 8 9 8 77777 9 22 9 11 7 9 55555 55 222 8 9 9 8 55 9 9 9
consensus : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TC-A-T-GG-------A--G-TT-A-G-TG----G--T----C-ATTT--TC---AC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-G-----AA--AT-G-GTGT--C---TAT--AA-T-G-AAG--A-AA-----C--GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--AC-AG-A--A-A-C--A-------CAT-A---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AA-A------C-C-AAT-T-GA-T-----G-TGG--C-T--A-TAC-T-----C--TA---AT-A-CT-C-ATA--CA-G-T-ACAA
Reference ( family-766 ) : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TC-A-T-GG-------A--G-TT-A-G-TG----G--T----C-ATTT--TC---AC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-G-----AA--AT-G-GTGT--C---TAT--AA-T-G-AAG--A-AA-----C--GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--AC-AG-A--A-A-C--A-------CAT-A---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AA-A------C-C-AAT-T-GA-T-----G-TGG--C-T--A-TAC-T-----C--TA---AT-A-CT-C-ATA--CA-G-T-ACAA
gi|81106 : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TC-A-T-GA-------A--G-TT-A-G-TG----G--T----C-ATTT--TC---AC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-G-----AA--TT-G-GTGT--C---TAT--AA-T-G-AAG--A-AA-----C--GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--AC-AG-A--A-A-C--A-------CAT-A---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AA-A------C-C-AGT-T-GA-C-----G-TGG--C-T--A-TAC-T-----C--CA---AT-A-CG-C-ATA--CA-G-T-ACAA
gi|81107 : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TC-A-T-GA-------A--G-TT-A-G-TA----G--T----C-ATTT--TT---AC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-G-----AA--AT-G-GTGT--C---TAT--AA-T-G-AAG--A-AA-----C--GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--AC-AG-A--A-A-CTTT-------CAC-C---AG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AA-A------C-C-AAT-T-GA-T-----G-TGG--C-T--A-TAC-T-----C--TA---AT-A-CT-C-ATA--CA-G-T-ACAA
gi|81108 : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TC-A-T-GG-------A--G-TT-A-G-TG----G--T----C-ATTT--TC---AC-------AAAAA-A-TATT---A-AT-AG-------A--CA---TGAAT-G-----AA--AT-G-GTTC--C---TAT--AA-T-G-AAG--A-AA-----T--GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--AC-AG-A--A-A-T--A-------C---A---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AA-A------C-C-AAT-T-GA-T-----G-TGG--C-T--A-TAC-T-----C--TA---AT-A-CT-C-GTA--CA-G-T-ACAA
gi|81109 : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TC-A-T-GA-------A--G-TT-A-G-TG----G--T----C-ATTT--TC---AT-------AAAAA-ACTATT---A-AT-AA-------A--CA---TGAAT-G-----AA--AT-G-GTGT--T---CAT--AA-T-G-AAA--A-AA-----C--GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--AC-AGCG--A-A-C--A-------CAT-A---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AA-A------C-C-AAT-T-GA-T-----G-TGG--C-CTAA-TAC-TC----C--TA---AT-A-CT-C-ATA--CA-G-T-ACAA
gi|81110 : GTAGT-A-TGG-A-A-GCC-TC-A-T-GA-------A--G-TT-A-G-TG----G--T----C-ATTT--TC---AT-------AAAAA-ACTATT---A-AT-AA-------A--CA---TGAATTG-----AA--AT-G-GTCT--G---TCT--AA-T-G-AAA--A-AGGGGGGC--GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--AC-CG-A--A---C--A-------CAT-A---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AA-A------C-C-AAT-T-GA-T-----G-TGG--C-CTAA-TAC-TC----C--TA---AT-A-CT-C-ATA--CA-G-T-ACAAat
gi|81111 : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TC-A-T-GG-------A--G-TT-A-G-TT----G--T----C-ATTT--TC---AC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-G-----AA--AT-G-GTGT--C---TAT--AA-T-G-AAG--A-AA-----C--GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--AC-AG-A--A-A-C--A-------C---G---GG-T-C-T-A--AA-TA-A--A--AT---G-T-AC--------AA-ACCTTGGC-C-AAT-T-GA-T-----G-TGG--T-T--A-TAC-T-----C--AA---AG-A-CT-C-ATG--CA-G-T-ACAAat
gi|81112 : GTAGC-A-GGA-A-A-CCA-TC-A-T-GG-------A--G-TT-A-G-TG----G--T----CCATTT--TC---AC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-G-----AA--AT-G-GTGT--TTCATAT--AA-T-G-AAG--A-AA-----C--GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--AC-AG-A--A-A-C--A-------C---C---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---GTT-AC---------A-A------C-C-AAT-T-GA-T-------T-G--C-T--A-TA--T-----C--T----AT-A-CT-C-ATA--CA-G-TAACAA
gi|81113 : GTAGTCA-TGG-A-A-CCAATC-A-T-GG-------A--G-TT-A-G-TG----G--T----C-ATTT--TCCAAGC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CT---TGAAT-G-----CA--AT-G-GTGT--C---TAT--AA-TCG-AAG--A-AA-----TCGGA-T-G-C----A-T-A-T-T--G-C-AC-AC-AG-A------------------AT-C---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AATA------C-C-AAT-T-GA-T-----G-TGA--C-T--A-TAC-T-----C--TA---AT-AGCT-C-ATA--CA-GCT-ACGA
gi|81114 : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TCGA-T-GG-------A--G-TT-A-C-TG----G--T----C-ATTT--TC---AC--------AAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-G-----AAATAT-G-G-GT--C---T-T--AATT-G-AAG----AA-----C--TA-T-G------A-T-ATT-T--G-C-A--AC-AA-G--A-A-A--A-------CA--A---GGTT-C-T-A--AAGTG-A--A--AT---G-T-A---------AA-A------C-CAAAT-T-GA-T-----GTTGG--C-T--ATTAC-T-----C--TA---AT-A-TT-CAATA--CA-G-T-ACAA
gi|81115 : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TC-A-TTGG-------A--G-TT-A-G-TG----GG-T----C-ATAT--TC---AC-------AACAACA-TACTTCAA-GT-AA-------AAACA---TGAAT-G-----AA--AG-G-TTGT--C---TAT--AA-T-G-A-G--A-AA-----C--GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-CCA--AC-AG-A--A-AAC--AA------CA--A---GG-T-C-TTA--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AA-A------C-C-AAT-T-GA-T-----G-TGG--CAT--A-TA--T-----C--TAC--AT-A-CT-C-ATA--CA-G-T-ACAA
gi|81116 : GTAGT-A-CGG-A-A-ACA-TC-A-T-GG-------A--G-TT-A-G--G----G--T----C-ATTT--TC---AC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A---A---TG-AT-G-----AA--AT-G-GTGT--T---CTT--AA-T-GAAAG--A-AA-----C--TA-TCG-C----C-T-ATT-T--G-C-A--AT-AG-A--A-A-C--A-------C-------GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-GC--------AA-A--------C-AAT-T-GA-T-----G-TGG--C------TAC-TGAGTAT--TA---AT-A-CT-C-ATA--CA-G-T-ACAA
gi|81117 : GTAGTCA-TGG-A-AACCAATC-AGT-GG-------A--GATT-A-G-TGCGAAG--C----C-ATTT--TCCA-AC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-G------A--AT-G-GTGT--C---TAT--AA-T-G-ATA--A-AA-----C--GA-T-G-T----A-T-ATC-TTGG-C-A--AC-AG-A--A-A-C--A-------C-T-A---GG-T-CGT-A--CA-TGAA--A--AT---G-TAAC--------AA-A------CGC-AAT-T-GA-T-----G-TGGGCC-T--A-TAC-T-----C--TA---AT-T-CTGCAATA--CACG-T-ACAA
gi|81118 : GTTGT-A-TG--A-A-CCA-TC-A-T-GG-------A--G-TT-A-G-TG----G--T----C-ATTT--TG---AC-------AAAAA-G-TATT------T-AA-------A--CA---TGAAT-G-----AA--AT-GAATGT--C---TAT--AA-G-T-AGG--A-AAAC---T--GA---G-C------T-AAT-T--ACC-A--AC-AG-AT-A-A-C--A-------CAT-A---GG-T-G-TAA--AA-TG-A--AGCAT---T-T-AC--------AA-A------C-C-AAT-T-GA-T-------TGG--C-T--A-TAC-T-----CT-TA---ATGA-CT-C-ATA--CA-A-T-ACAA
gi|81119 : GTAGT-A-TGG-ACA-CTA-TT-A-T-GG-------GATG-TT-A-G-CG----G--T----C-ATTT--TC---AC-------AAAAA-----TT---G-GT-AA-------A--CAAT-TGAAT-G-----AA--ATCA-GTGTT-C---TATT-AA-T-G-AAG--A-AA-----C--GA-T-G-C----AAT-ATT-T--GGC-A--AT-ATTA--A-A-C--A-------CC------GG-T-C-G-A--AA-TT-ATGA--AT---G-T-GC--------AA-A------C---AAT-T-GA-TC----G-TAG--C----A-TACCT-----C--TA---AT-A-CT-C-ATA--CA-G-T-ACAA
gi|81120 : GTAGT-A-TGG-A-A------------------------G-TT-A-T-CG----GATC----C-ATTTC-TC---ACTCAA---AAAAA-A-GATT---A-GTGAA-------A--CA---TTAAA-G-----AA--AT-G-GTGT--C---TATTAAA-T-G-AAG--T-A------C--GA-T-G-CTAAAA-T-ATT-TT-G-C-AGTAT-AG-A--A-A-C--AGAAGAACCATCATCCGG-T-C-T-ATCAA-TG-A--A--AT---G-T-GC--------AA-A------C-C-AATGT-GA-T-------TAG--C-T--A-TAC-TG----C--CA---ATAA-CT-C-ATA--C--G-T-ACA
gi|81121 : TAGT-ACTGG-G-A-CCA-AC-A-T-GACAAGCGAA--G-TTTA-G-TG----G--T----C-ATTTATTC---AC-------AAAAA-AATAAT---T-GT-AA-------A--CGATTTCAAT-G-----AA---T-G-TAGT--C---TAT--AA-T-G-AAA--A-AAT----C--GA-T-ACC----A-A-ATT-TA-A-C-A--AC-AT-G--T-A-T--AG------CAC-A---GG---C-T-A--AA-TG-A--A--ATTGCG-T-ATTTGTGACGGA-G------T-C-TAT-T-GATT-----G-TGG--C-TC-A-AAC-T-----C--TA---TT-A-CT-C--TA--T----T-ACAA
gi|81122 : AGT-A-TGGGA-A-CCA-TC-A-T-GG-------A--G-TT-A-GCTG----G--T----C-ATTT--TC---AC--------AAAA-A-TATT---AGGT-AA-------A--CA---TGAAT-GA----AA--AT-G-GGTT--C---TAT--AATT-G-A----A-AA-----C-----T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--ACAAG-A--A-A-A--A-------CAC-A---GG-T-C-T-A--AA--G-A--A--AT---G-TAAC--------AA-A------C-C-AAT-T-GA-T-----G-TGG--C-T--ATTAC-T-----C--TA---AT-A-TT-C-ATA--CA-G-T-ACAAgt
gi|81123 : T-A-TGG-A-A-CCAATC-A-T-GG-------A--G-TT-A-G-TG----A--T----C-ATTT--TC---AC-------AAAAA-A-TATTA--A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-G------A--AT-GTGTAT--C---TAT--AA-T-G-AAG--A-AA-----CA-GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--AC-AG-A--ATA-C--A-------GAC-AAGGGG-TAC-T-A--AA-TG-T--A--AT---G-T-AC--------AA-A------C-C--AT-T-GACT-----A-TGG--C-T--A-TAC-T-----CTATA---AT-A--G-C-ATAG-CA---T-ACAA
gi|81124 : G-------A--G-TT-ATG-TG----G--TGCGAT-ATTT--TCT--ACTTGCTAAAAAAG-A-TAAT---A-AT-AAGATTATAA--CA---TGAAT-AGTGACAA--AT-A-GTGTGCT---TAC--AA-T-A-AAG--ATAAGC---C--GAAT-G-C----A-TTACTGTAAG-C-A--ACGAG-AT-A-A-C--A-------CAG-A---AT-T-C-T-A--AA-TG-AC-A--ATT--G-T-AC--------AA-A------C-C-AAT-TCGA-TCATGGG-TGGTTC-T--ACTAC-T-----C--TAAACAT-A-AC-C-ATAATCA-G-T-
gi|81125 : ctatcattgaacT-AA-------A--CA---TCAAT-G-----AA--AT-A-GTG---A---TAT--AA-T-G-AAGAAA-AA-----C--AA-T-G-C----A-T-A---T--G-C----GT-AG-------------------CAT-G--------C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AA-A------C-C-AAT-
gi|81126 : T--AA-T-G-AAG--A-AA-----C--GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--AA-AG-AGAA-A-C--C-------CAT-A---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AA-A------T-C-AAT-T-GA-T-----G-TGG--C-T--A-TAC-T-----C--TA---AT-A-CT-C-ATA--CA-G-T-ACAA
gi|81127 : T-T--G-C-A--AC-AG-A--A-A-C--A-------CAT-A---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AA-A------C-C-AAT-T-GA-C-----G-TGG--C-T--A-TAC-T-----C--TA---AT-A-C--C-ATA--CA-G-T-ACAA
blockSeqs : C C G C A A G G T CAAGCGA AT A T T C CGAA AT GCGA C AT CAA TTGCTAA C C TCA G G GATTATA AA ATT T GTGAC AT C A GC TCA TA T C A AA T GGGGG CG A C C TAAA A T G TG C C GT A C GA T A TT GAAGAACCATCATCC T A G T TC G A TG GC TGC T A TTGTGACG T CCTTGG G A G C T CATGG T GC A TA T C GAGTA TA AAC G G G A AT C C A
blockSeqs : C . . . . A . . . . . . . . . . G . . C CA TCAA . C A . . . . AT . A . . T T . T T . . . . AC A . . . . . . . AA G . C G T T . . . GACAAGG . . . A . . . C . T . A . . . . . . . C C . TT . TA T . C T C A . . A G . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . T . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GC . . . . . . . . T . . . . . T . . . GCACA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C C . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . A . . . . . . . . . CACC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CACA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAGA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CATG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CTA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TC-A-T-GG-------A--G-TT-A-G-TG----G--T----C-ATTT--TC---AC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-G-----AA--AT-G-GTGT--C---TAT--AA-T-G-AAG--A-AA-----C--GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--AC-AG-A--A-A-C--A-------CAT-A---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AA-A------C-C-AAT-T-GA-T-----G-TGG--C-T--A-TAC-T-----C--TA---AT-A-CT-C-ATA--CA-G-T-ACAA
finalCons : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TC-A-T-GG-------A--G-TT-A-G-TG----G--T----C-ATTT--TC---AC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-G-----AA--AT-G-GTGT--C---TAT--AA-T-G-AAG--A-AA-----C--GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--AC-AG-A--A-A-C--A-------CAT-A---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AA-A------C-C-AAT-T-GA-T-----G-TGG--C-T--A-TAC-T-----C--TA---AT-A-CT-C-ATA--CA-G-T-ACAA
Alignments
lowQualScore : 1111111 11111 111111111111111 11111
lowQualScore : 4 2 2 2 2 6 2 2 2 6666666 22 2 2 2 2 4444 55 4444 2 55 888 1111111 2 6 555 2 2 6666666 22 666 2 77777 22 2 4 44 333 44 3 1 1 22 1 11111 44 1 1 1 4444 1 1 1 88 3 1 44 3 3 66 1 1 22 666666666666666 1 1 1 3 22 1 1 44 22 555 1 3 66666666 1 555555 1 1 1 1 3 66666 1 55 1 77 5 1 00000 44 555 3 1 1 3 44 1 1 1
lowQualScore : . . . . . . . . . ....... .. . . . . .... .. .... . .. ... ....... . . ... . . ....... .. ... . ..... .. . . .. ... .. . . . .. . ..... .. . . . .... . . . .. . . .. . . .. . . .. ............... . . . . .. . . .. .. ... . . ........ . ...... . . . . . ..... . .. . .. . . ..... .. ... . . . . .. . . .
lowQualScore : 4 2 2 2 2 7 2 2 2 8888888 99 1 1 1 1 5555 00 5555 1 00 777 3333333 1 3 888 1 0 5555555 88 222 0 00000 88 0 0 88 555 55 8 9 9 66 9 99999 55 9 9 9 0000 9 9 8 66 6 8 33 6 6 11 8 8 55 999999999999999 8 8 8 6 55 8 8 33 55 000 8 6 66666666 8 222222 8 8 8 9 8 77777 9 22 9 11 7 9 55555 55 222 8 9 9 8 55 9 9 9
consensus : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TC-A-T-GG-------A--G-TT-A-G-TG----G--T----C-ATTT--TC---AC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-G-----AA--AT-G-GTGT--C---TAT--AA-T-G-AAG--A-AA-----C--GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--AC-AG-A--A-A-C--A-------CAT-A---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AA-A------C-C-AAT-T-GA-T-----G-TGG--C-T--A-TAC-T-----C--TA---AT-A-CT-C-ATA--CA-G-T-ACAA
Reference ( family-766 ) : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TC-A-T-GG-------A--G-TT-A-G-TG----G--T----C-ATTT--TC---AC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-G-----AA--AT-G-GTGT--C---TAT--AA-T-G-AAG--A-AA-----C--GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--AC-AG-A--A-A-C--A-------CAT-A---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AA-A------C-C-AAT-T-GA-T-----G-TGG--C-T--A-TAC-T-----C--TA---AT-A-CT-C-ATA--CA-G-T-ACAA
gi|81106 : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TC-A-T-GA-------A--G-TT-A-G-TG----G--T----C-ATTT--TC---AC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-G-----AA--TT-G-GTGT--C---TAT--AA-T-G-AAG--A-AA-----C--GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--AC-AG-A--A-A-C--A-------CAT-A---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AA-A------C-C-AGT-T-GA-C-----G-TGG--C-T--A-TAC-T-----C--CA---AT-A-CG-C-ATA--CA-G-T-ACAA
gi|81107 : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TC-A-T-GA-------A--G-TT-A-G-TA----G--T----C-ATTT--TT---AC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-G-----AA--AT-G-GTGT--C---TAT--AA-T-G-AAG--A-AA-----C--GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--AC-AG-A--A-A-CTTT-------CAC-C---AG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AA-A------C-C-AAT-T-GA-T-----G-TGG--C-T--A-TAC-T-----C--TA---AT-A-CT-C-ATA--CA-G-T-ACAA
gi|81108 : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TC-A-T-GG-------A--G-TT-A-G-TG----G--T----C-ATTT--TC---AC-------AAAAA-A-TATT---A-AT-AG-------A--CA---TGAAT-G-----AA--AT-G-GTTC--C---TAT--AA-T-G-AAG--A-AA-----T--GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--AC-AG-A--A-A-T--A-------C---A---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AA-A------C-C-AAT-T-GA-T-----G-TGG--C-T--A-TAC-T-----C--TA---AT-A-CT-C-GTA--CA-G-T-ACAA
gi|81109 : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TC-A-T-GA-------A--G-TT-A-G-TG----G--T----C-ATTT--TC---AT-------AAAAA-ACTATT---A-AT-AA-------A--CA---TGAAT-G-----AA--AT-G-GTGT--T---CAT--AA-T-G-AAA--A-AA-----C--GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--AC-AGCG--A-A-C--A-------CAT-A---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AA-A------C-C-AAT-T-GA-T-----G-TGG--C-CTAA-TAC-TC----C--TA---AT-A-CT-C-ATA--CA-G-T-ACAA
gi|81110 : GTAGT-A-TGG-A-A-GCC-TC-A-T-GA-------A--G-TT-A-G-TG----G--T----C-ATTT--TC---AT-------AAAAA-ACTATT---A-AT-AA-------A--CA---TGAATTG-----AA--AT-G-GTCT--G---TCT--AA-T-G-AAA--A-AGGGGGGC--GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--AC-CG-A--A---C--A-------CAT-A---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AA-A------C-C-AAT-T-GA-T-----G-TGG--C-CTAA-TAC-TC----C--TA---AT-A-CT-C-ATA--CA-G-T-ACAAat
gi|81111 : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TC-A-T-GG-------A--G-TT-A-G-TT----G--T----C-ATTT--TC---AC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-G-----AA--AT-G-GTGT--C---TAT--AA-T-G-AAG--A-AA-----C--GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--AC-AG-A--A-A-C--A-------C---G---GG-T-C-T-A--AA-TA-A--A--AT---G-T-AC--------AA-ACCTTGGC-C-AAT-T-GA-T-----G-TGG--T-T--A-TAC-T-----C--AA---AG-A-CT-C-ATG--CA-G-T-ACAAat
gi|81112 : GTAGC-A-GGA-A-A-CCA-TC-A-T-GG-------A--G-TT-A-G-TG----G--T----CCATTT--TC---AC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-G-----AA--AT-G-GTGT--TTCATAT--AA-T-G-AAG--A-AA-----C--GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--AC-AG-A--A-A-C--A-------C---C---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---GTT-AC---------A-A------C-C-AAT-T-GA-T-------T-G--C-T--A-TA--T-----C--T----AT-A-CT-C-ATA--CA-G-TAACAA
gi|81113 : GTAGTCA-TGG-A-A-CCAATC-A-T-GG-------A--G-TT-A-G-TG----G--T----C-ATTT--TCCAAGC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CT---TGAAT-G-----CA--AT-G-GTGT--C---TAT--AA-TCG-AAG--A-AA-----TCGGA-T-G-C----A-T-A-T-T--G-C-AC-AC-AG-A------------------AT-C---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AATA------C-C-AAT-T-GA-T-----G-TGA--C-T--A-TAC-T-----C--TA---AT-AGCT-C-ATA--CA-GCT-ACGA
gi|81114 : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TCGA-T-GG-------A--G-TT-A-C-TG----G--T----C-ATTT--TC---AC--------AAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-G-----AAATAT-G-G-GT--C---T-T--AATT-G-AAG----AA-----C--TA-T-G------A-T-ATT-T--G-C-A--AC-AA-G--A-A-A--A-------CA--A---GGTT-C-T-A--AAGTG-A--A--AT---G-T-A---------AA-A------C-CAAAT-T-GA-T-----GTTGG--C-T--ATTAC-T-----C--TA---AT-A-TT-CAATA--CA-G-T-ACAA
gi|81115 : GTAGT-A-TGG-A-A-CCA-TC-A-TTGG-------A--G-TT-A-G-TG----GG-T----C-ATAT--TC---AC-------AACAACA-TACTTCAA-GT-AA-------AAACA---TGAAT-G-----AA--AG-G-TTGT--C---TAT--AA-T-G-A-G--A-AA-----C--GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-CCA--AC-AG-A--A-AAC--AA------CA--A---GG-T-C-TTA--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AA-A------C-C-AAT-T-GA-T-----G-TGG--CAT--A-TA--T-----C--TAC--AT-A-CT-C-ATA--CA-G-T-ACAA
gi|81116 : GTAGT-A-CGG-A-A-ACA-TC-A-T-GG-------A--G-TT-A-G--G----G--T----C-ATTT--TC---AC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A---A---TG-AT-G-----AA--AT-G-GTGT--T---CTT--AA-T-GAAAG--A-AA-----C--TA-TCG-C----C-T-ATT-T--G-C-A--AT-AG-A--A-A-C--A-------C-------GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-GC--------AA-A--------C-AAT-T-GA-T-----G-TGG--C------TAC-TGAGTAT--TA---AT-A-CT-C-ATA--CA-G-T-ACAA
gi|81117 : GTAGTCA-TGG-A-AACCAATC-AGT-GG-------A--GATT-A-G-TGCGAAG--C----C-ATTT--TCCA-AC-------AAAAA-A-TATT---A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-G------A--AT-G-GTGT--C---TAT--AA-T-G-ATA--A-AA-----C--GA-T-G-T----A-T-ATC-TTGG-C-A--AC-AG-A--A-A-C--A-------C-T-A---GG-T-CGT-A--CA-TGAA--A--AT---G-TAAC--------AA-A------CGC-AAT-T-GA-T-----G-TGGGCC-T--A-TAC-T-----C--TA---AT-T-CTGCAATA--CACG-T-ACAA
gi|81118 : GTTGT-A-TG--A-A-CCA-TC-A-T-GG-------A--G-TT-A-G-TG----G--T----C-ATTT--TG---AC-------AAAAA-G-TATT------T-AA-------A--CA---TGAAT-G-----AA--AT-GAATGT--C---TAT--AA-G-T-AGG--A-AAAC---T--GA---G-C------T-AAT-T--ACC-A--AC-AG-AT-A-A-C--A-------CAT-A---GG-T-G-TAA--AA-TG-A--AGCAT---T-T-AC--------AA-A------C-C-AAT-T-GA-T-------TGG--C-T--A-TAC-T-----CT-TA---ATGA-CT-C-ATA--CA-A-T-ACAA
gi|81119 : GTAGT-A-TGG-ACA-CTA-TT-A-T-GG-------GATG-TT-A-G-CG----G--T----C-ATTT--TC---AC-------AAAAA-----TT---G-GT-AA-------A--CAAT-TGAAT-G-----AA--ATCA-GTGTT-C---TATT-AA-T-G-AAG--A-AA-----C--GA-T-G-C----AAT-ATT-T--GGC-A--AT-ATTA--A-A-C--A-------CC------GG-T-C-G-A--AA-TT-ATGA--AT---G-T-GC--------AA-A------C---AAT-T-GA-TC----G-TAG--C----A-TACCT-----C--TA---AT-A-CT-C-ATA--CA-G-T-ACAA
gi|81120 : GTAGT-A-TGG-A-A------------------------G-TT-A-T-CG----GATC----C-ATTTC-TC---ACTCAA---AAAAA-A-GATT---A-GTGAA-------A--CA---TTAAA-G-----AA--AT-G-GTGT--C---TATTAAA-T-G-AAG--T-A------C--GA-T-G-CTAAAA-T-ATT-TT-G-C-AGTAT-AG-A--A-A-C--AGAAGAACCATCATCCGG-T-C-T-ATCAA-TG-A--A--AT---G-T-GC--------AA-A------C-C-AATGT-GA-T-------TAG--C-T--A-TAC-TG----C--CA---ATAA-CT-C-ATA--C--G-T-ACA
gi|81121 : TAGT-ACTGG-G-A-CCA-AC-A-T-GACAAGCGAA--G-TTTA-G-TG----G--T----C-ATTTATTC---AC-------AAAAA-AATAAT---T-GT-AA-------A--CGATTTCAAT-G-----AA---T-G-TAGT--C---TAT--AA-T-G-AAA--A-AAT----C--GA-T-ACC----A-A-ATT-TA-A-C-A--AC-AT-G--T-A-T--AG------CAC-A---GG---C-T-A--AA-TG-A--A--ATTGCG-T-ATTTGTGACGGA-G------T-C-TAT-T-GATT-----G-TGG--C-TC-A-AAC-T-----C--TA---TT-A-CT-C--TA--T----T-ACAA
gi|81122 : AGT-A-TGGGA-A-CCA-TC-A-T-GG-------A--G-TT-A-GCTG----G--T----C-ATTT--TC---AC--------AAAA-A-TATT---AGGT-AA-------A--CA---TGAAT-GA----AA--AT-G-GGTT--C---TAT--AATT-G-A----A-AA-----C-----T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--ACAAG-A--A-A-A--A-------CAC-A---GG-T-C-T-A--AA--G-A--A--AT---G-TAAC--------AA-A------C-C-AAT-T-GA-T-----G-TGG--C-T--ATTAC-T-----C--TA---AT-A-TT-C-ATA--CA-G-T-ACAAgt
gi|81123 : T-A-TGG-A-A-CCAATC-A-T-GG-------A--G-TT-A-G-TG----A--T----C-ATTT--TC---AC-------AAAAA-A-TATTA--A-GT-AA-------A--CA---TGAAT-G------A--AT-GTGTAT--C---TAT--AA-T-G-AAG--A-AA-----CA-GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--AC-AG-A--ATA-C--A-------GAC-AAGGGG-TAC-T-A--AA-TG-T--A--AT---G-T-AC--------AA-A------C-C--AT-T-GACT-----A-TGG--C-T--A-TAC-T-----CTATA---AT-A--G-C-ATAG-CA---T-ACAA
gi|81124 : G-------A--G-TT-ATG-TG----G--TGCGAT-ATTT--TCT--ACTTGCTAAAAAAG-A-TAAT---A-AT-AAGATTATAA--CA---TGAAT-AGTGACAA--AT-A-GTGTGCT---TAC--AA-T-A-AAG--ATAAGC---C--GAAT-G-C----A-TTACTGTAAG-C-A--ACGAG-AT-A-A-C--A-------CAG-A---AT-T-C-T-A--AA-TG-AC-A--ATT--G-T-AC--------AA-A------C-C-AAT-TCGA-TCATGGG-TGGTTC-T--ACTAC-T-----C--TAAACAT-A-AC-C-ATAATCA-G-T-
gi|81125 : ctatcattgaacT-AA-------A--CA---TCAAT-G-----AA--AT-A-GTG---A---TAT--AA-T-G-AAGAAA-AA-----C--AA-T-G-C----A-T-A---T--G-C----GT-AG-------------------CAT-G--------C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AA-A------C-C-AAT-
gi|81126 : T--AA-T-G-AAG--A-AA-----C--GA-T-G-C----A-T-ATT-T--G-C-A--AA-AG-AGAA-A-C--C-------CAT-A---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AA-A------T-C-AAT-T-GA-T-----G-TGG--C-T--A-TAC-T-----C--TA---AT-A-CT-C-ATA--CA-G-T-ACAA
gi|81127 : T-T--G-C-A--AC-AG-A--A-A-C--A-------CAT-A---GG-T-C-T-A--AA-TG-A--A--AT---G-T-AC--------AA-A------C-C-AAT-T-GA-C-----G-TGG--C-T--A-TAC-T-----C--TA---AT-A-C--C-ATA--CA-G-T-ACAA