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Reference ( family-756 )      : AAATACGTGAAGA----AA-T-AAAATTTGT--GT---TA-ACGCCGACGCGGGGAGTC-G-A-ACTC-ACGACG-TCGCGG-TTG-GCGGTCCGGAGCGT--TA-CCGA-CTGAGCTACGCAG-G-CC-CATG----AG--C----AT--T--GAGTC-GT-TAAT-TTT-T-ATTAT-A-A-----AGTTAACA--T-TGGCCTCCAGT-TCTA-------AATAC--C--C--G---T--T----T---AAG--AATTT
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gi|134647                     :   ATACATGAAGA----AA-TTAAAATTTGT--AT---TT-TCGCCGTTTCGCCGAGTC-C-A-ACTC-ACGACG-TCGCGA-TTG-GAAGTCCGGAGCGT--TA-CCGA-CTGAGCTACGCAGAG-CC-TAT-----AG--C----AT--T--ATGTC-GT-TAAT-TAT-T-ATTAT-A-t
gi|134648                     :    TACGTGAAGA----AA-T-AAAATTTGT--GT---TA-ACGC
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gi|134651                     :     ACG-GAAGA----AAAT-CAAATGTGT--GT---TA-ACGCC-ACGCGGGGAGTC-G-A-AATC-ACGACGTTTGCGG-TGGTGCGGT-CGGAGCG---TA-CCGA--TGAGCTACGCAG-G-CCACATG----AG--CCA--AT--T---AGTCAGT-TAATGTTT-T-ATTAA-A-A-----AGGTAACA--TATGGCATACCGTAACTA-------AA-A---C--C--G---T--TTA--T---AAG--AATT
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gi|134653                     :        TGAAGA----AA-G-AAAATATGT--GT---TA-A-GCCGA-GGGGGAGGTC-G---ACTC-AGGACG-T-GCGG-TTG-G-GTCCCGGAGCGT--TATCCG---TGAGC-A-GCAG-G--C-CATG----AG--C-----T--T--G-GTC-GTGTATT-TTT-T-ATT-----A-----AGTTAATA--
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gi|134655                     :                                                                                                                       ACGCAG-G-CC--ATG----AG--C----AT--TTGGAGTC-GT-TAAT-TGTGT-ATTAT-A-A-----GGTTAATACTT-TGGCCTCCAGT-TCTA-------AATAC--C--CT-T---T--T----T---AAG--AATTT





Alignments
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Reference ( family-756 )      : AAATACGTGAAGA----AA-T-AAAATTTGT--GT---TA-ACGCCGACGCGGGGAGTC-G-A-ACTC-ACGACG-TCGCGG-TTG-GCGGTCCGGAGCGT--TA-CCGA-CTGAGCTACGCAG-G-CC-CATG----AG--C----AT--T--GAGTC-GT-TAAT-TTT-T-ATTAT-A-A-----AGTTAACA--T-TGGCCTCCAGT-TCTA-------AATAC--C--C--G---T--T----T---AAG--AATTT
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blockSeqs                     :              .     . .         .   .    .                  . . .    .      .      .   . A            .   .    .             . .  .    .     .  .     .  AC     .  .    .   . .     . T              .  .           .    .           .  .  G      .  .    .     . 
blockSeqs                     :              .     . .         .   .    .                  . . .    .      .      .   . C            .   .    .             . .  .    .     .  .     .  AC     .  .    .   . .     . A              .  .           .    .           .  .  G      .  .    .     . 
blockSeqs                     :              .     . .         .   .    .                  . . .    .      .      .   . C            .   .    .             . .  .    .     .  .     .  GA     .  .    .   . .     . A              .  .           .    .           .  .  G      .  .    .     . 
blockSeqs                     :              .     . .         .   .    .                  . . .    .      .      .   . C            .   .    .             . .  .    .     .  .     .  GA     .  .    .   . .     . A              .  .           .    .           .  .  G      .  .    .     . 
blockSeqs                     :              .     . .         .   .    .                  . . .    .      .      .   . A            .   .    .             . .  .    .     .  .     .  AC     .  .    .   . .     . T              .  .           .    .           .  .  A      .  .    .     . 
blockSeqs                     :              .     . .         .   .    .                  . . .    .      .      .   . A            .   .    .             . .  .    .     .  .     .  AT     .  .    .   . .     . T              .  .           .    .           .  .  G      .  .    .     . 
blockSeqs                     :              .     . .         .   .    .                  . . .    .      .      .   . A            .   .    .             . .  .    .     .  .     .  AT     .  .    .   . .     . A              .  .           .    .           .  .  T      .  .    .       
blockSeqs                     :              .     . .         .   .    .                  . . .    .      .      .   . A            .   .    .             . .  .    .     .  .     .  AC     .  .    .   . .     . T              .  .           .    .                                        
blockSeqs                     :              .     . .         .   .    .                  . . .    .      .      .   . C            .   .    .             . .  .    .     .  .     .  AT     .  .    .   . .     . A              .  .           .    .                                        
blockSeqs                     :              .     . .         .   .    .                  . . .    .      .      .   . A            .   .    .             . .  .    .     .  .     .  GA     .  .    .   . .     . A              .  .           .    .                                        
blockSeqs                     :              .     . .         .   .    .                  . . .    .      .      .   . C            .   .    .             . .  .    .     .  .     .  A      .  .    .   . .     . A              .                                                            
blockSeqs                     :              .     . .         .   .    .                  . . .    .      .      .   . .            .   .    .             . .  .    .     .  .     .  G      .  .    .   . .     .                                                                             
blockSeqs                     :              .     . .         .   .    .                  . . .    .      .      .   . .            .   .    .             . .  .    .     .  .     .  .      .  .                                                                                              
blockSeqs                     :                                .   .    .                                                                                   . .  .    .     .  .     .                                                                                                           


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                      **
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Alignments
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lowQualScore                  :              4444  1 7         22  333  3                  1 1 1    1      1      3   1 3            22  1    1             1 1  1    3333  22 6666  55 7777   1  1    2   2 2     2 7777777        55 2           2    7777777     33 33 888888 33 9999 777   33     
lowQualScore                  :              ....  . .         ..  ...  .                  . . .    .      .      .   . .            ..  .    .             . .  .    ....  .. ....  .. ....   .  .    .   . .     . .......        .. .           .    .......     .. .. ...... .. .... ...   ..     
lowQualScore                  :              0000  9 6         55  222  6                  9 9 9    9      9      8   9 1            66  9    9             8 8  8    9999  55 4444  00 4444   9  9    0   0 0     0 1111111        00 2           2    2222222     77 77 111111 77 3333 333   99     
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Reference ( family-756 )      : AAATACGTGAAGA----AA-T-AAAATTTGT--GT---TA-ACGCCGACGCGGGGAGTC-G-A-ACTC-ACGACG-TCGCGG-TTG-GCGGTCCGGAGCGT--TA-CCGA-CTGAGCTACGCAG-G-CC-CATG----AG--C----AT--T--GAGTC-GT-TAAT-TTT-T-ATTAT-A-A-----AGTTAACA--T-TGGCCTCCAGT-TCTA-------AATAC--C--C--G---T--T----T---AAG--AATTT
gi|134633                     : AAATATGTGAAGA----AA-T-AAAATTTGT--GA---TA-ACGCCAACGCGCGGAGTC-G-A-ACTC-ACGACG-TCGCGG-TTG-GCGGTCCGGAGCGT--TA-CCGA-CTGAGCTACGCAG-G-CC-CATG----AG--C----ATAAT--GAGTC-GT-TAAT-TTT-T-ATTGT-A-A-----AGTTAACA--T-TGGCCTCCAGT-TCTA-------AATAC--C--C--G---T--T----T---AAG--AATTT
gi|134634                     : AAATCCGTGAAGA----AA-T-AAAATTTGT--TT---TA-ACGCCAACGCGGTGAGTC-A-A-ACTC-ACGACG-TCGCAG-TTG-GCGGTCAGGAGCGT--CA-CCGA-CTGAGCTACGCAG-G-CC-CATA----AA--C----AT--T--GAGTA-GT-TAAT-TTT-T-ATTAT-A-A-----AGTTAACA--T-TGGCCTCTAGT-TCTA-------AATAC--C--C--GT--T--T----T---AAG--AATTT
gi|134635                     : AAATACGTGAAGA----AA-T-AAAATTTGT--GC---TA-ACGCCGACGCTGGGAGTC-G-A-ACTC-ACGACG-TCGTGG-TTG-GAGGTCCGGAGCGT--TA-CCGA-CTGAGCTACACAG-G-CC-CTTA----AG--C----AT--T--GAGTC-GT-TAAT-TTT-T-ATTAC-A-T-----AGTTAACG--T-TCGCCTCCAGT-TCTA-------AATAC--C--C--G---T--TTTTAT---AGA--AATTT
gi|134636                     : AAACACGTGAAGA----AA-T-AAAACTTGT--GT---TA-ACGCCGACGCGGGCAGTC-G-A-GCTC-ATGACG-TCACGG-TTG-GCGGTCCGGAGCGT--TA-CCGA-CTTAGCTAC-------------------G--C----AT--T--GAGTC-GT-TAAT-TTT-T-GTTAT-A-A-----AGTTAACA--T-TAGTCTCTAGT-TCTA-------AATAC--C--C--GT--T--T----T---AAG--AATTT
gi|134637                     : AAACACGT-AAGA----A--T-A---CTTGT--GT---TA-ACGCCGACGCGGGCAGTCAG-AGACTC-ATGACG-TTACGT-TGG-GCGGTCCGGAGCGT--TA-CCGA-CT-AGC----------CT-GATC----AG--C----AT--T--GAGTC-GT-TAAT-TTT-T-GTT-T-ATA-----AGTTAACAT-T-TAGTCTCTAGT-TCTA-------AATACCTC--C--G---T--T----TTTAAAG--AAATT
gi|134638                     : AAAGACGTGAAGA----AA-TTAAAATTTGT--GT---TA-ACGCATAAG-AGGGAGTC-GAA-ACTC-ACGA-G-TCTCGGCTTG-GC-GTCCGGAGCGT--TA-CCGAGCTGAGCTACGCAG-GCCC-CATG----A---C----AT--T--GTGTC-G--TAAT-TTT-TCATTATAA-A-----AGTTAACA--T-TGGCCTCCAGT-TCTA-------AATAC--C--C--G---T--T----TA--AAG--AATT
gi|134639                     : AAATACGTGAAGA----AA-T-AAAATTTCA--AT---TA-ACGCTGACACGGAGAATC-A-A-ACTC-ACAACG-TCGCGA-TTG-GAAGTCTGGAGCGTTATA-CCGA-CTGAGTTATGCAG-G-CC-CTTG----AG--C----AT--T--ACGCT-GT-TAAT-TTT-T-ATTAT-ATACATGTAGTTAACA--T-TGGCCTCCAAT-TCTA-------AATAC--C--C--GTT-T--T----T---AAG--AATTT
gi|134640                     : AAATACGTGAAGA----AA-TTAAAATTCGT--GT---TA-ACGCCGACGCGGGGAGTC-G-A-ACTA-ACAACG-TCGCGG-TTG-GCGGTCCGGAACTT--TA-CCGA-CTGAGCTACGCAG-G-CC-CATG----AA--C------------------C-TAA--ATT-T-ATTAT-A-A-----AGTTAAAA--T-TGGCCTCCAGT-TCTA-------A
gi|134641                     : AAATACGTGAAGA----AA-T----ATTTTT--TTTCGTA-TCGTCAACGCGGGGAGTC-G-A-ACTC-ACGACG-TCGCGA-TTG-AAAGTCCGGAGCGT--TA-CCGA-CTGAGCTACGCGG----C-CATG----AG--C----AT--T--ACGTT-GT-TAAA-TTT-T-ATTGT-A-T-----AGTT-ACA--T-TGGCCTCCTGT-TCTA-------AATAC--C--CGTG---T--T----T---ACG--AGTTT
gi|134642                     : AAATACGTGAAGA----AA-T-AAAATTTGT--GT---TA-ACGCCGACGCGGGGAGTT-T-A-ACTC-ACGACG-TCGCGG-TTG-----------GCGT--TA-CCGA-TTGAGCTACGCAG-G-CC-CATG----AATCC----ATGCT--GAGTC-GT-TAA----T-T-AATAT-A-A-----GTTCAACA--G-TGG-CTCGATT-TCTA-------GA
gi|134643                     : AAATACGTGAAAA----AA-T-AAAATTTGT--GT---TA-GCGCTAACCCCGGAAGTC-G-A-ACTC-ACGACG-TCGCGG-TTG-GCGGTCCGGAGCTT--TA-TTGA-CTGAGCTACACAT-G-CC-CATG----AG--C----AT--T--GAGAC-GT-T
gi|134644                     : AAATACGTGTAGA----AA-T-AAAACCTGC--TT---TA-ACGCCGACGCGGGGAGTC-G-A-AATC-ACGACG-TCGCGG-TTG-GCGGTTCGGAGCAA--TA-CCGA-CTGAGCTACGCAG-G-CC-CATG----AA--C----AT--
gi|134645                     :  AATACGTGAAGA----AA-T-GAAATTTGT--GT---TA--CGA-GACGCGGGGAGTC-G---ACTC-ACGACG-TCGCGGCTTA-GCGGTCCGGAGCGT--TA-CCGC-ATGAGCTACGCAG----C-CACA----AG--C----AT--TG-GAGC---T-TAAT-TCT-T-ATTAT-T-A-----A-T--ATA--T-TGGCTTCTAGT-TCTA-------AAT
gi|134646                     :   ATACAGGAATA----AA-T-AACATTTTT--TT---TCTACGCCGTTGCGAGGAGTC-G-A-ACTG-AAGACG-TTGCTG-TTG-GATGTCCGGAACGT--TA-CTGA-ATGAGCTACGCAG-A-CC-CTCG----AG--C----AT--T--ACGTT-GT-TAAT-CTT-T-ACTAT-A-A-----AGTTAACA--T-TAGCCCTCAGT-TCTA-------AATAC--C--C--G---T--T----T---
gi|134647                     :   ATACATGAAGA----AA-TTAAAATTTGT--AT---TT-TCGCCGTTTCGCCGAGTC-C-A-ACTC-ACGACG-TCGCGA-TTG-GAAGTCCGGAGCGT--TA-CCGA-CTGAGCTACGCAGAG-CC-TAT-----AG--C----AT--T--ATGTC-GT-TAAT-TAT-T-ATTAT-A-t
gi|134648                     :    TACGTGAAGA----AA-T-AAAATTTGT--GT---TA-ACGC
gi|134649                     :     ACATGAAGATCGAAA-TTAAAGTTTGT--AA---TT-ACACCGTTACGTGGAGTC-A-A-ACTC-ACGACG-TTGCGG-TTG-GAGGTCCGAAATGT--TA-CCGA-CTGAGCTACACAG-G-CC-CTCG----AG--CAATAAT--T--ATGTT-GT-TAAT-TTT-C-ATTAT-A-T-----AGTTAACA--T-TAGTCTCCAGT-TCTA-------AATAT--C--C--A---TTCT----T---AAA--AGTT
gi|134650                     :     ACGTAAAAC----AA-T-CAA--TTATCAAT---CATACGCCGTTGCGGGGAGTA-G-G-ACTC-GCGACG-TCGTGG-ATG-GATGTCCGAAGTGT--TA-CCAA-CTGAGCTACGCAG-G-CC-CTCC----AG--C----GT--T--ACATT-GT-TAAT-CTT-T-AATAT-A-T-----AATTAACA--T-TAGCCCCCAGT-TCTA-------AATAC--T--C--GTT-T--T----T---AAG--AGTTT
gi|134651                     :     ACG-GAAGA----AAAT-CAAATGTGT--GT---TA-ACGCC-ACGCGGGGAGTC-G-A-AATC-ACGACGTTTGCGG-TGGTGCGGT-CGGAGCG---TA-CCGA--TGAGCTACGCAG-G-CCACATG----AG--CCA--AT--T---AGTCAGT-TAATGTTT-T-ATTAA-A-A-----AGGTAACA--TATGGCATACCGTAACTA-------AA-A---C--C--G---T--TTA--T---AAG--AATT
gi|134652                     :        TGAAGA----AA-T-AAAATTTGT--GT---TT-AGGCCGACGCAGTGAGTC-G-A-TCTCCACGACG-TCGCGA-TGG-GAGGTCCGGAGCGT--TA-CCGA-CTGAGCTATGCA--G-CC-TTTG----AG--C----AT--T--ATGTT-G--TAAT-TTT-T-ATAAT-A-T-----AGTTAATA--T-TGGCCTCCAGT-TCTAAGAGTTTAATAC--CAAC--T---T--T----T---AGGTAAATT
gi|134653                     :        TGAAGA----AA-G-AAAATATGT--GT---TA-A-GCCGA-GGGGGAGGTC-G---ACTC-AGGACG-T-GCGG-TTG-G-GTCCCGGAGCGT--TATCCG---TGAGC-A-GCAG-G--C-CATG----AG--C-----T--T--G-GTC-GTGTATT-TTT-T-ATT-----A-----AGTTAATA--
gi|134654                     :                           TTTGT--GT---TC-ACGCCGACGCGGGGAGTC-G-A-ACTC-ACGACG-TCGCGG-TTG-GCGGTCCGGAGCGT--TA-CCGA-CTGAGCTACGCAG-G-CC-CATGAGTCAG--C----AT--T--GAGTC-GT-TAAT-TTT-T-ATTAT-A-A-----AGTTAACA--T-TGGCCTCCTGT-TCT--------AATAC--C--C--GGTTT--T----T---AAG--AATTT
gi|134655                     :                                                                                                                       ACGCAG-G-CC--ATG----AG--C----AT--TTGGAGTC-GT-TAAT-TGTGT-ATTAT-A-A-----GGTTAATACTT-TGGCCTCCAGT-TCTA-------AATAC--C--CT-T---T--T----T---AAG--AATTT