lowQualScore : 3333333333
lowQualScore : 22 3 1 88 99 22 44 22 1 22 1 3 5555555555 1 3 66 1 22 1
lowQualScore : .. . . .. .. .. .. .. . .. . . .......... . . .. . .. .
lowQualScore : 99 0 9 11 55 55 33 55 5 55 0 6 2222222222 8 6 11 8 55 8
consensus : TCAAT--TTGAGC-ACAAT-TCN-CA--CCTTATGAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-T-T-ATCTA--C-C-GTAGGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
Reference ( gi|22212 ) : TCAAT--TTAAGC-ACAAT-TCA-CA--CCTTATGAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-T-T-ATCTAT-C-C-GTAGGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22213 : TCAAT--TTAAGC-ACAAT-TCA-CACACCTTATGAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-TCT-ATCTAT-C-C-GCAGGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22220 : TCAAT--TTAAGC-ACAAT-TCA-CA--CCTTATGAATTCACTAAAAT-T--ATTA-TC---T-T-ATCCAG-C-T-AT-GGAAAGCAT-TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22217 : TCAAT--TTAAGC-ACAAT-TCA-CA--CCTTATGAATTTACTAAAA--T--AGTA-TATA-T-C--TCT-C-C-C-GTAGGAAAGCA--TTA-A--TGTATT-ATTT
gi|22206 : TCAAT--TTGAGC-ACAAT-GAT-CA--CCTTATGAATTTACTAAAA--T--ATTG-TCTATT-T-ATC----C-C-ATAGGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22209 : TTAAT--TTGAGC-ACAAT-GCC-CA--CCTTATAAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-T-T-ATT--C-C-C-GTAGG-AAGCAACTTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22210 : TTAAT--TTGAGC-ACAAT-GCC-CA--CCTTATTAATTCACTAAAAATT--ATTA-TC-----T-ATCT-C-C-C-GTAGGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22215 : TTAAT--TTGAGC-ACTAT-GCC-CA--CCTTACAAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-T-T-ATC----C-C-GTAGGAAAGCA---TG-G--TGCCTTAATTT
gi|22208 : TCAAT--TTGAGC-ACTATGTCA--A--CCTTAAGAATTCACTACAA--T--ATTT-TCTA-T-C-ATC----C-C-GTAGGAAAGCA--TTG-A--TGCCGT-ATTT
gi|22219 : TCATT--TTGAGC-ACAAT-TCAATA--CTTTATGATTTCACTTAAA--T----TA-TCTA-T-T----TATAC-C-GTAGGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22207 : TCAAT--TTGAGC-ACAAT-GCC-TA--TCTGATGAATTCACTAAAA--T---TTGTTCTACT-T-ATC----C-C-GTAGGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATCT
gi|22218 : TCAATCTTTGAGCCACAAT-TCA-CA--CCTTATGAA-TCACTAAAA--TCAATCA-TCTA-TCT-TTC----C-C-GTAGGAAAGCA--TTG-G--TGTCTT-ATT
gi|22216 : TCAAA--TTGAGC-ACAAA-TCA-CA--CCTTATCAATTCACTAAAA--T--AGTT-TCTA-TCT-ATC----C-C-GTAGGAAAGCAT-TTG-ATGTGCCTT-GTTT
gi|22214 : TCAAT--TTGAGC-ATAAT-GCT-CA--CCATATGAATTCACTGAAA--T---TTA-TT---C-T-GTCTATCC-C-GTAGGAACGCA--TTG-A--TGCCTT-AT
gi|22221 : TTAAT--TTGAGC-ACTAT-TCA-CA--CCTTATGAATT-------A--T--A-TA-T----T-T-ATCTATCC-C-TTAGGAAAGCA--CTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22211 : TCAAC--TTGAGC-TAAAT-GCC-CA--TCTTATGAATTCACTGAAA--T--ATTT-TCTA-T-T----TAT-C-CTGTAGGAAAGCA--GTG-A--TGCATC-ATTT
gi|22203 : TCAAT--TTGAGC-ACAATGTC--CA--CCTTATGAATTCACTATGA--T--ACGT-TCTA-T-TCATC----C-T-GTAAGATAGCA--TTG-C--TGTCTT-ATTT
gi|22204 : TCAAT--TTGAGC-ACAATGTC--CA--CCTCATGAATTCACTATGA--T--ACGT-TCTA-T-TCATC----C-T-GTAAGATAGCA--TTG-C--TGTCTT-ATTT
gi|22205 : TCAAT--TTGAGC-ACAATGTC--CA--CCTTATGAATTCACTATGA--T--ACGT-TCTA-T-TCATC----C-T-GTAAGATAGCA--TTGTC--TGTCTT-ATTT
gi|22222 : AT--TTGAAA-AAAAT-GCC-TA--CCTTTTAAATTCCCTTATG--C--ACTT-TCTA-T-T----TAT-C-TTGTAGGAAAGCA--TTA-A--TGATTC-ATT
gi|22223 : TAAGC-ACAAT-TCA-CA--CTTTATGAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-TCT-ATC----C-C-GTAGGGAAACA--TTG-G--TGCCTT-ATTT
gi|22224 : -ACAAT-GCC-CA--ACTTATGAATTCACTAAAA--T--A-TA-TT---T-T-ATTTAC-CTT-GTAGGAAAGCA--TTG-G--TGGCTT-ATTT
gi|22225 : CAAT-TCA-CA--CCTTATGAATTCACTAAA---T--ATTA-TCTA-T-----CTAT-C-C-ATAGGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
Alignments
lowQualScore : 111 333
lowQualScore : 22 1 55 22 22 44 22 1 33 5 000 222 22 1 55 1 22 1
lowQualScore : .. . .. .. .. .. .. . .. . ... ... .. . .. . .. .
lowQualScore : 88 8 33 77 44 11 44 0 77 2 777 333 44 7 99 7 44 7
consensus : TCAAT--TTGAGC-ACAAT-GCN-CAC--CTTATGAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-T-T-ATCT--CC--GTA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
Reference ( family-749 ) : TCAAT--TTGAGC-ACAAT-TCN-CAC--CTTATGAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-T-T-ATCTA-CC--GTA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22203 : TCAAT--TTGAGC-ACAAT-GTC-CAC--CTTATGAATTCACTATGA--T--ACGT-TCTA-T-TCATC---CT--GTA-AGATAGCA--TTG-C--TGTCTT-ATTT
gi|22204 : TCAAT--TTGAGC-ACAAT-GTC-CAC--CTCATGAATTCACTATGA--T--ACGT-TCTA-T-TCATC---CT--GTA-AGATAGCA--TTG-C--TGTCTT-ATTT
gi|22205 : TCAAT--TTGAGC-ACAAT-GTC-CAC--CTTATGAATTCACTATGA--T--ACGT-TCTA-T-TCATC---CT--GTA-AGATAGCA--TTGTC--TGTCTT-ATTT
gi|22206 : TCAAT--TTGAGC-ACAAT-GAT-CAC--CTTATGAATTTACTAAAA--T--ATTG-TCTATT-T-ATC---CC--ATA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22207 : TCAAT--TTGAGC-ACAAT-GCC-TAT--CTGATGAATTCACTAAAA--T---TTGTTCTACT-T-ATC---CC--GTA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATCT
gi|22208 : TCAAT--TTGAGC-ACTATGTCA--AC--CTTAAGAATTCACTACAA--T--ATTT-TCTA-T-C-ATC---CC--GTA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCGT-ATTT
gi|22209 : TTAAT--TTGAGC-ACAAT-GCC-CAC--CTTATAAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-T-T-AT-TC-CC--GTA-GG-AAGCAACTTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22210 : TTAAT--TTGAGC-ACAAT-GCC-CAC--CTTATTAATTCACTAAAAATT--ATTA-TC-----T-ATCTC-CC--GTA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22211 : TCAAC--TTGAGC-TAAAT-GCC-CAT--CTTATGAATTCACTGAAA--T--ATTT-TCTATT-T-ATC---CT--GTA-GGAAAGCA--GTG-A--TGCATC-ATTT
gi|22212 : TCAAT--TTAAGC-ACAAT-TCA-CAC--CTTATGAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-T-T-ATCTATCC--GTA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22213 : TCAAT--TTAAGC-ACAAT-TCA-CACACCTTATGAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-TCT-ATCTATCC--GCA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22214 : TCAAT--TTGAGC-ATAAT-GCT-CAC--CATATGAATTCACTGAAA--T---TTATTCTG-TCT-ATC---CC--GTA-GGAACGCA--TTG-A--TGCCTT-AT
gi|22215 : TTAAT--TTGAGC-ACTAT-GCC-CAC--CTTACAAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-T-T-ATC---CC--GTA-GGAAAGCA---TG-G--TGCCTTAATTT
gi|22216 : TCAAA--TTGAGC-ACAAA-TCA-CAC--CTTATCAATTCACTAAAA--T--AGTT-TCTA-TCT-ATC---CC--GTA-GGAAAGCAT-TTG-ATGTGCCTT-GTTT
gi|22217 : TCAAT--TTAAGC-ACAAT-TCA-CAC--CTTATGAATTTACTAAAA--T--AGTA-TATA-T-C--TCTC-CC--GTA-GGAAAGCA--TTA-A--TGTATT-ATTT
gi|22218 : TCAATCTTTGAGCCACAAT-TCA-CAC--CTTATGAAT-CACTAAAA--TCAATCA-TCTA-T-C--TTTC-CC--GTA-GGAAAGCA--TTG-G--TGTCTT-ATT
gi|22219 : TCATT--TTGAGC-ACAAT-TCAATAC--TTTATGATTTCACTTAAA--T----TA-TCTA-T-T--TATA-CC--GTA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22220 : TCAAT--TTAAGC-ACAAT-TCA-CAC--CTTATGAATTCACTAAAAT-T--ATTA-TC---T-T-ATCCA-GC---TATGGAAAGCAT-TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22221 : TTAAT--TTGAGC-ACTAT-TCA-CAC--CTTATGAATT-------A--T--A-TA-TTTA-TCT-ATC---CC--TTA-GGAAAGCA--CTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22222 : AT--TTGAAA-AAAAT-GCC-TAC--CTTTTAAATTCCCTTATG--C--ACTT-TCTA-T-TTATCT---T--GTA-GGAAAGCA--TTA-A--TGATTC-ATT
gi|22223 : TAAGC-ACAAT-TCA-CAC--TTTATGAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-TCT-ATC---CC--GTA-GGGAAACA--TTG-G--TGCCTT-ATTT
gi|22224 : -ACAAT-GCC-CAA--CTTATGAATTCACTAAAA--T--A-TA-TT---T-T-ATTTA-CCTTGTA-GGAAAGCA--TTG-G--TGGCTT-ATTT
gi|22225 : CAAT-TCA-CAC--CTTATGAATTCACTAAA---T--ATTA-TCTA-T-----CTATCC--ATA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
Alignments
lowQualScore : 111 222
lowQualScore : 22 1 222 22 44 22 44 7 111 999 1 1 1 55 1 22 1
lowQualScore : .. . ... .. .. .. .. . ... ... . . . .. . .. .
lowQualScore : 88 8 999 77 11 44 88 0 777 000 7 7 7 99 7 44 7
consensus : TCAAT--TTGAGC-ACAAT--GCN-CACCTTATGAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-T-T-ATC---CC-G-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
Reference ( family-749 ) : TCAAT--TTGAGC-ACAAT--GCN-CACCTTATGAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-T-T-ATC--TCC-G-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22203 : TCAAT--TTGAGC-ACAAT--GTC-CACCTTATGAATTCACTATGA--T--ACGT-TCTA-T-TCATC---CT-G-TA-AGATAGCA--TTG-C--TGTCTT-ATTT
gi|22204 : TCAAT--TTGAGC-ACAAT--GTC-CACCTCATGAATTCACTATGA--T--ACGT-TCTA-T-TCATC---CT-G-TA-AGATAGCA--TTG-C--TGTCTT-ATTT
gi|22205 : TCAAT--TTGAGC-ACAAT--GTC-CACCTTATGAATTCACTATGA--T--ACGT-TCTA-T-TCATC---CT-G-TA-AGATAGCA--TTGTC--TGTCTT-ATTT
gi|22206 : TCAAT--TTGAGC-ACAAT--GAT-CACCTTATGAATTTACTAAAA--T--ATTG-TCTATT-T-ATC---CC-A-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22207 : TCAAT--TTGAGC-ACAAT--GCC-TATCTGATGAATTCACTAAAA--T---TTGTTCTACT-T-ATC---CC-G-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATCT
gi|22208 : TCAAT--TTGAGC-ACTAT--GTC-AACCTTAAGAATTCACTACAA--T--ATTT-TCTA-T-C-ATC---CC-G-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCGT-ATTT
gi|22209 : TTAAT--TTGAGC-ACAAT--GCC-CACCTTATAAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-T-T-ATT--CCC-G-TA-GG-AAGCAACTTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22210 : TTAAT--TTGAGC-ACAAT--GCC-CACCTTATTAATTCACTAAAAATT--ATTA-TCTA-T-C--TC---CC-G-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22211 : TCAAC--TTGAGC-TAAAT--GCC-CATCTTATGAATTCACTGAAA--T--ATTT-TCTATT-T-ATC---CT-G-TA-GGAAAGCA--GTG-A--TGCATC-ATTT
gi|22212 : TCAAT--TTAAGC-ACAAT--TCA-CACCTTATGAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-T-T-ATCTATCC-G-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22213 : TCAAT--TTAAGC-ACAATTCACA-CACCTTATGAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-TCT-ATCTATCC-G-CA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22214 : TCAAT--TTGAGC-ATAAT--GCT-CACCATATGAATTCACTGAAA--T---TTATTCTG-TCT-ATC---CC-G-TA-GGAACGCA--TTG-A--TGCCTT-AT
gi|22215 : TTAAT--TTGAGC-ACTAT--GCC-CACCTTACAAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-T-T-ATC---CC-G-TA-GGAAAGCA---TG-G--TGCCTTAATTT
gi|22216 : TCAAA--TTGAGC-ACAAA--TCA-CACCTTATCAATTCACTAAAA--T--AGTT-TCTA-TCT-ATC---CC-G-TA-GGAAAGCAT-TTG-ATGTGCCTT-GTTT
gi|22217 : TCAAT--TTAAGC-ACAAT--TCA-CACCTTATGAATTTACTAAAA--T--AGTA-TATA-T-C--TC--TCCCG-TA-GGAAAGCA--TTA-A--TGTATT-ATTT
gi|22218 : TCAATCTTTGAGCCACAAT--TCA-CACCTTATGAAT-CACTAAAA--TCAATCA-TCTA-T-C-TTT--CCC-G-TA-GGAAAGCA--TTG-G--TGTCTT-ATT
gi|22219 : TCATT--TTGAGC-ACAAT--TCAATACTTTATGATTTCACTTAAA--T----TA-TCTA-T-TTATA---CC-G-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22220 : TCAAT--TTAAGC-ACAAT--TCA-CACCTTATGAATTCACTAAAAT-T--ATTA-TC---T-T-ATC---CA-GCTATGGAAAGCAT-TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22221 : TTAAT--TTGAGC-ACTAT--TCA-CACCTTATGAATT-------A--T--A-TA-TTTA-TCT-ATC---CC-T-TA-GGAAAGCA--CTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22222 : AT--TTGAAA-AAAAT--GCC-TACCTTTTAAATTCCCTTATG--C--ACTT-TCTA-T-TTATC--TT--G-TA-GGAAAGCA--TTA-A--TGATTC-ATT
gi|22223 : TAAGC-ACAAT--TCA-CACTTTATGAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-TCT-ATC---CC-G-TA-GGGAAACA--TTG-G--TGCCTT-ATTT
gi|22224 : -ACAAT--GCC-CAACTTATGAATTCACTAAAA--T--ATAT-TTTATT-T-ACC--T-T-G-TA-GGAAAGCA--TTG-G--TGGCTT-ATTT
gi|22225 : CAAT--TCA-CACCTTATGAATTCACTAAA---T--ATTA-TCTA-T-C--TA--TCC-A-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
Alignments
lowQualScore : 1
lowQualScore : 22 1 222 22 44 22 44 8 3 7 1 666 1 1 55 1 22 1
lowQualScore : .. . ... .. .. .. .. . . . . ... . . .. . .. .
lowQualScore : 88 8 999 77 11 44 88 7 9 0 7 111 7 7 99 7 44 7
consensus : TCAAT--TTGAGC-ACAAT--GC-NCACCTTATGAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-T-T-A-TC---CCG-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
Reference ( family-749 ) : TCAAT--TTGAGC-ACAAT--GC-NCACCTTATGAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-T-T-A-TC---CCG-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22203 : TCAAT--TTGAGC-ACAAT--GT-CCACCTTATGAATTCACTATGA--T--ACGT-TCTA-T-TCA-TC---CTG-TA-AGATAGCA--TTG-C--TGTCTT-ATTT
gi|22204 : TCAAT--TTGAGC-ACAAT--GT-CCACCTCATGAATTCACTATGA--T--ACGT-TCTA-T-TCA-TC---CTG-TA-AGATAGCA--TTG-C--TGTCTT-ATTT
gi|22205 : TCAAT--TTGAGC-ACAAT--GT-CCACCTTATGAATTCACTATGA--T--ACGT-TCTA-T-TCA-TC---CTG-TA-AGATAGCA--TTGTC--TGTCTT-ATTT
gi|22206 : TCAAT--TTGAGC-ACAAT--GA-TCACCTTATGAATTTACTAAAA--T--ATTG-TCTATT-T-A-TC---CCA-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22207 : TCAAT--TTGAGC-ACAAT--GC-CTATCTGATGAATTCACTAAAA--T---TTGTTCTACT-T-A-TC---CCG-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATCT
gi|22208 : TCAAT--TTGAGC-ACTAT--GT-CAACCTTAAGAATTCACTACAA--T--ATTT-TCTA-T-C-A-TC---CCG-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCGT-ATTT
gi|22209 : TTAAT--TTGAGC-ACAAT--GC-CCACCTTATAAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-T-T-ATTC---CCG-TA-GG-AAGCAACTTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22210 : TTAAT--TTGAGC-ACAAT--GC-CCACCTTATTAATTCACTAAAAATT--ATTA-TCTA-T-C---TC---CCG-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22211 : TCAAC--TTGAGC-TAAAT--GC-CCATCTTATGAATTCACTGAAA--T--ATTT-TCTATT-T-A-TC---CTG-TA-GGAAAGCA--GTG-A--TGCATC-ATTT
gi|22212 : TCAAT--TTAAGC-ACAAT--TC-ACACCTTATGAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-T-T-A-TCTATCCG-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22213 : TCAAT--TTAAGC-ACAATTCAC-ACACCTTATGAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-TCT-A-TCTATCCG-CA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22214 : TCAAT--TTGAGC-ATAAT--GC-TCACCATATGAATTCACTGAAA--T---TTATTCTG-TCT-A-TC---CCG-TA-GGAACGCA--TTG-A--TGCCTT-AT
gi|22215 : TTAAT--TTGAGC-ACTAT--GC-CCACCTTACAAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-T-T-A-TC---CCG-TA-GGAAAGCA---TG-G--TGCCTTAATTT
gi|22216 : TCAAA--TTGAGC-ACAAA--TC-ACACCTTATCAATTCACTAAAA--T--AGTT-TCTA-TCT-A-TC---CCG-TA-GGAAAGCAT-TTG-ATGTGCCTT-GTTT
gi|22217 : TCAAT--TTAAGC-ACAAT--TC-ACACCTTATGAATTTACTAAAA--T--AGTA-TATA-TCT-C-TC---CCG-TA-GGAAAGCA--TTA-A--TGTATT-ATTT
gi|22218 : TCAATCTTTGAGCCACAAT--TC-ACACCTTATGAAT-CACTAAAA--TCAATCA-TCTA-TCT-T-TC---CCG-TA-GGAAAGCA--TTG-G--TGTCTT-ATT
gi|22219 : TCATT--TTGAGC-ACAAT--TCAATACTTTATGATTTCACTTAA------ATTA-TCTATT-T-A-TA---CCG-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22220 : TCAAT--TTAAGC-ACAAT--TC-ACACCTTATGAATTCACTAAAAT-T--ATTA-TC---T-T-A-TC---CAGCTATGGAAAGCAT-TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22221 : TTAAT--TTGAGC-ACTAT--TC-ACACCTTATGAATT-------A--T--AT-A-TTTA-TCT-A-TC---CCT-TA-GGAAAGCA--CTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22222 : AT--TTGAAA-AAAAT--GC-CTACCTTTTAAATTCCCTTATG--C--ACTT-TCTA-T-TTA-TC---TTG-TA-GGAAAGCA--TTA-A--TGATTC-ATT
gi|22223 : TAAGC-ACAAT--TC-ACACTTTATGAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-TCT-A-TC---CCG-TA-GGGAAACA--TTG-G--TGCCTT-ATTT
gi|22224 : -ACAAT--GC-CCAACTTATGAATTCACTAAAA--T--ATAT-TTTATT-T-A-CC---TTG-TA-GGAAAGCA--TTG-G--TGGCTT-ATTT
gi|22225 : CAAT--TC-ACACCTTATGAATTCACTAAA---T--ATTA-TCTA-TCT-A-T----CCA-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
Alignments
lowQualScore : 1
lowQualScore : 22 1 222 22 44 22 44 8 3 7 1 666 1 1 55 1 22 1
lowQualScore : .. . ... .. .. .. .. . . . . ... . . .. . .. .
lowQualScore : 88 8 999 77 11 44 88 7 9 0 7 111 7 7 99 7 44 7
consensus : TCAAT--TTGAGC-ACAAT--GC-NCACCTTATGAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-T-T-A-TC---CCG-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
Reference ( family-749 ) : TCAAT--TTGAGC-ACAAT--GC-NCACCTTATGAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-T-T-A-TC---CCG-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22203 : TCAAT--TTGAGC-ACAAT--GT-CCACCTTATGAATTCACTATGA--T--ACGT-TCTA-T-TCA-TC---CTG-TA-AGATAGCA--TTG-C--TGTCTT-ATTT
gi|22204 : TCAAT--TTGAGC-ACAAT--GT-CCACCTCATGAATTCACTATGA--T--ACGT-TCTA-T-TCA-TC---CTG-TA-AGATAGCA--TTG-C--TGTCTT-ATTT
gi|22205 : TCAAT--TTGAGC-ACAAT--GT-CCACCTTATGAATTCACTATGA--T--ACGT-TCTA-T-TCA-TC---CTG-TA-AGATAGCA--TTGTC--TGTCTT-ATTT
gi|22206 : TCAAT--TTGAGC-ACAAT--GA-TCACCTTATGAATTTACTAAAA--T--ATTG-TCTATT-T-A-TC---CCA-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22207 : TCAAT--TTGAGC-ACAAT--GC-CTATCTGATGAATTCACTAAAA--T---TTGTTCTACT-T-A-TC---CCG-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATCT
gi|22208 : TCAAT--TTGAGC-ACTAT--GT-CAACCTTAAGAATTCACTACAA--T--ATTT-TCTA-T-C-A-TC---CCG-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCGT-ATTT
gi|22209 : TTAAT--TTGAGC-ACAAT--GC-CCACCTTATAAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-T-T-ATTC---CCG-TA-GG-AAGCAACTTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22210 : TTAAT--TTGAGC-ACAAT--GC-CCACCTTATTAATTCACTAAAAATT--ATTA-TCTA-T-C---TC---CCG-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22211 : TCAAC--TTGAGC-TAAAT--GC-CCATCTTATGAATTCACTGAAA--T--ATTT-TCTATT-T-A-TC---CTG-TA-GGAAAGCA--GTG-A--TGCATC-ATTT
gi|22212 : TCAAT--TTAAGC-ACAAT--TC-ACACCTTATGAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-T-T-A-TCTATCCG-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22213 : TCAAT--TTAAGC-ACAATTCAC-ACACCTTATGAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-TCT-A-TCTATCCG-CA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22214 : TCAAT--TTGAGC-ATAAT--GC-TCACCATATGAATTCACTGAAA--T---TTATTCTG-TCT-A-TC---CCG-TA-GGAACGCA--TTG-A--TGCCTT-AT
gi|22215 : TTAAT--TTGAGC-ACTAT--GC-CCACCTTACAAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-T-T-A-TC---CCG-TA-GGAAAGCA---TG-G--TGCCTTAATTT
gi|22216 : TCAAA--TTGAGC-ACAAA--TC-ACACCTTATCAATTCACTAAAA--T--AGTT-TCTA-TCT-A-TC---CCG-TA-GGAAAGCAT-TTG-ATGTGCCTT-GTTT
gi|22217 : TCAAT--TTAAGC-ACAAT--TC-ACACCTTATGAATTTACTAAAA--T--AGTA-TATA-TCT-C-TC---CCG-TA-GGAAAGCA--TTA-A--TGTATT-ATTT
gi|22218 : TCAATCTTTGAGCCACAAT--TC-ACACCTTATGAAT-CACTAAAA--TCAATCA-TCTA-TCT-T-TC---CCG-TA-GGAAAGCA--TTG-G--TGTCTT-ATT
gi|22219 : TCATT--TTGAGC-ACAAT--TCAATACTTTATGATTTCACTTAA------ATTA-TCTATT-T-A-TA---CCG-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22220 : TCAAT--TTAAGC-ACAAT--TC-ACACCTTATGAATTCACTAAAAT-T--ATTA-TC---T-T-A-TC---CAGCTATGGAAAGCAT-TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22221 : TTAAT--TTGAGC-ACTAT--TC-ACACCTTATGAATT-------A--T--AT-A-TTTA-TCT-A-TC---CCT-TA-GGAAAGCA--CTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22222 : AT--TTGAAA-AAAAT--GC-CTACCTTTTAAATTCCCTTATG--C--ACTT-TCTA-T-TTA-TC---TTG-TA-GGAAAGCA--TTA-A--TGATTC-ATT
gi|22223 : TAAGC-ACAAT--TC-ACACTTTATGAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-TCT-A-TC---CCG-TA-GGGAAACA--TTG-G--TGCCTT-ATTT
gi|22224 : -ACAAT--GC-CCAACTTATGAATTCACTAAAA--T--ATAT-TTTATT-T-A-CC---TTG-TA-GGAAAGCA--TTG-G--TGGCTT-ATTT
gi|22225 : CAAT--TC-ACACCTTATGAATTCACTAAA---T--ATTA-TCTA-TCT-A-T----CCA-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
blockSeqs : CT C TCA AA AT CA GT T C C T TAT C T AC T TG A
blockSeqs : . . G C T . AT C C C . TAT . . T . . .
blockSeqs : . . G C . . T T C T . . . . T . . .
blockSeqs : . . G T . . T T C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . G C . . G T C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . G C . . T . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . G C . . A . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . G C . . A . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . G C . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T A . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . G A . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . G T . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T C . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T A . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T A . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T A . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T A . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T A . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . G C . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T A . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G C . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T A . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : TCAAT--TTGAGC-ACAAT--GC-NCACCTTATGAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-T-T-A-TC---CCG-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
finalCons : TCAAT--TTGAGC-ACAAT--GC-NCACCTTATGAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-T-T-A-TC---CCG-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
Alignments
lowQualScore : 1
lowQualScore : 22 1 222 22 44 22 44 8 3 7 1 666 1 1 55 1 22 1
lowQualScore : .. . ... .. .. .. .. . . . . ... . . .. . .. .
lowQualScore : 88 8 999 77 11 44 88 7 9 0 7 111 7 7 99 7 44 7
consensus : TCAAT--TTGAGC-ACAAT--GC-NCACCTTATGAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-T-T-A-TC---CCG-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
Reference ( family-749 ) : TCAAT--TTGAGC-ACAAT--GC-NCACCTTATGAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-T-T-A-TC---CCG-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22203 : TCAAT--TTGAGC-ACAAT--GT-CCACCTTATGAATTCACTATGA--T--ACGT-TCTA-T-TCA-TC---CTG-TA-AGATAGCA--TTG-C--TGTCTT-ATTT
gi|22204 : TCAAT--TTGAGC-ACAAT--GT-CCACCTCATGAATTCACTATGA--T--ACGT-TCTA-T-TCA-TC---CTG-TA-AGATAGCA--TTG-C--TGTCTT-ATTT
gi|22205 : TCAAT--TTGAGC-ACAAT--GT-CCACCTTATGAATTCACTATGA--T--ACGT-TCTA-T-TCA-TC---CTG-TA-AGATAGCA--TTGTC--TGTCTT-ATTT
gi|22206 : TCAAT--TTGAGC-ACAAT--GA-TCACCTTATGAATTTACTAAAA--T--ATTG-TCTATT-T-A-TC---CCA-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22207 : TCAAT--TTGAGC-ACAAT--GC-CTATCTGATGAATTCACTAAAA--T---TTGTTCTACT-T-A-TC---CCG-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATCT
gi|22208 : TCAAT--TTGAGC-ACTAT--GT-CAACCTTAAGAATTCACTACAA--T--ATTT-TCTA-T-C-A-TC---CCG-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCGT-ATTT
gi|22209 : TTAAT--TTGAGC-ACAAT--GC-CCACCTTATAAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-T-T-ATTC---CCG-TA-GG-AAGCAACTTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22210 : TTAAT--TTGAGC-ACAAT--GC-CCACCTTATTAATTCACTAAAAATT--ATTA-TCTA-T-C---TC---CCG-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22211 : TCAAC--TTGAGC-TAAAT--GC-CCATCTTATGAATTCACTGAAA--T--ATTT-TCTATT-T-A-TC---CTG-TA-GGAAAGCA--GTG-A--TGCATC-ATTT
gi|22212 : TCAAT--TTAAGC-ACAAT--TC-ACACCTTATGAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-T-T-A-TCTATCCG-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22213 : TCAAT--TTAAGC-ACAATTCAC-ACACCTTATGAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-TCT-A-TCTATCCG-CA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22214 : TCAAT--TTGAGC-ATAAT--GC-TCACCATATGAATTCACTGAAA--T---TTATTCTG-TCT-A-TC---CCG-TA-GGAACGCA--TTG-A--TGCCTT-AT
gi|22215 : TTAAT--TTGAGC-ACTAT--GC-CCACCTTACAAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-T-T-A-TC---CCG-TA-GGAAAGCA---TG-G--TGCCTTAATTT
gi|22216 : TCAAA--TTGAGC-ACAAA--TC-ACACCTTATCAATTCACTAAAA--T--AGTT-TCTA-TCT-A-TC---CCG-TA-GGAAAGCAT-TTG-ATGTGCCTT-GTTT
gi|22217 : TCAAT--TTAAGC-ACAAT--TC-ACACCTTATGAATTTACTAAAA--T--AGTA-TATA-TCT-C-TC---CCG-TA-GGAAAGCA--TTA-A--TGTATT-ATTT
gi|22218 : TCAATCTTTGAGCCACAAT--TC-ACACCTTATGAAT-CACTAAAA--TCAATCA-TCTA-TCT-T-TC---CCG-TA-GGAAAGCA--TTG-G--TGTCTT-ATT
gi|22219 : TCATT--TTGAGC-ACAAT--TCAATACTTTATGATTTCACTTAA------ATTA-TCTATT-T-A-TA---CCG-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22220 : TCAAT--TTAAGC-ACAAT--TC-ACACCTTATGAATTCACTAAAAT-T--ATTA-TC---T-T-A-TC---CAGCTATGGAAAGCAT-TTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22221 : TTAAT--TTGAGC-ACTAT--TC-ACACCTTATGAATT-------A--T--AT-A-TTTA-TCT-A-TC---CCT-TA-GGAAAGCA--CTG-A--TGCCTT-ATTT
gi|22222 : AT--TTGAAA-AAAAT--GC-CTACCTTTTAAATTCCCTTATG--C--ACTT-TCTA-T-TTA-TC---TTG-TA-GGAAAGCA--TTA-A--TGATTC-ATT
gi|22223 : TAAGC-ACAAT--TC-ACACTTTATGAATTCACTAAAA--T--ATTA-TCTA-TCT-A-TC---CCG-TA-GGGAAACA--TTG-G--TGCCTT-ATTT
gi|22224 : -ACAAT--GC-CCAACTTATGAATTCACTAAAA--T--ATAT-TTTATT-T-A-CC---TTG-TA-GGAAAGCA--TTG-G--TGGCTT-ATTT
gi|22225 : CAAT--TC-ACACCTTATGAATTCACTAAA---T--ATTA-TCTA-TCT-A-T----CCA-TA-GGAAAGCA--TTG-A--TGCCTT-ATTT