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Reference ( gi|119443 )       : ATGCAAA-T-GA-G-TCC-ATT--GT--A--------------TA---G-AT--GC-A-----GA--A-A----A----GGGGCG-ATTT--CAA-G-GTC-G---C----GA--TA-TA------A--------TGTA-GA-T-A-----T---T-A--C-A-TT-T-GCG-CAT-A--A---T-GAA----TA-T-C----G--A--T--A-AT------TT--G-AG-A-GTGA--T---GA--AATA-C----T--A-AGG--------------AA----AAG-----T--GAA---T--TG---------TATA-----ATA------A--TT-----T---C-A-C---G-T--G--A-------A---A---TT----T-T-A-C--ATGTAT----AC--A-TTTTATC--T-TTTGTTA--AC-CA--T--AG-TAAATAA
gi|119447                     : ATGCAAA-T-GA-G-TCC-ATT--GT--A--------------TA---G-AT--GC-A-----GA--A-A----A----GGGGCG-ATTT--CAA-G-GTC-G---G----GA--AA-TA------AC-------TGTA-GA-T-A-----T---T-A--C-A-TTCT-GCG-CAT-A--A---T-GAA----AT-T-C----G--A--G--A-A-------TT--G-AG-A-GTGA--T---GA--AATA-T----T--A-AGG--------------AA----AAG-----TTGAAA---T--TG---------TATA-----AAT------A--TT-----T---C-A-C---G-T--G--A-------AT--A---TT----TAC-A-C--ATGTAT----AC--A--TTTATC----TTTGTTA--GC-CAT-T--AG-TAAATAA
gi|119445                     : ATGCAAA-T-GA-G-TCC-ATA--GT--A--------------TA---G-AT--GC-A-----GA--A-A----A----GGGGCG-ATTT--CAA-G-ATC-G---C----GA--TA-CA------A--------TATA-GA-T-A-----T---C-A--C-A-CT-C-GTG-CAT-G--A---T-AAA----TA-T-C----G--A--G--A-AT------TT--G-AG-G-GTGA--T---GC--AACA-C----T--A-ATG--------------AA----AAG--------GTA---TA-TA---------TATA-----ACA------A--TT-----T---C-A-C---G-T--G--A-------A---A---TT----C-T-G-T--ACATAT----AC--A-TTTTATA--T-TTTGTTA--GC-CG--T--AG-TAA
gi|119444                     : ATGCAAA-T-GA-G-TCC-ATT--GT--AGAGTCCATTGCA--TA---G-AT--GC-A-----AG--A-A----A----GGGGCG-ATTT--CAA-T-GTC-G---C----GA--TA-TG------A--------TATA-GA-T-A-----T---T-G--C-A-TT-T-CCG-CAT-G--A---T-AAA----TA-T-C----G--A--G--A-AT------TT--G-AG-A-GTGA--T---GG--AATA-C----T--A-CAG--------------AA----ACG-----T--GAA---A--TA---------TATA-----ATG------A--TT-----A---A-A-A---G-T--G--A-------A---A---TG----T-T-T-C--ACGTAT----AC--A-TTTTATC--T-TTTGTTA--GC-CG--T--AG-TAAATAA
gi|119446                     : ATGCAAA-T-GA-G-TCC-ATT--GT--T--------------TA---G-AT--AC-A-----GA--A-A----A----GGGGCG-ATTT--CAA-G-GTC-G---C----GA--TA-TA------A--------TATA-GA-T-A-----T---T-A--C-A-TT-T-GCG-CAT-G--A---T-GAA----TA-C-C----G--A--G--A-AT------TG--G-AG-A-GTGA--T---GC--AATA-C-------A-AAG--------------AC----TAG--------GAA---T--GA---------TATA-----ATA------A--TT-----T---C-A-CTT-G-T--A--C-------A---A---TT----T-T-A-C--AC-TAT----AC--A-TTTTATC--T-TTTGTAT--GC-CG--TTAGG-TAAATAA
gi|119448                     : ATGCAAA-T-GA-G-CTC-ATT--GT--A--------------TA---G-AT--GC-A-----GA--A-A----AG---GGGGCG-ATTT--CAA-G-GTC-G---C----GA--TA-T-------A--------TGTA-GA-T-A-----T---T-A--C-A-TT-T-GCC-GAT-G--A---T-GAA----TA-T-C----G--A--G--A-GT------TT--G-AG-A-GTGA--TTGCAC--AATA-C----T--A-AGG--------------AA----AAG-----T--GAA---T--TG---------TATA-----AT-------A--TT-----T---C-A-C---G-T--G--A-------A---A---TT----T-TAA-CTAAT-CAT----AC---------TC--T-TTTGTTA--GC-CG--T--AC-T-AATAA
gi|119449                     : ATGCAAA-T-GA-G-TCC-ATT--AT--A--------------C----G-AC--GC-ACCATAAA--A-A----A----GAGGTG-ATTT--CAA-G-GTT-A---C----AG--TA-TACATGTAA--------TATA-GA-T-A-----T---T-A--C-A-TT-T-GCG-CAT-G--T---T-AGA----TA-T-A----A--AAAC--A-AT------TT--G-AG-A-GTGA--T---GC--AAAA-C----T--A-AAG--------------AA----AAA-----T--GAT---A--TG---------AATA-----ATA------A--T--------------------T--G--A-------A---A--------------------------------------ATC-----TTGTTA--GC-TG--T--AG-TAAATAA
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gi|119452                     : ATGCAAAAT-GA-G-TC--ATT--GT--A-------------------GTAT--GC-A-----GA--A-A----A----GGG-CG-ATTCGACAG-G-TTC-G---C----GAATTA-TA---------------TGTA-GA-T-A-----T---T-A--C-A-TT-T-GCG-CATGA--A---T-AAG----TA---C----G--G-----A-AT------TTTGG-AGAA-GTGA--T---GAG-AATA-CAT--T--A-AAGAGGAGAAATGCCGTAA----AGG-----T--GAAAAGT--TGGTTTAATAATAGA-----ACA------A--TT-----T---C-A-C---G-TA-G--ATCCCCCTA---A---TT----TAT-A-CGAATG-AT----AC--A--TTTATC--T-TTTGTTA--A
gi|119451                     : ATGTAAA-T-GA-G-TCT-ATT--GT--AAGATGCATCA----TA---G-TT--GC-A-----GA--A-A----A----AGGGCG-ATTT--CAA-G-GTC-A---A----GA--TA-TG------A--------TATA-GA-T-A-----T---T-A--C-A-
gi|119453                     : ATGCAAA-T-GA-GGTCC-ATT--GT--AGGCGGTCTTGCGATTA---G-ATTGAC-A-----GAGAA-A----A----GGAGCG-A-TT--CAA-GTGTC-G---CGATTGA--TA-TA------A--------GACA-GA-TAA-----G---T-G--CAA-TT-T-CCG-GGC-A--AACTT-GAAAAACTA-C-T----G--A--TCGA-AT------TT--GTGG-A-G-GA--T---GG--AATA-C----TTGACAGG--------------AG----AAGGATGAT--AAA---TAATA---------TATA-----ATATGAACTA--TTAAAAAT-----A-G---A-T--G--A-------T---A---CTGTAGT-T-A-T--ACGTACTA--ACAGA-TTTTATCCGT-TTTGTTA--GC-CACGT--AG--AAATA
gi|119454                     : ATGCAAA-T-GA-G-TCA-ATT--AT--AAAGCATCAT-----TA---A-AC--ACTA-----GA--ATT----A----GGGGTG-ATTT--CAA-A-GTC-A---A----AA--TA-TC------A--------TATG-AA-T-A-----T---C-A--A-C-TT-A-GCA-CAT-ACTA---T-GAA-----------------A--A--A-AT------C--------A-ATGG--T---GA--GAGA-T----T--ATA------------------------------T--GA------------------CATA-----ATT------A--TT-----T---C-G-C---A-A--GC-A-------AGCTA---TT----T-T-T-C--TCGTAT----AC--A-GTTTA
gi|119455                     :  TGCAAA-T-GA-G-TCC-ATT--GT--A--------------TA---G-AT--GC-A-----GA--A-A----G----GGGGTG-ATTT--CAA-G-GTC-G---C----GA--TA-TA------A--------TATA-GA-T-A-----T---A-A--C-A-TT-T-GCG-CAT-G--A---T-AGA----TA-T-C----G--A--T--A-AT------TT--G-AG-A-GTGA--T---GC--AATA-C----T--A-AAG--------------AA----AAC-----T--TAA---T--TG---------TATA-----GCA------A--TT-----T---C-A-C---G-TAAA--A-------A---A---TT----T-T-A-C--ACATAT----AC--A-CTTTATC--A-TTTGTTA--GC-CA--T--AG-TAAATA
gi|119456                     :  TGCAAA-TCGATG-TCCCATTT-GT--AC-------------TC---T-AT--GC-C-----GA--A-A----A----GGGGCGTATTT--CAA-G-GTCCG---CA---GA--TAATA------AATCGTTATTGTG-GA-T-A-----T---TTA--T-A-TTGT-GCG-CAT-A--T---A-GTA----TA-T-TCAGAG--A--C--A-AA------TT----AG-ATGTGA--T---GA--AATA-C----T--A-AGG--------------AACCACACG-----T--GAA---T--TG----------ATA-----ATAAG----A--TT-----T---CAA-C---GCT--GCAA-------G---A---TT----T-T-ACC--ATGTATCTG-AC--A-TTTTATC--TATTAGTTAGCAC-AA--T--AGCTAAATAA
gi|119457                     :   GTAAA-T-GA---TCC---T--GTTAA--------------TA-----AT--GC-A-----AG--A-A----A----AGGGCG-ATTT--CAA-G-GTC-G---C----GA--TA-TA------A--------TGTA-GA---A-----T---T-A--C-A--T-T-GCG-CAT-A--A---T--AA----TA-T-C-------A--G--A-AT------TT--G-AG-A-GTGA--T----A--AATA-C----T----AGG--------------AA----AAG-----T--GAA---T--TG---------TA-A-----ATA------A--TT-----T---C-A-C---G-T--G----------A---A---TT----T-T-A-C--ATGTATC---AC--ATTTTTATC--T-TTTGTTA--GC-CA--T--AGATAAATAA
gi|119458                     :   GCAAA-T-TA-G-TCC-ATT--GT--G--------------TATATG-AT--GC-A-----GA--A-A----A----GGGGC--ATTT--CAAAG-GTC-G---C----GA--TAATA------A--------TGTAAGA-T-A-----T-----A--T-T-TT-T-GCGATAT-G--A---T-GAA----TAAT-C----G--A--T--A-AT------TT--G-AG-A-GTGA--T---GC--AATAAC----T--A-AGG--------------AA----ATG-----T--TAA---T--TG---------TATAT----ATAT-----A--TT-----T---C-AAC---G-T--G--A-------A---A---TT----T-T-A-C--A---------------------C--T-TTTGTTA--GC-CG--TG-AG-TAAATAA
gi|119459                     :     AAA-T-GA-GGTCC-ATTTGGT--A--------------TA---G-AT--GC-A-----GA--A-A----G----GGGGCG--TTT--CGA-G-GTC-GACCT----GAC-TA-TA------G--------TGTA-GATT-A-----T---G-A--C-ATTT-T-GCG-CATGG--A---T-GAA----AT-T-C----G--A--G--G-AT------TT--G-AG-A-GTGA--T---GATCGATATC----TCAA-AGG--------------AA----AAGGT---C--GAA---T--TG---------TATA-----ATA------ATTTT-----T---C-A-CACGG-T--G----------A---A---TT----T-T-
gi|119460                     :                      T--GT--A--------------TA---A-ATT-GC-A-----GG--A-A----A----GGGGCG-ATTT--CAA-G-G---G---C-----A--TA-TA------A--------TATA-ctatctagtttctctctgtatta
gi|119461                     :                                                         -A-----GA--A-A----ATATAGGGGCG-ATTT--CAA-A-GTC-A---A----AA--TA-TG------A--------TATG-AA-T-A-----TC--T-A--C------T-ACA-TAT-A--T---T-CTA----TA---C----GTAA--G--A-AA------TG--A-AG-A-GTGATTT---GG--TATA-A----A--A-ATG--------------AA----A----------GAA------TG---------CATA-----AT----------TT-----TGGAC-A-A---G----A--A-------A---A---TG----T-T-T-C--ATGTAT----AC--A-TTATGTC--A-CTTGATA--AC-GT--T--AG-TAAAT
gi|119462                     :                                                         -A-----GA--A-AGACCA----GGGGCG-ATTT--CAA-A-GTC-A---C----AA--CA-TG------A--------TATG-AA-T-A-----T---C-A-------------G-C-T-A------T-AAA----TA-TTC----T--A--T--ATATAAAAAATG--G-AG-A-GCGA--TTT-GG--TATA-A----A--A-AGG--------------AA----AA----------AA---A--TG---------TATA-----ATT------A--TA-----G---G-A-C---A-A--G--A-------A---AAAGTT----T-----C--ATGTAT----AC--A-TAATGTC--A-CTTGATA--AT-GT--T--AG-TAAATAA
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gi|119465                     :                                                                       ----A----GTGGCG-ATTT--CAA-G-GTC-A---C----AA--TA-TG------A--------CATG-AC-T-A-----T---C-AACC-A----T-GCA-CAT-A--C---T---A----TA-C---------A--T--A-A--------A--A-AG-A-ATGG--A---GA--GCTA-CTTGGT--A-TGA--------------AA----AAGAA---A--GAA---A--TG---------CACA-----TCT------A--TT-----T---T-A-C---A-A--G--A-------A---AAC-TT----T-T---T--ATGTTT----AT--G-GTATATT--A-CTTGATA--AC-GG--T--AG-TAAATAA
gi|119466                     :                                                                            ----GGGGTG-ATTA--CAA-T-GTC-A---C----GA--TT-TG------A--------TACA-CA-A-A-----T---T-A--C-C-TT-TTGCG-CAT-G--T---T-AAA----TA-T-C----G--C--G--A-TT------TT--G-AG-A-GTGA--T---GC--AATA-T----T--A-AAG--------------AA----AAA-----T---AA---TA-TG---------CATA-----ATC------A--TA-----T---G-A-C---A-G--G--G-------A---A---TT----T-G-A-C--ACACAT----GC--A-CTCT
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Reference ( family-738 )      :                     ATGCAAA-T-GA-G-TCC-ATT--GT--A--------------TA---G-AT--GC-A-----GA--A-A----A----GGGGCG-ATTT--C-AAG-GTC-G---C----GA--T-A-TA------A--------TAT-AGA-T-A-----T---T-A--C-A-TT-T--GCG-CA----T-G--AT-GAA-T-ATC--G--A--GA---ATTT--G-AG-A-GTGA--T---G--NAAT-A-C--T--A-AGG--------------AA----AAG-----T--GAA---T--TG---------TATA-ATA------A--TT-----T---C-AC---G-T--G--AA---A---T--------T----T-TA-CACG--T-AT----AC--A-TTTTA-TC--T-TTTGTTAGC--C-G-T--AG-TAAATAA
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Reference ( family-738 )      :                     ATGCAAA-T-GA-G-TCC-ATT--GT--A--------------TA---G-AT--GC-A-----GA--A-A----A----GGGGCG-ATTT--C-AAG-GTC-G---C----GA--T-A-TA------A--------TAT-AGA-T-A-----T---T-A--C-A-TT-T--GCG-CA----T-G--AT-GAA-T-ATC--G--A--GA---ATTT--G-AG-A-GTGA--T---G--NAAT-A-C--T--A-AGG--------------AA----AAG-----T--GAA---T--TG---------TATA-ATA------A--TT-----T---C-AC---G-T--G--AA---A---T--------T----T-TA-CACG--T-AT----AC--A-TTTTA-TC--T-TTTGTTAGC--C-G-T--AG-TAAATAA
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gi|119460                     :                                          T--GT--A--------------TA---A-ATT-GC-A-----GG--A-A----A----GGGGCG-ATTT--C-AAG-G---G---C-----A--T-A-TA------A--------TAT-Actatctagtttctctctgtatta
gi|119461                     :                                                                             -A-----GA--A-A----ATATAGGGGCG-ATTT--C-AAA-GTC-A---A----AA--T-A-TG------A--------TAT-GAA-T-A-----TC--T-A--C------T--ACA-TA----T-A--TT-CTA-T-A-C--GTAA--GA---AATG--A-AG-A-GTGATTT---G--GTAT-A-A--A--A-ATG--------------AA----A----------GAA------TG---------CATA-AT----------TT-----TGGAC-AA---G----A--AA---A---T--------G----T-TT-CATG--T-AT----AC--A-TTATG-TC--A-CTTGATAAC--G-T-T--AG-TAAAT
gi|119462                     :                                                                             -A-----GA--A-AGACCA----GGGGCG-ATTT--C-AAA-GTC-A---C----AA--C-A-TG------A--------TAT-GAA-T-A-----T---C-A--G-C-TA-T--AAA-TA----T-T--CT-ATA-T-ATA--A--A--AA---A-TG--G-AG-A-GCGATTT---G--GTAT-A-A--A--A-AGG--------------AA----AA----------AA---A--TG---------TATA-ATT------A--TA-----G---G-AC---A-A--G--AA---AAAGT--------T----T----CATG--T-AT----AC--A-TAATG-TC--A-CTTGATAAT--G-T-T--AG-TAAATAA
gi|119463                     :                                                                             -A-----GAT-A-A----A----GGGGCG-ATTT--C-AAG-GTC-A---C----AA--T-A-TT------T--------TAT-GAA-T-AAGAACTTCAT-A--C-A-TT-T---TA-TA----C-A--ACAGAA-A-ATG--G--A--G----ATT----------GTTT--T---G--GTAT-A-T--T--A-AAA--------------AA----GAA-----G--GAA------TG---------CATA-TTT------A--TT-----G---G-AC---A-G--G--AA---A---T--------G----T-TT-CACC--T-ATTGAAAC------TTG-TC--A-CTTGATAA---C-G-TA-AG-TAAATAA
gi|119464                     :                                                                                           ----A----GGAGTG-ATTT--C-AAG-ATC-A---C----AA--T-A-TA------A--------TAT-GAA-T-A-----T---C-A--A-C-TT-C--TCA-CA----T-A--TT-ATA-T-GCA--G--A--AA---ATG---G-AG-A-ATTA--T---T--AGAT-A-T-------AGG--------------AA----AAA-----T--G-------------------TACA-ATT------A--TT-----C---T-AA---A-A--A--AA---G---T--------T----T----CACG--T-AT----TC--A-GCATA-TC--A-CTTGATAAC--G-A-T--TG-TAAATAA
gi|119465                     :                                                                                           ----A----GTGGCG-ATTT--C-AAG-GTC-A---C----AA--T-A-TG------A--------CAT-GAC-T-A-----T---C-AACC-A----T--GCA-CA----T-ACTAT-ACA-T-AAA--A--A--GA---A-TG--G-AG-A-GCTACTT---G--GTAT-G-A--A--A-AAG--------------AA----A----------GAA---A--TG---------CACA-TCT------A--TT-----T---T-AC---A-A--G--AA---AAC-T--------T----T-T--TATG--T-TT----AT--G-GTATA-TT--A-CTTGATAAC--G-G-T--AG-TAAATAA
gi|119466                     :                                                                                                ----GGGGTG-ATTA--C-AAT-GTC-A---C----GA--T-T-TG------A--------TAC-ACA-A-A-----T---T-A--C-C-TT-TT-GCG-CA----T-G--TT-AAA-T-ATC--G--C--GA---TTTT--G-AG-A-GTGA--T---G--CAAT-A-T--T--A-AAG--------------AA----AAA-----T---AA---TA-TG---------CATA-ATC------A--TA-----T---G-AC---A-G--G--GA---A---T--------T----T-GA-CACA--C-AT----GC--A-CTCT


blockSeqs                     :                            A C  T G   C   TG  TA GGCGGTCTTGCGAT  TAT T  TG  T CCATA  GA T GACC TATA      T    GA A   T   C ACC GATT  AT A A  CATGTA ATCGTTAT   A   T A AGAAC TCA T AC AA   C CC   A  AACT ACT   AG  CT    CA TA TC  CAA   TTG T  A T    TT TGC ATC   A T ATT   C A AGGAGAAATGCCGT  CCAC AGGATGATAAATAA       GTTTAATAA    T  ATGAACT TT  AAAAAT       ACGGT    CA  GCT AAG CCCCCTAA GTAG ACA    GAA G  TGAA  AG TT    C  CGT          CACG   TA  C
blockSeqs                     :                            . .  . G   .   T   .  AGATGCATCA      .   .  T   . .      T  . .    G         .    .  .   .   . .   A     C  . .  .      C          .   . . .     C   . .  AT   G T    .  .    ACT   AG  TA    .  .  .   CA    T   .  . .    TT .   AG    . . TTG   T T .               .    GGTGAAAAGT           .            .  AAG     .   TGGAC        TTGT     C   T   AC  .        .    TAC    G   .  CTG   .  T     .  TA           ACAA   G   A
blockSeqs                     :                            . .  . .   .   .   .  AAGCATCAT       .   .  .   . .      .  . .    .         .    .  .   .   . .   .     .  . .  .      .          .   . . .     .   . .  A    . .    .  .    GA    A   T     .  .  .   .     T   .  . .    CT .   G     . . TCA   . A .               .    AGTTGAAAT            .            .  AT      .   TCA          GTAA     .   .   .   .        .    TT     A   .  TA    .  T     .  T            CAT    A   .
blockSeqs                     :                            . .  . .   .   .   .  C               .   .  .   . .      .  . .    .         .    .  .   .   . .   .     .  . .  .      .          .   . . .     .   . .  A    . .    .  .    GG    A   T     .  .  .   .     G   .  . .    .  .   C     . . T     . G .               .    AGGTCGAAT            .            .  G       .   TCA          GCT      .   .   .   .        .    TG     G   .  C     .  T     .  T            CG     .   .
blockSeqs                     :                            . .  . .   .   .   .  .               .   .  .   . .      .  . .    .         .    .  .   .   . .   .     .  . .  .      .          .   . . .     .   . .  A    . .    .  .    G     G   T     .  .  .   .     T   .  . .    .  .   C     . . T     . G .               .    CGTGAAA              .            .  A       .   AA           GT       .   .   .   .        .    TA     G   .  .     .  T     .  T            CG     .   .
blockSeqs                     :                            . .  . .   .   .   .  .               .   .  .   . .      .  . .    .         .    .  .   .   . .   .     .  . .  .      .          .   . . .     .   . .  A    . .    .  .    G     G   A     .  .  .   .     T   .  . .    .  .   A     . . T     . A .               .    AGGTATA              .            .  A       .   TC           GT       .   .   .   .        .    TA     G   .  .     .  T     .  T            CG     .   .
blockSeqs                     :                            . .  . .   .   .   .  .               .   .  .   . .      .  . .    .         .    .  .   .   . .   .     .  . .  .      .          .   . . .     .   . .  A    . .    .  .    G     G   T     .  .  .   .     T   .  . .    .  .   C     . . T     . A .               .    AGTGAAT              .            .  T       .   TC           GT       .   .   .   .        .    TA     G   .  .     .  G     .  T            CG     .   .
blockSeqs                     :                            . .  . .   .   .   .  .               .   .  .   . .      .  . .    .         .    .  .   .   . .   .     .  . .  .      .          .   . . .     .   . .  A    . .    .  .    A     A   T     .  .  .   .     T   .  . .    .  .   C     . . T     . A .               .    AATGATA              .            .  A       .   TC           GT       .   .   .   .        .    TA     A   .  .     .  C     .  A            TG     .   .
blockSeqs                     :                            . .  . .   .   .   .  .               .   .  .   . .      .  . .    .         .    .  .   .   . .   .     .  . .  .      .          .   . . .     .   . .  A    . .    .  .    G     A   T     .  .  .   .     T   .  . .    .  .   C     . . T     . G .               .    ACTTAAT              .            .  A       .   TC           GT       .   .   .   .        .    TA     G   .  .     .  T     .  T            CA     .   .
blockSeqs                     :                            . .  . .   .   .   .  .               .   .  .   . .      .  . .    .         .    .  .   .   . .   .     .  . .  .      .          .   . . .     .   . .  A    . .    .  .    G     A   T     .  .  .   .     T   .  . .    .  .   G     . . T     . A .               .    CGTGAAT              .            .  T       .   CC           AT       .   .   .   .        .    TT     G   .  .     .  T     .  T            CA     .   .
blockSeqs                     :                            . .  . .   .   .   .  .               .   .  .   . .      .  . .    .         .    .  .   .   . .   .     .  . .  .      .          .   . . .     .   . .  A    . .    .  .    G     G   T     .  .  .   .     T   .  . .    .  .   A     . . T     . G .               .    AGTGAAT              .            .  A       .   TC           AA       .   .   .   .        .    TA     G   .  .     .  T     .  A            CG     .   .
blockSeqs                     :                            . .  . .   .   .   .  .               .   .  .   . .      .  . .    .         .    .  .   .   . .   .     .  . .  .      .          .   . . .     .   . .  C    . .    .  .    G     A   T     .  .  .   .     T   .  . .    .  .   C     . . T     . G .               .    TGTTAAT              .            .  A       .   TC           GT       .   .   .   .        .    TA     G   .  .     .  G     .  A            GT     .   .
blockSeqs                     :                            . .  . .   .   .   .  .               .   .  .   . .      .  . .    .         .    .  .   .   . .   .     .  . .  .      .          .   . . .     .   . .  A    . .    .  .    A     G   A     .  .  .   .     T   .  . .    .  .   A     . . T     . G .               .    AATAATA              .            .  A       .   TC           GT       .   .   .   .        .    TA     C   .  .     .  G     .  A            GT     .   .
blockSeqs                     :                            . .  . .   .   .   .  .               .   .  .   . .      .  . .    .         .    .  .   .   . .   .     .  . .  .      .          .   . . .     .   . .  A    . .    .  .    G     G   T     .  .  .   .     G   .  . .    .  .   A     . . T     . G .               .    AGGAAT               .            .  T       .   TC           AA       .   .   .   .        .    TT     G   .  .     .  C     .  A            CG     .   .
blockSeqs                     :                            . .  . .   .   .   .  .               .   .  .   . .      .  . .    .         .    .  .   .   . .   .     .  . .  .      .          .   . . .     .   . .  A    . .    .  .    A     C   T     .  .  .   .     G   .  . .    .  .   C     . . A     . T .               .    AAGGAA               .            .  T       .   TC           AG       .   .   .   .        .    TT     G   .  .     .  .     .  A            GA     .   .
blockSeqs                     :                              .  . .   .   .   .  .               .   .  .   . .      .  . .    .         .    .  .   .   . .   .     .  . .  .      .          .   . . .     .   . .  T    . .    .  .    T     A   A     .  .  .   .     G   .  . .    .  .   G     . . A     . G .               .    AAAA                 .            .  T       .   GG           AA       .   .   .   .        .    GA     A   .  .     .  .     .  .            GG     .   .
blockSeqs                     :                                           .   .  .               .   .  .   . .      .  . .    .         .    .  .   .   . .   .     .  . .  .      .          .   . . .     .   . .  C    . .    .  .    A     A   T     .  .  .   .     T   .  . .    .  .   G     . . T     . A .               .    AATG                 .            .  T       .   GG           AA       .   .   .   .        .    T      .   .  .     .  .     .  .                        
blockSeqs                     :                                                                             . .      .  . .    .         .    .  .   .   . .   .     .  . .  .      .          .   . . .     .   . .  A    . .    .  .    A     A   T     .  .  .   .     .   .  . .    .  .   G     . . A     . G .               .    GAAA                 .            .  C       .   CT           AG       .   .   .   .        .    .      .   .  .     .  .     .                           
blockSeqs                     :                                                                             . .      .  . .    .         .    .  .   .   . .   .     .  . .  .      .          .   . . .     .   . .  C    . .    .  .    G     A   T     .  .  .   .     .   .  . .    .  .   A     . . T     . A .               .    AGT                  .            .  .       .   TT           T        .   .   .   .        .    .      .   .  .     .  .                                 
blockSeqs                     :                                                                             . .      .  . .    .         .    .  .   .   . .   .     .  . .  .      .          .   . . .     .   . .  A    . .    .  .    .     .   .     .  .  .   .     .   .  . .    .  .   G     . . .     . A .               .    TGA                  .            .  .       .   TG           G        .   .   .   .        .    .      .   .                                             
blockSeqs                     :                                                                                           .    .         .    .  .   .   . .   .     .  . .  .      .          .   . . .     .   . .  C    . .    .  .    .     .   .     .  .  .   .     .   .  . .    .  .   C     . . .     . . .               .    GAA                  .            .  .       .   .            G        .   .   .   .        .                                                             
blockSeqs                     :                                                                                           .    .         .    .  .   .   . .   .     .  . .  .      .          .   . . .     .   . .  .                                                                                                                                                                                                                                                                           
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blockSeqCons                  :                     
originalCons                  :                     ATGCAAA-T-GA-G-TCC-ATT--GT--A--------------TA---G-AT--GC-A-----GA--A-A----A----GGGGCG-ATTT--C-AAG-GTC-G---C----GA--T-A-TA------A--------TAT-AGA-T-A-----T---T-A--C-A-TT-T--GCG-CA----T-G--AT-GAA-T-ATC--G--A--GA---ATTT--G-AG-A-GTGA--T---G--NAAT-A-C--T--A-AGG--------------AA----AAG-----T--GAA---T--TG---------TATA-ATA------A--TT-----T---C-AC---G-T--G--AA---A---T--------T----T-TA-CACG--T-AT----AC--A-TTTTA-TC--T-TTTGTTAGC--C-G-T--AG-TAAATAA
finalCons                     :                     ATGCAAA-T-GA-G-TCC-ATT--GT--A--------------TA---G-AT--GC-A-----GA--A-A----A----GGGGCG-ATTT--C-AAG-GTC-G---C----GA--T-A-TA------A--------TAT-AGA-T-A-----T---T-A--C-A-TT-T--GCG-CA----T-G--AT-GAA-T-ATC--G--A--GA---ATTT--G-AG-A-GTGA--T---G--NAAT-A-C--T--A-AGG--------------AA----AAG-----T--GAA---T--TG---------TATA-ATA------A--TT-----T---C-AC---G-T--G--AA---A---T--------T----T-TA-CACG--T-AT----AC--A-TTTTA-TC--T-TTTGTTAGC--C-G-T--AG-TAAATAA





Alignments
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lowQualScore                  :                            2 2  2 4   2   55  33 33333333333333  333 2  55  1 44444  44 1 3333 5555      1    22 1   1   1 222 5555  44 1 1  444444 77777777   1   1 1 44444 444 1 22 111  3 44   1  3333 9999  55  222   22 22 22  555   666 1  1 1    77 333 555   1 1 66666 3 1 00000000000000  3333 4444444444444444444  777777777    1  5555555 22  77777777777  88888888 44  555 555 66666666 3333 4444   333 1  2222  22 66 0  2  0000         555555 77  4       
lowQualScore                  :                            . .  . .   .   ..  .. ..............  ... .  ..  . .....  .. . .... ....      .    .. .   .   . ... ....  .. . .  ...... ........   .   . . ..... ... . .. ...  . ..   .  .... ....  ..  ...   .. .. ..  ...   ... .  . .    .. ... ...   . . ..... . . ..............  .... ...................  .........    .  ....... ..  ...........  ........ ..  ... ... ........ .... ....   ... .  ....  .. .. .  .  ....         ...... ..  .       
lowQualScore                  :                            5 4  4 7   4   33  11 99999999999999  999 2  33  9 88888  55 9 7777 2222      7    33 7   7   7 999 2222  00 7 7  888888 77777777   7   7 7 33333 888 7 44 999  6 33   8  9999 0000  55  666   55 55 55  777   888 8  8 8    55 222 333   8 8 55555 6 1 77777777777777  9999 6666666666666666666  333333333    8  0000000 55  66666666666  66666666 33  000 777 66666666 9999 5555   222 9  5555  88 66 6  1  4444         777777 99  7       
consensus                     :                     ATGCAAA-T-GA-G-TCC-ATT--GT--A--------------TA---G-AT--GC-A-----GA--A-A----A----GGGGCG-ATTT--C-AAG-GTC-G---C----GA--T-A-TA------A--------TAT-AGA-T-A-----T---T-A--C-A-TT-T--GCG-CA----T-G--AT-GAA-T-ATC--G--A--GA---ATTT--G-AG-A-GTGA--T---G--NAAT-A-C--T--A-AGG--------------AA----AAG-----T--GAA---T--TG---------TATA-ATA------A--TT-----T---C-AC---G-T--G--AA---A---T--------T----T-TA-CACG--T-AT----AC--A-TTTTA-TC--T-TTTGTTAGC--C-G-T--AG-TAAATAA
Reference ( family-738 )      :                     ATGCAAA-T-GA-G-TCC-ATT--GT--A--------------TA---G-AT--GC-A-----GA--A-A----A----GGGGCG-ATTT--C-AAG-GTC-G---C----GA--T-A-TA------A--------TAT-AGA-T-A-----T---T-A--C-A-TT-T--GCG-CA----T-G--AT-GAA-T-ATC--G--A--GA---ATTT--G-AG-A-GTGA--T---G--NAAT-A-C--T--A-AGG--------------AA----AAG-----T--GAA---T--TG---------TATA-ATA------A--TT-----T---C-AC---G-T--G--AA---A---T--------T----T-TA-CACG--T-AT----AC--A-TTTTA-TC--T-TTTGTTAGC--C-G-T--AG-TAAATAA
gi|119443                     :                     ATGCAAA-T-GA-G-TCC-ATT--GT--A--------------TA---G-AT--GC-A-----GA--A-A----A----GGGGCG-ATTT--C-AAG-GTC-G---C----GA--T-A-TA------A--------TGT-AGA-T-A-----T---T-A--C-A-TT-T--GCG-CA----T-A--AT-GAA-T-ATC--G--A--TA---ATTT--G-AG-A-GTGA--T---G--AAAT-A-C--T--A-AGG--------------AA----AAG-----T--GAA---T--TG---------TATA-ATA------A--TT-----T---C-AC---G-T--G--AA---A---T--------T----T-TA-CATG--T-AT----AC--A-TTTTA-TC--T-TTTGTTAAC--C-A-T--AG-TAAATAA
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gi|119445                     : atgcaaatgagtccattgtaATGCAAA-T-GA-G-TCC-ATA--GT--A--------------TA---G-AT--GC-A-----GA--A-A----A----GGGGCG-ATTT--C-AAG-ATC-G---C----GA--T-A-CA------A--------TAT-AGA-T-A-----T---C-A--C-A-CT-C--GTG-CA----T-G--AT-AAA-T-ATC--G--A--GA---ATTT--G-AG-G-GTGA--T---G--CAAC-A-C--T--A-ATG--------------AA----AAG--------GTA---TA-TA---------TATA-ACA------A--TT-----T---C-AC---G-T--G--AA---A---T--------T----C-TG-TACA--T-AT----AC--A-TTTTA-TA--T-TTTGTTAGC--C-G-T--AG-TAA
gi|119446                     :                     ATGCAAA-T-GA-G-TCC-ATT--GT--T--------------TA---G-AT--AC-A-----GA--A-A----A----GGGGCG-ATTT--C-AAG-GTC-G---C----GA--T-A-TA------A--------TAT-AGA-T-A-----T---T-A--C-A-TT-T--GCG-CA----T-G--AT-GAA-T-ACC--G--A--GA---ATTG--G-AG-A-GTGA--T---G--CAAT-A-C-----A-AAG--------------AC----TAG--------GAA---T--GA---------TATA-ATA------A--TT-----T---C-ACTT-G-T--A--CA---A---T--------T----T-TA-CAC---T-AT----AC--A-TTTTA-TC--T-TTTGTATGC--C-G-TTAGG-TAAATAA
gi|119447                     :                     ATGCAAA-T-GA-G-TCC-ATT--GT--A--------------TA---G-AT--GC-A-----GA--A-A----A----GGGGCG-ATTT--C-AAG-GTC-G---G----GA--A-A-TA------AC-------TGT-AGA-T-A-----T---T-A--C-A-TTCT--GCG-CA----T-A--AT-GAA-A-TTC--G--A--GA---A-TT--G-AG-A-GTGA--T---G--AAAT-A-T--T--A-AGG--------------AA----AAG-----TTGAAA---T--TG---------TATA-AAT------A--TT-----T---C-AC---G-T--G--AAT--A---T--------T----TACA-CATG--T-AT----AC--A--TTTA-TC----TTTGTTAGC--C-ATT--AG-TAAATAA
gi|119448                     :                     ATGCAAA-T-GA-G-CTC-ATT--GT--A--------------TA---G-AT--GC-A-----GA--A-A----AG---GGGGCG-ATTT--C-AAG-GTC-G---C----GA--T-A-T-------A--------TGT-AGA-T-A-----T---T-A--C-A-TT-T--GCC-GA----T-G--AT-GAA-T-ATC--G--A--GA---GTTT--G-AG-A-GTGA--TTGCA--CAAT-A-C--T--A-AGG--------------AA----AAG-----T--GAA---T--TG---------TATA-AT-------A--TT-----T---C-AC---G-T--G--AA---A---T--------T----T-TA--AC---T-A---------A-TCATACTC--T-TTTGTTAGC--C-G-T--AC-T-AATAA
gi|119449                     :                     ATGCAAA-T-GA-G-TCC-ATT--AT--A--------------C----G-AC--GC-ACCATAAA--A-A----A----GAGGTG-ATTT--C-AAG-GTT-A---C----AG--T-A-TACATGTAA--------TAT-AGA-T-A-----T---T-A--C-A-TT-T--GCG-CA----T-G--TT-AGA-T-ATA--A--A--AACA-ATTT--G-AG-A-GTGA--T---G--CAAA-A-C--T--A-AAG--------------AA----AAA-----T--GAT---A--TG---------AATA-ATA------A--T-------------------T--G--AA---A----------------------------------------------A-TC-----TTGTTAGC--T-G-T--AG-TAAATAA
gi|119450                     :                     ATGCAAA-T-TA-G-TGT-ATT--GT--A--------------TA---G-AT--GC-A------A--A-A----A----GGGGCG-ATTT--C-TAG-GCC-A---C----GA--T-A-TA------A--------TCC-AAA-C-A-----T---T-A--C-A-TT-T--GCG----------------AA---ATC--G--A--GA---ATTT--C-TG-G-GTGA--T---G--CAAT-A-C--T--T-AAA--------------AA----CAG-----T----------------------TAT--------------TC-----C---C-AT---G----G--AA---A---T--------T----T-TA-CATG--T-A
gi|119451                     :                     ATGTAAA-T-GA-G-TCT-ATT--GT--AAGATGCATCA----TA---G-TT--GC-A-----GA--A-A----A----AGGGCG-ATTT--C-AAG-GTC-A---A----GA--T-A-TG------A--------TAT-AGA-T-A-----T---T-A--C-A-
gi|119452                     :                     ATGCAAAAT-GA-G-TC--ATT--GT--A-------------------GTAT--GC-A-----GA--A-A----A----GGG-CG-ATTCGAC-AGG-TTC-G---C----GAATT-A-TA---------------TGT-AGA-T-A-----T---T-A--C-A-TT-T--GCG-CA----T-GA-AT-AAG-T-A-C--G-----GA---ATTTTGG-AGAA-GTGA--T---GA-GAAT-A-CATT--A-AAGAGGAGAAATGCCGTAA----AGG-----T--GAAAAGT--TGGTTTAATAATAGA-ACA------A--TT-----T---C-AC---G-T-----AG---A---TCCCCCTAAT----T-TA-TACGAATGAT----AC--A--TTTA-TC--T-TTTGTTA
gi|119453                     :                     ATGCAAA-T-GA-GGTCC-ATT--GT--AGGCGGTCTTGCGATTA---G-ATTGAC-A-----GAGAA-A----A----GGAGCG-A-TT--C-AAGTGTC-G---CGATTGA--T-A-TA------A--------GAC-AGA-TAA-----G---T-G--CAA-TT-TCCGGG-CAAACTT-G--AA-AAACT-ACT--G--ATCGA---ATTT--GTGG-A-G-GA--T---G--GAAT-A-C--TTGACAGG--------------AG----AAGGATGAT--AAA---TAATA---------TATA-ATATGAACTA--TTAAAAAT-----AG---A-T--G--AT---A---C--------TGTAGT-TA-TACG--T-ACTA--ACAGA-TTTTA-TCCGT-TTTGTTAGCCAC-G-T--AG--AAATAa
gi|119454                     :                     ATGCAAA-T-GA-G-TCA-ATT--AT--AAAGCATCAT-----TA---A-AC--ACTA-----GA--ATT----A----GGGGTG-ATTT--C-AAA-GTC-A---A----AA--T-A-TC------A--------TAT-GAA-T-A-----T---C-A--A-C-TT-A--GCA-CA----T-ACTAT-GAA-----------A--AA---ATC--------A-ATGG--T---G--AGAG-A-T--T--ATA------------------------------T--GA------------------CATA-ATT------A--TT-----T---C-GC---A-A--GC-AAGCTA---T--------T----T-TT-CTCG--T-AT----AC--A-GTTTA-
gi|119455                     :                      TGCAAA-T-GA-G-TCC-ATT--GT--A--------------TA---G-AT--GC-A-----GA--A-A----G----GGGGTG-ATTT--C-AAG-GTC-G---C----GA--T-A-TA------A--------TAT-AGA-T-A-----T---A-A--C-A-TT-T--GCG-CA----T-G--AT-AGA-T-ATC--G--A--TA---ATTT--G-AG-A-GTGA--T---G--CAAT-A-C--T--A-AAG--------------AA----AAC-----T--TAA---T--TG---------TATA-GCA------A--TT-----T---C-AC---G-TAAA--AA---A---T--------T----T-TA-CACA--T-AT----AC--A-CTTTA-TC--A-TTTGTTAGC--C-A-T--AG-TAAATA
gi|119456                     :                      TGCAAA-TCGATG-TCCCATTT-GT--AC-------------TC---T-AT--GC-C-----GA--A-A----A----GGGGCGTATTT--C-AAG-GTCCG---CA---GA--T-AATA------AATCGTTATTGT-GGA-T-A-----T---TTA--T-A-TTGT--GCG-CA----T----ATAGTA-T-ATTCAG--A--GACAAATT-----AG-ATGTGA--T---G--AAAT-A-C--T--A-AGG--------------AACCACACG-----T--GAA---T--TG----------ATA-ATAAG----A--TT-----T---CAAC---GCT--GCAAG---A---T--------T----T-TACCATG--T-ATCTG-AC--A-TTTTA-TC--TATTAGTTAGCA-CAA-T--AGCTAAATAA
gi|119457                     :                       GTAAA-T-GA---TCC---T--GTTAA--------------TA-----AT--GC-A-----AG--A-A----A----AGGGCG-ATTT--C-AAG-GTC-G---C----GA--T-A-TA------A--------TGT-AGA---A-----T---T-A--C-A--T-T--GCG-CA----T-A--AT--AA-T-ATC-----A--GA---ATTT--G-AG-A-GTGA--T------AAAT-A-C--T----AGG--------------AA----AAG-----T--GAA---T--TG---------TA-A-ATA------A--TT-----T---C-AC---G-T--G---A---A---T--------T----T-TA-CATG--T-ATC---AC--ATTTTTA-TC--T-TTTGTTAGC--C-A-T--AGATAAATAA
gi|119458                     :                       GCAAA-T-TA-G-TCC-ATT--GT--G--------------TATATG-AT--GC-A-----GA--A-A----A----GGGGC--ATTT--CAAAG-GTC-G---C----GA--TAA-TA------A--------TGTAAGA-T-A---------T-A--T-T-TT-T--GCGATA----T-G--AT-GAA-TAATC--G--A--TA---ATTT--G-AG-A-GTGA--T---G--CAATAA-C--T--A-AGG--------------AA----ATG-----T--TAA---T--TG---------TATATATAT-----A--TT-----T---CAAC---G-T--G--AA---A---T--------T----T-TA-CA-------------------------C--T-TTTGTTAGC--C-G-TG-AG-TAAATAA
gi|119459                     :                         AAA-T-GA-GGTCC-ATTTGGT--A--------------TA---G-AT--GC-A-----GA--A-A----G----GGGGCG--TTT--C-GAG-GTC-GACCT----GAC-T-A-TA------G--------TGT-AGATT-A-----T---G-A--C-ATTT-T--GCG-CA----TGG--AT-GAA-A-TTC--G--A--GG---ATTT--G-AG-A-GTGA--T---GATCGAT-ATC--TCAA-AGG--------------AA----AAGGT---C--GAA---T--TG---------TATA-ATA------ATTTT-----T---C-ACACGG-T--G---A---A---T--------T----T-T
gi|119460                     :                                          T--GT--A--------------TA---A-ATT-GC-A-----GG--A-A----A----GGGGCG-ATTT--C-AAG-G---G---C-----A--T-A-TA------A--------TAT-Actatctagtttctctctgtatta
gi|119461                     :                                                                             -A-----GA--A-A----ATATAGGGGCG-ATTT--C-AAA-GTC-A---A----AA--T-A-TG------A--------TAT-GAA-T-A-----TC--T-A--C------T--ACA-TA----T-A--TT-CTA-T-A-C--GTAA--GA---AATG--A-AG-A-GTGATTT---G--GTAT-A-A--A--A-ATG--------------AA----A----------GAA------TG---------CATA-AT----------TT-----TGGAC-AA---G----A--AA---A---T--------G----T-TT-CATG--T-AT----AC--A-TTATG-TC--A-CTTGATAAC--G-T-T--AG-TAAAT
gi|119462                     :                                                                             -A-----GA--A-AGACCA----GGGGCG-ATTT--C-AAA-GTC-A---C----AA--C-A-TG------A--------TAT-GAA-T-A-----T---C-A--G-C-TA-T--AAA-TA----T-T--CT-ATA-T-ATA--A--A--AA---A-TG--G-AG-A-GCGATTT---G--GTAT-A-A--A--A-AGG--------------AA----AA----------AA---A--TG---------TATA-ATT------A--TA-----G---G-AC---A-A--G--AA---AAAGT--------T----T----CATG--T-AT----AC--A-TAATG-TC--A-CTTGATAAT--G-T-T--AG-TAAATAA
gi|119463                     :                                                                             -A-----GAT-A-A----A----GGGGCG-ATTT--C-AAG-GTC-A---C----AA--T-A-TT------T--------TAT-GAA-T-AAGAACTTCAT-A--C-A-TT-T---TA-TA----C-A--ACAGAA-A-ATG--G--A--G----ATT----------GTTT--T---G--GTAT-A-T--T--A-AAA--------------AA----GAA-----G--GAA------TG---------CATA-TTT------A--TT-----G---G-AC---A-G--G--AA---A---T--------G----T-TT-CACC--T-ATTGAAAC------TTG-TC--A-CTTGATAA---C-G-TA-AG-TAAATAA
gi|119464                     :                                                                                           ----A----GGAGTG-ATTT--C-AAG-ATC-A---C----AA--T-A-TA------A--------TAT-GAA-T-A-----T---C-A--A-C-TT-C--TCA-CA----T-A--TT-ATA-T-GCA--G--A--AA---ATG---G-AG-A-ATTA--T---T--AGAT-A-T-------AGG--------------AA----AAA-----T--G-------------------TACA-ATT------A--TT-----C---T-AA---A-A--A--AA---G---T--------T----T----CACG--T-AT----TC--A-GCATA-TC--A-CTTGATAAC--G-A-T--TG-TAAATAA
gi|119465                     :                                                                                           ----A----GTGGCG-ATTT--C-AAG-GTC-A---C----AA--T-A-TG------A--------CAT-GAC-T-A-----T---C-AACC-A----T--GCA-CA----T-ACTAT-ACA-T-AAA--A--A--GA---A-TG--G-AG-A-GCTACTT---G--GTAT-G-A--A--A-AAG--------------AA----A----------GAA---A--TG---------CACA-TCT------A--TT-----T---T-AC---A-A--G--AA---AAC-T--------T----T-T--TATG--T-TT----AT--G-GTATA-TT--A-CTTGATAAC--G-G-T--AG-TAAATAA
gi|119466                     :                                                                                                ----GGGGTG-ATTA--C-AAT-GTC-A---C----GA--T-T-TG------A--------TAC-ACA-A-A-----T---T-A--C-C-TT-TT-GCG-CA----T-G--TT-AAA-T-ATC--G--C--GA---TTTT--G-AG-A-GTGA--T---G--CAAT-A-T--T--A-AAG--------------AA----AAA-----T---AA---TA-TG---------CATA-ATC------A--TA-----T---G-AC---A-G--G--GA---A---T--------T----T-GA-CACA--C-AT----GC--A-CTCT