lowQualScore : 111111 2222222
lowQualScore : 1 1 1 1 22 66666 3333 7 22 55 22 1 5 1 7777 1 44 55 000000 1 5555555 1 1 44 22 44 1 66666 7777 1 1 1 22 22 2
lowQualScore : . . . . .. ..... .... . .. .. .. . . . .... . .. .. ...... . ....... . . .. .. .. . ..... .... . . . .. .. .
lowQualScore : 9 9 8 8 55 44444 9999 3 55 11 55 8 5 8 5555 4 11 99 000000 7 3333333 9 9 55 66 55 9 77777 2222 9 9 9 66 66 0
consensus : AAACTGAA-CA-TCTT-G-CC--CG-----C----T-T--CA-AAT--T-TTCAC-C-TT----AGACA--T--CC------TA-CT--A----CTCC-C-TATCA--C--A--AT-A-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
Reference ( gi|92742 ) : AAACTGAA-CA-TCTT-G-CC--CG-----C----T-T--CA-GAT--T-TTCAC-C-TT----AGATA--T--CC------TA-CT--A----CTCC-C-TATCA--C--A--AT-A-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92743 : AAACTGAA-CA-TCTT-T-CC--CG-----C----T-T--CA-GAT--T-TTCA--C-TT----AGATA--T--CC------TA-CTA-A----CTCC-C-TATCA--C--A--AT-A-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92745 : AAACTGAA-CA-TCTT-G-CC--CA-----C----T-T--CA-AAT--T-TTCAC-C-TT----GGACA--T--CC------TA-CTA-A----CTCC-C-AATCA--C--A--AT-A-----AAA--C-T-T-G-C--A--TA-TCTTAC
gi|92751 : AAGCTGAA-GA-TCTT-A-TC--CG-----C----T-T--CA-GAT--T-TTCAC-C-TT----AAACA--T--CC------TA-CT--AC---CTCC-C-TATCA--C--A--AT-A-----AAT--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92750 : AAACTGAA-CA-CCTT-G-CC--CG-----C----T-T--CA-AAT--T-TTCAC-C-TT----AAACA--T--CC------TA-CTA-A----CCCC-C-TATCA--C--A--AT-A-----AAA--C-T-T-A-C--A--TT-
gi|92744 : AAACTGAA-CA-TCTT-G-TT--CA-----GAAAAT-T--CA-GAT--T-TTTAT-C-TT----AGGTA--T--CC------TA-CT--AA---CTCC-C-TATCA--C--A--AT-G-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92753 : AAACTGAA-CA-T-TT-G-TCTTCG-----C----T-T--TA-AAT--T-TTCAC-A-TT----AGACG--T--CC------TA-CT--AA---CTCC-C-TGTCA--C--A--AT-A-----AAA--C-T-T-G-T--A--TT-TCTTAC
gi|92754 : AAACTGAAACA-TCTT-T-GC--CG-----C----T-T--CA-AAA--T-TTCAC-C-TTA---AGACA--T--CC------TA-CTA-A----CTCC-C-TGTCA--C--AG-ATAA-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92755 : AAACTGAA-TA-TCTT-G-CC--CG-----C----T-T--CA-ACT--T-TTCGC-C-TT----AGACA--T--CC------TA-TTA-A----CTCC-C-TATGG--C--T--AT-ATATATGAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92756 : AAACTGG--CA-TCTT-G-CC--CG-----C----T-TTCCA-AAT--T-TTTCC-C-TT----AGACA--T--CC------TA-CTA-A----CTCC-C-TATCA--C--A--AT-A-----AAAACT-T-T-G-C--A--
gi|92752 : AAGCCTAA-GA-TCTT-A-TC--CG-----C----T-T--CA-GAT--T-TTCAC-C-TTA---AAACA--TA-CC------TA-CT--AC---CTCC-CATATCA--C--A--AT-A-----AAAT-C-T-T-G-C--ATTTT-TCTTAC
gi|92746 : AAACTGAA-CA-TCTT-GCCC--CG-----C----TCT--CA--AT--T-TTCAC-CATT----GGATA--TACCC------TA-CT--A----ACCC-T-TATCA--C--A--AC-AT----AAA--CGT-T-G-C--A--TT-TCTT
gi|92757 : AAACT-AA-CA-TCTTCG-CC--CG-----C----T-T--CAAGAG--TGTTCACTC-TTCCGTACACA--T--CC------TA-CT--AA---CTCC-C-T-TCA--C--A--AT-A-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92747 : AACCTGAA-CAATTTT-G-CC--CGG----C----T-T--CA-AAT--T-TTTAC-C-TG----GAATA--TT-CC------TA-CT--AA---CTCCTC-TATCA--CTCA--AT-A-----AAA--C-TAT-G-C--A--TT-TCTT
gi|92759 : AAACTGAA-TA-TCTT-G-CC--CG-----C----TCT--CA-AA---T-CTCACAC-TT----AGACA--T--CCCTGCGATA-CTA-A----CTCC-C-TATCC--T--G--AT-A-----AAA----T-T-G-C--A---T-TCTTAC
gi|92758 : AAACTGAA-TA-TCTT-G-CC--CG-----C----TCT--CA-AA---T-CTCACAC-TT----AGACA--T--CCCTGCGATA-CTA-A----CTCC-C-TATCC--T--G--AT-A-----AAA----T-T-G-C--A---T-TCTTAC
gi|92760 : AGATTGAA-CA-ACTT-G-CC--CC-----C----T-T--CA-GAT--C-TTCAC-C-TT----GGACAT-T--CC------TA-CTTGA----CTCT-T-TAT-A--C--A--GA-G-----AAA--C-T-TGG-C--A--TT-TCTT
gi|92748 : AAACTGAA-CA-TCTT-G-TC--TG-----C----T-T--AA-AAT--T-TTCAC-C-TT----AGACA--T--CC------TA-CT--A----
gi|92749 : AAATCGAA-TT-TCTT-G-TC--CG-----C----T-T--CA-T-C--T-TTCAC-C-GT----AGACA--T--CT------TA-CT--AACTACTCT-T-TATCAAAC--ACTAT-G-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAa
gi|92761 : AACTGAA-CA-TCTT-G-TT--CAGAAAAT----T-T--CA-GAT--T-TTTAT-C-TT----AGGTA--T--CC------TA-CT--A----ACCC-C-TATCA--C--A--AT-G-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92762 : AACTGAA-CA-TCTT-G-CC--GG-----C----TCT--CA-AATTCT-TTCAC-C-TC-----CCCA--T--CC------TA-CT--A----ACCC-C-TTTTC--C--A--AT-A-----AAAACT-T-T-G-C--A--TTCTCTTAC
gi|92763 : CTGAA-AA-TCTT-G-CC--CG-----C----T-T--CA-CAT--T-TTCAC-C-TT----AGACAACT--CC------TAGCT-------CACC-C-TA-CAT-C--A--AT-A-----CAC--CGT-T-G-CAAA--TT-TCTTA
gi|92764 : TT-A-CC--CA-----C----T-T--CA-AAT--T-TTCAC-C-TT----AAATA--T--CC------TA-CT--A----
gi|92765 : TA--T--CC------TA-CT--AA---CTCC-C-TGTCA--C--A--AT-A-----AAA--C-T-T-GTC--A--TT-TCTTACa
Alignments
lowQualScore : 2222222
lowQualScore : 1 1 1 1 22 66666 3333 5 22 22 44 22 5 1 6666 44444 1 55 44 999999 1 3333333 1 1 66 44 1 66666 66 3 1 1 1 22 22 1
lowQualScore : . . . . .. ..... .... . .. .. .. .. . . .... ..... . .. .. ...... . ....... . . .. .. . ..... .. . . . . .. .. .
lowQualScore : 8 8 7 7 44 11111 7777 2 44 33 00 33 0 7 9999 22222 7 66 00 666666 7 9999999 8 8 88 33 8 44444 88 6 8 8 8 55 55 9
consensus : AAACTGAA-CA-TCTT-G-CC--CG-----C----T-T--CAAA--T--TTT--CAC-C-TT----A-----GAC-A--T--CC------TA-CTA-A----CTCC-C-TATCA--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
Reference ( family-737 ) : AAACTGAA-CA-TCTT-G-CC--CG-----C----T-T--CAAA--T--TTT--CAC-C-TT----A-----GAC-A--T--CC------TA-CT--A----CTCC-C-TATCA--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92742 : AAACTGAA-CA-TCTT-G-CC--CG-----C----T-T--CAGA--T--TTT--CAC-C-TT----A-----GAT-A--T--CC------TA-CT--A----CTCC-C-TATCA--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92743 : AAACTGAA-CA-TCTT-T-CC--CG-----C----T-T--CAGA--T--TTT--CA--C-TT----A-----GAT-A--T--CC------TA-CTA-A----CTCC-C-TATCA--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92744 : AAACTGAA-CA-TCTT-G-TT--CA-----GAAAAT-T--CAGA--T--TTT--TAT-C-TT----A-----GGT-A--T--CC------TA-CT--AA---CTCC-C-TATCA--CA--AT-G-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92745 : AAACTGAA-CA-TCTT-G-CC--CA-----C----T-T--CAAA--T--TTT--CAC-C-TT----G-----GAC-A--T--CC------TA-CTA-A----CTCC-C-AATCA--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-G-C--A--TA-TCTTAC
gi|92746 : AAACTGAA-CA-TCTT-GCCC--CG-----C----T-C--TCAA--T--TTT--CAC-CATT----G-----GAT-A--TACCC------TA-CT--A----ACCC-T-TATCA--CA--AC-AT----AAA--CGT-T-G-C--A--TT-TCTT
gi|92747 : AACCTGAA-CAATTTT-G-CC--CGG----C----T-T--CAAA--T--TTT--TAC-C-TG----G-----AAT-AT-T--CC------TA-CTA-A----CTCCTC-TATCACTCA--AT-A-----AAA--C-TAT-G-C--A--TT-TCTT
gi|92748 : AAACTGAA-CA-TCTT-G-TC--TG-----C----T-T--AAAA--T--TTT--CAC-C-TT----A-----GAC-A--T--CC------TA-CT--A----
gi|92749 : AAATCGAA-TT-TCTT-G-TC--CG-----C----T-T--CA----TC-TTT--CAC-C-GT----A-----GAC-A--T--CT------TA-CT--AACTACTCT-T-TATCAAACACTAT-G-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAa
gi|92750 : AAACTGAA-CA-CCTT-G-CC--CG-----C----T-T--CAAA--T--TTT--CAC-C-TT----A-----AAC-A--T--CC------TA-CTA-A----CCCC-C-TATCA--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-A-C--A--TT-
gi|92751 : AAGCTGAA-GA-TCTT-A-TC--CG-----C----T-T--CAGA--T--TTT--CAC-C-TT----A-----AAC-A--T--CC------TA-CT--AC---CTCC-C-TATCA--CA--AT-A-----AAT--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92752 : AAGCCTAA-GA-TCTT-A-TC--CG-----C----T-T--CAGA--T--TTT--CAC-C-TTA---A-----AAC-A--TA-CC------TA-CT--AC---CTCC-CATATCA--CA--AT-A-----AAAT-C-T-T-G-C--ATTTT-TCTTAC
gi|92753 : AAACTGAA-CA-T-TT-G-TCTTCG-----C----T-T--TAAA--T--TTT--CAC-A-TT----A-----GAC-G--T--CC------TA-CT--AA---CTCC-C-TGTCA--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-G-T--A--TT-TCTTAC
gi|92754 : AAACTGAAACA-TCTT-T-GC--CG-----C----T-T--CAAA--A--TTT--CAC-C-TTA---A-----GAC-A--T--CC------TA-CTA-A----CTCC-C-TGTCA--CAG-ATAA-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92755 : AAACTGAA-TA-TCTT-G-CC--CG-----C----T-T--CAAC--T--TTT--CGC-C-TT----A-----GAC-A--T--CC------TA-TTA-A----CTCC-C-TATGG--CT--AT-ATATATGAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92756 : AAACTGG--CA-TCTT-G-CC--CG-----C----T-TTCCAAA--T--TTT--TCC-C-TT----A-----GAC-A--T--CC------TA-CTA-A----CTCC-C-TATCA--CA--AT-A-----AAAACT-T-T-G-C--A--
gi|92757 : AAACT-AA-CA-TCTTCG-CC--CG-----C----T-T--CAAGAGT--GTT--CACTC-TTCCGTA-----CAC-A--T--CC------TA-CTA-A----CTCC-C-T-TCA--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92758 : AAACTGAA-TA-TCTT-G-CC--CG-----C----TCT--CAAA-----TCT--CACAC-TT----A-----GAC-A--T--CCCTGCGATA-CTA-A----CTCC-C-TATCC--TG--AT-A-----AAA----T-T-G-C--A---T-TCTTAC
gi|92759 : AAACTGAA-TA-TCTT-G-CC--CG-----C----TCT--CAAA-----TCT--CACAC-TT----A-----GAC-A--T--CCCTGCGATA-CTA-A----CTCC-C-TATCC--TG--AT-A-----AAA----T-T-G-C--A---T-TCTTAC
gi|92760 : AGATTGAA-CA-ACTT-G-CC--CC-----C----T-T--CAGA--T--CTT--CAC-C-TT----G-----GAC-AT-T--CC------TA-CTTGA----CTCT-T-TAT-A--CA--GA-G-----AAA--C-T-TGG-C--A--TT-TCTT
gi|92761 : AACTGAA-CA-TCTT-G-TT--CAGAAAAT----T-T--CAGA--T--TTT--TAT-C-TT----A-----GGT-A--T--CC------TA-CT--A----ACCC-C-TATCA--CA--AT-G-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92762 : AACTGAA-CA-TCTT-G-CC--GG-----C----TCT--CAAA--TTCTTT--CAC-C-TC----------CCC-A--T--CC------TA-CT--A----ACCC-C-TTTTC--CA--AT-A-----AAAACT-T-T-G-C--A--TTCTCTTAC
gi|92763 : CTGAA-AA-TCTT-G-CC--CG-----C----T-T--CACA--T--TTT--CAC-C-TT----A-----GAC-AACT--CC------TAGCT-------CACC-C-TA-CAT-CA--AT-A-----CAC--CGT-T-G-CAAA--TT-TCTTA
gi|92764 : TT-A-CC--CA-----C----T-T--CAAA--T--TTT--CAC-C-TT----A-----AAT-A--T--CC------TA-CT--A----
gi|92765 : AAA--T--CTTGCCAC-A-TT----AACTAGGGCTA--T--CC------TA-CT--AA---CTCC-C-TGTCA--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-GTC--A--TT-TCTTACa
Alignments
lowQualScore : 1 1 1 1 22 66666 3333 5 22 22 44 22 5 1 6666666666 1 3 44 999999 1 222 22 1 1 22 44 44 1 66666 66 3 1 1 1 22 22 1
lowQualScore : . . . . .. ..... .... . .. .. .. .. . . .......... . . .. ...... . ... .. . . .. .. .. . ..... .. . . . . .. .. .
lowQualScore : 8 8 7 7 44 11111 7777 2 44 33 00 33 0 7 6666666666 7 3 00 666666 7 999 55 8 8 55 33 33 8 44444 88 6 8 8 8 55 55 9
consensus : AAACTGAA-CA-TCTT-G-CC--CG-----C----T-T--CAAA--T--TTT--CAC-C-TT----A-----GAC-A-T--CC------TAC-TA---ACT--CC-C-TATC--A--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
Reference ( family-737 ) : AAACTGAA-CA-TCTT-G-CC--CG-----C----T-T--CAAA--T--TTT--CAC-C-TT----A-----GAC-A-T--CC------TAC-TA---ACT--CC-C-TATC--A--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92742 : AAACTGAA-CA-TCTT-G-CC--CG-----C----T-T--CAGA--T--TTT--CAC-C-TT----A-----GAT-A-T--CC------TAC-T----ACT--CC-C-TATC--A--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92743 : AAACTGAA-CA-TCTT-T-CC--CG-----C----T-T--CAGA--T--TTT--CAC---TT----A-----GAT-A-T--CC------TAC-TA---ACT--CC-C-TATC--A--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92744 : AAACTGAA-CA-TCTT-G-TT--CA-----GAAAAT-T--CAGA--T--TTT--TAT-C-TT----A-----GGT-A-T--CC------TAC-TA---ACT--CC-C-TATC--A--CA--AT-G-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92745 : AAACTGAA-CA-TCTT-G-CC--CA-----C----T-T--CAAA--T--TTT--CAC-C-TT----G-----GAC-A-T--CC------TAC-TA---ACT--CC-C-AATC--A--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-G-C--A--TA-TCTTAC
gi|92746 : AAACTGAA-CA-TCTT-GCCC--CG-----C----T-C--TCAA--T--TTT--CAC-CATT----G-----GAT-A-TACCC------TAC-TA---AC---CC-T-TATC--A--CA--AC-AT----AAA--CGT-T-G-C--A--TT-TCTT
gi|92747 : AACCTGAA-CAATTTT-G-CC--CGG----C----T-T--CAAA--T--TTT--TAC-C-TG----G-----AAT-ATT--CC------TAC-TA---ACT--CCTC-TATC--ACTCA--AT-A-----AAA--C-TAT-G-C--A--TT-TCTT
gi|92748 : AAACTGAA-CA-TCTT-G-TC--TG-----C----T-T--AAAA--T--TTT--CAC-C-TT----A-----GAC-A-T--CC------TAC-TA---A
gi|92749 : AAATCGAA-TT-TCTT-G-TC--CG-----C----T-T--CA----TC-TTT--CAC-C-GT----A-----GAC-A-T--CT------TAC-TAACTACT--CT-T-TATCAAA--CACTAT-G-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTA
gi|92750 : AAACTGAA-CA-CCTT-G-CC--CG-----C----T-T--CAAA--T--TTT--CAC-C-TT----A-----AAC-A-T--CC------TAC-TA---ACC--CC-C-TATC--A--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-A-C--A--TT-
gi|92751 : AAGCTGAA-GA-TCTT-A-TC--CG-----C----T-T--CAGA--T--TTT--CAC-C-TT----A-----AAC-A-T--CC------TAC-TA---CCT--CC-C-TATC--A--CA--AT-A-----AAT--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92752 : AAGCCTAA-GA-TCTT-A-TC--CG-----C----T-T--CAGA--T--TTT--CAC-C-TTA---A-----AAC-A-TA-CC------TAC-TA---CCT--CC-CATATC--A--CA--AT-A-----AAAT-C-T-T-G-C--ATTTT-TCTTAC
gi|92753 : AAACTGAA-CA-T-TT-G-TCTTCG-----C----T-T--TAAA--T--TTT--CAC-A-TT----A-----GAC-G-T--CC------TAC-TA---ACT--CC-C-TGTC--A--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-G-T--A--TT-TCTTAC
gi|92754 : AAACTGAAACA-TCTT-T-GC--CG-----C----T-T--CAAA--A--TTT--CAC-C-TT----AA----GAC-A-T--CC------TAC-TA---ACT--CC-C-TGTC--A--CAG-ATAA-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92755 : AAACTGAA-TA-TCTT-G-CC--CG-----C----T-T--CAAC--T--TTT--CGC-C-TT----A-----GAC-A-T--CC------TAT-TA---ACT--CC-C-TATG--G--CT--AT-ATATATGAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92756 : AAACTGG--CA-TCTT-G-CC--CG-----C----T-TTCCAAA--T--TTT--TCC-C-TT----A-----GAC-A-T--CC------TAC-TA---ACT--CC-C-TATC--A--CA--AT-A-----AAAACT-T-T-G-C--A--
gi|92757 : AAACT-AA-CA-TCTTCG-CC--CG-----C----T-T--CAAGAGT--GTT--CACTC-TTCCGTA-----CAC-A-T--CC------TAC-TA---ACT--CC-C-T-TC--A--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92758 : AAACTGAA-TA-TCTT-G-CC--CG-----C----TCT--CAAA-----TCT--CACAC-TT----A-----GAC-A-T--CCCTGCGATAC-TA---ACT--CC-C-TATC--C--TG--AT-A-----AAA----T-T-G-C--A---T-TCTTAC
gi|92759 : AAACTGAA-TA-TCTT-G-CC--CG-----C----TCT--CAAA-----TCT--CACAC-TT----A-----GAC-A-T--CCCTGCGATAC-TA---ACT--CC-C-TATC--C--TG--AT-A-----AAA----T-T-G-C--A---T-TCTTAC
gi|92760 : AGATTGAA-CA-ACTT-G-CC--CC-----C----T-T--CAGA--T--CTT--CAC-C-TT----G-----GAC-ATT--CC------TACTTG---ACT--CT-T-TAT---A--CA--GA-G-----AAA--C-T-TGG-C--A--TT-TCTT
gi|92761 : AACTGAA-CA-TCTT-G-TT--CAGAAAAT----T-T--CAGA--T--TTT--TAT-C-TT----A-----GGT-A-T--CC------TAC-TA---AC---CC-C-TATC--A--CA--AT-G-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92762 : AACTGAA-CA-TCTT-G-CC--GG-----C----TCT--CAAA--TTCTTT--CAC-C-TC----------CCC-A-T--CC------TAC-TA---ACC--CC-T-TTTC-----CA--AT-A-----AAAACT-T-T-G-C--A--TTCTCTTAC
gi|92763 : CTGAA-AA-TCTT-G-CC--CG-----C----T-T--CACA--T--TTT--CAC-C-TT----A-----GAC-A----AC------TCC-TA---GCTCACC-C-TA-C--AT-CA--AT-A-----CAC--CGT-T-G-CAAA--TT-TCTTA
gi|92764 : TT-A-CC--CA-----C----T-T--CAAA--T--TTT--CAC-C-TT----A-----AAT-A-T--CC------TAC-TA---A
gi|92765 : AAA--T--CTTGCCAC-A-TT----AACTAGGGCTA-T--CC------TAC-TA---ACT--CC-C-TGTC--A--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-GTC--A--TT-TCTTAC
Alignments
lowQualScore : 1 1 1 1 22 66666 3333 5 22 22 44 22 5 1 6666666666 1 3 44 999999 1 222 22 1 1 22 44 44 1 66666 66 3 1 1 1 22 22 1
lowQualScore : . . . . .. ..... .... . .. .. .. .. . . .......... . . .. ...... . ... .. . . .. .. .. . ..... .. . . . . .. .. .
lowQualScore : 8 8 7 7 44 11111 7777 2 44 33 00 33 0 7 6666666666 7 3 00 666666 7 999 55 8 8 55 33 33 8 44444 88 6 8 8 8 55 55 9
consensus : AAACTGAA-CA-TCTT-G-CC--CG-----C----T-T--CAAA--T--TTT--CAC-C-TT----A-----GAC-A-T--CC------TAC-TA---ACT--CC-C-TATC--A--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
Reference ( family-737 ) : AAACTGAA-CA-TCTT-G-CC--CG-----C----T-T--CAAA--T--TTT--CAC-C-TT----A-----GAC-A-T--CC------TAC-TA---ACT--CC-C-TATC--A--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92742 : AAACTGAA-CA-TCTT-G-CC--CG-----C----T-T--CAGA--T--TTT--CAC-C-TT----A-----GAT-A-T--CC------TAC-T----ACT--CC-C-TATC--A--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92743 : AAACTGAA-CA-TCTT-T-CC--CG-----C----T-T--CAGA--T--TTT--CAC---TT----A-----GAT-A-T--CC------TAC-TA---ACT--CC-C-TATC--A--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92744 : AAACTGAA-CA-TCTT-G-TT--CA-----GAAAAT-T--CAGA--T--TTT--TAT-C-TT----A-----GGT-A-T--CC------TAC-TA---ACT--CC-C-TATC--A--CA--AT-G-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92745 : AAACTGAA-CA-TCTT-G-CC--CA-----C----T-T--CAAA--T--TTT--CAC-C-TT----G-----GAC-A-T--CC------TAC-TA---ACT--CC-C-AATC--A--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-G-C--A--TA-TCTTAC
gi|92746 : AAACTGAA-CA-TCTT-GCCC--CG-----C----T-C--TCAA--T--TTT--CAC-CATT----G-----GAT-A-TACCC------TAC-TA---AC---CC-T-TATC--A--CA--AC-AT----AAA--CGT-T-G-C--A--TT-TCTT
gi|92747 : AACCTGAA-CAATTTT-G-CC--CGG----C----T-T--CAAA--T--TTT--TAC-C-TG----G-----AAT-ATT--CC------TAC-TA---ACT--CCTC-TATC--ACTCA--AT-A-----AAA--C-TAT-G-C--A--TT-TCTT
gi|92748 : AAACTGAA-CA-TCTT-G-TC--TG-----C----T-T--AAAA--T--TTT--CAC-C-TT----A-----GAC-A-T--CC------TAC-TA---A
gi|92749 : AAATCGAA-TT-TCTT-G-TC--CG-----C----T-T--CA----TC-TTT--CAC-C-GT----A-----GAC-A-T--CT------TAC-TAACTACT--CT-T-TATCAAA--CACTAT-G-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTA
gi|92750 : AAACTGAA-CA-CCTT-G-CC--CG-----C----T-T--CAAA--T--TTT--CAC-C-TT----A-----AAC-A-T--CC------TAC-TA---ACC--CC-C-TATC--A--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-A-C--A--TT-
gi|92751 : AAGCTGAA-GA-TCTT-A-TC--CG-----C----T-T--CAGA--T--TTT--CAC-C-TT----A-----AAC-A-T--CC------TAC-TA---CCT--CC-C-TATC--A--CA--AT-A-----AAT--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92752 : AAGCCTAA-GA-TCTT-A-TC--CG-----C----T-T--CAGA--T--TTT--CAC-C-TTA---A-----AAC-A-TA-CC------TAC-TA---CCT--CC-CATATC--A--CA--AT-A-----AAAT-C-T-T-G-C--ATTTT-TCTTAC
gi|92753 : AAACTGAA-CA-T-TT-G-TCTTCG-----C----T-T--TAAA--T--TTT--CAC-A-TT----A-----GAC-G-T--CC------TAC-TA---ACT--CC-C-TGTC--A--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-G-T--A--TT-TCTTAC
gi|92754 : AAACTGAAACA-TCTT-T-GC--CG-----C----T-T--CAAA--A--TTT--CAC-C-TT----AA----GAC-A-T--CC------TAC-TA---ACT--CC-C-TGTC--A--CAG-ATAA-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92755 : AAACTGAA-TA-TCTT-G-CC--CG-----C----T-T--CAAC--T--TTT--CGC-C-TT----A-----GAC-A-T--CC------TAT-TA---ACT--CC-C-TATG--G--CT--AT-ATATATGAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92756 : AAACTGG--CA-TCTT-G-CC--CG-----C----T-TTCCAAA--T--TTT--TCC-C-TT----A-----GAC-A-T--CC------TAC-TA---ACT--CC-C-TATC--A--CA--AT-A-----AAAACT-T-T-G-C--A--
gi|92757 : AAACT-AA-CA-TCTTCG-CC--CG-----C----T-T--CAAGAGT--GTT--CACTC-TTCCGTA-----CAC-A-T--CC------TAC-TA---ACT--CC-C-T-TC--A--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92758 : AAACTGAA-TA-TCTT-G-CC--CG-----C----TCT--CAAA-----TCT--CACAC-TT----A-----GAC-A-T--CCCTGCGATAC-TA---ACT--CC-C-TATC--C--TG--AT-A-----AAA----T-T-G-C--A---T-TCTTAC
gi|92759 : AAACTGAA-TA-TCTT-G-CC--CG-----C----TCT--CAAA-----TCT--CACAC-TT----A-----GAC-A-T--CCCTGCGATAC-TA---ACT--CC-C-TATC--C--TG--AT-A-----AAA----T-T-G-C--A---T-TCTTAC
gi|92760 : AGATTGAA-CA-ACTT-G-CC--CC-----C----T-T--CAGA--T--CTT--CAC-C-TT----G-----GAC-ATT--CC------TACTTG---ACT--CT-T-TAT---A--CA--GA-G-----AAA--C-T-TGG-C--A--TT-TCTT
gi|92761 : AACTGAA-CA-TCTT-G-TT--CAGAAAAT----T-T--CAGA--T--TTT--TAT-C-TT----A-----GGT-A-T--CC------TAC-TA---AC---CC-C-TATC--A--CA--AT-G-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92762 : AACTGAA-CA-TCTT-G-CC--GG-----C----TCT--CAAA--TTCTTT--CAC-C-TC----------CCC-A-T--CC------TAC-TA---ACC--CC-T-TTTC-----CA--AT-A-----AAAACT-T-T-G-C--A--TTCTCTTAC
gi|92763 : CTGAA-AA-TCTT-G-CC--CG-----C----T-T--CACA--T--TTT--CAC-C-TT----A-----GAC-A----AC------TCC-TA---GCTCACC-C-TA-C--AT-CA--AT-A-----CAC--CGT-T-G-CAAA--TT-TCTTA
gi|92764 : TT-A-CC--CA-----C----T-T--CAAA--T--TTT--CAC-C-TT----A-----AAT-A-T--CC------TAC-TA---A
gi|92765 : AAA--T--CTTGCCAC-A-TT----AACTAGGGCTA-T--CC------TAC-TA---ACT--CC-C-TGTC--A--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-GTC--A--TT-TCTTAC
blockSeqs : A A C C TT GAAAA AAAA C TC AG TC GC T A AACTAG T T AC CTGCGA T ACT CA T A AA CT CT A TATAT AC G A G T AA TT C
blockSeqs : . . . . . G . C . . C . A . CCGTA . T A CTGCGA . . . . . . T G . T AC G . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . . A . AA . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : AAACTGAA-CA-TCTT-G-CC--CG-----C----T-T--CAAA--T--TTT--CAC-C-TT----A-----GAC-A-T--CC------TAC-TA---ACT--CC-C-TATC--A--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
finalCons : AAACTGAA-CA-TCTT-G-CC--CG-----C----T-T--CAAA--T--TTT--CAC-C-TT----A-----GAC-A-T--CC------TAC-TA---ACT--CC-C-TATC--A--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
Alignments
lowQualScore : 1 1 1 1 22 66666 3333 5 22 22 44 22 5 1 6666666666 1 3 44 999999 1 222 22 1 1 22 44 44 1 66666 66 3 1 1 1 22 22 1
lowQualScore : . . . . .. ..... .... . .. .. .. .. . . .......... . . .. ...... . ... .. . . .. .. .. . ..... .. . . . . .. .. .
lowQualScore : 8 8 7 7 44 11111 7777 2 44 33 00 33 0 7 6666666666 7 3 00 666666 7 999 55 8 8 55 33 33 8 44444 88 6 8 8 8 55 55 9
consensus : AAACTGAA-CA-TCTT-G-CC--CG-----C----T-T--CAAA--T--TTT--CAC-C-TT----A-----GAC-A-T--CC------TAC-TA---ACT--CC-C-TATC--A--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
Reference ( family-737 ) : AAACTGAA-CA-TCTT-G-CC--CG-----C----T-T--CAAA--T--TTT--CAC-C-TT----A-----GAC-A-T--CC------TAC-TA---ACT--CC-C-TATC--A--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92742 : AAACTGAA-CA-TCTT-G-CC--CG-----C----T-T--CAGA--T--TTT--CAC-C-TT----A-----GAT-A-T--CC------TAC-T----ACT--CC-C-TATC--A--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92743 : AAACTGAA-CA-TCTT-T-CC--CG-----C----T-T--CAGA--T--TTT--CAC---TT----A-----GAT-A-T--CC------TAC-TA---ACT--CC-C-TATC--A--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92744 : AAACTGAA-CA-TCTT-G-TT--CA-----GAAAAT-T--CAGA--T--TTT--TAT-C-TT----A-----GGT-A-T--CC------TAC-TA---ACT--CC-C-TATC--A--CA--AT-G-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92745 : AAACTGAA-CA-TCTT-G-CC--CA-----C----T-T--CAAA--T--TTT--CAC-C-TT----G-----GAC-A-T--CC------TAC-TA---ACT--CC-C-AATC--A--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-G-C--A--TA-TCTTAC
gi|92746 : AAACTGAA-CA-TCTT-GCCC--CG-----C----T-C--TCAA--T--TTT--CAC-CATT----G-----GAT-A-TACCC------TAC-TA---AC---CC-T-TATC--A--CA--AC-AT----AAA--CGT-T-G-C--A--TT-TCTT
gi|92747 : AACCTGAA-CAATTTT-G-CC--CGG----C----T-T--CAAA--T--TTT--TAC-C-TG----G-----AAT-ATT--CC------TAC-TA---ACT--CCTC-TATC--ACTCA--AT-A-----AAA--C-TAT-G-C--A--TT-TCTT
gi|92748 : AAACTGAA-CA-TCTT-G-TC--TG-----C----T-T--AAAA--T--TTT--CAC-C-TT----A-----GAC-A-T--CC------TAC-TA---A
gi|92749 : AAATCGAA-TT-TCTT-G-TC--CG-----C----T-T--CA----TC-TTT--CAC-C-GT----A-----GAC-A-T--CT------TAC-TAACTACT--CT-T-TATCAAA--CACTAT-G-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTA
gi|92750 : AAACTGAA-CA-CCTT-G-CC--CG-----C----T-T--CAAA--T--TTT--CAC-C-TT----A-----AAC-A-T--CC------TAC-TA---ACC--CC-C-TATC--A--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-A-C--A--TT-
gi|92751 : AAGCTGAA-GA-TCTT-A-TC--CG-----C----T-T--CAGA--T--TTT--CAC-C-TT----A-----AAC-A-T--CC------TAC-TA---CCT--CC-C-TATC--A--CA--AT-A-----AAT--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92752 : AAGCCTAA-GA-TCTT-A-TC--CG-----C----T-T--CAGA--T--TTT--CAC-C-TTA---A-----AAC-A-TA-CC------TAC-TA---CCT--CC-CATATC--A--CA--AT-A-----AAAT-C-T-T-G-C--ATTTT-TCTTAC
gi|92753 : AAACTGAA-CA-T-TT-G-TCTTCG-----C----T-T--TAAA--T--TTT--CAC-A-TT----A-----GAC-G-T--CC------TAC-TA---ACT--CC-C-TGTC--A--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-G-T--A--TT-TCTTAC
gi|92754 : AAACTGAAACA-TCTT-T-GC--CG-----C----T-T--CAAA--A--TTT--CAC-C-TT----AA----GAC-A-T--CC------TAC-TA---ACT--CC-C-TGTC--A--CAG-ATAA-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92755 : AAACTGAA-TA-TCTT-G-CC--CG-----C----T-T--CAAC--T--TTT--CGC-C-TT----A-----GAC-A-T--CC------TAT-TA---ACT--CC-C-TATG--G--CT--AT-ATATATGAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92756 : AAACTGG--CA-TCTT-G-CC--CG-----C----T-TTCCAAA--T--TTT--TCC-C-TT----A-----GAC-A-T--CC------TAC-TA---ACT--CC-C-TATC--A--CA--AT-A-----AAAACT-T-T-G-C--A--
gi|92757 : AAACT-AA-CA-TCTTCG-CC--CG-----C----T-T--CAAGAGT--GTT--CACTC-TTCCGTA-----CAC-A-T--CC------TAC-TA---ACT--CC-C-T-TC--A--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92758 : AAACTGAA-TA-TCTT-G-CC--CG-----C----TCT--CAAA-----TCT--CACAC-TT----A-----GAC-A-T--CCCTGCGATAC-TA---ACT--CC-C-TATC--C--TG--AT-A-----AAA----T-T-G-C--A---T-TCTTAC
gi|92759 : AAACTGAA-TA-TCTT-G-CC--CG-----C----TCT--CAAA-----TCT--CACAC-TT----A-----GAC-A-T--CCCTGCGATAC-TA---ACT--CC-C-TATC--C--TG--AT-A-----AAA----T-T-G-C--A---T-TCTTAC
gi|92760 : AGATTGAA-CA-ACTT-G-CC--CC-----C----T-T--CAGA--T--CTT--CAC-C-TT----G-----GAC-ATT--CC------TACTTG---ACT--CT-T-TAT---A--CA--GA-G-----AAA--C-T-TGG-C--A--TT-TCTT
gi|92761 : AACTGAA-CA-TCTT-G-TT--CAGAAAAT----T-T--CAGA--T--TTT--TAT-C-TT----A-----GGT-A-T--CC------TAC-TA---AC---CC-C-TATC--A--CA--AT-G-----AAA--C-T-T-G-C--A--TT-TCTTAC
gi|92762 : AACTGAA-CA-TCTT-G-CC--GG-----C----TCT--CAAA--TTCTTT--CAC-C-TC----------CCC-A-T--CC------TAC-TA---ACC--CC-T-TTTC-----CA--AT-A-----AAAACT-T-T-G-C--A--TTCTCTTAC
gi|92763 : CTGAA-AA-TCTT-G-CC--CG-----C----T-T--CACA--T--TTT--CAC-C-TT----A-----GAC-A----AC------TCC-TA---GCTCACC-C-TA-C--AT-CA--AT-A-----CAC--CGT-T-G-CAAA--TT-TCTTA
gi|92764 : TT-A-CC--CA-----C----T-T--CAAA--T--TTT--CAC-C-TT----A-----AAT-A-T--CC------TAC-TA---A
gi|92765 : AAA--T--CTTGCCAC-A-TT----AACTAGGGCTA-T--CC------TAC-TA---ACT--CC-C-TGTC--A--CA--AT-A-----AAA--C-T-T-GTC--A--TT-TCTTAC