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lowQualScore : 111111111111111111 1
lowQualScore : 1 1 22 1 3 55 1 3 1 88888 444 222 5555 222 3 444444 1 555555555 4 1 000000000000000000 1 444 666666 99 2
lowQualScore : . . .. . . .. . . . ..... ... ... .... ... . ...... . ......... . . .................. . ... ...... .. .
lowQualScore : 9 5 11 5 1 22 5 1 5 55555 222 777 0000 666 0 333333 5 999999999 8 5 999999999999999999 0 666 777777 44 0
consensus : CCCCCG-TAG-AATA--A-TGA-CC--G-G-G-G-----G---T---CA-NA-T---TTC-TACGTAG------A-A---------AACTGACCC-A------------------GGGTCANTA--TTCTA------CGT-AGAAAAATGACCC-TTT
Reference ( family-729 ) : CCCCCG-TAG-AATA--A-TGA-CC--G-G-G-G-----G---T---CA-NA-T---TTC-TACGTAG------A-A---------AACTGACCC-A------------------GGGTCANTA--TTCTA------CGT-AGAAAAATGACCC-TTT
gi|18085 : CCCCCA-TAA-AATG--A-AGA-CC--G-G-G-G-----GG--T---CA-AA-T---TTC-TACGTAG------G-A---------AACTGACCC-A------------------GGGTCAATA--TTCTA------TG--ACAAAGAGGGTCT-TTT
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gi|18087 : CCCCCA-TAG-AATG--A-TGA-CC--G-G-G-G-----G---T---CA-AA-T---TTC-TACGTAG------G-G---------AACTGACCC-A------------------GGGTCAATA--TTCTA------TG
gi|18088 : CCCCCG-TAGGAATA--T-TGA-CC--G-G-G-G-----G---T---CA-TA-T---TTC-TACGTAG------A-A---------AAATGACCC-A------------------Gacaaagaggggtattttttctaccgtagaaaaccattccagatctgta
gi|18089 : CCCCTA-GAG-AATA--A-TGA-CC--T-G-GTG-----G---T---CA-AA-T---TTC-TACGTTG------A-A---------AACTGATTC-A------------------GGGTCAATA--TTCTA------AG--ACAAAGAGGGTCT-TTT
gi|18090 : CCCCCA-TAG-AATA--A-TTA-CC--G-G-G-A-----A---T---AA-AA-T---TTC-TACGCAG------A-A---------AACTTATCC-A------------------GGGTTAATA--TTCTA------TG--ACAAAAttctaccgtagaaaaccatttcagacctgta
gi|18091 : CCCCCA-TAG-AATA--A-TGA-CC--G-G-G-G-----G---TGTTCA-AA-T---TTC-TACGTAG------A-A---------AACTTATCC-A------------------GGGGCAACA--TTCTA------TGgggtcttttcctaccgtagaaaaccattcttaaactgta
gi|18092 : CCACCA-TAG-AATA--A-TGA-CC--G-G-G-G-----G---T---CA-TA-T---TTG-TATGTAG------A-A---------AAATTACCC-A------------------acaaagagttttttttttcttctaacgtatggaaaaccattccaga
gi|18093 : CCCCCA-TAG-AATA--A-TGA-CC--G-G-G-GA----G---T---CA-AG-T---TTCCTACGTAG------A-A---------AACTGACCC-A-------------------GGTCAAT---TTCTA------TGA-ACAAAGAGGATCT-TTT
gi|18094 : CCCCGATAG-AACATTA-TAA-CC--G-G-G-GA----G---T---CA-TA-T-----C-TACGTAG------A-A---------AACTGACTC-A------------------GGGTCAATAATTCCTA------AAT-AGACAAAtttctacgtaga
gi|18095 : CCCCCA-TGA-AATA--A-TGA-AC--G-GCG-GTGTGTG---T---CA-AA-T---TTC-TACGTAG------A-A---------AACTAACCC-A------------------GGGTGAATA--TTCTATTCTACCAT-AGAAAAgagggtcttttttctattaccgtagaagccatttccaagaac
gi|18096 : CCCCCG-GAG-AAAG--A-GGA-CG--G-G-G-G-----G---T---CA-TC-T---TTC-GTCGTAG------A-A---------AA-TGACCC-G------------------GGGTCTTTA--TTccattccaga
gi|18096 : -AAAA--A-TGA-CC--G-T-G-----------T---C-----T---TTC-ATCGAAA------T-A---------AA--GACCC-C------------------GGGTCATT---TTCTA------CGA-CGAAAGATGACCC-tcgatgaaagacacggtcattttttcgaccgtagaaaatcattcca
gi|18097 : cccccggagaaagaggacgggCCCCTG-TAG-AATA--A-TGA-CC--G-G-G-G-----G---T---CA-TT-T---TTC-TATGTAG------A-A---------AAACAACCC-C------------------CGGTCATTA--TTCTA------CGT-AGAAAAATGACCC-TTTtcgaccgtagaaaatcattcca
gi|18098 : CCCCTG-GAG-AAAG--A-GGA-CCCTG-G-G-G-----G---G---AA-CA-TCTTTTC-GTCGTAG------AAA---------AAGTGACCCGG------------------GGGTC-TTA--TT
gi|18098 : CG-TAG-AAAA--AGTGA-CCC-G-G-G-G-----G---T---CT-TA-T---TTC-GA-AT-G------A-A---------AA--GACAA-A------------------CAGTCATTT--TTCAAC-----CGT-AGAAAAGTtcgaatgaaaagacaaacagtcatttttcaaccgtagaaaagtcattcca
gi|18099 : cccctggagaaagaggaccctggggggaacatcttttcgtCCCCCG-TAG-AATA--T-TGA-CC--G-G-G-G-----G---T---CC-TA-T---TTC-TACATAG------A-A---------AAATGACCC-A------------------cattcca
gi|18100 : CCCCA-TAG-AATA--A-TGA-CC--G-GTG-G-----A---T---AA-AT-T---TTT-TTCGTAC------A-A---------AACTTATCT-T------------------GGCTCAATA--TTATA------TG--ACAAAGAGGGTCT-TTT
gi|18101 : --TTCTA------CGTTAGAAAAATGACCCATTTttctaccgtagaaaaccattccagacctgta
gi|18102 : cccatacaagaattaaaatgacccaaggacataattctacgaagtcatccaagtatctacaacaCCCCCA-TAG-AATG--A-TGA-CC--G-G-G-G-----G---T---CA-AA-T---TTC-TACGTAG------G-G---------AACTGACCC-A------------------GGGTCAATA--TTCTA------TGatcc
gi|18103 : CCCCCA-TAG-AATA--A-TGA-CC--G-G-G-GA----G---T---CA-AG-T---TTCCTACGTAG------A-A---------AACTGACCC-A-------------------GGTCAAT---TTCTA------TGtcacttttc
gi|18104 : CCCCTG-TAG-AATA--A-TGA-CC--G-G-G-G-----G---T---CA-TT-T---TTC-TATGTAG------A-A---------AAACAACCC-C------------------CGGTCATTA--TTCTA------CGtcacttttct
gi|18105 : AG-AATA--A-TAA-CC--CCG-A-G-----G---A---CA-TAAT---TTC-TACGAAGTCATCCA-AGTATTCTACAACAAACT---------------------GGGTCATTT--TTCTA------CGT-AGAAAtcattattct
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gi|18106 : agaataataaccccgaggacataatttctacgaagtcatccaagtattctacaacaaaAG-AATG--A-TGA-CCA-G-G-G-G-----G---T---CA-AA-T---ATC-TACGTAG------G-A---------AACTGACCA-A------------------GGGTTAGTA--TTCTA------TG
gi|18106 : G-TAG-AAAA--A-AGA-CC------------------T---TA-T--T---TGC---CATAG------A-A---------TACTAACCC-T------------------TGGTCAGTT--TCCTA------CGT-AGATATTTGACCC-gcaaataaggtcttttttctaccgtagaaaaccattcc
gi|18107 : agaatgatgaccaggAG-AATA--A-TGACCC--C-A-A-G-----G---A---CATAA-T---TTC-TACG---------------------AAGTCATCC-AAGTATTCTACAACAAAATGGGTCATTT--TTCTA------CGT-AGAAAcgtagaaaaccattcc
gi|18107 : --TTCTA------CGT-AGAAAAATGACCCATTT
gi|18108 : agaataatgaccccaaggacataatttctacgaagtcatccaagtattctacaacaAG-AATA--A-TGACCC--C-G-A-G-----G---A---CATGA-T---TTC-TACG---------------------AAGTCATCC-A-----------------------AGTA--TTCTA------C---AACAAAATGa
gi|18108 : --TTCTA------CAT-AGAAAAATGACCCATTTggtcatttttctatgtagaaa