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Reference ( gi|113758 )       : AAATG-A-T-G-A-A-G-C----GGT------A--A-A---A--A-GC-A-AAGG-GGTT-CC--G-GA--A-CGA-G-----GT---G-TT--CCGC--ACGC-G-G-AG----T--G---C-T--G-AT-A-T--G-G-ATT-T-GCG-GGG-C-TG-AT-A-C--AG-G--T-T-AT-CA-G-C-CCTA---GG-GCT-G-AT-A-CGG-C--TAT-TG-TGA-T---G-T-CA-TC-T--GT-A-----TC-GCA--CA--T--GC----AAAAAA-C------CT-G-T--A-T--T-T---A-T--T---A-C-TAAGTA-TG-T-AATAAA
gi|113757                     : AAATG-A-T-G-A-A-G-C----GGT------A--A-A---A--A-AC-A-AAGG---TT-CC--G-GA--A-CGA-G-----GT---G-TT--CCGC--ACGC-G-G-AG----G--G---C-T--G-AT-A-T--G-G-ATT-T-GCA-GGG-C-TG-AT-A-C--AG-G--T-T-AT-CA-G-C-CCTA---GG-GCT-G-AT-A-CGG-C--TAT-TG-TGA-T---G-T-CA-TC-T--GT-A-----TC-GCA--CA--T--GC----AAAAAA-C------CT-G-T--A-T--T-T---A-A--T---A-C-TAAGTA-TG-T-AATAAA
gi|113756                     : AAATG-A-T-G-A-A-G-C----GGT------A--A-A---A--A-GC-A-AAGG-GGTT-CC--G-GA--A-CGA-G-----GT---G-TT--CCGC--ACGC-G-G-AG----G--G---C-T--G-AT-A-T--G-G-ATT-T-GCA-GGG-C-TG-AT-C-C--AG-G--T-T-AT-CA-G-C-CCTA---GG-GCT-G-AT-A-CGG-C--TAC-TG-TGA-T---G-T-CA-TC-T--GT-A-----TC-GCA--CA--T--GC----AAAAAA-C------CT-G-T--ATT--T-T---A-A--T---A-C-TAAGTA-TG-T-AATAAA
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gi|113777                     :  AATG-A-T-G-A-A-G-C----TGT------A--A-A---A----GC-A-TAGG-GGTTTCC--G-GATTA-CGA-G-----TTT--G-TT--C-GC---TAC-C-G-AG-------G---C-TT-G-AT-A-TATG-G-ATT-TTGCA-GGG-C-T--AT-A-C--AG----T-T-GT-TA-T-T-CCTA---GG--CT---AT-A-CTG-C--TAT-TG-T-A-T---G---CA-TCCT--GT-A------C-G-A--CA--T--GC-----AAAAA-C------CTGG-T--A-T--T-T---A-A--T---A-C-TAAATA-TG-TAAATAAA
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Reference ( family-727 )      : AAATG-A-T-G-A-A-G-C----GGT------A--A-A---A--A-GC-A-AAGG-GGTT-CC--G-GA--A-CGA-G-----GT---G-TT--CCGC--ACGC-G-G-AG--G----G---C-T--G-AT-A-T--G-G-ATT-T-GC-A-GGG-C-TG-AT-A-C--AG-G--T-TATC-AG-CCCTA---GG-GCT-G-AT-A-CGG-C--TAT-TG-TGA-T---G-T-CA-TC-T--GT-A-----TC-GCA--CA--T--GC----AAAAAA-C------CT-G-T--A-T--T-TA-NT---A-C-TAAGTA-TG-T-AATAAA
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gi|113778                     :    TG-A-T-G-A-A-G-C----G-T------A--A-A---A--A-GC-A-AAGG-GGTT-C---G-GA-----GA-G-----GT---G-TT--CCG---ACGC-G-G-AG--G----G---C-T--G-AT-A-T--G-G-ATT-T-GC-A--GG-C-TG-AT-A-C--AG-GT-T-TATC-AG-CCCTA---GG-G---G-AT-A-CGG-C--TAT-TG-TGA-T---G-T-CA-TC-T--GT-A-----T--GCA--CA--T--GG----AAAAAA-A------CT-G-T--A-T--T-TA-AT---A-C-T-AGTA-TG-T-AATAAA
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blockSeqs                     :      . G . . . A . A      TTT    TA . C   .  A  . .    .    T  .  .  AA     . .      CCC A  .     AA    . C .  .  CGTC G   . T  .  . A .  . .   . .  . G   . G  C  . . .   . A  A    .  A     CG   .   G C  . T   . .    A  .   . A   TT   .  C .   . TT    C    G   C  G   TA        . .       . . .  . G  .  TA A   . .      .  . A
blockSeqs                     :      . A . . . . . T      .      .  . .   .  .  . .    .    T  .  .  A      . .      A   T  .     .     . . .  .  .    .   . .  .  . . .  . .   . .  . G   . G  .  . . .   . T  A    .  .     .    .   . .  . .   . .    .  .   . .   TT   .  . .   . .     C    C   .  .   AA        . .       . . .  . A  .  A  A   . .      .  . A
blockSeqs                     :      . . . . . . . .      .      .  . .   .  .  . .    .    .  .  .  A      . .      T   .  .     .     . . .  .  .    .   . .  .  . . .  . .   . .  . G   . .  .  . . .   . .  A    .  .     .    .   . .  . .   . .    .  .   . .   TT   .  . .   . .     C    .   .  .   A         . .       . . .  . .  .  T  .   . .      .  . .
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Reference ( family-727 )      : AAATG-A-T-G-A-A-G-C----GGT------A--A-A---A--A-GC-A-AAGG-GGTT-CC--G-GA--A-CGA-G-----GT---G-TT--CCGC--ACGC-G-G-AG--G----G---C-T--G-AT-A-T--G-G-ATT-T-GC-A-GGG-C-TG-AT-A-C--AG-G--T-TATC-AG-CCCTA---GG-GCT-G-AT-A-CGG-C--TAT-TG-TGA-T---G-T-CA-TC-T--GT-A-----TC-GCA--CA--T--GC----AAAAAA-C------CT-G-T--A-T--T-TA-NT---A-C-TAAGTA-TG-T-AATAAA
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