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lowQualScore                  :     .   .   .   ......  . ....  . .. .  .......  .. .   ....  ... .   ..           ........   .  ....  ... .    . .  ...   ... ... .    . . .   ... ... .  .  . . ..  . .   .  .............    .  .   ....  . .....    ... .  ..   ...  . .... . . ..............  ............     ........   ..... ........ .. . ...  .     .   ..  .  . ..   .   ..  . .   .   .  ...     .    ..  . .  . ... ..   . .. .    .   
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Reference ( gi|5876 )         : CATA-TCC-AAC-TAT-A--A-CG-G----TC-A--T-CA-------CG--T-GAC----TT-A-A-GCG--ATTATTTGTTT-A------CCTATT----AA---G-AGTA-C-CT---GTA---T---T-TACT-A-T-AGG---C---G-AT-AA-C-G--GG-G-AGT-GT-------------GTAA-TT-AAA----CC-A-----TTAT---A-AC--TTT---TT-T----C-A-T--A----T------AT------T---A-TATAG--------AAA-----A-A-A----G--T-T---GG-ACCCC-TGA--CC-TG-A--AAG-AGC--AT-T-AAT-TTC-TA---CAAAA-GATG--AT-A-TA-T---T--TTA-T--T-TCAG-TTC
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gi|5880                       : CATA-TCC-AAC-TTT-A--G-CG-G----TC-A--T-CA-------CG--T-GAC----TT-A-A-GCG--ATTATTTGTTT-A------CCTATT----AA---G-AGTA-C-CT---GTA---T---T-TACT-A-T-AGG---C---G-AT-AA-C-G--GG-G-AGT-GT-------------GTGA-TT-AAA----CT-A-----TTAT---A-AC--TTT---TT-T----C-A-T--G----C------AT------T---A-TATAG--------AAT-----A-A-A----G--A-T---GG-ACCCC-TGA--CC-TG-A--ACG-AAC--AT-T-AAT-TTC-TA---TAAAA-GATA--AT-A-TA-T---T--TTA-T--
gi|5878                       : CATA-TCC-AAC-TAT-T--G-CG-G----CC-A--T-CA-------CG--T-GAT----TT-G-A-TCA--ATTATTTGTTT-A------CGTATT----AA---G-AGTA-C-CT---GTA---T---T-TACT-A-T-AGG---C---G-AT-AA-C-G--TG-G-AGT-GT-------------GTGA-TT-AAA----CT-A-----TTAT---A-AC--TTT---TT-T----C-A-T--G----T------AT------T---T-TATAG--------AAT-----A-A-A----G--T-T---GG-ATCTC-TGA--CC-TG-A--AAG-AGC--AT-C-AAT-TTC-TA---CAAAA-GATG--AT-A-TA-T---T--TTA-T--T-TTAG-TTC
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gi|5890                       :  ATA-TCC-AAC-TAT-T--G-CG-G----TC-A--T-CA-------CG--T-GAC----TT-A-A-GCG--ATTATTTGTTT-A-------CTATT----AA---G-AGTA-C-CA---GTAACCTGCAT-TACT-A-T-AGG---C---G-AT-AA-C-G--GG-G-AGT-GT-------------GTAA-TT-AAA-----C-A-----TTAT---A-AC--TTT---TT-T----C-A-T--G----C------AT------T---A-TATAG----------A-----A-A-A----G--T-T---GG-ACGCC-
gi|5891                       :  ATA-TCC-AGC-TAT-A--C-CC-G----TC-A--T-CA-------CA--T-GAC----TC-G-G-ATG--ATTATTTGTTT-ATATTTACCTGTTTTAAAA---G-ATTG-C-TTC--GTA---T---T-TACA-A-T-AGG---C---G-AT-AA-T-A--GG-G-TGT-GT-------------GTAA-TT-AAA----CT-A-----TGAT---A-ACTTTTT---TT-T----C-A-T--T----C------GT------T--------------------------------------T-T---GG-ACCCC-GGA--CT-TG-A--AAG-AAC--TT-T-TAT-TTC-TA---CAAAA-GATG--GT-A-TA-T---T--TTA-T--T-TCAG-TT
gi|5892                       :   TA-TCC-AGC-TATCA--G-CA-G----TT-G--T-CA-------TG--T-GGC----TT-G-T-ATG--ATTATTTGCTT---------------------------------C---GTA---T---T-TACC-A-A-ATG---C---G-AT-AA-C-A--GG-G-TGT-GT-------------GTAA-TT-TAG----CT-A-----TAAT---A-CC--TTT---TC-C----C-C-T--A----T------AT------C---A-TA-AG--------CAA-----A-C-TT---G--T-T---GG-ACTCC-TGA--CT-TG-A--TAG-AAT--AT-T-TAT-TTC-TA---CAAAA-AAAA--AT-A-TA-T---T--TTA-T--A-TCAA-TT
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gi|5894                       :     -TCC-AAC-C-T-A--AGCG-G----TC-A--T-CA-------CG--T-GAC----TTCA-A-GCG--ATT-TTTGTTT-A------CCTATT----AAA--G-AGTA-C-CT---GTA---T---T-TACTTA-T-AGG---C---G-AT-AA-CCG--GG-G-AGT-GT-------------GTAA-TT-AAA----CC-A-----TTAT---A-AC--TTT---TT-T----C-A-T--A----T------AT------T-----TATAG--------AAA-----A-A-A----G--T-T---GGAACCCC-TGA--C---G-A--AAG-AGC--AT-T-AAT-TTC-TA---CAAAT-GATA--ATCA-TA-T---T--TTA-T--T-TCAG-TTC
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lowQualScore                  :     .   .   .   ....   . ....  . .. .  .......  .. ....     ... .   ..           ........   .  ....  ... .    . .  ...   ... ... .    . . .   ... ... .  .  . . ..  . .   .  .............    .  .   ....  . .....    ... .  ..   ...  . .... . . ..............  ............     ........   ..... ........ .. . ...  .     .   ..  .  . ..   .   ..  . .   .   .  ...     .    ..  . .  . . ..   . ... .    .   
lowQualScore                  :     1   0   0   5555   0 2222  0 88 0  5555555  88 2222     444 0   88           88888888   3  5555  888 1    1 1  111   777 888 2    1 1 1   555 555 0  0  0 0 55  0 0   0  0000000000000    0  0   2222  0 00000    555 0  88   333  9 0000 9 9 66666666666666  999999999999     66666666   11111 55555555 55 7 111  7     5   55  6  8 33   8   55  8 8   8   8  222     8    55  8 8  8 8 55   8 777 9    0   
consensus                     : CATA-TCC-AAC-TAT-A--GCG-G----TC-A--T-CA-------CG--T----GACTT-G-A-GCG--ATTATTTGTTT-A------CCTATT----AA---G-AGTA-C-CT---GTA---T---T-TACT-A-T-AGG---C---G-AT-AA-C-G--GG-G-AGT-GT-------------GTAA-TT-AAA----CC-A-----TTAT---A-AC--TTT---TT-T----C-A-T--A----T------AT------T---A-TATAG--------AAA-----A-A-A----G--T-T---GG-ACCCC-TGA--CC-TG-A--AAG-AGC--AT-T-AAT-TTC-TA---CAAAA-GATG--AT-A-TA-T-T--TTA-T---T-TCAG-TTC
Reference ( family-722 )      : CATA-TCC-AAC-TAT-A--GCG-G----TC-A--T-CA-------CG--T----GACTT-G-A-GCG--ATTATTTGTTT-A------CCTATT----AA---G-AGTA-C-CT---GTA---T---T-TACT-A-T-AGG---C---G-AT-AA-C-G--GG-G-AGT-GT-------------GTAA-TT-AAA----CC-A-----TTAT---A-AC--TTT---TT-T----C-A-T--A----T------AT------T---A-TATAG--------AAA-----A-A-A----G--T-T---GG-ACCCC-TGA--CC-TG-A--AAG-AGC--AT-T-AAT-TTC-TA---CAAAA-GATG--AT-A-TA-T-T--TTA-T---T-TCAG-TTC
gi|5876                       : CATA-TCC-AAC-TAT-A--ACG-G----TC-A--T-CA-------CG--T----GACTT-A-A-GCG--ATTATTTGTTT-A------CCTATT----AA---G-AGTA-C-CT---GTA---T---T-TACT-A-T-AGG---C---G-AT-AA-C-G--GG-G-AGT-GT-------------GTAA-TT-AAA----CC-A-----TTAT---A-AC--TTT---TT-T----C-A-T--A----T------AT------T---A-TATAG--------AAA-----A-A-A----G--T-T---GG-ACCCC-TGA--CC-TG-A--AAG-AGC--AT-T-AAT-TTC-TA---CAAAA-GATG--AT-A-TA-T-T--TTA-T---T-TCAG-TTC
gi|5877                       : CATA-TCC-AAC-GAT-A--GCG-G----TC-A--T-CA-------CG--T----GACTT-A-A-GCG--ATTATTTGTTT--------CCT-TT----AA---G-AGTA-C-CT---GTA---T---T-TACT-A-T-AG----C---G-AT-AA-C-G--GG-G-AGT-AT-------------GTAA-TT-AAA----CC-A-----TTAT---A-AC--TTT---TT-T----C-A-TT-A----T------AT----------A-TATAG--------AAA-----A---A----G--T-T---GG-ACCCC-TGA--CC-TG-A--AAG-AGC--AA-T-AAT-TTC-TA---CAAAA-GATG--AT-A-TA-T-T--TTA-T---T-TCAG-TTC
gi|5878                       : CATA-TCC-AAC-TAT-T--GCG-G----CC-A--T-CA-------CG--T----GATTT-G-A-TCA--ATTATTTGTTT-A------CGTATT----AA---G-AGTA-C-CT---GTA---T---T-TACT-A-T-AGG---C---G-AT-AA-C-G--TG-G-AGT-GT-------------GTGA-TT-AAA----CT-A-----TTAT---A-AC--TTT---TT-T----C-A-T--G----T------AT------T---T-TATAG--------AAT-----A-A-A----G--T-T---GG-ATCTC-TGA--CC-TG-A--AAG-AGC--AT-C-AAT-TTC-TA---CAAAA-GATG--AT-A-TA-T-T--TTA-T---T-TTAG-TTC
gi|5879                       : CATA-TCC-AAC-TAT-T--GCG-G----CC-A--T-CA-------CG--T----GATTT-G-A-TCA--AATATTTGTTT-A------CCTA
gi|5880                       : CATA-TCC-AAC-TTT-A--GCG-G----TC-A--T-CA-------CG--T----GACTT-A-A-GCG--ATTATTTGTTT-A------CCTATT----AA---G-AGTA-C-CT---GTA---T---T-TACT-A-T-AGG---C---G-AT-AA-C-G--GG-G-AGT-GT-------------GTGA-TT-AAA----CT-A-----TTAT---A-AC--TTT---TT-T----C-A-T--G----C------AT------T---A-TATAG--------AAT-----A-A-A----G--A-T---GG-ACCCC-TGA--CC-TG-A--ACG-AAC--AT-T-AAT-TTC-TA---TAAAA-GATA--AT-A-TA-T-T--TTA-T---
gi|5881                       : CATA-TCC-AAC-TAT-A--GCG-G----TC-ACTC-CA-------CG--T----G-CTT-C-A-GCGA-ATTAATATTTT-AC-----CCTTTC----AAGGTG-AGTA-CGCT---GTC---T---T-T-CT-A-T-A-G---C---GTAT-AA-C-GATGG-G-AGTGGTTAGCAACACACTGGTAA-TTAAAA----AC-ACGAATTTATC--A-AC--TTCTAATC-T----C-A----A----TC-----ATGAAAGAT---A-TATAGTAGAACACAAA-----A-A-AACAGA--T-TCGGGG-ACCCC-TGACTCC-TG-A--AAGTAGCAAAT-T-CATCTTC-TA---CAAAGCGATA--AT-A-TA-T-A--TTA-T---A-T-AG-TTC
gi|5882                       : CATA-TCC-A-C-TATTA--GCG-G----CT-G----CA-------CGC-T----GACTT-C-A-GCG--ATTATTTGTT--A------CCTATA----AA---G-AGTA-C-CT---GTA---T---T-TACT-A-TGAGG---C---G-AT-AA-C----GG-G-AGT-GT-------------GTAA-TT-AAA----CC-A-----TTATATAA-ACT-TTT---TT-T----C-A-T--A----T------AT------T---A-TATAG--------AAA-----A-A-A----G----T---GG-ACCCC-TGA--CC-CGAA--AAG-AGC--AT-T-AAT-TTC--A---CAAAA-GATA--AT-A-TA-T-T--TTA-T---A-TTAG-TTC
gi|5883                       : CATACTCC-AACGTCT-A--GCG-G----TC-A--TTCA-------CG--TT---GACTT-A-A-GCG--ATTA---GTTT-A------CCTATT----AA---G-AGTA-C--T---GTA---T---GGTACT-A-T-AAGGAGC---G-AT-AA-C-G--GG-G--GT-GT-------------GAAA-TT-AAA----CC-A-----TTATA--A-AC--TTT---TT-T----C-A-TG-A----A------AT------T---A-TATAG--------AAA-----A-A-A----GA-T-TTGGGG-ACCCCTTGA--CC-TG-A--AAG-AGC--AT-T-AA--TTC-TA---CAAGT-GA----AT-A-TA---T--TTA-TTTAT-TCAG-TTC
gi|5884                       : CATA-TCC-AAC-TAT-ATAGCG-G----CC-A--T-AA-------CT--T----GACTT-G-A-ACG--ATTATTTGTTT-A------CCTATT-----A---G-AGTA-C-CTC--ATA---T---T-TACA-A-T-TGG---C---G-AA-AA-A-G--GG-G-AGT-GT-------------GTAA-TT-AAA----CT-A-----TTTT---A-ACTTTTT---TT-T----C-A-A--A----T------AT------T---ATTATAA--------TAATATATA-A-A----GTTT-T---GG-ACCTC-TGT--CC-TG-G--AAA-ACC--AT-T-AAC-ATG-TA---CAGAA-GATG--GT-G-TA-T-T--TTA-T---T-TGAG-TTC
gi|5885                       : CATA-TCC-AAC-TAT-A--GCG-G----TCCA--T-CA--------G--T----GATTT-A-A-G-G--ATT---------------------T----AA---G-AGTA-C-CT---GTA---TA--G-TACT-A---AGG---C---G-AT-AA-C-G--GG-G-AGT-GT-------------GTAATTT-AAA----CC-A-----TTAT---AGAC--TTT---TT-T----C-ACT--A----T------AT------TTTAA-TATAA--------TAA-----A-A-A----G--T-T---GG-CCCGT-TGA--CCTTG-A--AAG-AGC--AT-T-AAT-TTC-TA---CAAAG-GATGGAGT-ATTA-T-TTGTTAGT---T-TTAG-TTC
gi|5886                       : CATA-TCC-AAC-TAT-T--GCG-G----CC-A--T-CA-------CG--TACGTGA-TT-G-A-TCAC-ATTATTTGTTTTA------CCTATT----AA---G-AGTAAC-CT---GTA---T---T--ACT-A-T--GG---C---G-AT-AATC-G--GG-G-AGTCGT-------------GTA--TT-AAA----CT-A-----TTAT---A-ACCCTTT---TT-T----T-G-T--T----TTAAGCAAT------T---A-TATAG--------AGAT----A-A-A----G--T-T---GG-ACCCCCTGA--CC-TG-A--AGA-GGA--ATCT-AA--TTC-TA---GAAAG-AATG--AT-A-TACT-T--TTA-T---TATCAG-TTC
gi|5887                       : CATA-TCC-AAC-TAT-T--GCG-GCGAATC-A--TACATAGAATTCG--T----GAATT-T-G-TCA--ATTATTTGTTT-A------CCTATT----AA---GCAGTA-C-CTTGTATA---T---T-TA-T-A-T-AGG---CC--G-AT-AA-C-G--GG-GTAG--GT-------------GTGA-TT-AGA----CT-A-----TTAT---A-AC---TT---TT-T----C-A-T--T----C------ATG-----T---A-TAACG--------AAT-----A-A-A----G--T-G---AG-A-CCC-TGA--CC-TG-AGCAAG-AGC--AT-TAAAT-TTC-GAACGCAAAA-GATG--AC-G-TA-TAT--TTA-T---T-TCAG-
gi|5888                       : CATA-TCC-AAT-TAT-A--GTG-G----TC-A--T-CT-------CA--T----GAC-----A-GCGTGATTATATGTTT-A------TCTATT----AG---G--GTA-A-CTC--GTA---T---T-GAC--A-T-AGG---C---G-AT-AA-T-G--AG-G-AAT-GT-------------GAAA-TT-AAA----AT-A-----TTAT---A-AC--TTT---GT-C----CTA-T--ACATCT------AT------T---G-CAT----------AAA-----A-A-A----GTTT-T---TC-ACTCC-TGC--CC-TG-A--AAG-AGC--GT-T-CAT-AT--TA---CAGAA-GAAG--AT-A-TA-T-T--ATA-T---T-TTA
gi|5889                       :  ATA-TC--AAC-TAT-T--GCG-G-----C-A--T-CA-------CG--T----GATTT-G-A-TGA--ATTATTTGTTT-A------CCTATC----AA---G-AGTA-C-TT---GTA---T---T-TACT-A-T-AGG---C---G-AT-AA-C-G--AGCG-AGT-GT-------------G--A-TG-AAA----CT-A-----T--T---A-AC--TTT---TT-T----C-A-TC-C----T------CT------G---A-TATTT--------AAA-----A-----------T-A---GG-ACCCC-TGA--CT-TG-A--AAG-AGC--AT-T-ACT-ATC-TA---CAAAA-GATG--AT-A--A-T-T--TTA-T---T-TCAGATTC
gi|5890                       :  ATA-TCC-AAC-TAT-T--GCG-G----TC-A--T-CA-------CG--T----GACTT-A-A-GCG--ATTATTTGTTT-A-------CTATT----AA---G-AGTA-C-CA---GTAACCTGCAT-TACT-A-T-AGG---C---G-AT-AA-C-G--GG-G-AGT-GT-------------GTAA-TT-AAA-----C-A-----TTAT---A-AC--TTT---TT-T----C-A-T--G----C------AT------T---A-TATAG----------A-----A-A-A----G--T-T---GG-ACGCC-
gi|5891                       :  ATA-TCC-AGC-TAT-A--CCC-G----TC-A--T-CA-------CA--T----GACTC-G-G-ATG--ATTATTTGTTT-ATATTTACCTGTTTTAAAA---G-ATTG-C-TTC--GTA---T---T-TACA-A-T-AGG---C---G-AT-AA-T-A--GG-G-TGT-GT-------------GTAA-TT-AAA----CT-A-----TGAT---A-ACTTTTT---TT-T----C-A-T--T----C------GT------T--------------------------------------T-T---GG-ACCCC-GGA--CT-TG-A--AAG-AAC--TT-T-TAT-TTC-TA---CAAAA-GATG--GT-A-TA-T-T--TTA-T---T-TCAG-TT
gi|5892                       :   TA-TCC-AGC-TATCA--GCA-G----TT-G--T-CA-------TG--T----GGCTT-G-T-ATG--ATTATTTGCTT---------------------------------C---GTA---T---T-TACC-A-A-ATG---C---G-AT-AA-C-A--GG-G-TGT-GT-------------GTAA-TT-TAG----CT-A-----TAAT---A-CC--TTT---TC-C----C-C-T--A----T------AT------C---A-TA-AG--------CAA-----A-C-TT---G--T-T---GG-ACTCC-TGA--CT-TG-A--TAG-AAT--AT-T-TAT-TTC-TA---CAAAA-AAAA--AT-A-TA-T-T--TTA-T---A-TCAA-TT
gi|5893                       :   TA-TCCCAGC-TATCA--GCAAG----TT-G--T-CA-------TG--T----GGCTT-GTA-ATG--ATTATTTG-----------CCT---------------------TC---GTA---T---T-TACC-A-T---G---C---G-AT-AA-CCA--GG-G-TGT-GT-------------GTAA-TT-TAG----CCTA-----TAAT---A-CC--TTT---TTCC----C-C-T--A----T------AT------------CATAG--------CAA-----A-CTT----G--T-T---GG-ACTCC-TGA--CT-TG-A--TAG-AAT--AT-T-TAT-TTC-TA---CAAAA-AAAA--AT-A-TA-T-T--TTA-CTA-T-TCAA-TT
gi|5894                       :     -TCC-AACCTA--A--GCG-G----TC-A--T-CA-------CG--T----GACTTCA-A-GCG--ATT-TTTGTTT-A------CCTATT----AAA--G-AGTA-C-CT---GTA---T---T-TACTTA-T-AGG---C---G-AT-AA-CCG--GG-G-AGT-GT-------------GTAA-TT-AAA----CC-A-----TTAT---A-AC--TTT---TT-T----C-A-T--A----T------AT------T-----TATAG--------AAA-----A-A-A----G--T-T---GGAACCCC-TGA--C---G-A--AAG-AGC--AT-T-AAT-TTC-TA---CAAAT-GATA--ATCA-TA-T-T--TTA-T---T-TCAG-TTC
gi|5895                       :       CC-AAC-TAT-A--GCG-G----TC-AG-T-CAA------CGAAT-----ACTT-A-AAGCG--ATTAATTGTTT-AAA----CCTATT----AA---G-AGTT-C-CTC--GTA---T---TCTACT-AAT-AGG---CAAAG-AT-AA-C-GTGGG-G-AGT-GT-------------GTAAATT-AAAAACATC-T-----TTAT---A-AC--TTT---TT-CATGGC-A-TTAA----T------AT------T---A--GTAG--------AAA-----ATC-A----G--T-T---GG-ACCCC-TAA--CCCTG-AC-AAG-AGC--AT-T-AAT-TTCCTA---CAAAA-GATG--AT-A-TA-T-T--TTA-T---T-CCAG-TTC
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lowQualScore                  :     .   .   .   ....   . ....  . .. .  .......  .. ....     ... .   ..           ........   .  ....  ... .    . .  ...   ... ... .    . . .   ... ... .  .  . . ..  . .   .  .............    .  .   ....  . .....    ... .  ..   ...  . .... . . ..............  ............     ........   ..... ........ .. . ...  .     .   ..  .  . ..   .   ..  . .   .   .  ...     .    ..  . .  . . ..   . ... .    .   
lowQualScore                  :     1   0   0   5555   0 2222  0 88 0  5555555  88 2222     444 0   88           88888888   3  5555  888 1    1 1  111   777 888 2    1 1 1   555 555 0  0  0 0 55  0 0   0  0000000000000    0  0   2222  0 00000    555 0  88   333  9 0000 9 9 66666666666666  999999999999     66666666   11111 55555555 55 7 111  7     5   55  6  8 33   8   55  8 8   8   8  222     8    55  8 8  8 8 55   8 777 9    0   
consensus                     : CATA-TCC-AAC-TAT-A--GCG-G----TC-A--T-CA-------CG--T----GACTT-G-A-GCG--ATTATTTGTTT-A------CCTATT----AA---G-AGTA-C-CT---GTA---T---T-TACT-A-T-AGG---C---G-AT-AA-C-G--GG-G-AGT-GT-------------GTAA-TT-AAA----CC-A-----TTAT---A-AC--TTT---TT-T----C-A-T--A----T------AT------T---A-TATAG--------AAA-----A-A-A----G--T-T---GG-ACCCC-TGA--CC-TG-A--AAG-AGC--AT-T-AAT-TTC-TA---CAAAA-GATG--AT-A-TA-T-T--TTA-T---T-TCAG-TTC
Reference ( family-722 )      : CATA-TCC-AAC-TAT-A--GCG-G----TC-A--T-CA-------CG--T----GACTT-G-A-GCG--ATTATTTGTTT-A------CCTATT----AA---G-AGTA-C-CT---GTA---T---T-TACT-A-T-AGG---C---G-AT-AA-C-G--GG-G-AGT-GT-------------GTAA-TT-AAA----CC-A-----TTAT---A-AC--TTT---TT-T----C-A-T--A----T------AT------T---A-TATAG--------AAA-----A-A-A----G--T-T---GG-ACCCC-TGA--CC-TG-A--AAG-AGC--AT-T-AAT-TTC-TA---CAAAA-GATG--AT-A-TA-T-T--TTA-T---T-TCAG-TTC
gi|5876                       : CATA-TCC-AAC-TAT-A--ACG-G----TC-A--T-CA-------CG--T----GACTT-A-A-GCG--ATTATTTGTTT-A------CCTATT----AA---G-AGTA-C-CT---GTA---T---T-TACT-A-T-AGG---C---G-AT-AA-C-G--GG-G-AGT-GT-------------GTAA-TT-AAA----CC-A-----TTAT---A-AC--TTT---TT-T----C-A-T--A----T------AT------T---A-TATAG--------AAA-----A-A-A----G--T-T---GG-ACCCC-TGA--CC-TG-A--AAG-AGC--AT-T-AAT-TTC-TA---CAAAA-GATG--AT-A-TA-T-T--TTA-T---T-TCAG-TTC
gi|5877                       : CATA-TCC-AAC-GAT-A--GCG-G----TC-A--T-CA-------CG--T----GACTT-A-A-GCG--ATTATTTGTTT--------CCT-TT----AA---G-AGTA-C-CT---GTA---T---T-TACT-A-T-AG----C---G-AT-AA-C-G--GG-G-AGT-AT-------------GTAA-TT-AAA----CC-A-----TTAT---A-AC--TTT---TT-T----C-A-TT-A----T------AT----------A-TATAG--------AAA-----A---A----G--T-T---GG-ACCCC-TGA--CC-TG-A--AAG-AGC--AA-T-AAT-TTC-TA---CAAAA-GATG--AT-A-TA-T-T--TTA-T---T-TCAG-TTC
gi|5878                       : CATA-TCC-AAC-TAT-T--GCG-G----CC-A--T-CA-------CG--T----GATTT-G-A-TCA--ATTATTTGTTT-A------CGTATT----AA---G-AGTA-C-CT---GTA---T---T-TACT-A-T-AGG---C---G-AT-AA-C-G--TG-G-AGT-GT-------------GTGA-TT-AAA----CT-A-----TTAT---A-AC--TTT---TT-T----C-A-T--G----T------AT------T---T-TATAG--------AAT-----A-A-A----G--T-T---GG-ATCTC-TGA--CC-TG-A--AAG-AGC--AT-C-AAT-TTC-TA---CAAAA-GATG--AT-A-TA-T-T--TTA-T---T-TTAG-TTC
gi|5879                       : CATA-TCC-AAC-TAT-T--GCG-G----CC-A--T-CA-------CG--T----GATTT-G-A-TCA--AATATTTGTTT-A------CCTA
gi|5880                       : CATA-TCC-AAC-TTT-A--GCG-G----TC-A--T-CA-------CG--T----GACTT-A-A-GCG--ATTATTTGTTT-A------CCTATT----AA---G-AGTA-C-CT---GTA---T---T-TACT-A-T-AGG---C---G-AT-AA-C-G--GG-G-AGT-GT-------------GTGA-TT-AAA----CT-A-----TTAT---A-AC--TTT---TT-T----C-A-T--G----C------AT------T---A-TATAG--------AAT-----A-A-A----G--A-T---GG-ACCCC-TGA--CC-TG-A--ACG-AAC--AT-T-AAT-TTC-TA---TAAAA-GATA--AT-A-TA-T-T--TTA-T---
gi|5881                       : CATA-TCC-AAC-TAT-A--GCG-G----TC-ACTC-CA-------CG--T----G-CTT-C-A-GCGA-ATTAATATTTT-AC-----CCTTTC----AAGGTG-AGTA-CGCT---GTC---T---T-T-CT-A-T-A-G---C---GTAT-AA-C-GATGG-G-AGTGGTTAGCAACACACTGGTAA-TTAAAA----AC-ACGAATTTATC--A-AC--TTCTAATC-T----C-A----A----TC-----ATGAAAGAT---A-TATAGTAGAACACAAA-----A-A-AACAGA--T-TCGGGG-ACCCC-TGACTCC-TG-A--AAGTAGCAAAT-T-CATCTTC-TA---CAAAGCGATA--AT-A-TA-T-A--TTA-T---A-T-AG-TTC
gi|5882                       : CATA-TCC-A-C-TATTA--GCG-G----CT-G----CA-------CGC-T----GACTT-C-A-GCG--ATTATTTGTT--A------CCTATA----AA---G-AGTA-C-CT---GTA---T---T-TACT-A-TGAGG---C---G-AT-AA-C----GG-G-AGT-GT-------------GTAA-TT-AAA----CC-A-----TTATATAA-ACT-TTT---TT-T----C-A-T--A----T------AT------T---A-TATAG--------AAA-----A-A-A----G----T---GG-ACCCC-TGA--CC-CGAA--AAG-AGC--AT-T-AAT-TTC--A---CAAAA-GATA--AT-A-TA-T-T--TTA-T---A-TTAG-TTC
gi|5883                       : CATACTCC-AACGTCT-A--GCG-G----TC-A--TTCA-------CG--TT---GACTT-A-A-GCG--ATTA---GTTT-A------CCTATT----AA---G-AGTA-C--T---GTA---T---GGTACT-A-T-AAGGAGC---G-AT-AA-C-G--GG-G--GT-GT-------------GAAA-TT-AAA----CC-A-----TTATA--A-AC--TTT---TT-T----C-A-TG-A----A------AT------T---A-TATAG--------AAA-----A-A-A----GA-T-TTGGGG-ACCCCTTGA--CC-TG-A--AAG-AGC--AT-T-AA--TTC-TA---CAAGT-GA----AT-A-TA---T--TTA-TTTAT-TCAG-TTC
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gi|5886                       : CATA-TCC-AAC-TAT-T--GCG-G----CC-A--T-CA-------CG--TACGTGA-TT-G-A-TCAC-ATTATTTGTTTTA------CCTATT----AA---G-AGTAAC-CT---GTA---T---T--ACT-A-T--GG---C---G-AT-AATC-G--GG-G-AGTCGT-------------GTA--TT-AAA----CT-A-----TTAT---A-ACCCTTT---TT-T----T-G-T--T----TTAAGCAAT------T---A-TATAG--------AGAT----A-A-A----G--T-T---GG-ACCCCCTGA--CC-TG-A--AGA-GGA--ATCT-AA--TTC-TA---GAAAG-AATG--AT-A-TACT-T--TTA-T---TATCAG-TTC
gi|5887                       : CATA-TCC-AAC-TAT-T--GCG-GCGAATC-A--TACATAGAATTCG--T----GAATT-T-G-TCA--ATTATTTGTTT-A------CCTATT----AA---GCAGTA-C-CTTGTATA---T---T-TA-T-A-T-AGG---CC--G-AT-AA-C-G--GG-GTAG--GT-------------GTGA-TT-AGA----CT-A-----TTAT---A-AC---TT---TT-T----C-A-T--T----C------ATG-----T---A-TAACG--------AAT-----A-A-A----G--T-G---AG-A-CCC-TGA--CC-TG-AGCAAG-AGC--AT-TAAAT-TTC-GAACGCAAAA-GATG--AC-G-TA-TAT--TTA-T---T-TCAG-
gi|5888                       : CATA-TCC-AAT-TAT-A--GTG-G----TC-A--T-CT-------CA--T----GAC-----A-GCGTGATTATATGTTT-A------TCTATT----AG---G--GTA-A-CTC--GTA---T---T-GAC--A-T-AGG---C---G-AT-AA-T-G--AG-G-AAT-GT-------------GAAA-TT-AAA----AT-A-----TTAT---A-AC--TTT---GT-C----CTA-T--ACATCT------AT------T---G-CAT----------AAA-----A-A-A----GTTT-T---TC-ACTCC-TGC--CC-TG-A--AAG-AGC--GT-T-CAT-AT--TA---CAGAA-GAAG--AT-A-TA-T-T--ATA-T---T-TTA
gi|5889                       :  ATA-TC--AAC-TAT-T--GCG-G-----C-A--T-CA-------CG--T----GATTT-G-A-TGA--ATTATTTGTTT-A------CCTATC----AA---G-AGTA-C-TT---GTA---T---T-TACT-A-T-AGG---C---G-AT-AA-C-G--AGCG-AGT-GT-------------G--A-TG-AAA----CT-A-----T--T---A-AC--TTT---TT-T----C-A-TC-C----T------CT------G---A-TATTT--------AAA-----A-----------T-A---GG-ACCCC-TGA--CT-TG-A--AAG-AGC--AT-T-ACT-ATC-TA---CAAAA-GATG--AT-A--A-T-T--TTA-T---T-TCAGATTC
gi|5890                       :  ATA-TCC-AAC-TAT-T--GCG-G----TC-A--T-CA-------CG--T----GACTT-A-A-GCG--ATTATTTGTTT-A-------CTATT----AA---G-AGTA-C-CA---GTAACCTGCAT-TACT-A-T-AGG---C---G-AT-AA-C-G--GG-G-AGT-GT-------------GTAA-TT-AAA-----C-A-----TTAT---A-AC--TTT---TT-T----C-A-T--G----C------AT------T---A-TATAG----------A-----A-A-A----G--T-T---GG-ACGCC-
gi|5891                       :  ATA-TCC-AGC-TAT-A--CCC-G----TC-A--T-CA-------CA--T----GACTC-G-G-ATG--ATTATTTGTTT-ATATTTACCTGTTTTAAAA---G-ATTG-C-TTC--GTA---T---T-TACA-A-T-AGG---C---G-AT-AA-T-A--GG-G-TGT-GT-------------GTAA-TT-AAA----CT-A-----TGAT---A-ACTTTTT---TT-T----C-A-T--T----C------GT------T--------------------------------------T-T---GG-ACCCC-GGA--CT-TG-A--AAG-AAC--TT-T-TAT-TTC-TA---CAAAA-GATG--GT-A-TA-T-T--TTA-T---T-TCAG-TT
gi|5892                       :   TA-TCC-AGC-TATCA--GCA-G----TT-G--T-CA-------TG--T----GGCTT-G-T-ATG--ATTATTTGCTT---------------------------------C---GTA---T---T-TACC-A-A-ATG---C---G-AT-AA-C-A--GG-G-TGT-GT-------------GTAA-TT-TAG----CT-A-----TAAT---A-CC--TTT---TC-C----C-C-T--A----T------AT------C---A-TA-AG--------CAA-----A-C-TT---G--T-T---GG-ACTCC-TGA--CT-TG-A--TAG-AAT--AT-T-TAT-TTC-TA---CAAAA-AAAA--AT-A-TA-T-T--TTA-T---A-TCAA-TT
gi|5893                       :   TA-TCCCAGC-TATCA--GCAAG----TT-G--T-CA-------TG--T----GGCTT-GTA-ATG--ATTATTTG-----------CCT---------------------TC---GTA---T---T-TACC-A-T---G---C---G-AT-AA-CCA--GG-G-TGT-GT-------------GTAA-TT-TAG----CCTA-----TAAT---A-CC--TTT---TTCC----C-C-T--A----T------AT------------CATAG--------CAA-----A-CTT----G--T-T---GG-ACTCC-TGA--CT-TG-A--TAG-AAT--AT-T-TAT-TTC-TA---CAAAA-AAAA--AT-A-TA-T-T--TTA-CTA-T-TCAA-TT
gi|5894                       :     -TCC-AACCTA--A--GCG-G----TC-A--T-CA-------CG--T----GACTTCA-A-GCG--ATT-TTTGTTT-A------CCTATT----AAA--G-AGTA-C-CT---GTA---T---T-TACTTA-T-AGG---C---G-AT-AA-CCG--GG-G-AGT-GT-------------GTAA-TT-AAA----CC-A-----TTAT---A-AC--TTT---TT-T----C-A-T--A----T------AT------T-----TATAG--------AAA-----A-A-A----G--T-T---GGAACCCC-TGA--C---G-A--AAG-AGC--AT-T-AAT-TTC-TA---CAAAT-GATA--ATCA-TA-T-T--TTA-T---T-TCAG-TTC
gi|5895                       :       CC-AAC-TAT-A--GCG-G----TC-AG-T-CAA------CGAAT-----ACTT-A-AAGCG--ATTAATTGTTT-AAA----CCTATT----AA---G-AGTT-C-CTC--GTA---T---TCTACT-AAT-AGG---CAAAG-AT-AA-C-GTGGG-G-AGT-GT-------------GTAAATT-AAAAACATC-T-----TTAT---A-AC--TTT---TT-CATGGC-A-TTAA----T------AT------T---A--GTAG--------AAA-----ATC-A----G--T-T---GG-ACCCC-TAA--CCCTG-AC-AAG-AGC--AT-T-AAT-TTCCTA---CAAAA-GATG--AT-A-TA-T-T--TTA-T---T-CCAG-TTC
gi|5896                       :                                                                                                                                               ---C---G-ATTAA-C-G--GG-G-AGT-AT-------------GTAA-TT-AAA----CC-A-----TTAT---A-AC--TTT---T--T----C-A-T--A----T------AT------T---A-TATAG--------AAA-----A-A-A----G--T-T---GG-ACCCC-TGA--CC-TG-A--AAG-AGC--AA-T-AAT-TTC-TA---CAAAA-GATG--AT-A-TA-T-T--TTA-T---T-TCAG-TTC
gi|5897                       :                                                                                                                                                                                                                             C--TTG---TT-T----A-A----G----T------AT------T---A-TATAG--------AAA-----A-G-T----G--TAG---GG-ACCCC-TGC--CC-TG-A--AAG-AGC--AT-C-AAT-TTT-TA---CAAAA-GATG--AT-C-TA-T-T--TTA-T---T-TCAG-
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gi|5899                       :                                                                                                                                                                                                                                                                                               -----A-A-A----G--T-T---GG-ACCCC-TGA--CC-TG-A--AAG-AGC--AT-T-ATT-TTC-TA---CAAAA-GATG--AT-A-TA-T-T--GTA-T---T-TCAG-TTC


blockSeqs                     :     C   C   G   ATA    A CGAA  C CT T  TAGAATT  AA ACGT     GT  A   TG           ATATTTA       TTAA  GGT C    A G  TGT   ACC GCA G    T A G   GAG AAA T  T  T C AT  C T   G  TAGCAACACACTG    T  A   AACA  T CGAAT    ATA G  TT   TAA  C ATGG T C TTTAAGCA        GAAAGATA         TAGAACAC   TATAT AAACAG   TT A CGG  A     T   CT  T  A GC   T   AA  C A   C   C  ACG     C    GA  C T  C A TG   G TTA A    A
blockSeqs                     :     .   .   C   TA     . .     . G  A  A        C  T        CA  .   A            AAA           .     A   .    . .  C     .   A   C    . . .   .   C   .  .  . C TG  . .   C  .                A  .   .     . .        C   .  CC   .    . .    . . ACATCT          TTTAA            .          T     CTT      TT . TGG  .     C   .   C  . C    .   .   . .   .   .  .       .    .   . .  . . .    . TA  .    .
blockSeqs                     :     .   .   .   CA     . .     . .  .  .        .  .        A   .   C            AC            .     .   .    . .  C     .   .   .    . . .   .   .   .  .  . . .   . .   .  .                .  .   .     . .        A   .  TT   .    . .    . . TAAT            TAT              .          .     CTT      A  . .    .     .   .   .  . .    .   .   . .   .   .  .       .    .   . .  . . .    . .   .    .
blockSeqs                     :     .   .   .   CA     . .     . .  .  .        .  .        G   .   .            TA            .     .   .    . .  C     .   .   .    . . .   .   .   .  .  . . .   . .   .  .                .  .   .     . .        .   .  T    .    . .    . . TAT             GTA              .          .     TCA      .  . .    .     .   .   .  . .    .   .   . .   .   .  .       .    .   . .  . . .    . .   .    .
blockSeqs                     :     .   .   .   A      . .     . .  .  .        .  .        G   .   .            A             .     .   .    . .  C     .   .   .    . . .   .   .   .  .  . . .   . .   .  .                .  .   .     . .        .   .  .    .    . .    . . ATC             TT               .          .     AA       .  . .    .     .   .   .  . .    .   .   . .   .   .  .       .    .   . .  . . .    . .   .    .
blockSeqs                     :     .   .   .   T      . .     . .  .  .        .  .        A   .   .            A             .     .   .    . .  .     .   .   .    . . .   .   .   .  .  . . .   . .   .  .                .  .   .     . .        .   .  .    .    . .    . . GAA             TA               .          .     AA       .  . .    .     .   .   .  . .    .   .   . .   .   .  .       .    .   . .  . . .    . .   .    .
blockSeqs                     :     .   .   .   T      . .     . .  .  .        .  .        C   .   .            A             .     .   .    . .  .     .   .   .    . . .   .   .   .  .  . . .   . .   .  .                .  .   .     . .        .   .  .    .    . .    . . CCT             TA               .          .     AA       .  . .    .     .   .   .  . .    .   .   . .   .   .  .       .    .   . .  . . .    . .   .    .
blockSeqs                     :     .   .   .   A      . .     . .  .  .        .  .        C   .   .            A             .     .   .    . .  .     .   .   .    . . .   .   .   .  .  . . .   . .   .  .                .  .   .     . .        .   .  .    .    . .    . . GT              TA               .          .     AA       .  . .    .     .   .   .  . .    .   .   . .   .   .  .       .    .   . .  . . .    . .   .    .
blockSeqs                     :     .   .   .   A      . .     . .  .  .        .  .        A   .   .            A             .     .   .    . .  .     .   .   .    . . .   .   .   .  .  . . .   . .   .  .                .  .   .     . .        .   .  .    .    . .    . . GC              TA               .          .     AA       .  . .    .     .   .   .  . .    .   .   . .   .   .  .       .    .   . .  . . .    . .   .    .
blockSeqs                     :     .   .   .   A      . .     . .  .  .        .  .        G   .   .            A             .     .   .    . .  .     .   .   .    . . .   .   .   .  .  . . .   . .   .  .                .  .   .     . .        .   .  .    .    . .    . . AT              TG               .          .     AA       .  . .    .     .   .   .  . .    .   .   . .   .   .  .       .    .   . .  . . .    . .   .    .
blockSeqs                     :     .   .   .   A      . .     . .  .  .        .  .        A   .   .            A             .     .   .    . .  .     .   .   .    . . .   .   .   .  .  . . .   . .   .  .                .  .   .     . .        .   .  .    .    . .    . . AT              GA               .          .     AA       .  . .    .     .   .   .  . .    .   .   . .   .   .  .       .    .   . .  . . .    . .   .    .
blockSeqs                     :     .   .   .   T      . .     . .  .  .        .  .        G   .   .            A             .     .   .    . .  .     .   .   .    . . .   .   .   .  .  . . .   . .   .  .                .  .   .     . .        .   .  .    .    . .    . . AT              TA               .          .     AA       .  . .    .     .   .   .  . .    .   .   . .   .   .  .       .    .   . .  . . .    . .   .    .
blockSeqs                     :     .   .   .   T      . .     . .  .  .        .  .        T   .   .            A             .     .   .    . .  .     .   .   .    . . .   .   .   .  .  . . .   . .   .  .                .  .   .     . .        .   .  .    .    . .    . . TC              CA               .          .     AA       .  . .    .     .   .   .  . .    .   .   . .   .   .  .       .    .   . .  . . .    . .   .    .
blockSeqs                     :     .   .   .   A      . .     . .  .  .        .  .        G   .   .            A             .     .   .    . .  .     .   .   .    . . .   .   .   .  .  . . .   . .   .  .                .  .   .     . .        .   .  .    .    . .    . . GC              TA               .          .     AA       .  . .    .     .   .   .  . .    .   .   . .   .   .  .       .    .   . .  . . .    . .   .    .
blockSeqs                     :     .   .   .   T      . .     . .  .  .        .  .        A   .   .            A             .     .   .    . .  .     .   .   .    . . .   .   .   .  .  . . .   . .   .  .                .  .   .     . .        .   .  .    .    . .    . . TC              TA               .          .     AA       .  . .    .     .   .   .  . .    .   .   . .   .   .  .       .    .   . .  . . .    . .   .    .
blockSeqs                     :     .   .   .   T      . .     . .  .  .        .  .        G   .   .            .             .     .   .    . .  .     .   .   .    . . .   .   .   .  .  . . .   . .   .  .                .  .   .     . .        .   .  .    .    . .    . . AT              TA               .          .     AA       .  . .    .     .   .   .  . .    .   .   . .   .   .  .       .    .   . .  . . .    . .   .    .
blockSeqs                     :     .   .   .   A      . .     . .  .  .        .  .        G   .   .            .             .     .   .    . .  .     .   .   .    . . .   .   .   .  .  . . .   . .   .  .                .  .   .     . .        .   .  .    .    . .    . . AT              A                .          .     GT       .  . .    .     .   .   .  . .    .   .   . .   .   .  .       .    .   . .  . . .    . .   .    .
blockSeqs                     :     .   .   .   A      . .     . .  .  .        .  .        A   .   .            .             .     .   .    . .  .     .   .   .    . . .   .   .   .  .  . . .   . .   .  .                .  .   .     . .        .   .  .    .    . .    . . AT              T                .          .     AA       .  . .    .     .   .   .  . .    .   .   . .   .   .  .       .    .   . .  . . .    . .   .    .
blockSeqs                     :         .   .   A      . .     . .  .  .        .  .        .   .   .            .                                                            .   .   .  .  . . .   . .   .  .                .  .   .     . .        .   .  .    .    . .    . . AT              T                .          .     AA       .  . .    .     .   .   .  . .    .   .   . .   .   .  .       .    .   . .  . . .    . .   .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                              .    .    . .    . . GT              .                .          .     A        .  . .    .     .   .   .  . .    .   .   . .   .   .  .       .    .   . .  . . .    . .   .     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                    .          .     .        .  . .    .     .   .   .  . .    .   .   . .   .   .  .       .    .   . .  . . .    . .         
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blockSeqCons                  : 
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Reference ( family-722 )      : CATA-TCC-AAC-TAT-A--GCG-G----TC-A--T-CA-------CG--T----GACTT-G-A-GCG--ATTATTTGTTT-A------CCTATT----AA---G-AGTA-C-CT---GTA---T---T-TACT-A-T-AGG---C---G-AT-AA-C-G--GG-G-AGT-GT-------------GTAA-TT-AAA----CC-A-----TTAT---A-AC--TTT---TT-T----C-A-T--A----T------AT------T---A-TATAG--------AAA-----A-A-A----G--T-T---GG-ACCCC-TGA--CC-TG-A--AAG-AGC--AT-T-AAT-TTC-TA---CAAAA-GATG--AT-A-TA-T-T--TTA-T---T-TCAG-TTC
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gi|5890                       :  ATA-TCC-AAC-TAT-T--GCG-G----TC-A--T-CA-------CG--T----GACTT-A-A-GCG--ATTATTTGTTT-A-------CTATT----AA---G-AGTA-C-CA---GTAACCTGCAT-TACT-A-T-AGG---C---G-AT-AA-C-G--GG-G-AGT-GT-------------GTAA-TT-AAA-----C-A-----TTAT---A-AC--TTT---TT-T----C-A-T--G----C------AT------T---A-TATAG----------A-----A-A-A----G--T-T---GG-ACGCC-
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gi|5893                       :   TA-TCCCAGC-TATCA--GCAAG----TT-G--T-CA-------TG--T----GGCTT-GTA-ATG--ATTATTTG-----------CCT---------------------TC---GTA---T---T-TACC-A-T---G---C---G-AT-AA-CCA--GG-G-TGT-GT-------------GTAA-TT-TAG----CCTA-----TAAT---A-CC--TTT---TTCC----C-C-T--A----T------AT------------CATAG--------CAA-----A-CTT----G--T-T---GG-ACTCC-TGA--CT-TG-A--TAG-AAT--AT-T-TAT-TTC-TA---CAAAA-AAAA--AT-A-TA-T-T--TTA-CTA-T-TCAA-TT
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gi|5897                       :                                                                                                                                                                                                                             C--TTG---TT-T----A-A----G----T------AT------T---A-TATAG--------AAA-----A-G-T----G--TAG---GG-ACCCC-TGC--CC-TG-A--AAG-AGC--AT-C-AAT-TTT-TA---CAAAA-GATG--AT-C-TA-T-T--TTA-T---T-TCAG-
gi|5898                       :                                                                                                                                                                                                                                                                               tttAG--------AAT-----A-A-A----G--T-T---GA-ACCCC-TGA--CC-TG-A--AAG-AGA--TT-T-AAT-TGC-TA---CAAAA-GATG--AA-A-TA-T-T--TTA-T---T-TAAG-TTC
gi|5899                       :                                                                                                                                                                                                                                                                                               -----A-A-A----G--T-T---GG-ACCCC-TGA--CC-TG-A--AAG-AGC--AT-T-ATT-TTC-TA---CAAAA-GATG--AT-A-TA-T-T--GTA-T---T-TCAG-TTC