lowQualScore : 2 1111111111111111 1 2222222222222222 3333333333333
lowQualScore : 7 7 22 3333 1 1 1 8888 1 4444 2222222222222222 3 1 1 1 1 1 3 1 22 1 1 22 1 22 1 6 1 1 3 3333 8888888888888888 1 888 1 3 7777 1 1 55 1 555 2222222222222 2 2 2 55 2 4 2 2 5 2
lowQualScore : . . .. .... . . . .... . .... ................ . . . . . . . . .. . . .. . .. . . . . . .... ................ . ... . . .... . . .. . ... ............. . . . .. . . . . . .
lowQualScore : 5 1 44 9999 8 8 8 4444 8 4444 1111111111111111 6 8 7 7 7 7 2 6 22 6 6 22 6 22 7 4 7 7 1 9999 6666666666666666 8 666 8 6 4444 9 9 22 9 222 9999999999999 2 2 2 33 2 4 4 5 0 5
consensus : CGTCC-AAAAATCTTC-TATA----TCGC-TT-A-AACA-CT-AATGAA-CGGCC-C--A---C------------A-TTACAA-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTG-TTT-A--C-G--GAAT-TCAT-G-GGTCTC----T-------T-T------G-G---T-G-TTTTTC----C-G-AT--AT-C---TACACAAAA-------------TTTTATCG-C-T-GC--TC-T-C-TG-C-T-CCACC
Reference ( gi|109343 ) : CGTCCCAAAAATATTT-TATA----TCGC-TT-A-AACA-CC-AATGAA-CGGCC-C--A---T------------A-TTAAAA-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTG-TTT-A--C-G--GAAT-TCGT-G-GGTTTC----T-------T-T------G-G---T-G-TTTTTC----C-G-AT--AT-C---TACACAAAAT------------TTTTATCG-C-T-GC--TC-T-C-TG-C-T-CCACC
gi|109347 : CGTCC-GAAAATATTT-TGTG----TCAC-TT-A-AACA-CT-AATGAA-CGGCT-C--A---C------------A-TTACAG-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTG-TTT-A--A-G--GAAT-TTAT-G-GGTCTC----T-------T-T------ACG---T-G-TTTTTC----C-G-AT--GT-C---TAAACAAAA-------------TTTTATTA-C-T-GC--TC-T-C-TG-C-T-CCACC
gi|109346 : CGTCC-AAAAATCTTC-TATA----TCAT-TT-A-AACA-AT-TATAAA-CGGCC-A--A---C------------A-TTACAA-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTG-CTT-A--C-G--GAAT-TCAT-G-GGTTTC----T-------T-T------G-G---G-T-TTTTTC----C-A-AT--AT-C---TACACAAAA-------------GTTTATCG-C-T-GC--TC-T-T-TG-C-T-CCACC
gi|109344 : CGTCC-AAAAATCTTC-TATA----TCGC-TT-A-A-CA-CT-AATGAA-CGGCC-A--A---T------------A-TTTACA-TG-T-TTT-CCCCG-A--CTG-CTT-A--C-G--GAAT-TCAT-G-GGTCTC----T-------G-T------G-GG--T-G-TTTTTC----C-G-AT--AT-C---TACACAAAAA------------GTTTATCG-C-T-GC--TC-T-C-TG-C-T-
gi|109349 : CGTCC--AAAATTTTT-TATA----TCGC-TGAA-AACA--T-AATGAA-CGGCC-C--A---T------------A-TTACCA-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTG-TTT-A--C-G--GAAT-TCAT-G-GGTTTC----T-------T-TTTCTTGG-G---T-G-TTTTTC----C-G--T--AT-C---TACACAAAA-------------TTTTATCG-C-T-GC--TC-T-C-
gi|109350 : CGTCC-AAAAATCTTT-TATA----TCGC-C--A-AACA-AG-AATGA--CG-CC-C--A---C------------A-TTACAA-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTG--TT-A--C-G--GAAT-TCATGG-GGTTTC----T-------T-TG-----G-G---T-G-TTTTTC----CGG-AT--AT-C---TACACAAAAA------------TTTTA-CA-C-T-GC--TC-TCC-TG-CAT-CCACC
gi|109354 : CGTCC-AAAAATATTT-TATA----TCG--TT-ACAACA-CT-AATGAA-CGGCC-CA-A---C------------AGTTACAA-TG-T-TT---CC-G-A--ATG-GTT----C-G--GAAT-TCAT-G-GGTCTA----T-------T-TG-----G-G---T-GTTTTTTC----C-G-AT--AT-C---GACACAAA--------------TTTTATCG-CTT-GC--TC-T-C-TG-CTT-CCGCC
gi|109351 : CGTCC-AAAAATATTCCTATA----TCGC-AT-A-AAC---T-AATGAA--GGCCAT--A---T------------A-TTAAAA-TG-T-TTT-CCC-A-A--CTG-ATT-ACGC-G--AAAT-TCAT-G-GGTCTC----TG------T-G------G-G---T-G-TTTTCC----C-G-AC--ATAC---TA-ACAACAA------------TTTTATCG-C---GT--TC-T-C-TG-C-T-CCACC
gi|109355 : CGTCC--AAAATCTTC-TACA----TCGC-TT-T-AACA-CC-AGTGAA-CGGCC-C--A---C------------A-CTACAA-TG-T-TT---CG-G-A--CTC-TAT-A--TAG--AAAT-TCAT-GTGG--TC----T-------G-T------G-A---T-A-TTTTCC----C-G-AT--AT-C---TACACAAAA-------------TTGTATCGCC-T-GC--TC-T---TG-C-TCCCACC
gi|109353 : CGTCC-AAAAATCTTC-TATA----TCGC-TT-T-AACA-CT-AATAAA-GGGCC-C--A---C------------A-TTACAA-TG-A-TTT-CCC-G-A--CTG-TTT-A--G-G--GAAT-CCAT-G-GGTCTC----TG------T-G------G-G---T-GTTTTTTC----C-G-AT--AT-N---T
gi|109345 : CGTCC-AAAAATCTTC-TATA----CTGC----A-AACA-CT-AATGAA-CG--C-C--AAGAT------------A-TTACAA-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTT-TTA-A--C-G--AATT-TCAT-G-G--TTCATCAT-------G-T------G-G---T-G--TTTTC----C-G-AT--AT-CT--TACACAAAGA------------GTTTATCG---T-GCA-TCTT-C-TG-C---CCACC
gi|109352 : CGTCC-AAAAATATTC-TATA----TCGC-AT-A-AACA-CT-AATGAA-AGGCC-CATA---T------------A-TTACAA-TG-T-TTT-CCC-A-A--CTG-ATT-A--C-G--GA
gi|109356 : CGTCC-AAAAATCTTC-TACA----TCGC-TT-T-AACA-CC-AGTGAA-CGGCC-C--A---C------------A-CTACAA-TG-T-TTT--CG-G-A--CTG-CTT-A--T-A--GAAT-TCAT-T-GG
gi|109358 : CGTCC-AAAAATCTTC-TACA----TCGC-TT-A-AACA-CT-GATGAA-CGACC-C--A---C------------A-TTACAA-TG-T-TTT-CTC-GAA--CT--TTT-A--C-A--GTAT-TCAT-A-AGT
gi|109359 : CGTCC--AAAATATTT-CATAATTCTTGC-T--A-AACA-ATGAATGAG-CGGCC-C--A---T------------ATTTACAA-GGAT-TTC-CCC-G-A--CTG-GTT-A--C-AGCGAAT-TCAT-A-GGTTTC----T-------T-TTGG---G-A---T-G-TTTATCACCAC-GAAT--AT-G---T-TACAAGATGACCAACACACATTTTATCG-C-T-GCAGTC-T-CTTG-C-C-TCAc
gi|109362 : GTCC--AAAATCCTC-CATA----TCAC-TT-A-AACA-TT-AAAGAA-CGGCCAC--A---TTACAATCCCGGGA-TTACAA-TG-T-TTT-ACC-G-A--CTG-CTT-A--C-G--GAAT-TCAT-G-GGTCTT----T-------G-T------G-GG--T-G-TTTTTC----C-G-AT--AT-C---TACACAAAAT------------TTT-ATCG-T-T-GC--TC-T-C-TG-C-T-CCACC
gi|109348 : CCAGAAA-ATTT-CATA----TCAC-TT-A-AACAGCT-AATGAA-CGGCC-C--A---C------------A-TTTACA-TG-T-TTT-CCT-G-A--TTG-TTT-A--C-G--GAAT-TCAT-G-GGTCTC----TG------T-G------G-G---T-G-TTTTTC----T-G-AT--AT-C---TACACAAAAT------------TTATA-CG-C-T-GC--TC-TGC-TG-C-T-CCACC
gi|109361 : catCCAAAACTCTTT-T-TA----TCGC-TT-A-AGAA-CT-AATGAA-C------------T------------A-TTA----TG-TGTTT-CCC-G-A--CTA-T------------------------G-------------------------G-G---T-G-TTTTTC----C-T-TT--AT-C---TACAC-AAAT------------TCTTACCG-C-T-GC--TC-T-
gi|109364 : catCAACAATATTC-TATA----CCAC-TT-G-AACA-CT-AATGAA-CGGTC-C--A---T------------A-TTACAA-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTG-TTT-T--C-G--GAAT-TCAT-G-GGTCTC----TG------T-G------G-G---T-G-TGTTTC----C-G-AT--AT-C---TACACAAAA-------------TTTTATCG-C-T-GC--TC-T-A-TG-C-T-CCACC
gi|109357 : CAAAAAT-TTT-TATA----TCAC-TT-A-AACA-CT-AAGAGA-CGGCT-C--A---C------------A-TTACAA-TG-T-TTTGCCA-G-A--TTGATTTAA--C-G--GAAT-TCAT-G-GGTCTC------------T-G------G-G---TAG-TTTACCCGG-C-G-ATTAAT-C----ACAGAAAACA-----------TTGTATCT-C-TAGC--TC-T-C-TGCC-T-CCA
gi|109360 : cgttCAAAAATCTTC-TATA----TCGCTTT-A-AACT-TT-AATGAACCGGCT-C--AT--T------------A-TTACAATTG-T-TTT-TTCAG-AGCTTG-TTT-A----G--GAATGTCAC-A-TATCTC----CTG-----T-T------G-GGTTT-T-TTTTTA----C-A-ATAGAT-C---T-TACAAA
gi|109363 : cgttAGAAATATTC-TATA------GC-TT-A-A-CA-C--AGT-AA-CGGCC----A---T------------A-GTTACA-TT-T-TTT-TCC-G-A--CTG-TTC-A--C-G--G-AT-TCAT-G-GG--TC----T-------TGT------G-G---T-G-TATTT-----C-G-AT---T-CTTATACGCAAA--------------TTTTA--G-C-T-GC--TC-T-C-TG-C-T-CCA
gi|109365 : gtcaTTC-TCTA----TCAC-TT-A-AACA-CT-AATTAA-TGGCC-C--A---T------------A-TTACAG-TG-T-TTT-TCC-G-A--CTG-TTT-A--C-G--GAAT-TCAT-G-GGTCTC----TAGATCTGT-G------G-G---T-G-TTTTCC----T-G-AT--AT-C---TACACAAAA-------------TTTTATCG-C-T-GC--TC-T-C-TG-C-G-CCACC
gi|109366 : tcAA-TG-T-TTT-TCA-G-A--CTG-TTT-A--C-G--GAAT-TCAC-A-TATCTC----TG------T-T------G-G---T-G-TTTTT
gi|109367 : ac-CCC-G-A--CTG-TTT-A--C-G--GAAT-TCAT-G-GGTTTT----T-------T-G------G-A---T-G-TTTTTC----C-G-AT--AT-C---TACAAAAAA-------------TTTCATCG-A-T-GC--TC-T-C-TG-C-T-CCACCtttttacaatagatctta
gi|109368 : -G-A--CTG-TTT-A--G-G--GAAT-CCAG-G-GGTCTC----T-------G-T------G-GG--T-G-TTTTTC----C-G-AT--AT-C---TAC
Alignments
lowQualScore : 111111111 222222222222222
lowQualScore : 1 1 0 1 3333 1 1 1 1 1 1 6666666 444 333333333 1 1 1 1 3 1 1 22 1 1 22 1 22 1 1 1 1 1 999999999999999 1 444 1 3 6666 1 1 44 3 1 6666666 3 1 3 777 2 2 2 2 2 55 2 4 2 2 4 2
lowQualScore : . . . . .... . . . . . . ....... ... ......... . . . . . . . .. . . .. . .. . . . . . ............... . ... . . .... . . .. . . ....... . . . ... . . . . . .. . . . . . .
lowQualScore : 8 0 8 7 7777 7 7 7 7 7 7 4444444 888 999999999 7 7 7 7 2 5 5 11 5 5 11 5 11 6 6 6 7 7 444444444444444 7 888 7 5 7777 7 7 88 5 7 2222222 8 9 8 999 0 1 1 1 1 00 1 2 2 4 7 4
consensus : CGTCC-AAAAATCTTC-TATA----TCGC-TTA-AA-CA-CT-AATGAA-CGGCC----C--A---CA---------TT-ACAA-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTG-TTT-A--C-GG--AAT-TCAT-G-GGTC-TC-T-------TT------G-G---T-G-TTTTTC----C-G-AT--AT-C-TACA-------C-A-A-A---A-TTTTAT-CG-C-T-GC--TC-T-C-TG-C-T-CCACC
Reference ( family-698 ) : CGTCC-AAAAATCTTC-TATA----TCGC-TTA-AA-CA-CT-AATGAA-CGGCC----C--A---CA---------TT-ACAA-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTG-TTT-A--C-GG--AAT-TCAT-G-GGTC-TC-T-------TT------G-G---T-G-TTTTTC----C-G-AT--AT-C-TACA-------C-A-A-A---A-TTTTAT-CG-C-T-GC--TC-T-C-TG-C-T-CCACC
gi|109343 : CGTCCCAAAAATATTT-TATA----TCGC-TTA-AA-CA-CC-AATGAA-CGGCC----C--A---TA---------TT-AAAA-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTG-TTT-A--C-GG--AAT-TCGT-G-GGTT-TC-T-------TT------G-G---T-G-TTTTTC----C-G-AT--AT-C-TACA-------C-A-A-A---ATTTTTAT-CG-C-T-GC--TC-T-C-TG-C-T-CCACC
gi|109344 : CGTCC-AAAAATCTTC-TATA----TCGC-TT--AA-CA-CT-AATGAA-CGGCC----A--A---TAT--------TT-AC-A-TG-T-TTTCCCC-G-A--CTG-CTT-A--C-GG--AAT-TCAT-G-GGTC-TC-TG------TG------G-G---T-G-TTTTTC----C-G-AT--AT-C-TACA-------CAA-A-A---A-GTTTAT-CG-C-T-GC--TC-T-C-TG-C-T-
gi|109345 : CGTCC-AAAAATCTTC-TATA----CTGC---A-AA-CA-CT-AATGAA-CG--C----C--AAGATA---------TT-ACAA-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTT-TTA-A--C-GA--ATT-TCAT-G-GTTCATCAT-------GT------G-G---T-G--TTTTC----C-G-AT--AT-CTTACA-------C-A-A-AG--A-GTTTAT-CG---T-GCA-TCTT-C-TG-C---CCACC
gi|109346 : CGTCC-AAAAATCTTC-TATA----TCAT-TTA-AA-CA-AT-TATAAA-CGGCC----A--A---CA---------TT-ACAA-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTG-CTT-A--C-GG--AAT-TCAT-G-GGTT-TC-T-------TT------G-G---G-T-TTTTTC----C-A-AT--AT-C-TACA-------C-A-A-A---A-GTTTAT-CG-C-T-GC--TC-T-T-TG-C-T-CCACC
gi|109347 : CGTCC-GAAAATATTT-TGTG----TCAC-TTA-AA-CA-CT-AATGAA-CGGCT----C--A---CA---------TT-ACAG-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTG-TTT-A--A-GG--AAT-TTAT-G-GGTC-TC-T-------TT------ACG---T-G-TTTTTC----C-G-AT--GT-C-TAAA-------C-A-A-A---A-TTTTAT-TA-C-T-GC--TC-T-C-TG-C-T-CCACC
gi|109348 : CATCC-AGAAAATTTC--ATA----TCAC-TTA-AA-CAGCT-AATGAA-CGGCC----C--A---CAT--------TT-AC-A-TG-T-TTT-CCT-G-A--TTG-TTT-A--C-GG--AAT-TCAT-G-GGTC-TC-TG------TG------G-G---T-G-TTTTTC----T-G-AT--AT-C-TACA-------C-A-A-A---A--TTTATACG-C-T-GC--TC-TGC-TG-C-T-CCACC
gi|109349 : CGTCC-AAAA-TTTTT-TATA----TCGC-TGA-AAACA--T-AATGAA-CGGCC----C--A---TA---------TT-ACCA-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTG-TTT-A--C-GG--AAT-TCAT-G-GGTT-TC-T-------TTTTCTTGG-G---T-G-TTTTTC----C-G--T--AT-C-TACA-------C-A-A-A---A-TTTTAT-CG-C-T-GC--TC-T-C-
gi|109350 : CGTCC-AAAAATCTTT-TATA----TCGC-C-A-AA-CA-AG-AATGA--CG-CC----C--A---CA---------TT-ACAA-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTG--TT-A--C-GG--AAT-TCATGG-GGTT-TC-T-------TTG-----G-G---T-G-TTTTTC----CGG-AT--AT-C-TACA-------CAA-A-A---A-TTTTA--CA-C-T-GC--TC-TCC-TG-CAT-CCACC
gi|109351 : CGTCC-AAAAATATTCCTATA----TCGC-ATA-AA-C---T-AATGAA--GGCCA---T--A---TA---------TT-AAAA-TG-T-TTT-CCC-A-A--CTG-ATT-ACGC-GA--AAT-TCAT-G-GGTC-TC-TG------TG------G-G---T-G-TTTTCC----C-G-AC--ATAC-TA-A-------C-A-ACA---A-TTTTAT-CG-C---GT--TC-T-C-TG-C-T-CCACC
gi|109352 : CGTCC-AAAAATATTC-TATA----TCGC-ATA-AA-CA-CT-AATGAA-AGGCC----CATA---TA---------TT-ACAA-TG-T-TTT-CCC-A-A--CTG-ATT-A--C-GG--A
gi|109353 : CGTCC-AAAAATCTTC-TATA----TCGC-TTT-AA-CA-CT-AATAAA-GGGCC----C--A---CA---------TT-ACAA-TG-A-TTT-CCC-G-A--CTG-TTT-A--G-GG--AAT-CCAT-G-GGTC-TC-TG------TG------G-G---T-GTTTTTTC----C-G-AT--AT-N-T
gi|109354 : CGTCC-AAAAATATTT-TATA----TCG--TTACAA-CA-CT-AATGAA-CGGCC----CA-A---CAG--------TT-ACAA-TG-T-TT---CC-G-A--ATG-GTT----C-GG--AAT-TCAT-G-GGTC-TA-T-------TTG-----G-G---T-GTTTTTTC----C-G-AT--AT-C-GACA-------C---A-A---A-TTTTAT-CG-CTT-GC--TC-T-C-TG-CTT-CCGCC
gi|109355 : CGTCC-AAAA-TCTTC-TACA----TCGC-TTT-AA-CA-CC-AGTGAA-CGGCC----C--A---CA---------CT-ACAA-TG-T-TT---CG-G-A--CTC-TAT-A--TAGA--AAT-TCAT-GTGG---TC-T-------GT------G-A---T-A-TTTTCC----C-G-AT--AT-C-TACA-------C-A-A-A---A-TTGTAT-CGCC-T-GC--TC-T---TG-C-TCCCACC
gi|109356 : CGTCC-AAAAATCTTC-TACA----TCGC-TTT-AA-CA-CC-AGTGAA-CGGCC----C--A---CA---------CT-ACAA-TG-T-TTT--CG-G-A--CTG-CTT-A--T-AG--AAT-TCAT-T-GG
gi|109357 : CGTTC-AAAAATTTT--TATA----TCAC-TTA-AA-CA-CT-AAGAGA-CGGCT----C--A---CA---------TT-ACAA-TG-T-TTTGCCA-G-A--TTGATTTAA--C-GG--AAT-TCAT-G-GGTC-TC---------TG------G-G---TAG-TTTACCCGG-C-G-ATTAAT-C--ACA-------G-A-A-AAC-A-TTGTAT-CT-C-TAGC--TC-T-C-TGCC-T-CCA
gi|109358 : CGTCC-AAAAATCTTC-TACA----TCGC-TTA-AA-CA-CT-GATGAA-CGACC----C--A---CA---------TT-ACAA-TG-T-TTT-CTC-GAA--CT--TTT-A--C-AG--TAT-TCAT-A-AGTC-
gi|109359 : CGTCC-AAAA-TATTT-CATAATTCTTGC-T-A-AA-CA-ATGAATGAG-CGGCC----C--A---TA---------TTTACAA-GGAT-TTC-CCC-G-A--CTG-GTT-A--C-AGCGAAT-TCAT-A-GGTT-TC-T-------TTTGG---G-A---T-G-TTTATCACCAC-GAAT--ATGT-TACAAGATGACC-A-ACACACA-TTTTAT-CG-C-T-GCAGTC-T-CTTG-C-C-TCA
gi|109360 : CGTTC-AAAAATCTTC-TATA----TCGCTTTA-AA-CT-TT-AATGAACCGGCT----C--AT--TA---------TT-ACAATTG-T-TTT-TTCAG-AGCTTG-TTT-A----GG--AATGTCAC-A-TATC-TC-CTG-----TT------G-GGTTT-T-TTTTTA----C-A-ATAGAT-C-T-TA-------C-A-A-A---
gi|109361 : CATCC-AAAACTCTTT-T-TA----TCGC-TTA-AG-AA-CT-AATGAA-C---------------TA---------TT----A-TG-TGTTT-CCC-G-A--CT---------------------AT-G-------------------------G-G---T-G-TTTTTC----C-T-TT--AT-C-TACA-------C-A-A-A---T-TCTTAC-CG-C-T-GC--TC-T-
gi|109362 : GTCC-AAAA-TCCTC-CATA----TCAC-TTA-AA-CA-TT-AAAGAA-CGGCCACATT--A---CAATCCCGGGATT-ACAA-TG-T-TTT-ACC-G-A--CTG-CTT-A--C-GG--AAT-TCAT-G-GGTC-TT-T-------GT------G-GG--T-G-TTTTTC----C-G-AT--AT-C-TACA-------C-A-A-A---A-TTTTAT-CG-T-T-GC--TC-T-C-TG-C-T-CCACC
gi|109363 : GTCA-AGAAATATTC-TATA------GC-TTA-A--CA-C--AGT-AA-CGGCC-------A---TAG--------TT-ACA--TT-T-TTT-TCC-G-A--CTG-TTC-A--C-GG---AT-TCAT-G-GGTC-T--T-------GT------G-G---T-G-TATTT-----C-G-AT--TC-T-TATA-------C-GCA-A---A-TTTTA---G-C-T-GC--TC-T-C-TG-C-T-CCA
gi|109364 : C-AACAATATTC-TATA----CCAC-TTG-AA-CA-CT-AATGAA-CGGTC----C--A---TA---------TT-ACAA-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTG-TTT-T--C-GG--AAT-TCAT-G-GGTC-TC-TG------TG------G-G---T-G-TGTTTC----C-G-AT--AT-C-TACA-------C-A-A-A---A-TTTTAT-CG-C-T-GC--TC-T-A-TG-C-T-CCACC
gi|109365 : TCTTC-TCTA----TCAC-TTA-AA-CA-CT-AATTAA-TGGCC----C--A---TA---------TT-ACAG-TG-T-TTT-TCC-G-A--CTG-TTT-A--C-GG--AAT-TCAT-G-GGTC-TC-TAGATCTGTG------G-G---T-G-TTTTCC----T-G-AT--AT-C-TACA-------C-A-A-A---A-TTTTAT-CG-C-T-GC--TC-T-C-TG-C-G-CCACC
gi|109366 : -ACAA-TG-T-TTT-TCA-G-A--CTG-TTT-A--C-GG--AAT-TCAC-A-TATC-TC-TG------TT------G-G---T-G-TTTTT----------T--TT-T-TACA-------A-T-A-G---A-TCTTA
gi|109367 : -CCC-G-A--CTG-TTT-A--C-GG--AAT-TCAT-G-GGTT-TT-T-------TG------G-A---T-G-TTTTTC----C-G-AT--AT-C-TACA-------A-A-A-A---A-TTTCAT-CG-A-T-GC--TC-T-C-TG-C-T-CCACC
gi|109368 : -G-A--CTG-TTT-A--G-GG--AAT-CCAG-G-GGTC-TC-TG------TG------G-G---T-G-TTTTTC----C-G-AT--AT-C-TAC
Alignments
lowQualScore : 111111111 222222222222222
lowQualScore : 1 1 0 1 3333 1 1 1 1 1 1 6666666 444 333333333 1 1 1 1 3 1 1 22 1 1 22 1 22 1 1 1 1 1 999999999999999 1 444 1 3 6666 1 1 44 3 1 6666666 3 1 3 777 2 2 2 2 2 55 2 4 2 2 4 2
lowQualScore : . . . . .... . . . . . . ....... ... ......... . . . . . . . .. . . .. . .. . . . . . ............... . ... . . .... . . .. . . ....... . . . ... . . . . . .. . . . . . .
lowQualScore : 8 0 8 7 7777 7 7 7 7 7 7 4444444 888 999999999 7 7 7 7 2 5 5 11 5 5 11 5 11 6 6 6 7 7 444444444444444 7 888 7 5 7777 7 7 88 5 7 2222222 8 9 8 999 0 1 1 1 1 00 1 2 2 4 7 4
consensus : CGTCC-AAAAATCTTC-TATA----TCGC-TTA-AA-CA-CT-AATGAA-CGGCC----C--A---CA---------TT-ACAA-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTG-TTT-A--C-GG--AAT-TCAT-G-GGTC-TC-T-------TT------G-G---T-G-TTTTTC----C-G-AT--AT-C-TACA-------C-A-A-A---A-TTTTAT-CG-C-T-GC--TC-T-C-TG-C-T-CCACC
Reference ( family-698 ) : CGTCC-AAAAATCTTC-TATA----TCGC-TTA-AA-CA-CT-AATGAA-CGGCC----C--A---CA---------TT-ACAA-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTG-TTT-A--C-GG--AAT-TCAT-G-GGTC-TC-T-------TT------G-G---T-G-TTTTTC----C-G-AT--AT-C-TACA-------C-A-A-A---A-TTTTAT-CG-C-T-GC--TC-T-C-TG-C-T-CCACC
gi|109343 : CGTCCCAAAAATATTT-TATA----TCGC-TTA-AA-CA-CC-AATGAA-CGGCC----C--A---TA---------TT-AAAA-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTG-TTT-A--C-GG--AAT-TCGT-G-GGTT-TC-T-------TT------G-G---T-G-TTTTTC----C-G-AT--AT-C-TACA-------C-A-A-A---ATTTTTAT-CG-C-T-GC--TC-T-C-TG-C-T-CCACC
gi|109344 : CGTCC-AAAAATCTTC-TATA----TCGC-TT--AA-CA-CT-AATGAA-CGGCC----A--A---TAT--------TT-AC-A-TG-T-TTTCCCC-G-A--CTG-CTT-A--C-GG--AAT-TCAT-G-GGTC-TC-TG------TG------G-G---T-G-TTTTTC----C-G-AT--AT-C-TACA-------CAA-A-A---A-GTTTAT-CG-C-T-GC--TC-T-C-TG-C-T-
gi|109345 : CGTCC-AAAAATCTTC-TATA----CTGC---A-AA-CA-CT-AATGAA-CG--C----C--AAGATA---------TT-ACAA-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTT-TTA-A--C-GA--ATT-TCAT-G-GTTCATCAT-------GT------G-G---T-G--TTTTC----C-G-AT--AT-CTTACA-------C-A-A-AG--A-GTTTAT-CG---T-GCA-TCTT-C-TG-C---CCACC
gi|109346 : CGTCC-AAAAATCTTC-TATA----TCAT-TTA-AA-CA-AT-TATAAA-CGGCC----A--A---CA---------TT-ACAA-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTG-CTT-A--C-GG--AAT-TCAT-G-GGTT-TC-T-------TT------G-G---G-T-TTTTTC----C-A-AT--AT-C-TACA-------C-A-A-A---A-GTTTAT-CG-C-T-GC--TC-T-T-TG-C-T-CCACC
gi|109347 : CGTCC-GAAAATATTT-TGTG----TCAC-TTA-AA-CA-CT-AATGAA-CGGCT----C--A---CA---------TT-ACAG-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTG-TTT-A--A-GG--AAT-TTAT-G-GGTC-TC-T-------TT------ACG---T-G-TTTTTC----C-G-AT--GT-C-TAAA-------C-A-A-A---A-TTTTAT-TA-C-T-GC--TC-T-C-TG-C-T-CCACC
gi|109348 : CATCC-AGAAAATTTC--ATA----TCAC-TTA-AA-CAGCT-AATGAA-CGGCC----C--A---CAT--------TT-AC-A-TG-T-TTT-CCT-G-A--TTG-TTT-A--C-GG--AAT-TCAT-G-GGTC-TC-TG------TG------G-G---T-G-TTTTTC----T-G-AT--AT-C-TACA-------C-A-A-A---A--TTTATACG-C-T-GC--TC-TGC-TG-C-T-CCACC
gi|109349 : CGTCC-AAAA-TTTTT-TATA----TCGC-TGA-AAACA--T-AATGAA-CGGCC----C--A---TA---------TT-ACCA-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTG-TTT-A--C-GG--AAT-TCAT-G-GGTT-TC-T-------TTTTCTTGG-G---T-G-TTTTTC----C-G--T--AT-C-TACA-------C-A-A-A---A-TTTTAT-CG-C-T-GC--TC-T-C-
gi|109350 : CGTCC-AAAAATCTTT-TATA----TCGC-C-A-AA-CA-AG-AATGA--CG-CC----C--A---CA---------TT-ACAA-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTG--TT-A--C-GG--AAT-TCATGG-GGTT-TC-T-------TTG-----G-G---T-G-TTTTTC----CGG-AT--AT-C-TACA-------CAA-A-A---A-TTTTA--CA-C-T-GC--TC-TCC-TG-CAT-CCACC
gi|109351 : CGTCC-AAAAATATTCCTATA----TCGC-ATA-AA-C---T-AATGAA--GGCCA---T--A---TA---------TT-AAAA-TG-T-TTT-CCC-A-A--CTG-ATT-ACGC-GA--AAT-TCAT-G-GGTC-TC-TG------TG------G-G---T-G-TTTTCC----C-G-AC--ATAC-TA-A-------C-A-ACA---A-TTTTAT-CG-C---GT--TC-T-C-TG-C-T-CCACC
gi|109352 : CGTCC-AAAAATATTC-TATA----TCGC-ATA-AA-CA-CT-AATGAA-AGGCC----CATA---TA---------TT-ACAA-TG-T-TTT-CCC-A-A--CTG-ATT-A--C-GG--A
gi|109353 : CGTCC-AAAAATCTTC-TATA----TCGC-TTT-AA-CA-CT-AATAAA-GGGCC----C--A---CA---------TT-ACAA-TG-A-TTT-CCC-G-A--CTG-TTT-A--G-GG--AAT-CCAT-G-GGTC-TC-TG------TG------G-G---T-GTTTTTTC----C-G-AT--AT-N-T
gi|109354 : CGTCC-AAAAATATTT-TATA----TCG--TTACAA-CA-CT-AATGAA-CGGCC----CA-A---CAG--------TT-ACAA-TG-T-TT---CC-G-A--ATG-GTT----C-GG--AAT-TCAT-G-GGTC-TA-T-------TTG-----G-G---T-GTTTTTTC----C-G-AT--AT-C-GACA-------C---A-A---A-TTTTAT-CG-CTT-GC--TC-T-C-TG-CTT-CCGCC
gi|109355 : CGTCC-AAAA-TCTTC-TACA----TCGC-TTT-AA-CA-CC-AGTGAA-CGGCC----C--A---CA---------CT-ACAA-TG-T-TT---CG-G-A--CTC-TAT-A--TAGA--AAT-TCAT-GTGG---TC-T-------GT------G-A---T-A-TTTTCC----C-G-AT--AT-C-TACA-------C-A-A-A---A-TTGTAT-CGCC-T-GC--TC-T---TG-C-TCCCACC
gi|109356 : CGTCC-AAAAATCTTC-TACA----TCGC-TTT-AA-CA-CC-AGTGAA-CGGCC----C--A---CA---------CT-ACAA-TG-T-TTT--CG-G-A--CTG-CTT-A--T-AG--AAT-TCAT-T-GG
gi|109357 : CGTTC-AAAAATTTT--TATA----TCAC-TTA-AA-CA-CT-AAGAGA-CGGCT----C--A---CA---------TT-ACAA-TG-T-TTTGCCA-G-A--TTGATTTAA--C-GG--AAT-TCAT-G-GGTC-TC---------TG------G-G---TAG-TTTACCCGG-C-G-ATTAAT-C--ACA-------G-A-A-AAC-A-TTGTAT-CT-C-TAGC--TC-T-C-TGCC-T-CCA
gi|109358 : CGTCC-AAAAATCTTC-TACA----TCGC-TTA-AA-CA-CT-GATGAA-CGACC----C--A---CA---------TT-ACAA-TG-T-TTT-CTC-GAA--CT--TTT-A--C-AG--TAT-TCAT-A-AGTC-
gi|109359 : CGTCC-AAAA-TATTT-CATAATTCTTGC-T-A-AA-CA-ATGAATGAG-CGGCC----C--A---TA---------TTTACAA-GGAT-TTC-CCC-G-A--CTG-GTT-A--C-AGCGAAT-TCAT-A-GGTT-TC-T-------TTTGG---G-A---T-G-TTTATCACCAC-GAAT--ATGT-TACAAGATGACC-A-ACACACA-TTTTAT-CG-C-T-GCAGTC-T-CTTG-C-C-TCA
gi|109360 : CGTTC-AAAAATCTTC-TATA----TCGCTTTA-AA-CT-TT-AATGAACCGGCT----C--AT--TA---------TT-ACAATTG-T-TTT-TTCAG-AGCTTG-TTT-A----GG--AATGTCAC-A-TATC-TC-CTG-----TT------G-GGTTT-T-TTTTTA----C-A-ATAGAT-C-T-TA-------C-A-A-A---
gi|109361 : CATCC-AAAACTCTTT-T-TA----TCGC-TTA-AG-AA-CT-AATGAA-C---------------TA---------TT----A-TG-TGTTT-CCC-G-A--CT---------------------AT-G-------------------------G-G---T-G-TTTTTC----C-T-TT--AT-C-TACA-------C-A-A-A---T-TCTTAC-CG-C-T-GC--TC-T-
gi|109362 : GTCC-AAAA-TCCTC-CATA----TCAC-TTA-AA-CA-TT-AAAGAA-CGGCCACATT--A---CAATCCCGGGATT-ACAA-TG-T-TTT-ACC-G-A--CTG-CTT-A--C-GG--AAT-TCAT-G-GGTC-TT-T-------GT------G-GG--T-G-TTTTTC----C-G-AT--AT-C-TACA-------C-A-A-A---A-TTTTAT-CG-T-T-GC--TC-T-C-TG-C-T-CCACC
gi|109363 : GTCA-AGAAATATTC-TATA------GC-TTA-A--CA-C--AGT-AA-CGGCC-------A---TAG--------TT-ACA--TT-T-TTT-TCC-G-A--CTG-TTC-A--C-GG---AT-TCAT-G-GGTC-T--T-------GT------G-G---T-G-TATTT-----C-G-AT--TC-T-TATA-------C-GCA-A---A-TTTTA---G-C-T-GC--TC-T-C-TG-C-T-CCA
gi|109364 : C-AACAATATTC-TATA----CCAC-TTG-AA-CA-CT-AATGAA-CGGTC----C--A---TA---------TT-ACAA-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTG-TTT-T--C-GG--AAT-TCAT-G-GGTC-TC-TG------TG------G-G---T-G-TGTTTC----C-G-AT--AT-C-TACA-------C-A-A-A---A-TTTTAT-CG-C-T-GC--TC-T-A-TG-C-T-CCACC
gi|109365 : TCTTC-TCTA----TCAC-TTA-AA-CA-CT-AATTAA-TGGCC----C--A---TA---------TT-ACAG-TG-T-TTT-TCC-G-A--CTG-TTT-A--C-GG--AAT-TCAT-G-GGTC-TC-TAGATCTGTG------G-G---T-G-TTTTCC----T-G-AT--AT-C-TACA-------C-A-A-A---A-TTTTAT-CG-C-T-GC--TC-T-C-TG-C-G-CCACC
gi|109366 : -ACAA-TG-T-TTT-TCA-G-A--CTG-TTT-A--C-GG--AAT-TCAC-A-TATC-TC-TG------TT------G-G---T-G-TTTTT----------T--TT-T-TACA-------A-T-A-G---A-TCTTA
gi|109367 : -CCC-G-A--CTG-TTT-A--C-GG--AAT-TCAT-G-GGTT-TT-T-------TG------G-A---T-G-TTTTTC----C-G-AT--AT-C-TACA-------A-A-A-A---A-TTTCAT-CG-A-T-GC--TC-T-C-TG-C-T-CCACC
gi|109368 : -G-A--CTG-TTT-A--G-GG--AAT-CCAG-G-GGTC-TC-TG------TG------G-G---T-G-TTTTTC----C-G-AT--AT-C-TAC
blockSeqs : . A C ATTC T C A G G C ACATT AGA ATCCCGGGA T T A G C A A GC A A CG A CG G G T A A AGATCTGTG C GTT A T ACCA G A TA A T AGATGAC A C C CAC . A C T A AG T G T C A C
blockSeqs : . A . . . . . . . . CAT T T . . . . G . . . . . . . . . . . . . TTTTCTTG . G . T CGG . . AG G . . A . C AC . . . . . A . C . . T .
blockSeqs : . A . . . . . . . . AT . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTTGG . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . CA . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . TGTT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . A . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqCons : GTG************
originalCons : CGTCC-AAAAATCTTC-TATA----TCGC-TTA-AA-CA-CT-AATGAA-CGGCC----C--A---CA---------TT-ACAA-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTG-TTT-A--C-GG--AAT-TCAT-G-GGTC-TC-T-------TT------G-G---T-G-TTTTTC----C-G-AT--AT-C-TACA-------C-A-A-A---A-TTTTAT-CG-C-T-GC--TC-T-C-TG-C-T-CCACC
finalCons : CGTCC-AAAAATCTTC-TATA----TCGC-TTA-AA-CA-CT-AATGAA-CGGCC----C--A---CA---------TT-ACAA-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTG-TTT-A--C-GG--AAT-TCAT-G-GGTC-TC-TGTG------------G-G---T-G-TTTTTC----C-G-AT--AT-C-TACA-------C-A-A-A---A-TTTTAT-CG-C-T-GC--TC-T-C-TG-C-T-CCACC
Alignments
lowQualScore : 111111111
lowQualScore : 1 1 0 1 3333 1 1 1 1 1 1 6666666 444 555555555 1 1 1 3 1 1 22 1 1 1 44 1 1 1 666666 1 1 9999999 22 1 3 9999 1 1 44 3 1 6666666 3 1 3 777 2 2 2 2 2 55 2 4 2 2 4 2
lowQualScore : . . . . .... . . . . . . ....... ... ......... . . . . . . .. . . . .. . . . ...... . . ....... .. . . .... . . .. . . ....... . . . ... . . . . . .. . . . . . .
lowQualScore : 8 0 8 7 7777 7 7 7 7 7 7 4444444 888 777777777 7 7 7 2 5 5 11 5 5 5 22 6 6 6 555555 7 7 1111111 44 7 5 1111 7 7 88 5 7 2222222 8 9 8 999 0 1 1 1 1 00 1 2 2 4 7 4
consensus : CGTCC-AAAAATCTTC-TATA----TCGC-TTA-AA-CA-CT-AATGAA-CGGCC----C--A---CA---------TTACAA-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTG-TTT-AC-G--GAAT-TCAT-G-GGTC------T-C-T-----G-T--GGGT-G-TTTTTC----C-G-AT--AT-C-TACA-------C-A-A-A---A-TTTTAT-CG-C-T-GC--TC-T-C-TG-C-T-CCACC
Reference ( family-698 ) : CGTCC-AAAAATCTTC-TATA----TCGC-TTA-AA-CA-CT-AATGAA-CGGCC----C--A---CA---------TTACAA-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTG-TTT-AC-G--GAAT-TCAT-G-GGTC------T-C-T-----G-T--GGGT-G-TTTTTC----C-G-AT--AT-C-TACA-------C-A-A-A---A-TTTTAT-CG-C-T-GC--TC-T-C-TG-C-T-CCACC
gi|109343 : CGTCCCAAAAATATTT-TATA----TCGC-TTA-AA-CA-CC-AATGAA-CGGCC----C--A---TA---------TTAAAA-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTG-TTT-AC-G--GAAT-TCGT-G-GGTT------T-C-T-------T--TGGT-G-TTTTTC----C-G-AT--AT-C-TACA-------C-A-A-A---ATTTTTAT-CG-C-T-GC--TC-T-C-TG-C-T-CCACC
gi|109344 : CGTCC-AAAAATCTTC-TATA----TCGC-TT--AA-CA-CT-AATGAA-CGGCC----A--A---TAT--------TTAC-A-TG-T-TTTCCCC-G-A--CTG-CTT-AC-G--GAAT-TCAT-G-GGTC------T-C-T-----G-T--GGGT-G-TTTTTC----C-G-AT--AT-C-TACA-------CAA-A-A---A-GTTTAT-CG-C-T-GC--TC-T-C-TG-C-T-
gi|109345 : CGTCC-AAAAATCTTC-TATA----CTGC---A-AA-CA-CT-AATGAA-CG--C----C--AAGATA---------TTACAA-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTT-TTA-AC-G--AATT-TCAT-G-GTTCA-----T-CAT-----G-T---GGT-G--TTTTC----C-G-AT--AT-CTTACA-------C-A-A-AG--A-GTTTAT-CG---T-GCA-TCTT-C-TG-C---CCACC
gi|109346 : CGTCC-AAAAATCTTC-TATA----TCAT-TTA-AA-CA-AT-TATAAA-CGGCC----A--A---CA---------TTACAA-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTG-CTT-AC-G--GAAT-TCAT-G-GGTT------T-C-T-----T-T--GGGT---TTTTTC----C-A-AT--AT-C-TACA-------C-A-A-A---A-GTTTAT-CG-C-T-GC--TC-T-T-TG-C-T-CCACC
gi|109347 : CGTCC-GAAAATATTT-TGTG----TCAC-TTA-AA-CA-CT-AATGAA-CGGCT----C--A---CA---------TTACAG-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTG-TTT-AA-G--GAAT-TTAT-G-GGTC------T-C-T-----T-T--ACGT-G-TTTTTC----C-G-AT--GT-C-TAAA-------C-A-A-A---A-TTTTAT-TA-C-T-GC--TC-T-C-TG-C-T-CCACC
gi|109348 : CATCC-AGAAAATTTC--ATA----TCAC-TTA-AA-CAGCT-AATGAA-CGGCC----C--A---CAT--------TTAC-A-TG-T-TTT-CCT-G-A--TTG-TTT-AC-G--GAAT-TCAT-G-GGTC------T-C-T-----G-T--GGGT-G-TTTTTC----T-G-AT--AT-C-TACA-------C-A-A-A---A--TTTATACG-C-T-GC--TC-TGC-TG-C-T-CCACC
gi|109349 : CGTCC-AAAA-TTTTT-TATA----TCGC-TGA-AAACA--T-AATGAA-CGGCC----C--A---TA---------TTACCA-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTG-TTT-AC-G--GAAT-TCAT-G-GGTT------T-C-TTTTTCT-T--GGGT-G-TTTTTC----C-G--T--AT-C-TACA-------C-A-A-A---A-TTTTAT-CG-C-T-GC--TC-T-C-
gi|109350 : CGTCC-AAAAATCTTT-TATA----TCGC-C-A-AA-CA-AG-AATGA--CG-CC----C--A---CA---------TTACAA-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTG--TT-AC-G--GAAT-TCATGG-GGTT------T-C-T-----T-T--GGGT-G-TTTTTC----CGG-AT--AT-C-TACA-------CAA-A-A---A-TTTTA--CA-C-T-GC--TC-TCC-TG-CAT-CCACC
gi|109351 : CGTCC-AAAAATATTCCTATA----TCGC-ATA-AA-C---T-AATGAA--GGCCA---T--A---TA---------TTAAAA-TG-T-TTT-CCC-A-A--CTG-ATT-AC-GCGAAAT-TCAT-G-GGTC------T-C-T-----G-T--GGGT-G-TTTTCC----C-G-AC--ATAC-TA-A-------C-A-ACA---A-TTTTAT-CG-C---GT--TC-T-C-TG-C-T-CCACC
gi|109352 : CGTCC-AAAAATATTC-TATA----TCGC-ATA-AA-CA-CT-AATGAA-AGGCC----CATA---TA---------TTACAA-TG-T-TTT-CCC-A-A--CTG-ATT-AC-G--GA
gi|109353 : CGTCC-AAAAATCTTC-TATA----TCGC-TTT-AA-CA-CT-AATAAA-GGGCC----C--A---CA---------TTACAA-TG-A-TTT-CCC-G-A--CTG-TTT-AG-G--GAAT-CCAT-G-GGTC------T-C-T-----G-T--GGGT-GTTTTTTC----C-G-AT--AT-N-T
gi|109354 : CGTCC-AAAAATATTT-TATA----TCG--TTACAA-CA-CT-AATGAA-CGGCC----CA-A---CAG--------TTACAA-TG-T-TT---CC-G-A--ATG-GTT--C-G--GAAT-TCAT-G-GGTC------T-A-T-----T-T--GGGT-GTTTTTTC----C-G-AT--AT-C-GACA-------C---A-A---A-TTTTAT-CG-CTT-GC--TC-T-C-TG-CTT-CCGCC
gi|109355 : CGTCC-AAAA-TCTTC-TACA----TCGC-TTT-AA-CA-CC-AGTGAA-CGGCC----C--A---CA---------CTACAA-TG-T-TT---CG-G-A--CTC-TAT-ATAG--AAAT-TCAT-GTGG--------T-C-T-----G-T---GAT-A-TTTTCC----C-G-AT--AT-C-TACA-------C-A-A-A---A-TTGTAT-CGCC-T-GC--TC-T---TG-C-TCCCACC
gi|109356 : CGTCC-AAAAATCTTC-TACA----TCGC-TTT-AA-CA-CC-AGTGAA-CGGCC----C--A---CA---------CTACAA-TG-T-TTT--CG-G-A--CTG-CTT-AT-A--GAAT-TCAT-T-GG
gi|109357 : CGTTC-AAAAATTTT--TATA----TCAC-TTA-AA-CA-CT-AAGAGA-CGGCT----C--A---CA---------TTACAA-TG-T-TTTGCCA-G-A--TTGATTTAAC-G--GAAT-TCAT-G-GGTC------T-C---------T--GGGTAG-TTTACCCGG-C-G-ATTAAT-C--ACA-------G-A-A-AAC-A-TTGTAT-CT-C-TAGC--TC-T-C-TGCC-T-CCA
gi|109358 : CGTCC-AAAAATCTTC-TACA----TCGC-TTA-AA-CA-CT-GATGAA-CGACC----C--A---CA---------TTACAA-TG-T-TTT-CTC-GAA--CT--TTT-AC-A--GTAT-TCAT-A-AGTC------
gi|109359 : CGTCC-AAAA-TATTT-CATAATTCTTGC-T-A-AA-CA-ATGAATGAG-CGGCC----C--A---TAT--------TTACAA-GGAT-TTC-CCC-G-A--CTG-GTT-AC-AGCGAAT-TCAT-A-GGTT------T-C-T-----T-TTGGGAT-G-TTTATCACCAC-GAAT--ATGT-TACAAGATGACC-A-ACACACA-TTTTAT-CG-C-T-GCAGTC-T-CTTG-C-C-TCA
gi|109360 : CGTTC-AAAAATCTTC-TATA----TCGCTTTA-AA-CT-TT-AATGAACCGGCT----C--AT--TA---------TTACAATTG-T-TTT-TTCAG-AGCTTG-TTT-A--G--GAATGTCAC-A-TATC------TCC-T-----GTT--GGGT-T-TTTTTTTA--C-A-ATAGAT-C-T-TA-------C-A-A-A---
gi|109361 : CATCC-AAAACTCTTT-T-TA----TCGC-TTA-AG-AA-CT-AATGAA-C---------------TA---------TTA----TG-TGTTT-CCC-G-A--CTA-T----------------------------------------------GGGT-G-TTTTTC----C-T-TT--AT-C-TACA-------C-A-A-A---T-TCTTAC-CG-C-T-GC--TC-T-
gi|109362 : GTCC-AAAA-TCCTC-CATA----TCAC-TTA-AA-CA-TT-AAAGAA-CGGCCACATT--A---CAATCCCGGGATTACAA-TG-T-TTT-ACC-G-A--CTG-CTT-AC-G--GAAT-TCAT-G-GGTC------T-T-T-----G-T--GGGT-G-TTTTTC----C-G-AT--AT-C-TACA-------C-A-A-A---A-TTTTAT-CG-T-T-GC--TC-T-C-TG-C-T-CCACC
gi|109363 : GTCA-AGAAATATTC-TATA------GC-TTA-A--CA-C--AGT-AA-CGGCC-------A---TAG--------TTACA--TT-T-TTT-TCC-G-A--CTG-TTC-AC-G--G-AT-TCAT-G-GGTC------T---T-----G-T---GGT-G-TATTT-----C-G-AT--TC-T-TATA-------C-GCA-A---A-TTTTA---G-C-T-GC--TC-T-C-TG-C-T-CCA
gi|109364 : C-AACAATATTC-TATA----CCAC-TTG-AA-CA-CT-AATGAA-CGGTC----C--A---TA---------TTACAA-TG-T-TTT-CCC-G-A--CTG-TTT-TC-G--GAAT-TCAT-G-GGTC------T-C-T-----G-T--GGGT-G-TGTTTC----C-G-AT--AT-C-TACA-------C-A-A-A---A-TTTTAT-CG-C-T-GC--TC-T-A-TG-C-T-CCACC
gi|109365 : TCTTC-TCTA----TCAC-TTA-AA-CA-CT-AATTAA-TGGCC----C--A---TA---------TTACAG-TG-T-TTT-TCC-G-A--CTG-TTT-AC-G--GAAT-TCAT-G-GGTCTCTAGAT-C-T-----G-T--GGGT-G-TTTTCC----T-G-AT--AT-C-TACA-------C-A-A-A---A-TTTTAT-CG-C-T-GC--TC-T-C-TG-C-G-CCACC
gi|109366 : ACAA-TG-T-TTT-TCA-G-A--CTG-TTT-AC-G--GAAT-TCAC-A-TATC------T-C-T-----G-T--TGGT-G-TTTTT----------T--TT-T-TACA-------A-T-A-G---A-TCTTA
gi|109367 : -CCC-G-A--CTG-TTT-AC-G--GAAT-TCAT-G-GGTT------T-T-T-------T--GGAT-G-TTTTTC----C-G-AT--AT-C-TACA-------A-A-A-A---A-TTTCAT-CG-A-T-GC--TC-T-C-TG-C-T-CCACC
gi|109368 : -G-A--CTG-TTT-AG-G--GAAT-CCAG-G-GGTC------T-C-T-----G-T--GGGT-G-TTTTTC----C-G-AT--AT-C-TAC