lowQualScore : 1
lowQualScore : 6 0 1 5 7 9 6 55
lowQualScore : . . . . . . . ..
lowQualScore : 0 2 6 4 2 2 4 66
consensus : ATAACGAACAGTGATCAATCTCA-TAACTCCTATAAAGAATACAA-AATTAAG-AGT
Reference ( gi|50172 ) : ATAACGAGCAGTGATCAATCTCA-TAGCTCCTATAAGGAATAC-A-AATTAAA-AGT
gi|50166 : ATAACGAACAGTGATTAATCCCA-TAGCTTCTATAAAGAATACAA-AATTAAG-AGT
gi|50165 : ATAACAAACAGTGATCAATCTCA-TAAATCCTATAGAGAATAC-A-AATTAAG-AGT
gi|50175 : ATAACGAACAGTGATCAATCTCA-TAACTCCCACAAGAAATACAA-AAATAAA-AGT
gi|50168 : ATAATGAACAATGATCAACCTTA-TAACTCCTATAAAGAATAC-ACAATTAAA-AGT
gi|50162 : ATAACAAACAGTGATCAACCTCA-TAAGTCCTATAAAGAATACAA-AATTAAG-AGTa
gi|50170 : ATGACGAACAGTGACCAATCTCA-TAACTCCTATAAAGAATAC-AGAATTa
gi|50169 : ATAACGAATAGTGATCACTCTCA-TAACTCATATAAGGAATACAA-AATTAAT-AGT
gi|50178 : ATAACGAACAGTGATCAATCCCA-TAATTCCTATATTGAATACAA-AATTAAA-GGT
gi|50177 : ATAAAGAACAGTGATCAATCTCA-AAATTCCTATAAAGAATAC-ACAATTAAG-AGTa
gi|50167 : ATAACAAACAGTGATTAATCTCA-TAACTCCTATAAAGAA-AC-A-AAGTAAATAGTa
gi|50181 : ATAACATACAGTAATCAATCTTA-TAACTCCTATAACGAATAC-A-AATTAa
gi|50176 : ATAACGAACAGTGATCAATCCCA-TAATTCCTGCAAAGAATACAA-AATCAAG-AG
gi|50163 : ATAACAAACAGTGATCAATCTAA-TAAACCCTATAAAGAATATGA-AATTAAG-AGTca
gi|50179 : ATAACGAACAGTGATCAATTTCA-TAAATTCTATACAGAATAC---AATTAAC-AG
gi|50173 : ATAACAAACAGTGATCAATCTCA-TAAATCTTGTATAGAATAC-A-AAATTAA-AGT
gi|50174 : ATAGCGAACAGTGATCAATTTTG-TAACTCCTATTAAGAATACAA-AATTA
gi|50171 : ATAGCGAACAGTGATCAATTTAG-TAACCCCTATAATGAATACAA-AATTAccggta
gi|50164 : ATAGCAAACAGTGATCAATTTAG-TAACCCCTATAAAGAATAC-A-AAccggta
gi|50180 : ATAACAAACAGTGATCAATCTTT-TAAGTCCTATATAGAATAC-A-AAatt
gi|50182 : TAACGAACAGTGATCAATTTAG-TAATTCCTATAAAGAATGC-A-AATTAaacaagagt
gi|50183 : TAACAAACAGTGGTCAATCTGA-TAAATCCTATAGAGAATAC-A-AAccggta
gi|50184 : AACAGTGATCAATTTAG-TAACTCCTATAA-GAATACAA-AATTA
gi|50186 : aAACAGTGATCAATTTAG-TAACCCCTATAAAGAATAT-AGAATTAccggta
gi|50185 : CAGTGATCAAT-TCAGTAACCCCTATAAAGAATACAA-AATTAcag
gi|50187 : aacAGTGATAAATTTTA-TAACTCCTATAAAGAATACAA-AATTAAC-AGTccggta
Alignments
lowQualScore : 1 1 3
lowQualScore : . . .
lowQualScore : 5 0 4
consensus : ATAACGAACAGTGATCAATCTCA-TAACTCCTATAAAGAATACAAAATTAAGAGT
Reference ( family-696 ) : ATAACGAACAGTGATCAATCTCA-TAACTCCTATAAAGAATACAAAATTAAGAGT
gi|50162 : ATAACAAACAGTGATCAACCTCA-TAAGTCCTATAAAGAATACAAAATTAAGAGT
gi|50163 : ATAACAAACAGTGATCAATCTAA-TAAACCCTATAAAGAATATGAAATTAAGAGTa
gi|50164 : ATAGCAAACAGTGATCAATTTAG-TAACCCCTATAAAGAATACAAAATT
gi|50165 : ATAACAAACAGTGATCAATCTCA-TAAATCCTATAGAGAATAC-AAATTAAGAGT
gi|50166 : ATAACGAACAGTGATTAATCCCA-TAGCTTCTATAAAGAATACAAAATTAAGAGT
gi|50167 : ATAACAAACAGTGATTAATCTCA-TAACTCCTATAAAGAA-ACAAAGTAAATAGT
gi|50168 : ATAATGAACAATGATCAACCTTA-TAACTCCTATAAAGAATACACAATTAAAAGTa
gi|50169 : ATAACGAATAGTGATCACTCTCA-TAACTCATATAAGGAATACAAAATTAATAGTa
gi|50170 : ATGACGAACAGTGACCAATCTCA-TAACTCCTATAAAGAATACAGAATT
gi|50171 : ATAGCGAACAGTGATCAATTTAG-TAACCCCTATAATGAATACAAAATTA
gi|50172 : ATAACGAGCAGTGATCAATCTCA-TAGCTCCTATAAGGAATAC-AAATTAAAAGTccggta
gi|50173 : ATAACAAACAGTGATCAATCTCA-TAAATCTTGTATAGAATACAAAATTAA-AGT
gi|50174 : ATAGCGAACAGTGATCAATTTTG-TAACTCCTATTAAGAATACAAAATTA
gi|50175 : ATAACGAACAGTGATCAATCTCA-TAACTCCCACAAGAAATACAAAAATAAAAGTccggta
gi|50176 : ATAACGAACAGTGATCAATCCCA-TAATTCCTGCAAAGAATACAAAATCAAGAG
gi|50177 : ATAAAGAACAGTGATCAATCTCA-AAATTCCTATAAAGAATACACAATTAAGAGTca
gi|50178 : ATAACGAACAGTGATCAATCCCA-TAATTCCTATATTGAATACAAAATTAAAGGTa
gi|50179 : ATAACGAACAGTGATCAATTTCA-TAAATTCTATACAGAATAC--AATTAACAGa
gi|50180 : ATAACAAACAGTGATCAATCTTT-TAAGTCCTATATAGAATACAAAAACAAGAGT
gi|50181 : ATAACATACAGTAATCAATCTTA-TAACTCCTATAACGAATAC-AAATTA
gi|50182 : TAACGAACAGTGATCAATTTAG-TAATTCCTATAAAGAATGC-AAATTA
gi|50183 : TAACAAACAGTGGTCAATCTGA-TAAATCCTATAGAGAATACAAAccggta
gi|50184 : AACAGTGATCAATTTAG-TAACTCCTAT-AAGAATACAAAATTA
gi|50185 : aCAGTGATCAAT-TCAGTAACCCCTATAAAGAATACAAAATTAccggta
gi|50186 : aacAACAGTGATCAATTTAG-TAACCCCTATAAAGAATATAGAATTAccggta
gi|50187 : AGTGATAAATTTTA-TAACTCCTATAAAGAATACAAAATTAACAGTcag
Alignments
lowQualScore : 1 1 3
lowQualScore : . . .
lowQualScore : 5 0 4
consensus : ATAACGAACAGTGATCAATCTCA-TAACTCCTATAAAGAATACAAAATTAAGAGT
Reference ( family-696 ) : ATAACGAACAGTGATCAATCTCA-TAACTCCTATAAAGAATACAAAATTAAGAGT
gi|50162 : ATAACAAACAGTGATCAACCTCA-TAAGTCCTATAAAGAATACAAAATTAAGAGT
gi|50163 : ATAACAAACAGTGATCAATCTAA-TAAACCCTATAAAGAATATGAAATTAAGAGTa
gi|50164 : ATAGCAAACAGTGATCAATTTAG-TAACCCCTATAAAGAATACAAAATT
gi|50165 : ATAACAAACAGTGATCAATCTCA-TAAATCCTATAGAGAATAC-AAATTAAGAGT
gi|50166 : ATAACGAACAGTGATTAATCCCA-TAGCTTCTATAAAGAATACAAAATTAAGAGT
gi|50167 : ATAACAAACAGTGATTAATCTCA-TAACTCCTATAAAGAA-ACAAAGTAAATAGT
gi|50168 : ATAATGAACAATGATCAACCTTA-TAACTCCTATAAAGAATACACAATTAAAAGTa
gi|50169 : ATAACGAATAGTGATCACTCTCA-TAACTCATATAAGGAATACAAAATTAATAGTa
gi|50170 : ATGACGAACAGTGACCAATCTCA-TAACTCCTATAAAGAATACAGAATT
gi|50171 : ATAGCGAACAGTGATCAATTTAG-TAACCCCTATAATGAATACAAAATTA
gi|50172 : ATAACGAGCAGTGATCAATCTCA-TAGCTCCTATAAGGAATAC-AAATTAAAAGTccggta
gi|50173 : ATAACAAACAGTGATCAATCTCA-TAAATCTTGTATAGAATACAAAATTAA-AGT
gi|50174 : ATAGCGAACAGTGATCAATTTTG-TAACTCCTATTAAGAATACAAAATTA
gi|50175 : ATAACGAACAGTGATCAATCTCA-TAACTCCCACAAGAAATACAAAAATAAAAGTccggta
gi|50176 : ATAACGAACAGTGATCAATCCCA-TAATTCCTGCAAAGAATACAAAATCAAGAG
gi|50177 : ATAAAGAACAGTGATCAATCTCA-AAATTCCTATAAAGAATACACAATTAAGAGTca
gi|50178 : ATAACGAACAGTGATCAATCCCA-TAATTCCTATATTGAATACAAAATTAAAGGTa
gi|50179 : ATAACGAACAGTGATCAATTTCA-TAAATTCTATACAGAATAC--AATTAACAGa
gi|50180 : ATAACAAACAGTGATCAATCTTT-TAAGTCCTATATAGAATACAAAAACAAGAGT
gi|50181 : ATAACATACAGTAATCAATCTTA-TAACTCCTATAACGAATAC-AAATTA
gi|50182 : TAACGAACAGTGATCAATTTAG-TAATTCCTATAAAGAATGC-AAATTA
gi|50183 : TAACAAACAGTGGTCAATCTGA-TAAATCCTATAGAGAATACAAAccggta
gi|50184 : AACAGTGATCAATTTAG-TAACTCCTAT-AAGAATACAAAATTA
gi|50185 : aCAGTGATCAAT-TCAGTAACCCCTATAAAGAATACAAAATTAccggta
gi|50186 : aacAACAGTGATCAATTTAG-TAACCCCTATAAAGAATATAGAATTAccggta
gi|50187 : AGTGATAAATTTTA-TAACTCCTATAAAGAATACAAAATTAACAGTcag
blockSeqs : G G G
blockSeqs : . A G
blockSeqs : . A G
blockSeqs : . A T
blockSeqs : . A A
blockSeqs : . A T
blockSeqs : . A A
blockSeqs : . A A
blockSeqs : . A G
blockSeqs : . A G
blockSeqs : . A A
blockSeqs : . A C
blockSeqs : . A G
blockSeqs : . A C
blockSeqs : . A .
blockSeqs : . A
blockSeqs : . A
blockSeqs : . A
blockSeqs : . A
blockSeqs : . A
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons :
originalCons : ATAACGAACAGTGATCAATCTCA-TAACTCCTATAAAGAATACAAAATTAAGAGT
finalCons : ATAACGAACAGTGATCAATCTCA-TAACTCCTATAAAGAATACAAAATTAAGAGT
Alignments
lowQualScore : 1 1 3
lowQualScore : . . .
lowQualScore : 5 0 4
consensus : ATAACGAACAGTGATCAATCTCA-TAACTCCTATAAAGAATACAAAATTAAGAGT
Reference ( family-696 ) : ATAACGAACAGTGATCAATCTCA-TAACTCCTATAAAGAATACAAAATTAAGAGT
gi|50162 : ATAACAAACAGTGATCAACCTCA-TAAGTCCTATAAAGAATACAAAATTAAGAGT
gi|50163 : ATAACAAACAGTGATCAATCTAA-TAAACCCTATAAAGAATATGAAATTAAGAGTa
gi|50164 : ATAGCAAACAGTGATCAATTTAG-TAACCCCTATAAAGAATACAAAATT
gi|50165 : ATAACAAACAGTGATCAATCTCA-TAAATCCTATAGAGAATAC-AAATTAAGAGT
gi|50166 : ATAACGAACAGTGATTAATCCCA-TAGCTTCTATAAAGAATACAAAATTAAGAGT
gi|50167 : ATAACAAACAGTGATTAATCTCA-TAACTCCTATAAAGAA-ACAAAGTAAATAGT
gi|50168 : ATAATGAACAATGATCAACCTTA-TAACTCCTATAAAGAATACACAATTAAAAGTa
gi|50169 : ATAACGAATAGTGATCACTCTCA-TAACTCATATAAGGAATACAAAATTAATAGTa
gi|50170 : ATGACGAACAGTGACCAATCTCA-TAACTCCTATAAAGAATACAGAATT
gi|50171 : ATAGCGAACAGTGATCAATTTAG-TAACCCCTATAATGAATACAAAATTA
gi|50172 : ATAACGAGCAGTGATCAATCTCA-TAGCTCCTATAAGGAATAC-AAATTAAAAGTccggta
gi|50173 : ATAACAAACAGTGATCAATCTCA-TAAATCTTGTATAGAATACAAAATTAA-AGT
gi|50174 : ATAGCGAACAGTGATCAATTTTG-TAACTCCTATTAAGAATACAAAATTA
gi|50175 : ATAACGAACAGTGATCAATCTCA-TAACTCCCACAAGAAATACAAAAATAAAAGTccggta
gi|50176 : ATAACGAACAGTGATCAATCCCA-TAATTCCTGCAAAGAATACAAAATCAAGAG
gi|50177 : ATAAAGAACAGTGATCAATCTCA-AAATTCCTATAAAGAATACACAATTAAGAGTca
gi|50178 : ATAACGAACAGTGATCAATCCCA-TAATTCCTATATTGAATACAAAATTAAAGGTa
gi|50179 : ATAACGAACAGTGATCAATTTCA-TAAATTCTATACAGAATAC--AATTAACAGa
gi|50180 : ATAACAAACAGTGATCAATCTTT-TAAGTCCTATATAGAATACAAAAACAAGAGT
gi|50181 : ATAACATACAGTAATCAATCTTA-TAACTCCTATAACGAATAC-AAATTA
gi|50182 : TAACGAACAGTGATCAATTTAG-TAATTCCTATAAAGAATGC-AAATTA
gi|50183 : TAACAAACAGTGGTCAATCTGA-TAAATCCTATAGAGAATACAAAccggta
gi|50184 : AACAGTGATCAATTTAG-TAACTCCTAT-AAGAATACAAAATTA
gi|50185 : aCAGTGATCAAT-TCAGTAACCCCTATAAAGAATACAAAATTAccggta
gi|50186 : aacAACAGTGATCAATTTAG-TAACCCCTATAAAGAATATAGAATTAccggta
gi|50187 : AGTGATAAATTTTA-TAACTCCTATAAAGAATACAAAATTAACAGTcag