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gi|119425 : AAATAAT-T-G-A-C-CG-G-CCAAG-ATA-G-TTT--TTT-CGCC-A----C-------C------------TT----------------G--------------ATT--GCT-GCA-C----------------A------A---G-AA---------G-----A---TT------GATTTA-TTGTGA-CGTATA---AAAAA-------------C-GACCTT-----GC--GACT------------A-C---G-AGGCAAC---AACG-TG-A-CG-TC-A-C-A-A-TTAAAAA-AA---ACGAGA-T-A-ACG-T--T-------T------T-----------TGAAAGCC-------A-A-T----C-AT--GG--C-AAGGA-T-C-TCTAGATA-------AG-CATTACC
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gi|119428 : AACTA-T-T-G-A-C-CG-G-C--AGCAGA-G-AGT--TTT-C-CC-A----C-------C------------TTTTTACTGAGGTT----G--------------ATT--G-T-G-A-C----------------ATTGTATA---G-TA---------G-----A---TT------GATTTA-TTGTGA-CGTAA-T--AAAAA-------------T-G-TC-------AC--AACT------------A-T---A-AAACA-----AATG-TG-A-CG-TC-A-C-A-A-TT--AAT-AA---ACAAGA-T-A-ACA-T--T-------T------TTTAAAAA----TGAAAG-C-------A-A-T----C-GT--GG--C-AAGAT-T-T-TCTAGAT--------AA-CATTATC
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Reference ( family-687 ) : AAATA-T-T-G-A-C-CG-G-C--AG-AGA-G-TTT--TTT-C-CC-A----C-------C------------TT----------------G--------------ATT--G-T-G-A-C----------------A------A---G-AA---------G-----A---TT------GATTTA-TTGTGA-CGTAAAT--AAAAA-------------C-G-CC-------GC--GACT------------A-C---A-AAGCA-----AACG-TG-A-CG-TC-A-C-A-A-TT--AAA-AA---ACAAGA-T-A-ACG-T--T-------T------T-----------TGAAAG-C-------A-A-T----C-AT--GG--C-AAGAT-T-C-TCTAGAT--------AG-CATTACC
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gi|119435 : AAATG-T-T-G-A-C-CG-G-C--AG-AG----TTT--TTT-C-CCCA----C-------C------------TT----------------G--------------ATT--G-T-G-A-C----------------A------T---G-AG---------G-----A---TT------GATTCA-TTGTGA-CGT-AAT--AAGTA-------------C-G-TC-------GC--
gi|119436 : AACTA-T-T-G-A-C-CG-G-C--AT-AGA-G-TTT--T---C-CC-A----C-------C------------TTTTTACTGTCGGAGTTTG--------------ATT--G-T-G-A-T----------------T------A---A-TA---------G-----A---TT------GATTTA-TTGTGA-CGT-TAT--AAAAA-------------C-G-TT-------GC--TACTTGAAAAAAACCCA-C---A-AA-C------AACA-TG-A-CG-TC-A-C-A-A-TT--CAA--------AAGA---A-ACG-T--T-------GAAAA--T-----------TGAAAG-T-------A-G-T----
gi|119437 : AAATA-TCT-G-AAC-TG-GAC--AG-AGA-G-TTTATTTT-C-CC-A----C-------C------------TT----------------G---------------TT--G-T-G-C-A----------------A------A---G-AA---------G-----A---CTATCTTAGATT-A-GTGTGAACGTAAGTTAAAAAA-------------C-G-CTTTATAATGT--GGAT------------A-C---A-AAGCA-----AACGTTG-AGCGATCAA-C-A-A-TT--GTA-AA---ACAAGA-
gi|119438 : AAATA-T-T-G-A-C-CG-G-C--AG-AGA-GTTTT--TTT-C-CC-AG---C-------C------------TT-------------------------------ATT--
gi|119439 : AATA-T-T-G-A-C-TG-G-C--AG-AGA-G---T--TTT-C-CC-A----C-------CTTTTTATTGAATTT----------------G--------------ATT--G-T-G-A-C----------------A------A---
gi|119440 : -T-G-A-C-CG-G-C--AA-AGA-G-TTT--TC--C-CC-A----T-------C------------TTTTTACTGAGTTT----G--------------ATT--G-T-G-A-C----------------A------A---A-TA---------A-----A---TT------GATTTA-TTGTGA-CGT-AAT--AAAAA-------------C-G-TC-------GC--TATT------------T-C---A-AAAGA-----AACT-CG-A-CG-TC-A-T-A-A-TT--AAA-AA---ATA--A-T-A-GCG-T--TAAC----G------T-----------TAAAAA-CTTAATCTA-A-T----T-AT--GA--CAAAGAT-T-C-TTGAGGT--------TG-CATT
gi|119441 : TA-TTGTGA-TGTTA-T--AAAAA-------------C-G-TT-------AC--AACTTTT---------A-A---A-AAACACAAACAACA-TA-A-CG-TC-A-C-A-A-TT--CAA-AA---GAAATG-T-A-ACG-------------------T-----------TAAAAG-C-------
gi|119442 : -------------C-A-CT-------GA--GATT------------A-C---A-AG--A-----AACA-CG-A-CG-TC-A-C-A-A-TA--AAA-AA---AAAAAA-GGA-ACG-T--T-------A------AAA---------TAAAAA-A-------A-A-T----C-AT--GG--C-AAGAT-T-C-----GCT--------AG-CACTAC
blockSeqs : A C T G A G A T CA C T T AT TTG G C AGAA AAATGAG TTTTTACTGTCGGAGTTTG AC C A C G CCTGGGGGGATTTGAC TTGTAT ATA A TTTTTAATA ATCAA CAC ATCTTA A A GAA TA ACACCCAAAGAGA G A TTTATAAT TG TGAAAAAAACCC G CAAA CAAAC C C G A A C A C C AAA G AGC T G C T GG TTTTAAAAAAAAG C TTAATCT T T CCGG G CG GT A A A A ACAAATGC C
blockSeqs : A C . . . . . A . . . . . TT G . G . TTGTTAACGAGTCTTTG . . . . . . T . . . . . . . A ATA . . T . CTT . TTT . AT AC T . . . A . . . . AA . . . . . . . TTTTAAAAATAA . . . . AG . CG . . . . . A C
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . TT . . . . TTTTTACTGAGGTTG . . . . . . . . . . . . . . . TAA . . . . TG . . . AT . . . . . . . . . . AA . . . . . . . AAAAAAATTAA . . . . AG . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . TT . . . . CTTTTACTGAGTTTG . . . . . . . . . . . . . . . AAT . . . . T . . . A . . . . . . . . . . AA . . . . . . . TTTTAAAAA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . TT . . . . TGGGTAGTGAGTTTG . . . . . . . . . . . . . . . AAG . . . . T . . . A . . . . . . . . . . A . . . . . . . TAACAAAA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . TT . . . . TTTTTATTGAATTTG . . . . . . . . . . . . . . . AAG . . . . T . . . A . . . . . . . . . . A . . . . . . . GAAAAT . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . TT . . . . TTTTTACTGAGTTTG . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . T . . . A . . . . . . . . . . A . . . . . . . AACGT . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . TT . . . . TTG . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . T . . . A . . . . . . . . . . A . . . . . . . AAAA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . TT . . . . TTG . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . T . . . G . . . . . . . . . . A . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . TT . . . . TTG . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . T . . . G . . . . . . . . . . G . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . TT . . . . TTG . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . T . . . A . . . . . . . . . . A . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . TT . . . . TTG . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . T . . . A . . . . . . . . . . A . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . TT . . . . TTG . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . C . . . A . . . . . . . . . . C . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . TT . . . . TTC . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . C . . . A . . . . . . . . . . G . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . TT . . . . TTG . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . T . . . A . . . . . . . . . . A . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . C . . . . TTG . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . A . . . A . . . . . . . . . . C . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . . TTG . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . C . . . A . . . . . . . . . . A . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . . TTG . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . C . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . C . . . . TTG . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . C . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTG . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTG . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTG . . . . . . . . . . A . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . T .
blockSeqCons : AA*
originalCons : AAATA-T-T-G-A-C-CG-G-C--AG-AGA-G-TTT--TTT-C-CC-A----C-------C------------TT----------------G--------------ATT--G-T-G-A-C----------------A------A---G-AA---------G-----A---TT------GATTTA-TTGTGA-CGTAAAT--AAAAA-------------C-G-CC-------GC--GACT------------A-C---A-AAGCA-----AACG-TG-A-CG-TC-A-C-A-A-TT--AAA-AA---ACAAGA-T-A-ACG-T--T-------T------T-----------TGAAAG-C-------A-A-T----C-AT--GG--C-AAGAT-T-C-TCTAGAT--------AG-CATTACC
finalCons : AAATA-T-T-G-A-C-CG-G-C--AG-AGA-G-TTT--TTT-C-CC-A----C-------C------------TT----------------G--------------ATT--G-T-G-A-C----------------A------A---G-AA---------G-----A---TT------GATTTA-TTGTGA-CGTAA-T--AAAAA-------------C-G-CC-------GC--GACT------------A-C---A-AAGCA-----AACG-TG-A-CG-TC-A-C-A-A-TT--AAA-AA---ACAAGA-T-A-ACG-T--T-------T------T-----------TGAAAG-C-------A-A-T----C-AT--GG--C-AAGAT-T-C-TCTAGAT--------AG-CATTACC
Alignments
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Reference ( family-687 ) : AAATA-T-T-G-A-C-CG-G-C--AG-AGA-G-TTT--TTT-C-CC-A----C-------C------------TT----------------G--------------ATT--G-T-G-A-C----------------A------A---GAA---------G-----A---TT------GATTTA-TTGTGA-C-GT-AA--TAAAAA--------------C-G-CC-------GC--GACT------------A-C---A-AAGCA-----AACG-TG-A-CG-TC-A-C-A-A-TT--AAA-AA---ACAAGA-T-A-ACG-T--T-------T------T-----------TGAAAG-C-------A-A-T----C-AT--GG--C-AAGAT-T-C-TCTAGAT--------AG-CATTACC
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gi|119434 : AGATA-T-T-G-A-C-CG-G-T--AG--GA-G-GTT--TT----CC-A----C-------C------------TT----------------GTTAACGAGTCTTTGATTACG-TAG-A-C----------------A------A---GTA---------G-----A---TT------GATTTA-T-GTGA-C-GT-AA--GAAAAAAACACCCAAAGAGAC-G-TC-------GC--AACT------------A-TCAAA-AAACA-----AACA-TG-A-CG-TC-A-C-A-ACTT----A-AA---AC-AGA-T-A-ACC-T--T-------TAACAAAA-----------TGAAAG-C-------A-ATT----C-AT--TG--C-AAGAT-TAC-GCTAGAT--------AGCCACTACC
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gi|119436 : AACTA-T-T-G-A-C-CG-G-C--AT-AGA-G-TTT--T---C-CC-A----C-------C------------TTTTTACTGTCGGAGTTTG--------------ATT--G-T-G-A-T----------------T------A---ATA---------G-----A---TT------GATTTA-TTGTGA-C-GT-TA--TAAAAA--------------C-G-TT-------GC--TACTTGAAAAAAACCCA-C---A-AA-C------AACA-TG-A-CG-TC-A-C-A-A-TT--CAA--------AAGA---A-ACG-T--T-------GAAAA--T-----------TGAAAG-T-------A-G-T----
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