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lowQualScore                  :      .    . . . .  .   . .  ... .    ......   ...   .   . ..  .... . . .  .   ....................     .....    .. .. . ......  ...  .. .  ....... .  ...  .. .     .. . ..          .. .   .. ..... ...... .. . . ............ ..  .............................................................................................................................  . .  . .  ..... .  .  ...    . . .  .  ...... ... .    ..  . .....  ... .  .  . .   .   .       .. ..........................  .  .  .. .  ...  .     . ..  .  .  ... .   ...... ... ....... .   .  . .. . . .......  .  .   ..    .   ......... .     ...     .. .  .. . . . .  .           
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gi|95957                      :   TTA-ATGT-G-T-A-CT-CAC-C-AC---C-ACCA-----TCCG---ACA-TAT-C--CA--CCC-A-T-CA-GGC---------------------ATAT-----TCAA-TA--T-A------CA---CA-GG-AA-----T-T-TT---GA--T-ATCAT--T-C--TACCAGCATA--T-CTG--A-----T------C--T-G-T------------G--TC-------T--G----------------------T------T---GGTAGTCC-----G--AA-----C--CCC-AC-------TCCCAA-A---TT--------------------------C--CA-T-TT-G-CA---T-G-AT-CC---TTTT-C-A-GA-ATT--A--A---T-ATCC--AG-A-----AA---A-CA-TG-GGAAA-TCC-TTTCCAT--C--------------------------TT-GC-CC--G-AA---AA-TATCCAA--AA-AG-AA---C-ACT------A---T-------T-AGT-AA-G--TTT-T------TAA-CA-TAA--AACA-TTT---------T-AAAATA--CATGG--T-AG-CC-A-C-T-CT-TGAAACATGGA
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gi|95968                      : attaA-AGGT-G-T-A-CT-CAC-C-AT---C-ACAA-----ACCG---ACA-TAT-C--CA--GCC-A-T-CA-GGC---TTGTCAT---T-TAAAACATAC-----TCAA-GA--A-A------CA---CA-AG-AA-----G-T-TT---GA--T-AGCAT--T-C--TACCAGCATA--C-CTG--A-----T------A--T-G-T------------GTCTC-------A--T----------G-----T-T-GGT------T---G-----TC-----CAAAT-----A--CCC-CCAAAATAATTC----A---TT-----T-------------------------------T-CA---A-G-AT-CC---TTTT-C-A-GA-ATT--A--A---T-ATCT--A--A-----AA---A-CA-TG-GGAAG-TCA-TTTCCAT--C--------------------------TT-G
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lowQualScore                  :        4    4 4 2 2  2   2 2  999 4    6   7777 11111111  2   4 11  2 33   2   2  66666666666666666666     00000    0  88  888888  555   0   6666666 0 88   88 0    0 88  55          44 9   66 66666666 555555 66 9 44 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000  5 7  7 7 7 11111 7  7  222     7 7 22222 3   6 22 6 22    22  4 88888  22 22  6  6     2  2222222222222222222222     22  6 00000000000000000000000000    7  33 7  999  7     3 00  3  7  999 7   888888 999 4444444 7   7  7 7   3 22   6 22 2   22    6  22 22 2   22 6  88888 888    7 7 5555   7 7 33 7  8           
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Reference ( family-686 )      :     TTA-ATGT-G-T-A-CT-CAC-C-AT---C-ACAANCCG----A--------CA-TAT-C--CA-C--CCA-TCA-GGC---TTGTC-A-TT--AAAACATAT-----TCAA-TA--TA------CA---CAG-GAA-----G-T-T--TGA--T-ATCA-T--TC--TACCAGCATA--T-CTG--A--------T------C--T-G--T------------GTC---CG-----AA----A--AAT------C-GCC-----C--CCC--------CC--C-CCTCC----------AT-NT------TT--------T--TC----CA-T-TT-T-C-A---T-G-AT-CC---TTTTC-A-G-----A-ATT-A--A-T--ATCC--AG-A-----AA--A--CA-TG-GGAAA-TC--------------------C-TTTCC--AT-C--------------------------TTGT-CC--G-AA---AA-TGTCC-A--AA-AG-AA---C-AGT------A---T-------T-AGT-AA-G-TTC-T--TAA-C--A-CAA--AACA-TT--T--G-AAA--A-GA-----C---ATGA-C-A----GCC-A-C--T-CT-TGAAACATGGA
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gi|95972                      :      TA-ATGT-A-TTA-TT-TAT-A-AT---C-ACAATCCG----A--------CA-TAT-C---A-C--CCA-TCA-GGT--------------------ATAT-----T----TA--TA------CA---CAG-GGA-----T-T-T--TGA--T-GTCA-T--TT--TACCAGCATA--T-CTG--A--------T------C--T-G--T------------GTC---TGTTGGTAGTTCGA--AAT------C-------------CC--------CC--C-CCCCC----------AT-TT------TT--------T--TC----CAAT-TT-T-C-----T-G-AT-CC---TTTTC-A-G-----A-ATT-A--A-T--ATCC--AG-A-----AA--A--CA-TG-GGAAA-TC--------------------C-TTTCC--AT-C--------------------------TTGT-CC--G-AA---AA-TGTCC-A--AA-AG-AA---T-TTT------A---T-------T-AGT-AA-G-TTC-T--TAA-C--A-CAA--AACA-CT--T--G-AAA--A-GA-----C---ATGA-C-A----GCC-A-C--T-CT-TGAAACATGGA
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gi|95975                      :                                                                                                    AGACTTAT-----TCAA-GA--GA------CA---CAG-TAA-----G-T-T---GA--T-ATCA-T--TC--AATCAGCAT
gi|95975                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          acatccagcaatc--TC----CG-T-TT-A-C-A---A-A-AT-CA---TTTTC-A-GTAAGAA-AAA-A--A-T--ATCT--AG-A-----AA--ATGCA--G-AGAAG-TCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNN--NN-N--------------------------NNNN-NN--N-NN---NN-NNNNN-N--NN-NG-AA---C-AGT------A---T-------T-AGT-AA-G-TTC-T--TAA-C--A-TAA--AACT-TT--T--G-TAA--A-TA-----T---ATGG-C-A----GAC-T-C--T-CT-TGAAACATGGActgttggtactcggaataataacaaaaatccgtttacaaaatcattttcagtaagaaaaaaatatctagaaaatgcagagaagtcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaacagtattagtaagttcttaacataaaacttttgtaaatatatggcagactctcttgaaacatgga
gi|95976                      :             acatccagcaatcagacttattcaagagacacagtaagttgatatcattcaatcagcatctgttggtactcggaataataacaaaaaAAACATAT-----TCGA-GACGTAGAACCGCA---CAGAGAATTGGCA-T-T--TAA--TGATCA-TATTC--TACCAGC-TAG-T-CTG--AGGGTA---C------C--T-A--G------------GTC----G-----AG----AT-GAT------A-GAC-----T--CCCACTTTTCGCC--TACCTCC----------AT-AT------TTGTTGTATCC--TC----CA-T-TTGTGC-A---T-T-GTGCC---TGTTCTA-G-----A-ATT-A--A-TTTATCCTCAG-A-----AA--A--CA-TG-GAAAA-TC--------------------T-TTTCC--AT-C--------------------------TTGT-CC--T-AACCTAACTGTCC----AA-AG-AA---C-AGT------CCCTC-------T-GATAAA-G-TCC-T--TAACC--A-CAAATAGCAGCT--T--G-AAA--ACGAC----C---CTGAGC-C----ATC-A-C--T-C--TGGAACGTGGA
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Reference ( family-686 )      :     TTA-ATGT-G-T-A-CT-CAC-C-AT---C-ACAANCCG----A--------CA-TAT-C--CA-C--CCA-TCA-GGC---TTGTC-A-TT--AAAACATAT-----TCAA-TA--TA------CA---CAG-GAA-----G-T-T--TGA--T-ATCA-T--TC--TACCAGCATA--T-CTG--A--------T------C--T-G--T------------GTC---CG-----AA----A--AAT------C-GCC-----C--CCC--------CC--C-CCTCC----------AT-NT------TT--------T--TC----CA-T-TT-T-C-A---T-G-AT-CC---TTTTC-A-G-----A-ATT-A--A-T--ATCC--AG-A-----AA--A--CA-TG-GGAAA-TC--------------------C-TTTCC--AT-C--------------------------TTGT-CC--G-AA---AA-TGTCC-A--AA-AG-AA---C-AGT------A---T-------T-AGT-AA-G-TTC-T--TAA-C--A-CAA--AACA-TT--T--G-AAA--A-GA-----C---ATGA-C-A----GCC-A-C--T-CT-TGAAACATGGA
gi|95957                      :     TTA-ATGT-G-T-A-CT-CAC-C-AC---C-ACCATCCG----A--------CA-TAT-C--CA-C--CCA-TCA-GGC--------------------ATAT-----TCAA-TA--TA------CA---CAG-GAA-----T-T-T--TGA--T-ATCA-T--TC--TACCAGCATA--T-CTG--A--------T------C--T-G--T------------GTC---TGTT---GG----T--AGT------CCGAA-----C--CCC--------AC--T-CC--C----------AA-AT------T-------------C----CA-T-TT-G-C-A---T-G-AT-CC---TTTTC-A-G-----A-ATT-A--A-T--ATCC--AG-A-----AA--A--CA-TG-GGAAA-TC--------------------C-TTTCC--AT-C--------------------------TTGC-CC--G-AA---AA-TATCCAA--AA-AG-AA---C-ACT------A---T-------T-AGT-AA-G-TTT-T--TAA-C--A-TAA--AACA-TT--T--T-AAA--A-TA-----C---ATGG-T-A----GCC-A-C--T-CT-TGAAACATGGA
gi|95958                      :    aTTA-ATGT-G-T-A-CT-CAC-C-AC---C-ACCATCCG----A--------CA-TAT-C--CA-C--CCA-TCA-GG-------------------GCATAT------CAA-TA--TA------CA---CAG-GAA-----T-T-T--TGA--T-ATCA-T--TC--TACCAGCATA--T-CTG--A--------T------C--T-GG-T------------GTC---TGTT---GG----T--AGT------C---C-----G--AAC--------CC--C-ACTCC----------AC-AA------TT--------C---C----CA-T-TT-G-C-A---TTG-AT-CC---CTTTC-A-G-----A-ATT-A--A-T--ATCC--AG-A-----AA--A--CA-TG-GGAAA-TC--------------------CCTTTCC--AT-C--------------------------TTGC-CC--G-AA---AA-TATCC-A--AA-AG-AA---C-ACT------A---T-------T-AGT-AA-G-TTT-T--T-A-C--A-TAA--AACA-TT--T--T-AAA--A-TA-----C---ATGG-T-A----GCC-ACC--T-CT-TGAAACATGG
gi|95959                      :    aTTA-ATGT-G-T-A-CT-CAC-C-AT---C-ACAATCCG----A--------CA-TAT-C--TA-C--CCA-TCA-GGC--------------------ATAT-----TCAA-TA--TA------CA---CAG-GAA-----T-T-T--TGA--T-ATCA-T--TC--TACCAGCATA--T-CTG--A--------T------C--T-G--T------------GTCTGTCG-----GA----A--GTC------C-GAA-----C--CCA--------TT--C-CC-CC----------AT-AT------ATAGTATAG-T--TT----CA-G-TT-T-C-A---T-G-AT-CCT--TTTTC-A-G-----A-ATT-G--A-T--ATCC--AGAA-----AA--A--CA-TG-GG-AA-TC--------------------C-TTTCCATAT-C--------------------------TTGT-CC--G--A---AA-TGTCC-A--AA-AGAAA---C-AGT------A---G-------T-ACT-AA-G-TTC-T--TAA-C--A-CAA--AACA-TT--T--G-AAA--A-GA-----C---ATGA-CGA----GCC-A----T-TT-TGAAACATCGA
gi|95960                      :    aTTA-ATGT-G-T-A-CT-CAC-C-ATGATC-ACAATCCG----A--------CA-TAT-C--CA-C--CCA-TCA-G--------------------ACATAT-----TT---TA--TA------TA---CAG-GAA-----T-T-T--TGA--T-ATCA-T--TC--TACCAGCATA--T-CTG--A--------T------C--T-G--T------------GGC---TGTT---GG----T--AGT------T-GGA-----C--CCC--------CC--C-CCTAA----------AA-AA------AA--------A--TC----AA-T-TT-T-C-A---T-T--T-CC---TTTTC-A-G-----A-ATT-A--T-T--ATCC--AG-A-----AT-----CA-TG-GGAAA-TC--------------------C-CTTC---AT-C--------------------------TTGTTCC--G-AA---AA-TGTCC-A--AA-AG-AA---C-AAT------A---T-------T-AGT-AA-G-TTC-T--TAA-C--A-CAA--AATA-TT-----G-AAA--A-GA-----C---ATGA-C-A----GCC-A-C--T-
gi|95961                      :    aTTA-ATGT-G-T-A-CT-CAC-C-AT---C-ACAAACCG----A--------CA-TTT-C--CA-G--CCA-TCA-TGC---TCGTC-A-TTT-AAAACTTAT-----TGAG------A------TA---CAG-GAA-----G-T-T--TGA--T-ATCA-T--TC--TACCAGCATA--T-CTG--A--------T------C--T-G--TATCTGTTGGTT-GTC---CA-----AA----T--AAT------C--------------C--------CC--C-CAAAA----------AT----------------------------CA-T-TT-T-C-A---A-G-AT-CC---TATTC-A-G-----A-ATT-A--A-T--ATGT--AG-A-----AA--A--CA-TG-GGAAG-TC--------------------C-TTTCC--AT-C--------------------------TCAT-CC--G-AA---AA-TGTTC-A--AA-AG-AA---C-AGT------A---T-------T-AGC-AA-G-TTC-T--TGG-C--A-CAA--AACA-TT--T--G-AAA--A-GA-----C---ATGA-C-A----GCA-A-C--T-CT-TAAAACATGGA
gi|95962                      :    aTTA-ATGT-G-T-A-CT-CGC-C-AT---C-ACAAATCGCGACA--------CA-CAT-C--CG-C--C-A-TTA-G---------C-----------CATAT-----TCAA-TA--TA------CAAATCAA-GGA-----A-T-T--T-A--T-ATCA-T--TC--TACCAGCATA--T-CTG--A--------TTCGTGTC--T-G--TTGGTA-------GTC---CG-----AT----A--TAT------C-CCC-----C--CCC--------CC--CTCCTCCCAAA------AT-GT------TT--------T---C----CA-T-TG-C-C-A---T-G-AT-CC---TTTTC-A-G-----A-ATT-G--A-T--ATGC--AG-G-----AA--A--CA-TG-GGAAA-TC--------------------C-TATCC--AT-C--------------------------TTGT-CT--G-AA---AA-TGTCC-A--AA-AG-TT---T-AGT------A---T-------T-ATT-AA-G-ATC-T--TAA-C--A-CAA--AACA-TT--G--G-AAA--A-GA-----C---ATGA-C-A----GCC-A-C--G-AT-TGAAACATGGA
gi|95963                      :    aTTA-ATGT-G-T-A-CT-CAC-C-AT---C-ACAATCCG----A--------CA-TATGC--CA-C----A-TCA-GGC--------------------ATAT-----TCAA-TA--TAA-----CA---C-G-GTA-----T-T-TCTTGA--T-ATCA-T--TC--TACCAGCATA--T--TG--AATCTAGTGT------C--T-G--TTGTA--------GTC---CG-----AA----A----T------C--CC-----C--CCC--------CC--C-CCCCC----------AT-ATAAGTGACG--------T--TG----CA-G-TT-T-C-A---T-G--T-CC---TTTTC-AAG-----A-ATT-A--A-T---TCC---G-A-----AA--A--C--TG-GGAA--TC--------------------C-TTTCC--AT-C--------------------------TTGT-CC--G-AA---A--TGTCC-A--AA--G-AA---C-AGT------A---T-------T-ACT-AATG-TTC-T--TAA----A-CAA--AACA-TT--T--G-AAA--A-GA-----C---ATGA-C-A----GCC-T-T--T-CT-T-AAACATGGA
gi|95964                      :      aA-ATGT-G---A-CT-CAC-A-AT---C-ACAAACCG----A--------CA-TAT-C--CA-G--CCA-TCATGGC---TTGTC-A-TTT-AAAACATAT-----TCAAAGA--TA------CA---CAA-GAA-----G-T-T--TGA--T-ATCA-T--TC--TACCAGCATA--T-CTG--A--------T------C--T-G--TTTCTGTTTGATTGTC---TG-----AA----A--A----------------------TC--------CC--C-CAACA----------AT-CA------TT--------T--T-------------T-C-A---A-G-AT-CC---TATTC-A-G-----A-ATT-A--A-T--ATCT--AGAA-----AA--A--CA-CG-GGAAA-T---------------------C-TTTCC--AT-C--------------------------TTGT-TC--G-AA---AA-TGTCT-A--CA-AG-AA---C-AGT------A---T-------T-AGT--A-G-TTC-T--TAA-C--A-CAA--AACA-TT--T--G-AAT--A-GA-----C---ACGG-C-A----GCC-A-C--TAAT-TGAAACATGGA
gi|95965                      : attaTTA-ATAT-G-T-A-CT-CCC-C--------------------------------TAT-C--CA-C--CCA-TCA-GGT--------------------ATAT-----TCAA-TA--TA------CA---CAG-GAC-----T-T-T--TGA--T-ATTA-T--TC--TACCAGCACA--T-GTG--A--------T------C--T-G--T------------TTC---TGTT---GA----T--AGT------C--CA-----A--CCC--------CC--C-ACCCC----------A--------------------T--TA----CT-T-TT-T-C-A---T-G-AT-CC---T------------------------T--ATCC--AGAA-----AA--A--CA-TG-GGGAATTT--------------------T-TTTCC--AT-C--------------------------TTAT-CC--G-AA---AA-AGTCC-AG-AA-AG-AA---C-AGT------A---TTACAATGT-AGT-AA-G-TTC-T--TAA-C--A-CAA--AACA-TT--T--A-AAA--A-GA-----C---ATGA-C-A----GCC-A-C--T-CT-TGAAACATG
gi|95966                      :    aTTA-GT-T-G-T-A-CT-CACAC-AT---C-ACA------------------CA-TAT-C--CA-C--CCA-TTA-GGC-------------------CATAT-----TCA--TA--CA------CA----AG-GAA-----T-T-T--TGA--T-ATTA-C--TC--CACCAGCATA--T--TG--A--------T------C--T-G--T------------GTCTGTTG-----GT----A--AGT------C-ACC-----C--CAC--------CC--C-CC-CC----------AC-CC------CTCAAAAA--T--TC----CA-T-TT-T-C-A---T-A-AT-CC---TTTTC-A-G-----A-GTT-G--ATT--ATCC--AGAA-----AA--A--CA-TG-GTAAA-TC--------------------C-TTTCC--AT-CAGAGTTATATATGTCGTTTTCCCAATTTGT-CC--GAAA---AA-TGTCCAA--AA-AG-AA---CAAGT------A---T-------T-AGT-AA-G-TTC-T--TAA-C--A-CAA--AACA-TT--T--G-AAA--A-GA-----C---ATGA-C-A----GCCGA-CT-T-CT-TGAA
gi|95967                      :    aTTC-ATGT-GGT-A-CTTCAC-C-AT---CCACAAACCA----A--------CAATAT-G--CAGT--CTT-TCA-GG----TTGTT-A-TT--TAAACATAT-----TCAA-GGT-TA------CA---CAG-GAC-----G-TGT--TGA--T-ATCATT--TC--TACCAGCATAC-T-CTG--AGCGTTGTGT------CGTT-GGTT------------GTC---CG--------------AAT------C-ACC-----C--CCC--------CC--C-CCCCA----------AA-AT------TT--------G--T-----CG-T-TT-T-CAA---G-G-AT-CC---CTTTT-A-G-----C-ATT-A--A-T--TACT--AG-------AA--A--CACTG-GGCAG-TC--------------------C-TTTCC--AT-CT-------------------------TTGT-CC--G-AT---AA-TGTCC-ATGAA-AG-AA---T-AGT------A---T-------T-AGT-AA-GTTTC-T--TGA-C--A-C-A--AACA-TT--T--G-AAA--G-GA-----C---ATGA-C-A----GCC-A-C--T-CTCTGAAACATAGA
gi|95968                      :      aA-AGGT-G-T-A-CT-CAC-C-AT---C-ACAAACCG----A--------CA-TAT-C--CA-G--CCA-TCA-GGC---TTGTC-A-TTT-AAAACATAC-----TCAA-GA--AA------CA---CAA-GAA-----G-T-T--TGA--T-AGCA-T--TC--TACCAGCATA--C-CTG--A--------T------A--T-G--T------------GTC---TC-----AT----GTTGGT------T-GTC-----CAAATA--------CC--C-CCAAA----------AT-AA------TT-----------------CA-T-TT-T-C-A---A-G-AT-CC---TTTTC-A-G-----A-ATT-A--A-T--ATCT--A--A-----AA--A--CA-TG-GGAAG-TC--------------------A-TTTCC--AT-C--------------------------TTG
gi|95969                      : attaTTA-ATGT-G-T-A-CT-CAC-C-AT---C-ACAAACCG----A--------CA-TAT-C--CA-A--ACA-TCA-GGC---TTGTC-AATT--AAAACATAT-----TCAA-TA--TA------CA---CAA-GAA-----G-T-T--TGA--T-ATCA-T--TC--TACCAGCATA--T-CTG--A--------T------C--T-G--T------------GTC---AG-----AA----A--AAT------C-GCC-----C--CTC--------CC--C-CCTCC----------AT-TT------TT--------TTTTC----CA-T-TT-T-C-A---T-G-AT-CC---TTTTC-A-G-----A-ATC-T--A-T--ATCC--AG-A-----AA--A--CA-TG-GAAAA-TC--------------------C-TTTCC--AT-C--------------------------TTGT-CC--G-AA---AA-TGTCC-A--AA-AG-AA---C-AGT------A---T-------T-AGT-AA-G-TCC-T--GAA-C--A-CAA--AACA-TT--T--G-AAA--A-GG-----C---ATGA-C-A----GAC-A-C--T-CT-TGAAACATGGA
gi|95970                      :     TTT-ATGT-G-T-ATCT-CAC-TGAT---CGACAATCCG----A--------CA-TAT-C--CA-C--C-A-TCA-GGCGTATTGTC-A-TTGTAAGACATACATGTATCAA-TA--GA------CA---CAG-GAA-----G-T-T--TGA--T-ATAA-A--TT--TA-CAG--TA--T-TTG--A--------T------C--T-G--T------------GT----CG-----AA----A--ATT------C-GCC-----C--CAC--------CC--C----TC----------A----------TT--------T--TC----CATT-TT-T-C-A---T---AT-CC---TTTTC-A-G-----ATATT-A--A-T--ATCC--AG-ATAT--AT--A--CA-TG-TAAAA-TC------------------------TTC--AT-CGCT-----------------------TTGT-CC--G-AA---AA-TGT-C-A--AA-AG-AA---A-AGT------A---T-------TAAGT-AA-G-TCCTT--TAA-C--AGCAA--AAC--TT--T--G-AAA--A-GGAT---C---ATG
gi|95971                      :     TTACATGTCG-T-A-CT-CGA-C-AT---C-ACAATCCA----AACCATAAACA-TAT-CGCCA-CTACCAGTCA-GTCATTTTAAC-A-TTT-AAAACATTA-----GCAA-TA--TA------CA---CAG-GAA-----GTT-T--TGAACT-ATCA-T--CCCTTAACAGCATATGT-CTGTTA--------T------C--T-G--T------------GTC---CG-----AA----AC-AATGCCGCGC-GCCGGGCAC--CCCAA------CC--C-CCACCAATCTTCAAAAT-TT------TTATGC----T--TT----CA-TATT-T-C-AAGTT-G-AA-TCAAATTTTC-A-G-----A-ATT-AAGA-T--ATTC--AC-ATTACCAA--A---A-TT-TGAAACTC--------------------CATATCC--AT-C---------------------------TGT-CCTAG-AA---AA--GTCA-A--GA-AA-AA---C-AGCTCTTAAA---T-------A-AGT-AA-G-TCC-TACTAG-CGAA-CAT--AACA-TTTAT--G-AAAATA-GAAGAAGCACGATGA-C-ACAAGGTC-A-CGTT-CT-TGAA
gi|95972                      :      TA-ATGT-A-TTA-TT-TAT-A-AT---C-ACAATCCG----A--------CA-TAT-C---A-C--CCA-TCA-GGT--------------------ATAT-----T----TA--TA------CA---CAG-GGA-----T-T-T--TGA--T-GTCA-T--TT--TACCAGCATA--T-CTG--A--------T------C--T-G--T------------GTC---TGTTGGTAGTTCGA--AAT------C-------------CC--------CC--C-CCCCC----------AT-TT------TT--------T--TC----CAAT-TT-T-C-----T-G-AT-CC---TTTTC-A-G-----A-ATT-A--A-T--ATCC--AG-A-----AA--A--CA-TG-GGAAA-TC--------------------C-TTTCC--AT-C--------------------------TTGT-CC--G-AA---AA-TGTCC-A--AA-AG-AA---T-TTT------A---T-------T-AGT-AA-G-TTC-T--TAA-C--A-CAA--AACA-CT--T--G-AAA--A-GA-----C---ATGA-C-A----GCC-A-C--T-CT-TGAAACATGGA
gi|95973                      :       A-ATGT-G-T-A-CT-CAC-C-AT---C-ACAAACCG----A--------CA-TAT-C--CA-C--CCA-TCA-GGC---TTGTC-A-TTT-AAAACATAT-----TCAA-TA--TA------CA---CAG-GAA-----G-T-T--TGA--T-ATCA-T--TC--TAC-AGCATA--T-CTG--A--------T------C--T-G--T------------GTC---CG-----AA----A--AAT------C-G-------C--CCC--------CC--C-CCTTCAA--------ATATT------TT--------T--TC----CA---TT-T-C-A---T-G-AT-CCT--TTTTC-A-G-----A-ATTAA--A-T--ATCC--AG-A-----AA--A--GA-TG-GGAAA-TC--------------------C-TTTCC--AT-C--------------------------TTGT-CC--A---------------A--AA-AG-AA---C-AGT------A---T-------T-AGT-AA-G-TCC-T--TAA-C--A-CAA--AACA-TT--T--GAAAA--A-GA-----C---ATGA-C-A----GCC-A-T--C-TT-TGAAACATGGA
gi|95974                      :                 -A-CT-CAC-C-AT---C-AAAAACCG----A--------CA-TGTTC--CA-CG-CCA-TCA-GGC---TTGTCCA-TT--AAAACATAT-----TCAA-T---TA------CA---CAG-GAA-----G-TGT--TGA--TTATCA-T--AT--TACCAGCATA--TTCTG--A--------T------C--TTGC-T------------GTC---CG-----AAT---A--AAT------C-GTC-----C--TCC--------CC--C-CCTCC----------AT-TT------TT--------T--TTTCGTCA-T-TT-T-C-A---T-GCAT-CC---TTT-C-A-G-----A-ATT-A--A-T--ATCC--AG-A-----AA--A--CA-TG-CGGAA-TC--------------------T-CTTCC--AT-C--------------------------TTGT-CC--G-AA---AA-TGTC-----AA-AA-AA---C-AA-------G---T-------T-AG--AA-G-TCCTT--TAA-T--ACCAA--AACA-TT--T--GAAAA--A-GA-----C---ATGA-C-A----G-T-A-CA-T-CT-TGAAA
gi|95975                      :                                                                                                    AGACTTAT-----TCAA-GA--GA------CA---CAG-TAA-----G-T-T---GA--T-ATCA-T--TC--AATCAGCAT
gi|95975                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          acatccagcaatc--TC----CG-T-TT-A-C-A---A-A-AT-CA---TTTTC-A-GTAAGAA-AAA-A--A-T--ATCT--AG-A-----AA--ATGCA--G-AGAAG-TCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNN--NN-N--------------------------NNNN-NN--N-NN---NN-NNNNN-N--NN-NG-AA---C-AGT------A---T-------T-AGT-AA-G-TTC-T--TAA-C--A-TAA--AACT-TT--T--G-TAA--A-TA-----T---ATGG-C-A----GAC-T-C--T-CT-TGAAACATGGActgttggtactcggaataataacaaaaatccgtttacaaaatcattttcagtaagaaaaaaatatctagaaaatgcagagaagtcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaacagtattagtaagttcttaacataaaacttttgtaaatatatggcagactctcttgaaacatgga
gi|95976                      :             acatccagcaatcagacttattcaagagacacagtaagttgatatcattcaatcagcatctgttggtactcggaataataacaaaaaAAACATAT-----TCGA-GACGTAGAACCGCA---CAGAGAATTGGCA-T-T--TAA--TGATCA-TATTC--TACCAGC-TAG-T-CTG--AGGGTA---C------C--T-A--G------------GTC----G-----AG----AT-GAT------A-GAC-----T--CCCACTTTTCGCC--TACCTCC----------AT-AT------TTGTTGTATCC--TC----CA-T-TTGTGC-A---T-T-GTGCC---TGTTCTA-G-----A-ATT-A--A-TTTATCCTCAG-A-----AA--A--CA-TG-GAAAA-TC--------------------T-TTTCC--AT-C--------------------------TTGT-CC--T-AACCTAACTGTCC----AA-AG-AA---C-AGT------CCCTC-------T-GATAAA-G-TCC-T--TAACC--A-CAAATAGCAGCT--T--G-AAA--ACGAC----C---CTGAGC-C----ATC-A-C--T-C--TGGAACGTGGA
gi|95977                      :                                                                                                                                                                          C--TATCAGCGTG--T-CTG--A--------T------C--T-G--T------------TTC---TG----------------T------T-GAT-----C--ATT--------CAGGT-CATCA----------AT-GTA-----TT--------C--TC----TG-T-TT-T-C-A---G-C-AT-CA---TAATC-A-G-----ATATT-A----C--ATCT--AG-A-----A----------------------------------------T-TTTCT--AT-C--------------------------ATGC-CC--G-AA---AA-TGCCC-A--AAGAG-AA---T-AGT------A---T-------A-AGT-GA-G-TTC-T--TGA-T----------GGT-TT--T--G-AAA--A-GA-----C---ATAA-T-A----GAC-A-C--T-CT-TGAAACATGGA
gi|95978                      :                                                                                                                                                                          C--TATCAGCGTG--T-CTG--A--------T------C--T-G--T------------TTG---CG-----TT----G--GAT------C-ATT-----C--AGG--------TC--A---TCA----------AT-GT--------------------------A-T-TT-T-C-----T-G----------TTTC-A-G-----C-ATC-A--A-T--AATC--AG-A-----TATTG--CA-TCTAGAA--------------------------TTTCT--ATTC--------------------------ATGC-CC--G-AA---AA-TGCCC-A--AAGAG-AA---T-AGT------A---T-------A-AGT-GA-G-TT--T--TGA-T--G---------G-TT--TTGA-AAA--A-GA-----C---ATAA-T-A----GAC-A-CT-T-CT-TGAAACATGGA
gi|95979                      :                                                                                                                                                                                                                         ------------GTC---CG-----AA----T--AAT------C--CC-----C--CCC--------CC--C-CCCAA----------AT-AT------T-------------C----CA-T-TT-T-T-A---A-G-AT-CA---TTTTC-A-G-----A-ATT-A--A-T--ATCT--AG-A-----AT--A--CA-CG-GAAAG-TC--------------------C-T--CC--AT-T--------------------------TTGT-CC--G-AA---TA-TGTTC-A--AA-AG-AA---A-AGT------A---T-------T-AGA-AA-G-TTC-T--TAC-C--A-CAA--AACA-TT--T--G-AAA--A-GA-----C---ACGA-C-A----GCC-A-C--C-CT-TGAAACATGGA
gi|95980                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     T-T-C-A---A-G-AT-CG---TTTTC-A-G-----A-AAT-G--C-T--ATCT--AG-A-----AA--A--CA-AA-AGAAA-AT--------------------A-TTTC---AT-C--------------------------TTGC-TT--G-AA---AT-TATAT-A--AA-AA-AAAAAC-AGT------A---G-------T-AGT-AA-G-TTC-A--TAA-C--A-TAA--AACA-TT--T--G-AAA--A-GA-----T---ATGA-C-A----GAC-A-C--T-CT-TGCAACATGGA
gi|95981                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttca-A--A-T--TTCC--AG-A-----AA--A--CA-TA-GGAAA-TC--------------------C-TTTCC--AT-T--------------------------ATGT-CC--G-AA---AA-TGTCC-A--AA-AG-AA---A-GGT------A---T-------T-ATC-AA-G-TTC-T--GAA-C--A-CAG--AACA-TT--T--G-AAA--A-GA-----C---ATGG-C-A----GCC-A-C--T-C
gi|95982                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    --TAA-C--A-CAA--AACA-TT--T--G-AAA--A-GA-----C---ATGA-C-A----GTT-A-C--T-CT-TGAAATGTGGA


blockSeqs                     :        C    C G T T  T   A G  GAT C    T   CGAC ACCATAAA  A   G GC  G TA   G   T  CGTATTGTCATTGTAAGA       ATGTA    A  CG  GAACCG  AAT   A   TTGGCA  G CT   AC T    T AT  CT          TG T   TT ATCTAGTG TCGTGT GT T GT GTCCGAAACAATGCCGCGCGCCGGGCACCCCAACCCCCACCAATCTTCAAAATTTTTATGCTTT                                                        T A  G G A AGTT  C  G  AAA     T A TAAGA T   A AG T TT    TC  A TTACC  TT TG  C  T     T  AANNNNNNNNNNNNNNNNNNN      AT  T AGAGTTATATATGTCGTTTTCCCAAT    T  TA A  CCT  C     A TG  G  A  AAA A   TCTTAA CCT TACAATG A   A  T T   T AC   C GA G   AT    G  TA TG A   AT C  AGAAG ACG    G G CAAG   G C GT A  C
blockSeqs                     :        .    . . . .  .   . .  .   G    T   .    .         .   T .   . G    .   .  CATTTTAACATTTAAAA        .        .  T   A       .     .   GT      G .    .  G    . .   .           C  .   .  GCGTTGTG .      .  . G  GTCGAGATGATAGACTCCCACTTTTCGCCTACCTCCATATTTGTTGTATCCTC                                                                   A .  . . . TT    .  .  T       . . .     T   . .  . .     .   A TAT    .  .   .  .     C  CC                         .   . GCT                           .  .  .  .    .     . G   G  .  .   .   .      .   .       .   .  . .   T .    . .  C   .     .  .  .  A   .  .  AT    .      . . .      . . T  .  .
blockSeqs                     :        .    . . . .  .   . .  .   .    T   .    .         .   . .   . .    .   .  CTCGTCATTTAAAA           .        .  .   .       .     .   T       . .    .  .    . .   .           G  .   .  GGGTA    .      .  . C  GTCTGTCGGAAGTCCGAACCCATTCCCCCATATATAGTATAGTTT                                                                           . .  . . . T     .  .  T       . . .     .   . .  . .     .   A .      .  .   .  .     .  CA                         .   . T                             .  .  .  .    .     . .   .  .  .   .   .      .   .       .   .  . .   . .    . .  .   .     .  .  .  .   .  .  C     .      . . .      . . A  .  .
blockSeqs                     :        .    . . . .  .   . .  .   .    A   .    .         .   . .   . .    .   .  CTTGTCATTTAAAA           .        .  .   .       .     .   T       . .    .  .    . .   .           .  .   .  .        .      .  . .  TGGTAGTCCGATATATCCCCCCCCCCCTCCTCCCAAAATGTTTTC                                                                           . .  . . . T     .  .  .       . . .     .   . .  . .     .   A .      .  .   .  .     .  C                          .   . .                             .  .  .  .    .     . .   .  .  .   .   .      .   .       .   .  . .   . .    . .  .   .     .  .  .  .   .  .  .     .      . . .      . . T  .  .
blockSeqs                     :        .    . . . .  .   . .  .   .    A   .    .         .   . .   . .    .   .  CTTGTCATTTAAAA           .        .  .   .       .     .   T       . .    .  .    . .   .           .  .   .  .        .      .  . .  GTCTGTTGGTAAGTCACCCCACCCCCCCCACCCCTCAAAAATTC                                                                            . .  . . . A     .  .  .       . . .     .   . .  . .     .   . .      .  .   .  .     .  C                          .   . .                             .  .  .  .    .     . .   .  .  .   .   .      .   .       .   .  . .   . .    . .  .   .     .  .  .  .   .  .  .     .      . . .      . . .  .  .
blockSeqs                     :        .    . . . .  .   . .  .   .    T   .    .         .   . .   . .    .   .  CTTGTCAATTAAAA           .        .  .   .       .     .   G       . .    .  .    . .   .           .  .   .  .        .      .  . .  TGTAGTCCGAAATCCCCCCCCCCCCCCCATATAAGTGACGTTG                                                                             . .  . . . T     .  .  .       . . .     .   . .  . .     .   . .      .  .   .  .     .  C                          .   . .                             .  .  .  .    .     . .   .  .  .   .   .      .   .       .   .  . .   . .    . .  .   .     .  .  .  .   .  .  .     .      . . .      . . .  .  .
blockSeqs                     :        .    . . . .  .   . .  .   .    A   .    .         .   . .   . .    .   .  CTTGTCATTTAAAA           .        .  .   .       .     .   A       . .    .  .    . .   .           .  .   .  .        .      .  . .  GTCCGAATAAATCGTCCTCCCCCCCTCCATTTTTTTTTCGT                                                                               . .  . . . T     .  .  .       . . .     .   . .  . .     .   . .      .  .   .  .     .  C                          .   . .                             .  .  .  .    .     . .   .  .  .   .   .      .   .       .   .  . .   . .    . .  .   .     .  .  .  .   .  .  .     .      . . .      . . .  .  .
blockSeqs                     :        .    . . . .  .   . .  .   .    A   .    .         .   . .   . .    .   .  CTTGTCCATTAAAA           .        .  .   .       .     .   T       . .    .  .    . .   .           .  .   .  .        .      .  . .  GTCTGTTGGTAGTTCGAAATCCCCCCCCCCCATTTTTTTC                                                                                . .  . . . A     .  .  .       . . .     .   . .  . .     .   . .      .  .   .  .     .  C                          .   . .                             .  .  .  .    .     . .   .  .  .   .   .      .   .       .   .  . .   . .    . .  .   .     .  .  .  .   .  .  .     .      . . .      . . .  .  .
blockSeqs                     :        .    . . . .  .   . .  .   .    A   .    .         .   . .   . .    .   .  TTGTTATTTAAA             .        .  .   .       .     .   G       . .    .  .    . .   .           .  .   .  .        .      .  . .  TTCTGTTTGATTGTCTGAAAATCCCCCAACAATCATTTT                                                                                 . .  . . . T     .  .  .       . . .     .   . .  . .     .   . .      .  .   .  .     .  C                          .   . .                             .  .  .  .    .     . .   .  .  .   .   .      .   .       .   .  . .   . .    . .  .   .     .  .  .  .   .  .  .     .      . . .      . . .  .  .
blockSeqs                     :        .    . . . .  .   . .  .   .    A   .    .         .   . .   . .    .   .  G                        .        .  .   .       .     .   T       . .    .  .    . .   .           .  .   .  .        .      .  . .  GGCTGTTGGTAGTTGGACCCCCCCCCTAAAAAAAAATC                                                                                  . .  . . . T     .  .  .       . . .     .   . .  . .     .   . .      .  .   .  .     .  T                          .   . .                             .  .  .  .    .     . .   .  .  .   .   .      .   .       .   .  . .   . .    . .  .   .     .  .  .  .   .  .  .     .      . . .      . . .  .  .
blockSeqs                     :        .    . . . .  .   . .  .   .    T   .    .         .   . .   . .    .   .  C                        .        .  .   .       .     .   T       . .    .  .    . .   .           .  .   .  .        .      .  . .  GTCAGAAAAATCGCCCCTCCCCCCTCCATTTTTTTTTC                                                                                  . .  . . . G     .  .  .       . . .     .   . .  . .     .   . .      .  .   .  .     .  C                          .   . .                             .  .  .  .    .     . .   .  .  .   .   .      .   .       .   .  . .   . .    . .  .   .     .  .  .  .   .  .  .     .      . . .      . . .  .  .
blockSeqs                     :        .    . . . .  .   . .  .   .    T   .    .         .   . .   . .    .   .  A                        .        .  .   .       .     .   G       . .    .  .    . .   .           .  .   .  .        .      .  . .  GTCTCATGTTGGTTGTCCAAATACCCCCAAAATAATT                                                                                   . .  . . . A     .  .  .       . . .     .   . .  . .     .   . .      .  .   .  .     .  C                          .   . .                             .  .  .  .    .     . .   .  .  .   .   .      .   .       .   .  . .   . .    . .  .   .     .  .  .  .   .  .  .     .      . . .      . . .  .  .
blockSeqs                     :        .    . . . .  .   . .  .   .    T   .    .         .   . .   . .    .   .  C                        .        .  .   .       .     .   G       . .    .  .    . .   .           .  .   .  .        .      .  . .  GTCCGAAAAATCGCCCCCCCCCTTCAAATATTTTTTC                                                                                   . .  . . . T     .  .  .       . . .     .   . .  . .     .   . .      .  .   .  .     .  A                          .   . .                             .  .  .  .    .     . .   .  .  .   .   .      .   .       .   .  . .   . .    . .  .   .     .  .  .  .   .  .  .     .      . . .      . . .  .  .
blockSeqs                     :        .    . . . .  .   . .  .   .    A   .    .         .   . .   . .    .   .  C                        .        .  .   .       .     .   G       . .    .  .    . .   .           .  .   .  .        .      .  . .  GTCTGTTGGTAGTCCGAACCCCACTCCACAATTCC                                                                                     . .  . . . T     .  .  .       . . .     .   . .  . .     .   . .      .  .   .  .     .  C                          .   . .                             .  .  .  .    .     . .   .  .  .   .   .      .   .       .   .  . .   . .    . .  .   .     .  .  .  .   .  .  .     .      . . .      . . .  .  .
blockSeqs                     :        .    . . . .  .   . .  .   .    A   .    .         .   . .   . .    .   .  T                        .        .  .   .       .     .   G       . .    .  .    . .   .           .  .   .  .        .      .  . .  ATCTGTTGGTTGTCCAAATAATCCCCCCAAAAAT                                                                                      . .  . . . T     .  .  .       . . .     .   . .  . .     .   . .      .  .   .  .     .  C                          .   . .                             .  .  .  .    .     . .   .  .  .   .   .      .   .       .   .  . .   . .    . .  .   .     .  .  .  .   .  .  .     .      . . .      . . .  .  .
blockSeqs                     :        .    . . . .  .   . .  .   .    .   .    .         .   . .   . .    .   .  C                        .        .  .   .       .     .   T       . .    .  .    . .   .           .  .   .  .        .      .  . .  TTCTGTTGATCATTCAGGTCATCAATGTATTCTC                                                                                      . .  . . . T     .  .  .       . . .     .   . .  . .     .   . .      .  .   .  .     .  C                          .   . .                             .  .  .  .    .     . .   .  .  .   .   .      .   .       .   .  . .   . .    . .  .   .     .  .  .  .   .  .  .     .      . . .      . . .  .  .
blockSeqs                     :                 . .  .   . .  .   .    .   .    .         .   . .   . .    .   .  T                        .        .  .   .       .     .   G       . .    .  .    . .   .           .  .   .  .        .      .  . .  TTCTGTTGATAGTCCAACCCCCCACCCCATTA                                                                                        . .  . . . T     .  .  .       . . .     .   . .  . .     .   . .      .  .   .  .     .  T                          .   . .                             .  .  .  .    .     . .   .  .  .   .   .      .   .       .   .  . .   . .    . .  .   .     .  .  .  .   .  .  .     .      . . .      . . .  .  .
blockSeqs                     :                                                                                                            .        .  .   .       .     .   G       . .    .  .    . .   .           .  .   .  .        .      .  . .  GTCCGAATCACCCCCCCCCCCCCAAAATTTGT                                                                                        . .  . . . A     .  .  .       . . .     .   . .  . .     .   . .      .  .   .  .     .  T                          .   . .                             .  .  .  .    .     . .   .  .  .   .   .      .   .       .   .  . .   . .    . .  .   .     .  .  .  .   .  .  .     .      . . .      . . .  .  .
blockSeqs                     :                                                                                                            .        .  .   .       .     .   G       . .    .  .    . .   .           .  .   .  .        .      .  . .  GTCCGAATAATCCCCCCCCCCCCCAAATATTC                                                                                        . .  . . . T     .  .  .       . . .     .   . .  . .     .   . .      .  .   .  .     .  T                          .   . .                             .  .  .  .    .     . .   .  .  .   .   .      .   .       .   .  . .   . .    . .  .   .     .  .  .  .   .  .  .     .      . . .      . . .  .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                           .           .  .   .  .        .      .  . .  GTCGAAAATTCGCCCCACCCCTCATTTTC                                                                                           . .  . . . G     .  .  .       . . .     .   . .  . .     .   . .      .  .   .  .     .  C                          .   . .                             .  .  .  .    .     . .   .  .  .   .   .      .   .       .   .  . .   . .    . .  .   .     .  .  .  .   .  .  .     .      . . .      . . .  .  .
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 . .  . . . A     .  .  .       . . .     .   . .  . .     .   . .      .  .   .  .     .  C                          .   . .                             .  .  .  .    .     . .   .  .  .   .   .      .   .       .   .  . .   . .    . .  .   .     .  .  .  .   .  .  .     .      . . .      . . .  .   
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