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Alignments
lowQualScore : 1
lowQualScore : 2 2 4 2 4 1 1 1 33 1 1 3 1 222 1 1 3 1 1 2 33 4 2 2 2 3 2 2 33 2
lowQualScore : . . . . . . . . .. . . . . ... . . . . . . .. . . . . . . . .. .
lowQualScore : 2 2 4 2 6 5 5 5 55 5 5 0 5 666 5 5 0 5 5 2 11 4 2 2 2 3 2 2 11 2
consensus : TGATATGG-ATT-TGC-AGGG-C-TGAT-A-CAG-G--TT-AT-CA-G-CCCTA---GG-GCT-G-A-TA-CGG-C--TAT-TG-TGA-T-G-TCA-TC-T--G-TATCGCAC
Reference ( family-680 ) : TGATATGG-ATT-TGC-AGGG-C-TGAT-A-CAG-G--TT-AT-CA-G-CCCTA---GG-GCT-G-A-TA-CGG-C--TAT-TG-TGA-T-G-TCA-TC-T--G-TATCGCAC
gi|72924 : TGATATGG-ATT-TGC-AGGG-C-TGAT-A-CAG-G--TT-AT-CA-G-CCCTA---GG-GCT-G-A-TA-CGG-C--TAT-TG-TGA-T-G-TCA-TC-T--G-TATCGCAC
gi|72925 : TGATATGG-ATT-TGC-GGGG-C-TGAT-A-CAG-G--TT-AT-CA-G-CCCTA---GG-GCT-G-A-TA-CGG-C--TAT-TG-TGA-T-G-TCA-TC-T--G-TATCGCAC
gi|72926 : TGATATGG-ATT-TGC-AGGG-C-TGAT-A-CAG-G--TT-AT-CA-G-CCCTA---GG-GCT-G-A-TA-CGG-C--TAT-TG-TGA-T-G-TCA-TC-T--G-TATCGCAC
gi|72927 : TGATATGG-ATT-TGC-AGGG-C--GAT-A-CAG-G--TT-AT-CA-G-CCCTA---GG-GCT-G-A-TA-CGG-C--TAT-TG-TGA-T-G-TCA-TC-T--G-TATCGCAC
gi|72928 : TGATATGG-ATT-TGC-AGGG-C-TGAT-C-CAG-G--TT-AT-CA-G-CCCTA---GG-GCT-G-A-TA-CGG-C--TAC-TG-TGA-T-G-TCA-TC-T--G-TATCGCAC
gi|72929 : TGATATGG-ATT-TGC-AGGG-C-TGAT-A-CAG-G--TT-AT-CA-G-CCCTA---GG-GCT-G-A-TA-CGG-C--TAT-T--TGA-T-GTTCA-TC-T--G-TATCGCAC
gi|72930 : TGATATGG-ATT-TGC-AGG--C-TGAT-A-CAG-G--TT-AT-CAAG-C--TA---GG-GCT-G-A-TA-CGG-C--TAT-TG-TAA-T-G-TCA-TC-T--G-TATCGCAC
gi|72931 : TGATATGG-ATT-TGC-AGG--C-TGAT-A-CAG-G--TTTAT-CA-G-CCCTA---GG-G---G-A-TA-CGG-C--TAT-TG-TGA-T-G-TCA-TC-T--G-TAT-GCAC
gi|72932 : TGAAATGGCATT-TGC-GAGG-C-TGAT-AACAGAG--TT-AT-CA-G-CCCTA---GG--CT-G---TA-CGGGC--TAT-TG-TGA-T-G-TCA-TC-T--G-TATC
gi|72933 : TGATATGG-ATTGTGC-AGGG-CGTGAT-A-CAG-G--TT-AT-TA-G-CCTTA---GG-GCT-G-A-TA-CGG-C--TAT-TG-TGA-T-GTTTA-TC-T--G-TATAGC
gi|72934 : TGATATGG-ATT-TGCTTGAG-C--GAT-A-CAG-G---T-ATACA-G-CCCTA---GGAGCT-G-A-TA-CGG-C--TAT-TG-TGA-T-GTTCA-TC-TCCGTTATCGCAC
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gi|72936 : gGATATGA---T-TGC-AGGG-CGTGAT-A-CAG-G--TT-AT-GA-G-CCTTA---GG-GCT-GAA-TA-CGG-C---AT-TG-TGA-T-GTTCA-TC-T--G-TAT
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gi|72939 : ATGG-ATT--GC-AGGGTC-TGAT-A-CAG-G--TT-AT-CA-GACCCTAGGCGG-GCTGG-A-TA-CGG-CTTTAT-TG-T-A-T-G--CA-TC-T--G-TAT
gi|72940 : ATGG-ATT-TGC-AGGG-C-TGATCA-AAG-GAATA-AT-CAGG-CCCTA----G-GCT-GCATTA-CGG-C--TATATG-TGACT-GATCA-TC-T--G-TATCGCAC
gi|72941 : TGG-ATT-TGCGAGGG-C-TGAT-A-CAG-GA-TT-AT-CA-G-CCCTA----G-GCT-G-A-TA-CGG-C--AAT-TG-TGA-T-G-TCATTC-T--G-TATCGCAC
gi|72942 : -TGAT-A-CAG-G--TT-AT-CA-G-CCCTA---GG-G-T-G-A-TA-
gi|72943 : gc-TGAT-A-CAG-G--TT-AT-CA-G-CCCTA---GG-GCT-G-A-TA-
gi|72944 : -TGAT-A-CAG-G--TT-AT-CA-G-CCCTA---GG-GCT-G-A-TA-
gi|72945 : -TGAT-A-CAG-G--TT-AT-CA-G-CCCTA---GG-GCT-G-A-TA-
gi|72946 : GAT-A-CAG-G--TT-AT-CA-G-CCCTA---GG-GCT-G-A-TA-
gi|72947 : -TGAT-C-CAG-G--TT-AT-CA-G-CCCTA---GG-GCT-G-A-TA-
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gi|72949 : -TGAT-A-CAG-G--TT-AT-CA-G-CCCTA---GG-GCT-G-A-TA-
gi|72950 : -TGAT-A-CAG-G--TT-AT-TA-G-CCTTA---GG-GCT-G-A-TA-