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lowQualScore                  :   2   1  1 8 9  0000 9   9 66  8 33333 9 9      99  33 9  44 9 9  66 55 9  9 4 7 000 55 0  77  88 222      8  555  555 00000 55  2222 2222222 2222 0 0 0 666666666  555 999999  444444444 22 222  0  88 11 88 0  0 0 0  0 2222222  0 0 4444 999 0 0  0 66666 111   88  8888888888888888888888888888888888888 3  77777777  7 000000 7 8888 7777 7 7 22222  11 000  7777 44  88  00 7 00 7 33 6  6 6 6 11  1 1 5 0000000 5 5  5 777 5 11 5  6   5 5 66666666  5555555 666 77  888 5 5 5 5  2 1  1  77  11  11 6 2  222 222 888 5 777   88   44444444444444 44444 77 22 22 222 5 5 33 5 777  5   5 5 1 999 1 222 6 00000 00000  6   2 6 000  6  33  8888   33    
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Reference ( gi|22028 )        :  GGAAT-TC-G-A-AT----T-TTG-G--GA-G-----A-A-AACGGC-GTG--A-TT--T-A-TT--T--A-AA-TCA-A---A--G-TGG-TT--T---TTATCAGTT---GC---T-----A--CT----A----T--A----T-T-A-A---A-----TA---T----CAGAT---T----A-TG---TA-TA--T-TT--G-GT-T-A-TT-T--AA---GC-A-C--A-CA--T-T-CC-C--C--GC--TTG--AA--C-----A--CT--G-ATT--AC----A---C----A-AA--------TT-T------G-G-G--A----A-A-A-----AT--T---TG----G--TG--TC--C-G--C-C--A-TT-T-T-G--AA-T-C-G-------C-C-AT-T---T-T--G-AC-CTA-C-T--------TA-------A-A-G--CC---A-T-T-T-TC-A-TG-AA--GG--CC--A-G-CA---T---A---T-T---TTT--TCG-G-A--T-------T-----C--A--G--C---A-T-A--C-T---CG-AAA-T-A-G---G-T---T-A-----A-----AA-AAC-T-A---TGCTG--GA----CCA--AATA
gi|22031                      :  GAAAT-TC-G-A-AT----T-TTG-G--GA-G-----A-A-ACAGGC-GTG--A-TT--T-A-TT--T--A-AA-TCA-A---A--G-TGT-TT--TA--TTATCAGTT---GC---T-----A--CT----A----T--A----T-T-A-A---AAA---TA---T----CAGAT---T----A-TG---TA-TA--T-TT--G-GT-T-A-TT-T--AA---GC-A-C--A-CA--T-T-CC-C--C--GC--TTG--AAA-C-----A--CT--GGATT--AC----AGCAC----A-AA--------TT-T------G-G-G--A----A-A-A-----AT--T---TG----G--TG--TC--C-G--C-C--A-TT-T-T-G--AA-T-C-G-------C-C-AT-T---T-T--G-AC-CTA-C-T--------TA-------A-A-G--CC---A-T-T-T-TT-A-TG-AA--GG--CC--A-G-CA---T---A---T-T---TTT--TCG-G-A--T-------T-----C--A--G--C---A-T-A--C-T---CG-AAA-T-A-G---G-T---T-A-----A-----AA-AAC-T-A---TGCTG--GA----CCA--AATA
gi|22030                      :  GAAAT-TC-G-A-AT----T-TTG-G---A-G-----A-A-AACGGC-GTG--A-TT--T-A-TT--T--A-AA-TCA-A---A----TGG-TT--T---ATATCAGTT---GC---T-----A--CT----A----T--A----T-T-A-A---A-----TA---TAT--CAGAT---T----A-TG---TA-TA--T-TT--G-GT-T-A-TT-T--AA---GC-A-C--A-CA--T-T-CC-C--C--GC--TTG--AA--C-----A--CT--G-ATT--AC----A---C----A-AA--------TT----------G-G--G----A-A-A-----AT--T---TG----G--TG--TC--C-G--C-C--A-TT-T-T-G--AA-T-C-G-------CAC-AT-T---T-T--G-AC-CTA-C-T--------TA-------A-A-G--CC---A-T-T-T-TC-A-TG-AA--GG--CA--A-G-CA---T---A---T-T---TTT--TCG-G----T-------T-----C--A--G--C---A-T-A--C-T---CG-AAA-T-A-G---G-T---T-A-----A-----AA-AAC-T-A---TGCTG--GA----CCA--AATA
gi|22032                      :  GAAAT-TC-G-A-AT----T-TTG-G--GA-G-----A-A-AACGGC-GTG--A-TT--T-A-TT--T--A-AA-T-A-A---A--G-TGT-TT--A---TTATCAGTT---GC---T-----A--CT----A-------A----T-T-A-A---A-----TA---TAT--CAGAT--------A-TG---TA-TA--T-TTT-G-GT-T-A-TT-T--AA---GC-A-C--A-CA--T-T-CC-C--C--GC--TTG--AA--C-----A--CT--G-ATT--AC----AG--C----A-AA--------TT-T------G-G-G--A----A-A-AA----AT--T---TG----G--TG--TC--C-G--C-C--A-TT-T-T-G--AA-T-C-G-------C-C-AT-T---T-T--G-AC-CTA-C-T--------TA-------A-A-G--CC---A-T-T-T-TC-A-TG-AA---G--CC--A-G-CA---T---A---T-T---TTT--TCG-G-A--T-------T-----C--A--G--C---A-T-A--C-T---CG-AAA-T-A-G---GTT---T-T-----A-----AA-AAC-T-A---TGCTG--GA----CCA--AATA
gi|22034                      :  GAAAT-TC-GGA-AT----T-TTG-G--GA-G-----A-A-AAACGC-GTG--A-TTG-T-A-TT--T--A-AA-TCA-A---AA-G-TGG-TT--TA--TTATCAGTT---GCCCCT-----A--CT----A----C--A----T-T-ATA---A-----TA---TTATTCAGAT---T----A--G---TA-TA--T-TT--G-GT-T-A-TT-T--TATATGCCA-C--A-CA--T-T-CT-C--CCGGC--TTG--AA--------A--CT--G-ATT--AC----A---C----A-AA--------TT-T------G-G-A--A----A-A-A-----AT--T---TG----G--TG--TC--C-G--C-C--A-TT-T-T-G---A-T-C-G-------C-G-AT-T---T-T--G-AC-CTA-C-T--------TA-------A-A-G--CCA--A-T-T-T-TC-A-TG-AA--GG--CC--A---CA---T-------T-T---TTT--TCG-G-A--T-------T-----CA-A--G--C---A-T-A--C-T---CGAAAA-T-ATG---G-T---T-A-----A-----AA-AAC-T-A---TGCTG--GA----CCA--AA
gi|22038                      :  GAAAT-TC-G-A-AT----TCTTG-G--GA-G-----A-A-ACCGGC-GTG--A-TT--T-ACTT--T--A-CA-TCA-A---A--G-TGG-TT--TA--TTATCAGTT---GC---T-----A--CT----A----T--A----T---A-T---A-----TA---T----CTGAT---T----A-TG---TAATAA-T-TT--G-GT-TTA-TT-T--GA---GA-G-C--AGCAATT-T-CC-C--C--GC--TTG--AA--C-----AG-CT--G-ATT--AA----AGGAC----A-AA--------TT-T------GAG-G--A----A-A-A-----AT--T---TG----G--TGAATC--C------C--A-TT-G-T-G--AAAT-C-G-------C-A-AT-T---T-T--G-AC-CAC-C-T--------TA-------A-A-G--CCG--A-TCT-T-TC-AGTG-AAA-GG--CC--A-G-CA---T---A---TAT---TTTA-TCG-G-A--T-------TT----C--AC-A--C---A-T-A--C-T---CG-AAA-T-A-G---G-T---T-A-----A-----AA-AAC-TCA---TGCTG--GA----ACA--TATA
gi|22039                      :  GAAAT-TC-G-A-AGA---T-TTG-G--GA-G-----A-A-A-CGGC-GTG--A-TT--T----T--T--ATAA-TCA-A------G-TGGATT--TA--TTATCA-TT---CC---T-----A--CT----A----T--A----T-T-A-T---A-----TA---T----AAGAT---T----A--G---TAATAAGT-TT--G-TG-T-A-TT-T--AT---GC-A-C--AGCA--T-T-TC-C--C--GC--TTT--AA--C-----A--AT--G-ATT--AC----A---C----A-AA---------T-T------G-G-G--A----A-A-A-----TT--T---TG----G--TG--TC--C-G--C-CTTG-TT-A-T-GGCAT-T-C-G-------C-C-AT-T---T-T--G-AC-C-A-C-T--------TAAAG----A-A-G--CC---AGT-T-T-TCGA-TGAAA--GG--CC--AGG-CA---T---A---T-T---TTT--TCG-G-A--T-------T-----C-----G--C---A-T-A--C-T---CG-AAAGT-A-G---G-T---T-A-----A-----AA-A---T-A---TGCTGGAGA----CCA--
gi|22033                      :  GAAAT-TCCG-A-AT----T-TTT-G--GA-GG----A-A-AACGGC--TG--C-AT--T-A-TT--T--T-AA-CTA-A---A--G-TAA-CT--TCA-TTTCTA--T---GC---T-----A--TT----A----G--AATGTT-T-A-A---A-----TA---T------GTA---T----A-AG---TA-TA--T-ACAAG-GC-T-A-TT-T--CG---GC-A-T--C-C---T-T-TC-T--A--GG--TTG--AG--C-----G------G-CTTCAAC----G---G----AGAA--------TT-T------G-G-A--A----A-AGA-----AT--T---TG----G--TG--TC--C-G--C-C--A--T-T-T-G--AA-T-C-G-------C-C-A--T---T-T--G-ACACTA-C-T--------TA-------ACG-G--CC---A-T-T-T-TC-A-TG-AA--GG--CC--A-G--A---T---A---T-T---TTTTGTCGTT-A--T-------T-----C--A--A--CA--A-T-A--CAT---CG--AA-T-A-G---G-T---T-A-----A-----AA-AAC-T-AG--TGTTG--GAATACCCA--AATA
gi|22035                      :  GAAAT-TC-G-A-AT----T-TTG-G--AG-G-----A-A-AACGGC--TGGCA-TA--T-A-TT--T--A-AC-T-------A--A-TAC-TTCAT---TTCT-AGCT---AT---TTAGAAA--CT----G----T--T----T-T-A-A---------TA---T----GAAAT---A----A--G---TA-TA--T-ACAAG-GC-T-A-TT-TC-GG---GC-A-T--C-CT--T-T-CT-A--G--G----TG--AG--C-----G------G-CTT------------C----A-AC--------------------G-G--A----G-A-ATT---ATAAT---TG----G--TG--TC-------------------T-G--AA-T-C-G-------C-C-TT-T---T-T--G-AC-CTA-C-T--------TA-------A-C-G--CC---A-T-T-T-TC-A-TG-AA--AG--CC--A-G-CA---T---A---G-TGGGTTG--TCG-T-A--T-------T-----CCAG--G--C---A---A--C-T---CG-AAA-T-A-GC--G-T---T-------A-----AA-AAC-T-A---
gi|22029                      :   GAAA-TC-G-A-AT----T-TTT-G--GA-GGA---A-A-AACGGC--TGC-A-----T-A-TT-------AA-CTA-A---A--G-TAC-TT--C---ATTTC--TA---GC---T-----A--TTAGAAA----T--G----T-T-T-A---A-----TA---T----GAAA----T----A-AG---TA-TA--T-ACAAG-GC-T-A-TT-T--CG---GC-A-T----CC--T-T-TC-T--A--G---TTG--AG--C-----G------G-CTTCAAC----G---G----AGAA--------TT-T--------G-G--A----A-A-A-----AT--T---TG----G---G--TC--C-G--CGC--A-TT-T-T-G--AA-T-C-G-------C-C-AT-T---T-T--G-AC-CTA-C-T--------TA-------A-C-G--CC---A-T-T-T-TC-A-TG-AA--GG--CC--A-G-CA---T---A---T-T---TTT--TCG-T-A--T-------T-----C--A--G--C---A-T-A--C-T---CG-AAA-T-A-G---G-T---T-A-----A-----AA-A---T-A----GTTG--GA----CCA--AATA
gi|22047                      :    AAT-TC-G-A-ATAATTT-TCG-G--GA-G-----A-A-AACG-C-GTG--A-TT--T-A-TT--T--A-AA-TCA-A---A--G-TGG-TT--TA--TTATCAGTT---GCA--T-----A--CT----A----T--A----T-TAA-A---A-----TATATT----CAGA----T----A-TG---TC-TA--TGTT--G-GT-T-A-TT-T--AA---GC-A-C--A-CA--T-T--C-C--C--GC--TTGAAAA--C-----AACCTGAG-ATT--ACAATAA---CAA--A-AA--------TTAT------G-GAG--A----A-A-AAAAATAC--T---T-----G--TG--TC--C-G--C-A--A-TT-T-T-G--AA-T-C-G-------C-C-AT-T---C-TTAGCAC-CT--T-T--------TA-------A-A-G--CC---A-T-T-T-TC-A-TG-AA--GG--CC--A-GACAT--T---A---T-T---TTT--TCG-G-AC-T-------T-----C--A--G--C---A-TAA--C-T---CG-AAA-T-A-A---G-T---T-A-----ATTGCTAA-AACAT-AT--TGCTG--GA----CCA--
gi|22043                      :    AATATC-G-A--T----T-TTG-A--GC-G-----AGA-AACGGC-GTG--A-TT--TTA-TT--T--A-A---CA-AGT-A--G-GTG-TT--TACATTATCAGTT---GC---T-----AA-CT----A----TCTA----T-T-A-ACATA-----TA---T----C-GAT---T----A-TAAGTTA-TA--T-TT--T-GT-T-A-TT-TTTAA---GC-A-CTCA-CA--T-T-CC-CACC--GC--T-G--AAACC-----A--CT--G--TT--AC----AG--C----A-AAGT------CT-T------G-G-G--AGAACA-A-A-----AT--T---TG----G--TG--TCA-C-G--C-C--A-TT-T-T-G--AA-T-C-G---------C-AT-T---T-T--T-AC-CTA-C-T--------TA-------A-A-G--CC---A-T-T-T-TCGA-TG-AA--GA--C-----G-CATATT---A---T-T---TTT--TCG-G-A--A-------T-----C--AT-G--C---A-T-A--C-T---CG-AAA-T-AGG---G-T---T-A-----A-----AA-AAC-T-AATCCGCTG--GA----CCA--AATA
gi|22040                      :   aAAT-TC-G-A-AT----T-TTT-G--GA-G-----G-A-AACGGC--TG--C-AT--T-A-TT--T--A-AC-TAATA---C--T-TCA-TT--T---CTA---------GC---T-----A--TT----AGAAAT--G----T-T-T-A---A-----TA---T----GAAAT---A----A--G---TA-TA--T-ACAAG-GC-T-A-TT-T--CG---GC-A-T--C-CT--T-T-TC-T--A--GG--TTG--AG--C-----G------G-CTTCAAC----G---G----AGAA--------TT-T------G-G----A----A-A-A-----AT--T---TG----G--TG--TC--C-G--C----A-TT-T-T-G--AA-T-C-G-------C-C-AT-T---T-T--G-AC-CTA---T--------TA-------A-C-G--CC---A-T-T-T-TC-A-TG-AA--GG--CC--A-G-CA---T---A---T-T---TTT--TCG-T-A--T-------T-----C--A--G--C---A-T-A--C-T---CG-AAA-T-A-G---G-T---TAA-----A-----AA-AAC-T-A---TGTTG--GA----CCA--AATA
gi|22045                      :   aAAT-TC-G-A-AT----T-T-G-G--GA-G-----A-G-A-CGGC-GTG--A-TT----G-TT--T--A-AACTCA-AGATA--GCTGG-TT--T---TATTCATAT---GC---T--------CT----A----A--A----T-T-A-A---AG----TA---A----C-GATC--T----A-TGAC-TA-TA--T-TT--A----T---TT-T--AA---GC-A-C--A-CA--T----C-C--C--GT--T----AA--C-----A--CT--G-AAA--GC----A---C----A-AT--------TT-G------G-G-G--A----ACA-A-----AT--TAAGTACAATG--TG--TC--C-G--C-C--A-TT-----G--AA-T-CCG-------C-C----T---T-T--G-ACACTA-C-T--------TATTTT---A-A-G--CC---A-T-TAT-CC-A-TT-GA--AG--CC--A-G-CA---T---A---T-T---TTT--TGG-G-A--TC------T-----C--A--G--C---A-T-A--C-T---CG-AAA-T-G-G---GATGTAT-A-----A-----AA-AAC-T-A---TG-TG--GAGT--CCA--AATA
gi|22046                      :   aAAT-TC-G-A-AT----T-TTTTG--GA-G-----G-A-AACGGCTGCG--A-TT----A-TT--T--A-----CT-A---A--G-TAA-CT--T-------CATTTCTAGC---T-----A--TT----AGAAAT--G----T-T-A-A---T-----TA---T------GAA---T----A-AG---TA-TA--T-ACA-G-GC-T-A-TT-T--CG---GC-A-T--C-CT--T-T-TC-T--A--GG--TTG--AG--C-----G------G-CTTCAAC----G---G----AGAA--------TT-T------G-G-A--A----A-A-A-----TT--T---TG----G--T---TC--C-G--C-C--A-TT-T-T-G--AA-T-C-G-------C-C-A--T---T-T--G-A--CTA-C-T--------TA-------ACC-G--CC---A-T-T-T-TC---TGTAA--GG--CC--A-G-CA---T---A---T-T---TTT--TCG-T-A----------T-----C--AGCG--C---A-T-A--C-T---CG-AAA-T-A-G---------T-A-----A-----AA-AAC-T-A---TGTT---GA----CCA--AATA
gi|22041                      :   aAAT-TC-GCA-AT----T-TTG-G--AG-G-----A-A-AACGGC--TGC-A-TTAAA-A-TT--T--A-AA-CTA-A---A--
gi|22044                      :   aAAT-TC-G-A-AT----T-TTC-G--GATG-----A-A-AACGGC-GTGC-A-TA--T-A-TT--T--A-TA-CTACA---A--G-TA----------CTA--AATT---TC---C-----A--CT---------C--A----T-T-A-A---AATTTTTA---G----CAGAAACAT----A-AG---TAATA--C-AA--G-GC-T-ACTT-T--CG---GC-A-T--C-CT--T-T-CT-A--G--GA--TTG--AG--CGGCCAA--CT-----TT--A--------------G-AA--------TC-T------G-G-A--A----A-A-A-----AT--T----G----G--TAGTTC--C-GG-C-C--A-ATAT-T-G--AA-T-C-G-------C-C-AT-T--------G-AC-CTA-C-T-------------------A-A--CC---T-T-T-T-TC-A-TG-AA--GG--CCTAG-G-CA---T-------T-T---ACT--AC-------T-------T-----C--A--GT-C---A-T-A--C-T---CA-AAA-C-A-GCG-G-G---T-A-----A-----AA-AAC-T-A---CATTG--GA----CCATTAATAtgctacttcatttctaggcttattagaaatgttttaatatgaacataagtatccgtacaaggctatttcggcatccttcgttttctagttaagtcgtgccttcaacgagaatattgaggaaaattttggtgtccgagccattttgaatgctccattttgacctaactataacgtgtagacgcccatatttatcaatgaaggccagacatattttttcgatacagcataatcttcacgaaattagtgttaaaaaaactatgttggaccaaata
gi|22036                      :     aT-TC-G-A-AT----T-TTG-G--AA-GCGATGA-A-AACGCC-GTG--A-TTG-T-A-TT--T--A-AA-TCA-A---AAAG-TGG-TT--TA--TTATCAGTT---GC---T-----A--CT----AG---T--A----T-T-A-A---ACTA--TA---TG---CAGAT---T----A-TG---TA-TA--T-TT--G-GT-T-A-TT-T--AA---GC-A-C--A-CA--TCT-CCAC--T--GCAATTG--AA--CT----A--CTG-G-ATT--AC----A---CACCTA-AA--------TT-T------G-G-GAAA----A-A-A-----AT--T---GG----G--TG--TT--C-C--C-C--A-TT-T-T-G--AA-T-C-G-------C-C-ATGT---T-T--G-AC-CTA-CTT--------TA-------A-A-GC-CC---A-T-T-T-TC-A-TG-AA--GG--CC--A-GTCA---T---A---T-T---TTT--TCG-G-A--CA------TATGCAC--A--G--C---A-T-A--C-T---CG-AAA-T-A-G---G-T---T-A-----A-----AA-TAC-T-A---TG-TC--GA-----CA--AATA
gi|22048                      : gaaatT-CC-G-ACAT----T-TTG-GACGA-G-----A-ATAACGGC-GTG--A-TT--T-A-TTGAT--A-AA-TCACA---A--G-TGG-TT--TA--TCTTCAGTTC--GC---T-----A--CT----A----T--A----TCT-A-A---AGTA--TA---T----CAGAT---T----A-TG---TA-TA--T-TT--GAGTAT-A-TTAT--AA---GC-A-C--A-CA--T-T-CC-C--C--GC--TTG--AA--------A--CT--G-ATT--AC----A---CA---A-AA--------TT-C------G-GCG--A----A-A-A-----A---T---TG----G--TG--TC--C-G--C-C--ATTT-T-T-G--AA-T-C---------C-C-AT-T---T-T--G-A--CTA-C-T--------TA-------A-A-G--CC---A-T-T-T-TC-A-TG-AA--GG--CT--AGG-CA---T---ACATT-T---TTT--TCG-G-ATCT-------T-----C--A--GCCC---A-T-C--A-T---CG-GAA-A-A-GGCTG-T---T-A-----A-----AA-AAC-T-A---TGCT---GA----CCA--AATA
gi|22037                      :      T-TC-G-A--T----T-TTT-G--GA-G-----G-A-AACGGC-TTG--C-AT--T-A-TT--T--A-AC-T-A-A---A--G---A-CT--T-------CATTT----C---T-----AAGCT----A----T--A----G---A-A---A-----TG---TTTTACATAC---TGAAAA-GG---TA-TA--T-ACAAG-GCCT-A-TT-T--CG---GC-A-T--C-CT--T-T-CT-C--T--AG--TTG--AG--C-----G--CC-----TTCAACGG--A---G----A-AT--------TT-T------T-G-G--A----A-A-A-----AT--T---TG----GGGTG--TC--C-G--C-C--A-TT-T-T-G--GA-T-C-G-------C-C-AT-T---TAT--G-AC-CTA-C-T--------TACCACGTTA-A-GACCC---A-T-T-T-TC-A-TG--A--GG--CC--ACG-CA---T---ATT-T-T---TTT--TCG-T-A--T-------T-----C--A--G--C---AGT-AC-C-T---CG-AAA-T-A-G---G-TG--T-A-----A-----AA-AAC-T-A---TGTT---GA----CCA--AATA
gi|22049                      :      gaaaat-A-AT----T-TTG-G--GTTG-----A-A-AACGGCCGTG--AATT--T-A-TT--TA-A-AA-TCA-A---A----TGG-TT--A---TTATCA-TT---GC---T-----AGCCT----A-------A----T-T-A-A---T-----AA---T----CAGAT---T----A-TG---TA-TA----TT--G-GT-T-A-TT-T--AA---GC-ACC--A-CA--T-TACC-C--C--GC--TT---AA--C-----AC-CT--G-ATT---C----A---C----A-AA--------TT-T------G-GCG--A----A-A-A-----AT--T---TG----G--TG--TC--CGG--C-C--A-TT-T-T-G--AATT-C-G-------C-C-AT-TCTCC-T--G-ACGCTA-C----------TA-------A-A-G--CC---A-T-T-T-TCAA-TG-AA--GGGCCC--A-G-CA---T---A---A-T---TTT--TCG-GAA--T-------T-----C--A--G--CACTA-T-A--C-T---C--AAA-T-A-G---G-TTA-T-A-----A-----AA-AAC-T-A---TGCTG--GA----CCA--AA
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gi|22042                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ----A-AA--------TT-T------G-G----A----A-A-A-----AT--A---TT----A--TG--TCGTC-G--C-C--A-TT-T-TTG--AA-T-C-G-------C-CAAT-T---T-T--G-A--CTA-C-T--------TA-------A-C-G--CC---A-T-T-T-TCTA-TG-AAAGGA--CC--A-GTCA---TATCA---T-T---CTT--TCG-T-A--T-------T-----C--A--G--C---A-T-AACT-T---CG--AA-T-A-G---G-T---T-A-----A-----AA-AACGT-A---TGTTG--GA----CCA--TATA
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Reference ( family-676 )      :                                                                                                                                                             GAAA--T-T-C-G-A-AT----T-TTG-G--GA-G-----A-A-AACGGC-GTG--A-TT-T-A--TT--T--A-AA-TCA-A---A--G-TGG-TTT--A--TTATCAGTT-GC---T-----A--CT----A----T--A----T-T-A--A---A-----TA---T----CAGAT---T----A-TG----T-A--T-A--T-TC--G------G-T-TA-TT-T--AA---GC-A-C--A-C---A--T-T-CC-C--C--GC--TTG--AA--C-----A--CT--G-ATT---A---C----A---C----A-AA--------T-T-T------G-G-G--A----A-A-A-----AT--T---TG----G--TG--TC--C-G--C-C--A-TT-T-T-G--AA-T-C-G-------C-C-AT-T---T-T--G-AC-CTA-C-T--------TA-------A-A-G--CC---A-T-T-T-TC-A-TG-AA--GG--CC--A-G-CA---T---A---T-T---TTT--TCG-G-A--T-------T-----C--A--G--C---A-T-A--C-T---CG-AAA-T-A-G---G-T---T-A-----A-----AA-AAC-T-A---TGCTG--GA----CCA--AATA
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gi|22042                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ----A-AA--------T-T-T------G-G----A----A-A-A-----AT--A---TT----A--TG--TCGTC-G--C-C--A-TT-T-TTG--AA-T-C-G-------C-CAAT-T---T-T--G-A--CTA-C-T--------TA-------A-C-G--CC---A-T-T-T-TCTA-TG-AAAGGA--CC--A-GTCA---TATCA---T-T---CTT--TCG-T-A--T-------T-----C--A--G--C---A-T-AACT-T---CG--AA-T-A-G---G-T---T-A-----A-----AA-AACGT-A---TGTTG--GA----CCA--TATAgaaaatgttttttaatatagaaaataagtagtatacaaggctaatatcgggatcttctctagggttgtatgcggcttcacatcggagtaaatttggaaaaatattatgtcgtcgccatttttgaatcgccaattttgactacttaacgccattttctatgaaaggaccagtcatatcattctttcgtattcagcataacttcgaataggttaaaaaacgtatgttggaccatata
gi|22043                      : aaatttcgaatcttttggagaaacgtcttgcattattttaactaacagtaacttccatttctgctattagaaaatgttttttaatatagaaaataagtagtatacaaggctaatatcgggatcttctctagggttgtatgcggcttcacatcggagtAAA--TAT-C-G-A--T----T-TTG-A--GC-G-----AGA-AACGGC-GTG--A-TT-TTA--TT--T--A-A---CA-AGT-A--G-GTG-TTT--ACATTATCAGTT-GC---T-----AA-CT----A----TCTA----T-T-A--ACATA-----TA---T----C-GAT---T----A-TAAGT-T-A--T-A--T-TT--T------G-T-TA-TT-TTTAA---GC-A-CTCA-C---A--T-T-CC-CACC--GC--T-G--AAACC-----A--CT--G--TT---A---C----AG--C----A-AAGT------C-T-T------G-G-G--AGAACA-A-A-----AT--T---TG----G--TG--TCA-C-G--C-C--A-TT-T-T-G--AA-T-C-G---------C-AT-T---T-T--T-AC-CTA-C-T--------TA-------A-A-G--CC---A-T-T-T-TCGA-TG-AA--GA--C-----G-CATATT---A---T-T---TTT--TCG-G-A--A-------T-----C--AT-G--C---A-T-A--C-T---CG-AAA-T-AGG---G-T---T-A-----A-----AA-AAC-T-AATCCGCTG--GA----CCA--AATA
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