lowQualScore : 1 1 111 111111 11111 11111 111111 1 3333 111111 11111111 22222222 1111111111111 22222222 111111111111111111 1111
lowQualScore : 3 1 6 3 4 2 2 2 000 2 2 2 2 5 0 2 33 6666 9 999999 2 2 44444 88 3 6 3 3 3 3 55555 3 1 111111 6666 33 5 2 1 2 2 2 444 2 2 33 2 2 2 2 2 2222 2 2 2 55555 444444 4444 2 333 2 99999 2 999 55 2 22222222 5555 2 2 2 4 11111111 2 4444444444444 1 55555 6 2 6 66666666 33 55 99 77 2 666 2 222222222222222222 22 4 333 4 22 3333 333 66 22 1 44 555 1 22 1 1 1 5555 1 1 1 44444 1 3
lowQualScore : . . . . . . . . ... . . . . . . . .. .... . ...... . . ..... .. . . . . . . ..... . . ...... .... .. . . . . . . ... . . .. . . . . . .... . . . ..... ...... .... . ... . ..... . ... .. . ........ .... . . . . ........ . ............. . ..... . . . ........ .. .. .. .. . ... . .................. .. . ... . .. .... ... .. .. . .. ... . .. . . . .... . . . ..... . .
lowQualScore : 1 2 2 1 8 2 9 9 000 9 9 9 9 3 1 7 77 7777 6 333333 9 9 88888 99 1 7 3 3 1 1 44444 1 9 111111 1111 77 3 7 3 5 5 4 444 5 5 44 5 5 5 5 5 7777 5 2 2 44444 222222 7777 2 999 2 44444 2 222 33 5 66666666 0000 4 4 4 7 77777777 4 9999999999999 8 66666 7 2 7 88888888 11 33 77 55 2 888 2 444444444444444444 99 2 555 0 88 5555 555 55 66 9 55 888 7 44 7 7 7 4444 7 8 8 55555 8 6
consensus : TTTTA-AAAACTTCAC-AAAANTTTTATATTT-AATGTT-AT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTCA-CTCAAGAT-TCAT--GACAAA--TGTTACTTTAAATG------GTA-TT-TTTT--A--TATTTTTGTGTGGG-TCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCAN-TTGAGT-GTTA-AAAA-C----CGTA------A----CA-CA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------ATA----GTA-A-C-AGAT-TT----A--AATC-T-AGGC-A-A----TTATG-----CATG-AT-T-TGTGAGAN--TTTTATAGT--TATG--AC--TGCA--GT-A-G-AAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AAAAA---AAT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
Reference ( gi|90608 ) : TTTTA-AACACTTCAC-AACATTTTTATATTT-AATGTT-AT---TATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTCA-CTCAAGAT-TCAT--GACACA--TGTTACTGTAAATG------GTA-TT-TTTT--A--TATTTTTGTGTGGG-TCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-AAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCAT-TTGAGT-GTTA-AAAA-C----CGTA------A----CA-CA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------ATA----GTA-A-C-AGAT-TA----A--AATC-T-GGGC-A-A----TTATG-----CATG-AT-T-TGT-AGAG--TTTTATAGT--TATG--AC--TGCA--GT-A-A-AAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AAAAA---AAT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90609 : TTTTA-AACACTTCAC-AACATTTT-ATATTT-AATGTT-AT---TATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTCA-CTCAAGAT-TCAT--GACACA--TGTTACTGTAAATG------GTA-TT-TTTTT-A--TATTTTTGTGTGGG-TCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-AAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCAT-T-GAGT-GTTA-AAAA-C----CGTA------A----CA-CA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------ATA----GTA-A-C-AGAT-TA----A--AATC-T-GGGC-A-A----TTATG-----CATG-AT-T-TGT--GAGGTTTTTATAGT--TATG--AC--TGCA--GT---A-AAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AAAAA---AAT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGGGT
gi|90610 : TTTTA-AAAACTTCAC-AAAAATTTTATATTT-AATGTT-AT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCATAATTCA-CTCAAGAT-CCAT--GACAAG--TGTTACTTTAAATG------GAA-TT-TTTT--A--TATTTTTTTGTGGG-TCGGTTTTTG-AATGA-TGAGGTACATTTT-TT-TT--T--AA-TGCTAAT------TAC----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-G-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA--GTGAGT-GTTA-AAAA-C----TGTA------A----CA-CA---G-AGA-----G-A---AATG--A-T-G------ATA----GTA-A-C-AGAT-TT----A--AATT-T-AGGC-C-A----TTGTG-----CATG-AT-T-TGTGAGAT--TTTTATAGT--TATG--AC--GACA--GT-A-G-AAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--A--AAAAA---AAT-G--TT---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90611 : TTTTA-AAAACTTCAC-AAAATTTTTATAATT-AATGAT-AT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAA-ATA-TGCAGAATTCA-CTCAAGAT-CCAT--GACAAT--TGTTACTTTAAATG------GT--TT-TTTTAAA--TATTTTT-TGTGGG-TCGATTATTG-AATGA-TGGAGTACA-TTT-TT-TT--TAAAA-TGCTAAT------TAC----TA--T-GAA-ATGTGTAAGAGTAT-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCAG---TGAGT-ATTA-AAAA-C----TGTA------A----CA-CA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------ATA----GTA-A-C---AT-TT----A--ACTT-T-AGGC-C-A----TTGTG-----CATG-ATAT-TGTGAGAT--TTTTATAGT--TATG--AC--GGCA--GT-A-G-AAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CC-AAAAA---AAT-GCTTA----TA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90612 : TTTTA-AAATCTTCAA-AA-ATTTTTATATTCCAATGTT-AT---CATTGGTGAAATTTTTCAGAATAATA-TGCAGAGTTTA-CTCAGATT-TCAT---ACACA--TGTTACTGTAAATG------GTA-TT-TTTC--A--TATTTTTTTGT-GG-TCGATTTTTGAAAAGA-TGGCGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--TGGAA-AAGTGTAAGG-T-TGACGTTCAA---ATAATAATTCCATAAAA-A-ACATG-A-TTA-TCCCA--GTGAGT-GTTA-AAAT-C----TGTA------A----CA-CA---GCAGA-----G-A---AATC--ATT-G------ATA----GTAGA-C-AGAT-TGT---A--AATC-T-AGGC-A-A----TTATG-----CATG-AT-T-TGC-GGAT--TTTCAT-GT--TATG--AC--TGCA--GT-A-AGAAATATTT-----GAT-AT-------CAGTGCTGCCT-AAAAA---AAT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--T-AAA-ATTAGC-A-GTG----CGGAAAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90620 : TTTTA-AACACTTCAC-AACATTTTTATATTT-AATGTT-AT---TATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTCA-CTCAAGAT-TCAT--GACACA--TGTTACTGTAAATG------GTA-TT-TTTT--A--TATTTTTGTGTGGG-TCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-AAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCAT-TTGAGT-GTTA-AAAA-C----CGTA------A----CA-CA---G-AGA-----G-A---AATA--
gi|90621 : TTTTA-AACACTTCAC-AACATTTT-ATATTT-AATGTT-AT---TATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTCA-CTCAAGAT-TCAT--GACACA--TGTTACTGTAAATG------GTA-TT-TTTTT-A--TATTTTTGTGTGGG-TCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-AAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA--TTGAGT-GTTA-AAAA-C----CGTA------A----CA-CA---G-AGA-----G-A---AATA--atatgaaaagttgtaatagatatatagtgaaaattagcagtgcggaaatacttttgacccttgagtg
gi|90613 : TTTTAGAACA-TCCAA-AA---TTTTATATTT-AACGTTTAT---CATTG--GGAATTTT-CAGA-T-ATACTGCAGAATTCAACTCA-GATATC-T--CAC-CA--TGTTACTGTAGATT------GTAATT-TTTT--A--TATTTT-GTTTGGGGTTGCTTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--T-------CTGAC------TGA----TAATT-GGACAAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAATATACAC-AATT-CAT--AA-A--CATG-A-T-A-TCCCAG-TGGAGTTGTTGCAAAA-C----TGTA------A----CA-CA---G---------G-AT--AATA--A-TCG------ATA----GTA-A-CGAAAT-------A--AATC-T-ACTC-A------TTA-G-----CATG-AT-T--GTGAGAT--TTTTAT-GT--TATGC-ACG-CGCA--GTCA-G-AAATA-TT-----GAT-AC-------CATTGCT--CT-AAAAA---AATGG--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--T-AAA-CTTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTGatatgaaagtttgtaatagatatatagtgaaaattagcagtggcggaaatacttttgacccttgagtg
gi|90628 : tTTTTA-AAAACTTCAC-AAAATTTTTATAATT-AATGAT-AT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAA-ATA-TGCAGAATTCA-CTCAAGAT-CCAT--GACAAT--TGTTACT
gi|90629 : TTTTA-AAAACTTCAC-AAAAATTTTATATTT-AATGTT-AT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCATAATTtatgaaagttgtaatagatatatagtgaaaattagcaatgtggaaatacttttgacccttgagtg
gi|90614 : TTA-AA-A-TTCAC-AAAAATTGTATATAA-AAT-----T---TATT--------TTC-CAGAAT-ATA-T-CAGA--TTA-CTCAAGAT-CTATATGACAAG--TGT-ACTTTAAATG------G-A-TAATTTT--A--AATTGTTATG---G-TCGATTTTTG-AATGAATGAGGTACA-TTC-TT-TT--A--AAATGT--AT------TAC----TA--T-GAA----TGTTAGA-T-A-ACGTTCCA---ATAA-AATT-CAT--AA-AGACATG-A-TGA-TCCCGT---GAGT-GTTA-AAAA-C----TGTA------A--------A---G-AGA-----GGA---AATA--A-T-G------AAA----GTA-A---AGAT-TT----A--AATT-T-AAGC-C-A----TTGTG-----CATG-AT-T-TGT-TGAGC-TTTTATAGT--TATG--AC--GGCA--GT---G-AAATG-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CTCAGAAA---CAA-G--TA----TA---TT-CA--CTG-A--ATACTATATA-G--TGAAATATTAGC-A-G-G-----GG-AAA-TA-CT-----TTT-GA--CCTTGAtatgaaagttgtaatagatatatagagaaaattagcagtgcggaaatacttttgacccttgagtg
gi|90627 : TTA-AA-ACTTCACCAAAAAATTGATATCT----GTT-ATATCTATTA-TGAATTTTT-TGGATT-ATA-TGCAGAATTCA-CTCACGAT-TCAT--GACGAA--TGTTACTTTTAATGTTACATGTA-TT-TTT
gi|90615 : g-AAAACTCCAC-AAAAATTATATATTT-AATGTG-AT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TACAGA-TTTA-CTCAAGAT-CCAT--GATACAAATGTTACT-TAAATTT-----GTA-TT-TTTA--AACTATTTT---GTGGG-TCGATTTTTA-AATGG-TGGGGTAGA-TTTGTT-TTAAT--AA-TGCTAAT------TAAATATTA--T-GAA-T-TTGTAAGA-T-T-ACGTG-AA---GTAA-AGTT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCAG-T-GAGT-ATTA-AAAA-C----TCTA------A----CAACA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------ATAACTAGTA-A-C-AGCT-TT----G--AATC-T-AAGC-G-A----TTATAAATGACATG-AT-T-T-C-AGA---TTTTATAGT--TATG--AC--TGCA--GT-A-G-AAATA-TT-----GAT-A--------CAG-GCT--CA-AAAAA---ATT-G--TA---TCA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGA-A-GTG----CGG--AA-TA-CCTTAAGTTT-GA-CCCTTGAGTGtgtatgaaagttgtaatgaatatagagcaaaaattagcagtgcagaaattcttttgatccttgagtg
gi|90616 : -AAAACTTCACCAAAAAATTGATATCT----GTT-ATATCTATTA-TGAATTTTT-TGGATT-ATA-TGCAGAATTCA-CTCACGAT-TCAT--GACGAA--TGTTACTTTTAATGTTACATGTA-TT-TTTCAAA--GATTTTT-TGTGGA-TCGGTTTCTG-AATTA-TGAGGTAGA-CTT-TT-TTA-A--AA-TGCTCATTACCTGTAA----TA--T-GAA-ATGTGTAGGA-T-T-AAGTTCAA---GTAA-ATTT-CAT--AC-A-ACATG-A-TTA-TCCT-T-GTGAGT-GTCA-GAAA-CTGTACATA------A----TG-CA---G-AAA-----A-A---AATA--A-C----------------TA-A-C-AG-------------ATC-T-G-----------------------TG-A----------AA--TTTAATAGT--AAAG--AC--TGCA--GT-A-G-AAATA-TT-----T-T-AT-------CAGTGAT--TT---AAA---AATGG--TA---TTA---TT-CA--ATG-AT-AT--TATATG-G--TGAAA-AGTAGC-A-GTG----TAG-AAA-TA-AT-----TTT-GA-CCTTTGTGTG
gi|90617 : ATTT-GATATA-AT---T-----TAATATTTC-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTCA-CTTACGAT-TCAT--A----------TACTTTAAATG------TTA-TT-TT---------------TGTGGG-TCG
gi|90618 : aacttcaccaaGCAGAATTCATCTCAA-AT-ATAT--GACAAA---GTTACT-TAAATG-------TA-TT-TTTT--AA-TATTTTTGTG--GT-TCGACTTTTCTAAT-A-TTGTGTACA-CTT-TT-TT-----AA-TGCTAAT------TGC----TA--TTGAA-A--TTTAAGG-----ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-T-ACATG-AATGAATCCCGT---GAG--GTTA-AAAAAC----TGTA------A----CA-CATCAG-ATA-----G-ATA-AATAC-A-T--------ATA----CTA-AAC-AGAT-TT----A--AATTGT-AGG----A----CTGTG-----CACG-AT-------AGA----TTTGTAAT--TATTCTAT--TATAC-AT-G-A-AATTA-TTATGCGGAT-ATATCTTACCAGTGCT--CT-AAAAA---AAT-G--TA---CTA---TT-CT--ATG-A--AA--TATATA-AGTTGAAA-ATCAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GACCCCTTGAG
gi|90619 : -CTCAA------AT--G-CAAA--TTTTACTTTTGATG------ATA-TT-TTTT--A--TATTCTTTTGTGGG-TCGATTTTTG-AATGA-TGAGGTAGA-TCT-TTATT--T--AC-TGCTAAT------TAA----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-T-T-ACG
gi|90622 : -TT-TT--C--GA-CAGTCATA-----TAA----TA--T--AG-ATGTGCA----T-T-GTGTTGCA---ATGA-AAT-------AA-A-AGAAG-T-TCA-TCTCATACTGAG--------AAA-C----TGTATATAACA----TA-CA---T-AGA-----A-A---AAAA--A-T-T------AAA----ATG-T-C-AGAT-TT----A--AATC-T-AGG---------------------TG-AT-T-TGTGAAAT--TTTTATCCT--GATG--AC--TGCT--GT-A-G-AA----------------T-------CAGTGCT--TT-AAAAG---T-T-A--TA---TTA---TT-AATTATG-ATTAT--TCTATA--------A-ATTAGC-A-GTG----CAG-A
gi|90623 : AT------TAA----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-C-ACAAG-A-TGA-TCACAG-T-GAGT-GTTA-AAAA-C----TGTA------A----CA-CA---G-AGA-----A-A---AATA--A-T-G------ATA----GTA-A-C-AGAT-TT----A--AATC-T-AGGC-A-AAATTTTATG-----CATG-AT-T-TGTGAGAT--TTTTATAGT--TATA--AC--TGCA--GT-A-G-AAATA-TT-----GAT-AT-------CTGTGCT--CT-AAAAA---AAT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TACATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTGCAGTCAG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90624 : aA--T-GAA-ATGTATAAGA-G-T-ACGTTCAA---ATAA-GATT-CAT--TTTA-ACATG-A-TGT-TCCCAG-T---GT-GTTA-AAAA-C----TGTA------A----CA-CA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------AGA----GTA-A-C-AGAT-TT----A--AATT-T-AGGCCATA----TTGTG-----CATG-AT-T-TGTGAGAT--TTTTATAGT--TATG--AC--TGCA--GT-A-G-AAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AAAAA---AAT-G--TA---CTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90625 : -T-T-ACATTCAA---ATAA-AATT-CGT--GA-A-ACATG-A-TGA-TCCCAG-T-GAGT-GTTA-AAAA-G----TGTA------A----CA-CA---G-AGA-----G-AGATAATA--A-T-G------ATA----TTA-A-C-AGAT-TT----A--AATC-T-AGGC-T-A----TTATG-----CATG-AT-T-TGTGATAT--TTTTGTAGT--TATG--AC--TGCT--GT-A-G-AA----------------------------GCT--CT--TAAA---AAT-G--TA---------------------------TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CAG-AAAGTA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90626 : -ACGTTCAA---ATAA-AGTT-CAT--AA-A-ACATGGA-TGA-TCCCAG-T-GAGT-GTTA-AAAA-C----TGTA------AATAACA-CA---G-AGA-----G-A---AATA--T-T-G------ATA----GTA-A-C-AGAT-TT----A--AATC-T-AGGC-G-A----TTATG-----CATA-GT-T-TGTGAGAT--TTTTATAGT--TATG--AC--TGCA--AT-A-G-AAATA-TTG----GATAAT-------CAGTGCT--CTAAAAAA---AAT-G--------TA---TT-CA--ATG-A--AT--TATA
gi|90620 : TCA-AAAA-T----CG-ACCC---A----CA-CA---A-AAATATAAA-A---AATACCA-T-TT-----ACA----GTA-A-C-ATGTGTC----ATGAATC-TTGAGTGA-A----TTCTG-----CATATAT-TCTG--AAAA--TTTCACAAT--AATA--ACATTAAAT-AT-A-A-AAATG-TT-----GTG-A---------AGTGTT---T-AAAAA---TAT-G--AAAAGTTG---T---A--ATA-G--AT---ATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90621 : tatttctctctgtgttacggtttttaacactcaaatgggatcatcatgttttatgaattttatttgaacgtaatcttacacttttcatattaatcagcattgaaaaaaatctaccccatcatTCA-AAAA-T----CG-ACCC---A----CA-CA---A-AAATAT--A-A---AAAA--A-T-ACCATTTACA----GTA-A-C-ATGTGTC----ATGAATC-TTGAGTGA-A----TTCTG-----CATATAT-TCTG--AAAA--TTTCACAAT--AATA--ACA-TTAA--AT-ATA-AAATG-TT-----GTG-A---------AGTGTT---T-AAAAA---TAT-G--AAAGTTTG---T---A--ATA-G--AT---ATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTGG---CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90628 : tatttctctctgtgttacggtttttaacactcaatgggatcatcatgttttatgaattttatttgaacgtaatcttacacttttcatattaatcagcattgaaaaaaatctaccccatcatA----GTA-A-C-A-AT-TGTCATG--GATC-TTGAGTGA-A----TTCTG-----CATA-TT-T-TCTGAAAA--TTTCACAATGATATC--AT--TA-ATTAT-A-A-AAATT-TT-----GTG-A---------AGT--T--TT-TAAAA---TAT-G--AAAG-TTG---T---A--ATA-G--AT---ATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-ATG----TGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90629 : -A-A----TTATG-----CATATAT-TCTG--AAAA--TTTCACAAT--GATA--ACA-TTAA--AT-ATA-AAATT-TT-------T-GT-------GAA-GTT--TT-TAAAA---TAT-G--AAAG-TTG---T---A--ATA-G--AT---ATATA-G--AGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90630 : TGTT--CT-AAAAATGCAAA-G--T----TTG---T---A--ATA-G--ACA-TATATAAG--TTGAA-ATTAGC-A-ATG----CGG-AAA-TA-CT-----TTTGGA-CCCTTGGATG
gi|90627 : ---AAT-G--TA---TGAAAGTTGTA--ATG-A--AT---ATAGA-G--CAAAA-ATTAGC-A-GTG----CAG-AAA-TT-CT-----TTT-GA-TCCTTGAGTG
gi|90631 : gaaaaatacatgtaacattaaaagtaacattcgtcatgaatcgtgagtgaattctgcatataatccaaaaaattcataatagatataacagatatcaattttttggtgaagttttA--ATGGA--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGCAA-GTG----CAG-AAA-TA-C------TTT-GA-CCCGTGAGTG
gi|90633 : --TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90632 : --TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----TGG-AAA-TAGAA-----TTT-GATTTTTTGAGT
gi|90634 : ATA-A-G--TGAAA-TTTAGC-AAGTG----CGG-AA--TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGT
Alignments
lowQualScore : 1 1111 111111 11111 111111 2222 11111111 11111111 111
lowQualScore : 5 1 2 2 0000 2 2 2 2 2 2 2 33 33 1 0 555555 2 2 5 77 66 7 2 6 3 3 2 2 33333 2 1 000000 5555 33 5 2 2 2 2 2 444 2 2 33 2 2 4 2 4444 2 2 2 44444 55 666666 4444 2 333 55 88888 2 555 55 2 11111111 5555 2 2 4 6666 66 2 99 9999 4444 1 55555 0 8 2 5 22 2 99 22 2 4 555 2 2 77777 1 2 00000000 22 44 333 1 3 22 111 333 55 22 1 44 555 1 22 1 1 1 5555 1 1 1 44444 1 3
lowQualScore : . . . . .... . . . . . . . .. .. . . ...... . . . .. .. . . . . . . . ..... . . ...... .... .. . . . . . . ... . . .. . . . . .... . . . ..... .. ...... .... . ... .. ..... . ... .. . ........ .... . . . .... .. . .. .... .... . ..... . . . . .. . .. .. . . ... . . ..... . . ........ .. .. ... . . .. ... ... .. .. . .. ... . .. . . . .... . . . ..... . .
lowQualScore : 3 4 7 7 7777 7 7 7 7 7 5 5 44 44 5 6 333333 7 7 3 99 88 2 9 2 1 1 9 9 66666 9 1 333333 7777 44 0 5 2 4 4 2 111 4 4 22 4 4 7 4 1111 4 1 1 66666 88 111111 5555 1 777 00 99999 1 888 00 4 22222222 0000 2 2 4 9999 11 2 22 4444 5555 3 33333 9 4 1 1 99 1 22 99 1 2 888 1 1 44444 6 1 22222222 88 22 333 9 8 66 999 333 77 55 8 33 222 7 33 7 7 7 2222 7 7 7 33333 7 5
consensus : TTTTAAAAACTTCAC-AAAANTTTTATATTT-AATG-TTAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACAAATGTTACTTTAAATG------G-T-ATTTT-TT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-ATG-ATCCCAG-TTGAG-TGTT-A-AAAAC----CG--TA------A----C-A---CAG--AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----TAGT-A-ACAGAT-T----TA--AATC-T--AGGC-A-A----TTAT-----GCATGAT-TTGT-GAGATTTTTATAGT--TATG-AC--TG--CA-GT-A---GAAA-TA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AAAAA---A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
Reference ( family-670 ) : TTTTAAAAACTTCAC-AAAANTTTTATATTT-AATG-TTAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACAAATGTTACTTTAAATG------G-T-ATTTT-TT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-ATG-ATCCCAN-TTGAG-TGTT-A-AAAAC----CG--TA------A----C-A---CAG--AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----TAGT-A-ACAGAT-T----TA--AATC-T--AGGC-A-A----TTAT-----GCATGAT-TTGT-GAGANTTTTATAGT--TATG-AC--TG--CA-GT-A---GAAA-TA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AAAAA---A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90608 : TTTTAAACACTTCAC-AACATTTTTATATTT-AATG-TTAT---TATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACACATGTTACTGTAAATG------G-T-ATTTT-TT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-AAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-ATG-ATCCCAT-TTGAG-TGTT-A-AAAAC----CG--TA------A----C-A---CAG--AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----TAGT-A-ACAGAT-T----AA--AATC-T--GGGC-A-A----TTAT-----GCATGAT-TTGT--AGAGTTTTATAGT--TATG-AC--TG--CA-GT-A---AAAA-TA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AAAAA---A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90609 : TTTTAAACACTTCAC-AACA-TTTTATATTT-AATG-TTAT---TATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACACATGTTACTGTAAATG------G-T-ATTTTTTT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-AAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-ATG-ATCCCA--TTGAG-TGTT-A-AAAAC----CG--TA------A----C-A---CAG--AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----TAGT-A-ACAGAT-T----AA--AATC-T--GGGC-A-A----TTAT-----GCATGAT-TTGT-GAGGTTTTTATAGT--TATG-AC--TG--CA-GT-A----AAA-TA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AAAAA---A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGGGT
gi|90610 : TTTTAAAAACTTCAC-AAAAATTTTATATTT-AATG-TTAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCATAATTC-A-CTCAAGAT-CCAT--G--ACAAGTGTTACTTTAAATG------G-A-ATTTT-TT--A--TATTTTTTTGT-GGGTCGGTTTTTG-AATGA-TGAGGTACATTTT-TT-TT--T--AA-TGCTAAT------TAC----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-G-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-ATG-ATCCCAG--TGAG-TGTT-A-AAAAC----TG--TA------A----C-A---CAG--AGA-----G-A---AATG--A-T-G------A----TAGT-A-ACAGAT-T----TA--AATT-T--AGGC-C-A----TTGT-----GCATGAT-TTGT-GAGATTTTTATAGT--TATG-AC--GA--CA-GT-A---GAAA-TA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--A--AAAAA---A-AT-G--TT---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90611 : TTTTAAAAACTTCAC-AAAATTTTTATAATT-AATG-ATAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAA-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-CCAT--G--ACAATTGTTACTTTAAATG------G-T--TTTT-TTAAA--TATTTTT-TGT-GGGTCGATTATTG-AATGA-TGGAGTACA-TTT-TT-TT--TAAAA-TGCTAAT------TAC----TA--T-GAA-ATGTGTAAGAGTAT-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-ATG-AT-CCAG--TGAG-TATT-A-AAAAC----TG--TA------A----C-A---CAG--AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----TAGT-A-AC--AT-T----TA--ACTT-T--AGGC-C-A----TTGT-----GCATGATATTGT-GAGATTTTTATAGT--TATG-AC--GG--CA-GT-A---GAAA-TA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CC-AAAAA---A-AT-GCTTA----TA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90612 : TTTTAAAATCTTCA--AAAATTTTTATATTCCAATG-TTAT---CATTGGTGAAATTTTTCAGAATAATA-TGCAGAGTTT-A-CTCAGATT-TCAT-----ACACATGTTACTGTAAATG------G-T-ATTTT-TC--A--TATTTTTTTGT--GGTCGATTTTTGAAAAGA-TGGCGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--TGGAA-AAGTGTAAGG-T-TGACGTTCAA---ATAATAATTCCATAAAA-A-ACATG-ATT-ATCCCAG--TGAG-TGTT-A-AAATC----TG--TA------A----C-A---CAGC-AGA-----G-A---AATC--ATT-G------A----TAGT-AGACAGAT-TG---TA--AATC-T--AGGC-A-A----TTAT-----GCATGAT-TTGC-G-GATTTTCAT-GT--TATG-AC--TG--CA-GTAA---GAAA-TATTT-----GAT-AT-------CAGTGCTGCCT-AAAAA---A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--T-AAA-ATTAGC-A-GTG----CGGAAAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90613 : TTTTTAGAACATC-C-AAAA-TTTTATATTT-AACGTTTAT---CATTG--GGAATTTT-CAG-AT-ATACTGCAGAATTCAA-CTC-AGATATC-T--C--AC-CATGTTACTGTAGATT------G-TAATTTT-TT--A--TA-TTTTGTTTGGGGTTGCTTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--T-------CTGAC------TGA----TAATT-GGACAAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAATATACAC-AATT-CAT---A-A-ACATG-AT--ATCCCAG-TGGAGTTGTT-GCAAAAC----TG--TA------A----C-A---CAG----------G-AT--AATA--A-TCG------A----TAGT-A-AC-GAA-A----TA--AATC-T--ACTC---A----TTA------GCATGA--TTGT-GAGATTTTTAT-GT--TATGCACG-CG--CA-GTCA---GAAA-TA-TT-----GAT-AC-------CATTGCT--CT-AAAAA---A-ATGG--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--T-AAA-CTTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90614 : TTAAAA--TTCAC-AAAAATTGTATATAA-AAT--TTAT--------------TTTC-CAGAAT-ATA-T-CAGA--TT-A-CTCAAGAT-CTATATG--ACAAGTGT-ACTTTAAATG------GAT-AATTT-TA--A---ATTGTTATG----GTCGATTTTTG-AATGAATGAGGTACA-TTC-TT-TT--A--AAATGT--AT------TAC----TA--T-GAA----TGTTAGA-T-A-ACGTTCCA---ATAA-AATT-CAT--AA-AGACATG-ATG-ATCCCG---TGAG-TGTT-A-AAAAC----TG--TA------A-----------AG--AGA-----GGA---AATA--A-T-G------A----AAGT-A-A-AGAT-T----TA--AATT-T--AAGC-C-A----TTGT-----GCATGAT-TTGTTGAG-CTTTTATAGT--TATG-AC--GG--CA-GT-----GAAA-TG-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-CAGAA---ACAA-G--TA---T-A---TT-CA--CTG-A--ATACTATATA-G--TGAAATATTAGC-A-G-G-----GG-AAA-TA-CT-----TTT-GA--CCTTGA
gi|90615 : AAAACTCCAC-AAAAATTATATATTT-AATG-TGAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TACAG-ATTT-A-CTCAAGAT-CCAT--GATACAAATGTTACTTAAATTT------G-T-ATTTT-TA--AACTATTT---TGT-GGGTCGATTTTTA-AATGG-TGGGGTAGA-TTTGTT-TTAAT--AA-TGCTAAT------TAAATATTA--T-G-A-ATTTGTAAGA-T-T-ACG-TGAA---GTAA-AGTT-CAT--AA-A-ACATG-ATG-ATCCCAG--TGAG-TATT-A-AAAAC----TC--TA------A----CAA---CAG--AGA-----G-A---AATA--A-T-G------ATAACTAGT-A-ACAGCT-T----TG--AATC-T--AAGC-G-A----TTATAAATGACATGAT-T--T-CAGA-TTTTATAGT--TATG-AC--TG--CA-GT-A---GAAA-TA-TT-----GAT-A--------CAG-GCT--CA-AAAAA---A-TT-G--TA---TCA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGA-A-GTG----CGG--AA-TA-CCTTAAGTTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90616 : AAAACTTCACCAAAAAATTGATATCT----G-TTATATCTATTA-TGAATTTTT-TGGATT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCACGAT-TCAT--G--ACGAATGTTACTTTTAATGTTACATG-T-ATTTT-TCAAA--GATTTTT-TGT-GGATCGGTTTCTG-AATTA-TGAGGTAGA-CTT-TT-TTA-A--AA-TGCTCATTACCTGTAA----TA--T-GAA-ATGTGTAGGA-T-T-AAGTTCAA---GTAA-ATTT-CAT--AC-A-ACATG-ATT-ATCCT-T-GTGAG-TGTC-A-GAAACTGTACA--TA------A----T-G---CAG--AAA-----A-A---AATA--A-C----------------T-A-ACAGAT-C----T------------------------------------------GT-GA-AATTTAATAGT--AAAG-AC--TG--CA-GT-A---GAAA-TA-TT-----T-T-AT-------CAGTGAT--TT---AAA---A-ATGG--TA---TTA---TT-CA--ATG-AT-AT--TATATG-G--TGAAA-AGTAGC-A-GTG----TAG-AAA-TA-AT-----TTT-GA-CCTTTGTGTG
gi|90617 : AACTTCAC-CAAA-TTTGATAT---AAT--TTA-----AT-------ATTTC-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTTACGAT-TCAT--A----------TACTTTAAATG------T-T-ATTTT----------------TGT-GGGTCG
gi|90618 : GCAGAATTC-ATCTCAA-AT-ATAT--G--ACAAA-GTTACTT-AAATG--------T-ATTTT-TT--AA-TATTTTTGTG---GTTCGACTTTTCTAAT-A-TTGTGTACA-CTT-TT-TT-----AA-TGCTAAT------TGC----TA--TTGAA-AT-T-TAAGG-----ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-T-ACATGAATGAATCCCG---TGAG--GTTAA-AAAAC----TG--TA------A----C-ACATCAGATAGA-----T-A---AATAC-A-T--------A----TACTAA-ACAGAT-T----TA--AATTGT--AGG----A----CTGT-----GCACGAT-------AGA--TTTGTAAT--TATT--C--TA--TT-AT-ACATGAAATTA-TTATGCGGAT-ATATCTTACCAGTGCT--CT-AAAAA---A-AT-G--TA---CTA---TT-CT--ATG-A--AA--TATATA-AGTTGAAA-ATCAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GACCCCTTGAG
gi|90619 : -CTCAA------AT--G---CAAATTTTACTTTTGATG------A-T-ATTTT-TT--A--TATTCTTTTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGAGGTAGA-TCT-TTATT--T--AC-TGCTAAT------TAA----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-T-T-ACG
gi|90620 : TTTTAAACACTTCAC-AACATTTTTATATTT-AATG-TTAT---TATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACACATGTTACTGTAAATG------G-T-ATTTT-TT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-AAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-ATG-ATCCCAT-TTGAG-TGTT-A-AAAAC----CG--TA------A----C-A---CAG--AGA-----G-A---AATA--
gi|90620 : TC-A-AAAAT----CGACCC------A----C-A---CAA--AAATATAAA-A---AATACCA-T-TT-----A----CAGT-A-ACATGTGT----CATGAATC-TTGAGTG-A-A----TTCT-----GCAT-ATATTCT-GAAAATTTCACAAT--AATA-ACATTA--AATAT-A---AAAA-TG-TT-----GTG-A---------AGTGTT---T-AAAAA---T-AT-G--AAAAGTTG---T---A--ATA-G--AT---ATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTGatatgaaaagttgtaatagatatatagtgaaaattagcagtgcggaaatacttttgacccttgagtg
gi|90621 : tatttctctctgtgttacggtttttaacactcaaatgggatcatcatgttttatgaattttatttgaacgtaatcttacacttttcatattaatcagcattgaaaaaaatctaccccatcatTTTTAAACACTTCAC-AACA-TTTTATATTT-AATG-TTAT---TATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACACATGTTACTGTAAATG------G-T-ATTTTTTT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-AAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-ATG-ATCCCA--TTGAG-TGTT-A-AAAAC----CG--TA------A----C-A---CAG--AGA-----G-A---AATA--
gi|90621 : TC-A-AAAAT----CGACCC------A----C-A---CAA--AAATAT--A-A---AAAA--A-T-ACCATTTA----CAGT-A-ACATGTGT----CATGAATC-TTGAGTG-A-A----TTCT-----GCAT-ATATTCT-GAAAATTTCACAAT--AATA-ACA-TT--AA-AT-AT--AAAA-TG-TT-----GTG-A---------AGTGTT---T-AAAAA---T-AT-G--AAAGTTTG---T---A--ATA-G--AT---ATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTGG---CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTGatatgaaagtttgtaatagatatatagtgaaaattagcagtggcggaaatacttttgacccttgagtg
gi|90622 : tatttctctctgtgttacggtttttaacactcaatgggatcatcatgttttatgaattttatttgaacgtaatcttacacttttcatattaatcagcattgaaaaaaatctaccccatcat-TT-TT--C--GA-CAGTCATA-----TAA----TA--T--AG-ATGTGCA----T-T-GTGTTGCA---ATGA-AAT-------AA-A-AGAAG-TTC-ATCTCATACTGAG---------AAAC----TG--TATATAACA----T-A---CAT--AGA-----A-A---AAAA--A-T-T------A----AAAT-G-TCAGAT-T----TA--AATC-T--AGG---------------------TGAT-TTGT-GAAATTTTTATCCT--GATG-AC--TG--CT-GT-A---GA-----------------AT-------CAGTGCT--TT--AAAA---G-TT-A--TA---TTA---TT-AATTATG-ATTAT--TCTAT--------AA-ATTAGC-A-GTG----CAG-A
gi|90623 : AT------TAA----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-C-ACAAG-ATG-ATCACAG-T-GAG-TGTT-A-AAAAC----TG--TA------A----C-A---CAG--AGA-----A-A---AATA--A-T-G------A----TAGT-A-ACAGAT-T----TA--AATC-T--AGGC-A-AAATTTTAT-----GCATGAT-TTGT-GAGATTTTTATAGT--TATA-AC--TG--CA-GT-A---GAAA-TA-TT-----GAT-AT-------CTGTGCT--CT-AAAAA---A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TACATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTGCAGTCAG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90624 : aA--T-GAA-ATGTATAAGA-G-T-ACGTTCAA---ATAA-GATT-CAT--TTTA-ACATG-ATG-TTCCCAG-T---G-TGTT-A-AAAAC----TG--TA------A----C-A---CAG--AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----GAGT-A-ACAGAT-T----TA--AATT-T--AGGCCATA----TTGT-----GCATGAT-TTGT-GAGATTTTTATAGT--TATG-AC--TG--CA-GT-A---GAAA-TA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AAAAA---A-AT-G--TA---CTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90625 : -T-T-ACATTCAA---ATAA-AATT-CGT--GA-A-ACATG-ATG-ATCCCAG-T-GAG-TGTT-A-AAAAG----TG--TA------A----C-A---CAG--AGA-----G-AGATAATA--A-T-G------A----TATT-A-ACAGAT-T----TA--AATC-T--AGGC-T-A----TTAT-----GCATGAT-TTGT-GATATTTTTGTAGT--TATG-AC--TG--CT-GT-A---GAA-----------------------------GCT--CT--TAAA---A-AT-G--TA---------------------------TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CAG-AAAGTA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90626 : -ACGTTCAA---ATAA-AGTT-CAT--AA-A-ACATGGATG-ATCCCAG-T-GAG-TGTT-A-AAAAC----TG--TA------AATAAC-A---CAG--AGA-----G-A---AATA--T-T-G------A----TAGT-A-ACAGAT-T----TA--AATC-T--AGGC-G-A----TTAT-----GCATAGT-TTGT-GAGATTTTTATAGT--TATG-AC--TG--CA-AT-A---GAAA-TA-TTG----GATAAT-------CAGTGCT--CTAAAAAA---A-AT-G--------TA---TT-CA--ATG-A--AT--TATA
gi|90627 : AAAACTTCACCAAAAAATTGATATCT----G-TTATATCTATTA-TGAATTTTT-TGGATT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCACGAT-TCAT--G--ACGAATGTTACTTTTAATGTTACATG-T-ATTTT-T
gi|90627 : g---A-AT-G--TA---TGAAAGTTGTA--ATG-A--AT---ATAGA-G--CAAAA-ATTAGC-A-GTG----CAG-AAA-TT-CT-----TTT-GA-TCCTTGAGTGaatgtatgaaagttgtaatgaatatagagcaaaaattagcagtgcagaaattcttttgatccttgagtg
gi|90628 : gaaaaatacatgtaacattaaaagtaacattcgtcatgaatcgtgagtgaattctgcatataatccaaaaaattcataatagatataacagatatcaattttttggtgaagttttTTTTAAAAACTTCAC-AAAATTTTTATAATT-AATG-ATAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAA-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-CCAT--G--ACAATTGTTACT
gi|90628 : AGT-A-ACA-AT-TGTCATG--GATC-TTGAGTG-A-A----TTCT-----GCATATT-TTCT-GAAAATTTCACAATGATATC-AT--TAATTA--T-A---AAAA-TT-TT-----GTG-A---------AGT--T--TT-TAAAA---T-AT-G--AAAG-TTG---T---A--ATA-G--AT---ATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-ATG----TGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTGtatgaaagttgtaatagatatatagtgaaaattagcaatgtggaaatacttttgacccttgagtg
gi|90629 : TTTTAAAAACTTCAC-AAAAATTTTATATTT-AATG-TTAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCATAATT
gi|90629 : -A-A----TTAT-----GCAT-ATATTCT-GAAAATTTCACAAT--GATA-ACA-TT--AA-AT-A---TAAA--A-TT-----TTT-GT-------GAA-GTT--TT-TAAAA---T-AT-G--AAAG-TTG---T---A--ATA-G--AT---ATATA-G--AGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTGtatgaaagttgtaatagatatatagagaaaattagcagtgcggaaatacttttgacccttgagtg
gi|90630 : TGTT--CT-AAAAATGCA-AA-G--T----TTG---T---A--ATA-G--ACA-TATATAAG--TTGAA-ATTAGC-A-ATG----CGG-AAA-TA-CT-----TTTGGA-CCCTTGGATG
gi|90631 : A--ATGGA--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGCAA-GTG----CAG-AAA-TA-C------TTT-GA-CCCGTGAGTG
gi|90632 : --TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----TGG-AAA-TAGAA-----TTT-GATTTTTTGAGT
gi|90633 : --TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90634 : ATA-A-G--TGAAA-TTTAGC-AAGTG----CGG-AA--TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGT
Alignments
lowQualScore : 1 1111 111111 11111 111111 2222 11111111 111
lowQualScore : 5 1 2 2 0000 2 2 2 2 2 2 2 33 33 1 0 555555 2 2 5 77 66 7 2 6 3 3 2 2 33333 2 1 000000 5555 33 5 2 2 2 2 2 444 2 2 33 2 2 2 2 2 1111 2 2 2 44444 55 666666 4444 2 333 2 88888 2 888 66 2 00000000 4444 2 2 4 6666 55 2 88 8888 4444 1 55555 0 8 2 333 3 333 22 666666 2 88 2 22 2 4 2 2 99999 1 2 99999999 22 44 22 7777 1 3 22 111 333 55 22 1 44 555 1 22 1 1 1 5555 1 1 1 44444 1 3
lowQualScore : . . . . .... . . . . . . . .. .. . . ...... . . . .. .. . . . . . . . ..... . . ...... .... .. . . . . . . ... . . .. . . . . . .... . . . ..... .. ...... .... . ... . ..... . ... .. . ........ .... . . . .... .. . .. .... .... . ..... . . . ... . ... .. ...... . .. . .. . . . . ..... . . ........ .. .. .. .... . . .. ... ... .. .. . .. ... . .. . . . .... . . . ..... . .
lowQualScore : 3 4 7 7 7777 7 7 7 7 7 5 5 44 44 5 6 333333 7 7 3 99 88 2 9 2 1 1 9 9 66666 9 1 333333 7777 44 0 5 2 4 4 2 111 4 4 22 4 4 4 4 4 1111 4 1 1 66666 88 111111 5555 1 777 1 55555 0 222 88 2 11111111 7777 1 1 2 6666 88 1 77 0000 2222 5 00000 3 0 0 555 0 555 88 333333 0 88 0 88 0 0 0 0 00000 0 0 22222222 66 22 66 4444 9 8 66 999 333 77 55 8 33 222 7 33 7 7 7 2222 7 7 7 33333 7 5
consensus : TTTTAAAAACTTCAC-AAAANTTTTATATTT-AATG-TTAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACAAATGTTACTTTAAATG------G-T-ATTTT-TT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA-GTTGAG-TGTTA-AAAA-C----CG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----TAGTA-A-CAGAT-T----TA--AATC-T--AGGC-A-A----TTAT-----GCATGAT-TTGT-GAG---ATTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--T-G--CA-GT-A-GAAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AA--AAA----A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
Reference ( family-670 ) : TTTTAAAAACTTCAC-AAAANTTTTATATTT-AATG-TTAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACAAATGTTACTTTAAATG------G-T-ATTTT-TT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA-GTTGAG-TGTTA-AAAA-C----CG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----TAGTA-A-CAGAT-T----TA--AATC-T--AGGC-A-A----TTAT-----GCATGAT-TTGT-GAG---ATTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--T-G--CA-GT-A-GAAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AA--AAA----A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90608 : TTTTAAACACTTCAC-AACATTTTTATATTT-AATG-TTAT---TATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACACATGTTACTGTAAATG------G-T-ATTTT-TT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-AAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA-TTTGAG-TGTTA-AAAA-C----CG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----TAGTA-A-CAGAT-T----AA--AATC-T--GGGC-A-A----TTAT-----GCATGAT-TTGT--AG---AGTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--T-G--CA-GT-A-AAAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AA--AAA----A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90609 : TTTTAAACACTTCAC-AACA-TTTTATATTT-AATG-TTAT---TATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACACATGTTACTGTAAATG------G-T-ATTTTTTT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-AAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA--TTGAG-TGTTA-AAAA-C----CG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----TAGTA-A-CAGAT-T----AA--AATC-T--GGGC-A-A----TTAT-----GCATGAT-TTGT-GAG---GTTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--T-G--CA-GT-A--AAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AA--AAA----A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGGGT
gi|90610 : TTTTAAAAACTTCAC-AAAAATTTTATATTT-AATG-TTAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCATAATTC-A-CTCAAGAT-CCAT--G--ACAAGTGTTACTTTAAATG------G-A-ATTTT-TT--A--TATTTTTTTGT-GGGTCGGTTTTTG-AATGA-TGAGGTACATTTT-TT-TT--T--AA-TGCTAAT------TAC----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-G-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA-G-TGAG-TGTTA-AAAA-C----TG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATG--A-T-G------A----TAGTA-A-CAGAT-T----TA--AATT-T--AGGC-C-A----TTGT-----GCATGAT-TTGT-GAG---ATTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--G-A--CA-GT-A-GAAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--A--AA--AAA----A-AT-G--TT---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90611 : TTTTAAAAACTTCAC-AAAATTTTTATAATT-AATG-ATAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAA-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-CCAT--G--ACAATTGTTACTTTAAATG------G-T--TTTT-TTAAA--TATTTTT-TGT-GGGTCGATTATTG-AATGA-TGGAGTACA-TTT-TT-TT--TAAAA-TGCTAAT------TAC----TA--T-GAA-ATGTGTAAGAGTAT-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-T-CCA-G-TGAG-TATTA-AAAA-C----TG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----TAGTA-A-C--AT-T----TA--ACTT-T--AGGC-C-A----TTGT-----GCATGATATTGT-GAG---ATTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--G-G--CA-GT-A-GAAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CC-AA--AAA----A-AT-GCTTA----TA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90612 : TTTTAAAATCTTCA--AAAATTTTTATATTCCAATG-TTAT---CATTGGTGAAATTTTTCAGAATAATA-TGCAGAGTTT-A-CTCAGATT-TCAT-----ACACATGTTACTGTAAATG------G-T-ATTTT-TC--A--TATTTTTTTGT--GGTCGATTTTTGAAAAGA-TGGCGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--TGGAA-AAGTGTAAGG-T-TGACGTTCAA---ATAATAATTCCATAAAA-A-ACATG-A-TTA-TCCCA-G-TGAG-TGTTA-AAAT-C----TG--TA------A----C-ACA---GCAGA-----G-A---AATC--ATT-G------A----TAGTAGA-CAGAT-TG---TA--AATC-T--AGGC-A-A----TTAT-----GCATGAT-TTGC-G-G---ATTTT---CA--T-GT--T---ATG-AC--T-G--CA-GTAA-GAAATATTT-----GAT-AT-------CAGTGCTGCCT-AA--AAA----A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--T-AAA-ATTAGC-A-GTG----CGGAAAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90613 : TTTTTAGAACATC-C-AAAA-TTTTATATTT-AACGTTTAT---CATTG--GGAATTTT-CAG-AT-ATACTGCAGAATTCAA-CTC-AGATATC-T--C--AC-CATGTTACTGTAGATT------G-TAATTTT-TT--A--TA-TTTTGTTTGGGGTTGCTTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--T-------CTGAC------TGA----TAATT-GGACAAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAATATACAC-AATT-CAT---A-A-ACATG-A-T-A-TCCCA-GTGGAGTTGTTGCAAAA-C----TG--TA------A----C-ACA---G---------G-AT--AATA--A-TCG------A----TAGTA-A-C-GAA-A----TA--AATC-T--ACTC---A----TTA------GCATGA--TTGT-GAG---ATTTT---TA--T-GT--T---ATGCACG-C-G--CA-GTCA-GAAATA-TT-----GAT-AC-------CATTGCT--CT-AA--AAA----A-ATGG--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--T-AAA-CTTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90614 : TTAAAA--TTCAC-AAAAATTGTATATAA-AAT--TTAT--------------TTTC-CAGAAT-ATA-T-CAGA--TT-A-CTCAAGAT-CTATATG--ACAAGTGT-ACTTTAAATG------GAT-AATTT-TA--A---ATTGTTATG----GTCGATTTTTG-AATGAATGAGGTACA-TTC-TT-TT--A--AAATGT--AT------TAC----TA--T-GAA----TGTTAGA-T-A-ACGTTCCA---ATAA-AATT-CAT--AA-AGACATG-A-TGA-TCCCG---TGAG-TGTTA-AAAA-C----TG--TA------A--------A---G-AGA-----GGA---AATA--A-T-G------A----AAGTA-A--AGAT-T----TA--AATT-T--AAGC-C-A----TTGT-----GCATGAT-TTGTTGAG----CTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--G-G--CA-GT---GAAATG-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-CA--GAA----ACAA-G--TA---T-A---TT-CA--CTG-A--ATACTATATA-G--TGAAATATTAGC-A-G-G-----GG-AAA-TA-CT-----TTT-GA--CCTTGA
gi|90615 : AAAACTCCAC-AAAAATTATATATTT-AATG-TGAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TACAG-ATTT-A-CTCAAGAT-CCAT--GATACAAATGTTACTTAAATTT------G-T-ATTTT-TA--AACTATTT---TGT-GGGTCGATTTTTA-AATGG-TGGGGTAGA-TTTGTT-TTAAT--AA-TGCTAAT------TAAATATTA--T-G-A-ATTTGTAAGA-T-T-ACG-TGAA---GTAA-AGTT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA-G-TGAG-TATTA-AAAA-C----TC--TA------A----CAACA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------ATAACTAGTA-A-CAGCT-T----TG--AATC-T--AAGC-G-A----TTATAAATGACATGAT-T--T-CAG---A-TTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--T-G--CA-GT-A-GAAATA-TT-----GAT-A--------CAG-GCT--CA-AA--AAA----A-TT-G--TA---TCA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGA-A-GTG----CGG--AA-TA-CCTTAAGTTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90616 : AAAACTTCACCAAAAAATTGATATCT----G-TTATATCTATTA-TGAATTTTT-TGGATT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCACGAT-TCAT--G--ACGAATGTTACTTTTAATGTTACATG-T-ATTTT-TCAAA--GATTTTT-TGT-GGATCGGTTTCTG-AATTA-TGAGGTAGA-CTT-TT-TTA-A--AA-TGCTCATTACCTGTAA----TA--T-GAA-ATGTGTAGGA-T-T-AAGTTCAA---GTAA-ATTT-CAT--AC-A-ACATG-A-TTA-TCCTT-G-TGAG-TGTCA-GAAA-CTGTACA--TA------A----T-GCA---G-AAA-----A-A---AATA--A-C----------------TA-A-CAGAT-C----T------------------------------------------GT-GAA---A-TTT---AA--TAGT--A---AAG-AC--T-G--CA-GT-A-GAAATA-TT-----T-T-AT-------CAGTGAT--TT-----AAA----A-ATGG--TA---TTA---TT-CA--ATG-AT-AT--TATATG-G--TGAAA-AGTAGC-A-GTG----TAG-AAA-TA-AT-----TTT-GA-CCTTTGTGTG
gi|90617 : AACTTCAC-CAAA-TTTGATAT---AAT--TTA-----AT-------ATTTC-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTTACGAT-TCAT--A----------TACTTTAAATG------T-T-ATTTT----------------TGT-GGGTCG
gi|90618 : GCAGAATTC-ATCTCAA-AT-ATAT--G--ACAAA-GTTACTT-AAATG--------T-ATTTT-TT--AA-TATTTTTGTG---GTTCGACTTTTCTAAT-A-TTGTGTACA-CTT-TT-TT-----AA-TGCTAAT------TGC----TA--TTGAA-AT-T-TAAGG-----ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-T-ACATG-AATGAATCCCG---TGAG--GTTA-AAAAAC----TG--TA------A----C-ACATCAG-ATA-----G-ATA-AATAC-A-T--------A----TACTA-AACAGAT-T----TA--AATTGT--AGG----A----CTGT-----GCACGAT-------AG---ATTTG---TAATTATTC-T---ATT-A---T-A--CA--T-G-AAATTA-TTATGCGGAT-ATATCTTACCAGTGCT--CT-AA--AAA----A-AT-G--TA---CTA---TT-CT--ATG-A--AA--TATATA-AGTTGAAA-ATCAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GACCCCTTGAG
gi|90619 : -CTCAA------AT--G---CAAATTTTACTTTTGATG------A-T-ATTTT-TT--A--TATTCTTTTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGAGGTAGA-TCT-TTATT--T--AC-TGCTAAT------TAA----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-T-T-ACG
gi|90620 : TTTTAAACACTTCAC-AACATTTTTATATTT-AATG-TTAT---TATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACACATGTTACTGTAAATG------G-T-ATTTT-TT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-AAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA-TTTGAG-TGTTA-AAAA-C----CG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--
gi|90620 : TCA-AAAA-T----CGACCC------A----C-ACA---A-AAATATAAA-A---AATACCA-T-TT-----A----CAGTA-A-CATGTGT----CATGAATC-TTGAGTG-A-A----TTCT-----GCAT-ATATTCT-GAA---AATTT---CA--CAAT--A---ATA-ACATT-A--AATAT-A-AAAATG-TT-----GTG-A---------AGTGTT---T-AA--AAA----T-AT-G--AAAAGTTG---T---A--ATA-G--AT---ATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTGatatgaaaagttgtaatagatatatagtgaaaattagcagtgcggaaatacttttgacccttgagtg
gi|90621 : tatttctctctgtgttacggtttttaacactcaaatgggatcatcatgttttatgaattttatttgaacgtaatcttacacttttcatattaatcagcattgaaaaaaatctaccccatcatTTTTAAACACTTCAC-AACA-TTTTATATTT-AATG-TTAT---TATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACACATGTTACTGTAAATG------G-T-ATTTTTTT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-AAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA--TTGAG-TGTTA-AAAA-C----CG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--
gi|90621 : TCA-AAAA-T----CGACCC------A----C-ACA---A-AAATAT--A-A---AAAA--A-T-ACCATTTA----CAGTA-A-CATGTGT----CATGAATC-TTGAGTG-A-A----TTCT-----GCAT-ATATTCT-GAA---AATTT---CA--CAAT--A---ATA-ACA-T-T--AA-AT-ATAAAATG-TT-----GTG-A---------AGTGTT---T-AA--AAA----T-AT-G--AAAGTTTG---T---A--ATA-G--AT---ATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTGG---CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTGatatgaaagtttgtaatagatatatagtgaaaattagcagtggcggaaatacttttgacccttgagtg
gi|90622 : tatttctctctgtgttacggtttttaacactcaatgggatcatcatgttttatgaattttatttgaacgtaatcttacacttttcatattaatcagcattgaaaaaaatctaccccatcat-TT-TT--C--GA-CAGTCATA-----TAA----TA--T--AG-ATGTGCA----T-T-GTGTTGCA---ATGA-AAT-------AA-A-AGAAG-T-TCA-TCTCATACTGAG--------AAA-C----TG--TATATAACA----T-ACA---T-AGA-----A-A---AAAA--A-T-T------A----AAATG-T-CAGAT-T----TA--AATC-T--AGG---------------------TGAT-TTGT-GAA---ATTTT---TA--TCCT--G---ATG-AC--T-G--CT-GT-A-GA----------------AT-------CAGTGCT--TT--A--AAA----G-TT-A--TA---TTA---TT-AATTATG-ATTAT--TCTAT--------AA-ATTAGC-A-GTG----CAG-A
gi|90623 : AT------TAA----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-C-ACAAG-A-TGA-TCACA-GT-GAG-TGTTA-AAAA-C----TG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----A-A---AATA--A-T-G------A----TAGTA-A-CAGAT-T----TA--AATC-T--AGGC-A-AAATTTTAT-----GCATGAT-TTGT-GAG---ATTTT---TA--TAGT--T---ATA-AC--T-G--CA-GT-A-GAAATA-TT-----GAT-AT-------CTGTGCT--CT-AA--AAA----A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TACATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTGCAGTCAG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90624 : aA--T-GAA-ATGTATAAGA-G-T-ACGTTCAA---ATAA-GATT-CAT--TTTA-ACATG-A-TGT-TCCCA-GT---G-TGTTA-AAAA-C----TG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----GAGTA-A-CAGAT-T----TA--AATT-T--AGGCCATA----TTGT-----GCATGAT-TTGT-GAG---ATTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--T-G--CA-GT-A-GAAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AA--AAA----A-AT-G--TA---CTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90625 : -T-T-ACATTCAA---ATAA-AATT-CGT--GA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA-GT-GAG-TGTTA-AAAA-G----TG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-AGATAATA--A-T-G------A----TATTA-A-CAGAT-T----TA--AATC-T--AGGC-T-A----TTAT-----GCATGAT-TTGT-GAT---ATTTT---TG--TAGT--T---ATG-AC--T-G--CT-GT-A-GAA----------------------------GCT--CT--T--AAA----A-AT-G--TA---------------------------TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CAG-AAAGTA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90626 : -ACGTTCAA---ATAA-AGTT-CAT--AA-A-ACATGGA-TGA-TCCCA-GT-GAG-TGTTA-AAAA-C----TG--TA------AATAAC-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--T-T-G------A----TAGTA-A-CAGAT-T----TA--AATC-T--AGGC-G-A----TTAT-----GCATAGT-TTGT-GAG---ATTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--T-G--CA-AT-A-GAAATA-TTG----GATAAT-------CAGTGCT--CTAAA--AAA----A-AT-G--------TA---TT-CA--ATG-A--AT--TATA
gi|90627 : GA-----A-A---AATAC-A-T-G--------------TA-A-CA----T----TA--AAAG-T--AA-C-A-T----TCGT------CATGAA-TCGT-GAGTGAATTCTGCATA--TAAT--CCAAAAA-AT--TCA--TA-AT-A-GATATA-ACA----GAT-AT-------CAATTTT--TT-GGTGAAGTTTTA-AT-G--TA---TGAAAGTTGTA--ATG-A--AT---ATAGA-G--CAAAA-ATTAGC-A-GTG----CAG-AAA-TT-CT-----TTT-GA-TCCTTGAGTG
gi|90627 : AAAACTTCACCAAAAAATTGATATCT----G-TTATATCTATTA-TGAATTTTT-TGGATT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCACGAT-TCAT--G--ACGAATGTTACTTTTAATGTTACATG-T-ATTTT-T
gi|90628 : gTTTTAAAAACTTCAC-AAAATTTTTATAATT-AATG-ATAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAA-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-CCAT--G--ACAATTGTTACTaatgtatgaaagttgtaatgaatatagagcaaaaattagcagtgcagaaattcttttgatccttgagtg
gi|90628 : AGTA-A-CA-AT-TGTCATG--GATC-TTGAGTG-A-A----TTCT-----GCATATT-TTCT-GAA---AATTT---CA--CAATGAT---ATC-AT--T-AATTA--T-A-AAAATT-TT-----GTG-A---------AGT--T--TT-TA--AAA----T-AT-G--AAAG-TTG---T---A--ATA-G--AT---ATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-ATG----TGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTGtatgaaagttgtaatagatatatagtgaaaattagcaatgtggaaatacttttgacccttgagtg
gi|90629 : TTTTAAAAACTTCAC-AAAAATTTTATATTT-AATG-TTAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCATAATT
gi|90629 : -A-A----TTAT-----GCAT-ATATTCT-GAA---AATTT---CA--CAAT--G---ATA-ACA-T-T--AA-AT-A-TAAA-A-TT-----TTT-GT-------GAA-GTT--TT-TA--AAA----T-AT-G--AAAG-TTG---T---A--ATA-G--AT---ATATA-G--AGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTGtatgaaagttgtaatagatatatagagaaaattagcagtgcggaaatacttttgacccttgagtg
gi|90630 : TGTT--CT-AA--AAATGC-A-AA-G--T----TTG---T---A--ATA-G--ACA-TATATAAG--TTGAA-ATTAGC-A-ATG----CGG-AAA-TA-CT-----TTTGGA-CCCTTGGATG
gi|90631 : A--ATGGA--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGCAA-GTG----CAG-AAA-TA-C------TTT-GA-CCCGTGAGTG
gi|90632 : --TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----TGG-AAA-TAGAA-----TTT-GATTTTTTGAGT
gi|90633 : --TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90634 : ATA-A-G--TGAAA-TTTAGC-AAGTG----CGG-AA--TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGT
Alignments
lowQualScore : 1 1111 111111 11111 111111 2222 11111111 111
lowQualScore : 5 1 2 2 0000 2 2 2 2 2 2 2 33 33 1 0 555555 2 2 5 77 66 7 2 6 3 3 2 2 33333 2 1 000000 5555 33 5 2 2 2 2 2 444 2 2 33 2 2 2 2 2 1111 2 2 2 44444 55 666666 4444 2 333 2 88888 2 888 66 2 00000000 4444 2 2 4 6666 55 2 88 8888 4444 1 55555 0 8 2 333 3 333 22 666666 2 88 2 22 2 4 2 2 99999 1 2 99999999 22 44 22 7777 1 3 22 111 333 55 22 1 44 555 1 22 1 1 1 5555 1 1 1 44444 1 3
lowQualScore : . . . . .... . . . . . . . .. .. . . ...... . . . .. .. . . . . . . . ..... . . ...... .... .. . . . . . . ... . . .. . . . . . .... . . . ..... .. ...... .... . ... . ..... . ... .. . ........ .... . . . .... .. . .. .... .... . ..... . . . ... . ... .. ...... . .. . .. . . . . ..... . . ........ .. .. .. .... . . .. ... ... .. .. . .. ... . .. . . . .... . . . ..... . .
lowQualScore : 3 4 7 7 7777 7 7 7 7 7 5 5 44 44 5 6 333333 7 7 3 99 88 2 9 2 1 1 9 9 66666 9 1 333333 7777 44 0 5 2 4 4 2 111 4 4 22 4 4 4 4 4 1111 4 1 1 66666 88 111111 5555 1 777 1 55555 0 222 88 2 11111111 7777 1 1 2 6666 88 1 77 0000 2222 5 00000 3 0 0 555 0 555 88 333333 0 88 0 88 0 0 0 0 00000 0 0 22222222 66 22 66 4444 9 8 66 999 333 77 55 8 33 222 7 33 7 7 7 2222 7 7 7 33333 7 5
consensus : TTTTAAAAACTTCAC-AAAANTTTTATATTT-AATG-TTAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACAAATGTTACTTTAAATG------G-T-ATTTT-TT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA-GTTGAG-TGTTA-AAAA-C----CG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----TAGTA-A-CAGAT-T----TA--AATC-T--AGGC-A-A----TTAT-----GCATGAT-TTGT-GAG---ATTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--T-G--CA-GT-A-GAAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AA--AAA----A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
Reference ( family-670 ) : TTTTAAAAACTTCAC-AAAANTTTTATATTT-AATG-TTAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACAAATGTTACTTTAAATG------G-T-ATTTT-TT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA-GTTGAG-TGTTA-AAAA-C----CG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----TAGTA-A-CAGAT-T----TA--AATC-T--AGGC-A-A----TTAT-----GCATGAT-TTGT-GAG---ATTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--T-G--CA-GT-A-GAAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AA--AAA----A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90608 : TTTTAAACACTTCAC-AACATTTTTATATTT-AATG-TTAT---TATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACACATGTTACTGTAAATG------G-T-ATTTT-TT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-AAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA-TTTGAG-TGTTA-AAAA-C----CG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----TAGTA-A-CAGAT-T----AA--AATC-T--GGGC-A-A----TTAT-----GCATGAT-TTGT--AG---AGTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--T-G--CA-GT-A-AAAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AA--AAA----A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90609 : TTTTAAACACTTCAC-AACA-TTTTATATTT-AATG-TTAT---TATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACACATGTTACTGTAAATG------G-T-ATTTTTTT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-AAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA--TTGAG-TGTTA-AAAA-C----CG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----TAGTA-A-CAGAT-T----AA--AATC-T--GGGC-A-A----TTAT-----GCATGAT-TTGT-GAG---GTTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--T-G--CA-GT-A--AAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AA--AAA----A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGGGT
gi|90610 : TTTTAAAAACTTCAC-AAAAATTTTATATTT-AATG-TTAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCATAATTC-A-CTCAAGAT-CCAT--G--ACAAGTGTTACTTTAAATG------G-A-ATTTT-TT--A--TATTTTTTTGT-GGGTCGGTTTTTG-AATGA-TGAGGTACATTTT-TT-TT--T--AA-TGCTAAT------TAC----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-G-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA-G-TGAG-TGTTA-AAAA-C----TG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATG--A-T-G------A----TAGTA-A-CAGAT-T----TA--AATT-T--AGGC-C-A----TTGT-----GCATGAT-TTGT-GAG---ATTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--G-A--CA-GT-A-GAAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--A--AA--AAA----A-AT-G--TT---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90611 : TTTTAAAAACTTCAC-AAAATTTTTATAATT-AATG-ATAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAA-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-CCAT--G--ACAATTGTTACTTTAAATG------G-T--TTTT-TTAAA--TATTTTT-TGT-GGGTCGATTATTG-AATGA-TGGAGTACA-TTT-TT-TT--TAAAA-TGCTAAT------TAC----TA--T-GAA-ATGTGTAAGAGTAT-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-T-CCA-G-TGAG-TATTA-AAAA-C----TG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----TAGTA-A-C--AT-T----TA--ACTT-T--AGGC-C-A----TTGT-----GCATGATATTGT-GAG---ATTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--G-G--CA-GT-A-GAAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CC-AA--AAA----A-AT-GCTTA----TA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90612 : TTTTAAAATCTTCA--AAAATTTTTATATTCCAATG-TTAT---CATTGGTGAAATTTTTCAGAATAATA-TGCAGAGTTT-A-CTCAGATT-TCAT-----ACACATGTTACTGTAAATG------G-T-ATTTT-TC--A--TATTTTTTTGT--GGTCGATTTTTGAAAAGA-TGGCGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--TGGAA-AAGTGTAAGG-T-TGACGTTCAA---ATAATAATTCCATAAAA-A-ACATG-A-TTA-TCCCA-G-TGAG-TGTTA-AAAT-C----TG--TA------A----C-ACA---GCAGA-----G-A---AATC--ATT-G------A----TAGTAGA-CAGAT-TG---TA--AATC-T--AGGC-A-A----TTAT-----GCATGAT-TTGC-G-G---ATTTT---CA--T-GT--T---ATG-AC--T-G--CA-GTAA-GAAATATTT-----GAT-AT-------CAGTGCTGCCT-AA--AAA----A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--T-AAA-ATTAGC-A-GTG----CGGAAAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90613 : TTTTTAGAACATC-C-AAAA-TTTTATATTT-AACGTTTAT---CATTG--GGAATTTT-CAG-AT-ATACTGCAGAATTCAA-CTC-AGATATC-T--C--AC-CATGTTACTGTAGATT------G-TAATTTT-TT--A--TA-TTTTGTTTGGGGTTGCTTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--T-------CTGAC------TGA----TAATT-GGACAAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAATATACAC-AATT-CAT---A-A-ACATG-A-T-A-TCCCA-GTGGAGTTGTTGCAAAA-C----TG--TA------A----C-ACA---G---------G-AT--AATA--A-TCG------A----TAGTA-A-C-GAA-A----TA--AATC-T--ACTC---A----TTA------GCATGA--TTGT-GAG---ATTTT---TA--T-GT--T---ATGCACG-C-G--CA-GTCA-GAAATA-TT-----GAT-AC-------CATTGCT--CT-AA--AAA----A-ATGG--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--T-AAA-CTTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90614 : TTAAAA--TTCAC-AAAAATTGTATATAA-AAT--TTAT--------------TTTC-CAGAAT-ATA-T-CAGA--TT-A-CTCAAGAT-CTATATG--ACAAGTGT-ACTTTAAATG------GAT-AATTT-TA--A---ATTGTTATG----GTCGATTTTTG-AATGAATGAGGTACA-TTC-TT-TT--A--AAATGT--AT------TAC----TA--T-GAA----TGTTAGA-T-A-ACGTTCCA---ATAA-AATT-CAT--AA-AGACATG-A-TGA-TCCCG---TGAG-TGTTA-AAAA-C----TG--TA------A--------A---G-AGA-----GGA---AATA--A-T-G------A----AAGTA-A--AGAT-T----TA--AATT-T--AAGC-C-A----TTGT-----GCATGAT-TTGTTGAG----CTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--G-G--CA-GT---GAAATG-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-CA--GAA----ACAA-G--TA---T-A---TT-CA--CTG-A--ATACTATATA-G--TGAAATATTAGC-A-G-G-----GG-AAA-TA-CT-----TTT-GA--CCTTGA
gi|90615 : AAAACTCCAC-AAAAATTATATATTT-AATG-TGAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TACAG-ATTT-A-CTCAAGAT-CCAT--GATACAAATGTTACTTAAATTT------G-T-ATTTT-TA--AACTATTT---TGT-GGGTCGATTTTTA-AATGG-TGGGGTAGA-TTTGTT-TTAAT--AA-TGCTAAT------TAAATATTA--T-G-A-ATTTGTAAGA-T-T-ACG-TGAA---GTAA-AGTT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA-G-TGAG-TATTA-AAAA-C----TC--TA------A----CAACA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------ATAACTAGTA-A-CAGCT-T----TG--AATC-T--AAGC-G-A----TTATAAATGACATGAT-T--T-CAG---A-TTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--T-G--CA-GT-A-GAAATA-TT-----GAT-A--------CAG-GCT--CA-AA--AAA----A-TT-G--TA---TCA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGA-A-GTG----CGG--AA-TA-CCTTAAGTTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90616 : AAAACTTCACCAAAAAATTGATATCT----G-TTATATCTATTA-TGAATTTTT-TGGATT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCACGAT-TCAT--G--ACGAATGTTACTTTTAATGTTACATG-T-ATTTT-TCAAA--GATTTTT-TGT-GGATCGGTTTCTG-AATTA-TGAGGTAGA-CTT-TT-TTA-A--AA-TGCTCATTACCTGTAA----TA--T-GAA-ATGTGTAGGA-T-T-AAGTTCAA---GTAA-ATTT-CAT--AC-A-ACATG-A-TTA-TCCTT-G-TGAG-TGTCA-GAAA-CTGTACA--TA------A----T-GCA---G-AAA-----A-A---AATA--A-C----------------TA-A-CAGAT-C----T------------------------------------------GT-GAA---A-TTT---AA--TAGT--A---AAG-AC--T-G--CA-GT-A-GAAATA-TT-----T-T-AT-------CAGTGAT--TT-----AAA----A-ATGG--TA---TTA---TT-CA--ATG-AT-AT--TATATG-G--TGAAA-AGTAGC-A-GTG----TAG-AAA-TA-AT-----TTT-GA-CCTTTGTGTG
gi|90617 : AACTTCAC-CAAA-TTTGATAT---AAT--TTA-----AT-------ATTTC-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTTACGAT-TCAT--A----------TACTTTAAATG------T-T-ATTTT----------------TGT-GGGTCG
gi|90618 : GCAGAATTC-ATCTCAA-AT-ATAT--G--ACAAA-GTTACTT-AAATG--------T-ATTTT-TT--AA-TATTTTTGTG---GTTCGACTTTTCTAAT-A-TTGTGTACA-CTT-TT-TT-----AA-TGCTAAT------TGC----TA--TTGAA-AT-T-TAAGG-----ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-T-ACATG-AATGAATCCCG---TGAG--GTTA-AAAAAC----TG--TA------A----C-ACATCAG-ATA-----G-ATA-AATAC-A-T--------A----TACTA-AACAGAT-T----TA--AATTGT--AGG----A----CTGT-----GCACGAT-------AG---ATTTG---TAATTATTC-T---ATT-A---T-A--CA--T-G-AAATTA-TTATGCGGAT-ATATCTTACCAGTGCT--CT-AA--AAA----A-AT-G--TA---CTA---TT-CT--ATG-A--AA--TATATA-AGTTGAAA-ATCAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GACCCCTTGAG
gi|90619 : -CTCAA------AT--G---CAAATTTTACTTTTGATG------A-T-ATTTT-TT--A--TATTCTTTTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGAGGTAGA-TCT-TTATT--T--AC-TGCTAAT------TAA----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-T-T-ACG
gi|90620 : TTTTAAACACTTCAC-AACATTTTTATATTT-AATG-TTAT---TATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACACATGTTACTGTAAATG------G-T-ATTTT-TT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-AAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA-TTTGAG-TGTTA-AAAA-C----CG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--
gi|90620 : TCA-AAAA-T----CGACCC------A----C-ACA---A-AAATATAAA-A---AATACCA-T-TT-----A----CAGTA-A-CATGTGT----CATGAATC-TTGAGTG-A-A----TTCT-----GCAT-ATATTCT-GAA---AATTT---CA--CAAT--A---ATA-ACATT-A--AATAT-A-AAAATG-TT-----GTG-A---------AGTGTT---T-AA--AAA----T-AT-G--AAAAGTTG---T---A--ATA-G--AT---ATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTGatatgaaaagttgtaatagatatatagtgaaaattagcagtgcggaaatacttttgacccttgagtg
gi|90621 : tatttctctctgtgttacggtttttaacactcaaatgggatcatcatgttttatgaattttatttgaacgtaatcttacacttttcatattaatcagcattgaaaaaaatctaccccatcatTTTTAAACACTTCAC-AACA-TTTTATATTT-AATG-TTAT---TATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACACATGTTACTGTAAATG------G-T-ATTTTTTT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-AAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA--TTGAG-TGTTA-AAAA-C----CG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--
gi|90621 : TCA-AAAA-T----CGACCC------A----C-ACA---A-AAATAT--A-A---AAAA--A-T-ACCATTTA----CAGTA-A-CATGTGT----CATGAATC-TTGAGTG-A-A----TTCT-----GCAT-ATATTCT-GAA---AATTT---CA--CAAT--A---ATA-ACA-T-T--AA-AT-ATAAAATG-TT-----GTG-A---------AGTGTT---T-AA--AAA----T-AT-G--AAAGTTTG---T---A--ATA-G--AT---ATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTGG---CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTGatatgaaagtttgtaatagatatatagtgaaaattagcagtggcggaaatacttttgacccttgagtg
gi|90622 : tatttctctctgtgttacggtttttaacactcaatgggatcatcatgttttatgaattttatttgaacgtaatcttacacttttcatattaatcagcattgaaaaaaatctaccccatcat-TT-TT--C--GA-CAGTCATA-----TAA----TA--T--AG-ATGTGCA----T-T-GTGTTGCA---ATGA-AAT-------AA-A-AGAAG-T-TCA-TCTCATACTGAG--------AAA-C----TG--TATATAACA----T-ACA---T-AGA-----A-A---AAAA--A-T-T------A----AAATG-T-CAGAT-T----TA--AATC-T--AGG---------------------TGAT-TTGT-GAA---ATTTT---TA--TCCT--G---ATG-AC--T-G--CT-GT-A-GA----------------AT-------CAGTGCT--TT--A--AAA----G-TT-A--TA---TTA---TT-AATTATG-ATTAT--TCTAT--------AA-ATTAGC-A-GTG----CAG-A
gi|90623 : AT------TAA----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-C-ACAAG-A-TGA-TCACA-GT-GAG-TGTTA-AAAA-C----TG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----A-A---AATA--A-T-G------A----TAGTA-A-CAGAT-T----TA--AATC-T--AGGC-A-AAATTTTAT-----GCATGAT-TTGT-GAG---ATTTT---TA--TAGT--T---ATA-AC--T-G--CA-GT-A-GAAATA-TT-----GAT-AT-------CTGTGCT--CT-AA--AAA----A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TACATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTGCAGTCAG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90624 : aA--T-GAA-ATGTATAAGA-G-T-ACGTTCAA---ATAA-GATT-CAT--TTTA-ACATG-A-TGT-TCCCA-GT---G-TGTTA-AAAA-C----TG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----GAGTA-A-CAGAT-T----TA--AATT-T--AGGCCATA----TTGT-----GCATGAT-TTGT-GAG---ATTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--T-G--CA-GT-A-GAAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AA--AAA----A-AT-G--TA---CTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90625 : -T-T-ACATTCAA---ATAA-AATT-CGT--GA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA-GT-GAG-TGTTA-AAAA-G----TG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-AGATAATA--A-T-G------A----TATTA-A-CAGAT-T----TA--AATC-T--AGGC-T-A----TTAT-----GCATGAT-TTGT-GAT---ATTTT---TG--TAGT--T---ATG-AC--T-G--CT-GT-A-GAA----------------------------GCT--CT--T--AAA----A-AT-G--TA---------------------------TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CAG-AAAGTA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90626 : -ACGTTCAA---ATAA-AGTT-CAT--AA-A-ACATGGA-TGA-TCCCA-GT-GAG-TGTTA-AAAA-C----TG--TA------AATAAC-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--T-T-G------A----TAGTA-A-CAGAT-T----TA--AATC-T--AGGC-G-A----TTAT-----GCATAGT-TTGT-GAG---ATTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--T-G--CA-AT-A-GAAATA-TTG----GATAAT-------CAGTGCT--CTAAA--AAA----A-AT-G--------TA---TT-CA--ATG-A--AT--TATA
gi|90627 : GA-----A-A---AATAC-A-T-G--------------TA-A-CA----T----TA--AAAG-T--AA-C-A-T----TCGT------CATGAA-TCGT-GAGTGAATTCTGCATA--TAAT--CCAAAAA-AT--TCA--TA-AT-A-GATATA-ACA----GAT-AT-------CAATTTT--TT-GGTGAAGTTTTA-AT-G--TA---TGAAAGTTGTA--ATG-A--AT---ATAGA-G--CAAAA-ATTAGC-A-GTG----CAG-AAA-TT-CT-----TTT-GA-TCCTTGAGTG
gi|90627 : AAAACTTCACCAAAAAATTGATATCT----G-TTATATCTATTA-TGAATTTTT-TGGATT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCACGAT-TCAT--G--ACGAATGTTACTTTTAATGTTACATG-T-ATTTT-T
gi|90628 : gTTTTAAAAACTTCAC-AAAATTTTTATAATT-AATG-ATAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAA-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-CCAT--G--ACAATTGTTACTaatgtatgaaagttgtaatgaatatagagcaaaaattagcagtgcagaaattcttttgatccttgagtg
gi|90628 : AGTA-A-CA-AT-TGTCATG--GATC-TTGAGTG-A-A----TTCT-----GCATATT-TTCT-GAA---AATTT---CA--CAATGAT---ATC-AT--T-AATTA--T-A-AAAATT-TT-----GTG-A---------AGT--T--TT-TA--AAA----T-AT-G--AAAG-TTG---T---A--ATA-G--AT---ATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-ATG----TGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTGtatgaaagttgtaatagatatatagtgaaaattagcaatgtggaaatacttttgacccttgagtg
gi|90629 : TTTTAAAAACTTCAC-AAAAATTTTATATTT-AATG-TTAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCATAATT
gi|90629 : -A-A----TTAT-----GCAT-ATATTCT-GAA---AATTT---CA--CAAT--G---ATA-ACA-T-T--AA-AT-A-TAAA-A-TT-----TTT-GT-------GAA-GTT--TT-TA--AAA----T-AT-G--AAAG-TTG---T---A--ATA-G--AT---ATATA-G--AGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTGtatgaaagttgtaatagatatatagagaaaattagcagtgcggaaatacttttgacccttgagtg
gi|90630 : TGTT--CT-AA--AAATGC-A-AA-G--T----TTG---T---A--ATA-G--ACA-TATATAAG--TTGAA-ATTAGC-A-ATG----CGG-AAA-TA-CT-----TTTGGA-CCCTTGGATG
gi|90631 : A--ATGGA--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGCAA-GTG----CAG-AAA-TA-C------TTT-GA-CCCGTGAGTG
gi|90632 : --TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----TGG-AAA-TAGAA-----TTT-GATTTTTTGAGT
gi|90633 : --TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90634 : ATA-A-G--TGAAA-TTTAGC-AAGTG----CGG-AA--TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGT
blockSeqs : C A C T ATCT G T A C A T A AT AT C TTACAT A A T AA AC G G A A T G A TAA A G TACCTG ATAT AT G C A G A G TAT T C AA T G G A A TACT T C A TGTAC AC TATAAC ATAA A TCA C TATAA G GAT CC T ACCATTT TAAC G A G GTCA TG G TG CCAT AATT A AAATG A T TGA T GCA AT CCAA C AT C AT T A T T ATGCG A A TATCTTAC GC AA TG TTTT C G CT AAG AAG TG TT G TT ACT A GT T A A CAGT A G G TTAAG G C
blockSeqs : C T . . ATCT . . . . . . . . . A TTACAT . . T AA A T . T . . . . AAT . A A . . T . T . . . . . . . . . . . . GTG . . . C AC . . . . . TAT . TA C . CG . . . G G TG . TG CA . G . A . . T . . GAT . G . . . C . . G A . T . A . TGC . G . AGT . T . . T AT . . . . . G . . . . . T
blockSeqs : . T . . T . . . . . . . . . A . . . . . . T . . . . . . AA . A . . . . . T . . . . . . . . . . . . TTT . . . T . . . . . . . . T C . TT . . . . . . . TG CC . G . A . . T . . CT . A . . . . . . A A . T . A . . . . . AG . T . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . C . . . . . . . . . C . . . . . . G . . . . . . C . G . . . . . A . . . . . . . . . . . . TT . . . T . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . CC . A . A . . T . . T . A . . . . . . . A . T . A . . . . . AG . T . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . C . . . . . . . . . C . . . . . . A . . . . . . T . G . . . . . A . . . . . . . . . . . . GT . . . T . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . CA . A . . . . T . . T . . . . . . . . . A . T . A . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . C . . . . . . . . . A . . . . . . G . . . . . . C . A . . . . . T . . . . . . . . . . . . GT . . . T . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . CC . G . . . . C . . T . . . . . . . . . A . C . A . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . C . . . . . . . . . A . . . . . . T . . . . . . T . C . . . . . T . . . . . . . . . . . . GT . . . T . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . CG . A . . . . T . . T . . . . . . . . . A . T . C . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . C . . . . . . . . . A . . . . . . G . . . . . . A . A . . . . . T . . . . . . . . . . . . GT . . . T . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . GA . G . . . . A . . T . . . . . . . . . A . T . A . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . T . . . . . . . . . A . . . . . . G . . . . . . T . A . . . . . T . . . . . . . . . . . . GT . . . T . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . GA . C . . . . A . . T . . . . . . . . . T . T . A . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . T . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . C . G . . . . . A . . . . . . . . . . . . TT . . . C . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . CA . C . . . . T . . T . . . . . . . . . T . T . A . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . C . G . . . . . A . . . . . . . . . . . . GT . . . C . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . CT . A . . . . T . . A . . . . . . . . . A . T . A . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . C . C . . . . . T . . . . . . . . . . . . GT . . . C . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . CG . G . . . . T . . A . . . . . . . . . A . T . A . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . GT . . . C . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . CA . A . . . . T . . A . . . . . . . . . A . T . A . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . GT . . . T . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . GA . A . . . . T . . G . . . . . . . . . A . T . G . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . C . G . . . . T . . T . . . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . A . . T . . . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . A . . T . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqCons : GT**
originalCons : TTTTAAAAACTTCAC-AAAANTTTTATATTT-AATG-TTAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACAAATGTTACTTTAAATG------G-T-ATTTT-TT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA-GTTGAG-TGTTA-AAAA-C----CG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----TAGTA-A-CAGAT-T----TA--AATC-T--AGGC-A-A----TTAT-----GCATGAT-TTGT-GAG---ATTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--T-G--CA-GT-A-GAAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AA--AAA----A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
finalCons : TTTTAAAAACTTCAC-AAAANTTTTATATTT-AATG-TTAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACAAATGTTACTTTAAATG------G-T-ATTTT-TT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCAGT--GAG-TGTTA-AAAA-C----CG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----TAGTA-A-CAGAT-T----TA--AATC-T--AGGC-A-A----TTAT-----GCATGAT-TTGT-GAG---ATTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--T-G--CA-GT-A-GAAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AA--AAA----A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
Alignments
lowQualScore : 1 1111 111111 11 11111 11111111111 11111111 111
lowQualScore : 5 1 2 2 0000 2 2 2 2 2 2 2 33 33 1 0 555555 2 2 5 33 00 7 2 6 3 2 2 33333 5 1 2 00000000000 33 5 2 2 2 2 2 444 2 2 33 2 2 2 2 2 4 2 2 2 2 44444 55 666666 4444 2 333 2 88888 2 888 66 2 00000000 4444 2 2 4 6666 55 2 88 8888 4444 1 55555 0 8 2 333 3 333 22 666666 2 88 2 22 2 4 2 2 99999 1 2 99999999 22 44 22 7777 1 3 22 111 333 55 22 1 44 555 1 22 1 1 1 5555 1 1 1 44444 1 3
lowQualScore : . . . . .... . . . . . . . .. .. . . ...... . . . .. .. . . . . . . ..... . . . ........... .. . . . . . . ... . . .. . . . . . . . . . . ..... .. ...... .... . ... . ..... . ... .. . ........ .... . . . .... .. . .. .... .... . ..... . . . ... . ... .. ...... . .. . .. . . . . ..... . . ........ .. .. .. .... . . .. ... ... .. .. . .. ... . .. . . . .... . . . ..... . .
lowQualScore : 3 4 7 7 7777 7 7 7 7 7 5 5 44 44 5 6 333333 7 7 3 99 77 2 9 2 1 9 9 66666 7 1 7 77777777777 44 0 5 2 4 4 2 111 4 4 22 4 4 4 4 4 7 4 4 1 1 66666 88 111111 5555 1 777 1 55555 0 222 88 2 11111111 7777 1 1 2 6666 88 1 77 0000 2222 5 00000 3 0 0 555 0 555 88 333333 0 88 0 88 0 0 0 0 00000 0 0 22222222 66 22 66 4444 9 8 66 999 333 77 55 8 33 222 7 33 7 7 7 2222 7 7 7 33333 7 5
consensus : TTTTAAAAACTTCAC-AAAANTTTTATATTT-AATG-TTAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACAAATGTTACTTTAAATG------G-T-ATTTT-TT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGATTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT-TA------A----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA-GT-GAG-TGTTA-AAAA-C----CG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----TAGTA-A-CAGAT-T----TA--AATC-T--AGGC-A-A----TTAT-----GCATGAT-TTGT-GAG---ATTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--T-G--CA-GT-A-GAAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AA--AAA----A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
Reference ( family-670 ) : TTTTAAAAACTTCAC-AAAANTTTTATATTT-AATG-TTAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACAAATGTTACTTTAAATG------G-T-ATTTT-TT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGATTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT-TA------A----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA-GT-GAG-TGTTA-AAAA-C----CG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----TAGTA-A-CAGAT-T----TA--AATC-T--AGGC-A-A----TTAT-----GCATGAT-TTGT-GAG---ATTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--T-G--CA-GT-A-GAAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AA--AAA----A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90608 : TTTTAAACACTTCAC-AACATTTTTATATTT-AATG-TTAT---TATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACACATGTTACTGTAAATG------G-T-ATTTT-TT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGATTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT-TA------A----TA--T-GAA-AAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCATTT-GAG-TGTTA-AAAA-C----CG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----TAGTA-A-CAGAT-T----AA--AATC-T--GGGC-A-A----TTAT-----GCATGAT-TTGT--AG---AGTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--T-G--CA-GT-A-AAAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AA--AAA----A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90609 : TTTTAAACACTTCAC-AACA-TTTTATATTT-AATG-TTAT---TATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACACATGTTACTGTAAATG------G-T-ATTTTTTT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGATTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT-TA------A----TA--T-GAA-AAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA-TT-GAG-TGTTA-AAAA-C----CG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----TAGTA-A-CAGAT-T----AA--AATC-T--GGGC-A-A----TTAT-----GCATGAT-TTGT-GAG---GTTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--T-G--CA-GT-A--AAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AA--AAA----A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGGGT
gi|90610 : TTTTAAAAACTTCAC-AAAAATTTTATATTT-AATG-TTAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCATAATTC-A-CTCAAGAT-CCAT--G--ACAAGTGTTACTTTAAATG------G-A-ATTTT-TT--A--TATTTTTTTGT-GGGTCGGTTTTTG-AATGA-TGAGGTACATTT-TT-TT--TT-AA-TGCTAAT-TA------C----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-G-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA-GT-GAG-TGTTA-AAAA-C----TG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATG--A-T-G------A----TAGTA-A-CAGAT-T----TA--AATT-T--AGGC-C-A----TTGT-----GCATGAT-TTGT-GAG---ATTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--G-A--CA-GT-A-GAAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--A--AA--AAA----A-AT-G--TT---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90611 : TTTTAAAAACTTCAC-AAAATTTTTATAATT-AATG-ATAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAA-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-CCAT--G--ACAATTGTTACTTTAAATG------G-T--TTTT-TTAAA--TATTTTT-TGT-GGGTCGATTATTG-AATGA-TGGAGTACATTT-TT-TT--TAAAA-TGCTAAT-TA------C----TA--T-GAA-ATGTGTAAGAGTAT-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-T-CCA-GT-GAG-TATTA-AAAA-C----TG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----TAGTA-A-C--AT-T----TA--ACTT-T--AGGC-C-A----TTGT-----GCATGATATTGT-GAG---ATTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--G-G--CA-GT-A-GAAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CC-AA--AAA----A-AT-GCTTA----TA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90612 : TTTTAAAATCTTCA--AAAATTTTTATATTCCAATG-TTAT---CATTGGTGAAATTTTTCAGAATAATA-TGCAGAGTTT-A-CTCAGATT-TCAT-----ACACATGTTACTGTAAATG------G-T-ATTTT-TC--A--TATTTTTTTGT--GGTCGATTTTTGAAAAGA-TGGCGTAGATTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT-TA------A----TA--TGGAA-AAGTGTAAGG-T-TGACGTTCAA---ATAATAATTCCATAAAA-A-ACATG-A-TTA-TCCCA-GT-GAG-TGTTA-AAAT-C----TG--TA------A----C-ACA---GCAGA-----G-A---AATC--ATT-G------A----TAGTAGA-CAGAT-TG---TA--AATC-T--AGGC-A-A----TTAT-----GCATGAT-TTGC-G-G---ATTTT---CA--T-GT--T---ATG-AC--T-G--CA-GTAA-GAAATATTT-----GAT-AT-------CAGTGCTGCCT-AA--AAA----A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--T-AAA-ATTAGC-A-GTG----CGGAAAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90613 : TTTTTAGAACATC-C-AAAA-TTTTATATTT-AACGTTTAT---CATTG--GGAATTTT-CAG-AT-ATACTGCAGAATTCAA-CTC-AGATATC-T--C--AC-CATGTTACTGTAGATT------G-TAATTTT-TT--A--TA-TTTTGTTTGGGGTTGCTTTTTG-AATGA-TGGGGTAGATTT-TT-TT--T-------CTGAC-TG------A----TAATT-GGACAAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAATATACAC-AATT-CAT---A-A-ACATG-A-T-A-TCCCA-GTGGAGTTGTTGCAAAA-C----TG--TA------A----C-ACA---G---------G-AT--AATA--A-TCG------A----TAGTA-A-C-GAA-A----TA--AATC-T--ACTC---A----TTA------GCATGA--TTGT-GAG---ATTTT---TA--T-GT--T---ATGCACG-C-G--CA-GTCA-GAAATA-TT-----GAT-AC-------CATTGCT--CT-AA--AAA----A-ATGG--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--T-AAA-CTTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90614 : TTAAAA--TTCAC-AAAAATTGTATATAA-AAT--TTAT--------------TTTC-CAGAAT-ATA-T-CAGA--TT-A-CTCAAGAT-CTATATG--ACAAGTGT-ACTTTAAATG------GAT-AATTT-TA--A---ATTGTTATG----GTCGATTTTTG-AATGAATGAGGTACATTC-TT-TT--A--AAATGT--AT-TA------C----TA--T-GAA----TGTTAGA-T-A-ACGTTCCA---ATAA-AATT-CAT--AA-AGACATG-A-TGA-TCCC--GT-GAG-TGTTA-AAAA-C----TG--TA------A--------A---G-AGA-----GGA---AATA--A-T-G------A----AAGTA-A--AGAT-T----TA--AATT-T--AAGC-C-A----TTGT-----GCATGAT-TTGTTGAG----CTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--G-G--CA-GT---GAAATG-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-CA--GAA----ACAA-G--TA---T-A---TT-CA--CTG-A--ATACTATATA-G--TGAAATATTAGC-A-G-G-----GG-AAA-TA-CT-----TTT-GA--CCTTGA
gi|90615 : AAAACTCCAC-AAAAATTATATATTT-AATG-TGAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TACAG-ATTT-A-CTCAAGAT-CCAT--GATACAAATGTTACTTAAATTT------G-T-ATTTT-TA--AACTATTT---TGT-GGGTCGATTTTTA-AATGG-TGGGGTAGATTTGTT-TTAAT--AA-TGCTAAT-TA------AATATTA--T-G-A-ATTTGTAAGA-T-T-ACG-TGAA---GTAA-AGTT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA-GT-GAG-TATTA-AAAA-C----TC--TA------A----CAACA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------ATAACTAGTA-A-CAGCT-T----TG--AATC-T--AAGC-G-A----TTATAAATGACATGAT-T--T-CAG---A-TTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--T-G--CA-GT-A-GAAATA-TT-----GAT-A--------CAG-GCT--CA-AA--AAA----A-TT-G--TA---TCA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGA-A-GTG----CGG--AA-TA-CCTTAAGTTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90616 : AAAACTTCACCAAAAAATTGATATCT----G-TTATATCTATTA-TGAATTTTT-TGGATT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCACGAT-TCAT--G--ACGAATGTTACTTTTAATGTTACATG-T-ATTTT-TC--AAAGATTTTT-TGT-GGATCGGTTTCTG-AATTA-TGAGGTAGACTT-TT-TT--A--AAATGCTCAT-TACCTGTAA----TA--T-GAA-ATGTGTAGGA-T-T-AAGTTCAA---GTAA-ATTT-CAT--AC-A-ACATG-A-TTA-TCCTT-GT-GAG-TGTCA-GAAA-CTGTACA--TA------A----T-GCA---G-AAA-----A-A---AATA--A-C----------------TA-A-CAGAT-C----T------------------------------------------GT-GAA---A-TTT---AA--TAGT--A---AAG-AC--T-G--CA-GT-A-GAAATA-TT-----T-T-AT-------CAGTGAT--TT-----AAA----A-ATGG--TA---TTA---TT-CA--ATG-AT-AT--TATATG-G--TGAAA-AGTAGC-A-GTG----TAG-AAA-TA-AT-----TTT-GA-CCTTTGTGTG
gi|90617 : AACTTCAC-CAAA-TTTGATAT---AAT--TTA-----AT-------ATTTC-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTTACGAT-TCAT--A----------TACTTTAAATG------T-T-ATTTT----------------TGT-GGGTCG
gi|90618 : GCAGAATTC-ATCTCAA-AT-ATAT--G--ACAAA-GTTACTT-AAATG--------T-ATTTT-TT--AA-TATTTTTGTG---GTTCGACTTTTCTAAT-A-TTGTGTACACTT-TT-TT-----AA-TGCTAAT-TG------C----TA--TTGAA-AT-T-TAAGG-----ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-T-ACATG-AATGAATCCC--GT-GAG--GTTA-AAAAAC----TG--TA------A----C-ACATCAG-ATA-----G-ATA-AATAC-A-T--------A----TACTA-AACAGAT-T----TA--AATTGT--AGG----A----CTGT-----GCACGAT-------AG---ATTTG---TAATTATTC-T---ATT-A---T-A--CA--T-G-AAATTA-TTATGCGGAT-ATATCTTACCAGTGCT--CT-AA--AAA----A-AT-G--TA---CTA---TT-CT--ATG-A--AA--TATATA-AGTTGAAA-ATCAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GACCCCTTGAG
gi|90619 : -CTCAA------AT--G---CAAATTTTACTTTTGATG------A-T-ATTTT-TT--A--TATTCTTTTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGAGGTAGATCT-TTATT--T--AC-TGCTAAT-TA------A----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-T-T-ACG
gi|90620 : TTTTAAACACTTCAC-AACATTTTTATATTT-AATG-TTAT---TATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACACATGTTACTGTAAATG------G-T-ATTTT-TT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGATTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT-TA------A----TA--T-GAA-AAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCATTT-GAG-TGTTA-AAAA-C----CG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--
gi|90620 : TCA-AAAA-T----CGACCC------A----C-ACA---A-AAATATAAA-A---AATACCA-T-TT-----A----CAGTA-A-CATGTGT----CATGAATC-TTGAGTG-A-A----TTCT-----GCAT-ATATTCT-GAA---AATTT---CA--CAAT--A---ATA-ACATT-A--AATAT-A-AAAATG-TT-----GTG-A---------AGTGTT---T-AA--AAA----T-AT-G--AAAAGTTG---T---A--ATA-G--AT---ATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTGatatgaaaagttgtaatagatatatagtgaaaattagcagtgcggaaatacttttgacccttgagtg
gi|90621 : tatttctctctgtgttacggtttttaacactcaaatgggatcatcatgttttatgaattttatttgaacgtaatcttacacttttcatattaatcagcattgaaaaaaatctaccccatcatTTTTAAACACTTCAC-AACA-TTTTATATTT-AATG-TTAT---TATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACACATGTTACTGTAAATG------G-T-ATTTTTTT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGATTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT-TA------A----TA--T-GAA-AAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA-TT-GAG-TGTTA-AAAA-C----CG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--
gi|90621 : TCA-AAAA-T----CGACCC------A----C-ACA---A-AAATAT--A-A---AAAA--A-T-ACCATTTA----CAGTA-A-CATGTGT----CATGAATC-TTGAGTG-A-A----TTCT-----GCAT-ATATTCT-GAA---AATTT---CA--CAAT--A---ATA-ACA-T-T--AA-AT-ATAAAATG-TT-----GTG-A---------AGTGTT---T-AA--AAA----T-AT-G--AAAGTTTG---T---A--ATA-G--AT---ATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTGG---CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTGatatgaaagtttgtaatagatatatagtgaaaattagcagtggcggaaatacttttgacccttgagtg
gi|90622 : tatttctctctgtgttacggtttttaacactcaatgggatcatcatgttttatgaattttatttgaacgtaatcttacacttttcatattaatcagcattgaaaaaaatctaccccatcat-TT-TT--C--GA-CAGTCATATA------A----TA--T--AG-ATGTGCA----T-T-GTGTTGCA---ATGA-AAT-------AA-A-AGAAG-T-TCA-TCTCA--T--AC-TG--A-GAAA-C----TG--TATATAACA----T-ACA---T-AGA-----A-A---AAAA--A-T-T------A----AAATG-T-CAGAT-T----TA--AATC-T--AGG---------------------TGAT-TTGT-GAA---ATTTT---TA--TCCT--G---ATG-AC--T-G--CT-GT-A-GA----------------AT-------CAGTGCT--TT--A--AAA----G-TT-A--TA---TTA---TT-AATTATG-ATTAT--TCTAT--------AA-ATTAGC-A-GTG----CAG-A
gi|90623 : AT-TA------A----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-C-ACAAG-A-TGA-TCACA-GT-GAG-TGTTA-AAAA-C----TG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----A-A---AATA--A-T-G------A----TAGTA-A-CAGAT-T----TA--AATC-T--AGGC-A-AAATTTTAT-----GCATGAT-TTGT-GAG---ATTTT---TA--TAGT--T---ATA-AC--T-G--CA-GT-A-GAAATA-TT-----GAT-AT-------CTGTGCT--CT-AA--AAA----A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TACATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTGCAGTCAG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90624 : aA--T-GAA-ATGTATAAGA-G-T-ACGTTCAA---ATAA-GATT-CAT--TTTA-ACATG-A-TGT-TCCCA-GT-G---TGTTA-AAAA-C----TG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----GAGTA-A-CAGAT-T----TA--AATT-T--AGGCCATA----TTGT-----GCATGAT-TTGT-GAG---ATTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--T-G--CA-GT-A-GAAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AA--AAA----A-AT-G--TA---CTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90625 : -T-T-ACATTCAA---ATAA-AATT-CGT--GA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA-GT-GAG-TGTTA-AAAA-G----TG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-AGATAATA--A-T-G------A----TATTA-A-CAGAT-T----TA--AATC-T--AGGC-T-A----TTAT-----GCATGAT-TTGT-GAT---ATTTT---TG--TAGT--T---ATG-AC--T-G--CT-GT-A-GAA----------------------------GCT--CT--T--AAA----A-AT-G--TA---------------------------TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CAG-AAAGTA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90626 : -ACGTTCAA---ATAA-AGTT-CAT--AA-A-ACATGGA-TGA-TCCCA-GT-GAG-TGTTA-AAAA-C----TG--TA------AATAAC-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--T-T-G------A----TAGTA-A-CAGAT-T----TA--AATC-T--AGGC-G-A----TTAT-----GCATAGT-TTGT-GAG---ATTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--T-G--CA-AT-A-GAAATA-TTG----GATAAT-------CAGTGCT--CTAAA--AAA----A-AT-G--------TA---TT-CA--ATG-A--AT--TATA
gi|90627 : GA-----A-A---AATAC-A-T-G--------------TA-A-CA----T----TA--AAAG-T--AA-C-A-T----TCGT------CATGAA-TCGT-GAGTGAATTCTGCATA--TAAT--CCAAAAA-AT--TCA--TA-AT-A-GATATA-ACA----GAT-AT-------CAATTTT--TT-GGTGAAGTTTTA-AT-G--TA---TGAAAGTTGTA--ATG-A--AT---ATAGA-G--CAAAA-ATTAGC-A-GTG----CAG-AAA-TT-CT-----TTT-GA-TCCTTGAGTG
gi|90627 : AAAACTTCACCAAAAAATTGATATCT----G-TTATATCTATTA-TGAATTTTT-TGGATT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCACGAT-TCAT--G--ACGAATGTTACTTTTAATGTTACATG-T-ATTTT-T
gi|90628 : gTTTTAAAAACTTCAC-AAAATTTTTATAATT-AATG-ATAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAA-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-CCAT--G--ACAATTGTTACTaatgtatgaaagttgtaatgaatatagagcaaaaattagcagtgcagaaattcttttgatccttgagtg
gi|90628 : AGTA-A-CA-AT-TGTCATG--GATC-TTGAGTG-A-A----TTCT-----GCATATT-TTCT-GAA---AATTT---CA--CAATGAT---ATC-AT--T-AATTA--T-A-AAAATT-TT-----GTG-A---------AGT--T--TT-TA--AAA----T-AT-G--AAAG-TTG---T---A--ATA-G--AT---ATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-ATG----TGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTGtatgaaagttgtaatagatatatagtgaaaattagcaatgtggaaatacttttgacccttgagtg
gi|90629 : TTTTAAAAACTTCAC-AAAAATTTTATATTT-AATG-TTAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCATAATT
gi|90629 : -A-A----TTAT-----GCAT-ATATTCT-GAA---AATTT---CA--CAAT--G---ATA-ACA-T-T--AA-AT-A-TAAA-A-TT-----TTT-GT-------GAA-GTT--TT-TA--AAA----T-AT-G--AAAG-TTG---T---A--ATA-G--AT---ATATA-G--AGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTGtatgaaagttgtaatagatatatagagaaaattagcagtgcggaaatacttttgacccttgagtg
gi|90630 : TGTT--CT-AA--AAATGC-A-AA-G--T----TTG---T---A--ATA-G--ACA-TATATAAG--TTGAA-ATTAGC-A-ATG----CGG-AAA-TA-CT-----TTTGGA-CCCTTGGATG
gi|90631 : A--ATGGA--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGCAA-GTG----CAG-AAA-TA-C------TTT-GA-CCCGTGAGTG
gi|90632 : --TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----TGG-AAA-TAGAA-----TTT-GATTTTTTGAGT
gi|90633 : --TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90634 : ATA-A-G--TGAAA-TTTAGC-AAGTG----CGG-AA--TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGT