lowQualScore                  :          1          1                      111                                                                            111111           11111                                                   11111          111111                  1                                                             3333                        111111                                      11111111                     22222222      1111111111111                      22222222                                          111111111111111111                             1111                                                                                          
lowQualScore                  :       3  1       6  3 4   2      2      2  000     2         2      2   2           5    0   2    33    6666       9      999999   2  2    44444      88      3          6     3         3   3  3  55555  3    1  111111   6666  33 5   2 1        2 2 2        444    2    2   33  2 2     2 2   2     2222    2    2    2 55555   444444 4444  2  333 2   99999 2 999    55 2 22222222   5555   2 2 2    4 11111111    2 4444444444444  1  55555    6  2 6  66666666         33    55  99    77  2 666     2  222222222222222222       22  4     333   4 22  3333  333 66  22   1 44  555     1 22     1      1 1   5555   1   1  1  44444   1  3          
lowQualScore                  :       .  .       .  . .   .      .      .  ...     .         .      .   .           .    .   .    ..    ....       .      ......   .  .    .....      ..      .          .     .         .   .  .  .....  .    .  ......   ....  .. .   . .        . . .        ...    .    .   ..  . .     . .   .     ....    .    .    . .....   ...... ....  .  ... .   ..... . ...    .. . ........   ....   . . .    . ........    . .............  .  .....    .  . .  ........         ..    ..  ..    ..  . ...     .  ..................       ..  .     ...   . ..  ....  ... ..  ..   . ..  ...     . ..     .      . .   ....   .   .  .  .....   .  .          
lowQualScore                  :       1  2       2  1 8   2      9      9  000     9         9      9   9           3    1   7    77    7777       6      333333   9  9    88888      99      1          7     3         3   1  1  44444  1    9  111111   1111  77 3   7 3        5 5 4        444    5    5   44  5 5     5 5   5     7777    5    2    2 44444   222222 7777  2  999 2   44444 2 222    33 5 66666666   0000   4 4 4    7 77777777    4 9999999999999  8  66666    7  2 7  88888888         11    33  77    55  2 888     2  444444444444444444       99  2     555   0 88  5555  555 55  66   9 55  888     7 44     7      7 7   4444   7   8  8  55555   8  6          
consensus                     :  TTTTA-AAAACTTCAC-AAAANTTTTATATTT-AATGTT-AT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTCA-CTCAAGAT-TCAT--GACAAA--TGTTACTTTAAATG------GTA-TT-TTTT--A--TATTTTTGTGTGGG-TCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCAN-TTGAGT-GTTA-AAAA-C----CGTA------A----CA-CA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------ATA----GTA-A-C-AGAT-TT----A--AATC-T-AGGC-A-A----TTATG-----CATG-AT-T-TGTGAGAN--TTTTATAGT--TATG--AC--TGCA--GT-A-G-AAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AAAAA---AAT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
Reference ( gi|90608 )        :  TTTTA-AACACTTCAC-AACATTTTTATATTT-AATGTT-AT---TATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTCA-CTCAAGAT-TCAT--GACACA--TGTTACTGTAAATG------GTA-TT-TTTT--A--TATTTTTGTGTGGG-TCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-AAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCAT-TTGAGT-GTTA-AAAA-C----CGTA------A----CA-CA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------ATA----GTA-A-C-AGAT-TA----A--AATC-T-GGGC-A-A----TTATG-----CATG-AT-T-TGT-AGAG--TTTTATAGT--TATG--AC--TGCA--GT-A-A-AAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AAAAA---AAT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90609                      :  TTTTA-AACACTTCAC-AACATTTT-ATATTT-AATGTT-AT---TATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTCA-CTCAAGAT-TCAT--GACACA--TGTTACTGTAAATG------GTA-TT-TTTTT-A--TATTTTTGTGTGGG-TCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-AAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCAT-T-GAGT-GTTA-AAAA-C----CGTA------A----CA-CA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------ATA----GTA-A-C-AGAT-TA----A--AATC-T-GGGC-A-A----TTATG-----CATG-AT-T-TGT--GAGGTTTTTATAGT--TATG--AC--TGCA--GT---A-AAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AAAAA---AAT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGGGT
gi|90610                      :  TTTTA-AAAACTTCAC-AAAAATTTTATATTT-AATGTT-AT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCATAATTCA-CTCAAGAT-CCAT--GACAAG--TGTTACTTTAAATG------GAA-TT-TTTT--A--TATTTTTTTGTGGG-TCGGTTTTTG-AATGA-TGAGGTACATTTT-TT-TT--T--AA-TGCTAAT------TAC----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-G-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA--GTGAGT-GTTA-AAAA-C----TGTA------A----CA-CA---G-AGA-----G-A---AATG--A-T-G------ATA----GTA-A-C-AGAT-TT----A--AATT-T-AGGC-C-A----TTGTG-----CATG-AT-T-TGTGAGAT--TTTTATAGT--TATG--AC--GACA--GT-A-G-AAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--A--AAAAA---AAT-G--TT---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90611                      :  TTTTA-AAAACTTCAC-AAAATTTTTATAATT-AATGAT-AT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAA-ATA-TGCAGAATTCA-CTCAAGAT-CCAT--GACAAT--TGTTACTTTAAATG------GT--TT-TTTTAAA--TATTTTT-TGTGGG-TCGATTATTG-AATGA-TGGAGTACA-TTT-TT-TT--TAAAA-TGCTAAT------TAC----TA--T-GAA-ATGTGTAAGAGTAT-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCAG---TGAGT-ATTA-AAAA-C----TGTA------A----CA-CA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------ATA----GTA-A-C---AT-TT----A--ACTT-T-AGGC-C-A----TTGTG-----CATG-ATAT-TGTGAGAT--TTTTATAGT--TATG--AC--GGCA--GT-A-G-AAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CC-AAAAA---AAT-GCTTA----TA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90612                      :  TTTTA-AAATCTTCAA-AA-ATTTTTATATTCCAATGTT-AT---CATTGGTGAAATTTTTCAGAATAATA-TGCAGAGTTTA-CTCAGATT-TCAT---ACACA--TGTTACTGTAAATG------GTA-TT-TTTC--A--TATTTTTTTGT-GG-TCGATTTTTGAAAAGA-TGGCGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--TGGAA-AAGTGTAAGG-T-TGACGTTCAA---ATAATAATTCCATAAAA-A-ACATG-A-TTA-TCCCA--GTGAGT-GTTA-AAAT-C----TGTA------A----CA-CA---GCAGA-----G-A---AATC--ATT-G------ATA----GTAGA-C-AGAT-TGT---A--AATC-T-AGGC-A-A----TTATG-----CATG-AT-T-TGC-GGAT--TTTCAT-GT--TATG--AC--TGCA--GT-A-AGAAATATTT-----GAT-AT-------CAGTGCTGCCT-AAAAA---AAT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--T-AAA-ATTAGC-A-GTG----CGGAAAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90620                      :  TTTTA-AACACTTCAC-AACATTTTTATATTT-AATGTT-AT---TATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTCA-CTCAAGAT-TCAT--GACACA--TGTTACTGTAAATG------GTA-TT-TTTT--A--TATTTTTGTGTGGG-TCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-AAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCAT-TTGAGT-GTTA-AAAA-C----CGTA------A----CA-CA---G-AGA-----G-A---AATA--
gi|90621                      :  TTTTA-AACACTTCAC-AACATTTT-ATATTT-AATGTT-AT---TATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTCA-CTCAAGAT-TCAT--GACACA--TGTTACTGTAAATG------GTA-TT-TTTTT-A--TATTTTTGTGTGGG-TCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-AAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA--TTGAGT-GTTA-AAAA-C----CGTA------A----CA-CA---G-AGA-----G-A---AATA--atatgaaaagttgtaatagatatatagtgaaaattagcagtgcggaaatacttttgacccttgagtg
gi|90613                      :  TTTTAGAACA-TCCAA-AA---TTTTATATTT-AACGTTTAT---CATTG--GGAATTTT-CAGA-T-ATACTGCAGAATTCAACTCA-GATATC-T--CAC-CA--TGTTACTGTAGATT------GTAATT-TTTT--A--TATTTT-GTTTGGGGTTGCTTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--T-------CTGAC------TGA----TAATT-GGACAAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAATATACAC-AATT-CAT--AA-A--CATG-A-T-A-TCCCAG-TGGAGTTGTTGCAAAA-C----TGTA------A----CA-CA---G---------G-AT--AATA--A-TCG------ATA----GTA-A-CGAAAT-------A--AATC-T-ACTC-A------TTA-G-----CATG-AT-T--GTGAGAT--TTTTAT-GT--TATGC-ACG-CGCA--GTCA-G-AAATA-TT-----GAT-AC-------CATTGCT--CT-AAAAA---AATGG--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--T-AAA-CTTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTGatatgaaagtttgtaatagatatatagtgaaaattagcagtggcggaaatacttttgacccttgagtg
gi|90628                      : tTTTTA-AAAACTTCAC-AAAATTTTTATAATT-AATGAT-AT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAA-ATA-TGCAGAATTCA-CTCAAGAT-CCAT--GACAAT--TGTTACT
gi|90629                      :  TTTTA-AAAACTTCAC-AAAAATTTTATATTT-AATGTT-AT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCATAATTtatgaaagttgtaatagatatatagtgaaaattagcaatgtggaaatacttttgacccttgagtg
gi|90614                      :    TTA-AA-A-TTCAC-AAAAATTGTATATAA-AAT-----T---TATT--------TTC-CAGAAT-ATA-T-CAGA--TTA-CTCAAGAT-CTATATGACAAG--TGT-ACTTTAAATG------G-A-TAATTTT--A--AATTGTTATG---G-TCGATTTTTG-AATGAATGAGGTACA-TTC-TT-TT--A--AAATGT--AT------TAC----TA--T-GAA----TGTTAGA-T-A-ACGTTCCA---ATAA-AATT-CAT--AA-AGACATG-A-TGA-TCCCGT---GAGT-GTTA-AAAA-C----TGTA------A--------A---G-AGA-----GGA---AATA--A-T-G------AAA----GTA-A---AGAT-TT----A--AATT-T-AAGC-C-A----TTGTG-----CATG-AT-T-TGT-TGAGC-TTTTATAGT--TATG--AC--GGCA--GT---G-AAATG-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CTCAGAAA---CAA-G--TA----TA---TT-CA--CTG-A--ATACTATATA-G--TGAAATATTAGC-A-G-G-----GG-AAA-TA-CT-----TTT-GA--CCTTGAtatgaaagttgtaatagatatatagagaaaattagcagtgcggaaatacttttgacccttgagtg
gi|90627                      :    TTA-AA-ACTTCACCAAAAAATTGATATCT----GTT-ATATCTATTA-TGAATTTTT-TGGATT-ATA-TGCAGAATTCA-CTCACGAT-TCAT--GACGAA--TGTTACTTTTAATGTTACATGTA-TT-TTT
gi|90615                      :      g-AAAACTCCAC-AAAAATTATATATTT-AATGTG-AT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TACAGA-TTTA-CTCAAGAT-CCAT--GATACAAATGTTACT-TAAATTT-----GTA-TT-TTTA--AACTATTTT---GTGGG-TCGATTTTTA-AATGG-TGGGGTAGA-TTTGTT-TTAAT--AA-TGCTAAT------TAAATATTA--T-GAA-T-TTGTAAGA-T-T-ACGTG-AA---GTAA-AGTT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCAG-T-GAGT-ATTA-AAAA-C----TCTA------A----CAACA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------ATAACTAGTA-A-C-AGCT-TT----G--AATC-T-AAGC-G-A----TTATAAATGACATG-AT-T-T-C-AGA---TTTTATAGT--TATG--AC--TGCA--GT-A-G-AAATA-TT-----GAT-A--------CAG-GCT--CA-AAAAA---ATT-G--TA---TCA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGA-A-GTG----CGG--AA-TA-CCTTAAGTTT-GA-CCCTTGAGTGtgtatgaaagttgtaatgaatatagagcaaaaattagcagtgcagaaattcttttgatccttgagtg
gi|90616                      :       -AAAACTTCACCAAAAAATTGATATCT----GTT-ATATCTATTA-TGAATTTTT-TGGATT-ATA-TGCAGAATTCA-CTCACGAT-TCAT--GACGAA--TGTTACTTTTAATGTTACATGTA-TT-TTTCAAA--GATTTTT-TGTGGA-TCGGTTTCTG-AATTA-TGAGGTAGA-CTT-TT-TTA-A--AA-TGCTCATTACCTGTAA----TA--T-GAA-ATGTGTAGGA-T-T-AAGTTCAA---GTAA-ATTT-CAT--AC-A-ACATG-A-TTA-TCCT-T-GTGAGT-GTCA-GAAA-CTGTACATA------A----TG-CA---G-AAA-----A-A---AATA--A-C----------------TA-A-C-AG-------------ATC-T-G-----------------------TG-A----------AA--TTTAATAGT--AAAG--AC--TGCA--GT-A-G-AAATA-TT-----T-T-AT-------CAGTGAT--TT---AAA---AATGG--TA---TTA---TT-CA--ATG-AT-AT--TATATG-G--TGAAA-AGTAGC-A-GTG----TAG-AAA-TA-AT-----TTT-GA-CCTTTGTGTG
gi|90617                      :                              ATTT-GATATA-AT---T-----TAATATTTC-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTCA-CTTACGAT-TCAT--A----------TACTTTAAATG------TTA-TT-TT---------------TGTGGG-TCG
gi|90618                      :                                                                aacttcaccaaGCAGAATTCATCTCAA-AT-ATAT--GACAAA---GTTACT-TAAATG-------TA-TT-TTTT--AA-TATTTTTGTG--GT-TCGACTTTTCTAAT-A-TTGTGTACA-CTT-TT-TT-----AA-TGCTAAT------TGC----TA--TTGAA-A--TTTAAGG-----ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-T-ACATG-AATGAATCCCGT---GAG--GTTA-AAAAAC----TGTA------A----CA-CATCAG-ATA-----G-ATA-AATAC-A-T--------ATA----CTA-AAC-AGAT-TT----A--AATTGT-AGG----A----CTGTG-----CACG-AT-------AGA----TTTGTAAT--TATTCTAT--TATAC-AT-G-A-AATTA-TTATGCGGAT-ATATCTTACCAGTGCT--CT-AAAAA---AAT-G--TA---CTA---TT-CT--ATG-A--AA--TATATA-AGTTGAAA-ATCAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GACCCCTTGAG
gi|90619                      :                                                                                     -CTCAA------AT--G-CAAA--TTTTACTTTTGATG------ATA-TT-TTTT--A--TATTCTTTTGTGGG-TCGATTTTTG-AATGA-TGAGGTAGA-TCT-TTATT--T--AC-TGCTAAT------TAA----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-T-T-ACG
gi|90622                      :                                                                                                                                                                                              -TT-TT--C--GA-CAGTCATA-----TAA----TA--T--AG-ATGTGCA----T-T-GTGTTGCA---ATGA-AAT-------AA-A-AGAAG-T-TCA-TCTCATACTGAG--------AAA-C----TGTATATAACA----TA-CA---T-AGA-----A-A---AAAA--A-T-T------AAA----ATG-T-C-AGAT-TT----A--AATC-T-AGG---------------------TG-AT-T-TGTGAAAT--TTTTATCCT--GATG--AC--TGCT--GT-A-G-AA----------------T-------CAGTGCT--TT-AAAAG---T-T-A--TA---TTA---TT-AATTATG-ATTAT--TCTATA--------A-ATTAGC-A-GTG----CAG-A
gi|90623                      :                                                                                                                                                                                                                 AT------TAA----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-C-ACAAG-A-TGA-TCACAG-T-GAGT-GTTA-AAAA-C----TGTA------A----CA-CA---G-AGA-----A-A---AATA--A-T-G------ATA----GTA-A-C-AGAT-TT----A--AATC-T-AGGC-A-AAATTTTATG-----CATG-AT-T-TGTGAGAT--TTTTATAGT--TATA--AC--TGCA--GT-A-G-AAATA-TT-----GAT-AT-------CTGTGCT--CT-AAAAA---AAT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TACATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTGCAGTCAG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90624                      :                                                                                                                                                                                                                                aA--T-GAA-ATGTATAAGA-G-T-ACGTTCAA---ATAA-GATT-CAT--TTTA-ACATG-A-TGT-TCCCAG-T---GT-GTTA-AAAA-C----TGTA------A----CA-CA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------AGA----GTA-A-C-AGAT-TT----A--AATT-T-AGGCCATA----TTGTG-----CATG-AT-T-TGTGAGAT--TTTTATAGT--TATG--AC--TGCA--GT-A-G-AAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AAAAA---AAT-G--TA---CTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90625                      :                                                                                                                                                                                                                                                    -T-T-ACATTCAA---ATAA-AATT-CGT--GA-A-ACATG-A-TGA-TCCCAG-T-GAGT-GTTA-AAAA-G----TGTA------A----CA-CA---G-AGA-----G-AGATAATA--A-T-G------ATA----TTA-A-C-AGAT-TT----A--AATC-T-AGGC-T-A----TTATG-----CATG-AT-T-TGTGATAT--TTTTGTAGT--TATG--AC--TGCT--GT-A-G-AA----------------------------GCT--CT--TAAA---AAT-G--TA---------------------------TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CAG-AAAGTA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90626                      :                                                                                                                                                                                                                                                        -ACGTTCAA---ATAA-AGTT-CAT--AA-A-ACATGGA-TGA-TCCCAG-T-GAGT-GTTA-AAAA-C----TGTA------AATAACA-CA---G-AGA-----G-A---AATA--T-T-G------ATA----GTA-A-C-AGAT-TT----A--AATC-T-AGGC-G-A----TTATG-----CATA-GT-T-TGTGAGAT--TTTTATAGT--TATG--AC--TGCA--AT-A-G-AAATA-TTG----GATAAT-------CAGTGCT--CTAAAAAA---AAT-G--------TA---TT-CA--ATG-A--AT--TATA
gi|90620                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TCA-AAAA-T----CG-ACCC---A----CA-CA---A-AAATATAAA-A---AATACCA-T-TT-----ACA----GTA-A-C-ATGTGTC----ATGAATC-TTGAGTGA-A----TTCTG-----CATATAT-TCTG--AAAA--TTTCACAAT--AATA--ACATTAAAT-AT-A-A-AAATG-TT-----GTG-A---------AGTGTT---T-AAAAA---TAT-G--AAAAGTTG---T---A--ATA-G--AT---ATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90621                      :                                                                                                                                                                                         tatttctctctgtgttacggtttttaacactcaaatgggatcatcatgttttatgaattttatttgaacgtaatcttacacttttcatattaatcagcattgaaaaaaatctaccccatcatTCA-AAAA-T----CG-ACCC---A----CA-CA---A-AAATAT--A-A---AAAA--A-T-ACCATTTACA----GTA-A-C-ATGTGTC----ATGAATC-TTGAGTGA-A----TTCTG-----CATATAT-TCTG--AAAA--TTTCACAAT--AATA--ACA-TTAA--AT-ATA-AAATG-TT-----GTG-A---------AGTGTT---T-AAAAA---TAT-G--AAAGTTTG---T---A--ATA-G--AT---ATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTGG---CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90628                      :                                                                                                                                                                                                                                                                  tatttctctctgtgttacggtttttaacactcaatgggatcatcatgttttatgaattttatttgaacgtaatcttacacttttcatattaatcagcattgaaaaaaatctaccccatcatA----GTA-A-C-A-AT-TGTCATG--GATC-TTGAGTGA-A----TTCTG-----CATA-TT-T-TCTGAAAA--TTTCACAATGATATC--AT--TA-ATTAT-A-A-AAATT-TT-----GTG-A---------AGT--T--TT-TAAAA---TAT-G--AAAG-TTG---T---A--ATA-G--AT---ATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-ATG----TGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90629                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -A-A----TTATG-----CATATAT-TCTG--AAAA--TTTCACAAT--GATA--ACA-TTAA--AT-ATA-AAATT-TT-------T-GT-------GAA-GTT--TT-TAAAA---TAT-G--AAAG-TTG---T---A--ATA-G--AT---ATATA-G--AGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90630                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TGTT--CT-AAAAATGCAAA-G--T----TTG---T---A--ATA-G--ACA-TATATAAG--TTGAA-ATTAGC-A-ATG----CGG-AAA-TA-CT-----TTTGGA-CCCTTGGATG
gi|90627                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ---AAT-G--TA---TGAAAGTTGTA--ATG-A--AT---ATAGA-G--CAAAA-ATTAGC-A-GTG----CAG-AAA-TT-CT-----TTT-GA-TCCTTGAGTG
gi|90631                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gaaaaatacatgtaacattaaaagtaacattcgtcatgaatcgtgagtgaattctgcatataatccaaaaaattcataatagatataacagatatcaattttttggtgaagttttA--ATGGA--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGCAA-GTG----CAG-AAA-TA-C------TTT-GA-CCCGTGAGTG
gi|90633                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         --TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90632                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         --TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----TGG-AAA-TAGAA-----TTT-GATTTTTTGAGT
gi|90634                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATA-A-G--TGAAA-TTTAGC-AAGTG----CGG-AA--TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGT

lowQualScore                  :                                                                                                                                               1                    1111                                                                            111111                                                                    11111          111111                                                                               2222                                                                       11111111                                                                                                                                 11111111                              111                                                                                           
lowQualScore                  :                                                                                                                                          5    1          2    2    0000    2         2      2   2          2 2        2    33 33   1        0      555555 2 2     5  77 66       7   2             6     3         3   2  2  33333  2    1  000000   5555  33 5   2 2        2 2 2        444    2    2   33  2 2     4   2      4444   2    2 2     44444 55  666666 4444 2 333   55   88888 2 555    55 2 11111111 5555    2 2      4 6666  66    2 99   9999 4444  1 55555    0  8    2    5         22    2  99  22  2  4 555    2  2  77777 1 2 00000000       22  44    333 1  3 22  111   333 55  22   1 44  555     1 22     1      1 1   5555   1   1  1  44444   1  3          
lowQualScore                  :                                                                                                                                          .    .          .    .    ....    .         .      .   .          . .        .    .. ..   .        .      ...... . .     .  .. ..       .   .             .     .         .   .  .  .....  .    .  ......   ....  .. .   . .        . . .        ...    .    .   ..  . .     .   .      ....   .    . .     ..... ..  ...... .... . ...   ..   ..... . ...    .. . ........ ....    . .      . ....  ..    . ..   .... ....  . .....    .  .    .    .         ..    .  ..  ..  .  . ...    .  .  ..... . . ........       ..  ..    ... .  . ..  ...   ... ..  ..   . ..  ...     . ..     .      . .   ....   .   .  .  .....   .  .          
lowQualScore                  :                                                                                                                                          3    4          7    7    7777    7         7      7   7          7 5        5    44 44   5        6      333333 7 7     3  99 88       2   9             2     1         1   9  9  66666  9    1  333333   7777  44 0   5 2        4 4 2        111    4    4   22  4 4     7   4      1111   4    1 1     66666 88  111111 5555 1 777   00   99999 1 888    00 4 22222222 0000    2 2      4 9999  11    2 22   4444 5555  3 33333    9  4    1    1         99    1  22  99  1  2 888    1  1  44444 6 1 22222222       88  22    333 9  8 66  999   333 77  55   8 33  222     7 33     7      7 7   2222   7   7  7  33333   7  5          
consensus                     :                                                                                                                           TTTTAAAAACTTCAC-AAAANTTTTATATTT-AATG-TTAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACAAATGTTACTTTAAATG------G-T-ATTTT-TT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-ATG-ATCCCAG-TTGAG-TGTT-A-AAAAC----CG--TA------A----C-A---CAG--AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----TAGT-A-ACAGAT-T----TA--AATC-T--AGGC-A-A----TTAT-----GCATGAT-TTGT-GAGATTTTTATAGT--TATG-AC--TG--CA-GT-A---GAAA-TA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AAAAA---A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
Reference ( family-670 )      :                                                                                                                           TTTTAAAAACTTCAC-AAAANTTTTATATTT-AATG-TTAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACAAATGTTACTTTAAATG------G-T-ATTTT-TT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-ATG-ATCCCAN-TTGAG-TGTT-A-AAAAC----CG--TA------A----C-A---CAG--AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----TAGT-A-ACAGAT-T----TA--AATC-T--AGGC-A-A----TTAT-----GCATGAT-TTGT-GAGANTTTTATAGT--TATG-AC--TG--CA-GT-A---GAAA-TA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AAAAA---A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90608                      :                                                                                                                           TTTTAAACACTTCAC-AACATTTTTATATTT-AATG-TTAT---TATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACACATGTTACTGTAAATG------G-T-ATTTT-TT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-AAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-ATG-ATCCCAT-TTGAG-TGTT-A-AAAAC----CG--TA------A----C-A---CAG--AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----TAGT-A-ACAGAT-T----AA--AATC-T--GGGC-A-A----TTAT-----GCATGAT-TTGT--AGAGTTTTATAGT--TATG-AC--TG--CA-GT-A---AAAA-TA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AAAAA---A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90609                      :                                                                                                                           TTTTAAACACTTCAC-AACA-TTTTATATTT-AATG-TTAT---TATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACACATGTTACTGTAAATG------G-T-ATTTTTTT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-AAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-ATG-ATCCCA--TTGAG-TGTT-A-AAAAC----CG--TA------A----C-A---CAG--AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----TAGT-A-ACAGAT-T----AA--AATC-T--GGGC-A-A----TTAT-----GCATGAT-TTGT-GAGGTTTTTATAGT--TATG-AC--TG--CA-GT-A----AAA-TA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AAAAA---A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGGGT
gi|90610                      :                                                                                                                           TTTTAAAAACTTCAC-AAAAATTTTATATTT-AATG-TTAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCATAATTC-A-CTCAAGAT-CCAT--G--ACAAGTGTTACTTTAAATG------G-A-ATTTT-TT--A--TATTTTTTTGT-GGGTCGGTTTTTG-AATGA-TGAGGTACATTTT-TT-TT--T--AA-TGCTAAT------TAC----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-G-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-ATG-ATCCCAG--TGAG-TGTT-A-AAAAC----TG--TA------A----C-A---CAG--AGA-----G-A---AATG--A-T-G------A----TAGT-A-ACAGAT-T----TA--AATT-T--AGGC-C-A----TTGT-----GCATGAT-TTGT-GAGATTTTTATAGT--TATG-AC--GA--CA-GT-A---GAAA-TA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--A--AAAAA---A-AT-G--TT---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90611                      :                                                                                                                           TTTTAAAAACTTCAC-AAAATTTTTATAATT-AATG-ATAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAA-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-CCAT--G--ACAATTGTTACTTTAAATG------G-T--TTTT-TTAAA--TATTTTT-TGT-GGGTCGATTATTG-AATGA-TGGAGTACA-TTT-TT-TT--TAAAA-TGCTAAT------TAC----TA--T-GAA-ATGTGTAAGAGTAT-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-ATG-AT-CCAG--TGAG-TATT-A-AAAAC----TG--TA------A----C-A---CAG--AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----TAGT-A-AC--AT-T----TA--ACTT-T--AGGC-C-A----TTGT-----GCATGATATTGT-GAGATTTTTATAGT--TATG-AC--GG--CA-GT-A---GAAA-TA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CC-AAAAA---A-AT-GCTTA----TA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90612                      :                                                                                                                           TTTTAAAATCTTCA--AAAATTTTTATATTCCAATG-TTAT---CATTGGTGAAATTTTTCAGAATAATA-TGCAGAGTTT-A-CTCAGATT-TCAT-----ACACATGTTACTGTAAATG------G-T-ATTTT-TC--A--TATTTTTTTGT--GGTCGATTTTTGAAAAGA-TGGCGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--TGGAA-AAGTGTAAGG-T-TGACGTTCAA---ATAATAATTCCATAAAA-A-ACATG-ATT-ATCCCAG--TGAG-TGTT-A-AAATC----TG--TA------A----C-A---CAGC-AGA-----G-A---AATC--ATT-G------A----TAGT-AGACAGAT-TG---TA--AATC-T--AGGC-A-A----TTAT-----GCATGAT-TTGC-G-GATTTTCAT-GT--TATG-AC--TG--CA-GTAA---GAAA-TATTT-----GAT-AT-------CAGTGCTGCCT-AAAAA---A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--T-AAA-ATTAGC-A-GTG----CGGAAAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90613                      :                                                                                                                           TTTTTAGAACATC-C-AAAA-TTTTATATTT-AACGTTTAT---CATTG--GGAATTTT-CAG-AT-ATACTGCAGAATTCAA-CTC-AGATATC-T--C--AC-CATGTTACTGTAGATT------G-TAATTTT-TT--A--TA-TTTTGTTTGGGGTTGCTTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--T-------CTGAC------TGA----TAATT-GGACAAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAATATACAC-AATT-CAT---A-A-ACATG-AT--ATCCCAG-TGGAGTTGTT-GCAAAAC----TG--TA------A----C-A---CAG----------G-AT--AATA--A-TCG------A----TAGT-A-AC-GAA-A----TA--AATC-T--ACTC---A----TTA------GCATGA--TTGT-GAGATTTTTAT-GT--TATGCACG-CG--CA-GTCA---GAAA-TA-TT-----GAT-AC-------CATTGCT--CT-AAAAA---A-ATGG--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--T-AAA-CTTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90614                      :                                                                                                                             TTAAAA--TTCAC-AAAAATTGTATATAA-AAT--TTAT--------------TTTC-CAGAAT-ATA-T-CAGA--TT-A-CTCAAGAT-CTATATG--ACAAGTGT-ACTTTAAATG------GAT-AATTT-TA--A---ATTGTTATG----GTCGATTTTTG-AATGAATGAGGTACA-TTC-TT-TT--A--AAATGT--AT------TAC----TA--T-GAA----TGTTAGA-T-A-ACGTTCCA---ATAA-AATT-CAT--AA-AGACATG-ATG-ATCCCG---TGAG-TGTT-A-AAAAC----TG--TA------A-----------AG--AGA-----GGA---AATA--A-T-G------A----AAGT-A-A-AGAT-T----TA--AATT-T--AAGC-C-A----TTGT-----GCATGAT-TTGTTGAG-CTTTTATAGT--TATG-AC--GG--CA-GT-----GAAA-TG-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-CAGAA---ACAA-G--TA---T-A---TT-CA--CTG-A--ATACTATATA-G--TGAAATATTAGC-A-G-G-----GG-AAA-TA-CT-----TTT-GA--CCTTGA
gi|90615                      :                                                                                                                                AAAACTCCAC-AAAAATTATATATTT-AATG-TGAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TACAG-ATTT-A-CTCAAGAT-CCAT--GATACAAATGTTACTTAAATTT------G-T-ATTTT-TA--AACTATTT---TGT-GGGTCGATTTTTA-AATGG-TGGGGTAGA-TTTGTT-TTAAT--AA-TGCTAAT------TAAATATTA--T-G-A-ATTTGTAAGA-T-T-ACG-TGAA---GTAA-AGTT-CAT--AA-A-ACATG-ATG-ATCCCAG--TGAG-TATT-A-AAAAC----TC--TA------A----CAA---CAG--AGA-----G-A---AATA--A-T-G------ATAACTAGT-A-ACAGCT-T----TG--AATC-T--AAGC-G-A----TTATAAATGACATGAT-T--T-CAGA-TTTTATAGT--TATG-AC--TG--CA-GT-A---GAAA-TA-TT-----GAT-A--------CAG-GCT--CA-AAAAA---A-TT-G--TA---TCA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGA-A-GTG----CGG--AA-TA-CCTTAAGTTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90616                      :                                                                                                                                AAAACTTCACCAAAAAATTGATATCT----G-TTATATCTATTA-TGAATTTTT-TGGATT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCACGAT-TCAT--G--ACGAATGTTACTTTTAATGTTACATG-T-ATTTT-TCAAA--GATTTTT-TGT-GGATCGGTTTCTG-AATTA-TGAGGTAGA-CTT-TT-TTA-A--AA-TGCTCATTACCTGTAA----TA--T-GAA-ATGTGTAGGA-T-T-AAGTTCAA---GTAA-ATTT-CAT--AC-A-ACATG-ATT-ATCCT-T-GTGAG-TGTC-A-GAAACTGTACA--TA------A----T-G---CAG--AAA-----A-A---AATA--A-C----------------T-A-ACAGAT-C----T------------------------------------------GT-GA-AATTTAATAGT--AAAG-AC--TG--CA-GT-A---GAAA-TA-TT-----T-T-AT-------CAGTGAT--TT---AAA---A-ATGG--TA---TTA---TT-CA--ATG-AT-AT--TATATG-G--TGAAA-AGTAGC-A-GTG----TAG-AAA-TA-AT-----TTT-GA-CCTTTGTGTG
gi|90617                      :                                                                                                                                  AACTTCAC-CAAA-TTTGATAT---AAT--TTA-----AT-------ATTTC-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTTACGAT-TCAT--A----------TACTTTAAATG------T-T-ATTTT----------------TGT-GGGTCG
gi|90618                      :                                                                                                                                                                                                   GCAGAATTC-ATCTCAA-AT-ATAT--G--ACAAA-GTTACTT-AAATG--------T-ATTTT-TT--AA-TATTTTTGTG---GTTCGACTTTTCTAAT-A-TTGTGTACA-CTT-TT-TT-----AA-TGCTAAT------TGC----TA--TTGAA-AT-T-TAAGG-----ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-T-ACATGAATGAATCCCG---TGAG--GTTAA-AAAAC----TG--TA------A----C-ACATCAGATAGA-----T-A---AATAC-A-T--------A----TACTAA-ACAGAT-T----TA--AATTGT--AGG----A----CTGT-----GCACGAT-------AGA--TTTGTAAT--TATT--C--TA--TT-AT-ACATGAAATTA-TTATGCGGAT-ATATCTTACCAGTGCT--CT-AAAAA---A-AT-G--TA---CTA---TT-CT--ATG-A--AA--TATATA-AGTTGAAA-ATCAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GACCCCTTGAG
gi|90619                      :                                                                                                                                                                                                              -CTCAA------AT--G---CAAATTTTACTTTTGATG------A-T-ATTTT-TT--A--TATTCTTTTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGAGGTAGA-TCT-TTATT--T--AC-TGCTAAT------TAA----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-T-T-ACG
gi|90620                      :                                                                                                                           TTTTAAACACTTCAC-AACATTTTTATATTT-AATG-TTAT---TATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACACATGTTACTGTAAATG------G-T-ATTTT-TT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-AAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-ATG-ATCCCAT-TTGAG-TGTT-A-AAAAC----CG--TA------A----C-A---CAG--AGA-----G-A---AATA--
gi|90620                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TC-A-AAAAT----CGACCC------A----C-A---CAA--AAATATAAA-A---AATACCA-T-TT-----A----CAGT-A-ACATGTGT----CATGAATC-TTGAGTG-A-A----TTCT-----GCAT-ATATTCT-GAAAATTTCACAAT--AATA-ACATTA--AATAT-A---AAAA-TG-TT-----GTG-A---------AGTGTT---T-AAAAA---T-AT-G--AAAAGTTG---T---A--ATA-G--AT---ATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTGatatgaaaagttgtaatagatatatagtgaaaattagcagtgcggaaatacttttgacccttgagtg
gi|90621                      : tatttctctctgtgttacggtttttaacactcaaatgggatcatcatgttttatgaattttatttgaacgtaatcttacacttttcatattaatcagcattgaaaaaaatctaccccatcatTTTTAAACACTTCAC-AACA-TTTTATATTT-AATG-TTAT---TATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACACATGTTACTGTAAATG------G-T-ATTTTTTT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-AAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-ATG-ATCCCA--TTGAG-TGTT-A-AAAAC----CG--TA------A----C-A---CAG--AGA-----G-A---AATA--
gi|90621                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TC-A-AAAAT----CGACCC------A----C-A---CAA--AAATAT--A-A---AAAA--A-T-ACCATTTA----CAGT-A-ACATGTGT----CATGAATC-TTGAGTG-A-A----TTCT-----GCAT-ATATTCT-GAAAATTTCACAAT--AATA-ACA-TT--AA-AT-AT--AAAA-TG-TT-----GTG-A---------AGTGTT---T-AAAAA---T-AT-G--AAAGTTTG---T---A--ATA-G--AT---ATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTGG---CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTGatatgaaagtttgtaatagatatatagtgaaaattagcagtggcggaaatacttttgacccttgagtg
gi|90622                      :                                                                                                                                                                                               tatttctctctgtgttacggtttttaacactcaatgggatcatcatgttttatgaattttatttgaacgtaatcttacacttttcatattaatcagcattgaaaaaaatctaccccatcat-TT-TT--C--GA-CAGTCATA-----TAA----TA--T--AG-ATGTGCA----T-T-GTGTTGCA---ATGA-AAT-------AA-A-AGAAG-TTC-ATCTCATACTGAG---------AAAC----TG--TATATAACA----T-A---CAT--AGA-----A-A---AAAA--A-T-T------A----AAAT-G-TCAGAT-T----TA--AATC-T--AGG---------------------TGAT-TTGT-GAAATTTTTATCCT--GATG-AC--TG--CT-GT-A---GA-----------------AT-------CAGTGCT--TT--AAAA---G-TT-A--TA---TTA---TT-AATTATG-ATTAT--TCTAT--------AA-ATTAGC-A-GTG----CAG-A
gi|90623                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AT------TAA----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-C-ACAAG-ATG-ATCACAG-T-GAG-TGTT-A-AAAAC----TG--TA------A----C-A---CAG--AGA-----A-A---AATA--A-T-G------A----TAGT-A-ACAGAT-T----TA--AATC-T--AGGC-A-AAATTTTAT-----GCATGAT-TTGT-GAGATTTTTATAGT--TATA-AC--TG--CA-GT-A---GAAA-TA-TT-----GAT-AT-------CTGTGCT--CT-AAAAA---A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TACATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTGCAGTCAG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90624                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aA--T-GAA-ATGTATAAGA-G-T-ACGTTCAA---ATAA-GATT-CAT--TTTA-ACATG-ATG-TTCCCAG-T---G-TGTT-A-AAAAC----TG--TA------A----C-A---CAG--AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----GAGT-A-ACAGAT-T----TA--AATT-T--AGGCCATA----TTGT-----GCATGAT-TTGT-GAGATTTTTATAGT--TATG-AC--TG--CA-GT-A---GAAA-TA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AAAAA---A-AT-G--TA---CTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90625                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -T-T-ACATTCAA---ATAA-AATT-CGT--GA-A-ACATG-ATG-ATCCCAG-T-GAG-TGTT-A-AAAAG----TG--TA------A----C-A---CAG--AGA-----G-AGATAATA--A-T-G------A----TATT-A-ACAGAT-T----TA--AATC-T--AGGC-T-A----TTAT-----GCATGAT-TTGT-GATATTTTTGTAGT--TATG-AC--TG--CT-GT-A---GAA-----------------------------GCT--CT--TAAA---A-AT-G--TA---------------------------TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CAG-AAAGTA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90626                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -ACGTTCAA---ATAA-AGTT-CAT--AA-A-ACATGGATG-ATCCCAG-T-GAG-TGTT-A-AAAAC----TG--TA------AATAAC-A---CAG--AGA-----G-A---AATA--T-T-G------A----TAGT-A-ACAGAT-T----TA--AATC-T--AGGC-G-A----TTAT-----GCATAGT-TTGT-GAGATTTTTATAGT--TATG-AC--TG--CA-AT-A---GAAA-TA-TTG----GATAAT-------CAGTGCT--CTAAAAAA---A-AT-G--------TA---TT-CA--ATG-A--AT--TATA
gi|90627                      :                                                                                                                                AAAACTTCACCAAAAAATTGATATCT----G-TTATATCTATTA-TGAATTTTT-TGGATT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCACGAT-TCAT--G--ACGAATGTTACTTTTAATGTTACATG-T-ATTTT-T
gi|90627                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              g---A-AT-G--TA---TGAAAGTTGTA--ATG-A--AT---ATAGA-G--CAAAA-ATTAGC-A-GTG----CAG-AAA-TT-CT-----TTT-GA-TCCTTGAGTGaatgtatgaaagttgtaatgaatatagagcaaaaattagcagtgcagaaattcttttgatccttgagtg
gi|90628                      :        gaaaaatacatgtaacattaaaagtaacattcgtcatgaatcgtgagtgaattctgcatataatccaaaaaattcataatagatataacagatatcaattttttggtgaagttttTTTTAAAAACTTCAC-AAAATTTTTATAATT-AATG-ATAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAA-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-CCAT--G--ACAATTGTTACT
gi|90628                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AGT-A-ACA-AT-TGTCATG--GATC-TTGAGTG-A-A----TTCT-----GCATATT-TTCT-GAAAATTTCACAATGATATC-AT--TAATTA--T-A---AAAA-TT-TT-----GTG-A---------AGT--T--TT-TAAAA---T-AT-G--AAAG-TTG---T---A--ATA-G--AT---ATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-ATG----TGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTGtatgaaagttgtaatagatatatagtgaaaattagcaatgtggaaatacttttgacccttgagtg
gi|90629                      :                                                                                                                           TTTTAAAAACTTCAC-AAAAATTTTATATTT-AATG-TTAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCATAATT
gi|90629                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -A-A----TTAT-----GCAT-ATATTCT-GAAAATTTCACAAT--GATA-ACA-TT--AA-AT-A---TAAA--A-TT-----TTT-GT-------GAA-GTT--TT-TAAAA---T-AT-G--AAAG-TTG---T---A--ATA-G--AT---ATATA-G--AGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTGtatgaaagttgtaatagatatatagagaaaattagcagtgcggaaatacttttgacccttgagtg
gi|90630                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TGTT--CT-AAAAATGCA-AA-G--T----TTG---T---A--ATA-G--ACA-TATATAAG--TTGAA-ATTAGC-A-ATG----CGG-AAA-TA-CT-----TTTGGA-CCCTTGGATG
gi|90631                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         A--ATGGA--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGCAA-GTG----CAG-AAA-TA-C------TTT-GA-CCCGTGAGTG
gi|90632                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----TGG-AAA-TAGAA-----TTT-GATTTTTTGAGT
gi|90633                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90634                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATA-A-G--TGAAA-TTTAGC-AAGTG----CGG-AA--TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGT

lowQualScore                  :                                                                                                                                               1                    1111                                                                            111111                                                                    11111          111111                                                                                2222                                                                      11111111                                                                                                                                                                                   111                                                                                           
lowQualScore                  :                                                                                                                                          5    1          2    2    0000    2         2      2   2          2 2        2    33 33   1        0      555555 2 2     5  77 66       7   2             6     3         3   2  2  33333  2    1  000000   5555  33 5   2 2        2 2 2        444    2    2   33  2 2     2 2   2     1111   2     2    2 44444 55  666666 4444 2   333 2   88888 2 888    66 2 00000000 4444     2 2     4 6666  55    2 88   8888 4444  1 55555    0  8    2   333 3   333  22    666666   2  88 2 22  2  4 2      2  99999 1 2 99999999       22  44 22   7777 1  3 22  111   333 55  22   1 44  555     1 22     1      1 1   5555   1   1  1  44444   1  3          
lowQualScore                  :                                                                                                                                          .    .          .    .    ....    .         .      .   .          . .        .    .. ..   .        .      ...... . .     .  .. ..       .   .             .     .         .   .  .  .....  .    .  ......   ....  .. .   . .        . . .        ...    .    .   ..  . .     . .   .     ....   .     .    . ..... ..  ...... .... .   ... .   ..... . ...    .. . ........ ....     . .     . ....  ..    . ..   .... ....  . .....    .  .    .   ... .   ...  ..    ......   .  .. . ..  .  . .      .  ..... . . ........       ..  .. ..   .... .  . ..  ...   ... ..  ..   . ..  ...     . ..     .      . .   ....   .   .  .  .....   .  .          
lowQualScore                  :                                                                                                                                          3    4          7    7    7777    7         7      7   7          7 5        5    44 44   5        6      333333 7 7     3  99 88       2   9             2     1         1   9  9  66666  9    1  333333   7777  44 0   5 2        4 4 2        111    4    4   22  4 4     4 4   4     1111   4     1    1 66666 88  111111 5555 1   777 1   55555 0 222    88 2 11111111 7777     1 1     2 6666  88    1 77   0000 2222  5 00000    3  0    0   555 0   555  88    333333   0  88 0 88  0  0 0      0  00000 0 0 22222222       66  22 66   4444 9  8 66  999   333 77  55   8 33  222     7 33     7      7 7   2222   7   7  7  33333   7  5          
consensus                     :                                                                                                                           TTTTAAAAACTTCAC-AAAANTTTTATATTT-AATG-TTAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACAAATGTTACTTTAAATG------G-T-ATTTT-TT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA-GTTGAG-TGTTA-AAAA-C----CG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----TAGTA-A-CAGAT-T----TA--AATC-T--AGGC-A-A----TTAT-----GCATGAT-TTGT-GAG---ATTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--T-G--CA-GT-A-GAAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AA--AAA----A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
Reference ( family-670 )      :                                                                                                                           TTTTAAAAACTTCAC-AAAANTTTTATATTT-AATG-TTAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACAAATGTTACTTTAAATG------G-T-ATTTT-TT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA-GTTGAG-TGTTA-AAAA-C----CG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----TAGTA-A-CAGAT-T----TA--AATC-T--AGGC-A-A----TTAT-----GCATGAT-TTGT-GAG---ATTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--T-G--CA-GT-A-GAAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AA--AAA----A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90608                      :                                                                                                                           TTTTAAACACTTCAC-AACATTTTTATATTT-AATG-TTAT---TATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACACATGTTACTGTAAATG------G-T-ATTTT-TT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-AAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA-TTTGAG-TGTTA-AAAA-C----CG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----TAGTA-A-CAGAT-T----AA--AATC-T--GGGC-A-A----TTAT-----GCATGAT-TTGT--AG---AGTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--T-G--CA-GT-A-AAAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AA--AAA----A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90609                      :                                                                                                                           TTTTAAACACTTCAC-AACA-TTTTATATTT-AATG-TTAT---TATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACACATGTTACTGTAAATG------G-T-ATTTTTTT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-AAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA--TTGAG-TGTTA-AAAA-C----CG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----TAGTA-A-CAGAT-T----AA--AATC-T--GGGC-A-A----TTAT-----GCATGAT-TTGT-GAG---GTTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--T-G--CA-GT-A--AAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AA--AAA----A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGGGT
gi|90610                      :                                                                                                                           TTTTAAAAACTTCAC-AAAAATTTTATATTT-AATG-TTAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCATAATTC-A-CTCAAGAT-CCAT--G--ACAAGTGTTACTTTAAATG------G-A-ATTTT-TT--A--TATTTTTTTGT-GGGTCGGTTTTTG-AATGA-TGAGGTACATTTT-TT-TT--T--AA-TGCTAAT------TAC----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-G-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA-G-TGAG-TGTTA-AAAA-C----TG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATG--A-T-G------A----TAGTA-A-CAGAT-T----TA--AATT-T--AGGC-C-A----TTGT-----GCATGAT-TTGT-GAG---ATTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--G-A--CA-GT-A-GAAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--A--AA--AAA----A-AT-G--TT---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90611                      :                                                                                                                           TTTTAAAAACTTCAC-AAAATTTTTATAATT-AATG-ATAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAA-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-CCAT--G--ACAATTGTTACTTTAAATG------G-T--TTTT-TTAAA--TATTTTT-TGT-GGGTCGATTATTG-AATGA-TGGAGTACA-TTT-TT-TT--TAAAA-TGCTAAT------TAC----TA--T-GAA-ATGTGTAAGAGTAT-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-T-CCA-G-TGAG-TATTA-AAAA-C----TG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----TAGTA-A-C--AT-T----TA--ACTT-T--AGGC-C-A----TTGT-----GCATGATATTGT-GAG---ATTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--G-G--CA-GT-A-GAAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CC-AA--AAA----A-AT-GCTTA----TA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90612                      :                                                                                                                           TTTTAAAATCTTCA--AAAATTTTTATATTCCAATG-TTAT---CATTGGTGAAATTTTTCAGAATAATA-TGCAGAGTTT-A-CTCAGATT-TCAT-----ACACATGTTACTGTAAATG------G-T-ATTTT-TC--A--TATTTTTTTGT--GGTCGATTTTTGAAAAGA-TGGCGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--TGGAA-AAGTGTAAGG-T-TGACGTTCAA---ATAATAATTCCATAAAA-A-ACATG-A-TTA-TCCCA-G-TGAG-TGTTA-AAAT-C----TG--TA------A----C-ACA---GCAGA-----G-A---AATC--ATT-G------A----TAGTAGA-CAGAT-TG---TA--AATC-T--AGGC-A-A----TTAT-----GCATGAT-TTGC-G-G---ATTTT---CA--T-GT--T---ATG-AC--T-G--CA-GTAA-GAAATATTT-----GAT-AT-------CAGTGCTGCCT-AA--AAA----A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--T-AAA-ATTAGC-A-GTG----CGGAAAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90613                      :                                                                                                                           TTTTTAGAACATC-C-AAAA-TTTTATATTT-AACGTTTAT---CATTG--GGAATTTT-CAG-AT-ATACTGCAGAATTCAA-CTC-AGATATC-T--C--AC-CATGTTACTGTAGATT------G-TAATTTT-TT--A--TA-TTTTGTTTGGGGTTGCTTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--T-------CTGAC------TGA----TAATT-GGACAAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAATATACAC-AATT-CAT---A-A-ACATG-A-T-A-TCCCA-GTGGAGTTGTTGCAAAA-C----TG--TA------A----C-ACA---G---------G-AT--AATA--A-TCG------A----TAGTA-A-C-GAA-A----TA--AATC-T--ACTC---A----TTA------GCATGA--TTGT-GAG---ATTTT---TA--T-GT--T---ATGCACG-C-G--CA-GTCA-GAAATA-TT-----GAT-AC-------CATTGCT--CT-AA--AAA----A-ATGG--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--T-AAA-CTTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90614                      :                                                                                                                             TTAAAA--TTCAC-AAAAATTGTATATAA-AAT--TTAT--------------TTTC-CAGAAT-ATA-T-CAGA--TT-A-CTCAAGAT-CTATATG--ACAAGTGT-ACTTTAAATG------GAT-AATTT-TA--A---ATTGTTATG----GTCGATTTTTG-AATGAATGAGGTACA-TTC-TT-TT--A--AAATGT--AT------TAC----TA--T-GAA----TGTTAGA-T-A-ACGTTCCA---ATAA-AATT-CAT--AA-AGACATG-A-TGA-TCCCG---TGAG-TGTTA-AAAA-C----TG--TA------A--------A---G-AGA-----GGA---AATA--A-T-G------A----AAGTA-A--AGAT-T----TA--AATT-T--AAGC-C-A----TTGT-----GCATGAT-TTGTTGAG----CTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--G-G--CA-GT---GAAATG-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-CA--GAA----ACAA-G--TA---T-A---TT-CA--CTG-A--ATACTATATA-G--TGAAATATTAGC-A-G-G-----GG-AAA-TA-CT-----TTT-GA--CCTTGA
gi|90615                      :                                                                                                                                AAAACTCCAC-AAAAATTATATATTT-AATG-TGAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TACAG-ATTT-A-CTCAAGAT-CCAT--GATACAAATGTTACTTAAATTT------G-T-ATTTT-TA--AACTATTT---TGT-GGGTCGATTTTTA-AATGG-TGGGGTAGA-TTTGTT-TTAAT--AA-TGCTAAT------TAAATATTA--T-G-A-ATTTGTAAGA-T-T-ACG-TGAA---GTAA-AGTT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA-G-TGAG-TATTA-AAAA-C----TC--TA------A----CAACA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------ATAACTAGTA-A-CAGCT-T----TG--AATC-T--AAGC-G-A----TTATAAATGACATGAT-T--T-CAG---A-TTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--T-G--CA-GT-A-GAAATA-TT-----GAT-A--------CAG-GCT--CA-AA--AAA----A-TT-G--TA---TCA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGA-A-GTG----CGG--AA-TA-CCTTAAGTTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90616                      :                                                                                                                                AAAACTTCACCAAAAAATTGATATCT----G-TTATATCTATTA-TGAATTTTT-TGGATT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCACGAT-TCAT--G--ACGAATGTTACTTTTAATGTTACATG-T-ATTTT-TCAAA--GATTTTT-TGT-GGATCGGTTTCTG-AATTA-TGAGGTAGA-CTT-TT-TTA-A--AA-TGCTCATTACCTGTAA----TA--T-GAA-ATGTGTAGGA-T-T-AAGTTCAA---GTAA-ATTT-CAT--AC-A-ACATG-A-TTA-TCCTT-G-TGAG-TGTCA-GAAA-CTGTACA--TA------A----T-GCA---G-AAA-----A-A---AATA--A-C----------------TA-A-CAGAT-C----T------------------------------------------GT-GAA---A-TTT---AA--TAGT--A---AAG-AC--T-G--CA-GT-A-GAAATA-TT-----T-T-AT-------CAGTGAT--TT-----AAA----A-ATGG--TA---TTA---TT-CA--ATG-AT-AT--TATATG-G--TGAAA-AGTAGC-A-GTG----TAG-AAA-TA-AT-----TTT-GA-CCTTTGTGTG
gi|90617                      :                                                                                                                                  AACTTCAC-CAAA-TTTGATAT---AAT--TTA-----AT-------ATTTC-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTTACGAT-TCAT--A----------TACTTTAAATG------T-T-ATTTT----------------TGT-GGGTCG
gi|90618                      :                                                                                                                                                                                                   GCAGAATTC-ATCTCAA-AT-ATAT--G--ACAAA-GTTACTT-AAATG--------T-ATTTT-TT--AA-TATTTTTGTG---GTTCGACTTTTCTAAT-A-TTGTGTACA-CTT-TT-TT-----AA-TGCTAAT------TGC----TA--TTGAA-AT-T-TAAGG-----ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-T-ACATG-AATGAATCCCG---TGAG--GTTA-AAAAAC----TG--TA------A----C-ACATCAG-ATA-----G-ATA-AATAC-A-T--------A----TACTA-AACAGAT-T----TA--AATTGT--AGG----A----CTGT-----GCACGAT-------AG---ATTTG---TAATTATTC-T---ATT-A---T-A--CA--T-G-AAATTA-TTATGCGGAT-ATATCTTACCAGTGCT--CT-AA--AAA----A-AT-G--TA---CTA---TT-CT--ATG-A--AA--TATATA-AGTTGAAA-ATCAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GACCCCTTGAG
gi|90619                      :                                                                                                                                                                                                              -CTCAA------AT--G---CAAATTTTACTTTTGATG------A-T-ATTTT-TT--A--TATTCTTTTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGAGGTAGA-TCT-TTATT--T--AC-TGCTAAT------TAA----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-T-T-ACG
gi|90620                      :                                                                                                                           TTTTAAACACTTCAC-AACATTTTTATATTT-AATG-TTAT---TATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACACATGTTACTGTAAATG------G-T-ATTTT-TT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-AAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA-TTTGAG-TGTTA-AAAA-C----CG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--
gi|90620                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TCA-AAAA-T----CGACCC------A----C-ACA---A-AAATATAAA-A---AATACCA-T-TT-----A----CAGTA-A-CATGTGT----CATGAATC-TTGAGTG-A-A----TTCT-----GCAT-ATATTCT-GAA---AATTT---CA--CAAT--A---ATA-ACATT-A--AATAT-A-AAAATG-TT-----GTG-A---------AGTGTT---T-AA--AAA----T-AT-G--AAAAGTTG---T---A--ATA-G--AT---ATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTGatatgaaaagttgtaatagatatatagtgaaaattagcagtgcggaaatacttttgacccttgagtg
gi|90621                      : tatttctctctgtgttacggtttttaacactcaaatgggatcatcatgttttatgaattttatttgaacgtaatcttacacttttcatattaatcagcattgaaaaaaatctaccccatcatTTTTAAACACTTCAC-AACA-TTTTATATTT-AATG-TTAT---TATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-TCAT--G--ACACATGTTACTGTAAATG------G-T-ATTTTTTT--A--TATTTTTGTGT-GGGTCGATTTTTG-AATGA-TGGGGTAGA-TTT-TT-TT--C--AA-TGCTGAT------TAA----TA--T-GAA-AAGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA--TTGAG-TGTTA-AAAA-C----CG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--
gi|90621                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TCA-AAAA-T----CGACCC------A----C-ACA---A-AAATAT--A-A---AAAA--A-T-ACCATTTA----CAGTA-A-CATGTGT----CATGAATC-TTGAGTG-A-A----TTCT-----GCAT-ATATTCT-GAA---AATTT---CA--CAAT--A---ATA-ACA-T-T--AA-AT-ATAAAATG-TT-----GTG-A---------AGTGTT---T-AA--AAA----T-AT-G--AAAGTTTG---T---A--ATA-G--AT---ATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTGG---CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTGatatgaaagtttgtaatagatatatagtgaaaattagcagtggcggaaatacttttgacccttgagtg
gi|90622                      :                                                                                                                                                                                               tatttctctctgtgttacggtttttaacactcaatgggatcatcatgttttatgaattttatttgaacgtaatcttacacttttcatattaatcagcattgaaaaaaatctaccccatcat-TT-TT--C--GA-CAGTCATA-----TAA----TA--T--AG-ATGTGCA----T-T-GTGTTGCA---ATGA-AAT-------AA-A-AGAAG-T-TCA-TCTCATACTGAG--------AAA-C----TG--TATATAACA----T-ACA---T-AGA-----A-A---AAAA--A-T-T------A----AAATG-T-CAGAT-T----TA--AATC-T--AGG---------------------TGAT-TTGT-GAA---ATTTT---TA--TCCT--G---ATG-AC--T-G--CT-GT-A-GA----------------AT-------CAGTGCT--TT--A--AAA----G-TT-A--TA---TTA---TT-AATTATG-ATTAT--TCTAT--------AA-ATTAGC-A-GTG----CAG-A
gi|90623                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AT------TAA----TA--T-GAA-ATGTGTAAGA-T-T-ACGTTCAA---ATAA-AATT-CAT--AA-C-ACAAG-A-TGA-TCACA-GT-GAG-TGTTA-AAAA-C----TG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----A-A---AATA--A-T-G------A----TAGTA-A-CAGAT-T----TA--AATC-T--AGGC-A-AAATTTTAT-----GCATGAT-TTGT-GAG---ATTTT---TA--TAGT--T---ATA-AC--T-G--CA-GT-A-GAAATA-TT-----GAT-AT-------CTGTGCT--CT-AA--AAA----A-AT-G--TA---TTA---TT-CA--ATG-A--AT--TACATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTGCAGTCAG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90624                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aA--T-GAA-ATGTATAAGA-G-T-ACGTTCAA---ATAA-GATT-CAT--TTTA-ACATG-A-TGT-TCCCA-GT---G-TGTTA-AAAA-C----TG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--A-T-G------A----GAGTA-A-CAGAT-T----TA--AATT-T--AGGCCATA----TTGT-----GCATGAT-TTGT-GAG---ATTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--T-G--CA-GT-A-GAAATA-TT-----GAT-AT-------CAGTGCT--CT-AA--AAA----A-AT-G--TA---CTA---TT-CA--ATG-A--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90625                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -T-T-ACATTCAA---ATAA-AATT-CGT--GA-A-ACATG-A-TGA-TCCCA-GT-GAG-TGTTA-AAAA-G----TG--TA------A----C-ACA---G-AGA-----G-AGATAATA--A-T-G------A----TATTA-A-CAGAT-T----TA--AATC-T--AGGC-T-A----TTAT-----GCATGAT-TTGT-GAT---ATTTT---TG--TAGT--T---ATG-AC--T-G--CT-GT-A-GAA----------------------------GCT--CT--T--AAA----A-AT-G--TA---------------------------TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CAG-AAAGTA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90626                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -ACGTTCAA---ATAA-AGTT-CAT--AA-A-ACATGGA-TGA-TCCCA-GT-GAG-TGTTA-AAAA-C----TG--TA------AATAAC-ACA---G-AGA-----G-A---AATA--T-T-G------A----TAGTA-A-CAGAT-T----TA--AATC-T--AGGC-G-A----TTAT-----GCATAGT-TTGT-GAG---ATTTT---TA--TAGT--T---ATG-AC--T-G--CA-AT-A-GAAATA-TTG----GATAAT-------CAGTGCT--CTAAA--AAA----A-AT-G--------TA---TT-CA--ATG-A--AT--TATA
gi|90627                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GA-----A-A---AATAC-A-T-G--------------TA-A-CA----T----TA--AAAG-T--AA-C-A-T----TCGT------CATGAA-TCGT-GAGTGAATTCTGCATA--TAAT--CCAAAAA-AT--TCA--TA-AT-A-GATATA-ACA----GAT-AT-------CAATTTT--TT-GGTGAAGTTTTA-AT-G--TA---TGAAAGTTGTA--ATG-A--AT---ATAGA-G--CAAAA-ATTAGC-A-GTG----CAG-AAA-TT-CT-----TTT-GA-TCCTTGAGTG
gi|90627                      :                                                                                                                                AAAACTTCACCAAAAAATTGATATCT----G-TTATATCTATTA-TGAATTTTT-TGGATT-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCACGAT-TCAT--G--ACGAATGTTACTTTTAATGTTACATG-T-ATTTT-T
gi|90628                      :                                                                                                                          gTTTTAAAAACTTCAC-AAAATTTTTATAATT-AATG-ATAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAA-ATA-TGCAGAATTC-A-CTCAAGAT-CCAT--G--ACAATTGTTACTaatgtatgaaagttgtaatgaatatagagcaaaaattagcagtgcagaaattcttttgatccttgagtg
gi|90628                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AGTA-A-CA-AT-TGTCATG--GATC-TTGAGTG-A-A----TTCT-----GCATATT-TTCT-GAA---AATTT---CA--CAATGAT---ATC-AT--T-AATTA--T-A-AAAATT-TT-----GTG-A---------AGT--T--TT-TA--AAA----T-AT-G--AAAG-TTG---T---A--ATA-G--AT---ATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-ATG----TGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTGtatgaaagttgtaatagatatatagtgaaaattagcaatgtggaaatacttttgacccttgagtg
gi|90629                      :                                                                                                                           TTTTAAAAACTTCAC-AAAAATTTTATATTT-AATG-TTAT---CATTG-TGAAATTTT-CAGAAT-ATA-TGCATAATT
gi|90629                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -A-A----TTAT-----GCAT-ATATTCT-GAA---AATTT---CA--CAAT--G---ATA-ACA-T-T--AA-AT-A-TAAA-A-TT-----TTT-GT-------GAA-GTT--TT-TA--AAA----T-AT-G--AAAG-TTG---T---A--ATA-G--AT---ATATA-G--AGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTGtatgaaagttgtaatagatatatagagaaaattagcagtgcggaaatacttttgacccttgagtg
gi|90630                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGTT--CT-AA--AAATGC-A-AA-G--T----TTG---T---A--ATA-G--ACA-TATATAAG--TTGAA-ATTAGC-A-ATG----CGG-AAA-TA-CT-----TTTGGA-CCCTTGGATG
gi|90631                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     A--ATGGA--AT--TATATA-G--TGAAA-ATTAGCAA-GTG----CAG-AAA-TA-C------TTT-GA-CCCGTGAGTG
gi|90632                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 --TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----TGG-AAA-TAGAA-----TTT-GATTTTTTGAGT
gi|90633                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 --TATATA-G--TGAAA-ATTAGC-A-GTG----CGG-AAA-TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGTG
gi|90634                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATA-A-G--TGAAA-TTTAGC-AAGTG----CGG-AA--TA-CT-----TTT-GA-CCCTTGAGT