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gi|2274 : GTCT--GGAGA--TGGG--T--C------T-TGA----AC----T-AC-CCT------TT-----A--GCGT----T---A-----T-T--T----C--GGCTT-GAAGGG-----A-AA-C-TCC-----T----G--C-G-A--T-AAT-GCT-GGA-A-CTA----CACGC------TCC-GA-C-----AC-AG-AGG-C-T-G-TTTTGCGA--CT-AA---GAT--TT-GG--T-CT-G-CC-C--CTAC-GA-G-AGC-A-T-AAA-G-ACC-TG---A--A-C-ACG-GT--C--T--CTGCTCCAT-AATACAA-CGTAA-CAATGCTTG
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gi|2276 : GTCT--G-AGA--AGG---T--CC----CT--GA---CGCGGACT-AC-GC---A-T-TT-----G--GTGT----T---A-----T-T--T----T--GGCTT-TGAAGG------GAA-C-CCC-----G----G--C-GGA--G-AAT-GC---------------------A----TCC-AAATC-A--AC-AG-AGG-C-T-G--TTTGGGA--CT-AA---ATT--T---G--T-CT-GCCC-C--T--A-CA-G-AGCAA-T-AAA-G-CCC-TGC--A--A-CAACG-GTC-T--C--CTGCTCCATAAAAACAACCGTAA-CAGCATTTG
gi|2277 : GTCTTAGTAGA--ATGA--T--CC----CT-GGA---CGT----TTAC-CCCG-A-C-TT-----G--CTGT----T---C-----T-T--T-------GGCTT-TGAGAG-----AAAA-C-T-C-----G----G--C---A--T-AAT-GCT-TAA-G-ATA----C-TGC-AATCTTCA-GA-TC-AG-AC-GG-GG---------TTTGGGC--CT-A-----TTCGTT-GAT-A-AT-C-AC-G--T--C-CA-GCAGC-A-T-AAAGG-CCC-CAC--AACA-C-ACG-ATC-C--T--CTGCTCCAT-AACACAA-CGTAT-CAATGCTT
gi|2278 : GTGT--GGAGA--AGAAAAT--CC----CT-TGA---CCC----T-GC-CCC--A-C-TT-----GTGGCGT----A---T-----T-T--T----T--GGCTT-TGAGGG-----GCAAAC-TCC-----T----T--C-G-A--A-AAT-GCT-TGA-A-ATA----C-TGC-A----TCC-----C-A--GT-GC-AGT-C-T---TTTT---C--AC-GG---GTT--TT-GG--G-CT-G-CC-CGAT--C-CATA-AGT-A-T-AAA-G-CCC-TAT--C--A-C-ACG-GTC-C--T--CTGCCC
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Reference ( family-668 ) : GTCT--GGAGA--AGGG--T--CC----CT-TGA---CGC----T-AC-CCC--A-C-TT-----G--GCGT----T---C-----T-T--T----C--GGCTT-TGAGGG-A-------CAA-CT-CCG----G--C-G-A--G-AAT-GCT-GGA-A-ATACN-G----C-A----TCC-GA-TC-A--AC-AG-AGG-C-T-G-TTTTGGGC--C-T-AA---GTT--TT-GG--T-CT-G-CC-C--T--C-CA-G-AGC-A-T-AAA-G-CCC-TGC--A--A-C-ACG-GTC-C--T--CTGCTCCAT-AACACAACCGTAT-CAATGCTTG
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blockSeqs : . . G . . A . TT T CCA . TTGGTG TCATGTA . . CAA G . A . . AGTT . GG . . . . . . T . AGCC . ATCA . G A . . . CAA . . CT . A TA T T . A . . . . . . . . . . G . . . A . GATCA . .
blockSeqs : . . G . . A . TT A CCA . GTGG TGGT . . CT G . T . . AGTT . TG . . . . . . T . TA . TCAG . T G . . . CAA . . . . A TG T C . C . . . . . . . . . . G . . . A . T . .
blockSeqs : . . G . . . . TT . TA . TGG TTA . . CT . . A . . AG . G . . . . . . A . A . TCCA . G G . . . GC . . . . . A . G . G . . . . . . . . . . G . . . A . T . .
blockSeqs : . . G . . . . T . CT . GG TC . . C . . A . . . . G . . . . . . A . A . TCA . G A . . . GC . . . . . A . A . G . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . T . . . . T . CT . GC TA . . T . . C . . . . G . . . . . . T . A . TCA . G G . . . GA . . . . . T . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . G . . . . T . GA . GG TC . . C . . C . . . . A . . . . . . T . A . TCA . G G . . . GA . . . . . T . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . G . . . . T . CA . GT TC . . C . . A . . . . A . . . . . . G . A . TCA . G G . . . GC . . . . . G . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . .
blockSeqs : . . A . . . . T . CA . GT TA . . C . . A . . . . G . . . . . . T . A . ACA . G G . . . GC . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . G . . . . T . CA . AG TA . . C . . C . . . . G . . . . . . T . A . TCT . G T . . . GA . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . G . . . . A . A . GG TC . . T . . C . . . . G . . . . . . C . A . TCA . G G . . . GA . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . T . . . . T . C . GC AT . . T . . A . . . . A . . . . . . C . A . TCA . C T . . . GA . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . G . . . . T . A . GA AC . . C . . C . . . . G . . . . . . T . A . TCA . G G . . . GC . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . T . . . . T . A . TA TT . . C . . C . . . . T . . . . . . T . A . TCA . A G . . . GA . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . G . . . . A . A . GG CC . . T . . C . . . . A . . . . . . A . A . TCA . T G . . . GC . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . G . . . . A . A . GG TC . . C . . C . . . . A . . . . . . T . A . TCA . G G . . . AC . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . G . . . . T . A . GA TC . . A . . C . . . . G . . . . . . A . A . CG . A G . . . GC . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . G . . . . T . A . GG AC . . C . . T . . . . G . . . . . . A . A . CA . A . . . . GA . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . .
blockSeqs : . . . . . . T . A . GG AC . . G . . T . . . . G . . . . . . A . A . C . . . . . . GT . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . T . A . TG AC . . C . . T . . . . G . . . . . . A . A . C . . . . . . GC . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . T . A . A AC . . C . . C . . . . G . . . . . . A . . . C . . . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . G TA . . . . . C . . . . G . . . . . . A . . . . . . . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G TC . . . . . T . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G T . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : A***
originalCons : GTCT--GGAGA--AGGG--T--CC----CT-TGA---CGC----T-AC-CCC--A-C-TT-----G--GCGT----T---C-----T-T--T----C--GGCTT-TGAGGG-A-------CAA-CT-CCG----G--C-G-A--G-AAT-GCT-GGA-A-ATACN-G----C-A----TCC-GA-TC-A--AC-AG-AGG-C-T-G-TTTTGGGC--C-T-AA---GTT--TT-GG--T-CT-G-CC-C--T--C-CA-G-AGC-A-T-AAA-G-CCC-TGC--A--A-C-ACG-GTC-C--T--CTGCTCCAT-AACACAACCGTAT-CAATGCTTG
finalCons : GTCT--GGAGA--AGGG--T--CC----CT-TGA---CGC----T-AC-CCCA---C-TT-----G--GCGT----T---C-----T-T--T----C--GGCTT-TGAGGG-A-------CAA-CT-CCG----G--C-G-A--G-AAT-GCT-GGA-A-ATACN-G----C-A----TCC-GA-TC-A--AC-AG-AGG-C-T-G-TTTTGGGC--C-T-AA---GTT--TT-GG--T-CT-G-CC-C--T--C-CA-G-AGC-A-T-AAA-G-CCC-TGC--A--A-C-ACG-GTC-C--T--CTGCTCCAT-AACACAACCGTAT-CAATGCTTG
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lowQualScore : .. .. ... .. .... . ... ...... . .... . ......... .............. . .. ....... . . ........ . . .... .. ... .. . . . . . .. .... ...... . ....... . .. .. . . . .... . . ... .. . .... . . . .. .. . . . . . . . . . .. .. . . . . ..... . . .
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Reference ( family-668 ) : GTCT--GGAGA--AGGG--T--CC----CT-TGA---CGC----T-AC-CCC--A-C-TT-----G--GCGT----T---C-----T-T--T----C--GGCTT-TGAGGG-A-------CAA-CT-CCG----G--C-G-A--G-AAT-GCT-GGA-A-ATACN-G----C-A----TCC-GA-TC-A--AC-AG-AGG-C-T-G-TTTTGGGC--C-T-AA---GTT--TT-GG--T-CT-G-CC-C--T--C-CA-G-AGC-A-T-AAA-G-CCC-TGC--A--A-C-ACG-GTC-C--T--CTGCTCCAT-AACACAACCGTAT-CAATGCTTG
gi|2267 : GTCT--GGAAA--AGGG--T--CC----CT-TGA---CGC----T-AC-CCCC-A-C-TT-----G--GCGT----T---A-----T-T--T----C--ACCTT-TGAGGG-A-------CAA-CT-CCG----G--T-G-A--G-AAT-GCT-GGA-A-ATACA-G----C-A----TCC-GA-TC-A--AC-AG-AGG-C-T-G-ATTTAGGA--C-T-AA---GTT--TT-GG--T-TT-GCCC-C--T--C-CA-G-AGC-A-T--AA-C-CCC-TGC--A--A-C-ACG-GTT-C--T--TTGCTCCAT-GATACAACCGTAT-CAATGCTTG
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gi|2269 : GTCT--AGAGA--AGGG--C--CC----CT-TGA---CGC----T-AC-CCCT-A-C-TT-----G--CCGT----T---------T-T--T----T--GACTT-TGAGAG-A-------TAA-CT-CCG----G--T-G-A--G-AAT-GCT-GGA-A-ATACT-G----C-A----TCT-GA-TC-A--TC-AT-AGG-C-T-G-TTTGAGGC--C-T-TA---GTT--TT-GG--A-CT-G-CC-CA-T--C-CA-G-AGC-A-T-AAA-G-CCC-CAC--A--A-C-ACG-ATC-T--T--CTGATCAAT-AACACAACTTTAT-CAATGCTTG
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gi|2273 : GTCT--GAAGA--AGGT--T--CC-------TGA---CGC----T-AC-CCC--CTC-TT-----G--TTGT----T---C-----T-T--T----CT-GGTTT-TGAGAG-A-------CAA-AT-CCG-------C-A-A--T-AAT-G----GA-A-ATACT-G----C-A----TCC-GA-TC-A--ACAAG-AGG-C-T-G-TCTGGGGC--T-T--A---GTT--TT-GGCTC-CT-G----C--T--C-CA-A-AGC-A-T-AAA-A-TCC-CCC--A--A-C-ACG-ATT-CGATCACTGTTCCAT-AACACAACTGTAT-CAA
gi|2274 : GTCT--GGAGA--TGGG--T--C------T-TGA----AC----T-AC-CCT------TT-----A--GCGT----T---A-----T-T--T----C--GGCTT-GAAGGG-A--------AA-CT-CCT----G--C-G-A--T-AAT-GCT-GGA-A-CTACACG----C------TCC-GA-C-----AC-AG-AGG-C-T-G-TTTTGCGA--C-T-AA---GAT--TT-GG--T-CT-G-CC-C--CTAC-GA-G-AGC-A-T-AAA-G-ACC-TG---A--A-C-ACG-GT--C--T--CTGCTCCAT-AATACAA-CGTAA-CAATGCTTG
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gi|2276 : GTCT--G-AGA--AGG---T--CC----CT--GA---CGCGGACT-AC-GC---A-T-TT-----G--GTGT----T---A-----T-T--T----T--GGCTT-TGAAGG-G--------AA-CC-CCG----G--C-GGA--G-AAT-GC---------------------A----TCC-AAATC-A--AC-AG-AGG-C-T-G--TTTGGGA--C-T-AA---ATT--T---G--T-CT-GCCC-C--T--A-CA-G-AGCAA-T-AAA-G-CCC-TGC--A--A-CAACG-GTC-T--C--CTGCTCCATAAAAACAACCGTAA-CAGCATTTG
gi|2277 : GTCTTAGTAGA--ATGA--T--CC----CT-GGA---CGT----TTAC-CCCG-A-C-TT-----G--CTGT----T---C-----T-T--T-------GGCTT-TGAGAG-A-------AAA-CT--CG----G--C---A--T-AAT-GCT-TAA-G-ATACT-G----C-AATCTTCA-GA-TC-AG-AC-GG-GG---------TTTGGGC--C-T-A-----TTCGTT-GA--TAAT-C-AC-G--T--C-CA-GCAGC-A-T-AAAGG-CCC-CAC--AACA-C-ACG-ATC-C--T--CTGCTCCAT-AACACAA-CGTAT-CAATGCTT
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gi|2279 : TTT--GGAGA--AGAG--T--CC----CT-TGA---TCC----T-GTTCCC--A-C-TT-----G--ACGT----A---C-----T-G--T----C--GGCTT-TGAGAG-G-------CAA-CT-CTG----G--C-A-A--G-AAT-GCT-GGG-A-ATACC-G----A-A----TCT-GA-TC-T--AC-A------T-C-C-TCTT---C--C-C-AA---GTT--TT-GG--G-CT-G-CC-CG-T--C-CA-G-TGC-A-T-AAA-G-CCC-TGC--A--A-C-ACG-GTC-C--T--CTGTTTCAT-AACACAATCGTAT-CACTGCTTG
gi|2280 : TCT--GGAGT--AAGG--T--CC----CT-TGA---CG-----T-AC-TC-------TT-----T--ACGG----T---T-----TAT--TGCTGC--GGCTT--GAGAG-A-------ACA-CT-CCT----G--C-G-A--CTAGT-GCT-GGA-A-CTACC------C-A----TCCCGA-C-----AC-AG-AGGAC-T-G-TTTTGGGA--C-A-AA---GAT--TT-GG--TGCT-GGCCGC--T--C-CA-G-AGC-A-T-AAA-GGCCCGTGC--A--A-C-ACG-TTCTC--T--CTGCCC--T-AATACAACCGTAA-CAATGCTT
gi|2281 : TCC--GGAGC--GGGT--T--TC----TC-CGA---TGC----A-AC-CAC--A-C-GT-----A---TGT----C---C-----T-T--C----CAAGGCTT-TACTGA-C-------CGG-TT-CTG----C--C-T-G--G-AGT-GCT-AGA-A-GTGTT-G----C-A----TTC-GA-TC-A--AC-A----------G-CTT----C--C-TCAACT-GTC--TG-GG--G-TT-GACC-G--T--C-CA-G-GGC-G-T-AAA-A-CCC-TGC--G--T-C-TCG-GTC-T--T--CGGTGCCGT-AGCATAGCCG
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gi|2283 : CT--GGAGA--AG----T--CC----CT-TAA---CGC----T-ACACCC--A-C-TT-----G--GC-T----T---C-----T-T--T----T--G-CTT-GGAGG--A-------CAA-CT-TCG----G--CTG-A--G-AATCGCT-GAA-G-ATACA-G----C-A----TCT-GA-TCCA--AC-AT-GAT-C-T-G-TTTTGGAC----T-AA---GTT--TT-GT--T-CT----C-C--T--T-CA-G-AGC-ATT-AAA-G-ACC-T-CAAA--A-C-AC--CTC-C--T--ATGCTCAAT-AATACAACGTTAC-CAATGTT
gi|2284 : --GGAGA--AGG---T--TC----CT-TAA---CGC----T-AC-CCCC-A-C-TT-----G---CGT----T---C-----T-T--T----C--GACTT-TGAGGG-A-------CAA-CT-CCG----G--C-A-A--G-AAT-GCT-GTA-A-ATACT-G----C-A----TCC-GA-TC-A--AC-AG-AGG-A-T-GTTTTTGGGC--G-T-AC---GTT--TT-GG--G-CT-GCCC-C--T--G-CA-G-AAC-A-T-AAA-G-CCC-CGC--A--A-T-ACG-GTC-C--T--CTGCTCCAT-AACACAACCGTAT-CAACGTTTG
gi|2285 : --GGTGA--AGAT--T--CC----CG-TGATTCCGC-------C-CCC--A-C-TT-----G--ACCC----A---C-----T-T--G----A--CGCGG-TAGGGG-G-------CGA-TC-CCG----G--C-G-A--G-AAT-GCT-GGT-A-GTACA-GTCTAC-AGCC-TCC----TC-A--A---------C-T-G-TTTTGG-------------GTT------G--C-CT-G-------T--C-CA-G-GGC-A-T-GCA-G-CCC-AGC--A--T-C-ACG-GTC-C--T--CCGCTCCAT-AGCACAACCATGT-CACAGCTTG
gi|2286 : AGA--ATGG--T--CC----CAATGA---CGC----T-AC-CCCCCA-C-TT-----G---CGT----A---C-----T-T--C--------GCTTGCAAGGG-A-------TAA-CT-CTGAGTTG--C---A--G-AAT-GCT-GGA-A-ATACA-G----C-------------------------------T-G-TTTTGG-CAAC-T-AA---GTG--TTAGG--T-CTTG-CT-T--T--C-CA-G--GC-A-T-AAA-A-CCC-TGCG-A--A-C-ACGAGTC-C-----CTGTGCCAT-AATACAACCGTAT-CAAT
gi|2287 : AGA--ATGG--T--CC----CAATGA---CGC----T-AC-CCCCCA-C-TT-----G---CGT----A---C-----T-T--C--------GCTTGCAAGGG-A-------TAA-CT-CTGAGTTG--C---A--G-AAT-GCT-GGA-A-ATACA-G----C-------------------------------T-G-TTTTGG-CAAC-T-AA---GTG--TTAGG--T-CTTG-CT-T--T--C-CA-G--GC-A-T-AAA-A-CCC-TGCG-A--A-C-ACGAGTC-C-----CTGTGCCAT-AATACAACCGTAT-CAAT
gi|2288 : AGA--ATGG--T--CC----CAATGA---CGC----T-AC-CCCCCA-C-TT-----G---CGT----A---C-----T-T--C--------GCTTGCAAGGG-A-------TAA-CT-CTGAGTTG--C---A--G-AAT-GCT-GGA-A-ATACA-G----C-------------------------------T-G-TTTTGG-CAAC-T-AA---GTG--TTAGG--T-CTTG-CT-T--T--C-CA-G--GC-A-T-AAA-A-CCC-TGCG-A--A-C-ACGAGTC-C-----CTGTGCCAT-AATACAACCGTAT-CAAT
gi|2289 : GAG--T--CCAGGTCT-TGA---CGC----T-AC-CCCC-A-C-TT-----G--GCAT----T---A-----T-T--T----C--GGATT-TGAGAG-G-------CAT-CT-CCG----G--C-G-A--G-AAT-GCT-GGA-A-ATACA-G----C-A----TCC-GA-TC-A--AC-AA-AGG-C-T-G-TTTTGGGA--C-T-AA---GTT--TT-GA--T-CT-GCCC-C--T--C-GA-C-AGC-A-T-AAA-G-CCC-TGC--A--A-C-ACG-GTC-C--T--CTGCTCCAT-AATACAACCGTAT-CGATGCTTG
gi|2290 : --T--CG----CT-TGA---CTC-------C-CCA--A-CATT-----G--GCGT----T---CATGTAT-TGGT----G--GGCTT-TGGGGT-ATCTATATCAT-CTATCGAG--G--C-G-A--G-AAC-GATAGGA-C-ATACA-G----CTA----TCT-GA-TC-AATAC-AGCAGG-CAC-G----TGA--------AA---GTT--TT-GG--T-CT-G-CC-
gi|2291 : --CC----TT-TGA---CGC----TTAC-CCCC-A-C-TT-----T--GCGT----T---C-----T-T--T----C--GGCTT-TGTGGG-A-------CAA-CT-CCG----G--T-G-A--A-AAT-GCT-GGG-A-ATACT-G----C-A----TCC-GA-TC-A--AC-AA-AGG-C-T-C-TTTTGGGT--C-T-TA---GTT--TT-GG--G-CT-ACCC-C--T--C-AA-G-AGC-A-T-GAA-G-CCC-TGC--A--A-C-ACG-ACC-T--G--CTGCTCTAT-AACACAACCTTAT-CAATGCTTG
gi|2292 : -CCC--A-C-TTT----G--GCGG----TGG-T-----T-C--T----C--GGCTT-TGAGGG-A-------TCA-CT-CTG----GGTT-G-A--G--AT-GCT-GGA-ATATAC
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gi|2293 : -AGG-T-T-G-TTTGGGGC--C-T-TA---ATT--TT-GA--T-AT-G-CC-CG-T--C-CA-A-ATT-A-T-AAG-G-TCC-TGC--A--A-C-ACA-ATC-C--T--CTGCTCAAT-A--ACAACCGTAT-CAATGCTtttggggccttaattttgatatgcccgtccaaattataaggtcctgcaacacaatcctctgctcaataacaaccgtatcaatgct
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