lowQualScore : 1111
lowQualScore : 222 555 22 1 1 8888888888 1 1 444444 1 1 1 1 44444 1 6666 1 1 44 66 888 1 1 44 1 44444 1 3 222 777777 22 1 22 22 1 1 44 1111 222 1 1 1 5 1 1 22
lowQualScore : ... ... .. . . .......... . . ...... . . . . ..... . .... . . .. .. ... . . .. . ..... . . ... ...... .. . .. .. . . .. .... ... . . . . . . ..
lowQualScore : 888 111 22 6 5 3333333333 5 5 444444 5 5 5 5 44444 5 3333 5 5 66 22 111 7 7 66 7 22222 7 3 999 888888 33 7 33 33 7 7 00 7777 999 7 7 7 3 7 7 55
consensus : GTTTGAGGCTATG---GCGG-G-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----CTCTC-AA----T-C-AATAT--TG-C-A-A-TG-TTTA--T-T-----TT-G-CG---AAA-----ATT--T-TCA--CC--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTTA
Reference ( gi|109775 ) : GTTTGAGGCTATG---GCGG-G-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----CTCTC-AA----T-C-AATAT--TG-C-A-A-TG-TTTA--T-T-----TT-G-TG---AAA-----ATT--T-TCA--CC--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TACA-T-TA--GTTA
gi|109776 : GTTTAAGGCTATG---GCAG-G-CTATTC--GA-A-A----------C-TC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----TTCTC-AA----T-C-AATAT--TG-C-A-A-TT-TTTA--T-T-----TT-G-TG---AAA-----ATT--T-TCA--CC--AGA-T-CT--C----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTTA
gi|109779 : GTTTGAGGCTATG---GCGG-G-TTATTC--AA-A-A----------C-GC-T------CTT-T-C-A-AGATATG----CTCTC-AAA---T-C-AATAT--TG-C-A-A-TG-TTTA--T-T-----TT-T-TG---AAA-----ATT--T-TCA--CC--CGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-CATA-T-CA--GTTA
gi|109781 : GTTTAAGGCTATG---GCGC-G-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATC----CTCTC-AA----T-C-GATAT--TG-C-A-A-TG-TTTA--T-T-----TT-G-CG---AAG-----ATT--T-TCA--CC--AGA-T-TT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GATA
gi|109782 : GTTTGACGCTATG---GCGG-G-TTATTC--AA-A-AGTATTCAAAAC-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----CTCTC-AA----T-C-AATAT--TG-C-A-A-TG-CTTA--T-T-----TT-G-TG---AAA-----ATT--T-TCA--CC--CGA-T-CT--T----AG---TT-A-T-TATA-T-TA--GTTA
gi|109778 : GTTTGAGGCTATG---GCGG-T-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----GTCTC-AA----T-C-AATAT--TT-C-C-A-TG-ATTA--T-T-----TT-G-CA---AAA-----ATG--T-TCA--CC--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTTA
gi|109777 : GTTTGAGGCTATG---GCGG-T-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----GTCTC-AA----T-C-AATAT--TC-C-C-A-TG-ATTA--T-T-----TT-G-CA---AAA-----ATG--T-TCA--CC--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTTA
gi|109780 : GTTTGAGGCTATG---GCGG-G-TAATTC--GA-A-A----------C-GC-A------CAT-T-C-A-AAATATG----CTCTT-AA----T-T-AATAT--TC-C-C-A-TG-TTTA--T-T-----TT-G-CG---AAC-----ATT--T-TCA--CC--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GCTA
gi|109783 : GTTTGAGGCTATG---GCGGAG-TTATTT--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATGTG----CTCTC-AA----TCC-ACTAT--CG-C-A-A-TGCTTTA--T-T-----TT-G-TG---AAA-----ATT--A-TTA--TC--AGA-T-TT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-
gi|109784 : GTTTGAGACTGTG---GCGG-T-TTATTT--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-A-A-GGATATG----CTCTC-AA----T-C-AATAT--TC-C-C-A-TG-TCTAGTT-T-----TT-G-CG---GAA-----TTT--T-TTA--TC--AGA-T-CT--T----AATTGTT-A-T-TATA-T-TA--GTTA
gi|109785 : GTTTAAGGCTGTG---ACGG-G-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGAAATG----TTCTC-AG----T-C-AATAT--CG-A-A-A-TG-TTTA--TGTTTATGTT-G-TG---AAA-----ATT--T-TCA--CC--AGA-T-ATA-T----AT---AT-A-TATATA-T-TA--GTTA
gi|109787 : GTTTGAGGCTTTG---TGGG-G-GTATTC--AA-A-A----------CCGC-T------C-T-T-C-A-AGATATG----CTCTC-AA----T-CTAATATTGTG-C-A-A-TG-TTTA--T-T-----TT-G-TG---AAA-------T--T-TCA--AC--CGA-TGCT--T----A-----T-ACT-TATA-T-TA--GTTA
gi|109786 : GCTTGAGGCT-TGCCGGCGG-T-TCATTC--GA-A-TT---------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----CTCTCAAA----T-C-AATAT--T--C-C-A-TA-TATAATT-T-----TT-T-CG---AAA-----ATT--T-TCA---C--AGA-T-CT--T----AA---TC-A-T-TGTA-T-TA--GTTA
gi|109788 : GTTTGAATCTATG---GGGA-T-TTATTC--GA-A-A----------C-TC-T------CAT-C-C-G-ATATATA----------AA----T-C-AATAT--TC-C-C-A-TG-TTTA--T-T-----GT-G-CT---AAT-----TTT--T-TCA--TC--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTT
gi|109789 : GTTTGAGACTATG---GCGG-A-TTAGTT--AA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----TTCTC-AA----T-C-AAT
gi|109790 : GTTTAAGGCTATG---ACGG------TTCCGGG-G-A----------C-GGGT------CATCT-C-A-AGAAATG-----TCTC-AA----T-C-AATCA--TG-C-A---TG-TTTA--T-T-----TTGG-TG---AAA-------T--T-TTA--CCAAAAA-T-CTTAT----AA---TTAA-T-TATA-T-TA--GTTAttc
gi|109791 : GTTTGAGCCTATG---GCGG-G-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-
gi|109792 : GTCTAATGGTATG---GCAG-T-TTATGA--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-A-T-AGGCATG----TTCTC-AA----G-C-AATA---TG-CTC-T-TG-TTTG--T-T-----TT-GCTG------------TTTCT-TTA--TC--AGG-T-CT--TGTAAAA---GG-A-T-CATA-T-TG--GTTA
gi|109793 : GTCTTAGGCTATG---ACGG-G-TTACAT--GA-A-A----------C-AC-T------GAT-T-G-T-AGGTGTG-----------------------AT--TC-C-C-T-TC-TTTA--T-T-----TT-G-CT---AAA-----TTT--T-TCA--TC--ATA-T-TT--TATG-AA---TT-A-T-TA
gi|109794 : TTTGAG--TATG---GCGG-GGTTATTC--GACATA----------C-GC-T------CAT-T-C-AGAGATGTG----CTCTC-AA----T-C-AATAT--CG-C-AGA-TG-TTTT--T-T-----TT-G-TG---AAA-----ATT--T-T-A--TC--AGATT-TT--T----AA---TT---T-TATAGT-TA--GTTAt
gi|109795 : TTGAGGCTATG----CAA-A-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATGTG----CTCTC-AA----T-C-AATAT--CG-C-A-A-TA-TTTA--T-T-----TT-G-TG---AAA-----TTT--T-TTA--TC--AGA-T-TT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTTA
gi|109796 : TTGAGGCTATG---GCGG-G-TTATTC--GA-A-A----------T-GC-T------CAT-TGCGA-AGATATG----CTCTC-AAG---T-C-AATAT--TT-C-C-CTTG-TTTA--T-T-----TT-T-TGCGAAAA-----ATT--TGTCAACCT--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTT
gi|109797 : TGAGGCTATA---GTGG-T-TTATAT--GA-A-A----------T-AC-TAGAACTTAT-T-G-A-AGCTAGGAATTCTCTA-AA----A-C-AACAT--T--C-AGA-TG-TTTA--T-T-----TT-G-CT---GAA-----TTT--T-TCA--TC--ATA-T-CT--T----TA---GG-A-T-TACA-TATA--GTTA
gi|109798 : AGGCTATG---A----A-TTATTC--GA-A-A----------C-AC-T------AAG-T-G-T-AGAT-TG----CTCTC-AG----G-C-AACAT--TC-C-T-T-TG-TTCA--T-T-----TT-G-CC---GAATTTTTTTT--T-TCA--TC--AGA-T-CT--C----GG---GG-A-T-TATA-T-TATTGTTA
gi|109799 : GCTATG---GCGG-T-TTATGA--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-A-T-AGACATG----ATCTT-AA----G-C-AATATGCTC-C-----TG-TTTA--C-T-----TT-GCTC---ATT-----TTT--T-TTG--TC--AGG-T-CT--TGTAAAA---GG-A-T-TATA-T-TG--GTTA
gi|109800 : CTATG---ACGG-G-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGAAATG----CTCTC-AA----T-C-AATAT--TT-C-A-A-TG-TTTA--T-G-----TT-T-TG---AAA-----ATT--T-TCA--CC--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TTTA-T-TA--GTTA
gi|109801 : -A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----CTCTC-AA----T-C-AAT
gi|109802 : G----CCCTC-AAATAGT-C-AATAT--CGGC-A-A-T----TA--T-T-----TT-A-AG---AAA-----ATG--T-TTA--CC--AGA-T-CT--TA---AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTTAttc
Alignments
lowQualScore : 1111
lowQualScore : 22 444 22 1 1 8888888888 1 1 444444 1 1 1 1 33333 1 6666 1 1 44 55 777 1 1 66 1 44444 1 1 1 555555 22 1 22 22 1 1 33 1111 222 1 1 1 1 1 22
lowQualScore : .. ... .. . . .......... . . ...... . . . . ..... . .... . . .. .. ... . . .. . ..... . . . ...... .. . .. .. . . .. .... ... . . . . . ..
lowQualScore : 11 555 11 5 5 0000000000 5 5 333333 5 5 5 5 99999 5 1111 5 5 44 66 444 6 6 66 6 00000 6 6 6 222222 22 6 22 22 6 6 88 2222 888 6 6 6 7 7 44
consensus : GTTTGAGGCT--ATGGCGG-G-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----CTCTC-AA----T-C-AATAT--TG-C-A-A-TG-TTTA--T-T-----TTGC-G-AA-A-----ATT--T-TCA--CC--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTTA
Reference ( family-665 ) : GTTTGAGGCT--ATGGCGG-G-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----CTCTC-AA----T-C-AATAT--TG-C-A-A-TG-TTTA--T-T-----TTGC-G-AA-A-----ATT--T-TCA--CC--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTTA
gi|109775 : GTTTGAGGCT--ATGGCGG-G-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----CTCTC-AA----T-C-AATAT--TG-C-A-A-TG-TTTA--T-T-----TTGT-G-AA-A-----ATT--T-TCA--CC--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TACA-T-TA--GTTA
gi|109776 : GTTTAAGGCT--ATGGCAG-G-CTATTC--GA-A-A----------C-TC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----TTCTC-AA----T-C-AATAT--TG-C-A-A-TT-TTTA--T-T-----TTGT-G-AA-A-----ATT--T-TCA--CC--AGA-T-CT--C----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTTA
gi|109777 : GTTTGAGGCT--ATGGCGG-T-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----GTCTC-AA----T-C-AATAT--TC-C-C-A-TG-ATTA--T-T-----TTGC-A-AA-A-----ATG--T-TCA--CC--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTTA
gi|109778 : GTTTGAGGCT--ATGGCGG-T-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----GTCTC-AA----T-C-AATAT--TT-C-C-A-TG-ATTA--T-T-----TTGC-A-AA-A-----ATG--T-TCA--CC--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTTA
gi|109779 : GTTTGAGGCT--ATGGCGG-G-TTATTC--AA-A-A----------C-GC-T------CTT-T-C-A-AGATATG----CTCTC-AAA---T-C-AATAT--TG-C-A-A-TG-TTTA--T-T-----TTTT-G-AA-A-----ATT--T-TCA--CC--CGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-CATA-T-CA--GTTA
gi|109780 : GTTTGAGGCT--ATGGCGG-G-TAATTC--GA-A-A----------C-GC-A------CAT-T-C-A-AAATATG----CTCTT-AA----T-T-AATAT--TC-C-C-A-TG-TTTA--T-T-----TTGC-G-AA-C-----ATT--T-TCA--CC--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GCTA
gi|109781 : GTTTAAGGCT--ATGGCGC-G-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATC----CTCTC-AA----T-C-GATAT--TG-C-A-A-TG-TTTA--T-T-----TTGC-G-AA-G-----ATT--T-TCA--CC--AGA-T-TT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GATA
gi|109782 : GTTTGACGCT--ATGGCGG-G-TTATTC--AA-A-AGTATTCAAAAC-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----CTCTC-AA----T-C-AATAT--TG-C-A-A-TG-CTTA--T-T-----TTGT-G-AA-A-----ATT--T-TCA--CC--CGA-T-CT--T----AG---TT-A-T-TATA-T-TA--GTTA
gi|109783 : GTTTGAGGCT--ATGGCGGAG-TTATTT--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATGTG----CTCTC-AA----TCC-ACTAT--CG-C-A-A-TGCTTTA--T-T-----TTGT-G-AA-A-----ATT--A-TTA--TC--AGA-T-TT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-
gi|109784 : GTTTGAGACT--GTGGCGG-T-TTATTT--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-A-A-GGATATG----CTCTC-AA----T-C-AATAT--TC-C-C-A-TG-TCTAGTT-T-----TTGC-G-GA-A-----TTT--T-TTA--TC--AGA-T-CT--T----AATTGTT-A-T-TATA-T-TA--GTTA
gi|109785 : GTTTAAGGCT--GTGACGG-G-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGAAATG----TTCTC-AG----T-C-AATAT--CG-A-A-A-TG-TTTA--TGTTTATGTTGT-G-AA-A-----ATT--T-TCA--CC--AGA-T-ATA-T----AT---AT-A-TATATA-T-TA--GTTA
gi|109786 : GCTTGAGGCTTGCCGGCGG-T-TCATTC--GA-A-TT---------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----CTCTCAAA----T-C-AATAT--T--C-C-A-TA-TATAATT-T-----TTTC-G-AA-A-----ATT--T-TCA---C--AGA-T-CT--T----AA---TC-A-T-TGTA-T-TA--GTTA
gi|109787 : GTTTGAGGCT--TTGTGGG-G-GTATTC--AA-A-A----------CCGC-T------C-T-T-C-A-AGATATG----CTCTC-AA----T-CTAATATTGTG-C-A-A-TG-TTTA--T-T-----TTGT-G-AA-A-------T--T-TCA--AC--CGA-TGCT--T----A-----T-ACT-TATA-T-TA--GTTA
gi|109788 : GTTTGAATCT--ATGGGGA-T-TTATTC--GA-A-A----------C-TC-T------CAT-C-C-G-ATATATA----------AA----T-C-AATAT--TC-C-C-A-TG-TTTA--T-T-----GTGC-T-AA-T-----TTT--T-TCA--TC--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTT
gi|109789 : GTTTGAGACT--ATGGCGG-A-TTAGTT--AA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----TTCTC-AA----T-C-AAT
gi|109790 : GTTTAAGGCT--ATGACGG------TTCCGGG-G-A----------C-GGGT------CATCT-C-A-AGAAATG-----TCTC-AA----T-C-AATCA--TG-C-A---TG-TTTA--T-T-----TTGG-T-GA-A-----ATT--T-T-A--CCAAAAA-T-CTTAT----AA---TTAA-T-TATA-T-TA--GTTAttc
gi|109791 : GTTTGAGCCT--ATGGCGG-G-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-
gi|109792 : GTCTAATGGT--ATGGCAG-T-TTATGA--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-A-T-AGGCATG----TTCTC-AA----G-C-AATA---TG-CTC-T-TG-TTTG--T-T-----TTGCTG-----------TTTCT-TTA--TC--AGG-T-CT--TGTAAAA---GG-A-T-CATA-T-TG--GTTA
gi|109793 : GTCTTAGGCT--ATGACGG-G-TTACAT--GA-A-A----------C-AC-T------GAT-T-G-T-AGGTGTG-----------------------AT--TC-C-C-T-TC-TTTA--T-T-----TTGC-T-AA-A-----TTT--T-TCA--TC--ATA-T-TT--TATG-AA---TT-A-T-TAT
gi|109794 : TTTGAG--T--ATGGCGG-GGTTATTC--GACATA----------C-GC-T------CAT-T-C-AGAGATGTG----CTCTC-AA----T-C-AATAT--CG-C-AGA-TG-TTTT--T-T-----TTGT-G-AA-A-----ATT--T-T-A--TC--AGATT-TT--T----AA---TT---T-TATAGT-TA--GTTA
gi|109795 : TTGAGGCT--ATG-CAA-A-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATGTG----CTCTC-AA----T-C-AATAT--CG-C-A-A-TA-TTTA--T-T-----TTGT-G-AA-A-----TTT--T-TTA--TC--AGA-T-TT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTTA
gi|109796 : TTGAGGCT--ATGGCGG-G-TTATTC--GA-A-A----------T-GC-T------CAT-TGCGA-AGATATG----CTCTC-AAG---T-C-AATAT--TT-C-C-CTTG-TTTATTT-T-----TTGC-GAAA-A-----ATT--TGTCAACCT--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTT
gi|109797 : TGAGGCT--ATAGTGG-T-TTATAT--GA-A-A----------T-AC-TAGAACTTAT-T-G-A-AGCTAGGAATTCTCTA-AA----A-C-AACAT--T--C-AGA-TG-TTTA--T-T-----TTGC-T-GA-A-----TTT--T-TCA--TC--ATA-T-CT--T----TA---GG-A-T-TACA-TATA--GTTA
gi|109798 : AGGCT--ATGA----A-TTATTC--GA-A-A----------C-AC-T------AAG-T-G-T-AGAT-TG----CTCTC-AG----G-C-AACAT--TC-C-T-T-TG-TTCA--T-T-----TTGC-C-GA-ATTTTTTTT--T-TCA--TC--AGA-T-CT--C----GG---GG-A-T-TATA-T-TATTGTTA
gi|109799 : GCT--ATGGCGG-T-TTATGA--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-A-T-AGACATG----ATCTT-AA----G-C-AATATGCTC-C-----TG-TTTA--C-T-----TTGC-T-CATT-----TTT--T-TTG--TC--AGG-T-CT--TGTAAAA---GG-A-T-TATA-T-TG--GTTA
gi|109800 : CT--ATGACGG-G-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGAAATG----CTCTC-AA----T-C-AATAT--TT-C-A-A-TG-TTTA--T-G-----TTTT-G-AA-A-----ATT--T-TCA--CC--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TTTA-T-TA--GTTA
gi|109801 : -A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----CTCTC-AA----T-C-AAT
gi|109802 : G----CCCTC-AAATAGT-C-AATAT--CGGC-A-A-T----TA--T-T-----TTAA-G-AA-A-----ATG--T-TTA--CC--AGA-T-CT--TA---AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTTAttc
Alignments
lowQualScore : 1111
lowQualScore : 22 444 22 1 1 8888888888 1 1 444444 1 1 1 1 33333 1 6666 1 1 44 55 777 1 1 66 1 44444 1 1 1 555555 22 1 22 22 1 1 33 1111 222 1 1 1 1 1 22
lowQualScore : .. ... .. . . .......... . . ...... . . . . ..... . .... . . .. .. ... . . .. . ..... . . . ...... .. . .. .. . . .. .... ... . . . . . ..
lowQualScore : 11 555 11 5 5 0000000000 5 5 333333 5 5 5 5 99999 5 1111 5 5 44 66 444 6 6 66 6 00000 6 6 6 222222 22 6 22 22 6 6 88 2222 888 6 6 6 7 7 44
consensus : GTTTGAGGCT--ATGGCGG-G-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----CTCTC-AA----T-C-AATAT--TG-C-A-A-TG-TTTA--T-T-----TTGC-G-AA-A-----ATT--T-TCA--CC--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTTA
Reference ( family-665 ) : GTTTGAGGCT--ATGGCGG-G-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----CTCTC-AA----T-C-AATAT--TG-C-A-A-TG-TTTA--T-T-----TTGC-G-AA-A-----ATT--T-TCA--CC--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTTA
gi|109775 : GTTTGAGGCT--ATGGCGG-G-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----CTCTC-AA----T-C-AATAT--TG-C-A-A-TG-TTTA--T-T-----TTGT-G-AA-A-----ATT--T-TCA--CC--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TACA-T-TA--GTTA
gi|109776 : GTTTAAGGCT--ATGGCAG-G-CTATTC--GA-A-A----------C-TC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----TTCTC-AA----T-C-AATAT--TG-C-A-A-TT-TTTA--T-T-----TTGT-G-AA-A-----ATT--T-TCA--CC--AGA-T-CT--C----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTTA
gi|109777 : GTTTGAGGCT--ATGGCGG-T-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----GTCTC-AA----T-C-AATAT--TC-C-C-A-TG-ATTA--T-T-----TTGC-A-AA-A-----ATG--T-TCA--CC--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTTA
gi|109778 : GTTTGAGGCT--ATGGCGG-T-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----GTCTC-AA----T-C-AATAT--TT-C-C-A-TG-ATTA--T-T-----TTGC-A-AA-A-----ATG--T-TCA--CC--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTTA
gi|109779 : GTTTGAGGCT--ATGGCGG-G-TTATTC--AA-A-A----------C-GC-T------CTT-T-C-A-AGATATG----CTCTC-AAA---T-C-AATAT--TG-C-A-A-TG-TTTA--T-T-----TTTT-G-AA-A-----ATT--T-TCA--CC--CGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-CATA-T-CA--GTTA
gi|109780 : GTTTGAGGCT--ATGGCGG-G-TAATTC--GA-A-A----------C-GC-A------CAT-T-C-A-AAATATG----CTCTT-AA----T-T-AATAT--TC-C-C-A-TG-TTTA--T-T-----TTGC-G-AA-C-----ATT--T-TCA--CC--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GCTA
gi|109781 : GTTTAAGGCT--ATGGCGC-G-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATC----CTCTC-AA----T-C-GATAT--TG-C-A-A-TG-TTTA--T-T-----TTGC-G-AA-G-----ATT--T-TCA--CC--AGA-T-TT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GATA
gi|109782 : GTTTGACGCT--ATGGCGG-G-TTATTC--AA-A-AGTATTCAAAAC-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----CTCTC-AA----T-C-AATAT--TG-C-A-A-TG-CTTA--T-T-----TTGT-G-AA-A-----ATT--T-TCA--CC--CGA-T-CT--T----AG---TT-A-T-TATA-T-TA--GTTA
gi|109783 : GTTTGAGGCT--ATGGCGGAG-TTATTT--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATGTG----CTCTC-AA----TCC-ACTAT--CG-C-A-A-TGCTTTA--T-T-----TTGT-G-AA-A-----ATT--A-TTA--TC--AGA-T-TT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-
gi|109784 : GTTTGAGACT--GTGGCGG-T-TTATTT--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-A-A-GGATATG----CTCTC-AA----T-C-AATAT--TC-C-C-A-TG-TCTAGTT-T-----TTGC-G-GA-A-----TTT--T-TTA--TC--AGA-T-CT--T----AATTGTT-A-T-TATA-T-TA--GTTA
gi|109785 : GTTTAAGGCT--GTGACGG-G-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGAAATG----TTCTC-AG----T-C-AATAT--CG-A-A-A-TG-TTTA--TGTTTATGTTGT-G-AA-A-----ATT--T-TCA--CC--AGA-T-ATA-T----AT---AT-A-TATATA-T-TA--GTTA
gi|109786 : GCTTGAGGCTTGCCGGCGG-T-TCATTC--GA-A-TT---------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----CTCTCAAA----T-C-AATAT--T--C-C-A-TA-TATAATT-T-----TTTC-G-AA-A-----ATT--T-TCA---C--AGA-T-CT--T----AA---TC-A-T-TGTA-T-TA--GTTA
gi|109787 : GTTTGAGGCT--TTGTGGG-G-GTATTC--AA-A-A----------CCGC-T------C-T-T-C-A-AGATATG----CTCTC-AA----T-CTAATATTGTG-C-A-A-TG-TTTA--T-T-----TTGT-G-AA-A-------T--T-TCA--AC--CGA-TGCT--T----A-----T-ACT-TATA-T-TA--GTTA
gi|109788 : GTTTGAATCT--ATGGGGA-T-TTATTC--GA-A-A----------C-TC-T------CAT-C-C-G-ATATATA----------AA----T-C-AATAT--TC-C-C-A-TG-TTTA--T-T-----GTGC-T-AA-T-----TTT--T-TCA--TC--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTT
gi|109789 : GTTTGAGACT--ATGGCGG-A-TTAGTT--AA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----TTCTC-AA----T-C-AAT
gi|109790 : GTTTAAGGCT--ATGACGG------TTCCGGG-G-A----------C-GGGT------CATCT-C-A-AGAAATG-----TCTC-AA----T-C-AATCA--TG-C-A---TG-TTTA--T-T-----TTGG-T-GA-A-----ATT--T-T-A--CCAAAAA-T-CTTAT----AA---TTAA-T-TATA-T-TA--GTTAttc
gi|109791 : GTTTGAGCCT--ATGGCGG-G-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-
gi|109792 : GTCTAATGGT--ATGGCAG-T-TTATGA--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-A-T-AGGCATG----TTCTC-AA----G-C-AATA---TG-CTC-T-TG-TTTG--T-T-----TTGCTG-----------TTTCT-TTA--TC--AGG-T-CT--TGTAAAA---GG-A-T-CATA-T-TG--GTTA
gi|109793 : GTCTTAGGCT--ATGACGG-G-TTACAT--GA-A-A----------C-AC-T------GAT-T-G-T-AGGTGTG-----------------------AT--TC-C-C-T-TC-TTTA--T-T-----TTGC-T-AA-A-----TTT--T-TCA--TC--ATA-T-TT--TATG-AA---TT-A-T-TAT
gi|109794 : TTTGAG--T--ATGGCGG-GGTTATTC--GACATA----------C-GC-T------CAT-T-C-AGAGATGTG----CTCTC-AA----T-C-AATAT--CG-C-AGA-TG-TTTT--T-T-----TTGT-G-AA-A-----ATT--T-T-A--TC--AGATT-TT--T----AA---TT---T-TATAGT-TA--GTTA
gi|109795 : TTGAGGCT--ATG-CAA-A-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATGTG----CTCTC-AA----T-C-AATAT--CG-C-A-A-TA-TTTA--T-T-----TTGT-G-AA-A-----TTT--T-TTA--TC--AGA-T-TT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTTA
gi|109796 : TTGAGGCT--ATGGCGG-G-TTATTC--GA-A-A----------T-GC-T------CAT-TGCGA-AGATATG----CTCTC-AAG---T-C-AATAT--TT-C-C-CTTG-TTTATTT-T-----TTGC-GAAA-A-----ATT--TGTCAACCT--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTT
gi|109797 : TGAGGCT--ATAGTGG-T-TTATAT--GA-A-A----------T-AC-TAGAACTTAT-T-G-A-AGCTAGGAATTCTCTA-AA----A-C-AACAT--T--C-AGA-TG-TTTA--T-T-----TTGC-T-GA-A-----TTT--T-TCA--TC--ATA-T-CT--T----TA---GG-A-T-TACA-TATA--GTTA
gi|109798 : AGGCT--ATGA----A-TTATTC--GA-A-A----------C-AC-T------AAG-T-G-T-AGAT-TG----CTCTC-AG----G-C-AACAT--TC-C-T-T-TG-TTCA--T-T-----TTGC-C-GA-ATTTTTTTT--T-TCA--TC--AGA-T-CT--C----GG---GG-A-T-TATA-T-TATTGTTA
gi|109799 : GCT--ATGGCGG-T-TTATGA--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-A-T-AGACATG----ATCTT-AA----G-C-AATATGCTC-C-----TG-TTTA--C-T-----TTGC-T-CATT-----TTT--T-TTG--TC--AGG-T-CT--TGTAAAA---GG-A-T-TATA-T-TG--GTTA
gi|109800 : CT--ATGACGG-G-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGAAATG----CTCTC-AA----T-C-AATAT--TT-C-A-A-TG-TTTA--T-G-----TTTT-G-AA-A-----ATT--T-TCA--CC--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TTTA-T-TA--GTTA
gi|109801 : -A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----CTCTC-AA----T-C-AAT
gi|109802 : G----CCCTC-AAATAGT-C-AATAT--CGGC-A-A-T----TA--T-T-----TTAA-G-AA-A-----ATG--T-TTA--CC--AGA-T-CT--TA---AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTTAttc
blockSeqs : TG AG CG C T GTATTCAAAA C G AGAACT C G G G AATTC A ATAG C T TG GG TC T C GT G TTATG T A T TTTTTT TC G AC AA T G TA GTAA TTG A C A G A TT
blockSeqs : . GG . . . T . . . . . . . T . A . . GC G AG . . AT . . . . . A . . . . . . A GTAA . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . . . G . G . . . C AG . . TT . . . . . A . . . . . . . ATG . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . G . . . . . T A . . . . . . . . A . . . . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . C . . . . . G C . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . . . C . . . . . C C . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . . . C . . . . . G A . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . . . C . . . . . G C . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . . . C . . . . . G A . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . C . . . . . C A . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . . . T . . . . . G A . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . C . . . . . G C . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . . . C . . . . . C A . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . T . . . . . G C . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . T . . . . . G A . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . . . C . . . . . C C . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . C . . . . . G A . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . . . C . . . . . G C . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . C . . . . . T A . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . . . A . . . . . C C . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . C . . . . . C T . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . C . . . . . T A . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . C . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : GTTTGAGGCT--ATGGCGG-G-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----CTCTC-AA----T-C-AATAT--TG-C-A-A-TG-TTTA--T-T-----TTGC-G-AA-A-----ATT--T-TCA--CC--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTTA
finalCons : GTTTGAGGCT--ATGGCGG-G-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----CTCTC-AA----T-C-AATAT--TG-C-A-A-TG-TTTA--T-T-----TTGC-G-AA-A-----ATT--T-TCA--CC--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTTA
Alignments
lowQualScore : 1111
lowQualScore : 22 444 22 1 1 8888888888 1 1 444444 1 1 1 1 33333 1 6666 1 1 44 55 777 1 1 66 1 44444 1 1 1 555555 22 1 22 22 1 1 33 1111 222 1 1 1 1 1 22
lowQualScore : .. ... .. . . .......... . . ...... . . . . ..... . .... . . .. .. ... . . .. . ..... . . . ...... .. . .. .. . . .. .... ... . . . . . ..
lowQualScore : 11 555 11 5 5 0000000000 5 5 333333 5 5 5 5 99999 5 1111 5 5 44 66 444 6 6 66 6 00000 6 6 6 222222 22 6 22 22 6 6 88 2222 888 6 6 6 7 7 44
consensus : GTTTGAGGCT--ATGGCGG-G-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----CTCTC-AA----T-C-AATAT--TG-C-A-A-TG-TTTA--T-T-----TTGC-G-AA-A-----ATT--T-TCA--CC--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTTA
Reference ( family-665 ) : GTTTGAGGCT--ATGGCGG-G-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----CTCTC-AA----T-C-AATAT--TG-C-A-A-TG-TTTA--T-T-----TTGC-G-AA-A-----ATT--T-TCA--CC--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTTA
gi|109775 : GTTTGAGGCT--ATGGCGG-G-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----CTCTC-AA----T-C-AATAT--TG-C-A-A-TG-TTTA--T-T-----TTGT-G-AA-A-----ATT--T-TCA--CC--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TACA-T-TA--GTTA
gi|109776 : GTTTAAGGCT--ATGGCAG-G-CTATTC--GA-A-A----------C-TC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----TTCTC-AA----T-C-AATAT--TG-C-A-A-TT-TTTA--T-T-----TTGT-G-AA-A-----ATT--T-TCA--CC--AGA-T-CT--C----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTTA
gi|109777 : GTTTGAGGCT--ATGGCGG-T-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----GTCTC-AA----T-C-AATAT--TC-C-C-A-TG-ATTA--T-T-----TTGC-A-AA-A-----ATG--T-TCA--CC--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTTA
gi|109778 : GTTTGAGGCT--ATGGCGG-T-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----GTCTC-AA----T-C-AATAT--TT-C-C-A-TG-ATTA--T-T-----TTGC-A-AA-A-----ATG--T-TCA--CC--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTTA
gi|109779 : GTTTGAGGCT--ATGGCGG-G-TTATTC--AA-A-A----------C-GC-T------CTT-T-C-A-AGATATG----CTCTC-AAA---T-C-AATAT--TG-C-A-A-TG-TTTA--T-T-----TTTT-G-AA-A-----ATT--T-TCA--CC--CGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-CATA-T-CA--GTTA
gi|109780 : GTTTGAGGCT--ATGGCGG-G-TAATTC--GA-A-A----------C-GC-A------CAT-T-C-A-AAATATG----CTCTT-AA----T-T-AATAT--TC-C-C-A-TG-TTTA--T-T-----TTGC-G-AA-C-----ATT--T-TCA--CC--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GCTA
gi|109781 : GTTTAAGGCT--ATGGCGC-G-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATC----CTCTC-AA----T-C-GATAT--TG-C-A-A-TG-TTTA--T-T-----TTGC-G-AA-G-----ATT--T-TCA--CC--AGA-T-TT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GATA
gi|109782 : GTTTGACGCT--ATGGCGG-G-TTATTC--AA-A-AGTATTCAAAAC-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----CTCTC-AA----T-C-AATAT--TG-C-A-A-TG-CTTA--T-T-----TTGT-G-AA-A-----ATT--T-TCA--CC--CGA-T-CT--T----AG---TT-A-T-TATA-T-TA--GTTA
gi|109783 : GTTTGAGGCT--ATGGCGGAG-TTATTT--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATGTG----CTCTC-AA----TCC-ACTAT--CG-C-A-A-TGCTTTA--T-T-----TTGT-G-AA-A-----ATT--A-TTA--TC--AGA-T-TT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-
gi|109784 : GTTTGAGACT--GTGGCGG-T-TTATTT--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-A-A-GGATATG----CTCTC-AA----T-C-AATAT--TC-C-C-A-TG-TCTAGTT-T-----TTGC-G-GA-A-----TTT--T-TTA--TC--AGA-T-CT--T----AATTGTT-A-T-TATA-T-TA--GTTA
gi|109785 : GTTTAAGGCT--GTGACGG-G-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGAAATG----TTCTC-AG----T-C-AATAT--CG-A-A-A-TG-TTTA--TGTTTATGTTGT-G-AA-A-----ATT--T-TCA--CC--AGA-T-ATA-T----AT---AT-A-TATATA-T-TA--GTTA
gi|109786 : GCTTGAGGCTTGCCGGCGG-T-TCATTC--GA-A-TT---------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----CTCTCAAA----T-C-AATAT--T--C-C-A-TA-TATAATT-T-----TTTC-G-AA-A-----ATT--T-TCA---C--AGA-T-CT--T----AA---TC-A-T-TGTA-T-TA--GTTA
gi|109787 : GTTTGAGGCT--TTGTGGG-G-GTATTC--AA-A-A----------CCGC-T------C-T-T-C-A-AGATATG----CTCTC-AA----T-CTAATATTGTG-C-A-A-TG-TTTA--T-T-----TTGT-G-AA-A-------T--T-TCA--AC--CGA-TGCT--T----A-----T-ACT-TATA-T-TA--GTTA
gi|109788 : GTTTGAATCT--ATGGGGA-T-TTATTC--GA-A-A----------C-TC-T------CAT-C-C-G-ATATATA----------AA----T-C-AATAT--TC-C-C-A-TG-TTTA--T-T-----GTGC-T-AA-T-----TTT--T-TCA--TC--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTT
gi|109789 : GTTTGAGACT--ATGGCGG-A-TTAGTT--AA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----TTCTC-AA----T-C-AAT
gi|109790 : GTTTAAGGCT--ATGACGG------TTCCGGG-G-A----------C-GGGT------CATCT-C-A-AGAAATG-----TCTC-AA----T-C-AATCA--TG-C-A---TG-TTTA--T-T-----TTGG-T-GA-A-----ATT--T-T-A--CCAAAAA-T-CTTAT----AA---TTAA-T-TATA-T-TA--GTTAttc
gi|109791 : GTTTGAGCCT--ATGGCGG-G-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-
gi|109792 : GTCTAATGGT--ATGGCAG-T-TTATGA--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-A-T-AGGCATG----TTCTC-AA----G-C-AATA---TG-CTC-T-TG-TTTG--T-T-----TTGCTG-----------TTTCT-TTA--TC--AGG-T-CT--TGTAAAA---GG-A-T-CATA-T-TG--GTTA
gi|109793 : GTCTTAGGCT--ATGACGG-G-TTACAT--GA-A-A----------C-AC-T------GAT-T-G-T-AGGTGTG-----------------------AT--TC-C-C-T-TC-TTTA--T-T-----TTGC-T-AA-A-----TTT--T-TCA--TC--ATA-T-TT--TATG-AA---TT-A-T-TAT
gi|109794 : TTTGAG--T--ATGGCGG-GGTTATTC--GACATA----------C-GC-T------CAT-T-C-AGAGATGTG----CTCTC-AA----T-C-AATAT--CG-C-AGA-TG-TTTT--T-T-----TTGT-G-AA-A-----ATT--T-T-A--TC--AGATT-TT--T----AA---TT---T-TATAGT-TA--GTTA
gi|109795 : TTGAGGCT--ATG-CAA-A-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATGTG----CTCTC-AA----T-C-AATAT--CG-C-A-A-TA-TTTA--T-T-----TTGT-G-AA-A-----TTT--T-TTA--TC--AGA-T-TT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTTA
gi|109796 : TTGAGGCT--ATGGCGG-G-TTATTC--GA-A-A----------T-GC-T------CAT-TGCGA-AGATATG----CTCTC-AAG---T-C-AATAT--TT-C-C-CTTG-TTTATTT-T-----TTGC-GAAA-A-----ATT--TGTCAACCT--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTT
gi|109797 : TGAGGCT--ATAGTGG-T-TTATAT--GA-A-A----------T-AC-TAGAACTTAT-T-G-A-AGCTAGGAATTCTCTA-AA----A-C-AACAT--T--C-AGA-TG-TTTA--T-T-----TTGC-T-GA-A-----TTT--T-TCA--TC--ATA-T-CT--T----TA---GG-A-T-TACA-TATA--GTTA
gi|109798 : AGGCT--ATGA----A-TTATTC--GA-A-A----------C-AC-T------AAG-T-G-T-AGAT-TG----CTCTC-AG----G-C-AACAT--TC-C-T-T-TG-TTCA--T-T-----TTGC-C-GA-ATTTTTTTT--T-TCA--TC--AGA-T-CT--C----GG---GG-A-T-TATA-T-TATTGTTA
gi|109799 : GCT--ATGGCGG-T-TTATGA--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-A-T-AGACATG----ATCTT-AA----G-C-AATATGCTC-C-----TG-TTTA--C-T-----TTGC-T-CATT-----TTT--T-TTG--TC--AGG-T-CT--TGTAAAA---GG-A-T-TATA-T-TG--GTTA
gi|109800 : CT--ATGACGG-G-TTATTC--GA-A-A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGAAATG----CTCTC-AA----T-C-AATAT--TT-C-A-A-TG-TTTA--T-G-----TTTT-G-AA-A-----ATT--T-TCA--CC--AGA-T-CT--T----AA---TT-A-T-TTTA-T-TA--GTTA
gi|109801 : -A----------C-GC-T------CAT-T-C-A-AGATATG----CTCTC-AA----T-C-AAT
gi|109802 : G----CCCTC-AAATAGT-C-AATAT--CGGC-A-A-T----TA--T-T-----TTAA-G-AA-A-----ATG--T-TTA--CC--AGA-T-CT--TA---AA---TT-A-T-TATA-T-TA--GTTAttc